1WDNA

Glutamine-binding protein
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
223
structure length
223
Chain Sequence
KLVVATDTAFVPFEFKQGDLYVGFDVDLWAAIAKELKLDYELKPMDFSGIIPALQTKNVDLALAGITITDERKKAIDFSDGYYKSGLLVMVKANNNDVKSVKDLDGKVVAVKSGTGSVDYAKANIKTKDLRQFPNIDNAYMELGTNRADAVLHDTPNILYFIKTAGNGQFKAVGDSLEAQQYGIAFPKGSDELRDKVNGALKTLRENGTYNEIYKKWFGTEPK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The structure of glutamine-binding protein complexed with glutamine at 1.94 A resolution: comparisons with other amino acid binding proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMINE BINDING PROTEIN
molecule tags Complex (binding protein/peptide)
total genus 74
structure length 223
sequence length 223
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-05-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1wdnA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1wdnA01
3WAEA 2QL3A 3O2AA 1J1NA 3CG1A 3HCQA 3EHUA 2RCBA 5CBRA 1P99A 1FTJA 3PPPA 5LOMA 4XKPA 2ZXTA 3VLWA 4QFNA 4GFRA 4GRKA 2X7QA 3MZ9A 3MBPA 1MXWA 3FVGA 1Q1KA 2QJEA 4N13A 3V8XB 1XVXA 4LATA 2I4CA 1QVSA 4RYAA 2UXAA 5I2NA 2PVUA 4N6PA 1ELJA 3B6QA 2ZNUA 3LC8A 3M3LA 2QS2A 2F5XA 4AQ4A 3A3UA 3U92A 5KZTA 2AL4A 4M1VA 4N07A 2DWJA 2O1MA 3K00A 3FJMA 2XXTA 4X1BA 4X9TA 3C9HA 1VE4A 3UIFA 3OEMA 1B05A 1II5A 4EQ9A 2Y7RA 4U4SA 1A40A 3MZBA 3FZVA 4R6HA 3RT6B 3R6UA 2O69A 1IZ1A 1I6AA 4IGTA 4K3FA 4DXUA 1SW2A 4LZ5A 5AA3A 3FVKA 2DOJA 3IX1A 3EF7A 3KSJA 2V3TA 3RGYA 2XXXA 4KD5A 3TEPA 3ZKKA 4ONYA 5DVIA 2Q8JA 2XXPA 1QW0A 4QFKA 1ZMGA 2DWHA 5H8SA 2ONKE 2H99A 4OESA 4RK9A 2QMWA 3SESA 1US5A 3MAMA 1IEJA 3OXNA 4NF8B 1JVYA 4NWCA 4I1DA 1B3HA 3IORA 2O84X 3CIJA 1GR2A 2KLFA 4O3CA 4GF8A 3W9WA 3A3CA 2Z22A 4TOZA 2F8DA 1AMFA 3EPEA 5HPQA 1OLCA 1QUIA 4G77A 1A7LA 4TLMB 5I2KA 3BFUA 3PPQA 1B46A 1MG1A 4PFWA 2HXWA 3FV2A 4ZS9A 3LBSA 2ONSA 1XT8A 1S9TA 3L6GA 1B58A 1MQHA 3MVYA 4U23A 4ZE8A 3HHGA 4C0RA 1FQEA 5DT6A 3I5OA 1AIVA 1B5JA 2FYIA 3HV1A 5ICQA 5B70A 1A99A 3LSWA 4F3SA 1USYE 2G29A 1FQFA 4PE5B 3K1PA 3MP1A 1LAHE 4U4XA 1NNKA 3QAXA 4EQ7A 1B1XA 1MY1A 2PMSA 5ICTA 2W7YA 2Q2CA 3O97A 1VSOA 3KEIA 1UTHB 4E0XA 2BJJX 3GBBA 1JEVA 4F29A 3R26A 3RPWA 4Z7EA 3D4CA 3F11A 3Q29A 2H25A 3O6IA 2UYFA 4ESWA 1GTKA 2WKYA 3FJ7A 4YZZA 4F3BA 3LSXA 4F3GA 3O9PA 4F22A 4QSDA 5K2YA 2RKMA 4Z0IA 4QRZA 3T22A 3V83A 3OO6A 4FATA 1NNPA 2XX9A 2I48A 3T66A 1D9VA 5F1QA 2H98A 3RNNA 3K0VA 3VVEA 5AA4B 3THIA 3FVNA 3U94A 2FA7A 4DCYA 5B7DA 4LP2B 3MJNA 4QHQA 3SEYA 5CRYA 3R7XA 1USYH 1P1QA 4R9GA 4LZ8A 1JQFA 3QK6A 5FHMA 4I62A 4I8CA 3I3VA 1B4HA 3TUSA 4C1UA 1LFHA 1Y1MA 1ZBMA 3M3FA 3CFZA 3MUQA 1N84A 3MPLA 2XX7A 1ZIUA 2F36A 4G4PA 4G68A 4RXLA 4FIMA 3UK4A 5KCJA 1LLSA 3H3GA 2DYXA 1URGA 2H9BA 4KCDA 1P1WA 3DP6A 4NMYA 3N6UA 1UTBA 3T93B 1B2HA 3TTKA 1S50A 3K1NA 4KQPA 5CMBA 3PD8A 4LA9A 3PUXE 4F1UA 4UA8A 2V84A 3QXMA 1BP5A 3SKPA 2DXYA 3TCHA 1RYXA 4GXAA 1H76A 3BKIB 1P1NA 3AXFA 3TCGA 5I59B 2ZYKA 1O64A 5JEIA 3E13X 3U1OA 1IXIA 3LUYA 1LBCA 3OMBA 1MS7A 4DXBA 3KN7A 2Y7IA 2A5SA 2D5WA 2DE2A 2XXQA 3HPIA 4OFJA 1O63A 3U8QA 5H8FA 2RINA 4TQUQ 1WODA 1BKAA 2RC8A 1POY1 2QS3A 4F1VA 2QPQA 1FTKA 4KR5A 4YB7A 1B40A 3PPNA 2ZYNA 3ZKLA 4IO7A 4H6DA 3LR1A 2DE4A 1MM7A 4R73A 4O3BA 4NF5A 3VVFA 5CBSA 4KFQA 1P1UA 1B9JA 1WDNA 2VHAA 1DPPA 3OSQA 4R2FA 4P11A 5ITPA 2UVHA 2VD3A 2XHDA 2ZNSA 1HSLA 1Q35A 4GWOA 1FQAA 5I58A 2I58A 4FJPA 2P2AA 2AYSA 2F34A 4IO2A 1YCJA 4RY1A 2D21A 1JW5A 4NTLA 1Y9UA 1DSNA 2UYEA 4H5FA 5JTYA 3VE1B 1JETA 3TELA 3KG2A 4XKRA 3QYTA 3MVXA 4EF2A 4MBPA 1PDAA 1MQGA 2ZNTA 5FTIA 2NUVA 3QIMA 4X48A 1LSTA 4G2ZA 5TP9B 2M8CA 1SI1A 3H6WA 2V93A 1M5FA 3FUZA 3RTWB 3TCFA 1Z7NE 1VFDA 3VVDA 1P1OA 3S4UA 4Q5TA 3MW0A 1QKBA 1CE2A 3CSBA 3IJXB 5AA1A 3UA8A 1OLAA 3T9UA 3PUVE 1PB9A 1PBPA 3A09A 3PMVA 1DMBA 3SDFA 3C4MA 1M5BA 2Y7WA 1MXZA 2OLBA 4ELQA 3KBRA 3IAZA 1RYOA 2HZKA 2QS4A 4EQBA 3I6VA 3MVWA 1A8FA 2OJTA 1XHYA 4H5GA 1I69A 4IO5A 1KWHA 1NKXA 2XXIA 4F19A 3RUMA 5H8HB 2P1SA 5L9MA 3EHSA 3OOAA 1MPBA 4R72A 4DXCA 3IO4A 3IB1A 3K1MA 4O3AA 4EF1A 1IUDA 1LGBC 4OVJA 2DVCA 4F18A 3IO6A 3IOUA 1D9YA 5AE4A 5ISUA 1F9BA 3C35A 3HO7A 5CMCA 5I57B 2R71A 1MQDA 1BIYA 2I49A 4YU0A 3H06B 1YPNA 5M2VA 1B51A 3IR1A 4YAHX 3T9HB 4MH5A 1CB6A 3MVZA 4FE8A 4JWYA 3MC2A 1LFGA 1B6HA 3B6WA 4PETA 3PD9A 3UN6A 4KI0E 1NH7A 4F31B 1XVYA 1H44A 1LAXA 1A54A 3PV0E 5I57A 2ZMBA 1FQDA 3S9LC 3PU5A 1N3WA 3FXRA 2XD3A 3K6VA 2DVZA 4DCXA 4ESXA 3W9VA 5JK4A 3KGCA 1N7XA 1O7TA 4PQJA 4UACA 3TMGA 4AB5A 2PT1A 3N26A 3U93A 2I3VA 2HZLA 5TPAB 4NF4B 3N6TA 3TDJA 1UIVA 2V3UA 1ATGA 3B6TA 3IJOB 3G3HA 1SW1A 4GVOA 2NOOA 5L9SA 1FQCA 3MZ1A 2B3BA 2I6EA 5CMKA 1TXFA 4ZZEA 5A5XB 2Z8DA 4FEBA 1OQGA 4LUBA 4NF8A 2I3WA 4LQ5A 3RQTA 4G8MA 3H03A 2XX8A 4H8IA 1BTJA 1ZTYA 2CMOA 2XXHA 2Q2AA 1B3EA 2XXWA 1LCFA 1R9LA 3TAJA 2Q88A 2F7CA 2VOZA 4OMBA 5BUUA 3LSFB 3KOTA 5HBCA 1QULA 2Z8EA 3CFXA 2NXOA 4JDFA 3MWBA 4BDRA 2B3FA 3MP8A 3E4RA 3KJ7A 3SERA 2GHAA 4BDNA 3VLUA 4OZ9A 5H8QB 1MY3A 4EXKA 2IEEA 4DZ1A 2A5TB 2HAVA 4H1XA 3MP6A 2O68A 2QRYA 1D3KA 4KPTA 1MPCA 3VXCA 1OIBA 2DS9A 2OBGA 3G3FA 3P7IA 2FNCA 1EZPA 2Z23A 4BLAA 1YAEA 1LAFE 2RC9A 1UTHA 2QSXA 3K6XA 5AA2D 3UORA 2X26A 1B4ZA 4THIA 4NF6B 1JW1A 1H45A 2LAOA 5I56B 2I0CA 1MDP1 1XC1A 3H7MA 1SI0A 1Y1ZA 3IOVA 3N5LA 3S2VA 2XXRA 1N04A 2D3IA 1SVXB 4YMAA 3CG3A 3S9MC 3C32A 4R6YA 4F3PA 1B5HA 3O6HA 2GH9A 1B0LA 4G8NA 4GLIA 2O6AA 4BDMA 1R1NA 2HFBA 1L5TA 3ILUB 4FEDA 4C1TA 5AA4A 4GL0A 4QFOA 2ABHA 1SW4A 4R9FA 5AA2B 4RA1A 1OMPA 3TKDA 4MFIA 4ZEKA 3RTFB 4RNSA 3C33A 3KN3A 4JWXA 3CFLA 1NNTA 3SEXA 1Y3NA 1NH8A 2GRVA 2YLNA 2NVUB 5AA2A 3GZGA 1B5IA 4U1OA 4YB5A 3CVGA 3O29A 3TQWA 1FW0A 4F2QA 2OWTA 1IXHA 4ZZAA 3K01A 2ZYMA 3DM0A 1M5CA 1B52A 4JXIA 4XKQA 3G3IA 3UGWA 3ZS6A 4JB7A 1PEBA 3H6VA 1Y3PA 5I84A 3IOTA 4MLVA 3TTRA 3RT8A 3RN8A 4HS7A 1GVCA 4JSOA 4OENA 4KHZE 5DYHA 4GL8A 5FTHA 2Y7KA 1NL5A 3L6HA 1MY4A 5I59A 4R75A 3VFJA 1H3DA 4IO4A 4IO6A 1MXYA 5H8NB 4H65A 4WXJA 3H6TA 3QUFA 2R9JA 3TTNA 1URDA 1R6ZA 2V25A 4PFUA 1Y20A 2O7IA 4YKJA 1IIWA 1LBBA 3O66A 3PUZE 4ZEBA 1A8EA 1R9QA 3E3KA 3C31A 4JWOA 3RLFE 1N76A 3Q25A 1DOTA 4RPOA 4I9DA 4DDDA 5KDTB 1Y4CA 5DEXB 1QUKA 2DP8A 1IXGA 2DWIA 1TWYA 2ALUA 4H0WA 1B7HA 1SYHA 1MH4A 4IY5A 1PB8A 3G3JA 1SDXA 4GQOA 2Q9TA 2QMXA 3JV9A 5L9OA 1PC3A 4XXUA 3IK6B 2RC7A 4Q30B 2O7UA 4DIGA 4RK2A 2THIA 1MXXA 3RY3A 1PBQA 3Q26A 2DWAA 3ECRA 4E0WA 3JYRA 4MF3A 3KFMA 2OK2A 3TTLA 1NMUA 3OO9A 2Z8FA 1B3GA 1FTLA 4FORA 3OENA 4LZ7A 2XD2A 4ND9A 5TU0A 3PMXA 4IO3A 1ZLQA 1AOVA 1AL3A 5FHNA 1FTOA 3PUWE 5ITOA 5TP9A 1BLFA 3Q27A 4OETA 1JW4A 1B7UA 2XXUA 2O1LA 3O28A 3BFTA 1MQJA 4YKIA 1XOCA 1POTA 3FATA 5I2NB 2UVIA 3KZGA 4G68C 3PMWA 4PFYA 2GFEA 4OFOA 3S9EA 3TFLA 3G7WA 1MXVA 1RKMA 2PX1A 1MH3A 4EXLA 1TFDA 4YICA 1JNFA 3PPOA 4YMBA 3SETA 2DXRA 1JEUA 3TQLA 3OD7A 2F6GA 4ELOA 5HM4B 4OHNA 3WAFA 5DVFA 2OCUA 4QSCA 2DSFA 2H5YA 4EDPA 2DQVA 4GOTA 1HSEA 3M3KA 1ZKBA 5H8HA 3C36A 3QUJA 4ZECA 4HW8A 4WEDA 2HEUA 3SEVA 1XS5A 3VLVA 4U2RA 3K02A 3N94A 4PP0A 3H6UA 2G93A 1B0HA 2I0BA 4P0IA 3FGSA 2P0SA 5BWJA 3VV5A 4RJZA 4ELRA 1N3XA 4HCYA 2E0SA 3FJGA 1US4A 5EYFA 3M8UA 3EN3A 2YJPA 3V5AA 1MXUA 2Y7PA 1DTZA 3MQ9A 1LFIA 4WKMA 4H8JA 4BDLA 5IAIA 5I2KB 5CC2A 2F7AA 2E1SA 3ONMA 3HSTA 2IA4A 4PFTA 5DTBA 3FASA 3S9NC 3CSGA 1NNFA 4Q0CA 5TPAA 1T0KA 2HQ0A 4NF4A 5CI5A 3SEWA 1PB7A 2XXYA 4R2BA 3TODA 1B1HA 4ECFA 2OZZA 1B7ZA 1IQ7A 2F7BA 2ANJA 4OWDA 1VR5A 4R6KA 4YB6A 1S7YA 4LONB 3QSLA 1B3FA 3B7DA 3H4ZA 1ZJLA 4HCWA 1TFAA 5A5XA 4M4GA 3LSLA 3HN0A 1DPEA 1TT1A 3TTMA 3CRBA 4GIZA 4ZEIA 1FTMA 5K2XA 2F6PA 3K2DA 3DELB 1B3LA 3JZJA 3ZSFA 1NFTA 2REJA 2VP1A 3VDFA 4BDOA 1I6BA 3TYHA 4NWDA 5F7VA 4WEPA 3DP4A 2PYYA 2NWJA 1H43A 1Y3QA 3MPKA 2PBWA 4L17A 4POXA 4U1ZA 1FQBA 4F1YA 2X7PA 2RCAA 3KOSA 2ZYOA 4HTGA 3SEUA 4IY6A 5H8QA 2UVGA 2V3QA 3FD3A 1N7WA 1MQIA 4FECA 4Q8RA 3IL1B 4KCCA 4X1DA 2A5TA 4LVQA 3DP8A 2VGQA 1LB8A 4ELPA 2VD2A 3GXAA 1MY0A 1AH5A 3EQ1A 3PPRA 4TLLB 3W15C 3FXQA 1QUJA 4KYSA 1GV8A 3VXBA 3PUYE 4P0GA 3T96B 4XKNA 4ZEFA 2XXVA 4EUOA 4G68B 4OYVA 3CR9A 2QS1A 4NF6A 3TPAA 3D4GA 3E9XA 3IB2A 2H4IA 5KCJB 3KJTA 3OEKA 5I56A 1OVTA 5EHSA 3HHFA 3K6WA 4GXSB 4KYDA 4QFLA 3EHTA 4DE8A 2ONRA 1JVXA 1UTBB 3C34A 4FAJA 1YTVA 4XIGQ 1MPDA 2CZLA 3GBAA 2OWSA 5FHOA 3KN8A 1URSA 1A55A 5DVJA 4G8HA 1I6QA 4JBZA 4ISUA 2HAUA 3OO7A 4OXVA 3T9XB 2AIXA 2REGA 1UIUA 1MDQA 3O6GA 2ESNA 5CMMA 3K6UA 1LAGE 5H8FB 2YPNA 4F2OA 4OFLA 2Y84A 1MY2A 1QKAA 1ZU0A 4ZEDA 1SQYA 2PT2A 4GD5A 3V89B 4U21A 3GLBA 4QF9A 4OTEA 2F78A 1EZ9A 1GGGA 1EZOA 1Y4TA 3BBRA 2R6GE 4ZE9A 3FV1A 5IKBA 4DLDA 4R74A 2HCAA 4NF5B 1SD3A 3IOWA 4IB2A 5L8DA 2B65A 4QSEA 3ODBA 3U72A 2I4BA 1UQWA 1FCKA 4OERA 4KYEA 3OELA 4RPNA 3Q28A 3FIRA 5I58B 4OQOA 4NE4A 3CI8A 1M5DA 5CM6A 4POWA 4F39A 3DLNA 4YKKA 1LB9A 1Z7ME 3TZAA 2UVJA 4ZDMA 1OVBA 3G3KA 3FVOA 5H8NA 1N0TA 1SBPA 5JTYB 4OEVA 4U22A 2F97A 2AL5A 1WVJA 2DE3A 3G3GA 2GHBA 2RF1A 1SW5A 4JSDA 1IITA 1EH3A 4YKPA 1MM6A 1DTGA 1LCTA 2Q89A 2F35A 4H67A 4XTCQ 1SYIA 1OQHA 3OSRA 4AB6A 3KSXA 5EHMA 4QFPA 1D4NA 4IGRA 1IXCA 1HSJA 3FXUA 3PGFA 5KDTA 5J1DA 5DEXA 1MRPA 1B32A 1M5EA 1ANFA 4LQ2A 3OO8A 1VFEA 1QJMA 1EU8A 3IB0A 3USDA 4NEDA 3T9VA 3K4UA 5ELVA 4BDQA 3ILTB 4MLQA 2O51A 3UP9A 4OEUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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