3OEKA

Crystal structure of glun2d ligand-binding core in complex with l-aspartate
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
281
structure length
270
Chain Sequence
QHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNREKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARGTTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit epsilon-4
publication title Ligand-specific deactivation time course of GluN1/GluN2D NMDA receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 82
structure length 270
sequence length 281
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oekA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oekA02
3RNNA 3EPEA 2F7AA 3IO6A 4XKRA 4HCWA 3QK6A 4NF8B 1EZPA 2V3UA 3N5LA 3FVNA 2F7BA 4K3FA 3QAXA 5I59A 3H03A 3EHUA 1A99A 3QYTA 3A09A 4G8NA 2F36A 5FHMA 2UVHA 1N0TA 3LSFB 1RYOA 1Y9UA 3PMVA 5F7VA 3BFUA 4OVJA 4Q0CA 2QPQA 4POWA 3JZJA 2DE4A 4ELRA 3A3CA 2H99A 5I2NA 4GF8A 2V3TA 1B51A 3MPKA 4KCCA 1LBBA 2Y7PA 3O66A 5JEIA 4ZECA 3SEXA 2OBGA 2RKMA 4NEDA 5ISUA 3B6QA 1MY2A 4OWDA 1SVXB 4QFPA 2O1MA 2XXTA 2DWHA 1LB9A 2DYXA 1S7YA 4ZDMA 4NF5A 3CG3A 1MH4A 1KWHA 1USYE 1UTHA 4FE8A 4H8JA 1DPPA 3G3IA 1Y20A 4JDFA 4F39A 2CMOA 1VFDA 1N3XA 2OK2A 3H7MA 4DE8A 2R71A 2F8DA 4Z7EA 1OLAA 2O6AA 4RYAA 2ZNUA 1P1WA 4FECA 4G68C 1DOTA 3BFTA 5AA2D 3MZBA 1NNPA 3FV1A 1FW0A 2Z8DA 1B9JA 3UIFA 4LUBA 4R75A 2XXQA 2NOOA 3W9VA 1JEUA 4IO6A 4IY6A 5CBRA 3T9UA 2XXIA 3HPIA 1Y3PA 3V8XB 4F18A 4OEUA 3FZVA 3KOTA 5I57A 2RC7A 4JB7A 1YTVA 4RPNA 3O2AA 5KZTA 4YKKA 4R6KA 4F2QA 4BDLA 4NF6A 1Y1ZA 3IJXB 4PFUA 3VDFA 1FTMA 4DCXA 3QUJA 2F78A 1GV8A 2PT2A 3O6GA 3L6HA 4JSDA 4GFRA 3EQ1A 2B3FA 3Q27A 3KN7A 1JQFA 4YKIA 3RTFB 1UIUA 3MP6A 3LBSA 5FHNA 3KOSA 2Q9TA 2Y7WA 4F3SA 1DTZA 3QXMA 3IO4A 1Z7NE 2F97A 1AIVA 4LATA 4F19A 3C31A 4O3BA 1PDAA 5L8DA 1P1QA 3TQLA 5L9MA 1PB7A 1IXIA 2DE3A 4OERA 1QUJA 4NF4B 1LFIA 3G3GA 5KDTB 2AL5A 3CR9A 3KJ7A 4KCDA 3T22A 3DP6A 3MW0A 3CSBA 3U93A 2XXPA 3U94A 3GBAA 1MXXA 2THIA 5TU0A 3LSWA 4YKPA 3ZSFA 2UYFA 3IK6B 5FTHA 1R6ZA 1O63A 3I6VA 2XXWA 1MQHA 3DELB 2UYEA 2ONKE 4P0IA 1TWYA 1IUDA 4OXVA 2Q2AA 3IOUA 5LOMA 4XIGQ 2X7QA 2PX1A 3SEWA 5TPAB 4GWOA 4THIA 2QL3A 1OMPA 4XKQA 1YAEA 3EHSA 3CVGA 4H5FA 3RTWB 3F11A 1MXYA 5HBCA 4YB5A 4DZ1A 4MH5A 1TFDA 1H43A 1XS5A 3KN8A 4ZE9A 4ECFA 4OETA 4F1VA 4F3GA 5H8QA 4N13A 2FA7A 4GLIA 4WEPA 3VLVA 5CRYA 3KSJA 1FCKA 2D21A 5DEXA 3R6UA 1NNFA 1Z7ME 1LBCA 3T9VA 4RK9A 1GVCA 1MQGA 4ZE8A 4IO4A 3K0VA 4DIGA 3O28A 1LSTA 4MLQA 1P1OA 1B6HA 2AL4A 3TUSA 1H44A 3MVWA 1MM7A 4ONYA 3OOAA 5CMMA 3MJNA 2HZKA 3OO8A 3IB2A 5DVIA 3OELA 1QKBA 2DOJA 2YJPA 1N7WA 5DVFA 3TZAA 4H6DA 1HSJA 3MZ1A 3O97A 4YZZA 3OENA 3KBRA 2XXXA 5AA1A 2NUVA 3THIA 2D3IA 5JTYA 5ITOA 3OO7A 3OMBA 2HXWA 3H3GA 2X7PA 1BIYA 4G77A 3Q28A 2I58A 4C0RA 3I5OA 3K2DA 2X26A 5EHMA 1H45A 5HM4B 3HHFA 1US4A 2F6PA 4ESWA 3EHTA 1FQAA 1B52A 1POTA 3SERA 4BDRA 3G3JA 3MVXA 1MQJA 1LAFE 1SW4A 1ELJA 4XTCQ 4LZ8A 2H9BA 1JW5A 1B58A 3D4GA 1ZJLA 4YMBA 3UA8A 2ANJA 1DTGA 4I9DA 2E0SA 1D3KA 2DQVA 3PU5A 4P11A 2QSXA 2Z8EA 4OESA 1BTJA 1I69A 4Q5TA 3MP8A 2HEUA 3MC2A 4OFOA 4LA9A 5CC2A 3H6VA 5I2KB 4JWXA 4NF8A 2DXRA 1MQIA 3C33A 1O64A 2RF1A 3K1NA 2DVCA 3ECRA 1B5HA 4FEBA 4XKNA 1URGA 1SYHA 5K2YA 5FHOA 4ZEFA 1SD3A 4ESXA 1Q35A 1M5CA 2QRYA 3RY3A 2DVZA 3CI8A 3UP9A 3FUZA 3OEKA 3TELA 1LFHA 4R2FA 3TEPA 3OD7A 2LAOA 2ZNSA 2OWSA 3JV9A 2I3WA 4F29A 1N76A 3OO9A 4LVQA 1QVSA 1F9BA 1SQYA 4YB7A 2GFEA 4O3AA 4H65A 1SW5A 5ELVA 4EUOA 1B05A 3B6WA 2O84X 1LLSA 1N3WA 1USYH 1OVBA 1OVTA 3FJ7A 2Y7IA 2XXHA 1LFGA 1NL5A 4ND9A 2O7IA 1MQDA 1SI0A 1FQFA 4RA1A 1P1UA 3IORA 4G68B 3RLFE 3E3KA 4ZZAA 4LONB 2HAVA 3IAZA 2PT1A 3A3UA 2BJJX 3BBRA 4Z0IA 3UGWA 5L9OA 3N6UA 2I4BA 4X1DA 2VP1A 2F34A 2GRVA 1MXZA 3HO7A 3PUYE 3ZKLA 3TTRA 1Y4TA 4NWDA 4ZEIA 3PD9A 4PFWA 3FV2A 1VE4A 1MPCA 4KYEA 4TLLB 2G29A 4EDPA 5HPQA 4F3BA 3PPPA 2HZLA 2DE2A 5J1DA 4JXIA 1D9YA 3TTNA 1FQEA 4U1ZA 1T0KA 4G8HA 3KSXA 1M5FA 4OZ9A 3T9XB 3M3FA 3SEVA 2XXUA 1FTJA 3CG1A 5I58B 3S2VA 3WAFA 1JETA 4U22A 3FJMA 3IOTA 1TFAA 3HV1A 3C35A 4ZEBA 4DLDA 3N94A 4RPOA 3PPOA 4F31B 3DLNA 4GRKA 1B3LA 5DYHA 1ZMGA 3TCGA 3TTKA 1LAHE 1P99A 3OSQA 1AOVA 2GHAA 1RKMA 1HSLA 3V83A 1D9VA 4QF9A 4O3CA 1ZBMA 3CFLA 3PUVE 3MQ9A 2F35A 2PMSA 3CIJA 2QS4A 2D5WA 4NF4A 1UTBB 2AIXA 5KDTA 2XD2A 3PPQA 1B3HA 3ODBA 3TTLA 1B40A 1MM6A 5ITPA 1TXFA 3MZ9A 1BLFA 2DWAA 4H67A 3FXUA 3CFZA 2M8CA 2XXRA 4X9TA 4GXAA 1M5BA 4RJZA 3Q26A 3IB0A 4PFYA 5TPAA 1HSEA 2O69A 4QHQA 3T9HB 4GVOA 1B5JA 3ILUB 2O7UA 1A8EA 1QUKA 1IXGA 3TDJA 5CM6A 2VGQA 4JBZA 4QFKA 2Q88A 4LZ5A 5H8NB 2UVJA 1TT1A 4HS7A 1B4HA 4GQOA 4ZEDA 3PV0E 1A55A 2NVUB 2FYIA 1A7LA 3OEMA 5CMBA 3T93B 3S4UA 3K6XA 3RGYA 2I0BA 1QJMA 2P0SA 4YB6A 4R9GA 1NNKA 2V93A 5DTBA 4G8MA 2RINA 4EQBA 2UVIA 4ELQA 1XC1A 4LZ7A 4UACA 5EHSA 3VVDA 3KZGA 1MXVA 3PPRA 3B6TA 3TYHA 1EZ9A 4QSCA 4MFIA 4OFJA 4GOTA 1FQBA 3GXAA 4KQPA 3HHGA 4YAHX 1PB9A 4KPTA 4OTEA 1N7XA 4ELPA 4OHNA 5I56B 4F3PA 4KFQA 2Z8FA 5FTIA 3RT6B 2I6EA 1IXHA 2GHBA 3S9NC 4AQ4A 1MS7A 4IO3A 1NH8A 3LC8A 4XKPA 4HCYA 2O1LA 3I3VA 1AL3A 3TKDA 3MAMA 1MPBA 3KEIA 2ZYKA 2I48A 3H06B 4N6PA 3GLBA 4QSEA 3C32A 1SW1A 2H25A 1ANFA 5H8SA 1Y3QA 4H0WA 2XHDA 2R9JA 4BLAA 5KCJB 2IA4A 3IR1A 4IY5A 3RPWA 4F22A 2E1SA 3MVZA 3MWBA 1P1NA 1CE2A 4EQ7A 1VFEA 5I84A 1OIBA 4GXSB 5AA4B 1H76A 1MG1A 5I2KA 3H6WA 1QULA 5AA2B 4PE5B 1NH7A 3FVOA 5K2XA 2Y7RA 4PFTA 4RY1A 1GTKA 4IGTA 4QFLA 1NKXA 5CBSA 3FGSA 4ISUA 2H4IA 3SDFA 2RCBA 3UK4A 1WVJA 1B0LA 2IEEA 4R6YA 4FIMA 1XOCA 2V25A 3PUWE 3G7WA 1JEVA 4Q30B 3KN3A 3MPLA 4R2BA 4ZEKA 2FNCA 1PB8A 3K1PA 4WXJA 5B7DA 3KFMA 1LB8A 2Y84A 4FATA 4YMAA 3EN3A 5H8HB 3PMXA 4I8CA 1US5A 3DM0A 1EH3A 2P1SA 4GL8A 4QFNA 2O51A 3S9MC 2HCAA 1I6AA 3OXNA 3K6UA 2A5TB 1B3EA 1M5DA 2PVUA 5ICTA 2VD2A 2ZYOA 1M5EA 1PEBA 1IXCA 4G68A 1IQ7A 1OLCA 1PBQA 4KR5A 4NWCA 2ZMBA 5CI5A 2ALUA 3N26A 1SBPA 3D4CA 3IB1A 1B7HA 4DXCA 4QSDA 1MPDA 2DWJA 4BDOA 3P7IA 3TCHA 3PMWA 1WDNA 1AMFA 2XD3A 3EF7A 5TP9B 4DCYA 4G2ZA 2OZZA 2I0CA 1B4ZA 2R6GE 3TAJA 4QFOA 4U4XA 1Y3NA 4G4PA 3Q25A 3U1OA 3VVFA 2VD3A 1ATGA 3K00A 1N84A 3SESA 5B70A 2Q89A 1RYXA 5ICQA 3W15C 1B3GA 1MH3A 4AB5A 2UXAA 5I58A 4XXUA 2YPNA 3VLWA 5AA3A 3K4UA 2QS1A 4H1XA 1PC3A 1MDP1 2F6GA 3HCQA 4F1UA 3PUXE 4R74A 4EQ9A 2XX9A 4E0XA 1O7TA 3VE1B 2REGA 1YPNA 1FTLA 4IB2A 2F7CA 5JK4A 2ZNTA 4BDQA 4HW8A 5IAIA 5EYFA 5CMKA 3CFXA 3RQTA 4EF2A 4U2RA 1SDXA 4KI0E 5F1QA 3SEYA 5A5XB 2P2AA 1LAGE 4RNSA 4WKMA 1OQHA 1POY1 5H8FB 3JYRA 2UVGA 1B46A 1UTBA 1QW0A 1BKAA 2XXVA 4DXBA 1SI1A 2ESNA 4LQ2A 2Q2CA 1IEJA 3KGCA 2H98A 2KLFA 3FATA 3M3KA 1LCTA 1LCFA 3ONMA 1B32A 3R26A 2CZLA 1EZOA 3B7DA 5BUUA 2I4CA 4UA8A 1VR5A 4EXKA 1MY1A 5I59B 1B2HA 4LQ5A 3O6IA 2OWTA 2VOZA 1ZKBA 1B0HA 2VHAA 2V3QA 2NXOA 2DP8A 4U1OA 3V89B 3UN6A 4ZZEA 4OQOA 4X48A 3FVGA 3PPNA 4R73A 2RC9A 3K1MA 5I2NB 3S9LC 1IZ1A 5AE4A 2ZYNA 5H8NA 2HQ0A 3ZKKA 4R9FA 4P0GA 5IKBA 2ONSA 1FTKA 1UIVA 1YCJA 1FQCA 3FASA 3IL1B 1S9TA 3CRBA 3QSLA 4L17A 3LUYA 3VXCA 3E13X 1URDA 3KG2A 1JNFA 4MF3A 4R6HA 4NF5B 2OCUA 4WEDA 4OEVA 4IGRA 1UTHB 1DPEA 2RC8A 5M2VA 1B1XA 2B3BA 2I49A 4YKJA 1NMUA 3FXQA 4IO5A 4IO7A 1MXWA 2ONRA 4DDDA 1I6BA 3TFLA 3O6HA 3DP8A 4PQJA 3CSGA 2OJTA 2RCAA 2NWJA 1JW1A 1XVXA 4IO2A 3TPAA 4H5GA 1AH5A 2QJEA 5I56A 2ZXTA 4OENA 2W7YA 3N6TA 2QS3A 4C1TA 3GBBA 1J1NA 4QRZA 3AXFA 3C34A 3RT8A 4I1DA 4DXUA 1L5TA 5I57B 1Y1MA 1CB6A 4YICA 2ZYMA 3FD3A 4NF6B 4Q8RA 3K01A 3O9PA 1ZIUA 2GH9A 1ZLQA 2WKYA 1S50A 1LGBC 4GL0A 2REJA 3VV5A 3TMGA 3VFJA 1B5IA 3E4RA 5KCJA 2HFBA 1XT8A 4I62A 1MDQA 5DT6A 4ELOA 5BWJA 4TLMB 1MRPA 4E0WA 3G3FA 4YU0A 3IOWA 4M4GA 3U92A 3S9EA 1JW4A 4HTGA 5AA4A 4RK2A 3E9XA 3SETA 3FJGA 5AA2A 4PP0A 5DVJA 1I6QA 4F1YA 1WODA 3T66A 3RN8A 4F2OA 3M8UA 3OSRA 3TODA 3HSTA 2XX8A 1ZTYA 4FAJA 3IX1A 1MY4A 3V5AA 4FEDA 1A8FA 1B7UA 1OQGA 2DXYA 1N04A 3K6VA 3L6GA 3U72A 1PBPA 1XHYA 3DP4A 1ZU0A 4EXLA 4FORA 4R72A 4JWOA 3K02A 3GZGA 1GR2A 1NNTA 5H8HA 1IIWA 3QUFA 2ABHA 2OLBA 4POXA 4BDMA 1UQWA 3UORA 3PD8A 4BDNA 5L9SA 1QUIA 3TCFA 3LSLA 3PGFA 3MP1A 2AYSA 1FQDA 1R1NA 1B1HA 4H8IA 3FIRA 1URSA 1SYIA 2A5TA 1II5A 2B65A 5H8QB 1D4NA 2PYYA 2Q8JA 1SW2A 4OMBA 1R9LA 4TQUQ 4KYDA 3G3KA 4FJPA 5DEXB 2F5XA 3TTMA 3MVYA 3W9WA 4C1UA 5CMCA 3QIMA 3T96B 4U23A 2H5YA 3M3LA 4KD5A 1IITA 1JVYA 3ZS6A 4NMYA 2XX7A 4JWYA 1EU8A 4GIZA 3VLUA 3OO6A 2PBWA 5TP9A 3VXBA 4AB6A 1R9QA 4ZS9A 2O68A 3O29A 1B3FA 4NTLA 4X1BA 1JVXA 1DMBA 2YLNA 2DS9A 2A5SA 3R7XA 2QS2A 3K6WA 1A40A 4TOZA 4RXLA 1QKAA 5JTYB 3H6UA 2QMWA 4MBPA 4LP2B 4OYVA 2G93A 3ILTB 1Q1KA 3KJTA 3IJOB 2Z23A 2DWIA 3VVEA 2HAUA 4U21A 1FTOA 3H6TA 3LSXA 3LR1A 1GGGA 3BKIB 1H3DA 3H4ZA 2V84A 1MXUA 4JSOA 3SEUA 3RUMA 3SKPA 4MLVA 1MY0A 4GD5A 1Y4CA 3FXRA 3HN0A 2I3VA 2Z22A 3USDA 4KYSA 2QMXA 5A5XA 1VSOA 4OFLA 3C4MA 3MUQA 4M1VA 1XVYA 5H8FA 3IOVA 2DSFA 4PETA 2Y7KA 2XXYA 3MBPA 4NE4A 3U8QA 3C36A 3C9HA 1DSNA 1B7ZA 1NFTA 3TQWA 1LAXA 4U4SA 3PUZE 3WAEA 1A54A 4EF1A 3FVKA 1BP5A 4KHZE 4N07A 3Q29A 1MY3A 3G3HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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