3OEKA

Crystal structure of glun2d ligand-binding core in complex with l-aspartate
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
281
structure length
270
Chain Sequence
QHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNREKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARGTTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit epsilon-4
publication title Ligand-specific deactivation time course of GluN1/GluN2D NMDA receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 270
sequence length 281
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oekA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oekA02
3PPRA 2UVGA 4I1DA 2I6EA 3MVZA 3KSXA 3VLVA 1IXGA 3G3KA 4ZS9A 3KJTA 1B3HA 4YB6A 5IAIA 2VP1A 4XXUA 4RYAA 3VXCA 1QULA 3TKDA 4G8HA 5ITOA 1SW5A 3VLUA 5HM4B 1JNFA 2AL5A 1IXCA 3K0VA 4OTEA 4RJZA 1EH3A 2QRYA 3HO7A 3SESA 4N07A 3K2DA 3VFJA 4R74A 4LQ2A 4HCWA 3PD9A 2VD3A 1UIVA 2G93A 1USYE 1YCJA 3LSXA 1USYH 4ESWA 3S9LC 2GHBA 5I2KA 3E3KA 1M5EA 3MZBA 4JWXA 4WEDA 5JTYA 3B6WA 3VE1B 4KI0E 3FVGA 1AMFA 3RPWA 4TLMB 3LSWA 2DYXA 2Y7RA 1OLCA 5ITPA 2XX9A 3E9XA 5CC2A 2XHDA 4U2RA 2DP8A 1M5DA 3KG2A 4G2ZA 5DEXB 1OQGA 2O1LA 1Q1KA 4EQBA 5CBSA 4U4XA 4OVJA 1Z7NE 1DPEA 4IO6A 4C0RA 1SI0A 1LGBC 1B0LA 5L8DA 1BP5A 4EXKA 1B5JA 3USDA 4GXAA 1H45A 2I3WA 3IOTA 1URDA 2Z8FA 1FTMA 4DIGA 1EZ9A 5I56B 2PT1A 4NTLA 3CFXA 4MBPA 3I3VA 3M8UA 4PFWA 2RF1A 4F29A 4OXVA 4BDQA 1N76A 4OFLA 5EHMA 3OO6A 1JW5A 2F35A 4ISUA 3I5OA 1HSEA 2QSXA 4UA8A 5TPAA 4OZ9A 2DWJA 4KCCA 5CMCA 2D3IA 1UTBA 4ECFA 4ONYA 5EYFA 3IO6A 1OLAA 2I4CA 1B3LA 1DOTA 3OO9A 1URGA 1Q35A 1ZJLA 1II5A 4JXIA 2OZZA 1YPNA 2DSFA 2NXOA 1EU8A 1FCKA 2F7CA 1IUDA 1ZTYA 1POTA 1XT8A 4QFOA 4F3GA 5H8QB 3EHSA 3ECRA 1MDP1 1UIUA 4FEBA 2I3VA 3PD8A 3HCQA 2ZMBA 3MJNA 4F1UA 3PMVA 4IY5A 2QMWA 1SW2A 2DXYA 3QXMA 4H8IA 1QJMA 5H8HA 1L5TA 1I6AA 3PPNA 4E0XA 1A8FA 3FXUA 5B7DA 4LVQA 3VV5A 4R9GA 3N5LA 5I58B 1Z7ME 1I6BA 4PE5B 5I57A 2BJJX 1FQAA 3CG3A 2F97A 4G8NA 3MVWA 1H3DA 3OOAA 5DYHA 3T66A 4BDNA 3FXRA 4LZ7A 4YB7A 2UVHA 1MG1A 3M3KA 4H8JA 3IB0A 5EHSA 3EQ1A 1LCFA 3MVXA 2E0SA 1MPBA 3OENA 3TUSA 4F18A 2I0CA 5AA2B 4R2BA 1CE2A 2DE2A 4LUBA 3K01A 3EHUA 2F7AA 5KCJA 1SI1A 1SVXB 4X1BA 1TFDA 4POWA 4QRZA 4YB5A 2OK2A 4KR5A 1FTLA 2A5TA 4OEVA 3O66A 4ZDMA 4HCYA 3DLNA 1NFTA 3Q27A 3KN8A 3O28A 1P1OA 1I6QA 3GZGA 4H5FA 3H6VA 4I62A 5CMKA 1M5FA 1B7UA 1XHYA 3TELA 2Z8DA 2HEUA 3TTRA 4O3BA 5CBRA 3ONMA 1OVTA 3OEMA 1LAFE 4LZ8A 3L6HA 1B05A 1IXHA 1US4A 4YKJA 3MBPA 5F1QA 1ZLQA 1B32A 1Y3QA 3W15C 1DPPA 1O64A 4UACA 3QYTA 4DCYA 3T9UA 5I2KB 5LOMA 4OESA 4R73A 4RK2A 2X26A 1LBCA 5ELVA 5JTYB 2H99A 3SEVA 4R72A 5I59A 1Y4TA 3C31A 2RINA 3S9EA 5K2XA 1MY1A 2FNCA 3SKPA 3FUZA 4LP2B 3EF7A 2UXAA 4KPTA 4H6DA 3T9HB 3MZ1A 1B3FA 4C1TA 1S7YA 2PX1A 4XIGQ 1B3EA 4NF5A 3LR1A 4G68C 4LA9A 3VVFA 2Y7WA 3MUQA 4TQUQ 3O6IA 3V89B 3PUYE 1F9BA 1BKAA 4GD5A 4YKIA 3CVGA 3DP8A 5CM6A 1N04A 3KN7A 3IB1A 1JEVA 4RPNA 2HZLA 1H76A 4YICA 3KGCA 4GVOA 5AE4A 4LATA 4WKMA 2B3FA 1RKMA 2X7QA 4Q30B 4JDFA 1UTBB 3VVDA 2Y7IA 5BUUA 5AA1A 1D9YA 3U94A 4F1YA 4WEPA 3RN8A 4RXLA 3K6VA 1S9TA 4NMYA 3FVKA 1ZMGA 2XXTA 4XKRA 3PV0E 4NF4A 4U4SA 4ELOA 5L9SA 2UVJA 4DXBA 2DVCA 1LLSA 3OELA 3K1PA 1GGGA 2FYIA 1QUIA 3DELB 5H8HB 1ATGA 1DTZA 3T9VA 3QIMA 3HPIA 3QK6A 3EHTA 2UYFA 3CFZA 2XD2A 5FHNA 2F36A 1B4ZA 1ZKBA 3MPKA 3O97A 4QFLA 2ABHA 2H4IA 5CRYA 5I57B 1VFDA 2P0SA 4MFIA 4PFYA 1B2HA 4ZEIA 3CR9A 4F2OA 2R6GE 5AA2D 2OJTA 1BTJA 1MXWA 1N7WA 1LFHA 3PUWE 3CSBA 3E4RA 4ZEDA 2DOJA 4YAHX 3GBAA 1N0TA 3MP1A 4FE8A 4IB2A 4IGRA 4EUOA 1POY1 3FVOA 4I8CA 1VSOA 1MQGA 4FATA 5KCJB 1EZOA 3CRBA 3UGWA 2ONSA 1UTHA 1Y3NA 4QFKA 1A8EA 2O7IA 1AOVA 1SDXA 1KWHA 3JZJA 3ZS6A 3KEIA 4R6YA 2A5TB 4NF8A 1MY0A 3K4UA 2I4BA 4YMAA 1RYOA 1WODA 2XX8A 2NWJA 4OERA 3K00A 3FJ7A 5F7VA 1GR2A 3TDJA 4IGTA 1JW1A 1MXZA 2REGA 2OCUA 2ONKE 2XXXA 3TODA 4OETA 2DWHA 2G29A 4POXA 3GBBA 2F78A 4PFTA 1M5CA 3QUJA 2LAOA 4ND9A 4LZ5A 3RLFE 1MY3A 1NH8A 2VHAA 3MAMA 4LONB 4YZZA 3MC2A 1DSNA 1MS7A 2Z23A 1B46A 1NKXA 1O63A 5I59B 2O7UA 2Z22A 1LB9A 3HV1A 3FZVA 3C9HA 1B5HA 2ALUA 3FXQA 3TQWA 4U1OA 3FD3A 1B1HA 4MF3A 3H6WA 3B6TA 1WDNA 3FJGA 4EQ9A 2ZNUA 3K6WA 5DTBA 1FW0A 4KFQA 1MQHA 2XXQA 1H44A 3P7IA 5KDTA 3UIFA 3MP6A 3B7DA 1JEUA 3TQLA 5DT6A 4TOZA 1NH7A 3IR1A 2F6PA 2NUVA 3H4ZA 4GOTA 4Z0IA 3DM0A 1A54A 1MH3A 3VVEA 4U1ZA 1TT1A 1Y9UA 1XOCA 2V93A 1PB9A 1QKBA 4ESXA 2XX7A 4QFNA 1GVCA 4EDPA 4NWDA 2HAVA 3G3HA 4DZ1A 1ANFA 4ZZAA 1FTJA 3N6TA 3ILUB 1GV8A 3D4CA 2D21A 4QFPA 2Q89A 4NEDA 2O1MA 2HCAA 3CSGA 1WVJA 3U8QA 1URSA 2QS4A 5H8NA 4QSDA 3TCGA 4THIA 4AB5A 3PMWA 1N3XA 3K1NA 3CG1A 5I84A 3ODBA 5FTHA 3RT8A 1PB8A 3A3CA 3H03A 1B40A 4NF4B 1R1NA 3W9WA 3HHFA 4OQOA 1T0KA 1Y20A 1IEJA 2QPQA 3VDFA 3EN3A 4Q8RA 2DE4A 2FA7A 1LAGE 2ESNA 3ILTB 4H5GA 4PFUA 2ZYNA 4DE8A 4G68A 3PPQA 4OENA 1NNPA 5DVFA 2XXHA 3TTKA 2DE3A 2F8DA 4PETA 3R7XA 4GF8A 1B7ZA 2DVZA 1AH5A 2O84X 2CMOA 4R6HA 1HSJA 3L6GA 4ELRA 4QF9A 1SQYA 3FGSA 2M8CA 3Q26A 2GFEA 3FATA 2V3TA 4OMBA 2QS1A 1BLFA 3RNNA 1B7HA 1HSLA 4X48A 4IY6A 4DDDA 3RT6B 3G3GA 3WAFA 1A99A 3PPOA 5A5XA 4G4PA 1R9QA 3GLBA 4YMBA 3U93A 2ZYMA 4LQ5A 5FHMA 3K02A 1UTHB 2VOZA 1MPDA 1P1WA 4YU0A 1MPCA 1JQFA 3OO7A 3IL1B 3O29A 1MY2A 4OWDA 3F11A 1MQIA 4F31B 3PPPA 3MVYA 4NF8B 3RUMA 4DCXA 4AB6A 2I48A 2DXRA 1B0HA 4F39A 4O3CA 1N7XA 3BFUA 4IO7A 1LFGA 1SW1A 4JWOA 4N13A 5CMMA 5HBCA 1XVYA 5I2NA 3SEYA 3VLWA 3CFLA 1PB7A 3K6XA 1SW4A 1ZU0A 4H0WA 4X1DA 4F3SA 4MLVA 4ZEKA 1US5A 2XXVA 2V84A 1MXYA 2Q2AA 3HHGA 2THIA 3SEWA 2XXRA 2P2AA 3C33A 4JB7A 3RTFB 2XXIA 4RY1A 4C1UA 1AL3A 1D3KA 3BKIB 4IO5A 1B51A 2B65A 3S9MC 3T93B 3KJ7A 1P1NA 2QMXA 2X7PA 3A3UA 4DLDA 1O7TA 5H8FA 1I69A 1ZBMA 4Q0CA 5TPAB 3H6TA 2ZNSA 2QL3A 2F5XA 4BLAA 3TCFA 2NOOA 4YKPA 1LFIA 3T96B 4MLQA 4GL8A 2V3QA 2QS2A 4R2FA 1PC3A 2QJEA 1IZ1A 5KDTB 5ICQA 2AYSA 3I6VA 3U72A 1LAHE 4I9DA 1JETA 5J1DA 4HS7A 2HAUA 1PDAA 2PYYA 2XXYA 2GHAA 1FQFA 4R9FA 2DS9A 3LBSA 5ICTA 2WKYA 1Y1MA 2VGQA 2KLFA 3DP4A 4OFJA 4BDLA 2HFBA 5AA2A 2RC9A 3H3GA 4P0GA 1NNKA 1TWYA 4ZE9A 4GQOA 4IO4A 4OFOA 5FTIA 3ZSFA 2XXPA 4O3AA 3KZGA 2OBGA 3H6UA 1ELJA 3TAJA 1ZIUA 2CZLA 2V3UA 3QAXA 3LSFB 3OD7A 2E1SA 1PEBA 3N6UA 5H8NB 1XC1A 1QW0A 2Y7KA 2A5SA 1P99A 3C32A 4RK9A 2NVUB 4PQJA 3RY3A 4NWCA 5AA4A 4FEDA 1IITA 1SD3A 3TZAA 3IORA 4JSDA 1MRPA 5HPQA 5BWJA 3H7MA 4H67A 4QSEA 1N3WA 3S9NC 4DXUA 3KBRA 3IJXB 1YTVA 4BDOA 3ZKKA 3CIJA 3LC8A 1M5BA 4U23A 2F7BA 3PMXA 3UN6A 1OIBA 3FVNA 4XTCQ 4OYVA 3ZKLA 1OQHA 1YAEA 3S2VA 4G68B 1MQJA 4EXLA 3PUXE 1IQ7A 2W7YA 1MXUA 4X9TA 1QKAA 3N26A 1A40A 3IB2A 4GWOA 4RA1A 3BFTA 2Y7PA 4KYSA 3IOWA 2F6GA 4OEUA 4KHZE 2RC8A 1MQDA 3H06B 2RC7A 3RQTA 2OWSA 1MDQA 2ZNTA 1UQWA 2OLBA 4FORA 4GLIA 4H65A 4DXCA 3MQ9A 4U21A 3FV2A 4M1VA 5A5XB 3W9VA 2P1SA 4F1VA 3E13X 2AIXA 3MWBA 2XXWA 2PVUA 1PBQA 4GL0A 2Q9TA 3DP6A 1Y3PA 1DMBA 3FV1A 2GRVA 3V83A 4M4GA 1H43A 1NL5A 3FIRA 4WXJA 2HXWA 2H5YA 2ZXTA 1NMUA 2I0BA 3Q25A 4EF2A 3V5AA 3V8XB 4BDMA 1A55A 2PMSA 3A09A 1QVSA 3EPEA 1LCTA 1TXFA 2HQ0A 5I2NB 4NF5B 3JYRA 1NNTA 4PP0A 2DWIA 2H98A 1MY4A 5ISUA 1B3GA 3UP9A 3MW0A 1B6HA 2ANJA 3O6HA 4H1XA 2HZKA 2AL4A 2O69A 2H25A 3TCHA 1AIVA 4K3FA 4P0IA 5TP9A 1OVBA 4IO3A 4U22A 3WAEA 4F3PA 4KYEA 1R6ZA 3K6UA 2H9BA 5H8FB 5DVIA 2REJA 5B70A 5IKBA 4N6PA 4NF6A 1SBPA 2RCBA 5AA3A 5CMBA 1TFAA 1LB8A 3SEUA 1Y4CA 3UA8A 4HTGA 1VFEA 3D4GA 4GIZA 1SYHA 4P11A 1LSTA 5CI5A 1QUKA 4ZEFA 3OEKA 3UK4A 2PT2A 4RPOA 3AXFA 3C4MA 2F34A 3RGYA 4JSOA 1QUJA 1NNFA 3SDFA 3KSJA 3U1OA 1OMPA 4G8MA 3MP8A 3IX1A 4GXSB 4ELPA 1SYIA 3OSQA 1FTKA 3T22A 3UORA 5L9OA 3N94A 1GTKA 2Q8JA 1P1QA 3MPLA 3FJMA 4EQ7A 1JW4A 3TFLA 4FIMA 2R71A 3KN3A 3KFMA 4F19A 5KZTA 3KOTA 2PBWA 1D4NA 1B9JA 4KD5A 1S50A 4ZEBA 3OO8A 3KOSA 1B5IA 4ELQA 3TEPA 1MXXA 4RNSA 2ONRA 3OXNA 2GH9A 5L9MA 3M3FA 3O9PA 4FECA 4OHNA 4FAJA 5DEXA 5AA4B 3R26A 3OMBA 3PUZE 5JEIA 2Q88A 4F3BA 2V25A 2B3BA 4QHQA 4L17A 1N84A 4JWYA 1MH4A 4ZE8A 3IAZA 3IJOB 1IIWA 5JK4A 4ZECA 3LUYA 3JV9A 3C35A 5I56A 3TMGA 1J1NA 1LAXA 4E0WA 4XKQA 4F2QA 1IXIA 1RYXA 1CB6A 1FTOA 2YLNA 2OWTA 4FJPA 1B52A 3BBRA 3G3JA 2UYEA 2VD2A 1BIYA 3HSTA 5DVJA 5TU0A 3TTMA 3SEXA 1FQBA 3G3IA 3FASA 2O68A 4KYDA 2XXUA 1XVXA 2I49A 2RKMA 4G77A 3IOUA 2R9JA 2ZYKA 3VXBA 3U92A 2YJPA 4HW8A 1XS5A 4F22A 1JVYA 1R9LA 4GRKA 3TTLA 3MZ9A 3PUVE 5H8QA 1B4HA 5M2VA 4KCDA 1FQCA 3PGFA 3QUFA 4KQPA 5K2YA 2DQVA 1D9VA 3IOVA 3TTNA 3O6GA 3OSRA 3Q28A 1MM6A 3M3LA 1P1UA 4AQ4A 3T9XB 4BDRA 4GFRA 4MH5A 3O2AA 4EF1A 2ZYOA 1VE4A 3B6QA 4R75A 5H8SA 1DTGA 4TLLB 3G7WA 5I58A 1B58A 1LBBA 3K1MA 2O51A 1FQEA 1VR5A 2XD3A 4Z7EA 3C34A 4IO2A 1EZPA 3C36A 3SETA 1PBPA 4R6KA 2YPNA 4YKKA 3LSLA 2I58A 3CI8A 1MXVA 2IA4A 4XKPA 3THIA 3TYHA 3Q29A 3IK6B 1B1XA 2RCAA 3RTWB 4XKNA 4JBZA 3R6UA 1A7LA 4ZZEA 2Q2CA 2QS3A 2Y84A 5TP9B 3TPAA 2DWAA 4QSCA 3PU5A 3HN0A 3S4UA 4NE4A 2IEEA 1MM7A 3QSLA 3SERA 2D5WA 4Q5TA 2O6AA 4NF6B 2Z8EA 3G3FA 1JVXA 1Y1ZA 1FQDA 3IO4A 2UVIA 3GXAA 5FHOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PPRA 2UVGA 4I1DA 2I6EA 3MVZA 3KSXA 3VLVA 1NV2A 1IXGA 3G3KA 4ZS9A 3KJTA 1B3HA 4YB6A 5IAIA 2VP1A 4XXUA 4RYAA 3VXCA 1QULA 1FBFA 3TKDA 4G8HA 5ITOA 1SW5A 3VLUA 3RYDA 5HM4B 1JNFA 2AL5A 1IXCA 3K0VA 4OTEA 4RJZA 1EH3A 2QRYA 1FBHA 3HO7A 3SESA 4N07A 3K2DA 3VFJA 4R74A 1NUZA 4DI3D 1FBEA 1FPJA 4LQ2A 4HCWA 3PD9A 2VD3A 1UIVA 2G93A 1USYE 1YCJA 2KR0A 1SPIA 3LSXA 3IFAA 4OVQA 1USYH 4ESWA 3S9LC 2GHBA 5I2KA 3RPLA 3E3KA 1DK4A 5DW8A 1M5EA 3MZBA 4O94A 4JWXA 4WEDA 5JTYA 3B6WA 3VE1B 4KI0E 1AWBA 3FVGA 1AMFA 3RPWA 4TLMB 2ZZVA 3LSWA 2DYXA 2Y7RA 1OLCA 5ITPA 2XX9A 3E9XA 5CC2A 2XHDA 4U2RA 2DP8A 5ET7A 1M5DA 3KG2A 4G2ZA 5DEXB 1OQGA 2O1LA 1Q1KA 4EQBA 5CBSA 4U4XA 4OVJA 4PFRA 1Z7NE 1DPEA 4IO6A 1SI0A 4C0RA 1LGBC 1B0LA 5L8DA 1BP5A 4EXKA 1B5JA 3USDA 4GXAA 4N8YA 1H45A 2I3WA 3IOTA 1URDA 2Z8FA 1RDZA 1FTMA 4DIGA 4GWWA 1EZ9A 5I56B 5IZZA 2PT1A 4NTLA 3CFXA 4MBPA 3I3VA 3M8UA 3KC0A 4PFWA 2RF1A 4F29A 4QBAA 1QGXA 5I3SA 4OXVA 4BDQA 1N76A 4OFLA 1CNQA 5EHMA 3OO6A 1JW5A 2F35A 4ISUA 3I5OA 4OVRA 2FVZA 1HSEA 2QSXA 4UA8A 5TPAA 4OZ9A 2DWJA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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