3OEKA

Crystal structure of glun2d ligand-binding core in complex with l-aspartate
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
281
structure length
270
Chain Sequence
QHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNREKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARGTTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit epsilon-4
publication title Ligand-specific deactivation time course of GluN1/GluN2D NMDA receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 82
structure length 270
sequence length 281
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oekA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oekA02
1Z7NE 2F36A 4YKIA 4I8CA 5FTHA 1Y3QA 1ELJA 1ZMGA 3SEXA 3RLFE 4F19A 3K6UA 3KJTA 1PBPA 4K3FA 4U1OA 3IB1A 1O63A 4BDLA 3TPAA 4Q0CA 1FQEA 1TFAA 2RCBA 2F7BA 4MLVA 3VLWA 3MWBA 1P99A 2PYYA 5CBRA 3TZAA 4PFWA 3OO9A 5I59B 4YKJA 1MY4A 2XXRA 1M5CA 3FXUA 2B3BA 3W15C 3RY3A 1VFDA 2X26A 3O97A 2QS3A 4RA1A 4Z7EA 4F1VA 4NWDA 4NF4B 4ND9A 1M5DA 3IOTA 2ONSA 3TTRA 4EXLA 1NNTA 1QVSA 1AIVA 1MM6A 1JETA 2ZYOA 3EN3A 1S50A 4G8NA 3FD3A 4KI0E 2DE2A 3LBSA 1EZOA 3SEYA 1SD3A 1LB8A 1GR2A 3TTLA 3VFJA 3K6VA 3HN0A 2I3WA 1A55A 2DQVA 4LZ8A 4AB6A 1D9YA 2Z8FA 4QSDA 3QUFA 1N76A 4R2BA 4H0WA 1KWHA 3IAZA 1ZBMA 3G3GA 3T9HB 1R6ZA 2H25A 4IO5A 1LFIA 3G7WA 2DYXA 3PUZE 4X9TA 5DEXB 3TTKA 4G68C 2DOJA 3ILTB 1PDAA 3LSFB 3IB2A 2UYEA 4XKRA 2OLBA 2E0SA 5EHMA 3RGYA 3RQTA 4NF8A 3QSLA 1SQYA 4G2ZA 1PB9A 3O9PA 3RN8A 4ZDMA 2DWIA 1JW1A 4OEUA 3T9XB 4FIMA 3O28A 1RYOA 4NF6A 1B1XA 4F31B 4YZZA 3C35A 4JB7A 5I58B 1B3HA 4U4XA 2WKYA 3WAFA 5I2KB 3MPLA 2O6AA 1USYH 1LCFA 4EDPA 3K2DA 5FHNA 4Q5TA 2XXIA 2GHBA 5I56A 1N3WA 3AXFA 1IEJA 3I5OA 3D4GA 3G3HA 1A7LA 4OWDA 3KGCA 5DVJA 4DCXA 1MPBA 4RK2A 5H8HB 2G29A 2GRVA 1SI1A 2XXVA 2BJJX 3OO6A 1Y20A 2QS2A 1PEBA 2A5TB 4R74A 1Y3NA 4FAJA 3EQ1A 1H45A 1S7YA 1R1NA 2H4IA 2RC8A 1B3FA 5TU0A 4Q8RA 2B3FA 1LAHE 3OEKA 3O2AA 2RC7A 2UYFA 1A8EA 3IOUA 4H1XA 4ELOA 1P1UA 1MXWA 3CG1A 5DVFA 2UVGA 3FIRA 3V83A 3M3LA 4QHQA 5L8DA 5CMBA 3TTNA 3RUMA 5AA2D 4Z0IA 4R2FA 1B40A 4LQ5A 3FGSA 3I3VA 5I57B 5FHMA 5ISUA 3K02A 4THIA 4C1UA 1J1NA 1LBBA 1I6AA 2ESNA 2DP8A 2I0CA 4R6KA 2O1MA 4NWCA 3C36A 2HAVA 3TODA 1OVBA 5M2VA 3CSGA 3H3GA 4H5GA 5I2NB 2Z8DA 3MQ9A 3B6TA 5HBCA 4FEDA 2F35A 2HFBA 3C31A 3HHFA 1UIUA 3BBRA 4BDOA 5AA4A 3MPKA 1NNPA 3SEWA 1B3EA 4WEDA 4C1TA 1MM7A 3KJ7A 3Q26A 3LUYA 2X7QA 2YLNA 4DCYA 1BP5A 3EHTA 3MAMA 2XXWA 5H8QA 1GGGA 1ZTYA 3M8UA 4R73A 3DP6A 2I48A 1I69A 3IO6A 2DWAA 2VD2A 4BLAA 4UACA 3MP1A 4WEPA 3PMXA 3MZ1A 3DLNA 4BDQA 3T9UA 2XXYA 3KOTA 1VFEA 3QXMA 4YKPA 4FJPA 1SVXB 3PU5A 3QAXA 2V3QA 3TDJA 4WKMA 4RPNA 3T96B 2I3VA 2XXPA 3H4ZA 3GZGA 5CRYA 2PX1A 4G8MA 4FORA 3SESA 4JDFA 1IXGA 1B0LA 3QYTA 3KG2A 4ZEBA 2QSXA 1P1OA 4HCYA 3MVZA 5H8NA 4R6HA 3E3KA 2Z8EA 1NMUA 4NF5B 3G3JA 1MQGA 4UA8A 3K00A 3UIFA 3EPEA 3N5LA 3K01A 4JSOA 1YTVA 3N6UA 4E0WA 4EF1A 1VR5A 1JW5A 4LVQA 3KOSA 3K1PA 1SYHA 3L6HA 3LSXA 4RY1A 3UP9A 3KN7A 2H9BA 3PMVA 4ISUA 3TCFA 1MXXA 2DE4A 3CR9A 4YB6A 2Y7PA 1B51A 1M5BA 2DXRA 1QKAA 3E4RA 4GXAA 2PVUA 4YU0A 5I84A 4F18A 2QPQA 4F1YA 2QMWA 4GWOA 3TAJA 1A8FA 2R71A 3OOAA 4TLMB 2V3TA 3IL1B 3VLUA 3K6WA 3T22A 3JYRA 4H5FA 4TLLB 1B5HA 3MVWA 1N0TA 4OHNA 1QUKA 1WODA 3R7XA 1H44A 1IXHA 2ZMBA 3IORA 2RC9A 4KYEA 1JEUA 2F7AA 2KLFA 4EQBA 2O69A 4DLDA 1JW4A 2P2AA 4DIGA 3PUXE 4R6YA 5ELVA 1N7WA 4PP0A 4P0GA 4MLQA 1B1HA 3ZS6A 4POXA 5A5XA 4DXCA 1RKMA 3TUSA 1OLAA 1JNFA 4MBPA 2F6PA 3T66A 2ZYNA 4R75A 3V89B 1MRPA 3HO7A 1HSJA 2OWTA 5KDTA 5DT6A 1D4NA 4RK9A 5ITPA 1ATGA 2Y7WA 1TT1A 2FA7A 3OSRA 2REGA 3W9VA 1NH8A 2HQ0A 1NNKA 3H06B 3JZJA 1R9QA 4PFUA 3D4CA 3C4MA 3O6GA 2ONRA 3FVNA 2Y7KA 2F7CA 3OELA 1UTBA 1URDA 3O6HA 5L9OA 3IB0A 5KCJA 1OQHA 3MZ9A 4NF8B 4FEBA 3N6TA 1LFHA 2R6GE 1Y4CA 2HCAA 4XKPA 3M3FA 3G3IA 3TMGA 2DVZA 3U94A 4NF6B 3OSQA 3U93A 2HEUA 1Y9UA 3FV1A 4EQ7A 3K0VA 3OO8A 3Q28A 3QUJA 3OMBA 1B46A 5DVIA 4U22A 2ZNSA 3TCGA 2HZLA 3MBPA 3S9MC 3CFXA 5I56B 2PMSA 3VVDA 3FJ7A 3P7IA 1ANFA 1LAGE 1DMBA 1F9BA 1DOTA 4FECA 4GOTA 3VV5A 4ONYA 1IITA 3PPNA 3CFZA 5EHSA 5IKBA 1M5EA 2UXAA 3C34A 4O3AA 3KSJA 3V8XB 1QUIA 3KFMA 2XD3A 1XVXA 4IO2A 5FTIA 3EF7A 1RYXA 3H6VA 4DXUA 3KSXA 4JXIA 3RT8A 3CFLA 5BUUA 1QW0A 4IO7A 2QJEA 3FZVA 3RNNA 2V25A 2CMOA 5BWJA 1DSNA 3MZBA 3H6UA 3R6UA 4POWA 2XX9A 2AIXA 1SYIA 2DXYA 1TXFA 5ICQA 4ZZEA 4U1ZA 1QJMA 4JSDA 3UK4A 2VP1A 2Q8JA 2QRYA 4IO4A 4X48A 2IEEA 1DTGA 4QSEA 3SEUA 2OWSA 4QRZA 2ZYKA 4F29A 1B05A 2H5YA 4ZE9A 3PD9A 1IZ1A 4QFNA 1MXYA 4NTLA 4GF8A 3IOVA 1B7UA 4LZ7A 4C0RA 3GBAA 4OXVA 2Y7RA 4NMYA 1H43A 4DXBA 3WAEA 2A5SA 1PB8A 4DDDA 3IO4A 5B70A 2XD2A 1B32A 5ITOA 4WXJA 2XXQA 3IJXB 1LLSA 4ZEKA 4JWOA 2RINA 3PPPA 4ESWA 3OO7A 3RPWA 5AA4B 3SERA 4G8HA 1P1WA 5AA1A 4DE8A 4JWXA 2F8DA 1POY1 5IAIA 1MQIA 3HPIA 4OTEA 1MPCA 3DM0A 3N26A 3SEVA 1AOVA 1XVYA 4I1DA 2I4BA 5H8QB 3PV0E 4FATA 3ODBA 3UGWA 1O64A 4PFTA 2QS4A 2Q2AA 4RJZA 2VOZA 4ZEDA 2F6GA 1IUDA 1IIWA 1SW5A 3O66A 5CC2A 4MF3A 5AA2A 1NL5A 4RPOA 2X7PA 4PE5B 3G3FA 4XKQA 2XXTA 4ELQA 4PQJA 3U1OA 3PPRA 2OZZA 1T0KA 5FHOA 4YICA 2O51A 1M5FA 2I6EA 4EXKA 5K2YA 1Y4TA 1O7TA 4OZ9A 1ZJLA 5H8NB 2NXOA 4IO6A 2DWHA 1YCJA 1FQAA 4H65A 5B7DA 3E13X 3GXAA 4QFPA 3GLBA 4F39A 1NFTA 4ECFA 2PT1A 4G77A 4F3GA 3CG3A 4U21A 1D9VA 4I9DA 3RTFB 4TOZA 1MQJA 4ZZAA 1B9JA 3FV2A 3W9WA 1HSEA 2IA4A 4PFYA 3MVYA 2Z23A 4NEDA 2DSFA 1Y1MA 1IXCA 1URGA 4L17A 1DTZA 3IJOB 3R26A 4HS7A 1MXZA 2M8CA 4GVOA 4GQOA 1N3XA 3CI8A 2P1SA 1A54A 3MP6A 3K4UA 1Y1ZA 4LQ2A 1MPDA 1ZU0A 3O29A 2B65A 4KYDA 3B7DA 4ELPA 4KPTA 4IGTA 2OJTA 4G68A 2HXWA 1CE2A 1PB7A 3PUYE 4BDNA 3U92A 3IOWA 2DE3A 1N04A 4LP2B 1QKBA 4KR5A 4RNSA 1IQ7A 4H6DA 1R9LA 3KN3A 1MXUA 2REJA 1OVTA 1LAFE 5A5XB 1LB9A 3S2VA 5J1DA 1EZ9A 3HHGA 3MJNA 1TWYA 3RT6B 4ZEIA 2XXHA 5JTYA 1SW2A 1MXVA 4JWYA 4BDRA 5KDTB 1LSTA 1LBCA 4XXUA 2VHAA 4LATA 1N7XA 3GBBA 2Q9TA 4KD5A 5CI5A 1TFDA 1II5A 5TP9A 4OENA 1A40A 4M1VA 1JQFA 2UVIA 1USYE 3E9XA 4YMAA 5HM4B 2PBWA 1WVJA 2XXXA 3PUWE 2ONKE 2UVJA 2NVUB 4OFLA 4OYVA 3HSTA 2O7IA 1JVXA 1FCKA 3S4UA 3PUVE 2H99A 1XT8A 3I6VA 1UTBB 1AL3A 2V93A 4H8JA 1Q35A 2F5XA 1FTOA 5KCJB 2RF1A 4OERA 1L5TA 2ANJA 3JV9A 1US5A 4EQ9A 1BLFA 4N13A 3DP4A 4QFOA 4XKNA 2RKMA 1SW4A 1XC1A 4QF9A 4PETA 3PPOA 2I4CA 2OCUA 3ONMA 4U23A 1B3LA 5ICTA 3H6WA 1EH3A 3BKIB 1B5IA 4RXLA 5CMMA 1I6BA 1HSLA 1N84A 3LC8A 3FATA 3PMWA 4X1DA 2DWJA 5AE4A 1FTLA 1YAEA 3A3CA 1S9TA 1QULA 2NWJA 2QL3A 5F1QA 2P0SA 4YB7A 2XX7A 3TQWA 4GLIA 1POTA 3OXNA 3TTMA 3C9HA 1OMPA 3K6XA 4KCCA 1MS7A 3TELA 4ZEFA 1H76A 1IXIA 2E1SA 4GL8A 2O7UA 1XHYA 3VE1B 5H8FA 4O3BA 3UORA 4OMBA 3U8QA 1XS5A 1EZPA 5H8SA 1ZIUA 3IX1A 3OEMA 2GH9A 3CVGA 1UTHA 1JVYA 4HW8A 1QUJA 3IK6B 4OESA 4NE4A 3FVOA 2ZNTA 4KYSA 3H03A 3M3KA 5JEIA 2W7YA 1VSOA 2NOOA 4H8IA 3LR1A 3VXCA 3A3UA 2Q2CA 1MQHA 1FTMA 3FXQA 2ZYMA 1B58A 4EUOA 2H98A 4LA9A 4F3SA 3VVEA 4U2RA 4HTGA 2CZLA 3UN6A 1FQFA 1MY1A 4KCDA 3VLVA 2VGQA 4JBZA 2I58A 3EHUA 2F34A 3SETA 2Z22A 1FQDA 2OK2A 2XXUA 1MY2A 4TQUQ 2F78A 4R72A 5I59A 2O68A 2XHDA 3F11A 1FTKA 3C32A 5CBSA 3O6IA 1MY3A 3OENA 5CMKA 2I0BA 4KHZE 1SDXA 4NF4A 4R9GA 3TFLA 1FTJA 1MY0A 5JK4A 4KQPA 2RCAA 5AA2B 3RTWB 5CMCA 2O1LA 3KN8A 4EF2A 2LAOA 2Q88A 1B4ZA 3KBRA 1PBQA 4YB5A 3V5AA 1XOCA 2NUVA 1DPEA 3A09A 1FQCA 4QFLA 3KEIA 1GVCA 4X1BA 3KZGA 3U72A 4N07A 1B5JA 1ZKBA 5DEXA 5K2XA 3MUQA 3H7MA 4IB2A 3G3KA 4F3BA 4OFJA 3L6GA 3VXBA 1B7HA 5F7VA 5LOMA 1MH3A 4F1UA 1MQDA 2ABHA 1WDNA 4F3PA 1GTKA 1P1NA 3N94A 4N6PA 1ZLQA 4QFKA 1LCTA 4GFRA 1B6HA 3HV1A 4YAHX 5TPAB 5I58A 2Q89A 3K1NA 2V84A 3MP8A 4GL0A 3TKDA 5I2KA 4ZECA 3LSWA 2ZXTA 1OLCA 2D5WA 4ESXA 3CIJA 5CM6A 1H3DA 3S9NC 1LFGA 1NH7A 3VDFA 1PC3A 4H67A 3FUZA 4I62A 1URSA 4G68B 5H8HA 4M4GA 2GHAA 4IY5A 3SKPA 1LGBC 2A5TA 3TCHA 2VD3A 1LAXA 2O84X 4ELRA 3C33A 3T93B 3FASA 4AB5A 4F2OA 1OIBA 1B0HA 3Q27A 2D3IA 1JEVA 2D21A 2I49A 3Q25A 2UVHA 1P1QA 2YPNA 4IY6A 4LUBA 4LONB 1B3GA 2AL4A 5TPAA 5L9MA 3THIA 2ALUA 5JTYB 4R9FA 3MW0A 4YMBA 2HZKA 4OQOA 3B6QA 1FQBA 1CB6A 4F2QA 3PGFA 3TYHA 5I57A 4QSCA 1MDQA 3FVGA 4BDMA 3IR1A 4KFQA 4P0IA 1OQGA 4P11A 3BFUA 4GD5A 1SBPA 1VE4A 1US4A 1A99A 3K1MA 3ILUB 4GIZA 5TP9B 1NKXA 1BKAA 2GFEA 5EYFA 3OD7A 4OETA 1YPNA 4F22A 3ECRA 4U4SA 2FNCA 1B4HA 5I2NA 3FJMA 3Q29A 5HPQA 4DZ1A 2QS1A 3DP8A 1Q1KA 1NNFA 2YJPA 1I6QA 2F97A 4AQ4A 2V3UA 4E0XA 3QIMA 3ZSFA 3CRBA 4OFOA 5AA3A 1UQWA 4IO3A 1D3KA 1MG1A 5KZTA 1MH4A 4RYAA 3QK6A 2QMXA 2Y84A 3UA8A 3MC2A 4IGRA 1B52A 2THIA 1AH5A 3PPQA 1EU8A 1SI0A 2HAUA 4Q30B 4XIGQ 2FYIA 4XTCQ 4OEVA 2AL5A 4GRKA 3EHSA 1BIYA 1SW1A 3TQLA 3T9VA 5L9SA 3TEPA 3HCQA 1MDP1 2ZNUA 1DPPA 3USDA 2DVCA 3BFTA 1Z7ME 2AYSA 4FE8A 1BTJA 3PD8A 5DYHA 3FVKA 4MH5A 4NF5A 4GXSB 3S9EA 3MVXA 4G4PA 3ZKLA 3CSBA 1Y3PA 3FJGA 3H6TA 3S9LC 1AMFA 3B6WA 4MFIA 1FW0A 2G93A 1GV8A 3SDFA 3DELB 1B2HA 4OVJA 3ZKKA 2PT2A 4O3CA 5H8FB 2R9JA 3VVFA 3FXRA 4ZE8A 4YKKA 1UIVA 5DTBA 2XX8A 1B7ZA 4ZS9A 2Y7IA 4LZ5A 4HCWA 3LSLA 2OBGA 2DS9A 1UTHB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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