3OEKA

Crystal structure of glun2d ligand-binding core in complex with l-aspartate
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
281
structure length
270
Chain Sequence
QHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNREKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARGTTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Ligand-specific deactivation time course of GluN1/GluN2D NMDA receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit epsilon-4
total genus 82
structure length 270
sequence length 281
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oekA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oekA02
1L5TA 3KGCA 2OCUA 5KDTB 3O6HA 3KJ7A 3KSXA 3RT6B 2DXRA 3KFMA 2HZKA 4IB2A 3N6TA 4OFLA 1B7HA 3RGYA 4UA8A 2H5YA 2UYFA 1EZ9A 2OWSA 3G3KA 2YJPA 4IY6A 1Y1ZA 5BWJA 4JSOA 3V89B 4I8CA 2Y7RA 1JW5A 3PUYE 4XKPA 3ILTB 4GXSB 5FTIA 1OMPA 1S50A 2E0SA 3IB1A 1H45A 1N7XA 4AB6A 1QUIA 1XVYA 4IO4A 3IOWA 1P1QA 4G8MA 3EHSA 2QMXA 2FA7A 1IXGA 1JVYA 4G68B 4ZEDA 4TLLB 4POXA 5I56A 3IO4A 4X1BA 3LC8A 4JB7A 3R6UA 2UVHA 5TPAA 4FEBA 2I49A 1I69A 3S9NC 3C31A 2VOZA 4XKNA 1FQDA 5H8NB 1JNFA 4XTCQ 3TTKA 3FATA 2ABHA 2I0CA 3HPIA 4JSDA 2I58A 3MVYA 1URGA 4R75A 3K0VA 1SW5A 1DTGA 1IXHA 2I3VA 3MC2A 1B5IA 5BUUA 3E9XA 5ITPA 2I4BA 3W9VA 3CFLA 3H06B 2Q8JA 3KZGA 1GR2A 1ZIUA 1Y9UA 5DEXA 5TU0A 3I3VA 1CB6A 1MQJA 3GXAA 1MH4A 5A5XA 1O64A 4JDFA 3PPRA 4R72A 2DS9A 5H8FB 3Q26A 1II5A 3ZSFA 3JV9A 4GL0A 3MAMA 2DE3A 2UVJA 4F22A 4LA9A 3QIMA 4E0WA 1QJMA 1URDA 1Y20A 4H65A 1SDXA 3IL1B 3S9MC 3UK4A 5JTYA 1SW4A 3RLFE 1LBBA 2Y7WA 1B3EA 3PD9A 4N13A 4EXKA 3OELA 2V25A 1T0KA 1NNTA 3RUMA 3TTRA 2AIXA 1A8EA 1ZLQA 4H5FA 1FQFA 4YMAA 4TLMB 2RC7A 5KZTA 1N3WA 3MP6A 3RTWB 2YLNA 3ILUB 2Y84A 1QW0A 1TT1A 4L17A 1NH7A 1PB9A 4GWOA 1OVBA 2THIA 2F97A 1B9JA 3LSFB 3CR9A 2QL3A 2NVUB 1H76A 3L6GA 1MQDA 3S9LC 4X48A 5L8DA 2A5TB 1LB9A 2HQ0A 3W9WA 4POWA 5I2NA 4DE8A 5K2XA 3C36A 1ZKBA 2HFBA 1Y3QA 2Q2AA 3H4ZA 3VLUA 1N04A 3TEPA 2H25A 4HS7A 2AYSA 4IO2A 3OOAA 3B6WA 1TFAA 3V5AA 2OZZA 1BLFA 2Z8FA 5H8SA 2LAOA 4F31B 3TDJA 4YB5A 2XXHA 4KQPA 2UVGA 2IA4A 3FXUA 2XXUA 5EYFA 2XXTA 1MXYA 3M3LA 2ONKE 3PPOA 4IO6A 2OLBA 5HM4B 4KCCA 4R2BA 4GOTA 3DLNA 4PFTA 3FVOA 4Q0CA 3VVEA 1DPEA 2X26A 2VP1A 3Q29A 2G93A 1MY3A 2O6AA 1MDP1 2Y7IA 5I59A 2VD2A 2FYIA 2F35A 2GFEA 4C1UA 3VVFA 1SBPA 3OO9A 1B1HA 3CVGA 4ISUA 2XXYA 4ESXA 3SKPA 1LAXA 4NEDA 2OWTA 2UXAA 1SVXB 4PP0A 4LZ7A 4NF6A 1UTHA 1VFDA 5B7DA 3Q27A 4ECFA 2XX9A 3GBAA 3N26A 1LFGA 3V83A 3O2AA 5KCJB 3MZ1A 3IO6A 4BDNA 2XXRA 2F34A 1B3HA 3IR1A 4QF9A 3BKIB 2O69A 4NF5A 3IB2A 3U72A 3THIA 3N94A 1B0LA 3ECRA 1RYXA 3SEUA 1LFIA 2QS3A 4DXBA 1SI0A 1M5EA 1SD3A 3O29A 4N6PA 5ICTA 4M4GA 3SERA 4G8NA 3RPWA 4OETA 4ELRA 3HHFA 4IO7A 4GLIA 1A99A 5AA4B 3B7DA 5ICQA 3TYHA 4H67A 4R73A 4KCDA 2DP8A 5JK4A 3LSWA 2H98A 1DMBA 1B6HA 3VLWA 1POY1 3QUFA 3JZJA 2ZNUA 3FJGA 5DVIA 4OZ9A 1NNFA 5H8HB 4E0XA 1AMFA 1DOTA 1DTZA 4WXJA 3R7XA 2ANJA 1H43A 3TQLA 1B4ZA 2NWJA 5CC2A 1O7TA 1GVCA 3FIRA 4X9TA 2ESNA 2UYEA 2ZNTA 3TTNA 1JW4A 2HEUA 2F7BA 1MY2A 2REGA 1XVXA 4DIGA 1FTMA 3KJTA 4G2ZA 1JEUA 3M8UA 3HO7A 1R9QA 5KDTA 3KN3A 4ZEBA 1R9LA 2PMSA 1N7WA 4LQ5A 2ZYMA 2HCAA 4YAHX 1JETA 3CSBA 3H6UA 3QSLA 4DZ1A 4X1DA 3CRBA 3HV1A 3OMBA 5I57B 1M5BA 3MVWA 4ND9A 3K2DA 3SEYA 2O7UA 1D4NA 2B3FA 1XHYA 2XXVA 4MH5A 4QSDA 1IQ7A 5TP9B 4F3PA 2ZYKA 4U2RA 2GRVA 3FJMA 1MXUA 1B32A 4LZ8A 3U92A 1HSLA 4G68A 4FAJA 3CIJA 4U22A 5I84A 3E13X 1IXCA 3T9VA 2PBWA 3C35A 1UIUA 1JW1A 2GHAA 1B0HA 1A7LA 3GZGA 5H8NA 2ZXTA 4THIA 3H7MA 3G3HA 1USYE 3PPQA 3T96B 4AB5A 2XXQA 1GTKA 4OYVA 3VV5A 3MW0A 2R9JA 2O84X 2W7YA 2V84A 2YPNA 3PMXA 4Z0IA 4EQ9A 1MXZA 4C0RA 5H8FA 4K3FA 3K1NA 4U4XA 2R6GE 2XXXA 2O68A 2DE2A 4ZE8A 4YKIA 3QAXA 4OXVA 3FV1A 2QS4A 4GD5A 3EQ1A 3BFTA 3K01A 2ALUA 3OEKA 3IOVA 1IXIA 2P2AA 1S9TA 3SESA 3D4CA 3H3GA 5CI5A 3PUWE 1LCTA 2DVZA 3TCHA 3PV0E 4DLDA 3G3GA 4KI0E 2F7CA 3EF7A 3QUJA 1FW0A 1PDAA 1NH8A 2QS1A 3KN8A 5I2KB 4GXAA 2XXIA 3LR1A 1A55A 2QSXA 1XC1A 3KOTA 3FVNA 3O66A 2GH9A 1QKAA 1B5HA 3MWBA 3T9XB 4WEDA 4QRZA 1US4A 1SW2A 3OEMA 4NTLA 3EPEA 1ZBMA 1FQEA 4KYEA 1FTKA 2A5TA 4YB7A 3C34A 3T66A 2IEEA 1OLCA 3T9HB 1M5DA 2F7AA 5CM6A 1LBCA 5AE4A 3U8QA 4HCWA 1B7ZA 4LQ2A 3ONMA 3FUZA 4RY1A 3RTFB 2H9BA 2DE4A 4WKMA 3B6TA 3TCFA 2GHBA 1B51A 3PGFA 3RN8A 3TMGA 4G77A 3D4GA 3CSGA 3EN3A 4DCYA 1LAHE 3UIFA 1Q1KA 1MQIA 4Z7EA 4JBZA 1N76A 2Q2CA 1MXXA 3O6IA 2V3UA 2XXWA 1B52A 2B3BA 1A8FA 3KN7A 3MPLA 3R26A 4PQJA 1OLAA 1IIWA 3G3FA 1TXFA 3MJNA 4HCYA 1MQHA 5I58B 5FTHA 3OSQA 4QFOA 4KHZE 3TPAA 1P1UA 4OFOA 1IZ1A 3VDFA 2WKYA 1NFTA 3IJXB 2REJA 1D9YA 5EHSA 3PUXE 1AL3A 1PEBA 1URSA 1MH3A 4FIMA 4NF4A 1BP5A 4LP2B 2ONRA 4JXIA 3K1MA 4F1YA 2D5WA 1A40A 1O63A 4LONB 5L9SA 4OENA 5KCJA 5M2VA 4BDRA 4I62A 2I48A 4EXLA 3FV2A 1SQYA 1ATGA 3GBBA 4KD5A 4ELOA 2ZNSA 1QULA 1LB8A 1RKMA 3IOUA 1SYIA 1ELJA 1LCFA 2OBGA 4RPNA 3G3JA 1VSOA 2I3WA 3O28A 2DQVA 3SEWA 4NMYA 3G3IA 3Q25A 3VLVA 2VHAA 5AA4A 1P1NA 5DT6A 2F6GA 1B5JA 4ZEIA 4FE8A 3MZ9A 2P0SA 5F1QA 2M8CA 1B1XA 2O1MA 4U1ZA 3FD3A 3H6TA 1OVTA 5H8HA 1MPCA 5CMCA 1UTBA 4GVOA 4BDLA 3IK6B 3C9HA 4NF4B 1EZPA 4IGRA 1VFEA 3T22A 4EF2A 4QHQA 1MM7A 4ZZAA 3EHTA 1MG1A 2DOJA 4F3GA 1UQWA 4YB6A 3VXCA 4I9DA 1MY1A 2QS2A 2ZYNA 1RYOA 3MZBA 4PE5B 4Q8RA 4YICA 3VE1B 1B3GA 3M3KA 1Y3PA 5FHOA 4YKJA 5AA2A 3EHUA 1US5A 1H3DA 4R6YA 1AH5A 4OTEA 1Y4TA 1OQGA 3U93A 4XKRA 3L6HA 4RK2A 1QKBA 5I57A 1WODA 1M5CA 4IY5A 1MPBA 1PBPA 3TZAA 5CRYA 3O97A 2A5SA 5B70A 4FJPA 1FQAA 5L9OA 2PT2A 4OVJA 3OO7A 5TP9A 4IO3A 3K6XA 3SDFA 4OMBA 4R74A 1FQBA 4KYSA 3HN0A 1XOCA 1UTBB 3UA8A 4ELPA 3FXRA 4XXUA 3FVGA 3CG1A 3DELB 3K1PA 3H6VA 4HTGA 1B46A 4F19A 3MUQA 4GL8A 5ITOA 3IB0A 3IOTA 1EU8A 3IJOB 5AA2D 2Y7KA 1MY0A 3T9UA 3WAEA 1IUDA 5DYHA 3IX1A 5FHMA 2DVCA 4JWXA 2UVIA 3PPPA 1XT8A 1B05A 1I6QA 4WEPA 4QFNA 3UP9A 4NWCA 5AA2B 1IITA 3ZS6A 2XX7A 3E3KA 1KWHA 3PPNA 1MXWA 1D3KA 1YTVA 2VGQA 4H0WA 5FHNA 3OSRA 4LATA 3LUYA 4AQ4A 4OWDA 2H4IA 4OFJA 4RYAA 1AOVA 3QK6A 1P1WA 3M3FA 1GGGA 3CFZA 2VD3A 1MRPA 2Z8EA 4OQOA 3OENA 2BJJX 5AA1A 4QFLA 3V8XB 3OO6A 4N07A 4G4PA 3FVKA 3KG2A 2OJTA 2DWHA 3C4MA 4P11A 4DXCA 2RCAA 3C33A 3KEIA 3I6VA 2RINA 4QFKA 4RK9A 5H8QB 5J1DA 1CE2A 3PUZE 5HPQA 2NOOA 1LGBC 1MXVA 4PFWA 3VFJA 4YMBA 2Z8DA 3TUSA 2G29A 2I0BA 1MY4A 5I2KA 4TQUQ 4F18A 3K4UA 2PX1A 1NNPA 1B2HA 1Z7NE 2DSFA 2Q89A 4NF8B 3W15C 4JWYA 2Z23A 2DWIA 4F1UA 3SETA 3ZKKA 1JEVA 1ZMGA 1SI1A 3JYRA 2R71A 3LBSA 4NE4A 3QYTA 4R2FA 3S4UA 4EUOA 2F5XA 4ZE9A 3S2VA 4YZZA 3F11A 4U4SA 3GLBA 3KSJA 4G8HA 4H5GA 3DM0A 4EQ7A 2OK2A 1B3FA 4NWDA 3CG3A 3OXNA 4DDDA 2FNCA 1A54A 1LSTA 2DWJA 1UIVA 2XD3A 4ZS9A 4RXLA 4YU0A 3FXQA 1WDNA 3I5OA 1R1NA 1P1OA 4QSEA 2PT1A 3K02A 4H1XA 3MVXA 3RNNA 2HAVA 3SEXA 2B65A 1J1NA 1YAEA 1BKAA 3O9PA 2AL4A 4GQOA 3LSXA 1LAFE 4DXUA 4F2QA 4OERA 5ISUA 3RT8A 5ELVA 4M1VA 3IAZA 3U94A 3K00A 3WAFA 4F29A 4BDOA 3UORA 2QMWA 4EDPA 4BDMA 1FTJA 3K6UA 4YKPA 4ZECA 2P1SA 3IORA 4IO5A 5DVJA 5I58A 1Y1MA 4BLAA 2O7IA 1AIVA 1WVJA 3S9EA 1NKXA 3QXMA 4FECA 3P7IA 5I56B 1POTA 4U23A 5TPAB 1R6ZA 4GRKA 4JWOA 1FQCA 4BDQA 2O1LA 4PETA 1N3XA 3Q28A 3VXBA 2D3IA 4R6HA 2KLFA 3AXFA 3G7WA 2V3TA 3TTMA 1I6AA 5CMBA 3OO8A 3TFLA 3PD8A 5CBRA 4MLQA 1ZU0A 2NUVA 1TWYA 4XKQA 1B4HA 3PUVE 3O6GA 4OEUA 2QJEA 1MS7A 2O51A 4OEVA 5IKBA 5DEXB 2F8DA 4F39A 4FEDA 4HW8A 4RA1A 4QFPA 3A09A 5A5XB 2PVUA 1HSJA 1TFDA 1S7YA 3N5LA 3BFUA 1Y3NA 4OHNA 1HSEA 5JEIA 3CI8A 4R6KA 2I6EA 4OESA 1P99A 2DYXA 1BTJA 2Q9TA 3USDA 1YCJA 4GFRA 3LSLA 5IAIA 3MPKA 3MP1A 4O3AA 1EH3A 3KOSA 3MVZA 3HCQA 4F3SA 1MPDA 3DP4A 5JTYB 1MQGA 1QVSA 1Q35A 4U21A 3OD7A 3E4RA 2XXPA 3RQTA 3FASA 1DSNA 2QPQA 1LAGE 2XHDA 1MM6A 2E1SA 4KPTA 1PC3A 4ELQA 3FGSA 1NNKA 2RF1A 1QUJA 2X7PA 4C1TA 4O3BA 4F3BA 1NL5A 1PBQA 4O3CA 1B40A 3TQWA 4H6DA 3DP8A 4ONYA 1B58A 4IGTA 1BIYA 2PYYA 4MLVA 4TOZA 1IEJA 1XS5A 1N0TA 1ANFA 3FJ7A 3TELA 4RJZA 3U1OA 5I2NB 4YKKA 2Y7PA 3MBPA 4R9FA 2RKMA 5DVFA 4ZEKA 1FTLA 3VVDA 2RC8A 1M5FA 2V93A 4PFUA 1I6BA 1DPPA 4LUBA 5CMKA 1NMUA 5CBSA 3B6QA 1EZOA 3KBRA 1D9VA 2HZLA 3K6WA 2F78A 1PB7A 4RNSA 2I4CA 4F1VA 3CFXA 2QRYA 3RY3A 1JQFA 1SW1A 4H8IA 2DWAA 2XX8A 1LLSA 5LOMA 2ZYOA 3C32A 4MBPA 3TCGA 1MDQA 3TTLA 4ESWA 3DP6A 3A3CA 4XIGQ 3SEVA 2H99A 5K2YA 1B3LA 5CMMA 2X7QA 4FORA 4I1DA 3H6WA 4H8JA 1YPNA 4GF8A 5I59B 4U1OA 5F7VA 3PMWA 4ZZEA 4P0IA 2Z22A 3H03A 1LFHA 1H44A 4G68C 3FZVA 4MFIA 2F6PA 4KFQA 4UACA 1SYHA 2CMOA 2HXWA 5EHMA 2ZMBA 4LVQA 2HAUA 3TODA 4FATA 3PMVA 4MF3A 3HHGA 4F2OA 4EQBA 4NF6B 1Y4CA 1UTHB 1QUKA 3UN6A 5H8QA 4KR5A 1F9BA 4GIZA 2Q88A 4EF1A 1B7UA 5AA3A 2XD2A 4RPOA 2CZLA 4NF5B 3ODBA 1ZJLA 4Q5TA 5L9MA 4NF8A 3TKDA 3T93B 1GV8A 3MP8A 1OIBA 4LZ5A 3HSTA 1USYH 5HBCA 2D21A 3ZKLA 3MQ9A 1VR5A 3N6UA 2F36A 4ZDMA 4PFYA 1VE4A 2RCBA 4KYDA 3K6VA 1Z7ME 2AL5A 4ZEFA 2DXYA 5DTBA 3A3UA 1ZTYA 1FCKA 3BBRA 4P0GA 3UGWA 2RC9A 4QSCA 1N84A 4DCXA 4R9GA 3TAJA 2V3QA 1PB8A 1OQHA 3PU5A 1FTOA 2ONSA 4Q30B 2NXOA 1JVXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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