1EU8A

Structure of trehalose maltose binding protein from thermococcus litoralis
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
407
structure length
407
Chain Sequence
IEEGKIVFAVGGAPNEIEYWKGVIAEFEKKYPGVTVELKRQATDTEQRRLDLVNALRGKSSDPDVFLMDVAWLGQFIASGWLEPLDDYVQKDNYDLSVFFQSVINLADKQGGKLYALPVYIDAGLLYYRKDLLEKYGYSKPPETWQELVEMAQKIQSGERETNPNFWGFVWQGKQYEGLVCDFVEYVYSNGGSLGEFKDGKWVPTLNKPENVEALQFMVDLIHKYKISPPNTYTEMTEEPVRLMFQQGNAAFERNWPYAWGLHNADDSPVKGKVGVAPLPHFPGHKSAATLGGWHIGISKYSDNKALAWEFVKFVESYSVQKGFAMNLGWNPGRVDVYDDPAVVSKSPHLKELRAVFENAVPRPIVPYYPQLSEIIQKYVNSALAGKISPQEALDKAQKEAEELVKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
source organism Thermococcus litoralis
publication title The crystal structure of a liganded trehalose/maltose-binding protein from the hyperthermophilic Archaeon Thermococcus litoralis at 1.85 A.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TREHALOSE/MALTOSE BINDING PROTEIN
total genus 144
structure length 407
sequence length 407
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-04-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1eu8A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1eu8A01
2PVUA 1UTBA 4RA1A 1A8EA 1PC3A 1ZBMA 3FV2A 4FE8A 1QUIA 1LBBA 4I9DA 2XX8A 1ELJA 4LQ5A 3MPKA 1SW2A 3LUYA 2UXAA 4YKKA 4ZE8A 1N7XA 3RN8A 2Y7IA 3IO4A 1B3HA 2NXOA 3USDA 3UGWA 3G3FA 2E0SA 3CI8A 1AL3A 4GOTA 4R72A 4KFQA 2DS9A 2PYYA 1S9TA 2V84A 2XHDA 3H6WA 3SEYA 2D3IA 1LGBC 3I5OA 2O7IA 1I69A 4RJZA 4LONB 5I2NA 5I84A 2F6PA 3O6GA 3FVKA 1JNFA 3K1MA 2OK2A 1JVYA 3B6QA 5M2VA 2R6GE 4FJPA 1T0KA 3PPRA 2RCBA 3KFMA 3M3LA 1AMFA 1JEVA 1LFGA 3PPOA 5K2YA 2LAOA 1M5FA 5F1QA 3SEUA 3CSBA 3IORA 3JYRA 3U1OA 3KZGA 1B2HA 3MPLA 4PE5B 4F2OA 2GHAA 1MY1A 1IZ1A 4U23A 1VR5A 4IY5A 3MVZA 3LSXA 3W15C 4TOZA 3UA8A 1ZIUA 4Z7EA 4EQBA 1LB8A 2F5XA 1JW4A 2F78A 2IA4A 4F1VA 3RNNA 1R1NA 4TLMB 5KCJB 3TEPA 3E4RA 4GWOA 4DXUA 5KCJA 4H67A 1MM6A 1B4ZA 4FEBA 5H8FB 4X9TA 4R74A 3PU5A 3TTLA 3C32A 1VSOA 3DM0A 5DT6A 1ZU0A 2F7CA 2RCAA 5B70A 3KGCA 5H8HB 3H06B 3SERA 5TU0A 3FVGA 3OMBA 3OO6A 2PT1A 5H8HA 3FV1A 3FUZA 4I8CA 1OIBA 2UYEA 4R75A 3S9NC 5JTYB 1XT8A 5ISUA 3FVOA 2QMXA 3OSRA 4ZS9A 3TCFA 1B6HA 1JQFA 3QK6A 4JWYA 1IEJA 5CMMA 1OVBA 2RC8A 4ELOA 1R6ZA 3C9HA 1TFDA 3KBRA 4RXLA 4ZZAA 4IGTA 3S9MC 2ONRA 3D4GA 1MQHA 1MXWA 1ATGA 3RTFB 2O1LA 3KN7A 4PFYA 3MVWA 3MZBA 4NWDA 3PD9A 1PBPA 1YAEA 3T9XB 4LZ8A 2XXRA 2XD3A 3C31A 3JV9A 2AL4A 3UN6A 3TMGA 4RPNA 3K2DA 4LATA 1OMPA 3QSLA 3O97A 2X26A 5CBSA 2M8CA 1OLCA 5BUUA 4G68C 3QUJA 3HHFA 2HZKA 3SETA 3ILUB 3V83A 4EQ9A 5CRYA 1P1WA 1HSJA 3TELA 4GFRA 1B1HA 4BLAA 4HW8A 1QKBA 2Q8JA 2QS4A 1EZOA 3GXAA 4QHQA 4H8JA 1BKAA 1MDQA 1Y3NA 4KD5A 3T93B 3TQWA 1MY2A 1DMBA 1UIVA 1D9VA 2ZYOA 3SEVA 4YMAA 1FTJA 3LR1A 4BDRA 2ZMBA 3EF7A 1B52A 4QFNA 2YJPA 4H0WA 3R6UA 1YTVA 1IUDA 2OCUA 2DXYA 3IK6B 1N84A 2Y7KA 4OXVA 3VLUA 3MAMA 2O69A 2QRYA 4M4GA 4MLQA 4GD5A 4LA9A 4ZEDA 2RC9A 3C35A 4C1UA 5FTHA 4R6YA 3B6TA 3IJXB 1URSA 4OVJA 1N3WA 1Q35A 3DP8A 3PPQA 3SEWA 4YZZA 3RT8A 3OXNA 5H8QB 4EF2A 2PBWA 1O7TA 4ZZEA 2DP8A 1JW5A 3FXQA 4IB2A 5ICQA 4KR5A 1LLSA 4F2QA 5KZTA 2B3FA 4IGRA 4QRZA 4BDNA 2NVUB 1B05A 1B3GA 4QFOA 5I57B 3MQ9A 4LZ5A 4MLVA 3VVDA 1POTA 4JWOA 4KCDA 5I57A 3S9LC 4U4SA 2QMWA 1Y4CA 3MP8A 3PMVA 4KYDA 4IO7A 2DWIA 1B5HA 3S4UA 1BP5A 2R9JA 5TP9A 3MP6A 1MXVA 1ZTYA 5TPAB 4ELRA 1PB9A 4YKJA 2VOZA 5TPAA 4ZEKA 3VLVA 4R9GA 3QUFA 3MJNA 5CMCA 3O6HA 1Q1KA 3SDFA 1Y4TA 2XXHA 3KN3A 2PX1A 5FHNA 3ZSFA 1B9JA 4JBZA 2I4BA 3VV5A 3UP9A 2P2AA 4F1YA 3O66A 4DCYA 1LFIA 3MWBA 3TDJA 3H6TA 2G29A 1A8FA 4YKPA 2QS1A 1OQGA 5EHMA 3B7DA 4JWXA 2UVGA 2CMOA 5FHOA 2Z23A 4IO4A 4K3FA 2PT2A 2O1MA 4EDPA 4E0XA 1PBQA 3I6VA 3FJMA 3E3KA 5H8SA 2O51A 3IB1A 2XXQA 1IXIA 2I3WA 4I1DA 5J1DA 1MXUA 3FIRA 4Q0CA 3V8XB 4HTGA 2AL5A 1UTHB 4N07A 1DTZA 3LBSA 3LSFB 2FNCA 2OJTA 1UTHA 1BTJA 2F34A 1H76A 1XVXA 3QAXA 4F3PA 1B3EA 2H4IA 1MXXA 4LP2B 3LSWA 3RT6B 3KEIA 3ECRA 3JZJA 2XX9A 3O6IA 2I3VA 5B7DA 1LAFE 3TTRA 4LZ7A 3K01A 5K2XA 5I58B 3IOUA 1EZ9A 5I58A 4RNSA 4WXJA 2DWHA 1XOCA 4FECA 1RKMA 3RPWA 4GQOA 2XX7A 1R9QA 2QSXA 1L5TA 3FJ7A 2ESNA 4U21A 3RQTA 4X1DA 1Y20A 2AIXA 3MVXA 3IR1A 4P11A 3DP6A 3C33A 4GXAA 4G8HA 4FEDA 5ELVA 3A3UA 3RUMA 5I2NB 2FA7A 3TYHA 1QUKA 3MBPA 2B65A 1LCFA 2NWJA 4U1OA 3FASA 4G68B 3T9VA 2H25A 2Q89A 1M5BA 2OZZA 4ZE9A 3Q29A 4BDOA 4G68A 3FD3A 3DLNA 2BJJX 2I4CA 1B0LA 3DP4A 1A40A 3CR9A 5F7VA 3MVYA 3TPAA 1XHYA 3IB0A 3UIFA 1LAXA 2F7BA 2Z22A 1S7YA 3EPEA 3OO7A 1QJMA 3QYTA 3LSLA 4ZEBA 4OFLA 4I62A 1B7HA 3U94A 1R9LA 2ZNUA 2XXWA 1P1UA 3QIMA 4HCYA 2V93A 4F18A 4PP0A 3UORA 3IB2A 2NOOA 4BDMA 1GGGA 4QSEA 1MQDA 2X7QA 1JW1A 1IQ7A 4FORA 4F39A 1MPBA 3HCQA 1II5A 4Q30B 3K0VA 4KPTA 3OOAA 3KN8A 3ODBA 1JETA 2AYSA 2Q2CA 3L6GA 2G93A 1FQBA 2Y7WA 2DWAA 3U92A 3FXRA 4X48A 2ALUA 1ZKBA 1GV8A 3FATA 2KLFA 3K4UA 2Z8FA 4RYAA 1MY0A 1DPPA 3PMXA 4JSOA 3IJOB 1IXHA 2V25A 3PUVE 2DQVA 4H5GA 4HCWA 3WAFA 3TTNA 1NFTA 2V3QA 3PD8A 3V5AA 1Y3PA 4YAHX 3HHGA 3TODA 2HFBA 3I3VA 4OENA 4DCXA 4AB5A 1NNPA 4RK2A 3KJ7A 2A5SA 5AA2A 4O3BA 3B6WA 4F19A 3BFUA 1B3FA 2I48A 1PB8A 1PEBA 2DXRA 3GLBA 2FYIA 4PFUA 4U22A 3IAZA 1US5A 4WEPA 4ESXA 3G3KA 4ND9A 1B51A 4MF3A 1BIYA 1RYXA 1IXCA 4F3SA 1J1NA 1DTGA 3C4MA 5CMBA 4DIGA 3ZKKA 4DDDA 1PB7A 3G3IA 2DE4A 3TAJA 1ZMGA 1H3DA 2GHBA 4IY6A 2F6GA 1NKXA 2D5WA 3T22A 4R6KA 3PUXE 5A5XA 1H43A 2ZYMA 1OVTA 3PUYE 4GL0A 4KCCA 3ILTB 4ZEFA 1Y3QA 2V3TA 4YB7A 1IITA 1B1XA 1HSEA 1QW0A 1NMUA 1FTLA 1LBCA 2A5TB 2XXVA 1ANFA 3IL1B 2QJEA 3TFLA 1OQHA 2A5TA 3G3HA 4Z0IA 3DELB 2ONSA 1YCJA 4R73A 3IX1A 3MZ1A 2O84X 2DE2A 3HPIA 4FIMA 1EU8A 5L9SA 1TT1A 1A55A 3FGSA 3GBAA 4UACA 1FQAA 4JXIA 4QF9A 3K6VA 3R26A 1B5JA 5AA1A 4R9FA 3KOTA 1FCKA 2XXIA 1B4HA 3GZGA 2ZXTA 4C1TA 4OTEA 5I2KB 3H4ZA 4NF8A 4G2ZA 3KG2A 2NUVA 1USYH 5I2KA 3OEKA 4ELQA 2HAVA 1TXFA 2F35A 3M3FA 2GFEA 2UVIA 4UA8A 1ZLQA 1MQIA 3KJTA 3GBBA 4E0WA 2YLNA 1DPEA 1URGA 3N94A 2QS3A 4U2RA 3MZ9A 3TCGA 1P1QA 1DSNA 4ONYA 3PGFA 3U8QA 2OLBA 5TP9B 2DVZA 1A54A 3PPNA 3K6XA 5HPQA 5LOMA 2I0BA 4U4XA 3RY3A 3BKIB 4U1ZA 1SW5A 4PETA 4KQPA 2Y84A 1NNTA 3HSTA 4XKRA 3E13X 3HV1A 3O28A 4TLLB 2ONKE 1B32A 3MUQA 4ECFA 2XXYA 1Z7NE 3CFXA 4PFTA 2F8DA 4NTLA 1MPCA 4OERA 3A3CA 1VFEA 1D9YA 1N04A 1FTOA 3P7IA 4C0RA 3MW0A 5EYFA 4OFJA 3H3GA 2VHAA 4GRKA 4XTCQ 1SYHA 4NWCA 4LUBA 4ELPA 3TZAA 4N6PA 1SDXA 2OWTA 4RPOA 3OEMA 3KSJA 1JVXA 4RY1A 3FXUA 4Q5TA 2ANJA 2Z8DA 4YB6A 5DTBA 2H9BA 5HBCA 4QFKA 3VFJA 3VXCA 4XXUA 4M1VA 4EF1A 2VP1A 4OWDA 3Q28A 3FVNA 4H65A 4MBPA 1AOVA 3N6TA 2XXUA 4GXSB 3Q27A 1LFHA 1XS5A 3S2VA 1RYOA 2ZYKA 2P0SA 5DYHA 4NF5A 1IIWA 4DZ1A 5CC2A 1MQJA 2RC7A 5FTIA 3E9XA 4ISUA 5L9MA 5AA2D 2REJA 2H98A 4NE4A 3Q25A 1A99A 5JK4A 1B7UA 4QSDA 2REGA 1QULA 3A09A 2H5YA 2HXWA 3VVFA 5BWJA 3H7MA 3CRBA 4QSCA 1N3XA 2O68A 3IOTA 4YU0A 3RTWB 4ESWA 3OENA 3W9VA 2I58A 3VDFA 4NEDA 1SI0A 1NNFA 1B0HA 1GR2A 1B3LA 3OO9A 1LCTA 3U72A 1B40A 1P1OA 2RF1A 3OELA 4MH5A 4MFIA 1B5IA 1FTMA 3ZKLA 2QL3A 3VVEA 5CMKA 5JEIA 3D4CA 4THIA 3CSGA 3SEXA 4OFOA 2CZLA 4GF8A 4EXLA 4FAJA 3QXMA 4OQOA 1CE2A 5IAIA 4IO2A 2XXPA 2UYFA 4GVOA 5H8NB 3G3JA 2VGQA 3EQ1A 5ICTA 2Y7RA 3CG3A 5DEXB 2O6AA 5H8NA 1YPNA 4XKNA 4EQ7A 5DEXA 2RKMA 3BBRA 1WDNA 2DOJA 2F7AA 3SESA 1H44A 4YKIA 1ZJLA 4KYSA 1MXYA 3K1NA 5KDTB 4P0GA 4EXKA 4F3BA 1MDP1 5CI5A 1USYE 1UTBB 5KDTA 1H45A 3N26A 4PQJA 1D3KA 3IOVA 3O29A 4OEUA 5DVIA 3PUZE 1LB9A 3H03A 3T9UA 4H1XA 1MM7A 4G77A 2HEUA 4XIGQ 4F1UA 4POXA 5AA4B 5I56B 3H6VA 5L8DA 4G8NA 1QUJA 5AA4A 4GIZA 2E1SA 5I56A 2R71A 2WKYA 1AH5A 3ZS6A 4BDLA 3EHSA 4OZ9A 4L17A 4WKMA 4OESA 2ZYNA 3UK4A 2DVCA 4KYEA 1GVCA 1S50A 4H8IA 1P99A 4AB6A 5I59B 2Q88A 1SQYA 1FQCA 4QFLA 4WEDA 1MS7A 5H8FA 5AE4A 1EH3A 2THIA 5I59A 2OBGA 4QFPA 5CM6A 3TTKA 2PMSA 4YB5A 4Q8RA 3L6HA 3W9WA 4NF4B 4F3GA 1MY4A 4IO3A 3IOWA 4NF4A 4PFWA 4OYVA 4KHZE 2IEEA 3U93A 5AA2B 4F29A 5JTYA 3FJGA 5IKBA 2B3BA 1B58A 2Q9TA 1A7LA 1XVYA 3CG1A 2Q2AA 1MXZA 3C36A 3EHUA 2DSFA 2XXTA 4DXCA 3TUSA 3OO8A 1SBPA 1Z7ME 1O63A 5AA3A 3EHTA 3G3GA 2P1SA 2UVHA 1N76A 2X7PA 2OWSA 2F36A 4DE8A 1UQWA 3G7WA 3T9HB 1JEUA 1LAGE 3N5LA 3S9EA 3EN3A 3T96B 3AXFA 4DXBA 1SYIA 1SW1A 1MPDA 1MRPA 2I0CA 1KWHA 3LC8A 3MP1A 4X1BA 1BLFA 3CFLA 2XXXA 5A5XB 5DVFA 2DE3A 1CB6A 4NMYA 3VE1B 2I49A 5ITPA 4HS7A 5DVJA 4OEVA 1Y9UA 1AIVA 2VD2A 1POY1 3IO6A 1FQDA 4IO5A 4F31B 4H5FA 4R2FA 1I6AA 5L9OA 2O7UA 3PUWE 1EZPA 3KOSA 4H6DA 5FHMA 3R7XA 2W7YA 3HO7A 3TTMA 4LQ2A 2YPNA 4GL8A 3RLFE 3PV0E 3CVGA 3OD7A 3O2AA 3K6WA 2UVJA 3K1PA 1B46A 2DYXA 4YICA 2QPQA 1NNKA 2GRVA 3HN0A 1NH8A 1SVXB 3Q26A 3VLWA 4YMBA 2GH9A 1FQEA 1NH7A 1SD3A 3O9PA 3K00A 1I6BA 1M5CA 1M5DA 3PMWA 4ZEIA 2QS2A 4G8MA 1D4NA 2DWJA 4NF8B 3ONMA 2F97A 1P1NA 2H99A 1I6QA 1Y1ZA 4OMBA 1TFAA 5ITOA 1WODA 2XD2A 2Z8EA 4O3AA 1XC1A 1QVSA 5EHSA 5H8QA 3C34A 4JDFA 4OETA 3H6UA 4FATA 1MH4A 1LAHE 3THIA 1N0TA 4BDQA 2ABHA 3V89B 1IXGA 1F9BA 1FTKA 5CBRA 1WVJA 3TQLA 4DLDA 4JB7A 4POWA 4JSDA 3BFTA 2I6EA 2ZNSA 3VXBA 1TWYA 2V3UA 1B7ZA 1SW4A 4R6HA 1MQGA 1GTKA 1DOTA 1NL5A 2Y7PA 2D21A 1URDA 4TQUQ 2RINA 1MY3A 2HCAA 2ZNTA 3RGYA 4XKQA 4KI0E 1N7WA 4IO6A 4ZECA 3CIJA 3M3KA 3N6UA 1OLAA 2VD3A 1HSLA 4ZDMA 4GLIA 4LVQA 1UIUA 4N13A 3FZVA 4NF6B 2HAUA 4F22A 3F11A 1MG1A 4NF6A 4G4PA 5HM4B 3T66A 2HZLA 4OHNA 3TKDA 4RK9A 3MC2A 1FW0A 1Y1MA 3PPPA 4P0IA 3SKPA 1VE4A 1FQFA 4R2BA 3K6UA 1LSTA 1PDAA 3K02A 3M8UA 1QKAA 4NF5B 4AQ4A 1MH3A 1O64A 3CFZA 3KSXA 4XKPA 2HQ0A 1SI1A 4O3CA 1US4A 1VFDA 3WAEA 3TCHA 4EUOA 1M5EA 3OSQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HPGA 2PVUA 1UTBA 4RA1A 1A8EA 1IMAA 1PC3A 1ZBMA 3FV2A 4FE8A 4GBVA 1QUIA 4MNPA 1LBBA 2JJKA 1EYKA 4I9DA 2XX8A 1ELJA 4LQ5A 3MPKA 1SW2A 3LUYA 2UXAA 4YKKA 4ZE8A 1N7XA 3RN8A 2Y7IA 3IO4A 1B3HA 2NXOA 3USDA 1FPFA 4NAPA 3G3FA 3UGWA 2E0SA 3CI8A 1AL3A 4GOTA 4R72A 4KFQA 2DS9A 4MMPA 2PYYA 1S9TA 2V84A 4PCDA 2XHDA 1NV5A 1YZ0A 3H6WA 3SEYA 2D3IA 1LGBC 3I5OA 2O7IA 1I69A 4RJZA 4LONB 3RPLA 5I2NA 5I84A 2F6PA 3O6GA 3FVKA 4N81A 1JNFA 3K1MA 2OK2A 1JVYA 3B6QA 5M2VA 2R6GE 4FJPA 1T0KA 3PPRA 2RCBA 3KFMA 4PBHA 4DI4B 3M3LA 1AMFA 1AWBA 1JEVA 1LFGA 3PPOA 5K2YA 2LAOA 1M5FA 5F1QA 4N4UA 3SEUA 3CSBA 3IORA 2XWIA 3JYRA 3U1OA 3KZGA 1B2HA 3MPLA 4PE5B 4F2OA 2GHAA 5EYHA 1MY1A 4MEVA 1KZ8A 1IZ1A 4P47A 4U23A 1VR5A 4IY5A 3MVZA 3LSXA 4OVQA 3IFCA 3W15C 4TOZA 3KBZA 3UA8A 1ZIUA 4PDHA 4Z7EA 4EQBA 1LB8A 2F5XA 1JW4A 2F78A 4H46A 2IA4A 4F1VA 3RNNA 5I7IA 1R1NA 4TLMB 5KCJB 3TEPA 3E4RA 4GWOA 4DXUA 5KCJA 4H67A 1MM6A 1B4ZA 4FEBA 4X9TA 5H8FB 4R74A 3PU5A 3TTLA 3C32A 1VSOA 3DM0A 4PGNA 5DT6A 1ZU0A 2F7CA 2RCAA 5B70A 3KGCA 5H8HB 3H06B 3SERA 5TU0A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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