1EU8A

Structure of trehalose maltose binding protein from thermococcus litoralis
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
407
structure length
407
Chain Sequence
IEEGKIVFAVGGAPNEIEYWKGVIAEFEKKYPGVTVELKRQATDTEQRRLDLVNALRGKSSDPDVFLMDVAWLGQFIASGWLEPLDDYVQKDNYDLSVFFQSVINLADKQGGKLYALPVYIDAGLLYYRKDLLEKYGYSKPPETWQELVEMAQKIQSGERETNPNFWGFVWQGKQYEGLVCDFVEYVYSNGGSLGEFKDGKWVPTLNKPENVEALQFMVDLIHKYKISPPNTYTEMTEEPVRLMFQQGNAAFERNWPYAWGLHNADDSPVKGKVGVAPLPHFPGHKSAATLGGWHIGISKYSDNKALAWEFVKFVESYSVQKGFAMNLGWNPGRVDVYDDPAVVSKSPHLKELRAVFENAVPRPIVPYYPQLSEIIQKYVNSALAGKISPQEALDKAQKEAEELVKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords TREHALOSE/MALTOSE BINDING PROTEIN
publication title The crystal structure of a liganded trehalose/maltose-binding protein from the hyperthermophilic Archaeon Thermococcus litoralis at 1.85 A.
pubmed doi rcsb
source organism Thermococcus litoralis
molecule tags Sugar binding protein
total genus 144
structure length 407
sequence length 407
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-04-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1eu8A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1eu8A01
5KDTA 4MF3A 2VHAA 1N0TA 4FEBA 5FTIA 1S9TA 3TEPA 4F3PA 4AB6A 1LSTA 4ZDMA 1JEVA 4G2ZA 4AQ4A 2PT1A 3LC8A 4ZEFA 2YPNA 3LSXA 4BDOA 3SKPA 2Z23A 2ONKE 2G93A 2QMWA 5HM4B 2RC8A 4R72A 1BLFA 4GXSB 4LZ5A 4Q8RA 3SEXA 3V8XB 2I4CA 4C0RA 1MM7A 5HPQA 1AOVA 1FTJA 2XXPA 3KJTA 3PMVA 4NMYA 3VVFA 3PMXA 3FV1A 3C32A 3C34A 3N5LA 1MQJA 1A8EA 2H98A 4IO2A 1BKAA 2XX9A 4FORA 2O51A 4X48A 4QFOA 3OSRA 4HS7A 1TXFA 4QSDA 3V83A 3FATA 4GRKA 2X26A 1LAFE 3O66A 3QXMA 1QW0A 3TTLA 1DSNA 1FW0A 4FJPA 1MPBA 3IOUA 4TLMB 2I0BA 4N07A 3UA8A 5L8DA 2AIXA 2Q8JA 3QSLA 4I1DA 5H8NB 4G8HA 1LB9A 1MXVA 1MXYA 3MVZA 1N3WA 3O97A 3USDA 1M5FA 3VLUA 4OXVA 3TELA 3E9XA 2RC7A 3T9HB 3G3KA 3GLBA 4XKRA 4TLLB 2HFBA 3N6UA 3QYTA 1QVSA 2QS3A 4NF6A 3LUYA 2PX1A 2DVZA 3KJ7A 3IB0A 2ZYOA 4H67A 3RGYA 4R6YA 1RYOA 2AYSA 4NWCA 1JW5A 1YPNA 1IXIA 4NF4B 2E1SA 5L9SA 2Y84A 4ESXA 2F7AA 3ZSFA 2DE3A 3GXAA 2H99A 5DT6A 4POWA 4HCWA 2VD3A 4WXJA 2B3FA 2CZLA 3EHUA 3OO6A 1P1NA 3MP6A 3LR1A 3RQTA 4F18A 4YKKA 2ZMBA 2Q9TA 2PMSA 3KFMA 2DXYA 3A3UA 4G77A 5KCJA 3T9VA 5H8QA 4I62A 1ZLQA 3MAMA 1F9BA 4NF8A 2QRYA 3EPEA 1FTLA 5I59A 3FZVA 1XOCA 2DWJA 1XVXA 4OEVA 4EF2A 1IQ7A 1R6ZA 1LLSA 5I2KB 1VFEA 2V3TA 3ZS6A 3HO7A 3QUFA 3K6UA 4TQUQ 3FVKA 3MUQA 1Q35A 3EHTA 1A99A 4ZZAA 1RKMA 4PFUA 4U2RA 4FATA 4RPNA 2E0SA 3I6VA 3HPIA 3TTMA 2AL4A 4JWYA 3T9XB 2DWHA 3PMWA 1SYIA 4M4GA 2VD2A 4YKJA 4AB5A 2OCUA 2XXUA 3IB2A 4GF8A 4YICA 1M5CA 1CE2A 3OEKA 1II5A 3VXCA 3UGWA 2PBWA 3CR9A 4OVJA 3S9MC 1KWHA 5FHMA 2OWSA 3IO4A 1P1QA 4KPTA 1URSA 4BDMA 1NNKA 1VE4A 1PC3A 1FTKA 2OK2A 3O29A 2DSFA 3MZ9A 4OFOA 2UVHA 1B7UA 1B5HA 4BDQA 2V84A 3FD3A 1WODA 3G3FA 2F34A 3H3GA 5AA2B 1Y4TA 2XXQA 1N76A 1SVXB 4MH5A 2O84X 1R9LA 3TMGA 3LBSA 5M2VA 4QRZA 2PT2A 1JQFA 2Q89A 1NFTA 5I56A 2OJTA 4PQJA 4O3BA 4ELPA 4EQ9A 1UTBB 1TFDA 1DMBA 3G7WA 3M3LA 3UIFA 3HSTA 3C4MA 1B52A 3DELB 2LAOA 4E0XA 1B1HA 1O7TA 1JVYA 4GIZA 3IOTA 4PETA 4U23A 2OLBA 4ZECA 3CG1A 1JEUA 1IXHA 1MY3A 4OTEA 1B7HA 1NNPA 2A5TB 3CI8A 3ECRA 2RCBA 2WKYA 1P1WA 1H43A 5H8FA 4ELRA 2ZYNA 3WAEA 1H45A 3EF7A 3K01A 4JSOA 4C1TA 4JBZA 3E3KA 3PPOA 3L6GA 1Y1MA 4MFIA 4RNSA 5ICQA 4QFNA 3TFLA 2FA7A 4THIA 5IKBA 1Y20A 3H4ZA 3KOTA 3CSBA 3MC2A 5KZTA 3CIJA 3K02A 4EQBA 1VSOA 5IAIA 3B6QA 3FGSA 5BUUA 2ALUA 3CFLA 5DVJA 2F35A 4F2QA 1HSJA 4ELQA 5CMMA 4LQ2A 4EXLA 1SQYA 5LOMA 1US4A 2DWAA 4WKMA 3Q29A 2REGA 3IJXB 2F6PA 3PUWE 3JZJA 4BDRA 3KGCA 3MBPA 1LAHE 2QMXA 1SBPA 2GRVA 2ZNUA 3CFZA 4IGTA 3SEWA 4YZZA 5F1QA 3TCFA 3OENA 5CC2A 3OO7A 5H8SA 1MQGA 1EU8A 2VP1A 5B70A 3MJNA 1OLCA 2HAVA 5CMCA 5AE4A 1B4HA 3IR1A 2Z8EA 3R26A 1DOTA 4QFPA 4NTLA 2VOZA 4DXUA 4OYVA 4IO7A 1DPPA 2YLNA 1AMFA 1A54A 1LAXA 3FJGA 1MDQA 1EZPA 4F1YA 4U4XA 4NF6B 3OD7A 4JSDA 3FASA 1USYH 4KCCA 1N04A 3THIA 5B7DA 1MY1A 3D4CA 5DTBA 4XTCQ 1FQFA 4DCXA 3BFTA 2ONRA 4HW8A 3PUYE 2QJEA 1UIUA 3IAZA 1R1NA 4RYAA 2H25A 1URGA 3UP9A 3PUZE 3OO9A 1B3LA 1ZMGA 4LATA 1D9VA 3FIRA 5H8HA 4IY5A 3H7MA 3CRBA 3MPLA 1B46A 1D3KA 4H0WA 1OQHA 4NF8B 1J1NA 4N13A 3GZGA 2V3QA 4ISUA 5I59B 1MXUA 3IJOB 3K1NA 3FXRA 1QKBA 2UYFA 2F6GA 4KQPA 4KR5A 2V3UA 1FCKA 4Z0IA 1A40A 2DS9A 3T96B 4R74A 1TFAA 3PUVE 3RTWB 1PB7A 3BKIB 4ZEDA 1Z7ME 1LBCA 1QKAA 2RC9A 5EYFA 4R9FA 4OEUA 1QUJA 3B6WA 3H6VA 1N3XA 4M1VA 3K6XA 2HCAA 2Y7WA 2NVUB 4I9DA 3RTFB 2DVCA 1XVYA 3QUJA 3I5OA 4OMBA 4F3BA 3PPPA 1LBBA 4OHNA 3SEYA 5FTHA 3HV1A 3FV2A 5J1DA 5JEIA 1DTZA 4QF9A 4NF5A 5TP9B 1FQDA 5JK4A 2I0CA 5ICTA 1LFIA 3GBAA 1NNTA 3F11A 1LGBC 1MPDA 3OOAA 1MH4A 3U1OA 1OIBA 4E0WA 4I8CA 2D3IA 2DWIA 1B40A 3VVEA 2DE2A 3EQ1A 4DLDA 2ONSA 2RF1A 3OSQA 1TWYA 2HAUA 2ANJA 1GVCA 4H65A 1A7LA 1Y9UA 4QSEA 3E4RA 4KYEA 5CM6A 5K2XA 3PPQA 5TPAA 4ZS9A 5CRYA 5I56B 3MVYA 3K0VA 5AA3A 2F8DA 1IUDA 4U4SA 4YB5A 1GTKA 2X7PA 5I57B 2QPQA 4XKPA 4TOZA 1MH3A 1B6HA 3SEVA 1D9YA 1ZJLA 3GBBA 1VR5A 5AA1A 1B3EA 3CVGA 3HHFA 1QULA 5DEXA 4X1DA 3O9PA 5ITPA 3A09A 1OQGA 1XT8A 3VVDA 3KEIA 4WEDA 4LP2B 1ZKBA 2O1LA 4HCYA 4U21A 2I58A 1MRPA 1B51A 2OBGA 3Q27A 4BDNA 4RJZA 4PFTA 2O1MA 2REJA 3K6VA 1AIVA 4X1BA 1SW2A 2HQ0A 5F7VA 1AH5A 3R7XA 2M8CA 3DP6A 2YJPA 3FUZA 2Y7KA 1B4ZA 1M5BA 3MVWA 4LZ7A 3HN0A 1OLAA 3TTKA 2B65A 3IOWA 3HHGA 1YAEA 2Z8DA 3L6HA 3C9HA 4JXIA 4ZE9A 1DTGA 4F3SA 2R71A 1GV8A 2XXWA 2I48A 3B6TA 2ZNTA 4KFQA 5I58A 4KCDA 4YB6A 1MQDA 3RN8A 5CMBA 2AL5A 2CMOA 4RY1A 1B5JA 3K6WA 2FNCA 3PGFA 4G68A 1SDXA 2XXVA 5I84A 3G3JA 3MWBA 3W9WA 5CMKA 4R2BA 2Y7PA 4ELOA 2XXTA 4FECA 3V5AA 3UORA 1HSLA 3T22A 4XKQA 3TPAA 4KHZE 2Z8FA 1ZU0A 2Y7RA 3TODA 2O68A 3RY3A 2R6GE 1AL3A 2OWTA 3IX1A 3KSJA 5CBRA 3IK6B 1ZBMA 2D21A 1QJMA 3CFXA 1MS7A 2I6EA 3C31A 3TCGA 3M3KA 5KDTB 3LSLA 2XXHA 2RCAA 4KYSA 1P1UA 1MQHA 4QSCA 1IZ1A 4H8JA 3K4UA 4ESWA 5K2YA 2NWJA 3RUMA 5FHNA 3S4UA 5L9MA 3PUXE 4C1UA 1BTJA 3VE1B 2QS2A 4LONB 2P1SA 3H03A 1Q1KA 2Q2AA 5H8HB 4EXKA 1GR2A 1LCFA 2DXRA 3H06B 3HCQA 1N84A 3PD8A 4U1ZA 4YMAA 4ECFA 1LB8A 3M8UA 2F36A 2XXIA 2GHAA 3B7DA 2ZXTA 1OMPA 3BFUA 4JWXA 3MP1A 1P1OA 1EZ9A 2I3VA 2XD3A 3TKDA 4OFLA 2UXAA 4XIGQ 4LVQA 5AA2D 1SW4A 3PPRA 1SW5A 1POTA 4YMBA 2NXOA 3PU5A 2G29A 1R9QA 3C33A 1QUKA 4GL0A 3H6UA 4GXAA 1O64A 1SYHA 4UA8A 4NF5B 4GD5A 2F5XA 3OEMA 4G68C 5FHOA 2DQVA 5ELVA 4MLQA 3I3VA 4ZEBA 2UVIA 3PD9A 3ILUB 1ANFA 3P7IA 2THIA 2H4IA 3PPNA 4EQ7A 4OESA 3BBRA 3DP8A 1P99A 4GWOA 3KOSA 3FXQA 4BLAA 4H8IA 1PDAA 1B7ZA 3JYRA 5I2NA 3Q26A 4H6DA 4OETA 1FQBA 3MZ1A 3K1MA 2ZYMA 1H76A 4Z7EA 3N6TA 4K3FA 3O6GA 1H3DA 5TPAB 3SESA 4DE8A 3TUSA 4DZ1A 1S7YA 2A5TA 3O6HA 1JW4A 4GFRA 1Y4CA 4U1OA 4R9GA 4EF1A 4RPOA 2A5SA 5KCJB 4DCYA 2DOJA 3C36A 3K1PA 1MDP1 5H8QB 5DEXB 3SEUA 1PBQA 4R2FA 3EN3A 4X9TA 4F1UA 1FTOA 2XX8A 3PV0E 5JTYA 1US5A 3FVGA 4ZEIA 2UVGA 5A5XA 2QS4A 1MG1A 4H5GA 1M5EA 2O6AA 3T93B 1NMUA 3K2DA 1I6AA 3TAJA 2O69A 1POY1 2F7BA 3D4GA 4GLIA 4EUOA 3MVXA 5TU0A 3DLNA 2H9BA 1XC1A 4H1XA 1SW1A 2IA4A 2XXXA 4NE4A 3U94A 3SERA 4G8MA 5CI5A 2V25A 3VDFA 4JWOA 1UTHA 1XHYA 4DXBA 4F1VA 4LQ5A 4P11A 3K00A 3VLVA 3N94A 1MY0A 1UQWA 3U92A 3FJMA 5I58B 3U72A 2RINA 4XKNA 3W9VA 1B5IA 4PFYA 4POXA 1N7WA 3M3FA 4IO4A 1B3FA 4LUBA 4ZE8A 2DP8A 4QHQA 1I69A 4G68B 3C35A 1LFHA 4NEDA 2H5YA 1B3HA 3G3GA 3U93A 1QUIA 1I6BA 4JB7A 3FJ7A 4GVOA 1SI1A 3TTNA 3LSWA 4O3AA 1LAGE 2BJJX 2R9JA 3TCHA 2KLFA 2I49A 5AA4A 3S9EA 3JV9A 3MQ9A 3MP8A 4F22A 4GL8A 3ZKLA 2IEEA 1A8FA 4Q30B 2ZYKA 4IO5A 3RLFE 4GOTA 4EDPA 3RT6B 1MXWA 1PB9A 1JETA 3SETA 2HZKA 5H8FB 3KN3A 2XXYA 5DYHA 3O28A 5DVFA 3TQLA 3KZGA 1CB6A 1YCJA 2ESNA 5BWJA 4L17A 3O2AA 2NUVA 2QL3A 3VV5A 1RYXA 1LFGA 3TTRA 4ND9A 2XX7A 1HSEA 4G8NA 2ZNSA 2GH9A 5EHMA 1LCTA 2GHBA 4KYDA 3FVOA 1IIWA 2OZZA 3MZBA 1NH8A 1B58A 4G4PA 5EHSA 2HZLA 3QK6A 4R6KA 1NKXA 5ISUA 3KN7A 1PBPA 3CSGA 3DM0A 3Q28A 1PB8A 4QFKA 1WVJA 1PEBA 3KN8A 4H5FA 4R75A 2X7QA 1USYE 3RNNA 2Y7IA 4BDLA 1MQIA 1S50A 4NWDA 3Q25A 3MW0A 5H8NA 5TP9A 4OWDA 4IGRA 2F78A 3OMBA 2HEUA 3VFJA 1Z7NE 4FAJA 1B9JA 1SD3A 4ZZEA 3S2VA 4PP0A 3V89B 3UK4A 1URDA 4DDDA 1VFDA 2F97A 4RA1A 3G3IA 2QS1A 3KSXA 4IB2A 4N6PA 1MXXA 4U22A 3QIMA 1BIYA 1JNFA 2GFEA 1SI0A 4R6HA 1IXCA 1MPCA 3VXBA 3DP4A 1MY4A 2UVJA 3OO8A 3S9NC 5DVIA 2I3WA 2B3BA 3T66A 4RK9A 3RPWA 1B1XA 4GQOA 4P0IA 4NF4A 4Q0CA 3N26A 5I2NB 1UIVA 2XHDA 4F39A 4LA9A 3IO6A 4F29A 4OFJA 4KI0E 1NH7A 4UACA 2O7IA 5I57A 5CBSA 1B0HA 2F7CA 5L9OA 4FEDA 3LSFB 4FIMA 2W7YA 3ZKKA 4F19A 2P2AA 3FVNA 2ABHA 3IL1B 2VGQA 3EHSA 4MLVA 1MM6A 3UN6A 4OENA 1YTVA 1O63A 1Y3QA 2O7UA 4FE8A 3U8QA 1IITA 5I2KA 4F3GA 1I6QA 1Y3NA 2XD2A 4HTGA 3OXNA 2Q88A 1EZOA 5HBCA 4QFLA 1FQCA 1DPEA 4IY6A 3QAXA 2FYIA 4YKPA 1IEJA 1H44A 4RK2A 1FQAA 1MXZA 3TZAA 1ELJA 1WDNA 3KG2A 2HXWA 1N7XA 4XXUA 2DYXA 3SDFA 5JTYB 4JDFA 4ONYA 1M5DA 4YU0A 3FXUA 1ATGA 2RKMA 2DE4A 5A5XB 4LZ8A 3T9UA 2UYEA 1B32A 2NOOA 1JVXA 1MY2A 4RXLA 1NL5A 3A3CA 4OZ9A 4WEPA 3ONMA 1Y3PA 2D5WA 3ODBA 3CG3A 4P0GA 1XS5A 4DIGA 3IOVA 3KBRA 3G3HA 3H6WA 2QSXA 4ZEKA 3IB1A 1B3GA 3OELA 3AXFA 1T0KA 2P0SA 1OVTA 1B2HA 4R73A 3O6IA 1B05A 1UTHB 4KD5A 3TQWA 5AA2A 2V93A 1TT1A 4OERA 4YAHX 3WAFA 1GGGA 1B0LA 4O3CA 3H6TA 1ZTYA 1OVBA 4F2OA 3IORA 3VLWA 2Z22A 3S9LC 4Q5TA 4YKIA 4F31B 3R6UA 1ZIUA 1A55A 1Y1ZA 1EH3A 1UTBA 4PE5B 4MBPA 1L5TA 5ITOA 3RT8A 1D4NA 1BP5A 3W15C 2PVUA 2Q2CA 4OQOA 4DXCA 4IO6A 3E13X 3TDJA 2PYYA 1NNFA 4YB7A 1FQEA 1IXGA 2I4BA 3TYHA 4IO3A 3MPKA 1JW1A 4PFWA 5AA4B 3ILTB 1FTMA 2XXRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KDTA 4OVPA 4MF3A 2VHAA 4OVSA 1N0TA 4FEBA 5FTIA 4P3LA 1S9TA 3TEPA 4F3PA 4AB6A 1LSTA 4ZDMA 1JEVA 4G2ZA 4MX6A 4AQ4A 4GWUA 2PT1A 3LC8A 4ZEFA 2YPNA 3LSXA 2B4LA 4BDOA 3SKPA 2Z23A 4GWZA 2ONKE 2G93A 2QMWA 2P3NA 1D9QA 5HM4B 2RC8A 4R72A 3BIHA 1BLFA 4GXSB 4LZ5A 4Q8RA 2F3DA 1FBGA 4PFBA 3SEXA 3V8XB 2I4CA 4C0RA 1MM7A 5HPQA 1AOVA 1NV4A 1FTJA 1FTAA 2XXPA 3KJTA 3PMVA 4NMYA 3VVFA 3PMXA 3FV1A 3C32A 3C34A 4QXDA 3N5LA 2QVUA 1MQJA 1A8EA 2H98A 4IO2A 1BKAA 2XX9A 4FORA 2O51A 4X48A 4QFOA 3OSRA 4HS7A 1TXFA 4QSDA 3V83A 3FATA 4GRKA 5I3SA 1FBCA 2X26A 2WBDA 1LAFE 3O66A 3QXMA 1QW0A 3TTLA 3E78A 4QBAA 1DSNA 1FW0A 4FJPA 1FPKA 1MPBA 3IOUA 4TLMB 2I0BA 4N07A 3UA8A 5L8DA 2AIXA 2Q8JA 3QSLA 5EQ8A 4I1DA 4AS5A 4GWSA 5H8NB 1BK4A 4G8HA 1LB9A 1MXVA 1MXYA 1RDXA 3MVZA 1N3WA 4NG7A 3O97A 1QGXA 3USDA 1M5FA 5I7IA 3VLUA 4OXVA 3TELA 3E9XA 3LUZA 2RC7A 3T9HB 3G3KA 3GLBA 4XKRA 4TLLB 2HFBA 3N6UA 3QYTA 4PE3A 1QVSA 4OA4A 2QS3A 3FXBA 4NF6A 3LUYA 2WYKA 2PX1A 2DVZA 3KJ7A 3IB0A 2ZYOA 4H67A 3RGYA 4R6YA 1RYOA 4OVTA 3T1BA 2AYSA 4NWCA 1JW5A 1YPNA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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