3G3KA

Crystal structure of the glur6 ligand binding domain dimer i442h k494e k665r i749l q753k e757q mutant with glutamate and nacl at 1.24 angstrom resolution
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
256
structure length
253
Chain Sequence
b'NRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTHLGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREEVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKRSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITLAILKLQEQGLHMMKEKWWRGCP'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Stability of ligand-binding domain dimer assembly controls kainate receptor desensitization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 88
structure length 253
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-02-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3kA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3g3kA02
5JTYA 4F2QA 2F7AA 2QMWA 4U2RA 3PU5A 4H65A 4F2OA 3LSFB 3MWBA 4ZEDA 4JWYA 1USYE 5DVFA 2F97A 4EQ9A 5TPAA 3FATA 1B58A 4OEUA 3ZKLA 3MJNA 4Z0IA 3C34A 1M5DA 2AIXA 1MH3A 1SQYA 1XHYA 1FTKA 1VR5A 1ZMGA 5H8FA 3FJ7A 2XXHA 5F7VA 5JTYB 5FHOA 2HFBA 2OWTA 4G8MA 3A09A 2YJPA 4IY5A 2ALUA 3VLUA 5ELVA 3SEUA 4YKIA 3HCQA 4H8IA 3MZ9A 2B3FA 4YAHX 5TPAB 1B3EA 2XXUA 4NMYA 1DPPA 3PPRA 4KHZE 3SEWA 1MY0A 2E1SA 4X48A 3K00A 5K2YA 4KQPA 2NVUB 3G3KA 1PB8A 3PUXE 2QMXA 5H8FB 4G8HA 3PUVE 1B4ZA 3SDFA 3O29A 4X9TA 4RYAA 1B3GA 1SI1A 4IO6A 3DLNA 3KZGA 4OTEA 5FHMA 2O84X 2BJJX 4U4XA 4BDRA 2GFEA 3EHTA 4M4GA 5HM4B 4HCYA 5ICTA 4FECA 4F31B 1MG1A 1MXXA 4OERA 2H5YA 3H7MA 2Z8EA 5I2NA 4NF6A 3A3UA 1B3HA 4H5GA 5ICQA 1MQIA 2X26A 4G68A 2G93A 4R2BA 3DP6A 1ZKBA 3QUJA 1LCFA 4THIA 3CSGA 2QS3A 1AOVA 1PDAA 4X1BA 4R9GA 3K6UA 1AH5A 3TQWA 1D4NA 3PD9A 4POXA 1MQJA 1SW1A 3MZ1A 1PB7A 5JEIA 1B7HA 3U92A 4F1UA 3LUYA 3PUZE 3EHSA 4MH5A 4EUOA 4BDNA 3L6GA 2OBGA 2F5XA 3T9VA 5I2NB 4NF6B 4ELRA 3PGFA 2V3UA 4NE4A 4R74A 4G68B 1QVSA 4GIZA 2E0SA 2OLBA 1MY3A 4KD5A 4E0XA 4E0WA 1B5JA 4KI0E 1M5CA 2IEEA 1LB8A 4IGRA 3GZGA 3IL1B 4GL0A 1VFEA 3MAMA 1MDQA 1ANFA 3JV9A 3EN3A 3K1NA 1B3FA 3RGYA 1OQHA 3OO9A 3H6WA 1QKBA 2DS9A 2X7QA 1NMUA 2DSFA 4RY1A 3VLVA 2DE3A 4KFQA 2HAVA 2Q2AA 2RC8A 1B7UA 5HPQA 5M2VA 4LQ5A 3KN3A 4DXBA 3RT6B 3ZS6A 3W9VA 1EZ9A 1ATGA 4NF4A 5AE4A 4RK9A 3QUFA 4ZECA 5B7DA 4JB7A 3C4MA 1Y4TA 5EHSA 1D9VA 3MC2A 2WKYA 2R6GE 3Q27A 4XKNA 1H3DA 3PPPA 4H6DA 3BFUA 1UQWA 4G4PA 2R71A 4H1XA 4F29A 3TAJA 3CIJA 4PETA 4H5FA 4NF8A 2I58A 4R72A 3TZAA 1QKAA 2ANJA 2Z8FA 1SD3A 3IB2A 4ECFA 3MUQA 2XX8A 5CC2A 2F36A 1O7TA 1FTJA 4GF8A 1OMPA 1LBBA 3FUZA 1HSEA 4NF4B 5I58A 3PPOA 2O69A 3HV1A 4QFNA 5KDTB 4DCYA 3KSXA 2XXXA 4JWOA 2G29A 3EPEA 4JSDA 4R6YA 1N3WA 4XXUA 2Y7IA 4DE8A 3TEPA 4MLVA 3UK4A 1T0KA 1QUIA 2CZLA 3T9HB 3S2VA 1LLSA 1Q1KA 1RYOA 3MVZA 3PD8A 1A7LA 1B7ZA 1MXWA 3KOTA 5CI5A 4QF9A 4RA1A 3SETA 1PBQA 4NF8B 1P1NA 2O1MA 1MXYA 1MS7A 4OHNA 3SESA 1BKAA 3EF7A 2PX1A 1A55A 1N0TA 1B1HA 3ECRA 4KYSA 4G2ZA 3N6TA 3TTLA 1N84A 2VD3A 5I58B 3LSLA 4ZE9A 3I3VA 3TDJA 1LAXA 4R73A 3A3CA 1NNPA 3FIRA 4F1VA 1I69A 2D3IA 1NL5A 3ONMA 5FTIA 1SDXA 4XKPA 2I49A 4KPTA 1IXCA 4NF5A 1GGGA 1N76A 4PFWA 1WODA 3RNNA 1OLAA 4FAJA 3KJ7A 1LAHE 1CE2A 2H9BA 2AYSA 3AXFA 4AB6A 4RXLA 2GHAA 1B5HA 2XXRA 3TFLA 4H0WA 1B0HA 4ZEKA 1XT8A 2A5TA 4U22A 2UYEA 3U72A 2RCAA 1XVXA 3OO8A 1LGBC 2RCBA 1FQDA 3MW0A 1Z7NE 1WVJA 3FZVA 1J1NA 1EH3A 2F7BA 3RUMA 5TU0A 4DXUA 3EHUA 2Z23A 2PVUA 4I8CA 5H8SA 4HS7A 3PMXA 5I84A 1UIUA 3TELA 4ZE8A 4IO3A 1OVBA 2RINA 2QL3A 3KEIA 4F3PA 3KG2A 2A5TB 3IB1A 2QSXA 3QAXA 1H43A 2FA7A 4R6KA 1YAEA 1MPDA 4P0IA 3S9EA 1FQEA 4ZEBA 1IXGA 3OO6A 1LAGE 2W7YA 3B6TA 4RPNA 5I59A 1BLFA 2ZYMA 4ELOA 2V93A 1B9JA 4YB6A 1S7YA 3TTNA 3V89B 3G7WA 1MQDA 4C0RA 4U23A 1NFTA 2PMSA 3VE1B 4BLAA 3K6XA 1D3KA 2OCUA 4JBZA 2ABHA 4OQOA 2DWJA 3T93B 3MP1A 1P1WA 2I4BA 1UIVA 4POWA 3QIMA 3O97A 4KCDA 1B2HA 2Y7KA 1P1OA 2PT1A 2V3TA 3C35A 3SKPA 4WXJA 3GXAA 3K0VA 5I59B 3HO7A 4IO4A 2XXIA 2LAOA 3H3GA 1R6ZA 2F6GA 2PBWA 3OSQA 3FXRA 4G8NA 1IXIA 4YMAA 2Q2CA 3VXCA 1DPEA 4FEBA 1MM6A 4ZZAA 1HSJA 3SEXA 3RQTA 4EQ7A 1POY1 1EZPA 2HEUA 1MH4A 4IO2A 3H06B 4KCCA 3OEKA 4WEPA 2GHBA 4R2FA 4H67A 2UVJA 3LSWA 2I3VA 4U1ZA 1QUKA 5CBRA 2O1LA 1P1QA 3B7DA 1FQAA 1FQFA 4N13A 4P11A 3K02A 3RTWB 1FW0A 1BIYA 3V5AA 3KJTA 1IEJA 3FVGA 3S9LC 4OMBA 5I56A 3IO6A 3OENA 2F7CA 2O51A 3BBRA 3LR1A 4KYEA 1Y20A 4LZ5A 3U1OA 2HXWA 4JWXA 3PV0E 4FJPA 1FCKA 4BDQA 1BTJA 1M5EA 1IITA 4KYDA 2NWJA 5DT6A 3VVEA 1DTGA 3FV2A 2HQ0A 5BWJA 1TWYA 2OK2A 4OESA 1N3XA 4FIMA 1MQGA 1AIVA 4GWOA 3CFXA 4YMBA 5I57A 2XD2A 2I0CA 3IOVA 2ZNUA 3IORA 4I62A 1MPCA 3ILTB 2Z8DA 4F3GA 5B70A 1TFAA 4M1VA 1JW4A 1JW5A 4K3FA 3GLBA 3UA8A 4TLLB 3VVDA 4MFIA 1RKMA 2V3QA 4LVQA 1A54A 3FV1A 4DIGA 3LSXA 1UTBA 4MLQA 2ONKE 3DM0A 1ZLQA 4OFLA 4OZ9A 4O3CA 1TXFA 4GD5A 1IIWA 2DVCA 4QSEA 2YPNA 3SEVA 3IB0A 4GL8A 3OSRA 5L9SA 1Y9UA 1IUDA 5I57B 3L6HA 4GRKA 2PT2A 4QFLA 4NEDA 3Q29A 3S9NC 2RF1A 3H6VA 2O6AA 4EXLA 4FE8A 5H8QA 3V8XB 3U8QA 2NXOA 5AA2A 4MBPA 2DQVA 1D9YA 4BDLA 4LUBA 2DWHA 1FQCA 2DXRA 4ONYA 4OYVA 1MQHA 3IAZA 4F3SA 3M8UA 1SVXB 1UTBB 1LAFE 3KSJA 2I48A 2UVHA 1XC1A 3I5OA 1M5BA 1M5FA 4FORA 4QSCA 4EDPA 2XXWA 3TTKA 2DP8A 1SI0A 1URGA 2HCAA 4JXIA 3T22A 4GQOA 3F11A 2F78A 2O7UA 3OELA 1P99A 5AA4A 4IY6A 1F9BA 5DVIA 5H8QB 2IA4A 5L8DA 3CI8A 5AA2B 3MP8A 1QJMA 3WAEA 2DWAA 1JEUA 1UTHA 3O6GA 3TCHA 3WAFA 3CR9A 2ZYOA 4PFUA 3C32A 2Y7WA 3W15C 2HAUA 1MRPA 1MY2A 4GXSB 1MM7A 2UVIA 2FYIA 3M3FA 1JETA 2OJTA 4WEDA 4OETA 1JVXA 2Y7RA 1B05A 2H99A 5CMBA 2DE2A 3CG3A 2ZNSA 1EZOA 1QUJA 2R9JA 2UVGA 1IZ1A 4DXCA 3TUSA 3C33A 2XXPA 3M3LA 4PFTA 4Z7EA 3MVXA 1RYXA 4NTLA 4BDOA 1UTHB 3U93A 2GH9A 4AQ4A 2VGQA 4HTGA 1ELJA 3FXQA 5J1DA 4XKRA 4LZ8A 1B1XA 1URDA 2Q9TA 4G68C 2Y84A 5I2KA 3G3GA 3IOWA 3MQ9A 1N7WA 3FVKA 4F1YA 5LOMA 3FVNA 5CMCA 1TT1A 1DTZA 3S9MC 1A40A 1N04A 1B40A 3MPLA 2Q89A 5TP9A 3VV5A 3R7XA 2XXQA 3HHGA 3DP8A 5IAIA 5H8NA 4I9DA 3RY3A 3UGWA 1JW1A 4IO5A 5A5XA 3JYRA 4OEVA 1YPNA 1NNKA 3B6QA 2Q8JA 4JDFA 5I2KB 3FJGA 1GTKA 4XTCQ 3K2DA 1FTOA 5DVJA 1PBPA 4TOZA 4NF5B 2I4CA 3PMVA 4H8JA 5TP9B 1ZTYA 4EF1A 2F6PA 3IR1A 4ZZEA 3UORA 3PPQA 5H8NB 2F34A 2DOJA 4O3BA 1PEBA 1N7XA 5CM6A 4QRZA 5A5XB 1XVYA 3TCGA 3MVWA 1B3LA 4DCXA 2XX9A 4QFKA 1B52A 3TYHA 1B5IA 3THIA 1OVTA 3SERA 4L17A 1SW4A 3O9PA 1Y1ZA 5L9OA 5JK4A 2P2AA 4OFJA 2HZLA 2QJEA 1OIBA 4LA9A 5H8HA 3D4CA 2XXVA 3FJMA 3OO7A 4F22A 1XS5A 1NNTA 4F3BA 5F1QA 1H45A 3N26A 1NKXA 4R75A 2DWIA 4Q8RA 4C1TA 3N6UA 3MPKA 1CB6A 3TCFA 4ZEIA 2I6EA 3G3FA 4G77A 4XKQA 4LP2B 3N5LA 4ISUA 5BUUA 3IO4A 4ZEFA 4I1DA 1I6AA 1NH8A 5K2XA 2F8DA 3BKIB 3C9HA 3T96B 3K6VA 2ESNA 4YB5A 4DLDA 2ZNTA 3RTFB 1LFHA 3JZJA 1GR2A 2V25A 3Q28A 3K4UA 5H8HB 1QULA 2VOZA 1OQGA 4ELPA 1Q35A 2DXYA 3IJOB 3IX1A 5DYHA 2XXTA 4N07A 4Q0CA 5AA2D 3VVFA 3UN6A 5AA1A 1GVCA 1KWHA 4DDDA 1Y4CA 3CVGA 1USYH 1Y3NA 3E9XA 3CSBA 1LFIA 1R9QA 3O6HA 1EU8A 3IK6B 1A8FA 2REGA 3G3IA 1POTA 1II5A 5CMMA 5FHNA 3P7IA 5ISUA 1VFDA 1YTVA 3QXMA 4C1UA 1JVYA 3TTRA 3OMBA 4GVOA 3HN0A 1LBCA 4WKMA 1AMFA 1SYHA 2VP1A 2XHDA 1Y3PA 2H25A 3IOTA 1L5TA 4KR5A 1O63A 3D4GA 3VFJA 1I6BA 2ZXTA 3E3KA 2AL5A 5KCJA 4RK2A 3TKDA 1B4HA 4DZ1A 5DEXA 3W9WA 4F19A 2OZZA 3MVYA 5EYFA 1MXZA 5HBCA 1B46A 2NOOA 4IGTA 4PE5B 4LQ2A 3PPNA 4NWDA 1B6HA 1MY1A 4X1DA 3TTMA 5L9MA 1IXHA 3H6UA 3ZKKA 5ITPA 3HPIA 2M8CA 4OWDA 4ELQA 4GXAA 3T9UA 1LFGA 2DYXA 2PYYA 4PQJA 1DSNA 2B3BA 5I56B 4LZ7A 4RPOA 3KFMA 1R9LA 3FD3A 3LBSA 1H76A 2X7PA 2CMOA 3H4ZA 1DOTA 4JSOA 5KCJB 4UACA 2QPQA 5DEXB 1LSTA 1Y3QA 4ZDMA 1NNFA 2I3WA 4LATA 4GFRA 3USDA 1GV8A 4P0GA 4RNSA 4F18A 2XD3A 3R26A 3RPWA 3B6WA 3CRBA 3K1PA 2QS4A 1I6QA 1US5A 3K01A 4NWCA 3ODBA 4RJZA 2QRYA 3O6IA 1MXUA 3M3KA 3TODA 4Q5TA 2I0BA 2QS1A 2GRVA 3PMWA 3K1MA 2UYFA 2KLFA 4YKJA 3FXUA 2DE4A 4QFPA 2VHAA 2ZYNA 4PP0A 3O2AA 4PFYA 4OXVA 1MXVA 4YU0A 3N94A 3DP4A 2XXYA 2P0SA 2Z22A 4MF3A 3V83A 2THIA 4U1OA 2Y7PA 4BDMA 4Q30B 3C36A 4EF2A 3PUWE 1VSOA 1FTMA 1MDP1 2VD2A 1LB9A 3H6TA 3QYTA 5EHMA 1B0LA 5KDTA 2RC9A 1S50A 2HZKA 3OXNA 4EXKA 3QSLA 3U94A 1IQ7A 1O64A 4YKKA 5IKBA 1WDNA 3O28A 2H4IA 3UP9A 4ZS9A 4GLIA 1TFDA 4QSDA 1S9TA 1PC3A 1SW5A 4AB5A 1YCJA 3MZBA 4N6PA 1MY4A 3TQLA 3KBRA 3G3JA 3QK6A 3KN8A 4R6HA 2P1SA 3IJXB 1LCTA 4U4SA 4FATA 5KZTA 2D5WA 1A8EA 2ZYKA 3CG1A 5CRYA 2ONRA 3Q26A 2O7IA 3K6WA 3HSTA 4HCWA 4O3AA 2ONSA 1JQFA 1MPBA 2ZMBA 5AA4B 4OVJA 3OEMA 3E4RA 3FASA 1Z7ME 4TQUQ 1ZBMA 3H03A 1HSLA 3DELB 3VXBA 1DMBA 3I6VA 5FTHA 2REJA 4F39A 1AL3A 1QW0A 3S4UA 3GBBA 3Q25A 3BFTA 5DTBA 1JNFA 3VLWA 1H44A 1URSA 4TLMB 4HW8A 4XIGQ 4LONB 4OFOA 3CFZA 3T9XB 1XOCA 2UXAA 2RKMA 2OWSA 4UA8A 2V84A 5AA3A 3LC8A 4EQBA 2FNCA 3TMGA 2H98A 3ILUB 2A5SA 3RLFE 1FTLA 3FVOA 4IB2A 1SBPA 4GOTA 2O68A 4FEDA 2DVZA 3TPAA 2XX7A 2YLNA 4U21A 3CFLA 3RT8A 3GBAA 5CMKA 1OLCA 3R6UA 2D21A 1Y1MA 4IO7A 3G3HA 3T66A 1ZU0A 4R9FA 4ESXA 1A99A 1BP5A 1R1NA 3KOSA 4YICA 3MP6A 4ESWA 4YZZA 4ND9A 2AL4A 3O66A 3OOAA 5ITOA 3SEYA 1JEVA 1SW2A 1ZJLA 2F35A 4OENA 1B32A 1SYIA 4YKPA 3MBPA 3VDFA 4QFOA 3KGCA 2RC7A 3KN7A 3IOUA 1FQBA 1B51A 1P1UA 1NH7A 2NUVA 3C31A 1ZIUA 5CBSA 3RN8A 3E13X 3FGSA 3EQ1A 2Q88A 3HHFA 4QHQA 2QS2A 3OD7A 1PB9A 3PUYE 2B65A 3ZSFA 1VE4A 3UIFA 4YB7A 1US4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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