4E0WA

Crystal structure of the kainate receptor gluk3 ligand binding domain in complex with kainate
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
NRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
publication title Kainate induces various domain closures in AMPA and kainate receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 78
structure length 254
sequence length 254
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4e0wA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4e0wA02
2ZYMA 4IO4A 1B9JA 1B3HA 2QRYA 3MQ9A 4DCXA 2F7AA 4QF9A 3RPWA 4AB6A 1B7HA 1LBBA 5DEXA 3OEMA 1D4NA 5AA2A 4RJZA 3QIMA 4HCYA 5I2NA 1AIVA 1ZKBA 2OBGA 1ZBMA 1QKAA 3CG1A 2Y7PA 3JZJA 3UORA 3U92A 3G7WA 2QS1A 1IXHA 2V3QA 3QUFA 5I59A 3FVKA 3OELA 1QKBA 4TLLB 4UACA 4LQ2A 4IO5A 3KN7A 1JVYA 4BDQA 1B3GA 3KOTA 1NKXA 1LCTA 3IAZA 3MWBA 3M3FA 3VVEA 3M8UA 1XT8A 3H4ZA 3TYHA 5I58A 3TQWA 1DTGA 4RPNA 1R1NA 1L5TA 1UTHA 3BFTA 1ANFA 3IB2A 1MH3A 1Y1MA 4RK2A 4G68B 4GFRA 3CVGA 1NH8A 1H3DA 3C31A 2AIXA 1LAFE 4I8CA 5F7VA 1MQJA 1B0LA 4JWYA 2F7BA 2DS9A 1HSEA 1EU8A 4JSOA 1B40A 4G8HA 5L9OA 2OWTA 3FJGA 4Z0IA 1MQIA 2QL3A 1CE2A 1MQDA 1N0TA 2Y7IA 4JXIA 3G3IA 5DVJA 1DSNA 3PPPA 4XKNA 3PD8A 2PYYA 1O63A 3K6UA 1N76A 1B3EA 1LAGE 4GLIA 3VDFA 3UK4A 1EZPA 3CFLA 3RQTA 4OFJA 1FW0A 1XVXA 3KOSA 1LAHE 3TCGA 4ELOA 1H76A 2DVZA 4R6KA 4YB7A 4GF8A 5CBRA 4EXLA 5KDTA 3TKDA 2H98A 4NF5A 3K1NA 2XXYA 2UYFA 4ZZAA 3K4UA 2RINA 5FHMA 3H7MA 2XD2A 2O84X 1MS7A 1MPBA 2I3VA 1N7XA 3VLVA 4KFQA 3RT8A 4YU0A 3I3VA 3I5OA 3U93A 3R6UA 1NNPA 1AOVA 1Y1ZA 2OWSA 4JDFA 3U8QA 1ZIUA 3IR1A 3CR9A 4F39A 4R9GA 4F22A 3K2DA 2DSFA 4DCYA 3C32A 4H67A 4PQJA 1OLAA 4H65A 1DPPA 1JEUA 5AA1A 2QSXA 3ILUB 3C35A 1OIBA 1RYOA 3FZVA 4MLVA 1SI0A 3IJXB 3PU5A 3Q28A 1LFGA 3GBAA 4DXUA 3ECRA 1A8EA 4OHNA 1FCKA 2HCAA 3SEYA 4F19A 1B4ZA 3TTMA 1N3XA 3LSXA 4OMBA 4JBZA 1QVSA 4G4PA 3IK6B 2DXYA 1Y3QA 1FTOA 3T9UA 4F2OA 2ZYNA 4PE5B 4THIA 1PC3A 3T9VA 3HHGA 1TXFA 3SERA 2HZKA 3M3LA 5DVFA 4F1YA 4XXUA 3PV0E 2THIA 4I62A 3ZSFA 4ISUA 3LSFB 2VP1A 4IB2A 1J1NA 3FVOA 4BDNA 4ELRA 3IOVA 2A5SA 2I0BA 2ZYOA 3MC2A 4OENA 1GVCA 4FE8A 3E3KA 2OK2A 1ZJLA 2DWHA 4F3PA 2P1SA 1SI1A 2Q8JA 3LUYA 4WEDA 3CG3A 2XXXA 2AYSA 4IO3A 4U1OA 4X9TA 2GFEA 3OO6A 4LONB 3K6XA 5DTBA 1KWHA 3MZ9A 1SQYA 4N6PA 3KN8A 1P1QA 1SW5A 4EUOA 3T96B 3S9NC 2ONSA 2DE3A 1FQEA 1USYH 2QS3A 5CMMA 3D4CA 3VLWA 4PETA 3PMWA 1MM7A 4R9FA 3ZS6A 4ZEDA 3K1MA 4NF4A 2HAVA 4RXLA 4Q8RA 3PUXE 4PFWA 5I84A 3UN6A 1SW2A 1VSOA 5H8NB 2VOZA 1JQFA 4O3CA 4GVOA 4FAJA 4ND9A 3HN0A 2F6GA 3TFLA 3USDA 2F78A 3JV9A 3T93B 4ELQA 3R26A 3WAFA 3PUVE 1LB8A 4R73A 3K6WA 4O3BA 1SW1A 2Q89A 3CFXA 4AB5A 2XXUA 5ICQA 1SDXA 3CIJA 3FVGA 3RT6B 1BP5A 1OVTA 5FHNA 3RTFB 2I4CA 1M5BA 1JVXA 2XXRA 4MLQA 3C4MA 4R6YA 4R75A 1FTKA 3DLNA 1LGBC 4PP0A 2FNCA 4GOTA 1TT1A 2PMSA 4ELPA 1MM6A 5H8HB 1MXZA 4OQOA 3FGSA 1LBCA 3T22A 1O64A 4N13A 4DZ1A 3FXRA 2ANJA 4QHQA 2B3FA 2VHAA 2F8DA 4KYSA 4NF8A 3O2AA 3Q27A 2UVGA 2HAUA 4L17A 2BJJX 1YTVA 5CC2A 4F3GA 4F18A 5EHSA 1NH7A 3MUQA 1NFTA 3QAXA 2X7QA 1A8FA 1GR2A 1TFAA 4OXVA 2RC7A 2Q2AA 3IL1B 4PFTA 2D21A 5CMKA 3BKIB 3B7DA 5K2YA 3TAJA 1DOTA 4EDPA 3E4RA 3MP6A 4R72A 4MBPA 1H45A 1A40A 3IB0A 2V25A 1GV8A 3UGWA 4DIGA 4FORA 3N5LA 4KYEA 1M5CA 1Y4CA 5F1QA 2FA7A 1OVBA 4GL8A 1IXGA 4RK9A 1LB9A 3W9WA 5B70A 5AA4B 3EQ1A 2O1LA 3U94A 3D4GA 4RPOA 1IUDA 3GLBA 3MAMA 2H25A 3VXBA 4OZ9A 1XC1A 4KD5A 5L8DA 3O6GA 1UIVA 2RCBA 3QUJA 4KCCA 4R74A 4G2ZA 5KCJB 1P1OA 2AL5A 1M5FA 4YICA 1EZ9A 4GIZA 5L9MA 1B6HA 3HCQA 4YKJA 2XXQA 1YAEA 4ZECA 2H99A 1URGA 1PB9A 3G3KA 1GTKA 2ONKE 2NOOA 1YCJA 5FTHA 5H8FA 2G29A 4U21A 1MY1A 2OJTA 1QW0A 2X7PA 4C1TA 3VV5A 1WDNA 4QFOA 2GHBA 3FXUA 5A5XB 2DQVA 1BTJA 3MVZA 3M3KA 2I49A 5JTYA 1T0KA 4NMYA 4EF1A 4RA1A 3H6WA 2ZYKA 2F36A 3TZAA 3H6TA 1FTLA 2OZZA 3RN8A 3A3UA 3N6UA 3SKPA 5TP9B 2HQ0A 3LSLA 2XD3A 3ZKKA 3OSQA 1YPNA 5CRYA 1B5HA 3ZKLA 3K0VA 4QFLA 2I48A 4TLMB 2ZNSA 3UA8A 3HHFA 5I2NB 2GH9A 3MVXA 5DT6A 5LOMA 1IITA 4ZE9A 2VD2A 4F1VA 5I59B 4ZEIA 4IY6A 3IO4A 3L6GA 1LFIA 4EXKA 4RYAA 3EPEA 4LUBA 1US5A 2VGQA 1P1UA 1UTBA 1JW4A 2DWJA 4H5FA 2I58A 1WVJA 2REGA 4NEDA 1MXXA 3HPIA 1ZTYA 1QUKA 3MPLA 3OENA 1URSA 1CB6A 3IB1A 2XXPA 3ODBA 2Z23A 5K2XA 1Q35A 4QFPA 3FD3A 3TCFA 4U2RA 4XIGQ 3MP1A 4JWXA 1XOCA 2D5WA 3B6QA 2OLBA 4OEVA 1URDA 4K3FA 3PMVA 4XKRA 3TELA 5H8QB 3JYRA 2W7YA 4GXSB 3LSWA 1MRPA 3UP9A 4BLAA 2F6PA 1MXVA 2NUVA 3KSXA 1Z7NE 1Y4TA 2DWIA 3FATA 3V8XB 4MH5A 1B52A 3W9VA 3PUZE 3CSGA 4E0WA 1D9VA 4KCDA 1S7YA 5B7DA 2QMXA 4F2QA 3PD9A 1UIUA 1SW4A 3KSJA 3BBRA 3EHTA 1SYHA 4XTCQ 2R9JA 4I9DA 1HSJA 4WKMA 4R2FA 3FVNA 5ICTA 1JETA 2H5YA 2WKYA 1NNTA 3PUWE 4HS7A 4M4GA 1MXUA 2XX7A 2PT1A 1I6QA 3H06B 4YAHX 4HCWA 2ZXTA 1FQDA 4X48A 1UQWA 3SEVA 3WAEA 2E1SA 3FV2A 3SEXA 5I2KA 1MQGA 1MPCA 3MZ1A 4F1UA 1PB7A 2FYIA 4GD5A 3TTKA 3HV1A 5KDTB 2Q9TA 4P0GA 4I1DA 3DELB 4ZZEA 1O7TA 1B7UA 4ZE8A 2F34A 2PBWA 5H8HA 2O6AA 4G8MA 1IIWA 3TTRA 4DLDA 4H1XA 3TODA 1OLCA 4RY1A 1I6AA 5KZTA 1QUJA 3KEIA 4HTGA 4IGRA 3VLUA 1I69A 3O9PA 2LAOA 4Z7EA 2V84A 3QXMA 2RKMA 1B46A 2XHDA 3Q29A 4YMAA 4GL0A 1ZLQA 4G68C 3V5AA 1LSTA 2OCUA 1Y9UA 4PFYA 3T9HB 1B51A 3VXCA 1NNFA 3IOTA 3KFMA 1QJMA 1H43A 3F11A 3FASA 5FTIA 3KBRA 1BLFA 2Y7RA 4ESWA 4U4SA 4N07A 4KHZE 4C1UA 1B7ZA 4E0XA 2VD3A 3T66A 4F29A 2F7CA 5ITPA 1PB8A 1DMBA 1FQCA 2AL4A 5EHMA 1R9QA 2I4BA 1LAXA 4U23A 4GWOA 5HM4B 3GBBA 4O3AA 2A5TB 4YMBA 3OEKA 4ZS9A 3TUSA 2DE2A 1PBPA 4M1VA 3IOWA 3UIFA 2B3BA 1QUIA 3VFJA 2F35A 5CM6A 2KLFA 3K02A 1MPDA 5J1DA 2DE4A 4U1ZA 3K01A 3PMXA 1A54A 2XX9A 2GHAA 4TOZA 2IA4A 2UVJA 5KCJA 3TEPA 3QSLA 5BUUA 3LBSA 4IO7A 2Y7KA 3MZBA 5TPAB 1H44A 5AA2D 1TWYA 5CBSA 4F31B 2UYEA 5EYFA 2O51A 1MDQA 3T9XB 3H6UA 2ESNA 3Q26A 4JB7A 2XXVA 2XXTA 4BDMA 1D9YA 2D3IA 4Q5TA 1Y20A 1TFDA 3IORA 5L9SA 1SBPA 4G68A 3OD7A 1AL3A 3S9EA 2QS4A 5A5XA 4OFOA 2QPQA 4EQ9A 5JEIA 1OMPA 1LLSA 4ONYA 4PFUA 1JW5A 1USYE 2Q2CA 4LVQA 4YKIA 4EQBA 2E0SA 3MP8A 4NF4B 1R9LA 3MVYA 4IO6A 2Z8DA 4POXA 2XX8A 5TP9A 3W15C 4X1DA 5CMBA 1N7WA 5I57B 4OWDA 2HEUA 4DE8A 1FTJA 4UA8A 4FECA 4KI0E 4RNSA 5ELVA 4EQ7A 4G77A 2RC8A 3OO7A 5ISUA 1B2HA 1NNKA 1R6ZA 4GQOA 3TPAA 3SESA 3E9XA 1MXWA 3SDFA 2QJEA 3MJNA 1M5DA 1PEBA 1MY2A 2P0SA 2P2AA 3C36A 2YPNA 2O7IA 4LZ8A 4WEPA 4QFKA 2UVIA 3KGCA 1XS5A 1D3KA 3VVFA 3PUYE 1JEVA 3DP4A 3PPNA 2DWAA 3KJTA 2DVCA 4NE4A 3THIA 4YB6A 2F97A 3MVWA 4QRZA 1PBQA 1VFEA 3Q25A 1POTA 4IO2A 1XVYA 4BDRA 2XXIA 5H8QA 1DPEA 3FV1A 1OQGA 1M5EA 4NF8B 4KYDA 3HSTA 3TMGA 4P0IA 3CSBA 4ZDMA 2B65A 2UXAA 4NF6B 2HXWA 5I56B 1IZ1A 3GXAA 1ZU0A 4NTLA 2DXRA 4LP2B 3QK6A 3DM0A 1FQFA 2QS2A 3IX1A 3OO9A 3IJOB 1I6BA 1RYXA 2O68A 4LA9A 4C0RA 3BFUA 5DVIA 3MW0A 4X1BA 1MY4A 3H6VA 2Z8FA 4Q30B 3V83A 2DP8A 4YKPA 4R6HA 5DEXB 2YJPA 4POWA 5AA2B 2CZLA 4OFLA 1NL5A 1FTMA 5FHOA 4OYVA 4G8NA 3MBPA 1B05A 4AQ4A 4KQPA 4XKQA 1VFDA 2Q88A 3TTNA 1IQ7A 3GZGA 3EF7A 4QSEA 3I6VA 3LC8A 3C9HA 3CRBA 1MXYA 3PGFA 3OO8A 1Z7ME 1IXIA 3O6IA 4QSDA 1XHYA 3HO7A 3G3HA 3IO6A 4OETA 5HPQA 1B58A 3G3GA 3RUMA 2Z8EA 1VE4A 3SETA 2Y7WA 2PVUA 4ESXA 3S2VA 3MPKA 1B4HA 2CMOA 5I58B 5DYHA 3V89B 3N94A 3PPRA 3O28A 3PPOA 4MFIA 1MH4A 2PX1A 1A55A 1MDP1 3K1PA 5ITOA 1P99A 1AH5A 5BWJA 4TQUQ 2QMWA 1UTHB 1B3FA 1P1NA 5H8SA 2Y84A 4KPTA 3OXNA 4EF2A 3FIRA 2R6GE 3K6VA 5H8FB 5IKBA 4H0WA 4DXBA 3C33A 5M2VA 4YKKA 4H6DA 2NVUB 4OESA 5JTYB 1B1XA 4P11A 2XXWA 3KZGA 1JW1A 2I0CA 2V3UA 3G3FA 2PT2A 1LFHA 4GXAA 1IEJA 1B5IA 2DOJA 4MF3A 3N6TA 3O6HA 3U72A 4DDDA 3RTWB 1EH3A 3H03A 5AE4A 2V93A 5H8NA 1SD3A 3FXQA 4OVJA 2DYXA 2RC9A 3KJ7A 4YB5A 1B3LA 1MY0A 4F3BA 1II5A 2H4IA 4NWCA 3VVDA 4FEBA 4H8JA 2ONRA 2XXHA 3PPQA 3AXFA 3L6HA 3EHUA 4ECFA 1N3WA 4WXJA 5IAIA 1MQHA 3CFZA 5CI5A 3LR1A 2A5TA 4KR5A 1B1HA 4NF5B 3O97A 1UTBB 4LZ7A 3VE1B 2I3WA 2ABHA 4FEDA 3DP6A 1FQAA 3H3GA 1A7LA 1Y3PA 4OTEA 4ZEBA 1P1WA 2RF1A 3RNNA 3SEWA 5TPAA 4FATA 2HFBA 2H9BA 3DP8A 4JWOA 3O66A 3FJMA 4U22A 2ZNUA 5CMCA 3S9MC 3C34A 2RCAA 1B5JA 1DTZA 2YLNA 3SEUA 1S9TA 2HZLA 2REJA 3B6TA 3O29A 3R7XA 4HW8A 1SVXB 1QULA 4OEUA 1MY3A 1PDAA 3ILTB 4H5GA 1SYIA 4YZZA 4LQ5A 1US4A 3S9LC 3A09A 3ONMA 3G3JA 3QYTA 2G93A 1FQBA 3RGYA 2I6EA 4FJPA 3EN3A 3RY3A 1BKAA 2O1MA 1POY1 4BDOA 3OMBA 5TU0A 5I57A 3CI8A 3S4UA 1NMUA 4FIMA 1EZOA 1ELJA 2R71A 3FUZA 1VR5A 4LZ5A 3RLFE 5JK4A 5AA4A 1B0HA 4F3SA 3TDJA 2ZNTA 1Q1KA 2V3TA 3FJ7A 1F9BA 1S50A 4OERA 1AMFA 4U4XA 2ALUA 2NXOA 1A99A 4NWDA 5I2KB 4IGTA 3E13X 1BIYA 3U1OA 1GGGA 3KG2A 3B6WA 3K00A 3EHSA 1IXCA 3TTLA 4XKPA 1WODA 2X26A 4DXCA 2GRVA 4JSDA 3N26A 1ATGA 3OOAA 1N84A 3P7IA 1RKMA 4QFNA 2Z22A 1B32A 1OQHA 1JNFA 3KN3A 1LCFA 3A3CA 4QSCA 2IEEA 4ZEKA 1N04A 4BDLA 2M8CA 4ZEFA 4NF6A 1MG1A 5I56A 2UVHA 1ZMGA 2O69A 4LATA 4H8IA 3OSRA 2O7UA 2NWJA 4GRKA 1Y3NA 1HSLA 2F5XA 5HBCA 4Q0CA 3TCHA 3TQLA 4IY5A 2ZMBA 5AA3A 3IOUA 4R2BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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