4E0WA

Crystal structure of the kainate receptor gluk3 ligand binding domain in complex with kainate
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
NRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Kainate induces various domain closures in AMPA and kainate receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 78
structure length 254
sequence length 254
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4e0wA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4e0wA02
2O1MA 1B32A 1OIBA 4EXLA 3MQ9A 3R6UA 3MP1A 3TODA 3G3IA 3OD7A 4RPNA 4F1UA 4IO4A 1D9VA 2NWJA 1NNTA 3QUFA 1NNPA 3B7DA 3AXFA 2DWJA 2I0BA 1JVXA 5AA2B 3K02A 4JSDA 1MM6A 3IO4A 4NF5B 1ZMGA 3FJ7A 4R9GA 3RLFE 3PUXE 3L6HA 5F7VA 3K2DA 1WDNA 1TT1A 1N04A 3W9WA 4KCCA 3K1MA 2PMSA 3S9EA 4PFYA 3O29A 2DWIA 3UK4A 4M4GA 1JW5A 4I8CA 1YCJA 1Y4CA 1FQDA 1DSNA 1KWHA 3P7IA 1Y20A 5KDTA 1SYHA 4OEVA 2X7PA 4OFLA 4LONB 3MW0A 3V83A 1QKAA 5ITOA 4LA9A 2V3UA 2Z8FA 4H6DA 4KYDA 5H8NB 3IAZA 2RF1A 1B3EA 1D9YA 3FJGA 1CB6A 1SW5A 3FUZA 1FTOA 4ELOA 5TU0A 2Q8JA 2IA4A 3OELA 1AOVA 4KD5A 2OWSA 3E4RA 1QUKA 4G8NA 1SI1A 3BFTA 4DXUA 5K2YA 1M5EA 5I57B 3H6TA 4M1VA 1HSJA 1BP5A 3N6TA 4I9DA 3FV2A 3OENA 4PFWA 3UGWA 3LSFB 4R75A 3IR1A 3KG2A 4OENA 2RCAA 3TDJA 1NNFA 1M5CA 2ZYOA 2UYFA 1YPNA 3MVXA 3IB2A 3SDFA 3VVEA 4YZZA 4IGRA 3DELB 3M8UA 4E0XA 1I69A 2DE4A 2PT2A 1TFAA 1IUDA 4LZ7A 1NFTA 3BFUA 2Y7IA 4LQ5A 3CR9A 1DTGA 3B6QA 3PU5A 5A5XB 2F5XA 3V5AA 3LSWA 4X9TA 3JZJA 4KYSA 3VE1B 3S9NC 3CSGA 1FTKA 4DXBA 2Y7RA 4BDQA 2ONKE 4NTLA 2Q2AA 5EHSA 1Y1ZA 3VVFA 2UVGA 3HHFA 1LLSA 2AYSA 1US4A 2DS9A 1MY2A 1USYH 2O1LA 3WAEA 5BUUA 2XX7A 3LC8A 3MP6A 5CBSA 3K1PA 1JQFA 2QJEA 3K6XA 1LFIA 4OZ9A 4NF6A 5JTYB 2GRVA 3IOVA 2QS1A 4O3CA 3K0VA 3H7MA 3IB0A 2DVCA 3U94A 5I84A 3C32A 4RK9A 1ANFA 1XS5A 4I62A 4P11A 4ELRA 4KQPA 5TP9A 4NF8A 5H8FA 2REGA 4RJZA 5CMMA 1R9LA 2XHDA 3IOUA 4QSCA 1MH3A 3K6VA 3O6HA 4G77A 2Y84A 3RNNA 4U23A 1OLCA 2XXHA 3KGCA 2H4IA 3GZGA 4TQUQ 5KDTB 1UTBA 1Y3NA 2H25A 3Q28A 3PD9A 1XVYA 3R7XA 3TTLA 5CBRA 1P1UA 1QW0A 3TEPA 2QL3A 1MRPA 1ELJA 2PVUA 3TCHA 3TQWA 3H6VA 1R9QA 4KYEA 1CE2A 4ZEFA 2OZZA 4H5GA 5KZTA 4TOZA 4ISUA 5L8DA 4ZEIA 2Q88A 3U72A 2HZKA 5LOMA 1EH3A 2HXWA 3K1NA 3RTWB 1R6ZA 4LZ8A 3S4UA 1PB9A 2OWTA 4OQOA 4FORA 2F78A 5TPAA 2O84X 3IO6A 1Q1KA 2V84A 2R9JA 2O69A 4PFUA 1OMPA 5L9OA 2A5SA 2F35A 3VLWA 1PDAA 2I48A 2F97A 3KSJA 3MWBA 2A5TB 5ELVA 4HCWA 3D4CA 2VD3A 1M5BA 2I58A 3I3VA 3Q26A 4H8JA 1AMFA 1LCTA 4UA8A 4H67A 1NH8A 4BDMA 1Z7ME 3CIJA 2VD2A 1RYXA 1N3XA 1LFHA 1IXCA 4X1BA 2FA7A 3QSLA 1ZTYA 1XVXA 4KHZE 4YMAA 2Z22A 4F3BA 3KOSA 1B2HA 3TFLA 1MH4A 1H45A 2ANJA 2QPQA 5DVJA 5I59A 2CMOA 4OESA 3IJXB 4EQ7A 3FVGA 4ELQA 1PBQA 1YTVA 3C36A 4YKIA 3N26A 3VXBA 1MQIA 1A7LA 1M5FA 1B51A 2LAOA 1MY1A 1QUIA 3N5LA 3ONMA 3PPPA 2WKYA 2F34A 3IL1B 5H8FB 4IO6A 2D5WA 5M2VA 3G3GA 2PBWA 3T96B 4ELPA 1B7HA 4RXLA 3O66A 1L5TA 1XT8A 5K2XA 4JDFA 1LBCA 4YKJA 4I1DA 3VLUA 3TELA 3O9PA 5F1QA 3RQTA 1LAGE 3OEKA 4FAJA 1O63A 3UIFA 4GXSB 1B58A 4PE5B 1UTBB 3O6IA 1SDXA 1UTHA 3MUQA 2Y7WA 4QFNA 1T0KA 4ZZAA 2M8CA 1B5IA 3MZ1A 4MH5A 4G8HA 5DEXB 3WAFA 1Z7NE 1Q35A 3G3JA 2RC8A 3QUJA 4QSEA 1HSEA 4XIGQ 4H1XA 4IO3A 1IZ1A 3MVWA 4NF4A 4PP0A 3C4MA 3EHTA 3IOWA 2ABHA 1VFDA 4Z7EA 4G68A 3TAJA 3CFZA 1SW1A 3RPWA 2RKMA 2FNCA 4H8IA 5CRYA 3U1OA 1FQBA 2Q2CA 4LATA 3R26A 1NKXA 5TPAB 2F36A 1MG1A 3PPRA 4OFOA 1Y3PA 4ZEBA 1JETA 3O97A 3GBBA 3L6GA 2I49A 3KJ7A 2O7IA 4GL8A 1POTA 3OSRA 4GRKA 2XD2A 1EZPA 3SKPA 1UIVA 3M3KA 1LB9A 3M3FA 3OO6A 3MZBA 3V89B 4WEPA 3M3LA 4GFRA 2I4CA 4PFTA 3DP6A 2VGQA 3ECRA 3MVZA 2RCBA 1A40A 2DYXA 3N94A 3EF7A 3FVNA 5FHNA 1MXZA 4QF9A 4ESXA 1SD3A 4U22A 3ZKKA 3IX1A 3KBRA 2YLNA 4IY5A 1PBPA 3OMBA 4KCDA 4JWXA 1QULA 3N6UA 4DLDA 5IKBA 4LUBA 1N0TA 4XTCQ 3HCQA 4OYVA 3FXUA 2I0CA 4L17A 3FIRA 3TPAA 3E13X 4DE8A 3A3CA 2OK2A 4F3SA 1S50A 3TUSA 4WKMA 4BDNA 4IO7A 4AB5A 2VP1A 1LAHE 1QUJA 3H3GA 1D4NA 3LR1A 3PD8A 4DIGA 4OTEA 2Y7PA 1B7ZA 4NWDA 2DP8A 3MC2A 1QKBA 3FVOA 1MXXA 1POY1 2XXVA 2ZYNA 2F6PA 3C31A 4GVOA 5BWJA 1MPDA 3OO7A 4QFLA 3V8XB 2DVZA 3TCGA 2PX1A 3VDFA 4F3GA 4RK2A 4Q5TA 4EQBA 3BBRA 1MDQA 1B5JA 3T9HB 3OEMA 3H6UA 4JSOA 5JEIA 5KCJA 2PYYA 2Q89A 3VVDA 4FIMA 1XOCA 2E1SA 1OVTA 3UA8A 2QS4A 1LSTA 1XHYA 5H8QA 4NF4B 1FTLA 2B65A 5B7DA 2ESNA 2GHBA 1VFEA 4GD5A 1N84A 1P1QA 4G68B 4IB2A 5AA2D 1XC1A 4NMYA 4ZE9A 4U4XA 4WXJA 1B40A 1EU8A 1SW2A 2Y7KA 1B0HA 2X7QA 2HEUA 1P1OA 1MQHA 1LBBA 2G29A 1ZLQA 3Q25A 5FHMA 2F6GA 1SW4A 4RNSA 4GIZA 4F2QA 4U4SA 2F7AA 3FXQA 3RN8A 3KJTA 2GHAA 2QSXA 3PPQA 2VHAA 3QXMA 2QRYA 4LP2B 1EZ9A 3TZAA 1Y1MA 5CC2A 3DP4A 3PUZE 4MFIA 2E0SA 2B3FA 3KEIA 2Z8EA 1ZU0A 3LSXA 2DOJA 4FJPA 3RGYA 1AH5A 4EXKA 3CRBA 1JEVA 4ZDMA 4G4PA 2XX8A 3B6TA 4R9FA 4IGTA 4MLVA 2QMXA 4YMBA 3KSXA 3Q29A 3IB1A 4QFKA 1SI0A 1SYIA 4EF1A 1B3GA 3S9MC 4F39A 1FW0A 3H06B 4HW8A 3PUVE 2ONRA 2BJJX 3QIMA 1MM7A 1B1HA 1S7YA 4BDRA 3EHUA 4F3PA 1YAEA 4BDOA 1DOTA 4OERA 4DDDA 1B4ZA 3QYTA 2QS2A 2F7CA 3Q27A 3PMXA 4ZEKA 5AA2A 2GH9A 2NOOA 1MY4A 5H8SA 4NF5A 3T9VA 2DWHA 1I6AA 4XKPA 3K4UA 1IITA 2D3IA 4OXVA 1VSOA 3SEUA 2G93A 1R1NA 3PPOA 3SEWA 3RUMA 3ZKLA 1URDA 2OJTA 1JEUA 5I2KA 4E0WA 1LCFA 5KCJB 4KI0E 4F19A 4ZECA 1OVBA 1SQYA 2XXUA 3IORA 4OMBA 1B7UA 2Z8DA 3PMWA 5ICQA 2XXWA 4GXAA 2Q9TA 3OXNA 5L9SA 2UVIA 3EHSA 2NVUB 1H3DA 5H8QB 1B3LA 3U92A 4QRZA 1B3FA 2DXRA 4QSDA 3TTKA 1A55A 5DVFA 3ZSFA 4LQ2A 2THIA 3HHGA 3H03A 4OHNA 3GLBA 2B3BA 4EQ9A 5B70A 4NF6B 3E9XA 4P0GA 2D21A 2HQ0A 3E3KA 1BKAA 5HM4B 4PQJA 1I6BA 1PB8A 5TP9B 4NF8B 1N7XA 4F1VA 3MP8A 2NUVA 3SESA 3W15C 4C1UA 2UYEA 1FCKA 3G3HA 3VV5A 2REJA 4RY1A 1MXUA 3T66A 1AIVA 3KOTA 1FQEA 4G68C 4U1ZA 4G2ZA 4NEDA 3SETA 3FXRA 1VE4A 4QFOA 4GQOA 2V3TA 3G7WA 4U1OA 4Z0IA 2OLBA 3MJNA 4G8MA 3KN3A 2I4BA 3CVGA 1DMBA 4H5FA 3CFXA 5ITPA 1GR2A 1URSA 4C0RA 4TLMB 2YPNA 3PUWE 4X1DA 1LB8A 5AA4A 1MY0A 2V93A 2XXTA 1MY3A 1A99A 1B05A 5H8HA 2AL4A 1D3KA 4THIA 1B5HA 3CI8A 3UP9A 4R2FA 4ZE8A 4F22A 3FVKA 4YAHX 4JBZA 1USYE 4JWYA 3FV1A 2ZYMA 5JTYA 3ODBA 4JWOA 2R71A 2HAUA 4XKNA 5DTBA 2UXAA 4LZ5A 3KFMA 3KN8A 3U8QA 5JK4A 4IO5A 3JV9A 1OQGA 3MVYA 1MXYA 3TTMA 4POWA 1PB7A 2GFEA 3GXAA 1RKMA 1ZBMA 5I2NA 3SEVA 4ZZEA 1QVSA 1B0LA 3FASA 5AA1A 2R6GE 2XX9A 4GF8A 4ZEDA 5I2KB 2QMWA 4F1YA 4ND9A 3DP8A 4DCYA 2P1SA 3T9UA 1N7WA 1B52A 3THIA 1HSLA 2XXIA 4H65A 3ZS6A 3K00A 3QK6A 3HSTA 2DE3A 5I59B 1B9JA 5I56A 1A8FA 1US5A 1J1NA 5DVIA 3DM0A 2OCUA 2H99A 3HV1A 4XKRA 2HFBA 2UVJA 3FGSA 1B1XA 4OWDA 2NXOA 1B3HA 3QAXA 3A3UA 3LSLA 4R6KA 4F18A 4BDLA 4R2BA 5I58A 4RYAA 1NH7A 3SERA 4HS7A 2H5YA 3S9LC 3I6VA 4HTGA 3VLVA 4DXCA 4YICA 4FATA 1IXGA 1TWYA 1URGA 2XXPA 1M5DA 1UQWA 3ILTB 4KR5A 3EQ1A 1LAXA 3K6WA 3PPNA 1A54A 4F2OA 3TTNA 4F31B 1B6HA 2I3VA 3C35A 4DZ1A 3U93A 2A5TA 1ZIUA 1I6QA 1PEBA 1UTHB 4YB5A 2O51A 2HCAA 4Q30B 3TKDA 4EF2A 5FTHA 3RTFB 1DPEA 5HPQA 2VOZA 1A8EA 3S2VA 4K3FA 2ZYKA 3OSQA 3LUYA 5EYFA 1MXVA 4UACA 3K6UA 3K01A 2ZMBA 1H43A 1JW4A 1B46A 1F9BA 1RYOA 2V3QA 4KFQA 4P0IA 1JNFA 2RC9A 3OO9A 1WODA 5AA3A 4F29A 4U21A 4GL0A 3MAMA 3RT6B 5AA4B 3JYRA 5ISUA 4ESWA 1FQAA 3FATA 4MF3A 3SEXA 3RY3A 1VR5A 3DLNA 5CMBA 2XXYA 4KPTA 5H8HB 4JXIA 4OEUA 1FQFA 1NL5A 1IXIA 4IY6A 5CMKA 4NE4A 1FQCA 3ILUB 2ZNSA 4YKKA 2XXXA 1TXFA 4FECA 1BTJA 1JW1A 5FHOA 2YJPA 1BLFA 3EPEA 2V25A 4MBPA 4TLLB 2XD3A 3TYHA 1MQDA 3VXCA 2O6AA 2RINA 3D4GA 4N13A 3UORA 4BLAA 1GGGA 4GWOA 4IO2A 4R74A 4EUOA 4R73A 2W7YA 2F8DA 3TCFA 1GVCA 4FEBA 5IAIA 3UN6A 1MDP1 1B4HA 4Q0CA 4YKPA 3O28A 4XKQA 5I2NB 1GTKA 2O68A 2OBGA 4R6HA 1O7TA 5DYHA 1N76A 4AQ4A 1SBPA 1GV8A 3O6GA 4PETA 1MQJA 1UIUA 4QFPA 3MPKA 3IJOB 4LVQA 1H76A 2RC7A 1ATGA 3MPLA 1P1NA 3FD3A 2ALUA 3G3KA 1Y9UA 5DEXA 5ICTA 5CM6A 3A09A 4EDPA 4X48A 5I56B 4OETA 5CMCA 3W9VA 3USDA 3PGFA 3H6WA 4OFJA 3C33A 2PT1A 1MPCA 3PUYE 3T93B 1PC3A 1DPPA 2I3WA 1P99A 3FZVA 3MZ9A 3T22A 4ECFA 5AE4A 1IQ7A 5EHMA 2UVHA 2FYIA 3LBSA 1IIWA 3KN7A 2ZXTA 2XXQA 3CFLA 4DCXA 3MBPA 4R72A 1FTMA 5I58B 4Q8RA 4N6PA 4FEDA 1N3WA 2ONSA 3RT8A 2Z23A 3C34A 2H98A 2ZNUA 3IOTA 4O3AA 1Y3QA 1MPBA 3PMVA 1OQHA 1NMUA 4YB6A 3H4ZA 1O64A 4R6YA 2KLFA 2CZLA 1LAFE 3VFJA 1OLAA 4NWCA 3GBAA 1Y4TA 4XXUA 2F7BA 2I6EA 1ZJLA 5DT6A 4N07A 4JB7A 5H8NA 2AL5A 1LFGA 3T9XB 2DSFA 5CI5A 4ONYA 5FTIA 2O7UA 3EN3A 2P2AA 4GLIA 5J1DA 4OVJA 5HBCA 3SEYA 1DTZA 3BKIB 3HO7A 1AL3A 3G3FA 3CG3A 3CG1A 4RA1A 3OOAA 1TFDA 1SVXB 1JVYA 2QS3A 2DE2A 5I57A 1ZKBA 1MS7A 1MXWA 4RPOA 1H44A 4QHQA 4C1TA 2X26A 4GOTA 3F11A 4FE8A 4O3BA 3C9HA 4H0WA 3O2AA 2DQVA 1BIYA 2AIXA 4HCYA 2DXYA 2HZLA 3PV0E 2XXRA 2DWAA 2P0SA 1S9TA 3TQLA 4POXA 3HPIA 3CSBA 3IK6B 5L9MA 3TTRA 1IEJA 4AB6A 4U2RA 1MQGA 1FTJA 1WVJA 3TMGA 1LGBC 3I5OA 3KZGA 4WEDA 4ZS9A 2IEEA 1II5A 1NNKA 1P1WA 5A5XA 1IXHA 4YU0A 2HAVA 2ZNTA 3FJMA 2H9BA 4YB7A 4MLQA 1EZOA 3HN0A 3B6WA 1QJMA 3OO8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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