4E0WA

Crystal structure of the kainate receptor gluk3 ligand binding domain in complex with kainate
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
NRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
publication title Kainate induces various domain closures in AMPA and kainate receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 78
structure length 254
sequence length 254
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4e0wA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4e0wA02
1QUIA 3O29A 3S9LC 4GVOA 4HCWA 2NVUB 2DVZA 3WAEA 3RTWB 3JZJA 1MRPA 2DWJA 1A54A 4ZE9A 1QUJA 2XX8A 5KCJB 3KFMA 3MUQA 3DLNA 1HSEA 1P1QA 5H8SA 4F31B 3IJOB 1EZ9A 2QS4A 3BFTA 4H65A 2DE3A 2F78A 3OEMA 3E9XA 4YKPA 2F6PA 1DTZA 1BIYA 3K02A 3S9NC 1MQGA 4ELRA 3LSFB 5CM6A 3IOVA 4MLQA 1XVXA 2OK2A 2I48A 4JWXA 3LC8A 2H4IA 4H67A 1UIVA 3W9VA 5DEXB 2AYSA 1D4NA 4XXUA 3T93B 4KCCA 1TWYA 3H3GA 3TTMA 3N5LA 4QFNA 5L8DA 3M3LA 4GL8A 5I59A 4LZ8A 2O1MA 3G3IA 3IR1A 2NXOA 4PFWA 4EXLA 1LGBC 3KJTA 1DMBA 4F1UA 1NKXA 4G77A 4N07A 5H8HB 1LAFE 5I58B 3MAMA 5H8QA 4X1DA 4PFTA 3IORA 1PB9A 5CMBA 3VLVA 3IX1A 1TFAA 1B0LA 4PFUA 5I57A 3VVDA 4QSEA 4QHQA 2F35A 1ZMGA 2DYXA 5I2NB 3SEUA 4LQ2A 1EZOA 1B52A 1MQHA 4H1XA 3RPWA 2A5SA 4GXSB 1SW5A 4F3BA 3KJ7A 3RUMA 3HSTA 3WAFA 2HFBA 4NF6A 3FJ7A 3T22A 3G7WA 1M5EA 4QF9A 1IXGA 3ECRA 2ESNA 1MH3A 2H98A 4DXBA 3U1OA 1SW4A 3U92A 4YB5A 4GIZA 2WKYA 1SI0A 3UGWA 4YMAA 2DE4A 5FHMA 3EQ1A 2YLNA 4ELPA 5A5XB 3FXRA 5EYFA 1PBQA 3JYRA 3FUZA 1FTMA 3OEKA 1OVBA 3RT6B 1WDNA 1SVXB 2XXQA 3MQ9A 4KYDA 4IO4A 2Q89A 5AA3A 1UTBA 2H99A 1M5CA 3FVKA 3Q26A 5TPAB 3MP8A 1DOTA 3K6XA 4ZZAA 5FTIA 2XD2A 2OZZA 5J1DA 3DP8A 5CMKA 3H6WA 2XXHA 1GR2A 5JTYA 1FTLA 2G93A 2DE2A 2QPQA 2XXXA 4ZEFA 1RYXA 1MY0A 2W7YA 4FEBA 3G3GA 5FTHA 3IB1A 3I3VA 3C32A 2Q88A 4G8HA 2XXVA 3T9UA 3H4ZA 5IAIA 4N6PA 4POXA 2QS3A 4YICA 3LR1A 3B7DA 2GRVA 3JV9A 2AL4A 4LQ5A 3IOTA 3PMXA 3A3CA 3LSWA 5TP9B 2HQ0A 3H7MA 1B5JA 2FYIA 5L9MA 3C9HA 1EZPA 1JETA 3CFXA 1P1NA 3CFZA 4M1VA 3Q25A 3ZS6A 1USYE 4MFIA 1LFIA 5AE4A 3F11A 2I49A 1SYHA 3SEWA 4U4XA 2QSXA 1JQFA 4EQ9A 2Q8JA 2I58A 3SEVA 2XXWA 3BKIB 5M2VA 4OEUA 1AOVA 2RC7A 4IO6A 1SQYA 1B3LA 1P1OA 2I3VA 1XHYA 3PUZE 3KZGA 3OOAA 2H9BA 2REJA 4Q8RA 1OQGA 1H43A 1MDQA 4QFOA 4NF5A 3FV2A 1NMUA 3U72A 3CG1A 2H5YA 4QSDA 5H8HA 4KFQA 2ANJA 2R6GE 1FQFA 4OESA 2V25A 5I59B 2YPNA 3K1NA 1FTKA 3TAJA 4ESWA 2F7AA 1P99A 2HAVA 4ND9A 4IGTA 1D9VA 1O7TA 4JB7A 4MBPA 3N26A 4LZ7A 3TQWA 5HM4B 5H8QB 2Y7IA 1VFDA 1Y3PA 4O3BA 2R9JA 5K2YA 2DVCA 4LONB 4KI0E 3HHGA 4ZECA 1A99A 1IXHA 1US4A 4NTLA 4KCDA 5I57B 4XKNA 1N7XA 1YTVA 4RPNA 3Q28A 3O2AA 3IOWA 4FECA 2ZNUA 3HO7A 2O7IA 3MVYA 3CVGA 4R9GA 1MXYA 5EHMA 2AIXA 4NF6B 1BLFA 2RKMA 1BTJA 3QXMA 2QS1A 1UIUA 4U2RA 3QUFA 1EU8A 1MXXA 3O97A 1LB8A 4ELOA 4F29A 4H6DA 5AA2A 3R7XA 2HZLA 5H8NA 1Q1KA 3UN6A 1B9JA 1R9LA 2D3IA 3RLFE 2XXRA 3K6VA 3RQTA 4E0WA 2ZYNA 2IEEA 3ONMA 4GL0A 4ZDMA 2VHAA 3VFJA 4TQUQ 3H6VA 5K2XA 1UTBB 3TTKA 2ZYOA 5I2KA 4KR5A 3EF7A 4F18A 4LVQA 2ONRA 3FATA 1FQEA 3SETA 1IITA 2ZNTA 4H0WA 2ALUA 3C33A 5JTYB 3OENA 5TP9A 2V3UA 3PU5A 4LATA 4JSDA 3V5AA 1A40A 1FQBA 3CR9A 1POTA 2RC9A 4Q0CA 1A55A 1QJMA 1HSJA 4I62A 4JXIA 3MVWA 3ZKKA 2PVUA 3GXAA 4KYSA 4BDLA 2B65A 4LA9A 1JNFA 2NUVA 4KD5A 4RPOA 3C31A 1KWHA 3A3UA 3DP6A 4DCYA 4K3FA 4BDOA 4DDDA 3PUXE 2O6AA 4OFOA 4DXCA 1MDP1 4U4SA 5I84A 1B6HA 1US5A 3MPLA 2HAUA 4ECFA 3KN7A 2HEUA 4THIA 4I1DA 1H44A 3USDA 1EH3A 1MY1A 2D5WA 1L5TA 4OQOA 2ONSA 3K0VA 1SW2A 4AB5A 3B6TA 1FCKA 1Y1MA 1J1NA 1NNPA 4FIMA 1VSOA 3MVZA 4IB2A 3E13X 2BJJX 4ZEKA 2ZYMA 3EHTA 3CFLA 2VOZA 3TYHA 1ANFA 4WEPA 1VFEA 2PT1A 1TFDA 5ITPA 4GD5A 1JVXA 1B7UA 2RCBA 3K6WA 4OTEA 1N04A 3U94A 4ZEIA 4DLDA 2KLFA 3MC2A 1FTJA 4JWOA 4NF5B 3FD3A 3O9PA 3VDFA 5CMCA 3HPIA 3D4CA 4RK9A 1R1NA 1DTGA 4NEDA 5L9OA 1MM7A 4ONYA 1PC3A 1NH7A 1B05A 2QS2A 1LCFA 2Q9TA 3ILUB 4PFYA 3RTFB 4EXKA 1MG1A 2Z23A 4XKRA 2B3BA 3MZ9A 1OIBA 1BP5A 1MM6A 4Z7EA 3IL1B 5KDTA 3T9VA 1AH5A 1DPEA 2XX7A 4HCYA 4FEDA 3U93A 3K2DA 5CRYA 4HTGA 1AL3A 3IK6B 5JEIA 5ITOA 2O7UA 3TQLA 2NOOA 3QAXA 4OFLA 1I69A 1B3FA 3K00A 4R6YA 1B40A 3IB0A 2CZLA 3OSRA 1B46A 3D4GA 1MXUA 4R74A 5FHNA 3PMVA 4OXVA 3S9EA 4YB7A 1B4HA 2I6EA 1I6AA 3SEYA 1II5A 2OLBA 1B7HA 4XKQA 4ZEBA 3PUWE 2VP1A 3THIA 2VGQA 1QUKA 3Q29A 1B3GA 3SDFA 1QVSA 1QULA 4OENA 5AA2B 4R72A 4R9FA 5H8NB 1S7YA 4YMBA 2DWIA 3VXCA 4M4GA 1RKMA 4BDRA 3OSQA 1ZKBA 1ZJLA 1NNKA 3C4MA 3Q27A 4L17A 4WXJA 3V8XB 1FQCA 1Y20A 2V84A 2REGA 2F7BA 1ELJA 4IO3A 3PUVE 3RNNA 3G3JA 1XS5A 2THIA 1PBPA 5I2KB 3PV0E 1B1XA 1S9TA 3W9WA 1Y4CA 1Y3NA 5DT6A 1A8EA 2H25A 1NNFA 1ZTYA 2GHAA 3FGSA 2ZNSA 4U23A 1USYH 4F3GA 1ZBMA 1M5BA 1YPNA 1URGA 3OMBA 3TEPA 1JW5A 3O6IA 4X9TA 3MW0A 4KYEA 4ZZEA 2RC8A 1B0HA 4G4PA 3MPKA 1GGGA 3DELB 2V93A 4NMYA 4G68C 1LAGE 2DWAA 5DTBA 4RY1A 4F3SA 2XXTA 4ZEDA 4X48A 5CC2A 4H8JA 2PMSA 3BFUA 2UVGA 4ISUA 2I0BA 1B4ZA 3TCGA 1B51A 3G3FA 4WEDA 4QRZA 3KOSA 4R75A 3CIJA 2XXIA 1IEJA 3OO6A 4NWCA 2DSFA 3PPNA 1ZLQA 2OWSA 3K1MA 3SKPA 1M5DA 1LAXA 3EHSA 3OELA 4POWA 5DVIA 4F2QA 4G2ZA 4O3AA 4EF2A 4GLIA 4HS7A 4F1VA 3M8UA 4I9DA 1QKBA 2I3WA 1NH8A 2XD3A 2RF1A 4AB6A 2P0SA 2HXWA 3TZAA 4G68A 2HZKA 2OJTA 3TELA 5H8FA 2O69A 3H6UA 3OXNA 1ZIUA 1PEBA 4H5FA 1B7ZA 1S50A 3FASA 2UXAA 1O64A 4KHZE 4RJZA 5BUUA 2D21A 1SI1A 2Z8FA 4RNSA 2VD2A 4C0RA 3FXUA 4QFKA 1Y9UA 3T66A 1MPBA 4EDPA 3PUYE 2FA7A 2P1SA 2DWHA 4XTCQ 3TCFA 3IO6A 2FNCA 3PPOA 1Z7ME 3FJMA 1M5FA 3MJNA 3L6GA 2OWTA 3QUJA 2E1SA 1FQDA 4RYAA 4U1ZA 5B70A 1N84A 5KDTB 1MQJA 5BWJA 1MY4A 5AA1A 4ESXA 1IQ7A 5KZTA 1LBBA 2Y7PA 3EPEA 3LUYA 3BBRA 1VR5A 1SD3A 4MF3A 2NWJA 3T9HB 1RYOA 3V89B 2UVHA 4RXLA 4EQ7A 1IXIA 3QSLA 4JWYA 3VE1B 2XHDA 3CRBA 4Q5TA 3B6WA 2Q2CA 4JDFA 2ZMBA 3FZVA 4OHNA 1PB7A 4PETA 4YKJA 3MP6A 1MH4A 4ELQA 2Z8DA 3TTRA 2A5TA 5ICTA 1URSA 2Y84A 3K4UA 2F97A 3IO4A 3PPRA 5LOMA 1JEVA 3G3HA 4TLLB 4BDNA 3I6VA 4EF1A 3OO8A 3O6HA 2O51A 4OETA 4JBZA 4P0GA 1SDXA 1JW4A 4YB6A 4XIGQ 1O63A 1AMFA 2QL3A 4YAHX 2LAOA 3KSJA 1WODA 3C35A 4H5GA 2UYEA 1NFTA 2I4BA 1IUDA 3DM0A 3E4RA 2P2AA 4RA1A 1B58A 2X7PA 2O1LA 4OYVA 1N0TA 4TOZA 3VLWA 1MQDA 5HPQA 4H8IA 4BDMA 5AA2D 4N13A 5EHSA 3PD9A 3C36A 1F9BA 3ZSFA 1B3EA 1XVYA 2F34A 2DP8A 4GWOA 4R2FA 4IY6A 3UIFA 3RY3A 4UA8A 3AXFA 3HN0A 1A8FA 2QJEA 3C34A 4FORA 1MXWA 4I8CA 3MZ1A 1P1WA 3H06B 3EHUA 5ICQA 3O28A 1AIVA 4YKIA 3TODA 1OLAA 1B2HA 3U8QA 3PMWA 1POY1 1Y1ZA 4RK2A 3HHFA 3FV1A 4TLMB 3O6GA 3MZBA 4HW8A 1D3KA 3ILTB 3K01A 2G29A 3GBAA 1IZ1A 5JK4A 3UORA 1OMPA 2VD3A 2E0SA 5ISUA 1ATGA 3FXQA 4Q30B 2HCAA 2UVIA 2RINA 2PBWA 3QIMA 4P0IA 2Y7WA 1CE2A 1D9YA 4G68B 1HSLA 3KGCA 1DPPA 4EQBA 5H8FB 3L6HA 1NL5A 1IXCA 5ELVA 4PQJA 1N7WA 4IO2A 3TFLA 1YAEA 5AA4B 4F22A 4U21A 1P1UA 3T96B 5L9SA 3PPQA 2B3FA 2YJPA 5IKBA 4GQOA 4IGRA 4OVJA 3TCHA 1FTOA 5HBCA 4NF4A 2I0CA 2AL5A 4C1TA 3HV1A 3MVXA 3UA8A 4R6HA 1MXVA 4NF8A 2XX9A 2UVJA 3LSXA 3V83A 3DP4A 3KSXA 3TKDA 4MLVA 1LB9A 3TPAA 4IO7A 5CI5A 3TTLA 5I56A 3VVEA 1JVYA 4G8NA 2ZXTA 1OQHA 5CBSA 1LAHE 3FVGA 3GZGA 3W15C 3IAZA 1LLSA 5CBRA 4UACA 1MQIA 3M3FA 4JSOA 2O68A 3CG3A 1FQAA 2Z22A 2PYYA 2F8DA 2QRYA 4AQ4A 4OFJA 3GLBA 4F1YA 4LP2B 1PB8A 4MH5A 4F2OA 5F7VA 5F1QA 1H3DA 2XXPA 2XXUA 1QW0A 2A5TB 2IA4A 4IO5A 3B6QA 1Q35A 3E3KA 3KN3A 4NWDA 2ONKE 4DCXA 3TMGA 3EN3A 2ABHA 2I4CA 4EUOA 1MY3A 3MBPA 4XKPA 2F6GA 2PT2A 1Z7NE 3K6UA 5FHOA 5B7DA 3MP1A 1LSTA 3RGYA 3FJGA 4OEVA 1R9QA 5KCJA 1A7LA 4G8MA 2GFEA 1UTHB 3N6UA 1XT8A 3K1PA 5CMMA 3MWBA 5DVJA 2V3TA 4E0XA 4YU0A 3PGFA 1YCJA 1MY2A 1LCTA 1IIWA 2OBGA 4P11A 3OO7A 2DXRA 4GRKA 3FVOA 1XC1A 3IJXB 3OD7A 5DEXA 4FE8A 1MXZA 2QMXA 3VXBA 3PD8A 2F7CA 3KOTA 4IY5A 2Z8EA 3R6UA 4OMBA 4DXUA 2F5XA 3R26A 4FJPA 2DQVA 1BKAA 1SBPA 2CMOA 3TTNA 1GTKA 2DS9A 4PP0A 5I58A 3S9MC 2Y7KA 4OWDA 1CB6A 4F39A 1WVJA 4BLAA 3HCQA 4YZZA 2XXYA 2O84X 1B1HA 4U1OA 4OZ9A 1OVTA 1QKAA 5DYHA 4FATA 2GH9A 1VE4A 5I2NA 3S4UA 1ZU0A 2RCAA 4F3PA 5AA4A 2X7QA 4R2BA 1LBCA 4DIGA 3IB2A 1I6BA 2QMWA 3P7IA 4FAJA 3FIRA 2DOJA 1B32A 3I5OA 3VVFA 3QK6A 2UYFA 2OCUA 4Z0IA 1DSNA 3UK4A 3KG2A 4WKMA 2M8CA 3VLUA 4BDQA 4X1BA 2X26A 2V3QA 1TXFA 4KPTA 1H45A 3H03A 2Q2AA 4GXAA 1N3WA 3ODBA 1PDAA 4KQPA 3KEIA 1N3XA 3O66A 1B3HA 1B5IA 5A5XA 4QSCA 3H6TA 3TUSA 3UP9A 3KN8A 3TDJA 3ZKLA 1B5HA 1SW1A 3KBRA 1NNTA 4NF4B 4DZ1A 4F19A 2GHBA 1Y3QA 3VV5A 1MPCA 1URDA 1JEUA 4ZE8A 4NF8B 4R6KA 5TPAA 1T0KA 1I6QA 1OLCA 4OERA 3CI8A 4R73A 3N94A 3FVNA 1SYIA 5I56B 1MS7A 5DVFA 4QFLA 3LSLA 1UQWA 3RN8A 4YKKA 1GVCA 1LFGA 1N76A 1H76A 1FW0A 4ZS9A 2DXYA 3RT8A 3OO9A 4GFRA 1JW1A 4GF8A 3SEXA 2ZYKA 3A09A 1LFHA 3G3KA 4U22A 3N6TA 4NE4A 1MPDA 2PX1A 4LZ5A 4O3CA 3M3KA 3SESA 5TU0A 4LUBA 3QYTA 1R6ZA 1UTHA 3CSGA 3PPPA 1TT1A 4QFPA 3GBBA 3LBSA 1XOCA 1Y4TA 3IOUA 4PE5B 2Y7RA 1GV8A 4C1UA 4GOTA 3CSBA 4DE8A 3SERA 3S2VA 3T9XB 2F36A 2R71A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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