5AA2D

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in complex with nam-pentapeptide.
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
416
structure length
416
Chain Sequence
GVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGRDDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFTQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa
publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
total genus 131
structure length 416
sequence length 416
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
D PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
D PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2D01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2D02
4YMBA 5FTHA 1NNTA 5K2XA 2V3TA 3LR1A 3ECRA 3UN6A 2DWAA 3N6TA 5AA1A 3M3KA 5JK4A 4ZE9A 3OO9A 1XHYA 5K2YA 1ZLQA 3OD7A 2DS9A 4I62A 3EHSA 1B6HA 4R6KA 3IB1A 5L8DA 4LA9A 2F5XA 4NF4B 4MLVA 1PBQA 3U1OA 4G68C 4FJPA 4ZEFA 2AL4A 1TWYA 4Q30B 3SEYA 4E0XA 3ZKLA 2NUVA 1QJMA 2Q89A 2A5TB 2XXQA 5ITPA 2HCAA 1QUIA 4PFYA 2VHAA 3MWBA 4NTLA 2UVGA 3C35A 4RYAA 1B3HA 2Q9TA 4N07A 2RC9A 1SW5A 1DPPA 2I3VA 1EZOA 4YKJA 5EYFA 3KBRA 4FIMA 1Y3NA 3OEMA 1MY2A 4ZEIA 2OBGA 2DE2A 3KG2A 1WDNA 1FW0A 3VFJA 2V3UA 3K00A 3OMBA 3W9VA 3RTWB 2HAVA 4H6DA 5DTBA 1EU8A 1YPNA 3S9EA 3Q25A 5B70A 3LBSA 2ZYKA 4H5FA 2ONSA 4R6HA 1XOCA 4JB7A 2PT2A 4F22A 2GFEA 4AB6A 2NXOA 3A3UA 3FGSA 4AB5A 2FYIA 3GZGA 1O64A 1R6ZA 3TCGA 3FVNA 3K01A 3T22A 5CBSA 4YB6A 1B4ZA 1B9JA 4H1XA 1USYH 2RC7A 4RY1A 1O63A 2UVHA 3RUMA 1R9QA 4C0RA 2ZYMA 3LUYA 3KGCA 3D4CA 1VE4A 3G3GA 1YCJA 3VVEA 4JSDA 3C33A 3C34A 4OEUA 2VD3A 1US4A 1IQ7A 1UTHA 4Z0IA 3O28A 4KCCA 4OETA 1JW5A 2UYFA 4U4SA 2I4BA 1SDXA 1MH4A 3K6XA 1MY3A 3S9LC 1NH7A 4F29A 2QS2A 4JWYA 4LATA 1FQBA 5HPQA 3TZAA 5EHSA 1LAXA 4X1DA 4TLMB 3LSWA 2F7BA 1A7LA 1Y3QA 5JTYB 2XX9A 3SEVA 1OQGA 5JTYA 4ELOA 1MY1A 1ELJA 4P0IA 1Y1MA 3TUSA 4IO5A 1GVCA 1N3XA 2YJPA 3EHTA 4PFTA 4QRZA 3RY3A 2PMSA 1POTA 1MDP1 4DXBA 5KCJA 5ELVA 3HCQA 1QULA 3Q29A 3S9NC 3O6IA 3MJNA 4BDOA 3PMXA 2V25A 2O1MA 3K1NA 1Y1ZA 2KLFA 3FJMA 4GXSB 2DE3A 3U8QA 1IXHA 2OK2A 2HEUA 3KSXA 3FVOA 3UIFA 4MLQA 4FECA 2O68A 1XVYA 3LC8A 1LAGE 2A5SA 1WVJA 4EQBA 1P99A 1MY0A 1Y4TA 4QFPA 4RJZA 2DVCA 4BDMA 3F11A 4U22A 1JVYA 1NH8A 5FTIA 3Q26A 1BIYA 3PMVA 1FQCA 3T9UA 2ZYOA 3E4RA 3Q28A 1YTVA 4ZE8A 2P0SA 2QS3A 1SW2A 1UTBA 4DCYA 1MPDA 4KFQA 1OVTA 3ILTB 3K2DA 4OENA 4RK2A 4WXJA 1NKXA 1Y9UA 2O7IA 3K0VA 3MPLA 4ZEBA 3UK4A 2Q8JA 3E9XA 5DVFA 3EQ1A 3MBPA 3R26A 3H7MA 1URDA 1JW1A 5I58B 2NWJA 3FXUA 1CE2A 3MAMA 1P1UA 3ZSFA 1JEVA 5CMKA 2OWTA 1B7UA 3KJTA 3U72A 1AMFA 4G8NA 3C32A 5H8QA 4XIGQ 3IOWA 3KJ7A 4Q5TA 3OSRA 3FJGA 2PX1A 4NWDA 4JXIA 4ZZEA 3BBRA 3K4UA 2G29A 2YLNA 5CBRA 5B7DA 4NF8B 2IA4A 4ZDMA 1SW4A 4X1BA 2XXWA 1LAHE 1H44A 3CG3A 1PDAA 2VP1A 5H8FB 3SEXA 3PUYE 4YKIA 5H8FA 4GRKA 3D4GA 3IX1A 4GXAA 3G3HA 4N6PA 1SQYA 3ZS6A 3O9PA 4OFLA 4OZ9A 3LSFB 1NL5A 4O3BA 5H8NA 1JQFA 1A54A 3IB0A 3K6UA 1M5CA 4KCDA 4OQOA 1ZMGA 1GR2A 3GBAA 4K3FA 4U2RA 2ZMBA 1DTGA 5LOMA 4DLDA 2Y7WA 5TP9B 2RINA 4WEDA 5TP9A 5I2KB 4OXVA 2F36A 4QFNA 1GV8A 1A99A 4YAHX 5AA3A 3TCHA 3OELA 4UA8A 3SKPA 3H6UA 3MVWA 4JWOA 1VFDA 1LCTA 3CI8A 1VSOA 1AIVA 1WODA 3EPEA 1I69A 4THIA 2OCUA 4YZZA 3UGWA 1NNPA 2H99A 3IJXB 2O51A 1NNFA 1MQHA 4I1DA 2R6GE 1JW4A 1R9LA 4BDRA 3K1MA 4F2QA 3M8UA 3CFLA 3K6WA 1II5A 1LBCA 2RCBA 1SD3A 4PP0A 1N7WA 2XXTA 1OIBA 1H43A 3QAXA 1IXCA 2ZXTA 1IXGA 2DSFA 3KEIA 3USDA 2I49A 1VR5A 3TODA 5JEIA 4NWCA 4KYSA 3CSBA 5CC2A 3E3KA 2AYSA 3TKDA 2GH9A 1O7TA 1Y4CA 5ITOA 4R72A 2QL3A 5I59B 3DLNA 1N76A 5ICTA 2VD2A 2QRYA 4M4GA 1B3LA 3VVDA 4IO6A 4H67A 2F6PA 5ICQA 1ZTYA 4R9GA 2I3WA 4ZEKA 4NF4A 1PBPA 2Q88A 3EN3A 5BWJA 1J1NA 4MF3A 1MS7A 1AL3A 5F1QA 1B7HA 1LAFE 1B4HA 3PPPA 1FCKA 1Y3PA 4ZS9A 2FA7A 4ELPA 1DTZA 1MQIA 2XXUA 3V83A 4KD5A 2A5TA 3GLBA 2I6EA 2DQVA 4U1OA 1MPCA 1MPBA 4POXA 3MZ9A 5CI5A 4U21A 2F6GA 3CSGA 5HM4B 2QSXA 2ZNSA 4DXUA 4KR5A 3FUZA 3PU5A 3VDFA 4NEDA 4QFOA 2X7PA 4F2OA 2QS1A 3RQTA 1SYHA 4OTEA 3W9WA 3SDFA 1GTKA 1SVXB 1UIUA 1OLAA 3MP1A 4QF9A 3B6QA 3QYTA 1PC3A 3U94A 1N3WA 4U23A 5J1DA 3FV2A 1MQJA 1DPEA 3KFMA 4GF8A 3V5AA 2PBWA 4TOZA 4IGRA 4X9TA 4RXLA 4WKMA 3SEUA 3T96B 1MM6A 5EHMA 2Q2AA 1B3FA 2D21A 3H6VA 2E0SA 4U4XA 2OWSA 4QSDA 1ZIUA 1LB9A 5DEXB 4KI0E 4ELQA 3PPNA 5DEXA 2GRVA 2DXYA 3E13X 1A55A 3OO6A 3CVGA 3QIMA 1RYOA 3CIJA 1L5TA 3PPQA 2Z8EA 3GXAA 4LQ5A 2HXWA 3MP6A 3B7DA 5M2VA 3FVKA 1OVBA 4O3CA 4LONB 3DP8A 2HZKA 1PEBA 2P2AA 2QPQA 2DVZA 3U93A 3IJOB 2ZNUA 1MXYA 2PYYA 5H8HB 4RK9A 3OSQA 5H8HA 1XVXA 4IB2A 4F3GA 3KSJA 1IITA 4FAJA 1JVXA 2XXYA 3DP6A 3IOVA 3G7WA 1BKAA 3T66A 1B5JA 2B3BA 4MH5A 3C4MA 4ND9A 1MG1A 4ECFA 3HHGA 2D5WA 4AQ4A 3OXNA 3HN0A 4OWDA 2O84X 4DXCA 1EZ9A 3B6TA 4M1VA 4F18A 3OEKA 2Z8FA 3K1PA 2BJJX 3MPKA 1MXZA 1PB8A 4G4PA 3O2AA 3HPIA 5DT6A 3C9HA 2HQ0A 1OQHA 1EZPA 3W15C 4RA1A 4R75A 2I0BA 3R7XA 1P1QA 4GWOA 3FVGA 3L6HA 3FJ7A 3QUFA 1DMBA 4FATA 1SYIA 3P7IA 4OHNA 5AA2D 3BFUA 2B65A 2F34A 2XX8A 4YKKA 3CRBA 3VXBA 4F3BA 4X48A 3PV0E 2O69A 2F35A 4F1VA 5FHNA 2V3QA 1QVSA 1QKBA 1M5BA 3WAEA 5ISUA 1JETA 1GGGA 3C36A 3SERA 2ALUA 2HFBA 3CG1A 3QUJA 2H9BA 4G8HA 3VE1B 5CMMA 1T0KA 3TQWA 3MW0A 4OERA 4R73A 2VGQA 2H98A 1S50A 1OLCA 3G3KA 5I58A 1MRPA 1ATGA 4LZ5A 1B40A 1A8FA 4MBPA 2DOJA 5A5XB 3SESA 1P1WA 5CMCA 3OENA 1JEUA 4R9FA 5KZTA 4FORA 5A5XA 4OEVA 3FXRA 3T9VA 1AH5A 2CZLA 2REJA 4I8CA 2I48A 2F7AA 2V93A 4JBZA 4NF8A 1ZKBA 4FE8A 4GLIA 4F31B 1POY1 4ISUA 1Q35A 1MM7A 4PETA 1SI1A 5TPAB 2QS4A 5F7VA 2H5YA 4EXLA 4O3AA 1F9BA 1RYXA 3PPRA 1MQGA 1Z7ME 1XT8A 5DVJA 2AIXA 4KHZE 1CB6A 4TQUQ 4XTCQ 1RKMA 4P0GA 4NMYA 1MXWA 3JV9A 1D4NA 2DWJA 4IO3A 5I84A 3SEWA 1B5IA 3HSTA 1LB8A 2O6AA 2YPNA 4OFOA 5I2KA 3K6VA 1B0LA 1DSNA 3EF7A 2RCAA 1BLFA 3FIRA 4EQ7A 2I4CA 2OZZA 3OOAA 5TU0A 1B05A 4NE4A 3KOTA 1M5FA 1N84A 4ESWA 3PUXE 4Z7EA 2F7CA 1N04A 4EF1A 3H3GA 1B2HA 1FQFA 3QSLA 1FQEA 2O1LA 3MP8A 4IY5A 4QSEA 4JSOA 4IO2A 4YU0A 2OJTA 4Q0CA 2QJEA 1URSA 5DVIA 4JDFA 3C31A 1I6BA 1SW1A 4TLLB 3MZ1A 3KN7A 3PD9A 1UIVA 2P1SA 3O97A 4BLAA 3TDJA 5I2NB 4R2BA 1MY4A 2V84A 5I2NA 1FTOA 2Z8DA 1ZJLA 3ILUB 5AA2B 3M3FA 3TTKA 3MQ9A 4LUBA 3QK6A 3PUVE 4U1ZA 5AA2A 3MVZA 4PFWA 3G3FA 4LP2B 3MC2A 1EH3A 3TYHA 5I59A 3OO8A 4YICA 1B3GA 4XXUA 4ZZAA 3PGFA 3VLVA 1DOTA 4G68B 2R9JA 2M8CA 1KWHA 3LSLA 4G68A 4DDDA 1LFIA 3K02A 1B46A 5CRYA 1BTJA 3FATA 1B58A 1FQAA 2ONRA 3TAJA 3O66A 2XHDA 2GHAA 1H3DA 2UXAA 4HCYA 2ESNA 2Z23A 1B1HA 1N0TA 2XXVA 1IIWA 2DE4A 3H06B 5AE4A 4GVOA 4HTGA 2Y7PA 1US5A 1LBBA 4KYEA 2XX7A 3EHUA 4R74A 4H0WA 2I0CA 1FTKA 4YKPA 3TMGA 1FTLA 4OMBA 3S9MC 1LGBC 3U92A 4N13A 2H4IA 3PUWE 4FEBA 4RPNA 5L9MA 4GFRA 1NNKA 4XKRA 3B6WA 2REGA 1AOVA 2F97A 3H03A 1B7ZA 4RPOA 3M3LA 2DWIA 4H65A 4R2FA 2RC8A 3FV1A 3FZVA 2X7QA 4F39A 2HAUA 4EUOA 1N7XA 2Z22A 4E0WA 3BFTA 4F3SA 1Y20A 1LCFA 3QXMA 4LZ8A 3IAZA 3FASA 3HO7A 1B32A 2Y7IA 3KZGA 4KPTA 4C1TA 3IR1A 2XXHA 5CMBA 2Q2CA 3I6VA 5BUUA 3I5OA 4KQPA 4H8JA 3CFXA 5I57B 1R1NA 1VFEA 5I57A 1P1NA 1MXXA 4XKNA 3TELA 4GL0A 3S2VA 1H76A 3TTMA 3PMWA 5DYHA 3IOTA 3TTLA 4EDPA 1JNFA 2XXPA 3LSXA 1S9TA 3MUQA 1TFDA 2UVJA 4PE5B 1LFHA 4NF5B 2DXRA 4NF5A 4GOTA 2PVUA 3TTNA 1UTHB 2G93A 3TEPA 1B52A 4QSCA 5L9OA 4G77A 3RGYA 3UA8A 4GQOA 4C1UA 1MDQA 3DELB 1NFTA 3N6UA 3VLWA 1FTMA 3IB2A 4LVQA 1PB7A 2THIA 3N94A 3PD8A 1IXIA 1LSTA 4G8MA 4OFJA 4YB7A 2NVUB 3O6HA 1D3KA 2FNCA 3MVXA 1S7YA 4F19A 3H6WA 3KN3A 4ZEDA 2IEEA 2ZNTA 2F78A 3R6UA 3KN8A 2XD3A 3PPOA 3TTRA 4HCWA 5KCJB 1A8EA 2HZLA 2XD2A 2H25A 2AL5A 2OLBA 5CM6A 4IO7A 5IAIA 1PB9A 2E1SA 1MH3A 3RLFE 2I58A 4EXKA 4R6YA 2ABHA 4KYDA 4ESXA 2R71A 2B3FA 1SBPA 4QFKA 3IK6B 3RT6B 1IEJA 4YMAA 3TQLA 4G2ZA 1FTJA 4EF2A 3KOSA 1B5HA 2NOOA 4WEPA 4ONYA 3TFLA 1LLSA 2VOZA 1UQWA 1P1OA 1BP5A 3VXCA 2ANJA 3OO7A 2Y84A 2XXXA 5H8SA 3VVFA 1OMPA 3IOUA 4GIZA 3RT8A 2DP8A 1UTBB 1D9VA 4OESA 3TPAA 3ZKKA 1TT1A 4IY6A 1ZBMA 2ZYNA 3UORA 4HS7A 3L6GA 4LZ7A 4POWA 2WKYA 2RKMA 3RTFB 1H45A 1HSLA 3V8XB 4IO4A 1QKAA 1URGA 3H6TA 1LFGA 3T93B 4GL8A 1TXFA 4RNSA 1NMUA 3ONMA 5KDTB 2GHBA 3A3CA 1TFAA 5KDTA 1M5DA 3FXQA 1IUDA 3CFZA 1QUJA 4F3PA 1D9YA 1MXUA 1A40A 1M5EA 3A09A 1XC1A 3N5LA 3MZBA 1FQDA 3HV1A 5H8QB 3G3IA 2UYEA 2CMOA 4ELRA 3FD3A 2Y7KA 3O29A 1YAEA 4OYVA 5TPAA 5AA4B 4F1UA 3DP4A 4QHQA 4DCXA 2F8DA 5L9SA 5AA4A 3TCFA 3N26A 3VV5A 3AXFA 1Q1KA 1SI0A 4JWXA 3IL1B 1HSEA 4GD5A 1IZ1A 2XXRA 4F1YA 5FHOA 3JZJA 2XXIA 2X26A 3G3JA 4ZECA 4H8IA 3BKIB 4XKQA 1B51A 2RF1A 5H8NB 3H4ZA 4FEDA 4L17A 4I9DA 2QMXA 3T9HB 1QUKA 2ONKE 3THIA 3IO4A 1B3EA 4PFUA 2DWHA 4Q8RA 1MQDA 4UACA 1ANFA 4BDNA 4DE8A 3CR9A 4H5GA 4QFLA 4MFIA 4HW8A 1HSJA 1I6QA 4XKPA 4IGTA 1QW0A 1Z7NE 3RPWA 3I3VA 4P11A 1XS5A 3HHFA 3WAFA 1USYE 4BDQA 4OVJA 3MVYA 1I6AA 2QMWA 4NF6B 2O7UA 4NF6A 3S4UA 2LAOA 4LQ2A 3VLUA 4PQJA 3RNNA 3SETA 3JYRA 3O6GA 4DZ1A 4EQ9A 1MXVA 5HBCA 3IORA 4BDLA 3T9XB 2DYXA 5I56B 1B1XA 4DIGA 5I56A 2W7YA 3ODBA 4YB5A 2PT1A 3UP9A 3DM0A 1B0HA 3GBBA 2UVIA 3Q27A 3IO6A 5FHMA 2Y7RA 5IKBA 1ZU0A 2D3IA 3V89B 3RN8A 3PUZE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Y5KA 2FBPA 4YMBA 5FTHA 1NNTA 5K2XA 2V3TA 3LR1A 3ECRA 3UN6A 2DWAA 3N6TA 5AA1A 3M3KA 5JK4A 4ZE9A 3OO9A 1XHYA 5K2YA 1ZLQA 1FBHA 3OD7A 2DS9A 4I62A 3EHSA 2BJIA 1B6HA 4R6KA 3IB1A 5L8DA 4LA9A 2F5XA 4NF4B 4MLVA 1PBQA 3U1OA 2QVUA 4G68C 4FJPA 4ZEFA 2HPGA 2AL4A 1TWYA 1FBPA 4Q30B 4NAPA 3SEYA 4E0XA 1EYIA 3ZKLA 2VT5A 2NUVA 1QJMA 2Q89A 2A5TB 2XXQA 5ITPA 2HCAA 1QUIA 4PFYA 2VHAA 4MJOA 3MWBA 4NTLA 2UVGA 3C35A 4RYAA 1B3HA 2Q9TA 4QBAA 4N07A 2RC9A 1SW5A 3KC0A 1DPPA 2I3VA 1EZOA 4YKJA 5EYFA 3KBRA 4FIMA 1Y3NA 4N6KA 3OEMA 1MY2A 4ZEIA 2OBGA 2DE2A 3KG2A 1WDNA 1FW0A 1FPLA 3VFJA 2V3UA 3K00A 3OMBA 3W9VA 3RTWB 2HAVA 4H6DA 5DTBA 1EU8A 1YPNA 3S9EA 3Q25A 5B70A 3LBSA 2ZYKA 4H5FA 2ONSA 4R6HA 1XOCA 4JB7A 2PT2A 4F22A 2GFEA 4AB6A 2NXOA 3A3UA 3FGSA 4AB5A 2FYIA 3GZGA 1O64A 1R6ZA 1G0IA 3TCGA 3FVNA 3K01A 1FTAA 3T22A 5CBSA 4YB6A 1B4ZA 5LTCA 1B9JA 4H1XA 4MAGA 1USYH 2RC7A 4DI4B 4RY1A 2CZKA 1O63A 4N8YA 2UVHA 3RUMA 1R9QA 4C0RA 2ZYMA 3LUYA 1NV1A 3KGCA 3D4CA 4AS4A 1VE4A 3G3GA 4XF5A 4X8RA 1YCJA 4NX1A 1IMEA 3VVEA 4P56A 4JSDA 3C33A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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