5AA2D

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in complex with nam-pentapeptide.
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
416
structure length
416
Chain Sequence
GVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGRDDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFTQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Lyase
total genus 131
structure length 416
sequence length 416
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
D PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
D PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2D01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2D02
4OXVA 5FHOA 4RYAA 2QSXA 3N6TA 1HSLA 1BP5A 3OSQA 1ANFA 3UA8A 1FTKA 1B9JA 3K1PA 4HCWA 5I2NA 4KYSA 3TUSA 1P1QA 1MY0A 4H6DA 1PBQA 1JW5A 4TQUQ 4JWXA 4YMBA 1EZ9A 3VXCA 3GLBA 2R9JA 1MRPA 2G93A 3U92A 4EF1A 4P11A 1AIVA 4OQOA 1M5BA 1D4NA 1NNTA 3VV5A 4ELQA 2VOZA 1FQDA 2NUVA 3W9VA 1N3XA 1GGGA 3G3IA 3OO8A 4BLAA 4U4SA 4C1UA 5CC2A 4X9TA 3CFXA 2LAOA 3PUXE 3E4RA 1QJMA 2F97A 5KZTA 5KDTB 1S9TA 1FTLA 3IJOB 5BUUA 3QYTA 3O9PA 2ZYMA 5CBRA 4IO3A 3ODBA 3C33A 3H6TA 3C31A 2DQVA 3EHTA 3O2AA 5J1DA 4ESWA 2Z8DA 4GIZA 1US5A 3IX1A 3IB1A 2VD2A 4FJPA 4NF6B 1BLFA 2XXUA 3VLVA 3D4CA 1Y1ZA 4TLMB 4G8NA 5L9SA 4OMBA 1YPNA 4OEUA 4OESA 1WDNA 3EHUA 3TCFA 2XX7A 4YB6A 3T66A 2O1MA 1MQJA 3O6GA 4C0RA 4R9FA 1DTZA 3Q29A 2VGQA 1A8EA 2RC7A 3Q26A 3HV1A 2XXPA 3PPQA 4ZE9A 3CG1A 2WKYA 1FTJA 4JSDA 4G68C 5H8HA 2DXRA 3U72A 2DYXA 2I4BA 3T9XB 4R75A 4G8MA 3S4UA 3VVFA 4F2QA 4LQ5A 3RY3A 4K3FA 1URDA 3I3VA 2PT1A 1SI1A 2X7PA 1M5DA 2CMOA 4U1OA 5TP9B 2GRVA 2UXAA 4ZEBA 2A5TA 3OELA 3RUMA 3TKDA 1VFDA 4ZECA 3ILUB 1ZU0A 3CFZA 4H5GA 1A40A 2Z8EA 3QIMA 2DWAA 4F2OA 3B6QA 4TLLB 4IO6A 1LFGA 1TWYA 2D3IA 3N26A 5TPAA 3MVYA 3ONMA 3S9LC 3EPEA 2AIXA 4JXIA 4RJZA 4N13A 1MXXA 3IB0A 4KFQA 4JDFA 1R1NA 3PPRA 1B3GA 3OSRA 1FQEA 4YKPA 2O1LA 5IAIA 1MG1A 4XXUA 1MXVA 1O64A 3CR9A 3MPKA 1MQHA 1B5IA 3UORA 2I0CA 1MS7A 2OZZA 3FJMA 4IO2A 2HEUA 1Y1MA 5H8FB 1JVXA 4Q30B 4DIGA 4WEPA 4JBZA 3FVNA 5DVJA 4ZE8A 2YJPA 4ZEFA 4P0IA 4ELPA 3K6WA 4JWOA 4MBPA 1II5A 3FATA 3FIRA 3H3GA 1UTBA 4QFOA 2V25A 5CBSA 3CRBA 5CMBA 1Z7NE 3PPPA 4NWDA 5I58B 1P1WA 2IA4A 2W7YA 1B32A 3V8XB 4YKIA 2O7IA 1AOVA 4O3AA 1MXYA 5I2NB 1JEVA 3K02A 2V3TA 3MPLA 3MZBA 3OMBA 3KN3A 4G68A 2P1SA 3DM0A 2H4IA 4IO5A 2QS3A 5CMCA 5I57B 4HTGA 1URGA 1Q1KA 4OERA 4KD5A 2X26A 4M4GA 5KDTA 1URSA 3GBAA 1N7XA 4ZS9A 1QKBA 1LAFE 1ZLQA 3I5OA 1PB8A 1Y3QA 5K2XA 4I62A 4GOTA 5CI5A 2F78A 4KI0E 3MJNA 3RT6B 2UVHA 4EXLA 1IQ7A 1ZTYA 4QRZA 4ZDMA 3TEPA 3KEIA 2OWSA 3RQTA 4DZ1A 1A55A 3ZKLA 1H3DA 2OWTA 5ITPA 3QAXA 3SEXA 1GV8A 4F3GA 5H8SA 5DVIA 4GQOA 5K2YA 5B70A 4RK9A 2VP1A 4GF8A 4X1DA 4AQ4A 2F6GA 2QS2A 5L9OA 3QK6A 1QW0A 3PU5A 1ZIUA 1MDQA 4GVOA 4PETA 3UK4A 1N7WA 2Z23A 3FVGA 3N94A 1LFHA 4XTCQ 2ZYNA 4LP2B 3TTLA 2XXQA 1DOTA 2DSFA 4IY5A 3T22A 5TU0A 5EHSA 2Q2CA 2ZXTA 3UIFA 1MY2A 3VLWA 4F3PA 2Y7KA 4LUBA 3TPAA 3IOWA 1PEBA 3KZGA 1MQGA 3HO7A 1DMBA 3PMWA 3ZS6A 4OETA 2QL3A 3LUYA 3VLUA 3G3JA 4U23A 2ONSA 3BBRA 2UVIA 3TCGA 1M5CA 5AA4A 3FVKA 1B5HA 2V93A 5H8QB 1Y4TA 1LFIA 2E1SA 2NXOA 1B1HA 4UA8A 1IITA 3G3HA 1B4ZA 1KWHA 1FQFA 5FTHA 1MH3A 3FASA 1Q35A 3JV9A 2DS9A 1P1NA 1B3LA 3DP8A 1RYXA 2F6PA 4Q8RA 1IXHA 3EHSA 4F29A 2PYYA 2FNCA 2XD2A 3D4GA 3U1OA 1US4A 5I2KA 3AXFA 3LSWA 2GHBA 4F1YA 2DP8A 1TT1A 1Y9UA 5I58A 4NTLA 2O6AA 5H8NB 1UTBB 3RTWB 3TFLA 1EZPA 1RKMA 3PUVE 5BWJA 4R73A 4GXSB 5B7DA 1CB6A 3FXUA 3GZGA 3OD7A 2XD3A 1FQAA 2GHAA 4RY1A 2ZNTA 4FEBA 2IEEA 3FXRA 1ELJA 5I57A 2B65A 4G68B 1B1XA 1OVTA 2XXWA 1LAXA 1HSJA 3EQ1A 3K00A 1GTKA 3U94A 1DPEA 4GFRA 3O29A 1SYHA 1VE4A 1A8FA 4EUOA 2BJJX 1H44A 4JB7A 4R9GA 5AE4A 1YCJA 3GXAA 1H43A 4XIGQ 4ZEIA 2DWHA 3OEMA 1EZOA 1A54A 2VHAA 3K01A 1LBCA 3C35A 4JWYA 3OXNA 4U2RA 1NKXA 4ELOA 4R6YA 1XS5A 1B40A 4WEDA 3S9MC 2Q88A 5FTIA 4MFIA 3PGFA 4PFWA 4R6KA 4FAJA 1SW5A 2FA7A 2XXVA 4H8IA 4QFPA 1GR2A 3CIJA 5EHMA 4OENA 3H03A 4F3SA 5IKBA 2B3BA 3LBSA 4M1VA 3G3KA 2ONRA 1UIVA 4FORA 1B51A 4IGTA 3O66A 5ELVA 2O68A 2O51A 3TELA 3K6VA 4F1UA 4DCXA 4BDNA 3LSXA 3DP6A 3K1MA 2Y7RA 3E3KA 4F22A 3MUQA 4ZEDA 1FTMA 2O7UA 1GVCA 2H99A 1QULA 2ZYKA 1QKAA 3IB2A 3S9NC 3W15C 2OLBA 1N84A 1B0LA 3V83A 2XXHA 4EQ9A 4F1VA 3G3FA 1M5FA 5H8QA 4LZ8A 4PQJA 3PMVA 1XT8A 4YB7A 1UIUA 1N0TA 1NNFA 3KFMA 5AA4B 4H8JA 3PD8A 5AA2D 2H25A 4R74A 4OTEA 2UYEA 5DTBA 4Q0CA 3T9VA 3ZKKA 4DDDA 1QUIA 2YLNA 3TYHA 3HPIA 4TOZA 4NEDA 3QXMA 1NH7A 3KGCA 4BDMA 4F19A 2F7CA 1LSTA 2DWJA 4KHZE 2DE2A 3OO9A 4EQBA 4IB2A 2ZYOA 5I2KB 5H8NA 3VFJA 2B3FA 4POWA 1JNFA 1B3FA 1WODA 3PUWE 2Q9TA 4EF2A 4RPOA 2OK2A 3C9HA 2I3WA 4E0XA 2I49A 3MAMA 1WVJA 3BFTA 4FATA 2DOJA 4Q5TA 3FZVA 3SEUA 1B46A 4EQ7A 1T0KA 4MLQA 2Q2AA 2H9BA 4FECA 4LZ7A 2P0SA 4XKQA 3C4MA 1HSEA 3P7IA 4ISUA 2NOOA 5AA3A 4OVJA 1ZKBA 4NMYA 3MVXA 4ZZEA 4NF5B 1UTHB 3C36A 1MH4A 2XXIA 2ALUA 1B7ZA 2AYSA 1OIBA 3A09A 3IO6A 3T96B 2F7AA 3MZ9A 1LAGE 3UGWA 3RT8A 1MPDA 1LBBA 4BDRA 2M8CA 2XXRA 3N5LA 1JW4A 3RPWA 4YKKA 4OHNA 3BFUA 4FEDA 4KCCA 3FXQA 3IL1B 1B52A 3MBPA 3QUFA 3B6WA 1IIWA 1MXZA 4DXUA 2Z8FA 4RK2A 3IOVA 1MY3A 1OQHA 3K1NA 2KLFA 4BDOA 1YTVA 2DWIA 2PBWA 4GL0A 4JSOA 3F11A 2HZLA 1MDP1 2I4CA 1B3HA 3SKPA 3TTRA 4QFKA 2HCAA 3I6VA 4I9DA 4RXLA 3HHFA 2RC8A 1I6AA 1FQBA 4LA9A 2XXYA 5AA1A 2HZKA 4WXJA 2VD3A 4R2FA 1QUJA 5ICQA 1B6HA 3H06B 1XC1A 3K6UA 4R6HA 1N04A 1SYIA 3CSBA 3FJGA 1OMPA 3TCHA 3IAZA 3MWBA 4PFYA 4R2BA 4GWOA 3RNNA 4WKMA 1VR5A 4QSEA 3H6VA 2OBGA 5M2VA 3L6GA 4KCDA 5I56B 1FCKA 2QMXA 5CRYA 3FGSA 4I1DA 1B4HA 2R6GE 1BIYA 3LSLA 4QFLA 3FUZA 1LGBC 1PB9A 2RCBA 3TMGA 4LONB 2Y84A 3A3UA 2XHDA 3FVOA 3MZ1A 3IR1A 2UYFA 4H67A 3O28A 3B6TA 1A7LA 3M3LA 2V3QA 3PPNA 4XKPA 1PC3A 1XHYA 3H6UA 2OJTA 1H45A 3CVGA 1FW0A 4MLVA 4U21A 1P99A 2HAVA 1S50A 3PUZE 3C32A 2I48A 1M5EA 4OZ9A 3JZJA 4F18A 3ECRA 3TODA 1JEUA 5CMMA 1Y4CA 1OVBA 4I8CA 1IXIA 1AL3A 3PD9A 2F5XA 4HW8A 1B7UA 5I59B 1Y3PA 2QMWA 2Y7PA 2RKMA 5FHMA 4PFUA 3R6UA 4DLDA 4IO4A 3SESA 3MVWA 4QSCA 4PE5B 1QVSA 4Z7EA 2GFEA 4HCYA 4OFLA 4O3CA 1L5TA 3MP8A 1Z7ME 1OQGA 3ILTB 4U1ZA 3FV2A 2REGA 4O3BA 1NNKA 4KQPA 4YMAA 2XXXA 3E13X 4P0GA 3K2DA 3PV0E 1USYE 3TQWA 2F36A 3T93B 3HCQA 1DTGA 4NE4A 2V3UA 5ITOA 3DLNA 4ONYA 4KR5A 5L9MA 2Q8JA 1SW4A 1UTHA 4NF5A 1IXGA 2Q89A 3KJTA 4E0WA 4X48A 2P2AA 2HAUA 4FE8A 3U8QA 3G3GA 5JTYB 2F8DA 3Q28A 3IOTA 3USDA 1O63A 1MY4A 4QF9A 1JW1A 2R71A 3O6IA 1PBPA 4F31B 1MXWA 4NF8A 3MQ9A 3JYRA 2X7QA 3MW0A 1SW1A 3KOTA 3TQLA 4Z0IA 2AL4A 2THIA 5A5XA 1AH5A 2F34A 4BDQA 1IZ1A 1B5JA 3E9XA 3VXBA 1B05A 1I6BA 2HFBA 1IUDA 3A3CA 3TTNA 4PP0A 2DVZA 2H98A 2XXTA 2ANJA 3IJXB 3KBRA 3RN8A 2ONKE 3SEWA 2YPNA 1MPCA 4OWDA 3R7XA 1MPBA 3OO7A 3BKIB 2I58A 4U4XA 3HN0A 3TAJA 2GH9A 3RGYA 2REJA 2DVCA 3SETA 5FHNA 4YKJA 2CZLA 1BKAA 1RYOA 3Q27A 4H65A 5ISUA 3EN3A 2QRYA 3VVDA 2UVGA 3HHGA 3T9UA 1LCFA 5DT6A 4OFOA 5EYFA 4EXKA 5I56A 4G77A 1XOCA 4GL8A 4ESXA 4QFNA 1B3EA 1DPPA 3IORA 5HM4B 4N6PA 3G7WA 2HXWA 3RLFE 4RA1A 1LAHE 4DCYA 5KCJA 1S7YA 3W9WA 1QUKA 4XKNA 1TFDA 4IO7A 1FQCA 3KN7A 1LCTA 5HPQA 2HQ0A 3FJ7A 2ZNSA 3T9HB 4DXBA 2D21A 3V5AA 2XX8A 3HSTA 4AB5A 3S9EA 1EU8A 5L8DA 1IXCA 4PFTA 3PPOA 2RC9A 2ABHA 5LOMA 4NF4B 2FYIA 1R9LA 2RINA 1XVXA 2I3VA 4ND9A 1ATGA 1O7TA 5I59A 4KYDA 4ECFA 4C1TA 1PDAA 3RTFB 3VE1B 1A99A 4H1XA 3VVEA 2PMSA 3QUJA 4R72A 3FD3A 3KG2A 3THIA 1D3KA 3UP9A 1OLCA 1I6QA 5DEXA 4QHQA 3ZSFA 1B7HA 1DSNA 3CFLA 2G29A 1B2HA 5AA2B 2AL5A 1TXFA 2PT2A 4H0WA 1P1UA 1OLAA 3C34A 4GXAA 2QS4A 4X1BA 4EDPA 4LVQA 3CG3A 4L17A 2DE3A 3CSGA 2A5SA 4YAHX 1I69A 4MH5A 2ZNUA 3H7MA 4KPTA 2I6EA 4ZZAA 3KSXA 3EF7A 3TTMA 5F7VA 1FTOA 3O6HA 3FV1A 2E0SA 1PB7A 4F3BA 4IGRA 3K0VA 2XX9A 1SVXB 5JTYA 4G8HA 1POTA 4N07A 1MQIA 4LATA 1IEJA 1D9VA 2QS1A 4LZ5A 4POXA 1EH3A 3L6HA 4ZEKA 3OENA 4RNSA 3M8UA 1ZJLA 4YICA 1SW2A 1BTJA 3MVZA 4NF8B 3OO6A 3LC8A 5CMKA 3B7DA 4GD5A 5A5XB 1UQWA 5HBCA 3SDFA 3SEYA 2DE4A 5ICTA 1R9QA 2O69A 4GLIA 3KOSA 1SQYA 1SDXA 3SERA 1MY1A 4NF6A 1CE2A 3KJ7A 3PMXA 3TZAA 1LB8A 4H5FA 3VDFA 3N6UA 4U22A 3KSJA 4OYVA 3IK6B 3TDJA 3LR1A 1NFTA 1ZBMA 4DE8A 3DELB 1N76A 2H5YA 3K4UA 4YU0A 4G2ZA 4KYEA 2NVUB 2I0BA 4THIA 1MQDA 1VFEA 2RCAA 4OFJA 4MF3A 1NNPA 1AMFA 1JVYA 1MXUA 2ZMBA 4YB5A 1JETA 3MP6A 4DXCA 2OCUA 4YZZA 2QPQA 1Y3NA 3WAFA 4UACA 1YAEA 1Y20A 5DYHA 5H8HB 3WAEA 5JK4A 1SD3A 5KCJB 4F39A 2DXYA 3Q25A 5TP9A 3U93A 5I84A 1ZMGA 3H6WA 4GRKA 3PUYE 4ELRA 1NH8A 2D5WA 1J1NA 1POY1 1LLSA 1NMUA 2A5TB 2F35A 2O84X 1USYH 5JEIA 1JQFA 3OEKA 4QSDA 2PVUA 2V84A 3H4ZA 4NF4A 4BDLA 2ESNA 1B58A 1VSOA 2Z22A 1SBPA 1F9BA 5TPAB 3R26A 2Y7WA 3K6XA 4FIMA 3UN6A 1SI0A 4HS7A 2F7BA 1NL5A 3IO4A 3GBBA 1P1OA 1B0HA 3LSFB 1H76A 3CI8A 2RF1A 3V89B 3S2VA 5CM6A 2QJEA 1MM7A 1MM6A 2PX1A 3KN8A 4RPNA 5DVFA 2UVJA 1XVYA 4IY6A 2NWJA 1LB9A 1D9YA 3IOUA 3TTKA 4G4PA 3SEVA 3OOAA 4LQ2A 5H8FA 1R6ZA 3O97A 4AB6A 1TFAA 4NWCA 3QSLA 4OEVA 3MP1A 2Y7IA 3M3FA 5AA2A 1N3WA 3DP4A 5DEXB 4XKRA 5F1QA 3M3KA 3MC2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OXVA 5FHOA 4RYAA 2QSXA 4HE0A 3N6TA 1HSLA 1BP5A 3OSQA 4HE1A 1K9YA 1ANFA 3UA8A 1FTKA 1B9JA 3K1PA 5IZZA 4HCWA 5I2NA 2XWVA 4KYSA 3TUSA 4OVTA 1P1QA 1MY0A 4H6DA 1PBQA 1JW5A 4TQUQ 4JWXA 1KZ8A 4YMBA 1EZ9A 3VXCA 3GLBA 2R9JA 2P3NA 4GX3A 1MRPA 2G93A 3U92A 4EF1A 4P11A 1AIVA 4N4UA 4OQOA 1M5BA 1D4NA 1IMDA 1NNTA 3VV5A 4ELQA 2VOZA 1FQDA 2NUVA 3W9VA 1N3XA 1GGGA 3G3IA 3OO8A 4BLAA 1LEVA 4U4SA 2ZZWA 4C1UA 5CC2A 4X9TA 3CFXA 2LAOA 4PAFA 3PUXE 3E4RA 1QJMA 2F97A 5KZTA 5KDTB 1S9TA 1FTLA 3IJOB 5BUUA 3QYTA 3O9PA 2ZYMA 5CBRA 4IO3A 3ODBA 3C33A 3H6TA 1NUZA 3C31A 4H45A 2DQVA 3EHTA 3O2AA 5J1DA 4ESWA 2Z8DA 3HFUA 4GIZA 1US5A 3IX1A 3IB1A 2VD2A 4FJPA 4NF6B 1BLFA 2XXUA 3VLVA 3D4CA 1Y1ZA 4GBWA 4TLMB 4QBAA 4G8NA 5L9SA 4OMBA 3LUZA 1YPNA 4OEUA 4OESA 1WDNA 3EHUA 3TCFA 2XX7A 4G61A 4PTKA 1VDWA 4OA4A 4YB6A 3T66A 2O1MA 4QXDA 1MQJA 3O6GA 4C0RA 3PTYA 4R9FA 1DTZA 3Q29A 2VGQA 1A8EA 2RC7A 3Q26A 3HV1A 4NN3A 2XXPA 3PPQA 4ZE9A 3CG1A 2WKYA 1FTJA 4JSDA 4G68C 5H8HA 2DXRA 3U72A 2DYXA 2I4BA 3T9XB 4R75A 4G8MA 3S4UA 3VVFA 4F2QA 4LQ5A 3RY3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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