1ZKBA

Zinc-free engineered maltose binding protein
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWHHDHFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVMALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPEFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFEYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding, metal binding protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title Structural studies of an engineered zinc biosensor reveal an unanticipated mode of zinc binding.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 127
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zkbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zkbA01
2NWJA 3TMGA 2O6AA 1PB9A 2Q88A 4LVQA 3N5LA 3SETA 4N13A 2Q2AA 2F5XA 1BIYA 4F3GA 2XXWA 3CSBA 1TFDA 3IX1A 4C1UA 1B40A 4YAHX 2ONSA 4ZZAA 3O2AA 4GL0A 3GZGA 1RKMA 2F7AA 1IXGA 4QF9A 1D4NA 1FW0A 1H76A 4NF4A 4KFQA 5ITOA 3OO7A 2D21A 3B6TA 3SDFA 3UA8A 2Z8DA 4JB7A 3A3UA 3FUZA 1YCJA 2H98A 4RK9A 2AL4A 2GHAA 3HSTA 5FHNA 2Z8FA 4X9TA 3ILTB 3KG2A 5FTIA 2D3IA 1A99A 1P99A 1UIVA 1FQCA 1LAXA 3QUFA 4IO2A 4RXLA 3TAJA 4RK2A 3IAZA 1LAGE 2O68A 4ZEIA 2QS4A 4GD5A 5I84A 3KOSA 3G3JA 1Y3PA 1BP5A 1ZLQA 4BLAA 4N07A 4GXAA 3FV1A 1JW1A 3H06B 2DS9A 4ZEFA 1B0HA 4ZE9A 1XT8A 4K3FA 3Q26A 2OCUA 1FQAA 4M4GA 1UTBA 3RTFB 1LB8A 3Q29A 1Y20A 2F34A 3E4RA 4OESA 1L5TA 3S9NC 4F2QA 2WKYA 2UXAA 2ZYOA 4HCYA 1DOTA 4I62A 1H3DA 5KCJB 3T9XB 3MQ9A 4HCWA 2XD2A 1A40A 1Z7ME 4ESWA 3CG3A 4OYVA 5TPAB 3PPOA 4KR5A 3UGWA 2OJTA 3D4GA 4ND9A 3K2DA 4Z0IA 3C32A 3O97A 3RY3A 4FIMA 2G93A 4ZECA 1FQBA 4BDOA 3A09A 5IKBA 1JQFA 4GF8A 3CR9A 1SI0A 4G8HA 2IEEA 1NNPA 3V83A 3IOVA 5J1DA 3TCGA 2DE2A 4Q30B 2D5WA 1B0LA 3U1OA 4NWCA 1FQEA 1NL5A 4NF8A 1D3KA 4GLIA 3E13X 2F6GA 4FJPA 5I56A 3QYTA 4YMBA 1FCKA 4IY5A 4OHNA 5CBRA 3PMWA 3SESA 2PT2A 3C34A 3HN0A 2UYFA 4TLMB 1MRPA 1QKBA 4H1XA 2RINA 1Y1ZA 5CMBA 3C4MA 5BUUA 2F36A 2YJPA 3KJTA 4YKJA 1FTKA 5FHMA 2XXTA 1M5DA 1WVJA 3OOAA 3O28A 2VHAA 3VFJA 1QW0A 4QSDA 3K4UA 2ZMBA 5ELVA 4G68B 3ZSFA 1MQHA 3DLNA 2QSXA 2Z22A 5I58B 4NF6B 1XVXA 3FXUA 1WODA 3MWBA 1B7UA 1NH7A 4P0GA 4QFPA 1EU8A 5L9OA 4EF2A 5I57B 3OEKA 1D9YA 3RGYA 4RJZA 3FGSA 3PPPA 2QS3A 1DPEA 1USYE 1VFEA 3JYRA 3RNNA 3FXQA 2Q2CA 2V93A 4PFUA 3O66A 4H8JA 3L6GA 4OFOA 1J1NA 3MVWA 3O9PA 4KI0E 4QFKA 4OEVA 2I0CA 3M8UA 1SI1A 3MVZA 4EDPA 2I48A 1HSJA 2UVGA 4YB6A 2NOOA 2DP8A 1VSOA 3G3HA 4DLDA 3K6XA 4WEDA 4ELRA 5H8FA 1M5BA 4I9DA 3OELA 5TP9A 4ELQA 1N7WA 3DP8A 4O3CA 3LUYA 4OENA 5KDTB 1B5JA 1JW5A 2VGQA 5A5XB 4QHQA 1ZIUA 3UP9A 3QSLA 2QPQA 1VFDA 3KSJA 3RT6B 3TTMA 4NE4A 3MP6A 4H5GA 4O3AA 3FD3A 4FE8A 2O7UA 1Z7NE 3IJXB 4C0RA 3HPIA 4GVOA 1R1NA 3TUSA 3QAXA 1OVBA 2G29A 2ZYNA 2HFBA 3K01A 1ATGA 3LR1A 3IO6A 1FTOA 5LOMA 4PFTA 4ZZEA 1FQDA 1LBCA 1OLCA 1JEUA 4PFYA 2PVUA 3MBPA 5CMMA 2O51A 3MW0A 4F1YA 5CMKA 1NNKA 1UQWA 3P7IA 4KCDA 1UTHA 1JNFA 5K2XA 5B70A 1S50A 3PUZE 4DCXA 3H6UA 3PD8A 3G3GA 3JV9A 3FVOA 3IJOB 2V25A 3N94A 4LZ5A 3FXRA 1MQDA 1OQGA 5DEXB 3N26A 1NNTA 5DT6A 5H8QB 4PETA 4DIGA 3O6HA 4WXJA 2I3VA 5HPQA 1B3EA 2OK2A 4QRZA 1RYXA 3MPLA 3U92A 1B4ZA 1RYOA 4FAJA 4BDLA 1QUIA 5CMCA 2XXIA 4IGRA 1MM6A 2QJEA 3CI8A 3KGCA 3OSRA 1DMBA 4ZS9A 3T22A 3KBRA 1IZ1A 2IA4A 4ECFA 5CBSA 2E0SA 1B7ZA 3OO8A 1FQFA 2H99A 3EHSA 2DVZA 1SQYA 2DWIA 1TFAA 4YB5A 3PUXE 3KN8A 5CRYA 3DM0A 4JSOA 1GVCA 3TEPA 4KYDA 3LSFB 1GR2A 5CI5A 1LFGA 3U8QA 1JVXA 2FYIA 2F78A 4AB6A 3OENA 5KCJA 3V5AA 4OWDA 4X1BA 3H4ZA 3OMBA 4OQOA 4UA8A 3IK6B 2O69A 2UYEA 3A3CA 3H6TA 2ZYKA 2RF1A 4ZDMA 5ITPA 4F3SA 2R71A 4ZE8A 1Y9UA 3ODBA 3I5OA 2DOJA 3CFZA 3HHFA 1H44A 2O7IA 4OFLA 5F1QA 4HS7A 3ONMA 4YICA 1M5FA 3OSQA 1AMFA 5AA2D 4EQ9A 1IIWA 3W9WA 5I2KB 2VOZA 2Y7RA 4TQUQ 1HSLA 3E9XA 3VVDA 4THIA 4JWYA 1B3LA 5H8HB 1QUKA 4X1DA 2RCAA 2O1MA 4IB2A 2AYSA 4RNSA 3R26A 5L9MA 3O29A 4G68C 3VLUA 3FATA 4JXIA 2Z8EA 4LATA 2PT1A 2QS1A 2ZXTA 5BWJA 1VR5A 2UVJA 4PE5B 1JVYA 3VVFA 1URGA 3TCFA 1LFIA 1AH5A 2PBWA 4U4SA 1P1UA 5JK4A 3TFLA 1ANFA 4FEBA 2I0BA 1SYHA 1ZMGA 2F97A 3MZ1A 3U94A 1GGGA 3N6TA 1Q35A 4ZEBA 3CIJA 4G68A 4Z7EA 2REGA 3LC8A 3MUQA 4H5FA 3TCHA 2VD3A 2W7YA 4O3BA 5I58A 5B7DA 3RT8A 1XHYA 4QFLA 2XXQA 1FTJA 1XC1A 5AA2B 3BKIB 5I57A 4GRKA 2XX8A 3FVNA 3IORA 3GBBA 3SERA 4NF5B 3EQ1A 3ILUB 1B3FA 1LBBA 1P1QA 1N0TA 1IXHA 2Y7PA 2XX7A 3Q27A 1CB6A 4YKIA 2BJJX 3K1PA 4OERA 4EXKA 4I8CA 1YAEA 2AIXA 3EN3A 1QVSA 3TQLA 4L17A 2CZLA 2RCBA 4R6HA 2PX1A 4H0WA 1PBPA 3KEIA 3SKPA 4G2ZA 1O63A 4OXVA 1UIUA 1MXXA 2FA7A 3EPEA 1IXCA 2H4IA 5L9SA 3FIRA 3BFUA 2Y7WA 1B5HA 5KDTA 3W15C 2HAVA 4POWA 3SEVA 1DPPA 4PFWA 1LCFA 3OO9A 2F8DA 3WAEA 4POXA 4PP0A 1BKAA 1HSEA 3K02A 4DXUA 3OD7A 3TTKA 4R6KA 5H8NA 3B6WA 1EZPA 4IY6A 3G3FA 1EZOA 1LAHE 5EHMA 2ONRA 4M1VA 2AL5A 1N84A 4XKQA 4AB5A 1POTA 3IB1A 3MVYA 4XTCQ 3TKDA 3LSWA 1NFTA 2ONKE 4U21A 3RTWB 4LQ2A 4Q5TA 3H6VA 5AA1A 5CC2A 4KYSA 4U22A 1VE4A 3PPRA 3FVKA 1EZ9A 2REJA 2DXYA 1YPNA 1O7TA 4JBZA 4RYAA 2XXVA 4QFNA 1UTBB 3TZAA 4WKMA 2F7BA 1Y4TA 4NMYA 4R75A 3T9VA 4R9FA 1N3WA 4ZEDA 3ECRA 5AA4A 1BLFA 1B32A 5DEXA 5H8QA 3G7WA 3MP1A 3QK6A 3K1NA 3VXCA 4MFIA 4FEDA 3H7MA 3TPAA 3KJ7A 3H6WA 4QFOA 4LONB 2KLFA 5DVFA 1JETA 1II5A 3RN8A 2OBGA 3SEWA 4P11A 1SD3A 4JDFA 4JSDA 5EHSA 1Y1MA 2V3QA 1I6AA 2ZNSA 4GWOA 3BFTA 1B6HA 3U93A 3KSXA 3VV5A 1P1WA 4LUBA 4IO4A 4EXLA 1M5CA 3S9MC 2NXOA 4R9GA 4NF8B 2XXXA 2GFEA 2P1SA 4WEPA 2DWHA 2ANJA 3JZJA 3EF7A 5K2YA 4XKNA 1SDXA 1MPDA 4KYEA 2I58A 2V84A 3K6WA 3V89B 1PB7A 1MPBA 1O64A 1S7YA 2A5SA 3I6VA 1JEVA 3RPWA 1MDP1 3T9HB 4LQ5A 3S9EA 4F31B 4OMBA 3AXFA 1AOVA 3MAMA 2RKMA 3RUMA 1PEBA 4UACA 2XXPA 1H45A 1A8EA 3CFLA 2YPNA 1Q1KA 3N6UA 3EHTA 4YZZA 3K6UA 2X7QA 3IO4A 4TOZA 3V8XB 4F1UA 4R72A 4NEDA 4ESXA 1B3GA 3PPQA 3K0VA 1B51A 1B5IA 1QJMA 1MXUA 1URSA 4P0IA 1US4A 2F35A 4KQPA 4OETA 5F7VA 2I6EA 5I2KA 4OEUA 1NMUA 1OQHA 4H67A 1MXVA 2A5TB 3VLWA 3KN3A 4U23A 3RLFE 4GXSB 2VP1A 5H8HA 2Q8JA 4F2OA 1TXFA 4LP2B 4ONYA 3PGFA 1DTZA 5I59B 3HO7A 4YU0A 3VXBA 1SW4A 3C35A 4H65A 4DCYA 3T9UA 1B2HA 4IO3A 2H25A 4XIGQ 3FV2A 3IB2A 3C9HA 4G8MA 1MDQA 1FTMA 3TTLA 3R7XA 4EF1A 5H8FB 4KCCA 4AQ4A 4Q8RA 4DXBA 2M8CA 1MY2A 4HTGA 4F1VA 3F11A 2DVCA 3PV0E 1R9LA 5HM4B 5JTYB 1ZJLA 4JWXA 1MG1A 4KPTA 1LAFE 2OLBA 4IGTA 2DWJA 1B4HA 4FATA 3TQWA 4IO6A 1SW5A 4RPNA 5H8SA 4KHZE 5ISUA 1NNFA 5AA2A 3C36A 2HXWA 5I2NB 4HW8A 5TPAA 1MY4A 4NF5A 1TWYA 2ZNUA 3B7DA 1I6BA 2DQVA 3BBRA 3UORA 3T66A 4MLVA 1I6QA 5KZTA 4H8IA 1N76A 1CE2A 1UTHB 3ZKLA 3MJNA 4IO7A 2ZYMA 2H5YA 1POY1 3EHUA 4E0WA 5ICQA 1GTKA 3OEMA 1A7LA 2XX9A 3FZVA 5DVIA 1IUDA 3H03A 3G3IA 3RQTA 3FJGA 4F18A 1B3HA 5ICTA 2F7CA 1TT1A 1A8FA 1US5A 5EYFA 4GL8A 5FTHA 2B3FA 3IR1A 4YKPA 2HZKA 1OLAA 1PB8A 2I4CA 1URDA 4OVJA 1ZTYA 4XKRA 1AL3A 3IL1B 3VE1B 2R6GE 1F9BA 1Y4CA 1XOCA 1GV8A 1MXZA 3CRBA 3PD9A 4XKPA 3TDJA 1SVXB 5DVJA 1IITA 2YLNA 4U4XA 1SW1A 3QUJA 1AIVA 3MZ9A 3T96B 2HAUA 2Y7KA 2DWAA 1N04A 3VVEA 3I3VA 3C31A 4NF6A 2Q89A 2GH9A 3UN6A 1OVTA 4I1DA 1LB9A 4H6DA 2XHDA 2UVIA 4LA9A 1IQ7A 2CMOA 1LGBC 2ESNA 3TTNA 4E0XA 2B65A 1PC3A 4BDNA 2QMWA 4QSCA 2ZNTA 2DSFA 4FORA 4ISUA 4G4PA 4NF4B 5HBCA 4DXCA 2R9JA 3ZKKA 3MZBA 4F3BA 2RC8A 3O6IA 1MQGA 2GHBA 4QSEA 4YB7A 3FJMA 4PQJA 3VDFA 3FJ7A 3GLBA 3PMVA 3MVXA 3QXMA 4YMAA 2QMXA 4MLQA 2GRVA 5M2VA 4ELOA 3KFMA 5A5XA 3CSGA 4X48A 4YKKA 2QRYA 1SW2A 2B3BA 1OMPA 1Y3NA 4G77A 3G3KA 4NTLA 4R2BA 3IOWA 3TYHA 1DSNA 1KWHA 3K6VA 5L8DA 4LZ7A 1B1HA 2V3UA 4GIZA 4FECA 4JWOA 2ABHA 1ELJA 2HQ0A 2V3TA 1XS5A 1MXWA 2DXRA 3KZGA 1B58A 1YTVA 2NUVA 3HCQA 1B52A 3D4CA 2OWSA 1LSTA 1LLSA 3PMXA 3THIA 5FHOA 3IOTA 3PUYE 1DTGA 1H43A 1MM7A 3M3LA 4EQBA 3LBSA 2QS2A 4DDDA 3SEYA 1B46A 4F22A 3GXAA 4G8NA 1WDNA 5TU0A 2THIA 2RC9A 4C1TA 4EUOA 2X7PA 3H3GA 4DE8A 3OXNA 4Q0CA 2XXHA 3S2VA 3USDA 5CM6A 1B7HA 3CG1A 4RY1A 2ALUA 4R6YA 3SEUA 2A5TA 4GQOA 4DZ1A 1M5EA 4ZEKA 1NH8A 1MQIA 1PDAA 3KN7A 4F39A 4NWDA 4BDRA 3PU5A 3OO6A 4IO5A 1NKXA 1D9VA 3S9LC 5I59A 3PUWE 5AE4A 5DTBA 3U72A 2I4BA 1QKAA 4RA1A 1IEJA 2UVHA 3M3KA 3UIFA 1MH3A 3HHGA 3T93B 1B05A 3FVGA 1A54A 4MBPA 1USYH 5I56B 1ZBMA 4MH5A 3FASA 4OZ9A 2F6PA 1N7XA 4N6PA 5JEIA 5JTYA 3VLVA 4U2RA 4BDQA 2I49A 2Q9TA 1MH4A 1BTJA 5H8NB 1EH3A 1SYIA 3ZS6A 2QL3A 1Y3QA 1I69A 4KD5A 3DELB 3Q25A 4F19A 3O6GA 3CFXA 1QUJA 5I2NA 1A55A 3TODA 2O84X 1N3XA 1SBPA 2P0SA 3CVGA 4EQ7A 4XXUA 4GOTA 3B6QA 2PYYA 2XD3A 3PPNA 2E1SA 2XXRA 4U1ZA 1MY0A 2OWTA 1ZU0A 2DYXA 4ELPA 3S4UA 1MXYA 1XVYA 2Z23A 4OFJA 2DE4A 3QIMA 1R6ZA 2HCAA 1LCTA 4MF3A 3WAFA 2HEUA 5AA4B 2I3WA 3LSXA 3TTRA 2PMSA 3K00A 1ZKBA 2DE3A 3DP4A 3K1MA 4TLLB 2P2AA 3UK4A 3PUVE 3GBAA 1MQJA 3LSLA 3MPKA 1P1NA 3MP8A 4BDMA 2Y84A 3Q28A 4LZ8A 3HV1A 3C33A 2XXYA 4GFRA 4F3PA 2RC7A 2H9BA 2X26A 4R73A 2FNCA 3R6UA 3IOUA 1B9JA 1PBQA 2XXUA 5TP9B 1R9QA 1FTLA 3W9VA 3E3KA 4OTEA 3TELA 2HZLA 2OZZA 4R2FA 3L6HA 1MPCA 4F29A 1T0KA 3DP6A 5DYHA 2LAOA 1IXIA 1QULA 1P1OA 2VD2A 1JW4A 1B1XA 3KOTA 2NVUB 1S9TA 1OIBA 3M3FA 1MY3A 2Y7IA 5AA3A 4U1OA 4RPOA 5IAIA 3MC2A 1LFHA 3IB0A 2O1LA 4R74A 3SEXA 1MS7A 1MY1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2NWJA 3TMGA 2O6AA 1PB9A 2Q88A 4LVQA 1AWBA 3N5LA 3SETA 4OVRA 4LN5A 4NF0A 4N13A 2Q2AA 1LBXA 2F5XA 1BIYA 4F3GA 2XXWA 3CSBA 1TFDA 3IX1A 4C1UA 1B40A 4YAHX 2ONSA 4ZZAA 3O2AA 4GL0A 3GZGA 5A5LA 1FBEA 1RKMA 2F7AA 1IXGA 1FJ9A 4QF9A 1D4NA 1FW0A 1H76A 4NF4A 4KFQA 5ITOA 3SZPA 4DI4B 3OO7A 2D21A 5EQ8A 4PDHA 3B6TA 1D9QA 3SDFA 3UA8A 2Z8DA 4JB7A 3A3UA 3FUZA 1YCJA 2H98A 4RK9A 1FPGA 1FPLA 2AL4A 2GHAA 3HSTA 5FHNA 2Z8FA 4X9TA 3ILTB 3KG2A 5FTIA 2D3IA 3RPLB 1A99A 1P99A 1UIVA 1FQCA 1LAXA 2XWOA 3QUFA 4IO2A 4RXLA 3TAJA 5I5PA 4RK2A 1RDYA 3IAZA 1LAGE 2O68A 4ZEIA 2QS4A 4GD5A 5I84A 3KOSA 3G3JA 1Y3PA 1BP5A 1ZLQA 4BLAA 4N07A 4GXAA 3FV1A 5T3JA 1JW1A 3H06B 2DS9A 4ZEFA 1B0HA 4ZE9A 1XT8A 4K3FA 4MIJA 3Q26A 2OCUA 1FQAA 4M4GA 4O7MA 1UTBA 3RTFB 1LB8A 3Q29A 1Y20A 2F34A 3E4RA 4OESA 1L5TA 3S9NC 1LBVA 4F2QA 2WKYA 2UXAA 2ZYOA 4HCYA 1DOTA 4I62A 1H3DA 5KCJB 3T9XB 3MQ9A 4HCWA 2XD2A 5LTCA 1A40A 1Z7ME 4ESWA 3T1BA 2P3VA 4O94A 4OVPA 4HXVA 3CG3A 4OYVA 5TPAB 3PPOA 4HE2A 1FJ6A 4KR5A 3FBPA 3UGWA 2OJTA 3D4GA 4ND9A 2Q8MA 3K2DA 4HE0A 4Z0IA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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