1ZKBA

Zinc-free engineered maltose binding protein
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWHHDHFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVMALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPEFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFEYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies of an engineered zinc biosensor reveal an unanticipated mode of zinc binding.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding, metal binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 127
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zkbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zkbA01
3MZ9A 5I2NB 4ELRA 4YKIA 4FECA 1DOTA 1B40A 3QYTA 3E9XA 2R6GE 1POTA 3SEYA 2RF1A 4OTEA 4HW8A 3K0VA 2F7CA 1B51A 4GXAA 5H8HA 5L9SA 1BTJA 3USDA 3VLWA 1MDQA 4TOZA 2XHDA 1P1WA 2Y84A 4NTLA 5AA2B 1Y9UA 4IGRA 1FTJA 1B2HA 1IXIA 5M2VA 4OYVA 1IEJA 2VGQA 4EXLA 1BIYA 3QXMA 5H8NA 1IXGA 4KD5A 3SEVA 4TLLB 3OO6A 1MXXA 1N3XA 4F3PA 2OZZA 3TPAA 1RKMA 4TLMB 3T9HB 2I6EA 3OMBA 5AE4A 2QMXA 4O3CA 3GBAA 4RJZA 3HSTA 2CZLA 4F3GA 1N7XA 1N76A 1YPNA 4C1TA 1IIWA 3T9UA 1IUDA 2QL3A 3BKIB 1UQWA 4OHNA 3MC2A 1USYH 1DTZA 1UTHB 1CB6A 1XOCA 3MPKA 4RNSA 4E0WA 5DYHA 4XKQA 3I6VA 3IX1A 1LB8A 4JSOA 4F39A 5ICQA 4QFKA 4LUBA 3PD8A 1MXWA 4LZ7A 4IO6A 1ZU0A 4PETA 1OVTA 3C36A 4JXIA 3S9NC 4QFOA 4MFIA 1JQFA 2HZKA 3EHTA 3ONMA 2O51A 3O28A 4YB5A 2ZNUA 1OVBA 3TEPA 4EUOA 3I5OA 4NF5B 5DEXB 4H67A 4MLQA 1Z7ME 1B7UA 1QKAA 4PQJA 2UXAA 3QIMA 4ONYA 3U92A 1QW0A 4ND9A 1NH7A 3LSXA 1N3WA 3U94A 1JETA 3PUYE 4M1VA 3T66A 2OBGA 1JW5A 1YAEA 4YAHX 4NWDA 4POXA 3O6GA 2I0BA 2QS2A 3ECRA 4GL8A 3LUYA 4BLAA 2A5TB 3THIA 4U1OA 1EZ9A 3CR9A 2Q2AA 4IO5A 3C4MA 2DYXA 4O3BA 3JV9A 2NWJA 3LSWA 3A09A 5L9MA 4N07A 3CG1A 3K00A 4EXKA 3CI8A 1ZLQA 3K01A 3TCGA 1T0KA 1DMBA 4LQ5A 5K2YA 2DWJA 3G3KA 4NF4B 3N6TA 3PPQA 2KLFA 3O6IA 1P1UA 1D3KA 3RTWB 3SEWA 3V5AA 3MVZA 1H3DA 5CMCA 5I59B 1M5DA 5BUUA 1A8EA 1PBQA 3FD3A 2IEEA 1MY0A 3MVWA 1NNTA 2NUVA 5I2NA 1JVXA 2RKMA 3ILUB 4LVQA 4G4PA 1ZBMA 3F11A 2OWSA 3FGSA 5HPQA 3TQWA 3MP6A 4F22A 3IR1A 1L5TA 3UGWA 4R75A 2NOOA 2VP1A 1WODA 1MQGA 3DM0A 2RINA 3PU5A 1Y1MA 4G8MA 1NNKA 4QFLA 3FXQA 3V89B 4NWCA 1Z7NE 3OSRA 1JW4A 4KYEA 2OJTA 1LAGE 1US4A 2ZYOA 1D9YA 4R2FA 5ISUA 2QS3A 3FVGA 2XXWA 4MLVA 1MDP1 5AA2A 3FJ7A 3TCFA 2R9JA 5CMKA 4U1ZA 1NNPA 2ZYMA 3BFTA 1R1NA 5FTIA 2V3UA 1PBPA 3WAEA 3DELB 2AIXA 5FTHA 4TQUQ 4ZZAA 1MQDA 3H03A 1UIUA 1TFDA 2D3IA 3KOSA 1URDA 3KN3A 1MM7A 3IB2A 1TT1A 1PB9A 4UACA 1EZPA 3TZAA 2RC8A 1KWHA 2ZXTA 4EQ9A 2O6AA 1IITA 1P1OA 1XVXA 3T96B 5AA2D 4R74A 1AIVA 1B6HA 5HM4B 3H6WA 2OLBA 1QKBA 4IGTA 3R6UA 4NF8B 2UYFA 1P99A 2ONKE 1A40A 2HAVA 2GH9A 4BDOA 1US5A 4ZZEA 3RT8A 2G93A 2ZYKA 3WAFA 3K2DA 4JWOA 4F29A 2XXTA 1B0HA 4HCYA 1B52A 1Y3PA 4FAJA 2X7QA 2Y7WA 4THIA 5AA3A 1Y3QA 4NF5A 5I57B 3K1MA 1JW1A 2Q9TA 3QUFA 2DE3A 4OETA 1Q35A 5CC2A 1FQBA 2XX8A 3N26A 1SBPA 1UTBB 1N04A 2YJPA 2AYSA 3MBPA 3OXNA 1QUJA 2DVZA 3D4GA 2ALUA 2A5TA 2W7YA 3G3HA 2O68A 5CM6A 3KSXA 4ZE8A 3CRBA 3UIFA 5DTBA 1GTKA 3LSLA 3IJXB 3UN6A 1O64A 4FIMA 4H1XA 5AA1A 1H76A 1M5BA 5F7VA 4X9TA 1EH3A 5CI5A 5L9OA 4BDRA 4Q5TA 4WEPA 1P1QA 3TODA 2F6GA 4MBPA 4NF4A 3V83A 3OEMA 1I69A 1SVXB 3JYRA 5I59A 2HXWA 4R9FA 1R9LA 3H6VA 3U8QA 1S9TA 4P0GA 2V93A 3IL1B 2PBWA 2RC7A 2HFBA 3FUZA 4G77A 3TTRA 2XX7A 3FJGA 3MWBA 5ITOA 4IY6A 4ZEBA 2F97A 1MY2A 4M4GA 3LR1A 4G2ZA 1CE2A 4DZ1A 3PGFA 4U21A 3DP6A 3ILTB 3S4UA 5I84A 3TCHA 3S9MC 2Q89A 2I48A 3ZKKA 3Q29A 3T93B 3K6VA 2FYIA 1F9BA 3TQLA 5ICTA 4QRZA 4EQBA 3K1NA 2H98A 2THIA 4OFLA 4WXJA 1QJMA 4ISUA 1FQDA 4NMYA 1URGA 3MP1A 2I0CA 3RGYA 4F3SA 1Y4CA 2Z8EA 3IB1A 1A7LA 1BKAA 1FTMA 4EDPA 2DVCA 3IOTA 2PVUA 4IY5A 1LFHA 1ANFA 4BDMA 1N84A 3KJ7A 3MZ1A 1B7ZA 1B3GA 4UA8A 4ECFA 4OERA 2P2AA 1B46A 5KDTA 4AB5A 5TP9B 1VSOA 2LAOA 4YKJA 3B7DA 2WKYA 2E1SA 2YLNA 1JVYA 3BFUA 3LBSA 3VVFA 2DXRA 3FVOA 4PFWA 5EHMA 1MQIA 3IJOB 2I58A 3IO4A 4I1DA 3RY3A 5DVJA 4ZEDA 4NF8A 4YMBA 4H8IA 3MVXA 4BDNA 3S2VA 2ONRA 1ELJA 3IB0A 3GXAA 3GLBA 1VE4A 5IKBA 2DWAA 4OEUA 5DVIA 1MY1A 3GBBA 2YPNA 2REJA 1B7HA 4G68B 4NF6B 3ZS6A 4ZECA 1R6ZA 1FQCA 1GVCA 4YB7A 1MPBA 3FZVA 4KR5A 5TPAB 4GLIA 2PT2A 2P1SA 1LBBA 1FW0A 3I3VA 1O7TA 5I57A 3G3FA 2Y7KA 3O2AA 3PPPA 5CBSA 5I56B 3N5LA 2ANJA 3MP8A 3KSJA 4H0WA 2R71A 2QMWA 4R9GA 1LAXA 3H6TA 4IO7A 4Q30B 5AA4A 1N0TA 2PMSA 3PPOA 3L6GA 1UTBA 3O9PA 2I4CA 1VR5A 3ZSFA 4HTGA 3MW0A 2H4IA 1RYXA 2VD3A 3K6WA 4OEVA 2PX1A 3O97A 2X26A 2I3WA 1EU8A 1O63A 4NE4A 2PYYA 4ZEFA 4ELOA 4ZS9A 5TU0A 4ELPA 4OZ9A 3W9WA 4LATA 4LP2B 3MJNA 3TMGA 3RLFE 2IA4A 3EPEA 2XXXA 4LZ8A 1FQFA 3SKPA 2QJEA 4GRKA 3M3KA 4XKPA 4Z0IA 4H5GA 4C1UA 4YKKA 3PUWE 5DVFA 1LGBC 3ODBA 3CSGA 4N6PA 1PC3A 2DWHA 4G68C 3O6HA 4YMAA 3SERA 1OMPA 3CIJA 3CFXA 1MY4A 1AH5A 3EHUA 5JEIA 1A54A 4F31B 3H6UA 4H65A 2HEUA 4KQPA 3G7WA 1FQEA 1ZKBA 2FNCA 4N13A 4JB7A 3TTNA 1URSA 2ONSA 1FQAA 1HSLA 2CMOA 2XXRA 2V25A 1MY3A 1MQHA 4RY1A 3T9XB 2H9BA 5J1DA 3CG3A 3KBRA 4YICA 1Y20A 4GVOA 3KG2A 1HSJA 3FVKA 2DP8A 4FATA 2H5YA 3VDFA 1GGGA 4GD5A 1LB9A 3PUXE 2F8DA 4F19A 3PMWA 5A5XA 1LCFA 3PPRA 3RTFB 4ZEIA 3VFJA 2I4BA 1S7YA 4K3FA 3T9VA 3Q25A 5CRYA 3EHSA 4R6KA 1FTKA 4KFQA 4DE8A 2ESNA 1B58A 1ZJLA 1MXZA 4OVJA 2H25A 3M3FA 1QUIA 4YZZA 2XXQA 2XXIA 3QUJA 3OO8A 4QSEA 2GFEA 2XXHA 1MXYA 3FV1A 3R7XA 1MXVA 4YU0A 1B9JA 4I8CA 1DPPA 4R72A 1MPCA 1YTVA 3PV0E 1BP5A 3H4ZA 4H8JA 3H7MA 5KDTB 3TTKA 2NXOA 4P11A 5TP9A 4OMBA 4DIGA 1M5EA 2QPQA 1LFIA 4R73A 1SI1A 1SW2A 2HQ0A 1MPDA 1IQ7A 1OLAA 3OO9A 3DP8A 3KZGA 1N7WA 4JWYA 1XS5A 1NL5A 4BDLA 1MRPA 1J1NA 3OOAA 2O84X 1SI0A 3RT6B 2XD3A 4F1VA 4G68A 2I49A 4GXSB 1M5CA 5H8FB 1TXFA 4NF6A 4JSDA 3TDJA 1GR2A 1OIBA 4JBZA 2F35A 5H8QB 5TPAA 2QS1A 3TTLA 4G8HA 4G8NA 1SD3A 1A8FA 4O3AA 3E4RA 2Q88A 1II5A 5I56A 3N94A 5EHSA 3OEKA 1NNFA 4JWXA 1B32A 3FASA 5AA4B 4Q8RA 1NFTA 3O29A 2DOJA 3EN3A 4LONB 4F3BA 1A99A 2P0SA 3TFLA 3HPIA 1S50A 5FHOA 2RC9A 3H3GA 3U1OA 4RPOA 3FIRA 3SETA 4KYDA 1B4HA 4DCXA 1B3FA 2UVIA 1RYOA 4ZEKA 3RNNA 4E0XA 4Z7EA 2DSFA 4XKRA 4GWOA 3KJTA 1PDAA 3K1PA 1B3LA 3GZGA 3UK4A 1DSNA 4HCWA 4YKPA 1XHYA 2Y7RA 2AL4A 2HAUA 4ELQA 5FHMA 1BLFA 4OWDA 4GIZA 3C34A 3C9HA 2O1LA 4DXBA 1EZOA 4AQ4A 2UVJA 2HCAA 4QFNA 3IORA 3UORA 5JTYA 4KPTA 2D21A 2OCUA 4F2OA 2FA7A 3P7IA 1A55A 1SW1A 3C32A 2E0SA 3C33A 3AXFA 4LQ2A 4U22A 4GFRA 3N6UA 4IO4A 3IOVA 4PFTA 2XD2A 2V84A 4F2QA 3Q26A 5A5XB 5FHNA 2Z23A 1IXHA 4XTCQ 1MG1A 1YCJA 3OENA 1B05A 3PUVE 4C0RA 2A5SA 1NKXA 3VXBA 3KGCA 2F5XA 4EF1A 1QVSA 3KN8A 4OFOA 4EF2A 3PMVA 2QS4A 4ESXA 3RN8A 5B7DA 1M5FA 3TAJA 4OESA 5I2KA 4PE5B 3FV2A 3VVEA 3QAXA 2DQVA 2F7BA 4MF3A 2B3BA 4Q0CA 1Y3NA 2Y7IA 1B3EA 2O7IA 1QULA 2OWTA 5I58B 3PUZE 4PFUA 2F78A 3CFZA 1SDXA 4RYAA 1TWYA 3MAMA 4KCDA 4U4XA 1H45A 2PT1A 3KOTA 4R6HA 1B5JA 3HN0A 3SESA 3TTMA 1HSEA 2DE4A 2V3TA 4ESWA 4DDDA 4NEDA 1SYIA 2I3VA 3EQ1A 4RXLA 3ZKLA 1LLSA 3HHFA 2DWIA 4I62A 1POY1 3TYHA 2ZMBA 1IZ1A 4H5FA 2DS9A 3TKDA 2XXUA 3HCQA 2G29A 5H8FA 3V8XB 4HS7A 3A3CA 4F1YA 4QF9A 4QHQA 5H8QA 2GHBA 1D9VA 3HO7A 5ITPA 4U23A 2BJJX 3SEUA 4RPNA 3H06B 1PB8A 3G3IA 4FORA 4L17A 4IO2A 3U72A 5K2XA 1B4ZA 4PP0A 2D5WA 3R26A 3S9EA 3KEIA 4DLDA 2ZNSA 1ZMGA 4DXUA 1I6BA 5ELVA 1LAHE 1LBCA 3TELA 3FATA 5F1QA 1Q1KA 3EF7A 3VE1B 2XXVA 2O1MA 3E13X 4FEDA 4POWA 3Q28A 2F6PA 3L6HA 4KHZE 3QK6A 3BBRA 1AMFA 2O69A 3OO7A 2F36A 1DPEA 2Q2CA 1AL3A 4PFYA 4BDQA 1OQHA 3JZJA 4RA1A 1VFEA 3HV1A 3IAZA 3IO6A 3G3GA 2GHAA 4QSCA 4DCYA 5EYFA 2ABHA 4WEDA 3LSFB 3O66A 3K4UA 3OD7A 2UVGA 4X1DA 1XT8A 1JEVA 5JTYB 3D4CA 1OQGA 2VOZA 1SQYA 1H43A 2DXYA 1USYE 5CMBA 5LOMA 5KCJB 1DTGA 4FE8A 3RUMA 2HZLA 4GL0A 2X7PA 2ZYNA 4XXUA 1B5HA 5L8DA 2O7UA 3FXUA 3RQTA 3S9LC 1MS7A 2RCBA 1MH4A 3LC8A 4XKNA 3SEXA 2M8CA 5B70A 4ZE9A 2B3FA 1I6QA 3FJMA 3IOUA 5H8HB 1Y4TA 4F1UA 3QSLA 1P1NA 4QSDA 3K02A 4LZ5A 2GRVA 4YB6A 4IB2A 1OLCA 1ZIUA 1FCKA 4DXCA 4MH5A 5I2KB 3CFLA 1WVJA 3K6XA 4KCCA 1FTOA 1VFDA 2XXYA 1FTLA 3B6TA 5H8NB 5BWJA 3OSQA 2AL5A 2XXPA 1B3HA 3G3JA 1PEBA 3E3KA 3PPNA 3IK6B 1JEUA 4F18A 5I58A 3CVGA 2Y7PA 3A3UA 4U4SA 4JDFA 4KYSA 4IO3A 3VXCA 2REGA 3MQ9A 3DP4A 3K6UA 3VLVA 2B65A 1PB7A 1NH8A 3VVDA 3IOWA 4OXVA 1LAFE 1ATGA 3W15C 1UTHA 1JNFA 5CMMA 4X48A 3MVYA 1MQJA 5H8SA 4GQOA 1R9QA 3C31A 1QUKA 1I6AA 4OFJA 5DT6A 3UA8A 3PMXA 3OELA 1MH3A 2RCAA 3RPWA 4EQ7A 3SDFA 3UP9A 1AOVA 1LFGA 4P0IA 4LA9A 2UVHA 1GV8A 1B1HA 1XC1A 1MM6A 4KI0E 2QRYA 1NMUA 5DEXA 2H99A 4QFPA 5JK4A 1UIVA 2Z22A 3MZBA 4GOTA 5HBCA 3MPLA 3C35A 4ZDMA 3MUQA 1TFAA 4OQOA 3M8UA 4WKMA 3TUSA 4I9DA 1XVYA 3CSBA 3DLNA 3M3LA 1IXCA 1LSTA 1SW4A 4H6DA 2XX9A 4RK2A 5IAIA 2VHAA 3VLUA 2V3QA 4AB6A 1ZTYA 2DE2A 4R6YA 5CBRA 3KFMA 2Q8JA 1WDNA 2ZNTA 3FXRA 1B5IA 1SW5A 3B6WA 4FJPA 4RK9A 1B0LA 2NVUB 5KZTA 1B1XA 3FVNA 4GF8A 4X1BA 4XIGQ 2F34A 4R2BA 1H44A 2Z8DA 3HHGA 4OENA 2OK2A 4U2RA 2QSXA 2UYEA 3U93A 4FEBA 3W9VA 3KN7A 1LCTA 3T22A 1Y1ZA 2VD2A 1MXUA 1D4NA 5KCJA 1SYHA 2F7AA 3VV5A 2Z8FA 3PD9A 3B6QA 3Q27A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MZ9A 5I2NB 4ELRA 4YKIA 4P3LA 4FECA 1DOTA 4GWXA 1B40A 3QYTA 3E9XA 2R6GE 1POTA 3SEYA 2RF1A 4OTEA 4HW8A 1YYZA 3K0VA 2F7CA 1B51A 4GXAA 5H8HA 5L9SA 1BTJA 3USDA 3VLWA 4N15A 1MDQA 4TOZA 2XHDA 1P1WA 2Y84A 2FHYA 4NTLA 4N91A 5AA2B 1Y9UA 4IGRA 1FTJA 1B2HA 1NUXA 1IXIA 4MX6A 5M2VA 4OYVA 1IEJA 2VGQA 4EXLA 1BIYA 3QXMA 5ET5A 5H8NA 1IXGA 4KD5A 3SEVA 4MCOA 4TLLB 3OO6A 4NQ8A 1MXXA 1N3XA 4F3PA 2OZZA 3TPAA 1RKMA 4TLMB 3T9HB 2I6EA 4PCDA 3OMBA 5AE4A 2Y5LA 2QMXA 4MEVA 4O3CA 3GBAA 4RJZA 3HSTA 2CZLA 4F3GA 1N7XA 1N76A 1YPNA 2FBPA 4C1TA 1IIWA 3T9UA 1IUDA 2QL3A 3BKIB 1UQWA 4OHNA 3MC2A 1USYH 1DTZA 1UTHB 1CB6A 1XOCA 3MPKA 4RNSA 4E0WA 5DYHA 4XKQA 3I6VA 3IX1A 4MIJA 1LB8A 4JSOA 4F39A 4MAGA 5ICQA 4QFKA 4LUBA 2WEFA 1VDWA 3PD8A 1MXWA 4LZ7A 4GWYA 4IO6A 1ZU0A 4PETA 1OVTA 3C36A 4JXIA 3S9NC 4QFOA 4MFIA 1JQFA 2HZKA 3EHTA 3ONMA 2O51A 3O28A 4YB5A 2ZNUA 1OVBA 3TEPA 1LEVA 4EUOA 3I5OA 4NF5B 5DEXB 4H67A 4MLQA 1Z7ME 4PFRA 1B7UA 1QKAA 2F3DA 4PQJA 1AWBA 2B4LA 2UXAA 3QIMA 4P1LA 4ONYA 3U92A 1QW0A 4ND9A 2Q8MA 1NH7A 3LSXA 1N3WA 2KR0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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