1ZKBA

Zinc-free engineered maltose binding protein
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWHHDHFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVMALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPEFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFEYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding, metal binding protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title Structural studies of an engineered zinc biosensor reveal an unanticipated mode of zinc binding.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 127
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zkbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zkbA01
1SW4A 2AYSA 3KZGA 1POTA 3PUYE 4I62A 3U94A 5I2KB 1LSTA 3H6UA 3OXNA 4FJPA 1IITA 4Z7EA 5J1DA 2V93A 3T9VA 1NL5A 1FQEA 3TFLA 3FUZA 3FXQA 1UTHB 3MPKA 3IO4A 3WAFA 4X1DA 2VD3A 4YKIA 3B6QA 1BIYA 5DEXA 2I48A 2HEUA 3V5AA 2Q2CA 3S2VA 4OERA 4PFTA 4R2FA 1Y1ZA 1OVBA 1LB8A 2AL4A 1UTBB 3SEUA 3EN3A 5ICQA 3OO9A 3S9NC 3OO6A 4HS7A 3LBSA 2ZMBA 4U4SA 3O6GA 1PBQA 1OIBA 3SDFA 4OEUA 4LA9A 4U22A 1LFHA 2VHAA 5AA4A 4I1DA 3W9VA 4IO2A 1MY1A 5ICTA 3OEMA 4NWDA 1B05A 3MPLA 1URGA 3U72A 3MP1A 1ZJLA 3FVNA 2O1MA 3CG3A 4IO5A 5DYHA 1XVXA 2PMSA 3OELA 1A8FA 1M5BA 2PVUA 1MXUA 3EQ1A 1URDA 4QFNA 3ZKLA 3IR1A 4YMBA 4TLMB 1SVXB 4EXLA 3GZGA 4XKNA 1FCKA 4NF4A 3G3FA 3G3KA 1B7ZA 1JW4A 2ANJA 1LB9A 3C9HA 4F2OA 2YPNA 3Q25A 5I2NB 4EXKA 2DSFA 1MM7A 3UIFA 3CIJA 2ZXTA 4ELRA 4AB5A 1LCTA 2NXOA 4RA1A 1Y3PA 3C34A 4IY5A 4NF5A 3P7IA 4F39A 1ATGA 3ZS6A 1SW5A 4PFUA 4KCDA 3S9MC 1NKXA 1FTLA 4KI0E 4Q30B 1OMPA 4F22A 3D4GA 5CMCA 4ELOA 4DIGA 1S7YA 1GVCA 2Z8EA 1MPCA 2H99A 1M5DA 4U21A 3VVDA 5FTIA 1B4ZA 4QFKA 1PBPA 3KSXA 2XD3A 2F6PA 3V8XB 5ELVA 1MY3A 2HQ0A 3KN7A 3HO7A 3FV2A 5KDTB 4TQUQ 4O3CA 1TT1A 2DS9A 3VVEA 1N7WA 1B3HA 2DYXA 4DCXA 1ZMGA 3O97A 2R71A 3H6TA 4RPNA 1MXWA 4EDPA 4P0GA 1Y4TA 2GHBA 3A09A 3VE1B 3IORA 5HM4B 2IA4A 4DDDA 3U8QA 2YLNA 2O1LA 2DP8A 3TTRA 1Y20A 1US5A 4XTCQ 2X7QA 3MVZA 4ZE9A 3TMGA 1QVSA 4K3FA 1H45A 4NE4A 3U92A 3W15C 5H8QB 1MQGA 1PB8A 3N5LA 3VFJA 3CFZA 1VE4A 2DE4A 1L5TA 2OWTA 3K2DA 5AA1A 4LUBA 4OENA 2VOZA 1QUJA 2DE3A 2XX7A 4XKRA 1ZU0A 3QSLA 3T9HB 4GQOA 4R6HA 4ZE8A 4RXLA 1RKMA 3C35A 2VGQA 2Y7WA 3WAEA 3PUZE 3W9WA 3Q28A 2G93A 4BDMA 3QYTA 4PQJA 4F29A 2PBWA 2XXWA 4Q0CA 1PC3A 4QSEA 3UORA 5JTYB 1EZPA 4R74A 3TZAA 2QS4A 1HSEA 4LVQA 3RQTA 1JEVA 4OFLA 4FE8A 5CMKA 1MRPA 5BWJA 4R9FA 2Z8DA 4ZEIA 3DP4A 3I5OA 1VR5A 5I2KA 3MQ9A 1Q35A 2NOOA 3O9PA 2XXPA 2H25A 4I8CA 3U1OA 3S9EA 3IAZA 3MW0A 4ZECA 4DXUA 1B4HA 3DM0A 3CFXA 1J1NA 1B0HA 3QK6A 2GHAA 1LBBA 4N07A 2F78A 3UA8A 2UYEA 2UYFA 4OQOA 1SQYA 2O69A 3SEWA 2DWIA 1UTBA 1LGBC 1I6BA 3SEYA 4NF6B 1Y9UA 4ZEKA 5B70A 1OQHA 4H1XA 3K6WA 1MQHA 2DXYA 4FEDA 3VLVA 2I3VA 3OSQA 3GBAA 1A55A 5KZTA 3F11A 3L6GA 3DP8A 4KYEA 5I84A 4BDNA 3QXMA 3C33A 4H0WA 3T9XB 1B0LA 5I58B 4P11A 2PT1A 3JZJA 4BDOA 4XKPA 1MXVA 3H03A 1USYH 4KYDA 1P1OA 3JV9A 3C4MA 2CZLA 3VDFA 5KCJB 1TFAA 3LSFB 1FTOA 4ZZAA 1O64A 3PPPA 1XT8A 4DLDA 1POY1 4FORA 2V3QA 5I2NA 3N6TA 1GV8A 3E4RA 3R7XA 4FATA 1Y3QA 2B65A 3OOAA 4G4PA 2NUVA 3IL1B 3IOTA 1B58A 1DPEA 2OBGA 4JDFA 3G3JA 3MBPA 1NMUA 1LAGE 4GD5A 3MP6A 1TXFA 4MH5A 1XS5A 1B5HA 1IIWA 3JYRA 4G8HA 2GFEA 4EQBA 1NNFA 2QMXA 2UVGA 3QAXA 1FQFA 3TTLA 3K02A 5H8HB 4OHNA 3MZ9A 4X48A 1GGGA 3CFLA 2V3TA 4ONYA 5KDTA 1D9YA 2LAOA 5HBCA 3CVGA 3O6HA 1H43A 2XXUA 3KBRA 2REJA 1BP5A 5I57A 1FQBA 4C1UA 5ITOA 3V89B 5A5XB 3A3CA 4ZEDA 3TODA 3MVXA 3PPNA 1N04A 2Z23A 4GXSB 2P1SA 3ONMA 2QS3A 4OXVA 3FATA 3RTFB 1AOVA 4OVJA 4MF3A 1WODA 2XXHA 1BTJA 2H4IA 3UP9A 2DE2A 1NH8A 4GRKA 4KD5A 3T66A 2I0BA 3HPIA 1QW0A 4BDQA 1SW2A 3PGFA 2DQVA 4POWA 2ONRA 1B52A 5H8QA 1D4NA 2XXYA 2ZYKA 4GFRA 4KQPA 1LFGA 3FXUA 1QUKA 1ZTYA 4FECA 3TTMA 4YB7A 3PD8A 2OJTA 4KR5A 2IEEA 2UVJA 2QSXA 1B6HA 2OLBA 3AXFA 3UK4A 3VLWA 4IB2A 4H8JA 3QIMA 1MG1A 4F1UA 4NTLA 1UIVA 1VSOA 4RYAA 3T22A 3OO8A 3H3GA 2QMWA 5JTYA 3TCGA 4M1VA 3CRBA 4G68B 3SEVA 1Z7ME 2RF1A 4OFOA 4PETA 5FHMA 3IOUA 4U23A 2ZNSA 1DTZA 1YTVA 2QJEA 3HHGA 3M3KA 4YU0A 4LATA 1LAXA 4XXUA 1IXCA 4AB6A 4N6PA 4Q5TA 4NWCA 4UACA 1OVTA 3SEXA 4LZ5A 4JB7A 4YICA 4F2QA 2PT2A 1UQWA 1Y3NA 2V25A 3G3HA 4YB6A 4QSCA 3QUFA 3T93B 1N3WA 3B6WA 2I6EA 3KN8A 1P1NA 3OMBA 3E3KA 1YAEA 2Q89A 1JQFA 1PB7A 5DVJA 1B40A 4IO6A 3K6VA 3OO7A 3M3FA 3EHUA 2F97A 3QUJA 1NFTA 2I3WA 5JK4A 3MAMA 2GRVA 1TWYA 5L9SA 1SDXA 4WEPA 2H5YA 2XXVA 3HV1A 4NF6A 2O68A 5BUUA 3OEKA 1A99A 4BDRA 3EPEA 1Z7NE 3IJXB 2DVZA 4YAHX 1P99A 2F34A 1B46A 2Q2AA 1CE2A 4R2BA 2HAVA 4O3BA 3O6IA 4OTEA 2A5TB 2OWSA 5H8FB 4QF9A 3TTNA 2ZYOA 2X7PA 1SW1A 3ECRA 5I58A 4ESXA 4YZZA 4KHZE 2E1SA 4IGRA 1XVYA 2OCUA 4FEBA 4F1YA 4BDLA 3PV0E 4LP2B 3IOWA 5CC2A 4ELPA 3THIA 1DTGA 1P1QA 3K6UA 1JW1A 3T96B 5F7VA 5H8SA 5AA2D 4ZZEA 2VP1A 2ABHA 4MLVA 5CM6A 5KCJA 3MUQA 1ZIUA 1MQJA 4GLIA 4RJZA 1MQIA 5IAIA 1A8EA 4F3GA 1JNFA 4ZDMA 1QKAA 2UXAA 3M3LA 4X9TA 1WVJA 3K6XA 3PU5A 5TP9B 4PE5B 2R6GE 1MPDA 2M8CA 2Y7KA 4ESWA 1MXYA 5FHNA 5TPAB 5AA2B 1DOTA 5F1QA 3TUSA 3IOVA 1MDQA 3DLNA 4H6DA 2XXIA 1MY2A 2FA7A 1Y4CA 5CMBA 1S50A 4BLAA 1RYXA 4OESA 4JSOA 5FTHA 2DXRA 3R26A 1LBCA 5L9OA 4EUOA 2HXWA 4L17A 4ISUA 4JXIA 3K0VA 1ELJA 4QFOA 4LZ7A 3GBBA 4H67A 1TFDA 3G7WA 4DCYA 4ND9A 2GH9A 5I59B 1N0TA 2RC9A 5H8HA 1AL3A 4OMBA 1WDNA 2BJJX 4RNSA 1UTHA 1MM6A 1A54A 1N7XA 4MLQA 3ZSFA 1EZ9A 3VVFA 1LLSA 3K01A 5A5XA 1B32A 3OENA 3SKPA 5K2YA 4THIA 1B7HA 4WKMA 4OWDA 1FW0A 3O29A 1URSA 1JVXA 3EHSA 4C0RA 2X26A 1AMFA 4OETA 1LCFA 1O7TA 2I49A 5EHSA 4U1OA 2PYYA 1R1NA 3IX1A 4NF8B 3T9UA 4EQ9A 1GR2A 4ECFA 5DVIA 3OSRA 4IO3A 1B51A 2DWHA 3KJ7A 2F35A 1USYE 2F7BA 4G77A 2QRYA 3K1PA 4HCYA 1B2HA 1R9LA 1HSJA 1IZ1A 3R6UA 4YB5A 1PDAA 4JWOA 1DPPA 3KOSA 1MXZA 4GOTA 4RK9A 2Z8FA 4FIMA 3CSBA 1FQCA 4QFPA 3BFUA 1F9BA 1T0KA 4GL8A 1EH3A 4G68A 1NNTA 2RC7A 3RT6B 4IO4A 3TDJA 4X1BA 3RNNA 2H9BA 2ONKE 1B3GA 5L9MA 2REGA 3KGCA 2O6AA 2DVCA 1SI0A 3IJOB 2F7AA 3TCFA 5H8NB 4R6YA 2F7CA 4F31B 2A5SA 1IQ7A 4ZEFA 4OFJA 2AL5A 1KWHA 2Z22A 1VFEA 3O2AA 4QSDA 3TKDA 4KFQA 2O7IA 4JSDA 1XOCA 3S4UA 2KLFA 2E0SA 1VFDA 5AE4A 3CSGA 1II5A 5TU0A 4M4GA 2AIXA 2UVHA 3MVYA 3SETA 4HW8A 3H6WA 5CRYA 2RINA 5AA3A 2Y84A 3PUWE 2B3BA 2W7YA 4NEDA 3BBRA 3B6TA 3HSTA 3LR1A 1I6AA 2WKYA 2O7UA 4JBZA 1IXIA 3N6UA 4JWYA 3ILUB 3KOTA 4GF8A 1JW5A 2A5TA 3H6VA 4TOZA 2F36A 2NVUB 3O28A 1SI1A 5H8FA 2XD2A 2FYIA 3Q27A 2DOJA 5IKBA 1B3FA 1B1XA 3EF7A 1MDP1 3PPQA 5CBSA 2Y7PA 4OZ9A 3RN8A 2XX9A 4R9GA 2QPQA 3B7DA 2OK2A 3IB0A 2UVIA 3HHFA 1O63A 4DXCA 2HAUA 3FV1A 2ZNTA 3FJMA 4E0WA 2HZKA 2ALUA 3PMVA 4EF2A 2CMOA 2F5XA 1IUDA 3MC2A 2OZZA 2B3FA 5TP9A 1MS7A 5I56B 5DTBA 3HCQA 2V84A 3RUMA 3E13X 4G8MA 1B7UA 5TPAA 1IXHA 1SYHA 5AA2A 4R75A 1P1WA 3DP6A 1SD3A 3N26A 3IB1A 1R6ZA 1XC1A 2D5WA 2Q8JA 5EHMA 4R72A 3S9LC 2FNCA 1ZBMA 4GL0A 3N94A 2O51A 3TPAA 1GTKA 3FD3A 1FTMA 3RLFE 3TQWA 3ILTB 4JWXA 1P1UA 2ZYNA 1LFIA 4XIGQ 3CG1A 4IGTA 1B3EA 3H4ZA 4Z0IA 1MH4A 3C32A 2P0SA 4I9DA 1I6QA 4OYVA 4IO7A 4R73A 1JEUA 1A40A 3SERA 2HZLA 2V3UA 5I59A 2XHDA 4MBPA 1FQDA 5FHOA 3SESA 4GXAA 4F19A 3H06B 1H3DA 4TLLB 1B5IA 4H8IA 1LAFE 3LC8A 4YKPA 5L8DA 2NWJA 4EQ7A 1R9QA 4RPOA 1OLAA 3TCHA 2QS2A 3TYHA 2Y7RA 2XXXA 1IXGA 4AQ4A 5JEIA 4EF1A 1ZLQA 3MVWA 3PPOA 2RC8A 3BFTA 3ZKKA 2QS1A 4GWOA 2I0CA 5DT6A 4NF8A 5B7DA 3E9XA 4R6KA 3Q26A 3TTKA 1MQDA 1JVYA 2XXRA 3DELB 3U93A 3FASA 1BKAA 5LOMA 3FXRA 5I57B 5DEXB 4DE8A 1ANFA 2O84X 3PMXA 3MP8A 1A7LA 4N13A 2Y7IA 3USDA 3PD9A 1PEBA 1SYIA 1NH7A 4NMYA 5ITPA 3O66A 4ELQA 3LUYA 3VXCA 4WEDA 1US4A 1JETA 4GVOA 1S9TA 4DXBA 3RTWB 3FIRA 3G3GA 4P0IA 4HTGA 5AA4B 3K1MA 4YKJA 4H5FA 3OD7A 1IEJA 1MXXA 3CR9A 4GIZA 4YKKA 3GXAA 4FAJA 1OQGA 3GLBA 4O3AA 4YMAA 5H8NA 2RCBA 3MZ1A 2D21A 3BKIB 1MY0A 3TQLA 3C36A 2Q88A 3IK6B 1NNPA 4ZS9A 3K4UA 1QJMA 4KYSA 4NF4B 2QL3A 4WXJA 4U2RA 3LSLA 1D3KA 3K00A 2ZYMA 4G68C 1H76A 4MFIA 1FTKA 3PPRA 1D9VA 4U1ZA 4KPTA 3MJNA 4F18A 4IY6A 4NF5B 1QKBA 2Q9TA 5CMMA 1N84A 1YCJA 2I4CA 3FJGA 2DWAA 4ZEBA 3A3UA 4XKQA 3CI8A 5CBRA 3KG2A 3RPWA 1ZKBA 4H5GA 5HPQA 3ODBA 4F3PA 3VV5A 3HN0A 4QHQA 2ESNA 4PFWA 4QFLA 4LZ8A 3FVKA 3FVGA 1H44A 4HCWA 3D4CA 3TELA 2HFBA 3KFMA 4RY1A 5EYFA 1RYOA 3KJTA 1AH5A 3M8UA 1B9JA 3FGSA 1LAHE 1N76A 2H98A 4G8NA 4E0XA 3IO6A 3PUVE 2R9JA 2D3IA 3K1NA 1MH3A 4QRZA 1HSLA 1MPBA 1XHYA 3FJ7A 1EZOA 3MWBA 5ISUA 3KSJA 4G2ZA 3RGYA 4DZ1A 4C1TA 1EU8A 3H7MA 4Q8RA 3G3IA 1QUIA 2P2AA 4RK2A 3KN3A 1SBPA 5K2XA 3V83A 4LQ5A 5I56A 1I69A 4UA8A 4PFYA 2XXTA 1N3XA 4LQ2A 3FVOA 3IB2A 3RT8A 1B5JA 1B1HA 3TAJA 2HCAA 2F6GA 3C31A 3MZBA 2YJPA 3EHTA 1YPNA 1AIVA 2XX8A 3LSXA 1CB6A 4PP0A 2PX1A 4OEVA 4H65A 3UN6A 3TEPA 3UGWA 1M5EA 1NNKA 4POXA 2F8DA 3LSWA 2DWJA 2G29A 1UIUA 3Q29A 2ONSA 2THIA 2RKMA 2RCAA 1FQAA 5CI5A 4F1VA 4F3BA 1OLCA 3VXBA 3PUXE 4KCCA 2I4BA 1DSNA 1FTJA 1Q1KA 1B3LA 3KEIA 4U4XA 3I3VA 1PB9A 4LONB 1M5FA 4F3SA 3FZVA 5M2VA 1QULA 3L6HA 3VLUA 2I58A 1DMBA 1Y1MA 1MY4A 3RY3A 3I6VA 2ZNUA 1M5CA 2XXQA 1BLFA 5DVFA 3PMWA 2VD2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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