5HPQA

Crystal structure of cyclohexadienyl dehydratase from pseudomonas aeruginosa bound to acetate
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
238
structure length
238
Chain Sequence
ESRLDRILESGVLRVATTGDYKPFSYRTEEGGYAGFDVDMAQRLAESLGAKLVVVPTSWPNLMRDFADDRFDIAMSGISINLERQRQAYFSIPYLRDGKTPITLCSEEARFQTLEQIDQPGVTAIVNPGGTNEKFARANLKKARILVHPDNVTIFQQIVDGKADLMMTDAIEARLQSRLHPELCAVHPQQPFDFAEKAYLLPRDEAFKRYVDQWLHIAEQSGLLRQRMEHWLEYRWPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
molecule keywords Cyclohexadienyl dehydratase
publication title Crystal structure of cyclohexadienyl dehydratase from Pseudomonas aeruginosa bound to acetate
rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa (strain atcc 15692 / pao1 / 1c / prs 101 / lmg 12228)
total genus 85
structure length 238
sequence length 238
ec nomenclature ec 4.2.1.51: Prephenate dehydratase.
pdb deposition date 2016-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5hpqA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5hpqA02
3IB1A 5I58A 1LLSA 3KOTA 3OXNA 3RTFB 3ZKLA 3PUVE 1MY1A 5AA2B 1DPEA 2RCBA 4AB6A 5HBCA 3GBAA 3P7IA 3EPEA 4X1DA 5CMBA 3PUWE 4OETA 1H76A 5AE4A 1VFEA 2PX1A 2F34A 4FAJA 1DTGA 2HQ0A 3HHGA 2OWSA 4NF4A 3G3JA 4R2FA 4YAHX 4F1VA 1HSLA 1A40A 1OLAA 5I2NB 4JBZA 4MFIA 1B2HA 4N07A 2PYYA 1NH8A 3UK4A 2V3UA 4MLVA 3PPNA 2ONKE 1FW0A 3VLWA 1SBPA 3BFTA 4FE8A 4I1DA 2QPQA 4ECFA 3H6UA 3DP8A 2Q89A 3PD9A 1AIVA 1Y20A 3CG1A 2DOJA 1DTZA 4EF1A 1EZPA 4KPTA 5H8SA 5L9OA 4NF5A 2GHAA 1US4A 2ZYMA 3FVKA 4RNSA 4NMYA 4U1OA 1MY4A 2P0SA 3E13X 3TTNA 4IO2A 1M5CA 1LBBA 3CIJA 1F9BA 2NUVA 4LP2B 1ZU0A 4JSDA 3MZBA 1FQCA 2O1LA 2DE3A 4NF4B 3OO8A 3CFXA 1FQFA 5H8QB 1NL5A 3JYRA 1Y3PA 1O63A 1LSTA 2F35A 4NWCA 3RN8A 3C9HA 2THIA 4Q30B 2I48A 2H9BA 3GLBA 1YAEA 5M2VA 4LQ5A 2I4CA 4YMBA 5H8NB 5DYHA 2HAVA 2X7QA 4F39A 3E3KA 1NNPA 2YJPA 3S9NC 2XXRA 1Y1ZA 4OXVA 4H5FA 1I69A 3C33A 2RINA 2QSXA 2QS3A 1RKMA 2UVJA 2Z8DA 1T0KA 4R9GA 2XXXA 3N26A 1LAHE 2WKYA 1Z7NE 1ATGA 4JSOA 2RC8A 3K1PA 4YMAA 1LCTA 3B6WA 4F18A 3IX1A 2ZYNA 3MC2A 1B5IA 3MVZA 3RTWB 3PUZE 2OZZA 4WXJA 3PUYE 4GOTA 1EU8A 2V3QA 1I6BA 4ELOA 5I2KA 3Q29A 1NH7A 3UIFA 3A3CA 3SESA 3Q28A 2YLNA 3OO7A 1MDP1 4QHQA 4JWXA 4PFYA 1LFGA 2Q8JA 1WDNA 5H8FA 2I3VA 4C0RA 2Z8FA 2UYEA 1MDQA 1B0LA 4IGTA 1B6HA 1XVYA 4E0WA 5IKBA 1B4ZA 1B52A 3HV1A 4FEBA 4ZZEA 4NWDA 4OWDA 3V5AA 3G7WA 1HSEA 4BDRA 1POTA 3OSRA 5CBRA 1QULA 1DOTA 3MPLA 5I84A 3PMWA 1NNKA 2XXIA 4ZEKA 2O1MA 1D9YA 3I5OA 3D4GA 2ESNA 3FVOA 4TLMB 5AA2D 3HCQA 4JB7A 4F22A 3UORA 1MXZA 4QFKA 3MVWA 2DWHA 2GRVA 2AL5A 1JVYA 1IXCA 5KDTA 3QK6A 5JTYB 3VV5A 3KJ7A 1QW0A 4KYSA 2XXUA 3IJOB 3MVXA 4ELQA 3TMGA 2XXVA 4R2BA 1SVXB 3E4RA 2I58A 3VDFA 2XXQA 2HXWA 1QUJA 5ISUA 1FQAA 5DVJA 1QJMA 1PEBA 3MUQA 4OENA 3QYTA 5CMKA 3K6UA 4R73A 3ZSFA 3DLNA 3IOUA 1AL3A 4QFNA 1IITA 3R6UA 1YPNA 1OVTA 2PT2A 4GLIA 1J1NA 2XHDA 1PBQA 1MXUA 3L6HA 3VVDA 1FQEA 5KCJA 4G68C 1H3DA 1S7YA 1R9LA 5BWJA 5K2XA 2XX9A 3DM0A 4R75A 2H4IA 1MM6A 4M4GA 1YCJA 3W9WA 5DEXA 2D5WA 4LVQA 2ZXTA 1B5JA 2FA7A 4LA9A 1L5TA 2ZYOA 4G77A 2QJEA 2F8DA 2DQVA 5A5XB 3KBRA 5B7DA 1QUIA 3OD7A 3EHUA 1NNTA 3FJMA 5ICTA 4QFOA 1JETA 2KLFA 1JEUA 3PMVA 4F19A 1SW5A 4JWYA 2F7CA 3WAFA 4RPNA 4I8CA 3OO9A 3FIRA 4H8JA 2DVCA 3RNNA 1N7WA 5CMMA 1DSNA 5BUUA 3CG3A 2V25A 3B6TA 2DWAA 1Q1KA 4G8HA 4U1ZA 4JDFA 4ZE8A 4KI0E 3WAEA 1CB6A 1MXXA 3ECRA 2QMXA 3Q26A 2DWJA 4R6KA 3KFMA 5EYFA 4EDPA 4IO6A 2X26A 3FVGA 1H44A 3TUSA 3T22A 3TELA 3EHTA 3FUZA 1N76A 1MY3A 2DVZA 1URGA 1GV8A 4GWOA 4N13A 3LR1A 3CSGA 1A54A 4C1TA 5ITPA 2Y7IA 1B3EA 1B32A 4DXUA 3VXCA 5J1DA 3OMBA 1UIVA 2DS9A 1MXVA 1TFAA 1LFHA 2R9JA 2IA4A 2Z22A 3U8QA 3Q27A 3QSLA 4QRZA 3H6TA 4I62A 1EZOA 2X7PA 3K0VA 3U93A 4U4XA 1S9TA 4OVJA 5IAIA 1XOCA 3RY3A 4P11A 4EQ7A 4Q5TA 1JEVA 3TQWA 3MP6A 1SI0A 1B46A 1ZLQA 5H8HA 1FTMA 2O69A 4LONB 2XXYA 3FVNA 1B7HA 2ONRA 4YKJA 3IK6B 5CMCA 1PC3A 4XKRA 4Q8RA 4GQOA 2HCAA 4FIMA 3C31A 1OIBA 1OMPA 2QS2A 3EHSA 2ABHA 3FV2A 2ZNSA 4DCYA 3TFLA 1FQBA 3MBPA 5TPAA 1SW4A 2RC9A 3F11A 3LSWA 1MXWA 4LUBA 4ND9A 2HZLA 4I9DA 4KCDA 4RK9A 1N84A 5CBSA 5DVFA 4GL0A 1N3XA 5ICQA 2OWTA 4AQ4A 3Q25A 3UGWA 1SYHA 1O64A 2XD3A 3K1MA 3VVFA 3FATA 4R6HA 3FJGA 2OCUA 4LZ8A 3SDFA 3MW0A 1AMFA 2V93A 3CR9A 5CRYA 4DXBA 1A99A 2F36A 3DP4A 3SEXA 5I58B 3OEMA 4NE4A 4GXAA 4H5GA 1FCKA 4M1VA 3N6TA 1MY0A 4F2OA 2OBGA 4OFLA 1QKAA 2Y7WA 2DXYA 4RXLA 4G68A 3VVEA 1LAXA 4YZZA 4GD5A 5I57A 3U92A 4U23A 3SETA 3LBSA 4QF9A 1XS5A 2R71A 1D9VA 5EHMA 3KG2A 2OK2A 2H98A 3IJXB 3T96B 1WODA 1ZBMA 1FTKA 4DDDA 3U72A 3A3UA 1D3KA 1OVBA 1YTVA 4ESWA 1QUKA 3RGYA 4JXIA 4EQBA 4N6PA 3QXMA 2PBWA 3G3KA 2LAOA 4QSDA 3ZKKA 5DT6A 1PB8A 1UQWA 1NFTA 4XXUA 3VLUA 1CE2A 1TXFA 4PFUA 4NF5B 2FYIA 1PB7A 2GFEA 2D21A 1NKXA 4HS7A 3FJ7A 1JQFA 3ONMA 3I3VA 1UIUA 4LATA 1B4HA 4ESXA 4G68B 3TDJA 2F6PA 3KOSA 4GVOA 2Q9TA 4F29A 3FV1A 3CSBA 3BBRA 1N04A 2O84X 3TEPA 1MG1A 5AA3A 3TTKA 1URDA 2ZMBA 1IUDA 3FZVA 1EH3A 5B70A 1XVXA 4RA1A 4WEPA 3SEVA 2QMWA 5KZTA 4GFRA 3N5LA 5FHMA 1S50A 3EQ1A 1TFDA 3K6XA 5HM4B 2REJA 1P1NA 1MPDA 3HN0A 3M3FA 1IQ7A 4QSEA 4KFQA 4ZS9A 3S9EA 1B3HA 2XXHA 1ELJA 3IB2A 3PD8A 4LZ7A 2UVGA 5AA4A 2F6GA 3K1NA 1VFDA 2M8CA 1II5A 3O28A 1R1NA 3K00A 2F7BA 4U4SA 4HCWA 3N94A 4C1UA 3H03A 4YKIA 1JNFA 4PFWA 2DXRA 4PFTA 1BIYA 4G8MA 3FXUA 1LB8A 1VSOA 1R6ZA 2OJTA 3TCFA 2H25A 3G3HA 1BKAA 4NF6A 5I2KB 1PBPA 3O6HA 1ZMGA 3TPAA 4F3SA 1VR5A 3T9UA 1ZTYA 2NVUB 3PPQA 3QIMA 3OENA 3CFLA 2W7YA 3FXRA 4F3PA 5H8FB 2DE4A 1M5EA 1RYXA 3GBBA 3FGSA 2H5YA 3IO4A 2BJJX 2DSFA 3MPKA 2Y7RA 5I59A 1LCFA 4OZ9A 1MPBA 1AH5A 1SW1A 3IORA 2VD2A 4ELPA 1LGBC 3OOAA 4FECA 3VE1B 4YB7A 4OFOA 4ZE9A 4ZEBA 3K6WA 4OESA 3O2AA 4E0XA 4BDOA 3V83A 2QS1A 4ZEIA 4H65A 2IEEA 3T9XB 2VD3A 3K6VA 1XHYA 3S2VA 4YB5A 4NF8A 4Q0CA 3TTMA 2E1SA 3IR1A 1B05A 3RUMA 4OHNA 2DP8A 4F3GA 3JZJA 5KDTB 1HSJA 5ITOA 4F1YA 1GTKA 2DE2A 1FQDA 3ILUB 3IB0A 3OEKA 3OO6A 4KCCA 3MVYA 4X48A 4IO5A 2Z8EA 1DMBA 3MQ9A 3ZS6A 1POY1 4THIA 1VE4A 4O3CA 3KN3A 4PE5B 1Y3NA 3MP1A 1LAGE 1USYE 1UTBA 1XT8A 2I0CA 3SKPA 3W9VA 2PVUA 1Y3QA 1ZJLA 5I56A 4PETA 1KWHA 1MPCA 2D3IA 4YICA 1UTHA 4KHZE 1TWYA 3PPPA 2F78A 3AXFA 4GL8A 4GIZA 3H6WA 5KCJB 4NF8B 1Z7ME 3MZ1A 4OMBA 2XXPA 3HHFA 4ZEDA 4KD5A 3TCHA 4MLQA 3DELB 5DEXB 3QUFA 3SEUA 3M3KA 3CRBA 1LFIA 1IZ1A 3MAMA 4WKMA 1SQYA 5DVIA 1M5BA 4KYDA 1B51A 1MS7A 4XKPA 4EF2A 3JV9A 3OELA 2PT1A 4DCXA 2DYXA 1QVSA 4EQ9A 3FASA 1FTLA 5AA2A 4IY6A 1OQGA 1MRPA 3IO6A 3K2DA 4G2ZA 3C35A 3LSFB 1MQGA 4FJPA 2RCAA 4GF8A 3T66A 4U22A 3O6IA 1P99A 5I2NA 1A7LA 2O7UA 4KYEA 2GH9A 4DZ1A 4K3FA 1N3WA 4OYVA 5ELVA 4F1UA 3RPWA 2AIXA 1H43A 4OTEA 4GRKA 1URSA 1Y4CA 1GR2A 4R6YA 2XX7A 1OLCA 3TAJA 3M3LA 1LAFE 3VLVA 2DWIA 2HFBA 1B5HA 3TODA 2ZYKA 3C34A 3H4ZA 1D4NA 1SDXA 2CMOA 1MQJA 1MXYA 5CM6A 2O7IA 2YPNA 2A5SA 4ZECA 3MP8A 1P1OA 4DLDA 3C36A 4OFJA 5H8QA 1BP5A 1A55A 1USYH 5FTHA 4FORA 4ISUA 4POXA 2AYSA 5H8NA 4X1BA 2V3TA 5H8HB 3V89B 4G4PA 3ILTB 1JW5A 1AOVA 4RJZA 3T9VA 2B3FA 4EXLA 4F31B 3KZGA 1Q35A 3HPIA 2UXAA 4U2RA 4P0IA 3S9LC 5L9SA 2I3WA 5TPAB 4OEUA 4QSCA 4FEDA 5TU0A 1SD3A 1B58A 4IO3A 3E9XA 2H99A 3BFUA 4H8IA 4YB6A 3ODBA 3O29A 1B7ZA 2ALUA 5F1QA 1B7UA 1GGGA 1FTJA 3G3GA 4FATA 4L17A 5LOMA 2NXOA 4XIGQ 3KN7A 3OSQA 2RC7A 2VP1A 4BLAA 2O51A 3THIA 1MH4A 1MQDA 4IB2A 4GXSB 2XX8A 1XC1A 4OQOA 4F3BA 1PB9A 5DTBA 3PUXE 4HW8A 4QFLA 3O97A 3TKDA 3EF7A 3O9PA 3O66A 5L9MA 1SW2A 5I57B 4TQUQ 4MBPA 2QRYA 4NEDA 4H6DA 3IOVA 3IAZA 4NTLA 2I0BA 3IOWA 4P0GA 3PGFA 1Y1MA 3TZAA 4IO7A 1IIWA 2AL4A 2A5TA 5FTIA 1PDAA 1MH3A 4YKPA 3C4MA 1US5A 5JK4A 4JWOA 3O6GA 2V84A 3LC8A 2RKMA 3M8UA 1LBCA 3TYHA 2Y7KA 4XKQA 2FNCA 5JTYA 2VOZA 4XTCQ 1R9QA 4ONYA 3K4UA 2HEUA 2ANJA 2P1SA 4MH5A 2E0SA 2NOOA 1B1XA 2GHBA 4O3BA 5F7VA 2G93A 4ELRA 5HPQA 3U1OA 3W15C 3UP9A 2O6AA 3RQTA 2UYFA 4G8NA 2I49A 4BDMA 1MM7A 1Y9UA 4R9FA 4RK2A 2Q2AA 3LSLA 3PU5A 4UACA 3PPRA 3S4UA 1DPPA 3VFJA 1NMUA 2Y7PA 1TT1A 3CVGA 4H0WA 3QAXA 1N7XA 1IEJA 3H6VA 3RLFE 3TTLA 4IGRA 2ZNTA 2A5TB 3MJNA 2XXWA 1MQHA 1NNFA 3LSXA 3V8XB 3PPOA 3S9MC 3FD3A 2UVIA 4LQ2A 4EUOA 1P1QA 1P1UA 3KN8A 3UA8A 2QS4A 4OEVA 3CI8A 4LZ5A 2RF1A 3G3FA 5AA4B 2REGA 3K02A 3HSTA 1M5FA 2F5XA 4YKKA 4ZZAA 2Q2CA 5A5XA 3SERA 3KJTA 1QKBA 1SI1A 3C32A 3VXBA 2XXTA 3QUJA 1ZKBA 1IXGA 3TCGA 1B0HA 4KR5A 4TLLB 4EXKA 1ANFA 3TTRA 2QL3A 4OERA 1I6AA 1B40A 1WVJA 4NF6B 3FXQA 2Q88A 3MZ9A 3USDA 1N0TA 3L6GA 3I6VA 1Y4TA 1LB9A 1B3LA 1M5DA 2G29A 4U21A 4KQPA 3H06B 2R6GE 4YU0A 5CI5A 3T93B 2UVHA 5L8DA 4UA8A 3B7DA 2XD2A 5I59B 2CZLA 2PMSA 2B65A 3D4CA 5FHNA 1IXHA 2VHAA 1EZ9A 3SEYA 2I4BA 4RPOA 4BDLA 5AA1A 3PV0E 3BKIB 4XKNA 4X9TA 3LUYA 2ONSA 3GXAA 3RT6B 3N6UA 3SEWA 5K2YA 1B3FA 4RYAA 3HO7A 2VGQA 3KGCA 1A8EA 3IOTA 4R72A 4ZDMA 2HAUA 5FHOA 5CC2A 2Z23A 3KSXA 1GVCA 2B3BA 1BLFA 3U94A 4Z7EA 5TP9A 3A09A 1JVXA 1IXIA 2O68A 3UN6A 4O3AA 4HTGA 1ZIUA 4PP0A 2F7AA 3K01A 4H67A 1B1HA 1B3GA 3CFZA 4R74A 4POWA 4HCYA 1H45A 1RYOA 1OQHA 3B6QA 2NWJA 3G3IA 1UTBB 4DE8A 1MQIA 2I6EA 1JW4A 2Y84A 3T9HB 4BDNA 1FTOA 3R7XA 5I56B 1B9JA 1I6QA 3IL1B 3KSJA 3TQLA 1O7TA 4H1XA 4WEDA 1UTHB 4DIGA 3DP6A 3MWBA 1JW1A 1A8FA 4RY1A 4IY5A 1BTJA 3KEIA 4IO4A 4DXCA 4AB5A 3RT8A 1P1WA 4Z0IA 2P2AA 1SYIA 4TOZA 4BDQA 3H3GA 4ZEFA 4MF3A 1MY2A 4PQJA 3PMXA 4QFPA 2OLBA 5JEIA 5TP9B 2HZKA 3GZGA 3EN3A 2ZNUA 3H7MA 5EHSA 4F2QA 2F97A 3R26A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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