5HPQA

Crystal structure of cyclohexadienyl dehydratase from pseudomonas aeruginosa bound to acetate
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
238
structure length
238
Chain Sequence
ESRLDRILESGVLRVATTGDYKPFSYRTEEGGYAGFDVDMAQRLAESLGAKLVVVPTSWPNLMRDFADDRFDIAMSGISINLERQRQAYFSIPYLRDGKTPITLCSEEARFQTLEQIDQPGVTAIVNPGGTNEKFARANLKKARILVHPDNVTIFQQIVDGKADLMMTDAIEARLQSRLHPELCAVHPQQPFDFAEKAYLLPRDEAFKRYVDQWLHIAEQSGLLRQRMEHWLEYRWPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Cyclohexadienyl dehydratase
publication title Crystal structure of cyclohexadienyl dehydratase from Pseudomonas aeruginosa bound to acetate
rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa (strain atcc 15692 / pao1 / 1c / prs 101 / lmg 12228)
molecule tags Lyase
total genus 85
structure length 238
sequence length 238
ec nomenclature ec 4.2.1.51: Prephenate dehydratase.
pdb deposition date 2016-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5hpqA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5hpqA02
2R6GE 3M3KA 2RC8A 3QK6A 1QKAA 3H03A 1TT1A 3EHSA 1B52A 1N3WA 5ELVA 3RGYA 4F22A 5L8DA 3M8UA 1RYOA 1P1QA 3ILTB 4X1BA 5EYFA 1TXFA 2E0SA 3EF7A 3RNNA 1FW0A 4BDMA 3MBPA 1XOCA 4NF6B 4F3BA 2V3TA 4RPNA 2KLFA 1A7LA 5H8FB 4QRZA 2PBWA 2QSXA 3Q25A 5I58A 3MP6A 5BUUA 2Y7KA 1NL5A 4ZEBA 2PX1A 1P99A 1OVTA 3JZJA 3W9WA 3C34A 1B7ZA 1USYE 2HXWA 2NOOA 3TQLA 3RT6B 4NTLA 4O3CA 4ZEFA 3FXUA 2ZMBA 1NNFA 1H45A 4F1UA 4AB6A 1YTVA 2NUVA 1MH4A 1OIBA 4GXSB 2G93A 5ISUA 4GRKA 4KI0E 2AYSA 2P2AA 1Z7ME 4JDFA 2HAVA 4OYVA 4PFWA 4JSOA 4MLVA 4JWOA 1IXGA 3UA8A 3U72A 5M2VA 4KYSA 4NF4A 2UXAA 3TCHA 2V3UA 2WKYA 3VXCA 1QUKA 5I2KA 1FQCA 3N94A 3ILUB 2QMWA 2I4BA 4DDDA 1LB9A 2OLBA 2PYYA 4EUOA 5CI5A 1B05A 3C4MA 3HO7A 1A99A 3HPIA 1LAFE 1FQFA 2FA7A 2DE2A 3SEYA 5I56A 1B0HA 2GHAA 4ZS9A 3D4CA 1LGBC 4R9FA 3VVDA 1Y3QA 3R6UA 3IL1B 3QIMA 1B3FA 4E0WA 2O68A 4NF8B 4NF5A 3C32A 4FAJA 3ZKKA 4R73A 1RKMA 3PMWA 2IA4A 1XT8A 5CMBA 3VDFA 3H06B 1MH3A 1YAEA 3TTNA 1FTOA 3PU5A 3TTLA 2PVUA 3VLWA 3USDA 1JW4A 2QRYA 4F2QA 1D9VA 4Q0CA 2GH9A 3H6WA 3T9XB 1DMBA 1R1NA 4ONYA 1GR2A 4POWA 1ZLQA 4X9TA 3BFTA 2GFEA 3AXFA 2I48A 4WEPA 3K0VA 2Z8FA 3EN3A 3O9PA 2AL5A 4GL8A 3B6QA 2DYXA 3K6XA 4L17A 1I6AA 2DE4A 3VE1B 3FVGA 2NXOA 3VXBA 4AQ4A 1MM6A 2R9JA 1DOTA 3MVXA 1XHYA 1MXVA 1N76A 5CBSA 3UGWA 1PBQA 4FORA 3FJGA 1UQWA 4R6HA 2DE3A 1MDQA 1MY4A 2RF1A 1FQEA 1BLFA 4BDOA 1UIUA 3CFZA 4H5FA 1B6HA 1B2HA 4LONB 2QL3A 1FQDA 5DT6A 1KWHA 3TAJA 1I6BA 1SYHA 3ECRA 2V84A 2V25A 5I2NB 1B51A 3ZS6A 1YCJA 2XHDA 5F1QA 5AA2D 2ONSA 1TWYA 1HSJA 1YPNA 3RTFB 3GZGA 3BKIB 3CR9A 5KCJA 2G29A 3CRBA 4EF1A 1O7TA 1FQAA 1B7UA 5KDTA 3IB0A 4U4XA 1IXHA 1B46A 1Y3NA 4IO5A 3KJTA 2XX8A 1GGGA 2W7YA 4P0IA 2OCUA 1B3GA 1Y20A 3IOWA 3PPQA 4ZZEA 3PV0E 4OWDA 4GFRA 4E0XA 3SKPA 2ABHA 1OVBA 3VV5A 4UA8A 4OEVA 3E13X 3TTRA 4PFUA 5H8HA 2HEUA 4KYDA 2DWAA 2QMXA 1WDNA 5DTBA 3U92A 3CFLA 2ZYOA 2OJTA 3VLVA 1Y4TA 1B4HA 1S50A 2PT2A 4F1YA 4LUBA 3G3IA 3H6UA 5I58B 4LZ7A 1UIVA 2Q89A 5H8QA 4R9GA 4P11A 1A40A 2VOZA 2HQ0A 5BWJA 2Q2CA 4YKKA 1MQDA 3G3FA 3FIRA 4LQ5A 4RXLA 5CMKA 2HFBA 4JB7A 4OQOA 1D3KA 3RQTA 4OMBA 4KHZE 2UVGA 4YU0A 3LSWA 1SQYA 3OEMA 3Q26A 4ELRA 1H76A 3RT8A 3FATA 1OLCA 3TUSA 4WEDA 5CBRA 3UK4A 4JBZA 4YMBA 1MXZA 5JEIA 4ECFA 2V3QA 5L9MA 3H6VA 3PUWE 1LAHE 3PPOA 4NF4B 1MRPA 4RK9A 4GIZA 1FTMA 1ZJLA 3SEVA 1QUJA 5I2KB 4IY5A 3IK6B 3EQ1A 5B70A 3FVNA 2UVHA 3VLUA 1MQHA 1P1UA 4POXA 2XXTA 4MH5A 3DELB 1SDXA 1B1HA 5FTIA 3C31A 5I84A 1ZBMA 2QJEA 3C9HA 2YLNA 3FJ7A 3WAEA 2XXWA 2NWJA 3O66A 4YZZA 3T66A 2F6GA 5I57A 4ISUA 1Y3PA 1JEVA 2F97A 4LA9A 1VSOA 2ONRA 1ZMGA 2H99A 3T93B 3G7WA 3W15C 4ESWA 3E4RA 2AIXA 3S9MC 3UORA 3IX1A 3EHUA 3K1NA 3RLFE 1SW2A 3VVEA 3PUVE 4P0GA 4I8CA 4R2FA 4F29A 1NH8A 3K02A 4OTEA 3VVFA 3T9VA 1VFEA 1EZ9A 3LBSA 3MPKA 2X7PA 2NVUB 3MP1A 3U94A 3PPRA 1Z7NE 3FASA 5CMMA 1QW0A 3K1PA 1B5JA 3C36A 3KEIA 3IB2A 1D9YA 4G2ZA 2A5SA 3SEUA 2F7CA 1H43A 2F6PA 4KFQA 4FEDA 3OELA 4GOTA 2DP8A 1M5DA 4ZDMA 4DCXA 3TELA 2XXUA 3CSBA 2OZZA 4MFIA 1N04A 3PMVA 3PUYE 4G68C 2VD2A 4LZ5A 2Q9TA 1PB7A 4Q5TA 3H6TA 3SEWA 1MXXA 3VFJA 1MY2A 2QPQA 4BLAA 1A8FA 2RC9A 4XKNA 1B0LA 1IQ7A 3I5OA 4PP0A 3TEPA 4EQ9A 1DPEA 2ZNSA 5EHSA 3FJMA 2P1SA 3IJOB 4BDQA 1DTZA 3OO6A 5A5XA 1LCTA 2I4CA 3MUQA 4IO7A 3TMGA 1LAXA 3I6VA 2DXRA 4F3PA 4YKIA 4ESXA 2A5TA 1TFAA 2FYIA 1DTGA 4THIA 1NFTA 2XX9A 3QUFA 3S9LC 5KCJB 3JYRA 1IXIA 5KDTB 4YB5A 3LSFB 4JWXA 2XXXA 1AMFA 1AL3A 3HSTA 1LLSA 4YICA 2AL4A 4ZZAA 4DXUA 4PQJA 4KQPA 4ELPA 4ELOA 4OESA 1P1WA 2RCAA 3RY3A 1UTHA 5AA2A 1DSNA 3T9HB 3OO7A 5H8HB 1OLAA 4GD5A 1BKAA 4LP2B 1IEJA 3KZGA 1NKXA 1ELJA 1H3DA 3H3GA 2THIA 3MW0A 3PUXE 2Z23A 4G4PA 4N13A 4QF9A 1BP5A 1N3XA 1IUDA 3K00A 3CI8A 5JTYA 4QFNA 3OXNA 3UIFA 5H8QB 3WAFA 3TPAA 5AA4B 4JSDA 1B3EA 3OO8A 1Y1MA 1A55A 3RN8A 4DZ1A 3TCGA 5AE4A 2OWSA 3KSXA 3K6VA 4ZEDA 5DVFA 2VGQA 4ZE8A 4YMAA 4ZECA 1SBPA 1MY1A 3A3CA 3G3GA 1PEBA 5ICQA 5DEXA 2ZYMA 1URSA 2QS1A 4I9DA 1MY3A 1BTJA 3IOUA 3H7MA 1R6ZA 2DVCA 1R9QA 2O7UA 2D21A 1LFIA 1F9BA 1LB8A 1J1NA 1US4A 5AA3A 4XTCQ 3FUZA 4KCDA 1VE4A 3BFUA 2RCBA 3CIJA 4G8HA 3JV9A 3HHFA 4F19A 1PC3A 3L6GA 4NMYA 1R9LA 4FE8A 3FXQA 4H1XA 4H65A 1MPDA 3DP6A 5B7DA 2Q8JA 1MQIA 4U1ZA 2XXQA 1SVXB 3ODBA 3GLBA 4XKRA 2B3BA 3PD8A 5I57B 1B9JA 3OENA 4JWYA 3V89B 1QULA 1QJMA 1N7XA 5FHNA 3CG3A 2F36A 3TTKA 3KN7A 1AOVA 2XXPA 1N84A 4ND9A 2VP1A 3IO4A 4OFLA 1N0TA 1LCFA 4DE8A 4F2OA 1JNFA 2B3FA 2QS2A 3N5LA 1QVSA 2I49A 3MJNA 4Q8RA 4YAHX 1M5EA 4RJZA 4R2BA 3UP9A 2DWHA 1VFDA 2OBGA 3OSQA 2V93A 4U21A 1CE2A 2H98A 1MPBA 1IXCA 3IORA 4IO2A 3PGFA 1Q1KA 3G3JA 1B40A 5CMCA 1NMUA 3KSJA 3C33A 3V83A 3IAZA 1USYH 1UTBA 2I3VA 2ZNTA 1N7WA 4ELQA 5HPQA 4G8NA 1B4ZA 4XXUA 4PE5B 4OHNA 3Q29A 4RA1A 3FXRA 4PFYA 3CG1A 4H67A 4ZEKA 4BDLA 3QXMA 3OD7A 3ZKLA 2Y7IA 1PDAA 4LVQA 4G68A 2UYFA 4KR5A 3L6HA 1B32A 1ZTYA 3T22A 5H8SA 2Y7RA 1EU8A 5JK4A 4IY6A 1AH5A 5FTHA 2ANJA 2F8DA 3MZ1A 5H8NA 3K1MA 1M5CA 2O7IA 5CRYA 5A5XB 2OWTA 3DP8A 4TQUQ 1IITA 4EQ7A 5F7VA 4HW8A 4TLLB 3FVOA 3MZ9A 1GVCA 2M8CA 3PPPA 2A5TB 1URDA 3RPWA 2DSFA 2CMOA 4FECA 5TPAA 3KG2A 4OENA 1ZIUA 3MVZA 4EQBA 2RINA 2XD3A 1LSTA 3TDJA 4F39A 3SEXA 4BDNA 1M5BA 1M5FA 1JW1A 5I56B 1NNPA 1EZOA 4RNSA 4N6PA 2HZLA 2DVZA 5TP9A 2Q88A 3RTWB 3B6WA 3FV2A 4NF5B 1MM7A 3OOAA 2O84X 3MVYA 3R7XA 4O3AA 5EHMA 1UTHB 5AA2B 5FHOA 4IO3A 3A09A 2I58A 4M4GA 3RUMA 2BJJX 2DQVA 4XIGQ 2Y7WA 3BBRA 2YPNA 3MPLA 3SETA 1LBCA 2HZKA 4X48A 3FV1A 2B65A 1NNKA 4IO4A 3ZSFA 5JTYB 4R6KA 4QSCA 3TZAA 2XXIA 2REGA 2Z22A 4OZ9A 3MP8A 1OMPA 3KOTA 4KD5A 3O29A 4TOZA 1IZ1A 3O6GA 1B3LA 1MQJA 4R6YA 2F7BA 3O6IA 2I0BA 4EXKA 4U1OA 4IO6A 3PD9A 5L9SA 4XKPA 2O51A 4NEDA 2IEEA 4Z0IA 4WKMA 4GQOA 2YJPA 3KOSA 4R74A 5DEXB 5KZTA 2XXRA 3FGSA 3MC2A 1I69A 1SW4A 4RY1A 3ONMA 2I6EA 5LOMA 1CB6A 5I59A 2I3WA 3DP4A 2H25A 2XD2A 1B3HA 4IGTA 3SESA 1MDP1 1RYXA 4GF8A 2DWJA 2LAOA 1B5IA 1POY1 4GL0A 3F11A 5ITOA 3KJ7A 1B7HA 3KBRA 3QSLA 2H9BA 3EPEA 2HCAA 4QFLA 3DLNA 2REJA 3KGCA 1JVYA 4FEBA 4MLQA 1JVXA 1TFDA 3IB1A 5IKBA 4DXCA 2RC7A 2H5YA 1MXWA 3O2AA 1Y9UA 1FTJA 3H4ZA 4WXJA 4N07A 2XX7A 3TYHA 3OMBA 3SERA 1MPCA 1ANFA 2CZLA 1P1NA 1POTA 4PFTA 3HCQA 1NNTA 1OQGA 1II5A 1IIWA 1MQGA 3LUYA 3O28A 3MWBA 4GWOA 4I1DA 4H5GA 2Y84A 3K6WA 3QAXA 4R72A 3CVGA 2FNCA 1MY0A 4OVJA 4RK2A 1LFGA 2O6AA 4HCWA 3EHTA 4EXLA 1FTLA 3MVWA 4GXAA 3M3FA 2F78A 4DIGA 4F3GA 3TTMA 1UTBB 2Y7PA 4O3BA 3E3KA 4QSEA 4U22A 5TU0A 4NWCA 1ZKBA 1S9TA 1WODA 2O1LA 5HM4B 1MS7A 3N6TA 4OEUA 3GBAA 3N6UA 3O97A 1JETA 4F18A 1ZU0A 1B5HA 4G68B 3B7DA 3IJXB 4QFKA 5J1DA 1PBPA 5L9OA 4UACA 4OXVA 3S2VA 3Q27A 2ZXTA 4R75A 2XXHA 3LSLA 3SDFA 4HTGA 1LFHA 1L5TA 1AIVA 3K6UA 4LQ2A 5H8NB 3A3UA 4NF6A 4X1DA 1FQBA 3TCFA 5H8FA 2UVIA 4QHQA 2X7QA 4H6DA 3R26A 4HCYA 2DWIA 1SW5A 1O63A 1LAGE 3KN8A 3I3VA 1EZPA 3UN6A 2XXYA 3OSRA 4PETA 3IO6A 2P0SA 1MXUA 1SYIA 1PB8A 5TPAB 2ZYKA 4YKPA 3OO9A 4F3SA 4K3FA 1DPPA 4AB5A 2DOJA 4U2RA 1B1XA 1JEUA 2F7AA 2E1SA 5CC2A 2X26A 2OK2A 3K01A 4NWDA 1FCKA 3LSXA 3Q28A 1S7YA 4C0RA 1P1OA 3MAMA 5TP9B 4EDPA 3LC8A 1XC1A 4ZEIA 1GV8A 1QUIA 4F31B 3FZVA 4QFOA 1WVJA 2I0CA 3FD3A 5IAIA 2VD3A 3K2DA 4OERA 3W9VA 2O69A 3T9UA 4G77A 5ICTA 3QYTA 4FIMA 2ZNUA 3U93A 2ONKE 3OEKA 4HS7A 4Z7EA 5DVIA 3B6TA 3TODA 1I6QA 4MF3A 2F5XA 1URGA 3PMXA 4XKQA 1XVXA 2XXVA 5CM6A 2HAUA 4C1TA 1OQHA 4H8JA 3FVKA 4NF8A 2D3IA 1XS5A 1D4NA 2R71A 4GVOA 4QFPA 4OFJA 4BDRA 1BIYA 1XVYA 1Y4CA 4FATA 4F1VA 1SD3A 3N26A 3T96B 1HSEA 4OFOA 1H44A 3CFXA 4GLIA 1T0KA 1QKBA 4OETA 3DM0A 4KCCA 2RKMA 3GXAA 1GTKA 3E9XA 3TKDA 4H0WA 3P7IA 5AA4A 5I59B 3O6HA 4KYEA 3MZBA 3S9EA 2ZYNA 4G8MA 4DLDA 4IGRA 3PPNA 1SW1A 4DCYA 4U23A 3U1OA 4RPOA 4ZE9A 4LATA 5AA1A 1A8EA 3TFLA 3D4GA 1ATGA 4EF2A 5DYHA 3IR1A 3IOVA 3PUZE 3KFMA 1JQFA 5HBCA 1JW5A 3HHGA 4M1VA 4NE4A 2DXYA 3K4UA 3V8XB 4U4SA 4I62A 3QUJA 4Q30B 1B58A 5K2YA 3C35A 1NH7A 3M3LA 4TLMB 1Q35A 4KPTA 5K2XA 4C1UA 1LBBA 2PMSA 2Q2AA 2QS4A 4YB7A 4YKJA 5ITPA 1FTKA 3S9NC 2D5WA 4H8IA 3IOTA 2UVJA 3MQ9A 3TQWA 2DS9A 5I2NA 2GHBA 1O64A 3S4UA 1HSLA 1SI1A 4IB2A 2GRVA 1SI0A 4MBPA 4DXBA 1A54A 4QSDA 1VR5A 2F34A 3LR1A 3THIA 4FJPA 3G3KA 1EH3A 3HV1A 3CSGA 1Y1ZA 1MG1A 1US5A 2ALUA 2QS3A 2H4IA 2Z8DA 5FHMA 4RYAA 3HN0A 3U8QA 3KN3A 2PT1A 2VHAA 1PB9A 2ESNA 2O1MA 2UYEA 2F35A 2Z8EA 4LZ8A 3V5AA 1MXYA 3G3HA 4JXIA 4YB6A 3GBBA 5DVJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GWYA 2R6GE 3M3KA 2RC8A 3QK6A 1QKAA 3FBPA 3H03A 2Q8MA 1YXIA 1TT1A 3EHSA 1FPLA 4MNIA 1B52A 1N3WA 5ELVA 3RGYA 4F22A 5L8DA 3M8UA 4DI4B 1RYOA 4MNPA 1P1QA 3ILTB 4X1BA 2VPOA 5EYFA 1TXFA 2E0SA 3EF7A 3RNNA 1FW0A 4G61A 4BDMA 3MBPA 1XOCA 4NF6B 4F3BA 2V3TA 4RPNA 2KLFA 1A7LA 5H8FB 4QRZA 2PBWA 4HE2A 2QSXA 3Q25A 5I58A 3MP6A 5BUUA 2Y7KA 1NL5A 4ZEBA 2PX1A 1P99A 1OVTA 3JZJA 3W9WA 3C34A 1B7ZA 1USYE 2HXWA 4OVQA 2NOOA 3TQLA 3RT6B 1Q9DA 4NTLA 4P1EA 4O3CA 4ZEFA 3FXUA 2ZMBA 1NNFA 1D9QA 1H45A 4F1UA 4AB6A 1YTVA 2NUVA 1MH4A 1OIBA 1IMCA 4GXSB 2G93A 5ISUA 1FPEA 4GRKA 1IMBA 4KI0E 2AYSA 2P2AA 1Z7ME 4JDFA 2HAVA 4OYVA 4PFWA 4PF8A 4JSOA 4MLVA 4JWOA 1IXGA 4GWXA 2DDKA 3UA8A 2V4CA 3U72A 5M2VA 4KYSA 4NF4A 2UXAA 3TCHA 2V3UA 2WKYA 4NN3A 3VXCA 1QUKA 5I2KA 1FQCA 3N94A 3ILUB 2QMWA 2I4BA 4PBHA 4DDDA 1LB9A 2OLBA 2PYYA 4EUOA 5CI5A 1B05A 3C4MA 3HO7A 1A99A 3HPIA 1LAFE 1FQFA 2FA7A 2DE2A 4N15A 3SEYA 5I56A 4N4UA 1B0HA 2GHAA 4ZS9A 3D4CA 1LGBC 4R9FA 3VVDA 1Y3QA 3R6UA 3IL1B 3QIMA 1B3FA 4E0WA 2O68A 1VDWA 4NF8B 4NF0A 4NF5A 3C32A 4FAJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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