5HPQA

Crystal structure of cyclohexadienyl dehydratase from pseudomonas aeruginosa bound to acetate
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
238
structure length
238
Chain Sequence
ESRLDRILESGVLRVATTGDYKPFSYRTEEGGYAGFDVDMAQRLAESLGAKLVVVPTSWPNLMRDFADDRFDIAMSGISINLERQRQAYFSIPYLRDGKTPITLCSEEARFQTLEQIDQPGVTAIVNPGGTNEKFARANLKKARILVHPDNVTIFQQIVDGKADLMMTDAIEARLQSRLHPELCAVHPQQPFDFAEKAYLLPRDEAFKRYVDQWLHIAEQSGLLRQRMEHWLEYRWPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of cyclohexadienyl dehydratase from Pseudomonas aeruginosa bound to acetate
rcsb
molecule keywords Cyclohexadienyl dehydratase
molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa (strain atcc 15692 / pao1 / 1c / prs 101 / lmg 12228)
total genus 85
structure length 238
sequence length 238
ec nomenclature ec 4.2.1.51: Prephenate dehydratase.
pdb deposition date 2016-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5hpqA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5hpqA02
4JDFA 3ZSFA 1NNPA 4FE8A 4BDMA 1SW1A 3E4RA 2DE2A 2RC8A 4YKPA 5CMMA 1XOCA 1ZU0A 2V3TA 4ELQA 1USYH 4O3BA 2W7YA 2XXXA 4EQBA 2AL4A 3F11A 1JETA 1MXYA 4LVQA 3C33A 4YU0A 2Z23A 4HW8A 4OHNA 4ZEKA 3T9VA 2F97A 3OO7A 1D9YA 2Q8JA 1Y9UA 2P2AA 3KOTA 4EXLA 3MVWA 2XXRA 3UN6A 3HN0A 4IO4A 2HAUA 3KZGA 1NNKA 1MDP1 3IOVA 4RYAA 1ANFA 1UTBA 5DVJA 1N0TA 4F3PA 3THIA 3B6WA 4H8IA 4R2FA 1FTLA 1QUJA 2V25A 3QXMA 2QS3A 3VXCA 3O2AA 1VE4A 4H5GA 1H43A 1SBPA 3RY3A 4OFLA 4DXCA 3HO7A 3Q29A 3UORA 1VFDA 4ESXA 1P99A 4QFOA 4BLAA 4G8MA 4U2RA 2OJTA 2ZXTA 1NH7A 4RY1A 3CR9A 3FXQA 2LAOA 1LAFE 4H6DA 5CC2A 5KZTA 3G3FA 1O64A 1US4A 1VFEA 2QPQA 3HHGA 4ZE8A 3IL1B 3W9VA 1FTOA 3FV1A 4O3AA 4G8HA 4RK9A 4ELPA 5H8FB 5CMKA 5K2YA 1A40A 4R73A 4EQ7A 3K0VA 1A99A 2ESNA 1BP5A 1JNFA 4BDOA 4I9DA 4RPNA 2A5TB 4EXKA 3BFTA 2XXVA 1SW5A 1FQBA 5CM6A 4R9FA 4F3SA 1YPNA 3SKPA 3FV2A 2NXOA 2OLBA 5A5XB 3A3UA 4YZZA 4OYVA 3K1MA 1XHYA 4FATA 3EF7A 5KDTB 3KJTA 2HZLA 3K1NA 3IR1A 2B3FA 2O84X 2QS4A 4EDPA 1TWYA 3OENA 4NTLA 1HSLA 3PUVE 4IO3A 1FQAA 2RCBA 5L9MA 1IXGA 1URSA 3B6TA 3FATA 4XKNA 1O7TA 2PYYA 4RXLA 3M3LA 4U22A 3IOUA 1GGGA 1LBCA 1B3LA 4QFNA 3OSRA 3GLBA 4JSDA 1VR5A 1MPCA 1NNFA 1B4ZA 1BLFA 1I69A 1SQYA 5FTHA 3RGYA 4AB6A 1CB6A 4MLQA 3PPQA 2I3WA 1H44A 1XVXA 4FIMA 5JTYB 4PFYA 2PT2A 3DP4A 1JEVA 2ZYKA 1N7XA 1B5JA 3U92A 4YB5A 2RINA 4IO5A 1DTGA 3C36A 4NF6B 2DE3A 1D9VA 5I2NA 2YJPA 4F3GA 3CSGA 3VLWA 5ITPA 3IORA 1Z7NE 3FGSA 1M5EA 2XXUA 2Y84A 1HSJA 3VLVA 3OD7A 3A3CA 4GWOA 4H8JA 4F1UA 3IO6A 3HHFA 1WODA 2RKMA 4YAHX 4I1DA 4LQ2A 3U94A 2OWTA 1URDA 2I49A 1SW4A 4NF4A 4HTGA 3MUQA 4JWOA 3O6GA 4F3BA 5F7VA 3LUYA 1MPDA 5FHMA 2I0BA 2O7UA 2XXYA 4JBZA 2I6EA 4QSCA 4KPTA 4DXBA 4XXUA 3RPWA 3Q27A 4IY6A 1LSTA 3HSTA 3ILUB 4OESA 3PUWE 2O51A 4FORA 4ZECA 3U8QA 2OCUA 2X7PA 2RCAA 3VLUA 2XX7A 4XKRA 3K2DA 1ZBMA 1IUDA 3OMBA 1PB8A 5KCJB 3JYRA 2DXRA 3TTMA 1P1UA 4NWDA 4R74A 1FTKA 5I57B 5JK4A 2DS9A 2ZNSA 2HEUA 1Q35A 4U4XA 3MZBA 5ELVA 4BDRA 1TFDA 5FHOA 4F19A 3MBPA 4U23A 3C9HA 1LCTA 3TTKA 3CG3A 1RYOA 4G68B 4POWA 2RC9A 4RK2A 4G68C 3MW0A 3CFLA 1T0KA 2BJJX 1NNTA 1SD3A 4M4GA 4TQUQ 3W9WA 2DXYA 4THIA 5H8NB 2I4CA 5I56A 3O9PA 1B46A 4KYSA 3MJNA 4YKIA 3CIJA 4RJZA 4JWYA 3TCFA 3PGFA 4LQ5A 4ESWA 2WKYA 5CRYA 1B58A 3TAJA 3K6VA 4UACA 3R7XA 4MFIA 1A8EA 4AB5A 1O63A 3A09A 4AQ4A 2IEEA 4GQOA 2QMWA 4FECA 1PC3A 1B4HA 1JW1A 1N3WA 1BTJA 2ZMBA 2UYFA 4F18A 3O29A 3MP6A 3T9XB 1EZPA 4KR5A 3C31A 3S9LC 3Q25A 1B7ZA 2ZYMA 3GBAA 4DZ1A 1MY4A 4ELOA 5H8QB 4NF5A 1SYHA 2VP1A 4NF8A 1UIVA 2I3VA 1IXIA 1DTZA 3T9UA 3V89B 1OVTA 2UVIA 2UVGA 3PPPA 2VHAA 1AIVA 1ZTYA 2I58A 1PBPA 1S7YA 1B6HA 5BUUA 3H6VA 2Q9TA 2Y7KA 5H8HB 1UTHA 2V3QA 4R6KA 1EZ9A 3OSQA 5AA2A 3MP1A 4OWDA 2DWHA 3SEXA 2DWIA 1NFTA 4IO7A 4H5FA 1ZMGA 1IXCA 5AA4A 1LLSA 3G3HA 3RTFB 1IQ7A 2XD2A 1IXHA 4DE8A 1QVSA 4IY5A 2OK2A 3PD8A 2P1SA 3LR1A 4R72A 5DEXB 1B3GA 3QAXA 4KHZE 4YB7A 1Y3PA 4E0XA 1MY3A 2X26A 1USYE 5HBCA 4ZEIA 3FVGA 1S50A 3SEUA 3IK6B 4ZDMA 3DELB 1H3DA 1OQHA 1DPPA 4QFLA 4Z7EA 3FJMA 3MPKA 1M5FA 1IITA 3WAEA 4C1UA 4Q30B 5IAIA 3TZAA 3I5OA 4C0RA 3VVDA 3SEVA 1H76A 4FAJA 3PMWA 5EHMA 5CBRA 1MXUA 1MXXA 3TTRA 1TFAA 4OTEA 1M5CA 1II5A 2Z22A 2FNCA 2DQVA 3T66A 4OFOA 1B32A 3GZGA 3EHUA 1EZOA 3TFLA 4YKJA 3M3FA 4R9GA 5BWJA 2PT1A 3MVZA 4X9TA 2KLFA 2RC7A 1PB9A 4RNSA 3VVFA 1LAGE 2HQ0A 1ZLQA 2ONSA 3G7WA 4ZEDA 3T22A 2DVZA 1GVCA 4QFKA 1MDQA 2H4IA 4ZZAA 2D21A 5M2VA 1PB7A 3PPNA 5B7DA 4GF8A 1B0LA 4NEDA 1DPEA 4RPOA 3PUYE 5I59A 4P11A 1FW0A 4LZ8A 1I6AA 4QHQA 4EUOA 1FTJA 2V93A 3ODBA 2AL5A 5I2KB 1FCKA 5I58A 5AA2D 2R6GE 5L8DA 1N7WA 2F8DA 2O68A 1MXVA 1IEJA 2F6GA 2V3UA 2B65A 1JW4A 1J1NA 2HFBA 1JW5A 3TYHA 3T93B 1Y4CA 3MP8A 1KWHA 1MQDA 1N04A 2H9BA 2I4BA 3KJ7A 4BDNA 5IKBA 4F39A 4U4SA 4ISUA 5TPAA 3IB2A 3K4UA 2XXQA 2P0SA 1NMUA 2PVUA 4K3FA 3D4GA 3MC2A 3RTWB 2XHDA 3K6XA 3OOAA 1AH5A 4LUBA 5F1QA 3EQ1A 3GXAA 4G8NA 3LSXA 4L17A 1PEBA 2FYIA 3ECRA 2Y7RA 3CSBA 3VVEA 3U93A 2HCAA 2VOZA 3CG1A 2REJA 1SYIA 3PPOA 1B40A 4WEPA 2QS1A 2VGQA 4YKKA 3EHTA 2ALUA 1OQGA 1EH3A 3UP9A 4H0WA 4F1VA 2D3IA 3I3VA 5CMCA 4KCDA 3MVXA 1MRPA 3FJGA 1S9TA 2YPNA 4G77A 3V8XB 2GFEA 2B3BA 5FHNA 3C35A 1LAXA 4GFRA 5DVFA 2QL3A 3H6WA 4OMBA 3V83A 3FXRA 4PE5B 1PBQA 2GHAA 5CBSA 4P0IA 1LB9A 3ILTB 3UA8A 3G3GA 1A55A 3L6HA 3N6TA 3TPAA 3LC8A 3VV5A 5AE4A 3CRBA 1XVYA 2XXIA 2ONKE 4GL0A 2H98A 2F6PA 2PMSA 1POY1 4O3CA 1BIYA 1UTBB 2E1SA 2Q89A 1GV8A 4ONYA 4R2BA 4QFPA 1OIBA 2Y7IA 3SEWA 1SDXA 2QMXA 3RNNA 4MBPA 3LSFB 3R26A 4KQPA 1BKAA 1P1QA 4HCYA 3KN7A 1AMFA 1IIWA 1US5A 5J1DA 1N76A 1MY2A 4PP0A 1ATGA 1B3HA 1DSNA 3K6WA 1XC1A 3MZ1A 2Z8EA 2UYEA 1Y3NA 3UK4A 1IZ1A 1DOTA 1LFHA 2H5YA 3MQ9A 3M3KA 1D4NA 4YICA 4OERA 4N13A 2Q88A 5DYHA 3N26A 1B5HA 3O6HA 3HPIA 4OXVA 4XKPA 3IAZA 4R6HA 2O6AA 4Z0IA 4I8CA 3TODA 5H8FA 3KSXA 2G93A 5EYFA 4XTCQ 4MF3A 1QKAA 1P1OA 1P1WA 5L9OA 3BFUA 2A5TA 1I6BA 3RN8A 2F7AA 3FXUA 3N94A 4ECFA 3UIFA 5CI5A 4I62A 1Y3QA 2V84A 3TDJA 1NKXA 2QJEA 2D5WA 1R1NA 1B7UA 3H6UA 2XXWA 3H06B 3MZ9A 5A5XA 3PUXE 1B3EA 1LBBA 4GL8A 3IX1A 4XKQA 5KDTA 2NOOA 3LSLA 1MY1A 1B1XA 2FA7A 3FVKA 2ANJA 2PX1A 3KSJA 3KEIA 3H7MA 1SVXB 4DXUA 1TT1A 4QSDA 1H45A 2XX8A 5K2XA 2UVHA 2QRYA 1B7HA 1ELJA 2QS2A 3G3IA 3IB0A 3PU5A 2DYXA 3SDFA 3PD9A 4WKMA 1D3KA 2RF1A 3P7IA 5B70A 3TQLA 4FEBA 3EHSA 1F9BA 3PV0E 1LAHE 4JSOA 5TP9A 3DP6A 3FZVA 4C1TA 4GXSB 3IJOB 4PFWA 5JTYA 3OO6A 1QUIA 2O69A 2QSXA 1R9LA 1MG1A 1B1HA 2X7QA 3D4CA 1LFIA 4NF6A 4YMBA 1I6QA 1YTVA 4ZEFA 5I2NB 3DM0A 4N07A 2CMOA 3ZKKA 3AXFA 3RUMA 4ZE9A 3E13X 4ZZEA 3RLFE 1FQEA 1QKBA 3RT6B 3OO9A 3O6IA 2Y7PA 1B51A 4GVOA 4LZ5A 2R71A 2AIXA 3OEMA 2E0SA 3FVOA 3O28A 2UXAA 3FD3A 1UQWA 3ZKLA 4G2ZA 2F35A 3KG2A 3QSLA 3KN8A 3QUFA 4BDLA 4OEUA 3FVNA 3LSWA 5ICTA 4Q8RA 4EQ9A 4MLVA 4NF4B 4OEVA 3TKDA 4H67A 3IB1A 2DOJA 4IGTA 3USDA 3MVYA 3DP8A 5DTBA 3L6GA 3RQTA 3K02A 3Q26A 1B52A 4QF9A 2A5SA 1YCJA 2O7IA 4G4PA 1B05A 1MPBA 5EHSA 3CFZA 4TLMB 1ZJLA 4LP2B 3VFJA 3I6VA 1B9JA 3TCGA 4HCWA 4X1DA 4KD5A 4OETA 3ZS6A 2HAVA 3MPLA 1GTKA 2THIA 2ZNUA 4QSEA 5KCJA 3OO8A 4FJPA 3M8UA 1OVBA 3DLNA 1JQFA 1QJMA 4Q0CA 4N6PA 4IB2A 5I57A 4JXIA 4XIGQ 3K01A 3S4UA 1L5TA 1UIUA 4IO2A 2Z8DA 4GD5A 3TMGA 4PFTA 3TQWA 2F7CA 1NL5A 4OQOA 2AYSA 3GBBA 3E9XA 3SEYA 4DIGA 1Y4TA 3FJ7A 4TOZA 5LOMA 1PDAA 4G68A 1MXZA 5CMBA 2ZNTA 3S2VA 3JZJA 4P0GA 2R9JA 3LBSA 3KGCA 1B5IA 4M1VA 4BDQA 3TTLA 2XXHA 5DVIA 4NWCA 4LA9A 5I56B 5H8NA 1CE2A 1FQCA 1MM6A 1JVYA 3QYTA 3KBRA 1JVXA 4GOTA 3S9MC 2I0CA 3SETA 3EN3A 2NWJA 1LCFA 3K00A 3KOSA 1LFGA 2F5XA 1LGBC 2O1MA 5AA1A 3G3KA 2DWAA 3VXBA 3OXNA 4PETA 3FUZA 3G3JA 4U1OA 2F36A 1Y1ZA 4R75A 3JV9A 3IJXB 2ZYOA 4MH5A 2Q2AA 3TELA 3CVGA 1VSOA 2GRVA 2XXTA 2HZKA 1POTA 5HPQA 2YLNA 3QIMA 1B3FA 1QW0A 2DE4A 3SESA 3N6UA 1WVJA 4GRKA 1XT8A 3S9NC 3EPEA 3ONMA 3C34A 1EU8A 1HSEA 3PUZE 3H03A 1N84A 2Z8FA 1MQGA 4DDDA 5H8QA 3O66A 4NF5B 1MQIA 4NF8B 2IA4A 4QRZA 1RKMA 1MS7A 4F2QA 1A54A 3K1PA 5TP9B 2NUVA 4EF2A 5TU0A 1R6ZA 2F34A 3O97A 4ZEBA 2ZYNA 1JEUA 5ISUA 3V5AA 2HXWA 3T96B 2OZZA 3MAMA 4X48A 1A8FA 2XD3A 4U21A 1UTHB 2XXPA 3CI8A 4F2OA 5H8HA 4F31B 5AA2B 2UVJA 3H6TA 2NVUB 4JB7A 1Y20A 4DLDA 1AL3A 1M5BA 3B6QA 5AA4B 5HM4B 4POXA 2DWJA 4UA8A 4DCYA 5AA3A 4JWXA 4F22A 5JEIA 4H65A 1FQFA 2ABHA 2M8CA 1ZKBA 4GIZA 1P1NA 5DEXA 1LB8A 5L9SA 1MXWA 4FEDA 2ONRA 3N5LA 3IO4A 4KFQA 3CFXA 5ITOA 4GLIA 4EF1A 5FTIA 1SI1A 3TEPA 5ICQA 1OLCA 3U72A 1FQDA 3T9HB 4OVJA 1MH4A 3Q28A 1Y1MA 4NMYA 1M5DA 3KFMA 1Z7ME 1URGA 3SERA 3KN3A 3S9EA 4PFUA 3H3GA 2H25A 3PMVA 4HS7A 5I84A 3R6UA 3E3KA 2VD3A 4E0WA 4KYDA 2H99A 1B2HA 2VD2A 4X1BA 4LZ7A 3BKIB 2Q2CA 1Q1KA 3FASA 1MQJA 2I48A 1NH8A 3TUSA 1MQHA 3HCQA 3TCHA 3OELA 3HV1A 4KCCA 2REGA 2OWSA 3C32A 2F78A 3WAFA 4WXJA 2DVCA 5H8SA 1TXFA 1AOVA 3VDFA 3B7DA 4KI0E 4TLLB 2G29A 3QUJA 4H1XA 1FTMA 4NE4A 2CZLA 2XX9A 1MM7A 3FIRA 3UGWA 2O1LA 3RT8A 5I59B 1QUKA 4R6YA 4PQJA 2OBGA 4ZS9A 1B0HA 3W15C 5I2KA 1XS5A 5I58B 3OEKA 2DP8A 1ZIUA 3K6UA 4RA1A 2GHBA 1SW2A 3IOTA 2F7BA 2GH9A 3VE1B 1YAEA 3BBRA 3MWBA 1OLAA 4Q5TA 4DCXA 4F1YA 4F29A 1DMBA 4OFJA 3PPRA 4IO6A 4OZ9A 1RYXA 3PMXA 2DSFA 3C4MA 1SI0A 3TTNA 5TPAB 4ND9A 1MY0A 1OMPA 1GR2A 5DT6A 1R9QA 3QK6A 4YB6A 1WDNA 1N3XA 2Y7WA 4KYEA 4GXAA 2PBWA 1QULA 4IGRA 4ELRA 1A7LA 4YMAA 3IOWA 4WEDA 4OENA 4LATA 3H4ZA 4U1ZA 4LONB 1MH3A 3U1OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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