3IOWA

Huntingtin amino-terminal region with 17 gln residues - crystal c99-hg
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
419
structure length
414
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAMATLEKLMKAFESLKSFQQQQQQQQQQQQPPPPPPPPPPPQLPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Secondary structure of Huntingtin amino-terminal region.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli (strain k12)
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Huntingtin
total genus 121
structure length 414
sequence length 419
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iowA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iowA02
2NXOA 2VHAA 5DVJA 4JWXA 1D9YA 3HSTA 3MP8A 4YZZA 1IZ1A 3BBRA 3ZSFA 1H43A 4EXKA 1LB9A 2O7IA 3OSQA 4QFLA 4EXLA 3F11A 5KZTA 1LLSA 2I0CA 2OZZA 3D4CA 2HQ0A 3MVWA 4F39A 3FIRA 5CM6A 4R2BA 5ICQA 1SD3A 1FQEA 4O3AA 4XIGQ 3QAXA 3PUXE 1B0LA 2I4CA 1ZBMA 3Q26A 4FEBA 4WKMA 3Q25A 2Z22A 4X1DA 4BDMA 2Q2AA 3CIJA 3MPLA 4N07A 3K1PA 4NWCA 1BP5A 1R6ZA 4ZEBA 4Q30B 3TZAA 4BDOA 3CFXA 2RC9A 3PUYE 3FV1A 1SW2A 5HBCA 1A8EA 1B3FA 4QHQA 2Q8JA 3PD8A 4ZZEA 4PFWA 4QF9A 2PVUA 2B3FA 2HZKA 1YCJA 2OBGA 3LC8A 3O9PA 3QXMA 1LAGE 4GQOA 3HHGA 4JDFA 4RPNA 5FHOA 5H8QA 3O2AA 4ZEIA 5L9MA 3ZKLA 4F31B 2F8DA 1D4NA 3CG1A 1B3EA 2G93A 3KG2A 1MXZA 1US5A 3H6VA 4H8JA 4C0RA 3OO9A 4F18A 3TPAA 4GL8A 4JSOA 2WKYA 1SW1A 2ZYKA 5CMKA 3B6QA 1N0TA 3CVGA 3FVKA 5DVFA 3DP4A 3SEYA 2Q89A 2YLNA 1FQAA 2V93A 2NVUB 3UP9A 3LSXA 3S9LC 4YKJA 1B1HA 3TODA 3MWBA 1JW4A 3FVOA 3SKPA 3TTLA 3MVYA 1PB9A 1S7YA 3LR1A 5I2NB 5BWJA 1B3HA 2XD2A 3TTRA 2H9BA 5FTIA 5AA4B 1EU8A 4F3SA 3A3UA 3IOUA 4NTLA 4RNSA 4IO3A 3CR9A 4G4PA 2GRVA 4LQ5A 1MRPA 4R6KA 3SEXA 5CMBA 1H76A 1MQIA 3IB2A 1H3DA 3OENA 3N6TA 5ICTA 5L8DA 4GRKA 2KLFA 4LZ5A 4OMBA 2REGA 3IL1B 4R74A 4YB5A 5A5XB 4JBZA 1IXHA 2AYSA 1MXUA 2Z8EA 3QK6A 3K0VA 5BUUA 1O63A 3C32A 5CC2A 4NE4A 1WVJA 1H44A 1R1NA 3KN7A 2XXHA 1FQBA 4YMAA 4H65A 4KI0E 1SW5A 4X48A 1B7ZA 4UACA 4FECA 1DSNA 4YKIA 4NF6B 2QS4A 4ZECA 3O6IA 1B6HA 3Q28A 3TELA 1DPEA 3K02A 1JVXA 1DTGA 1MQDA 1MQGA 1PB7A 3O66A 1IITA 3KGCA 4ND9A 4ELPA 4GWOA 1LSTA 5JEIA 2PBWA 1XOCA 1ZLQA 4ZE8A 2LAOA 1I6BA 1IEJA 2D5WA 4YU0A 1B5HA 5I57B 2FA7A 3MBPA 3QSLA 3PPRA 2Y7RA 1YAEA 2QMWA 3U93A 3PPPA 3SEWA 1JEVA 3ZS6A 3OOAA 3KZGA 3RGYA 5DT6A 1A55A 5K2XA 2XXXA 3H6TA 5DYHA 1N3WA 1MY1A 3BFUA 5AA2A 1B3LA 1Y3QA 4GXAA 4LZ7A 1NL5A 2XXPA 4KYEA 1GR2A 3SDFA 3CFLA 4N6PA 3G3KA 1FW0A 1SW4A 1UTHB 3BFTA 1N3XA 2F7BA 4Q8RA 3RY3A 2R9JA 4YB7A 1GTKA 3T66A 1VFEA 1A54A 5FHNA 4R9GA 3K6UA 4AB5A 2UVJA 3UN6A 2H99A 2Y7KA 4QFPA 3MC2A 1MS7A 3KJTA 4U4SA 3TCGA 5AA2B 2DXRA 1CE2A 3FXUA 2RCAA 1WODA 2UXAA 3HO7A 2D21A 3MVZA 3MZ1A 1LBCA 4MBPA 4U1OA 3U94A 4U4XA 3B6TA 2ZNSA 4I9DA 4YB6A 3SERA 5I58A 4HCWA 1MM7A 4HS7A 1ZKBA 4I8CA 4YKKA 2OLBA 1XS5A 1QJMA 1AIVA 3VLVA 2A5TB 3Q29A 4FIMA 2ZYMA 4X9TA 5AA1A 2DS9A 3UIFA 4G77A 1LFGA 3MPKA 4F1UA 2I58A 1ZJLA 3H4ZA 4ESWA 1Z7NE 2P1SA 2PT1A 4ELOA 3MZ9A 2DSFA 4M4GA 2I49A 2XD3A 3LSFB 1VR5A 4PFUA 4DCYA 1LB8A 3VXCA 1FTLA 1J1NA 4ZDMA 4F2OA 1OVBA 4PETA 5DEXB 2DP8A 2QPQA 3MZBA 1A40A 1PC3A 1Y4CA 1JW1A 2ZYOA 4OQOA 2E0SA 3T93B 2VP1A 1SI0A 2IEEA 3UK4A 2I48A 3TCFA 3G7WA 3R26A 4KD5A 4R2FA 2AIXA 5H8FA 1YPNA 1RYOA 4KFQA 3TMGA 1T0KA 4TOZA 2P2AA 2HZLA 4XXUA 3T9UA 4GXSB 4NWDA 3T9VA 5I58B 3DELB 2H98A 5FTHA 4PQJA 1DTZA 1OMPA 1ZU0A 1BLFA 3C34A 3FV2A 1O64A 4I1DA 3PGFA 4OFOA 3B7DA 1QKBA 4QFKA 2ZYNA 3MQ9A 4ZEKA 3OMBA 4JSDA 3TFLA 2VOZA 2F97A 3VV5A 3ONMA 3RN8A 1B46A 4RK9A 2NOOA 4ESXA 4OZ9A 3PMXA 3SEUA 4KCCA 2OWTA 2PT2A 3RTFB 4U23A 4OYVA 2HAVA 3K6WA 4ISUA 5HPQA 1KWHA 4F3PA 1DMBA 4R73A 1JEUA 1MY3A 2I0BA 4GOTA 4OWDA 2X26A 4PFYA 1Y20A 1B32A 4FAJA 3EHUA 3U1OA 2F35A 4YMBA 4POWA 3IAZA 3ECRA 3R7XA 3VE1B 2UYFA 2F6PA 1BTJA 1VE4A 3FASA 2DWAA 4LQ2A 2GFEA 1MY2A 4WXJA 3CFZA 2XXIA 2G29A 1B0HA 1MG1A 3VXBA 3PD9A 5DTBA 3HPIA 2PYYA 1SI1A 2RKMA 3RPWA 3MW0A 3T9HB 3TKDA 1R9QA 2ONSA 2OCUA 1PBPA 5IAIA 3VVEA 5CMCA 1FQCA 2R71A 4QFNA 5ITOA 5DVIA 1FCKA 4K3FA 1NNFA 3FUZA 3PMVA 1N7XA 5H8NB 3IX1A 1ZIUA 4OERA 4DZ1A 5I2NA 4AQ4A 1H45A 1LFHA 2RC7A 3I6VA 3U8QA 3RNNA 2QS3A 4O3CA 1MXVA 1P1QA 2GH9A 1NKXA 2M8CA 4OEVA 4H67A 4R6HA 3S4UA 4FJPA 5F7VA 2ALUA 4F2QA 4POXA 1POY1 1USYE 3VLWA 1A99A 4FE8A 1R9LA 4ZZAA 4IY5A 3K01A 3DP8A 4JB7A 1GGGA 1UQWA 2H25A 2Z23A 1OLCA 3IO4A 2XXYA 3ZKKA 4XTCQ 5H8FB 3IJOB 4M1VA 4P0GA 1Z7ME 3K6XA 2VGQA 4H5FA 1NNKA 3TDJA 5ISUA 1GV8A 5AA4A 1A7LA 2F6GA 2NWJA 4HW8A 4Z7EA 3EPEA 3E3KA 3FZVA 1IIWA 2QSXA 5KDTA 2CZLA 1P1UA 1SDXA 5H8HB 3SETA 1B52A 1NMUA 1URGA 5EYFA 1Q1KA 2O1MA 4RYAA 5H8NA 3THIA 4H8IA 5I59A 4JWYA 1US4A 3GXAA 2P0SA 1VSOA 4IO2A 4MF3A 1B4ZA 5JTYA 1HSLA 4OTEA 3V83A 2QS2A 2UVHA 3KSXA 4N13A 3MP1A 3V8XB 2A5SA 4F1YA 2DE3A 1OVTA 3PMWA 3KFMA 2QS1A 4G68A 3K1MA 4PE5B 1SVXB 4E0XA 1TWYA 3DP6A 3IOVA 1URDA 1IXCA 3H3GA 3OO6A 3VFJA 1B51A 1LCTA 1MXXA 1B4HA 3K2DA 3O6HA 2Y84A 3C33A 4LATA 4QRZA 3C36A 1M5DA 1TFDA 4GFRA 3S9MC 2FNCA 1B7HA 4ZEDA 3CSGA 2XX8A 1M5BA 3M3LA 1D3KA 3KN8A 3O6GA 1S50A 2AL4A 2B3BA 2DXYA 3G3IA 2UVGA 4OETA 1AH5A 2V3TA 3IB1A 3TAJA 3USDA 3MAMA 1M5EA 3E13X 4DIGA 4EUOA 3KEIA 2Q88A 1YTVA 5CBSA 1MDQA 1HSJA 3I3VA 4X1BA 1IQ7A 1I69A 2VD3A 3N6UA 3OO7A 5L9SA 4KHZE 4DXCA 1B5JA 2I3WA 1L5TA 3D4GA 1Y4TA 1NH8A 1QVSA 3CRBA 1AL3A 4G68C 1XC1A 2PX1A 4H5GA 1XHYA 2QL3A 4IO7A 1MPDA 3S2VA 4IY6A 2XXWA 2HFBA 1ATGA 3KBRA 4LVQA 3VLUA 4IB2A 4ONYA 1N7WA 2DWIA 2CMOA 5TP9B 3RT6B 2D3IA 3H03A 2ABHA 2HCAA 3C9HA 4NEDA 4OXVA 4P11A 3W9VA 3V89B 1B7UA 1B1XA 5ELVA 2Z8FA 1URSA 3FXQA 1M5FA 1DOTA 1BKAA 2V3UA 1Q35A 3ILTB 3PUVE 4NF6A 4KPTA 5JTYB 3MP6A 2E1SA 1HSEA 1A8FA 3C31A 3GBAA 4ELQA 2Q9TA 1XVXA 1VFDA 1NNPA 2ZXTA 5DEXA 4MLVA 4QFOA 2O69A 3IR1A 5M2VA 5ITPA 4O3BA 1LAHE 1IXIA 3GBBA 4FATA 4IO5A 1UIUA 2O51A 1XT8A 2H5YA 3CSBA 3KOTA 1GVCA 1NFTA 4QSDA 3TQWA 3WAFA 2XX9A 1Y3NA 5H8HA 4RK2A 1II5A 4E0WA 2REJA 3N5LA 5F1QA 2ANJA 3H7MA 3EHSA 1N84A 3TUSA 4GL0A 3IO6A 4HCYA 4KCDA 4H6DA 2O68A 1B3GA 2GHBA 2X7QA 3M3KA 5B70A 3MVXA 3GLBA 4ZEFA 4NF4A 3A09A 3HN0A 5H8SA 3B6WA 1PDAA 2R6GE 4F29A 1UTHA 4LUBA 4U2RA 4EQBA 5EHMA 1OQGA 4IGTA 3LUYA 1FTJA 4GIZA 4JXIA 5H8QB 3RUMA 3IK6B 3JYRA 5HM4B 2RCBA 3OD7A 1PEBA 1QULA 1QUKA 2XXQA 1IUDA 4YAHX 3UORA 4DXUA 4MLQA 4EDPA 1LGBC 1FQFA 1I6AA 3HV1A 1P1WA 3VVFA 3AXFA 2ONRA 3E9XA 3H6WA 3PPQA 4NF8B 3T22A 1MH4A 3PUZE 4OENA 3VDFA 2HEUA 2GHAA 3MUQA 4BDNA 3IOTA 1TXFA 3WAEA 3QYTA 3TQLA 3T9XB 5IKBA 4YICA 1USYH 3K00A 3KSJA 4OESA 1SYIA 5I59B 3N26A 3FVGA 3IOWA 4RXLA 3EF7A 3RT8A 3W9WA 1I6QA 5TPAA 2F7CA 4KR5A 5TU0A 3RTWB 1JETA 1B58A 1JVYA 2W7YA 3IB0A 1BIYA 4OEUA 4PFTA 4DDDA 1Y3PA 2RF1A 4QSEA 4F3GA 1F9BA 3FXRA 4WEPA 5CBRA 1B2HA 4OVJA 3JZJA 4LP2B 4ZS9A 4DE8A 1MDP1 3PUWE 1Y9UA 1N76A 2O84X 4G8NA 2F78A 5CRYA 3OXNA 2DVCA 4HTGA 3OO8A 4U22A 5FHMA 1LAFE 2HXWA 2QJEA 4OHNA 1P1NA 4IO4A 3FATA 3EN3A 5I2KB 4ELRA 3DM0A 1SYHA 2PMSA 4KYSA 3QUFA 1B9JA 1MM6A 4NMYA 5I2KA 1MH3A 3TTKA 2Y7IA 3O29A 4LA9A 4MH5A 1D9VA 2DOJA 4YKPA 2DQVA 4AB6A 4Q0CA 4JWOA 2XHDA 3M3FA 3FJMA 2OK2A 1ZTYA 3C4MA 3P7IA 4F19A 3VVDA 1ZMGA 4OFLA 4DCXA 2V84A 4WEDA 1N04A 2ZNTA 1FTKA 3FJ7A 3ILUB 4XKQA 3UA8A 2VD2A 4LZ8A 1UTBB 3T96B 4PP0A 1MQHA 3K1NA 5TPAB 3PPOA 3IORA 1AOVA 2XXUA 3M8UA 5AE4A 2RINA 4R72A 1WDNA 4BLAA 3K6VA 4R9FA 4F1VA 1AMFA 1XVYA 2QMXA 4RJZA 4KQPA 3OELA 4I62A 5CI5A 3BKIB 1S9TA 2Z8DA 4BDLA 4OFJA 3E4RA 3A3CA 3FVNA 3K4UA 1UTBA 2O6AA 2DWJA 2I6EA 1QKAA 4G8HA 5B7DA 1QW0A 1NNTA 1ELJA 1NH7A 2OJTA 2YJPA 1M5CA 2ZNUA 3CI8A 3I5OA 4P0IA 4Q5TA 2OWSA 4R6YA 4TQUQ 5KCJA 2I4BA 2Y7PA 5CMMA 3TCHA 5I56B 4EQ9A 1MY4A 3LSWA 5KCJB 1LFIA 3Q27A 4GD5A 4TLLB 4FEDA 5I56A 1RYXA 3RLFE 1P99A 3N94A 5A5XA 3TEPA 4RPOA 1EZPA 2DE2A 1B05A 2XXTA 5EHSA 4BDQA 2XXVA 4G68B 5JK4A 4MFIA 3G3JA 4L17A 3KN3A 4H1XA 4TLMB 3UGWA 3S9NC 1QUJA 1LBBA 4NF4B 3C35A 4G8MA 1TFAA 3OEMA 5AA3A 1SBPA 1MXWA 3FD3A 3TYHA 4C1UA 5LOMA 3TTNA 1POTA 3IJXB 5L9OA 4FORA 3HCQA 1MXYA 4THIA 2YPNA 4XKNA 3OSRA 1JW5A 1UIVA 2F5XA 4EQ7A 3G3HA 4Z0IA 1EZ9A 4KYDA 3LSLA 3QIMA 3U92A 2B65A 4EF2A 2FYIA 2DWHA 1FTMA 3FGSA 3SESA 3PV0E 5AA2D 2F36A 3H6UA 3O28A 1DPPA 4G2ZA 5I57A 1JNFA 3G3GA 3W15C 1P1OA 2X7PA 3L6HA 2O1LA 4BDRA 4IO6A 4EF1A 3L6GA 3RQTA 3EQ1A 1QUIA 3R6UA 1FQDA 4XKPA 1EZOA 1MQJA 3TTMA 2AL5A 1RKMA 2F7AA 2ONKE 2XX7A 1MPBA 1CB6A 1EH3A 3KJ7A 4U21A 2THIA 1B5IA 4GF8A 4RA1A 2HAUA 3O97A 1SQYA 1LCFA 3PPNA 4C1TA 3HHFA 1MPCA 4GVOA 3ODBA 3LBSA 3PU5A 4UA8A 3G3FA 3MJNA 4H0WA 1PBQA 3QUJA 2ZMBA 3OEKA 2I3VA 4RY1A 2NUVA 2IA4A 3FJGA 4DXBA 1FTOA 3DLNA 2Q2CA 3EHTA 1OLAA 3KOSA 2A5TA 2H4IA 2DE4A 2RC8A 1O7TA 2V3QA 3H06B 1TT1A 1OIBA 4NF5A 4QSCA 3SEVA 4F3BA 3GZGA 5J1DA 2UYEA 2QRYA 4NF5B 2BJJX 2DVZA 4ECFA 1IXGA 3V5AA 2ESNA 1JQFA 4GLIA 1ANFA 2XXRA 4U1ZA 1MY0A 4IGRA 1Y1ZA 5K2YA 5TP9A 1B40A 4NF8A 1OQHA 4LONB 4DLDA 5I84A 3U72A 4XKRA 5KDTB 2UVIA 4ZE9A 3S9EA 3JV9A 4R75A 2O7UA 1Y1MA 2Y7WA 2F34A 3CG3A 1LAXA 1PB8A 4F22A 2DYXA 2V25A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MP8A 1IZ1A 5FBPA 3OSQA 4F39A 3FIRA 4R2BA 4FEBA 2I4CA 4X1DA 3Q25A 4EXLA 3MPLA 1R6ZA 3TZAA 1B3FA 5A5LA 3LC8A 3QXMA 4GQOA 1D4NA 2G93A 1MXZA 4C0RA 4H8JA 4NHBA 4JSOA 4XFEA 3RPLA 3UP9A 3S9LC 3MWBA 3SKPA 3TTLA 1PB9A 1S7YA 5BWJA 3TTRA 1EU8A 4MNPA 2BJIA 4LN5A 3D1RA 5ICTA 2REGA 5A5XB 1IXHA 2Z8EA 3QK6A 1FPLA 4NE4A 4ZECA 3TELA 1DPEA 1JVXA 4P1EA 1LSTA 4N6DA 2LAOA 5I57B 2FA7A 3U93A 2Y7RA 1YAEA 3SEWA 3ZS6A 3OOAA 5DT6A 5EQ7A 3BFUA 2XXPA 1FPJA 1FW0A 2R9JA 4YB7A 1GTKA 1VFEA 1A54A 4R9GA 1CNQA 3MC2A 3TCGA 2DXRA 4U1OA 3B6TA 4I9DA 5I58A 4HCWA 4MNIA 4HS7A 4I8CA 4N6KA 1QJMA 4AS4A 4FIMA 2ZYMA 4X9TA 5EQ8A 3UIFA 1LFGA 2B4MA 1K9ZA 2P1SA 5ET6A 2DSFA 4M4GA 2I49A 1LB8A 1OVBA 5F7VA 4OQOA 2E0SA 2VP1A 3UK4A 3G7WA 3KC0A 5H8FA 1RYOA 1T0KA 2XWKA 4TOZA 4XXUA 3GYYA 3T9UA 4JVCA 5FTHA 4GBVA 1OMPA 3OMBA 2F97A 2NOOA 4ESXA 4OZ9A 3RTFB 2OWTA 3K6WA 5HPQA 1NV3A 1KWHA 1DMBA 1JEUA 2I0BA 4PFYA 2X26A 4PBQA 3EHUA 3U1OA 4MNCA 4GBWA 5LDZA 3CFZA 4PDHA 2PFZA 4KXPA 1B0HA 3HPIA 4O94A 1R9QA 5IAIA 1Q9DA 5ITOA 1FCKA 3FUZA 3PMVA 1N7XA 4MCOA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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