3IOWA

Huntingtin amino-terminal region with 17 gln residues - crystal c99-hg
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
419
structure length
414
Chain Sequence
b'KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAMATLEKLMKAFESLKSFQQQQQQQQQQQQPPPPPPPPPPPQLPQ'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Secondary structure of Huntingtin amino-terminal region.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Huntingtin
source organism Escherichia coli (strain k12)
molecule tags Signaling protein
total genus 121
structure length 414
sequence length 419
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iowA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iowA02
4HW8A 3HHFA 3VVEA 4ZEDA 3C31A 5LOMA 1Y4TA 2X7QA 4ECFA 1H43A 3SDFA 1ZLQA 1MS7A 4U1ZA 5TP9A 2F6GA 5I2NA 3MVYA 4Z0IA 2XXWA 1N7XA 2HFBA 4RXLA 3FVOA 3QUJA 1LAHE 2THIA 3EF7A 5FTHA 1LLSA 5I58A 3LSXA 2B3BA 1UIVA 1VR5A 4Q5TA 5CMCA 1B51A 1MY0A 3OSQA 3W9WA 2F5XA 1GR2A 3E13X 2P0SA 1B58A 4P0IA 3THIA 3IX1A 1B05A 1ZIUA 2Y7RA 4H5FA 3HN0A 3M3KA 3W15C 3TEPA 4DXBA 2REJA 2DSFA 3CR9A 1M5EA 1S50A 2NUVA 3K6UA 3B6WA 4H6DA 4Z7EA 1LFIA 1SQYA 4ZDMA 1B40A 5I2KB 5JTYB 1B0HA 4ZEBA 2DP8A 3FASA 5J1DA 1MQGA 3TTLA 4BDQA 4R73A 5H8HB 1B9JA 4RYAA 4JDFA 4DCXA 5DVJA 3GLBA 4GL8A 3KN7A 1B6HA 4KPTA 5H8NA 2O7IA 1OIBA 2Y7PA 3HO7A 3SEXA 1SI1A 2DE3A 5HPQA 2QJEA 3VLVA 4QFNA 4F19A 1M5CA 2I58A 3T96B 4IO7A 1O63A 3TCFA 4POWA 2D5WA 3M3LA 4ESWA 1BKAA 3IJOB 2NVUB 4ZEIA 2A5SA 1A8EA 2Q88A 4BDLA 2M8CA 4AB6A 4E0WA 4F2QA 1O7TA 1NL5A 2YJPA 5AA4B 4ELPA 4KFQA 1I6QA 3K02A 3Q29A 1QVSA 3TELA 4BDMA 4EF1A 5ICTA 3IOWA 4OERA 4THIA 3PD9A 3RTWB 4MH5A 3QYTA 3FJ7A 1Q35A 3K1MA 1EZPA 3KJTA 4K3FA 2DWJA 1NNTA 2Z8DA 1JQFA 2O1MA 1P1NA 2ZYOA 5CI5A 1MPCA 3RLFE 3ZKKA 2Z8FA 2G29A 3VDFA 3KOSA 1N84A 1RYXA 4RPNA 4NWDA 1SD3A 3PMXA 4WKMA 3C36A 1B4ZA 4R72A 4HCYA 3R7XA 1LBBA 3PD8A 3SEUA 3LC8A 1II5A 1DPEA 1DPPA 3T9HB 3TCGA 1B5HA 4DIGA 4OENA 3U72A 2Q8JA 4F31B 3A3UA 3DLNA 5EYFA 4FIMA 4KD5A 1P1OA 3V89B 4FE8A 3SEVA 4MF3A 4MBPA 1USYE 2R6GE 4QFOA 3HV1A 1M5BA 4G4PA 1LCTA 3TFLA 3FVGA 2XX7A 1UTHB 2O7UA 3IAZA 3RN8A 4Q0CA 3RT8A 4ELQA 1B3HA 4GL0A 3T9XB 2F97A 3PUYE 2HZLA 4P11A 4KYDA 2Q2CA 1XVXA 5AA2B 2OCUA 3UP9A 3DELB 1B7HA 1S7YA 2VP1A 4G68A 4O3CA 4Q30B 3FD3A 2DQVA 1VFDA 1IEJA 4F3SA 3K1PA 3K00A 4EF2A 4DXCA 3L6GA 1US5A 4R9GA 2PMSA 2I0BA 3T9UA 4OEVA 1R9LA 4R6HA 3MPKA 1FQDA 3DP8A 4G68C 3H06B 2QS2A 1PEBA 3H7MA 1QKAA 1FW0A 3F11A 4UA8A 1URDA 3V5AA 2OJTA 1QUKA 5H8FB 1TWYA 1FTOA 4NE4A 4FATA 2ALUA 1PB9A 3PU5A 3N6TA 3I6VA 2XX8A 2F7BA 3RT6B 4YKPA 3H6TA 3VVDA 5L9SA 1MPDA 5EHMA 3IORA 5I84A 3OO9A 1RKMA 1PB7A 4QFLA 3WAEA 3A3CA 4OZ9A 3SEWA 4R9FA 1B3GA 1ZMGA 1NMUA 1Z7ME 4GD5A 4PFWA 1JVXA 2ANJA 1TFAA 1B7ZA 1NFTA 3CSBA 5EHSA 1LSTA 4GVOA 3CVGA 1LCFA 4LONB 3OO7A 1PC3A 5L9MA 4KYSA 3PMVA 3LSWA 4QF9A 3FUZA 1MQHA 2BJJX 4OESA 3U92A 1A99A 4F39A 4TQUQ 4DDDA 3SKPA 2F7CA 5AA1A 2OWTA 4U1OA 5CMBA 1QKBA 1I69A 4LZ5A 4H5GA 2H25A 4YB7A 3KFMA 3VV5A 3W9VA 3G3HA 1P1UA 1IXHA 4G8NA 4YMAA 3IB1A 2LAOA 1ATGA 2IEEA 4H1XA 2I49A 4NF4B 3SEYA 3E9XA 3IK6B 1A8FA 3GBAA 1XHYA 3IJXB 3IOVA 3UN6A 3QAXA 5B70A 3QIMA 3RY3A 1CE2A 3C4MA 5I59B 4LATA 3OSRA 2XXQA 2GFEA 3MVZA 4IY5A 4XKQA 1J1NA 4YMBA 3VVFA 1FTKA 4KHZE 1D9YA 1F9BA 2V84A 2H99A 4OYVA 5DEXA 3HHGA 1N04A 2R71A 1B52A 1Z7NE 3AXFA 4U21A 5CBRA 2ZNSA 3FJMA 3S9NC 2AIXA 1IQ7A 1MY4A 4DE8A 3RTFB 4BDOA 4ESXA 3U93A 4DCYA 5FHMA 3OXNA 4M4GA 1IITA 1UTBB 3QK6A 2H4IA 2F34A 5M2VA 1Y20A 4F1VA 2A5TB 2X26A 3G3KA 2DYXA 1NNKA 2VHAA 3CG1A 1POTA 4OFJA 3OO6A 1DMBA 4X48A 4H67A 1B1XA 1HSLA 2I0CA 3KSJA 4YKIA 4ZE9A 1AL3A 5BWJA 2ZXTA 1S9TA 4UACA 1JW1A 3T93B 1JW5A 3Q26A 3O2AA 4YAHX 2XXYA 3KOTA 1WVJA 5ISUA 2ABHA 3CRBA 4NF5A 4ND9A 3Q27A 3SERA 5JK4A 3T9VA 3S4UA 4GQOA 3K01A 1UIUA 2RKMA 2ZYNA 4WEPA 4FORA 2V3QA 4F22A 4LZ7A 3WAFA 1AH5A 3FZVA 4YZZA 1B3LA 1MM7A 4LQ2A 2UVIA 4FEDA 2DE4A 1YTVA 3IOUA 3KN8A 3OELA 2I4CA 3USDA 3UORA 3OD7A 1PDAA 2ONKE 1EH3A 3S9MC 4F18A 3VXCA 4M1VA 3PGFA 1MY2A 3O29A 5ELVA 5TPAB 5KCJB 3TPAA 1A7LA 3H3GA 4QRZA 5L8DA 3S9LC 3R26A 4LVQA 3E3KA 3ILUB 4OVJA 2PX1A 4AB5A 3C35A 4GOTA 2QS4A 4YICA 1IIWA 4U4SA 1Y1MA 4OQOA 1WODA 3ODBA 1GVCA 4ZEFA 3VE1B 3PUWE 1LFHA 1FQAA 1LB9A 2HQ0A 1B5IA 2D3IA 4IO5A 4XTCQ 4ZZAA 3R6UA 1LAXA 1P1QA 5I56B 3Q28A 2QL3A 1JNFA 4G77A 2REGA 2QMXA 4R6KA 3FV2A 1MQIA 4AQ4A 4I8CA 4JBZA 4GXSB 5CRYA 4GF8A 2RC8A 3DP4A 4MFIA 1XT8A 2V3TA 5A5XA 3JZJA 3JV9A 2VD3A 4F1UA 3PUXE 2O69A 3MP6A 1SW5A 4F29A 2RC9A 1USYH 1BP5A 1DTZA 3SETA 1ELJA 4U22A 5KDTA 2Y84A 5I57B 3UGWA 3ZSFA 2XXVA 5H8QA 3IB2A 4OHNA 1AOVA 1QJMA 4IO3A 2NOOA 3FVNA 1B7UA 1SBPA 3PMWA 1H3DA 4I9DA 3UIFA 3D4GA 4DZ1A 5TP9B 2ZNTA 3CIJA 1KWHA 1ANFA 3G3GA 3PPQA 1OMPA 5I2NB 3GBBA 3A09A 3S9EA 1D9VA 2HXWA 1HSJA 3LR1A 1MXYA 2UVJA 1FTMA 1NKXA 3BFUA 1MQDA 5I58B 3TTMA 2H5YA 1M5DA 4NMYA 4KQPA 1UQWA 3V8XB 1TT1A 3MQ9A 3G3IA 4GWOA 2PT1A 2XXHA 3B7DA 1VFEA 3MP8A 4KYEA 2HEUA 3GZGA 3IL1B 1OLAA 2F78A 3EN3A 2Q89A 1B1HA 2AL4A 2I6EA 3RQTA 5CMKA 5BUUA 3V83A 1B3FA 3O6HA 1B4HA 3T22A 3FXQA 5ITPA 2DOJA 2DWHA 2CZLA 2UYFA 4PQJA 5HBCA 3U94A 1PB8A 1D3KA 2OK2A 5CM6A 2FYIA 4WEDA 4JWXA 1MG1A 4IB2A 4NF8A 4NWCA 3ECRA 1T0KA 3FXRA 3CFZA 1PBQA 1VSOA 2ZNUA 4GRKA 4U23A 4RK2A 5H8NB 3KSXA 4OEUA 4XKNA 3N94A 1QULA 1FTLA 1H44A 1FQBA 4RK9A 3VFJA 4KI0E 2XD2A 2XXXA 2GH9A 1FTJA 4U2RA 4N07A 1P99A 2NWJA 3ILTB 3CI8A 3IB0A 1B46A 3T66A 4F3BA 1EZ9A 1QUJA 3E4RA 3MZ1A 4XIGQ 1R6ZA 3GXAA 5ITOA 4OETA 1IZ1A 2ESNA 2V3UA 1XC1A 4KR5A 3K0VA 4R74A 3RPWA 3N26A 5K2XA 2P2AA 4DLDA 4BDNA 2I3VA 3CFLA 3H6WA 2QS3A 3LUYA 5F7VA 3C34A 2FNCA 1FQEA 1IXIA 1Y9UA 3TQLA 4GLIA 5DTBA 3VXBA 3LSLA 2I4BA 3BBRA 1LFGA 3PUZE 4YKJA 3CG3A 1IXCA 4JXIA 3PPNA 1N3XA 2OWSA 1SW4A 4JSDA 5KDTB 2XXPA 4H65A 3TAJA 4TLLB 3TMGA 1QW0A 2PVUA 1JEUA 2RCBA 3MZ9A 2XX9A 2HAVA 3KBRA 4FAJA 4ZEKA 1LAGE 4EDPA 3D4CA 2O68A 4LQ5A 1Y3NA 1JETA 3PV0E 4RJZA 3H4ZA 3K6WA 4ONYA 4GXAA 3N6UA 3RUMA 1MQJA 3KZGA 3CFXA 2FA7A 3L6HA 3Q25A 1Y4CA 4POXA 3EPEA 4FJPA 4QHQA 3IO4A 1GV8A 1B2HA 1B32A 4F3PA 2DE2A 2HCAA 3M8UA 4F3GA 4HS7A 4JB7A 4PP0A 3PPOA 1BTJA 5AA4A 1DOTA 3JYRA 3EHSA 4Q8RA 2V25A 5TU0A 2CMOA 4KCCA 2YPNA 4X1DA 1IUDA 4L17A 4IGTA 1URSA 1L5TA 4YU0A 5CMMA 3MP1A 2HZKA 4I62A 3O6GA 4RA1A 2RCAA 3QSLA 1B0LA 4OXVA 5L9OA 3KN3A 4C1UA 2WKYA 3LSFB 4G68B 1NNFA 1POY1 2AYSA 5IKBA 1N0TA 4R2FA 1NNPA 3MC2A 1MH3A 2O6AA 2PYYA 1MRPA 4EXLA 1R1NA 3IOTA 3DP6A 2G93A 2W7YA 3DM0A 3MWBA 1BIYA 4GIZA 4ISUA 3H03A 4PFYA 1OQHA 2R9JA 4G8HA 1RYOA 4LA9A 2VGQA 4EQ7A 5AA2D 2PBWA 1CB6A 3FJGA 4MLVA 2ZYKA 4LZ8A 1ZU0A 3O9PA 3OEKA 3PPRA 3C33A 3UA8A 3MUQA 1LGBC 2QMWA 2XXTA 4LP2B 3U1OA 3I5OA 5ICQA 4BDRA 1MPBA 3HSTA 3QXMA 5FTIA 3B6QA 1TXFA 1BLFA 4N6PA 1YAEA 2OZZA 4WXJA 1A40A 1UTHA 3RGYA 3FXUA 1Y3QA 4G2ZA 3OENA 3O97A 4OWDA 2VOZA 4NTLA 4TOZA 1JEVA 2I48A 1LAFE 1MY1A 5B7DA 2QSXA 2XXRA 5AA2A 1TFDA 2E0SA 2GRVA 1FQCA 3MVXA 3M3FA 4G8MA 1OVBA 3KGCA 2F35A 3MVWA 4NF6A 2F7AA 1SDXA 3C9HA 3EHTA 5FHNA 4QSEA 2H98A 2XXIA 4ZS9A 4ELRA 4BLAA 2P1SA 2X7PA 3TDJA 3FGSA 3ZS6A 5DT6A 3MPLA 2OLBA 1JW4A 5H8FA 4ZZEA 5K2YA 1ZKBA 1D4NA 1NH7A 4QSCA 5CBSA 1XOCA 1MM6A 4GFRA 2DWIA 3UK4A 1SW2A 4JSOA 5AE4A 5DEXB 2O51A 1Y3PA 4IO6A 4YKKA 4OMBA 3TYHA 2YLNA 1ZBMA 1US4A 5DYHA 3TODA 1YPNA 4O3AA 1I6BA 2B65A 4I1DA 2VD2A 4X9TA 2O84X 3TUSA 3G3JA 1GTKA 4IGRA 4QSDA 4TLMB 2QRYA 1SW1A 3PPPA 1B5JA 3TCHA 2XHDA 1VE4A 4EQ9A 3FV1A 3TTRA 1MY3A 3G7WA 4YB5A 3S2VA 2ZYMA 2NXOA 2V93A 2ZMBA 4EXKA 2IA4A 4OFLA 2I3WA 3MW0A 2DXYA 1H76A 4NF4A 3K1NA 1YCJA 4JWOA 3OO8A 4U4XA 2Z8EA 4HCWA 4NF5B 4R2BA 4FEBA 2XD3A 5I59A 2Y7KA 1PBPA 2D21A 1M5FA 3K2DA 3FVKA 4C0RA 3KG2A 2ONRA 4XKRA 1HSEA 4RNSA 4X1BA 4XXUA 3C32A 2Y7WA 1P1WA 4C1TA 1FQFA 1XVYA 1N76A 2DXRA 4QFPA 4E0XA 3O28A 1AMFA 2O1LA 2DS9A 2UVHA 4EQBA 5FHOA 3H6VA 5H8SA 3VLWA 1UTBA 3TKDA 1SYHA 2QPQA 4NF6B 2A5TA 2XXUA 3EHUA 1Q1KA 1FCKA 4FECA 4JWYA 3LBSA 2F36A 1WDNA 4ZE8A 2UYEA 4YB6A 5HM4B 2HAUA 1LBCA 5KZTA 1MDQA 3ONMA 5JEIA 1EZOA 2E1SA 3N5LA 4KCDA 3I3VA 3IR1A 4QFKA 2Y7IA 2RF1A 3TTNA 4IY6A 1OLCA 1H45A 5DVIA 1MXVA 2Q2AA 2RC7A 3OOAA 4MLQA 3CSGA 4RPOA 4H8JA 2RINA 3OMBA 2H9BA 3K4UA 5A5XB 1MXXA 1NH8A 1Y1ZA 3P7IA 1R9QA 1N3WA 4RY1A 5DVFA 5I2KA 5JTYA 2GHBA 3QUFA 1B3EA 3O66A 4N13A 2UVGA 5H8QB 1SI0A 1QUIA 2UXAA 1EU8A 1URGA 3FATA 5H8HA 5TPAA 5KCJA 1ZJLA 4H8IA 1OQGA 3U8QA 1MH4A 1A54A 3MAMA 4R75A 2F6PA 3PUVE 4R6YA 5IAIA 4IO4A 4F2OA 3FIRA 2Z22A 5F1QA 3KJ7A 1DTGA 3VLUA 5CC2A 1MDP1 1LB8A 3B6TA 2DWAA 3RNNA 3O6IA 1I6AA 2DVZA 3MJNA 4EUOA 2ONSA 2Z23A 3HPIA 4O3BA 1MXWA 4PETA 2OBGA 4NEDA 1AIVA 3TTKA 2B3FA 4ELOA 1SVXB 1MXUA 3TZAA 1ZTYA 5I56A 3OEMA 3BKIB 3ZKLA 1SYIA 2KLFA 3EQ1A 4PFUA 1N7WA 3G3FA 2Q9TA 2AL5A 4IO2A 4LUBA 5AA3A 4PE5B 2PT2A 4XKPA 4P0GA 4H0WA 4HTGA 1XS5A 2GHAA 1GGGA 4DXUA 1A55A 3K6XA 4F1YA 4PFTA 3MZBA 1JVYA 1IXGA 2DVCA 3IO6A 1OVTA 3SESA 3HCQA 4OTEA 3K6VA 1O64A 5I57A 4ZECA 3KEIA 3BFTA 4NF8B 3TQWA 2QS1A 4OFOA 2F8DA 3MBPA 1DSNA 1MXZA 3H6UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2V4CA 4HW8A 3HHFA 3VVEA 4ZEDA 3C31A 5LOMA 1Y4TA 3MSTA 2X7QA 4ECFA 1H43A 5ESYA 3SDFA 1ZLQA 1G0IA 1MS7A 4U1ZA 5TP9A 1NV0A 2F6GA 5I2NA 3MVYA 4Z0IA 2XXWA 4G61A 1N7XA 2HFBA 4RXLA 3FVOA 3QUJA 1LAHE 2THIA 3EF7A 5FTHA 1LLSA 5I58A 3LSXA 2B3BA 1UIVA 1VR5A 4Q5TA 5CMCA 1B51A 1MY0A 3OSQA 3W9WA 2F5XA 1GR2A 3E13X 2P0SA 1B58A 4P0IA 3THIA 3IX1A 1B05A 1ZIUA 2Y7RA 4H5FA 3HN0A 3M3KA 3W15C 3TEPA 1IMCA 4DXBA 2REJA 2DSFA 3CR9A 1M5EA 4XF5A 1S50A 2NUVA 3K6UA 3B6WA 4H6DA 2KQZA 1LFIA 1SQYA 4Z7EA 4P56A 4ZDMA 1B40A 5I2KB 2VPNA 4OVRA 5JTYB 1B0HA 4ZEBA 2DP8A 3FASA 5J1DA 1MQGA 3TTLA 4BDQA 4R73A 5H8HB 1B9JA 4RYAA 4OVPA 4JDFA 4DCXA 5DVJA 3PTYA 3GLBA 4GL8A 3KN7A 1B6HA 4KPTA 5H8NA 2O7IA 4JVCA 1OIBA 2Y7PA 4P3LA 3HO7A 3SEXA 1SI1A 2DE3A 5HPQA 2QJEA 2BJIA 3VLVA 4QFNA 4F19A 1M5CA 2I58A 3T96B 2Y5LA 4IO7A 1O63A 3TCFA 2QVUA 4POWA 5IZ3B 2D5WA 3M3LA 4ESWA 1BKAA 3IJOB 2NVUB 4ZEIA 2A5SA 1A8EA 2Q88A 4BDLA 2M8CA 4AB6A 4E0WA 4F2QA 1O7TA 1NL5A 4PF6A 2YJPA 4ELPA 5AA4B 4KFQA 1I6QA 3K02A 1IMDA 3Q29A 1QVSA 3TELA 4BDMA 4EF1A 5ICTA 3IOWA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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