3IOWA

Huntingtin amino-terminal region with 17 gln residues - crystal c99-hg
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
419
structure length
414
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAMATLEKLMKAFESLKSFQQQQQQQQQQQQPPPPPPPPPPPQLPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Huntingtin
publication title Secondary structure of Huntingtin amino-terminal region.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli (strain k12)
total genus 121
structure length 414
sequence length 419
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iowA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3iowA02
3U93A 5ITOA 1P1UA 1MRPA 3T9VA 3G7WA 4Q0CA 1BKAA 4NF5B 1NMUA 2ZNUA 2F7CA 4PQJA 3SETA 3V5AA 1I6QA 5DVFA 1DMBA 1UIVA 3P7IA 2QS3A 5JTYA 2RF1A 4OENA 4JWXA 1Y20A 5DVIA 2DQVA 4NMYA 2F7AA 4IO2A 4FATA 2WKYA 3TKDA 3IJXB 4U21A 1ZBMA 4POXA 4JXIA 1UQWA 1TT1A 1ZKBA 1IZ1A 1LFHA 4LP2B 1SI0A 3PUXE 3S9LC 4QFNA 2XXXA 1MXYA 2O1LA 4E0WA 4QSCA 3PUYE 4IB2A 1EH3A 5DT6A 3H6WA 5H8FB 4AQ4A 2I3WA 4H6DA 3UP9A 4NF6A 2VOZA 4ELRA 4ZS9A 4OHNA 4U22A 1MQJA 5CMBA 4FJPA 4OZ9A 4LZ5A 1YTVA 1ELJA 1YAEA 3MQ9A 3O2AA 3TEPA 2IA4A 2HAVA 3MVWA 1POTA 4C1UA 1O64A 4RY1A 3MC2A 4YAHX 3E13X 3FXQA 1MXVA 3W15C 3PV0E 3MW0A 1N04A 2XXRA 5CMMA 3ZKLA 5LOMA 4X1BA 4XKRA 1MY2A 1B5IA 4YU0A 4U4XA 1CB6A 3USDA 4EXLA 1PB7A 1VFDA 1ZMGA 4LVQA 2ZYMA 4QF9A 1YPNA 4G68C 3KN8A 4IO6A 3VV5A 4NF4B 2PMSA 4U4SA 2PVUA 4ZZEA 4G77A 5KZTA 2O7IA 2ABHA 2A5TB 2XX8A 1Q35A 3JYRA 3RUMA 1A55A 1TXFA 4F3BA 3MWBA 3F11A 1IEJA 1ZU0A 4R6YA 3S4UA 3RTFB 5DEXB 1SDXA 3VLWA 4DCXA 1Z7NE 1WDNA 3C9HA 3PMVA 3KEIA 2P1SA 4OWDA 4H8JA 1MPCA 5ISUA 2RCBA 1B05A 5B7DA 3V8XB 1URSA 2W7YA 1NL5A 4PETA 3MPLA 3DLNA 3KFMA 3O29A 4OYVA 3CFZA 1WODA 3IAZA 1Y4CA 1VE4A 1P1NA 1MQHA 4BDMA 3GBAA 1IXHA 1URDA 2RCAA 1MQIA 3OEMA 3D4GA 3MUQA 1QVSA 4L17A 2G93A 1MM6A 2UVJA 3C4MA 1LGBC 1LSTA 4EXKA 1XC1A 4OQOA 1JETA 4RK9A 4KCDA 3EQ1A 1FQAA 2V3TA 2X7QA 2YPNA 2OWTA 3LBSA 1M5EA 1N84A 4KPTA 1SW5A 2B3FA 3TTLA 4I1DA 3UGWA 4ZE8A 1ANFA 3N6UA 4HCWA 3G3HA 2XXQA 4R75A 3TAJA 3SERA 4ISUA 1D9VA 1B0HA 1D4NA 1JNFA 4OTEA 3N6TA 1YCJA 2H99A 3G3GA 4OETA 3IOUA 1QKAA 4DDDA 3KOTA 4PP0A 1MPDA 4EF2A 4FECA 4KYSA 4OFJA 5F1QA 2AYSA 4E0XA 2RKMA 3CR9A 5TP9A 3H3GA 1S7YA 3L6HA 1D9YA 2HCAA 2Y84A 3TTMA 3VVEA 3IO4A 3IOVA 4RYAA 1UTHB 1XS5A 4P0GA 2ONKE 4YB7A 2X26A 2O69A 3KBRA 5HBCA 4MF3A 4O3CA 5I58B 3QK6A 4GXAA 2R6GE 1MQGA 1OLCA 2Q9TA 5DVJA 4G68B 4IO5A 3KOSA 1LFGA 2DE4A 2VD2A 5EHMA 4JBZA 4UA8A 5AA2B 3W9WA 5FHOA 1EU8A 4EQBA 5I56B 4ZEDA 4G8HA 2DOJA 5AA4A 3MAMA 3HSTA 2RC7A 1USYH 3CRBA 1Y3PA 2E1SA 4QHQA 3MVXA 1SBPA 3R26A 5I2NB 1FQBA 1MG1A 3H4ZA 3HHGA 3M3LA 3TTKA 1FTJA 2DSFA 3H6TA 4NF5A 3VE1B 2Y7KA 1SD3A 3QIMA 3ILTB 1B4ZA 4C0RA 3H06B 1M5CA 1BIYA 5I59B 3CSGA 3DP8A 1Y1ZA 3BFUA 2D3IA 2RC9A 2DWHA 4N07A 2I4BA 2BJJX 1LB8A 1B3GA 3S9EA 3K02A 4QFOA 3OEKA 4PFWA 3PD8A 4DLDA 1RYXA 2G29A 4GL0A 3TCGA 3T9XB 4DIGA 5H8HB 2RC8A 4RPOA 2A5SA 3FIRA 4ND9A 3V89B 1Z7ME 3TELA 4LA9A 1NH7A 3GBBA 1NKXA 1B51A 1IUDA 2Q88A 4X48A 5H8FA 1AIVA 4EDPA 4GLIA 4ZZAA 3FD3A 3O6GA 3MZ1A 4G8NA 4HW8A 1QUIA 1M5BA 1VFEA 1IXIA 1ZLQA 3LC8A 4XKNA 2V25A 1URGA 3TUSA 4LUBA 2NUVA 4YKPA 1AOVA 1B6HA 1JVYA 1XHYA 3A3CA 1NNTA 3FVGA 2Z22A 4R74A 1MXXA 1OQGA 3K1PA 1Y1MA 1JQFA 4DE8A 5L8DA 1IQ7A 2F78A 1XOCA 3R6UA 2GH9A 3T93B 3MVZA 3VFJA 3HV1A 4QFPA 3U8QA 3OSQA 2DWJA 2PT2A 5H8SA 3CIJA 5CC2A 1DTZA 2R71A 4R9FA 4GFRA 2O1MA 1OVBA 4GD5A 1TFAA 4H5GA 4NF4A 4F3PA 2XXWA 1HSEA 1CE2A 3H6UA 3U72A 2FA7A 1P99A 3SEWA 1N76A 2Z8EA 1B7ZA 2A5TA 2HQ0A 2QMWA 5DYHA 4YKKA 3ZKKA 1MH3A 3PUZE 3ZSFA 3UIFA 1H3DA 1M5FA 2D21A 5DEXA 3HHFA 3Q26A 3GLBA 2F8DA 4QSDA 4M1VA 4GWOA 5ITPA 3T22A 3I6VA 1H43A 4QFLA 5JK4A 1B52A 2DS9A 2XXPA 4QRZA 4O3BA 3RQTA 4ZEBA 1XVXA 4BDOA 1TWYA 3TZAA 2Y7RA 5A5XB 1MXWA 1N3WA 4YB5A 1NNKA 1GV8A 1N3XA 2ONRA 1IITA 3C31A 1R1NA 3EN3A 2UVIA 1LBBA 4YB6A 3KN3A 1B3HA 2RINA 5ICTA 3LSWA 2Q89A 1MM7A 2Z23A 1B3EA 3RGYA 4RK2A 3PPOA 3Q25A 5M2VA 1B0LA 2DVCA 4JWYA 3EF7A 3C32A 1TFDA 2ONSA 1POY1 3RLFE 3HCQA 4RJZA 1IXCA 3EHSA 3TPAA 3Q29A 3HPIA 3RN8A 4F18A 4H5FA 4XTCQ 4U1OA 2OZZA 3D4CA 3Q27A 4RXLA 3IOWA 3G3KA 2REJA 3FJMA 4OFOA 1UTBB 3TTRA 5JEIA 4MLVA 1A7LA 5HM4B 1FQCA 5L9SA 4GXSB 2ZYKA 1GR2A 1PC3A 1P1WA 1B58A 2XX7A 3G3IA 3VVDA 2H5YA 1B32A 4JDFA 1HSLA 4UACA 3H6VA 1BTJA 2XX9A 2YJPA 5H8QB 4HTGA 4JWOA 1IXGA 3PD9A 2GHAA 1PBQA 4ZEIA 4NWCA 1UTHA 3PPQA 1AMFA 4R6KA 2DXRA 3C36A 2ZXTA 2REGA 3C34A 1N7XA 2ZNSA 3FXUA 3WAFA 4TOZA 5I58A 3UN6A 3IB2A 4X1DA 1LLSA 4F1VA 4H1XA 3B6TA 1B5JA 1LCTA 3FV2A 4PE5B 4G68A 4I8CA 1MXUA 1LBCA 1PB9A 2Q2CA 2ANJA 2DWIA 4Q5TA 3FATA 4C1TA 5AA2A 2I48A 4POWA 1F9BA 1A40A 3KGCA 3MP6A 4ELPA 5I56A 1H45A 1VR5A 1II5A 3QUJA 3EHTA 2XHDA 4F2OA 5I2NA 1QW0A 3FVNA 2Q8JA 2O84X 2O51A 4QSEA 4YZZA 2XXHA 3K01A 1H76A 3T66A 5CM6A 4ELQA 3M8UA 2I4CA 2VD3A 5I57B 4X9TA 1LFIA 4ZDMA 3PGFA 5I59A 2GHBA 1B7HA 1HSJA 1PDAA 2F34A 1JEUA 3ODBA 2E0SA 3T9HB 2OK2A 4RPNA 2ZMBA 4WEDA 1GGGA 1D3KA 1XT8A 4F29A 1QJMA 5H8HA 4O3AA 3UA8A 4LZ7A 1B4HA 3TQWA 3K1NA 1O63A 2THIA 1LCFA 2QL3A 1B1XA 2XXIA 2F6PA 1SW1A 3OO9A 4YKJA 3B6WA 2XXUA 5CMCA 1RYOA 2I58A 4HCYA 1S50A 3LSXA 3S2VA 3IL1B 5AA1A 3SEXA 2CMOA 2O7UA 5TU0A 1SW4A 2F35A 4OERA 2Y7IA 3U94A 5BUUA 4I9DA 2HAUA 1OQHA 3K2DA 2UXAA 1SQYA 1JVXA 3O66A 4ONYA 3RPWA 1US4A 4OESA 4BDQA 3DP6A 3OOAA 3FJGA 2Y7PA 2ZNTA 3CG1A 3TMGA 4K3FA 3IJOB 5KDTB 1I69A 1S9TA 3WAEA 2I3VA 1JEVA 3HO7A 1JW4A 4KR5A 4MH5A 3TCFA 2QS4A 2GRVA 3IX1A 4DZ1A 2HFBA 2QJEA 3QUFA 1A54A 1T0KA 1NH8A 3SDFA 1NNPA 3KG2A 3K00A 5ICQA 5H8NB 2P0SA 3PPRA 1XVYA 4YICA 1N0TA 4PFUA 1WVJA 5CI5A 5L9MA 1PB8A 2OCUA 3K6UA 3PMWA 1NFTA 2XD2A 1OIBA 3O6HA 4EF1A 5CBSA 2HZLA 1LAFE 4G8MA 1US5A 3B7DA 2QS2A 3GXAA 2Q2AA 4H0WA 4DXBA 5A5XA 3M3FA 4H67A 4KI0E 3A3UA 2I6EA 1EZ9A 4GF8A 3MZ9A 1SVXB 3H03A 2H9BA 4F3SA 4BDNA 4GVOA 4IGTA 5FHNA 4ESWA 2D5WA 3QAXA 2V84A 2NVUB 3SEYA 1PBPA 2QRYA 2VGQA 5J1DA 3G3FA 4IY5A 2F97A 1ZIUA 2F6GA 2UVHA 3K6XA 3CFXA 5KCJB 2DE3A 4OEVA 3ONMA 1KWHA 5DTBA 1LAHE 3LR1A 4NF8B 4DXUA 1QKBA 3KJ7A 1B9JA 1OVTA 1UTBA 5CMKA 3PU5A 2LAOA 2B3BA 2NXOA 2I49A 1MXZA 4WEPA 3IR1A 5ELVA 1DPEA 3IOTA 1GTKA 3IORA 1B3FA 2UYEA 1PEBA 3FV1A 4R73A 1DSNA 4KFQA 1VSOA 1LB9A 2AL5A 4OXVA 1B2HA 4OVJA 3K6WA 5H8QA 2DVZA 4JSDA 4KHZE 4IGRA 4F1YA 1MH4A 2QMXA 3O28A 4R6HA 3DM0A 3W9VA 2AIXA 1JW5A 2OJTA 3EHUA 4R9GA 3K6VA 1OLAA 3QYTA 4F2QA 2F36A 3B6QA 3EPEA 1DTGA 3TFLA 3C35A 4GL8A 3O6IA 3IB0A 2VHAA 2HZKA 4Q30B 4AB5A 4PFTA 3FJ7A 4THIA 2XD3A 4U2RA 4R72A 5EYFA 3TCHA 3MP1A 4R2FA 3T9UA 3TODA 3JZJA 4Z0IA 3KJTA 3LSFB 3RT6B 4P0IA 3CFLA 4ZE9A 1GVCA 1ZTYA 1NNFA 3PUVE 4QFKA 3H7MA 1B7UA 2F5XA 5BWJA 3K0VA 1B3LA 5I2KB 3ECRA 1QULA 2I0CA 3FGSA 4F22A 4IO7A 5I57A 5FHMA 4LATA 1P1OA 4GQOA 4IO3A 3N26A 2VP1A 4TLMB 4ESXA 5F7VA 4FAJA 2ZYNA 1MS7A 1R9QA 4EQ7A 4GOTA 1A99A 2P2AA 5TPAB 1J1NA 1N7WA 4NE4A 1I6AA 3M3KA 4I62A 4GRKA 3TDJA 4F31B 3VXCA 1FW0A 4JSOA 5AA2D 1EZPA 2H4IA 2IEEA 1FCKA 1DOTA 5B70A 2Z8DA 2V3QA 1P1QA 5JTYB 3ZS6A 1MY3A 4LONB 1M5DA 1SYHA 4F39A 2XXYA 3KSJA 3S9NC 2OWSA 3IK6B 4XXUA 3DP4A 4OMBA 5L9OA 3MP8A 5FTIA 1LAXA 3RTWB 4F1UA 1AH5A 2PT1A 3MJNA 2PBWA 1MY0A 3ILUB 3CVGA 3OXNA 1FTKA 4RNSA 1FQFA 4Q8RA 2PYYA 4H8IA 4RA1A 3SKPA 5HPQA 3TYHA 1AL3A 1R9LA 3GZGA 2QPQA 1Y3QA 4KYDA 3RNNA 1MDP1 1FQDA 2DXYA 4KCCA 4NF6B 2V93A 1Y3NA 1OMPA 5KDTA 4AB6A 3LSLA 3CI8A 2I0BA 4YMBA 5CRYA 2HEUA 4ZEFA 3KSXA 1FQEA 1SW2A 4H65A 2HXWA 3OD7A 1B5HA 3T96B 4N6PA 2O6AA 4WXJA 3FXRA 5AE4A 4NEDA 1SYIA 3OMBA 4DCYA 3TTNA 1B46A 3E4RA 5H8NA 1FTMA 1R6ZA 4NWDA 3VXBA 3KZGA 2XXVA 2H25A 3KN7A 3PPPA 2DYXA 4LQ5A 4OFLA 4XKQA 1UIUA 3JV9A 3MZBA 3FUZA 3CG3A 1A8FA 1SI1A 2YLNA 3MBPA 2B65A 2XXTA 4IO4A 2DWAA 4G2ZA 4ZECA 2FYIA 4FEDA 1B40A 4KD5A 3FASA 1MPBA 3L6GA 2X7PA 3Q28A 1FTOA 4YKIA 1MDQA 3IO6A 3N94A 1QUJA 4ZEKA 2F7BA 3SEVA 1ATGA 2R9JA 1MQDA 1MY1A 2Y7WA 1BLFA 1H44A 2ESNA 3VDFA 2V3UA 3QSLA 4F19A 4PFYA 3QXMA 2DP8A 5CBRA 5FTHA 5KCJA 2AL4A 4FEBA 2ALUA 3FZVA 2FNCA 4R2BA 5K2XA 3O9PA 4OEUA 3SESA 5AA3A 4WKMA 3LUYA 5I84A 4YMAA 4DXCA 4NF8A 3PPNA 4MLQA 4M4GA 1Y4TA 3S9MC 3IB1A 2GFEA 2CZLA 3E9XA 1L5TA 2QSXA 4U1ZA 1RKMA 4LQ2A 3G3JA 4FIMA 1EZOA 1DPPA 3A09A 3FVKA 4HS7A 1IIWA 4MBPA 3SEUA 3OELA 4IY6A 2NWJA 3OSRA 3MVYA 4EQ9A 1Q1KA 2UYFA 3OO7A 3UORA 2OLBA 4KYEA 2M8CA 4KQPA 2PX1A 4BDRA 4F3GA 3AXFA 3UK4A 3O97A 1BP5A 3VLUA 4Z7EA 4LZ8A 1JW1A 3OO8A 2NOOA 3K4UA 3OENA 4XIGQ 4G4PA 4BDLA 2H98A 3U1OA 1A8EA 1QUKA 3N5LA 3BBRA 1O7TA 1B1HA 3VLVA 3PMXA 4TLLB 1USYE 3BKIB 3U92A 4FORA 3TQLA 4NTLA 3VVFA 2Z8FA 4ECFA 1LAGE 4U23A 5TP9B 1MY4A 3DELB 3I3VA 2O68A 2OBGA 5EHSA 3I5OA 1I6BA 2UVGA 3CSBA 3BFTA 2QS1A 5K2YA 1Y9UA 4FE8A 3RT8A 3V83A 3E3KA 3RY3A 4EUOA 3K1MA 4P11A 2DE2A 3PUWE 5I2KA 4BLAA 4GIZA 3C33A 5IAIA 3MPKA 2KLFA 3OO6A 4JB7A 3THIA 1FTLA 1ZJLA 4N13A 3HN0A 4ELOA 4MFIA 2ZYOA 5AA4B 5IKBA 3FVOA 4XKPA 5TPAA 3R7XA 4TQUQ
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LBYA 3U93A 5ITOA 3CHGA 1P1UA 1MRPA 3T9VA 3G7WA 4Q0CA 1BKAA 4NF5B 1NMUA 2ZNUA 2F7CA 3QMFA 4PQJA 3SETA 3V5AA 1I6QA 5DVFA 4N6DA 1DMBA 1UIVA 2XWOA 3P7IA 2QS3A 4N15A 5JTYA 2RF1A 4OENA 4JWXA 1Y20A 5DVIA 2DQVA 4NMYA 2F7AA 4IO2A 4FATA 2WKYA 2MKZA 3TKDA 3IJXB 4U21A 4I3YA 1ZBMA 1NI9A 4POXA 4JXIA 1UQWA 1LBZA 1TT1A 1ZKBA 1IZ1A 1LFHA 4LP2B 1SI0A 3PUXE 5I3SA 3S9LC 5J16A 4IR8A 4QFNA 3KBZA 2XXXA 1MXYA 2O1LA 4E0WA 4GBWA 4MHFA 4QSCA 3PUYE 2OWZA 4GWSA 4IB2A 1EH3A 5DT6A 3H6WA 5H8FB 4AQ4A 2I3WA 4H6DA 3UP9A 4NF6A 2VOZA 4ELRA 4ZS9A 4OHNA 4U22A 1MQJA 5CMBA 4FJPA 4OZ9A 4LZ5A 1YTVA 1ELJA 1YAEA 3MQ9A 3O2AA 3TEPA 2IA4A 2HAVA 3MVWA 1POTA 4C1UA 1O64A 4RY1A 3MC2A 4YAHX 3E13X 3FXQA 1MXVA 3W15C 3PV0E 3MW0A 1N04A 2XXRA 5EQ8A 1EYIA 5CMMA 3ZKLA 5LOMA 4X1BA 4XKRA 1MY2A 1B5IA 4YU0A 4U4XA 1CB6A 3USDA 5DW8A 4EXLA 1PB7A 1VFDA 1ZMGA 4LVQA 2ZYMA 4QF9A 1YPNA 4G68C 3KN8A 4IO6A 3VV5A 4NF4B 2PMSA 4U4SA 2PVUA 4ZZEA 4G77A 5KZTA 2O7IA 2ABHA 2A5TB 2XX8A 1Q35A 3JYRA 3GYYA 3RUMA 1A55A 1TXFA 4F3BA 3MWBA 3F11A 1IEJA 1ZU0A 4R6YA 3S4UA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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