1FTMA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with ampa at 1.7 resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftmA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftmA01
4EXKA 3GBAA 3D4GA 1SBPA 1FQCA 3FIRA 1OLCA 3SEXA 1B1HA 4OFLA 3OEMA 5I56A 4YKPA 4AQ4A 2OK2A 3OMBA 1D9YA 5H8HB 5ICTA 1Y3QA 4OEUA 4ZS9A 4XKNA 1ZU0A 3TCHA 2P0SA 3RT8A 3SERA 5CC2A 1CE2A 2DE4A 1VFEA 3QUJA 5JK4A 1DPEA 5FTHA 2XD2A 5IAIA 2XXVA 1LFHA 4ZE9A 4NF8B 5IKBA 1I6QA 1XOCA 1ZLQA 2UYEA 2DVCA 1CB6A 3KN3A 2G93A 3DP8A 1JW5A 4G2ZA 4JB7A 1B3GA 1S7YA 3S4UA 3F11A 4YKIA 4GFRA 2QRYA 3VV5A 3U94A 3SETA 2H99A 4OXVA 3B7DA 2H9BA 1A55A 3C32A 1L5TA 1POTA 4OQOA 2Q9TA 5I57B 3RY3A 4BDLA 4GL8A 5FHNA 1PBPA 1WVJA 3IB2A 3HPIA 4DZ1A 4P0IA 3I6VA 2G29A 3O66A 4GLIA 3IB1A 1MM7A 1B51A 4JBZA 2PBWA 3ONMA 4POWA 1MQIA 1I6BA 4G77A 4GXAA 1MH3A 3WAEA 1SW5A 2REJA 2B3FA 4LP2B 2DWAA 2HZLA 3S9LC 2W7YA 3TODA 3VXBA 1MY1A 2HCAA 5H8FB 1IITA 3O6GA 4NF5A 1QVSA 1SW1A 1QKAA 3IOWA 1MG1A 4K3FA 2Q2CA 4DXBA 1NH7A 1HSEA 3U93A 3TMGA 3LSLA 4H67A 4YMBA 2F97A 3C33A 2GHBA 1NL5A 2V3UA 1MQGA 1I6AA 2CZLA 1NNTA 4PP0A 1JEUA 4M1VA 5TPAA 3T9XB 2A5SA 3FGSA 3MP8A 2BJJX 2Z23A 1EH3A 3A3UA 1MXUA 4H1XA 3LSFB 4I1DA 3MC2A 4ZEFA 4JDFA 1SI1A 1JVYA 2H4IA 4P0GA 4YKJA 3FUZA 2PT2A 3CSGA 1BLFA 1MM6A 2PMSA 3LC8A 4OENA 2ALUA 3M8UA 3EPEA 1B3FA 3OSQA 3OXNA 1B4HA 1QUJA 5AA3A 4IGRA 4ELOA 1A8EA 3ZKKA 1JNFA 2VHAA 3EHSA 5J1DA 3MPKA 3VVDA 3K02A 1N76A 3KOSA 3C9HA 1F9BA 2I58A 3C35A 1Z7ME 5HM4B 2V93A 2XD3A 1JW1A 3C34A 4XXUA 2XX7A 4E0XA 4OTEA 4G4PA 3CIJA 5CBRA 1OQGA 3M3LA 4G68A 3HHGA 4NWCA 3EQ1A 1H3DA 2Y84A 4ZEBA 3FVNA 1GR2A 1B9JA 4QFOA 2I3VA 4OESA 2Q8JA 4BDMA 3H4ZA 4QFLA 1Y3PA 3K1NA 2A5TA 3BBRA 1LCFA 4GQOA 5L9OA 4H0WA 4NF5B 4KD5A 3PUVE 4RPOA 4ELQA 2ESNA 2YPNA 1MH4A 3EHUA 5CMCA 1M5CA 4FE8A 5F1QA 3QAXA 1FQFA 5CRYA 1XC1A 3MP1A 2Q88A 3UA8A 4DCYA 1VE4A 1Q1KA 1PB7A 3H3GA 4PQJA 1MXWA 1D9VA 4HS7A 2YLNA 2GFEA 1MY0A 2ZMBA 1GGGA 1SYIA 2RF1A 2ANJA 1OMPA 5AA4A 3DP4A 4IO5A 3V5AA 4OZ9A 2QS3A 1YTVA 3E13X 3EN3A 2Q2AA 4NEDA 1QUKA 1FQEA 1ZTYA 1UTHB 4RNSA 2O84X 4MH5A 4RY1A 2H98A 1DMBA 2F7BA 1PBQA 3N26A 1QUIA 4R2FA 2V3TA 2XXWA 1N3XA 3PPRA 1FTJA 2DE3A 1QJMA 4DIGA 2DWJA 1FTKA 1LGBC 1SYHA 4O3CA 1NFTA 3RNNA 4HW8A 1PB9A 2OZZA 4ND9A 4ZZAA 3S9MC 2KLFA 3N94A 4KCCA 1UIUA 1S50A 3MVWA 3BFUA 1A40A 1YCJA 3G3GA 3CG3A 4NF6A 5FTIA 3Q25A 4IB2A 4R74A 4R75A 4LZ7A 3IORA 2RCAA 3TDJA 2VP1A 3T9VA 5AA2B 3GLBA 1VFDA 3K0VA 2I4CA 5KCJB 3RQTA 5F7VA 5AA1A 2B3BA 4LA9A 3VE1B 3A09A 2HXWA 1EZPA 3OO8A 2XX9A 1Q35A 1MPCA 4F18A 2Y7IA 3IOUA 4BDQA 3FXUA 1ZIUA 4YZZA 3TCFA 4EQ9A 2Z8FA 3QYTA 4YAHX 4AB5A 1H44A 1H43A 2Z22A 4KCDA 2VGQA 5H8NA 1Y1ZA 3T66A 5JTYA 3OSRA 4G8HA 3KZGA 1LFIA 1B52A 1BKAA 3VXCA 1QULA 2OCUA 3MVYA 4KR5A 4OFJA 4IO7A 3TAJA 5AE4A 2H25A 3VVFA 2DS9A 4QSEA 3PUXE 3CFXA 3ECRA 2X7QA 5I2NA 3B6QA 4OYVA 3K4UA 3TYHA 2IEEA 3DLNA 1DOTA 5CMBA 3Q26A 3PUYE 2R71A 4TOZA 3G3FA 4DCXA 3OOAA 4FIMA 5L8DA 5DYHA 3KN7A 2ZNUA 4JSDA 4NF6B 2XHDA 4RJZA 1O7TA 3CVGA 5H8QB 1ZBMA 4F1VA 2UVIA 5L9MA 4BLAA 3MW0A 4N6PA 1TFDA 3RPWA 3OO7A 3GZGA 3PPNA 2AYSA 5DVFA 3WAFA 1H76A 1P1OA 1RYOA 2O7IA 4Z0IA 2DSFA 2ONSA 2ZXTA 4GRKA 4WEPA 4RPNA 2DWIA 3FVGA 1MQJA 4ESXA 4U1OA 4LVQA 4P11A 1VSOA 2DXYA 2AL5A 3O9PA 2HAUA 3PUWE 1Y4CA 4HCYA 3HN0A 4RK2A 3IOVA 3W9VA 4PFYA 1MXYA 4PETA 4KYSA 4LUBA 1XT8A 2OLBA 2UVJA 3JYRA 1PC3A 4UACA 5HPQA 1FTOA 3DELB 1Y4TA 2AL4A 1SQYA 3USDA 2RCBA 1S9TA 4OEVA 1R6ZA 5TP9A 3TKDA 3S2VA 4FEBA 4DE8A 2XXPA 3OEKA 1LB8A 1LAFE 1MY2A 2QS1A 1A99A 3KJ7A 1B2HA 1Z7NE 3OO9A 2I6EA 3HV1A 4C1UA 4IY5A 2THIA 5I2NB 1BTJA 4LQ5A 2XXUA 4ZEKA 1D3KA 5DEXA 2CMOA 2QJEA 4X1BA 1P1UA 1LB9A 2PT1A 1MPDA 3N5LA 3H7MA 3KG2A 4H8JA 2O6AA 1B7ZA 5ICQA 4EDPA 1B5JA 2F7CA 4O3AA 5I56B 1B1XA 2QPQA 4ZDMA 1PEBA 3P7IA 2ZNTA 1RYXA 3R7XA 3T96B 1GVCA 1MDP1 4FATA 3W9WA 3K6WA 2B65A 4PE5B 3IJOB 4L17A 3TTNA 3PV0E 2FA7A 4YMAA 2I4BA 1P1NA 1DTGA 4U1ZA 1DPPA 4BDOA 1HSJA 2Q89A 2VD3A 4GIZA 3CR9A 3QXMA 3PMWA 4DXCA 1LSTA 1POY1 4Q0CA 1USYH 3H6TA 2ZYKA 3Q27A 2M8CA 2XXHA 4YICA 3CG1A 1JETA 2X26A 5AA2D 3FVOA 3O6IA 1IXHA 3TTLA 3MJNA 2ZNSA 3K1PA 4NE4A 5K2YA 2HEUA 2D3IA 5TP9B 3MUQA 1ZKBA 3GXAA 1FQAA 3VLUA 4X1DA 5I2KA 3IO6A 3OD7A 2O51A 4M4GA 3H6UA 3TELA 2REGA 3FXQA 5ELVA 4EF1A 1LBBA 2GHAA 1LBCA 3ZS6A 1IXCA 3IO4A 3QIMA 4U21A 3MZ9A 3PD9A 2QSXA 5I84A 3L6HA 4ONYA 1YPNA 4F1YA 4F31B 2GH9A 1OVTA 2NXOA 4ELRA 1TT1A 1J1NA 1XVXA 4YB5A 3MQ9A 3H6WA 1A54A 5DTBA 4RXLA 1IEJA 3FVKA 1JW4A 1II5A 1R1NA 1I69A 2PYYA 2XXRA 4U4SA 1Y1MA 5BWJA 1PDAA 4PFUA 3TZAA 3U8QA 1MS7A 4NMYA 3FD3A 1USYE 4IO2A 1B3LA 1B3HA 4NF4A 5I59A 1M5DA 1IQ7A 3FJGA 5EHSA 1M5EA 4U23A 3O2AA 4GOTA 3TEPA 3CFLA 4Z7EA 3K6VA 3Q28A 4HCWA 5TPAB 4U2RA 1QW0A 4ZZEA 5HBCA 5A5XA 2VOZA 5DT6A 3IL1B 3U72A 5FHOA 1FW0A 3HSTA 3KSJA 3KN8A 4C1TA 3W15C 4Q5TA 2HQ0A 3G3JA 2OJTA 1O64A 1N0TA 2PVUA 4F1UA 5FHMA 5I2KB 1B7UA 2FNCA 3K00A 2DVZA 2RC8A 3T22A 5CMKA 3C4MA 3SKPA 2R9JA 1FTLA 3ZSFA 2RKMA 3O6HA 4UA8A 2RINA 3HHFA 2DQVA 4MFIA 1TWYA 4I8CA 3G3HA 1EZ9A 5H8SA 4OVJA 3R6UA 1B4ZA 4R2BA 3KBRA 1URGA 4G8MA 1PB8A 3V8XB 4EF2A 3MP6A 4G68B 1B40A 4GD5A 4FEDA 4N07A 3UORA 4LONB 4WEDA 3MPLA 3MVXA 3T9UA 1QKBA 2NWJA 1IUDA 4H5FA 3RGYA 2HAVA 4EXLA 1MY4A 3ZKLA 4I9DA 2A5TB 3VLVA 1ZMGA 4TLLB 1TFAA 1OLAA 5L9SA 4R6YA 3KEIA 3U1OA 3FJMA 5H8HA 3KFMA 1B32A 1MRPA 4YB7A 2Y7PA 1MQDA 4I62A 3IAZA 3KSXA 4DDDA 4AB6A 3M3FA 3FZVA 4TLMB 4IY6A 3ODBA 3K01A 3TQLA 5B7DA 4H8IA 3VFJA 2OWSA 3CFZA 4JSOA 5A5XB 5AA4B 3UIFA 2E0SA 1ZJLA 2DOJA 1VR5A 1B0HA 3IB0A 1SI0A 3I3VA 1XHYA 2IA4A 2I49A 2WKYA 1H45A 3S9NC 3IJXB 1N84A 3H6VA 2ZYOA 1B6HA 2I0BA 3FV2A 2XXYA 1GTKA 4KYDA 3S9EA 3TTRA 3TFLA 1MQHA 2Y7KA 3RT6B 4QFPA 1Y3NA 3E4RA 3KJTA 4F3SA 2Y7WA 4LZ5A 4R9FA 4QSCA 3G3KA 5I57A 2Z8DA 3KGCA 5CBSA 2D5WA 2F78A 3RTFB 2ABHA 1TXFA 5KZTA 3IX1A 3PPQA 3N6TA 5I58A 1BIYA 3T9HB 1WODA 1EZOA 2ZYNA 4ISUA 3TPAA 2D21A 2QS2A 4C0RA 3G3IA 4GVOA 4IO6A 2DXRA 4R6KA 1NNFA 4F2QA 4N13A 5H8FA 2F6GA 3PU5A 3V83A 1IXIA 1EU8A 3CSBA 3SEVA 1MY3A 2I3WA 3UN6A 3C31A 1P1WA 4OERA 1URSA 4QHQA 5H8NB 4DXUA 3ILTB 1NKXA 3RN8A 5JTYB 4F29A 4ZEDA 5CI5A 3OENA 1B05A 3U92A 2I48A 4IO4A 1SW4A 5JEIA 1AH5A 1M5BA 3TQWA 1OQHA 4F3BA 1JVXA 2DYXA 1N3WA 4U4XA 2E1SA 4EQ7A 1MXVA 5TU0A 2V84A 4LQ2A 2ONRA 3N6UA 1HSLA 2NOOA 4MBPA 2NUVA 3G7WA 3PMVA 3K6UA 1DSNA 3LUYA 3MVZA 3K1MA 4QSDA 1GV8A 3SDFA 5I58B 5DVJA 1OIBA 4POXA 3RUMA 2X7PA 4YB6A 4OHNA 3QSLA 3EHTA 4YU0A 1JQFA 4PFWA 2XXQA 1A7LA 3CI8A 3Q29A 4XKRA 1T0KA 2F5XA 3O97A 4OFOA 5K2XA 1BP5A 3THIA 1ANFA 4QRZA 3LSWA 1P1QA 4GWOA 5EHMA 2QL3A 4G8NA 2R6GE 4LZ8A 4R73A 3PGFA 5KDTA 2DP8A 4GXSB 4DLDA 1FCKA 3ILUB 4X9TA 2XX8A 1R9QA 4IGTA 1SDXA 3E3KA 4RK9A 4NTLA 3IK6B 4WKMA 3FXRA 2QMXA 4YKKA 4JWXA 4THIA 4ZECA 3MWBA 1LAGE 4ZEIA 4F3GA 2F7AA 4KHZE 4ZE8A 4QFNA 3VDFA 4EQBA 4KYEA 4U22A 2UYFA 2UVGA 4JWOA 1UTHA 1IIWA 3RLFE 2O7UA 4PFTA 2PX1A 1YAEA 2F34A 2XXIA 4EUOA 4GF8A 1IZ1A 3M3KA 5DEXB 3SEYA 2FYIA 4ECFA 3AXFA 3TUSA 3SESA 1B58A 2OBGA 1MXZA 3MAMA 1M5FA 4Q30B 1O63A 2RC7A 3TTMA 3SEWA 1B0LA 3MZ1A 4H65A 2ONKE 1US5A 3IR1A 1KWHA 1P99A 2F35A 4R6HA 3PPOA 3LR1A 1LAXA 3IOTA 4F2OA 4FORA 2GRVA 5CMMA 3KOTA 4F39A 3HO7A 4OWDA 5AA2A 4MLQA 3DP6A 1Y9UA 2NVUB 1FQBA 2O1LA 5KCJA 3MZBA 1NNKA 4GL0A 3TCGA 4G68C 3JV9A 2LAOA 2P1SA 4OETA 4LATA 3PPPA 5KDTB 4X48A 3T93B 4NWDA 4F19A 3VVEA 5ITOA 3FATA 3FASA 4WXJA 4O3BA 4TQUQ 3BKIB 1NH8A 4XTCQ 2V25A 3HCQA 4FECA 3L6GA 1B5IA 3H06B 2QS4A 3R26A 4JWYA 2UVHA 2Z8EA 4KI0E 1B5HA 1DTZA 1AL3A 3H03A 2H5YA 3B6TA 3JZJA 1WDNA 4F3PA 1LFGA 1UTBA 3K2DA 5CM6A 3PMXA 3UGWA 1RKMA 1FTMA 2DWHA 1A8FA 1ATGA 2O69A 2HZKA 3BFTA 4MF3A 4ESWA 2O1MA 2Y7RA 2QMWA 4JXIA 4BDNA 1MDQA 1D4NA 3A3CA 1FQDA 1N7XA 4XKPA 3QK6A 3RTWB 4FJPA 3V89B 3EF7A 4FAJA 3K6XA 3D4CA 3FJ7A 3MBPA 3DM0A 3LSXA 1AOVA 3PUZE 2XXTA 1LAHE 4Q8RA 4MLVA 5H8QA 3C36A 3O28A 4QF9A 3SEUA 2F6PA 1NMUA 4R9GA 4NF4B 4H6DA 3GBBA 5I59B 5LOMA 1SW2A 4IO3A 4QFKA 1Y20A 3FV1A 3QUFA 4HTGA 3B6WA 1NNPA 5ITPA 4ELPA 2ZYMA 1AIVA 4XIGQ 1JEVA 2OWTA 5EYFA 3TTKA 1SVXB 4OMBA 4NF8A 4KPTA 1UIVA 2F36A 3LBSA 1MPBA 5ISUA 1XS5A 4KFQA 4XKQA 4R72A 2XXXA 4E0WA 4H5GA 4RYAA 1XVYA 2UXAA 3OO6A 1MXXA 4BDRA 5B70A 4RA1A 3E9XA 2DE2A 3CRBA 3O29A 1UTBB 2F8DA 1IXGA 1AMFA 3UK4A 2HFBA 2I0CA 1ELJA 3VLWA 4KQPA 2O68A 2P2AA 3PD8A 5M2VA 1URDA 1N04A 1B7HA 1US4A 1B3EA 1LCTA 2RC9A 3OELA 3UP9A 5DVIA 2AIXA 1UQWA 3I5OA 2YJPA 2VD2A 2V3QA 1R9LA 1N7WA 1LLSA 1OVBA 1B46A 1SD3A 5BUUA 4F22A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4EXKA 3GBAA 3B50A 1SBPA 1FQCA 3D4GA 1OLCA 3FIRA 4OVPA 3SEXA 1B1HA 4OFLA 3OEMA 5I56A 4YKPA 4AQ4A 2OK2A 3OMBA 1D9YA 4N6DA 4OVQA 2Q74A 5H8HB 1IMAA 4LN5A 5ICTA 1Y3QA 4OEUA 4ZS9A 4XKNA 1FBEA 1ZU0A 2P0SA 3RT8A 3SERA 3TCHA 5CC2A 1IMFA 1NV4A 1CE2A 3MYUA 2DE4A 1VFEA 2JJKA 3QUJA 1FPGA 5JK4A 1DPEA 4NX1A 5FTHA 2XD2A 5IAIA 2XXVA 1LFHA 4ZE9A 4NF8B 5IKBA 1IMCA 5I3SA 5A5LA 1I6QA 1XOCA 1ZLQA 2UYEA 1FPIA 2DVCA 1CB6A 3KN3A 2G93A 3DP8A 1JW5A 3KC1A 4G2ZA 4JB7A 1B3GA 1S7YA 3S4UA 3F11A 4O7IA 4YKIA 4GFRA 2QRYA 3VV5A 4IR8A 3U94A 3SETA 2H99A 4OXVA 3B7DA 2H9BA 1A55A 3C32A 1L5TA 5BUUA 1POTA 4OQOA 2Q9TA 5I57B 3RY3A 4BDLA 4GL8A 5FHNA 1PBPA 1WVJA 3IB2A 3HPIA 4DZ1A 2CZKA 4P0IA 3I6VA 2G29A 3O66A 4GLIA 4GX6A 3IB1A 1MM7A 1B51A 4JBZA 2DDKA 2PBWA 3ONMA 4POWA 1MQIA 4H45A 1I6BA 4G77A 3ISPA 4GXAA 1MH3A 2VPNA 3WAEA 1SW5A 2REJA 2B3FA 4LP2B 4N8GA 2DWAA 2HZLA 5IZ3A 3S9LC 2W7YA 3T1BA 3TODA 3VXBA 1MY1A 2HCAA 5H8FB 1IITA 3O6GA 4NF5A 1QVSA 1SW1A 1QKAA 3IOWA 3A29A 1MG1A 4K3FA 2Q2CA 4DXBA 1NH7A 1HSEA 3U93A 3TMGA 3LSLA 1QGXA 4H67A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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