1FTMA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with ampa at 1.7 resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftmA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftmA01
4LATA 2ABHA 4KQPA 5KDTA 3V5AA 4XIGQ 4FIMA 3K1PA 2ZXTA 3G7WA 2HZKA 1I6AA 3EHSA 5ELVA 3OOAA 4QSEA 5FHNA 2ONKE 1D4NA 1MRPA 5CMBA 1B5IA 2ESNA 2PVUA 3LSWA 1TWYA 1B3HA 4QFLA 2ONRA 3MVXA 1JETA 3TTLA 4KYDA 1B0HA 4LVQA 1MS7A 3PUVE 5H8NB 5LOMA 2NVUB 1Q35A 1B3EA 5EYFA 3HV1A 4GF8A 2I3WA 1KWHA 1S9TA 2O1LA 2HXWA 1XVYA 3TDJA 1FTMA 3QIMA 1QVSA 4ZEFA 3UIFA 4F1VA 3V83A 5TPAA 3FJ7A 1LGBC 4BDRA 4EQ7A 2DWJA 3MUQA 1GV8A 1Z7ME 5DT6A 4OEVA 1ZLQA 3RY3A 1UTHB 4YAHX 1TXFA 3TTNA 4YKPA 3CSGA 3TCGA 4U1OA 2O69A 4KI0E 2QL3A 1VFEA 3N5LA 4JWXA 1MDP1 1JVYA 2R9JA 3OO6A 3GBBA 2PYYA 3CSBA 3ILTB 1H3DA 4OZ9A 2FNCA 2G29A 2ZYOA 5DEXA 4NF8B 2R71A 3QXMA 2THIA 4FEDA 1IEJA 4YMBA 3Q27A 2Q89A 4X9TA 4R2FA 4OVJA 2AYSA 2DWIA 5BUUA 3K0VA 4R72A 2F5XA 1MH4A 1UQWA 4O3CA 3RN8A 1GTKA 3SEVA 1WDNA 3KSJA 3U93A 1OLAA 5DYHA 1DOTA 4KFQA 4ZDMA 1UIVA 3G3JA 1LAGE 3H3GA 4N07A 3PGFA 3CIJA 4EDPA 4TLLB 4F3PA 1SW5A 1VSOA 3MVZA 3PUYE 2QS1A 3EPEA 3MZBA 1EH3A 4ND9A 4GWOA 4H1XA 3C9HA 2V84A 1DSNA 4G8NA 4G68A 5I2KB 4Q30B 1N3XA 4RYAA 4OYVA 3RT6B 2DYXA 5KDTB 4R75A 1ZTYA 3VE1B 2QSXA 2Y84A 1QUKA 3BFUA 1Y1MA 2F7BA 2I4CA 3B6WA 5CMKA 2BJJX 1R9QA 3DM0A 4LZ5A 1Z7NE 4IGRA 4EF1A 3KFMA 2V25A 1YPNA 2UVHA 1FW0A 2REGA 2XXRA 3O2AA 3VLUA 3TUSA 1VE4A 2YLNA 3FUZA 1I69A 3IK6B 2FA7A 2RC9A 2GHAA 1VR5A 5H8QB 3OSQA 1OMPA 2X7QA 4EQBA 4R73A 3TKDA 5I2NB 4U22A 3RNNA 1Y3QA 4YB6A 3S4UA 3QAXA 4ZECA 2O6AA 3UN6A 2Z8FA 2QJEA 1PB9A 2QPQA 2XXQA 3W9WA 5TPAB 5H8HA 4RXLA 4LQ5A 3ILUB 3E9XA 3IJXB 5K2XA 5F1QA 1B7UA 1OIBA 3KZGA 1GVCA 2UVGA 4G77A 3GBAA 3K6VA 4IO6A 2V3QA 3TTKA 1NMUA 1FTOA 1A55A 3FJMA 1PEBA 3LUYA 1MQGA 4ZEKA 3PUWE 3HO7A 3H7MA 4R6YA 3H6TA 2RKMA 4BDMA 1URGA 3VXCA 1H44A 2HFBA 1NNKA 3OMBA 3FV2A 3T9UA 5DEXB 5ICTA 4IY5A 4KHZE 5L9SA 1SBPA 2X7PA 3B7DA 2F34A 3MP6A 1FCKA 2D3IA 1URSA 1O7TA 2XXUA 1MXUA 4I62A 1MDQA 1QKBA 2DWAA 3FVGA 2F35A 4Z7EA 4F19A 5AA4A 2XXHA 4RK9A 3A09A 3DP8A 2LAOA 2DQVA 1R6ZA 4IO7A 4GOTA 4G68C 3O28A 3TCHA 1QUIA 2OCUA 3FJGA 4MBPA 4H65A 3PPOA 1A8FA 3QUFA 2O84X 2DE2A 4U4SA 3CI8A 1WODA 1MQIA 3L6HA 5TP9A 3K6WA 1B51A 2Y7KA 1P1WA 4DE8A 4JBZA 5I57B 2ZYKA 1NL5A 3CR9A 3K02A 5CRYA 5CBRA 1ZKBA 2UYEA 4LA9A 2VGQA 5KZTA 3Q25A 1Y20A 3C34A 1PB8A 2PT2A 4ZE8A 2XD2A 3UK4A 3E13X 3MZ1A 1B40A 3KN8A 4WXJA 4U21A 1QW0A 3VVDA 2OWSA 3OO8A 3PMXA 1Y9UA 4I8CA 1MY3A 1B46A 1A99A 4QFOA 4DIGA 1PB7A 1SDXA 1LBBA 3GLBA 1B4HA 3OEMA 3CFLA 4YZZA 3IR1A 3SERA 4NTLA 3KOSA 3SDFA 2VD2A 2ONSA 2V3UA 3HCQA 2H25A 3MW0A 5ITOA 1P1UA 5DTBA 4GRKA 3L6GA 3D4GA 4NF6A 5H8HB 5JTYB 5IKBA 4QFKA 3KJ7A 3T22A 3TQWA 1NNTA 5I56A 5JEIA 5DVJA 5F7VA 3SEYA 4M1VA 3U72A 4C1TA 1UTBA 3T66A 4ELPA 5AA2A 2I49A 4I9DA 5H8FA 3PD8A 3JYRA 3MVYA 1FQBA 1GGGA 4FE8A 5CMCA 2XXVA 4ISUA 4F22A 1XT8A 5I59B 4LP2B 2XX9A 4F18A 1IXCA 1WVJA 3LSFB 1B3GA 3A3UA 4O3AA 1EU8A 3WAEA 2OLBA 1NNPA 2QMXA 2Z8EA 4KYSA 3VLVA 2ALUA 1MXXA 3B6QA 4BDLA 4H5GA 2VD3A 3F11A 2RCAA 4PETA 5FTHA 3TODA 3K01A 2GRVA 3T96B 1H76A 1SI1A 4NMYA 1XHYA 4NF5A 1MQJA 3ZKLA 3RGYA 2XX8A 3FD3A 3CFXA 1B7ZA 4P0IA 3IAZA 2AL5A 1LAHE 5JK4A 1LB9A 1II5A 5TP9B 1LAFE 2QS4A 4MH5A 1PDAA 2A5TA 1FQCA 1B9JA 3PUZE 3KG2A 1SW2A 3PD9A 3IO6A 3LSXA 3OENA 3C36A 4KD5A 3S9MC 1FQEA 4F29A 4XXUA 2DOJA 2E1SA 4ZE9A 3FZVA 4IB2A 4NE4A 4LZ7A 3SKPA 1J1NA 3PU5A 1PBQA 3TCFA 4FORA 3VV5A 4DCXA 4YICA 1LCFA 3K1NA 2QS3A 1B0LA 4ZEIA 1P1NA 3G3FA 4I1DA 3FXUA 4H67A 1B3FA 4YKIA 1P99A 2F6GA 5AA3A 5ISUA 2AIXA 2ZMBA 3MZ9A 3IOVA 4E0WA 4POWA 3LBSA 3N6TA 1M5CA 1B5JA 4OESA 1DTZA 2G93A 4LZ8A 1UIUA 3HSTA 5KCJA 3O29A 5EHSA 3TQLA 4QRZA 1MY2A 4IO2A 3RT8A 2HQ0A 1OQGA 4KYEA 1LBCA 1GR2A 4ZZAA 1N0TA 4QSDA 3VLWA 2O68A 3H4ZA 5AA2B 1B7HA 5HM4B 1HSLA 1ELJA 3VDFA 2VHAA 2DVZA 4ONYA 3N26A 4KPTA 3FIRA 1FQAA 4YKJA 1ANFA 5FHMA 2QRYA 3QYTA 3TZAA 5L8DA 2I0BA 1DTGA 1AOVA 1B4ZA 3RLFE 3OD7A 3OSRA 1IZ1A 1B1HA 2XXXA 1MPDA 3CRBA 4R6KA 1LLSA 3P7IA 1F9BA 1LCTA 1B52A 3QUJA 2Q8JA 4OFOA 4BDNA 1SW4A 4YB7A 4OFJA 4U2RA 3MP8A 4TQUQ 4GXSB 3GZGA 4P11A 2O1MA 2Y7WA 3W15C 5AA1A 4ECFA 4ESXA 3TTMA 2ZYMA 4EXLA 3SETA 2NWJA 5HPQA 3T9HB 4NF5B 2UVJA 3PPQA 4DZ1A 2HAVA 3BFTA 4XKRA 3QK6A 1YTVA 1DPPA 4MFIA 3H6WA 3FATA 2M8CA 4EQ9A 3FASA 2I58A 4H0WA 1SD3A 1NKXA 4RNSA 4YMAA 2REJA 1MQHA 5L9MA 3EN3A 4GD5A 1M5DA 3MVWA 3ZKKA 4FJPA 1PBPA 2V93A 3MQ9A 4OWDA 4H5FA 1RYOA 1TFDA 5ICQA 4JSOA 2XXPA 3IO4A 1USYH 3O66A 3ONMA 4FECA 2NUVA 5I84A 1M5BA 2OZZA 1OLCA 3RQTA 3CG1A 2RCBA 4R2BA 3H06B 4QHQA 4BDOA 3M8UA 3RUMA 3EHUA 1BTJA 3FVNA 1IXHA 3LSLA 1NH8A 5CC2A 4GXAA 3H6UA 3SEWA 4DLDA 5KCJB 1Q1KA 4C0RA 1MXYA 3S9NC 3ECRA 3T93B 2RF1A 2ZNTA 5H8SA 2YJPA 2XXIA 1XC1A 2DVCA 4JDFA 3LC8A 1NFTA 3DLNA 4MLVA 1POY1 1IQ7A 3D4CA 4DXUA 2H4IA 3A3CA 1JW1A 3IORA 1XOCA 4XKNA 2O51A 1B6HA 3UORA 4F3BA 1A7LA 3FVKA 1JVXA 2YPNA 2A5SA 2AL4A 4G68B 4P0GA 1XS5A 1S50A 1O63A 2F6PA 4GL0A 2F78A 4ELOA 4HW8A 4OXVA 4F31B 5ITPA 3G3IA 3PPPA 2W7YA 1UTHA 4WKMA 3R7XA 3KEIA 1QKAA 2VOZA 4NEDA 2QS2A 3H6VA 1N3WA 1B1XA 3S2VA 1AH5A 1P1OA 4FEBA 4X48A 2O7IA 5AE4A 4ZEDA 4R74A 3SEUA 1IIWA 2DXYA 4JWYA 3WAFA 2XHDA 3C31A 3TPAA 4E0XA 1JNFA 2QMWA 1S7YA 1MM7A 1HSEA 2D21A 4UACA 4AQ4A 3BKIB 2PMSA 2GHBA 4ESWA 1MM6A 3C4MA 3ZSFA 1LB8A 1Y4CA 4QSCA 2ZNUA 2F8DA 1OQHA 4Z0IA 4F1YA 3SESA 1M5EA 2DE4A 1I6QA 1SW1A 4MF3A 2P1SA 3ODBA 2CZLA 3EHTA 4HS7A 1YAEA 1URDA 3K00A 4IO5A 1A40A 5DVFA 3B6TA 4TOZA 4EXKA 3PMVA 1JQFA 3IB1A 1ZIUA 2Q2AA 1O64A 5BWJA 4F1UA 1MY4A 3ZS6A 1P1QA 3HPIA 3PPNA 4G8HA 3MJNA 1B2HA 3PPRA 2UVIA 5AA4B 4Q0CA 3O9PA 3FV1A 4H8JA 5CMMA 3KGCA 1YCJA 5HBCA 1H45A 1N04A 3UGWA 1CB6A 1FQFA 1L5TA 3M3FA 3I5OA 3MBPA 4GVOA 3MAMA 2IA4A 4G4PA 1TT1A 1QULA 3G3GA 2DXRA 3VVEA 1MXVA 3UA8A 1B3LA 4OEUA 5CI5A 4RA1A 5H8QA 1MXZA 3GXAA 1AMFA 3UP9A 4OQOA 5I2NA 3E4RA 1MPCA 3KOTA 3U8QA 1BKAA 2B3BA 1POTA 3K4UA 4Q5TA 1NNFA 4YB5A 1LFGA 1OVTA 1USYE 2P2AA 2HCAA 5J1DA 1VFDA 1LFIA 3TFLA 4ZS9A 1CE2A 1SYIA 5AA2D 1XVXA 4F2QA 4IO4A 2OWTA 5IAIA 1MPBA 1SVXB 4GIZA 2UXAA 1D9VA 1HSJA 5M2VA 3RPWA 3M3LA 4PFYA 4JWOA 3I3VA 3RTFB 4H8IA 3MWBA 2F97A 4OETA 4AB5A 3S9EA 3R6UA 2V3TA 1IXIA 4R9GA 1EZOA 4X1DA 3HN0A 4OENA 1BLFA 4NF6B 3IOWA 1SQYA 4ZZEA 4OFLA 3RTWB 4PQJA 1US5A 4HCYA 1N7XA 2DP8A 4ZEBA 1EZPA 4PFUA 4RPOA 2OJTA 5I56B 5A5XA 4LUBA 4TLMB 4LQ2A 1MY0A 4EUOA 3K1MA 1B5HA 1DPEA 2R6GE 1UTBB 5K2YA 1JW4A 5H8FB 1ZBMA 2XXWA 1EZ9A 1A54A 3V89B 1ZU0A 3FXQA 1QJMA 4R6HA 3R26A 2I6EA 4FAJA 1SYHA 4U4XA 5I57A 4NF4A 3HHGA 1H43A 3TYHA 3O6IA 5FTIA 3OO7A 1AL3A 4KCCA 3FXRA 3K2DA 4BDQA 3USDA 4AB6A 1IUDA 1ATGA 5I58A 3IL1B 3TELA 4N6PA 2E0SA 2XXTA 1Y3NA 4PE5B 4F2OA 2RC7A 3OEKA 1ZMGA 2HZLA 2Y7IA 2B3FA 3VVFA 3HHFA 4G8MA 2OBGA 3OO9A 1FTKA 2A5TB 2GFEA 4YU0A 4OHNA 4OMBA 2Z23A 3KBRA 2H99A 3FGSA 1B32A 3K6UA 4RJZA 3AXFA 3TAJA 2HAUA 3MPKA 4GQOA 3VXBA 5EHMA 1Y1ZA 5JTYA 4HTGA 4K3FA 3IX1A 3K6XA 4RY1A 4R9FA 3H03A 3QSLA 1BP5A 2ZNSA 5TU0A 1T0KA 4WEDA 1NH7A 2IEEA 3JV9A 1ZJLA 4XTCQ 1RKMA 4HCWA 2DS9A 3DELB 3IB0A 1MY1A 3CG3A 3THIA 5L9OA 3LR1A 3Q28A 4IGTA 1IITA 3OELA 4ELRA 3IJOB 1R1NA 3IOTA 4PFWA 2B65A 4G2ZA 3KJTA 3KSXA 4LONB 2RC8A 4POXA 2VP1A 2Y7RA 3C33A 1RYXA 4U1ZA 5I59A 1N84A 2PT1A 1JEUA 3CFZA 3U92A 2WKYA 2RINA 3TMGA 2F7CA 2I3VA 4QF9A 4O3BA 1Y3PA 2F7AA 1MQDA 3PV0E 1OVBA 4X1BA 4Q8RA 2O7UA 3N94A 1SI0A 1MG1A 2XX7A 5FHOA 2I48A 1M5FA 4U23A 3S9LC 1D9YA 1B05A 4F3GA 4DDDA 3EQ1A 4NWCA 4XKPA 4DXCA 3BBRA 4KR5A 5A5XB 2FYIA 3DP4A 3N6UA 3I6VA 3W9VA 4YKKA 3T9XB 3C35A 4RK2A 3Q29A 1B58A 4NWDA 4PFTA 1IXGA 1JW5A 2OK2A 3O6GA 1FQDA 2Z8DA 1FTLA 4JB7A 3PUXE 3U94A 1TFAA 2P0SA 5H8NA 4IY6A 1Y4TA 2XD3A 4OERA 2Z22A 3O6HA 2D5WA 4DCYA 4NF4B 2XXYA 2Q88A 4JXIA 4C1UA 4FATA 2I4BA 2KLFA 5I58B 5CBSA 3G3KA 1AIVA 1US4A 4IO3A 5CM6A 4ELQA 4N13A 5B7DA 2ANJA 2Q2CA 3IOUA 4KCDA 3C32A 3Q26A 3V8XB 4PP0A 2Q9TA 1LAXA 4QFPA 3SEXA 5B70A 3PMWA 4M4GA 1MXWA 1LSTA 3DP6A 4GL8A 2NXOA 4F39A 2DSFA 4NF8A 3O97A 2H5YA 4MLQA 3E3KA 1N76A 3FVOA 1BIYA 3T9VA 1D3KA 1PC3A 3EF7A 1A8EA 2H98A 3CVGA 2UYFA 3TEPA 2X26A 4L17A 4THIA 3IB2A 5DVIA 1MH3A 1LFHA 3G3HA 2PBWA 2F36A 3OXNA 1FTJA 2DWHA 4RPNA 2GH9A 3JZJA 3MC2A 3U1OA 3KN3A 4DXBA 1JEVA 3MP1A 2Y7PA 2HEUA 4F3SA 4QFNA 2DE3A 4WEPA 4JSDA 2ZYNA 1N7WA 4GLIA 2I0CA 4OTEA 2H9BA 3VFJA 1QUJA 4EF2A 3MPLA 3KN7A 4XKQA 4UA8A 3TTRA 1I6BA 3M3KA 2NOOA 4H6DA 2CMOA 5I2KA 2PX1A 4BLAA 1DMBA 1R9LA 4GFRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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