1FTMA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with ampa at 1.7 resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftmA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftmA01
3A3CA 5CM6A 5H8HA 1IUDA 1URSA 1IXGA 2H98A 3CFXA 1N76A 3H4ZA 4FECA 1F9BA 3KOSA 5L8DA 1LB9A 1A54A 4P0IA 4YB7A 4JSOA 3PU5A 1OLAA 4JB7A 1QKAA 4NF8B 5H8NB 4LZ5A 5A5XB 2Y7PA 1MH3A 5F7VA 1YCJA 1GV8A 1B2HA 2XXPA 1D9VA 4OFOA 3KBRA 4ZS9A 1SDXA 2GFEA 4EF1A 1B3EA 4PFWA 1QW0A 3IOWA 2XXYA 4OFLA 4YU0A 3BFTA 1EZPA 1VSOA 2Y7RA 2RINA 1SD3A 4RY1A 3EF7A 3FJ7A 4QF9A 4ONYA 1M5BA 3KOTA 3GBBA 3R6UA 1HSLA 3MPLA 2PBWA 2NVUB 5TU0A 3KN8A 1FTOA 4LATA 2F34A 4KCCA 4AB6A 4QFLA 3O2AA 3N6UA 3TODA 1NNKA 4U4XA 1XVYA 1B40A 4ELQA 4FAJA 4F31B 1XC1A 3PGFA 3C33A 2RC9A 2UVGA 2BJJX 2V25A 4GD5A 1MPDA 2F6PA 4OYVA 1Y3PA 4PETA 1UTHA 3PUZE 3FXQA 1AIVA 3W9VA 1AMFA 2PT1A 3OSQA 3EN3A 5CC2A 1CB6A 1BIYA 3MVZA 3FD3A 4M1VA 4NF5B 4BDQA 1B52A 3D4CA 4POXA 1QUIA 3VVEA 1NNFA 4RPOA 4NWDA 2Z8FA 1B3HA 2QS2A 4X9TA 1ATGA 2H5YA 1ELJA 3K00A 4OESA 1SW2A 3O29A 1FQDA 3H06B 4BDNA 5ISUA 2DYXA 4GL0A 3OD7A 3VLWA 3IAZA 2HZLA 3WAFA 3OEKA 4F3BA 3HPIA 4YMAA 2UVIA 2F97A 3SEYA 3R7XA 4OVJA 1POTA 4N6PA 1A99A 3AXFA 1LSTA 2P2AA 3S2VA 1URGA 3ZSFA 1UTBB 4G68A 1JQFA 4POWA 3QUFA 4AQ4A 1MM6A 4F3SA 3RPWA 1US5A 3IJOB 2I58A 3OMBA 4QSEA 4KI0E 3B7DA 5DVIA 1MXUA 1MH4A 4KD5A 2RC7A 1Y4TA 4O3CA 2AL4A 4G2ZA 4ESWA 2Z22A 3Q26A 5B70A 4YMBA 3C9HA 2D3IA 1NKXA 2ZNUA 1POY1 3K6WA 1UIUA 4XKQA 1H43A 4EQBA 3VDFA 4QFPA 3HSTA 3IB2A 1OQHA 3FVGA 2OZZA 2REGA 1HSJA 4KFQA 3U93A 3MZBA 4F22A 1QKBA 3V5AA 2DVZA 3KJTA 1WVJA 4OEVA 2R9JA 4F19A 1B5HA 4GQOA 4F2OA 3OO8A 2X7PA 3N5LA 1ANFA 3O6IA 3FV1A 3OEMA 4NWCA 1D3KA 3PPRA 2QMWA 3I5OA 3THIA 1B9JA 3VLUA 4AB5A 3CI8A 1NFTA 4DCYA 1B46A 2PYYA 4ELOA 1PB8A 3T9HB 3CG3A 1EH3A 2IA4A 3G7WA 1QUKA 2O1MA 4R2FA 3I3VA 1LB8A 4OFJA 4QSCA 2R6GE 4FE8A 3MWBA 4EQ7A 3K6UA 4R73A 5I59B 3QAXA 2QS4A 4JWYA 1TFDA 3C31A 4IB2A 3H6TA 2V84A 3O28A 1MY4A 1WDNA 2AIXA 1B4HA 1A8EA 1J1NA 3O66A 4WEDA 3MP1A 1DPEA 2XXHA 5FHMA 1LFIA 3K02A 4IY5A 3H6WA 3T9UA 3UA8A 4LVQA 1USYE 1MQJA 4GOTA 3TPAA 1VFDA 2Q9TA 4WKMA 4U23A 1Y3NA 3U92A 4NF4A 2PT2A 4LZ7A 4IO3A 1LAFE 2WKYA 1MDQA 5H8QB 1US4A 3U1OA 1SYIA 3RTFB 3E4RA 2ONSA 5M2VA 3TCFA 3UK4A 5B7DA 1A8FA 3EHTA 3CVGA 4UA8A 3HN0A 3Q27A 3EQ1A 3MC2A 4NMYA 1GTKA 4EQ9A 4R9GA 4KYEA 1MY2A 1B7UA 2HXWA 4NF5A 1OVBA 4GFRA 5FHNA 1Y1MA 4M4GA 3WAEA 5KCJB 3USDA 4E0WA 2PMSA 1JETA 4O3AA 1B32A 1IITA 4OTEA 5AA3A 1QJMA 4BLAA 1FTLA 2I6EA 5HBCA 2Q89A 5ELVA 2XXTA 4DXUA 5CBSA 4X1DA 1II5A 3OO7A 2VGQA 3LBSA 2E0SA 4YKJA 2O7IA 1LLSA 5AA2B 2XXQA 1B7ZA 1DOTA 3S4UA 1B3LA 5DEXA 3RN8A 3TTNA 4E0XA 4YB5A 4GL8A 4C1TA 1MXVA 3O97A 2ANJA 2XXVA 2V93A 1B0HA 1PB7A 3KEIA 2W7YA 4G8NA 5J1DA 1BLFA 4NTLA 4GRKA 1B5IA 2XXUA 3ZKKA 3MVWA 3JYRA 4EXLA 4JBZA 1DTGA 4KCDA 1Q1KA 1IXHA 1FQEA 3K2DA 1A7LA 2NWJA 2FYIA 3KGCA 1SI1A 2O7UA 4ZEBA 3F11A 5DYHA 1ZJLA 3Q25A 3SEWA 1DSNA 3N94A 2DWAA 1BP5A 1PBPA 3TDJA 1LAXA 3IK6B 4XIGQ 1RKMA 3B6WA 1LCFA 4IO5A 4MH5A 4QFKA 5TP9B 3S9MC 2THIA 4QSDA 3GLBA 5TPAB 3V8XB 3VXBA 4FIMA 4ELPA 1JEUA 2D5WA 2XX9A 5I2KB 4OXVA 3TEPA 4R75A 1H45A 3HCQA 5H8FB 2ONKE 3SERA 2ALUA 1MM7A 4ELRA 1QVSA 1JW1A 5K2YA 1ZBMA 4DXCA 1MXXA 2H99A 2YLNA 5LOMA 1LBCA 3FJMA 3KN7A 5I59A 1VR5A 5KDTA 1MQIA 1N7XA 1M5CA 2ZYMA 3TTLA 3UN6A 3GBAA 3TZAA 3RT6B 3TYHA 4P0GA 1JVXA 2ZYKA 2HAUA 3MZ1A 2O6AA 4Q5TA 4F1VA 3G3IA 3CG1A 4WXJA 3IB1A 2O1LA 3B6QA 4H65A 4OENA 1P1NA 5I57B 1B1HA 1LAGE 4QRZA 5EHMA 4C0RA 1MRPA 2F7AA 1R1NA 5DVJA 1SW5A 1URDA 2Y7WA 5JTYB 1FQBA 3HV1A 2HFBA 2UVHA 1VE4A 3CRBA 1MS7A 2XX8A 3BKIB 2HCAA 4G8MA 3DP8A 1B51A 3PD8A 4ZDMA 3U94A 3OO9A 4PE5B 3LSXA 4HCWA 3G3KA 3ONMA 1MXWA 5I58B 3EHUA 4BDLA 3H03A 3DM0A 2QS3A 2CMOA 1A55A 2I4CA 3DLNA 3G3HA 4N07A 1RYXA 3UGWA 1GVCA 2QMXA 3KFMA 2A5TA 5I2NA 3TUSA 4LQ2A 1MXYA 1BTJA 2ZNTA 4ZEDA 3FVKA 3S9NC 2ESNA 1H3DA 3TMGA 4U22A 4HW8A 3A09A 3V89B 4U1ZA 4Q30B 2QJEA 2LAOA 5AA2A 1N7WA 2ABHA 2Q2AA 3FVOA 4RXLA 1DPPA 2OK2A 3UIFA 3VE1B 2GH9A 2VD2A 4FEBA 5ICQA 2OJTA 1MXZA 1ZTYA 1N0TA 1TWYA 2OCUA 2RC8A 3C4MA 1B0LA 5H8HB 1TT1A 2R71A 3PPOA 2KLFA 4NF6B 4I8CA 3DP4A 3T9XB 2Z8EA 3FXUA 1BKAA 3Q29A 4KYSA 5F1QA 2P1SA 5AA4A 3PD9A 1IQ7A 3U72A 3MUQA 4I1DA 4ZZAA 5CRYA 3VVFA 2XHDA 1IEJA 1UQWA 5L9SA 2F8DA 2DWIA 3RGYA 1MQGA 4ISUA 4HTGA 4F2QA 1GR2A 3IJXB 1EZOA 1T0KA 3G3JA 1M5FA 5I84A 2I0CA 4NF8A 5H8NA 4YICA 5A5XA 1MDP1 4IO4A 3BFUA 2YJPA 4ZE8A 4U1OA 2ZYOA 4KYDA 3QYTA 1YPNA 1Y1ZA 2F7BA 3ZS6A 2V3TA 5FTHA 1L5TA 3W15C 4R74A 3QXMA 1S50A 3DELB 3K6XA 3TTRA 3OO6A 3GZGA 3R26A 3MW0A 2UXAA 1OVTA 5JK4A 4MLQA 4MLVA 1FQFA 3JV9A 5BUUA 1PEBA 3IOUA 3TELA 3QUJA 3K1MA 4GLIA 4PQJA 3IOTA 1SYHA 3CIJA 2Y84A 2A5SA 2HQ0A 4XXUA 1MY1A 3M3LA 4MF3A 1SQYA 1FCKA 4R72A 1D4NA 4THIA 3S9LC 4JWOA 2AL5A 1Q35A 5AA2D 1B5JA 2QL3A 4IY6A 4GF8A 1UTHB 2HAVA 4YAHX 1P1OA 4H67A 1I6BA 3I6VA 5L9OA 4H1XA 4F3PA 4U2RA 3GXAA 1MY3A 5HM4B 4DDDA 5KZTA 2H25A 3FV2A 2I48A 4OERA 2OBGA 5I57A 1P1WA 4X48A 1R9LA 2RF1A 1XS5A 2F78A 3KN3A 4RNSA 2OLBA 2UYEA 3UP9A 4PFUA 2XD2A 1SI0A 3ODBA 4H8IA 5JTYA 2VP1A 4OQOA 1LGBC 4BDMA 3IB0A 2I3WA 3VLVA 4ND9A 4YKIA 4KQPA 1CE2A 4OMBA 1P1UA 3D4GA 1R6ZA 3MVYA 2X7QA 2B3FA 4Z7EA 1OMPA 3KSXA 5HPQA 5ICTA 3UORA 3MJNA 2NXOA 2DE2A 3JZJA 2I49A 1TXFA 5I58A 3T66A 2PVUA 4F18A 3PV0E 3B6TA 3FGSA 4HS7A 1B3FA 3K1NA 5DTBA 4LP2B 4TQUQ 2XX7A 4RK2A 3HO7A 2XXRA 1H76A 4XKNA 3QK6A 4LUBA 1R9QA 2F36A 3TCHA 2F35A 3LUYA 3SEVA 3M3KA 1UTBA 4DCXA 4YKPA 1LCTA 2RCAA 2B3BA 1UIVA 4YKKA 2X26A 3H3GA 4ZEKA 2I4BA 5JEIA 4Q8RA 4P11A 4U21A 4F29A 4BDRA 4EUOA 3RNNA 4ZEFA 2OWTA 2Q8JA 3MP6A 3N6TA 2GRVA 5ITOA 3RTWB 3H6UA 2XXWA 3LSLA 2NOOA 4YB6A 1N3XA 1AL3A 1FTJA 3E9XA 4H0WA 4Q0CA 1LBBA 4L17A 3RQTA 4OWDA 4NF6A 4H5GA 3FVNA 2PX1A 4MBPA 4TLMB 4UACA 5AE4A 1N04A 3K4UA 2I0BA 3C36A 3CR9A 1B05A 1M5EA 4TOZA 4KR5A 4IGRA 4EXKA 3KG2A 2VHAA 1JVYA 4XKRA 3FZVA 2VOZA 3TQWA 2DXRA 2DS9A 2ZXTA 3PUXE 4ZEIA 5CMBA 2O68A 5CI5A 3TAJA 1XOCA 3E3KA 3MZ9A 4FORA 4DLDA 4JWXA 3SKPA 1IIWA 4LQ5A 4QFOA 1ZMGA 3FIRA 1A40A 3PMVA 2DE3A 1RYOA 1AOVA 4JDFA 3TCGA 3FATA 4R6YA 4G8HA 4OETA 2DP8A 4FATA 4PFTA 1XT8A 1Z7NE 1MPBA 3IR1A 4ESXA 1FTMA 2UYFA 2F7CA 1NH8A 3QSLA 1PBQA 2Y7IA 3Q28A 2DXYA 3OENA 3O6HA 2E1SA 1N84A 2O84X 2YPNA 3FASA 5CBRA 4QHQA 4IGTA 4F1YA 3PUYE 3S9EA 2FNCA 3PUWE 1PC3A 1PDAA 4NF4B 4OHNA 4X1BA 2F5XA 3OSRA 1GGGA 2DQVA 1IXCA 1YTVA 1XVXA 2XXIA 3RLFE 2GHBA 3TFLA 3FUZA 3PPNA 3DP6A 4GXAA 3SESA 1LAHE 4ZECA 3O6GA 5H8QA 1LFHA 5IKBA 3OELA 1O7TA 4LA9A 3PUVE 3QIMA 1JW5A 1DTZA 5K2XA 1ZLQA 3MBPA 5FHOA 3VV5A 1VFEA 2DWJA 5I56B 3PPQA 1Y9UA 4HCYA 4OZ9A 4G68C 3K6VA 1P1QA 2DWHA 1I6QA 4G77A 3W9WA 3C34A 1MQDA 2XD3A 3EPEA 4KHZE 5BWJA 4F3GA 5KCJA 2RKMA 2VD3A 1Y3QA 4IO2A 1FW0A 3IO6A 4G4PA 1NNPA 3HHFA 1QULA 1HSEA 3IL1B 2DSFA 2AYSA 4RA1A 1IXIA 1FQCA 3IORA 3CFLA 3RUMA 4KPTA 1D9YA 4H5FA 3VFJA 2F6GA 5DEXB 3T9VA 1I69A 1MG1A 1EZ9A 1ZIUA 2ZYNA 2G29A 2V3UA 5H8SA 3A3UA 1M5DA 2QPQA 2P0SA 4RK9A 1P99A 3C35A 3MP8A 1MPCA 3O9PA 1NNTA 5AA1A 1Y20A 5CMCA 3SETA 3T22A 3ZKLA 4BDOA 4LONB 2O69A 4R6KA 4I62A 5DVFA 3BBRA 4C1UA 2DOJA 2QS1A 2ZMBA 2G93A 2ONRA 3ILTB 4DZ1A 3VXCA 3PPPA 3KZGA 3TKDA 3MQ9A 3K0VA 3SEUA 1OLCA 3H7MA 1O63A 4F1UA 4R6HA 2H4IA 4I9DA 2CZLA 4JXIA 1B7HA 4DE8A 4DIGA 2D21A 3OXNA 4H8JA 2Z8DA 3EHSA 4K3FA 1OQGA 5TP9A 3H6VA 3U8QA 3LC8A 1NL5A 2V3QA 5TPAA 1JNFA 2QSXA 4QFNA 1USYH 3RT8A 4EF2A 2HZKA 1MY0A 3LSFB 5I2KA 4JSDA 1WODA 3N26A 1B4ZA 3MAMA 5H8FA 4YZZA 4XKPA 1ZU0A 5KDTB 3VVDA 3LR1A 1B1XA 2ZNSA 5FTIA 3MVXA 4IO6A 2H9BA 2B65A 1SW1A 1O64A 5ITPA 4FJPA 3FXRA 4NEDA 3IX1A 4N13A 2QRYA 2O51A 2XXXA 5EHSA 4RYAA 3ILUB 4GIZA 1QUJA 1SBPA 1TFAA 4Z0IA 1SVXB 3TTKA 4GVOA 1Y4CA 2UVJA 3CSBA 3T93B 1B58A 1S7YA 4WEPA 2REJA 3K1PA 3V83A 1XHYA 3P7IA 1NH7A 1SW4A 4GXSB 5EYFA 1JW4A 1OIBA 5CMMA 2IEEA 4OEUA 3SEXA 5CMKA 3G3GA 2FA7A 2NUVA 2Q88A 1LFGA 1N3WA 2DE4A 4U4SA 1EU8A 3FJGA 2RCBA 4NE4A 3CFZA 4ECFA 1I6AA 2M8CA 1H44A 5I56A 1Z7ME 4RPNA 3C32A 4IO7A 4XTCQ 1FTKA 3OOAA 4H6DA 2HEUA 3ECRA 2A5TB 5I2NB 1JEVA 2DVCA 5IAIA 1PB9A 4LZ8A 4G68B 1AH5A 1B3GA 1FQAA 4R2BA 2OWSA 3G3FA 3IOVA 1NMUA 3LSWA 2Q2CA 1MQHA 2Y7KA 4F39A 3TTMA 4MFIA 1KWHA 5DT6A 4GWOA 4DXBA 2I3VA 3M3FA 2Z23A 1YAEA 4ZZEA 3PMXA 3TQLA 3K01A 4PP0A 3PMWA 3CSGA 3M8UA 4TLLB 3E13X 4ZE9A 3RY3A 1B6HA 5L9MA 3MPKA 1DMBA 3KSJA 3SDFA 4EDPA 3L6HA 3T96B 3HHGA 1ZKBA 4FEDA 4R9FA 4PFYA 3L6GA 4O3BA 4RJZA 1IZ1A 1S9TA 3IO4A 3KJ7A 5AA4B 2GHAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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