1FTMA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with ampa at 1.7 resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftmA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftmA01
3HHFA 1AH5A 3L6GA 1M5FA 3MVWA 1LAFE 4OFOA 4NF4B 3OENA 5I56A 1CE2A 2B3BA 1J1NA 4JWOA 5H8QB 2RC7A 1S9TA 3MZBA 2FYIA 3FVOA 4Q8RA 4H6DA 3VLVA 4NF4A 4H8IA 2ESNA 5I59B 2Y7KA 2D3IA 4KFQA 3VDFA 1SD3A 4R75A 2V3UA 3U8QA 3Q27A 4QSDA 1O7TA 4G77A 2RC9A 4ZEIA 1GR2A 2RCAA 4R74A 1XHYA 2ZMBA 4IGTA 3LUYA 1N84A 3OSQA 2Q9TA 2F7CA 2XXIA 1I6AA 1YAEA 4KI0E 4NEDA 5AA2D 2F8DA 2QJEA 3QUFA 4BDNA 3JYRA 4BDOA 3OMBA 2GH9A 3CFZA 3OELA 2P2AA 4R6HA 1RYOA 3C33A 5IKBA 1HSEA 2I0CA 3O29A 1HSJA 3Q26A 4KHZE 3MZ9A 3W15C 5AA3A 2ZNTA 5AE4A 2UVHA 4UA8A 2O51A 4OXVA 4EXLA 2E1SA 2HAVA 3F11A 4WEPA 3MP1A 5DVFA 1IZ1A 2P1SA 1A40A 3VXBA 2Q89A 5BUUA 1URDA 3RN8A 3PD8A 5CMKA 1EZ9A 5KCJB 2DQVA 4JBZA 1R9LA 2UVIA 4WKMA 5H8FB 2PT1A 1VE4A 2HQ0A 2PVUA 1P1WA 5KCJA 4Q30B 5TPAB 1MQDA 1NH8A 1ZKBA 4DZ1A 2HZLA 1URSA 4ISUA 1MXYA 3MAMA 1MH3A 3O97A 3BFTA 5A5XA 5TPAA 4LONB 5I2NB 5L8DA 1B5JA 5KDTA 3OSRA 4QRZA 3VV5A 3PD9A 1D9YA 5J1DA 3WAEA 4OTEA 2DXYA 2DXRA 2E0SA 5I2NA 2F7BA 3D4CA 3IJOB 5AA4B 2OK2A 3SDFA 5B7DA 1MXVA 4R2BA 4DXCA 3G3GA 3HSTA 3TCHA 1P1NA 3RUMA 3U1OA 2UXAA 1B0HA 1ATGA 4FJPA 3LSXA 1OLAA 2NXOA 3IK6B 4POWA 3M3FA 1MY4A 1H76A 1A8EA 1B32A 4R9FA 4QFKA 2F34A 3PUYE 1SI1A 3MC2A 1ZU0A 4U4XA 1SYHA 4KR5A 4GL8A 4XXUA 3QIMA 1R9QA 5L9MA 2UYEA 1OMPA 2F97A 1MXZA 4JWYA 1MG1A 5AA2B 4JWXA 2X7PA 3FUZA 2AL4A 3S9NC 3KN3A 3EN3A 2YPNA 4RJZA 3S9LC 2ONRA 2THIA 1N7XA 5AA2A 3IOWA 3S9MC 5H8NA 3PUXE 5CMCA 4YZZA 3QYTA 4U22A 3GBAA 1B7UA 1IXHA 3IB0A 2OZZA 3SERA 1TFAA 2HCAA 1R6ZA 3PPPA 3T93B 4XIGQ 1H3DA 4EQBA 3FVGA 3I5OA 4QSCA 4X48A 2F7AA 2ABHA 4HCYA 1B0LA 2XHDA 1FTKA 4GL0A 2IA4A 1AIVA 3VE1B 3FXQA 4TQUQ 1P1QA 3E9XA 2XXVA 4JDFA 3UN6A 1Q35A 1PB9A 2XXXA 3B6QA 2GHBA 3N94A 2NWJA 1LFHA 3ILTB 1OVBA 4EXKA 1XOCA 3VLWA 1USYE 3O6IA 1Y3QA 5DVJA 1Z7ME 2ZXTA 3FZVA 4FECA 4OFLA 3S9EA 4M4GA 2DWJA 2DVCA 2Z8DA 3IB1A 1UTBA 4RA1A 1SVXB 1JVXA 4OQOA 3ZKLA 2M8CA 1LB8A 4ZDMA 2O69A 2OWTA 2PYYA 3EPEA 4DCYA 3K0VA 3K6UA 4HTGA 3IO4A 1QW0A 3PPRA 1Y1MA 4F2QA 1H44A 1MY2A 3SEXA 3TDJA 4Z0IA 5K2XA 5I57B 2P0SA 3N6TA 3BFUA 4HCWA 3UP9A 4R9GA 5CBSA 4ZEBA 3CR9A 4I62A 3TFLA 2I4CA 3DM0A 4G8MA 3PPQA 4G2ZA 4PFWA 1RKMA 1P1OA 4RPOA 5H8HA 3KFMA 1I6QA 4IO4A 4DXBA 3PUZE 1D3KA 3DELB 4P0GA 3PMWA 3SESA 1B3LA 1UTHB 3FXRA 2F6PA 4R6YA 2Z22A 4KYDA 3RPWA 1A7LA 2Y84A 3A09A 1O63A 1D4NA 3JZJA 3V83A 4JXIA 3TQWA 2DYXA 4PFUA 5H8SA 2O7UA 2XXRA 5I84A 4ZZAA 5AA1A 2FNCA 3L6HA 1IIWA 4H0WA 3T96B 3FJGA 4C1TA 3TELA 1QUIA 1QKAA 1OQGA 4THIA 3FVKA 3D4GA 3IJXB 2AIXA 3O2AA 4EUOA 3PU5A 3K4UA 2ZYOA 1GV8A 4G8HA 4H1XA 1UIVA 3RGYA 2QL3A 3MVXA 4ZS9A 3U93A 3FJMA 4ELRA 1MQIA 1MRPA 1WDNA 3SEWA 1DSNA 4KPTA 3EQ1A 1PBPA 3TKDA 3R7XA 5JTYB 3THIA 2F35A 1POTA 3S4UA 3KOTA 4ONYA 4GXAA 1B3FA 4GOTA 1NFTA 2XXHA 2Y7WA 2H25A 4KQPA 1LAGE 2QMWA 2QS4A 5H8QA 1VSOA 1IXGA 3M8UA 1DTGA 4OZ9A 1N3WA 1FTMA 4JSOA 3C36A 3CG3A 5I59A 3PPOA 3W9WA 3FXUA 4EQ9A 2WKYA 4FEBA 4NF5B 3FATA 1ZBMA 4F18A 3TUSA 1QUJA 3TZAA 5DVIA 4NF5A 2DP8A 1A55A 2I4BA 4C0RA 3T9UA 1A8FA 4OETA 3OD7A 4AQ4A 2Y7PA 4YKJA 4GXSB 3O66A 2QS3A 2QSXA 4KCCA 2UVJA 3MVYA 1H45A 3IL1B 2H4IA 1M5BA 1AOVA 3H4ZA 4R2FA 2D5WA 1GGGA 1JW4A 1MXUA 2I3VA 3QSLA 3C9HA 3KGCA 4YICA 2R9JA 3K1PA 1B3EA 3CSGA 2A5TB 1MM6A 4PETA 4LUBA 4EF2A 2D21A 3TCFA 4NF8B 3WAFA 3SEUA 3OOAA 3TQLA 4IO5A 1SW5A 5TP9B 4NTLA 1ZTYA 4OMBA 3MBPA 5H8FA 3TTNA 3G3KA 3G3IA 4GD5A 4GWOA 4NF8A 3KG2A 5ITOA 4HW8A 4PQJA 3ONMA 3TPAA 1QJMA 5TP9A 2DWAA 2V3TA 3G3HA 1B9JA 2HEUA 1B3GA 4F22A 1US5A 1XVYA 2Q2CA 4ZEDA 4GIZA 4IO6A 3CG1A 3GBBA 1B5IA 4R72A 1PEBA 2O7IA 2W7YA 4FAJA 1A99A 2QRYA 1QKBA 1ELJA 4TOZA 1P1UA 2V25A 2YLNA 2F6GA 2I6EA 3PPNA 4M1VA 1EZPA 2RINA 1EH3A 3T9XB 2VD2A 1B6HA 4YMAA 5AA4A 1Y3NA 4ELQA 3H6VA 1PB8A 5KZTA 4EF1A 4F3PA 2XXYA 1Y4TA 3H06B 3JV9A 1SDXA 5K2YA 4R73A 3LSWA 2DOJA 1PDAA 2QPQA 4DE8A 1VFDA 3A3UA 5B70A 3ZS6A 4Z7EA 1B05A 2BJJX 4RY1A 1B3HA 5CMMA 4YKKA 4KYSA 1XT8A 2X26A 1P99A 4MFIA 3OO7A 4F19A 2NOOA 5DEXB 5ISUA 3SEYA 2DWHA 4OEUA 4H65A 2V93A 1OIBA 1B52A 2VOZA 2B3FA 3H7MA 1M5EA 2I58A 2QS1A 2PBWA 4X9TA 5ELVA 2UVGA 4F1YA 4ELOA 3LSFB 3BBRA 4LQ2A 4ESXA 3RT6B 4OENA 4F39A 1LB9A 2UYFA 4F3GA 1PB7A 3V8XB 4H5FA 2F78A 1Y4CA 1FQEA 4N13A 4H8JA 2CZLA 2AYSA 3USDA 3MP8A 1US4A 1A54A 1MQJA 4F3SA 3OEMA 1M5DA 3I3VA 2H9BA 5CC2A 1ZMGA 3VVFA 5TU0A 4E0WA 3MVZA 2XXPA 1LAHE 4I8CA 1TWYA 3HN0A 1DTZA 2GRVA 3DP6A 1ZIUA 1IQ7A 1LBBA 4NF6B 3UGWA 3FASA 4TLLB 5HM4B 2RCBA 3RY3A 3V89B 1N3XA 1JW5A 5CRYA 3U92A 3MPLA 4NMYA 1BTJA 3IORA 3GXAA 1XC1A 3LBSA 2AL5A 2F5XA 3K2DA 3RNNA 3C31A 1SW4A 4X1DA 2DE4A 1ZJLA 3QAXA 4G68C 1L5TA 2A5SA 1BKAA 1N0TA 3EHTA 3O6GA 4N6PA 2DE3A 1DPEA 2XXQA 2IEEA 1FQDA 5I57A 3K02A 1TT1A 3Q25A 4ZEFA 1N04A 3IOVA 1JEVA 3RT8A 4QFOA 1B2HA 5CI5A 3HPIA 4P11A 3PUVE 3K6VA 2XD3A 5ICQA 1Y20A 4G68B 4LQ5A 3GZGA 3KJ7A 2LAOA 4QFPA 4RK9A 1UQWA 2OJTA 1Z7NE 4FE8A 3IX1A 4G68A 3CI8A 3LR1A 1LFGA 4N07A 4MLQA 4BDLA 1FQFA 3H6UA 5JK4A 1MH4A 2PMSA 1UTHA 4YB5A 3VFJA 1QVSA 4F1UA 3KSXA 3G7WA 4RPNA 1CB6A 3K01A 3CIJA 1TFDA 2XX9A 1TXFA 1Y1ZA 3HCQA 1MPBA 3TAJA 4H5GA 4IO3A 2G29A 1N7WA 3B6WA 4DCXA 3Q29A 4GRKA 1R1NA 4LA9A 1JQFA 3RLFE 5EHSA 3P7IA 1DMBA 3IR1A 4RXLA 1NL5A 3O9PA 3K1MA 3HO7A 1XVXA 5CM6A 3VVEA 3K1NA 1LCTA 3R6UA 1JNFA 1NH7A 3DLNA 3TMGA 4YKIA 4MH5A 5I56B 2DVZA 3G3JA 3FV2A 4FATA 1EZOA 4XKRA 1BLFA 2Y7RA 1LGBC 1SQYA 4PFYA 5JTYA 2R71A 3FD3A 3CRBA 3OO8A 3PGFA 1BIYA 2OLBA 4FEDA 1B40A 1B58A 4GLIA 1SBPA 3DP4A 3VLUA 4KYEA 4MBPA 4HS7A 4ZZEA 3IB2A 3KN7A 3FV1A 5ICTA 4G8NA 2VHAA 2I3WA 1FTLA 2O68A 4AB6A 3R26A 3H6TA 4IB2A 5DYHA 3E13X 1MDP1 1USYH 4U4SA 2H99A 1MY1A 3KZGA 1NMUA 4EQ7A 4QF9A 3PMVA 3SEVA 2Z23A 4QSEA 4U2RA 3MJNA 3VXCA 3UK4A 2GFEA 4YMBA 2DWIA 1FTOA 4ECFA 4LVQA 3TTRA 3KOSA 4ZE9A 4LP2B 1B7HA 1SW2A 3N6UA 3LSLA 1GVCA 4GQOA 1NNFA 1HSLA 3VVDA 5ITPA 5L9OA 4OERA 4R6KA 1IEJA 1B1HA 3MPKA 1Q1KA 4LATA 1QULA 2RC8A 5BWJA 3MW0A 3QUJA 3SKPA 5I2KB 2DSFA 3U72A 2V84A 4FIMA 5HBCA 4XKQA 4L17A 3K00A 1WODA 3Q28A 2A5TA 1B5HA 1JW1A 2ONKE 1B4HA 2Q8JA 1LAXA 5I2KA 4ELPA 1POY1 3E4RA 2H98A 3O28A 5A5XB 2OWSA 4WXJA 2KLFA 5L9SA 5IAIA 5FHOA 5KDTB 4YKPA 3T9VA 3TTMA 1B1XA 4F2OA 3IOUA 2HAUA 4XKNA 3EHSA 2ZNUA 4LZ5A 1ZLQA 4F3BA 4BDQA 4U21A 2Q88A 3MWBA 1S50A 2HFBA 3CFLA 4U1ZA 3FVNA 4KCDA 4E0XA 3N26A 4ND9A 4F1VA 1B51A 1FW0A 2XXTA 2Y7IA 1ANFA 3C34A 4IO2A 3KBRA 1FTJA 4Q0CA 4XTCQ 1GTKA 1MY3A 2VGQA 1OQHA 2XXWA 1PBQA 3MP6A 1MM7A 3KEIA 4I1DA 4YAHX 3AXFA 1NNTA 4DLDA 1IXIA 4RK2A 3T66A 1BP5A 3M3LA 1MDQA 3K6WA 3ODBA 3ILUB 3ECRA 1MQGA 1NNPA 2DE2A 4QHQA 3QXMA 4F29A 1MXXA 4NWDA 2REJA 3G3FA 2NVUB 3B6TA 2ONSA 2ALUA 3V5AA 2CMOA 3IAZA 3LC8A 1O64A 2ZNSA 5FHMA 3TTKA 1FQAA 1JVYA 1IITA 4QFLA 4NE4A 1LLSA 5DTBA 2GHAA 5H8NB 1B4ZA 2OBGA 1UIUA 5M2VA 5DEXA 4BDRA 2PX1A 2YJPA 3S2VA 4IY5A 4IO7A 4GFRA 4YB6A 1NKXA 4QFNA 1MPCA 1SW1A 1MXWA 4XKPA 1T0KA 2V3QA 2FA7A 3KJTA 2DS9A 1AL3A 5EHMA 3FGSA 4OWDA 5I58B 3OEKA 1H43A 1JEUA 1VR5A 1B46A 4YU0A 2R6GE 3M3KA 4OESA 2XX7A 3SETA 2G93A 2F36A 5F1QA 1EU8A 5EYFA 3UIFA 5I58A 3PUWE 3KSJA 2ZYNA 2NUVA 4EDPA 4H67A 1URGA 4GF8A 3C4MA 4I9DA 3TTLA 2QMXA 2OCUA 1FCKA 2HZKA 3DP8A 3H6WA 3MQ9A 1MPDA 4AB5A 4PP0A 2ZYMA 1Y3PA 3OO6A 4NF6A 5FTHA 1YTVA 1S7YA 2ZYKA 1UTBB 1YCJA 4BDMA 3B7DA 2XD2A 3QK6A 2Q2AA 5FHNA 2B65A 3EF7A 4IY6A 4KD5A 4U1OA 3N5LA 4GVOA 1JETA 3MUQA 3FIRA 3TODA 2HXWA 1MS7A 3ZKKA 4ZECA 1WVJA 1LFIA 3H3GA 3HHGA 4MLVA 2Z8EA 4DIGA 3ZSFA 2PT2A 3A3CA 3EHUA 5JEIA 1PC3A 1MQHA 5HPQA 4OFJA 3K6XA 3OXNA 3RQTA 1VFEA 2O84X 1KWHA 2XX8A 4ZE8A 4O3CA 5CMBA 2VD3A 1LCFA 1RYXA 1N76A 4MF3A 5LOMA 1FQCA 2VP1A 5H8HB 4F31B 3O6HA 2I48A 3TYHA 1NNKA 3UORA 3I6VA 5DT6A 1I6BA 3FJ7A 3CVGA 4NWCA 1AMFA 3E3KA 4P0IA 4JSDA 4RNSA 1YPNA 4IGRA 1LBCA 1OLCA 3OO9A 2H5YA 4G4PA 4POXA 4LZ8A 3C35A 3IOTA 3T22A 1MY0A 4DDDA 3TCGA 2REGA 3RTFB 4BLAA 5FTIA 3T9HB 1B7ZA 4OEVA 4ESWA 2XXUA 4PE5B 1QUKA 1DPPA 3GLBA 1XS5A 3HV1A 5CBRA 4U23A 4OHNA 4TLMB 1SYIA 2I49A 4OVJA 2Z8FA 1M5CA 2O1MA 4X1BA 3IO6A 5F7VA 4RYAA 3KN8A 4FORA 4O3BA 4DXUA 1D9VA 4LZ7A 4JB7A 3PV0E 3U94A 3W9VA 4YB7A 3H03A 1I69A 4Q5TA 4OYVA 1Y9UA 4ZEKA 1LSTA 1SI0A 1FQBA 4WEDA 1DOTA 2QS2A 2RF1A 4PFTA 3CSBA 1IXCA 3C32A 4C1UA 2O6AA 2X7QA 3RTWB 4K3FA 1IUDA 2O1LA 1OVTA 1F9BA 3MZ1A 2ANJA 2I0BA 3BKIB 4UACA 3UA8A 1II5A 3CFXA 2RKMA 4O3AA 3TEPA 3PMXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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