4ECFA

Crystal structure of an abc-type phosphate transport system, periplasmic component (lvis_0633) from lactobacillus brevis atcc 367 at 1.55 a resolution
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
AGESITAVGSTALQPLVEAAGEQYTGEHLGTFINVQGGGTGTGLSQIQEGAVQIGNSDLFAGEQKGINARQLVDHRVAVVGITPIVNKKVGVKNLSTNQLIKIFTGQITNWKEVGGADQSIVLINRAQGSGTRATFEQFGLANHRSKTAQEQDSSGMVRSIVATTPGAISYVAFSYVNKTVQALSLNHVAPTEVNVTTNDWRIWSYEHLYTKGHPTGLTKAFITYVQSPAIQNTLVRQLGYLSPDQMLVERDANGHITKT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of an ABC-type phosphate transport system, periplasmic component (LVIS_0633) from Lactobacillus brevis ATCC 367 at 1.55 A resolution
rcsb
molecule tags Phosphate-binding protein
source organism Lactobacillus brevis
molecule keywords ABC-type phosphate transport system, periplasmic component
total genus 88
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ecfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ecfA02
5CRYA 2XXHA 3THIA 2ANJA 1S7YA 3C35A 2H9BA 4F2QA 4FAJA 1ZJLA 5LOMA 1DOTA 1FTJA 1QKBA 2P2AA 3OEMA 5TU0A 4BDQA 4ZEKA 3I6VA 4ZS9A 1AL3A 4C0RA 2ZNTA 4IB2A 3FIRA 3KJ7A 2F97A 4EDPA 4RXLA 4X1BA 3KOSA 3LC8A 1MG1A 5CBRA 3K00A 4IO6A 1MXZA 3IOWA 4LONB 2ZYOA 2QMXA 2DQVA 5I2NB 4C1TA 3IL1B 3HHGA 1VFEA 3O28A 2O68A 3KSJA 4XIGQ 2OJTA 1MQIA 4H5FA 2ABHA 1B46A 1USYE 4HW8A 1O64A 1PDAA 4EQ9A 1IZ1A 3IOTA 1AMFA 5KDTA 3TUSA 3VLUA 1R9LA 2O7IA 4YKPA 1B1XA 1XHYA 4XKQA 1PBQA 3MBPA 4YKKA 1RYXA 4G8NA 1PB7A 2P1SA 4XXUA 2H4IA 3BFUA 3G3HA 2V84A 2ONRA 3VE1B 3QSLA 4EXLA 1A8EA 1B7UA 5FHMA 4EF2A 4PFWA 2PT1A 1MH3A 3CSGA 3RY3A 4NEDA 1MY1A 3TYHA 2E1SA 3DP6A 3TELA 4GQOA 2REJA 3TZAA 3N94A 5K2YA 4ESXA 1QUJA 5B7DA 1MXXA 1M5CA 4JWYA 1ANFA 4NF8A 2QS1A 3BBRA 5CMMA 3M3LA 3S4UA 3OSRA 2Q8JA 5DYHA 2VOZA 1JVXA 1DTZA 2ZNUA 5I59B 1O63A 2RKMA 3SERA 4KHZE 1FW0A 3RN8A 3MWBA 5AA2D 2KLFA 3O9PA 4THIA 3MPKA 2I48A 3B6QA 5KDTB 2H98A 4QFKA 3HHFA 2QMWA 1P1NA 1DPPA 4OEVA 3JYRA 3T9VA 4IO3A 5AA3A 2I58A 4PFYA 2ZXTA 3G3GA 3I3VA 3U93A 2QS3A 5EYFA 1Q1KA 1BP5A 4U23A 4JDFA 2OLBA 4P0GA 2DXRA 5BWJA 1SDXA 2DWIA 2GRVA 1A40A 1MPBA 2R6GE 1YTVA 5L9SA 4GVOA 1LGBC 3N6TA 4OWDA 4NF8B 3W15C 4U1OA 1P1UA 1JETA 3H06B 5CM6A 4JWXA 1EU8A 1USYH 4ISUA 2F5XA 4G68A 1BLFA 1FQEA 3GBAA 1I69A 2ALUA 2PVUA 1WDNA 2NVUB 1AH5A 1ZLQA 3U92A 4BDLA 2V3TA 3FJMA 1B5JA 1LSTA 4YU0A 2ZNSA 3PD8A 2F35A 3TTKA 3E13X 4OESA 3OD7A 4GFRA 1I6QA 1TT1A 4ZE9A 2FYIA 2UVJA 4NE4A 2X7QA 4EQ7A 3SEVA 2Z22A 1NNTA 5CMKA 1RYOA 2H99A 2DVCA 3PUXE 3WAEA 4F3BA 1B7HA 3R7XA 1HSEA 3FUZA 5A5XA 1N3WA 3FVOA 3WAFA 3HCQA 3VLVA 4NMYA 1OIBA 3CG3A 1B3LA 2RC7A 3PUWE 3MPLA 3QUFA 4TLLB 2YLNA 3U94A 3LBSA 3ECRA 4PQJA 2O1LA 4BDRA 2V25A 3FXRA 3S9MC 4OQOA 4WXJA 4G68B 3MUQA 3OO7A 5AA1A 4F3SA 4G8HA 1A55A 2DS9A 4OYVA 4FE8A 2F7AA 3IJXB 3OO8A 3OO9A 1LAGE 1XVYA 3RUMA 3D4GA 4TOZA 4YKJA 4OXVA 3A09A 1EZPA 3KFMA 2GHAA 5H8QA 2B3FA 3K02A 4KQPA 2FA7A 1UTHA 3T9HB 1IXGA 3CI8A 4O3CA 3TTRA 1CE2A 4GD5A 4ZZAA 3UIFA 2M8CA 4RK2A 1N04A 2F7BA 3T22A 2DE3A 1ZBMA 1B05A 5EHMA 5H8NA 1KWHA 4MLVA 4YICA 1B3GA 4JSOA 5F7VA 3I5OA 5EHSA 4H5GA 4EF1A 5FHNA 2Q2AA 1YCJA 2P0SA 2OWSA 2AL5A 4DDDA 1A8FA 4PE5B 3OO6A 5ISUA 1H44A 1Y20A 3RTWB 1ZIUA 3TTLA 1P99A 2V93A 1GTKA 3UGWA 2OZZA 4U1ZA 3O2AA 5AA2A 3FD3A 2Y7PA 2UYEA 4ZEIA 1FQAA 4JXIA 3SEWA 1ATGA 2XXIA 5K2XA 3TDJA 5H8QB 4OZ9A 3CVGA 1A54A 1US4A 2VD3A 1TFAA 1UTHB 1URSA 1B0LA 4UACA 3KN7A 1I6AA 3KZGA 3CIJA 3ZKKA 4JBZA 5ELVA 2HCAA 4R72A 3UK4A 3SETA 2NUVA 1P1OA 4DXUA 3OSQA 5H8FA 3FJ7A 2Q89A 2OBGA 3KSXA 5FTIA 3FVKA 4R2BA 5ICQA 3H6VA 4H67A 3Q27A 4R2FA 3A3CA 4GF8A 4DXCA 2HZLA 3CFZA 5AA2B 3RPWA 3FJGA 2DWJA 2QSXA 3FVGA 5ICTA 3FXUA 2DWAA 2HQ0A 1ZMGA 5I57A 1TFDA 1MXYA 4Z7EA 1SW5A 1FQBA 1MY4A 3E3KA 3TCHA 3H03A 4YAHX 3RLFE 3OENA 5KCJA 1R6ZA 3N26A 3PUVE 4DE8A 3TCGA 4QFLA 4IGRA 5M2VA 4F3GA 2XX7A 4WKMA 1N7XA 1D9YA 1NL5A 2HEUA 1SVXB 2Q2CA 4FATA 3M3KA 3OXNA 1Z7NE 3V83A 4OTEA 1H45A 1II5A 2HXWA 3E9XA 1Y1ZA 1MDQA 1PEBA 4KYSA 1MY0A 1FTKA 5H8FB 2H25A 4Q5TA 5I59A 2AYSA 1DPEA 4XKRA 4G68C 3H4ZA 3Q29A 1LCTA 3KN8A 3HV1A 1QUKA 4ZEFA 3L6HA 3M8UA 2OCUA 1N76A 3SEYA 4I8CA 3O97A 4GIZA 3KGCA 1NH7A 3PUZE 1JQFA 1ZTYA 5I57B 4F18A 4R6HA 1QW0A 5L9OA 4KR5A 2PX1A 3DP8A 3FV1A 2DSFA 4MBPA 1QULA 2RCBA 3MZBA 3E4RA 4ESWA 1POTA 1Y4CA 5KCJB 1IIWA 4ELPA 1NMUA 1B6HA 2QL3A 2H5YA 4F29A 3IORA 3USDA 3T96B 2I0BA 5CBSA 5I56A 1JNFA 3RT8A 2QS4A 4IO2A 3FV2A 3TQLA 1M5BA 2XXTA 4G2ZA 4R74A 4PFTA 1TWYA 3K6WA 3VXCA 2Z8FA 3O6GA 2UVHA 4ELQA 2B65A 5I84A 4NF4A 4POWA 3U72A 4OFJA 3K6UA 3KEIA 1B0HA 3C31A 1UTBA 3JV9A 4DLDA 2F8DA 1XC1A 3S9EA 3LSFB 2F34A 5H8HA 1LCFA 4H6DA 1HSLA 3T9XB 2ZYMA 2VGQA 4H65A 2D3IA 4G8MA 3L6GA 2Q9TA 4OENA 1SW2A 4DXBA 5CI5A 2ONKE 2XXXA 3TPAA 3H7MA 2VD2A 1B3EA 5DVIA 4ZEDA 3IK6B 2ZYNA 4YMAA 1JW1A 1H76A 5I56B 1MXVA 3UA8A 1B4ZA 2D5WA 2PYYA 4AB5A 3Q28A 4ZECA 3LSWA 3FZVA 3S9NC 2I0CA 1Y9UA 1H43A 4ZDMA 3R26A 5HBCA 4F19A 1SI1A 4RYAA 4BDOA 4N07A 3SEXA 1LAHE 2QPQA 2Y7KA 3A3UA 4YKIA 3QYTA 3LR1A 4K3FA 3K1NA 2AIXA 3LSLA 3VVEA 4GL8A 4NF4B 5F1QA 1M5DA 3IJOB 1EZ9A 3W9VA 4JSDA 1Y3PA 5ITPA 3T9UA 3UN6A 2XXYA 1UTBB 4O3BA 1NFTA 4MLQA 5DVJA 2YPNA 2QRYA 4RJZA 4O3AA 5H8HB 2Y7IA 3TTNA 2I4BA 2F36A 3H3GA 4I1DA 2XXUA 3B6TA 3N6UA 4R75A 3EN3A 2DP8A 5AE4A 3KJTA 3DP4A 4ONYA 2HAVA 1B32A 2Z23A 4H8IA 2O84X 3K1MA 4BDNA 3MP1A 3CSBA 2I3VA 3CR9A 5TPAA 3JZJA 2I49A 1O7TA 2V3UA 3TAJA 1MQDA 3EHTA 1MY3A 3CRBA 4GRKA 3VDFA 4GWOA 3HN0A 1L5TA 1IQ7A 1PBPA 4IY5A 3MQ9A 1FCKA 3T66A 4MF3A 4RA1A 4ZZEA 1GV8A 4BLAA 3FASA 2CMOA 2GHBA 2A5SA 4MH5A 2RC8A 5H8SA 3RTFB 2O69A 2I6EA 5HM4B 2G29A 4DIGA 3IO6A 2F7CA 1UIVA 3PPOA 4PETA 4QFNA 1JEVA 1JW4A 1SI0A 2UXAA 1MY2A 5DEXA 2OK2A 4F2OA 4OETA 4I9DA 1B58A 1IXCA 3LSXA 2R9JA 5TP9A 1IITA 3N5LA 3CFXA 4RK9A 2QS2A 1I6BA 4OERA 4U2RA 1OQHA 2XHDA 1FQCA 1SYIA 3IOUA 1N3XA 5TPAB 3VLWA 3MAMA 4U4XA 4ZE8A 1D3KA 3IB2A 2UVGA 3FGSA 4F31B 2ESNA 4LZ5A 3PMXA 1EZOA 1NNPA 4LA9A 4F22A 5CMCA 3FXQA 2O7UA 4AB6A 1IEJA 2X26A 3Q26A 2RF1A 3MP6A 1Y1MA 3TODA 2G93A 1MM7A 3IR1A 4HS7A 5CC2A 1J1NA 4FEDA 4LUBA 4XKNA 2Z8DA 1AOVA 1PB8A 3TKDA 2O1MA 3MJNA 4UA8A 2I3WA 3K2DA 4TLMB 2RC9A 3SKPA 1Z7ME 1OVTA 1Y3NA 1FTLA 4N6PA 5DEXB 3ZS6A 2A5TA 3MVZA 3K6XA 1F9BA 3IOVA 4QFPA 2DXYA 1B3HA 5TP9B 3H6WA 1Y3QA 5FTHA 4ELRA 4OHNA 5IKBA 1OLAA 4GXAA 5L9MA 3VVFA 5KZTA 1S50A 1IXHA 3C33A 3QXMA 3B6WA 4F1VA 3C4MA 3TCFA 3G3KA 4R6KA 1LB8A 2QJEA 1SQYA 3PPQA 1ELJA 5I58A 1MXWA 1T0KA 3G3FA 4MFIA 4ELOA 4YZZA 4LZ7A 3GXAA 1B4HA 3PD9A 1LAFE 4FORA 3OMBA 1B52A 5DT6A 1YAEA 1UQWA 1MPDA 4OMBA 3IB0A 4EUOA 4POXA 1BTJA 2NOOA 3O6IA 2PBWA 3BKIB 3PPNA 5JK4A 4U22A 3ILTB 3LUYA 3PPRA 5B70A 3GLBA 3MC2A 2LAOA 3PV0E 4QSCA 3MZ9A 1JW5A 4N13A 2A5TB 3PPPA 1XOCA 3O29A 3KG2A 3SEUA 3VV5A 3QK6A 1NNKA 2OWTA 1ZKBA 1MXUA 3K4UA 4AQ4A 5FHOA 3PUYE 4R73A 3HO7A 5CMBA 1OLCA 2F6PA 1CB6A 5I58B 1MPCA 4IO4A 4NF5A 1LB9A 4L17A 3SESA 3VXBA 4RPNA 1MH4A 3G7WA 1D4NA 3C36A 4QF9A 1URGA 1FQDA 2NWJA 1IUDA 3T93B 4F1YA 3C9HA 1FTOA 1XVXA 4IO7A 2AL4A 3IX1A 4G77A 1WVJA 3BFTA 2Y7RA 3TFLA 1QUIA 5I2KA 1NKXA 2NXOA 1SYHA 4HCWA 3KN3A 1SBPA 3PU5A 2XX8A 3HSTA 3FATA 1P1QA 3MW0A 1NH8A 1URDA 4X9TA 3O66A 1MM6A 4IGTA 4Q30B 3EQ1A 5JTYA 1LAXA 2Y7WA 4NF6A 1MQJA 2WKYA 4F3PA 2HZKA 1VE4A 4P0IA 3V8XB 3PGFA 3K6VA 3C32A 3R6UA 5IAIA 1B3FA 3H6TA 1QJMA 4QHQA 5ITOA 4NF5B 1OQGA 3EPEA 3P7IA 4KI0E 1DTGA 2I4CA 1LBBA 3RGYA 4DCYA 3QAXA 4EQBA 3U8QA 4OEUA 4BDMA 5AA4A 1B51A 4I62A 2PT2A 2F6GA 3SDFA 3M3FA 4XKPA 2DYXA 2Q88A 4NWCA 3GZGA 3RQTA 1FTMA 4U21A 5I2KB 4FIMA 4P11A 4RPOA 1OMPA 4IY6A 4Q8RA 4DCXA 2R71A 1GR2A 2B3BA 2DE2A 3ZSFA 4PFUA 3UP9A 1RKMA 1M5FA 4E0WA 3RT6B 3K1PA 2Z8EA 4QRZA 2RCAA 3GBBA 5JTYB 3HPIA 4R9FA 4U4SA 4NF6B 4OVJA 4RNSA 3K0VA 4X1DA 2UVIA 2Y84A 2IEEA 4ZEBA 2UYFA 1LBCA 5BUUA 3TEPA 3S9LC 2GFEA 4JWOA 2XX9A 3AXFA 3IO4A 2XD3A 3MVWA 1H3DA 3PMVA 1MQGA 1LFIA 3S2VA 1LLSA 2XXPA 4R9GA 1XS5A 4E0XA 1SW1A 5AA4B 2HFBA 3MP8A 3O6HA 4TQUQ 1PB9A 1VFDA 3D4CA 4GL0A 3ZKLA 1M5EA 3Q25A 2F78A 3F11A 4KCCA 4KCDA 4GLIA 1A99A 3MVYA 3W9WA 2FNCA 3OEKA 3DLNA 4XTCQ 4F39A 4LZ8A 1HSJA 5L8DA 1B40A 1VSOA 4GXSB 1P1WA 1B1HA 3VVDA 4C1UA 1LFGA 3PMWA 4NWDA 1MDP1 3G3IA 4EXKA 2THIA 3U1OA 1JVYA 3ILUB 1FQFA 3RNNA 2BJJX 4YB5A 5HPQA 4X48A 2XXQA 1D9VA 4H1XA 1ZU0A 1PC3A 3TQWA 3OOAA 1TXFA 2VHAA 3OELA 2DOJA 1POY1 4LQ2A 5DTBA 3H6UA 1QKAA 1GGGA 1XT8A 2D21A 1R1NA 3KBRA 4YMBA 1UIUA 1IXIA 1R9QA 4WEDA 3V5AA 3EF7A 3IB1A 3MZ1A 4LVQA 4M4GA 4NTLA 1QVSA 4KYDA 4HCYA 1OVBA 3TTMA 5A5XB 1SW4A 2RINA 4H0WA 4FJPA 4KPTA 4OFLA 1N7WA 5J1DA 2XXRA 3KOTA 2DWHA 4DZ1A 1AIVA 3K01A 2X7PA 2REGA 2W7YA 1B9JA 2VP1A 2O51A 4QFOA 4JB7A 4RY1A 3ODBA 4LQ5A 1JEUA 2O6AA 3CG1A 3IAZA 5DVFA 4IO5A 3QIMA 2E0SA 4ECFA 2HAUA 1DSNA 1DMBA 4G4PA 1N84A 3ONMA 4Z0IA 1LFHA 1BIYA 4KYEA 2ZMBA 2ONSA 4F1UA 4WEPA 2ZYKA 4YB7A 5JEIA 3G3JA 3C34A 4KD5A 1Q35A 1A7LA 1B5HA 2YJPA 4Q0CA 2V3QA 2IA4A 2DE4A 3DELB 2XD2A 4KFQA 2DVZA 3QUJA 4H8JA 1NNFA 4HTGA 1BKAA 1B7ZA 1YPNA 4PP0A 3B7DA 3EHUA 4FECA 1B5IA 3EHSA 4GOTA 4ND9A 4OFOA 3MVXA 2GH9A 5H8NB 1S9TA 1VR5A 2PMSA 3TMGA 1WODA 2XXVA 4FEBA 4M1VA 1SD3A 5I2NA 3V89B 3DM0A 1Y4TA 2XXWA 1MS7A 4LATA 1N0TA 4QSEA 2CZLA 1EH3A 4QSDA 3CFLA 3VFJA 1MQHA 4YB6A 3FVNA 1GVCA 1MRPA 4LP2B 1US5A 3UORA 4R6YA 1B2HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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