4ECFA

Crystal structure of an abc-type phosphate transport system, periplasmic component (lvis_0633) from lactobacillus brevis atcc 367 at 1.55 a resolution
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
AGESITAVGSTALQPLVEAAGEQYTGEHLGTFINVQGGGTGTGLSQIQEGAVQIGNSDLFAGEQKGINARQLVDHRVAVVGITPIVNKKVGVKNLSTNQLIKIFTGQITNWKEVGGADQSIVLINRAQGSGTRATFEQFGLANHRSKTAQEQDSSGMVRSIVATTPGAISYVAFSYVNKTVQALSLNHVAPTEVNVTTNDWRIWSYEHLYTKGHPTGLTKAFITYVQSPAIQNTLVRQLGYLSPDQMLVERDANGHITKT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of an ABC-type phosphate transport system, periplasmic component (LVIS_0633) from Lactobacillus brevis ATCC 367 at 1.55 A resolution
rcsb
molecule keywords ABC-type phosphate transport system, periplasmic component
source organism Lactobacillus brevis
molecule tags Phosphate-binding protein
total genus 88
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ecfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ecfA02
1B2HA 3DM0A 2XD3A 3G3GA 4QHQA 1USYE 1HSEA 5DVFA 2NUVA 1YAEA 3IR1A 4JWYA 4R6YA 1B7UA 1B3EA 5ISUA 4HCWA 4HW8A 1B3HA 1MXWA 2ZYOA 1B51A 2E0SA 4PE5B 3V83A 1POTA 3PUZE 2XXRA 3HO7A 3K0VA 3RNNA 2QS2A 5ICQA 2CMOA 4L17A 1JVYA 4C0RA 5I59A 3KBRA 3RTFB 5L9MA 5H8FA 3O66A 3UGWA 4U21A 4BDMA 1VFEA 5AA4A 1SD3A 4X1DA 2O51A 3KJTA 4ZE8A 5FTIA 1MDP1 5K2XA 1UTHB 5B70A 1LBCA 1US5A 2P1SA 3KG2A 4MLQA 2I49A 1DMBA 4NE4A 3K6WA 4LZ5A 3MVYA 4EF1A 3H03A 3VVEA 3FXQA 5TU0A 1B52A 1NMUA 1P1OA 3RN8A 3R6UA 1EH3A 2XXQA 1MH4A 4AQ4A 1J1NA 3H7MA 1N84A 4ZE9A 3PPNA 4OWDA 2Q89A 1PC3A 2XXYA 1URDA 4DCYA 1LB9A 1R9QA 2GRVA 3IX1A 1YPNA 1H45A 3IB0A 1MQDA 3E13X 1PB7A 2PX1A 4OMBA 1SW5A 4ONYA 1MQGA 1OVBA 4OETA 3OO7A 2D21A 3IORA 4JSOA 1QVSA 2DE2A 4QFPA 3KN7A 4GL0A 2ONSA 3ECRA 4WXJA 4ISUA 3ZS6A 1M5FA 4I8CA 5AA2A 1UTBA 2B3FA 5H8HB 4FIMA 1R6ZA 1GGGA 2DWAA 1BKAA 3JYRA 4U1ZA 3IB1A 2XXTA 3KN3A 1QUIA 3O2AA 2OWSA 1O7TA 4ZDMA 4U2RA 4IY6A 1I6BA 4P11A 4POXA 4H0WA 2RINA 5BWJA 3IOWA 4OFOA 4DXBA 2DE3A 1Y3PA 3F11A 2KLFA 2XXPA 1FW0A 3TZAA 4UACA 4IO4A 3HV1A 1P1UA 3PPPA 4XKPA 3MVXA 1IXCA 3O9PA 2V84A 3JZJA 4NF6A 1MY1A 4PFTA 4KCCA 3QUFA 1NH8A 4THIA 3IOUA 4ZEDA 1Y4TA 2PMSA 3Q26A 1LFGA 5EHMA 4ECFA 2H99A 3FZVA 4LQ2A 3KFMA 2O7UA 2O84X 4IO3A 3G7WA 4OFJA 3ZKKA 3N94A 2Q2AA 2GHBA 3OO9A 4U1OA 3VXCA 3I3VA 3SKPA 5HBCA 5I59B 4X9TA 5H8FB 1MS7A 3LR1A 4IO5A 3CFXA 1MY0A 3T9VA 2YLNA 1FTOA 4P0GA 1IXHA 2R9JA 2B65A 3KOTA 1M5EA 5CMBA 4F18A 1O64A 3C35A 4KHZE 4GXAA 3K1MA 4PFWA 1N7WA 4KYSA 2XX8A 1OQHA 5H8QB 4F3BA 1PDAA 4DXUA 3RUMA 1B58A 2XXUA 3IL1B 2RC8A 1D9VA 2Z8DA 1EZ9A 4RK2A 1BP5A 3RT8A 1JVXA 2Q88A 4FATA 3PUWE 2VD3A 3P7IA 5FHOA 1A7LA 3JV9A 5ICTA 3UN6A 1B0HA 2DVCA 3MQ9A 4K3FA 3PV0E 1H43A 4N13A 1EU8A 1M5BA 1UTBB 4KD5A 4BDNA 1XT8A 3EHSA 3K6UA 5I84A 1OLAA 3RTWB 1QKBA 2CZLA 4YKPA 4TOZA 4ESWA 4H5GA 3DP8A 4KYDA 2V25A 1CB6A 3Q28A 1H76A 2W7YA 3GBAA 1SYIA 2PYYA 4ELPA 3ODBA 4X1BA 1ELJA 3N6TA 1KWHA 2HEUA 4WEDA 4NF6B 2DWJA 3FV1A 2RF1A 3CG1A 3K00A 2Z8EA 1BTJA 3UP9A 4GD5A 1B6HA 2O69A 5CMMA 3FVOA 3W15C 5CI5A 3FJ7A 1F9BA 4LZ8A 1AMFA 4ZS9A 1B3GA 3MP6A 4E0XA 4OHNA 1FTKA 3OSQA 3N6UA 4G8MA 2HAUA 1JEVA 3RY3A 3VVDA 4R74A 2DP8A 3QSLA 3OD7A 4N6PA 3CFZA 4EQ9A 2AL5A 2DXYA 1DOTA 3VLWA 4RPOA 2FA7A 3MZ9A 1ZIUA 4YAHX 1T0KA 1M5DA 3VFJA 1IXGA 5BUUA 4GWOA 4H8IA 2XXIA 1S50A 2H5YA 2XHDA 4ZZAA 1A55A 1AIVA 1Q1KA 4LA9A 4OESA 2ZNSA 1A8EA 2WKYA 4IY5A 3FXUA 5J1DA 1US4A 4BLAA 4MBPA 1LCFA 4R9FA 5EYFA 3KSJA 5DVIA 3TTMA 1GTKA 2I3VA 5L9SA 2QS3A 3VXBA 3VLVA 1B1HA 3QIMA 1N3WA 3M8UA 1MXXA 1A40A 1Y20A 1PB9A 3L6HA 1MQHA 1PEBA 1H44A 4JDFA 1RYOA 5I57A 2O1LA 3TAJA 2H9BA 1Y1ZA 2F6PA 3PU5A 1NL5A 1FTJA 3V89B 2R6GE 3VDFA 4IB2A 4RJZA 2D5WA 3N5LA 4DXCA 3C36A 4R72A 3T22A 3IOTA 3C32A 4NF4A 3HPIA 4KFQA 4Q0CA 1QUJA 1Z7NE 1IXIA 3H6TA 4RNSA 1RYXA 1B40A 3N26A 3K4UA 3B7DA 5B7DA 4YICA 4R73A 4YMBA 1VE4A 4H65A 3G3JA 4F2OA 3MZBA 3FVGA 4LONB 1OQGA 1SW4A 2ZNTA 3K01A 2ESNA 5AE4A 3T9UA 5TP9B 2HCAA 4XKRA 1YCJA 2O6AA 3ZKLA 1LAXA 3D4GA 2H4IA 4GLIA 3THIA 3HHFA 3HHGA 1OMPA 4FJPA 2NOOA 3HCQA 1LGBC 1ANFA 5KDTB 4NF8A 3U1OA 4G68C 3B6WA 2HZKA 2I4CA 3PMWA 2X7PA 1R9LA 2I48A 2PVUA 4DCXA 1Y9UA 4ZEBA 4H67A 3SEUA 1B1XA 1ATGA 3GLBA 3USDA 4Q30B 3O6HA 1URSA 2UVIA 4JWOA 1ZLQA 2DQVA 1NNFA 3TUSA 1JW4A 3MW0A 3MVZA 3VV5A 1ZMGA 3G3IA 5L9OA 5ELVA 4YKKA 4BDLA 2P2AA 4R9GA 1XS5A 1L5TA 3BFTA 2ABHA 1MPCA 2Q8JA 5A5XA 1DTZA 2DOJA 4H8JA 3TTLA 3T9HB 2VOZA 3BFUA 3PMXA 2YJPA 2NXOA 4WKMA 2QL3A 2QSXA 4XIGQ 4F22A 2RKMA 1CE2A 3CVGA 3TPAA 4GOTA 5I58A 3MZ1A 2XXHA 4FORA 4XTCQ 3TELA 4XKNA 3SEWA 1DPPA 3CG3A 2VD2A 2QS1A 2G29A 1WVJA 1URGA 4F3PA 4FAJA 2OLBA 4F1VA 4EF2A 4F19A 3MP8A 4QSEA 1N7XA 3S9NC 1MPBA 2QMWA 2Y7WA 4BDOA 4F1YA 2ZMBA 3ILUB 4ELOA 1NKXA 2Y7RA 2ONKE 4G77A 5CBSA 1A99A 2DWIA 4OENA 2QPQA 3E3KA 1JNFA 1SDXA 1NNKA 2HQ0A 3LSFB 1OLCA 1IEJA 4NF4B 2UYFA 3SERA 2I6EA 5DEXA 1B0LA 2NVUB 5H8NA 3FVKA 3LBSA 2ANJA 4OZ9A 3MBPA 3PPOA 4PP0A 1GR2A 3C33A 4P0IA 2O68A 2F5XA 1AH5A 4KPTA 2F8DA 3M3LA 1FTLA 4U4XA 3HSTA 4F2QA 1D9YA 5AA3A 5K2YA 5AA4B 3LC8A 3PUVE 3CIJA 2XXWA 4M1VA 1PBPA 3TTKA 1N0TA 4O3BA 3IOVA 3GZGA 3TMGA 4I1DA 1HSJA 2Q2CA 1LCTA 2Y7PA 3KEIA 2F7CA 2R71A 3G3HA 2VHAA 4NF8B 3WAEA 2FYIA 3RT6B 2P0SA 1I6QA 2Y7KA 2M8CA 3PGFA 1B3FA 1BIYA 1H3DA 1IZ1A 4KR5A 3A3CA 2E1SA 1MXUA 3SETA 3I5OA 2ZYKA 1BLFA 1Y1MA 4OFLA 1B3LA 4H5FA 1LAGE 3MUQA 1SVXB 4QFKA 5A5XB 3PMVA 4NEDA 3MVWA 1FQDA 1ZBMA 1ZU0A 4HS7A 1SYHA 2QS4A 5FTHA 1O63A 3QXMA 3TFLA 4H6DA 3V8XB 2XD2A 2G93A 3TQLA 1IQ7A 2I3WA 5AA2B 1MXZA 2ALUA 2PT1A 1Y4CA 2F78A 3MAMA 1Y3NA 3QK6A 1FQAA 1NNTA 5CRYA 1FTMA 3K02A 3D4CA 3CRBA 3KSXA 2AIXA 4EXKA 2DYXA 4E0WA 4PFYA 4KCDA 5LOMA 4TLLB 2QJEA 2Q9TA 3L6GA 5F7VA 1VFDA 2XXVA 3IB2A 5ITPA 1Q35A 3QUJA 3KN8A 3A09A 2GHAA 1JQFA 1B4HA 1QUKA 3T9XB 1N3XA 2Y84A 4NWCA 2OK2A 1MPDA 3K6XA 3RGYA 2DE4A 3U93A 4DDDA 1A54A 4NMYA 2D3IA 2X7QA 2FNCA 4MFIA 4F1UA 2A5SA 3B6TA 1N04A 1QKAA 3UA8A 3PPQA 1B5HA 3FUZA 2ZYNA 2I0BA 3S9MC 3V5AA 2DS9A 4OXVA 3SEXA 2V3TA 3FJGA 4GF8A 5DEXB 4I62A 1LBBA 3IO4A 3O97A 5H8NB 4LVQA 2H25A 2PBWA 2QRYA 4QFNA 1B9JA 1P99A 1OIBA 1JW5A 3LSLA 3EHTA 4ND9A 2GH9A 4UA8A 4FECA 5I2NA 2RCBA 1FQFA 1I69A 3TCFA 4OQOA 4KYEA 4M4GA 2X26A 3RPWA 4ESXA 4IO2A 3EPEA 2ZYMA 2OZZA 3FJMA 2UVHA 3FD3A 3RQTA 2HZLA 3TTRA 3O29A 3FATA 1QULA 1VSOA 1LB8A 2DWHA 1R1NA 2HFBA 1UIUA 1RKMA 4Q5TA 2F35A 4ZEIA 4NF5A 2I58A 3H6VA 3I6VA 4GRKA 3DP4A 3G3FA 1POY1 4U23A 4YU0A 1IUDA 3A3UA 3H6WA 4MH5A 5AA2D 3FXRA 3IJOB 3C31A 4MF3A 3SDFA 3QAXA 1N76A 4YKJA 2GFEA 4PFUA 2IA4A 3U94A 2I4BA 2RCAA 3ZSFA 3OENA 4C1TA 3TCHA 3PUYE 4R6KA 2BJJX 4NTLA 2F7AA 3IK6B 1SI1A 3TKDA 3WAFA 3IAZA 3OOAA 3UIFA 3FGSA 4XXUA 5CM6A 1SW2A 4O3AA 3MC2A 1II5A 3K1PA 1EZPA 1GV8A 1XC1A 3KOSA 1SI0A 4JWXA 4X48A 5CC2A 4Q8RA 5JTYA 4GVOA 3GXAA 2OJTA 4F31B 1B5JA 4GFRA 1XHYA 1LFIA 3OSRA 3H6UA 1YTVA 2THIA 3EN3A 3W9WA 3W9VA 3EHUA 5DT6A 1IIWA 4F39A 4FEDA 3U92A 2O1MA 3EQ1A 4OERA 3T96B 2DSFA 1DPEA 2F7BA 3C4MA 1JEUA 3CR9A 1TXFA 2AL4A 1B4ZA 2F36A 3OXNA 5H8QA 3DLNA 1QJMA 1MY3A 4BDQA 3VLUA 1JETA 2QMXA 1MQIA 3SEVA 2I0CA 5I2NB 1TWYA 4EUOA 5DTBA 3M3FA 4U22A 5JK4A 4G8NA 4HCYA 5F1QA 1VR5A 1AL3A 3UK4A 3TTNA 5I56A 4U4SA 1D4NA 4RYAA 2PT2A 5KCJA 1PB8A 4YB5A 5AA1A 2XX7A 5HM4B 4OEVA 4RA1A 5I2KA 3CSBA 1P1QA 2OBGA 4OYVA 5DVJA 4LP2B 4NF5B 4AB5A 4G2ZA 4F3SA 2RC7A 2H98A 2XXXA 4LUBA 5I57B 4YKIA 2UXAA 3E4RA 2UVGA 4IO6A 1PBQA 3H4ZA 4DLDA 4ZECA 3RLFE 2Z22A 2Z8FA 4EXLA 4GQOA 4I9DA 3CFLA 1WODA 5FHNA 1UQWA 5TPAA 5CMCA 3PD8A 3LUYA 4KI0E 4JB7A 3E9XA 4RK9A 4F29A 1DTGA 4WEPA 3DP6A 5HPQA 4POWA 4ELQA 2RC9A 3O6GA 4FEBA 3HN0A 1FQCA 1MG1A 3K1NA 4JSDA 3T93B 3FIRA 3IJXB 3MWBA 4IO7A 3OELA 5JTYB 3C9HA 3FVNA 1P1WA 1I6AA 4PQJA 3FASA 1S9TA 1LLSA 4IGTA 4F3GA 1DSNA 4LZ7A 3AXFA 2UYEA 4R2FA 2LAOA 2YPNA 5CMKA 3H06B 3BBRA 3Q29A 1D3KA 1USYH 1XVXA 3R26A 1JW1A 4QFLA 3S2VA 2ZXTA 3UORA 2F97A 4R75A 4ELRA 1LFHA 3G3KA 4RY1A 1WDNA 1NNPA 2F34A 4IGRA 4Z0IA 4LQ5A 2VP1A 4R6HA 4JBZA 4G68A 5L8DA 3PPRA 3U8QA 3OEMA 4QSDA 4FE8A 1LSTA 3TQWA 4GXSB 3TODA 1LAFE 3Q25A 3U72A 1MRPA 2A5TA 1MY4A 3IO6A 4OEUA 2V3UA 5FHMA 1AOVA 5CBRA 5I58B 5I56B 1UIVA 1FQBA 4RXLA 4QRZA 3C34A 1M5CA 1HSLA 3DELB 3MJNA 4YZZA 4AB6A 5KCJB 1ZJLA 3FV2A 3S9EA 3O28A 3OO8A 4YB7A 1FCKA 5KZTA 2DVZA 3K2DA 2ZNUA 1EZOA 5I2KB 5H8SA 4EQ7A 4YB6A 3M3KA 1B7ZA 1S7YA 2VGQA 3TEPA 2IEEA 2AYSA 4KQPA 2B3BA 4TQUQ 3R7XA 1Z7ME 2HAVA 4NWDA 5TP9A 1LAHE 5ITOA 2XX9A 3SEYA 1MH3A 5IKBA 4ZEFA 1GVCA 1UTHA 1B5IA 3OMBA 4DZ1A 1NFTA 4OTEA 4EQBA 2UVJA 3ILTB 1Y3QA 5KDTA 4QF9A 4MLVA 3K6VA 3MP1A 4JXIA 5M2VA 1MDQA 3ONMA 4HTGA 5TPAB 2ONRA 4QSCA 4YMAA 2V93A 1FQEA 5EHSA 3KZGA 4TLMB 3TCGA 3EF7A 4XKQA 2REJA 5IAIA 1P1NA 4DE8A 4EDPA 3OO6A 3TYHA 3GBBA 2REGA 2Z23A 3MPLA 3VVFA 1TT1A 3T66A 4ZEKA 2OCUA 3KGCA 1A8FA 1MXVA 1MM6A 4DIGA 1SQYA 1XOCA 4C1UA 4GIZA 1MQJA 4LATA 1MXYA 4H1XA 1NH7A 3B6QA 4G4PA 1B46A 3CSGA 3MPKA 4G8HA 3BKIB 5H8HA 3O6IA 1OVTA 4BDRA 1B32A 1ZKBA 1ZTYA 4N07A 1TFAA 2V3QA 4O3CA 3VE1B 4ZZEA 3KJ7A 1TFDA 4RPNA 1IITA 3LSXA 3TDJA 1B7HA 3QYTA 2F6GA 4G68B 4PETA 3CI8A 3OEKA 1B05A 3PUXE 2O7IA 3SESA 4R2BA 2Y7IA 3S9LC 3Q27A 3PD9A 3LSWA 1MY2A 4GL8A 4QFOA 3H3GA 2A5TB 1XVYA 2NWJA 1MM7A 4Z7EA 4OVJA 2OWTA 1QW0A 5DYHA 3S4UA 1SBPA 1SW1A 2DXRA 5JEIA 2HXWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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