4ECFA

Crystal structure of an abc-type phosphate transport system, periplasmic component (lvis_0633) from lactobacillus brevis atcc 367 at 1.55 a resolution
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
b'AGESITAVGSTALQPLVEAAGEQYTGEHLGTFINVQGGGTGTGLSQIQEGAVQIGNSDLFAGEQKGINARQLVDHRVAVVGITPIVNKKVGVKNLSTNQLIKIFTGQITNWKEVGGADQSIVLINRAQGSGTRATFEQFGLANHRSKTAQEQDSSGMVRSIVATTPGAISYVAFSYVNKTVQALSLNHVAPTEVNVTTNDWRIWSYEHLYTKGHPTGLTKAFITYVQSPAIQNTLVRQLGYLSPDQMLVERDANGHITKT'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords ABC-type phosphate transport system, periplasmic component
publication title Crystal structure of an ABC-type phosphate transport system, periplasmic component (LVIS_0633) from Lactobacillus brevis ATCC 367 at 1.55 A resolution
rcsb
source organism Lactobacillus brevis
molecule tags Phosphate-binding protein
total genus 88
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ecfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ecfA02
3OO8A 3DLNA 3G3KA 2ANJA 2Q9TA 1JW5A 1UTHA 2YPNA 4KYEA 2PMSA 2NVUB 3TCGA 1HSJA 3MVZA 2GRVA 3E3KA 5CMMA 2H4IA 1R6ZA 5K2XA 3K0VA 4C1UA 4U4SA 1O64A 3IOTA 2RCBA 4F1UA 3E13X 4RPOA 2GFEA 1UTBB 4NF8B 5TU0A 2D3IA 4IO7A 1BIYA 4XIGQ 4FE8A 1I6AA 1DTZA 5CI5A 3TCHA 2XXPA 4RA1A 3D4GA 1B6HA 4L17A 3H06B 2V93A 2ZYKA 4Z0IA 1R9LA 4WEPA 3FATA 3H6UA 3TELA 3SEVA 3D4CA 4OZ9A 5DVFA 3H03A 3N5LA 4LVQA 2HZKA 2GH9A 1NL5A 4PFWA 1H3DA 5H8FA 1ZTYA 3SERA 1B7ZA 1GGGA 2X26A 1YAEA 3N26A 1P1QA 3ILUB 3MQ9A 1AMFA 1SW1A 1PBQA 3CR9A 1JW1A 4I62A 3I5OA 1IXIA 4P0IA 4OESA 3LSFB 2REGA 3QXMA 3P7IA 4ND9A 2V84A 3C4MA 5L9MA 1XOCA 3OELA 4PP0A 3IOWA 4F31B 1FTLA 2OWTA 2PX1A 2GHAA 4KPTA 3DM0A 2O84X 1PB7A 4GF8A 4KYSA 1A8FA 4OEVA 3G3JA 2ZMBA 5I84A 3PUYE 4H1XA 4U23A 1B3FA 2I3VA 1N84A 2G29A 1HSEA 2B3BA 4X9TA 4OFOA 3BKIB 5DVIA 1MDP1 2E0SA 4X48A 3PD9A 4H8IA 4HS7A 5FHOA 2Y7RA 3VFJA 2OJTA 2AL5A 1DSNA 1MY4A 4NMYA 1A40A 1QKAA 3KSJA 4X1BA 4OWDA 3TTNA 3HV1A 2WKYA 5CMKA 4E0XA 4G4PA 3USDA 4YU0A 3TTMA 3IB2A 3UGWA 2UXAA 3O28A 3H4ZA 3IR1A 2DE2A 5DEXA 2UVGA 3SKPA 2RF1A 3OXNA 2F78A 5AA2A 4QF9A 2VHAA 4FATA 2H25A 1URDA 3UA8A 4OETA 3C36A 5H8HB 1HSLA 3T22A 4JSDA 4YB7A 3THIA 5JK4A 3O9PA 4TQUQ 1FQBA 1SD3A 2QS4A 1M5EA 5TPAA 3WAFA 2XXYA 1ZJLA 2I48A 4RY1A 5FTIA 4EQ9A 1MQIA 4FECA 3TKDA 2H5YA 1BKAA 2I3WA 3C35A 3FVGA 1UTHB 3OO7A 1KWHA 1CB6A 2DOJA 1NNTA 1D3KA 3FXQA 1UIUA 1PC3A 4G68C 4JWYA 1BLFA 3K6XA 1MRPA 3KGCA 4JDFA 3O29A 1AOVA 4OEUA 3AXFA 4EF2A 3KJTA 3HCQA 2OWSA 4RK9A 4R75A 3HHFA 3MP1A 1B0HA 1LB9A 3LSWA 3PPOA 4FORA 1B4HA 3PPNA 1UTBA 4TLLB 1A54A 4YICA 1DMBA 2O68A 2DWIA 4R2BA 1NH8A 4U21A 1JEVA 2HQ0A 3U8QA 3SESA 3HHGA 3K4UA 5ITOA 4DXUA 1D9VA 5LOMA 4QFKA 3FV2A 1MM6A 4THIA 4YAHX 4IGTA 5CBRA 1NKXA 5TP9A 1O7TA 2HXWA 1FQDA 1XS5A 3GBAA 3GZGA 4BDMA 3RPWA 4IO2A 4IO5A 4BDQA 1ELJA 1LAFE 2OLBA 4Z7EA 5ICTA 3VE1B 2AIXA 2CMOA 4GL8A 3PMVA 4KQPA 3SEUA 3RTWB 1B4ZA 1H45A 5H8FB 2ABHA 3RT6B 4IO4A 4M1VA 4EXKA 3N6UA 2R9JA 3PPRA 4GRKA 1IQ7A 4ONYA 1DPEA 4KYDA 1MG1A 3G3IA 3QK6A 1MXUA 2P2AA 4F3BA 1IEJA 2ZYMA 1VR5A 1MQHA 4Q8RA 4Q5TA 2VD3A 3DP6A 3EHTA 3DP8A 1QW0A 3FJGA 4LONB 4ZEKA 3M3FA 1FTJA 4NF4B 3PPPA 4O3BA 5BWJA 3FIRA 4Q0CA 2NOOA 2RC7A 2Z8FA 3W9VA 4YMAA 4GQOA 3VLUA 4X1DA 2QRYA 4OXVA 3TTKA 4XTCQ 5AA3A 2PBWA 1NNPA 1M5FA 1FQEA 3U92A 2H99A 2QMWA 4WXJA 3TMGA 4LZ8A 1JETA 1QVSA 1IITA 3F11A 1AL3A 5I58A 4OMBA 4KHZE 4ESXA 4DXBA 1JW4A 2UVIA 3VVEA 4ZEFA 1FQFA 2XXXA 4GFRA 3KN8A 4N13A 4OFJA 2DE3A 3MBPA 1H44A 4O3CA 4P11A 4RYAA 3G3GA 1Y9UA 2RC8A 2ONRA 3TPAA 1OLAA 4LA9A 3LSLA 4DCYA 5DEXB 4AB6A 4F19A 1N0TA 1N3WA 1O63A 4GL0A 5I59B 3CG3A 3QUJA 1TXFA 1N7XA 3T66A 2Q2AA 1GR2A 1PBPA 3HPIA 1XC1A 4HW8A 4IGRA 1B7HA 5TPAB 2ALUA 3CVGA 2IEEA 4F3PA 4PQJA 2V3QA 3CG1A 4RNSA 3IOVA 4U22A 1Z7NE 2Q89A 1SVXB 2UVHA 2R6GE 4C0RA 2DWHA 3ONMA 3IAZA 1FW0A 2M8CA 4OERA 4YMBA 1LAGE 5A5XA 1QJMA 2Z23A 4WEDA 3MZ9A 4GLIA 2XX8A 4DLDA 1SI1A 5K2YA 3TYHA 2O1LA 3MC2A 2YLNA 4H5FA 1SW5A 3OOAA 3RNNA 1MY1A 4EQ7A 4ELRA 2B3FA 3W15C 3K1MA 4OVJA 3MZ1A 1ZBMA 4MLQA 3VV5A 1MDQA 1S50A 1IZ1A 5TP9B 2Q2CA 2V25A 1MPBA 4G77A 5EHMA 2Z22A 5H8NB 2F34A 1PEBA 3K01A 2HCAA 2AYSA 3HSTA 3I6VA 4IY6A 4NF6A 4NWDA 1ZIUA 1WODA 2VOZA 3FGSA 2F7BA 4BDOA 4ELPA 1MH4A 1MY0A 3L6HA 3VVDA 2W7YA 3MW0A 1M5DA 1B58A 3LBSA 2X7PA 2Z8DA 5F7VA 3HN0A 4QHQA 3JV9A 3IOUA 3Q27A 3QAXA 1FQCA 2ESNA 5IKBA 4XKPA 1FTKA 4DIGA 2DP8A 3SEYA 2PT1A 2XXIA 3SDFA 3WAEA 3VXCA 1MXZA 4GIZA 1MXWA 1OIBA 5FHNA 1MQJA 3W9WA 3B6QA 1POY1 5JTYA 2XXUA 4NF4A 1B5IA 4PFTA 4F3GA 5I57A 3B7DA 1NMUA 2DE4A 3T93B 4RXLA 1LB8A 3UORA 4K3FA 3SETA 3O6HA 1P1UA 3B6WA 4HTGA 3H7MA 1YPNA 2XXHA 3IJXB 1XT8A 4MBPA 5DYHA 2OK2A 5L9SA 3RY3A 1B7UA 2I6EA 3FVKA 1FTMA 3OO6A 4OTEA 4P0GA 4R73A 5I58B 1B5HA 5HPQA 4JWOA 2HAVA 3CFZA 1ATGA 5CBSA 1POTA 4ELOA 1H43A 1I69A 1SDXA 3Q28A 1P1NA 2P1SA 2HZLA 4KD5A 3PUZE 2XXVA 3T9HB 4POXA 3ZSFA 2AL4A 3TEPA 1IUDA 5CM6A 4I1DA 3DP4A 3M3LA 4M4GA 1NFTA 3FJ7A 2XD3A 4XKQA 3C32A 3FV1A 4OHNA 3KBRA 5I59A 2I0CA 4RK2A 5IAIA 5EYFA 3RLFE 2DXYA 3UN6A 1BP5A 1NNKA 3KJ7A 4H6DA 3T9UA 4F3SA 4KCDA 2XXRA 1Y1MA 3A09A 5AA2D 1IXHA 4NWCA 4MF3A 4OFLA 1D9YA 1USYE 3O6IA 3SEWA 2NXOA 4QSCA 4LZ7A 1S9TA 3ZKLA 1ZLQA 3IB0A 5M2VA 1XVXA 3O66A 1ANFA 3PGFA 1XHYA 3H3GA 3BFTA 1OMPA 4ECFA 3C33A 1QKBA 2F7AA 3K2DA 4GVOA 3TCFA 1A7LA 4GXSB 5A5XB 4U1ZA 4AQ4A 2Y7PA 3IK6B 3K6WA 5BUUA 2RKMA 5B70A 4C1TA 4ZECA 4LUBA 5KDTA 3O2AA 1SW2A 3N94A 4XXUA 4FAJA 3ECRA 1MQGA 1B9JA 1MXVA 4YKPA 4LQ2A 1US5A 4FIMA 4HCWA 1LAXA 1N7WA 2DSFA 4YKJA 3U94A 1QUJA 5KCJB 1M5CA 5HM4B 5J1DA 2NWJA 5H8NA 3K6UA 1RYXA 2ZNTA 4EDPA 4JB7A 4ESWA 1MPDA 2UYEA 4NF6B 4QFOA 4R2FA 4DXCA 3FXRA 4OENA 3IX1A 2VP1A 3PMWA 3GBBA 3H6WA 3OEKA 5I56A 3O97A 3QUFA 1MY2A 3QYTA 4G8MA 2D5WA 2KLFA 1VFDA 3VVFA 3ZS6A 1ZU0A 4ZDMA 1UQWA 3RGYA 2QS1A 2UVJA 4JWXA 3OENA 3LSXA 5CMBA 2QS2A 5CRYA 1NH7A 1DTGA 3KZGA 3OO9A 3K02A 5JTYB 1LGBC 1I6QA 5ISUA 4KI0E 5I57B 4QFPA 2I4CA 3KN7A 3IORA 1WVJA 4F1VA 3OD7A 4F18A 2XX9A 3IO6A 1TWYA 4G2ZA 1T0KA 3FXUA 1SI0A 5CC2A 5H8QB 4MLVA 4LQ5A 3MUQA 3MP8A 5ELVA 5AA1A 1EU8A 3BBRA 4JBZA 3IO4A 1MXXA 3PPQA 2REJA 1I6BA 2DWAA 3LC8A 2QMXA 3MVYA 1DPPA 1IXCA 4F39A 4ZEIA 3I3VA 2Q8JA 2RCAA 1URSA 3S4UA 2IA4A 3MWBA 4ZEBA 3CIJA 2V3UA 2ZYNA 3T96B 3K6VA 4PFYA 1JVXA 4F1YA 1USYH 3S9NC 4IB2A 1B1HA 4I9DA 3GLBA 5I2KA 4JSOA 1DOTA 3C9HA 5L8DA 2Y7WA 2HFBA 4R6YA 1L5TA 2DXRA 2I58A 2ZXTA 4I8CA 4IO6A 2QJEA 5L9OA 4ELQA 1IIWA 3GXAA 4QRZA 2XXWA 3PD8A 4N6PA 4H65A 4XKRA 1LCTA 2O51A 2ZNUA 1B0LA 1B05A 3JZJA 2OZZA 4EF1A 2DS9A 3KG2A 1B1XA 1EH3A 5KZTA 4E0WA 3UP9A 1SYHA 4ZEDA 2XHDA 4MFIA 2QL3A 3HO7A 1FQAA 2DYXA 3G7WA 3RTFB 1US4A 2DVCA 2FNCA 4QSDA 5KDTB 2PT2A 1Q35A 4GWOA 3LR1A 2G93A 3FASA 2NUVA 3MVXA 1BTJA 1SYIA 2A5TB 4R9GA 3QIMA 5EHSA 4H8JA 2VD2A 1EZ9A 2PYYA 4EUOA 1B51A 1LAHE 3KOSA 5CMCA 3PUVE 5KCJA 3TUSA 2HAUA 5DVJA 1EZOA 3MZBA 4WKMA 3EPEA 3H6TA 2B65A 2E1SA 3TQLA 3IJOB 5DTBA 3KSXA 2BJJX 1II5A 3OEMA 1F9BA 3PV0E 1B3EA 4IY5A 1TFDA 3TTRA 3PUXE 3FVNA 1D4NA 2F97A 1N04A 1B40A 2XXQA 2UYFA 3EHUA 1NNFA 2XX7A 4ZE8A 4XKNA 1B5JA 3OMBA 4F29A 4ZZAA 1Y20A 4ZE9A 5I56B 3U1OA 2FA7A 3MVWA 1SBPA 1R1NA 3T9VA 1MH3A 5AA4A 1B32A 3OSRA 2CZLA 4NF5A 1Y4CA 2YJPA 1WDNA 4U2RA 4R6HA 5ITPA 1URGA 4Q30B 3S9LC 2O7IA 1Y1ZA 1Y4TA 3PUWE 5I2NB 1MY3A 3R6UA 1Y3PA 4GD5A 2XD2A 2VGQA 3IB1A 3U72A 1JNFA 4MH5A 4PETA 1LSTA 1P1OA 2Z8EA 2F7CA 3TZAA 2ONSA 1CE2A 5H8QA 3E9XA 4GXAA 2F6GA 3KFMA 2GHBA 3MPKA 3TQWA 3B6TA 4DZ1A 5FTHA 1SQYA 4ISUA 4ZZEA 1OVTA 2ONKE 2RINA 3MAMA 4R6KA 4JXIA 4YKKA 1B3HA 4DDDA 1B46A 3T9XB 1TT1A 2V3TA 4TOZA 3N6TA 4R9FA 3UK4A 2F36A 3K00A 3V83A 1OLCA 4UACA 3UIFA 3KOTA 4G68A 5DT6A 1UIVA 4LATA 1P99A 3EQ1A 3SEXA 4F2QA 4U1OA 3DELB 3ZKKA 3CRBA 5ICQA 5H8SA 2H98A 5I2KB 3Q29A 3EN3A 1ZKBA 1GV8A 3V8XB 3TFLA 3CFLA 4O3AA 3CFXA 5FHMA 1LBBA 4FJPA 1QULA 3MP6A 1TFAA 1MPCA 4H67A 3C31A 3R26A 3VDFA 4OQOA 1FCKA 2P0SA 3K1NA 1PB9A 3U93A 1H76A 4N07A 1Q1KA 3FJMA 1QUKA 4NTLA 3RUMA 4BDRA 4ZS9A 1LFGA 1MS7A 1GVCA 2ZYOA 4IO3A 3RT8A 3TDJA 1A55A 4F22A 3EF7A 1P1WA 2I4BA 4PE5B 3H6VA 5F1QA 1IXGA 1PB8A 4LP2B 2DVZA 2A5TA 1N3XA 4YB5A 1ZMGA 2I49A 4NF8A 3G3HA 4GOTA 4YZZA 4EXLA 4DE8A 4QSEA 1LLSA 1LBCA 3V5AA 3A3UA 4KR5A 4POWA 4YKIA 4QFLA 1VSOA 3QSLA 1VE4A 1OQHA 2R71A 3S9MC 5JEIA 4BDLA 2Y84A 4PFUA 4BLAA 2I0BA 1PDAA 3E4RA 1S7YA 2O69A 1LCFA 4F2OA 1SW4A 1GTKA 1JVYA 5AA4B 4FEDA 4U4XA 4NF5B 4FEBA 4G8NA 1FTOA 1N76A 3CSGA 4QFNA 2THIA 3FVOA 4LZ5A 1LFHA 3CI8A 1JEUA 2X7QA 2OCUA 3Q26A 3LUYA 3Q25A 1LFIA 1OQGA 3VLWA 3R7XA 2Y7KA 2F6PA 3O6GA 3ODBA 4BDNA 1MXYA 5I2NA 2DWJA 1M5BA 1AIVA 2LAOA 2FYIA 3VXBA 4R72A 4H0WA 3L6GA 1VFEA 1YTVA 2F35A 3VLVA 4TLMB 1QUIA 3BFUA 5HBCA 1A8EA 2DQVA 2OBGA 1Z7ME 1Y3QA 2O7UA 4UA8A 1RKMA 3FUZA 1J1NA 4EQBA 3G3FA 3K1PA 2H9BA 4RJZA 3TODA 3S2VA 1A99A 4R74A 3TAJA 5B7DA 1MM7A 3OSQA 3A3CA 2ZNSA 3KN3A 3M3KA 3FD3A 1B3LA 1MQDA 3M8UA 2RC9A 4NE4A 4H5GA 1R9QA 3RQTA 2O6AA 2HEUA 1AH5A 2F5XA 3PMXA 5AE4A 4KCCA 1B52A 3EHSA 3FZVA 4OYVA 4RPNA 3MJNA 1YCJA 3ILTB 4G68B 3C34A 3KEIA 4G8HA 1OVBA 2O1MA 2A5SA 4HCYA 1B2HA 3V89B 1B3GA 3CSBA 3S9EA 2F8DA 3IL1B 2PVUA 2XXTA 3MPLA 2QPQA 2QSXA 5AA2B 4NEDA 2Q88A 3JYRA 4YB6A 2QS3A 4DCXA 5H8HA 3RN8A 2Y7IA 1Y3NA 3PU5A 2D21A 1XVYA 4AB5A 3TTLA 1JQFA 1EZPA 1RYOA 4KFQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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