3C31A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with lithium at 1.49 angstrom resolution
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 81
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c31A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c31A02
4XKQA 4FEBA 4OETA 2Q89A 3IORA 3LSFB 2FYIA 4C1UA 1TFAA 3SEYA 3KOSA 5HPQA 2REJA 2O1MA 4H65A 2V84A 1N04A 1FTOA 2QMXA 2O7UA 5KCJB 3FVNA 1M5EA 2KLFA 1MH3A 1N0TA 5IKBA 4OVJA 4E0XA 5I2NB 3OO6A 1MQGA 4F2OA 3G3IA 1MM6A 1NMUA 4JBZA 2E0SA 1SI0A 5DEXA 4GQOA 5H8QB 1FQFA 3SEUA 2XXUA 3TFLA 1SYHA 3U8QA 4KR5A 1F9BA 4NWCA 3PPOA 4Q5TA 3VVDA 5B7DA 1B3FA 3P7IA 3A3UA 2DYXA 2HXWA 1RKMA 1NH8A 2F7CA 2ONRA 1B0HA 1B2HA 1LFIA 1R9QA 1ANFA 3I6VA 1MH4A 4U1ZA 1B5IA 3K4UA 2F78A 1B3HA 4JWYA 3PGFA 1PDAA 4NF8B 4GIZA 3IB0A 4TLMB 4F1UA 1TXFA 2NXOA 5CRYA 4MLQA 3UORA 4M4GA 3PMWA 3EN3A 1MG1A 4PP0A 3EQ1A 3OMBA 2OWSA 4O3AA 3K01A 1MQIA 4IY6A 3TZAA 5CMKA 4JB7A 1MXXA 4N13A 3QIMA 4NF6B 1QUIA 2GHAA 4GXSB 3MZBA 4IGRA 3SEVA 4R6KA 3KOTA 1SW4A 1LCFA 3GBAA 3QYTA 2F36A 2UYEA 2DE2A 5AA3A 4KHZE 3UIFA 3E3KA 2HAVA 3F11A 4XTCQ 4YZZA 3RTFB 2IEEA 3KSJA 1MXYA 3U92A 4OERA 4IO6A 1N3WA 4KPTA 3PV0E 1BLFA 2THIA 3MVZA 4XIGQ 3TUSA 1T0KA 2DE3A 3RT6B 2QMWA 2P0SA 3CG1A 3K02A 3HCQA 2RC8A 3S9NC 4M1VA 2WKYA 1YAEA 4BDMA 4PETA 4C1TA 3PPRA 1US4A 5TPAB 3JYRA 1BKAA 3EPEA 3SKPA 4RK2A 1MY1A 4EUOA 3TTLA 2Z8DA 3K6UA 3DELB 2QS2A 4ELOA 4I62A 1MY0A 1NH7A 3OEKA 1Y3NA 3Q26A 5FHNA 1RYOA 1JW4A 4KQPA 1LB8A 3RLFE 3IK6B 1P1QA 4ESXA 3FIRA 3HO7A 3M8UA 2REGA 5H8HB 1S9TA 4XXUA 3D4GA 4G2ZA 4RA1A 1JNFA 3BFUA 2UVJA 3CFZA 3BBRA 3TKDA 4KD5A 3TODA 1TT1A 4IY5A 5B70A 4Q8RA 3T22A 3O6IA 2X7QA 4IGTA 4IO3A 1MPDA 2OWTA 3H6TA 4TQUQ 3KN3A 5L9MA 1DTZA 2DWHA 2V3UA 2ZYKA 3KN8A 1TWYA 1LAHE 3HV1A 3VLWA 4RNSA 1Y3PA 4JWXA 4RK9A 3O66A 2ESNA 1BIYA 3A09A 1YTVA 4POXA 2RC9A 1LAFE 2GFEA 3SEWA 1IXHA 2HQ0A 2P1SA 3N6TA 1A8FA 3OXNA 1IXIA 1YCJA 3TTKA 4KYSA 1ELJA 4F29A 3THIA 2RKMA 2XXVA 2XXXA 1B3EA 2I0CA 2O69A 1FQBA 3O6HA 4THIA 4EF1A 4WEDA 4C0RA 2V3QA 3FJGA 4DIGA 5CBSA 3CRBA 3PU5A 3IOUA 1NNFA 4ZZEA 5TP9A 2XXIA 3CR9A 1XS5A 1UTBA 2Z8FA 4AQ4A 1B7HA 1ZKBA 3H7MA 3O97A 3JZJA 1CE2A 3R7XA 2RINA 1WDNA 2PT1A 2UXAA 4Z0IA 3H3GA 3MP1A 1B0LA 3U93A 3WAFA 3C36A 3LBSA 4LA9A 1PBQA 1USYH 3IAZA 3QUFA 2O68A 4ND9A 1IUDA 4MLVA 3ILTB 3TTMA 2IA4A 3MUQA 5JTYA 2D3IA 4PFWA 5H8NB 3ZKKA 3K1NA 3IOVA 3SETA 4PFTA 4QFKA 4NF4B 1O7TA 3RTWB 4G4PA 4G68B 3IB1A 3CSBA 2H4IA 4R6YA 2Y7RA 2VGQA 4I8CA 2ONKE 2GH9A 1JW1A 5F7VA 3B6QA 3MZ9A 4F1YA 4PFUA 3FVKA 2HFBA 3OSQA 2RC7A 4F1VA 3VXCA 2PT2A 1R1NA 3K00A 1GTKA 3PMXA 2DS9A 3MQ9A 3QK6A 2R9JA 2F34A 1HSJA 3KJTA 4FE8A 5A5XA 3S9MC 1DOTA 4L17A 2XXPA 3LSXA 5I56B 1GVCA 5HM4B 3CVGA 3H6UA 1IIWA 5AA4B 4G68C 1D3KA 2H98A 3MJNA 2VD2A 2FA7A 3IOTA 3VDFA 1LLSA 4OFOA 1I69A 4F18A 2HCAA 4KFQA 4GD5A 1A54A 2ZYOA 3PPNA 1QJMA 3T9VA 5I57B 2AL5A 1EH3A 4NE4A 4PE5B 4NWDA 3KJ7A 5BUUA 2I3WA 2Q9TA 3QUJA 1Q35A 4RXLA 1AH5A 2DWIA 2H5YA 2Y7PA 4N6PA 4ELRA 3OO7A 3TCGA 1EZ9A 1P1WA 1B4ZA 3MVYA 2HZLA 1NL5A 1ZTYA 1B3LA 3FV2A 3KEIA 4JSOA 1IXCA 4Q30B 1QKBA 3FVOA 2V3TA 1DMBA 4YKJA 4P0IA 4LZ8A 2ONSA 2AYSA 3Q29A 4IO4A 1POY1 2ZYMA 3LSLA 2R71A 1P1UA 3PUYE 1JVXA 2AIXA 4RY1A 2OJTA 3TPAA 5LOMA 1WVJA 4QSEA 1UQWA 1XOCA 3G3KA 1N7WA 3PD9A 3O2AA 5I2KB 1HSEA 1AL3A 4FIMA 1SYIA 4K3FA 1DTGA 3T93B 3I5OA 1VR5A 4QSDA 1LFHA 1MQDA 3TMGA 3FUZA 4LATA 3ZS6A 4QF9A 4FECA 2PVUA 4NF5B 1B7UA 4OEUA 5AA1A 2XXYA 4O3CA 4R73A 2Q2CA 1US5A 1SQYA 1XVYA 2ZMBA 2NWJA 3PUWE 1LB9A 2F6GA 1I6QA 3D4CA 3VFJA 4X9TA 5K2YA 2NUVA 5I58B 1VFDA 4NTLA 4ZECA 5CMBA 3TQLA 3Q25A 1GGGA 4JXIA 1LFGA 4F2QA 3FJMA 2VP1A 1FQDA 2A5TB 1JEUA 4YMBA 2XXRA 1XHYA 4R9FA 2FNCA 3K1MA 2OBGA 1FQCA 3GXAA 3FZVA 1D9YA 4N07A 1PBPA 2Z23A 4FORA 4QRZA 1PC3A 4PFYA 5ICTA 1Y1ZA 4YICA 3RPWA 3OENA 5I59A 1MDP1 3TYHA 4YKKA 4BDRA 1JQFA 2QS3A 1D9VA 4DXCA 1UTHB 1IQ7A 4H0WA 1POTA 3ZKLA 4H1XA 4GWOA 3DP6A 3LSWA 1O64A 1AIVA 4QFPA 1MXVA 4G77A 3GLBA 3SESA 5JK4A 3VXBA 3FGSA 4LUBA 3WAEA 1MXWA 3DLNA 5HBCA 1M5BA 1MQHA 4EQBA 2ZNUA 3IOWA 2XXHA 3QXMA 2Q88A 1TFDA 4P11A 3HN0A 3T9UA 4YMAA 4EF2A 4ECFA 2D21A 2O1LA 3PUXE 4R2BA 3CFLA 4QHQA 3USDA 4HCYA 4X1BA 2OLBA 1QULA 1I6AA 1A40A 4GLIA 4UACA 4KI0E 2VD3A 1B6HA 4POWA 1ZLQA 4F3SA 3U72A 5DEXB 1A55A 1URDA 5ITOA 2VHAA 2B3FA 1FTMA 2DP8A 4NMYA 1WODA 4R9GA 4BDNA 2PBWA 1B1XA 3TTNA 3H06B 4KCCA 4BDQA 1H43A 1MRPA 2NOOA 4ELQA 4ZEBA 2HAUA 4DZ1A 3TCFA 2XXQA 3MAMA 1MPBA 2CZLA 5AA2A 5EHMA 4YKIA 3W9WA 4LP2B 2GHBA 1Y9UA 2A5SA 2QSXA 3FATA 3OOAA 4OZ9A 4FATA 5F1QA 4FJPA 1MQJA 4WEPA 4ZEFA 1USYE 5H8FA 1GV8A 1B05A 4RPOA 3TAJA 4JDFA 4MF3A 3RT8A 5CC2A 3MP6A 1OVTA 3MPKA 1I6BA 1RYXA 4ZZAA 3UGWA 1QVSA 3V5AA 1OMPA 4ONYA 2F97A 1MDQA 3VE1B 1CB6A 1OQHA 2QS4A 4KCDA 2F8DA 4O3BA 3T9HB 3U1OA 1J1NA 3DP8A 3T66A 1DPEA 4BLAA 3CI8A 4QSCA 2H99A 4JWOA 1A99A 3O6GA 4G8HA 3V89B 2G29A 2H25A 3RNNA 3RUMA 1FTLA 3QAXA 2VOZA 2OK2A 1PEBA 4DCYA 4F39A 2DOJA 1M5DA 4LVQA 5KDTA 3ZSFA 3UK4A 2DXYA 3FD3A 2YLNA 4RPNA 1GR2A 5DTBA 4GL0A 1MY3A 1Y20A 3G7WA 3Q28A 4ZEIA 5BWJA 3RY3A 2DXRA 1JW5A 2Q2AA 4LQ2A 4QFLA 1OLAA 5AA2D 3ECRA 2ANJA 5IAIA 1XC1A 3E9XA 5KCJA 4OXVA 3E13X 3G3HA 4ZDMA 1ATGA 5I2NA 4GFRA 1MS7A 4RJZA 4YB5A 3IJOB 1SW1A 5H8QA 2AL4A 1B4HA 3ONMA 1MPCA 1Y4TA 1NFTA 3K6XA 3VV5A 4GXAA 5L9SA 5FTIA 3OO9A 4ZE9A 3DP4A 3MW0A 3VLVA 3PD8A 3W15C 4NEDA 1LBBA 1IEJA 3BKIB 1IZ1A 1AMFA 4G8NA 4OFJA 2XD3A 3K2DA 3PUVE 1OQGA 4R6HA 4NF8A 3C35A 3EHSA 4EXLA 4U2RA 4DLDA 3M3FA 3QSLA 1P99A 2I0BA 2F6PA 3C34A 3CFXA 2O7IA 1Y1MA 2D5WA 2ZYNA 4H5GA 3L6GA 4ZS9A 3MVXA 2XXWA 1UIUA 4NF6A 5TP9B 1QW0A 4GOTA 3KZGA 3IO6A 3MVWA 5DVIA 4R74A 2X7PA 1B5JA 1UTBB 4XKNA 5JEIA 3FASA 3TELA 2UVGA 2DWAA 1N76A 1FCKA 2QPQA 3LC8A 3S2VA 2F35A 2DVZA 1ZJLA 1FTKA 2UVHA 5JTYB 2I4BA 1XT8A 4EXKA 4OQOA 1LAGE 2NVUB 4R75A 3GBBA 4HS7A 4RYAA 3FJ7A 3S9EA 5TPAA 3B7DA 1MM7A 3PPQA 1VFEA 2CMOA 3JV9A 1SVXB 1ZMGA 4TOZA 1LSTA 3M3KA 5L9OA 4EQ7A 1II5A 3KG2A 1QKAA 3EF7A 3N26A 4KYEA 5CM6A 1M5CA 3K6WA 4GVOA 1BTJA 1QUJA 3LUYA 5CMCA 3CSGA 4U22A 3C32A 1B51A 4ZEDA 1FW0A 5H8HA 4DE8A 4UA8A 3K0VA 5A5XB 4HTGA 3OD7A 3HPIA 1D4NA 1R9LA 2B3BA 4YB6A 3G3GA 4ZEKA 2H9BA 1B7ZA 3B6WA 1P1NA 1H76A 1MXZA 1URSA 3ILUB 3OO8A 3V8XB 4GL8A 2UYFA 2W7YA 2X26A 3VVEA 4R2FA 3K6VA 4YAHX 2XX8A 1B32A 4OMBA 5ISUA 3G3FA 4LONB 2DE4A 1AOVA 1BP5A 2PYYA 3ODBA 3B6TA 3C33A 1IITA 1JETA 4GF8A 2OCUA 4YU0A 3MPLA 1R6ZA 4U23A 2RCAA 2DQVA 4BDLA 3KSXA 2I4CA 4I1DA 2I6EA 1OIBA 3IL1B 1LCTA 5CMMA 5EYFA 3FXUA 5FHOA 4G8MA 1SW2A 1N84A 2YPNA 2HZKA 5DYHA 3FXQA 1ZU0A 3MZ1A 3UA8A 4X48A 4E0WA 4IO5A 4DDDA 1NNKA 3H03A 1HSLA 5CBRA 1JEVA 4IO2A 3CG3A 4MBPA 5DVFA 1NKXA 4EQ9A 3PUZE 1SBPA 3C9HA 1B52A 2UVIA 1FQAA 4DXBA 4WXJA 2M8CA 1XVXA 4Q0CA 3Q27A 1VE4A 3OSRA 4F3PA 3V83A 5J1DA 3HHGA 2RCBA 5TU0A 4XKPA 3TCHA 3N6UA 1NNPA 2F7BA 3N94A 1Y3QA 3KN7A 5CI5A 4X1DA 1N7XA 3I3VA 3H4ZA 5H8NA 2Z22A 2XD2A 4AB5A 3C31A 2QS1A 4F22A 4YB7A 1VSOA 2PMSA 1Z7NE 2Q8JA 1B1HA 4ELPA 4NF4A 4IO7A 1EZPA 2O51A 5DVJA 4IB2A 4G68A 1MXUA 1ZBMA 3A3CA 3EHUA 2ABHA 1Y4CA 4PQJA 3C4MA 2F5XA 2QJEA 3U94A 2XX7A 2O84X 2O6AA 3PMVA 1OVBA 4LQ5A 3BFTA 1SD3A 4LZ7A 1PB8A 2DSFA 3IX1A 1B9JA 2I48A 4EDPA 3FXRA 2HEUA 1A8EA 2LAOA 1PB7A 3R6UA 5I56A 2Y7WA 5I59B 5KZTA 5AA4A 3KFMA 2GRVA 5ELVA 4AB6A 4F3BA 1LAXA 1PB9A 1O63A 2QL3A 4OEVA 3T96B 1H45A 3M3LA 1MY4A 1B46A 4XKRA 3IR1A 1YPNA 4BDOA 5I57A 3TQWA 2DWJA 3H6WA 5DT6A 4ISUA 1DPPA 5FTHA 1Z7ME 4U1OA 3PPPA 4H6DA 1B5HA 3DM0A 1UIVA 2Y7IA 3OELA 4HW8A 3VVFA 4HCWA 2Z8EA 2F7AA 5FHMA 4OFLA 3IO4A 3KGCA 4JSDA 1FTJA 3UN6A 3HSTA 2QRYA 5ICQA 4U21A 3L6HA 3EHTA 3GZGA 4FEDA 4FAJA 5I84A 3LR1A 2B65A 4H8IA 2RF1A 3RQTA 1B3GA 2YJPA 2R6GE 3SERA 1Q1KA 2G93A 4WKMA 3VLUA 4QFOA 5AE4A 2Y7KA 1URGA 3TTRA 4OWDA 3N5LA 3FVGA 4U4XA 3UP9A 1DSNA 1MY2A 5I2KA 4F31B 2E1SA 2ZNTA 3E4RA 3S4UA 4H5FA 4OTEA 3MC2A 4LZ5A 2DVCA 1L5TA 3KBRA 1LGBC 3MP8A 2P2AA 1NNTA 5K2XA 5AA2B 4F19A 2ALUA 1FQEA 2OZZA 2XXTA 3MBPA 4KYDA 3S9LC 4ZE8A 3RGYA 4NF5A 3RN8A 1A7LA 2ZXTA 3CIJA 1IXGA 1SDXA 4DXUA 3HHFA 4OYVA 3H6VA 1B40A 5H8FB 1SW5A 4DCXA 5I58A 3IB2A 4OHNA 1ZIUA 1SI1A 2I49A 3MWBA 1N3XA 3IJXB 3O28A 2A5TA 1H44A 3G3JA 4F3GA 4ESWA 4H8JA 1OLCA 2I58A 3TDJA 2V93A 1S50A 4QFNA 3SDFA 4YKPA 2BJJX 2PX1A 1KWHA 4MH5A 4OESA 4R72A 1QUKA 4MFIA 3O9PA 5EHSA 5L8DA 5M2VA 2XHDA 4TLLB 4GRKA 3AXFA 1P1OA 3T9XB 2XX9A 5ITPA 3FV1A 1LBCA 4Z7EA 1JVYA 1EZOA 4OENA 4P0GA 4H67A 1EU8A 1UTHA 1S7YA 2I3VA 2Y84A 3W9VA 5H8SA 3SEXA 1H3DA 4U4SA 4I9DA 3O29A 3OEMA 3R26A 3K1PA 1M5FA 3TEPA 1B58A 5KDTB 2V25A 2ZNSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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