3C31A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with lithium at 1.49 angstrom resolution
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
total genus 81
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c31A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c31A02
3UK4A 2HEUA 2Y7PA 3OO9A 5H8SA 2Q2CA 3C32A 3QUJA 4NMYA 1J1NA 3O66A 4XTCQ 1PBPA 1N0TA 1PC3A 4FECA 4O3BA 4XKNA 4YKJA 1IXGA 3E13X 3FASA 3VVEA 5I56B 2NOOA 3ZKLA 4E0WA 1FQCA 1P99A 3MVXA 3N6TA 1RYOA 3ILUB 4DZ1A 4H65A 2O7UA 2FA7A 2I49A 3S9LC 4F3PA 4OENA 4EQ7A 1B32A 4M1VA 2VD2A 4LONB 1S9TA 4F2OA 2XX7A 3BFTA 3RLFE 5I57A 2GH9A 4KR5A 3H6TA 3C9HA 2OWSA 4YZZA 3HN0A 4PFTA 2XD2A 3VLVA 4DE8A 3PD9A 4YU0A 1TWYA 1VE4A 3CSGA 3KSXA 1H45A 4BDOA 4YB6A 3PPRA 3CG3A 4U21A 3TPAA 4GFRA 1SBPA 2H9BA 2PYYA 2VP1A 1MXZA 4YB5A 2O7IA 4ZE9A 4QFOA 1B3GA 1B52A 1LB9A 2QPQA 3IB1A 3M3LA 3CG1A 1IEJA 4YAHX 1FTLA 4G4PA 3OSQA 1BIYA 4R72A 1UTHA 2IA4A 1B1XA 2Q88A 1ZU0A 5AE4A 5I58A 1YAEA 3H7MA 3HO7A 3KN8A 1MH4A 1O63A 3TZAA 2I4CA 2F97A 4HS7A 4QSEA 2ALUA 4G8MA 2ONKE 1YCJA 1JEVA 4C1UA 2O6AA 3T66A 3KGCA 2X26A 3A3UA 1AMFA 4OHNA 1Q1KA 2UVJA 2QMXA 4OESA 4EUOA 1F9BA 1B7UA 1MPBA 2OK2A 2X7QA 3IAZA 1FQFA 1BKAA 1NL5A 4ESXA 1OIBA 2B3FA 2BJJX 3DLNA 3SERA 3SEUA 2QRYA 5M2VA 4FIMA 1OQHA 1MM7A 1M5BA 1HSEA 1Y3QA 2H98A 3IB0A 4DXBA 1BTJA 5L9SA 1SDXA 2QJEA 5H8HA 4PE5B 1NH8A 1LGBC 1FTKA 4JDFA 4MLVA 1B3FA 3OOAA 4OYVA 5EHMA 5ICQA 4JSOA 4POWA 1D9VA 5J1DA 3ODBA 1P1QA 2FNCA 1B5IA 2DVCA 4RK2A 4LZ7A 3PPNA 4F22A 5H8FA 1EZOA 4U1OA 2NVUB 3OO7A 3BFUA 4L17A 5BWJA 3S9MC 4PFYA 2UYFA 3LUYA 1JVYA 1PEBA 2G29A 3MPLA 3MVYA 3OO6A 1S50A 4R6HA 1US5A 1DMBA 1B3HA 1SD3A 4I9DA 2YJPA 1O64A 5ITOA 1RKMA 2ZXTA 1IQ7A 5KDTA 1B4HA 2YPNA 1IITA 3H6UA 3MUQA 1IUDA 3QXMA 1DTGA 4ZDMA 3VDFA 3IJOB 1MXWA 4F3SA 3OSRA 2H4IA 1ELJA 4JBZA 3FXQA 4NF8A 4NE4A 3B7DA 5FHNA 2Z8FA 4AB5A 4X1DA 1B05A 2OWTA 4RPOA 3IR1A 2Z23A 3MP8A 4FE8A 1Y3NA 3TTKA 2UYEA 3VE1B 3H03A 4ELRA 5CC2A 1CB6A 1LCFA 3IB2A 1XC1A 1L5TA 5ICTA 5IKBA 3T93B 5IAIA 1SYHA 4MBPA 2VGQA 2YLNA 1GTKA 1DSNA 4EDPA 1XVXA 2ESNA 3O97A 4C1TA 1JEUA 3DP8A 2HCAA 2E1SA 3Q27A 4I8CA 4UA8A 4NWDA 3C35A 2PT1A 4ELQA 3LC8A 1WDNA 2UVGA 5H8QA 1XT8A 3KJ7A 4F19A 3K1NA 3K4UA 3KN3A 2O1LA 3PUYE 2OLBA 4KPTA 4X9TA 4ZEKA 3T9XB 3K1MA 4KCCA 3TTLA 2QS4A 2AL5A 4YKKA 1LAHE 4U23A 2GHBA 1P1NA 1UIVA 1QULA 2QMWA 3G3HA 3K2DA 4AQ4A 3I3VA 1XOCA 2I48A 4GRKA 5I2KA 3UA8A 1MDQA 4IO3A 1UTBA 4F29A 1IXIA 2M8CA 4TLLB 2XXVA 1I6AA 3LSWA 3KJTA 3PUZE 4IY6A 2W7YA 3FD3A 2F36A 4GOTA 3QAXA 4NF5A 3EPEA 3K6WA 1NH7A 2QS3A 4N07A 5DEXB 5JEIA 2AL4A 4IY5A 1A40A 1SW5A 2O84X 2Q9TA 2REJA 5DT6A 5FHMA 1US4A 1OLCA 2F34A 3BBRA 2RINA 3G3JA 4IO4A 1OVBA 4Q8RA 5DTBA 5I58B 1PB9A 2F6PA 2NXOA 4M4GA 4QF9A 3D4GA 1B46A 3DP6A 3N94A 5DVFA 3ZSFA 5HPQA 1YTVA 1SQYA 3H06B 3ILTB 2XXYA 4KD5A 4R2BA 4RYAA 1Y4TA 3PPOA 4ONYA 1LCTA 1N76A 3R7XA 2XXXA 5TP9A 1MY3A 3THIA 3KG2A 4G8NA 2DWIA 2H25A 3QUFA 4Q0CA 4X48A 2Y7RA 2I0CA 4WEPA 2ZNTA 3RT8A 3H6WA 4GLIA 5F7VA 4BLAA 1MDP1 1PBQA 1H44A 3CFZA 4U1ZA 4ZZEA 1N84A 4YKIA 3G3IA 2AYSA 3V89B 1USYH 4R6YA 1MY4A 1NNPA 3HSTA 3KEIA 4OWDA 5TU0A 4ECFA 2ZYNA 3IOUA 3K00A 2Q2AA 4QSDA 4R9FA 3H3GA 5CMBA 3OO8A 3IK6B 5H8HB 2Y7KA 3PGFA 4RY1A 4GWOA 5TPAB 4G68A 4DIGA 5L9OA 4P11A 4X1BA 3VXCA 1MPCA 1H3DA 1Y1ZA 5LOMA 3TCHA 1Z7NE 1P1OA 3DELB 1B58A 2I3VA 4KYDA 4AB6A 3EHTA 4LQ5A 3OD7A 2HZKA 3CVGA 4R9GA 2Y7WA 3CFLA 1JQFA 4XIGQ 2QS1A 3B6TA 2I58A 4MH5A 1PB8A 4NF6A 2Q89A 3N26A 4NTLA 3U8QA 4P0GA 1FCKA 3ECRA 3P7IA 1NNTA 1JETA 4RA1A 2OZZA 5KCJB 3K01A 1B40A 1SVXB 1YPNA 5AA4A 2OCUA 3W9VA 1POY1 4F1UA 1R9QA 3FV1A 3IO4A 2LAOA 3FV2A 3HV1A 3IJXB 3L6GA 1A8EA 4LP2B 4PP0A 3RGYA 3FATA 4Z0IA 2DXYA 2RF1A 5FTHA 4EQ9A 4HCYA 3EHSA 3KOTA 2V93A 1O7TA 3O6HA 1FQBA 1JW5A 4QRZA 3G3FA 4E0XA 1USYE 5I2NA 3Q29A 2UVHA 1XHYA 3IOVA 3KSJA 2Y84A 2RKMA 3RNNA 3V5AA 4PETA 2ONSA 3ONMA 3WAFA 2WKYA 2DXRA 4F3GA 5H8NB 1FQEA 1MXXA 1Y1MA 4FEDA 4U2RA 4OERA 3T22A 1XVYA 1ZKBA 2RC9A 1T0KA 4IGRA 1B5JA 1GGGA 1A8FA 1UTHB 3Q26A 4ELOA 2XXHA 3RT6B 4DXCA 1UIUA 2DE3A 3TQWA 2O69A 2X7PA 3LBSA 2ONRA 4JB7A 1ZBMA 3ZS6A 3O2AA 2F8DA 1FW0A 1B0LA 4H0WA 5JTYA 1N7WA 5KDTB 2HAVA 3QK6A 1QUIA 5ITPA 3D4CA 3FUZA 1MXYA 1LFGA 2QL3A 1D4NA 3JYRA 4NWCA 1AL3A 1EZ9A 5EYFA 3RY3A 1UTBB 3TTNA 4MF3A 4F1VA 4YMAA 4DXUA 2DSFA 4GQOA 5TP9B 1B5HA 2DYXA 1LAGE 3FXRA 3VV5A 5AA2A 4BDLA 4F3BA 1B51A 1Y9UA 3FJGA 3MQ9A 1M5FA 1PB7A 2A5TA 1ZIUA 2XD3A 2OBGA 3CSBA 2RC8A 2I3WA 3G3KA 3M3FA 2XX8A 1B3LA 1D3KA 4G8HA 4LZ5A 4EF2A 4F18A 3MVZA 5B7DA 3E4RA 1TT1A 3MW0A 4RNSA 3PUVE 2PT2A 1HSJA 3IORA 4GIZA 4IGTA 2QSXA 2UVIA 3G7WA 4QHQA 2Z8DA 5FTIA 1SYIA 1MQIA 4R74A 2V3QA 2DS9A 2V25A 5HM4B 4GL0A 1AIVA 3TCGA 2ZMBA 3SDFA 2D21A 2D5WA 4HW8A 5CM6A 4POXA 2XXWA 3MZBA 5EHSA 1B0HA 3B6QA 3H6VA 4N13A 4R73A 2XX9A 2R71A 3EQ1A 3T9UA 4P0IA 5H8FB 1LAFE 4GD5A 4JWYA 2F35A 5K2XA 2RC7A 3B6WA 3FVOA 3O28A 3PD8A 5DVIA 3AXFA 3RN8A 2HQ0A 4H8IA 4ELPA 4WXJA 1OVTA 1Y3PA 2NUVA 4FJPA 3TMGA 1GR2A 1AOVA 3LR1A 5ISUA 1B7ZA 2H99A 1N3XA 2PX1A 3C36A 4OEVA 4YICA 2ZYKA 4Q30B 3UIFA 3V8XB 2ZYMA 1P1WA 1VFEA 2F5XA 4G68B 4NF8B 3RTWB 4G2ZA 3R6UA 1H43A 1QUKA 1QW0A 1R9LA 3DM0A 3U1OA 1LBCA 1QUJA 4OTEA 4PFWA 3U94A 1FTJA 3K0VA 2DE4A 3MP1A 5DVJA 5K2YA 3TELA 2I6EA 4YKPA 4YMBA 5I59A 3Q28A 4IO2A 4K3FA 3RUMA 3KOSA 1LFIA 4OMBA 4KFQA 5KCJA 3TQLA 1VSOA 1FTOA 3PUXE 1WVJA 4TLMB 1SW1A 4H6DA 4C0RA 4ESWA 2DE2A 3PMWA 2DWAA 3R26A 3GZGA 1ZTYA 2DOJA 2I4BA 3C33A 3CR9A 4ZS9A 5HBCA 3TODA 3PUWE 2DVZA 4OXVA 1M5EA 2P1SA 3LSLA 3PMXA 4XKQA 1IXCA 1DPPA 2OJTA 4RJZA 3TEPA 2F6GA 3SEVA 1S7YA 2THIA 3EHUA 1MS7A 1OQGA 3QSLA 4TQUQ 5I57B 1KWHA 5I2KB 2V84A 3W15C 5A5XA 5L9MA 1LFHA 1MH3A 3FJ7A 4LQ2A 4KHZE 1MQGA 1B7HA 1Q35A 1PDAA 1QKBA 2REGA 5TPAA 1ZJLA 1II5A 5FHOA 1B4ZA 3TUSA 1FTMA 1MQJA 4U4SA 4GF8A 3LSXA 3M8UA 1QKAA 4LZ8A 5CRYA 3TKDA 2O68A 3HHFA 1B9JA 1B1HA 1FQAA 3MWBA 3GLBA 4GVOA 1TFDA 3C4MA 3L6HA 3IOWA 1I69A 4Z7EA 2HXWA 3FGSA 1DTZA 3E3KA 2CMOA 3OENA 1A55A 1MXVA 3PU5A 4N6PA 4Q5TA 3FVKA 1EZPA 1ANFA 2PMSA 3N6UA 3OELA 5AA3A 5AA4B 1IZ1A 3VLUA 4JSDA 5CMMA 3TAJA 3MP6A 3IL1B 5CBSA 4O3AA 1NMUA 4EXLA 4ZE8A 3KFMA 3G3GA 3FXUA 1UQWA 4FEBA 5AA2B 1QVSA 4GXSB 2F7AA 4RPNA 4FORA 4JXIA 3T96B 2AIXA 2PBWA 4UACA 4BDNA 3M3KA 3I5OA 5L8DA 5BUUA 3MPKA 4LATA 1LBBA 4HTGA 4WKMA 3T9VA 3CRBA 2D3IA 3JZJA 2F78A 1GVCA 2GHAA 3EF7A 2XXQA 4KYSA 3SEYA 2XHDA 5A5XB 1JVXA 1A99A 1HSLA 2VOZA 4XXUA 4I1DA 3GBAA 1B3EA 4BDRA 1XS5A 3BKIB 2DP8A 2F7BA 3VVDA 5I84A 1POTA 4HCWA 4G68C 1SI0A 2ZYOA 2V3TA 2A5SA 2PVUA 2Q8JA 1M5DA 3SETA 4U22A 2DWJA 1EU8A 4IO6A 1R1NA 1N04A 4F31B 4IO7A 2XXIA 4OZ9A 3SEWA 3QIMA 3VLWA 1VFDA 1P1UA 2H5YA 1WODA 3PPQA 2FYIA 3S4UA 4FAJA 3K02A 2KLFA 4I62A 3QYTA 1DOTA 3LSFB 5AA1A 3MZ1A 1JW1A 1M5CA 3KBRA 1IIWA 1CE2A 3F11A 3TCFA 4OVJA 4YB7A 1SW2A 1MQHA 5KZTA 3FJMA 2ANJA 4XKRA 2F7CA 4MFIA 5I56A 3CFXA 2E0SA 1OLAA 2HZLA 3MVWA 5F1QA 1URDA 3VVFA 2XXPA 3OEKA 4DLDA 2B65A 5AA2D 3V83A 1TFAA 3OXNA 3SEXA 3C34A 3SESA 2P2AA 4QFNA 3O29A 3VXBA 4BDQA 5CMKA 3RPWA 4EF1A 4R75A 1ATGA 4TOZA 5I2NB 4QFLA 4KYEA 4DCYA 1D9YA 2O1MA 4PQJA 1Y4CA 1R6ZA 2DQVA 1MG1A 4IO5A 2CZLA 4KQPA 4NF4B 2XXUA 1MM6A 1ZLQA 5CBRA 3O6IA 4QFPA 3MC2A 5H8NA 3GBBA 2O51A 2RCAA 1BLFA 4OEUA 3U92A 2DWHA 4H67A 2P0SA 4OFLA 1LLSA 3ZKKA 2V3UA 1MQDA 4RK9A 3UGWA 3PPPA 4JWXA 4BDMA 5B70A 4OQOA 1FQDA 3IO6A 3K6VA 4U4XA 3TDJA 3GXAA 3O6GA 4R6KA 3IOTA 2ZNSA 3A3CA 4XKPA 5H8QB 3N5LA 1NNKA 4DCXA 2Z22A 4NF6B 3TTMA 1NNFA 3UP9A 3UORA 5CMCA 3FVGA 4ZECA 1A54A 1MY1A 1MY0A 1OMPA 3DP4A 4GL8A 4H1XA 4NEDA 4EXKA 4GXAA 4OETA 1MPDA 3RQTA 1A7LA 5JTYB 3FIRA 1RYXA 1LAXA 4F2QA 4WEDA 1TXFA 4KCDA 4IB2A 3TFLA 2VD3A 4OFJA 3K6XA 1IXHA 3UN6A 3KZGA 3CIJA 4NF5B 5CI5A 3SKPA 1JNFA 4LVQA 2Y7IA 5ELVA 1Z7ME 4LUBA 5DEXA 1SW4A 4R2FA 2A5TB 3W9WA 3HPIA 2XXTA 1JW4A 1I6BA 1ZMGA 4O3CA 4ZEFA 4DDDA 3U72A 4EQBA 2R6GE 3K6UA 3VFJA 5I59B 3S9EA 2G93A 4NF4A 3C31A 1URGA 3FZVA 3HHGA 3HCQA 3MAMA 4RXLA 2HAUA 4F1YA 1N7XA 2XXRA 3H4ZA 1LSTA 1NFTA 3JV9A 3T9HB 4KI0E 1NKXA 1SI1A 3K1PA 4JWOA 2RCBA 4ZEDA 3USDA 3MZ9A 2R9JA 3PV0E 2VHAA 1BP5A 3Q25A 1Y20A 3IX1A 2HFBA 5DYHA 4ZEIA 4FATA 3OEMA 1DPEA 4LA9A 4THIA 3O9PA 3E9XA 4G77A 3MJNA 1EH3A 1LB8A 4ISUA 4QFKA 3S9NC 1MRPA 4H8JA 4PFUA 2Z8EA 3OMBA 3I6VA 4MLQA 3WAEA 1I6QA 2ABHA 4F39A 4OFOA 3PMVA 3U93A 1H76A 3TYHA 3KN7A 4H5GA 1GV8A 3A09A 3MBPA 3CI8A 4ZEBA 3RTFB 4ND9A 1N3WA 2NWJA 5JK4A 3S2VA 1URSA 4H5FA 3EN3A 2GRVA 2GFEA 1MXUA 2QS2A 3FVNA 3TTRA 1B6HA 1QJMA 2B3BA 2I0BA 4QSCA 1MY2A 2IEEA 4ZZAA 1AH5A 2UXAA 1VR5A 1B2HA 2ZNUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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