3C31A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with lithium at 1.49 angstrom resolution
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c31A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c31A02
3TELA 3OO6A 2ESNA 3C9HA 1QKAA 1Q35A 1FTOA 2AIXA 3MC2A 4RXLA 5LOMA 5I59B 4OQOA 4DLDA 2QS3A 2NWJA 2UYFA 4ZZAA 5IAIA 4RNSA 5BWJA 4R72A 3RTWB 4ZS9A 2FNCA 4Q30B 4NF8A 4EF1A 3U1OA 1BP5A 3PPRA 3CRBA 1I6BA 1MQIA 4ZECA 1OLAA 3VLUA 1B9JA 4F3GA 3FUZA 3Q26A 3E13X 1R1NA 3O6IA 2F35A 4GXSB 3RGYA 1FQEA 3E4RA 3K6UA 4E0XA 3KZGA 3TTLA 4JBZA 4N07A 4ESXA 2E0SA 2DE3A 4C0RA 4LATA 1MXWA 3LR1A 1Y4TA 1N84A 5DVJA 4PP0A 3RT6B 4WKMA 1GGGA 1MM7A 1Y3QA 4N13A 2DSFA 4P11A 4AQ4A 4KR5A 1ZLQA 5ITPA 1QULA 3QYTA 1MXZA 2XXPA 3I6VA 4OETA 1SDXA 4HW8A 4I9DA 3K1MA 5CI5A 2IA4A 1D3KA 2O7IA 3LSXA 2B3BA 4PFYA 4HCWA 4G8NA 1Y9UA 3U92A 3PPOA 2Q89A 3FVKA 1A8FA 1VFEA 3T9VA 3TQLA 1PDAA 2HXWA 2B65A 5AA1A 2I6EA 4NF4B 4HCYA 3Q27A 1M5BA 2QJEA 1Y1MA 3PMWA 5I59A 2Z8EA 3OO7A 1B3GA 4QFNA 3FVNA 1NNPA 5KCJB 2DVCA 3CSBA 5DVFA 1EZOA 4JDFA 1B52A 2VGQA 1ZKBA 1LAFE 4IO4A 2ONRA 3N5LA 2XXRA 1LAGE 3F11A 1QVSA 2DOJA 1NMUA 3M3LA 1D9VA 2Q9TA 1B2HA 3MPLA 4RYAA 3OSQA 3IOWA 5ITOA 4NF6B 1POY1 3OO8A 3MWBA 3HV1A 1AL3A 3MZ9A 5F7VA 1Y1ZA 4RJZA 3S9LC 4GVOA 4P0GA 4F1VA 3SETA 4X48A 3T66A 4I62A 2PBWA 1PC3A 2YPNA 1B0LA 4DXUA 3BFUA 3K0VA 4HS7A 3H6VA 3C4MA 3H6TA 2Z8FA 2V25A 1FQBA 4GQOA 1Y3PA 4ZEKA 4C1UA 4KPTA 3B6QA 1VE4A 3TKDA 3VDFA 4LZ7A 3KJ7A 1AIVA 3O97A 4QFPA 4G77A 2Q2CA 4OTEA 4KYSA 3H7MA 1CB6A 3O6GA 4OFLA 1A54A 2XXUA 1QUIA 1MRPA 4XKPA 2ZYNA 2XXYA 1Y4CA 3ZKKA 3T96B 2NUVA 4FATA 2OK2A 3RPWA 1UTBA 3TCFA 3PMVA 5KDTB 1I6QA 2HFBA 3C33A 4R9FA 4X9TA 1FTLA 4OFOA 3CFXA 2IEEA 3CVGA 4F22A 1FTKA 4AB5A 4PFUA 4U21A 2PT1A 4YMBA 4NF4A 3C34A 1B5IA 5I2KA 4EF2A 1MM6A 1PB8A 1XHYA 3MW0A 4JB7A 1B0HA 4F2QA 5KCJA 3K01A 4ZEDA 5FTIA 4POWA 1B3HA 3MQ9A 4ZEBA 3KSJA 2UVGA 2VHAA 4QSCA 2QPQA 1IIWA 4ZE8A 1MPDA 3MZ1A 4GRKA 2HEUA 4IGRA 4F31B 4RK9A 3TTRA 5B70A 3RQTA 1Y3NA 3OD7A 5HM4B 3K1PA 4BLAA 1IZ1A 4NF6A 3WAFA 3OENA 2BJJX 4KI0E 3S9MC 4H8IA 2Q88A 5CBSA 2DE2A 1ZIUA 4U22A 1URGA 4GFRA 1UIUA 3PGFA 4IB2A 3UGWA 3PV0E 3QSLA 5FHOA 3KGCA 4EXLA 4ONYA 2I3VA 3G3GA 1D4NA 2Y7KA 1H45A 1M5DA 2PMSA 2F8DA 3LUYA 4ZEFA 2XHDA 2ZYOA 4EQ7A 2OWTA 4JXIA 4NMYA 4KCCA 5JTYB 5EYFA 3MP8A 1MDP1 4H67A 2V84A 1US4A 4R9GA 3DELB 2AL5A 3CSGA 4YU0A 4U23A 2F34A 3OMBA 3OO9A 3USDA 1A7LA 2B3FA 4KD5A 5A5XA 5DTBA 4OXVA 1PBQA 1JVYA 2H99A 3QUFA 3R7XA 2V3TA 4F1UA 1IXGA 1WVJA 3PMXA 4G4PA 4I1DA 1DTZA 3OEMA 2W7YA 1B3LA 2H4IA 4AB6A 5FTHA 1EH3A 4OVJA 3DLNA 1L5TA 1QW0A 3O29A 3HHGA 5H8FB 2O69A 4LA9A 3IR1A 1N76A 3PUZE 1B51A 4GL8A 3FVOA 3DP6A 4X1BA 4UACA 1KWHA 4RPOA 3G3JA 3EPEA 1GR2A 5CMKA 3RT8A 4U4SA 3PUYE 4ZDMA 3DP4A 3KJTA 5TP9B 2F6GA 5HPQA 2P1SA 4MF3A 1MY1A 4DE8A 1US5A 4MFIA 3TPAA 3VFJA 3K6VA 3H3GA 2DWIA 3GLBA 5I57B 2XXQA 5DEXB 3OOAA 2GFEA 5ICTA 1A40A 5H8NA 2LAOA 4NWDA 3A09A 1B1XA 5JEIA 1SVXB 2O1LA 2UVJA 4XTCQ 3I3VA 2DXYA 3UORA 1JEVA 1SW2A 4F2OA 3TODA 3MAMA 5JTYA 2HQ0A 2O7UA 1OVTA 1S9TA 3PUWE 2WKYA 2I48A 3N6UA 1SBPA 4KQPA 4NE4A 2XXXA 1JEUA 3ILUB 4IO3A 5I58A 1LBCA 4YKPA 1URDA 1AOVA 2O1MA 4Q0CA 4GL0A 3BBRA 1TT1A 1MDQA 3FV2A 4ESWA 4LONB 3VE1B 3ECRA 1FTMA 1S7YA 4ZZEA 3TTKA 4H8JA 5H8FA 3SEWA 3IO4A 1IXHA 3G7WA 2ZNUA 4JWOA 3N94A 3TFLA 3S9NC 1SYIA 4GD5A 3AXFA 4Q8RA 1WODA 4KFQA 4OHNA 3T9HB 5TP9A 1N0TA 1JW4A 1FCKA 3O2AA 3TCHA 2REJA 5AA4A 2UVIA 3JZJA 2FYIA 3CIJA 1I6AA 3LSFB 4YZZA 5DEXA 4FAJA 3PD8A 3SDFA 1N04A 4DIGA 3HO7A 1AH5A 3U93A 4ELQA 1MH3A 3SEUA 3KFMA 1LFIA 3K2DA 4MLVA 3Q28A 4IO6A 3K02A 3MJNA 5AA2B 3TMGA 1D9YA 2P2AA 1UTHB 4HTGA 2OJTA 2OCUA 4QFLA 4O3AA 3FJGA 4R75A 1EU8A 2ZNTA 2I3WA 1S50A 1USYH 4EQ9A 2ZXTA 1O63A 3G3HA 3TAJA 3IJXB 4ELOA 1BIYA 4G8HA 2UYEA 2H98A 1MQDA 1NH8A 3FJ7A 1GTKA 4F19A 2UXAA 3KN3A 3IORA 4X1DA 3ZS6A 4XIGQ 4YAHX 3OSRA 1NH7A 4NWCA 1ZJLA 2F5XA 3MZBA 1BTJA 4EXKA 1ELJA 1JNFA 2UVHA 4XKRA 2ALUA 1RKMA 1R9LA 4P0IA 3VLVA 5H8HB 1P99A 1GVCA 4IY6A 3C35A 3LSWA 3SKPA 4F1YA 3E9XA 1MXXA 3H06B 2DWAA 3TQWA 3V5AA 3A3CA 3UIFA 3B6WA 4OENA 4R74A 2GHBA 1NFTA 4JSDA 4RPNA 2QS1A 3FZVA 5BUUA 2V3UA 2Y7RA 4DZ1A 5CC2A 4EDPA 3V89B 1YPNA 4G8MA 4YB7A 3EHSA 2VD3A 4OWDA 1USYE 4KYEA 2XD2A 2NOOA 1VSOA 4G68C 2F7CA 3LSLA 2Q2AA 2DE4A 3PU5A 3LBSA 2F78A 3MVZA 2KLFA 2VOZA 2O84X 2M8CA 4QF9A 4G68B 3VVDA 2QS2A 3HN0A 1IITA 1B5JA 1P1QA 3TZAA 2GHAA 1M5CA 5CBRA 2RINA 4F3PA 4F3BA 4LQ2A 3H6UA 5L9OA 3CFZA 1MG1A 4RY1A 5I2NB 1SYHA 1LCTA 4OEVA 3FD3A 4Z0IA 2D3IA 4R2BA 3IOUA 3V8XB 2D21A 3PPNA 1MQJA 3OELA 4F3SA 1Z7NE 3H6WA 4PETA 2P0SA 3H03A 1ZBMA 5ICQA 2GRVA 4IO5A 3D4CA 4R6YA 2I49A 3QUJA 3SEYA 1H43A 4R2FA 1LSTA 1B7UA 3Q29A 3I5OA 1LAXA 4FEBA 3PPQA 4WXJA 1PBPA 1UIVA 3HPIA 3IOVA 1H3DA 1NNTA 1P1NA 1B05A 3VV5A 1IUDA 2D5WA 4ELPA 3UN6A 3S9EA 5KZTA 3R26A 5L9SA 3O9PA 4GOTA 4L17A 2XD3A 4QSEA 1URSA 5AA2D 2R71A 1POTA 4BDMA 3QXMA 3IB2A 5KDTA 3R6UA 3CI8A 2F36A 2X26A 1RYOA 4LZ8A 1OVBA 4IO2A 4MBPA 3G3FA 4LQ5A 4O3CA 1XVXA 3PPPA 1N7XA 1T0KA 3SERA 5CMMA 3B6TA 1IXIA 3TEPA 1A8EA 1OMPA 1ANFA 1SD3A 2DVZA 4GF8A 1I69A 4ZEIA 2F7BA 1FW0A 3JYRA 1MY4A 2DQVA 3O66A 3GZGA 3FXQA 1OLCA 1M5EA 2XXHA 3T9UA 3C32A 4LZ5A 1DPPA 4ISUA 1NNFA 2XXWA 5CM6A 3D4GA 5I2NA 3S4UA 3L6HA 3VVFA 4I8CA 5J1DA 2I58A 4R6HA 3KOTA 4FECA 4UA8A 1M5FA 2Z22A 1LBBA 2QMXA 3TTMA 2H9BA 4YKKA 3CG1A 5L8DA 4OFJA 4FEDA 5H8QB 4YKIA 4BDRA 4TOZA 1BKAA 2R9JA 3K4UA 1TXFA 4BDNA 4N6PA 2F6PA 5F1QA 3U72A 1XOCA 5K2YA 1FQCA 1VFDA 2ZMBA 5AE4A 1JETA 4OERA 1MS7A 3GXAA 1J1NA 3EHTA 1ZMGA 3EHUA 1B7ZA 3ILTB 2OZZA 1LB9A 1UQWA 3O28A 3VXCA 3A3UA 1QKBA 5CRYA 1H76A 4G2ZA 3EQ1A 2HAUA 1ATGA 3GBBA 5DT6A 3K6XA 3C31A 3FJMA 4LVQA 1MXUA 1Q1KA 2FA7A 2HZLA 4XKQA 2A5TB 1O64A 4XKNA 5L9MA 3H4ZA 2DS9A 5I56B 4EQBA 1Z7ME 4ZE9A 3O6HA 5K2XA 1SW5A 1O7TA 1A99A 2G29A 1TFAA 3N26A 1JW1A 1VR5A 2ABHA 4QFOA 5JK4A 5TU0A 3ZSFA 1QJMA 4OEUA 2V3QA 4F29A 3T93B 3TCGA 4DXCA 3MBPA 4OESA 4BDLA 4YMAA 5AA3A 3DM0A 3PD9A 3EF7A 1SW4A 3N6TA 3KN8A 1P1WA 1MXYA 2RC7A 3THIA 2Z8DA 3FASA 4LUBA 4IO7A 1HSJA 3KSXA 1IQ7A 2HAVA 3JV9A 3FV1A 1DPEA 4DXBA 2DYXA 4DCYA 3C36A 2GH9A 5EHSA 5HBCA 1A55A 3IB0A 4IY5A 2HZKA 4YKJA 1B46A 3TYHA 4YB5A 1HSEA 5H8QA 2I4CA 3IX1A 4TLLB 1FQFA 5H8SA 5EHMA 2RKMA 3TTNA 5ELVA 4WEPA 2NVUB 3K00A 3W9VA 4F18A 2R6GE 3K1NA 1H44A 4FIMA 3RN8A 4THIA 5I57A 2HCAA 4NEDA 4TQUQ 4FE8A 4FORA 1UTBB 2OBGA 1IEJA 4FJPA 3HCQA 1HSLA 2THIA 1MY3A 2Y7PA 4F39A 2Y84A 4R73A 1YAEA 2XXIA 4M1VA 2VP1A 3VVEA 2A5TA 3ZKLA 4GXAA 5I2KB 1EZ9A 2ZYMA 2DXRA 2QSXA 3TUSA 5FHMA 2OWSA 5I56A 3TDJA 1B58A 4WEDA 3VLWA 1NNKA 1P1UA 2DP8A 1B4ZA 4U2RA 2ZYKA 1LCFA 3QK6A 3FVGA 2QL3A 4YB6A 2NXOA 2H25A 1NL5A 2CMOA 3VXBA 1B3EA 3IL1B 4RA1A 2DWHA 2QRYA 3PUXE 2QS4A 1XT8A 1EZPA 3U94A 2AYSA 4O3BA 5IKBA 2G93A 3IB1A 1AMFA 3G3IA 3KBRA 4U1ZA 4XXUA 3FXRA 3BKIB 3MUQA 1JW5A 1F9BA 2VD2A 2Y7IA 1B1HA 1MXVA 4K3FA 3U8QA 1FQAA 1PB9A 2X7QA 4KCDA 2OLBA 1MQHA 4IGTA 3IOTA 3FIRA 4BDOA 3K6WA 3SEXA 3CFLA 2H5YA 2ANJA 4JWXA 3UK4A 4M4GA 4H5GA 5M2VA 4QHQA 4C1TA 2O51A 4PFTA 1FTJA 4NTLA 1B5HA 3GBAA 1BLFA 3QAXA 3V83A 1DMBA 2PT2A 3HHFA 3RY3A 2F97A 1CE2A 3IO6A 5TPAB 3DP8A 1Y20A 1DTGA 1XVYA 2Q8JA 5AA2A 3UA8A 4EUOA 4RK2A 2RCBA 4YICA 1DSNA 4BDQA 1IXCA 2PYYA 5A5XB 1LAHE 1UTHA 1ZU0A 3S2VA 4DDDA 1TFDA 2Z23A 1B40A 2XXTA 4PQJA 5CMCA 4E0WA 4JWYA 4GWOA 1B7HA 3M3KA 2RC9A 2F7AA 2RCAA 4Q5TA 3ODBA 1SW1A 5CMBA 1RYXA 3M3FA 3P7IA 4H6DA 1QUJA 4U4XA 1YCJA 2QMWA 3ONMA 1MQGA 3EN3A 3KG2A 4KHZE 3OXNA 4U1OA 3B7DA 5DYHA 1WDNA 4DCXA 1SI1A 1PB7A 1MH4A 1B4HA 2E1SA 4KYDA 2CZLA 2XX7A 4QRZA 1B6HA 1N7WA 3LC8A 1MY0A 3IAZA 2PX1A 4PFWA 3SEVA 3BFTA 1YTVA 2I4BA 4ECFA 5H8HA 4GIZA 4NF5B 4OMBA 2YLNA 1TWYA 3KEIA 2I0CA 1PEBA 1R9QA 1SI0A 1ZTYA 1XS5A 1OIBA 1QUKA 4GLIA 3L6GA 4MH5A 4H1XA 1N3XA 1II5A 2AL4A 3W15C 3T22A 1MPBA 1LFHA 2I0BA 1LLSA 2A5SA 3MVYA 5H8NB 2ZNSA 3QIMA 3G3KA 3MP6A 3PUVE 2ONKE 2X7PA 5B7DA 2DWJA 1JQFA 4PE5B 4MLQA 2ONSA 3MPKA 3RUMA 3M8UA 3RLFE 3SESA 1XC1A 1LB8A 3HSTA 5TPAA 4NF8B 1B32A 1MY2A 3FGSA 3MVXA 1NKXA 1N3WA 4G68A 5DVIA 3UP9A 1FQDA 5I58B 5FHNA 3IK6B 3OEKA 4TLMB 3MP1A 2O68A 2XXVA 1DOTA 3RTFB 2YJPA 2RF1A 2Y7WA 4QSDA 2XX8A 3CR9A 2O6AA 1GV8A 1P1OA 4OYVA 4OZ9A 1JVXA 3W9WA 2XX9A 3IJOB 1LFGA 3T9XB 5ISUA 2REGA 4R6KA 3FXUA 4H0WA 2RC8A 4QFKA 5I84A 2V93A 3WAEA 4ELRA 4ND9A 2PVUA 3CG3A 1OQHA 3MVWA 1OQGA 1SQYA 1LGBC 1B3FA 3KOSA 4NF5A 4H65A 3RNNA 4LP2B 4Z7EA 5AA4B 4H5FA 3FATA 3Q25A 3KN7A 1MPCA 1R6ZA 4POXA 4JSOA 3E3KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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