2DE2A

Crystal structure of desulfurization enzyme dszb
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
347
structure length
347
Chain Sequence
b'RDTLTYSNCPVPNALLTASESGFLDAAGIELDVLSGQQGTVHFTYDQPAYTRFGGEIPPLLSEGLRAPGRTRLLGITPLLGRQGFFVRDDSPITAAADLAGRRIGVSASAIRILRGQLGDYLELDPWRQTLVALGSWEARALLHTLEHGELGVDDVELVPISSPGVDVPAEQLEESATVKGADLFPDVARGQAAVLASGDVDALYSWLPWAGELQATGARPVVDLGLDERNAYASVWTVSSGLVRQRPGLVQRLVDAAVDAGLWARDHSDAVTSLHAANLGVSTGAVGQGFGADFQQRLVPRLDHDALALLERTQQFLLTNNLLQEPVALDQWAAPEFLNNSLNRHR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords DIBENZOTHIOPHENE DESULFURIZATION ENZYME B
publication title Crystal structure and desulfurization mechanism of 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinic acid desulfinase.
pubmed doi rcsb
source organism Rhodococcus sp.
molecule tags Hydrolase
total genus 113
structure length 347
sequence length 347
ec nomenclature ec 3.13.1.3: 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinate desulfinase.
pdb deposition date 2006-02-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2de2A01
3.40.190.270 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 2de2A02
1I6AA 1MXZA 4ZEIA 2B3FA 4Q0CA 1B9JA 1B6HA 1MXVA 3G3KA 2O1LA 1N84A 1Y1MA 4U2RA 4EF1A 5FHNA 4MFIA 3CG1A 4LZ5A 1TXFA 5TPAA 4NF5A 2DWHA 1A8EA 2Y7KA 4U4XA 3IAZA 3MVYA 5DYHA 2I4BA 1B5HA 2P1SA 1PC3A 4Z7EA 1LAXA 4NF8A 4EQ7A 3S2VA 1XS5A 4KD5A 2PT1A 5TPAB 4NF5B 2PVUA 5B70A 4NWDA 1LFGA 2XXWA 2GH9A 1RYOA 3EN3A 1LAHE 4PFTA 5L9OA 4P0GA 2DE4A 3K6WA 1NNTA 5FHOA 1FTLA 1FQBA 5FTHA 1PDAA 2OBGA 4K3FA 4JSDA 3K6UA 4EXKA 3I3VA 2OWTA 1B5JA 2RCBA 3MQ9A 1BP5A 2I3WA 2QSXA 3UGWA 2I58A 2VGQA 5I56A 3S9LC 4AB5A 1GR2A 2DYXA 2THIA 4PQJA 1Y4TA 2F7BA 3PPNA 4UACA 5CRYA 5CMKA 5I56B 3TDJA 4QFNA 1LLSA 4OMBA 1MH3A 3VXBA 3C32A 4POXA 1JEUA 3HHGA 1MXXA 2A5SA 5BUUA 3PPOA 4WEPA 3H03A 1DMBA 3FATA 2DSFA 4F29A 3L6GA 4IO4A 2XXIA 1P1NA 2ONRA 2Q9TA 1AIVA 1D4NA 1JVYA 2F7AA 3OENA 1EZOA 2CZLA 3OSRA 4G8NA 2DP8A 3PD8A 1B46A 4EUOA 1LFIA 1QUJA 4MBPA 1QULA 4IO3A 4OENA 1ANFA 1IEJA 4HCYA 2V3QA 1UIUA 5H8NA 3UA8A 3K1MA 2Y84A 3M3LA 1I69A 2B3BA 1B7HA 4FE8A 3PUVE 3VV5A 3UN6A 4GRKA 1ZKBA 4JB7A 3U1OA 3G7WA 4G68A 1ZLQA 3PUXE 3UIFA 3K00A 2I6EA 3MW0A 2HQ0A 4DCXA 1MDQA 2I0BA 3MJNA 1AL3A 1SW1A 1DTZA 3W9WA 5JK4A 1SW4A 1OMPA 3Q27A 4G68B 1SDXA 4THIA 2E1SA 3RPWA 4G2ZA 4GQOA 1MY0A 1Y3QA 4OERA 3N5LA 3IB1A 3OO8A 4RJZA 4NF6A 3SEVA 3FVGA 1B7UA 1WODA 3C34A 1SD3A 4R9GA 1SYHA 1CE2A 4FORA 3V5AA 2DWIA 1LB8A 5AA4A 4QSEA 3G3HA 3VVFA 4Q8RA 2RCAA 3B6QA 4G8MA 3K2DA 2I49A 1O63A 4OQOA 4Z0IA 4HCWA 5AA4B 3TTNA 4FECA 4Q30B 4PFWA 4ZZEA 2ALUA 2F5XA 4MF3A 5ICQA 5KZTA 5L9MA 1MY3A 3PPQA 4GL0A 1B1HA 3VVDA 4TLMB 3FASA 5DVIA 4ZS9A 1LFHA 5CMMA 3TQWA 1IITA 3B6TA 4OEVA 4GWOA 4F1VA 4F39A 4ISUA 2OK2A 3PMXA 4F1YA 4MLVA 4R74A 3N6TA 5CMCA 1MXWA 1MPDA 2ONSA 4ZEDA 1IXHA 3E9XA 1S50A 2BJJX 3TCHA 4IO7A 4ONYA 3LC8A 2AYSA 4LVQA 2Q2AA 4RY1A 2GFEA 3TTMA 1TWYA 3O66A 4PETA 4F3GA 2ZYMA 1P99A 3D4GA 2XX8A 4LQ2A 2PT2A 4YU0A 3OO6A 4QSCA 4QFLA 3PMVA 3QYTA 2O84X 4R72A 1P1QA 3KSJA 3Q28A 4RA1A 1WDNA 3CFZA 1O7TA 3MAMA 3MZBA 1MY4A 1CB6A 1QUIA 1IQ7A 1B4ZA 4QF9A 2NOOA 1B32A 1N7WA 3N6UA 2AL4A 4JBZA 5B7DA 2REJA 2PBWA 1UTBA 3H6VA 3JYRA 4IO6A 4QHQA 1VE4A 3K4UA 2RINA 1ATGA 1XVYA 5AA1A 2XXUA 1B52A 1M5EA 2UVGA 4R9FA 3S9NC 5H8HB 1UTBB 1BTJA 2DWAA 3OO7A 4U4SA 2HFBA 1B3FA 4U1ZA 3OSQA 1URDA 1Z7ME 3QK6A 3TELA 2REGA 2V3TA 4OWDA 3R6UA 2OLBA 4O3CA 3DP4A 3OD7A 1URSA 2Y7PA 1JVXA 1UTHA 3T9XB 2UVIA 3G3FA 1MQJA 1M5DA 3S9EA 2HZLA 1SW2A 3R7XA 1XT8A 2ZNUA 5DVFA 3LSXA 2I48A 3N26A 4YMBA 3C9HA 1SYIA 3TTLA 4F1UA 4KFQA 3CG3A 2NVUB 2GRVA 2H98A 3A09A 4TOZA 2QMXA 1D3KA 2ZNSA 3VLVA 4ZECA 4RK9A 1KWHA 4KCDA 2ZXTA 1MS7A 1P1OA 3RT6B 4NWCA 4GD5A 4GIZA 3EF7A 4LZ8A 1A55A 3K1NA 3K6XA 1A99A 4WEDA 1USYH 1JW4A 3HO7A 3P7IA 4DIGA 5DEXB 3CI8A 3H6TA 4POWA 3TMGA 4H1XA 1FQFA 4H65A 4MH5A 4R2FA 1Y3PA 1JQFA 3PD9A 5EHSA 1LBCA 3K1PA 2DVCA 3JZJA 1IUDA 3MBPA 5ICTA 1ZIUA 2FA7A 4QFPA 2OZZA 2QS3A 2AIXA 5BWJA 1H43A 3C36A 1R1NA 3OEMA 4NEDA 4GLIA 1FW0A 3MUQA 2Z23A 4AB6A 4XKNA 1BIYA 2XXHA 4C1TA 4EDPA 4U21A 4RYAA 4OZ9A 3V89B 3M3KA 3O6GA 2ZNTA 3O9PA 2ANJA 5I2KA 4EXLA 3IK6B 1I6QA 5EYFA 4YMAA 3G3GA 4QFKA 2F78A 4XKPA 1FQAA 5H8SA 1D9YA 3KN8A 3IOVA 4OVJA 3EHSA 1MXYA 1MM6A 3KFMA 3O29A 2HZKA 2PMSA 2DXRA 2XHDA 1HSLA 4JWXA 2RC8A 4NF8B 3FVNA 2XD3A 3UORA 2P0SA 3H6WA 3SERA 3FXRA 5CBSA 1Z7NE 3CSBA 2F8DA 1BKAA 5I59A 1DPEA 3OO9A 3A3CA 4F18A 5I84A 2DVZA 3KOSA 4KQPA 3FJMA 3K01A 5I59B 3KJ7A 4XKQA 1DSNA 1N3XA 3E3KA 3ILTB 3TEPA 4ELRA 3U94A 1P1WA 4R6HA 1XVXA 1B0LA 1B1XA 1A8FA 1NH8A 3SEXA 4FAJA 1F9BA 1H44A 3GBAA 4ZE8A 2F7CA 4LP2B 3VLUA 3FD3A 2R71A 5F1QA 2F36A 3B7DA 4I62A 5F7VA 4R6YA 1B3LA 3ILUB 1M5BA 2Q2CA 2HAUA 5AE4A 4C0RA 3HPIA 1LB9A 1MQGA 4MLQA 4GOTA 1MPBA 1VR5A 1O64A 1MH4A 5ITOA 2GHBA 3VDFA 4F22A 4F31B 5H8FA 4OTEA 3T9UA 1NL5A 4DXBA 5H8NB 1XOCA 1QJMA 3EPEA 2D5WA 3KZGA 1OQHA 1MPCA 3IOWA 1J1NA 5H8FB 1PEBA 5K2YA 4DZ1A 4ZZAA 2ZYNA 4RXLA 3RNNA 1XC1A 3H4ZA 3LSLA 3SKPA 1OLCA 2F35A 1FTOA 3I6VA 3FZVA 3WAEA 4HW8A 1YCJA 2XXPA 3LSWA 3A3UA 1LSTA 3UK4A 2V84A 1NNPA 1B5IA 1II5A 3VVEA 4GF8A 3KSXA 3PPPA 3FXQA 2IA4A 2Q8JA 3G3IA 4JXIA 4EF2A 4KR5A 4OESA 2HAVA 2HEUA 3I5OA 4QFOA 1MXUA 3BFUA 2UYFA 2DXYA 4NF6B 3KG2A 2H9BA 1ZMGA 4OFOA 2D3IA 4JDFA 3RTFB 3C33A 1FTMA 3GLBA 4EQ9A 3K0VA 2ZYOA 3OEKA 4TLLB 1QUKA 2VOZA 3MVXA 4E0WA 4ZEKA 1S9TA 4JWOA 4G77A 4XTCQ 1DPPA 3M8UA 3IX1A 1I6BA 1JETA 1OVTA 4O3BA 3O6HA 5H8QA 1SBPA 2Z8DA 3O97A 4KPTA 3OELA 3U72A 4LA9A 5AA2A 2QS1A 4JSOA 1LCTA 4GFRA 3ONMA 3S9MC 5DTBA 1MQHA 4GVOA 2OCUA 1POTA 4KHZE 4ZDMA 5AA2B 2KLFA 3K02A 4IO2A 3CFLA 1AMFA 4ZEFA 3ODBA 4BDNA 1RKMA 2O51A 4R6KA 3KN7A 3FIRA 4KYSA 3EQ1A 1QKAA 4OHNA 4BLAA 4YKJA 1Y20A 3CRBA 2NUVA 3RY3A 2XXRA 4KYDA 4YB7A 3CR9A 3GZGA 2H4IA 3FV2A 4XXUA 3PV0E 1SW5A 1MQDA 1US5A 3UP9A 3USDA 3SEWA 4ELOA 4IY5A 3CIJA 1ELJA 4Q5TA 5AA3A 3G3JA 4DXCA 3H6UA 1N76A 3DELB 4PFYA 3SEUA 4FEDA 4OYVA 3C31A 1PBPA 3TCFA 3TYHA 3Q29A 4IGRA 3FV1A 1M5FA 1USYE 5FTIA 3D4CA 4FEBA 5HPQA 1LCFA 1R6ZA 3IO6A 1S7YA 1T0KA 2O6AA 3W15C 1US4A 5I58A 2RC9A 1M5CA 3RT8A 2Y7WA 1RYXA 2B65A 1UTHB 2X26A 2RC7A 4BDLA 3OXNA 3TZAA 1N7XA 5I58B 1ZJLA 2ESNA 3QIMA 3FJ7A 4X48A 5CMBA 3O6IA 3E4RA 5ITPA 5TP9A 1NFTA 2A5TA 3RQTA 1VFDA 1IZ1A 1NH7A 3BBRA 3TKDA 2ONKE 3FXUA 2Y7RA 2OWSA 3TCGA 5TP9B 1IXGA 4BDQA 2NWJA 2VD2A 3U8QA 5ELVA 3CSGA 3H06B 3SETA 2IEEA 4OFLA 4X1BA 1WVJA 3ZKLA 4DDDA 3MVZA 3O28A 1FQEA 2QS4A 5I57A 2Z8EA 4KYEA 4BDMA 3OOAA 2I4CA 1HSEA 3FUZA 3H7MA 1UQWA 3IOUA 1NMUA 4IB2A 2R6GE 3THIA 5FHMA 5A5XA 2XD2A 1SI0A 4YZZA 3TODA 1JNFA 3TQLA 2H5YA 3M3FA 5HBCA 4XIGQ 2XXTA 2DE3A 5I57B 2HXWA 2Y7IA 1JEVA 3MWBA 5KCJA 3RGYA 1JW1A 5A5XB 4R2BA 4QRZA 4N6PA 5J1DA 3LSFB 3O2AA 4JWYA 5KCJB 4PP0A 3WAFA 1B3EA 2E0SA 3QUJA 4H8JA 2Q88A 3IL1B 1OIBA 4GXAA 3KGCA 5I2KB 1H76A 2X7PA 3KJTA 3VE1B 2AL5A 4ELPA 1ZU0A 5CI5A 4RK2A 2W7YA 2DWJA 3FGSA 3MP6A 1H45A 1ZBMA 2O7UA 5CC2A 3TPAA 2F6GA 1PBQA 1D9VA 1A54A 1GGGA 5EHMA 1SVXB 3ECRA 3CVGA 3EHUA 4YICA 1Q1KA 4TQUQ 4YKPA 3QSLA 3QUFA 2QMWA 1QW0A 4G68C 4I9DA 4OXVA 4X9TA 1B05A 4P11A 1AOVA 4YB6A 3IB0A 2UVJA 4DE8A 1XHYA 2YJPA 2UXAA 1B4HA 2V93A 3FVKA 2ABHA 2VHAA 1TFAA 4F3PA 4U23A 1HSJA 2XXQA 4RPNA 4EQBA 3KEIA 1IXIA 2F97A 1H3DA 3AXFA 4FJPA 5KDTA 1LBBA 1L5TA 4LONB 4H6DA 4X1DA 4DLDA 5K2XA 3LBSA 3MP1A 1B40A 5IKBA 4LQ5A 3MVWA 3HN0A 2DS9A 2FNCA 3LUYA 4PFUA 5KDTB 1SI1A 5ISUA 3QXMA 2ZYKA 1B51A 1B7ZA 5LOMA 4DCYA 1DTGA 3C4MA 4R73A 3Q25A 3GBBA 4H5GA 4OETA 1VFEA 1QVSA 2NXOA 4KCCA 3KOTA 4PE5B 4ELQA 3N94A 2OJTA 3IO4A 3T22A 2XXXA 1YAEA 3IJXB 3T93B 2RF1A 4NF4A 2O7IA 1R9LA 1B2HA 2I0CA 4XKRA 1FCKA 4WKMA 2D21A 3K6VA 3PUYE 3IR1A 4RNSA 2I3VA 3DP6A 3HHFA 3IORA 4L17A 4NF4B 4F3BA 3LR1A 3MP8A 2XXYA 4FATA 5M2VA 2QL3A 4F3SA 1GTKA 2QRYA 3FVOA 1Y9UA 2F34A 2WKYA 3RLFE 1URGA 1GVCA 3U93A 5JTYA 4ESWA 2XX7A 3DLNA 4IY6A 3W9VA 4RPOA 5DT6A 4R75A 3SDFA 3FJGA 5JTYB 1OLAA 1AH5A 3PUWE 3SESA 4H5FA 1MG1A 3BKIB 1LAGE 2QJEA 2XX9A 3QAXA 2DOJA 4F2QA 3PMWA 4LUBA 4M1VA 3PUZE 3PU5A 3ZSFA 4F19A 5H8QB 4U22A 2G29A 5L9SA 1SQYA 3HCQA 3MPKA 3HSTA 5AA2D 4C1UA 4E0XA 1FQDA 1N0TA 3MZ9A 4IO5A 4N13A 5TU0A 4UA8A 1IXCA 5IAIA 2V25A 2H99A 4G8HA 2CMOA 1JW5A 1MRPA 2G93A 1MY1A 3T66A 3PGFA 1MQIA 3IJOB 4LATA 3HV1A 3MC2A 2YLNA 3H3GA 2YPNA 1EZPA 1EZ9A 3TTKA 1FTJA 1TFDA 3MZ1A 1DOTA 2DE2A 1LAFE 2XXVA 3C35A 1PB9A 1TT1A 4GL8A 4QSDA 4AQ4A 1B3GA 2HCAA 5H8HA 2R9JA 5HM4B 4NE4A 1IIWA 4M4GA 4BDOA 4YKKA 3U92A 1OQGA 5JEIA 1LGBC 4HS7A 1EU8A 3DM0A 2QS2A 4OEUA 3VFJA 3MPLA 4GXSB 2VP1A 3VLWA 4H0WA 3TTRA 1FTKA 1VSOA 3RTWB 2V3UA 3TAJA 2M8CA 2H25A 1Y1ZA 4YB5A 1GV8A 1YPNA 4BDRA 3BFTA 3TUSA 2Z22A 4YKIA 1PB8A 3EHTA 1A40A 3GXAA 3F11A 4ESXA 4KI0E 3IOTA 4IGTA 1P1UA 1Y3NA 4U1OA 2DQVA 3ZS6A 1N04A 3PPRA 3T9VA 2X7QA 2GHAA 5CM6A 3SEYA 4P0IA 3T96B 2O1MA 3Q26A 4O3AA 2O68A 4NMYA 3S4UA 1MM7A 2PYYA 1POY1 4ND9A 3V8XB 4F2OA 1B58A 3TFLA 1A7LA 2Q89A 4ECFA 4I8CA 3RN8A 1OVBA 1UIVA 2O69A 2FYIA 3RUMA 3KN3A 1MDP1 3IB2A 1B3HA 3JV9A 5CBRA 4OFJA 4NTLA 4ZEBA 1B0HA 1YTVA 3R26A 1N3WA 2UYEA 5DEXA 2A5TB 1NNFA 2VD3A 2PX1A 2QPQA 3OMBA 4DXUA 5DVJA 1Q35A 1Y4CA 5I2NA 2F6PA 3KBRA 1MY2A 2P2AA 4HTGA 4YAHX 4I1DA 3B6WA 5I2NB 4N07A 4H8IA 3ZKKA 4FIMA 3CFXA 2ZMBA 2RKMA 1FQCA 3DP8A 3VXCA 1QKBA 3E13X 1NNKA 3T9HB 1PB7A 1EH3A 5L8DA 2LAOA 4G4PA 4H67A 1BLFA 3L6HA 4LZ7A 2UVHA 1ZTYA 1R9QA 4WXJA 2Z8FA 1NKXA 4ZE9A 3V83A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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