2DE2A

Crystal structure of desulfurization enzyme dszb
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
347
structure length
347
Chain Sequence
RDTLTYSNCPVPNALLTASESGFLDAAGIELDVLSGQQGTVHFTYDQPAYTRFGGEIPPLLSEGLRAPGRTRLLGITPLLGRQGFFVRDDSPITAAADLAGRRIGVSASAIRILRGQLGDYLELDPWRQTLVALGSWEARALLHTLEHGELGVDDVELVPISSPGVDVPAEQLEESATVKGADLFPDVARGQAAVLASGDVDALYSWLPWAGELQATGARPVVDLGLDERNAYASVWTVSSGLVRQRPGLVQRLVDAAVDAGLWARDHSDAVTSLHAANLGVSTGAVGQGFGADFQQRLVPRLDHDALALLERTQQFLLTNNLLQEPVALDQWAAPEFLNNSLNRHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords DIBENZOTHIOPHENE DESULFURIZATION ENZYME B
publication title Crystal structure and desulfurization mechanism of 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinic acid desulfinase.
pubmed doi rcsb
source organism Rhodococcus sp.
total genus 113
structure length 347
sequence length 347
ec nomenclature ec 3.13.1.3: 2'-hydroxybiphenyl-2-sulfinate desulfinase.
pdb deposition date 2006-02-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2de2A01
3.40.190.270 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 2de2A02
3BBRA 4R2BA 3MWBA 3I5OA 3KEIA 3TTRA 3H06B 2E1SA 1MQIA 4U23A 2OBGA 1DPPA 1O64A 1PDAA 4AQ4A 3LSLA 4P0GA 3V8XB 4XKRA 4RK2A 3GBBA 3G3IA 3USDA 4F31B 2B65A 1S50A 2QMXA 3RLFE 1Q1KA 4EQBA 3HPIA 2ZYOA 4WEPA 1B5JA 2XD2A 4HS7A 1LAXA 4DDDA 4ECFA 2DVZA 4FECA 4G77A 3QK6A 1QVSA 5CC2A 1BTJA 2V3TA 4GIZA 3EHUA 3O6GA 3PUZE 3U72A 1N84A 1P1NA 4GXAA 4QFOA 2XXIA 1DTZA 3UK4A 3MUQA 4L17A 1II5A 1SYIA 3QAXA 3K6WA 4O3CA 3OEMA 2UYEA 3IB0A 2VP1A 2Q89A 1LBCA 3L6HA 2O1MA 4OMBA 2I4BA 4OFJA 1Y20A 2Z22A 2G29A 1MDQA 3VLVA 2HZKA 3QUFA 4TLMB 3VLWA 3HV1A 3Q26A 1POTA 1B4ZA 5H8QA 1N76A 3ZS6A 2FA7A 2R6GE 3CIJA 2ZYKA 1UTHA 2DE3A 4NF5A 4KR5A 2Z8DA 1UIUA 4RA1A 2RC9A 2O84X 1N04A 1US5A 3K1MA 3ZSFA 3VE1B 4F19A 1AH5A 1B32A 1PB8A 4IB2A 3PV0E 3C9HA 3SEVA 1MY0A 2E0SA 2QS1A 2P2AA 3QSLA 1B3EA 3PPOA 2Q9TA 3G7WA 2DE2A 2HZLA 3VVEA 2Z23A 5H8QB 3CFLA 1URDA 3K01A 1Y1MA 4KCCA 3C33A 1I6AA 1UTHB 2YJPA 1EH3A 4NF5B 3VXBA 2XXVA 3KG2A 4OXVA 5BWJA 2ZYMA 1M5EA 4ZEKA 3MPLA 4I8CA 1B46A 3EHTA 2O51A 1US4A 3DLNA 1O7TA 1LFGA 5ELVA 2FYIA 3IOVA 1IIWA 3A09A 1B52A 1Y3PA 2DWAA 5TPAB 4Q8RA 1D3KA 3C31A 5CI5A 2F97A 4JDFA 4MLQA 1OMPA 4DCYA 3TTLA 4XKPA 5B70A 5ICQA 4NF8A 3T22A 1QUIA 3Q29A 4H65A 4HCYA 5IKBA 3MQ9A 3RY3A 2OLBA 1SW2A 1NKXA 3KZGA 3JYRA 5H8HB 2VD3A 1JVXA 2H9BA 3MBPA 4LONB 4DXBA 1GVCA 3M3LA 3FVKA 2V84A 1Y9UA 3MVWA 4GL0A 1T0KA 5EHSA 4ND9A 2DWHA 4H8IA 2H98A 3DM0A 1B1HA 4GRKA 4NF8B 1FQBA 1I6QA 3D4GA 2F8DA 3K6UA 3SDFA 4C1UA 3S9LC 1OQGA 1PBQA 3IL1B 3PPQA 4U1ZA 2HAUA 5JTYA 4G4PA 1MM6A 4TLLB 1MM7A 1TFAA 2Y7RA 5FTHA 2RC7A 1MQDA 1IITA 4R6YA 2HEUA 3G3GA 1D9YA 3T66A 3HN0A 4LP2B 4GFRA 4WXJA 4GL8A 3O28A 1LAFE 1TWYA 5K2XA 2PT2A 1IUDA 1OLAA 4YAHX 3IAZA 3PMXA 4BDRA 1NH7A 1BIYA 5JTYB 5DVIA 1YTVA 3E9XA 4QHQA 2ZNTA 3RT6B 2I3WA 2AIXA 3TFLA 3B6TA 3W9WA 3KGCA 4YKPA 4NEDA 3IB2A 3U1OA 2O68A 5CBRA 3MP6A 4N6PA 4RXLA 2ZNSA 2UVHA 5LOMA 3FUZA 2IA4A 4G8MA 3H6UA 1SW1A 3FXRA 3P7IA 3GLBA 2A5TA 3R7XA 2P1SA 4EXLA 4ELPA 2I48A 4BDLA 4YMBA 2X7PA 1AMFA 4GWOA 1GR2A 4MBPA 4AB5A 3K00A 3TEPA 1B05A 4ISUA 5JEIA 1MRPA 4U2RA 1HSEA 3Q25A 1GTKA 3H3GA 4QSEA 3HSTA 2B3FA 2A5TB 3N5LA 2Y7KA 1B0LA 4BDQA 4KCDA 1ELJA 1ZMGA 4HCWA 5AE4A 4IO7A 3VLUA 1R9LA 2O6AA 2ZYNA 3PU5A 4RYAA 1LB8A 2ALUA 3MZBA 3OSQA 4R6KA 1P1WA 2VOZA 4I62A 4HTGA 1P1UA 4QF9A 1MY2A 2XXHA 3TODA 1VR5A 4BDMA 1YAEA 1IXHA 4E0XA 4OESA 2R71A 4F22A 4THIA 1BP5A 3BFTA 4JSDA 1GGGA 3QXMA 3MVXA 3MVZA 3U92A 4DLDA 2XXQA 3I6VA 1MXXA 4LQ2A 1SQYA 4G68A 5I57A 1Y1ZA 4Q30B 3F11A 3RTFB 2DP8A 3UGWA 1YCJA 2REJA 4EF2A 5ISUA 2ANJA 1A54A 4WEDA 1B7HA 5HPQA 5DVFA 3VDFA 2UVJA 2QS4A 5A5XA 5J1DA 3PUYE 1XC1A 1PC3A 4QFNA 1OQHA 2ABHA 2V3QA 4F2QA 4U21A 5TP9B 2HFBA 3PD9A 4PFWA 4IO2A 3G3FA 4G68B 3N6TA 2QMWA 1H43A 5I57B 3PUXE 4OQOA 1Y3QA 3PD8A 4OEUA 1EU8A 3FJMA 2X7QA 4PE5B 2D21A 5A5XB 5EYFA 1EZPA 4M4GA 4G8NA 1JEVA 1SW4A 4GD5A 2RINA 4ZS9A 3R6UA 3PPRA 2I0CA 4DXCA 3N26A 1A40A 4H8JA 2DXRA 3G3KA 1H45A 3UIFA 1FQAA 4KI0E 4H5GA 3MW0A 3HO7A 1FCKA 5H8FA 5AA1A 4POXA 3T9UA 5AA3A 1ZLQA 1UQWA 2OJTA 4QFPA 1GV8A 1RKMA 1DTGA 1B40A 1M5CA 2DYXA 4AB6A 4LATA 1MS7A 2DOJA 4P11A 2DWJA 4RJZA 3B6QA 2QS2A 3JZJA 3B7DA 2QS3A 2DS9A 3S9EA 1IXCA 1Q35A 5CBSA 2DVCA 4POWA 1JQFA 1MH4A 2GH9A 1M5FA 5H8FB 4H6DA 1FTKA 2PT1A 2ESNA 1USYE 5I59A 3OENA 1ATGA 2RCAA 4ZZAA 3MAMA 3OO8A 1A7LA 2FNCA 2YPNA 3MP8A 5I2NA 2QSXA 1UTBA 5H8NA 5CMKA 4F39A 4ZE8A 1JW5A 3TMGA 2V3UA 3TKDA 3K1PA 5F1QA 2O1LA 4YKIA 1LGBC 1HSLA 1PEBA 3PGFA 3DP6A 3OO6A 3SEXA 4QFKA 3VFJA 4OERA 1FQCA 3VVFA 3LUYA 5AA4A 1ZTYA 1QKBA 3I3VA 1IXGA 4UA8A 3ILTB 3UA8A 1TT1A 5I59B 4R74A 3ONMA 4OYVA 3U8QA 5HM4B 2CMOA 3FASA 4ZEIA 5I2NB 2XXUA 3GBAA 2ONSA 3H7MA 4R2FA 1I69A 1UTBB 5H8NB 3AXFA 3KN8A 1CB6A 4G2ZA 1N3XA 4OHNA 4NE4A 3TAJA 4X1BA 3UP9A 5TU0A 3T9HB 1JNFA 4JSOA 4G8HA 5DVJA 4IO4A 5AA4B 1B3FA 1VSOA 4LA9A 1NFTA 1POY1 1VFDA 3H6WA 4EXKA 2Q2CA 1RYXA 1BLFA 1IXIA 3ECRA 1P1QA 4OWDA 1XOCA 1B58A 2LAOA 4KQPA 1IQ7A 1MXVA 4KYSA 4U22A 4OTEA 4XKQA 1R1NA 3RQTA 4YZZA 2QPQA 3VV5A 3MP1A 2O7UA 1A55A 4EQ9A 4IY5A 2UVIA 2AL5A 4P0IA 1TXFA 3CSGA 1MY1A 4DXUA 3S9NC 3KOSA 5K2YA 1EZOA 2ZXTA 5KDTA 4MFIA 2XX9A 3KSJA 3MZ9A 3MC2A 1PBPA 4R9FA 1FTOA 3TUSA 3EHSA 2QJEA 3SKPA 3EF7A 1SVXB 2THIA 2F7BA 1RYOA 4NF4A 3DP4A 3QYTA 4BDOA 1MPCA 3CSBA 2I0BA 4OEVA 3FV1A 4K3FA 5DEXA 4F2OA 1SI1A 3EPEA 4BLAA 2OWSA 4I1DA 1MPDA 4F3SA 1LAGE 3SEWA 3PUVE 5KDTB 3TYHA 4F3PA 3H4ZA 1D4NA 2GFEA 4YKJA 5I58A 4OFLA 1B3HA 3M3FA 3H03A 2W7YA 3HHGA 2F7AA 4U1OA 2XHDA 4GLIA 5AA2A 4TQUQ 5F7VA 4NF4B 3SERA 3O9PA 3H6TA 1NNFA 4ZECA 4IGTA 4KFQA 1NH8A 3IR1A 4LQ5A 4RPOA 3U93A 4FJPA 4LZ7A 3IOUA 1S7YA 3WAFA 4YB6A 2XXYA 1NNTA 3G3JA 1B5IA 5I58B 4FORA 3BKIB 5FHMA 4KPTA 3FVGA 3FJ7A 1MDP1 5IAIA 5ICTA 3SEYA 1JW1A 4MH5A 4JB7A 5AA2B 1LBBA 1QJMA 1JEUA 1LSTA 4KHZE 4PQJA 1D9VA 4UACA 4RY1A 2V93A 4IO5A 1IEJA 3PUWE 2UYFA 2OWTA 3KFMA 4EDPA 1ZBMA 3T96B 4YICA 1QKAA 4RPNA 3RNNA 1MH3A 4EUOA 5HBCA 2AL4A 1A8EA 1N7XA 3MJNA 3LR1A 3VVDA 2O7IA 2UVGA 3ILUB 4DIGA 3Q28A 3RTWB 3V89B 4E0WA 3QIMA 4GVOA 3FZVA 4FE8A 3PMVA 4F3BA 1OIBA 4RK9A 4GOTA 3IO6A 1MPBA 2X26A 4I9DA 2M8CA 4FATA 3LSFB 1B0HA 1Z7ME 4QFLA 1Y3NA 3CRBA 3FV2A 1URGA 4ONYA 1B7ZA 3CG1A 3SESA 1SBPA 3U94A 3TCGA 1XHYA 2XXXA 4NWCA 3OO7A 4JBZA 4FEDA 1B2HA 3T9VA 2XXRA 4O3BA 4H67A 1S9TA 3N94A 1MQGA 5AA2D 5EHMA 2XXPA 3DELB 4LZ8A 4YU0A 4QSDA 4ZZEA 4LVQA 4PFYA 1AL3A 3BFUA 2F36A 3KSXA 4M1VA 4DZ1A 5M2VA 1LFIA 1LCFA 4YMAA 1J1NA 4XIGQ 1FQDA 3FATA 3QUJA 3V5AA 3IORA 4IO6A 3MPKA 2I58A 4KYDA 4KD5A 1ZKBA 3IB1A 1H44A 1QULA 3D4CA 2A5SA 1LFHA 4H1XA 2GRVA 3SETA 4NMYA 2D3IA 1NNKA 2HQ0A 3UN6A 3K02A 4ZEDA 1P1OA 4BDNA 1XVXA 3IO4A 4XXUA 3UORA 3R26A 5FTIA 3W9VA 3FXUA 2GHBA 3IJOB 4EF1A 2F7CA 4DE8A 4OETA 1YPNA 2F34A 3C35A 1XS5A 3PPNA 1FW0A 4N07A 5BUUA 3IK6B 1ANFA 5JK4A 2Y7WA 2H5YA 4ZDMA 1Y4TA 4XTCQ 4MLVA 3GXAA 1PB9A 5I2KA 3B6WA 1DPEA 2Y7IA 5FHOA 2V25A 3FD3A 3OOAA 1OLCA 3TZAA 1R9QA 4JXIA 3GZGA 4R9GA 4ZEBA 2XXTA 3DP8A 3TQLA 3EN3A 1OVBA 2RC8A 3ZKKA 4ELRA 4JWOA 2Z8FA 4C1TA 1BKAA 3LSWA 1B4HA 1MXUA 1M5DA 2Y7PA 5B7DA 3TCHA 2P0SA 4PETA 3RN8A 4R72A 2ONKE 3H6VA 4R75A 1OVTA 4TOZA 1NL5A 5I2KB 4OFOA 1H76A 1ZJLA 5L9SA 1ZU0A 1N3WA 3LSXA 3KN3A 1NMUA 1P99A 3EQ1A 4R73A 3KN7A 4F18A 1MG1A 1SD3A 1KWHA 3JV9A 2F78A 1B1XA 3FGSA 3MZ1A 4FIMA 4PFTA 2UXAA 3WAEA 3C36A 3LC8A 3TTKA 1MXWA 4U4SA 1WVJA 5ITOA 4WKMA 5FHNA 2WKYA 1QUKA 5TPAA 1N0TA 2HXWA 3W15C 1N7WA 2RF1A 2Y84A 4JWYA 3RGYA 5DYHA 3KJTA 4JWXA 4X1DA 4YKKA 1JW4A 3OEKA 2I6EA 2H99A 1LCTA 1A8FA 5DT6A 3E3KA 1H3DA 3CFZA 3CFXA 5CMCA 3K6VA 1CE2A 2ZNUA 2F35A 4OVJA 1JVYA 4F1YA 2HCAA 2XX7A 4LZ5A 3RPWA 1MY4A 2VD2A 2OCUA 3G3HA 2BJJX 5H8HA 2D5WA 4RNSA 3M3KA 1B6HA 3FVNA 3PMWA 4H5FA 2ZMBA 2NXOA 4F29A 1EZ9A 5CRYA 4IY6A 1VFEA 4F1VA 4FAJA 3PPPA 2DWIA 3M8UA 2R9JA 2F6GA 2G93A 3T9XB 2NVUB 2PVUA 5L9OA 1DSNA 5KCJA 1NNPA 1USYH 2PYYA 4IGRA 2CZLA 4NWDA 3K6XA 1XT8A 4XKNA 3TTMA 2I3VA 3O66A 1Y4CA 2NOOA 2DQVA 1F9BA 2DXYA 3Q27A 3OSRA 1MXYA 3IJXB 4H0WA 3O2AA 1B51A 3FIRA 3VXCA 4ELQA 5L9MA 4DCXA 3S2VA 1URSA 2QL3A 3C32A 3HCQA 3KJ7A 4Z0IA 3TQWA 3L6GA 5KCJB 3MVYA 1M5BA 4NF6A 4LUBA 3TTNA 3A3UA 4Q0CA 1MQHA 4N13A 2VGQA 2Z8EA 2IEEA 4X9TA 1MY3A 2H25A 4F1UA 1IZ1A 1LAHE 2OZZA 3FJGA 3IX1A 5DEXB 4IO3A 3O6HA 3TCFA 3ODBA 1MXZA 2I49A 3CG3A 1Z7NE 4GF8A 3CR9A 3HHFA 2REGA 3LBSA 4ZE9A 4O3AA 3N6UA 4PFUA 1DMBA 3K4UA 3CVGA 4Z7EA 5CMMA 2DE4A 4NF6B 2NUVA 3V83A 5L8DA 1SW5A 2Q88A 5H8SA 1B7UA 2NWJA 3S9MC 1R6ZA 5CMBA 3IOTA 1L5TA 1FTJA 1FTMA 3O6IA 3ZKLA 2PBWA 2KLFA 1PB7A 1UIVA 4YB7A 4ZEFA 2VHAA 2ONRA 4C0RA 1FTLA 2H4IA 1VE4A 2B3BA 4GQOA 2RCBA 3E4RA 1FQEA 2QRYA 4MF3A 5I56A 4OZ9A 3S4UA 4F3GA 5ITPA 3KOTA 1QW0A 5I84A 2PMSA 3OO9A 4ELOA 1SDXA 2DSFA 2YLNA 1TFDA 3RT8A 2XXWA 3C4MA 2GHAA 1B3LA 3FXQA 1MQJA 3K2DA 2Q2AA 3OXNA 1SYHA 4KYEA 5KZTA 1A99A 3K1NA 4NTLA 3TPAA 2RKMA 5I56B 1WDNA 3C34A 1HSJA 3E13X 3O97A 1QUJA 4X48A 4ESWA 4HW8A 3OD7A 1AIVA 2F5XA 3OMBA 2PX1A 1JETA 1SI0A 1B9JA 1B5HA 4U4XA 2HAVA 5CM6A 2AYSA 2OK2A 5DTBA 1ZIUA 4Q5TA 2F6PA 3O29A 1LLSA 3TELA 4QRZA 2O69A 4G68C 2Q8JA 1LB9A 3TDJA 1WODA 5TP9A 2I4CA 3OELA 3T93B 3FVOA 4ESXA 4QSCA 1I6BA 3IOWA 1B3GA 3KBRA 4EQ7A 3A3CA 4PP0A 3K0VA 2XX8A 3SEUA 3THIA 4OENA 1XVYA 4GXSB 4YB5A 4R6HA 3RUMA 1O63A 1AOVA 4FEBA 1DOTA 1FQFA 2XD3A 3CI8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3BBRA 4R2BA 1EYKA 3MWBA 3I5OA 3KEIA 3ISPA 4I3YA 3TTRA 3H06B 2E1SA 1MQIA 4U23A 2OBGA 2WYPA 1DPPA 1O64A 1PDAA 4AQ4A 3LSLA 4P0GA 2PCRA 3V8XB 4XKRA 3GYYA 1NV3A 4RK2A 3GBBA 3G3IA 1FPKA 3USDA 3BIGA 1KZ8A 4F31B 2B65A 1S50A 2GQ1A 4NN3A 1FSAA 1DK4A 3PTYA 2QMXA 1FTAA 2L5VA 3RLFE 1Q1KA 4N8GA 4EQBA 3HPIA 2ZYOA 4WEPA 1B5JA 2XD2A 4HS7A 1LAXA 4DDDA 4ECFA 2DVZA 4FECA 4G77A 3QK6A 1QVSA 5CC2A 1BTJA 2V3TA 4GIZA 3EHUA 3O6GA 3PUZE 4PAKA 3U72A 1N84A 1P1NA 4GXAA 4QFOA 2XXIA 1DTZA 3UK4A 3MUQA 2KR0A 4L17A 1II5A 1FBCA 2ZZXA 1SYIA 5IZ1A 3QAXA 3K6WA 4O3CA 3OEMA 2UYEA 3IB0A 2VP1A 2Q89A 1LBCA 3L6HA 2O1MA 4OMBA 2I4BA 4OFJA 1Y20A 1LBZA 2Z22A 2G29A 1MDQA 3VLVA 2HZKA 1KA1A 5DW8A 3QUFA 4TLMB 3VLWA 3HV1A 3Q26A 1POTA 1B4ZA 5H8QA 4MAGA 1N76A 3ZS6A 3T0JA 2FA7A 2R6GE 3CIJA 2ZYKA 1UTHA 2DE3A 4NF5A 4KR5A 2Z8DA 1UIUA 4RA1A 2RC9A 2O84X 1N04A 1US5A 3K1MA 3ZSFA 2HXRA 2WEFA 2P3NA 3VE1B 4F19A 1AH5A 1B32A 1PB8A 4IB2A 3PV0E 3C9HA 3SEVA 1MY0A 2E0SA 2QS1A 2P2AA 3QSLA 1B3EA 3PPOA 2Q9TA 3G7WA 2DE2A 3KC0A 2FIXA 2HZLA 3VVEA 2Z23A 4HE1A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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