5DEXB

Crystal structure of glun1/glun2a nmda receptor agonist binding domains with glycine and antagonist, phenyl-acepc
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
280
structure length
279
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis of subunit selectivity for competitive NMDA receptor antagonists with preference for GluN2A over GluN2B subunits.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
total genus 81
structure length 279
sequence length 280
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dexB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dexB02
2XXYA 1USYH 4BDOA 5TPAA 1B0HA 4POWA 1NNPA 3O6GA 4DE8A 4F22A 5I58A 1CE2A 1D3KA 1H45A 1GVCA 4EXLA 2ZNSA 2DE4A 4U4SA 2NVUB 3MUQA 4R9FA 1R6ZA 1M5FA 1OMPA 2GFEA 3MQ9A 1DSNA 3KSXA 2Z22A 4LZ8A 1PEBA 1GGGA 1H43A 1Y4TA 3N26A 1AOVA 2DVCA 5AE4A 2DWHA 1J1NA 4BLAA 2UVJA 1NL5A 3OD7A 4EF2A 1EZPA 2Y7IA 3OMBA 1UTHA 2DE2A 1DPPA 3LBSA 3QK6A 1QJMA 2F78A 5A5XB 1ZU0A 1H44A 1B1HA 4ESWA 4P11A 4F3BA 3TCFA 4Q8RA 1NMUA 2XXQA 3ILUB 1VFDA 3K01A 1NNTA 5I2NB 1B9JA 1MM7A 1MDP1 1XS5A 4ND9A 3TTNA 2HAVA 5I56B 4H1XA 1B51A 1GV8A 3MW0A 1B32A 4OETA 2Q89A 1ZMGA 3EN3A 1MY1A 3VLWA 5H8SA 2DVZA 2F7CA 2F7BA 3U94A 1EZOA 5HM4B 3LC8A 3OO8A 4YKKA 2YPNA 3FIRA 1OLCA 1N76A 1MXUA 4OENA 1P1NA 1RYOA 3P7IA 1XHYA 3CI8A 2HXWA 4HW8A 4FAJA 3SERA 1WDNA 2XXHA 4E0XA 3BFTA 4KYSA 3TDJA 1D9YA 2PYYA 4F3SA 4GL8A 3RN8A 4JDFA 1R9QA 1Y3NA 3H6TA 1IUDA 1B3GA 3G3IA 5BWJA 5KDTB 1OQGA 3KN7A 5H8HA 4DDDA 1LB8A 4MH5A 4R9GA 4R6HA 2Y7PA 1IXCA 4EXKA 1B52A 2ANJA 2H9BA 3CG3A 5DVFA 4NF8A 4YB5A 3CSGA 3FV2A 4F39A 4GFRA 3FVGA 2VD2A 4YZZA 3QUJA 3T9XB 1OLAA 2QS1A 3VDFA 5H8QA 4Q30B 1JW5A 2H4IA 4GF8A 4LA9A 2I48A 1N3XA 1B40A 1PBPA 3U93A 5CMKA 1SQYA 1I6QA 3RQTA 1PB9A 3D4CA 3SEUA 2VP1A 3SKPA 3MVWA 3E4RA 4EQ9A 4RK2A 5H8FA 3EQ1A 2X26A 4NTLA 1NH7A 4H6DA 4N6PA 1DPEA 3U92A 4NMYA 4I1DA 2Q88A 2IEEA 2V3TA 3MPLA 1P1WA 1B7HA 1FQBA 2I0BA 3FJGA 4DCXA 2Z8EA 2DWJA 4U22A 1A54A 2WKYA 3FVOA 4F1VA 3K1NA 2PT1A 5I2KB 1US4A 4WKMA 3QAXA 5TP9A 4I9DA 2F97A 1L5TA 4LUBA 4MLVA 3SESA 2FA7A 1MS7A 3KN3A 3VFJA 1FTKA 3O66A 1Q1KA 4R2BA 4F1UA 3TPAA 3IORA 1PBQA 2I58A 3C32A 3H6VA 3S9EA 3RTWB 3PPQA 5CMMA 5L9SA 3RT6B 1B3EA 3VVFA 1MXZA 5JTYA 1UQWA 3SDFA 1A8FA 3HV1A 3B6WA 4R72A 2F8DA 1Y20A 2F6PA 3KGCA 1S9TA 5DYHA 5F1QA 3VVDA 3K6UA 5AA4B 3ILTB 3K1PA 2XXUA 1URGA 3FXUA 5IKBA 1IIWA 3OELA 4GXAA 4RPNA 4OMBA 1N7XA 2H99A 4ZECA 2V25A 3PUVE 3CSBA 3LSLA 2D5WA 1B3HA 3O6IA 3TUSA 2FNCA 3TKDA 2P2AA 2ONSA 4F29A 4DXCA 3DP6A 4AB6A 1IXHA 1RKMA 3T66A 5FHOA 1LB9A 4TLLB 4GWOA 5HPQA 2DP8A 3S4UA 1FTMA 2R9JA 4XKPA 1MPCA 4I62A 2RCBA 1BLFA 3PPRA 4QRZA 1WODA 3UK4A 3MWBA 3OO6A 3D4GA 3IO4A 3UA8A 1MY2A 3PPNA 2XD3A 2Y7WA 3TTMA 1MXXA 1M5EA 1O63A 5KCJA 2QJEA 3KSJA 1LFIA 4THIA 2QSXA 2O84X 1US5A 3N5LA 3KBRA 2RC7A 2DXRA 2OZZA 1QUJA 5DEXB 3S9LC 3ZKKA 1Y1MA 3IO6A 3N6UA 1T0KA 4H8JA 4H5FA 2GH9A 2PMSA 3VXCA 4ZEBA 4QF9A 3K0VA 4RJZA 1B1XA 4YKJA 1LAXA 3HN0A 5CMCA 1MY0A 1IEJA 2DWIA 3T9UA 3O28A 1H3DA 2PX1A 5CM6A 1I6AA 2ONKE 1OVBA 3CR9A 1VFEA 2O51A 3CRBA 1MPDA 4JBZA 3OO9A 3C4MA 4F3GA 3ECRA 4Q0CA 3QUFA 3MPKA 3PD8A 1MH3A 1P1UA 4MF3A 3THIA 1POTA 3C36A 4PFWA 4C1TA 1XVXA 4G8NA 1PB8A 3CIJA 3IK6B 4ZDMA 3TMGA 1B5JA 4K3FA 1BP5A 5TPAB 3TELA 1UTBA 3IOTA 4HCWA 4IO4A 3DELB 3HHFA 3PMXA 2RKMA 5FTHA 4NE4A 4ELOA 5I57A 4BDNA 1B3FA 4WEPA 3KOSA 4JXIA 2O1LA 4YICA 1R9LA 1DTGA 3K00A 3H6UA 2H5YA 3MBPA 1XVYA 1FQDA 4DIGA 5CBSA 4RPOA 3VE1B 4YMAA 3FASA 4LP2B 4GD5A 4DXUA 3RGYA 4YAHX 2QPQA 4KQPA 4LZ5A 2I3WA 3I6VA 3EHSA 3L6HA 2XX8A 3M8UA 4ZEFA 1PC3A 4LVQA 3FXRA 3AXFA 3FJMA 1SYIA 1MY4A 4POXA 1YCJA 4U1OA 3G3GA 2D21A 3W9WA 5CRYA 2ZYKA 4ELQA 4EQBA 1ANFA 3LSWA 4IB2A 2RCAA 4I8CA 1S50A 1NFTA 1QW0A 1NNKA 3VLVA 4F2OA 5CI5A 1IZ1A 3KN8A 4LQ2A 2XX9A 4LONB 5I59A 4PQJA 2X7QA 4ZS9A 3TFLA 5B70A 3H3GA 3DLNA 4O3BA 2Q9TA 3G3KA 2UXAA 2HFBA 4MBPA 2RF1A 4QSDA 1JNFA 4AQ4A 2AL5A 3K6XA 3TQLA 3UGWA 4GQOA 4XKRA 1MXVA 4YKPA 2NWJA 4JB7A 3JV9A 3TCGA 4R74A 2GHBA 1PDAA 2V93A 4PE5B 2VHAA 1D9VA 4G8HA 4OXVA 3MJNA 2DOJA 4Z0IA 4U23A 5ICQA 3C35A 3ODBA 1OQHA 2XXXA 3PD9A 3IB1A 3SEXA 2AL4A 3PMWA 3IB2A 3OO7A 1VE4A 4G68A 3FD3A 3RPWA 1JVYA 3A09A 4LZ7A 3EPEA 5B7DA 5KDTA 4JWXA 2YJPA 3JZJA 1FQEA 1P1QA 1FQCA 4H65A 1N3WA 4IO6A 2GHAA 4OERA 4JSOA 1ATGA 5TU0A 4TLMB 5FHMA 3C34A 3L6GA 4UA8A 1B6HA 1RYXA 1WVJA 3TTRA 4OQOA 2ZYOA 4NF5A 3GBAA 4RNSA 4PFTA 3FJ7A 4XKNA 4F2QA 1HSLA 1P1OA 3DP8A 1JVXA 3CFXA 4GIZA 4RYAA 1BKAA 4OHNA 3VXBA 4RXLA 2RINA 3KJTA 3C9HA 1SW1A 2Z8FA 4LQ5A 5AA3A 1LCFA 4UACA 2QL3A 3IX1A 1EZ9A 2O7IA 4F31B 5ELVA 5H8NB 4F19A 1CB6A 3VV5A 3IJXB 3MAMA 3FZVA 1MXYA 1N0TA 3IAZA 4F3PA 2UVGA 4KFQA 4WEDA 2F6GA 5BUUA 4KI0E 1B0LA 3TQWA 1I6BA 5JTYB 1TFAA 4ZEKA 2O1MA 2HCAA 1JETA 2NUVA 2XXVA 1SVXB 3PUXE 1B58A 1I69A 4MLQA 3Q27A 3QYTA 1NNFA 4BDMA 4KYDA 1ZLQA 2H98A 4FE8A 4OWDA 4QHQA 4OFJA 4MFIA 4X48A 3K02A 4PETA 2O6AA 2F36A 4H5GA 4IO7A 3Q25A 5LOMA 3B6QA 4HS7A 1HSEA 1DTZA 1LLSA 2REJA 1FQAA 3T96B 4IO3A 2F35A 3QIMA 3MP6A 3G3FA 2B65A 2NOOA 5ICTA 3B6TA 3R26A 3TAJA 2VD3A 3OEMA 2P0SA 3IL1B 2O69A 3K6VA 2DS9A 3H03A 4FEBA 4GXSB 4YKIA 2PBWA 2REGA 4NF4B 1URSA 1LAFE 4EF1A 2F34A 2X7PA 1LFGA 1Y3QA 3MP1A 1DOTA 4JWYA 4QSEA 4DLDA 1LAHE 1FW0A 4QFOA 1MM6A 4BDRA 2HQ0A 4FORA 2I6EA 1MY3A 2G29A 4U1ZA 3EHTA 3USDA 1LBBA 3IOWA 3QSLA 2F5XA 1SW2A 4OYVA 3CFLA 3VVEA 3IR1A 3MVXA 4OTEA 3H7MA 3HCQA 1XT8A 3KOTA 3K1MA 1B4HA 4HTGA 2OLBA 5EHSA 4NWDA 1M5DA 4NF6A 3N94A 2DXYA 3T9HB 1A40A 4NWCA 3FVNA 4ELRA 1O7TA 1QUKA 3T93B 1B3LA 4KCCA 1FCKA 4OVJA 2VOZA 3MVYA 2DSFA 1TT1A 4RK9A 3R6UA 3RNNA 2OWSA 3ZSFA 5M2VA 4IGTA 1QUIA 3K4UA 3FUZA 1B05A 2GRVA 1DMBA 5DVIA 1Z7NE 2I4CA 1OVTA 3GBBA 4QFKA 2Q2AA 5AA2B 2QRYA 3E9XA 5K2XA 1FTOA 5L8DA 4R75A 4GLIA 1S7YA 1UTBB 2A5TA 2I0CA 2XX7A 4G68C 1IQ7A 1BIYA 3B7DA 1LFHA 3WAEA 3RUMA 4F18A 5EHMA 2DE3A 3EHUA 4KR5A 2UYEA 4Z7EA 5I58B 1QULA 2V3QA 1FQFA 3KG2A 1B5IA 1P99A 1MPBA 2HZKA 4FATA 1SW5A 1H76A 2ALUA 3FGSA 4X1DA 1GTKA 3PUWE 1B46A 2ABHA 3OOAA 3FATA 2B3BA 3UIFA 1YPNA 1LGBC 3M3FA 2G93A 3U72A 1A99A 2XXTA 1UTHB 2I49A 3OENA 2OBGA 2BJJX 3WAFA 3O97A 1FTLA 3ZS6A 2Y7RA 1F9BA 3SEYA 1MQDA 1MQHA 2D3IA 2I3VA 3IB0A 1QVSA 5CMBA 4OESA 3FVKA 3MZ9A 1SBPA 2AYSA 4N13A 3PV0E 3RT8A 3KFMA 4N07A 4X9TA 3K6WA 1ZKBA 1VSOA 1IXIA 3G7WA 4KYEA 1N04A 3UORA 4NEDA 1O64A 1BTJA 4U21A 2XXIA 5I59B 3GLBA 4QSCA 4ONYA 5J1DA 1N7WA 3F11A 4JSDA 2E0SA 3MC2A 5IAIA 1TFDA 3LSXA 1A55A 4WXJA 3G3JA 5A5XA 1URDA 4H67A 4IO5A 4EUOA 1ZJLA 5JK4A 3IJOB 4YU0A 3CG1A 4ISUA 1Y9UA 2IA4A 1YTVA 3MZ1A 4R6YA 1LSTA 5I2NA 4O3CA 1PB7A 3PPPA 3RLFE 2CZLA 5ISUA 3CFZA 1USYE 2HAUA 3BBRA 1XC1A 5I56A 3MVZA 3FXQA 3O29A 3S9NC 3TCHA 3R7XA 5CBRA 3W9VA 1TXFA 4R6KA 4E0WA 1M5BA 4IGRA 3C33A 4M4GA 1AMFA 4H0WA 4M1VA 4QFLA 2ZYNA 5L9OA 4BDQA 2YLNA 4ZZEA 2Y7KA 4U4XA 2F7AA 5H8HB 2HEUA 2Z8DA 4XXUA 1JEVA 1SD3A 5FTIA 1IITA 4C1UA 3OEKA 4RY1A 3TTKA 4KD5A 4OFLA 2PT2A 2PVUA 3M3LA 3E3KA 1XOCA 2XHDA 1SI1A 3UP9A 4NF8B 4QFPA 4G68B 1Y1ZA 2RC9A 4P0GA 2O7UA 2XXWA 3A3CA 1MQIA 4ZEDA 4AB5A 1LCTA 2ZNUA 2RC8A 3UN6A 5H8QB 5CC2A 4BDLA 1SDXA 4GL0A 3TEPA 1Q35A 3MZBA 1IXGA 4OEVA 1ELJA 3Q26A 5EYFA 1NKXA 3PPOA 4FEDA 1A7LA 4NF5B 5H8FB 2OK2A 3V8XB 2UVIA 3G3HA 5I84A 4OFOA 2M8CA 4R2FA 4PFUA 5KZTA 2Z23A 3SETA 3H4ZA 1SW4A 2VGQA 4FJPA 3EF7A 2ZXTA 3K2DA 3I3VA 3BKIB 4DXBA 2A5SA 1AH5A 4ZZAA 3CVGA 2OWTA 5TP9B 4G2ZA 1NH8A 3W15C 4TQUQ 2OJTA 1QKBA 3IOVA 2P1SA 4JWOA 1EU8A 2UYFA 4GRKA 4FECA 2CMOA 4IO2A 3QXMA 1MQGA 2Q8JA 3N6TA 1MH4A 4YB7A 4R73A 3RY3A 4OEUA 1JQFA 1MRPA 1AIVA 1B5HA 1VR5A 1AL3A 2ZNTA 4ZE8A 2V84A 3I5OA 4PFYA 3KEIA 5FHNA 4TOZA 4LATA 2V3UA 5DT6A 1HSJA 3JYRA 5I2KA 1B2HA 1KWHA 5HBCA 3DP4A 1II5A 5H8NA 1MQJA 2ZMBA 2FYIA 4GOTA 3LR1A 2E1SA 3IOUA 3LUYA 3TZAA 3O9PA 1JW1A 1YAEA 4IY5A 1A8EA 3Q29A 3FV1A 3E13X 1EH3A 2R6GE 2NXOA 1R1NA 4YMBA 3SEWA 1MXWA 3KZGA 3T22A 5AA2D 4Q5TA 1N84A 5L9MA 4U2RA 5DVJA 1UIVA 2DQVA 3H6WA 1B7ZA 1ZBMA 4P0IA 2UVHA 3PU5A 3H06B 3PUYE 1Z7ME 3O2AA 1GR2A 1OIBA 2XD2A 2R71A 4EDPA 2QMWA 5AA4A 4ECFA 3V83A 3OSQA 4G4PA 4EQ7A 3V89B 3S2VA 1B4ZA 2QS3A 4XIGQ 5DTBA 1FTJA 2THIA 1M5CA 4ELPA 4X1BA 1ZIUA 3HSTA 5KCJB 3ONMA 4KCDA 2Q2CA 2ZYMA 3V5AA 3S9MC 4L17A 5AA1A 3VLUA 2QS2A 4GVOA 3HHGA 4NF4A 2H25A 1Y3PA 4NF6B 4H8IA 1SYHA 4O3AA 4G77A 4C0RA 4DCYA 3PUZE 1JW4A 3SEVA 4ESXA 3T9VA 2ESNA 4ZEIA 5F7VA 3M3KA 2Y84A 4DZ1A 1ZTYA 4KHZE 1TWYA 4F1YA 3ZKLA 3HO7A 3TYHA 3Q28A 2ONRA 3MP8A 1LBCA 1LAGE 2O68A 2W7YA 3HPIA 1Y4CA 4YB6A 4XTCQ 4XKQA 3U1OA 5DEXA 4ZE9A 3BFUA 4HCYA 1QKAA 3KJ7A 3GXAA 1B7UA 5ITPA 5ITOA 2HZLA 2DYXA 2B3FA 3PGFA 3GZGA 3DM0A 2QMXA 3C31A 2XXPA 2A5TB 2QS4A 1MG1A 3LSFB 3RTFB 3U8QA 5JEIA 2AIXA 4IY6A 2I4BA 2LAOA 4PP0A 4FIMA 1JEUA 4KPTA 3TTLA 1SI0A 3PMVA 5K2YA 4QFNA 1UIUA 3OSRA 1MDQA 3OXNA 5I57B 3O6HA 3TODA 1POY1 2OCUA 4G8MA 4RA1A 5AA2A 3A3UA 4OZ9A 2XXRA 2KLFA 1D4NA 2DWAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XXYA 1USYH 4P1LA 4N6DA 3QMFA 4BDOA 5TPAA 1B0HA 4POWA 1NNPA 3O6GA 4DE8A 4F22A 5I58A 1CE2A 1D3KA 4DI4B 1H45A 1GVCA 4EXLA 1YYZA 3NOHA 3GYYA 2ZNSA 2DE4A 4U4SA 2NVUB 3MUQA 4R9FA 2DDKA 1R6ZA 1M5FA 1OMPA 2GFEA 3MQ9A 1DSNA 3KSXA 1G0IA 2Z22A 4LZ8A 1PEBA 1GGGA 1AWBA 1H43A 1Y4TA 3N26A 1AOVA 2DVCA 2JJKA 5AE4A 4N6KA 2DWHA 1J1NA 4BLAA 2UVJA 1NL5A 2Q74A 3OD7A 4EF2A 1EZPA 2Y7IA 3OMBA 1UTHA 2DE2A 1DPPA 3LBSA 3QK6A 1QJMA 2F78A 2XWOA 5A5XB 1ZU0A 3IFAA 1H44A 1B1HA 4ESWA 4P11A 1D9QA 3TCFA 4F3BA 4Q8RA 1NMUA 2XXQA 3ILUB 1VFDA 3K01A 1NNTA 1NUWA 5I2NB 1B9JA 1MM7A 1MDP1 4P56A 3EKIA 1XS5A 4ND9A 3TTNA 2HAVA 5I56B 4H1XA 1B51A 1GV8A 3E78A 3MW0A 1B32A 4OETA 1FBCA 5LTCA 2Q89A 1ZMGA 3EN3A 1MY1A 3VLWA 5H8SA 2DVZA 2F7CA 2F7BA 3U94A 2WX9A 1EZOA 5HM4B 3LC8A 3OO8A 4YKKA 2YPNA 3FIRA 1OLCA 1N76A 1MXUA 4OENA 1P1NA 2CZKA 1RYOA 3P7IA 4LN5A 1XHYA 3CI8A 2PFYA 2XWIA 2HXWA 4HW8A 4FAJA 3SERA 1WDNA 3CHGA 2XXHA 4E0XA 1FTAA 3BFTA 4KYSA 3TDJA 1D9YA 2PYYA 4F3SA 4GL8A 3RN8A 1K9ZA 4JDFA 1R9QA 1Y3NA 3H6TA 3BIGA 1IUDA 1B3GA 3G3IA 5BWJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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