5DEXB

Crystal structure of glun1/glun2a nmda receptor agonist binding domains with glycine and antagonist, phenyl-acepc
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
280
structure length
279
Chain Sequence
b'DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGICH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis of subunit selectivity for competitive NMDA receptor antagonists with preference for GluN2A over GluN2B subunits.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, receptor
total genus 81
structure length 279
sequence length 280
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dexB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dexB02
4P11A 4Q8RA 5IAIA 4IY5A 1I69A 3O29A 2F97A 4FIMA 5CMMA 4WKMA 4R6KA 2XXTA 4EQ7A 3DP4A 1JW5A 1LCFA 2O6AA 2O7UA 4BDQA 3IAZA 1XOCA 2OCUA 3GXAA 5I57B 2F7BA 2VGQA 3O6IA 4YMAA 5L9MA 4H5GA 5TPAA 3GLBA 3CSBA 4LQ2A 5AA4B 4JSDA 4RK2A 5FTIA 1FQCA 3CG3A 3IOUA 3OD7A 4GXSB 3E3KA 4FORA 1JEVA 2G29A 2ZXTA 3PUZE 4X1DA 2A5SA 4FAJA 2REGA 3DP6A 1B3HA 3PUVE 1F9BA 2DS9A 3CFXA 1ANFA 4GXAA 4YKJA 3S9EA 3PV0E 5AA2B 1MY2A 4ZEIA 1B3LA 3P7IA 3KSXA 1B3GA 4GL8A 1A55A 2XXRA 5KCJB 1AH5A 2H98A 2QS3A 3OOAA 2I49A 1TFAA 4DCXA 1SYIA 3MVZA 2VP1A 4KCDA 3E13X 3UK4A 1GTKA 3U93A 3ECRA 5I2NB 1LFIA 1OLAA 4OEUA 2RCBA 1ZKBA 4PQJA 3OMBA 2PT2A 1N3WA 3TZAA 5I59B 1VFEA 1D3KA 1ZJLA 2DSFA 3OELA 1QUIA 2OBGA 1N76A 4XKRA 1PBQA 3N94A 3OSQA 4C1TA 3IJXB 4H1XA 1P1WA 3RTFB 4YB7A 1XS5A 4YKKA 1TXFA 1SD3A 2E0SA 4DLDA 4KR5A 3MBPA 2PVUA 3FIRA 3S2VA 3B6WA 2I3VA 4I62A 2F7AA 3LSWA 1NH8A 2VD3A 1B9JA 4BDLA 3MPLA 4ZZAA 5FHNA 2YJPA 2V3QA 2RC7A 1T0KA 3C34A 1FTJA 3RTWB 3VXCA 3MZBA 3PD9A 3Q26A 1Q1KA 2DE4A 4GF8A 3HCQA 3B7DA 3QIMA 2GHBA 1H76A 2KLFA 5H8NA 3TEPA 4H65A 2QL3A 4POWA 1H43A 4XKPA 1POY1 3UGWA 4I1DA 4KYEA 4I8CA 4XIGQ 1MM7A 4EQBA 1USYH 4NMYA 4EUOA 2VOZA 3K01A 1Z7ME 2OJTA 2NUVA 2I48A 3TELA 4PFUA 1SW5A 4F1YA 4NF6B 4BDNA 3D4CA 4N13A 3LC8A 3MWBA 3EHSA 4K3FA 4MH5A 1TWYA 2RCAA 4QSDA 5I84A 3FV1A 3OO7A 2RINA 2H99A 4KHZE 1M5BA 3SERA 2DQVA 2E1SA 3RQTA 4F3GA 3DLNA 1P1UA 1B46A 3I5OA 1N7XA 3O6HA 1FTOA 3T96B 4MLVA 1VFDA 2R9JA 3PUYE 3LUYA 4OZ9A 1DPEA 2DWIA 3HSTA 3V5AA 1NNKA 2OWSA 3TQLA 2QS2A 5I59A 3IB1A 4DXUA 2Q2AA 5DTBA 3USDA 2O51A 1MQIA 1SBPA 2LAOA 2THIA 5I56B 4EF2A 3VVDA 1JW1A 1FQDA 4FECA 2R71A 1SW2A 1Y9UA 4ELRA 3R26A 4ZDMA 5H8FA 4EXLA 3TQWA 2HEUA 5AA2D 1B7UA 4THIA 2XXXA 3KJ7A 4EDPA 1TFDA 3MZ9A 1QUJA 1SVXB 1MQGA 5I2KB 4RXLA 4AQ4A 3K6WA 3FV2A 1OMPA 4LZ8A 5CC2A 4ND9A 3IO6A 3VVEA 3MJNA 3FGSA 3H4ZA 1IQ7A 4YB5A 5A5XB 4DXBA 4GLIA 2XXQA 2Y7IA 3IJOB 3FUZA 3OEMA 3C35A 3TTLA 2IEEA 2F6GA 1Y1MA 2BJJX 2F6PA 3TCFA 4BLAA 4XXUA 4IO6A 4DE8A 3K1MA 5ICQA 1ZMGA 2Z22A 3UN6A 2ZNSA 3MC2A 3TTMA 3V83A 3G3KA 4POXA 3SEWA 3ZKKA 2UYEA 1B5IA 3HHGA 1LAGE 4G4PA 4Q5TA 1GV8A 1ATGA 2P2AA 3QK6A 2UVJA 2H4IA 1B7ZA 3AXFA 3IO4A 4OXVA 3K6XA 4IO2A 1WODA 3V89B 3QSLA 1KWHA 4PE5B 3GBAA 4NWDA 4C0RA 4G68A 3EPEA 1B40A 4QFPA 4TOZA 4ELQA 3E9XA 1R6ZA 3TTNA 1JNFA 1IITA 1SI0A 3QYTA 3CIJA 1MPCA 3WAFA 4PFTA 4Q30B 2X7QA 4BDRA 3S9LC 2Z8DA 1S9TA 4AB6A 2I0BA 3U94A 2V3TA 3QUJA 2DWJA 1SDXA 3PPOA 1B5HA 1BP5A 3OEKA 2B3BA 3RN8A 1P1OA 3BFUA 3PPNA 1FQEA 4H5FA 5ELVA 4NF8A 4X48A 4DZ1A 3A09A 3VVFA 1I6AA 4G8MA 3KJTA 2RC9A 1B3EA 3FASA 5CBSA 4U1OA 4LZ5A 2Y7PA 2QSXA 5FHOA 5EYFA 4JWXA 3RLFE 2NVUB 2I3WA 2OZZA 4ZECA 2GRVA 1MQJA 3IOWA 3KZGA 3EN3A 1MDP1 4G8NA 2IA4A 2AIXA 4U2RA 1EU8A 4YICA 5DVFA 4U4SA 1J1NA 5I58A 2B3FA 1AMFA 2V25A 4NE4A 1PDAA 3U8QA 1FCKA 5BUUA 3FXRA 4F18A 1R1NA 5JTYA 1GVCA 2AL5A 5L9SA 4QHQA 3THIA 4ZEDA 4F2OA 2V84A 3KN3A 1OLCA 4R6YA 5TP9B 5J1DA 4F22A 1DTZA 2QMWA 3Q28A 1M5DA 4DXCA 1B1HA 3PUWE 4ISUA 3ODBA 4JWOA 1ZTYA 2DWAA 2P0SA 1LFHA 1SW4A 3DP8A 1NH7A 1M5EA 3S4UA 4IO5A 2XXPA 1R9QA 1USYE 2UVIA 4F1VA 4GOTA 1B7HA 3M3FA 3HO7A 2ZNTA 3MVYA 5H8QB 2H5YA 3T9HB 4QRZA 2HQ0A 1Q35A 3QXMA 2XXYA 4R73A 5EHSA 4DCYA 3H03A 1B2HA 2ZYKA 1B6HA 3D4GA 1PBPA 1P1NA 4PETA 4QFKA 5JEIA 2D21A 3TUSA 1B4HA 2XXHA 3N26A 2O7IA 2REJA 1O7TA 1R9LA 3ILUB 3OXNA 3SDFA 5BWJA 1LAXA 5KDTB 2Q8JA 4ZEFA 5LOMA 3VV5A 2ANJA 1MRPA 3TYHA 5IKBA 4WXJA 2VD2A 2O1LA 4NF4A 4O3CA 3E4RA 1MXYA 2FA7A 3C9HA 2OWTA 4RJZA 4I9DA 1POTA 4GRKA 3CSGA 1OIBA 3HN0A 4LZ7A 1IXCA 4ZE8A 2DWHA 1DOTA 3BBRA 1LGBC 4FE8A 1PB7A 2YPNA 4PFYA 4RY1A 3JYRA 1UQWA 2DYXA 1SI1A 1A54A 1BTJA 1HSEA 4O3BA 1QVSA 2I4BA 1I6BA 1LLSA 2D3IA 2ONSA 2VHAA 3F11A 1LBBA 4F1UA 4JDFA 3IB2A 2R6GE 2RKMA 1I6QA 3T9XB 3U1OA 1DMBA 3FJGA 4TQUQ 4P0IA 1B52A 2XX7A 2QMXA 5I57A 1MXZA 5AE4A 2AYSA 3FVOA 3VDFA 1UTHB 3LSFB 5H8SA 2PMSA 4Z0IA 3H7MA 2D5WA 3HHFA 5AA4A 2W7YA 1UTBB 1DSNA 4E0WA 1Y3NA 2RC8A 1MXUA 2A5TB 3H6TA 3VLWA 1FQBA 1FTKA 1H3DA 4KFQA 1XVYA 2RF1A 3RGYA 4RK9A 4LATA 3W9VA 1URGA 3LBSA 4OVJA 3RPWA 1LBCA 5DEXB 3FVGA 5AA3A 4OYVA 1BIYA 3RUMA 4F31B 3IR1A 3LSLA 4R9FA 1MH3A 2H25A 3KGCA 5AA2A 4WEDA 1ZBMA 5CMCA 4R6HA 3H6VA 4OQOA 3V8XB 3W15C 1NNTA 5KCJA 1A8FA 4IO7A 2UVGA 3H06B 5TU0A 3KOTA 4F3BA 5I2NA 1B5JA 3L6GA 5CM6A 5CRYA 1Y4CA 3SKPA 1IZ1A 2Z8FA 3VXBA 4EF1A 1YCJA 2Y7RA 3PU5A 3MP8A 3K2DA 4KYSA 3FZVA 3O6GA 4KI0E 3SETA 1MG1A 2Q9TA 4H67A 4GL0A 3KOSA 5HPQA 1B32A 5DYHA 3JZJA 4XTCQ 4YZZA 1ZU0A 2NXOA 2Y7WA 4NF5B 4F2QA 1MQDA 2ZYOA 4TLLB 3IX1A 3DM0A 2O68A 4GQOA 2GHAA 5K2YA 1OVTA 2CZLA 4FEDA 4ZEBA 2UYFA 4U1ZA 3RNNA 3TMGA 3PMVA 3ZKLA 4G77A 1MPBA 1B0LA 2Q89A 1JVXA 2XX8A 3FJMA 3TODA 1GGGA 5DT6A 3IL1B 5M2VA 4JB7A 2HZLA 3C33A 3LSXA 1US4A 3B6TA 1M5CA 4JBZA 2O84X 1NNFA 3IB0A 4MBPA 4ONYA 3O28A 3A3UA 3MZ1A 1ELJA 1O63A 3A3CA 3MUQA 3DELB 1MPDA 2ONKE 4H8IA 2X26A 2QS1A 1N04A 1D4NA 4EQ9A 3SESA 4PFWA 5TPAB 4UACA 1D9YA 4XKNA 1MY3A 4HW8A 3R6UA 1VR5A 4IB2A 3UIFA 4NF6A 4OTEA 2GH9A 4GVOA 3OSRA 1P99A 4NWCA 3CRBA 3MAMA 4ELPA 3T9VA 3M8UA 5F7VA 2I6EA 3CI8A 3VLUA 3MQ9A 1LAFE 1P1QA 2QJEA 3PPPA 4M4GA 4LP2B 3ZS6A 5ISUA 2FNCA 3MP1A 3R7XA 4MFIA 3ONMA 2HXWA 4YKIA 4ECFA 4U23A 2ALUA 3JV9A 3M3LA 3LR1A 1JETA 1B4ZA 1SYHA 4IGRA 5I56A 5F1QA 4DDDA 2F5XA 2AL4A 3KSJA 4R9GA 3OO9A 2DVZA 1FQFA 4RA1A 1D9VA 2O1MA 4KPTA 1VSOA 3GZGA 4GFRA 2PT1A 5H8HB 3TPAA 4OETA 4JSOA 2XD3A 2XD2A 4EXKA 3CFLA 4ESWA 5CBRA 5I2KA 1OQGA 3FD3A 3W9WA 4O3AA 4N6PA 1XHYA 4NTLA 1B58A 4YU0A 3FATA 3O66A 2F7CA 4ZEKA 5A5XA 4F3SA 3MVXA 4OFLA 3H6WA 3K1NA 2ZMBA 4UA8A 4KQPA 3K6UA 1B3FA 3PUXE 3EQ1A 2YLNA 1YAEA 3RT8A 1MY0A 4IO3A 2XX9A 2Q88A 1Z7NE 3N5LA 3OENA 3TTKA 2PBWA 1Y3PA 3G3GA 4N07A 5H8NB 4RPNA 4OERA 4F29A 3Q27A 3CVGA 1B0HA 1AOVA 4TLMB 5CI5A 3MW0A 4WEPA 1XVXA 1OVBA 4OESA 5ICTA 2F78A 3S9MC 2NWJA 2DE2A 5B7DA 2I58A 3KEIA 4R2FA 1UIUA 2CMOA 3H3GA 2B65A 3IK6B 3G3HA 2F8DA 1A8EA 2V3UA 1H44A 4C1UA 5ITOA 3SEXA 3CR9A 3OO8A 2DE3A 1H45A 4G2ZA 1A99A 3K00A 3U92A 4KCCA 3G7WA 3Q29A 3FVKA 1WVJA 1EH3A 1N7WA 3IOVA 4HCWA 4ESXA 3N6TA 3PD8A 4YB6A 4OFJA 4E0XA 5FHMA 5KZTA 3K1PA 4HS7A 3ILTB 2I4CA 3OO6A 4RYAA 4GWOA 1NNPA 3T9UA 3UA8A 1XT8A 4H0WA 4H8JA 3TCGA 2Q2CA 3CFZA 4FATA 4G68C 4U21A 1TT1A 4OEVA 5H8HA 3WAEA 2NOOA 3M3KA 3UORA 1LSTA 1MXWA 1ZIUA 3L6HA 1NKXA 1BLFA 5H8FB 1L5TA 1JW4A 3PMXA 2ZYNA 1NFTA 4OHNA 4QF9A 3HV1A 3GBBA 3RT6B 1IXHA 1Y20A 1FTMA 3PGFA 3K02A 2PYYA 4P0GA 3FVNA 1IIWA 3VFJA 1SQYA 3TKDA 5DVIA 3T66A 4XKQA 3QUFA 2ABHA 5L9OA 4KD5A 1EZPA 2F35A 1VE4A 5JK4A 2ONRA 2DP8A 3VLVA 2QRYA 3C31A 4GIZA 4ELOA 4DIGA 3ZSFA 3K4UA 4U4XA 1Y3QA 2FYIA 1QUKA 4L17A 1MY4A 1RKMA 4IY6A 1FW0A 1HSLA 4Q0CA 5TP9A 1S7YA 5HBCA 4F3PA 2G93A 1A7LA 1M5FA 5EHMA 3BKIB 5FTHA 3TDJA 1LFGA 1MDQA 1NMUA 3Q25A 2Y84A 2WKYA 4ZZEA 4ZS9A 2F36A 5CMKA 1II5A 4YAHX 1MY1A 3KFMA 2UVHA 1PC3A 1IUDA 4U22A 1OQHA 3U72A 2XXUA 5B70A 3I6VA 4M1VA 5H8QA 1LAHE 4X1BA 4G68B 1MXVA 1QULA 1QJMA 4H6DA 4GD5A 4RNSA 3I3VA 2OLBA 1A40A 1MQHA 1NL5A 4PP0A 3BFTA 1IXGA 3B6QA 3HPIA 2ZYMA 4R75A 2ZNUA 3O2AA 4LQ5A 1URDA 3IORA 3C36A 3G3IA 4LUBA 4RPOA 4FJPA 4NEDA 3PMWA 4BDOA 1EZOA 3MP6A 1B1XA 3N6UA 3MVWA 4FEBA 4IGTA 5AA1A 2XXIA 1FTLA 3TFLA 1YTVA 5KDTA 1FQAA 1EZ9A 3EHTA 1S50A 4NF8B 3T22A 4HCYA 3QAXA 4F39A 3TCHA 2UXAA 1N84A 2QS4A 2DOJA 3KG2A 3C32A 4QSEA 4LA9A 3G3JA 4ZE9A 3S9NC 3EF7A 3EHUA 3C4MA 1QKBA 5DVJA 4KYDA 4IO4A 5HM4B 1N0TA 2ESNA 2HCAA 4OWDA 4OENA 3PPRA 1LCTA 1SW1A 5K2XA 4AB5A 4OMBA 5I58B 4X9TA 2HZKA 1US5A 4R2BA 4LONB 2HAVA 1B51A 4HTGA 5CMBA 3TTRA 2X7PA 3PPQA 2O69A 2XXVA 1UTHA 5ITPA 4MLQA 5JTYB 3FXUA 3K6VA 1UTBA 3O97A 1CB6A 2Y7KA 2V93A 2A5TA 1CE2A 2I0CA 3SEUA 4G8HA 1XC1A 1ZLQA 1PB8A 3FXQA 4QFNA 3SEYA 3VE1B 2DVCA 1JQFA 5DEXA 1MS7A 4QFLA 3CG1A 2DXRA 1LB9A 3UP9A 1QW0A 3H6UA 2OK2A 5L8DA 1O64A 1AL3A 3G3FA 2Z23A 3O9PA 3MPKA 2HFBA 4Z7EA 2DXYA 1DPPA 2GFEA 1Y1ZA 4JXIA 4YKPA 1UIVA 4YMBA 1GR2A 4QSCA 4LVQA 3T93B 2H9BA 4JWYA 3FJ7A 1Y4TA 1LB8A 1B05A 1BKAA 2M8CA 2Z8EA 3KBRA 1JEUA 1PB9A 1IXIA 2P1SA 2PX1A 1RYXA 4OFOA 1HSJA 4NF5A 1RYOA 3RY3A 3IOTA 2HAUA 4F19A 1AIVA 1YPNA 1MXXA 1MH4A 4MF3A 4R72A 1WDNA 3K0VA 4QFOA 4NF4B 3KN8A 1N3XA 4BDMA 3TAJA 3KN7A 2XXWA 1QKAA 1MM6A 1IEJA 1PEBA 1JVYA 3SEVA 4R74A 2F34A 2XHDA 1URSA 2QPQA 1DTGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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