5DEXB

Crystal structure of glun1/glun2a nmda receptor agonist binding domains with glycine and antagonist, phenyl-acepc
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
280
structure length
279
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
publication title Structural basis of subunit selectivity for competitive NMDA receptor antagonists with preference for GluN2A over GluN2B subunits.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, receptor
total genus 81
structure length 279
sequence length 280
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dexB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dexB02
2Z8DA 4P0IA 1SW4A 1R9LA 4R75A 1FTKA 5DEXB 1J1NA 1SYIA 3RTFB 1CE2A 2DQVA 1MY2A 3IK6B 2Q88A 1N04A 3MAMA 3HCQA 1MXVA 2AIXA 3JV9A 3U72A 1UTHA 5KZTA 1JW1A 3MUQA 1PBQA 1UIVA 2RC7A 2NXOA 2Y7KA 3K6WA 2Q8JA 4KQPA 3KFMA 4Q0CA 3MW0A 1L5TA 3PUWE 3O9PA 1LAXA 1CB6A 3OSRA 4PQJA 4YICA 1IITA 2F36A 3VXCA 1ZU0A 4ZEIA 2Q89A 1MH4A 2OWTA 5IAIA 1TWYA 3PUVE 2GH9A 1EZ9A 2XXTA 1FQAA 4AB6A 3FZVA 3FVKA 4XKNA 5CMMA 1ZIUA 3IR1A 4U1ZA 1WDNA 4Q5TA 4BDNA 1LAFE 4ELQA 4O3AA 1SW2A 3GXAA 3K01A 5L9OA 4GRKA 1AOVA 2CZLA 2DE4A 2XXXA 2ZYKA 4WKMA 4Q30B 2CMOA 2I4BA 3OO6A 3HO7A 2IEEA 2QL3A 5B70A 4LQ5A 1ZJLA 3E3KA 2UVJA 4GLIA 1RKMA 4FIMA 4DCXA 2I49A 5JEIA 5KCJA 3OO8A 3FJGA 3PPQA 4G8MA 1Z7ME 1POTA 4KCDA 4KYSA 1QJMA 5TPAA 5DVIA 3I5OA 4RK2A 3LSFB 5AE4A 2F7AA 3W9WA 1MRPA 1Y4CA 2RC8A 4MH5A 4OQOA 3PPRA 1MY3A 2A5SA 2PYYA 4U2RA 4XKPA 3CFLA 2DE3A 2RINA 2E0SA 1R1NA 4QHQA 1B5IA 1D9VA 1WODA 1VFEA 5H8QB 5H8NB 4ELPA 5I57A 4TLMB 3N6UA 3OO9A 4H8IA 2DS9A 3K2DA 4R9FA 4P0GA 4OFLA 3S9LC 4M1VA 3ILUB 4C1UA 4OHNA 2OK2A 4GXAA 2UYFA 1XHYA 3THIA 3ILTB 3B6WA 1VFDA 3B6QA 3K1MA 4UA8A 3TCGA 4OEVA 4NWDA 3OOAA 1YPNA 1QKBA 1NNTA 4LZ5A 5A5XB 1XOCA 2DWAA 5IKBA 3RY3A 3P7IA 3CIJA 3OXNA 4JSDA 4U4XA 2NOOA 4KD5A 2PMSA 4DXUA 2V3UA 4F3BA 2P1SA 5BUUA 3U93A 3KSXA 3TUSA 3PPOA 1MXWA 4KHZE 2PT2A 3FJ7A 3MPLA 1IXIA 3KN8A 4GF8A 5AA1A 3DP6A 1ELJA 3MQ9A 4NF8A 3L6GA 4NWCA 3MZBA 1UIUA 2PBWA 4GFRA 4G77A 4LUBA 4U22A 1B3HA 4BDLA 2F78A 3M3LA 4EXKA 1A7LA 3O6GA 3IB2A 4NF5A 3SERA 4GL0A 4F2OA 2G29A 2DYXA 1UTBB 2GFEA 1MM6A 2F35A 2GHAA 3FATA 1QKAA 3CI8A 3S9EA 1Y4TA 3PPNA 2WKYA 4I62A 2OBGA 4HW8A 1OVTA 2VOZA 2V3QA 3OMBA 5ELVA 4RJZA 4FEDA 1Z7NE 3R6UA 1N3XA 2R9JA 4JB7A 1H43A 2DVZA 2DOJA 1UQWA 3VVDA 1AIVA 4AB5A 1B7ZA 3T9XB 4GL8A 1EU8A 3SEUA 1HSEA 1LB8A 4F18A 3MBPA 1MPBA 3HHGA 3LBSA 4BDMA 4F2QA 2ONRA 1B7HA 2VP1A 1P1OA 1YTVA 1B46A 1MXXA 2QS2A 3QUJA 5DEXA 4HCWA 2I3WA 5JTYA 5EHMA 3DM0A 5CMBA 3TDJA 1A40A 3D4GA 4GOTA 1HSLA 4IO4A 3CR9A 4H6DA 4Z0IA 5I2NB 4OETA 3Q25A 3U8QA 2I6EA 3KJ7A 1LBCA 1B51A 4OXVA 2I0BA 1LSTA 4K3FA 4R72A 5L9MA 4PFWA 4BDRA 1A99A 4F1YA 4R2FA 4ZS9A 2X26A 3IORA 5DT6A 5I58A 4FJPA 5AA4B 3PGFA 4ECFA 1ANFA 2IA4A 4TOZA 5ITPA 3O2AA 3KBRA 2YJPA 4NE4A 4JWXA 3MPKA 2O69A 5BWJA 4IGRA 1H76A 3K02A 4O3CA 2XXPA 3O6IA 1B52A 5J1DA 3CG1A 4LQ2A 4F22A 5I2KA 3VE1B 1MPDA 2F5XA 4F39A 3ONMA 2XD2A 4IY5A 5FHNA 2XD3A 4OFJA 5AA2B 4KYEA 5M2VA 4RNSA 4QFOA 3I3VA 3G3HA 3QIMA 2V3TA 2KLFA 1O64A 4BDOA 4IY6A 4OTEA 5CRYA 3FVOA 2Y7WA 1MY1A 2RKMA 4LATA 2B65A 2HFBA 4PFTA 4PFYA 3SETA 2W7YA 3TELA 3PD8A 2H5YA 2UVIA 5CBSA 4GVOA 2HAUA 2Z22A 3SEWA 1TT1A 1B0HA 1XS5A 1ZLQA 2ESNA 5EYFA 3TKDA 3IB0A 4DE8A 1M5EA 4JDFA 4DXBA 5B7DA 1Y9UA 3AXFA 3H6TA 1IXCA 1JEUA 2FA7A 3RT6B 3PUZE 3O66A 2NWJA 2DP8A 3IAZA 1NH8A 5K2YA 1OQHA 5H8FB 3K6XA 4YKPA 1MM7A 3W15C 1QUJA 2Z8FA 1YAEA 5FHMA 5CMKA 1VR5A 4HS7A 3T93B 3EN3A 1QW0A 3D4CA 1FQDA 3O97A 3KJTA 4NF4B 1O7TA 4BLAA 1A54A 4I1DA 3G3JA 3L6HA 5FTIA 4QSEA 3V8XB 1LCFA 1TFDA 3ZKLA 5H8HA 1KWHA 4GD5A 3VVEA 2O1LA 1Y20A 3OELA 4YKJA 1OQGA 2ZXTA 4O3BA 4P11A 3ODBA 1BP5A 4ELOA 3C4MA 1P99A 3TTKA 3KEIA 3Q26A 2PVUA 3MVWA 2HZLA 3OSQA 2H98A 3U92A 3A3UA 2ABHA 4XIGQ 5H8SA 1FW0A 2OWSA 1IUDA 3SDFA 1NKXA 3U1OA 1EZPA 5HBCA 4YB5A 1NMUA 3F11A 1B9JA 2YPNA 1EH3A 1PB7A 1B5JA 3GZGA 3H6WA 4EXLA 2HQ0A 3FD3A 5I59A 2A5TA 1RYXA 1OLAA 4IO6A 4U4SA 2GRVA 5CC2A 3CFZA 2QJEA 4KFQA 3N26A 3TMGA 1USYH 4H8JA 3OD7A 3S9MC 2Q2CA 3IB1A 3S9NC 4FE8A 5EHSA 3C35A 2GHBA 5ISUA 4ZE9A 2REGA 4EQ7A 2ZYMA 3EHUA 2E1SA 3Q29A 4ZEKA 1NNKA 3S4UA 4KCCA 5K2XA 4YB6A 1DPPA 4KR5A 3OEMA 4QFKA 4ZEBA 2O7IA 4L17A 1MXUA 2H9BA 2P2AA 1TXFA 1JW5A 1OLCA 3RT8A 2H4IA 3BFUA 3QXMA 4H5FA 2AL4A 1Y3PA 3PMVA 4DZ1A 1II5A 1QUIA 2RCBA 1B0LA 1DTZA 4IO2A 1B3EA 1M5BA 1QULA 5I2NA 1Y3NA 2OJTA 1MXYA 2QS4A 3CRBA 3V89B 5F7VA 3V5AA 3LC8A 4LA9A 1B4ZA 1P1QA 4JXIA 5L8DA 4NF6B 1DPEA 5KDTA 3LUYA 2ZMBA 4C1TA 1IZ1A 1R6ZA 2DVCA 2NVUB 1DMBA 4G68B 1SYHA 3KOTA 3K1PA 1ZTYA 1SW5A 3GBBA 4F19A 4OFOA 4FATA 4RK9A 4N07A 2QS1A 2ZNTA 4H67A 2HCAA 1MY4A 1UTHB 3C36A 1OIBA 4EF1A 4R73A 2XXWA 1FQBA 3TCFA 4I8CA 3T22A 3B6TA 3UIFA 4YU0A 3C32A 3IOVA 3KZGA 1POY1 4FEBA 2F6GA 4G8NA 3LSWA 5DTBA 4OESA 1ZKBA 3TQLA 3W9VA 4PFUA 2X7PA 4THIA 1SDXA 5F1QA 1MPCA 1MDP1 3KGCA 3MVYA 3K6VA 5FHOA 2XX9A 3KN3A 4WEPA 2H99A 4R9GA 1Y1ZA 1IIWA 1SW1A 1JEVA 4YKIA 1I6QA 4ZZEA 4G4PA 3TQWA 4RPOA 4YAHX 3VLVA 5I56A 1BIYA 4U23A 4IO5A 1SD3A 3K0VA 3OENA 4EDPA 3MZ9A 4R6YA 4PP0A 2O68A 2Q9TA 3S2VA 1MY0A 1N7WA 3PD9A 1M5CA 3GBAA 3FIRA 3EPEA 3TODA 2QMWA 5CM6A 3QUFA 3G3KA 3C9HA 5KCJB 5TP9A 4LONB 3KG2A 1P1WA 2I4CA 3SESA 4QRZA 2HEUA 4OYVA 3UGWA 3C33A 3T9HB 5TPAB 2PX1A 1BLFA 1PC3A 3FJMA 2I48A 3VLWA 3T9VA 1ATGA 2NUVA 2DXRA 2I58A 3H03A 1DTGA 1PDAA 3MC2A 5LOMA 2Y7IA 1AMFA 3RUMA 3E9XA 5I57B 4X48A 3UA8A 1B58A 1JETA 2OZZA 4IO3A 3N6TA 3VLUA 3DP4A 2ZNSA 1QVSA 2VHAA 4KPTA 1FTMA 2OLBA 2D3IA 3N94A 4WEDA 1N0TA 1IXGA 1URSA 4G2ZA 1O63A 1Q35A 4UACA 4IB2A 4F3SA 2O1MA 3DLNA 1AH5A 1MQHA 3UN6A 4ESXA 3QAXA 2X7QA 2F8DA 2G93A 4NMYA 4HTGA 1SBPA 3O29A 4ZEDA 1MQGA 1WVJA 3QYTA 2QMXA 4U1OA 3H06B 1Y1MA 1B40A 1JQFA 5AA3A 3IJXB 4F1VA 2P0SA 3MJNA 1LBBA 2V93A 3K1NA 4H5GA 3WAFA 1MXZA 4XTCQ 3V83A 1BTJA 4XKQA 4RY1A 1LB9A 4YMAA 4FORA 1MQDA 4MFIA 2REJA 4FECA 4NF8B 1XVXA 2V25A 1A55A 4QFPA 3USDA 1B05A 2I0CA 5CI5A 2F7CA 2OCUA 3H7MA 1URDA 2XHDA 1GTKA 3LSXA 3TTLA 5I84A 2UYEA 5DVFA 4QFLA 2HXWA 4IO7A 5L9SA 1MG1A 3LR1A 2XX8A 1H3DA 4F3PA 4R74A 5TU0A 1B5HA 2F97A 5H8QA 5H8NA 3CVGA 1OVBA 1FTLA 3A09A 3VVFA 1PB8A 3Q28A 3KN7A 1JVXA 1M5FA 4ESWA 4TQUQ 1SI1A 2UVHA 2FYIA 1B3LA 3IO6A 4FAJA 1DOTA 1D4NA 2QSXA 5A5XA 3IL1B 1NFTA 4ZECA 3WAEA 4POWA 5JTYB 4X1DA 3H4ZA 3K6UA 3TFLA 3TAJA 3PV0E 3M3FA 4TLLB 3SEXA 1FCKA 2ZYNA 4G8HA 1XT8A 1JVYA 4NEDA 2QRYA 4H1XA 2O84X 4OEUA 3RN8A 4QSCA 4H0WA 4RA1A 2VGQA 1HSJA 3E4RA 5I58B 2B3BA 2ONSA 3C34A 3ZKKA 4GQOA 4OVJA 3KOSA 2QPQA 4RXLA 1PEBA 3RPWA 2VD2A 3RGYA 1N7XA 1H44A 3G7WA 4F3GA 1USYE 4E0WA 1UTBA 3B7DA 1LCTA 4DCYA 1PBPA 2Z8EA 5AA2D 2F34A 4DIGA 2Y7RA 3K00A 3IOTA 3FXQA 5ICQA 1D3KA 1B2HA 3EHSA 5I2KB 4R6HA 3UP9A 4QSDA 3CG3A 1LFGA 4G68C 1NNPA 2XXYA 1JW4A 4LZ8A 2DWHA 2Y84A 2XXUA 2XXQA 1MH3A 4YZZA 2UXAA 4X1BA 4R2BA 2VD3A 3MVXA 4LVQA 3IOWA 3H3GA 1M5DA 1B4HA 2XXHA 1AL3A 3IX1A 2XXRA 3RNNA 4G68A 3JZJA 4PETA 1D9YA 4MF3A 1P1UA 2F6PA 1OMPA 3ZS6A 3EHTA 1N3WA 5ITOA 2V84A 4M4GA 3FGSA 5HPQA 2RC9A 2B3FA 1IXHA 3FXUA 2DSFA 3TCHA 4XKRA 5AA4A 2THIA 3OO7A 1US5A 2Z23A 3PUXE 3FVNA 1S7YA 1R9QA 3HHFA 2DWJA 1RYOA 2R6GE 4POXA 3GLBA 2DE2A 5H8HB 1LFIA 1LAGE 1LLSA 1QUKA 2PT1A 2UVGA 4AQ4A 4X9TA 4EF2A 3MP8A 2I3VA 5DVJA 1DSNA 1NH7A 3VV5A 1S9TA 3G3FA 5HM4B 1NNFA 3FXRA 1TFAA 2O7UA 2YLNA 3M8UA 2ANJA 1URGA 1A8EA 4RPNA 2D5WA 4YB7A 3Q27A 3IOUA 3SKPA 5AA2A 2O6AA 1F9BA 3IO4A 4C0RA 3QK6A 4DXCA 3FVGA 3R7XA 3U94A 1LFHA 4KI0E 1FTOA 3PPPA 4N6PA 1MQIA 1I6BA 1B3GA 4MLQA 4GXSB 2RCAA 3O28A 1GR2A 3BBRA 2BJJX 4OENA 2ALUA 3HPIA 2AYSA 1ZMGA 1B1HA 5I59B 2FNCA 3TTRA 2A5TB 4IGTA 2AL5A 3M3KA 4N13A 4ONYA 1FTJA 3VDFA 1VSOA 3ZSFA 4EQBA 1FQCA 1S50A 4H65A 4F31B 4E0XA 4U21A 1MDQA 3I6VA 5H8FA 4QF9A 3DELB 2ZYOA 3RLFE 3O6HA 2ZNUA 5DYHA 1Y3QA 4DDDA 1FQEA 4GIZA 1MQJA 1SQYA 4NF4A 4ZZAA 4JBZA 3HN0A 3HV1A 3TZAA 4ND9A 3UK4A 1FQFA 1ZBMA 4JWYA 2QS3A 3HSTA 3BFTA 3FV2A 3TTNA 3T9UA 4NTLA 3EQ1A 4R6KA 3TEPA 1XC1A 2DXYA 3MP1A 1YCJA 3PMWA 2Y7PA 3RQTA 1A8FA 1B32A 3RTWB 2R71A 1PB9A 3DP8A 3MVZA 2RF1A 4YKKA 4OWDA 2O51A 2M8CA 5ICTA 3CFXA 3OEKA 4LZ7A 2XXVA 1GV8A 3IJOB 3BKIB 1EZOA 1B1XA 2HAVA 3UORA 4Z7EA 5FTHA 4ELRA 2HZKA 1B6HA 5KDTB 3T66A 4WXJA 3FASA 3TTMA 2DWIA 3A3CA 1N84A 3MP6A 1H45A 1MS7A 3E13X 3CSBA 4LP2B 1I69A 4I9DA 1N76A 4OMBA 4ZEFA 1US4A 1SI0A 2H25A 4Q8RA 3LSLA 3G3GA 4PE5B 3KSJA 3VXBA 4GWOA 3H6VA 2XX7A 4MBPA 4F1UA 4MLVA 1SVXB 4JSOA 3K4UA 5CBRA 4ISUA 3JYRA 1JNFA 4DLDA 2ONKE 4EUOA 1IEJA 3SEYA 2XXIA 3CSGA 4KYDA 4NF5B 3QSLA 3MZ1A 4RYAA 1GGGA 2LAOA 3FUZA 3ECRA 3R26A 3VFJA 2F7BA 4BDQA 3MWBA 4QFNA 1I6AA 1BKAA 2D21A 3PUYE 4F29A 4EQ9A 3PMXA 1P1NA 4OERA 1XVYA 1GVCA 4ZE8A 1LAHE 1Q1KA 1B7UA 3T96B 3G3IA 4JWOA 5I56B 4OZ9A 5CMCA 3EF7A 4HCYA 3C31A 1T0KA 2Q2AA 1LGBC 1VE4A 3H6UA 3SEVA 3TPAA 4NF6A 3FV1A 5JK4A 3N5LA 1NL5A 1IQ7A 1B3FA 3TYHA 3PU5A 4ZDMA 4YMBA 4XXUA 5TP9B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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