1FTLA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with the antagonist dnqx at 1.8 a resolution
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
total genus 78
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftlA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftlA01
1TFAA 4QFPA 4H6DA 1L5TA 3EF7A 3I6VA 4ESWA 2O7UA 5I59B 2P1SA 2F97A 3SETA 4JSDA 5CC2A 1IXGA 2YLNA 3MP1A 2HXWA 4Q5TA 1CE2A 1EZPA 4OEVA 1H43A 4G8HA 4GVOA 1B3FA 2GHBA 2DE4A 3PMWA 4E0XA 4H1XA 2I0BA 4G4PA 1MPBA 2F5XA 3KN8A 4JWOA 2QS3A 2QJEA 1HSLA 3O6GA 5DT6A 5H8NA 5AA1A 3TTNA 4EXKA 1B05A 4U2RA 1IEJA 3LSLA 4MLVA 4WKMA 4WEDA 3W9VA 1O63A 3DELB 4YAHX 3H7MA 2HCAA 4YB7A 4IO3A 3TCHA 1EH3A 4IO4A 3OO9A 2XXHA 5CMCA 3OSQA 4R2FA 4QFLA 3OOAA 5I2KB 1LB8A 1MXXA 2ALUA 3KSJA 3RY3A 3G3GA 3U93A 1N3XA 2XXIA 3IX1A 3MVZA 3G3IA 3PPOA 2XXUA 2Q9TA 5I2NA 3QUFA 1FW0A 4KI0E 1D3KA 3ECRA 1SW2A 1IUDA 5ELVA 3EHSA 1MM6A 1MXUA 4ZDMA 3U92A 1B0HA 3IL1B 5L9MA 5L9OA 3C32A 4G2ZA 3S9LC 3UN6A 1OQGA 2AIXA 5DTBA 4BDQA 4F29A 1M5FA 1LSTA 5AA2A 5K2YA 2M8CA 4H65A 3IJXB 4OXVA 2F34A 1MQDA 1Q35A 2R9JA 2HZKA 4RNSA 1B40A 5L9SA 4OENA 4IO5A 3FV1A 2IEEA 4GD5A 4GL8A 1P1OA 2ANJA 3I5OA 1O64A 3IORA 3TTMA 3VVDA 3PU5A 1GR2A 3CSGA 1N3WA 2D3IA 1P1WA 2Q2CA 4ZS9A 2ZNUA 1B4ZA 2LAOA 4OFLA 2RC9A 4PETA 3SEUA 1JNFA 4ZE8A 3B6WA 2OK2A 3PUWE 4OVJA 2XXTA 1B5IA 3V89B 2X7QA 3DP6A 4NF8A 4Z0IA 4YMAA 3UK4A 1QULA 2R71A 3MJNA 3W15C 2XXXA 4GL0A 2ONKE 3Q28A 3KOTA 1MQGA 4IO2A 2Y7IA 4P0GA 1QKBA 4AB6A 4ND9A 2XXVA 5F1QA 1B3HA 1TXFA 2Z22A 3N6UA 2F36A 1MDQA 2A5TA 1J1NA 3H6UA 4YMBA 4WXJA 4NMYA 2ZMBA 3GZGA 5ICQA 5IKBA 4H67A 4EQ7A 2HEUA 1P1QA 3VLVA 4XKRA 4RY1A 2I4BA 3VV5A 1JQFA 1LAXA 1S7YA 2HZLA 1XT8A 3PMVA 4GOTA 2I3WA 1LCTA 1XS5A 4MH5A 2FNCA 2O7IA 2ZNSA 4NWDA 1A7LA 4OHNA 5CMMA 4AQ4A 3TYHA 3H03A 1YPNA 2I48A 2RCBA 5H8HA 3TFLA 3VVFA 5ISUA 2RC7A 4KCDA 4EQBA 4F2QA 3K6WA 3KG2A 1AOVA 3D4CA 1VE4A 4NE4A 5FHMA 1NNTA 1DPPA 3OEKA 3WAFA 3W9WA 1FTLA 3FVGA 1PB8A 3A3CA 4BLAA 4UACA 2QS1A 5DEXA 2RCAA 2Q8JA 4OETA 2REJA 1Y1ZA 2HAUA 1TT1A 1SQYA 1OLAA 2O1MA 2QRYA 3IO6A 3RTWB 3MZ1A 3RT6B 1B0LA 4KCCA 4ZEFA 5TP9A 4TLLB 1XC1A 3O97A 1IXCA 4MBPA 3H6WA 4O3AA 3V8XB 1XVXA 2XD3A 4LQ2A 1OLCA 4BDLA 1ZKBA 2UVIA 3QUJA 3T9HB 1SW4A 1IQ7A 4EF1A 1ATGA 1PC3A 2F78A 4FECA 2DWHA 2I58A 4P11A 2H98A 2XX8A 1MQJA 1ZBMA 3OO6A 5HM4B 2RC8A 4ESXA 3EPEA 4TLMB 5K2XA 3SKPA 3MP6A 1PBQA 2Y7RA 2Y7WA 4R2BA 3T9XB 2NWJA 2NOOA 5I59A 3TUSA 2Z8EA 3A09A 3CR9A 1NH7A 1SD3A 4I8CA 1H44A 4F1YA 1B1HA 4DCXA 2O84X 3KBRA 4IGRA 4XXUA 1EZ9A 3MVWA 3UIFA 1N04A 3TMGA 3IB2A 1B7UA 2QL3A 4KD5A 1MY2A 3BFTA 2VOZA 4EQ9A 5JEIA 2E0SA 3P7IA 1IXIA 1BIYA 1XOCA 1Y9UA 2VP1A 4R9GA 5TU0A 1TFDA 3H6VA 3DP4A 4EF2A 2OJTA 3O6IA 3TPAA 4KYSA 4PQJA 1DPEA 3RNNA 2XXYA 3JV9A 3SESA 4LZ8A 4G68A 3LC8A 3ZS6A 4QSDA 2ONSA 2THIA 3KOSA 5H8FA 1B4HA 5I2NB 1LLSA 1P1UA 3T96B 1AL3A 4OMBA 3U94A 2NUVA 1IIWA 1FCKA 1P99A 2V84A 1B9JA 2G93A 3K01A 4C1TA 1DOTA 4HTGA 3OMBA 4YB5A 2IA4A 3THIA 3IK6B 3PD9A 1UIUA 1DMBA 1CB6A 3IOWA 3VXCA 4NF5B 1LFGA 2F35A 3E3KA 3KZGA 3V5AA 1NKXA 2UVHA 3LUYA 1R6ZA 1NL5A 1LBBA 1UTBB 4YKKA 5TP9B 3K00A 4F39A 4ZEDA 2I0CA 3L6HA 4JBZA 2OCUA 3VXBA 3TEPA 2Z8FA 1SI1A 4JDFA 3WAEA 2F6GA 1RYXA 4GXAA 4MF3A 4THIA 3QIMA 2RF1A 3FVOA 3MC2A 4OFOA 2Y7KA 2DVZA 1PB9A 5FTIA 3T22A 4DDDA 5AA3A 3K2DA 4IO6A 3FVKA 4FIMA 4N13A 1XHYA 1A8FA 2PX1A 3QSLA 2PT1A 1OMPA 4POWA 4FEBA 3E4RA 1B51A 1QKAA 2HFBA 3HN0A 3TDJA 4IGTA 4ZE9A 1QUJA 3QXMA 3RN8A 3G3KA 4IB2A 2RINA 5CM6A 2DS9A 3M3KA 3ONMA 3ODBA 1QVSA 2O68A 3DM0A 3IR1A 1B7HA 5I57B 1B5JA 3MVXA 4GRKA 4LP2B 1FQFA 3D4GA 3LR1A 3LSXA 4YKPA 3TCFA 1LAHE 4H8JA 4PFUA 2Z8DA 1Y4TA 1H3DA 1VFEA 2ABHA 2O1LA 3BKIB 4HS7A 4GIZA 3HV1A 2A5SA 4QHQA 1BKAA 3S4UA 4YB6A 3TQWA 4R72A 1FQEA 4NF6A 4G68B 1UTHB 2XHDA 4F19A 2H99A 3Q29A 1MXWA 1TWYA 1FQDA 4LVQA 4RK2A 3U8QA 1ZU0A 4BDMA 5DEXB 4BDNA 5JK4A 1EZOA 4G77A 2OZZA 2Q88A 1BTJA 1HSJA 1N84A 4RK9A 1MRPA 5F7VA 3SDFA 4FJPA 5CRYA 3TZAA 3C36A 3H4ZA 3TTRA 1ELJA 2GRVA 1LGBC 1FTJA 1LFIA 2DWJA 2ZYNA 3CG3A 3MWBA 4PFYA 3R7XA 1PEBA 4F3SA 1R9QA 3RT8A 2HAVA 4EUOA 3O2AA 1MY3A 3FXRA 1QW0A 3LSWA 3MUQA 3PPQA 4DE8A 1I6QA 3S9NC 1SI0A 2VHAA 2BJJX 2OWSA 4F18A 1OVBA 1XVYA 2DE2A 3KJ7A 4HCWA 4OQOA 2PYYA 1S9TA 4U21A 5EHSA 3U72A 5BWJA 5KDTB 3K1PA 3E9XA 5EYFA 3UORA 3E13X 1A99A 2XXRA 4MLQA 3R26A 1LAGE 4JB7A 1BLFA 1VFDA 1YTVA 1AMFA 2O6AA 3IOVA 4N07A 4DXCA 5AA4A 1JETA 3MZ9A 4U22A 2I49A 4PFTA 3HSTA 2X7PA 3L6GA 4QFNA 1SYHA 1B32A 2F7BA 2GH9A 5DYHA 3IB1A 3LSFB 1O7TA 4X9TA 1LAFE 3IJOB 1WODA 3SEVA 1MQIA 4FE8A 1FTOA 4U23A 3GXAA 1POY1 1AH5A 1US5A 2UYFA 1SDXA 1PBPA 3IAZA 2XXWA 3KSXA 1LCFA 1R1NA 4U1ZA 4YICA 5TPAB 5B70A 4FEDA 1GVCA 3SEXA 3QK6A 2ZNTA 4YKJA 5H8NB 2I4CA 3DLNA 4KYDA 1II5A 1MQHA 3EQ1A 4JWYA 4M1VA 3AXFA 1B3EA 1SW1A 4NF6B 3TCGA 4QF9A 5A5XB 5I84A 3LBSA 1B46A 4LA9A 4ZEKA 5JTYB 1POTA 1SW5A 2QMWA 1SVXB 1FQBA 3C34A 3HHFA 1FTMA 4LZ7A 2HQ0A 3MPLA 2R6GE 3FUZA 2QPQA 2GHAA 3H6TA 2Q89A 3PUXE 1QUIA 4RPNA 4F1VA 3HCQA 2AYSA 2DQVA 2XXQA 4FAJA 1HSEA 2ZXTA 1KWHA 3FJ7A 3MBPA 4LATA 3ILUB 4FATA 5JTYA 3CIJA 3JYRA 2QS2A 2ZYKA 3OO7A 3PPRA 4POXA 2DXRA 4YU0A 4G68C 2Q2AA 2F7CA 2UVGA 3C33A 3FXUA 3KN7A 4KFQA 4NTLA 5FHNA 1JVXA 1N76A 2VD2A 2B3BA 1MH4A 2NXOA 3RLFE 4QFKA 3TTLA 3G3FA 3PMXA 1NFTA 5AE4A 1SBPA 3EHTA 1YAEA 3K6XA 4NEDA 5AA2D 2OLBA 1UIVA 3OEMA 4H5GA 1VR5A 4F3BA 3OELA 3K0VA 3OXNA 3OENA 3CFXA 1MXZA 2Z23A 2H4IA 3T66A 3VLWA 3FV2A 4H8IA 3T93B 3KN3A 3FXQA 5A5XA 1D9VA 4R6HA 1MXVA 2VD3A 2A5TB 4YZZA 1MG1A 2X26A 3EN3A 3BFUA 3K1MA 3SEWA 1WVJA 1A8EA 2AL4A 1P1NA 3G3HA 3Q26A 1I6BA 2ZYOA 1M5CA 4RYAA 3O66A 3EHUA 2XX7A 3HO7A 2KLFA 4IY5A 3RGYA 1MY1A 1D9YA 2PVUA 1MPCA 3B6TA 4U4XA 4XIGQ 4ELPA 5KDTA 2YJPA 1A54A 1Y3PA 4OZ9A 1M5EA 3O28A 4I62A 3N94A 5ITOA 2ZYMA 4JWXA 1YCJA 5H8SA 4JXIA 2O51A 4QRZA 1Y3NA 3QYTA 2DWAA 4HCYA 4L17A 1B58A 2DWIA 2Y7PA 1GGGA 1ZJLA 3H06B 5KCJA 1Y20A 2E1SA 5LOMA 4EDPA 1Z7NE 3R6UA 1JW1A 3O9PA 5CI5A 3TKDA 1JEVA 1VSOA 4AB5A 3CI8A 3CSBA 3KFMA 4DLDA 1RKMA 3C35A 5B7DA 4OEUA 1Y1MA 1EU8A 2UVJA 4ELRA 4YKIA 4ELQA 5HBCA 3CG1A 1GV8A 2AL5A 4R73A 2I3VA 2GFEA 2REGA 3FZVA 3G7WA 3MQ9A 2UXAA 2I6EA 3ZKKA 1ZMGA 1MXYA 2D21A 1H45A 2XD2A 5CMKA 3K02A 3MAMA 4DIGA 1IZ1A 3MZBA 4XTCQ 3RQTA 4DCYA 1Y4CA 4PFWA 5TPAA 4RPOA 5FHOA 2FYIA 2PMSA 3OSRA 4ECFA 4G8MA 4XKNA 3I3VA 1DTZA 5I58B 3CRBA 5DVIA 1QJMA 3IO4A 4NWCA 1IITA 3PGFA 4PP0A 3C31A 1LFHA 1FTKA 3CFZA 3IOUA 1Z7ME 1MPDA 4F1UA 4Q0CA 1OQHA 4O3CA 1F9BA 4PE5B 3FATA 3M8UA 2F6PA 3OD7A 4C0RA 5DVFA 3DP8A 3S9MC 2DVCA 3VFJA 2DE3A 4BDOA 5I2KA 5BUUA 4P0IA 5H8QB 3O29A 3TTKA 3TELA 1B5HA 4LUBA 4E0WA 5I56A 2NVUB 5ICTA 2B65A 3TODA 2QS4A 3S9EA 2V25A 2CZLA 3CFLA 3KGCA 2XXPA 3FJMA 3VE1B 1B1XA 3O6HA 3VVEA 2DXYA 1USYH 1JW5A 3FVNA 2WKYA 4ZEBA 1A55A 4DZ1A 2DP8A 1M5DA 4FORA 1QUKA 4R9FA 2DSFA 3A3UA 1LB9A 3MVYA 1SYIA 4F22A 3F11A 3B7DA 5CMBA 4GFRA 3PUZE 4HW8A 4ZECA 4Q30B 2V3UA 3GLBA 1USYE 2FA7A 4LONB 3MP8A 1DSNA 4X1DA 1MS7A 1MY0A 3ILTB 2OBGA 3UA8A 4O3BA 4H0WA 1B7ZA 2OWTA 1I69A 3OO8A 4U1OA 3N6TA 2H5YA 1IXHA 1B6HA 4DXUA 3SEYA 1MM7A 3IOTA 3K4UA 3PUVE 4KHZE 4R6YA 3V83A 1PB7A 2PBWA 5I57A 1ZTYA 4IO7A 1MY4A 5IAIA 3FASA 1US4A 4MFIA 5AA2B 4ISUA 4LZ5A 1OVTA 3FIRA 3N26A 4OWDA 3SERA 4GXSB 2Y84A 2CMOA 3Q27A 4I9DA 4I1DA 1NMUA 3C9HA 3M3FA 4ONYA 4Q8RA 3K6UA 4GLIA 4Z7EA 1WDNA 3H3GA 3QAXA 4JSOA 4ZEIA 1B3GA 1H76A 1I6AA 4M4GA 3CVGA 1M5BA 4NF4B 3MW0A 5EHMA 4UA8A 1FQCA 2YPNA 4U4SA 1LBCA 1ZLQA 4GF8A 5CBRA 5I56B 3FGSA 3IB0A 1N7WA 5L8DA 4R74A 1N7XA 2F7AA 4OERA 2P2AA 1S50A 3K1NA 4QFOA 4RJZA 4XKQA 1GTKA 1B3LA 1D4NA 3T9UA 2D5WA 4X48A 4H5FA 5H8FB 3PPNA 3U1OA 1B52A 4DXBA 4K3FA 1UTHA 3UGWA 3T9VA 3JZJA 2H25A 4F3PA 1UTBA 3RPWA 2DOJA 1R9LA 1JVYA 3B6QA 3GBBA 1FQAA 1JEUA 4TOZA 2UYEA 3K6VA 2ESNA 2P0SA 5H8QA 1URGA 4KYEA 2DYXA 4KPTA 4IY6A 1URDA 4KR5A 1T0KA 2V3QA 3FD3A 2W7YA 3MPKA 4ELOA 1UQWA 2QMXA 3TQLA 5KCJB 3USDA 2F8DA 3ZSFA 1ZIUA 2H9BA 2V3TA 4NF4A 4WEPA 2RKMA 1RYOA 2QSXA 4NF8B 4GQOA 3VLUA 2PT2A 1JW4A 5KZTA 3KEIA 3N5LA 4ZZEA 3GBAA 4NF5A 1NNFA 3M3LA 1A40A 1AIVA 2G29A 3HHGA 4ZZAA 3PD8A 4F31B 2XX9A 1MH3A 4BDRA 5AA4B 1MDP1 1Y3QA 3PPPA 1B2HA 4KQPA 2B3FA 3HPIA 4OTEA 1NNPA 3Q25A 4OESA 4QSEA 4TQUQ 1NH8A 4X1BA 3C4MA 5H8HB 4OFJA 3PV0E 3ZKLA 4C1UA 2VGQA 4GWOA 5ITPA 4OYVA 3TAJA 3PUYE 1Q1KA 5DVJA 4N6PA 3VDFA 5CBSA 3G3JA 4R6KA 5J1DA 1NNKA 3UP9A 5I58A 3FJGA 4G8NA 5M2VA 1DTGA 3RUMA 2ONRA 1PDAA 3BBRA 2V93A 3RTFB 3S2VA 4RXLA 1URSA 4EXLA 1OIBA 1ANFA 4LQ5A 2O69A 5FTHA 4QSCA 4F3GA 4XKPA 4R75A 1BP5A 5HPQA 1N0TA 3KJTA 4F2OA 4RA1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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