1FTLA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with the antagonist dnqx at 1.8 a resolution
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
b'TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 78
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftlA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftlA01
2B65A 2E0SA 2O51A 3LSLA 4FEBA 3EHUA 4UACA 5EHSA 5TU0A 1LAFE 3OEKA 2GRVA 1B3FA 1FTMA 4ZE8A 1DTZA 2ZMBA 1JETA 2X7PA 1II5A 5JK4A 1TT1A 4RPNA 5B70A 2UVIA 4G77A 1ZJLA 3CG3A 2REJA 4R9FA 3KSJA 2F7BA 3E13X 4U4SA 2QS3A 4LVQA 4I1DA 3IOVA 3FV2A 1MQJA 1SW5A 4IGTA 3PGFA 1WDNA 3L6HA 1B9JA 1Z7ME 4AB6A 1MY2A 3SETA 1M5EA 3H4ZA 4IO7A 1Y3NA 4F39A 3FVKA 1B4ZA 4GL0A 3GZGA 4HCYA 1B3EA 4OENA 4F3SA 3T93B 3DP8A 4DLDA 4BDQA 2F6PA 2RF1A 2XXHA 2Y7KA 1MDP1 4HTGA 3B7DA 3R26A 3N6TA 2ALUA 1FTOA 4L17A 4ND9A 2AIXA 3KJ7A 5I59B 3PUZE 2G93A 3K1MA 1Y4TA 2VHAA 4ELQA 1A7LA 4EQBA 4YMAA 3IOWA 4KYDA 4G2ZA 1HSEA 4PFYA 3IB0A 3O97A 4R6YA 2A5TA 2ZYMA 2HAUA 2UYEA 3V5AA 4QFLA 1URGA 1MPBA 4LQ5A 3UK4A 5ICTA 2RC8A 3PMXA 3FATA 3E3KA 4ELPA 1BLFA 3PPPA 3N94A 1B7HA 3T9UA 4OTEA 1L5TA 3UA8A 1NNPA 2OCUA 3MW0A 2REGA 4BDNA 3SEVA 4EXLA 4QSCA 3PPNA 3IJOB 4OEUA 3TTKA 4O3BA 1DPPA 2ABHA 1M5BA 2E1SA 1I6BA 2PVUA 4LA9A 3CFLA 2GFEA 4KYEA 3TTRA 1I6AA 1M5CA 3S9LC 3UN6A 2F7CA 5DVFA 1BKAA 1EU8A 3TYHA 3MZ9A 3RUMA 1JQFA 5J1DA 4ZECA 2D21A 1PB9A 3EQ1A 3TKDA 1IITA 5H8HB 2QS2A 3FVGA 4FE8A 4GL8A 4R6HA 2V84A 5K2XA 3SKPA 3H6TA 1A55A 2F36A 4F2OA 2Z8FA 4ZEDA 2ONRA 2V3UA 4LZ8A 4WXJA 1TFDA 2P1SA 3TTMA 5I2NB 4YKPA 2H99A 3RN8A 2DXYA 4DCXA 3K01A 1B4HA 5TPAB 3OO7A 1D9YA 4OYVA 1USYH 1B3LA 3A3CA 3I5OA 4GIZA 4OESA 1IQ7A 3RPWA 4LZ5A 2V25A 1MPDA 1Q1KA 4U21A 1FTKA 1P1NA 1B32A 3RNNA 3MC2A 3QSLA 4TLLB 4IO5A 2Q2CA 3RY3A 5IAIA 3FV1A 3FIRA 3CRBA 1NKXA 4NF4A 3LBSA 1ZLQA 1XT8A 1ZU0A 1SW2A 3VLWA 2DE2A 3OELA 2XD3A 4BDOA 3SESA 2Y84A 3G7WA 3GLBA 4RJZA 3QAXA 3CVGA 3IK6B 2GHBA 3O29A 5CMMA 2NWJA 1OLCA 2AL4A 4K3FA 4JWOA 3K6UA 2HZLA 1TWYA 4NMYA 3O2AA 1JW5A 5CBSA 4H8IA 2DP8A 1A99A 2Q2AA 4NTLA 3LC8A 5H8SA 5M2VA 2D5WA 1B52A 4JB7A 1B3GA 2LAOA 4LZ7A 4RPOA 2RCAA 3DP6A 4EF2A 1UTBB 4OHNA 3V89B 3OENA 3PV0E 2X26A 1A40A 4FECA 1B58A 3TTNA 2UVHA 5AA4A 1N0TA 1MDQA 2YLNA 3TPAA 2H5YA 5KCJA 5ISUA 4LP2B 1MXUA 2I6EA 1DTGA 1B3HA 3O6IA 4GRKA 1UTHB 5BWJA 4OFJA 1FQAA 3M3LA 5L8DA 3MVZA 3OO9A 1ZIUA 1N04A 1I6QA 2ZYOA 4KHZE 2FYIA 2CMOA 4G8NA 2QMXA 1VE4A 3QUJA 4NF5A 3EF7A 3VXBA 4X9TA 5KDTB 1OQHA 5TP9A 2IA4A 2H4IA 3Q25A 3U8QA 4OFOA 3KOTA 4O3AA 4BDRA 2Q89A 4F2QA 3W9VA 3G3FA 1LAXA 1UIVA 3TAJA 3U1OA 1GR2A 3U93A 3SERA 2F35A 3BFTA 1AIVA 2Y7RA 4Q30B 2F34A 4R9GA 3MP6A 3B6QA 1EZOA 3S2VA 1XVYA 2O1MA 3OSRA 2ESNA 4NF8B 1MH4A 3MQ9A 4H6DA 3EN3A 4I9DA 4WKMA 3H3GA 1N7WA 5A5XB 2QS4A 1DPEA 1Y1ZA 3MAMA 4PETA 4YICA 3SEXA 1QUKA 1QVSA 4ECFA 1IXHA 1N76A 1B1HA 1LFGA 2XXWA 5CMKA 1B1XA 5I2KB 3U72A 5H8QA 3KZGA 1FQCA 3PPRA 3FVOA 3IOTA 1ELJA 3ZSFA 4O3CA 3K6XA 2H9BA 5I56A 1ANFA 3C9HA 4ZEBA 1ZKBA 3SEUA 3TDJA 2Z8DA 4I8CA 4G68C 3BFUA 4G68A 5I57B 3K6VA 2I3WA 1JEVA 5H8FB 4Z0IA 3TTLA 1FQFA 4JWXA 3MVXA 3KN7A 2HEUA 2RKMA 1NMUA 3LUYA 3PUWE 4NF6B 5I58B 1B46A 1F9BA 4N07A 4F1VA 2BJJX 3I6VA 2NVUB 3MBPA 3MZBA 3IOUA 1EZPA 2RINA 4XIGQ 4DE8A 1LCFA 5KZTA 2RC9A 3G3KA 4FAJA 3OXNA 4FEDA 3B6WA 3HHGA 4ZEFA 3RT6B 3VXCA 1YAEA 1IXGA 2PBWA 4E0XA 4HS7A 1WODA 4OERA 4IO6A 2O6AA 2XXPA 5I84A 3H6VA 3G3GA 3IR1A 4PFWA 3UORA 1MXYA 1MG1A 1B5JA 5ITPA 4EXKA 4RY1A 1CB6A 1B0HA 2QS1A 1FCKA 5AA2A 1QUIA 4H67A 2VOZA 1PB7A 3L6GA 2X7QA 4YKJA 2RC7A 1LAGE 1VR5A 3RLFE 1S50A 4ONYA 3MJNA 1YCJA 5JTYA 3OSQA 3R7XA 3FGSA 4OMBA 1SYIA 4ZEIA 3D4CA 4FJPA 2IEEA 4YKKA 4OWDA 1B40A 1ATGA 2I0CA 1N3WA 2A5TB 4R72A 1MY0A 3KN3A 1H44A 4G8MA 1Y4CA 2DXRA 5L9OA 1GGGA 3E9XA 1B6HA 4MF3A 2OK2A 3ILTB 2Z8EA 2ANJA 3BBRA 4OQOA 1QJMA 1DSNA 1EH3A 4POWA 1PEBA 4R2FA 1FW0A 3FD3A 2AYSA 1N7XA 1IZ1A 1J1NA 4ZDMA 3TQWA 2O84X 5LOMA 3DM0A 4C1TA 1QULA 1XC1A 3T9XB 3K6WA 3C4MA 5DTBA 4XKQA 3GBBA 1US5A 4G8HA 4F1YA 3ZKLA 3MZ1A 4DIGA 2F78A 3ZS6A 3VVEA 4EUOA 4RYAA 3HN0A 4RK9A 1PBPA 3N26A 1POY1 3IX1A 2QMWA 3IAZA 1B7UA 1Y3QA 1D9VA 1PDAA 3HV1A 2DSFA 4RA1A 1USYE 1MRPA 4QFKA 4F18A 4TOZA 4C0RA 1SBPA 3KOSA 1MXXA 3E4RA 2NXOA 5ITOA 2WKYA 3CR9A 3RTFB 3KEIA 4Q5TA 3O6GA 4PE5B 5CI5A 3LSWA 1FQEA 4Q8RA 5CRYA 4U23A 5DVJA 1OVTA 4RK2A 3AXFA 1RYOA 2YJPA 3KSXA 2HZKA 4KPTA 4X1DA 1LB9A 3TODA 4QSEA 1T0KA 4EQ9A 1IIWA 1M5DA 3FUZA 2M8CA 3FXRA 3PPOA 2O1LA 3PPQA 1TXFA 3ILUB 3KJTA 3VLUA 2H25A 4F3BA 1Q35A 5DYHA 1JNFA 2AL5A 2XXTA 3A3UA 3VV5A 4DDDA 3HPIA 4DZ1A 4YZZA 4NF4B 1S7YA 3B6TA 1OIBA 4AQ4A 3TCGA 4IY5A 4GFRA 1GTKA 4E0WA 4GXAA 1MY1A 3TUSA 2ZNSA 1EZ9A 4Z7EA 1RYXA 2XXQA 1MQDA 4MH5A 2OZZA 2F6GA 4ISUA 2KLFA 2XX7A 3O9PA 4H5GA 3Q27A 1R6ZA 2I48A 3V8XB 4C1UA 3QUFA 1HSLA 1QKAA 2PT1A 2XXYA 1VSOA 2O68A 1P1UA 1NNKA 1LBCA 3S9NC 1MM6A 1WVJA 4IO2A 1YPNA 4F1UA 3MP8A 2Y7WA 2PMSA 3Q29A 1I69A 3FXUA 4OXVA 4JSOA 1OQGA 4IB2A 2XXVA 4Q0CA 2YPNA 1XOCA 1P1OA 4ZS9A 3CFXA 4FIMA 2QRYA 4POXA 4ESXA 2VP1A 2DE3A 5L9MA 3MVYA 3SDFA 5F1QA 5FHNA 4DXUA 2O7IA 4HCWA 5EHMA 5AA3A 4N13A 1IUDA 2CZLA 3C36A 4EQ7A 4GD5A 2XD2A 2I0BA 5AA4B 5L9SA 5KCJB 1N3XA 2XHDA 2OBGA 4PFUA 3T9VA 4GQOA 3PD9A 2DS9A 1QKBA 4XTCQ 1H76A 1FTJA 4R73A 1ZTYA 4H5FA 4YAHX 1FQBA 3D4GA 5DVIA 3IO4A 1AL3A 2XXRA 4NF5B 4YMBA 2XX8A 3RGYA 4HW8A 5TP9B 5ICQA 1S9TA 3TZAA 2NOOA 4JDFA 1JVXA 3FVNA 3CIJA 2OJTA 2QJEA 1NL5A 3H03A 3LSFB 4X1BA 4LATA 5H8NA 3M3KA 4KCDA 5DEXA 4LUBA 1B0LA 4FATA 2I58A 4QHQA 1TFAA 2I49A 3MWBA 2ZXTA 4DXCA 2V3QA 1MH3A 3IJXB 4MLVA 4NWCA 4NEDA 1XS5A 3H6UA 4DXBA 3G3IA 2ZYKA 4M1VA 3HSTA 4U2RA 4XXUA 4THIA 2QSXA 1MPCA 4LONB 4QFOA 1Y20A 1N84A 1QUJA 4PQJA 4H1XA 4M4GA 3KBRA 5BUUA 1ZMGA 3BKIB 4RXLA 3N5LA 3TQLA 1NH7A 5EYFA 1B5HA 3O6HA 4G4PA 1P99A 4P0GA 2HXWA 1B5IA 2OWTA 5H8QB 1SW4A 3HCQA 1R1NA 2DQVA 1O7TA 3M8UA 3OO6A 1VFDA 4MBPA 1OLAA 3C31A 3UP9A 3USDA 5I56B 3OO8A 2R9JA 1MQGA 1MXWA 3VLVA 4ZZEA 1FTLA 3FJGA 3G3HA 1A54A 4G68B 2QL3A 3TCHA 5IKBA 3KN8A 4BLAA 3OMBA 4KI0E 4NWDA 4NE4A 3UIFA 5FTHA 4IGRA 4FORA 3S4UA 2FA7A 1YTVA 4GXSB 3IO6A 5I59A 4ZZAA 3K1PA 1JEUA 4U22A 4IO3A 3F11A 3K2DA 2HCAA 5CMCA 1LFHA 1IEJA 3I3VA 1AH5A 1JVYA 2PT2A 2HAVA 5CMBA 4BDMA 1P1WA 2DWJA 1JW1A 5CM6A 1NFTA 2P2AA 2DYXA 4KD5A 4XKPA 2R71A 1R9QA 3K4UA 5FHMA 4XKNA 3N6UA 3HO7A 3KFMA 1H45A 4KQPA 3WAFA 2THIA 5B7DA 1BIYA 3S9MC 2OWSA 2DVZA 1Z7NE 3GXAA 1Y3PA 4F3GA 1LLSA 4OVJA 3WAEA 1SI0A 4TQUQ 4EF1A 4MLQA 1US4A 2V93A 2VGQA 2V3TA 2F97A 2F7AA 4F29A 5AA2B 1GVCA 3MP1A 1BTJA 3QIMA 3ZKKA 3CG1A 4EDPA 3KG2A 1MY3A 3OOAA 3A09A 4AB5A 3RQTA 1MQHA 1LBBA 5JTYB 5CC2A 3C34A 5H8HA 1M5FA 2ZNUA 5AA1A 1AMFA 4YB5A 2PX1A 4ESWA 3THIA 4BDLA 1O64A 3R6UA 3QXMA 4GWOA 3PD8A 2UVGA 4GOTA 2B3BA 2DVCA 1LAHE 2XXIA 4GVOA 5I2NA 1LB8A 2DOJA 2W7YA 3G3JA 1DMBA 2RCBA 4R2BA 2ONKE 5TPAA 3LR1A 3DLNA 2B3FA 2Z23A 1O63A 4F31B 1PB8A 4QF9A 2QPQA 2VD2A 2I4BA 2VD3A 3T96B 1SYHA 4U1ZA 2DWIA 3TELA 3VE1B 5HBCA 4F22A 2UYFA 1IXIA 2DWAA 2PYYA 1QW0A 3CSBA 4KCCA 1B05A 3V83A 1H43A 3P7IA 4X48A 1NNFA 4OZ9A 4QFNA 4GF8A 4YB7A 4KFQA 1SQYA 1D4NA 4F19A 3K1NA 3IB1A 1VFEA 4R75A 4YKIA 3W15C 3K00A 3GBAA 4ZE9A 3IL1B 4R74A 2F8DA 3EHSA 2O69A 4WEPA 4LQ2A 2A5SA 2DWHA 1XVXA 2HFBA 1P1QA 2R6GE 1URDA 1MY4A 3FJMA 1GV8A 3VDFA 4IO4A 3PUVE 2F5XA 3H06B 5CBRA 5HPQA 1LFIA 3DELB 2XXXA 3C32A 3T66A 1B7ZA 3FASA 3OEMA 3W9WA 3JYRA 4TLMB 1NH8A 5JEIA 3CSGA 1SW1A 4JBZA 3K0VA 2I4CA 1MXZA 3Q28A 1UTBA 4PFTA 1B51A 4UA8A 1SI1A 3S9EA 4JSDA 5FHOA 2H98A 3MPKA 3O28A 1MQIA 1RKMA 3EPEA 3IORA 1A8FA 2Q8JA 1UTHA 3VVFA 3FZVA 4JWYA 4ELRA 1AOVA 5K2YA 1UIUA 2ZYNA 1LGBC 3U94A 2XXUA 1OVBA 2Y7IA 5HM4B 1DOTA 1SVXB 4P11A 1LCTA 1R9LA 2Q88A 5AA2D 5KDTA 3ODBA 1OMPA 3HHFA 4H65A 4ELOA 1HSJA 1BP5A 1H3DA 5F7VA 3DP4A 3PU5A 4MFIA 4OFLA 3QYTA 4PP0A 3PUYE 4QSDA 1PC3A 1PBQA 4H0WA 3LSXA 3RTWB 3TEPA 3TMGA 2NUVA 4KYSA 3M3FA 3KGCA 3SEWA 3PUXE 3JV9A 3MPLA 2Y7PA 1FQDA 4R6KA 1ZBMA 3MVWA 1POTA 4XKRA 4F3PA 1MM7A 1JW4A 1UQWA 4I62A 1KWHA 3VFJA 5ELVA 4OEVA 1SD3A 2P0SA 4RNSA 4NF8A 3T22A 1Y9UA 2OLBA 3RT8A 2GH9A 4U4XA 1MS7A 5A5XA 3EHTA 4OETA 1NNTA 3PMWA 2D3IA 3O66A 3PMVA 1D3KA 1SDXA 1Y1MA 3C35A 3H7MA 3H6WA 3T9HB 3U92A 2FNCA 3TCFA 4P0IA 4QFPA 3SEYA 1MXVA 4N6PA 5I2KA 2UVJA 3CI8A 2ONSA 3IB2A 2GHAA 2Q9TA 5FTIA 4H8JA 3ONMA 3TFLA 2DE4A 1IXCA 3FJ7A 4ZEKA 3QK6A 2O7UA 5H8NB 3ECRA 2G29A 5DEXB 5I57A 2UXAA 3OD7A 4WEDA 5H8FA 3FXQA 1XHYA 3C33A 3VVDA 4QRZA 4IY6A 3JZJA 1CE2A 4U1OA 4JXIA 4DCYA 1B2HA 3CFZA 2XX9A 1A8EA 3UGWA 3K02A 2I3VA 4KR5A 5AE4A 4NF6A 5I58A 4YB6A 1LSTA 4YU0A 3MUQA 1URSA 2Z22A 5DT6A 2HQ0A 3Q26A 4GLIA 2ZNTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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