1FTLA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with the antagonist dnqx at 1.8 a resolution
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
total genus 78
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftlA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftlA01
4ELQA 4IO2A 3SDFA 5TPAA 3C31A 4XTCQ 1NNTA 2Q9TA 3A09A 2V3TA 3RT6B 1A99A 3TTMA 4RK9A 3CSBA 4MLQA 4P11A 2XXYA 1EZPA 4R2FA 1JEUA 1SW1A 1VE4A 3LC8A 1SI0A 4I8CA 3OEKA 2REGA 2XXVA 1EZ9A 4YMBA 4OXVA 1S9TA 3IB2A 3MJNA 3G3JA 1LCFA 4GD5A 2I6EA 3E9XA 1FQEA 4EXLA 5K2YA 1MQGA 4R73A 4I9DA 3T9HB 4FATA 4U1OA 2PVUA 3OOAA 3IB1A 3O2AA 4ND9A 3UK4A 3UORA 2PX1A 4EDPA 5I58B 2O84X 4GWOA 2DP8A 2GHAA 3PUXE 3EQ1A 2I58A 5LOMA 2V3UA 2H25A 5H8QB 1MY0A 3C4MA 4OFOA 1MQIA 3O9PA 1YCJA 5H8FB 3BKIB 1N84A 4F1YA 4NF6B 2R9JA 2V25A 2X7QA 2W7YA 5CMBA 4FAJA 2YJPA 1NFTA 3V83A 3UP9A 5FTIA 2E1SA 2ZNUA 2AL5A 3TFLA 1ZJLA 1ZKBA 5ISUA 2BJJX 2PMSA 4OHNA 2DE4A 1Q1KA 2Z8FA 3E4RA 2O1LA 3UIFA 3EN3A 4MH5A 4WKMA 3IOWA 4YKIA 2Q2AA 2X26A 4ZEBA 1QW0A 4QFLA 3Q28A 4DCYA 1NH8A 1XC1A 4AB5A 1LBBA 3OXNA 3Q26A 4ZEFA 4QFOA 3O28A 4DDDA 1WVJA 3K1NA 4KPTA 1HSJA 2R6GE 4K3FA 4WEDA 1O7TA 4ZEKA 3USDA 4LZ8A 1QUKA 4JDFA 3KG2A 1ZIUA 3PGFA 4JSOA 2DE2A 2ZYMA 3ILUB 3LSXA 3TTRA 3KZGA 4G68B 4GF8A 3MP1A 2DXYA 1MXVA 4F2QA 5F7VA 5DTBA 2ONKE 3JYRA 5TU0A 4KYDA 1T0KA 1XVXA 2KLFA 4MF3A 2XD2A 4NF8B 4FE8A 2IEEA 2O68A 4ESWA 4MLVA 3PUZE 1I69A 1QKBA 3I3VA 2FYIA 1B51A 3ZS6A 5KDTA 2ZYOA 1D3KA 3ILTB 3FJGA 1H43A 3H06B 3TQLA 3KJTA 4PFUA 2ZMBA 3VVFA 1H76A 4LA9A 4EF1A 1P1WA 4NTLA 2M8CA 4NEDA 4YKKA 1DMBA 5AA2B 3CG3A 3H7MA 5I59B 4ISUA 3WAEA 5I56A 5FHMA 2VGQA 4IY6A 4U22A 1B3EA 5CMCA 4F29A 4OESA 4PFTA 2WKYA 2XXXA 4U2RA 4PFWA 3MQ9A 2V3QA 4DLDA 1PBPA 4AB6A 5FHOA 1LFIA 4OYVA 3VXCA 3T66A 2DXRA 1SBPA 5H8HB 3SKPA 1B3GA 1XHYA 1FQCA 1B3HA 3KSJA 2O7UA 3FXQA 1JVYA 3S9EA 4EQ9A 3M3LA 4R6YA 2AYSA 3L6GA 2OCUA 3MW0A 4OWDA 3O6HA 2ANJA 1IXGA 3B7DA 1Y20A 2I0BA 4DE8A 3UA8A 3IOVA 4O3BA 1LFGA 3QXMA 4KYSA 2RCBA 5KCJB 1ZBMA 3EF7A 1LSTA 3PUYE 3VVDA 3MWBA 5DEXA 3MVWA 5AE4A 1MY1A 3N5LA 2OWSA 3GBBA 1AIVA 4FJPA 2DOJA 4NWCA 1Q35A 2HXWA 5EHSA 1QULA 3FIRA 1S7YA 4U23A 4ZEDA 1UTBB 4G8MA 5ITOA 4QFNA 3QYTA 1R1NA 2Y7IA 1UTHB 4XKNA 1Z7NE 5I2NB 1DSNA 1PEBA 4BDOA 2UYFA 3MPLA 1DTZA 3RTWB 4YMAA 3O29A 3TCGA 2DS9A 1BLFA 2B65A 3KN7A 1NL5A 1DOTA 3TUSA 2B3BA 5H8NA 2XD3A 5I57B 4HW8A 4UA8A 5L9MA 1ATGA 1VFDA 3LR1A 1KWHA 2B3FA 1LAXA 3W15C 1J1NA 2F8DA 1LAFE 4I1DA 5B70A 1LAGE 3DP6A 1HSLA 5I84A 3MPKA 2OWTA 1ZLQA 4ELOA 3M8UA 1P1UA 1B7HA 1URGA 4LVQA 2H9BA 5CC2A 2DVZA 5JK4A 3HO7A 2XXTA 3HN0A 1BKAA 2I0CA 1BTJA 4P0GA 2GRVA 2RC7A 3TCHA 1Y9UA 1GTKA 3T22A 3VE1B 1B2HA 1JW4A 4RPNA 3DP8A 3KFMA 1PDAA 3O6IA 3O66A 2D5WA 4Q30B 1NH7A 3GLBA 2QMWA 4G8NA 4GRKA 2NXOA 1NNPA 1MH4A 2O7IA 1SYIA 1PB8A 3FZVA 3RPWA 3U93A 3H6UA 2Q8JA 1MM6A 3HHFA 2ABHA 2DWHA 3PMXA 4F19A 2XX8A 3T93B 4BDLA 3RT8A 5BWJA 4F18A 1GR2A 3F11A 2XXHA 4RK2A 2UVGA 2YPNA 3IO6A 1FTOA 2Z22A 3IL1B 3N94A 5FTHA 4ONYA 2VHAA 4KI0E 3TQWA 5HM4B 4KHZE 2Y7WA 3EHTA 2E0SA 3TYHA 4YB6A 3RTFB 3HHGA 5CBSA 4IO7A 4H67A 3FXRA 3K1PA 5IKBA 3H4ZA 3E3KA 1MQJA 3K1MA 3S4UA 3IJXB 1N0TA 2ALUA 1XVYA 2OZZA 4G68C 4C1TA 2G29A 3OO7A 3K02A 1EU8A 3DP4A 4OFJA 2I3VA 4GLIA 3MP6A 4ELPA 3K6UA 3FJMA 1N04A 3VLWA 3IOUA 1POY1 3FVNA 5JTYB 2A5TA 2UVHA 3M3KA 4U1ZA 2UXAA 3IB0A 4AQ4A 3L6HA 3MBPA 2F78A 2OJTA 2F35A 3T9XB 4GL8A 5I2KA 2QS1A 4X1DA 3CG1A 2H99A 3W9VA 3K0VA 2Y7KA 3MZ9A 4ZZAA 4DXCA 1TFDA 4R6KA 4BDMA 4U21A 3FV1A 5AA4A 1WDNA 4F2OA 4NF5A 4GVOA 4YAHX 1P1QA 3OD7A 2P2AA 3TPAA 5CMKA 1SDXA 2OK2A 4U4XA 3CR9A 3SESA 3K6VA 1JVXA 4H6DA 4N13A 1P1OA 4QFKA 4X48A 4ESXA 4Z7EA 4Q0CA 1DPEA 4JWYA 3RQTA 4LATA 1IUDA 2XXRA 3IAZA 1QUJA 2XXPA 1IXHA 3TTNA 3TKDA 4R2BA 1JW1A 4WXJA 3CVGA 5TP9B 2F97A 1B1XA 1TWYA 1Y3PA 4YKPA 4KYEA 4TOZA 1MPBA 3N26A 1A8EA 1OQHA 2QJEA 1RKMA 1A54A 3OMBA 3PMWA 1N76A 4U4SA 3CFLA 5DVIA 1CE2A 2NWJA 3BFUA 1FTKA 2ZNSA 2RINA 1IXCA 2XXQA 4KQPA 1BP5A 3CSGA 3R7XA 2QMXA 4OTEA 1B40A 1YAEA 3U94A 5ELVA 1MG1A 2AIXA 4LQ5A 1SW4A 4QHQA 5I58A 4DZ1A 1QUIA 3ZSFA 3OELA 3QSLA 2XXIA 5H8QA 5CMMA 3D4CA 3KN8A 1D4NA 3O97A 1PB7A 2HCAA 5H8FA 1LBCA 5EYFA 4JBZA 1OVTA 3IJOB 1D9YA 3KJ7A 1FW0A 4NF6A 4OEUA 3I6VA 3G3GA 3UN6A 3IORA 4GXSB 2Y84A 3IR1A 1JQFA 2F5XA 2D21A 3BFTA 4NF4B 3RLFE 3VLVA 3OSRA 3T96B 1B52A 3WAFA 5A5XB 2Z23A 3CFZA 3G3KA 1MPCA 2QL3A 3SEWA 2ZYNA 3FXUA 3S2VA 2QS2A 1FTJA 4OZ9A 4PETA 3R6UA 1EH3A 4H8IA 4OVJA 1N3WA 1Z7ME 1MY3A 4H5GA 3TTKA 1MQHA 3RN8A 5CRYA 3S9LC 2ZXTA 2QRYA 1MH3A 3ZKKA 1FQAA 4C0RA 4Q8RA 3O6GA 3D4GA 4G68A 1II5A 4M1VA 4H0WA 1JEVA 1BIYA 2VP1A 5F1QA 2XX9A 1ZTYA 2PYYA 3M3FA 3PPRA 1M5CA 3PUVE 2Q2CA 3G3HA 4FIMA 4NF8A 3H6TA 2DSFA 2RC8A 3VFJA 3C33A 3OO6A 4F31B 4PFYA 1EZOA 3QUJA 3U92A 3THIA 1A55A 4L17A 2ZYKA 5ITPA 3PU5A 3K6XA 1L5TA 2FNCA 1O63A 1SVXB 2DVCA 3QK6A 3VDFA 1FQDA 1N7XA 1NKXA 4DCXA 1ANFA 3IOTA 1B7ZA 5AA2A 4F1VA 4RNSA 4DIGA 5I59A 3PPNA 1MXZA 3PPOA 3FATA 5AA3A 3OENA 1M5FA 2RC9A 2P1SA 1RYOA 2XXWA 2RCAA 2HAVA 1SW2A 4F3GA 4GIZA 2UVJA 3PPQA 1B46A 4BDRA 2GH9A 2I49A 5L9OA 3HCQA 4TQUQ 4IO5A 3TODA 4KR5A 4ZS9A 4TLMB 2F36A 4EXKA 3MC2A 3KOSA 1GGGA 3AXFA 3P7IA 5H8HA 1HSEA 3N6TA 4YZZA 3LSFB 1TFAA 3C34A 3MP8A 3VLUA 4XXUA 4ZZEA 4Z0IA 1M5EA 1I6BA 4EQBA 4LUBA 3SEVA 1MM7A 4F3BA 2VD2A 1VR5A 3UGWA 1JW5A 2UVIA 4QSEA 3S9NC 4LZ5A 4R9FA 5TPAB 3G7WA 3Q25A 5EHMA 5K2XA 2O51A 1ZU0A 5KCJA 1UQWA 2V93A 4UACA 1NMUA 2AL4A 1MRPA 1POTA 4EQ7A 4BDQA 1Y3QA 3FD3A 2RKMA 2F34A 4R9GA 1GVCA 1MDQA 3LSWA 4QSCA 5AA2D 3I5OA 1B1HA 3QAXA 1GV8A 3C36A 1B7UA 1UTBA 4MBPA 1WODA 4RXLA 3MZ1A 3PD9A 4ZE8A 3K01A 1UTHA 5I2NA 5J1DA 1US5A 4ZEIA 3MUQA 4H65A 1VFEA 3SETA 3CRBA 4POXA 3MVZA 1MDP1 1IIWA 1CB6A 4ELRA 1JETA 2PT1A 3N6UA 3PUWE 2I4CA 1S50A 4RJZA 1F9BA 3IK6B 3FVGA 5I57A 3FASA 1MPDA 1SQYA 1OLAA 3H3GA 1JNFA 4BDNA 3RUMA 4WEPA 4ZECA 5HPQA 4FEDA 2I48A 1B05A 2Z8EA 3BBRA 3TAJA 5L9SA 4TLLB 3JV9A 1LFHA 3RY3A 3KGCA 3K4UA 1LCTA 4OQOA 1IXIA 1LLSA 1XT8A 4GQOA 2DWJA 4R75A 4XKQA 5ICQA 4YU0A 4F3SA 4ZDMA 1US4A 1SD3A 2F7CA 4RY1A 1TT1A 1NNKA 2A5SA 1Y4TA 5B7DA 4KD5A 4X9TA 3LUYA 4DXUA 2H4IA 4JWOA 4EUOA 4OERA 2GFEA 1I6QA 3TEPA 2HFBA 2PBWA 3ECRA 4FEBA 4HTGA 1USYH 1AL3A 2HZKA 1AH5A 3TDJA 4LQ2A 3TELA 4IO6A 2I3WA 2ZNTA 3H6WA 2G93A 1P99A 4PQJA 5FHNA 3R26A 1AMFA 4THIA 3RNNA 2QPQA 4H8JA 1QVSA 1N7WA 3VVEA 4R72A 5KDTB 1XOCA 3FV2A 3PPPA 3CI8A 2OLBA 3TCFA 3H03A 4NE4A 1A8FA 1Y4CA 4BLAA 2ONSA 3A3UA 3MZBA 1MQDA 4NWDA 3SEXA 3K6WA 4H5FA 4JB7A 4RPOA 3U72A 4PP0A 3Q27A 5I56B 4M4GA 2IA4A 2F7AA 2F7BA 5JTYA 3W9WA 4E0WA 1DPPA 3MVYA 5DT6A 1UIUA 4F3PA 4QF9A 4OMBA 4YB5A 3SEYA 2I4BA 1Y1MA 3C32A 1UIVA 2R71A 4GFRA 1RYXA 1FQBA 2UYEA 1H45A 2P0SA 4G4PA 5DVJA 1LGBC 4JWXA 3K2DA 3JZJA 1OVBA 1VSOA 1IEJA 3VXBA 1LB8A 1D9VA 1FTLA 1B0HA 3GZGA 3KBRA 3RGYA 3K00A 4GOTA 1XS5A 2CMOA 3CFXA 5HBCA 1SI1A 2O69A 4PE5B 5BUUA 1H3DA 1YPNA 3KSXA 2D3IA 2NVUB 2H98A 4HCYA 4OFLA 3C9HA 3E13X 1B3LA 5IAIA 5DEXB 1LB9A 4IGRA 3HPIA 1SYHA 5CBRA 2X7PA 1LAHE 3FVOA 2Y7RA 1AOVA 1O64A 1QJMA 4NMYA 4JXIA 2O1MA 1P1NA 2NUVA 5TP9A 3DM0A 3OO9A 3SERA 3KEIA 1B0LA 3KOTA 3A3CA 4G77A 3MAMA 4Q5TA 1PBQA 3IX1A 2THIA 1DTGA 2FA7A 1IZ1A 1A40A 2XHDA 3H6VA 3Q29A 1N3XA 3FJ7A 1MXUA 2NOOA 5KZTA 1YTVA 4ZE9A 5H8NB 3TMGA 4F22A 1OIBA 1R6ZA 1FQFA 2HAUA 4LONB 4G2ZA 4FECA 4YB7A 4IB2A 2CZLA 3B6TA 1IITA 1R9LA 4POWA 4P0IA 2GHBA 3EPEA 4LP2B 3TTLA 4N6PA 3SEUA 2QS4A 2V84A 5JEIA 4O3AA 4H1XA 1I6AA 1MXYA 3OO8A 2DE3A 2Q88A 3IO4A 1MY2A 1SW5A 1B9JA 4RYAA 3V89B 1R9QA 2ONRA 4NF4A 1B4HA 1Y3NA 4HS7A 4KCCA 3QIMA 4F39A 3T9VA 2DWIA 2XX7A 3EHUA 5A5XA 3HV1A 3PD8A 3MVXA 2DWAA 4KFQA 3FGSA 5DVFA 1OQGA 4EF2A 3ZKLA 4YICA 2HEUA 4GL0A 2ESNA 1MS7A 4YKJA 3DELB 1ELJA 5CI5A 4IY5A 1M5DA 1B5IA 1B32A 4OENA 2XXUA 1B6HA 4F1UA 3B6WA 3T9UA 1B3FA 3HSTA 2DYXA 5DYHA 4OETA 3TZAA 4I62A 4O3CA 2VOZA 1ZMGA 2QSXA 1NNFA 4MFIA 4KCDA 5H8SA 3LSLA 3ODBA 1B4ZA 4LZ7A 3V8XB 1M5BA 1MXWA 2Y7PA 4N07A 1Y1ZA 4X1BA 1FTMA 3KN3A 2YLNA 4R6HA 3CIJA 2OBGA 4OEVA 3U8QA 3PMVA 1B5JA 4QSDA 3GXAA 2A5TB 1OMPA 3OEMA 2F6PA 5M2VA 4HCWA 4R74A 4JSDA 3OSQA 4IGTA 5AA1A 3VV5A 5L8DA 1OLCA 1MY4A 3G3FA 2LAOA 3G3IA 4G8HA 3U1OA 2Q89A 5I2KB 4XIGQ 3FUZA 1A7LA 5ICTA 3FVKA 4RA1A 3PV0E 4ECFA 3DLNA 2Z8DA 1FCKA 1PC3A 1MXXA 4GXAA 2O6AA 1QKAA 1B5HA 3LBSA 2PT2A 5AA4B 2H5YA 4IO4A 4NF5B 4QFPA 4FORA 2HZLA 2REJA 4C1UA 2QS3A 4DXBA 2DQVA 4E0XA 4XKPA 2VD3A 1IQ7A 3ONMA 1B58A 3EHSA 3C35A 4QRZA 3S9MC 2HQ0A 4IO3A 3V5AA 5CM6A 3B6QA 3QUFA 1H44A 3GBAA 1TXFA 4XKRA 1USYE 1URDA 2F6GA 2RF1A 1PB9A 1URSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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