2QS1A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer in complex with ubp315 at 1.80 angstroms resolution
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Binding site and ligand flexibility revealed by high resolution crystal structures of GluK1 competitive antagonists.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
total genus 78
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs1A02
1FQDA 1XHYA 5F1QA 1GVCA 2XXQA 1MH4A 2XHDA 3EQ1A 4M1VA 4RJZA 3HSTA 3VE1B 1NH8A 1DOTA 1B1XA 2YJPA 1SVXB 3PD8A 4F31B 1NMUA 1QUJA 3OEKA 4R2BA 4PP0A 4ESWA 3UN6A 1N0TA 2UYFA 2QMWA 4MLQA 2XD3A 2CMOA 3TTMA 2ZXTA 3C36A 2F35A 3IB1A 4OWDA 4ZDMA 3RNNA 3SERA 5TP9B 1B5HA 1B32A 3TFLA 3OELA 5ITOA 2DXRA 4ZE9A 3F11A 2Z22A 4N13A 3M3KA 3D4GA 1FQCA 4GQOA 2QSXA 2QPQA 3TQWA 4RXLA 1ANFA 3PPRA 1AL3A 2HFBA 2ZMBA 1P1QA 4F1YA 2DP8A 3UA8A 1Q1KA 5K2XA 3JYRA 1ZBMA 2F7CA 2XXPA 3H6TA 4XXUA 2QRYA 5AA2B 4GXAA 2HCAA 2HZKA 5AA4A 2DWIA 3THIA 4G68C 2H98A 5ICQA 4FJPA 2PMSA 2LAOA 4ELRA 1A7LA 5TP9A 1Y20A 5L9SA 2H4IA 1MPBA 2I3WA 5K2YA 3SDFA 3SEUA 2REJA 4HTGA 2WKYA 2DE2A 4JB7A 4BDNA 4Q8RA 2RKMA 4QSDA 2V3QA 2F97A 4NF8B 4U21A 2QL3A 4G77A 1MM6A 3G3HA 4DXUA 4N07A 2I4BA 5TU0A 4R6KA 3O6HA 3CFXA 1QULA 1B52A 2X26A 1MXWA 1DTGA 2O1MA 2V93A 3H06B 4DZ1A 4E0XA 4F3PA 2O68A 3IL1B 2PT2A 3KG2A 3PD9A 1J1NA 4XKNA 3FGSA 3ZKLA 3O66A 1A8FA 3CIJA 3ODBA 5I2KA 5DYHA 1LAXA 4GOTA 3LSLA 1US4A 3GBAA 1JVYA 3P7IA 4HCWA 2R71A 1EZ9A 2W7YA 1FQAA 5DVIA 5I59B 1N3XA 5JK4A 3KGCA 4EQ7A 5EHMA 4NF8A 4IB2A 2H5YA 4HCYA 4Z7EA 3OOAA 3U72A 5CMMA 3A09A 5H8NA 5FTIA 3ILTB 4F18A 4H6DA 4OETA 4G8MA 1MQDA 1Z7ME 2Q2AA 5CMCA 1MG1A 3PMWA 1OIBA 1DMBA 2XXHA 4Q0CA 3R7XA 1NFTA 1EZOA 1IUDA 1IXHA 1H45A 3K2DA 3FV2A 4LQ2A 5H8QA 4EUOA 3KZGA 2HAUA 3G7WA 1P1UA 1RYXA 3C31A 1SDXA 5JTYA 2I4CA 3RN8A 4PFUA 4KHZE 2R6GE 4U4SA 2D5WA 4LZ8A 4ZE8A 4JWXA 4Q5TA 5CM6A 3EHUA 2RCAA 3T96B 3T9UA 2GFEA 5CBRA 1MQJA 3C4MA 4KCCA 3RUMA 5M2VA 3TTNA 3BFUA 2OK2A 4IO3A 1RKMA 3U1OA 1EZPA 1Y4TA 2XX8A 5H8HA 1URGA 1NKXA 3MZBA 1M5DA 2RC7A 1B0LA 2XX7A 2VD2A 3OD7A 1I69A 4I9DA 4KPTA 1N3WA 2KLFA 1TFDA 3KSJA 4KFQA 3IJOB 3RTWB 3V8XB 4LVQA 4UA8A 3VDFA 5KDTA 1S50A 3UORA 2QJEA 2QS3A 1IEJA 2ONSA 1T0KA 1URSA 2GHBA 4OVJA 3TPAA 2XXTA 1MXUA 1PEBA 2UVGA 3LSFB 3OSRA 2VHAA 4G2ZA 4THIA 1B3EA 1LCFA 1FQFA 4EQ9A 1CB6A 1HSJA 3OO7A 2Y7RA 3TZAA 3JZJA 1MY4A 1HSLA 1GR2A 2RC8A 3O9PA 1PB7A 4XIGQ 1VFEA 5DT6A 1NNFA 4TOZA 2AL5A 5I59A 2OWTA 5DTBA 5H8HB 3K0VA 3CRBA 4QSEA 2OJTA 4O3BA 4GVOA 1SYHA 1M5CA 4GL8A 1A54A 5LOMA 3GXAA 3CVGA 1B9JA 3K6VA 4F3SA 2FNCA 4MBPA 3K4UA 4YZZA 1BP5A 3LBSA 2UXAA 4OFLA 1MPDA 1SW4A 1ZMGA 2Y7KA 2D21A 3FXUA 4U4XA 5I57A 1IZ1A 4PFTA 1BKAA 2DS9A 1Y3QA 2F8DA 5AA3A 2VGQA 1UTBB 4GLIA 4TLMB 5DEXB 2Q9TA 3TCFA 5KCJA 3B6QA 4PETA 3TAJA 2E0SA 1P1NA 5CMKA 4U1OA 3TCGA 1SI1A 3H6VA 4I8CA 2D3IA 3A3UA 4LZ5A 3G3GA 1B3FA 1JW1A 3EHSA 1LBCA 3Q27A 4R9FA 3S9MC 4AB5A 1YPNA 3C32A 5H8FA 3Q26A 2UVHA 4KYSA 1IXCA 1MY1A 2I3VA 2HZLA 3QUFA 3DP6A 5FHMA 1B46A 4WXJA 1JEVA 5ELVA 1MXYA 1WVJA 3IOTA 4LP2B 3CG1A 3E9XA 1B2HA 4AB6A 4X1BA 1Y3PA 4F19A 4YMAA 3DP4A 3PV0E 3U94A 5I2KB 2NUVA 1QKAA 4OXVA 3U92A 5ITPA 1R9QA 1SW5A 3I3VA 4ZEDA 1LSTA 1Y9UA 3I6VA 4GXSB 5I58B 3T9XB 3S9EA 4O3AA 2RINA 1LLSA 1XVXA 3VVDA 4DCYA 1AOVA 3T93B 5H8FB 3LSWA 1EH3A 1FW0A 1Y3NA 3O6GA 3PPOA 3N5LA 4NF4A 3VLVA 1XOCA 2Z8FA 3GBBA 3H6WA 2F5XA 3VXCA 1FQBA 4DDDA 3GLBA 4X1DA 5JTYB 1QUKA 1LAGE 3G3IA 3MZ1A 2UVJA 4IY5A 1MXXA 5KZTA 2I0BA 3SEVA 4DE8A 3LR1A 1N84A 3FJGA 3IO4A 4FEBA 4IO2A 4YB6A 3H3GA 3N6UA 3O6IA 4OYVA 3ECRA 3MVZA 3FJ7A 4OENA 3K6XA 2ZNUA 3RTFB 3MBPA 2OZZA 2NWJA 3CSGA 1VR5A 4C0RA 3MVWA 4DCXA 4EF1A 2O69A 4FATA 4R75A 4R9GA 3T9HB 4R6YA 3K00A 2IA4A 5B7DA 1GGGA 3T66A 1NNTA 2Q2CA 1DPPA 3PPNA 1N7WA 2DXYA 4LATA 4MF3A 4TQUQ 3OO8A 1H76A 3MVXA 5AA1A 3S2VA 3W9VA 1MY0A 3SESA 4BDRA 1JETA 3RY3A 1SD3A 3OMBA 3H7MA 1UIVA 1LFGA 3KJ7A 1XC1A 3CFLA 1QW0A 1ATGA 1YCJA 4JSOA 2HAVA 4DIGA 4BDMA 3FVOA 4QFKA 4KQPA 3C35A 3V5AA 2HQ0A 3FVKA 4QSCA 1D3KA 1OQGA 3PUZE 4IY6A 2DWHA 2F7BA 1B4ZA 3G3JA 3MP1A 3QK6A 5EYFA 5CI5A 4PFWA 1BIYA 4RY1A 2H25A 4U1ZA 2B3FA 4FE8A 2ZYMA 2RF1A 2HXWA 4OESA 2OLBA 3OENA 2E1SA 1B40A 2QMXA 3T22A 2X7QA 3UIFA 5I56A 2ZNSA 4QFPA 5AE4A 4IO5A 4F1VA 4RK9A 3GZGA 3MC2A 2Q8JA 5I57B 4PQJA 3H4ZA 3MVYA 1POTA 2DWAA 4RPOA 3VLUA 3TTRA 1IXIA 5I84A 4NE4A 1USYH 1UTBA 1B0HA 2VP1A 2G29A 4OZ9A 5L8DA 3QYTA 2AYSA 4FECA 5AA4B 1IITA 3HCQA 3PMVA 3SKPA 4F2OA 3K1MA 2DE3A 4H8IA 4ZS9A 4JSDA 1H44A 4H0WA 2VD3A 2XXRA 3I5OA 2DVZA 2PBWA 3ONMA 1P1OA 3SEYA 3U8QA 4F22A 5ICTA 4F29A 4MLVA 4G4PA 2OCUA 3FJMA 5JEIA 4NWDA 4EXKA 4F2QA 1B1HA 1OLCA 1FTKA 1LB8A 2YPNA 1AMFA 2THIA 3IORA 3O28A 4Q30B 3TELA 3QIMA 3FD3A 1FQEA 4FORA 3EF7A 1TFAA 3TDJA 2DOJA 1B5IA 3FV1A 4NF6B 1MRPA 2DYXA 4NF4B 2O6AA 1NH7A 3KOTA 4EQBA 3VVFA 1O7TA 1SQYA 1SW1A 3LC8A 3FXQA 3MJNA 4KYDA 5CMBA 4ESXA 2V3UA 3R26A 4P0IA 3RLFE 5I58A 5CC2A 3TKDA 3G3KA 1MDQA 4GL0A 4F1UA 2CZLA 1POY1 3LSXA 1B4HA 1LGBC 4QF9A 2AL4A 2G93A 4HS7A 2I58A 1IQ7A 4P11A 2B65A 3TQLA 1CE2A 1MDP1 3DELB 4Z0IA 1B58A 4M4GA 2XXVA 4ZZEA 3TYHA 1PC3A 1FTLA 1O63A 5CRYA 1OVTA 4H5FA 2GH9A 1YTVA 4L17A 5EHSA 3W9WA 1TXFA 2F7AA 5TPAA 1B6HA 4XKRA 2FYIA 3E13X 1D9YA 2IEEA 2XD2A 3IB0A 3IO6A 2GRVA 2XXYA 3MPLA 1JEUA 1KWHA 3PPPA 4OEUA 4OMBA 1Y4CA 3HHFA 3RPWA 4NMYA 5H8QB 2VOZA 5IAIA 1AH5A 1US5A 2Q88A 1DPEA 2R9JA 2REGA 4NF5A 1Q35A 2Z8EA 3E4RA 3TUSA 4H65A 4YB5A 3K02A 4QFOA 3U93A 3OEMA 4IO7A 4ISUA 4OEVA 1LCTA 2ABHA 3IJXB 1M5BA 4I62A 3VFJA 2P2AA 3PUWE 3O29A 4K3FA 2XX9A 3QUJA 2Q89A 2ZYKA 1TT1A 3WAEA 4R73A 1JNFA 5BUUA 3IOUA 3IK6B 2PT1A 3IX1A 4LUBA 2DQVA 3SEXA 3MQ9A 4EF2A 1B7HA 3S9LC 1SI0A 3ILUB 3VXBA 3L6GA 4PE5B 4R72A 2F36A 3FZVA 4G8NA 5FHOA 4ELOA 2OBGA 1S9TA 1XS5A 3IOVA 3K1PA 1S7YA 3SETA 3TTKA 5HPQA 3ZKKA 1OQHA 2P1SA 4FIMA 5KDTB 3MZ9A 1A99A 2H9BA 3Q25A 2O51A 3IOWA 4YKJA 1DSNA 3M3FA 4YU0A 3TEPA 1ZU0A 3OXNA 4KR5A 3N6TA 4LZ7A 4ECFA 4JWOA 4N6PA 3CI8A 2A5TA 2DE4A 2ZYNA 1MH3A 1UTHA 1OVBA 1R9LA 4NEDA 3ZSFA 4E0WA 1JQFA 2QS2A 4JWYA 4F39A 1R6ZA 2UYEA 4LA9A 4IO6A 3HV1A 4RK2A 2I49A 5L9MA 3UP9A 1USYE 4RA1A 3SEWA 3UGWA 2NOOA 3LUYA 5H8SA 4LQ5A 2PVUA 3D4CA 1MS7A 2O1LA 1URDA 1B3GA 3FASA 1QUIA 1GV8A 3MW0A 3RGYA 3B6WA 3VV5A 3FATA 2I6EA 2A5TB 1MQGA 1PB8A 4WEDA 1R1NA 5DEXA 4POWA 4NF6A 4ZEFA 4ZEBA 2V3TA 1A55A 1DTZA 1N7XA 2Y84A 3PUXE 4OERA 4QFLA 4GIZA 2DVCA 1SW2A 4OFJA 5H8NB 4MH5A 2QS4A 4QRZA 4YKIA 3EHTA 3KN7A 4NWCA 5IKBA 4X48A 4H1XA 3UK4A 3KJTA 2A5SA 1EU8A 4GWOA 3ZS6A 1N76A 4XTCQ 1AIVA 3IB2A 2V25A 3S4UA 3PU5A 2ZYOA 3Q28A 3KN3A 4YAHX 4WKMA 5CBSA 3IAZA 3MWBA 1A40A 2Y7IA 2AIXA 3CR9A 3S9NC 2DWJA 4JXIA 3K1NA 2ZNTA 4WEPA 4OHNA 1F9BA 4U2RA 3MAMA 2DSFA 3USDA 1B7UA 5TPAB 1PB9A 3BFTA 4GRKA 4R74A 2RC9A 3MP6A 4DLDA 5A5XB 4HW8A 3C9HA 1MPCA 1FTJA 3FVGA 3HO7A 3FUZA 1WDNA 1NNKA 3C34A 3K6WA 1UQWA 3V89B 4YMBA 4GFRA 2F34A 1BLFA 1P1WA 3QSLA 5HBCA 4O3CA 1QVSA 4RYAA 4KCDA 5I2NA 2O7UA 2NXOA 3Q29A 4U22A 4MFIA 1ZTYA 3EN3A 2ANJA 2O7IA 1MQIA 3MUQA 1N04A 4QFNA 4QHQA 4NF5B 2ALUA 2XXUA 3PMXA 4G68B 2XXIA 1P99A 1YAEA 2ESNA 3E3KA 3PUYE 4YKKA 1LFHA 2Y7WA 3MP8A 3N94A 4EDPA 2ONKE 3OO9A 1ZJLA 2I48A 4UACA 3RQTA 1I6AA 3VVEA 4EXLA 1NL5A 4YB7A 4GD5A 4ZECA 4RPNA 1QKBA 1B51A 1FTOA 2OWSA 4NTLA 3RT6B 3BKIB 3T9VA 5FHNA 4JDFA 1WODA 4ELQA 2BJJX 1IIWA 2YLNA 2GHAA 5FTHA 1OMPA 3HPIA 5I2NB 3EPEA 3K6UA 5A5XA 3B6TA 3WAFA 1FCKA 4H67A 1JW5A 1ELJA 1ZLQA 2F6GA 3TCHA 3O2AA 4KYEA 4DXCA 5KCJB 1LAFE 2PX1A 2QS1A 4G68A 1PDAA 1LFIA 1VE4A 1JW4A 3N26A 3TMGA 3FXRA 4OTEA 1H43A 4KI0E 3K01A 3L6HA 3AXFA 4ZEIA 1JVXA 1XT8A 1O64A 2Y7PA 3M3LA 4I1DA 1L5TA 1UTHB 4C1TA 2ONRA 4YKPA 3QXMA 4JBZA 5AA2A 5DVFA 3DM0A 3BBRA 3H03A 4TLLB 1D4NA 4FAJA 1FTMA 3MPKA 4P0GA 1D9VA 1B3HA 2UVIA 1UIUA 3PPQA 1LBBA 5DVJA 4OQOA 4BLAA 1ZKBA 1I6QA 1IXGA 2X7PA 4ONYA 2FA7A 1LB9A 5I56B 1HSEA 4OFOA 4R2FA 4GF8A 1SYIA 3CFZA 5AA2D 5BWJA 4BDLA 5L9OA 1MY3A 3R6UA 1RYOA 4YICA 4H5GA 4RNSA 3KFMA 4IGRA 4IO4A 4POXA 3G3FA 1MM7A 2B3BA 1QJMA 3JV9A 4ZZAA 3FVNA 2P0SA 2M8CA 2I0CA 3V83A 3FIRA 4DXBA 2PYYA 3DP8A 5J1DA 3VLWA 4LONB 1ZIUA 1VSOA 2H99A 3C33A 1I6BA 1MXVA 3OO6A 1A8EA 1B5JA 3PGFA 4C1UA 1PBQA 4KD5A 1PBPA 4U23A 5ISUA 3O97A 4PFYA 4XKQA 3W15C 1VFDA 3A3CA 1MY2A 2V84A 3KBRA 2Z23A 1M5FA 2F78A 3H6UA 3KOSA 3TODA 1OLAA 2XXXA 3KSXA 1XVYA 4AQ4A 1B3LA 2F6PA 2Z8DA 4FEDA 4ND9A 4R6HA 5B70A 1GTKA 1BTJA 1Y1ZA 3HN0A 1Y1MA 1H3DA 3KEIA 4XKPA 4ELPA 4F3BA 5F7VA 5HM4B 1LAHE 1TWYA 4BDOA 4G8HA 1MQHA 4X9TA 1II5A 3OSQA 4IGTA 4BDQA 4F3GA 3RT8A 1MXZA 1SBPA 1B7ZA 3M8UA 4ZEKA 3QAXA 2NVUB 2HEUA 3IR1A 2XXWA 3DLNA 3PUVE 3CG3A 3CSBA 4H8JA 2RCBA 3B7DA 3TTLA 3KN8A 1Z7NE 1B05A 2O84X 3HHGA 1M5EA 1NNPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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