2QS1A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer in complex with ubp315 at 1.80 angstroms resolution
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
publication title Binding site and ligand flexibility revealed by high resolution crystal structures of GluK1 competitive antagonists.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 78
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs1A02
4IO3A 4ZE9A 3H7MA 2DE2A 1ANFA 4NTLA 3DELB 1OLCA 1US4A 3HSTA 1OMPA 5DEXA 3P7IA 4QFKA 1UQWA 3CG1A 3TTMA 1H43A 3Q28A 4E0WA 3TODA 5CRYA 1MM6A 3FXQA 3DP4A 5JTYA 4YKKA 4KD5A 2A5SA 2DWIA 2H4IA 2ZYOA 3GZGA 4OFJA 5I57A 1Q1KA 3G3JA 1IZ1A 3LC8A 2AIXA 3K01A 1GGGA 4JWXA 2QJEA 1SW2A 5DYHA 1ZU0A 1Y3PA 2F36A 2W7YA 1HSLA 4QSEA 5I59B 2R6GE 3H6VA 3TFLA 5CMCA 4KYEA 5CMKA 3PUVE 5H8QA 4OQOA 5I2NB 1LB9A 4NF6B 5J1DA 2I4CA 2DWHA 1SQYA 1PBQA 1DMBA 3IOUA 3QXMA 1P99A 4FATA 1ZMGA 3MZ9A 1SYHA 1MH4A 1B0LA 4PFWA 4TOZA 4U4SA 3ZKKA 2UYEA 1URGA 2OJTA 3RNNA 3C36A 2F5XA 1R9LA 1ZIUA 3I6VA 3VVFA 1DTZA 4QHQA 3RGYA 1BKAA 3MQ9A 1HSJA 4LVQA 3HN0A 4RK9A 3CSGA 1B3EA 2UXAA 3H03A 1SD3A 1POY1 3L6GA 3MC2A 1N3WA 5KDTB 1OVTA 1MG1A 4H8IA 1USYH 5CBSA 2Y7PA 1L5TA 5ICTA 4EDPA 1KWHA 4LZ5A 5TU0A 3KN3A 1FQCA 1TFAA 5K2XA 1B3HA 5BWJA 3IJXB 1B7HA 3OD7A 2Z23A 4KHZE 2XHDA 3E4RA 4IO5A 3W9VA 2QS3A 1IIWA 4OEUA 2O68A 4KYSA 1NNPA 3F11A 2Z8EA 2DYXA 4IO7A 4IGTA 5FHNA 3KFMA 4XKQA 1ZTYA 3OEMA 5TP9A 1Y3QA 4UA8A 2RF1A 3TMGA 2P0SA 2HCAA 4EF2A 1PEBA 3A3CA 2O1LA 1FTJA 3IJOB 2I49A 5EHSA 4I9DA 3O6IA 3ECRA 2Y7RA 3W15C 1GVCA 3K0VA 1ATGA 4PQJA 3OO7A 3ILUB 1OLAA 1SW1A 2H99A 5DT6A 4KI0E 4DCYA 1I6BA 1CE2A 3KSJA 1PDAA 5I58A 2IEEA 4TLMB 1JQFA 4NWDA 1URSA 3V5AA 1EH3A 4NF5A 3R26A 4GXAA 3MVWA 3O6HA 3KJ7A 3WAFA 3K6VA 4HTGA 3RLFE 3K4UA 1QUIA 1WDNA 3UA8A 4LZ8A 4LQ2A 3KZGA 2V25A 3MAMA 3IK6B 3FVNA 3U8QA 2NVUB 1GV8A 3SERA 3I5OA 4DXBA 3LSLA 1SVXB 3OELA 3IB0A 2NWJA 1MDQA 2QPQA 5KZTA 3S9LC 4JDFA 4Z0IA 4G77A 4F1YA 3OEKA 4NF8B 5I56B 3KN8A 2O84X 4F1VA 2DP8A 2I0CA 3SEVA 1BLFA 4H67A 1B4ZA 2RKMA 3ZSFA 5AA4A 3D4GA 4FORA 4KFQA 2HQ0A 1NNFA 1WVJA 3DM0A 2F78A 3N94A 2I3WA 1QUJA 1PB7A 3K6WA 3C9HA 2OZZA 1Y20A 4JWYA 4NWCA 2OBGA 1FTKA 3RTWB 3PPPA 4ZEBA 5H8NA 1XVXA 3PMXA 2YLNA 1B40A 1P1WA 2UVHA 3MP1A 1FQBA 4IO4A 2QS2A 5FTHA 1XC1A 1MXWA 3IO4A 1QJMA 5AA2A 3IB2A 1LLSA 5I59A 4OENA 3TTKA 3MW0A 1M5FA 3PMVA 1N76A 4H65A 3K2DA 4H1XA 4X1DA 4QFOA 4O3BA 3IOVA 4H5GA 1D9YA 2GHAA 4YMBA 2AYSA 1FTOA 1TXFA 1Y9UA 3PUZE 3E3KA 3H6UA 1B6HA 4ZEFA 2QRYA 3SEYA 3FV1A 3OSQA 1FQFA 2RC7A 3QYTA 1MM7A 4QFNA 4KQPA 1LCTA 3VDFA 1MQHA 1N0TA 5LOMA 4X9TA 2ZNUA 1ZBMA 4YB6A 1UTHB 1LBBA 4K3FA 2VOZA 2XXPA 3UP9A 4TQUQ 3CI8A 2PVUA 4PE5B 2AL5A 2F34A 1ZLQA 3B6WA 2Q2CA 4G68A 3O97A 1II5A 2DSFA 2REGA 1D4NA 3MBPA 1LGBC 3SESA 3N5LA 3U72A 2XXXA 5CMBA 5H8HA 4OETA 2RC8A 2GHBA 1Z7NE 1SYIA 4MFIA 3EN3A 3K1MA 1J1NA 3C35A 1SBPA 1EZOA 4BDLA 5IAIA 3KJTA 1H3DA 4KPTA 1MQIA 3TDJA 1B51A 2ZYNA 1IXIA 4RY1A 2Q88A 1EZPA 2I48A 3MUQA 1M5CA 2DOJA 4U21A 1B58A 3OO9A 1MPDA 4XTCQ 2RC9A 4IY5A 1MS7A 3MJNA 3MWBA 2DXYA 2B3BA 4RPOA 3OOAA 1UTBA 1NL5A 4F3GA 3TEPA 4G8HA 3VLUA 3IAZA 3TCFA 2RCAA 3KG2A 4IY6A 3UGWA 1QW0A 5DTBA 3VLVA 1B52A 4H5FA 3O9PA 2ONSA 4RJZA 1Z7ME 5ICQA 3KSXA 5A5XB 3G3FA 2I3VA 2QS4A 5H8FA 5CI5A 3MZBA 4LP2B 1MH3A 3HV1A 3ODBA 3PGFA 3CFLA 4OWDA 3OO6A 4FE8A 3QAXA 2HXWA 1FQDA 4YKPA 1R6ZA 2UVGA 3LBSA 3TZAA 2X7QA 4ZS9A 2H5YA 3E9XA 1AMFA 1SW5A 1S9TA 4THIA 3KBRA 2RCBA 1DPEA 4LZ7A 1WODA 4ZEKA 5I2KA 1SDXA 2ZXTA 1POTA 4OYVA 3FXRA 4KYDA 5B7DA 4F1UA 3PPOA 4FEDA 4GVOA 3RUMA 2ANJA 4GL0A 5AA2D 4JBZA 1DSNA 4R2BA 3LSWA 3VVDA 3RTFB 2QL3A 2O69A 3ILTB 1VE4A 3T9HB 2Q9TA 4LONB 3TTNA 3PPQA 5H8SA 1YPNA 3N6TA 2DE3A 5JEIA 3O29A 4YICA 1BP5A 3LR1A 1ELJA 3GBAA 4DLDA 2QS1A 3SDFA 2VD2A 2A5TB 3IB1A 2XXYA 4ELRA 1Q35A 3FATA 4LQ5A 3EQ1A 5AA3A 3HCQA 3C34A 1AOVA 4P0IA 1SW4A 3O28A 4NF4B 3E13X 3ONMA 1S50A 3B6QA 1MXYA 2UVIA 3GBBA 3IO6A 1PB9A 4DDDA 3T96B 1AL3A 1IEJA 3FZVA 1BIYA 3DLNA 2QMWA 3TQLA 1IUDA 3Q27A 3VE1B 1NKXA 4N13A 1QUKA 3TYHA 1JVYA 3FUZA 4U1ZA 2THIA 3MPLA 1I6QA 4AB5A 3HHGA 4WXJA 3O6GA 3CR9A 2F35A 2FA7A 4RNSA 3IL1B 5I84A 3O2AA 1JETA 1OQGA 4YU0A 5DEXB 2G29A 1A40A 1B32A 3DP8A 2HZKA 3TKDA 4MH5A 5FHMA 2ZYMA 5JTYB 3R6UA 4EQ7A 3VXCA 2FNCA 5I57B 3CFXA 4M4GA 3V89B 2GRVA 1P1OA 3PD9A 4PFUA 3M8UA 2F6GA 2XD3A 3ZS6A 3G3KA 4F3SA 4OZ9A 1PC3A 3W9WA 2NOOA 4JSDA 3C4MA 1US5A 4O3AA 2M8CA 3S9MC 1LAHE 1LAFE 3BKIB 3CG3A 2UYFA 2BJJX 5H8QB 4R6HA 1MY2A 2HAVA 1B05A 4EXLA 3VXBA 3JYRA 5CM6A 4H6DA 1A7LA 3IOWA 3Q25A 2DE4A 3T9VA 1O64A 3S4UA 3TCHA 1Y1ZA 4R6KA 2H25A 3FJGA 5K2YA 4N6PA 1A54A 5TPAA 3PUYE 1JW5A 3T93B 4ZDMA 1QULA 1IQ7A 3H6WA 4KR5A 2E1SA 1FCKA 2OLBA 4G4PA 2DVCA 3CIJA 3C33A 4R75A 3A09A 2I4BA 1OQHA 3IR1A 3PUXE 4JXIA 4C1TA 1A99A 3TTRA 2REJA 1T0KA 1P1UA 4G68C 5KCJB 1QKAA 4LUBA 3RN8A 3K6UA 4XKPA 3V8XB 1HSEA 1P1QA 2V3TA 3G3IA 1MDP1 3K1NA 5HBCA 1B3LA 3UN6A 2B3FA 4OTEA 4G2ZA 5ISUA 1VSOA 4F18A 1XS5A 3K02A 3RQTA 2RINA 4BDMA 3MVXA 1LBCA 2PYYA 4YKJA 4QSDA 2DWJA 1N3XA 5I2NA 1LFGA 4X1BA 3QSLA 4YKIA 4NF6A 3G7WA 5JK4A 2H98A 3JV9A 4POWA 4YB7A 3UIFA 5TP9B 1MQJA 4EQBA 2H9BA 1LFIA 3H6TA 2XXRA 1XHYA 1A8FA 4POXA 4H0WA 4KCDA 4MBPA 4H8JA 4OERA 3M3KA 3TQWA 4ISUA 3H4ZA 1SI0A 1JEUA 5L9MA 1UIVA 3PPNA 4O3CA 3K1PA 3FVKA 3S9EA 2PBWA 1O7TA 4ESXA 4NEDA 3RT8A 3FGSA 5I58B 3PV0E 4F2QA 3VVEA 5CMMA 3TUSA 2DXRA 1MY0A 5KDTA 3KOSA 4NF5B 2P1SA 3CSBA 2F7AA 3IOTA 4YMAA 2AL4A 1MPCA 3O66A 3VFJA 2D5WA 2DS9A 2HAUA 3BFTA 3MZ1A 5ITPA 3BFUA 3H06B 4ELOA 3MVZA 3TELA 4R73A 2XXTA 5FTIA 3T66A 2PMSA 2F6PA 1USYE 1FW0A 2XX8A 2Y7WA 2Z8DA 3TCGA 4G8MA 4OFLA 4LATA 4F3BA 3M3FA 4GFRA 1MY1A 3KN7A 3U92A 2Y7IA 3ZKLA 4GOTA 1XVYA 1EZ9A 3I3VA 1MXUA 4BDOA 2DQVA 5AA4B 3UORA 2OWSA 4TLLB 3EHTA 2V84A 4FAJA 4F19A 4P11A 1LB8A 2X7PA 3GXAA 3PPRA 4ONYA 3MP8A 2R9JA 4GIZA 3V83A 3G3GA 4QRZA 3FASA 5M2VA 4N07A 4F31B 2XXIA 2OCUA 1URDA 1AIVA 4IO6A 1RYOA 2Z22A 1YCJA 4F3PA 5H8NB 3IX1A 1MRPA 2Q8JA 2O1MA 5AE4A 1B3GA 2PT2A 1M5DA 4JSOA 2I6EA 1MY4A 2GFEA 4P0GA 4DE8A 4DXUA 5AA2B 2ABHA 1LSTA 2QMXA 2F8DA 1IXCA 2F97A 3DP6A 3EF7A 3R7XA 4DIGA 4GL8A 4ECFA 4DZ1A 4ZZAA 2UVJA 3KOTA 4FIMA 2Y84A 1IXGA 1I69A 3UK4A 4FJPA 4F22A 2I58A 3OXNA 4ESWA 4NE4A 4OEVA 4OMBA 1QKBA 3FXUA 3LUYA 3H3GA 4ZEIA 5CC2A 4XKNA 3OSRA 2HEUA 1XOCA 2V3UA 4BDNA 4NF8A 2G93A 5I56A 1DPPA 4R2FA 4BDQA 1LAGE 4PP0A 4ZZEA 2HFBA 2XD2A 4MLQA 2E0SA 3U94A 4XXUA 2Y7KA 1B46A 4GF8A 1B3FA 4KCCA 3QUFA 4G68B 4RYAA 1FTMA 4XKRA 1H45A 1GTKA 1N04A 3OMBA 1B1HA 4PFTA 4Q30B 1BTJA 1LAXA 1FQEA 3FIRA 3S2VA 4R6YA 2Q89A 4X48A 2ZYKA 5H8HB 3K00A 5KCJA 1LCFA 2O7UA 4U4XA 4U22A 3FV2A 4C0RA 3TPAA 4GWOA 4BDRA 1ZKBA 3EPEA 3EHUA 2PX1A 1JNFA 4M1VA 1S7YA 1ZJLA 4HCWA 4NMYA 3N6UA 2XXQA 1NFTA 3D4CA 5FHOA 5DVJA 2DVZA 3SKPA 1JEVA 3U93A 1SI1A 2O6AA 3T22A 4AB6A 4OVJA 1H76A 1MXVA 2P2AA 1B5JA 1B5HA 1UTBB 1JW4A 4EQ9A 4IGRA 4R72A 4MLVA 4U2RA 4I1DA 3VLWA 3HPIA 3FVOA 4GD5A 4QSCA 4WEDA 4IO2A 2HZLA 1YAEA 2PT1A 4F2OA 1UTHA 2ONRA 4WEPA 4EUOA 2ZNTA 3B7DA 5H8FB 3RY3A 1FQAA 3OO8A 1YTVA 3A3UA 3SEXA 1MY3A 3HHFA 4MF3A 1XT8A 3EHSA 3FD3A 3OENA 3PU5A 1I6AA 1TT1A 5CBRA 1EU8A 4QFLA 2X26A 3LSFB 3PUWE 1B2HA 1TFDA 5DVIA 2ZNSA 3B6TA 1NH8A 2Q2AA 4IB2A 4G8NA 2VP1A 3C32A 2XXHA 5ELVA 5I2KB 2VGQA 3BBRA 1Y3NA 3MPKA 4Q0CA 1B7UA 1N84A 3IORA 2NUVA 4RK2A 5L8DA 3C31A 3PD8A 1B7ZA 3TAJA 2KLFA 1F9BA 2Z8FA 2WKYA 1B1XA 1N7XA 1R9QA 4OXVA 1VFEA 5EHMA 4QF9A 3Q29A 4ELPA 1NNTA 4I62A 3RPWA 3PMWA 3Q26A 4Z7EA 1OIBA 2V3QA 5F7VA 1D3KA 4PFYA 4HW8A 3HO7A 1M5EA 2YJPA 4I8CA 2O51A 4YB5A 1B4HA 4GLIA 4OHNA 2V93A 3M3LA 2F7BA 4RXLA 2XXWA 1MPBA 2FYIA 2NXOA 1B5IA 2ONKE 1B0HA 1AH5A 5A5XA 4QFPA 1NNKA 3L6HA 2IA4A 3CFZA 2D21A 3CRBA 1MXXA 4C1UA 1PBPA 5IKBA 2OWTA 4R74A 2XX9A 1B9JA 2DWAA 4FECA 1QVSA 4GRKA 3SEWA 1P1NA 1Y4TA 3MP6A 4ELQA 3FJMA 4FEBA 4RA1A 4F39A 3FJ7A 3LSXA 1R1NA 3T9XB 2I0BA 1DTGA 3THIA 2R71A 3K6XA 4Q5TA 3SEUA 1N7WA 3N26A 3QUJA 4RPNA 4GQOA 4HS7A 4R9FA 4EXKA 2GH9A 4U1OA 1VR5A 4PETA 4AQ4A 3USDA 3U1OA 4ZECA 3VV5A 2CZLA 1D9VA 5B70A 2OK2A 2XX7A 1UIUA 1A55A 2YPNA 1IXHA 3AXFA 4E0XA 4JB7A 4F29A 4Q8RA 5EYFA 5BUUA 4ZEDA 2ESNA 3S9NC 1O63A 2D3IA 5DVFA 5HM4B 1NH7A 4ZE8A 4HCYA 3TTLA 3G3HA 4L17A 4EF1A 5L9SA 1CB6A 5HPQA 1MQGA 1Y1MA 4UACA 3KEIA 2B65A 3GLBA 2A5TA 4JWOA 4DXCA 4OESA 4LA9A 2F7CA 2VHAA 1RKMA 1MXZA 1PB8A 2LAOA 1GR2A 4NF4A 2XXVA 4XIGQ 1RYXA 3CVGA 1LFHA 2O7IA 5L9OA 5ITOA 1DOTA 5F1QA 1JW1A 3RT6B 4GXSB 1A8EA 1OVBA 4WKMA 1JVXA 2VD3A 2QSXA 3MVYA 3FVGA 1MQDA 4DCXA 4BLAA 3T9UA 4U23A 3JZJA 2CMOA 2XXUA 2ALUA 1TWYA 4R9GA 3QIMA 3QK6A 1H44A 3SETA 2ZMBA 1M5BA 4ND9A 1Y4CA 1FTLA 1NMUA 3KGCA 4OFOA 4YAHX 3WAEA 4YZZA 1VFDA 1IITA 5AA1A 5TPAB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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