2QS1A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer in complex with ubp315 at 1.80 angstroms resolution
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Binding site and ligand flexibility revealed by high resolution crystal structures of GluK1 competitive antagonists.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
total genus 78
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs1A02
3H6WA 4LVQA 1MQDA 1XC1A 3MUQA 5AA2A 1SW1A 3SEXA 2XXYA 2W7YA 3CSGA 3RTFB 5I56B 1XS5A 2AIXA 2G93A 1FQAA 1AH5A 1URSA 1PC3A 1B52A 2XXTA 3IK6B 2V3QA 3PUWE 1UTBB 4HTGA 4JWOA 3USDA 5CM6A 5KCJB 1OQHA 3N26A 3LSXA 5AA2B 4AQ4A 3FVKA 3RN8A 1Y3QA 1D9VA 3BBRA 1TFAA 4R6KA 1P1UA 5JK4A 4DCXA 3FXQA 1B5JA 3HV1A 4H5GA 3VV5A 2OJTA 1SBPA 5H8QA 1LAHE 1PBPA 1D3KA 3L6GA 5CRYA 1UQWA 4YKIA 3U93A 2CZLA 4F39A 3MQ9A 1B46A 2Z8FA 3OEKA 4PFYA 4R9FA 3H6VA 3CG1A 3IR1A 3FVNA 4HCWA 4RY1A 4F22A 3ONMA 4WKMA 1A7LA 4G4PA 3LSFB 4LQ2A 2I0BA 1ZIUA 1B7HA 2VP1A 4G8NA 4RXLA 3MZBA 1Q35A 3M3KA 4ELQA 4LATA 5CMKA 2P0SA 1MXZA 2HAVA 1D9YA 4LZ8A 3TDJA 3O29A 5DYHA 1HSJA 1Q1KA 4NE4A 4U22A 1O64A 3O2AA 4THIA 3UIFA 3HCQA 2UVIA 4O3CA 1XT8A 4WEDA 4BLAA 1IXCA 1N7WA 1PB9A 1P99A 2OLBA 2Y7WA 3K6WA 3OSRA 4QRZA 4P0GA 2PMSA 4TLLB 3L6HA 2OZZA 3IX1A 3KN3A 4F3GA 3P7IA 4DE8A 5I59B 1TFDA 3PUXE 2O69A 3IB1A 1B2HA 1Z7ME 2XX8A 3MAMA 3W9VA 1FCKA 1J1NA 1NH7A 4IO4A 5L8DA 1LBBA 4F2OA 3MP6A 5ELVA 1JW1A 4YU0A 1M5DA 3VXBA 4XKQA 4NF4A 1B5IA 1QULA 4HS7A 1QVSA 1BTJA 2A5TB 3O6HA 5CBRA 1FQFA 3K02A 3CSBA 3PPOA 4Q5TA 5TPAA 2RF1A 2DXRA 4XIGQ 3GXAA 3K6XA 1MQGA 2Y7KA 3D4CA 1F9BA 2NXOA 4Z0IA 5JEIA 2DYXA 2I3WA 2VD2A 3QAXA 4N07A 2FYIA 4YB7A 3UGWA 4JWYA 2DWIA 3OD7A 2HZKA 3LSWA 4Q0CA 3TCHA 1I6AA 2QS2A 5FHNA 4NF8A 5AA2D 2OWTA 3N6UA 5IKBA 4FEDA 2I3VA 1PB8A 1I69A 3SEYA 4QHQA 1SW5A 2ZYKA 2VD3A 1XOCA 5CBSA 3MVXA 5TPAB 1URDA 3IO6A 4AB6A 3QUFA 5KZTA 3VXCA 2F7AA 1UIVA 3DELB 4OFOA 3PD9A 1IITA 2F97A 4H1XA 2Q2AA 3FIRA 3K2DA 1FQBA 1MM7A 3VVDA 4GRKA 4PETA 1MY4A 5TP9A 4PE5B 1B6HA 2HZLA 3ECRA 3IJXB 4R2FA 1H76A 3B7DA 3H6UA 1PB7A 1OVTA 3H06B 2DP8A 3IOTA 1MY0A 3C35A 3IORA 3S9MC 3O28A 4JB7A 1OLCA 1DMBA 2XD3A 1EZ9A 4K3FA 5ISUA 1US4A 5L9MA 1H44A 3H7MA 2ZMBA 1Z7NE 1B3EA 1B0HA 1QUJA 3GZGA 5CMMA 1A55A 1P1QA 1R1NA 3G3IA 2LAOA 4F3BA 1I6QA 3MZ9A 2DSFA 3DM0A 3RGYA 2ONRA 4C1UA 3WAEA 3RY3A 2PVUA 5H8NA 2DOJA 3UA8A 2ALUA 2O7IA 2UXAA 1BIYA 3E9XA 2R9JA 2OBGA 3B6WA 3KSJA 5CMCA 5EHMA 2QL3A 4KCDA 4ZE9A 3K01A 1SYIA 3MP1A 3TMGA 4AB5A 1P1OA 4H8JA 5K2XA 5I57A 3IB0A 2ANJA 1QW0A 2UYFA 3KBRA 4GQOA 2ZYNA 4GXSB 1Y4TA 2B3FA 4LA9A 3RT8A 3FGSA 4IB2A 1HSLA 5I2NA 1ZMGA 4FEBA 2THIA 3FATA 1TWYA 4TLMB 2O68A 4QF9A 1OQGA 4QSCA 3O66A 3MJNA 5I59A 3OO6A 3G3HA 5I57B 5DEXB 5KCJA 5I2KA 2F8DA 4YMAA 3C34A 4F3PA 1B32A 4KI0E 1S7YA 2F5XA 2ZNUA 3GBBA 2Z8EA 3TCGA 3U92A 2FNCA 3UK4A 4EF1A 2B65A 3FJ7A 4ISUA 3KOSA 2QS3A 3IO4A 3QUJA 3DP6A 3A3CA 3C36A 3GLBA 5IAIA 1ZLQA 4G8HA 3BFUA 2NWJA 3U94A 2XXRA 4DCYA 1ZTYA 2R71A 3ILUB 1RYOA 3T9XB 3BFTA 2F7CA 4EXKA 1WVJA 5CI5A 1MXXA 3FXRA 4KD5A 1VFEA 1ZBMA 1USYH 4OEVA 3RNNA 4BDMA 3DLNA 4U4SA 2F7BA 1JW4A 3G3KA 3E3KA 2OCUA 3PU5A 5ITPA 1LAFE 4N6PA 3UN6A 1Y1MA 4ECFA 5HM4B 3EPEA 5FTHA 3K00A 3PPPA 1I6BA 2ZYMA 3H6TA 4RPOA 3VVFA 4F1YA 1P1WA 1FQEA 4OZ9A 2QMXA 2F6GA 3EHTA 4XTCQ 4R74A 2B3BA 1NMUA 4RA1A 3ILTB 1B9JA 4G2ZA 2XX7A 4H5FA 4ZEFA 2VOZA 5DVJA 1LFGA 4G8MA 1MY3A 4GLIA 5H8HB 3S9EA 2ZYOA 2PBWA 3Q26A 4LQ5A 2D5WA 4JBZA 1NNKA 1LLSA 4QFPA 5H8FA 3DP4A 3W9WA 4NF5B 5F1QA 4DIGA 4H67A 5AA3A 1AOVA 3TTMA 1Y1ZA 1NKXA 3CFXA 3K1PA 4OETA 1R9QA 2Q89A 3CIJA 1N7XA 4LUBA 4X48A 4E0XA 3EN3A 1NL5A 1PBQA 3FVOA 3PGFA 4WXJA 3JV9A 1T0KA 3ODBA 4BDNA 3M3LA 5I84A 4RYAA 3HHFA 5H8FB 4UACA 2D21A 1B7UA 1FTOA 3AXFA 3H03A 3RPWA 3SEWA 2I58A 1ATGA 3TAJA 3TCFA 2HFBA 4YAHX 1Y20A 1FTJA 1B4HA 4F2QA 3C31A 4NWDA 3FVGA 2HQ0A 2I49A 5CMBA 2BJJX 2QJEA 3M3FA 2V25A 3LBSA 3TTLA 4DDDA 3EHSA 3KG2A 2RKMA 1B0LA 3SESA 3ZS6A 4FIMA 1XVXA 1AMFA 1SDXA 1TT1A 2Y7PA 3FZVA 1JETA 4R73A 1SW2A 4RK9A 2V3UA 5FTIA 3G3JA 1SYHA 2V3TA 3KFMA 4H0WA 1O63A 2I4CA 2Q2CA 1H3DA 4NF6A 1NFTA 1VSOA 1UIUA 1M5FA 3GBAA 4EQ9A 4RNSA 1R6ZA 1RKMA 5B7DA 1M5CA 2ZNTA 4JWXA 2NVUB 1B3GA 4R2BA 3U1OA 4EQ7A 2ONKE 4GD5A 4I8CA 3UORA 1MRPA 1YTVA 2XXXA 3VDFA 4OWDA 3HSTA 3OSQA 3TTNA 3MBPA 2REGA 3FV2A 1II5A 1WDNA 4OHNA 4G68A 1OLAA 4DXCA 4POWA 3EQ1A 4NTLA 1JEVA 1N04A 4OYVA 3OENA 4X1BA 1USYE 3C32A 4YB6A 2HEUA 3QIMA 4QFOA 5KDTB 1Y4CA 3PMWA 4PFTA 5CC2A 2Y7IA 4R6HA 5A5XB 5FHOA 4LP2B 4OMBA 4TQUQ 4GVOA 4IY5A 1MXVA 2O1LA 3N5LA 1IXIA 2H25A 2P2AA 1B58A 3MVWA 4ND9A 4TOZA 1BP5A 1SW4A 3KJ7A 3K0VA 2RINA 2Q9TA 5DEXA 1PDAA 1N84A 3IAZA 3QXMA 3PV0E 3RQTA 3TKDA 3TQLA 4U23A 4BDQA 3V83A 3VE1B 4R72A 4YZZA 1JQFA 3U8QA 4MF3A 2XX9A 1R9LA 3G3GA 3MVZA 2O1MA 2YPNA 2Z8DA 4ESXA 3E13X 1ELJA 3ZSFA 4EQBA 5AA4B 1LB9A 2RCAA 4JXIA 3O6IA 1N3XA 2F35A 5AE4A 3HO7A 3T9VA 3Q27A 3TODA 3ZKLA 5ICTA 3PMXA 1M5EA 4JSOA 1B40A 1QKAA 1SVXB 2UVHA 4BDOA 3FV1A 3LC8A 2REJA 1CE2A 1GGGA 3OMBA 5B70A 3M8UA 2DE4A 4NF6B 3RT6B 3FJGA 1GTKA 3KSXA 3LSLA 3THIA 4ELPA 2O84X 1MDP1 2R6GE 3IOVA 3IB2A 5H8NB 5FHMA 2VHAA 2YLNA 1IIWA 1EU8A 2IA4A 2AYSA 1A99A 2XHDA 2DS9A 3V8XB 4FATA 1LFHA 1MS7A 1PEBA 4IO2A 2ZNSA 1MXWA 1FTLA 2F36A 2IEEA 3PPNA 3PUZE 1Y3NA 3EHUA 3W15C 1DTZA 2XXWA 3HPIA 3Q28A 1MY1A 4ONYA 3TTRA 3TTKA 4R75A 4OVJA 1SI1A 4I9DA 2X7QA 1DOTA 2RCBA 3KOTA 3DP8A 2KLFA 3QK6A 4ZEBA 2DE3A 1ZJLA 1LCTA 3KEIA 1B1HA 4U21A 1B7ZA 2Q88A 3K1NA 5ITOA 4U1ZA 1FTMA 1P1NA 3SEUA 3T9UA 2H5YA 2A5SA 1BLFA 1NNTA 1NNFA 2XD2A 3PUYE 3QSLA 2M8CA 4H8IA 4OERA 4ZZAA 3R7XA 1TXFA 2V84A 3H4ZA 1UTHB 2XXIA 3EF7A 4M4GA 3KGCA 4P11A 4XXUA 2ZXTA 4KYSA 5H8SA 4ZDMA 1DPEA 3SERA 3K4UA 3R26A 4H65A 4NF5A 3T22A 3TYHA 1ZU0A 3U72A 2PX1A 1MXYA 4ZECA 1N76A 1A8FA 4KHZE 4F3SA 2X26A 4NMYA 2PYYA 2F6PA 4U2RA 2XXHA 4I62A 2Y7RA 3KN7A 4O3BA 3TPAA 3BKIB 3MWBA 3R6UA 4C1TA 4ESWA 3A09A 4NWCA 4QSEA 2AL4A 3V5AA 5DVFA 1MM6A 3K1MA 3PUVE 2QMWA 4KR5A 3SKPA 4DXUA 4KYEA 1UTHA 2O7UA 4G77A 4PFWA 2ONSA 4LONB 2DVZA 2DWJA 2DXYA 1VFDA 2UVJA 2UVGA 3SEVA 5L9OA 4NF4B 4LZ7A 4UA8A 4OENA 4DLDA 4L17A 3MVYA 2ABHA 3S9NC 1B3LA 4GIZA 3O6GA 4F31B 5BWJA 4M1VA 5K2YA 3RUMA 1MDQA 1LAGE 4C0RA 5I58A 3FD3A 2FA7A 5JTYB 1Y3PA 4O3AA 4YKPA 2ESNA 1HSEA 2GH9A 3OELA 1GVCA 1N3WA 3RLFE 1QUKA 4HCYA 1VE4A 3VLVA 4IO3A 3E4RA 3T93B 4GXAA 4F1UA 4R9GA 1JVXA 2P1SA 3C4MA 3HN0A 4LZ5A 4MLQA 2QS1A 1JEUA 3IL1B 2AL5A 3OOAA 4QFLA 4X1DA 4XKPA 1POTA 1AIVA 3TEPA 4BDLA 4KCCA 3TUSA 1Y9UA 3IOUA 5AA1A 1EZPA 4MH5A 1YPNA 2GRVA 1LGBC 2HCAA 2UYEA 4OFJA 3FJMA 4Z7EA 5TU0A 2E1SA 4BDRA 2F78A 4RJZA 3VFJA 3FXUA 5I2KB 1DSNA 1POY1 4GWOA 1GV8A 2PT2A 1CB6A 3O97A 3VVEA 4GOTA 3A3UA 4E0WA 3C9HA 1MG1A 4GL0A 3B6QA 3OXNA 5AA4A 2Z23A 5LOMA 1BKAA 1LAXA 1B5HA 1L5TA 1MQJA 1OVBA 5DT6A 4G68C 1EH3A 4RPNA 3MW0A 2O6AA 3K6VA 4FJPA 3FASA 3VLUA 5I2NB 2RC9A 1LFIA 1A40A 4X9TA 4P0IA 3SETA 4EUOA 4DXBA 4WEPA 2DWHA 3WAFA 1DPPA 4IY6A 3SDFA 3PPRA 4F29A 2GFEA 1MH4A 1UTBA 3V89B 2I0CA 2RC8A 4FAJA 3JYRA 5I56A 4RK2A 4HW8A 1IZ1A 1URGA 1IEJA 1XVYA 2XXQA 4EDPA 1DTGA 4FECA 5A5XA 3I3VA 3CRBA 1SD3A 4R6YA 2O51A 4MLVA 4OESA 3TZAA 1LBCA 1XHYA 5KDTA 1B3FA 1B4ZA 1NH8A 2QSXA 5M2VA 1B51A 2HAUA 4MFIA 4U1OA 4YICA 2RC7A 2VGQA 1YCJA 4G68B 1OMPA 3B6TA 2D3IA 3CR9A 4IO6A 4OQOA 5EYFA 3I5OA 3K6UA 1IUDA 3IOWA 3MZ1A 4KYDA 4OTEA 1MPBA 3CG3A 1QKBA 4YB5A 3TQWA 5JTYA 1H43A 2Y84A 3OO7A 2H4IA 2H98A 2HXWA 3LUYA 4GL8A 5I58B 4ZS9A 4ZZEA 1A54A 3TELA 1O7TA 4YKKA 3PMVA 2XXUA 5TP9B 1B3HA 3CFZA 4ZEKA 3Q25A 1MQHA 1S9TA 3MPKA 4PFUA 1SI0A 3PD8A 3JZJA 3T96B 4KPTA 5J1DA 3CVGA 3S4UA 4H6DA 4DZ1A 4IO5A 1KWHA 3VLWA 4Q30B 5EHSA 3KZGA 1LB8A 2I6EA 3MPLA 1IQ7A 1JNFA 2GHAA 4ELRA 1FW0A 4NF8B 4ZE8A 1JVYA 1FQDA 2GHBA 4GF8A 4QFKA 3OEMA 3MC2A 4JDFA 4PQJA 5DTBA 4PP0A 1JW5A 2X7PA 3CI8A 1N0TA 2G29A 2CMOA 3G7WA 2QS4A 3O9PA 4MBPA 1MXUA 3I6VA 4YKJA 2WKYA 2XXVA 5HPQA 3KN8A 1MPCA 3S2VA 1H45A 2DWAA 3Q29A 5BUUA 2XXPA 3HHGA 1LCFA 4N13A 2OK2A 2OWSA 4NEDA 2A5TA 4OFLA 1FQCA 4I1DA 1YAEA 3C33A 2DQVA 2NOOA 4ELOA 4F1VA 4GFRA 3F11A 1FTKA 5DVIA 1EZOA 4POXA 1QJMA 1M5BA 1OIBA 1QUIA 2I48A 2NUVA 1ANFA 4IGTA 4OXVA 3G3FA 5H8HA 4U4XA 3MP8A 1WODA 3CFLA 2PT1A 4OEUA 2QPQA 3TFLA 2I4BA 4YMBA 3T66A 2Z22A 4ZEIA 1A8EA 1IXHA 2YJPA 1US5A 3UP9A 1MPDA 5L9SA 1B05A 5HBCA 1RYXA 1MQIA 2Q8JA 3KJTA 4IGRA 3N6TA 4Q8RA 1IXGA 1MH3A 3QYTA 3S9LC 2DVCA 1LSTA 1AL3A 4EF2A 2H9BA 4IO7A 3LR1A 3OO8A 1NNPA 1GR2A 4JSDA 4QFNA 4XKNA 5F7VA 4ZEDA 1D4NA 2H99A 3D4GA 3IJOB 4XKRA 1ZKBA 4KFQA 2E0SA 3PPQA 3ZKKA 3FUZA 4F18A 5ICQA 1S50A 2DE2A 4KQPA 4EXLA 4FORA 3RTWB 2V93A 4FE8A 1B1XA 4F19A 2F34A 1VR5A 3N94A 4QSDA 5H8QB 1SQYA 2QRYA 1MY2A 3T9HB 3OO9A 3H3GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XC1A 3MYUA 5AA2A 2W7YA 3RTFB 2G93A 4HTGA 3IK6B 4JWOA 3N26A 3LSXA 5AA2B 4AQ4A 3RN8A 1TFAA 5JK4A 3HV1A 1LEVA 1PBPA 3L6GA 4YKIA 1LBXA 1B46A 4IR8A 3KBZA 4LQ2A 3MZBA 4MMPA 1D9YA 1HSJA 4NE4A 4PFBA 3O2AA 3HCQA 4O3CA 4BLAA 2OLBA 4QRZA 3OSRA 2PMSA 4TLLB 4F3GA 2VPOA 1IMEA 3IB1A 4F2OA 4YU0A 1QVSA 5CBRA 1FQFA 3K02A 5TPAA 2RF1A 4XIGQ 3K6XA 1LBZA 1F9BA 3QAXA 4ELRA 3UGWA 3OD7A 4MJOA 1I6AA 5FHNA 1NV4A 2V4CA 4G61A 4JVIA 1XOCA 1NUXA 1UIVA 4H1XA 4MAGA 1MM7A 4PETA 4PE5B 3B7DA 3H6UA 2DP8A 3IORA 1OLCA 1DMBA 2ZMBA 1QUJA 1P1QA 1R1NA 3G3IA 4PC9A 1I6QA 2VT5A 4QBAA 3RY3A 3UA8A 2ALUA 3KSJA 3E9XA 2OBGA 4ZE9A 1SYIA 1P1OA 4H8JA 1QGXA 5K2XA 2ANJA 1QW0A 2UYFA 3USDA 4LA9A 4IB2A 1HSLA 4FEBA 4TLMB 3FATA 1TWYA 4HXVA 5EYGA 2O68A 3G3HA 5KCJA 1FPIA 4O8MA 2F5XA 4EF1A 2R8TA 3KOSA 5I5PA 3DP6A 3GLBA 1ZLQA 3BFUA 3PTYA 4EXKA 5CI5A 1MXXA 4OEVA 1VFEA 1JW4A 5ITPA 1LAFE 5HM4B 3VVFA 1FQEA 4P1LA 1FPEA 3EHTA 4XTCQ 3RPLB 2B3BA 4H5FA 4ZEFA 2VOZA 1MY3A 4MNPA 1AWBA 2D5WA 4GBWA 4QFPA 4NF5B 1AOVA 3CFXA 3K1PA 1R9QA 1N7XA 4E0XA 3LV0A 1NV6A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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