2QS1A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer in complex with ubp315 at 1.80 angstroms resolution
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
publication title Binding site and ligand flexibility revealed by high resolution crystal structures of GluK1 competitive antagonists.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 78
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs1A02
4JWXA 3U8QA 5I56A 3KOTA 3M3LA 1IXIA 3GZGA 1B7ZA 1MXXA 3B7DA 2FYIA 1P99A 2P0SA 4ZZAA 4MF3A 4RPOA 4G2ZA 3V83A 2OK2A 1LAFE 2F7CA 1PB8A 2Q88A 2ZNTA 3N5LA 1MQHA 2B3FA 1DPPA 4U21A 1T0KA 4EXLA 1LSTA 1R9QA 4BDMA 4EF2A 3MQ9A 2YJPA 1B1XA 4C1TA 5TPAB 4RYAA 4EDPA 3HV1A 3A3UA 1AL3A 1B6HA 1USYH 3MPLA 2QSXA 4ND9A 4R75A 5ISUA 4JDFA 4OQOA 3RTFB 3CIJA 3PUWE 5JTYA 4R2BA 3TCHA 1LGBC 4PFUA 4ZE8A 5I2NA 2V25A 1Q35A 3RPWA 3TELA 4K3FA 3VVDA 3K6VA 4GOTA 1B3EA 2F7AA 3JYRA 3GBAA 1B0HA 3H7MA 1B7UA 3C34A 2B3BA 3IL1B 3H4ZA 1YAEA 3CG1A 3BBRA 4H67A 1SQYA 1O64A 4G77A 1B3GA 3CFLA 3RLFE 3JV9A 1MY4A 3R6UA 1N3XA 1EZOA 2I58A 3PMXA 4F18A 1BLFA 1MXYA 1FQBA 3QYTA 3K6UA 4EXKA 1Y4TA 2DE3A 1NH7A 3DP4A 1USYE 3PD9A 3HO7A 1A40A 2Y7RA 2YLNA 1AH5A 1R6ZA 4FEDA 3ECRA 1PB9A 2PT1A 5I57B 4F3SA 2KLFA 2XD2A 1SW2A 3S9MC 3T96B 3FIRA 3K1PA 5F7VA 1LCTA 3BFTA 3N94A 4N6PA 3CSGA 4X1BA 3KFMA 3R26A 4PFTA 4EUOA 1UQWA 1WODA 1P1OA 1GR2A 1MM7A 4RA1A 4YKJA 3V8XB 3T9UA 3FXUA 3CVGA 3VV5A 4F39A 3OO7A 3RT6B 3VFJA 3T22A 5AE4A 1H3DA 4G8HA 1B05A 3TDJA 2P1SA 1B4HA 1UIUA 3KN3A 4KHZE 3IB0A 3OD7A 2Y7KA 2Q2CA 1PB7A 1LAGE 3IORA 4RPNA 2V3QA 4EQBA 1B9JA 1IEJA 2V84A 3MP8A 4X48A 3TTKA 4JB7A 3ILTB 5CMCA 5AA3A 4OEVA 1LBBA 3CFZA 2XXTA 5CC2A 1B4ZA 1IXCA 2REGA 3TQWA 3VXBA 4OFLA 4BDRA 2P2AA 3QIMA 4KQPA 3U72A 4C1UA 2QL3A 1MQDA 4PFWA 1PC3A 4XKNA 3PGFA 1URSA 2NOOA 2Z23A 1H43A 1XC1A 1AIVA 4XKQA 3T9HB 3W15C 4F1UA 4RXLA 3N6UA 2I0CA 4F29A 3S2VA 1MDP1 3O2AA 1MQJA 3G3FA 2G93A 2O51A 4ONYA 5FTHA 1ELJA 3OELA 1MPBA 3PPOA 3RY3A 5I57A 1MY3A 1LFHA 1MY1A 3FZVA 3RT8A 1MG1A 4H8IA 4TQUQ 1IXGA 1N7WA 2R71A 1TT1A 3O6HA 3DP6A 3KG2A 3EHTA 3ZSFA 3OENA 3RQTA 5TP9A 3KZGA 4FIMA 1UIVA 1MQIA 3SKPA 3T9XB 3S9LC 1R9LA 2QJEA 1PEBA 4P0IA 5HBCA 2XXQA 1JETA 2AIXA 4H0WA 4ZEIA 4MLVA 2HXWA 3ILUB 1II5A 2ZXTA 3DELB 2PT2A 3MBPA 5I58A 3ZS6A 2Q8JA 3MP1A 1B3FA 4G8MA 3FGSA 5B7DA 1B3HA 3O28A 4DLDA 2GFEA 3PUVE 4U23A 3VLVA 1TFAA 1UTBB 3UK4A 2ZMBA 3IJOB 3T93B 2I6EA 4NWCA 1SDXA 3G3KA 1ZBMA 1DSNA 1YPNA 4FATA 3O6IA 4LZ5A 5CRYA 1LB8A 2RF1A 1SBPA 2A5TB 1ZIUA 3FVKA 3M3KA 1SD3A 3Q27A 3OEKA 3O97A 2V3UA 2OWTA 3G3IA 4N07A 3MZ1A 4F22A 1M5EA 2HCAA 1LBCA 5DT6A 2F34A 3TODA 4BDQA 4F3PA 1JEVA 3OO9A 1D3KA 1HSEA 3UORA 1MQGA 3E13X 3VLWA 3P7IA 1MRPA 1I6AA 3I6VA 1MH3A 3C32A 2XXPA 4Z7EA 5L9OA 3FJMA 1A8FA 3E3KA 3GBBA 2XD3A 2QRYA 3AXFA 1VFEA 4GRKA 4O3BA 3K2DA 1DMBA 2O7UA 3LSFB 1EH3A 2Q2AA 1L5TA 1TWYA 4ZEDA 1FW0A 1S9TA 4JBZA 3SEUA 3OXNA 1Z7ME 1D9VA 2ZNSA 1QULA 5K2YA 2V3TA 1OQGA 2W7YA 4GQOA 1O7TA 2GHBA 2I49A 2QMXA 4GF8A 1MY0A 2B65A 1Y4CA 3SEXA 1FQFA 3PUZE 2Y7PA 1XS5A 4AB5A 3OSRA 5EYFA 2DP8A 3PUYE 4MFIA 3KGCA 2I4CA 4YMAA 1QVSA 4G68B 1H45A 1MXWA 1VFDA 5K2XA 5TU0A 3TTNA 1JVYA 1OLCA 4UA8A 1NH8A 3C31A 1R1NA 3H6WA 1B32A 3SETA 2Z8EA 4X9TA 1QKAA 3Q29A 4BDNA 4XIGQ 3SEYA 1IQ7A 2ZYKA 5EHSA 1D9YA 5AA4A 3PU5A 4R2FA 1URDA 5CMBA 4IGRA 1B2HA 4WXJA 4QSCA 1I69A 3U92A 1UTBA 3RTWB 2Y7WA 3CFXA 1XVXA 3VXCA 1NFTA 3T66A 4GL8A 3TKDA 1NNKA 2UVGA 4DZ1A 4TLLB 2A5TA 4Q0CA 5I2KA 5KZTA 5I59B 4DIGA 1EU8A 1UTHA 2XX9A 3FATA 3Q28A 3M3FA 4OTEA 4H6DA 2DQVA 4NF6B 1A54A 1M5DA 3PUXE 5B70A 1ZU0A 3MVYA 1YCJA 1FQCA 1JVXA 2RINA 4RNSA 1O63A 1SI1A 4HCYA 3O9PA 4NMYA 5FTIA 2XXXA 4ZEKA 1FTLA 2O1LA 2HQ0A 1JW1A 3IB1A 2FNCA 3C36A 4LA9A 1MXUA 3R7XA 1OIBA 1FQEA 4DE8A 3HCQA 1BIYA 3S9NC 3E4RA 4FEBA 1ZJLA 5H8FB 4KI0E 2F8DA 3C9HA 2A5SA 4U22A 3OSQA 4NF5A 4F2QA 4R73A 2I48A 4NF8A 4IO5A 3MZBA 1QKBA 5BUUA 2ONRA 1B3LA 1QUKA 1N0TA 4MH5A 2DS9A 4LUBA 1B1HA 5AA2D 4U2RA 4RJZA 4G68A 2FA7A 4KD5A 1J1NA 2HAUA 2QS1A 5M2VA 4AQ4A 1NMUA 4KYDA 4YAHX 3H3GA 3K1NA 3OOAA 3U1OA 4P11A 2DWJA 4Q8RA 3IJXB 3SDFA 3I5OA 1MDQA 4NTLA 3IOUA 4HTGA 1N3WA 3UIFA 2NVUB 1B40A 2H98A 5EHMA 3EHSA 1GGGA 4LP2B 1S50A 5HM4B 4NWDA 3WAFA 3S4UA 2I3WA 3K6XA 4DDDA 2XXHA 1ZKBA 5LOMA 1BKAA 3UP9A 4KFQA 4ZZEA 2QPQA 1LLSA 3TTRA 3LC8A 1URGA 4IO7A 3SEVA 4YB7A 4YICA 4O3CA 1Y9UA 4ISUA 5DYHA 4BDOA 2QS2A 3V89B 1IIWA 4U4SA 1MPDA 2ZYOA 5TPAA 2R9JA 1YTVA 4H8JA 3A3CA 3FV1A 2I3VA 3DM0A 4DXUA 4NF6A 2Y7IA 2PMSA 3D4CA 1FTOA 3FVGA 4YKPA 5ICQA 4ZECA 4BDLA 4Z0IA 2IA4A 5H8QB 1ANFA 2D5WA 3IOTA 5CMKA 4O3AA 4PFYA 3H03A 1B7HA 5KDTB 3DLNA 4DXBA 4NF4B 2XXUA 1MXZA 1HSJA 4EQ9A 2ZNUA 1FQAA 1DPEA 3H06B 5A5XB 1Y1MA 3KN8A 4GLIA 4JWOA 3KJ7A 4RK9A 2HEUA 5H8HB 2IEEA 1DTGA 2O69A 1SYIA 1NNTA 3VE1B 4OZ9A 3PPPA 1Z7NE 1TFDA 4F1YA 1TXFA 2DVCA 2H9BA 1IITA 1XT8A 1SVXB 4GXSB 1N04A 4ZEFA 1WVJA 5ITOA 1GV8A 4QSDA 1LAXA 3KEIA 3OMBA 3LSWA 3F11A 4KCCA 1RKMA 3CG3A 3N26A 2UXAA 3G3JA 3QUFA 2RC9A 4I62A 4LATA 1RYXA 3KJTA 1BP5A 3G3GA 3IR1A 2PBWA 4WEPA 3EF7A 4F2OA 3MW0A 2PVUA 4QF9A 2VHAA 2GH9A 1XHYA 4F31B 2OZZA 4KYEA 5L9MA 3ZKKA 3O6GA 5H8NB 4ELPA 4FAJA 1POY1 3TTMA 3MPKA 1P1NA 3W9WA 4IB2A 2VOZA 2O84X 3PMWA 3K6WA 4IO6A 4HW8A 1JW4A 5AA2B 3VVFA 4QFNA 1MH4A 1P1UA 3IAZA 4RY1A 2F97A 3L6GA 4H5FA 5KCJB 5DVFA 3C33A 4AB6A 1M5FA 2UVIA 5H8QA 2WKYA 2THIA 5I56B 3H6UA 3U94A 3UA8A 3JZJA 3WAEA 1MS7A 3QAXA 3LUYA 3SERA 3RGYA 4OFOA 4ELQA 3FD3A 5A5XA 1QW0A 2O1MA 4XKRA 1Y1ZA 3PPNA 1CB6A 5H8HA 4P0GA 3TUSA 4GD5A 2HAVA 1DTZA 4OYVA 2RCAA 4YB5A 2UYFA 2XX8A 2HFBA 3HHFA 5ITPA 4KPTA 1B52A 1SI0A 4PE5B 4U1ZA 4DCYA 3FUZA 3IO6A 4L17A 4QFPA 3MP6A 4XXUA 4GVOA 4FJPA 1JEUA 1P1QA 3G7WA 3H6TA 1B5IA 1ATGA 2X26A 1KWHA 4M1VA 2DWAA 4I1DA 3TAJA 5JTYB 3IK6B 2ONSA 5CBRA 4IO2A 3TQLA 5I2NB 4OXVA 3FXQA 2OWSA 2XXWA 5I84A 5CI5A 3TYHA 3V5AA 1MY2A 4R6HA 1ZTYA 4MLQA 2DE4A 1WDNA 1IXHA 2XXYA 1A99A 4GWOA 3IOWA 5H8NA 3A09A 3C4MA 3G3HA 1SW5A 1SW1A 3QUJA 2UVJA 1JQFA 1B46A 2V93A 4Q5TA 3MVWA 2X7QA 5AA1A 2E0SA 4GL0A 1P1WA 3TCGA 5DVJA 4M4GA 1F9BA 4G4PA 4JWYA 3UN6A 4WEDA 3RUMA 5IAIA 3I3VA 1PBQA 4MBPA 2I0BA 3KSXA 3RN8A 4THIA 1S7YA 2ZYNA 3MC2A 2ESNA 3BKIB 2QS3A 5HPQA 1Y20A 2XXIA 3IB2A 2R6GE 2DXRA 3OEMA 4YU0A 3OO8A 2H5YA 4G68C 4QFOA 3K4UA 5BWJA 2QMWA 1Y3QA 2RC8A 4R74A 3LSLA 1MM6A 4ZEBA 1NKXA 2F35A 4IY6A 1SYHA 4YMBA 2AYSA 5JK4A 4XKPA 3BFUA 2CMOA 3K00A 1FTKA 1MPCA 5DVIA 4JSDA 2VD3A 5L9SA 4DXCA 5ELVA 1LFIA 1D4NA 4KCDA 2Z8FA 3LBSA 4KYSA 2CZLA 2RC7A 1B0LA 1AMFA 1VSOA 4F19A 2O68A 3QK6A 2AL4A 3TPAA 1GTKA 1POTA 2F6GA 1Q1KA 3MVXA 2DOJA 1Y3NA 2HZLA 4POWA 4POXA 4H1XA 4IY5A 3FASA 2HZKA 2Y84A 4OENA 3USDA 1B5JA 2H4IA 3ZKLA 3ONMA 1H76A 2NUVA 3FXRA 3OO6A 4YZZA 3EPEA 3IOVA 4LZ8A 3FVNA 4QHQA 1IZ1A 2ZYMA 3KN7A 2DVZA 4NEDA 4WKMA 1FCKA 3GLBA 2DWIA 2OLBA 2PX1A 3MJNA 4QFKA 5FHMA 3D4GA 2NXOA 3N6TA 3T9VA 2RCBA 1PDAA 3IO4A 1DOTA 5L8DA 4IGTA 4OERA 3VDFA 2DXYA 5IKBA 2G29A 4BLAA 1RYOA 4IO3A 1VE4A 4ECFA 2Z8DA 1VR5A 3TCFA 3MVZA 1MXVA 3EQ1A 4OEUA 3TZAA 1M5CA 1BTJA 1I6BA 2XXRA 3CSBA 2VGQA 2DYXA 5I59A 3LSXA 4H5GA 3RNNA 2F36A 1LFGA 3PPRA 4PETA 3B6WA 3FJ7A 3MUQA 5TP9B 2ONKE 1NL5A 4N13A 4ELOA 2NWJA 4F3GA 3Q25A 2XX7A 3HSTA 3MZ9A 3Q26A 5FHOA 1US5A 3KOSA 4EQ7A 5I58B 1EZ9A 1A55A 5J1DA 4LQ5A 3TTLA 4ZS9A 2ANJA 3FJGA 3CR9A 2O6AA 3ODBA 5H8FA 3SEWA 1SW4A 1ZLQA 4ZDMA 1OVTA 3VVEA 3K1MA 3CRBA 2OCUA 4RK2A 3MAMA 4OMBA 1LCFA 3QSLA 1N84A 1XOCA 4YKKA 3TEPA 4TLMB 1N76A 2REJA 1XVYA 2XXVA 2VP1A 3L6HA 2DSFA 3SESA 3PD8A 3KSJA 2UVHA 2DWHA 4UACA 4GFRA 4PP0A 3B6QA 2F5XA 1N7XA 1A7LA 2QS4A 2D21A 5F1QA 4ELRA 3K02A 4OHNA 4JSOA 4GIZA 4HCWA 2X7PA 3E9XA 4C0RA 3PV0E 4DCXA 3GXAA 4E0WA 2ABHA 4ZE9A 2F78A 5ICTA 3H6VA 2XHDA 4JXIA 4LQ2A 3O66A 4QFLA 3KBRA 3K0VA 1OMPA 5CMMA 2F7BA 1B5HA 3HPIA 2RKMA 4R9FA 2DE2A 4TOZA 1JNFA 4R72A 4HS7A 3M8UA 4OESA 2AL5A 3TFLA 4E0XA 4LZ7A 1NNFA 1OVBA 4U4XA 4I8CA 4X1DA 3PMVA 3FVOA 4R9GA 1LB9A 5DEXB 1IUDA 1QJMA 1ZMGA 3LR1A 4YKIA 1FTJA 4NE4A 2YPNA 2F6PA 3EHUA 5FHNA 1B51A 2LAOA 4U1OA 5DTBA 5KDTA 1Y3PA 4KR5A 5AA4B 4NF4A 1M5BA 1PBPA 4H65A 2H99A 3DP8A 1AOVA 4OETA 2O7IA 2OJTA 1I6QA 4IO4A 3UGWA 3VLUA 3B6TA 3MWBA 2PYYA 4QRZA 2GHAA 3QXMA 1CE2A 3HHGA 4QSEA 5I2KB 1FQDA 4LONB 2UYEA 2OBGA 4XTCQ 1UTHB 2Z22A 4PQJA 1LAHE 2M8CA 1B58A 1OQHA 4F3BA 4EF1A 5JEIA 3IX1A 5H8SA 4FORA 1H44A 4FE8A 4I9DA 3HN0A 4OWDA 1FTMA 4ESXA 4R6KA 2BJJX 3THIA 1A8EA 3TMGA 4OVJA 4F1VA 4ESWA 2GRVA 2Q9TA 4G8NA 5CM6A 3PPQA 3K01A 4NF5B 2Q89A 5CBSA 1NNPA 4GXAA 4NF8B 4YB6A 4Q30B 4LVQA 3W9VA 1EZPA 1OLAA 3FV2A 1US4A 2ALUA 4R6YA 2VD2A 1QUJA 1QUIA 5AA2A 1JW5A 3CI8A 1HSLA 2E1SA 2H25A 3S9EA 3O29A 5DEXA 4FECA 3C35A 4OFJA 1GVCA 3EN3A 2I4BA 3U93A 5KCJA 2D3IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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