2QS1A

Crystal structure of the glur5 ligand binding core dimer in complex with ubp315 at 1.80 angstroms resolution
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Binding site and ligand flexibility revealed by high resolution crystal structures of GluK1 competitive antagonists.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
total genus 78
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2qs1A02
1MQJA 4HTGA 3ODBA 4YKKA 4MH5A 4KR5A 5CMBA 5I57A 1DTGA 3K1PA 1JEUA 4U4SA 1MM7A 2DWHA 2NWJA 2FYIA 2KLFA 4IO3A 2B3FA 3KOSA 3OSRA 4HCWA 5I58B 2GH9A 3HSTA 4QFNA 1TWYA 4U23A 4PFUA 4DIGA 1UIVA 1P1NA 5I2NA 1MQDA 2O68A 1EU8A 2G29A 3RLFE 4G8NA 4WEDA 4ZZAA 4LUBA 4G68A 1UTHB 2Y7PA 2Z8EA 4U1OA 4F2QA 3CFXA 1D3KA 2OK2A 1OQHA 3G3KA 1DMBA 4KCCA 1QKAA 3PPPA 4XKPA 3B7DA 4GL0A 2CMOA 1MRPA 1B4ZA 1AH5A 2RC9A 3F11A 1XVXA 1MXWA 3IAZA 4BDQA 3UA8A 1POTA 2UVGA 2H9BA 4UACA 3S9MC 4NF4B 3MC2A 3VE1B 4F3GA 1WDNA 3K6UA 3DP8A 4LATA 3EPEA 5B7DA 1LGBC 1FTKA 4NTLA 3PUVE 1MPDA 1MY2A 3O29A 2QRYA 1LAGE 4H0WA 2D5WA 2Y7RA 1NNTA 3H6UA 1DTZA 2Y84A 3TPAA 3TCHA 4IY6A 5H8HA 3TTRA 5ICQA 4R9GA 4IGRA 3HPIA 2A5TA 3CFZA 3PUXE 4TOZA 4R6HA 5A5XB 1FTOA 3KSJA 4R9FA 1EZ9A 4YMAA 3EHUA 4ZZEA 4WXJA 3WAEA 3KFMA 3DM0A 1VSOA 5AA3A 4LP2B 2B3BA 2O7IA 4H6DA 2VHAA 2I3WA 4YKIA 2QSXA 1NMUA 2ESNA 4JSDA 1B51A 1SYHA 4ELQA 1FTLA 1MG1A 4JBZA 4YICA 4DXUA 1MDP1 3OO9A 4RPNA 2Z23A 1O63A 1LAHE 3QUJA 2ABHA 3P7IA 3K1NA 4Q5TA 4C1TA 5AA2A 4GOTA 2PT2A 3TUSA 4LQ2A 1MQGA 1MXZA 4JXIA 1IITA 2VD3A 4OZ9A 4HW8A 5FHNA 2I49A 4YZZA 3PMXA 4FEDA 1I6QA 2DVCA 3FATA 3O97A 4MFIA 4KD5A 3I5OA 2I3VA 2ZNTA 1D4NA 3PPOA 3IL1B 4XIGQ 3KJ7A 2ZMBA 2PVUA 4OQOA 1M5CA 3LUYA 3JYRA 4F1UA 1JVXA 1O64A 5L9OA 3RTWB 3PGFA 4R6KA 4FATA 1Q35A 2DE3A 4RYAA 2Y7KA 4RXLA 3IOVA 4MLQA 3RT6B 3L6HA 3KG2A 2E0SA 4U21A 2H98A 3Q27A 2XXYA 2DWAA 5DVJA 1A40A 1BP5A 2D21A 2H4IA 3OO6A 1URSA 3UGWA 3M8UA 2Y7IA 5BWJA 1IUDA 4RNSA 3FV1A 1XT8A 4F39A 4ESXA 3K6WA 1MXYA 1PB7A 1IXCA 1SW5A 4GF8A 2QS2A 3KJTA 1RKMA 3U1OA 3S9LC 3SETA 4YKPA 2XXPA 4AB6A 5H8QB 1RYOA 4ZECA 1D9YA 3MUQA 3T9VA 3B6WA 2F6PA 5FTHA 1IQ7A 1YCJA 1FQCA 2OWTA 4ZE8A 3KN8A 4WEPA 1B52A 5TPAB 4GWOA 2Z8FA 4XKRA 4PP0A 4OVJA 1TT1A 1SBPA 2P0SA 2GFEA 5K2YA 4OERA 4F31B 1MXXA 1DOTA 2THIA 5DVFA 3VXBA 3TDJA 2PX1A 1N3WA 2P2AA 1MQHA 1SD3A 3USDA 3CIJA 2Y7WA 1J1NA 2I6EA 1LCTA 1O7TA 1ATGA 1N3XA 3VXCA 1XOCA 1FW0A 2HAVA 3GBAA 4RK2A 3S2VA 3H03A 4DZ1A 4XKQA 1OVTA 4C0RA 5J1DA 2DYXA 2V3TA 2XX9A 1FQBA 5L8DA 1US4A 3A3CA 4N13A 1R9LA 3LSLA 3G3FA 4DLDA 1KWHA 3IB0A 1NL5A 1QUIA 3PUZE 5KZTA 4QSCA 5IAIA 1OVBA 3U72A 2FNCA 3SEUA 2O7UA 5H8FB 1WVJA 3IB1A 4PFWA 1PB8A 2ZYNA 4RPOA 4O3CA 4DXBA 3QUFA 3QSLA 1H45A 1JW5A 1SW2A 3QK6A 1BTJA 2GRVA 1B7UA 1B6HA 4NMYA 3EHTA 3KBRA 1MXVA 4I1DA 2QS1A 1Y4TA 1VFEA 3K4UA 3AXFA 4YB6A 3SERA 1B3GA 1P99A 2UYEA 3MVXA 3M3FA 2H5YA 4MLVA 3OELA 3V5AA 4DCXA 2XXQA 1YTVA 1VE4A 1BKAA 3UN6A 1P1WA 1IIWA 2ZYKA 2B65A 4N07A 4ELPA 1S7YA 1MY3A 1H44A 1MQIA 4OWDA 3SKPA 2UYFA 4LVQA 2O1LA 3PPQA 4AB5A 5F1QA 3K1MA 4ZS9A 3VLWA 4IO7A 4R72A 3OENA 3C32A 4M1VA 5H8NB 2ZNUA 1Y3PA 4OTEA 4XTCQ 2ALUA 4F3PA 3LC8A 4OETA 4PFTA 3FD3A 5FHMA 3KOTA 4H67A 5CM6A 4DDDA 1NNKA 4H5GA 3B6QA 3JZJA 4ELRA 2QJEA 4IY5A 3H7MA 3UK4A 3CR9A 3N6TA 5DTBA 3E9XA 5JEIA 5LOMA 4Q8RA 4TLMB 3L6GA 4F29A 3GXAA 1B3FA 2F97A 2Q89A 4GRKA 1FTJA 1S50A 3U8QA 3T66A 3ZKLA 5I2NB 1AL3A 4OMBA 1JNFA 4G68B 4GL8A 2X26A 3IX1A 2RINA 3TCGA 1JVYA 3FJGA 2ZYOA 3W15C 3LR1A 2DSFA 2DP8A 1OLAA 3N6UA 1SI0A 1URGA 2HZKA 3IJXB 4QF9A 1MM6A 2PT1A 4QHQA 2QS4A 2DS9A 3H4ZA 3K02A 4FECA 1N0TA 2W7YA 3EQ1A 2XXWA 1HSJA 1QUJA 1N84A 1EZOA 1MH3A 3MPKA 4OFLA 3TFLA 3TTNA 1BIYA 2DXRA 4JDFA 3FIRA 2O84X 2REGA 1IZ1A 1PDAA 3GBBA 1N7WA 2O51A 3N5LA 4ZEBA 3QXMA 3DP6A 4P0GA 1R9QA 1M5DA 4ISUA 3CSBA 3IOUA 1SYIA 4MBPA 1B4HA 5H8HB 3TKDA 2A5TB 2XXVA 3MP1A 1SVXB 3W9WA 3T9UA 4IO6A 1GV8A 3QAXA 3CSGA 3Q29A 3H6TA 4YAHX 4DCYA 3FGSA 3N94A 4IB2A 5HM4B 3Q26A 2FA7A 4X9TA 1A55A 1GTKA 4ZEDA 5KDTA 1UIUA 3S9EA 4H5FA 3W9VA 1D9VA 4ZEFA 3FVKA 3O9PA 3H6WA 4FIMA 2DE4A 3UP9A 1LB9A 1B40A 1QW0A 3K6XA 3EF7A 1M5BA 4GVOA 1H3DA 1OIBA 1SW4A 2HXWA 2ZNSA 3SEYA 5AA2B 4NF5A 5DEXA 3Q25A 2LAOA 2DE2A 1S9TA 1AMFA 2CZLA 3MJNA 3RY3A 5DYHA 4DXCA 5CRYA 1NNFA 3BBRA 5JTYA 3RUMA 4GXSB 4LZ5A 2XXHA 5I84A 3TODA 4F1VA 4YKJA 3VVEA 1TXFA 3TCFA 2I0CA 4KPTA 4EF2A 1MS7A 2DQVA 4BLAA 3BFTA 3R7XA 3IOTA 5AE4A 3EHSA 3TAJA 2R6GE 4NWCA 3QIMA 4EXLA 5L9SA 3RN8A 3OEKA 1I69A 2XD2A 4ZEIA 4OHNA 3FXUA 2I58A 2O6AA 2QPQA 1N04A 3MQ9A 1B1XA 1LSTA 1DPPA 1ZMGA 3FJMA 4U1ZA 1DSNA 2RC7A 1UTBA 2UVIA 4EXKA 3O2AA 4NF8A 4F2OA 1JW4A 1H43A 3OD7A 4YB5A 1B0LA 1FQDA 1B3LA 3LSXA 5I59A 5ELVA 1EH3A 1LB8A 3OMBA 2F78A 3FVOA 3PUYE 3FVNA 3MBPA 3U93A 4ZEKA 3T93B 4OFOA 5BUUA 2R71A 4RJZA 3OO8A 1TFAA 4L17A 1Z7NE 3K01A 3H6VA 1NFTA 4EQBA 3CFLA 4YU0A 3CG3A 4NE4A 1B5IA 3T96B 2V84A 1TFDA 1QVSA 1USYH 3SEVA 1MXUA 2ZYMA 1MY1A 5CC2A 3PPRA 4KQPA 4RK9A 4UA8A 4P11A 4KI0E 5FHOA 2XXRA 2AL5A 4OESA 4E0WA 1ZKBA 3CI8A 4FEBA 5ICTA 4NF6A 1N7XA 4F19A 1A54A 1OMPA 4Z0IA 2AIXA 1PEBA 2F7CA 4I9DA 1B5HA 3RGYA 3C31A 4R2BA 1CE2A 1JW1A 1P1UA 3OEMA 3EN3A 2OBGA 4R74A 3HO7A 4KCDA 1Y3NA 4QRZA 3CRBA 2VP1A 2M8CA 3C33A 2Q88A 3C35A 1DPEA 3VV5A 3TTMA 3PD8A 4I62A 4FORA 3MZ9A 4ZE9A 3MP8A 2XD3A 4Z7EA 4OXVA 5B70A 4R75A 2PYYA 1Y20A 3ILTB 2OLBA 1MDQA 3MVYA 4X1DA 3IOWA 2F36A 5AA4A 2HZLA 4OEUA 3R6UA 2OCUA 2F35A 3RNNA 3WAFA 4R6YA 4MF3A 1AIVA 1WODA 2VD2A 1LFHA 2BJJX 4POWA 3O6IA 4ECFA 4EDPA 2O1MA 3IR1A 3MP6A 3D4GA 3T22A 3ONMA 4PQJA 1A7LA 3SESA 2V3QA 3C9HA 3SDFA 5CMKA 3MWBA 5DVIA 3THIA 5ITPA 2I4CA 3HN0A 4G77A 5I2KA 3TQLA 2NOOA 5HBCA 3KSXA 2E1SA 4OEVA 3SEWA 3RQTA 1PB9A 3TELA 1QUKA 4JWXA 5FTIA 4G68C 1XS5A 4RY1A 2XX7A 3V89B 1Y4CA 2YLNA 2F6GA 3E3KA 5H8SA 4FAJA 4F18A 3MAMA 4KHZE 4QSDA 1P1OA 4Q30B 4EQ7A 2F34A 4BDRA 5I56A 3ECRA 4G2ZA 1LFIA 1A99A 2V3UA 5CMMA 1MPCA 5IKBA 4QFKA 2O69A 4KYSA 3IO6A 4F1YA 3H06B 1FQFA 4GD5A 1ZJLA 1AOVA 1A8EA 1B58A 2Z8DA 3U94A 4U22A 1OLCA 5JK4A 3GZGA 2HAUA 1LAFE 4JB7A 1LAXA 3I3VA 4ELOA 5KCJB 3MVZA 5TP9A 3MZBA 4O3AA 4JSOA 4KYEA 1B46A 4PFYA 4K3FA 5KCJA 1VR5A 1HSLA 1ZBMA 5EHSA 3K6VA 2DVZA 1PBQA 4X48A 3GLBA 2RKMA 2F8DA 2ONSA 1IEJA 3A3UA 5I58A 2V25A 2RF1A 4QFOA 3S4UA 3IK6B 2NVUB 3RPWA 1YPNA 2ZXTA 3V8XB 3PUWE 1Y1MA 4E0XA 3BFUA 2R9JA 2UXAA 2Q2CA 4H65A 1B3HA 3PMWA 3FXQA 4THIA 1UTHA 2QS3A 1PC3A 1B3EA 4DE8A 3O28A 2PMSA 2YJPA 2A5SA 1B7HA 3JV9A 2XXIA 3LBSA 1ZTYA 1Y3QA 1Y9UA 4GLIA 1JEVA 1EZPA 5HPQA 3G3JA 4IO4A 5TU0A 3TEPA 2IEEA 4OENA 4EF1A 2ONRA 2AL4A 1Q1KA 4NF4A 3MVWA 4QFLA 4X1BA 2RCAA 1Z7ME 2OWSA 4YB7A 4LZ7A 1FQAA 1SDXA 5KDTB 3OO7A 2V93A 3S9NC 3G7WA 2GHAA 1SI1A 3G3GA 3FV2A 2OZZA 3FASA 3FXRA 3SEXA 1NKXA 4NF5B 3O6HA 1QJMA 5DEXB 5M2VA 1B9JA 3C34A 5A5XA 2HCAA 4G8MA 3O66A 4F3BA 1UQWA 5JTYB 3K0VA 1ZIUA 1B5JA 4HS7A 1XHYA 5ISUA 4GQOA 2AYSA 3N26A 3BKIB 4ONYA 1LLSA 4R73A 1NNPA 3MZ1A 1B32A 2F7BA 4H8IA 3VVDA 1NH7A 2IA4A 1B0HA 1POY1 2DXYA 2REJA 3TZAA 3U92A 4QSEA 1LBCA 5AA1A 3DP4A 3ZS6A 3KN3A 3M3LA 1N76A 3PPNA 3HCQA 2XXXA 3IORA 3VDFA 2XHDA 4JWYA 3K00A 3G3HA 4ZDMA 4BDMA 1UTBB 2DOJA 2DWIA 3ZSFA 3HHFA 1IXHA 3TQWA 4NF8B 3RT8A 4LA9A 2QMWA 3E4RA 3PMVA 3UIFA 3OXNA 4YMBA 2ANJA 4U4XA 5I59B 1RYXA 3FJ7A 4BDNA 4EUOA 2QMXA 2OJTA 1B1HA 4IO5A 2G93A 1NH8A 4TQUQ 3VVFA 3HV1A 4O3BA 3R26A 4KYDA 1VFDA 3CG1A 4KFQA 5EYFA 1SQYA 4IGTA 3FVGA 1M5EA 3KN7A 1PBPA 4JWOA 1XVYA 1ZU0A 5DT6A 2Q9TA 3LSWA 4QFPA 1ANFA 1LCFA 1F9BA 2X7QA 1QULA 1BLFA 2H99A 1P1QA 4PETA 4NF6B 3MPLA 1GR2A 2VOZA 3ILUB 1LFGA 3PV0E 3T9XB 4XXUA 3OSQA 3C36A 2X7PA 3VLVA 5L9MA 1B7ZA 5H8QA 2I48A 2NXOA 1QKBA 1FCKA 3IB2A 4BDLA 4FE8A 3Q28A 2PBWA 4AQ4A 2UVHA 3CVGA 4P0IA 1FTMA 3RTFB 1B05A 2I0BA 1II5A 5TPAA 1A8FA 3FUZA 3IJOB 3MW0A 2YPNA 2QL3A 2HQ0A 1LBBA 3TTLA 1T0KA 4TLLB 3T9HB 1US5A 2WKYA 2F5XA 1JQFA 2ONKE 5AA4B 1IXGA 2XXUA 3VFJA 4C1UA 1M5FA 1GVCA 2Q8JA 2VGQA 5CBSA 2UVJA 2XX8A 2XXTA 4M4GA 4HCYA 4RA1A 2I4BA 3KGCA 4PE5B 1I6BA 2HFBA 3TYHA 4U2RA 1GGGA 3V83A 3PU5A 4G4PA 2Q2AA 4Q0CA 4GFRA 3QYTA 4ESWA 3E13X 4IO2A 1USYE 2RC8A 3IO4A 4BDOA 1JETA 2NUVA 4NWDA 5CBRA 1B2HA 1URDA 1MY0A 4POXA 2Z22A 5AA2D 5H8FA 1L5TA 5I2KB 4XKNA 2F7AA 4OYVA 3KEIA 3HHGA 4EQ9A 4ND9A 1XC1A 3I6VA 5CMCA 3TTKA 3B6TA 4H8JA 5F7VA 3VLUA 1SW1A 1I6AA 3UORA 4NEDA 2P1SA 1R1NA 5EHMA 1Y1ZA 3M3KA 3D4CA 4H1XA 3C4MA 1IXIA 3OOAA 1ELJA 3G3IA 4F22A 3DLNA 3FZVA 4LONB 4LZ8A 3A09A 3PD9A 1MY4A 2H25A 5I56B 4G8HA 3TMGA 4OFJA 3ZKKA 2DWJA 5CI5A 3K2DA 2RCBA 3KZGA 5K2XA 1H76A 5ITOA 2HEUA 1MH4A 1R6ZA 2GHBA 1OQGA 4N6PA 4LQ5A 1HSEA 4F3SA 4WKMA 1FQEA 4I8CA 1CB6A 4GIZA 3O6GA 5H8NA 1MPBA 4GXAA 2D3IA 3H3GA 4FJPA 1ZLQA 3DELB 5TP9B 5I57B 1YAEA 3LSFB 4R2FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1MQJA 4HTGA 3ODBA 4YKKA 4MH5A 4KR5A 5CMBA 4NX1A 5I57A 1FBDA 2WYKA 3BIHA 1DTGA 3K1PA 1JEUA 4U4SA 1MM7A 2DWHA 2NWJA 2FYIA 2KLFA 4IO3A 3NOHA 2B3FA 3KOSA 3OSRA 4HCWA 5I58B 2GH9A 3HSTA 4PAFA 4QFNA 1TWYA 2ZZWA 5ET5A 4U23A 4I3YA 4PFUA 1NV2A 4DIGA 1NV6A 1UIVA 1P1NA 5I2NA 1MQDA 2O68A 1EU8A 1QGXA 2G29A 3RLFE 4G8NA 4WEDA 4ZZAA 4LUBA 4G68A 1UTHB 2Y7PA 2Z8EA 4U1OA 4F2QA 3CFXA 1D3KA 2OK2A 4XEQA 1OQHA 3G3KA 1DMBA 4KCCA 1QKAA 3PPPA 4XKPA 1FBFA 1KZ8A 4P8BA 2GQ1A 3B7DA 4GL0A 2CMOA 1MRPA 5FBPA 1B4ZA 1AH5A 2RC9A 1BK4A 3F11A 1XVXA 1MXWA 3IAZA 4BDQA 3UA8A 1POTA 1RDXA 2UVGA 2H9BA 4UACA 3S9MC 4NF4B 3MC2A 3VE1B 4F3GA 1WDNA 3K6UA 3DP8A 4LATA 2KR0A 3EPEA 5B7DA 1LGBC 1FTKA 4NTLA 3PUVE 1MPDA 1MY2A 4N8YA 3O29A 2QRYA 1LAGE 4H0WA 2D5WA 2Y7RA 1NNTA 3H6UA 1DTZA 2Y84A 3TPAA 3TCHA 4IY6A 5H8HA 3TTRA 5ICQA 4R9GA 4IGRA 3HPIA 2A5TA 1LBYA 4I3EA 3CFZA 3PUXE 4TOZA 4HE2A 4R6HA 5A5XB 1FTOA 3KSJA 4R9FA 1EZ9A 4YMAA 3EHUA 4ZZEA 4WXJA 3WAEA 4H45A 3KFMA 3DM0A 1VSOA 5AA3A 4LP2B 2B3BA 2O7IA 1K9ZA 2VPOA 4H6DA 2VHAA 2I3WA 4YKIA 2QSXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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