3K4UA

Crystal structure of putative binding component of abc transporter from wolinella succinogenes dsm 1740 complexed with lysine
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
233
structure length
233
Chain Sequence
LRGELRVGLEPGYLPFEMKDKKGNVIGFDVDLAREMAKAMGVKLKLVPTSWDGLIPGLVTEKFDIIISGMTISQERNLRVNFVEPYIVVGQSLLVKKGLEKGVKSYKDLDKPELTLVTKFGVSAEYAAKRLFKNAKLKTYDTEAEAVQEVLNGKADMFIFDLPFNVAFMAQKGQGYLVHLDTSLTYEPLGWAIKKGDPDFLNWLNHFLAQIKHDGSYDELYERWFVDTKWLEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
source organism Wolinella succinogenes
publication title CRYSTAL STRUCTURE OF putative binding component of ABC transporter from Wolinella succinogenes DSM 1740 complexed with lysine
rcsb
molecule keywords BINDING COMPONENT OF ABC TRANSPORTER
total genus 65
structure length 233
sequence length 233
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k4uA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k4uA02
1OVTA 1LLSA 1N7XA 3CSGA 4PFTA 3PUWE 2VD3A 3ODBA 5A5XA 4PE5B 2B3FA 1IXGA 4FIMA 1MDQA 3OO7A 4RY1A 4YAHX 2UYEA 4ZDMA 3TTRA 4LZ5A 1PEBA 4ZZEA 3N5LA 1O64A 3TTNA 1B51A 3EHUA 1NH8A 3FVGA 3HN0A 5F7VA 4X9TA 4LQ5A 4Q30B 3W9VA 2LAOA 4C1UA 2CZLA 4ZS9A 3O28A 3FVNA 1LCTA 1N84A 4POWA 3KEIA 4K3FA 3EN3A 3H06B 1AL3A 3Q27A 3MVZA 4EF1A 2A5SA 3FXUA 3RPWA 1NL5A 1MQJA 5EYFA 3RTWB 3IO6A 3T22A 4I1DA 4GXAA 4OENA 3GBBA 3IO4A 2PX1A 4N07A 1EZOA 4LATA 2FA7A 1ZU0A 1OQHA 4U1ZA 4ZE9A 4F3SA 5BWJA 3IB2A 1NMUA 1B32A 5H8FB 4KHZE 2Z8EA 2F35A 3CIJA 1D3KA 2AYSA 2AL5A 2AL4A 4NF4A 4ELRA 1NNPA 2NWJA 2I49A 5ISUA 3OELA 2RCAA 1XC1A 1JEUA 2O68A 1XT8A 2UXAA 5ITOA 2ALUA 5LOMA 4H0WA 5IKBA 3M8UA 3LSWA 1BIYA 4PETA 1IQ7A 2GHBA 4DZ1A 1R1NA 4P0GA 1UTHA 4R75A 4KFQA 2V84A 1B6HA 1O63A 4NF4B 4JSOA 3G3KA 2I48A 1FQDA 2OWSA 2NUVA 2HFBA 3FZVA 4F18A 1IEJA 3HO7A 3CI8A 1VE4A 3PMWA 2O51A 1Y1MA 2XX8A 1H3DA 3MJNA 4IO2A 3OSQA 2E1SA 4P11A 4L17A 4KCCA 2RC9A 2ESNA 1GR2A 3H3GA 1S50A 4H5FA 2XHDA 4IGTA 4NTLA 1Y20A 4MH5A 5JEIA 1QUKA 4X1DA 3MBPA 3MC2A 1TFDA 1MM6A 4G68B 2I4BA 4X1BA 3JYRA 4N6PA 1VFEA 4FEBA 1BKAA 4DCXA 4GOTA 1FTLA 2O1LA 3UGWA 2DYXA 2F7BA 4JWOA 1B3GA 4X48A 5TPAB 4ESXA 3IOVA 3QYTA 4IO3A 5EHMA 3VV5A 3MW0A 1LFGA 1I6BA 4NF8A 1QJMA 2F5XA 2Z8DA 1R9QA 3UK4A 1ZBMA 2ZNUA 4QF9A 3LR1A 4R72A 2NXOA 1QUJA 3CG1A 2ZYMA 1JW5A 2DP8A 1MH4A 2RC7A 1MS7A 3H6TA 3HV1A 2Q2CA 1ZKBA 2H99A 1S9TA 4QSEA 4YICA 4NF5A 4EDPA 4R2BA 4QFPA 1PB8A 2HAUA 4GWOA 4NF8B 3KJ7A 3PUXE 3S9EA 3VDFA 4M1VA 4O3AA 1D9YA 4DCYA 4F2OA 4GQOA 3H7MA 2Q9TA 1LFHA 1MY3A 4KQPA 3DLNA 3WAFA 2UVHA 5AA4A 1YTVA 3SKPA 1FQEA 4OQOA 5I59A 1BP5A 1YPNA 3S4UA 2XXIA 4G4PA 5H8NA 2XX7A 1B1HA 1QW0A 2GHAA 2RC8A 4ZE8A 3FJMA 5JK4A 3S9LC 3RQTA 1MQHA 4F19A 1Y4CA 3BBRA 3O6HA 1DPEA 1PDAA 1H44A 3MP1A 3HHFA 3SESA 1B3HA 3H6VA 2A5TA 1DMBA 3QK6A 4HTGA 3T96B 2YLNA 4H1XA 2ONRA 1FTOA 4IY6A 4QSDA 3O66A 3OXNA 4BDOA 4GD5A 1N76A 3E13X 1DOTA 5H8NB 4NF6B 3LUYA 5I2KA 2ZYNA 4ELQA 1VSOA 1JW1A 1SYHA 3W9WA 4JBZA 4G2ZA 4P0IA 1L5TA 1JVXA 1Y3PA 2DVCA 1HSEA 3K02A 2HQ0A 3QAXA 4Q5TA 4RXLA 1I69A 1OQGA 4Z7EA 4ZECA 3OOAA 4YKIA 3TUSA 2QL3A 3SEWA 4LA9A 3N94A 5I58B 1B0LA 2H25A 2ZXTA 3N26A 3K01A 3IL1B 1VFDA 1A55A 2XXXA 1Z7ME 2P2AA 4ZEKA 1UTBB 2QS2A 4YB7A 4ECFA 2PYYA 2ZNSA 3VVDA 5DTBA 4F3GA 3DP4A 4MLQA 4TLLB 3VXCA 5TP9A 4AQ4A 2DWJA 1FTKA 2HAVA 3IB1A 3T9HB 4JWYA 2VD2A 3IORA 3C4MA 1IZ1A 1URDA 1YCJA 5AE4A 4U22A 2OCUA 3TPAA 1B3FA 4OEVA 2XXWA 2B3BA 4OFLA 2Q8JA 2X26A 2QJEA 1P1OA 1JW4A 4MFIA 1A7LA 4FAJA 1H43A 3R7XA 3PUYE 4QFOA 4PQJA 2H98A 4N13A 3KN7A 3HPIA 3FV1A 3PMVA 2ABHA 2XXUA 2X7PA 1MXVA 4R9GA 5H8QA 4OMBA 3ZSFA 4R2FA 2ZMBA 3TAJA 2ANJA 3B7DA 3M3FA 4BDRA 1LBCA 5KCJA 1LGBC 3Q28A 2O6AA 1EZPA 1FQAA 4DLDA 2O7UA 1SW4A 1USYH 3G3JA 2F7AA 2THIA 1AMFA 1JVYA 4EXKA 3UA8A 4MF3A 5H8QB 2X7QA 2QPQA 1TWYA 3IOUA 3CFZA 1B52A 3PUZE 5A5XB 1SQYA 1N3XA 5BUUA 4IGRA 5AA2D 2G93A 5KCJB 2REJA 4Z0IA 4NE4A 1UQWA 2F6GA 1B7UA 4I8CA 4DDDA 2DXYA 4NEDA 3KSXA 5ELVA 3FVKA 4OTEA 1A8EA 1QKAA 4H65A 2DE3A 4TLMB 5HM4B 1A54A 3ONMA 4G68C 1B5IA 4KYDA 3IX1A 3PPOA 1CE2A 2OZZA 4G77A 1CB6A 3G3FA 4ND9A 4OZ9A 1UIVA 3V5AA 3C36A 2DWIA 1T0KA 1B4HA 4DXBA 1XVXA 3FJ7A 3U93A 5DEXA 1YAEA 3V83A 4F22A 2Q89A 2B65A 3U92A 1PBPA 2XXPA 5DVIA 3KN8A 3SEUA 3RY3A 5I2NA 4HS7A 2I4CA 4U2RA 3TFLA 1NKXA 2NVUB 4KR5A 1NH7A 3I3VA 3WAEA 3O29A 1B0HA 3P7IA 3MPLA 4OETA 2Q88A 3TQLA 1QUIA 1B4ZA 1QULA 3GBAA 1EU8A 3MVXA 5FTHA 3ZKKA 1JNFA 1RYXA 5DEXB 5DVFA 4C0RA 2I6EA 3RLFE 2DSFA 2O84X 3PU5A 3HHGA 4BLAA 3LSLA 1MY1A 4I62A 3RT8A 2GFEA 2V3UA 3TCGA 1FQCA 3R26A 4R6HA 2VHAA 3RTFB 5I2NB 2OJTA 5L9SA 3SEYA 3H03A 3TODA 1AH5A 3LBSA 3E4RA 3KOTA 1MY0A 4LONB 1LCFA 1ELJA 1UTHB 1MY2A 4UACA 5K2XA 2I3VA 1Y4TA 4PFUA 5L9OA 1UIUA 1B9JA 4RK2A 3MVWA 3TEPA 4I9DA 1MXYA 1JEVA 4OYVA 3KGCA 2G29A 1A8FA 4F1UA 3N6TA 4QHQA 3OD7A 5ICTA 3SEVA 4AB5A 1Y3NA 3T9VA 2QS4A 3UIFA 3UN6A 1MRPA 4EQBA 3OO8A 3KSJA 5H8SA 1B3EA 1NNFA 4R6KA 3K6VA 2ONKE 1POTA 1IXCA 3A3UA 4QRZA 4XKNA 3FJGA 4ZEIA 4IO4A 3IJXB 3K0VA 2DXRA 1PBQA 1MXWA 1GVCA 2REGA 1J1NA 4H6DA 4LZ7A 3O6GA 1TXFA 5HBCA 3I6VA 2HZLA 4EQ7A 3BKIB 3SEXA 2Y84A 3THIA 1GTKA 2DVZA 2XXRA 1H45A 5I84A 1LB9A 1Y3QA 1ZTYA 2FYIA 1D4NA 3IJOB 4KYEA 2XXQA 3S9NC 1SBPA 3PMXA 3OEKA 3FUZA 3G3GA 1M5CA 4NWDA 3MP8A 3IK6B 4RK9A 2D21A 4FORA 4NF5B 4YMAA 2RINA 4JB7A 5IAIA 4BDQA 4ESWA 2V93A 2ZYKA 3O6IA 3ZS6A 3PPPA 2E0SA 2GH9A 5AA4B 1JQFA 5CMBA 4QSCA 4ISUA 1NNTA 1MDP1 1MPDA 5I59B 4XKRA 1RKMA 1TFAA 2XXYA 4PP0A 5L9MA 3A09A 4FEDA 3FGSA 2XXTA 3EHSA 4IB2A 2I3WA 1Z7NE 4TQUQ 5I56A 2F78A 5FTIA 3MAMA 1B5HA 4MBPA 3QXMA 4PFWA 5AA1A 3CR9A 2A5TB 1R9LA 4JDFA 3USDA 2R9JA 3B6QA 4F2QA 1VR5A 1ZLQA 3RT6B 3VVEA 2DQVA 4GL0A 1LBBA 4HW8A 3PGFA 2IA4A 4KYSA 1Y1ZA 2IEEA 5I2KB 3IOWA 3L6HA 3MZ1A 1IITA 1XS5A 3H4ZA 4QFNA 1M5EA 2ZNTA 2KLFA 1URGA 2Y7RA 4DE8A 1OLCA 2YPNA 1IIWA 3C9HA 2UVJA 4HCWA 4GLIA 3DP8A 4U1OA 3RN8A 3VLVA 1FQFA 3TKDA 5H8HA 4C1TA 4LZ8A 1AOVA 4RNSA 1WODA 4DIGA 4F3BA 1EH3A 1IXIA 1LFIA 3DM0A 4BDMA 1QVSA 1SD3A 1MQIA 1OIBA 4FE8A 1I6QA 1TT1A 5I57A 4OXVA 2V3QA 4RPOA 3E9XA 5CI5A 5FHOA 2OBGA 4O3BA 4YKPA 4F31B 4IO6A 5F1QA 1B3LA 5H8HB 1SVXB 3OENA 5TP9B 3H6UA 4O3CA 2UVGA 4OERA 1N0TA 1MPCA 4MLVA 1RYOA 5DVJA 5FHMA 3U94A 3SDFA 3FXQA 4LP2B 1P1WA 2DOJA 2I0CA 1ANFA 1XVYA 2HZKA 1A40A 3K6XA 4JSDA 3G7WA 2DS9A 4ZEDA 1MXZA 4YMBA 5CBRA 4LVQA 3O2AA 3SETA 4BDNA 4M4GA 3I5OA 2NOOA 1P1QA 3T9XB 3KBRA 4IO5A 2ZYOA 2CMOA 3IAZA 5B7DA 2VGQA 1B58A 3K6WA 2OLBA 4G8MA 3CFLA 4ZEFA 1ZMGA 4F29A 3B6WA 3V89B 3ILTB 4FJPA 4H8JA 4OFOA 4DXCA 1PB9A 1B40A 1LAHE 3G3IA 2DWAA 3MPKA 4LUBA 3CVGA 1GV8A 4RYAA 1M5FA 5CMMA 4YB6A 4XKPA 1F9BA 2D3IA 3VE1B 1SDXA 2PT2A 3F11A 4KI0E 3ECRA 3N6UA 5CMCA 4ZEBA 1A99A 3T9UA 2O69A 3TTKA 1D9VA 4OFJA 1B7ZA 1ATGA 2XX9A 2QMXA 1H76A 3MWBA 4OEUA 1MM7A 3LSFB 5H8FA 1OMPA 1P1UA 3KG2A 5CRYA 4KPTA 2OK2A 4QFLA 3MQ9A 4XTCQ 3K1NA 3Q29A 3EHTA 4F3PA 4OWDA 3OMBA 2XXHA 4GF8A 1B2HA 2V25A 4OESA 4TOZA 4R74A 4YKKA 1N3WA 1HSLA 1P99A 2PBWA 3QUFA 5EHSA 3GZGA 4KD5A 4HCYA 3FV2A 3JV9A 4YB5A 4EXLA 1WDNA 1II5A 4PFYA 1ZJLA 4YU0A 1Q35A 3SERA 1US5A 5L8DA 4F39A 3TYHA 3FD3A 3KFMA 1EZ9A 3RUMA 3GLBA 4EUOA 3V8XB 2XD3A 3M3KA 3TCHA 1OLAA 3BFUA 1SI1A 4H5GA 3U1OA 2Q2AA 4H8IA 3K00A 5FHNA 3BFTA 4THIA 3TQWA 3C31A 5ICQA 3RGYA 3W15C 3Q25A 3LC8A 1USYE 4LQ2A 2AIXA 1MQDA 3EPEA 4WKMA 4XIGQ 2Y7KA 1QKBA 2QS1A 4POXA 1POY1 4RJZA 1LAXA 4U21A 4ELPA 4G68A 1O7TA 2RF1A 5KZTA 3S9MC 4E0XA 4OHNA 5DYHA 1FTJA 3KJTA 2RCBA 2F6PA 2WKYA 2UVIA 3S2VA 3D4GA 2Z23A 5TPAA 4JXIA 4RA1A 2QMWA 4R73A 2R71A 4WEPA 1S7YA 3A3CA 3IB0A 1LSTA 5CM6A 3LSXA 3PPNA 1BTJA 3K1PA 4FATA 4GVOA 1Y9UA 4ZZAA 2HXWA 2VP1A 3TZAA 3QUJA 3FASA 4F1VA 2F34A 4XXUA 3C34A 1HSJA 2DWHA 2UYFA 4U23A 2PT1A 3DP6A 1M5BA 4G8NA 4Q0CA 2O1MA 3JZJA 3U8QA 1IXHA 1FQBA 3VLWA 3QSLA 2O7IA 3R6UA 3OO6A 2Y7IA 1MXUA 1Q1KA 3TTLA 4NMYA 1ZIUA 1B05A 3K1MA 4DXUA 4RPNA 3H6WA 4GXSB 1URSA 2DE4A 5AA2A 4OVJA 1MY4A 3VFJA 3OO9A 3ILUB 4G8HA 1FTMA 4GL8A 1JETA 3VXBA 1BLFA 4IY5A 2DE2A 2PMSA 1SYIA 4IO7A 3C32A 2P1SA 3OSRA 3ZKLA 3TTMA 3E3KA 5AA2B 1US4A 3U72A 3TELA 1MH3A 2R6GE 5TU0A 1LB8A 1P1NA 1SI0A 4NWCA 1MPBA 3CRBA 3Q26A 4Q8RA 2PVUA 1LAGE 3CG3A 4ONYA 5CBSA 3AXFA 4NF6A 2HCAA 1M5DA 1MXXA 3MZ9A 2VOZA 4U4SA 2H4IA 4U4XA 1WVJA 3M3LA 2Y7WA 3T66A 5KDTA 1PB7A 4AB6A 3OEMA 2XD2A 1I6AA 4GRKA 3TDJA 3D4CA 1SW2A 4EQ9A 2YJPA 2GRVA 5CMKA 2QS3A 4JWXA 3B6TA 5JTYA 3G3HA 2F7CA 4F1YA 3TMGA 4R6YA 3FVOA 3K4UA 3GXAA 1FCKA 5I58A 4UA8A 1DSNA 2H9BA 2F97A 1B5JA 5K2YA 5KDTB 4GIZA 4WEDA 5HPQA 2RKMA 2Z8FA 2OWTA 5ITPA 1UTBA 5J1DA 4KCDA 1B1XA 1DPPA 2Y7PA 4BDLA 2W7YA 5I56B 1KWHA 3K6UA 3MZBA 4YKJA 1LAFE 3HSTA 5JTYB 1AIVA 1SW5A 2QRYA 1NNKA 2M8CA 3O97A 3TCFA 1OVBA 1MQGA 3UORA 2D5WA 1IUDA 3MVYA 2I0BA 4GFRA 5B70A 1GGGA 3DELB 1DTGA 3C35A 2V3TA 2Z22A 3IR1A 3PPQA 1XOCA 3UP9A 3EF7A 3PPRA 3K2DA 2H5YA 5M2VA 2P0SA 2FNCA 1N7WA 4WXJA 3FATA 2QSXA 5AA3A 2XXVA 3PD9A 3KZGA 3L6GA 3PUVE 5CC2A 1B46A 4EF2A 4YZZA 2F8DA 3T93B 4ELOA 3KOSA 3CSBA 2HEUA 3RNNA 3CFXA 1R6ZA 3EQ1A 3KN3A 1XHYA 3FIRA 4R9FA 2ONSA 3PV0E 4FECA 3VLUA 4H67A 1MG1A 3O9PA 4E0WA 2BJJX 5I57B 3PD8A 3MUQA 3IOTA 1B7HA 1FW0A 5DT6A 3C33A 3QIMA 4QFKA 1N04A 1PC3A 3FXRA 1SW1A 3MP6A 2F36A 1NFTA 3HCQA 1DTZA 4XKQA 3VVFA 2I58A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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