2NUVA

Crystal structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with atenolol at 2.25 a resolution
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with atenolol at 2.25 A resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 108
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2nuvA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2nuvA02
1URGA 4OFOA 1Y4TA 1D4NA 4LONB 3CR9A 4EUOA 2PT1A 4PP0A 3PPNA 5L8DA 4C1TA 3EHSA 3E3KA 3KOSA 4NF5B 4R9GA 3PUZE 1EZ9A 4Z7EA 1MG1A 1GTKA 4JSOA 2OLBA 1FTOA 3A3UA 4OXVA 2F34A 3SDFA 1M5BA 2GFEA 3VXCA 1DPEA 1B32A 5H8NA 2PBWA 3E13X 3TDJA 4OFLA 5AA4A 1P1QA 2XXUA 2I4CA 5L9MA 2ZNTA 5DYHA 3TCFA 3Q26A 1FTLA 3G3IA 1SQYA 1UTHB 3TUSA 4ZEKA 4KR5A 1MM7A 3RT8A 1IEJA 3MVZA 2VD3A 3IOTA 1GVCA 1LBCA 4JWOA 2UVHA 5JTYB 4HS7A 3UIFA 1IXCA 4G4PA 3BKIB 1HSJA 2Q2AA 4HCWA 4BDNA 1PC3A 5KCJB 4F22A 3H6TA 5ICTA 3FD3A 3MVWA 2R71A 3MP8A 3FUZA 2QJEA 3IORA 3QK6A 4ELOA 1Z7NE 4X1DA 3O66A 4QFKA 4MF3A 4TOZA 2DYXA 4U4XA 4THIA 3ILTB 1DMBA 3B7DA 1O7TA 1XS5A 3SEYA 1N7XA 3U92A 2X26A 4H67A 5I58A 1PB8A 4PE5B 4BDQA 4LQ5A 3DM0A 4OERA 1T0KA 4FORA 4RY1A 4GXSB 1N0TA 1OIBA 5CM6A 2O68A 4XKPA 3FATA 1OLCA 3MAMA 1MRPA 1MDP1 5FHMA 3ODBA 3GZGA 1ZJLA 2F97A 2WKYA 1XT8A 3HPIA 4JWYA 5H8FB 3O9PA 1UTBB 4ESXA 4H5FA 1A99A 2Z8FA 2DE4A 4P0GA 5CMCA 4YB5A 1BTJA 4ISUA 4NF8A 1P1NA 4N6PA 2G29A 2V84A 1QJMA 1DPPA 2XD3A 3CFXA 4YMAA 3GXAA 1CB6A 2Q88A 4KQPA 2OWTA 3UK4A 2Q9TA 2X7QA 1MY3A 4OTEA 1Y3NA 2UVIA 2XXRA 4P0IA 5FHNA 1OLAA 1B52A 1YPNA 3MJNA 3K02A 3MVYA 4NEDA 4DIGA 3LSFB 4OESA 3G3KA 4ESWA 2RKMA 3KJTA 3LSWA 1WDNA 1Y1ZA 3QSLA 2OWSA 3PD8A 2D21A 1I6BA 1LAGE 4I8CA 2AYSA 2FYIA 3EF7A 1FW0A 4BLAA 4H5GA 2O51A 4PFTA 3RN8A 5M2VA 4GVOA 3KBRA 4NTLA 4N07A 1P1UA 4TQUQ 3TMGA 2UYEA 4PQJA 1QW0A 3HO7A 3PPQA 1MXXA 3IOUA 5TPAB 1LAXA 2AL4A 4YKPA 3C35A 4NF5A 1FQDA 5H8HB 3OXNA 3H06B 1US4A 1OQHA 2OCUA 4KYDA 3TZAA 3TTMA 2RCAA 2GHBA 4YKIA 3LC8A 3W9VA 1URDA 1MPCA 5HM4B 2UVJA 4OMBA 3D4GA 1B0LA 4F19A 1MY2A 2HCAA 1B3LA 4GXAA 1Q35A 1MY1A 5CMMA 2PMSA 1MXVA 5I2KA 2XXHA 4KYSA 1R9QA 3BBRA 3FV1A 4FECA 1I6AA 4F1VA 1JW1A 1UTHA 2THIA 5BWJA 3TQLA 3IL1B 1XVYA 3G3FA 3M8UA 4RA1A 4F3PA 3V83A 1H43A 1FQCA 3MPLA 3I6VA 3D4CA 5JTYA 2RCBA 2F6GA 1ZIUA 1LCFA 2I4BA 1IZ1A 2XXWA 3THIA 2A5SA 3H03A 1SW4A 4HTGA 5I2NA 1S50A 1MQIA 3PMXA 3KN8A 4NF4A 5H8QB 4RK2A 1A54A 4O3BA 3LSXA 3K0VA 1JQFA 4IO3A 4QHQA 3S9LC 1FQEA 3ECRA 4ZZAA 4MFIA 3VFJA 4ELRA 1DOTA 4AB5A 3FXUA 4Q0CA 5TP9A 2ZNUA 1PDAA 5EHMA 3ZSFA 4F3BA 4RK9A 3O6HA 4AB6A 1YTVA 2PYYA 3C34A 2I48A 2HAUA 1BP5A 1B46A 5TU0A 3GLBA 4KD5A 4R75A 3LSLA 5AE4A 1B5HA 3IOWA 3H6UA 1M5EA 2W7YA 1ELJA 1AMFA 1B9JA 4FEBA 4N13A 2F78A 4Z0IA 5K2XA 5J1DA 4DXBA 1POY1 3EQ1A 4LATA 1MXZA 1YCJA 2LAOA 5F1QA 5H8FA 3FXRA 3PUVE 3U94A 1MY0A 4H8JA 2CMOA 4M1VA 3QYTA 3TAJA 3ZKLA 4NF6A 4G68C 3FASA 1EH3A 3H4ZA 4ONYA 1MH4A 2ONRA 1TFDA 1CE2A 5CRYA 2DE2A 1LBBA 5DEXA 1LFHA 3H3GA 1R9LA 1D9VA 4EF2A 3UORA 2Y7IA 4H8IA 1L5TA 1JVXA 4JDFA 1SBPA 1B3EA 4NE4A 4IGTA 4GL8A 1B3HA 3TCGA 3MZ9A 3K00A 2V3QA 3K2DA 1EZPA 4DCXA 2DWHA 1H45A 1QUKA 2OBGA 2P1SA 4EF1A 1OQGA 4BDOA 5B7DA 3VLWA 5L9SA 3W15C 2V93A 2NXOA 3N6TA 1P1OA 4GQOA 2NOOA 4G8HA 3UA8A 5CC2A 3U93A 3EN3A 3KFMA 5H8HA 3T22A 2HFBA 4JXIA 1BLFA 1RKMA 2I6EA 2I3WA 2HEUA 1IUDA 3JV9A 1JW4A 1Y1MA 1QUJA 3T9HB 1VFEA 1B58A 3RLFE 1JEUA 4IO4A 4EXLA 4QFNA 4I9DA 3S9MC 3E9XA 2UYFA 1D9YA 1H3DA 3SEVA 3TTNA 4OENA 3TCHA 5BUUA 4GL0A 1IIWA 2H5YA 2D5WA 2OJTA 1NNFA 1FQBA 1IQ7A 3H7MA 3OSQA 3HCQA 2REJA 1Z7ME 3USDA 1OVTA 3BFTA 1AH5A 4XKNA 5I2KB 1F9BA 4MLQA 3RGYA 1B7ZA 1N7WA 2Y7WA 2ANJA 2ZYKA 1BKAA 5H8SA 3GBBA 2Y84A 2XXPA 2I0CA 5CMBA 3ONMA 5H8QA 1WVJA 3EPEA 4H0WA 4YICA 3PV0E 4POWA 3Q28A 2ZMBA 3FJGA 3CSGA 1LFGA 2VGQA 2QSXA 3DELB 1ZKBA 4KCDA 3UN6A 4ELPA 4DXUA 4FJPA 3PMVA 2DWIA 1B51A 3TYHA 5I59A 3FJMA 5DTBA 5I2NB 3CG3A 3LR1A 4OVJA 4U23A 4NF4B 4WEPA 3IO4A 4RNSA 2DS9A 1ZTYA 3HV1A 1LAHE 3TQWA 2QS3A 4G68A 1ZLQA 3CFLA 3K1PA 3SEWA 4YB6A 3K6XA 3K01A 4KYEA 1JEVA 4FIMA 2DE3A 1MXYA 4GRKA 3PUXE 4XKRA 5TP9B 1LCTA 1JVYA 3PUWE 3RNNA 4OHNA 4NMYA 2B65A 4XTCQ 3M3LA 4M4GA 3O28A 3K4UA 1NMUA 3N94A 2P2AA 2B3BA 1S7YA 1SDXA 2DXRA 4XIGQ 3TKDA 4LUBA 2ZXTA 5I57A 3GBAA 5FTIA 3G7WA 2PT2A 4FATA 4U22A 4QSDA 1KWHA 2P0SA 3U72A 1A55A 3T9XB 4F3SA 3N26A 1UIUA 4BDRA 3LUYA 4PFWA 2GHAA 1H44A 3T96B 1GV8A 1QVSA 1DSNA 4NF6B 2X7PA 1B7UA 1USYH 1NKXA 4H1XA 4KPTA 3MQ9A 2RINA 3G3HA 1B1XA 4R6HA 4GLIA 3S4UA 4ZEDA 1R6ZA 3OEKA 3FVKA 3TTLA 3N6UA 1TT1A 1YAEA 3KOTA 4GIZA 4KI0E 5DEXB 1MS7A 4MLVA 1ANFA 3Q25A 2QMWA 1URSA 2O6AA 3OO6A 2VP1A 3CG1A 3OO8A 4F2OA 4GWOA 3FV2A 2I58A 4MBPA 4F1YA 1NL5A 5A5XA 2R9JA 3VVDA 4XXUA 4LZ7A 3MBPA 2I0BA 2PVUA 4PETA 3IJOB 3T93B 3PPRA 4IY5A 1B3GA 1Q1KA 4WKMA 1AIVA 1B7HA 1QULA 4H6DA 1B05A 4IO6A 5I56B 3O6IA 4GF8A 3V8XB 3G3GA 3IB2A 2HAVA 1Y20A 5AA1A 4NWCA 1QUIA 1D3KA 4TLMB 5I84A 2GH9A 3KZGA 3K1MA 1SW2A 4X9TA 5EYFA 2XXTA 4XKQA 5DVJA 1Y3PA 1FQAA 2HZLA 1LB9A 1LAFE 4ZE9A 4JBZA 4Q5TA 3WAEA 3KN3A 4ECFA 4R72A 1MPDA 1M5DA 4WXJA 3UP9A 2DXYA 1PB7A 4R73A 3EHUA 4U2RA 2RF1A 2QMXA 4IO5A 5CBRA 2Q2CA 3IO6A 3OENA 4JWXA 3TTKA 1SYIA 3MP1A 2Y7RA 1NH8A 2VOZA 3IX1A 4QF9A 2ALUA 1HSEA 3B6QA 3C36A 5ICQA 5KDTA 4OFJA 2UVGA 3KG2A 2G93A 2QRYA 4FAJA 2HZKA 3K6UA 3C32A 2OK2A 2AIXA 1N76A 1Y9UA 1JETA 3F11A 5FHOA 2ONKE 4R6YA 4IB2A 1A8FA 2A5TA 5EHSA 4DLDA 4E0XA 3DP8A 1MXUA 4DE8A 1B0HA 2Q89A 3OELA 1SVXB 1A8EA 1B4HA 1NH7A 4EXKA 1UQWA 3ZKKA 1JW5A 4ZZEA 5LOMA 4R6KA 4JSDA 5AA2D 3TODA 3PUYE 3PPOA 2XX7A 5I59B 4E0WA 4O3AA 3U1OA 5F7VA 4ZE8A 1POTA 1DTGA 4ZEIA 1ZU0A 5CMKA 1N04A 1PEBA 2F36A 1FTMA 2XXVA 4G68B 4R2FA 4PFUA 4HW8A 2DOJA 4U21A 3K1NA 5JK4A 3KGCA 3MWBA 1XVXA 5HBCA 4ZS9A 3PD9A 4ELQA 2BJJX 4F39A 3SERA 2OZZA 2F35A 4FE8A 3VDFA 4IY6A 1LB8A 4F31B 3C4MA 3U8QA 1I69A 4UA8A 2QL3A 2F7BA 5ITPA 1ZBMA 4L17A 1N3WA 4HCYA 3Q29A 3MW0A 4KHZE 2XX9A 5I57B 2RC8A 1SI0A 3V5AA 1ATGA 3DP6A 2XX8A 2XXXA 3MC2A 4YU0A 3O2AA 1HSLA 4F1UA 2F7AA 3AXFA 4R74A 4R9FA 3HHFA 2CZLA 4IGRA 1B1HA 3LBSA 1SW1A 5I56A 3TEPA 2NUVA 1P99A 2Y7PA 1NFTA 3RTWB 5A5XB 1MQHA 1S9TA 4F2QA 5HPQA 3K6VA 2ONSA 4JB7A 1SW5A 1XOCA 2R6GE 3B6WA 5K2YA 2I49A 3FVNA 3RY3A 5FTHA 3OSRA 1US5A 3OMBA 4QSCA 3S9EA 4WEDA 1XHYA 3OD7A 1OVBA 2V3UA 4RYAA 3QUFA 3RT6B 3T9UA 4KFQA 2DSFA 4OWDA 2M8CA 5ELVA 3FVOA 1Y3QA 2XXIA 5DVIA 2QS2A 2ZYMA 4OYVA 3VVEA 1A40A 3IK6B 4X48A 2HXWA 4UACA 3VE1B 4EDPA 2QS4A 1MY4A 1R1NA 4QRZA 3QXMA 1FTKA 2AL5A 3H6VA 2PX1A 3IOVA 1M5FA 3MVXA 1QKAA 2REGA 1MPBA 5KDTB 3O97A 3R6UA 3QUJA 1JNFA 5AA2A 3V89B 4I62A 3OO9A 2O7UA 3KJ7A 5KZTA 2DVCA 1DTZA 3FXQA 3SETA 1BIYA 2UXAA 2QS1A 2A5TB 3B6TA 1LLSA 4U1OA 2O7IA 3HSTA 2O1MA 3MUQA 1B4ZA 3WAFA 4POXA 3P7IA 4YKJA 3DP4A 3CSBA 4OEVA 4QFLA 1IITA 3EHTA 3OO7A 4LZ5A 1VSOA 2V3TA 3FVGA 3H6WA 5IAIA 4QFPA 2V25A 4EQ9A 4OQOA 4Q30B 3R7XA 2ZYOA 2O69A 1VE4A 1B2HA 3C31A 1VR5A 4U4SA 3RQTA 2QPQA 4PFYA 1PBQA 1WODA 3SEUA 1B40A 4DXCA 5CI5A 3OEMA 4EQBA 2DWJA 2ZNSA 1AL3A 4C0RA 2RC9A 3E4RA 1IXGA 3CRBA 2XD2A 3IB0A 1XC1A 4F18A 5B70A 1NNPA 3SKPA 3VLVA 4YMBA 3L6HA 3MP6A 3T9VA 3SEXA 3CI8A 2YPNA 1MQDA 3KSJA 1UIVA 4LZ8A 5ISUA 5ITOA 3TPAA 2IA4A 1PB9A 4Q8RA 3L6GA 1B6HA 3FIRA 1IXHA 2H9BA 3MZ1A 3HHGA 3OOAA 4ZDMA 1RYOA 4G8MA 4G2ZA 4KCCA 5DT6A 4EQ7A 4I1DA 2VD2A 4RJZA 2RC7A 4H65A 1H76A 1SD3A 3VXBA 3PPPA 3IB1A 2F8DA 3TTRA 1LGBC 2O84X 1EZOA 2XXYA 4YAHX 3KEIA 2DP8A 2FA7A 4GFRA 3A09A 3FZVA 4R2BA 1O63A 5JEIA 4OETA 2DWAA 1P1WA 1FTJA 3RUMA 3W9WA 4QSEA 1A7LA 2HQ0A 2E0SA 3C9HA 2E1SA 1N3XA 3K6WA 3A3CA 3DLNA 1GGGA 5CBSA 1PBPA 4O3CA 1J1NA 1IXIA 4DDDA 3ILUB 1OMPA 5IKBA 1TXFA 1TWYA 1NNTA 4DZ1A 4RXLA 2YLNA 1I6QA 1II5A 4F3GA 4YKKA 1MDQA 4F29A 2YJPA 2DVZA 3TELA 3VLUA 2DQVA 2ESNA 1O64A 1N84A 4QFOA 2Y7KA 3FJ7A 2XXQA 3HN0A 4TLLB 1SI1A 3M3KA 1MH3A 3KN7A 3RTFB 5H8NB 2H99A 3QAXA 5AA4B 2F7CA 3G3JA 1MQGA 5KCJA 2H4IA 4K3FA 4X1BA 1Y4CA 3UGWA 5AA2B 4ZEBA 3R26A 2ZYNA 1AOVA 2O1LA 3VVFA 3Q27A 3O6GA 4IO2A 1LSTA 3CIJA 3M3FA 1MXWA 2H98A 2B3FA 4RPNA 1USYE 4BDLA 3BFUA 4U1ZA 4G77A 3I5OA 1FCKA 2H25A 3FGSA 2ABHA 4GD5A 4C1UA 1FQFA 2KLFA 3PGFA 5DVFA 3JZJA 3O29A 4ZEFA 4DCYA 1EU8A 3N5LA 2XHDA 4NWDA 4GOTA 4LQ2A 5L9OA 4OZ9A 2IEEA 3IAZA 4MH5A 3S9NC 2FNCA 4LA9A 1MM6A 2D3IA 2Z23A 3MPKA 1UTBA 4IO7A 3JYRA 3IR1A 5I58B 3ZS6A 2F6PA 2VHAA 4G8NA 1B5IA 4OEUA 1GR2A 1VFDA 1NNKA 3CVGA 3VV5A 2Q8JA 3RPWA 4BDMA 1TFAA 3S2VA 1LFIA 2NVUB 3PMWA 3CFZA 4ND9A 2I3VA 3SESA 4NF8B 3QIMA 1MQJA 3PU5A 3C33A 3I3VA 1SYHA 1RYXA 1ZMGA 4AQ4A 2Z8DA 4ZECA 1B3FA 5AA3A 3TFLA 3MZBA 4YZZA 2Z8EA 4LP2B 2Z22A 2NWJA 5TPAA 4LVQA 4P11A 4RPOA 2F5XA 4FEDA 1M5CA 1QKBA 3IJXB 2GRVA 3T66A 1B5JA 3KSXA 4YB7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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