2NUVA

Crystal structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with atenolol at 2.25 a resolution
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with atenolol at 2.25 A resolution
rcsb
total genus 108
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2nuvA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2nuvA02
1BLFA 1IIWA 4I9DA 5I2NB 3IJXB 3TQWA 3CFXA 3FV1A 3DP4A 4GL0A 2RKMA 4DZ1A 5FHMA 2YLNA 1CE2A 1LCFA 4OFOA 3C34A 2GH9A 3EHUA 1N04A 3IOVA 1SYIA 5FHNA 1MXXA 2ZYOA 1OVBA 4QFNA 4F1YA 3HN0A 3L6HA 5ELVA 2Z8EA 3KGCA 5HBCA 3Q28A 3K2DA 3UORA 1EZOA 2I3WA 5K2YA 3KN8A 1MQHA 3FVKA 4MLVA 3SESA 1PBQA 4KCCA 3TYHA 3VVDA 4RPNA 3TCFA 1D3KA 1ZTYA 4KFQA 1IXIA 1ZLQA 3VVFA 3MAMA 1US4A 1UTBA 5ICQA 4MH5A 2XXQA 4LA9A 1B5JA 3K6WA 4O3BA 1H76A 4XKQA 3B6WA 1RYXA 1VFDA 3IO4A 1LB9A 4IO6A 2Y7IA 3VDFA 3HSTA 4BDLA 1UTHA 1EH3A 1LAGE 2PX1A 3PD8A 3PPOA 4TLLB 3E4RA 4DXUA 2P0SA 1VSOA 4G8MA 1JW4A 4YKIA 4KR5A 4R9FA 3SEWA 3B7DA 3KOTA 2ALUA 2GHBA 2QSXA 2V84A 2DYXA 1QKBA 3C36A 2DP8A 1FQEA 1D4NA 1MG1A 1NL5A 4MBPA 5A5XA 1WDNA 1MXYA 3IL1B 4AB6A 4GD5A 2I48A 3GLBA 3TCHA 4TLMB 2DE3A 2XXRA 4QFPA 4U1ZA 3OOAA 3O66A 3PPPA 3VV5A 4EQ7A 3TMGA 1JW1A 3BFTA 5FHOA 4O3AA 1LFHA 4QSEA 2QPQA 1MY2A 1ZBMA 4M1VA 3V8XB 3M3KA 3M3FA 3K1PA 3KEIA 2H4IA 3MP1A 2XXYA 3Q26A 4OENA 1NFTA 3DLNA 2PT2A 1FCKA 3MPLA 5L9OA 2FYIA 3TTLA 3C9HA 2DE4A 4QSCA 3JYRA 1UTBB 2F36A 2FA7A 2O7UA 5DEXA 3O9PA 2FNCA 1DTZA 2NXOA 2F97A 3EF7A 4NF6A 1HSLA 3PMWA 4BDOA 2B65A 3CRBA 5AA3A 1A99A 3HPIA 4KYEA 3UGWA 4JWYA 4KPTA 1B7ZA 4LZ5A 1EZ9A 3TQLA 5AA1A 2UVHA 3CVGA 3VVEA 3GZGA 1XVXA 2G93A 4XKPA 2ABHA 4ONYA 2I0CA 2Q9TA 2X7PA 1NNTA 1UTHB 3C31A 1M5EA 2UXAA 3UP9A 5H8NA 1P1QA 4XKNA 5L9MA 1JNFA 5B7DA 3OEMA 3SETA 1TWYA 1OLCA 1H45A 1SYHA 4DE8A 4YKJA 3EPEA 4MLQA 4H67A 4YMAA 2XXPA 2XXHA 5I56A 2F78A 3TCGA 4OERA 4R6YA 2XHDA 2ZNUA 1T0KA 3OO9A 1I6QA 4I1DA 1PC3A 2Q89A 3FXQA 2O1MA 4PQJA 4YKKA 1EZPA 3LSLA 2RC9A 4E0WA 4GXSB 4X9TA 4WKMA 1LBBA 4WEPA 4QFOA 5IAIA 1QUJA 3FATA 2H25A 3TTNA 4H65A 2QS2A 3LSXA 4QF9A 4EDPA 4JBZA 5H8SA 4U21A 1A40A 1PBPA 4TOZA 4R75A 4ELRA 5DEXB 1QVSA 1POY1 4OFLA 3C32A 3IK6B 4NF6B 1AMFA 4R9GA 4XIGQ 5KCJA 3PUVE 3G7WA 1KWHA 5DT6A 1B4ZA 4F3SA 2YJPA 1B40A 1D9VA 4OYVA 2O68A 3DP6A 4BDMA 1AOVA 5H8NB 3IB1A 4ELQA 3G3HA 2NOOA 3H6VA 2Z8FA 3VLUA 5FTIA 4KYDA 1DPPA 5TP9A 2A5TA 4POXA 3H4ZA 5I56B 3K4UA 2B3BA 2QMXA 4G8HA 4EQ9A 1S7YA 3MC2A 4ZE9A 3OSQA 5CRYA 4Q8RA 3N6TA 2PYYA 1PDAA 1F9BA 4NF8A 4Q0CA 2LAOA 3HHGA 2V3UA 4WEDA 3H6TA 3FV2A 1MM7A 3KFMA 3S9MC 5IKBA 4ZEKA 3I5OA 4H8IA 1JETA 3CFLA 4NF5A 1O7TA 4TQUQ 2ONKE 3OO7A 4EXLA 2DWJA 1USYH 4YU0A 1HSEA 1IXGA 3THIA 4JXIA 2BJJX 3MZBA 4G4PA 1MDP1 2HZLA 4O3CA 3LR1A 4F31B 3N94A 1MY1A 1MXZA 1IQ7A 3SKPA 1N7XA 1Y3NA 1N76A 3W9VA 2QS1A 1PEBA 2GFEA 5JEIA 4G68B 5I2KA 2F7CA 2R9JA 4F3PA 5KCJB 2NWJA 1JVXA 3KSJA 3EQ1A 1D9YA 1RYOA 4GWOA 1R9QA 2UYEA 1MQDA 2QJEA 5BUUA 1SD3A 1UIVA 1ZU0A 2D3IA 4RA1A 4AQ4A 2RC8A 3Q25A 3SEYA 4OETA 2OLBA 3VLWA 3CSGA 4GLIA 1I69A 4DLDA 2XX8A 4HCWA 3MUQA 5TP9B 2A5TB 2P2AA 2DWIA 3MVWA 4RY1A 4GOTA 3MZ1A 2V3QA 2Q88A 1XVYA 4U4SA 4ZEDA 5CI5A 3PUWE 4H6DA 2AL4A 1JEVA 2OZZA 3TTRA 4PE5B 4NF8B 2ANJA 2IA4A 4F19A 3KG2A 1MPDA 1IEJA 3DELB 2VD2A 2W7YA 1R6ZA 5DVFA 3RT8A 3TKDA 5I59A 1VE4A 4NF5B 4K3FA 3G3GA 5H8HB 1A8EA 5AE4A 4LZ7A 5FTHA 4Z7EA 4JWXA 1P1OA 2DE2A 1M5FA 4R72A 1LAXA 3S9EA 4N13A 4KCDA 1P1NA 3G3FA 2DVCA 2REJA 2XXIA 1BTJA 2DOJA 3KSXA 4FE8A 1CB6A 4HCYA 4LQ5A 4IB2A 1SW2A 3QIMA 4GRKA 1FTLA 3KZGA 4DCXA 3QK6A 3OO8A 1MQIA 5I2KB 1MH3A 4IGRA 3H3GA 4NF4A 3VXBA 3K0VA 3CR9A 3UA8A 4C1TA 3OELA 4FATA 2RC7A 2ONSA 2O84X 4L17A 2V3TA 5DYHA 3RLFE 3PUYE 3EN3A 5CMCA 2F34A 3D4CA 1SW4A 1B3EA 2X26A 1Y3QA 4ECFA 1NNPA 1URDA 5AA2B 1B1XA 1Y1MA 2ZXTA 3O6HA 3P7IA 3WAEA 1NKXA 3OXNA 3BKIB 4R2FA 1Y9UA 2PBWA 2VOZA 3TAJA 2I3VA 3U8QA 2F7AA 2Z8DA 5I59B 4DXCA 4N07A 3VFJA 1LB8A 5EHSA 3S9NC 3IJOB 5H8QA 1A54A 3TUSA 1MY0A 4NWCA 4ZS9A 4IO7A 4IO2A 4JSOA 4MF3A 3QUJA 1IITA 5I57A 5K2XA 3RUMA 4EF1A 1BIYA 4OEUA 5JTYA 3DP8A 3MP8A 4NF4B 1IXCA 1VFEA 2XD2A 2NVUB 1B1HA 3MBPA 2F6GA 3SDFA 2DXYA 1HSJA 3FJGA 1ANFA 4YAHX 3R6UA 3T93B 4G8NA 2DXRA 2ZNTA 2ZYMA 1ATGA 4PFTA 2H98A 4F39A 3IORA 4U2RA 4GF8A 3U93A 2AIXA 3LUYA 1TXFA 3IR1A 1ZJLA 3TODA 3VE1B 4ESWA 3TEPA 1YTVA 2XXWA 3MVXA 4FAJA 3EHTA 2XXXA 4OMBA 1MPCA 4BDNA 3QSLA 1Q1KA 2QS4A 4RNSA 4H0WA 1SW5A 1Y4CA 1LAFE 1M5BA 4KI0E 3M3LA 1OQGA 5CMMA 5A5XB 3IAZA 4LVQA 4F29A 1I6BA 3BBRA 5EYFA 3IO6A 1H44A 5F7VA 1XHYA 2ZYNA 1QUIA 4FIMA 4NEDA 3N5LA 5H8QB 3CIJA 3T96B 2F6PA 3OMBA 3EHSA 3MPKA 1JW5A 4EXKA 2RCAA 1FQCA 5I57B 3U92A 4OFJA 2PMSA 3K6VA 2I49A 3RGYA 5TPAA 4ZZAA 3C35A 2YPNA 4H5FA 1QJMA 3PPRA 3O28A 5DVIA 3SEUA 4ZZEA 4NMYA 3H06B 4HW8A 3B6QA 1DPEA 3TPAA 3ZKKA 3N26A 3UIFA 1XOCA 4LZ8A 2DWHA 3U72A 1NNKA 2O1LA 4C1UA 3ECRA 3DM0A 3KBRA 4DIGA 3FD3A 2REGA 4GL8A 2WKYA 4XTCQ 1MXWA 4PFUA 1B7HA 2OBGA 4E0XA 2CZLA 1SW1A 4KYSA 3I3VA 2B3FA 2HZKA 3QUFA 1H43A 1IXHA 1JEUA 3CSBA 3L6GA 4ELOA 3ONMA 2UVGA 2GRVA 3LSWA 2UYFA 5AA4A 3A3CA 2D5WA 3FUZA 1MY4A 1B46A 3T9UA 1B4HA 4DDDA 3I6VA 1MRPA 1GVCA 1MS7A 3HCQA 1B2HA 3KN7A 3RTFB 1YPNA 1URSA 2QMWA 1VR5A 1DOTA 3VLVA 5ISUA 1N84A 3TZAA 1PB7A 2PT1A 1LFGA 1B52A 1P99A 3T9HB 2AYSA 3PUXE 3V83A 1ELJA 2F7BA 1FTOA 4RPOA 2RF1A 2OK2A 1B5IA 4KHZE 3OD7A 1Q35A 1P1UA 5DVJA 4GFRA 4FJPA 4OZ9A 2PVUA 4QRZA 4MFIA 1DTGA 1QUKA 3FVOA 3M8UA 2Y84A 4U23A 1Y20A 3F11A 1LLSA 4YB5A 1WVJA 3MW0A 4I8CA 1SQYA 1USYE 1ZMGA 3IOTA 5I84A 4Q5TA 4F2QA 4ZEFA 3PGFA 3G3JA 2F8DA 3R26A 3HHFA 5L9SA 4RK9A 2I4BA 1TFAA 2OWTA 4U22A 3K01A 2ZYKA 5CC2A 1AIVA 1M5CA 1B6HA 1IUDA 4F1UA 2HEUA 1N7WA 3SEVA 5CMKA 1MH4A 5ITPA 1OQHA 5H8FA 4ELPA 4IGTA 3JV9A 4JB7A 4QHQA 3ZSFA 3W9WA 1TFDA 4AB5A 4FEDA 1AH5A 2O51A 3IB0A 3QAXA 4IO4A 3IX1A 5AA4B 3FXRA 3VXCA 4ZECA 3MJNA 3ODBA 5CMBA 4F22A 1ZIUA 4G77A 1MPBA 3K1MA 4LONB 5KZTA 4H8JA 1B3HA 3IOUA 1B9JA 5KDTA 2Y7KA 2DQVA 3HV1A 1A8FA 2XXTA 3FVNA 2VD3A 3G3IA 1LAHE 1SI0A 1B05A 4JSDA 3ZKLA 3ZS6A 5F1QA 4XKRA 1II5A 2V25A 2UVIA 3KJ7A 2HQ0A 5CM6A 2AL5A 4OWDA 1B0HA 3T9VA 1URGA 5EHMA 2E0SA 3GBBA 1UIUA 3OSRA 4H5GA 3K00A 4Z0IA 1MM6A 2NUVA 3D4GA 2KLFA 4H1XA 4THIA 1LBCA 1R1NA 4M4GA 2D21A 1NH8A 3RPWA 3OO6A 1FW0A 4EUOA 4OEVA 2Q2CA 3W15C 4R6KA 2HCAA 4UA8A 1B32A 4GIZA 5B70A 1M5DA 1N0TA 4OHNA 4XXUA 3R7XA 2Q8JA 5AA2D 3H03A 5H8FB 4F3BA 1FTKA 2RINA 3IOWA 4F1VA 4YICA 1GGGA 2E1SA 1B0LA 1UQWA 4GXAA 1BP5A 1FQBA 3H6WA 3K02A 4ZDMA 3K6UA 2ZNSA 1WODA 2HAUA 4R73A 3A09A 4EQBA 2Y7PA 1A55A 5M2VA 1OVTA 3UK4A 5HM4B 3HO7A 2F35A 2HAVA 5KDTB 3V5AA 5I58A 1DSNA 2XXUA 3RN8A 3KJTA 1IZ1A 2R6GE 4PP0A 3LSFB 4PFWA 3S2VA 5HPQA 3A3UA 2DSFA 4KD5A 3CI8A 3LC8A 1QW0A 3E9XA 2G29A 4QFLA 3RT6B 1S50A 3MWBA 1L5TA 1A7LA 3FIRA 3PU5A 1SBPA 2Z23A 3OEKA 3PV0E 4JWOA 1POTA 3FGSA 2H99A 2RCBA 1US5A 3E13X 3O97A 3U94A 1NMUA 3T22A 3B6TA 2DS9A 3O6IA 4ZEBA 4YB6A 2X7QA 3PMXA 4KQPA 1RKMA 3MVZA 1B3LA 4FORA 3MP6A 2XX7A 3IB2A 2V93A 1J1NA 4YB7A 2OJTA 4IY5A 3O29A 1N3XA 3MQ9A 2Z22A 4G2ZA 4NTLA 2QS3A 4DXBA 1MDQA 3ILTB 1MQJA 2VP1A 1PB9A 5BWJA 3MZ9A 2H9BA 4IO3A 1MXUA 4LUBA 1R9LA 4LATA 2R71A 1FQFA 4QSDA 1FTJA 2OWSA 4F3GA 1Z7ME 1FQDA 3K6XA 4JDFA 3USDA 4LQ2A 5I58B 3QYTA 1NH7A 1Y4TA 1QULA 4RYAA 4ND9A 3G3KA 4R2BA 2Y7WA 4NE4A 4C0RA 2H5YA 1ZKBA 4IY6A 4POWA 3OENA 3C4MA 3KN3A 1O64A 1YAEA 1XT8A 1LCTA 4OTEA 2DVZA 4GQOA 4BDQA 1JVYA 4F18A 4UACA 1JQFA 3PD9A 4N6PA 1OIBA 4ZEIA 1LSTA 2GHAA 4HTGA 5JTYB 4YMBA 3PUZE 2M8CA 2O69A 4FEBA 1B58A 3ILUB 3O6GA 3V89B 1S9TA 2IEEA 4YZZA 1Y3PA 5ICTA 1B7UA 4RJZA 4OQOA 4FECA 3RY3A 3FJ7A 3UN6A 1MY3A 4OVJA 1AL3A 5DTBA 3H7MA 1P1WA 1SI1A 2I58A 3C33A 3PMVA 5L8DA 1SVXB 4G68A 4ISUA 1SDXA 2A5SA 4YKPA 1GV8A 5J1DA 4F2OA 1B3FA 2F5XA 3PPQA 3Q27A 1LGBC 2I0BA 2VHAA 3KOSA 1EU8A 4G68C 4IO5A 2O7IA 3SEXA 2I6EA 3GXAA 3T66A 4WXJA 3QXMA 2THIA 1DMBA 3TDJA 3RQTA 4HS7A 2ONRA 3CFZA 3T9XB 3FZVA 1N3WA 4R6HA 1MXVA 3JZJA 3PPNA 1B5HA 5ITOA 1PB8A 2QL3A 3N6UA 4OXVA 1MQGA 1XS5A 2ZMBA 4ESXA 3RNNA 1Z7NE 5CBSA 1I6AA 1QKAA 4BLAA 4DCYA 4P0GA 4PETA 2Y7RA 3K1NA 2XXVA 1GTKA 5TPAB 4ZE8A 4LP2B 4U1OA 3LBSA 3S4UA 3TTMA 5I2NA 1XC1A 4PFYA 3GBAA 1OLAA 3U1OA 5H8HA 1TT1A 3SERA 4RXLA 2Q2AA 5LOMA 2I4CA 1H3DA 3TELA 4Q30B 2O6AA 1O63A 3FASA 1B3GA 1GR2A 3Q29A 4P0IA 4OESA 1OMPA 3FVGA 4QFKA 2UVJA 2VGQA 3E3KA 4BDRA 5TU0A 3RTWB 3AXFA 1LFIA 3H6UA 3TTKA 2HFBA 1BKAA 1YCJA 2P1SA 2ESNA 3TFLA 1FTMA 2OCUA 1Y1ZA 5CBRA 4R74A 2DWAA 3FJMA 1B51A 2QRYA 2HXWA 4X1BA 1NNFA 5AA2A 4X48A 2XX9A 3S9LC 3CG1A 4NWDA 3BFUA 5JK4A 3CG3A 4U4XA 3FXUA 2CMOA 4P11A 4RK2A 4EF2A 3MVYA 3O2AA 4I62A 4X1DA 4GVOA 2XD3A 3WAFA 1FQAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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