2NUVA

Crystal structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with atenolol at 2.25 a resolution
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with atenolol at 2.25 A resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 108
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2nuvA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2nuvA02
4U4SA 5I59B 2I0CA 3PU5A 3CG1A 3OXNA 3C32A 3M3KA 4I8CA 5FHMA 5AA2A 3C35A 4G8NA 3UP9A 1AOVA 2Q9TA 1LAFE 3FIRA 4LVQA 3I5OA 2B65A 4E0XA 1LFHA 1LAGE 3G3IA 3K6VA 3KGCA 3O28A 1MDP1 4KYEA 4U21A 4YB6A 3S9EA 3D4CA 1FTLA 2I4BA 3VV5A 4DXUA 1B9JA 4ZEBA 3DM0A 3K00A 1ZTYA 2QS4A 2GFEA 3O2AA 2HAUA 3E3KA 3L6HA 1SD3A 3IR1A 3QSLA 4NF4B 3TCGA 4U4XA 4UA8A 4YKIA 1N3XA 2HXWA 1DSNA 2ESNA 2X7PA 1MM6A 1XOCA 2DWIA 4JWYA 1A99A 5TPAA 3U1OA 3UGWA 3EHTA 5I56B 3HN0A 3MQ9A 4R72A 3CFLA 1JEUA 1P1QA 4HCYA 4Q5TA 5ICQA 3G7WA 1B0LA 4QFNA 4F39A 3Q29A 4DXBA 3CSGA 2Y7PA 1TT1A 1UIVA 1UTBB 2XXRA 1EU8A 3OEMA 3W9VA 3OO6A 5H8QB 3LUYA 4R6KA 5I2KB 1L5TA 4H65A 1RYOA 3IB2A 1MPDA 4G8MA 2GRVA 3RLFE 4KI0E 1Y9UA 3PPNA 5AA2D 3Q26A 1B32A 3DP6A 4RYAA 3MVXA 1N0TA 4YMAA 2DQVA 2V84A 3C33A 3M8UA 3VXCA 1JW5A 2ZYOA 4YAHX 4ZZEA 1EZ9A 1MY3A 1QUJA 2QRYA 3WAEA 3FXQA 3MZBA 3MZ1A 1JVYA 1B4HA 4R6YA 1P1UA 1LFGA 1NH7A 1B7ZA 5F1QA 1UTBA 3D4GA 1B52A 3G3FA 1POTA 4LUBA 1QW0A 4ELQA 3GBAA 1B5IA 1ZMGA 5H8NA 3MP8A 4YKPA 3S9LC 1P99A 3QK6A 2HAVA 4TLMB 3OELA 3C34A 5AE4A 2QS1A 5CMCA 1LGBC 2X7QA 3UK4A 2ANJA 1PB9A 4LZ7A 1US5A 1CB6A 3H6VA 3KFMA 1Y3NA 1M5BA 2VD2A 5AA1A 1OQHA 3QXMA 2QL3A 4OZ9A 1R6ZA 4TLLB 4BDMA 4ZEIA 5A5XB 4C1UA 2NUVA 3HSTA 4G68C 4U1OA 2X26A 2Y7IA 3FVNA 4RK9A 2F6GA 2Z8FA 2OZZA 1B4ZA 3FJMA 5DVIA 4R9GA 3MWBA 3SEXA 4XTCQ 5DVFA 1POY1 4GFRA 2HEUA 2F7CA 1CE2A 4BDQA 1PB7A 5AA2B 1SYIA 1JQFA 1B6HA 4F1VA 3U72A 5A5XA 3W15C 1IITA 1F9BA 4NE4A 4YB7A 1D4NA 1D9YA 1FQDA 2RC9A 2IEEA 2O68A 1OLCA 2O69A 3DLNA 4HCWA 4I1DA 3SEUA 5I57B 4Z0IA 1N04A 1URSA 3G3GA 4OTEA 1LCTA 1OMPA 4XKPA 3FATA 4F18A 2F35A 3SETA 5KDTB 2Q2AA 1R9LA 2QMXA 4NF6A 2UVIA 1JNFA 4OMBA 3IOUA 1YTVA 3RTWB 4BDNA 3I6VA 3SEWA 2XXQA 5CMBA 3GZGA 1QKAA 1MH3A 3ZKKA 1B3FA 4NF5B 4Z7EA 3FVKA 1LBCA 2I58A 1MQJA 1FQBA 4NF4A 1YAEA 3RPWA 2DYXA 3MP1A 2I3VA 2YPNA 3M3FA 5TU0A 4LP2B 5M2VA 4PFYA 1ANFA 4EQBA 2DXYA 4UACA 3IO4A 5ELVA 2CMOA 3RT6B 1ZBMA 3LC8A 3S4UA 3CSBA 4F1UA 1B40A 4OEUA 2QPQA 1MQDA 3MUQA 3IJXB 2XXXA 3PUYE 4G8HA 2UVGA 1VFEA 4NF5A 3VLWA 2I0BA 4OERA 5L9OA 4TQUQ 4BDOA 4DCYA 1N7XA 3K02A 2DE2A 5ITPA 3N6TA 1WVJA 4N13A 3TTKA 3ILUB 4JB7A 3P7IA 3TAJA 4QF9A 4RPOA 4KCCA 3GLBA 2DS9A 3EQ1A 1BLFA 5HPQA 4GWOA 1JEVA 1LB9A 4R2FA 1NNTA 1NL5A 1B7HA 4RY1A 1Y1ZA 2NOOA 2NXOA 4F3PA 1HSJA 1KWHA 3A09A 3RQTA 5ICTA 2ZNSA 2FYIA 3SEYA 3QYTA 1M5FA 3DP8A 3OO9A 3R26A 2HCAA 4KQPA 4OFLA 4EXKA 4G68A 5JTYA 3CFXA 1XHYA 3C31A 4R74A 3H3GA 3TZAA 2VP1A 1DPEA 1B51A 4RJZA 4YMBA 3FVOA 1FTMA 3IO6A 4EF2A 3MPLA 4ELOA 5BUUA 5KZTA 2YJPA 2XXIA 3G3HA 3E13X 4QSDA 3FASA 2OWSA 4DXCA 3LSXA 3EPEA 1LCFA 5H8HB 1R1NA 4NTLA 2A5SA 4OXVA 1M5CA 2R9JA 4PFWA 4QFOA 1DOTA 4YU0A 3K2DA 1B2HA 4NEDA 2O1MA 4GL8A 4YKJA 4F19A 4H0WA 3CVGA 1SI0A 3KBRA 2HFBA 4TOZA 1R9QA 4MFIA 1T0KA 1B3EA 2O1LA 3S9MC 3TMGA 4FAJA 4OFJA 4IY5A 1TXFA 3H03A 1P1OA 2V3QA 4R9FA 3TKDA 2F97A 1A54A 1Y20A 1ZLQA 1PBQA 2UXAA 1XT8A 3IB0A 1O64A 4X1DA 2Y84A 3GXAA 2Z8DA 1SDXA 4OVJA 4Q30B 3WAFA 4IO4A 2ZMBA 4N07A 5FTIA 4P11A 2CZLA 2RKMA 3HPIA 3A3UA 1N3WA 1PC3A 1Y4TA 3OO7A 4F3BA 1I69A 1LAXA 5FTHA 1RYXA 1J1NA 3UORA 4ELRA 2F6PA 4QHQA 2O7UA 3MW0A 2Z8EA 4PETA 4LATA 1M5EA 1MXYA 2QMWA 5DEXB 4RK2A 4PQJA 2M8CA 2RCBA 3ECRA 3FGSA 2PX1A 4L17A 1B05A 3TTMA 3K0VA 3OO8A 3VVDA 5I2NB 3JZJA 1BP5A 3W9WA 3FZVA 3IJOB 4QSCA 3RUMA 2FA7A 1MH4A 1N76A 2D21A 4IGTA 1MXWA 2O6AA 3RT8A 5B70A 2AYSA 4G68B 3H6UA 1B7UA 1B46A 3ILTB 3Q28A 2P2AA 4P0GA 4ZEKA 4I62A 3HCQA 1EH3A 2DE4A 3N94A 3OSQA 1A8FA 4QSEA 2OWTA 3HHFA 3B6QA 4LZ8A 4MBPA 1FW0A 2IA4A 4PE5B 2I6EA 3SKPA 3PMVA 4HTGA 3IOTA 3K1PA 2ALUA 1OVBA 5AA3A 2FNCA 4LA9A 2XHDA 4E0WA 2QS3A 3H4ZA 1MG1A 3OSRA 1S7YA 1NNFA 3E4RA 3GBBA 3IOVA 1B3HA 4ZECA 1XVYA 4EUOA 1IIWA 1QKBA 4AB6A 2REJA 1IXIA 5I59A 1XS5A 1SW5A 2UVJA 4RXLA 5CMMA 1AL3A 1USYE 1O7TA 1S9TA 1PB8A 4XKNA 3MJNA 1Y3QA 4AQ4A 1OLAA 1ZJLA 4KYSA 4P0IA 4YKKA 1ZKBA 2ZYKA 3BBRA 4GIZA 3MC2A 2B3FA 1URDA 3QAXA 5CBRA 2DWHA 5I58A 2VD3A 4DIGA 3R7XA 1OVTA 5EYFA 5H8FB 4EQ9A 4F29A 3T93B 5IKBA 3O9PA 2VGQA 4U23A 4ZE8A 4RA1A 3RN8A 3ONMA 4H1XA 4QRZA 3ZS6A 3RNNA 5JEIA 1US4A 2HZKA 5J1DA 1XVXA 2V3UA 2F78A 5CMKA 1PEBA 1YCJA 1Y4CA 3KJTA 1MPBA 2UYEA 3FJ7A 1MPCA 2XXYA 1O63A 3O6IA 3IK6B 5DEXA 3MVZA 5AA4B 3ODBA 4FATA 2HZLA 4OQOA 1GR2A 5DVJA 5DTBA 3N6UA 3T66A 4F3GA 3PMWA 4GF8A 1M5DA 1UQWA 2G93A 3LSFB 4KCDA 4RPNA 3T96B 4F3SA 3G3JA 4JWOA 5I57A 3TTNA 3EHSA 4KR5A 1MXUA 2H4IA 3R6UA 3BKIB 4OESA 5H8QA 3FXRA 5H8HA 3TFLA 3TODA 5I2KA 5AA4A 4FE8A 4GXAA 3QIMA 1A40A 1USYH 3PUXE 4H67A 1IXCA 3TDJA 1LAHE 4JSDA 4R2BA 1B1HA 1LLSA 3K1NA 3OEKA 1FCKA 3SDFA 5KCJB 2RINA 2ONSA 3I3VA 1FQFA 2UYFA 2PT1A 4F31B 4U1ZA 5TPAB 5DYHA 3PUVE 1IZ1A 5K2YA 3V5AA 4ESWA 2AIXA 2DSFA 2G29A 3C9HA 3JV9A 3O97A 4U22A 1I6QA 2OCUA 3F11A 1FQAA 2F7AA 5ITOA 1II5A 3C4MA 4GL0A 4F2OA 4ZZAA 3PD9A 4XKQA 1PDAA 1NFTA 4OFOA 4IO5A 2DE3A 2REGA 3MZ9A 4KFQA 1BTJA 3FVGA 2F36A 1Y1MA 4O3CA 4XKRA 4ZE9A 1GGGA 4MLQA 2XD2A 4OHNA 4M4GA 2XX9A 4N6PA 4EQ7A 2Q2CA 2XX7A 2Z23A 3HHGA 3SEVA 5KCJA 1B3GA 1MDQA 5DT6A 1SW1A 1ZU0A 3AXFA 3HV1A 2PVUA 4QFLA 4QFKA 3H06B 1MXVA 1UTHB 2F7BA 3FUZA 1IUDA 1H44A 1MRPA 3O6HA 4GRKA 4NMYA 2AL5A 3RY3A 3USDA 1B5HA 2D5WA 4JSOA 1QULA 2Y7KA 1FQCA 3FV2A 3N26A 1Q35A 1GV8A 4ELPA 1HSEA 4LONB 1LB8A 4OEVA 3LSWA 1MM7A 4WKMA 1B1XA 4X1BA 4GLIA 4WXJA 1MXXA 3KJ7A 3PUWE 4DZ1A 2GHAA 3IOWA 3MPKA 4H5FA 5H8SA 4KPTA 2XXPA 3SERA 1B3LA 2E1SA 4ZEFA 1DTGA 1UIUA 1VSOA 1YPNA 2DWJA 4F2QA 1URGA 2QJEA 2A5TA 2DWAA 2WKYA 5CC2A 2Q8JA 5LOMA 2H98A 2XXHA 2DVCA 2ONRA 3PD8A 4GXSB 2OBGA 1IQ7A 3DP4A 1FTKA 3T9VA 1Q1KA 4XIGQ 3TUSA 1OQGA 4ZDMA 3SESA 4LQ5A 4C1TA 3H7MA 3PGFA 4M1VA 1GVCA 3FV1A 3KN8A 4ZEDA 2Y7WA 4BDRA 3LSLA 4WEPA 2H99A 2RF1A 1ELJA 2BJJX 2H5YA 4GQOA 4GVOA 4PP0A 3V89B 2F8DA 1MY2A 3IL1B 2O7IA 3T9HB 3THIA 5BWJA 4KD5A 1SW4A 2XXVA 1FQEA 2D3IA 3K01A 3Q25A 2I48A 3PUZE 4IB2A 1TFDA 4RNSA 2ZNTA 3HO7A 2VHAA 2QS2A 4JWXA 2ZNUA 3UN6A 4HS7A 2DP8A 4YZZA 4KYDA 3VDFA 3FD3A 1S50A 3TQWA 2GHBA 3H6TA 4ISUA 5KDTA 3IB1A 2AL4A 2ZYNA 1QJMA 3K6XA 4MH5A 5K2XA 5FHNA 2KLFA 3E9XA 1I6AA 1NNKA 1QUKA 2I3WA 1JETA 2F5XA 4Q8RA 3IORA 1VFDA 1BKAA 3LR1A 1N84A 4OETA 5TP9A 5FHOA 2OLBA 1MXZA 3VFJA 2XX8A 1FTOA 3CIJA 4F22A 1P1NA 5IAIA 1IXHA 1NMUA 1Y3PA 3VLUA 4R6HA 3ZSFA 1NKXA 1Z7ME 4JBZA 2DOJA 3TCHA 3IAZA 1SVXB 5H8FA 1N7WA 2Q89A 1I6BA 3B6WA 2XXUA 1MQIA 3OENA 3BFTA 3KN3A 4FEDA 3K6WA 2XXWA 1B5JA 3KZGA 1WDNA 4G4PA 3VVFA 1QVSA 5L8DA 1DMBA 3TCFA 4ZS9A 1TWYA 3V8XB 4POWA 4ESXA 3UIFA 4C0RA 3A3CA 3KOTA 4MLVA 5HBCA 1B0HA 1DTZA 3UA8A 4NF8A 4H8JA 4IO2A 2Z22A 1MS7A 3PPQA 5EHSA 1QUIA 2O84X 4O3BA 4H5GA 2Q88A 5JTYB 4DE8A 1WODA 2PYYA 5H8NB 3EF7A 2YLNA 4PFUA 2OJTA 3Q27A 3FJGA 5JK4A 1TFAA 5HM4B 3OMBA 4YB5A 1SYHA 1NNPA 1OIBA 2R71A 3H6WA 3FXUA 4I9DA 2LAOA 3PPOA 4FJPA 2NVUB 4NF8B 4DCXA 4F1YA 5I84A 1AIVA 4POXA 3VVEA 3S9NC 3K1MA 3M3LA 2RCAA 1JW1A 2V3TA 2PMSA 2OK2A 2THIA 4Q0CA 2P1SA 3MP6A 4LZ5A 3U94A 2V25A 4EF1A 1D3KA 1VE4A 1ZIUA 2E0SA 4ND9A 3CRBA 3U8QA 3VLVA 4DDDA 1AMFA 1MY4A 3KEIA 1MY1A 4NWCA 5ISUA 3TTLA 1JVXA 3VXBA 5CI5A 2O51A 2ZYMA 1BIYA 2W7YA 3BFUA 1D9VA 1UTHA 2RC8A 4H8IA 4IO3A 2I4CA 4THIA 3T22A 1XC1A 4R73A 3CFZA 4IO7A 2Y7RA 1RKMA 5L9MA 1MQHA 2PBWA 3MAMA 3PV0E 5TP9B 5CBSA 4G2ZA 4OWDA 3TTRA 5CM6A 2I49A 1P1WA 4G77A 5B7DA 1EZOA 4AB5A 2ABHA 3K4UA 4YICA 2GH9A 2H9BA 3VE1B 2RC7A 3V83A 4KHZE 1MQGA 2B3BA 2F34A 2XXTA 3TELA 4H6DA 5I58B 4FIMA 3IX1A 3T9XB 3TYHA 3JYRA 3QUJA 3PPRA 3K6UA 4GD5A 4IO6A 4X9TA 1H76A 2DVZA 3CR9A 1ATGA 1FTJA 4JDFA 3PPPA 4XXUA 4NWDA 5CRYA 3RTFB 4EDPA 5I56A 5I2NA 3C36A 4OENA 3TQLA 1DPPA 4FORA 5EHMA 3S2VA 3KN7A 4HW8A 2DXRA 3MBPA 3L6GA 2PT2A 3KG2A 4PFTA 3KOSA 1AH5A 4U2RA 5F7VA 2ZXTA 3O29A 1SW2A 3LBSA 3TEPA 1SQYA 4QFPA 1A7LA 4R75A 1Z7NE 1LSTA 1PBPA 1SBPA 4BLAA 3OOAA 3RGYA 2ONKE 3KSXA 3O6GA 4FECA 4JXIA 1GTKA 1HSLA 3U93A 4WEDA 3ZKLA 4BDLA 4O3AA 3EN3A 4K3FA 3PMXA 5L9SA 2R6GE 1A55A 3N5LA 1NH8A 4NF6B 3T9UA 4DLDA 3DELB 2H25A 1IEJA 3B6TA 1H3DA 1LBBA 3CG3A 3O66A 1H45A 2QSXA 4IGRA 1IXGA 2A5TB 2HQ0A 2P0SA 3MVYA 3B7DA 3OD7A 4IY6A 4GOTA 4X48A 2XD3A 2NWJA 3G3KA 1LFIA 3TPAA 4FEBA 4MF3A 1H43A 4OYVA 3MVWA 3QUFA 3EHUA 3U92A 1B58A 1JW4A 1MY0A 3KSJA 1A8EA 3CI8A 1SI1A 4LQ2A 1VR5A 4ECFA 4EXLA 4ONYA 2V93A 2VOZA 1EZPA 2UVHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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