2NUVA

Crystal structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with atenolol at 2.25 a resolution
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with atenolol at 2.25 A resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
total genus 108
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2nuvA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2nuvA02
1Y1ZA 2CZLA 1NKXA 1QUIA 2ZNTA 5CBRA 1O63A 4N6PA 1Y1MA 3BKIB 4GL0A 4FE8A 4YICA 5FHNA 2A5SA 4GIZA 4R6HA 4XXUA 1QW0A 2DYXA 3U93A 5TPAB 3C9HA 3T9UA 2QJEA 1SD3A 4ISUA 4R9GA 5H8SA 4C1TA 2KLFA 3UORA 3CSBA 3FVNA 4OQOA 1PB9A 1FTLA 3MC2A 5CM6A 4LVQA 5AA4A 3SESA 1FQBA 2THIA 2D3IA 4QSDA 1B7ZA 2YPNA 4THIA 3HN0A 3FXUA 4LQ5A 5I2NA 3EQ1A 4ZEFA 1SBPA 4YZZA 4BDNA 1FW0A 1LAXA 4L17A 4GOTA 1JEUA 1LFGA 2RCAA 3T96B 3G3GA 2DQVA 3VVFA 3V8XB 1CE2A 4H1XA 1B7HA 3PPNA 2E1SA 3PPOA 1USYE 2DXRA 5TU0A 1B5HA 5DEXA 2Q8JA 4FEDA 1SYHA 3K1NA 3O9PA 4OFOA 2Q9TA 2DWHA 1M5BA 4POXA 1SW2A 3VE1B 1OLAA 2ESNA 2V84A 1NH8A 4ZE9A 4YKKA 1GR2A 4GXSB 3FV1A 3I3VA 5L8DA 3TCHA 3C36A 1ZKBA 5AA2A 3KZGA 2W7YA 3MP1A 2Z8EA 4F39A 2ONRA 4OEUA 2REJA 3FZVA 5I58B 5KCJB 3FATA 1B3HA 1DOTA 5I56B 3FASA 3H6WA 5FTHA 2UXAA 3B6WA 2GHBA 4YAHX 4LZ7A 2Y7RA 4I8CA 4KHZE 3CI8A 1H76A 3IAZA 4X48A 1D3KA 3O29A 3PD9A 1MXZA 3UIFA 2QMXA 2OLBA 4LP2B 4OEVA 1M5EA 1Y4TA 2QS2A 1B3LA 1N3XA 2XX9A 4QFNA 3M3KA 1UTHB 1ZLQA 1US4A 3FJ7A 1MH4A 4TLLB 1IITA 3FD3A 1FQDA 4MBPA 2FA7A 1NNTA 5CMMA 1QUJA 2RCBA 4OFLA 5L9SA 3GBAA 3QK6A 2F7CA 4F3GA 3FIRA 1A99A 2QRYA 3IOWA 3Q28A 2IA4A 4Q0CA 2FYIA 3KG2A 3TCGA 1BP5A 2Z22A 3K00A 2V25A 1SI1A 2XXPA 1AOVA 3KFMA 4K3FA 1D9YA 3SEWA 2HFBA 2A5TB 1AMFA 1NNPA 2R6GE 2DWJA 4H8IA 5EHSA 1B1HA 3VVDA 4U21A 1JEVA 4G4PA 3C32A 4LQ2A 3ILTB 2YLNA 4U22A 4F22A 3AXFA 3U1OA 1A7LA 4NWDA 5ICTA 4IGRA 1N7WA 4FECA 3JZJA 4O3AA 3TUSA 3O2AA 1B5IA 3DP6A 4NF5A 1MS7A 1B05A 1IXGA 1NFTA 1UIUA 2XXUA 4R75A 4U4SA 4LA9A 2OWTA 1B3GA 4DXUA 1LFHA 3ZSFA 4ELRA 4ELOA 2NWJA 3KN3A 4LONB 4U1ZA 5IKBA 2V3QA 3K1PA 3MUQA 4AB6A 3T22A 4WKMA 4JSOA 3KEIA 4F3SA 3IB0A 3E9XA 1SI0A 1ZBMA 3TMGA 2Q88A 4NF4B 3PD8A 1QULA 5F7VA 2X7PA 1Q35A 5B70A 1ZTYA 5ICQA 1B46A 4JXIA 1H45A 3OO8A 3G3IA 4M1VA 3TTLA 1VR5A 3PPPA 4RPNA 4I62A 1Y9UA 4WEPA 3RNNA 5JK4A 5DVIA 3LSLA 2I3VA 1GTKA 2O68A 3GZGA 3Q27A 1USYH 3TELA 5HPQA 4ZEBA 4U1OA 4OENA 1I6BA 1M5CA 5ITPA 2DP8A 1IZ1A 2M8CA 3TTMA 4QFKA 2XXIA 2Z23A 5I2KB 3CIJA 2XX7A 2PVUA 1Z7NE 4YKPA 4QFLA 3OO9A 3JV9A 3TAJA 1EZPA 3HHFA 4IO7A 3K6VA 3U72A 2DE2A 3I5OA 1IXCA 4JWOA 1MM6A 1WVJA 2Q2CA 2PX1A 3P7IA 2RC7A 5JTYA 4P0IA 3CRBA 3FJMA 3MVZA 4IO3A 3O6GA 2D21A 4UA8A 5M2VA 1FQAA 3TFLA 4KR5A 3EHTA 2F34A 5J1DA 4JWYA 2OBGA 4FIMA 3FXRA 1TFAA 2XXTA 3CSGA 2XXQA 3L6GA 4ZDMA 1P1WA 4U4XA 2QS3A 4KCCA 3THIA 3RN8A 2RC8A 4XKPA 3N6TA 4H6DA 5FTIA 1JW1A 4EXLA 4KQPA 3RLFE 1DTZA 2Y7IA 1QKBA 1B4ZA 3FUZA 2UVJA 2I4BA 1SQYA 2RINA 4JDFA 2VD3A 1XC1A 1LB9A 3D4CA 5TP9B 2XXWA 4G8MA 3F11A 2ZNUA 4FAJA 1B1XA 3KSJA 4KD5A 1OVTA 4X9TA 5BWJA 4KYSA 1JW4A 2PYYA 4ZZEA 3B6TA 3IOTA 2UVIA 2X26A 1ZU0A 1L5TA 2Y7KA 4PFTA 3O28A 1H43A 3FGSA 1OIBA 1ZJLA 4Q30B 4OERA 2GH9A 1RYXA 2UVHA 1B0HA 1PBPA 3JYRA 3Q26A 4IGTA 3S9MC 4PFWA 3PUVE 1A8FA 4G8HA 1MPBA 4HS7A 1UTBB 3V83A 3M3FA 2V93A 4GVOA 1LBCA 3OELA 4EXKA 4XIGQ 3O6IA 4C1UA 4RK9A 4GRKA 1LB8A 4O3BA 1XVYA 2DSFA 3OEMA 1I6AA 4RXLA 4AQ4A 4PP0A 1BIYA 1IUDA 3MVXA 5H8FB 3E4RA 3K2DA 4BDQA 4HW8A 1TWYA 1JVYA 5KDTB 4DIGA 1H44A 4R72A 1A40A 2F36A 1N3WA 1CB6A 3TPAA 2R9JA 3B6QA 1VE4A 3HV1A 2I58A 4FJPA 2DXYA 3PPQA 4U2RA 1LCFA 2OZZA 4FEBA 4OXVA 4N07A 3R26A 1S7YA 4DCXA 2DVZA 1TT1A 2HCAA 1Y20A 5CC2A 4MFIA 2NVUB 1YCJA 3DELB 3VDFA 3Q25A 1DMBA 4XTCQ 2DWIA 2H5YA 1N0TA 1ZMGA 2O84X 2FNCA 2VHAA 1EH3A 3TTKA 4YMAA 3VLWA 3MBPA 5H8NA 5AA2D 2P0SA 4O3CA 4LZ5A 4F31B 4BDLA 3TKDA 3VLUA 2GHAA 4ELPA 4OYVA 1P1UA 2O1LA 3C34A 4HCWA 2DWAA 3IB2A 2F7BA 4PE5B 3TEPA 3SKPA 4EQ9A 2H99A 2QMWA 3U92A 4IY5A 4F1VA 1FTMA 1DSNA 3TODA 2V3UA 3KN8A 3MAMA 3R6UA 5K2YA 4ZZAA 4EF1A 3IOUA 3T9VA 2F97A 2AL4A 5A5XB 3MWBA 2I6EA 5EHMA 1MXVA 3SERA 5H8QB 1MQDA 4BDOA 4F1YA 2XX8A 1HSLA 3IX1A 3VVEA 4F18A 1B32A 4RY1A 2NXOA 1LAHE 3VV5A 4OZ9A 5I59B 4NTLA 3TQWA 2XXXA 1Q1KA 2REGA 5CMBA 4RJZA 1AL3A 3UK4A 3RTWB 2H4IA 4YU0A 1Y3NA 1Y3QA 3DM0A 4TQUQ 4DCYA 1MY3A 2I3WA 4NF6B 1FTOA 3T9HB 4JBZA 4MLQA 3ZKLA 3FVOA 3IL1B 2DVCA 4IO4A 3A3UA 2UYFA 2Q2AA 4UACA 5TP9A 4G68B 3MVYA 3O66A 3H03A 3ODBA 4EDPA 2O1MA 4DZ1A 5AA3A 2HZKA 1B3EA 1NMUA 3K6UA 4F29A 3C4MA 1OQHA 4DXBA 2P1SA 2PT2A 3IB1A 3KJ7A 1RKMA 4NF8B 1MY2A 3MZ1A 3KGCA 3ONMA 4IO2A 3A09A 3T93B 3OD7A 1XOCA 2I49A 4Q5TA 3C33A 3EHSA 2LAOA 2ZXTA 5BUUA 3V89B 3G3JA 3TZAA 3K1MA 1FCKA 5TPAA 3VLVA 3E13X 4OFJA 3MVWA 3K0VA 3SEXA 5AA4B 2OWSA 4RNSA 4H5GA 3RT8A 3MPKA 1MG1A 3QXMA 4YMBA 3IJOB 4LZ8A 1LGBC 2R71A 5AA1A 2H25A 1MY1A 3PPRA 4ESWA 1MDP1 4ZECA 3MZ9A 1N04A 2XD2A 3RUMA 5FHOA 4KFQA 2BJJX 4OMBA 4GD5A 3G3HA 3DLNA 2O7IA 2F78A 1SW1A 1MXWA 2I0BA 3A3CA 5DEXB 4Q8RA 2XXVA 4RYAA 2F6GA 1FQCA 3RY3A 5AE4A 4I1DA 3S9LC 2VD2A 3EN3A 3KJTA 5CI5A 3I6VA 4PQJA 1PBQA 3EF7A 1NH7A 3RGYA 4KYDA 3H3GA 2ZYOA 1PC3A 4I9DA 3CFZA 2Z8DA 4BDRA 3H6VA 1FQEA 1ELJA 3H6UA 1B7UA 3N5LA 1I6QA 3FVGA 3L6HA 4X1DA 4YKIA 3EPEA 3BFUA 3N6UA 3LUYA 3LC8A 2DE3A 4MLVA 3OO6A 3U94A 5I58A 1Y4CA 2I48A 5KCJA 1DTGA 4E0XA 4G2ZA 2PT1A 5I56A 2F7AA 3PV0E 4ZS9A 2DE4A 1GVCA 3LSWA 3BBRA 4E0WA 1B58A 1PB7A 3LSXA 4HCYA 4C0RA 4QFOA 5H8QA 4LATA 4OWDA 3ZS6A 2QS1A 2RF1A 4OTEA 2CMOA 1YAEA 1HSJA 3MJNA 4F3PA 3H6TA 2XXHA 2DOJA 3V5AA 1D9VA 3M8UA 4MH5A 3SETA 4GWOA 1UTHA 3QIMA 1O7TA 5I59A 1IQ7A 1OLCA 1P1NA 3C35A 1SW5A 3G7WA 1QJMA 3DP4A 1N7XA 5K2XA 1FTKA 2D5WA 4NF6A 3K02A 1F9BA 3WAFA 3PUWE 1UQWA 4OVJA 3TYHA 2Y7PA 3S9EA 4PETA 1B5JA 1R9QA 2G29A 2NUVA 2XXRA 4ZEKA 1N76A 1B4HA 2NOOA 3PUZE 1MH3A 1IXIA 4XKQA 3IO4A 1VFDA 3TDJA 3IJXB 1SYIA 2A5TA 3HCQA 3CG1A 3U8QA 2VP1A 5DTBA 1ATGA 4NWCA 2H98A 4NF5B 1IXHA 4KYEA 4F2OA 5CMCA 3UA8A 1M5FA 4EQ7A 4DDDA 1US5A 3IR1A 3MP8A 1A8EA 4ELQA 3MQ9A 3KOSA 4ND9A 3QYTA 4QSEA 1YTVA 2ZNSA 3IORA 4NF8A 5I84A 2HXWA 2G93A 1II5A 4F1UA 3LR1A 3IK6B 4RA1A 1UIVA 5ISUA 2AIXA 2Y84A 3O6HA 4IO5A 4QHQA 3HHGA 1A54A 3G3KA 1B0LA 3H7MA 3ZKKA 1FQFA 3EHUA 3KOTA 4ONYA 3QSLA 1MRPA 4EF2A 4OESA 1P1QA 4F2QA 3W15C 3SEUA 4R2BA 4NF4A 2I0CA 4U23A 3K6WA 1POTA 3OSRA 4OHNA 1LAFE 1BTJA 2ZYKA 3H06B 3OENA 3QAXA 1MXYA 4ECFA 4GXAA 4ZEDA 4DE8A 1DPPA 3W9VA 1XT8A 1URGA 4YB7A 4R6KA 1YPNA 4R6YA 1NNKA 3UGWA 3FVKA 2VOZA 4GF8A 2WKYA 4BLAA 3PUXE 4F19A 2I4CA 4KI0E 1B40A 3GXAA 3LSFB 5I2KA 4FORA 5JTYB 4BDMA 4QF9A 3PU5A 1B2HA 2O51A 2ONSA 3OMBA 3IOVA 3RT6B 2O6AA 2O7UA 1URSA 2H9BA 2HEUA 3CFLA 1B51A 1LBBA 2B3BA 4Z7EA 1AIVA 1MPCA 1WODA 1KWHA 3PGFA 5DT6A 5LOMA 2Q89A 1VSOA 4R2FA 4WEDA 1N84A 5I57B 3RPWA 1PEBA 2Y7WA 2HZLA 3O97A 1POY1 2Z8FA 2X7QA 2AL5A 3T9XB 4R74A 3S9NC 4G68C 3E3KA 4YKJA 3UN6A 1QUKA 1LLSA 5CBSA 1GGGA 2P2AA 1I69A 4AB5A 3FV2A 1MPDA 1PDAA 1XS5A 1Z7ME 3SDFA 4GQOA 4PFUA 4OETA 2RKMA 4GFRA 1MXUA 3MP6A 5H8HB 1VFEA 3PMVA 2V3TA 3IO6A 1MDQA 2F5XA 3GLBA 5F1QA 2OCUA 3PMWA 3S2VA 3N94A 3CFXA 2F6PA 1JQFA 2UVGA 1LAGE 2OK2A 2PBWA 1LFIA 4JB7A 4YB6A 1SW4A 4N13A 5ELVA 1SVXB 4H65A 1HSEA 1XHYA 2ALUA 3OEKA 1QVSA 1PB8A 1R1NA 3FJGA 3HSTA 3KSXA 5CRYA 3OO7A 1EZOA 2B65A 1B52A 5IAIA 4IY6A 2ZYMA 1T0KA 3KN7A 1MQHA 5DYHA 2GRVA 1UTBA 3N26A 3KBRA 4F3BA 4DXCA 4R9FA 4JSDA 2QS4A 1ANFA 1WDNA 2YJPA 4TLMB 4IB2A 3TCFA 5B7DA 1JNFA 1JVXA 5I2NB 4HTGA 4R73A 3DP8A 1RYOA 1H3DA 3MZBA 1MM7A 1NNFA 4MF3A 1MXXA 5H8FA 1URDA 1FTJA 1J1NA 2HAUA 5DVJA 3RQTA 4DLDA 3CVGA 5KDTA 4TOZA 1OVBA 5CMKA 1ZIUA 2UYEA 2ONKE 4RK2A 1B6HA 3D4GA 3SEVA 4ZE8A 4XKNA 4QSCA 2QL3A 2AYSA 3SEYA 3K01A 1MY4A 1JW5A 3OXNA 1AH5A 5L9MA 2QPQA 5ITOA 3S4UA 1MQIA 1LCTA 2F8DA 5H8NB 4NE4A 4KCDA 3PUYE 4G77A 2HQ0A 2F35A 4ZEIA 2E0SA 2XD3A 3UP9A 4M4GA 1R9LA 3TTRA 2ZMBA 3W9WA 4WXJA 2HAVA 4RPOA 1BKAA 2GFEA 1IEJA 4IO6A 5AA2B 3RTFB 3BFTA 5HBCA 4YB5A 2VGQA 3VFJA 2OJTA 3USDA 4GL8A 2IEEA 3VXCA 3K4UA 4KPTA 4QRZA 1TXFA 2ZYNA 4P0GA 1LSTA 1EU8A 1DPEA 1Y3PA 1QKAA 3G3FA 4H8JA 2XXYA 2ANJA 1P1OA 3PMXA 4POWA 4EUOA 5KZTA 3TTNA 4NMYA 1JETA 1D4NA 1BLFA 4PFYA 1MY0A 4H5FA 4P11A 4ESXA 2RC9A 3CR9A 1S50A 1NL5A 3FXQA 1OMPA 1IIWA 4X1BA 3B7DA 5A5XA 4H0WA 2PMSA 3MW0A 5HM4B 3HPIA 5JEIA 3HO7A 3OOAA 1S9TA 4LUBA 1XVXA 4JWXA 3TQLA 1OQGA 2XHDA 4H67A 5FHMA 1B3FA 3ECRA 3MPLA 5L9OA 3WAEA 1EZ9A 5I57A 1GV8A 1B9JA 3LBSA 4Z0IA 2B3FA 2O69A 3T66A 4G8NA 3K6XA 3QUJA 3H4ZA 3OSQA 2ABHA 3Q29A 1A55A 2QSXA 1M5DA 1TFDA 1MQGA 3CG3A 4FATA 4QFPA 3QUFA 1O64A 2DS9A 3ILUB 5H8HA 4GLIA 3R7XA 5EYFA 3C31A 3M3LA 4XKRA 1P99A 3VXBA 1SDXA 4EQBA 4G68A 1R6ZA 5DVFA 1MQJA 4NEDA 3GBBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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