1XVYA

Crystal structure of iron-free serratia marcescens sfua
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
307
structure length
307
Chain Sequence
GIVIYNAQHENLVKSWVDGFTKDTGIKVTLRNGGDSELGNQLVQEGSASPADVFLTENSPAMVLVDNAKLFAPLDAATLAQVEPQYRPSHGRWIGIAARSTVFVYNPAKLSDAQLPKSLLDLAKPEWKGRWAASPSGADFQAIVSALLELKGEKATLAWLKAMKTNFTAYKGNSTVMKAVNAGQVDSGVIYHYYPFVDGAKTGENSNNIKLYYFKHQDPGAFVSISGGGVLASSKHQQQAQAFIKWITGKQGQEILRTNNAFEYAVGVGAASNPKLVPLKDLDAPKVDAAQLNSKKVVELMTEAGLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Iron binding protein
source organism Yersinia enterocolitica
publication title Novel Anion-independent Iron Coordination by Members of a Third Class of Bacterial Periplasmic Ferric Ion-binding Proteins
pubmed doi rcsb
molecule keywords sfuA
total genus 109
structure length 307
sequence length 307
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1xvyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1xvyA02
1LB8A 5B70A 4FECA 4ZDMA 4O3BA 4XKPA 3HO7A 4DLDA 1WDNA 2IA4A 3PMVA 5DEXB 5BUUA 3PPPA 3MQ9A 1B40A 2H25A 4Z7EA 3L6GA 2P0SA 4DCXA 3IOUA 2R9JA 3VLWA 2ZNTA 4OEUA 3ZKLA 1NNTA 4K3FA 4KR5A 3LBSA 3E3KA 4RYAA 4RY1A 1B7ZA 2THIA 4U23A 1OQGA 1UTBA 3MW0A 3MPLA 3SESA 2QS4A 3DP4A 3T22A 2O7UA 2Q88A 1B5IA 1YPNA 3MVXA 3CI8A 3K0VA 4AB6A 5L9OA 3K4UA 4YZZA 2CMOA 3O6IA 2QS3A 2DE4A 4KCDA 1UQWA 3VDFA 4R9FA 2ABHA 1ZU0A 4G68B 5IAIA 1NH8A 5EHSA 2HAUA 1VSOA 4P11A 4H5GA 1SD3A 3GZGA 4PQJA 3RTWB 5JK4A 2PT2A 2Q89A 2F6PA 4YB6A 1NNPA 2XXXA 4YB7A 5EHMA 5TP9A 2XD2A 3G3JA 2YPNA 4ZEFA 1B46A 3OENA 3U72A 3FATA 1FQAA 1TFDA 2O1LA 4I62A 2FNCA 3BKIB 3VXCA 3G3FA 3K6XA 3TUSA 4OEVA 1Y3PA 1HSEA 4X1DA 4LZ5A 5CRYA 4OZ9A 3FD3A 1LFHA 1OLCA 4QFPA 4KYEA 1NNKA 4TLMB 4EQBA 4R72A 2X7PA 3T66A 1B6HA 1WVJA 3O2AA 2GRVA 1S7YA 4NF4A 4FIMA 2E0SA 3MP6A 5H8FB 2F7AA 5ICTA 3LR1A 1IUDA 2ZYMA 3CVGA 3I6VA 3SDFA 1B1XA 2O84X 1SI1A 3MPKA 3Q29A 1P1UA 1H44A 5CMCA 1B4HA 3JV9A 5BWJA 1MXWA 2H9BA 1LAXA 3KJ7A 3C4MA 4KCCA 3UA8A 1XS5A 2QMXA 1MG1A 3U93A 4AQ4A 2UYFA 1B5JA 4XIGQ 4JWYA 3GXAA 3C33A 2X7QA 4H8JA 1ZMGA 1ZJLA 3MAMA 3R26A 4R74A 2KLFA 1P1WA 1I6BA 1Y1MA 1A54A 1MM7A 4P0IA 1PB8A 4JWXA 3LC8A 1UIUA 4Q5TA 1MY0A 2RF1A 3SERA 1FCKA 5DEXA 3OO7A 4F31B 4FATA 3ILUB 1TFAA 3H6UA 3N94A 4DIGA 3KGCA 4XKRA 4R6HA 1FQCA 3CFZA 3EHSA 1EH3A 4ELOA 1RKMA 3TFLA 4IO6A 5EYFA 4ESXA 3KG2A 2XXVA 3L6HA 1USYE 5I57B 3P7IA 1FTKA 3LUYA 4YMBA 2DE3A 1F9BA 3IR1A 3V5AA 4E0WA 1LGBC 1N7XA 4IO5A 1MXZA 5CBRA 1LFIA 3VLVA 1XOCA 4OYVA 1H45A 3OELA 1AH5A 5IKBA 4RNSA 4HCYA 4LVQA 4G68A 1QW0A 4EQ7A 1Q1KA 1MPDA 5F7VA 2Z8FA 4LA9A 4F29A 3U1OA 3RT8A 3O29A 2RINA 3TZAA 3I5OA 3HHGA 2YLNA 1US4A 4Z0IA 2HQ0A 1B3FA 2Z23A 4YKKA 5ISUA 5ITOA 4MLQA 1AMFA 3KEIA 3B6QA 4LQ2A 1MQJA 3CIJA 1MDP1 3IO6A 4O3AA 3PGFA 5H8SA 5I58B 4QFLA 3VLUA 1M5BA 1SQYA 1XVXA 3OMBA 2VHAA 1DOTA 1IXHA 4GWOA 1N84A 3TODA 1NH7A 3HHFA 1Y9UA 3U92A 4G4PA 1PBQA 4GXSB 3RGYA 3V89B 1JVYA 4G8NA 3PD9A 1MPBA 3H03A 1POTA 3SEWA 4FORA 2DYXA 3B7DA 1MQIA 3FASA 1JW4A 3R6UA 4GL0A 3ZS6A 5H8FA 4R2BA 4H1XA 4ECFA 4R2FA 5I2KB 2HAVA 3K00A 1P1OA 2Q9TA 4ONYA 4PETA 2O6AA 4F2QA 1QJMA 5CMKA 1B58A 1FW0A 5F1QA 1HSLA 4OHNA 3FVKA 4PE5B 4U2RA 4U21A 3D4CA 2IEEA 1ZBMA 5DTBA 3ECRA 4WEDA 3CRBA 2ANJA 3QXMA 2F7BA 4QFOA 2AIXA 2UXAA 3EPEA 4OTEA 4EXKA 3GLBA 3FV1A 3D4GA 4U4XA 2PMSA 5H8NB 3S9EA 1IEJA 4U22A 3T9XB 4FJPA 3TYHA 3FUZA 1SW4A 2XXRA 3IB2A 1UTHB 2XXIA 4ND9A 3MZ9A 1Y20A 1PBPA 3USDA 2AL5A 4POXA 4F1UA 3BBRA 1Z7ME 3JZJA 4H67A 4H0WA 2X26A 2D5WA 4BLAA 1MY1A 1GGGA 1YCJA 4DE8A 2GHBA 1JVXA 3TCGA 1H3DA 4KPTA 1MY2A 2I48A 3PUZE 3TPAA 2ZYKA 3G7WA 3UN6A 5I57A 4IO7A 4YKJA 3FXRA 1SYHA 1JW5A 4MH5A 3UGWA 3IK6B 2ONKE 3E13X 3B6TA 3K1PA 2I58A 1MH4A 1B3HA 1MPCA 2VD3A 1N3XA 4TLLB 4R75A 3K1NA 4F19A 1B3LA 3E9XA 4G8HA 1MM6A 2R6GE 4NF5B 1SDXA 4F3PA 1BIYA 3A09A 3IORA 2Y7IA 1XC1A 1MY3A 4C1TA 1H76A 4ELRA 4ZE8A 3HPIA 3B6WA 1TXFA 4OWDA 2OBGA 3HSTA 4N07A 2F97A 1B0LA 3SEUA 3V83A 4XKNA 4IGTA 2HZLA 1MXXA 5I58A 3U94A 4OESA 4HCWA 2Y7WA 3PPNA 4F1YA 3G3KA 4QF9A 1DMBA 3OSQA 5KCJB 1N3WA 4ZE9A 1YAEA 1LAFE 3MP1A 3WAEA 4PFTA 1P1QA 2OCUA 3PPOA 4ZEIA 3EHUA 1SW5A 2I6EA 2XXUA 2VD2A 3G3GA 1SI0A 4ISUA 2B65A 3H4ZA 4YMAA 2M8CA 4RPOA 2GH9A 4FAJA 1B51A 3TDJA 2Z8DA 1Z7NE 1A40A 3SETA 2PT1A 4XKQA 1A99A 1RYXA 1A8EA 3QIMA 5I2KA 3PMWA 4OERA 4HS7A 2QMWA 2DWHA 3IOWA 3T96B 2NOOA 3FV2A 3C36A 4RPNA 5AA2B 3G3HA 3UORA 4QFKA 4G2ZA 4FE8A 3FZVA 2HEUA 5AA3A 1NMUA 4EDPA 4GOTA 5AE4A 2CZLA 1IITA 4RJZA 3AXFA 1LFGA 1SYIA 2D3IA 4JSOA 1PEBA 5DT6A 2PVUA 3FXUA 2ZNSA 1RYOA 1OMPA 2V3TA 3DP6A 3LSWA 4OFOA 1EU8A 2FYIA 4DZ1A 5H8NA 4ELQA 3TAJA 4X48A 4TOZA 2FA7A 2HXWA 3CSGA 3VE1B 3M3KA 1UTHA 4BDLA 1B7HA 1P1NA 3QAXA 4F3BA 4R6YA 2ZNUA 3FGSA 3CSBA 2Y84A 1JEVA 5FTIA 2NUVA 3TQWA 4NF6B 3TTRA 1LBBA 3C35A 3KBRA 2G29A 2Z8EA 4KHZE 2R71A 3TMGA 3KJTA 3TQLA 3IO4A 3O28A 4R6KA 5I59B 5K2XA 4I9DA 3IL1B 1LLSA 3RT6B 5DVJA 3PUYE 1JNFA 1O7TA 1ANFA 3M3LA 2W7YA 3LSLA 4NE4A 3R7XA 1MXVA 4OMBA 1MXUA 4ESWA 3RQTA 1B3GA 3S4UA 4YKPA 2XD3A 2OZZA 1DSNA 3Q27A 1KWHA 3H3GA 2VOZA 2BJJX 2DWJA 3ONMA 4ZEBA 5I2NB 4G8MA 1B9JA 2DVZA 1D3KA 3KZGA 4NF5A 1A7LA 4LZ8A 2QJEA 5A5XB 2DE2A 2F8DA 2XXWA 4PFYA 3MVYA 3MC2A 2LAOA 1D9YA 2F35A 3QYTA 1QUKA 3VVEA 3O97A 4BDNA 3GBAA 3S9MC 3FVGA 1LCFA 2H5YA 4LZ7A 1ZKBA 1GVCA 4H65A 4MF3A 1SVXB 2OWSA 1FQEA 3IJXB 3PPRA 2QL3A 1URDA 3HCQA 2V84A 1FTJA 4ZECA 1R1NA 5KCJA 2P1SA 2ZXTA 3K6VA 3DM0A 5JEIA 1D9VA 4ZEDA 2QRYA 5FTHA 4IY6A 4O3CA 2I49A 3MBPA 4OENA 3O66A 2Z22A 3TTLA 3MVZA 4GLIA 1GV8A 3BFUA 2ZMBA 1BKAA 3QUJA 2Y7PA 4OXVA 5ELVA 1IXGA 2Q2AA 3MJNA 1D4NA 1CB6A 3UP9A 4X9TA 3T9VA 2OLBA 4E0XA 2PYYA 1QUJA 1IQ7A 1I6AA 4JXIA 4EUOA 1MDQA 2F6GA 1PC3A 1Q35A 4HTGA 5AA2A 4U1OA 3S9NC 2AL4A 4X1BA 5L9MA 1BTJA 4C0RA 1I6QA 4LP2B 3M8UA 1PB7A 2HZKA 3LSXA 3VXBA 1OVBA 3WAFA 1WODA 2REGA 3ODBA 3G3IA 1LSTA 3VFJA 4QSCA 1M5FA 1PB9A 1LB9A 2RCAA 1PDAA 1DTGA 2YJPA 5JTYB 4NWCA 3RPWA 3E4RA 1BLFA 1ATGA 4WXJA 2RCBA 1M5EA 4QHQA 2NWJA 3H6WA 4XXUA 1NFTA 5TU0A 1IXCA 1J1NA 3K1MA 1MY4A 4GF8A 2V93A 1POY1 2F78A 3T9UA 1B4ZA 4MBPA 4DXBA 3F11A 3UIFA 1XVYA 1MQDA 2ZYNA 4NF6A 4QSEA 1BP5A 5I56B 3IB1A 1JETA 4DXCA 1LCTA 3K01A 1EZ9A 3TTKA 3W15C 2HFBA 2DSFA 3EHTA 4LUBA 1NKXA 5I59A 4JBZA 2UVGA 1QUIA 2XXTA 5ITPA 3PUWE 1JW1A 4F3SA 5FHOA 3DP8A 3PPQA 4JSDA 5AA4B 2I0BA 2OWTA 1OQHA 2O1MA 1JEUA 1B3EA 3UK4A 3DELB 1SW1A 4BDQA 4ZZEA 3C31A 3IOTA 2I0CA 2REJA 3QK6A 4GD5A 3SKPA 3MP8A 1VE4A 4POWA 2E1SA 5HM4B 5I2NA 1H43A 4G77A 5LOMA 2O51A 2PX1A 1FQDA 3K2DA 5A5XA 1A55A 3OOAA 3JYRA 1VR5A 4YB5A 1Y3QA 2A5TB 2XX8A 4WKMA 3MZBA 3RTFB 3DLNA 2XXPA 4RK2A 1ZTYA 2ZYOA 5DVIA 2H99A 3THIA 2ALUA 1MS7A 5J1DA 3HN0A 3K6UA 3T93B 4RK9A 1Y3NA 2DWIA 3ZSFA 1AIVA 4IGRA 5ICQA 4GVOA 3HV1A 2DP8A 5CC2A 1JQFA 3H7MA 4I1DA 3FJ7A 4IY5A 4BDMA 3OEMA 4OFLA 1M5DA 3EF7A 1QKBA 4GQOA 4Q0CA 4KD5A 3O6HA 1S9TA 4XTCQ 3N6UA 3KSXA 4PP0A 4PFUA 3RUMA 3K6WA 1I69A 3OSRA 2F7CA 3VV5A 3OEKA 1GR2A 1OIBA 4RXLA 5CM6A 3GBBA 3TCFA 1B0HA 1OVTA 1QVSA 4YKIA 5H8QB 2XXQA 1QULA 4YAHX 3I3VA 1N7WA 1O63A 3SEYA 2I3WA 1Y4TA 1N0TA 1N76A 5JTYA 1AOVA 3MUQA 2QSXA 4DDDA 1FTMA 4U1ZA 4H8IA 4JB7A 3TELA 2GHAA 4QRZA 4P0GA 2UYEA 1MQHA 2XX7A 4OETA 4JDFA 4ZS9A 4F1VA 4M1VA 4UACA 3CR9A 2ONSA 1MH3A 5FHMA 2PBWA 3IJOB 4IB2A 5TPAB 1AL3A 3MVWA 2O68A 3CFLA 5DYHA 4HW8A 4OQOA 3KFMA 5I56A 1R9LA 4KYSA 2P2AA 1QKAA 5CMBA 5KDTB 2Y7RA 4Q30B 4F3GA 1IZ1A 3Q28A 3EQ1A 3IB0A 3C34A 4U4SA 5H8HB 2XHDA 4L17A 1Y1ZA 3LSFB 4ZZAA 3Q25A 1ZLQA 1XT8A 4IO4A 3N6TA 2DXRA 2UVIA 1MQGA 2UVHA 3W9VA 1VFDA 5AA4A 2GFEA 2G93A 3A3CA 3OXNA 3OO9A 2ESNA 3FIRA 3KOTA 3PV0E 2DS9A 4BDOA 4EQ9A 1B1HA 3H6TA 4THIA 1SW2A 2F5XA 2V25A 4TQUQ 3A3UA 4ELPA 3OO8A 1N04A 2QPQA 4LQ5A 3FXQA 4KQPA 1B7UA 1FQFA 2RC7A 1B32A 4NEDA 2OJTA 2A5TA 3KN3A 1S50A 3T9HB 1M5CA 5L8DA 3O9PA 4F2OA 3BFTA 1TT1A 3QSLA 4JWOA 4GL8A 2OK2A 1OLAA 4H5FA 4MLVA 1GTKA 4NF8B 3VVFA 3SEXA 4KFQA 4GXAA 3IX1A 4DXUA 1VFEA 1ELJA 2VGQA 2DXYA 2ONRA 2XXHA 1R6ZA 4OVJA 4C1UA 1T0KA 2DQVA 3FVOA 4H6DA 4PFWA 3M3FA 4UA8A 2D21A 3N26A 1B2HA 2NXOA 3H6VA 1EZPA 3FVNA 4GRKA 4QSDA 3IOVA 2F34A 1P99A 4KI0E 3PUXE 1L5TA 5I84A 1DTZA 1LAGE 2NVUB 1LAHE 1DPPA 1URSA 3FJGA 4RA1A 2B3BA 4YICA 3C32A 3RY3A 3RNNA 4Q8RA 4KYDA 4F18A 3MWBA 5H8QA 3MZ1A 5K2YA 2DWAA 1UTBB 3O6GA 1NL5A 3ILTB 3ZKKA 3S2VA 1US5A 1B05A 1O64A 1A8FA 1DPEA 3KOSA 3C9HA 3CG1A 3PU5A 2XXYA 3PD8A 2VP1A 2F36A 2O7IA 2HCAA 3W9WA 3CFXA 3V8XB 5CBSA 5FHNA 5AA2D 3PMXA 1II5A 5DVFA 3FJMA 1SBPA 1YTVA 4EXLA 5B7DA 1FTOA 2QS1A 5TP9B 2B3FA 3TEPA 4F39A 4F22A 1NNFA 1Y4CA 4NTLA 3RN8A 5TPAA 1FQBA 2QS2A 2DOJA 2A5SA 3KN8A 5KDTA 4G68C 4WEPA 3TTNA 4N6PA 2H98A 4NMYA 1IXIA 4EF1A 4LONB 1ZIUA 2RC9A 5H8HA 3S9LC 4YU0A 3TCHA 2H4IA 3KSJA 3CG3A 3IAZA 4FEBA 1MRPA 4DCYA 3Q26A 2I4BA 2XX9A 2O69A 4BDRA 4R73A 1IIWA 1URGA 4M4GA 4OFJA 4IO3A 3QUFA 4GFRA 4FEDA 4EF2A 3EN3A 1R9QA 5HBCA 4R9GA 4GIZA 1TWYA 2UVJA 1XHYA 3N5LA 1EZOA 1B5HA 5M2VA 4NF4B 3SEVA 2DVCA 2Y7KA 2V3UA 2I4CA 3VVDA 2RKMA 3PUVE 4LATA 4ZEKA 4QFNA 2V3QA 5HPQA 1HSJA 3TTMA 2RC8A 4N13A 3H06B 4MFIA 3OO6A 5L9SA 3K02A 3RLFE 1FTLA 3OD7A 1B52A 1MXYA 4NF8A 2Q8JA 5KZTA 2I3VA 4AB5A 3U8QA 5CI5A 3KN7A 4NWDA 2Q2CA 3TKDA 4IO2A 1USYH 4I8CA 1CE2A 1UIVA 5AA1A 2AYSA 1LBCA 5CMMA 2WKYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OVSA 1LB8A 5B70A 4FECA 4ZDMA 4O3BA 4XKPA 3HO7A 4DLDA 1FBHA 3E79A 2CEYA 4PGPA 1WDNA 2IA4A 3PMVA 5IZ3A 5DEXB 5ET5A 5BUUA 3PPPA 1Q9DA 5I7IA 3MQ9A 1B40A 2H25A 4Z7EA 2WBDA 3L6GA 2P0SA 4DCXA 3IOUA 2R9JA 3VLWA 2ZNTA 4OEUA 3ZKLA 1NNTA 4K3FA 4KR5A 1K9ZA 3LBSA 3E3KA 5IZZA 4RYAA 4RY1A 4P47A 1B7ZA 4N81A 2THIA 4U23A 1OQGA 1UTBA 3MW0A 3MPLA 3SESA 2ZZXA 2QS4A 3DP4A 4PF8A 3T22A 2JJKA 2O7UA 2KR0A 4HXVA 5EQAA 2Q88A 1B5IA 1YPNA 3MVXA 3CI8A 3K0VA 4AB6A 5L9OA 3K4UA 4YZZA 4I40A 2CMOA 3O6IA 2QS3A 2DE4A 4KCDA 1UQWA 3VDFA 4R9FA 2ABHA 1ZU0A 3LUZA 4G68B 5IAIA 1NH8A 5EHSA 2HAUA 1VSOA 4P11A 4H5GA 1SD3A 3GZGA 4PQJA 3RTWB 5JK4A 2PT2A 2Q89A 2F6PA 4N91A 4YB6A 1NNPA 5EQ8A 2XXXA 4YB7A 5EHMA 5TP9A 2XD2A 1G0HA 4JVCA 3G3JA 4O94A 2YPNA 3RPLB 4ZEFA 1B46A 3OENA 3U72A 3FATA 1FQAA 1TFDA 2O1LA 3KBZA 4I62A 2FNCA 4I3EA 3BKIB 3VXCA 3G3FA 3K6XA 3TUSA 4OEVA 1Y3PA 3IFCA 1HSEA 4X1DA 5DW8A 4LZ5A 2XA5A 5A5LA 5CRYA 4OZ9A 3FD3A 1LFHA 2PFZA 2FVZA 1OLCA 4QFPA 4KYEA 1NNKA 1YXIA 4TLMB 4EQBA 4R72A 4IR8A 2X7PA 5ET7A 3T66A 1B6HA 1WVJA 3O2AA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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