1XVYA

Crystal structure of iron-free serratia marcescens sfua
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
307
structure length
307
Chain Sequence
GIVIYNAQHENLVKSWVDGFTKDTGIKVTLRNGGDSELGNQLVQEGSASPADVFLTENSPAMVLVDNAKLFAPLDAATLAQVEPQYRPSHGRWIGIAARSTVFVYNPAKLSDAQLPKSLLDLAKPEWKGRWAASPSGADFQAIVSALLELKGEKATLAWLKAMKTNFTAYKGNSTVMKAVNAGQVDSGVIYHYYPFVDGAKTGENSNNIKLYYFKHQDPGAFVSISGGGVLASSKHQQQAQAFIKWITGKQGQEILRTNNAFEYAVGVGAASNPKLVPLKDLDAPKVDAAQLNSKKVVELMTEAGLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Novel Anion-independent Iron Coordination by Members of a Third Class of Bacterial Periplasmic Ferric Ion-binding Proteins
pubmed doi rcsb
molecule keywords sfuA
molecule tags Iron binding protein
source organism Yersinia enterocolitica
total genus 109
structure length 307
sequence length 307
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1xvyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1xvyA02
3FXRA 4KCDA 1Y9UA 4NF6A 4H0WA 2H25A 2Z23A 3SEUA 3JZJA 3G3HA 1UTHB 1IXHA 5L9OA 3QXMA 1JETA 3HSTA 1LCTA 2F7BA 2BJJX 3KG2A 3KJ7A 3MQ9A 4BLAA 3ZSFA 3UIFA 2UVHA 2OJTA 3MZBA 4QSDA 1P1QA 4KYEA 1MXXA 3M3FA 2F6GA 5HBCA 5KCJB 3FV2A 1F9BA 3FJ7A 4O3CA 3IOUA 1LGBC 1MXUA 2Q88A 1UTHA 4WEDA 1PBQA 4THIA 1IUDA 2ESNA 3TTNA 3UA8A 2O69A 4RPOA 4ESXA 1MM7A 2FNCA 3OD7A 4ZECA 2F8DA 2HFBA 4GLIA 1NFTA 3EHSA 1JW5A 3EHTA 3SDFA 1GTKA 3B6WA 3KZGA 4OERA 5KCJA 3R26A 1OVTA 1OQHA 3ZKLA 3F11A 3HO7A 1B2HA 2VP1A 2Y7WA 3PMXA 3TUSA 3VV5A 2GRVA 4R74A 1S9TA 1AIVA 3OO7A 1OLAA 4XKRA 4JWXA 4R9FA 4FAJA 3CG3A 4TLMB 2VD3A 3PUWE 2GHBA 2XD2A 1ZKBA 3M3KA 3W15C 4Q8RA 4FECA 1B3HA 1DPPA 4PFWA 4JWOA 3H4ZA 1M5BA 1JW4A 4U23A 1XHYA 3RTWB 2RC7A 4EQBA 2O1MA 5CRYA 3EPEA 1N3XA 4F2OA 1IIWA 4R6KA 4PFYA 3FVNA 1B40A 3SEVA 4LUBA 5TPAB 3A3CA 4F1VA 4DZ1A 1N04A 4OHNA 5HPQA 1QUIA 3THIA 3HN0A 5L9SA 1SYHA 3IX1A 2YPNA 2I3VA 2XXIA 1S7YA 3DELB 3E9XA 2DE4A 4X9TA 3TCFA 1H45A 4OQOA 3S2VA 4ZDMA 1FQCA 5I2KB 2XXHA 1MQIA 2DS9A 2X7PA 4TOZA 3W9VA 3A3UA 3IOWA 3KN3A 1TFAA 5B70A 1DPEA 5TU0A 5LOMA 3BBRA 5I84A 1H44A 3PUZE 4IO6A 3OSQA 4GL0A 4F1YA 3IB2A 4HCYA 3HPIA 3MPKA 1L5TA 3K01A 2F34A 1FTOA 5I2KA 2V84A 3Q28A 2P1SA 4IGRA 2O68A 1WDNA 3SEXA 5H8NB 4MFIA 1IXCA 3DLNA 3N94A 3KSJA 4DDDA 1XC1A 3CG1A 2ONRA 1R9QA 1USYE 1D9YA 2XX7A 4F2QA 4ZZEA 4UACA 4ZEDA 3IJOB 1OQGA 1RYXA 1N84A 3OSRA 1Y4TA 3IOVA 1OMPA 3PV0E 4MLVA 3H6VA 5H8NA 3MJNA 1GGGA 1QVSA 3VXBA 3TODA 4QSEA 1B9JA 5AA2D 2ALUA 1AOVA 1NMUA 3IK6B 1ZU0A 3KOTA 3TYHA 4LQ2A 4H8JA 3VFJA 4IY5A 3UN6A 1M5CA 4GXSB 2UYFA 1B5HA 2OWTA 1LLSA 3OXNA 2UVJA 1Y1MA 3MP1A 3MZ1A 5BWJA 3SESA 4AQ4A 4DXBA 2XXRA 3KBRA 2QRYA 2REGA 3T9UA 1T0KA 3GZGA 2UXAA 3B6QA 4XKPA 4FE8A 1A40A 3E4RA 3PD9A 5ITOA 1D9VA 2D21A 1TFDA 1SW1A 5F7VA 3U93A 1A8FA 4MH5A 1MY3A 4KPTA 4RK2A 3K2DA 1LFHA 5CMBA 2RC9A 4ELQA 2PT1A 4JSOA 1URDA 1Y3QA 4BDQA 2PT2A 3PPQA 5IKBA 4OWDA 3K02A 4OEUA 2Y7IA 4WKMA 2F35A 3N5LA 5CMMA 5ISUA 4N07A 1A99A 1R1NA 3K00A 4PFTA 4P11A 4RA1A 4GF8A 4GXAA 4LVQA 1JEUA 3T66A 1B5JA 3FXUA 4G8NA 4QRZA 2HAUA 4JBZA 1WVJA 4DXCA 1SW2A 2B3FA 2PMSA 4ELOA 4K3FA 1UIVA 2UYEA 5L8DA 5FHMA 1I69A 3SEYA 3IO6A 2H9BA 1MPBA 1B7UA 3Q26A 4L17A 1SBPA 4ZE8A 1TT1A 1PB7A 1FW0A 4F19A 4OYVA 4GVOA 4BDLA 1ATGA 3L6HA 4GL8A 4KYSA 4JB7A 1BIYA 1R6ZA 2NUVA 3GXAA 4YAHX 4FIMA 4GWOA 4OMBA 2CZLA 1NNPA 1ZTYA 1Y1ZA 2F36A 4IO2A 3ILUB 5FHNA 4RJZA 3IB1A 2THIA 1O7TA 5AE4A 3UP9A 3U8QA 3KN8A 2QL3A 4F18A 3N6UA 3EHUA 1FQDA 3BFTA 3SERA 1CB6A 3ZKKA 3RUMA 2AL4A 1DTZA 5EHSA 5JK4A 2ONKE 4ZE9A 3D4GA 4WXJA 3RY3A 4OTEA 1BLFA 3K4UA 2ZNUA 3OMBA 2R71A 3PMWA 3HHGA 3H6WA 5FTIA 1M5DA 3H7MA 3O28A 2NOOA 4EUOA 3H6UA 4R72A 1WODA 4F3GA 3O6GA 1GR2A 2XD3A 4ZEBA 3C33A 3IB0A 4YB5A 4RYAA 3ILTB 2B65A 4PETA 3FUZA 3GBBA 2X7QA 4HCWA 1MG1A 4MBPA 2HAVA 2O6AA 4LZ8A 3CSGA 3IR1A 3PPRA 4DCXA 4EDPA 5I59B 5EYFA 1YPNA 4HTGA 2H4IA 2H98A 3CIJA 3E3KA 3IORA 1US4A 2M8CA 4H8IA 4IO3A 2ZYMA 3U94A 4R6YA 1QUKA 4KCCA 1YTVA 4Q5TA 1XOCA 3KOSA 3MAMA 4EQ7A 2OK2A 1B05A 3QAXA 2VGQA 2HZLA 4F29A 3WAFA 4H65A 5I59A 4LZ7A 5JEIA 1NNTA 1FTKA 2B3BA 2R9JA 1ZMGA 4AB6A 1IZ1A 4U1ZA 3CSBA 4O3BA 3RT8A 4PQJA 4NF5B 4QSCA 4KI0E 1I6QA 3G3FA 1O63A 2AL5A 1MXVA 3R6UA 4X1BA 3LC8A 3QSLA 3G3KA 3PPOA 5I58B 3CFXA 5DEXB 2O84X 3V5AA 1URGA 1FQBA 4NF5A 4DXUA 4YZZA 1SVXB 1MDP1 3G3IA 4RNSA 1Q35A 4P0IA 1DSNA 2O7IA 2IA4A 5AA1A 3R7XA 4POXA 2G93A 2I49A 3FIRA 1M5EA 2YLNA 3WAEA 2ZMBA 4C1UA 5I58A 5I57B 3UGWA 5DEXA 4YB7A 3JV9A 1B3LA 3USDA 1LSTA 1US5A 4DIGA 1NL5A 4EXLA 3S9LC 3TZAA 1EU8A 1NH8A 2NXOA 2QS3A 5F1QA 1OLCA 1OVBA 4XXUA 2A5TB 2V93A 3JYRA 5I57A 1P1NA 2ANJA 3TFLA 4OXVA 3BFUA 2ZXTA 4KHZE 2DWHA 4LA9A 4YB6A 2H5YA 4OETA 4C0RA 4NF8B 3DP8A 1NNKA 5TPAA 2A5TA 4I1DA 1B32A 2Q8JA 2Y7PA 1VSOA 1PB8A 3PU5A 4FJPA 3LSLA 2GH9A 4H67A 1LBCA 3C9HA 3FJMA 3T9VA 4N6PA 2D3IA 1EZ9A 1B5IA 2PYYA 4NF8A 2V3TA 5CM6A 2DWAA 3OENA 1VE4A 1IEJA 3N6TA 2ABHA 4U2RA 3SEWA 3U92A 2NVUB 1N0TA 2REJA 2ZYKA 1H76A 1URSA 4G68C 4DLDA 2XXPA 3K1NA 1UQWA 2I6EA 3V83A 1MY1A 3VVDA 1SI1A 2I48A 4IO5A 2UVGA 4X48A 3VXCA 1MH3A 5H8HB 4QF9A 4YMAA 3FVKA 1MRPA 4R73A 2Q89A 1MPDA 4P0GA 3VVEA 3DP6A 5AA3A 1SI0A 5BUUA 4Z7EA 3LSXA 1ZJLA 2O51A 5HM4B 3KEIA 1LAGE 1MXWA 4KQPA 4XKNA 2UVIA 2G29A 4EF2A 2CMOA 5H8HA 4POWA 5B7DA 4RK9A 1II5A 1IITA 5ELVA 4WEPA 1B4HA 3H3GA 5K2XA 4X1DA 1PDAA 3PUXE 4GOTA 4OESA 4OFJA 4FORA 2F6PA 1N7XA 4KFQA 4LP2B 4KYDA 3O6HA 3RGYA 4LATA 3N26A 2Z22A 1DOTA 1TXFA 3K1PA 2RC8A 5KZTA 1DTGA 1B1XA 1KWHA 1BP5A 1B58A 4NMYA 3O9PA 5DVJA 3DP4A 2HEUA 5CMCA 3TCHA 1Z7NE 1NKXA 4QFPA 2AYSA 3RLFE 3OO8A 3K6XA 5I56B 3QYTA 2Y7KA 3FJGA 1XS5A 4LZ5A 4R2BA 3OELA 1MXZA 5K2YA 4YKPA 3PGFA 3U72A 3VE1B 1Q1KA 4NF4B 3Q27A 4OVJA 4BDMA 4H6DA 2DYXA 4MF3A 1ANFA 2HQ0A 1N7WA 3FATA 5I56A 3CFZA 2GHAA 1BKAA 4NF4A 4G77A 3S9MC 1LAXA 4G4PA 2HCAA 4HW8A 3H03A 1HSJA 5CI5A 2V25A 3TTMA 4ND9A 1YAEA 4OZ9A 2QS4A 2X26A 3LUYA 1P1UA 2H99A 4ZZAA 1FQAA 4DCYA 4IGTA 1B46A 3HHFA 3M3LA 4E0WA 2P0SA 4N13A 3K6WA 1LFIA 1PC3A 4OEVA 1DMBA 4JXIA 5CMKA 2XXYA 3RPWA 3PUYE 3G7WA 3EN3A 4F31B 1LAFE 1IQ7A 1ZIUA 5IAIA 3TPAA 5CC2A 4G68B 1VR5A 3IAZA 3FD3A 3H6TA 4JDFA 4F3BA 1JNFA 4ECFA 4BDRA 5FTHA 4E0XA 3V8XB 2PVUA 3OEKA 1QULA 4Z0IA 3FVOA 1AH5A 4G68A 5JTYB 3MVYA 4H5FA 4AB5A 1YCJA 2PX1A 3S9EA 2QS1A 3IO4A 5H8QB 5J1DA 2F97A 4TLLB 3DM0A 3A09A 4F39A 2DXYA 1Y3PA 1S50A 3O97A 3VDFA 1MS7A 2E1SA 3FV1A 4NE4A 5H8FB 1B0HA 3MZ9A 5JTYA 2V3QA 1AL3A 1VFDA 4C1TA 1JEVA 4YKKA 3UORA 5H8QA 3KN7A 5CBRA 3AXFA 3MPLA 1N76A 2V3UA 3HV1A 4ZEIA 3MW0A 3I6VA 2OLBA 1NH7A 2I4BA 2RF1A 4H1XA 4ISUA 2VOZA 4ESWA 5H8FA 4ELPA 2F7AA 1JVYA 2IEEA 1HSLA 1LCFA 1B4ZA 4QFKA 4FEBA 4KR5A 2F5XA 3OEMA 2DWJA 1JVXA 3GBAA 1FQFA 2I3WA 3OO9A 2YJPA 2ZNSA 1MY0A 3OOAA 3T9HB 4YU0A 1BTJA 3OO6A 3RNNA 3LSWA 4BDOA 4LQ5A 2AIXA 3RT6B 3LBSA 3P7IA 4NEDA 4I8CA 1SW5A 3O29A 1HSEA 2Y7RA 3RQTA 3FZVA 2QS2A 1H43A 2FYIA 4DE8A 2I0CA 1FTMA 1M5FA 3KJTA 1MQDA 1B3EA 2RCAA 3O66A 3TTKA 4PFUA 4GIZA 4IB2A 1MQGA 2F7CA 4Q30B 3PD8A 3TTLA 4R2FA 5A5XB 4QFOA 1MY4A 2O1LA 3IOTA 3QK6A 4ELRA 1SQYA 4NWDA 2QMWA 4ZS9A 3RTFB 3ECRA 2Z8EA 2RINA 2ZYOA 3QIMA 4RY1A 4EQ9A 1MH4A 1JW1A 1B6HA 5KDTB 4BDNA 3B7DA 3C35A 1UIUA 4ONYA 3V89B 1FTLA 2LAOA 2DSFA 1N3WA 5A5XA 5CBSA 2VHAA 2DQVA 1FTJA 1ZBMA 1IXIA 3LSFB 1IXGA 2DE3A 2ZNTA 1FCKA 3M8UA 3FGSA 5KDTA 1TWYA 3H06B 3FVGA 2A5SA 1QW0A 4JSDA 4QHQA 3KSXA 1CE2A 4F3PA 2F78A 3C32A 2QMXA 3D4CA 4Q0CA 2Q9TA 3TAJA 3G3JA 4GQOA 2OBGA 2I0BA 3Q29A 3C4MA 4NWCA 1LFGA 5ITPA 1Y4CA 1POTA 2QSXA 1RYOA 2XXXA 3PPPA 1P1WA 4JWYA 4LONB 3TCGA 1SDXA 3SKPA 4U4XA 2XX9A 4H5GA 4O3AA 1MQJA 2HXWA 2PBWA 3FASA 3VVFA 2XXWA 4F1UA 2QPQA 3T93B 1B3GA 1J1NA 2GFEA 1P1OA 1H3DA 4OFOA 1LB9A 4TQUQ 1A55A 2I4CA 1GV8A 1GVCA 4FATA 1LB8A 1A7LA 1PB9A 3EQ1A 3MP8A 4YKIA 2OCUA 3MUQA 2DVZA 2XHDA 1B0LA 3U1OA 1PEBA 3CFLA 4ZEKA 2FA7A 1VFEA 2DE2A 4M4GA 5EHMA 4IO4A 4XTCQ 3VLUA 3K0VA 3MC2A 1D4NA 4OENA 2DOJA 2QJEA 5AA2B 2XX8A 5M2VA 5DTBA 5AA4B 2Z8FA 4R6HA 3Q25A 1SYIA 1EZPA 2NWJA 1NNFA 1MPCA 3CR9A 3MWBA 3O2AA 1D3KA 5DT6A 1B7HA 4R9GA 3CRBA 2XXTA 2Q2AA 5AA2A 1B1HA 3BKIB 2DP8A 1B51A 3T22A 4F3SA 5AA4A 4QFNA 3E13X 1SD3A 4FEDA 4HS7A 1ZLQA 1LBBA 1OIBA 4IY6A 2D5WA 5H8SA 3C36A 5I2NB 1MXYA 4YICA 3QUJA 1MM6A 5ICTA 2RKMA 2WKYA 3TKDA 3C34A 1MDQA 2E0SA 3QUFA 3K6UA 2ONSA 2Y84A 3IJXB 2KLFA 1Y3NA 3LR1A 5DVFA 3I5OA 4GFRA 3W9WA 4EXKA 3S4UA 3RN8A 2R6GE 3PPNA 3I3VA 2DVCA 3CI8A 5I2NA 2XXVA 4PP0A 3HCQA 3K6VA 3S9NC 1B52A 1XVXA 1QKBA 2W7YA 4GD5A 5L9MA 1XT8A 3VLWA 4U4SA 4U1OA 1I6BA 1MQHA 1MY2A 4XIGQ 4PE5B 1USYH 4OFLA 3TMGA 4ZEFA 1QKAA 3ODBA 1POY1 4XKQA 5DVIA 4NTLA 4EF1A 4YMBA 1I6AA 3MBPA 3FXQA 3KGCA 1SW4A 3PUVE 2OZZA 2VD2A 5FHOA 4U22A 3L6GA 4YKJA 3T96B 4MLQA 1RKMA 3PMVA 3T9XB 4IO7A 1EZOA 3C31A 3GLBA 3K1MA 3KFMA 4RXLA 5TP9B 4UA8A 1Z7ME 4G2ZA 2P2AA 1ELJA 3SETA 4U21A 1R9LA 1QUJA 1AMFA 3MVZA 1A54A 3TQWA 3VLVA 3TTRA 4F22A 5ICQA 3TDJA 1UTBB 1LAHE 1JQFA 4I9DA 1A8EA 3ONMA 1XVYA 1FQEA 1B7ZA 4G8HA 1PBPA 5TP9A 2I58A 3TEPA 4I62A 2HZKA 3UK4A 2RCBA 3B6TA 3TQLA 1O64A 3CVGA 2DXRA 2ZYNA 3TELA 1QJMA 1P99A 1B3FA 2Q2CA 4KD5A 1Y20A 2XXQA 4NF6B 1UTBA 2OWSA 3MP6A 4M1VA 5DYHA 2DWIA 2O7UA 4RPNA 3EF7A 2XXUA 3IL1B 1EH3A 3O6IA 3ZS6A 3MVWA 4G8MA 2Z8DA 3MVXA 4R75A 4GRKA 4QFLA 3G3GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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