1XVYA

Crystal structure of iron-free serratia marcescens sfua
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
307
structure length
307
Chain Sequence
GIVIYNAQHENLVKSWVDGFTKDTGIKVTLRNGGDSELGNQLVQEGSASPADVFLTENSPAMVLVDNAKLFAPLDAATLAQVEPQYRPSHGRWIGIAARSTVFVYNPAKLSDAQLPKSLLDLAKPEWKGRWAASPSGADFQAIVSALLELKGEKATLAWLKAMKTNFTAYKGNSTVMKAVNAGQVDSGVIYHYYPFVDGAKTGENSNNIKLYYFKHQDPGAFVSISGGGVLASSKHQQQAQAFIKWITGKQGQEILRTNNAFEYAVGVGAASNPKLVPLKDLDAPKVDAAQLNSKKVVELMTEAGLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Novel Anion-independent Iron Coordination by Members of a Third Class of Bacterial Periplasmic Ferric Ion-binding Proteins
pubmed doi rcsb
source organism Yersinia enterocolitica
molecule tags Iron binding protein
molecule keywords sfuA
total genus 109
structure length 307
sequence length 307
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1xvyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1xvyA02
2DE2A 4F19A 3TZAA 2PVUA 2QJEA 3PUWE 4F29A 1H3DA 2XXIA 3G3GA 4ZEFA 3K00A 3FXUA 1FTOA 3DELB 1LCFA 1M5DA 4WEDA 4OTEA 3RNNA 3TTKA 5FHNA 2O84X 1II5A 1S50A 3PUXE 3TTNA 3B6TA 4O3CA 4FAJA 5DEXB 3N94A 4X1BA 4R74A 4ZZAA 1SYIA 1OLAA 4G4PA 4FATA 4TLLB 3SEUA 3K1MA 1M5BA 1MQJA 1B05A 1JNFA 1SW4A 1Y1MA 3H6VA 3VLWA 4ELOA 2O7IA 1CB6A 2F36A 3EHUA 1GR2A 5L9OA 4XIGQ 1MPBA 3FVKA 3KN3A 5I58A 4YMAA 4R6KA 1WVJA 3M3FA 4UACA 2F34A 2Y7PA 4R6YA 1VSOA 1MQDA 1ZIUA 1S9TA 4JSOA 5DVFA 4GQOA 4ZECA 2Z23A 1NNTA 4TLMB 3CRBA 4P11A 2QS1A 2Q9TA 2HAVA 4F22A 3VV5A 1GGGA 1GV8A 2XXPA 1MS7A 2DP8A 3JYRA 3OSRA 5ISUA 4OHNA 1A8FA 1NNKA 2RF1A 2WKYA 1QUJA 3CIJA 3DP4A 3KSXA 2AIXA 4KYEA 4LONB 4NF5B 4IO3A 1ZU0A 1OLCA 3H6UA 4M1VA 5AA1A 5AA4B 1PBPA 4RY1A 1A99A 1WODA 5B7DA 4YB6A 1FQAA 1N04A 4HS7A 1XVYA 4MLVA 4ZZEA 3MJNA 2OK2A 2XXTA 2B65A 4FEDA 4JB7A 4E0XA 5A5XA 4NE4A 1AMFA 5AE4A 5EHMA 2O69A 1R6ZA 1B4HA 1O63A 3BKIB 3IK6B 1P99A 2XXRA 3M3LA 4R75A 1Y9UA 1US5A 3MVYA 4U23A 4KQPA 2F6PA 4PFTA 3H7MA 4U1OA 4YU0A 1B7ZA 5L8DA 1A54A 5TP9B 4F39A 3CG3A 4OVJA 1QJMA 3MUQA 3PD8A 3H3GA 3ILTB 1UQWA 2RKMA 3BFTA 1MG1A 2I4CA 3SKPA 1B51A 2I58A 4FORA 1DOTA 4IO2A 3SETA 1PB7A 3R6UA 1Z7ME 4MBPA 1ELJA 3S2VA 3UK4A 2H98A 2HQ0A 2XHDA 4M4GA 1NMUA 5CI5A 2I0CA 4EQ7A 4KCCA 5K2YA 3W15C 3A3UA 3JZJA 3PGFA 3PUZE 5EHSA 5AA4A 2G29A 4ZDMA 4IY6A 4IY5A 2I3VA 1NNFA 4IO6A 5ICTA 3ILUB 1LAGE 1MQIA 2DSFA 2YPNA 3LSFB 5KDTA 2OBGA 1QW0A 1URSA 4LATA 1H44A 2QMWA 2V3QA 3C34A 3ZSFA 1MXWA 4GIZA 2Q2AA 3LR1A 2ONKE 3O66A 4FIMA 5K2XA 4TQUQ 4F1UA 2XXUA 1T0KA 4OEUA 3LBSA 4I9DA 1B4ZA 2V3UA 2OWTA 2QPQA 4BLAA 3DLNA 1IQ7A 1B5IA 1ZBMA 1SI1A 2DVCA 2HZKA 2ZYNA 3T9XB 2RINA 3FJMA 4G68B 5AA2D 5FHOA 4OERA 3RPWA 3MZ9A 2XX9A 1MM7A 5KDTB 3GBAA 2IEEA 3HSTA 2R71A 3PD9A 3G7WA 2HFBA 4PETA 3H4ZA 4GOTA 2ONSA 1R9QA 4DIGA 4OWDA 3HHFA 2ESNA 1B1HA 5AA2A 1A40A 2AYSA 2ZNTA 3IX1A 3K02A 3SEYA 3LSXA 5B70A 3KZGA 3OXNA 2P1SA 3C32A 3EHTA 1MXYA 4G8NA 3TDJA 1JVYA 3U92A 1SI0A 3VE1B 1ATGA 1N3XA 5CMBA 4YKIA 2F7CA 3VVEA 4ZE9A 2NXOA 1BTJA 1OMPA 1ZMGA 1OIBA 3VLVA 3KN8A 1XOCA 1B9JA 1LB9A 4QHQA 3T9HB 3IO6A 1LFGA 3KG2A 3OEMA 3IOVA 2F35A 1QKBA 2VGQA 5L9SA 3FJ7A 3FD3A 4KPTA 4H8JA 3WAEA 3CVGA 2Q89A 4L17A 4NF8A 3DP6A 4YMBA 5CBSA 1N76A 5CM6A 3OEKA 3D4CA 4EDPA 4GXSB 1USYH 2H9BA 3IORA 5JEIA 2O7UA 4QFPA 3T9UA 1IXGA 1MXZA 1N0TA 4N13A 2NUVA 5IAIA 2CZLA 1LLSA 1OQHA 3QK6A 3ODBA 4X1DA 4KYDA 4ESXA 5I2NA 2XX7A 3U1OA 2UVHA 1D9YA 1VE4A 2F5XA 1H45A 3E3KA 3FVOA 3MP1A 3V83A 4FECA 4PP0A 3TEPA 3OENA 1SW5A 2F6GA 3GZGA 1EU8A 4H5GA 2ALUA 4LA9A 4XKQA 3MBPA 2DOJA 3PUVE 1P1OA 4QF9A 4G2ZA 3UGWA 5H8NB 3HN0A 4TOZA 1H76A 2ZNUA 2XD2A 3IO4A 4QFOA 4E0WA 3IOTA 4ELQA 1AOVA 1IIWA 3PPNA 5TU0A 1MY4A 4X9TA 2ANJA 3K6WA 3MAMA 3FV1A 1DTZA 4GXAA 4YICA 5H8FB 1B40A 2Y7WA 3G3HA 2O6AA 4NWDA 3SESA 3T9VA 3V89B 1FTKA 2Y7KA 3DP8A 4Q5TA 4Z0IA 1MM6A 5CC2A 2I6EA 3Q29A 1N3WA 2D5WA 3OO6A 4JXIA 2ABHA 5I2NB 1FQBA 3K01A 4F2OA 1CE2A 2PX1A 2R9JA 4FJPA 3GLBA 5KZTA 3S9MC 1BLFA 1MY1A 3E13X 2FYIA 1SD3A 4RPOA 1POTA 3DM0A 3IB2A 4NF5A 3O6HA 4HCYA 4YKJA 4NF8B 4GVOA 4R2FA 4RJZA 2G93A 4OFJA 3TQLA 5DVIA 3FXQA 3MWBA 3PU5A 3THIA 4RA1A 1HSJA 3TTMA 3QAXA 3MP8A 3TODA 2VD3A 3JV9A 2I3WA 5H8SA 4DZ1A 3FATA 2Y7RA 1O7TA 4ZS9A 5TPAB 4KHZE 3SDFA 1TFDA 3C9HA 3T93B 3EQ1A 5BUUA 2UVJA 3RQTA 1P1UA 1B58A 4H1XA 5F7VA 3TQWA 2QS3A 3IL1B 4IO7A 4LVQA 4XTCQ 4BDLA 3TPAA 1AIVA 4EF2A 2AL5A 5AA3A 3B7DA 4F3SA 1VFDA 3ONMA 3M8UA 4POXA 3AXFA 4DE8A 4IO4A 1B0HA 3LUYA 2R6GE 3H6WA 1AH5A 1IXHA 1B7UA 3HPIA 4GF8A 4XKNA 3S9EA 1JW1A 3N26A 4R9FA 3G3JA 5TP9A 4GL0A 4C1UA 2Q88A 3UP9A 1GTKA 2HEUA 1FTMA 2O68A 2THIA 3OOAA 4GL8A 5FTIA 2H99A 1IEJA 1EZPA 1IXIA 1Q1KA 3HCQA 4LUBA 2P2AA 1YPNA 4KFQA 1DSNA 1SQYA 4ZEKA 2ZMBA 1LBBA 4ISUA 2DWJA 2V93A 3KSJA 3VLUA 1GVCA 4EQ9A 3TUSA 1DPEA 1B6HA 3FVNA 1FTJA 3Q26A 5TPAA 2A5SA 3MC2A 4H67A 2DQVA 3H6TA 4HTGA 3KFMA 1FCKA 3Q25A 4NMYA 3TFLA 1Y3PA 5ICQA 2PYYA 2DE4A 3K6XA 1MDQA 2DXRA 3U93A 1Z7NE 3PPRA 4KCDA 1N7WA 4NF4A 3IAZA 4JSDA 4U2RA 4Q30B 3USDA 1B2HA 1NFTA 1USYE 2YJPA 4F1YA 3VXCA 1MPCA 2REGA 4YAHX 1N7XA 1R1NA 3PMWA 1KWHA 1XHYA 1LBCA 3VVFA 4P0GA 3C33A 1XC1A 5I59B 2VD2A 1QKAA 4LZ7A 3W9WA 1B0LA 2Z8DA 4BDMA 1JQFA 3R26A 1FTLA 3FVGA 2X7QA 3SEXA 1IITA 2DWHA 3C31A 1LAHE 4O3BA 4QSDA 2OJTA 1MY0A 1P1NA 1PEBA 1RKMA 3LC8A 3C4MA 1UTHB 1DTGA 4R72A 4ZE8A 3TCGA 1OVTA 4KYSA 4NF6A 2V84A 2V25A 3O9PA 1SDXA 2CMOA 3QXMA 1MQHA 4MFIA 4EXLA 4QFKA 4DCYA 2XD3A 1B3HA 1TFAA 2VOZA 3L6GA 5DTBA 5I57A 4KD5A 2Z8EA 3OO9A 4P0IA 3EN3A 4YB7A 3N5LA 2VHAA 5I2KB 2QMXA 5CMMA 2X26A 3OO8A 2GRVA 4H8IA 4PE5B 1MY2A 4ND9A 3T22A 2UVGA 3CFZA 5F1QA 2NWJA 3RT8A 4BDOA 5A5XB 3VFJA 1MRPA 4UA8A 2F78A 2DYXA 1BKAA 3EPEA 3N6TA 4RXLA 3G3IA 1LAFE 3CSGA 3FV2A 3S9LC 2RCBA 3K2DA 3PPQA 4OXVA 4OFLA 1ZLQA 2A5TB 3HV1A 3C36A 1I6AA 1JVXA 3Q27A 4GWOA 4PFWA 5KCJB 3IJXB 2QS4A 3TAJA 5CRYA 3UIFA 3IJOB 1DPPA 2E1SA 3PV0E 3K4UA 3W9VA 4RK9A 1N84A 1ANFA 2O1LA 5ELVA 4AB5A 4F3BA 2GHAA 3GBBA 4O3AA 1Y20A 3EF7A 1ZKBA 3KOTA 4R9GA 1HSEA 1US4A 2QRYA 2O1MA 2RC8A 3ZKKA 3UN6A 2XX8A 1NL5A 1D9VA 1SVXB 4EQBA 1WDNA 1XS5A 4GD5A 5H8FA 2F7AA 4JWOA 5JTYB 3CFXA 2Y7IA 4X48A 5DEXA 2DXYA 3FUZA 5AA2B 5IKBA 2HAUA 1A55A 3TTRA 3ZKLA 2B3BA 5I56B 5I84A 4GFRA 5LOMA 1RYOA 5I59A 4IB2A 1IXCA 4R2BA 1B7HA 3FZVA 3K6VA 1I6QA 2GHBA 4LP2B 5KCJA 4DLDA 3OD7A 2B3FA 3ECRA 2DWAA 2RC9A 2Z8FA 3KBRA 4K3FA 4R73A 1RYXA 2Z22A 4BDNA 4YZZA 5I2KA 1SW1A 2H4IA 4IGRA 3BBRA 3RGYA 4PFUA 3KJTA 4EF1A 1PBQA 3MQ9A 3RN8A 2OCUA 1OVBA 4KR5A 4U4XA 2I0BA 5H8NA 4ELRA 1B5HA 1SYHA 5H8QB 1P1QA 2XXQA 3PPOA 5DT6A 2QL3A 3O29A 1FQEA 4F3PA 4WXJA 1F9BA 3QUJA 4YB5A 1PDAA 2FNCA 1B3LA 3Q28A 3O97A 4GRKA 2X7PA 4C0RA 4LQ2A 3F11A 1LB8A 1PB9A 4MLQA 2ONRA 3A09A 3TCHA 1NH7A 2D21A 2LAOA 2DS9A 4KI0E 5ITOA 3QYTA 2H5YA 2P0SA 4G8MA 4YKKA 1JEUA 4QRZA 2OWSA 3WAFA 4JBZA 3O6IA 1UTHA 1BP5A 1UIVA 1Y3QA 3CSBA 3I3VA 1H43A 4RNSA 4RYAA 4DCXA 1FQCA 2XXHA 1M5CA 4LZ5A 4DDDA 4F3GA 5CBRA 4LZ8A 2HCAA 3OELA 2QSXA 3IOUA 4OFOA 3MVWA 4QSCA 4U21A 5FTHA 3TCFA 3FXRA 5I56A 2RCAA 1MXUA 2F7BA 2HXWA 2HZLA 3IR1A 4OZ9A 2E0SA 2UVIA 4N07A 1EH3A 1P1WA 3CFLA 1B3GA 2F8DA 3H06B 4OETA 4N6PA 2I48A 1QUIA 4PFYA 3TKDA 2PT1A 1UIUA 3KOSA 4QSEA 1ZTYA 1VR5A 3QUFA 3V8XB 2H25A 3P7IA 3S9NC 4G77A 3OO7A 1TWYA 1JW5A 4ELPA 4BDRA 1VFEA 2V3TA 2Q2CA 1URGA 4RK2A 5H8HA 2AL4A 1B3EA 5DVJA 3QSLA 4ONYA 1LAXA 2I4BA 3S4UA 3VVDA 5CMCA 1B5JA 1Y4CA 3KN7A 1MXVA 1PC3A 2DVZA 4QFLA 1XVXA 2I49A 2O51A 1JW4A 2XXVA 2PMSA 4WKMA 4NEDA 2PT2A 3GXAA 3O28A 2UYFA 4DXCA 1HSLA 1M5EA 3RUMA 3UORA 4XKPA 3U72A 1YCJA 4OENA 1EZOA 4AQ4A 4F1VA 3TMGA 2Y84A 1B1XA 1MPDA 1URDA 3A3CA 3EHSA 3HHGA 3MP6A 3PPPA 5FHMA 5EYFA 5ITPA 2XXYA 3C35A 3PMVA 3ZS6A 2ZYKA 2ZYMA 1FW0A 1QULA 3IB1A 2DE3A 3I5OA 3KJ7A 3T66A 4H65A 5JK4A 4I1DA 4AB6A 1POY1 3K1NA 3U94A 2UXAA 1YAEA 5DYHA 1PB8A 4H5FA 1B3FA 2D3IA 3TELA 3M3KA 3HO7A 4GLIA 3QIMA 1LCTA 3IB0A 4IGTA 4NWCA 2NVUB 1BIYA 4DXUA 4EXKA 1IUDA 1D3KA 2KLFA 1JETA 4POWA 5L9MA 1O64A 2RC7A 2OZZA 5M2VA 1AL3A 4EUOA 1LGBC 2YLNA 1MY3A 3FJGA 2ZXTA 2DWIA 3V5AA 1TXFA 3L6HA 2BJJX 5HPQA 1D4NA 4LQ5A 3G3FA 3UA8A 3T96B 4F18A 1I6BA 1DMBA 1IZ1A 4G68C 4H0WA 4ZEDA 3RT6B 3FIRA 1QVSA 3R7XA 1ZJLA 1LFHA 4FEBA 3K0VA 1MH3A 4G68A 4THIA 1UTBA 3FGSA 1NNPA 5H8QA 4U22A 3VXBA 4JDFA 4OEVA 3B6QA 4I8CA 4OMBA 3MPLA 4YKPA 1MQGA 4C1TA 4Q8RA 4NF4B 1MDP1 2GFEA 4NTLA 4IO5A 2GH9A 3E9XA 1SBPA 2QS2A 1M5FA 4ZEBA 3RTFB 1TT1A 4RPNA 1R9LA 3IOWA 1JEVA 1B46A 1Y3NA 2IA4A 4I62A 3K1PA 3SEVA 2W7YA 3B6WA 4JWXA 1SW2A 3MVXA 1LSTA 4XKRA 4JWYA 3TYHA 3O2AA 3O6GA 3KGCA 4OESA 5CMKA 4ZEIA 3BFUA 1A8EA 1Y4TA 3CI8A 4F2QA 1LFIA 2NOOA 4HCWA 4FE8A 3H03A 4H6DA 1A7LA 1I69A 1Q35A 3MZ1A 2XXWA 4QFNA 4XXUA 1MH4A 3SEWA 3CG1A 1EZ9A 1S7YA 5J1DA 3E4RA 3RTWB 1FQDA 1MXXA 1L5TA 3PMXA 4DXBA 5I57B 1J1NA 2FA7A 3MZBA 2PBWA 3RLFE 3D4GA 4F31B 4MF3A 4ECFA 2OLBA 2XXXA 5JTYA 4NF6B 4Z7EA 2UYEA 4U1ZA 4ESWA 5BWJA 5HM4B 1FQFA 3K6UA 3MPKA 3MW0A 4U4SA 4OYVA 3SERA 4PQJA 3CR9A 3KEIA 3G3KA 3LSWA 3MVZA 2Q8JA 1B52A 3TTLA 2ZYOA 3U8QA 2VP1A 4R6HA 3FASA 2M8CA 2F97A 3N6UA 1YTVA 3LSLA 1UTBB 3RY3A 3OSQA 5HBCA 1XT8A 2A5TA 1OQGA 4MH5A 4OQOA 2ZNSA 4BDQA 4G8HA 4Q0CA 5H8HB 1Y1ZA 2REJA 5I58B 3OMBA 3VDFA 3I6VA 1NKXA 4WEPA 1B32A 1QUKA 3PUYE 1NH8A 4HW8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F19A 4O7IA 3A29A 3TTKA 4O3CA 4PCDA 4R74A 4P1LA 3SEUA 1M5BA 1MQJA 1Y1MA 4ELOA 2O7IA 2F36A 4OVSA 4TLMB 3VV5A 3T0JA 2DP8A 3JYRA 5I5PA 5ISUA 4NF5B 2WKYA 4LN5A 2AIXA 5AA1A 4MCOA 1NV0A 4M1VA 4XEQA 1WODA 4YB6A 1FQAA 1N04A 4MLVA 1XVYA 3ROJA 4ZZEA 3MJNA 2XXTA 4MNCA 5FBPA 5EHMA 1R6ZA 1O63A 4R75A 2XXRA 1Y9UA 4U1OA 5L8DA 3MUQA 1NUWA 1IMDA 1PB7A 3S2VA 4M4GA 2XHDA 2BJIA 2PFYA 4IY6A 3ILUB 4LATA 2QMWA 2V3QA 3LR1A 4F1UA 2ONKE 3KBZA 1T0KA 1LBXA 3LBSA 4I40A 1B4ZA 2V3UA 1B5IA 4OVRA 2ZYNA 2B4LA 5KDTB 3GBAA 2R71A 3PD9A 2HFBA 4PETA 4GOTA 2ONSA 1R9QA 1LBZA 4HE1A 5AA2A 1A40A 2AYSA 3EHTA 1MXYA 1SI0A 5CMBA 4YKIA 2F7CA 1BTJA 1LB9A 3T9HB 3KG2A 1RDXA 3IOVA 3OEMA 1NV6A 3FJ7A 4PE3A 2P3NA 5JEIA 2O7UA 1MXZA 4N13A 3RPLA 2NUVA 3ODBA 4X1DA 2XX7A 4NG7A 4FECA 4LA9A 3TMGA 1EU8A 4DXBA 4XKQA 3PUVE 1P1OA 3UGWA 4PBHA 5EQ8A 1AOVA 3IOTA 4N81A 1IIWA 4FBPA 4X9TA 3K6WA 4GXAA 2Y7WA 3SESA 1FTKA 3DP8A 4Q5TA 3B50A 3Q29A 1N3WA 4JXIA 5I2NB 1FQBA 3K01A 5KZTA 2R9JA 1BLFA 2XWIA 2FYIA 4RPOA 1POTA 3IB2A 3O6HA 4GVOA 4RJZA 1FPLA 4OFJA 3MWBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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