1XVYA

Crystal structure of iron-free serratia marcescens sfua
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
307
structure length
307
Chain Sequence
b'GIVIYNAQHENLVKSWVDGFTKDTGIKVTLRNGGDSELGNQLVQEGSASPADVFLTENSPAMVLVDNAKLFAPLDAATLAQVEPQYRPSHGRWIGIAARSTVFVYNPAKLSDAQLPKSLLDLAKPEWKGRWAASPSGADFQAIVSALLELKGEKATLAWLKAMKTNFTAYKGNSTVMKAVNAGQVDSGVIYHYYPFVDGAKTGENSNNIKLYYFKHQDPGAFVSISGGGVLASSKHQQQAQAFIKWITGKQGQEILRTNNAFEYAVGVGAASNPKLVPLKDLDAPKVDAAQLNSKKVVELMTEAGLL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Novel Anion-independent Iron Coordination by Members of a Third Class of Bacterial Periplasmic Ferric Ion-binding Proteins
pubmed doi rcsb
molecule keywords sfuA
source organism Yersinia enterocolitica
molecule tags Iron binding protein
total genus 109
structure length 307
sequence length 307
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1xvyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1xvyA02
2XX9A 5I2KA 4KCCA 1L5TA 5FTHA 2NXOA 5DTBA 4XIGQ 3D4GA 3C34A 5I57B 2G29A 3PUZE 4EQ9A 1XVYA 4ECFA 4LQ5A 3N5LA 3TQLA 1SW5A 3PUYE 1ANFA 1PDAA 4NF4A 4EQ7A 2ANJA 3O6HA 1JW1A 4GF8A 2HCAA 1PBQA 4DCXA 1RYOA 1FTJA 3PPQA 4FATA 1AIVA 4PQJA 4XKQA 1MY1A 4DXUA 3PU5A 3IO6A 5A5XA 1XS5A 2HZKA 4RPOA 1H3DA 1M5CA 2LAOA 1XOCA 3KGCA 4POXA 3CFXA 2Y7IA 4RYAA 3IX1A 4G2ZA 1LSTA 2RCAA 1B52A 4YKJA 3TPAA 5H8SA 4NF8B 1SBPA 2R71A 3HHGA 1HSLA 5TU0A 3WAFA 3KBRA 3R7XA 1JVXA 2PVUA 2H98A 3DLNA 2ESNA 3SERA 4EXLA 3KN7A 3WAEA 1N3WA 3Q26A 2DE3A 1SW4A 4HTGA 4G68C 1MPCA 2Z8EA 2XD3A 2WKYA 3VDFA 3CSGA 4GVOA 3OMBA 1TFAA 3K0VA 1YPNA 3MPKA 5AA2A 3MWBA 4GFRA 4R73A 1MPBA 1FW0A 3OELA 4U22A 1P1OA 3MVZA 3PD9A 3KJTA 3ILTB 1UTHB 1FQDA 1FTKA 2VD3A 2OWSA 3P7IA 4TLLB 5CBSA 5H8NB 4BDRA 2H9BA 2QRYA 3IR1A 1FQAA 4BDOA 4O3AA 4PE5B 2O69A 2R9JA 3O2AA 2I6EA 1MY3A 3U1OA 1B5JA 4G4PA 1MXXA 4JB7A 1A7LA 1IZ1A 5I2NA 2ONKE 1P99A 1SW2A 2F7AA 4G77A 2F6PA 1I69A 3ZSFA 3BBRA 3LBSA 2F35A 4RA1A 2DWJA 3FVGA 1JVYA 3MVYA 3MC2A 2XXVA 5FHMA 3RTFB 1USYH 3PPOA 5EHSA 4AQ4A 4YICA 1AH5A 4KI0E 4KD5A 4JSOA 4QFNA 1LCFA 5I59A 3K2DA 1EZPA 1MM6A 1XT8A 3K6XA 3SEUA 2I3WA 1A8FA 3H06B 1PB8A 3V5AA 2RC9A 4FORA 2Y7KA 3HV1A 3E4RA 4ZZEA 1A55A 2OWTA 3RPWA 3MQ9A 2UVJA 3V83A 4LZ7A 4NE4A 1NH7A 5ICTA 4NMYA 1MQGA 1B4HA 3T66A 3B7DA 3MZ9A 4MLVA 3QUJA 1DSNA 2OLBA 3MZ1A 3CIJA 4C1TA 3C35A 3FASA 2I58A 1IEJA 4QHQA 1B05A 2ZNTA 4JDFA 3RQTA 2KLFA 3S9LC 4R74A 2DVZA 4XKPA 3S2VA 1M5FA 1B32A 4ZEFA 1POTA 3A09A 2DE2A 3DP6A 3RNNA 4GIZA 5FHNA 4E0WA 1B3LA 3K1MA 2YPNA 4FEDA 2I48A 5I56A 2DOJA 1I6QA 1N76A 3VLWA 3DP4A 1HSEA 2ZYKA 4R72A 3ILUB 5CMBA 3TCHA 2XXWA 1MH4A 4NTLA 2QMWA 3ODBA 2QPQA 3FV1A 3F11A 1IUDA 3TZAA 3IB1A 4DLDA 3FZVA 3FGSA 4F1VA 3SEWA 4PETA 2PYYA 3HN0A 3QIMA 2A5TA 4OFLA 3C32A 1QKAA 5TP9A 2Q88A 1FQFA 3Q27A 1EH3A 2O51A 3BFUA 4DXCA 4NF4B 4NF6B 2Z22A 5DYHA 4GXSB 2XXRA 2I3VA 4LONB 3V89B 4ELRA 1US5A 1J1NA 2ZXTA 3LSXA 1ZBMA 1OVBA 4IO2A 2DS9A 3TODA 5CC2A 1IXGA 3PUVE 3OSRA 1USYE 5A5XB 3EHSA 3EHUA 1PB9A 2ABHA 1Q35A 2QS4A 4P0GA 5H8HA 4H1XA 2B65A 1MQIA 1DTGA 4F3SA 4KQPA 4YKPA 1B40A 3HHFA 3TMGA 4I8CA 1MPDA 1B5HA 1ZJLA 1LAGE 3TFLA 3O6GA 1LB9A 1Y1ZA 1Y3PA 1B58A 2HAUA 4HS7A 3LR1A 2UYFA 4PFUA 4H67A 4YB7A 4GQOA 4JBZA 3OXNA 1JNFA 4YZZA 1EU8A 3UA8A 1B9JA 3H4ZA 3KN3A 4AB5A 4N07A 4DDDA 1SD3A 2F6GA 5DEXA 4YB5A 3PPRA 4MBPA 3MP8A 1OMPA 3RT8A 2F97A 4N6PA 3MPLA 4GRKA 3U92A 3QXMA 1TWYA 4IO5A 3O29A 1VE4A 4TOZA 3MAMA 4ZZAA 4FEBA 5L9MA 2Y7PA 3TAJA 3VFJA 3E3KA 4U23A 1NL5A 4ZE9A 1JQFA 3RUMA 3ECRA 3HSTA 3CFLA 4GWOA 1NFTA 1EZOA 3IOUA 3O97A 4THIA 5KCJA 1MY0A 4GL8A 2UVHA 3K02A 3GLBA 3FXRA 4LATA 3MP6A 3PUWE 1D3KA 1II5A 4R9GA 2HZLA 2I49A 3OENA 5IKBA 3KEIA 1R1NA 2RCBA 2RC8A 4UA8A 4OENA 4OVJA 1JW4A 1OVTA 4I62A 3CG3A 3OOAA 1DMBA 5AA1A 3FVOA 2B3BA 4P11A 4F1UA 3S9MC 2QS2A 4QFPA 1ATGA 2RINA 2DE4A 2XX7A 1A54A 1BP5A 3K6UA 1S7YA 1GTKA 3E9XA 3M3FA 4TQUQ 3KG2A 4I1DA 3G3KA 2FYIA 1B5IA 3PV0E 3K1NA 4EXKA 3LSWA 2E1SA 3CSBA 1NNFA 2BJJX 4LQ2A 3W9VA 1P1UA 4GXAA 3IJXB 1YAEA 1SW1A 1R9QA 2P2AA 3OSQA 1N0TA 3CVGA 4EUOA 1PB7A 4C0RA 3H6VA 3S9NC 3VVFA 2H5YA 1H44A 2E0SA 4XTCQ 5CBRA 3O28A 4DE8A 3TEPA 3A3UA 3H6UA 5TPAA 3DM0A 2X7QA 4QRZA 1B1XA 3VLUA 4QF9A 4MF3A 1B51A 2ONSA 3TUSA 4DXBA 3GXAA 3VXCA 1VFDA 3VLVA 3IB0A 4KYEA 2V3UA 2OK2A 2NOOA 4OTEA 1VFEA 4ZE8A 2XXPA 3K01A 3FXUA 3M8UA 3W15C 2QL3A 3UP9A 2HEUA 2DQVA 3MW0A 4QSEA 4H8JA 1GV8A 3T22A 3FJMA 3SEVA 4IGRA 5F7VA 2YLNA 1MXWA 1LCTA 3JYRA 4U21A 4OXVA 3TCGA 5H8QB 5JTYA 4POWA 3U94A 2V3TA 3M3LA 3ZKKA 3FJ7A 4GOTA 1B1HA 4G8MA 5CI5A 1B2HA 3K6VA 4KYDA 3BFTA 1IITA 5I58A 1OQGA 3RY3A 4M4GA 4EDPA 1I6AA 3T9UA 2Z8DA 1SI0A 4X48A 1PEBA 2F36A 5HBCA 3UIFA 3PD8A 1UTBA 3B6QA 1CB6A 5AA4A 1Y3QA 3W9WA 3CFZA 1N04A 4PFTA 1FTLA 4F2OA 2RKMA 3IOVA 1QUIA 4Q5TA 1OIBA 3GBAA 3KZGA 3TTKA 4X1DA 4RPNA 3UK4A 1B0HA 3C31A 4KPTA 4EF2A 2NUVA 2ZNUA 2O68A 5AA2D 5K2XA 1A40A 1ZLQA 2PMSA 4IO6A 4IO3A 1URSA 3B6TA 3R6UA 2OZZA 1GGGA 2GFEA 3H6TA 1N7XA 3O66A 3ONMA 1EZ9A 3OO7A 1US4A 4IB2A 4QSDA 1PBPA 3RN8A 1IIWA 2HQ0A 4NEDA 4O3CA 1BLFA 3LC8A 3Q25A 2QJEA 2QMXA 3QSLA 3FJGA 1URDA 4F39A 1VR5A 4OYVA 5EYFA 1MXYA 3SEXA 4F29A 1AL3A 1D9VA 1LB8A 4IY5A 4I9DA 1FTOA 3U72A 1O63A 4R2BA 2YJPA 3RT6B 1MXVA 2HAVA 4NF8A 5AA3A 2DYXA 4BDMA 4FJPA 4N13A 5L9OA 4WEPA 1DTZA 1P1WA 4F2QA 1GR2A 3T9XB 2V84A 4F22A 5I2KB 3T9VA 3IK6B 1R6ZA 4F3BA 2REGA 3SKPA 1B3GA 2QS1A 3OD7A 3EQ1A 1FQBA 1MRPA 2REJA 2GHAA 1MH3A 2ALUA 4XKNA 5L8DA 4H6DA 2X7PA 4ZECA 4YMAA 3N6UA 1XHYA 2F7BA 1OLAA 2PX1A 4OEVA 3FD3A 2XXIA 4MLQA 1H76A 1UTHA 3N94A 4K3FA 3G3HA 1WDNA 3FATA 5H8FA 5J1DA 5B7DA 3FXQA 2XD2A 4IGTA 4YU0A 3VV5A 1O7TA 1IQ7A 4P0IA 3TTRA 2H25A 3U93A 2RF1A 1D4NA 4R6KA 3KOSA 3SEYA 2AIXA 2G93A 3ZS6A 4R2FA 4U4XA 5JK4A 2I0BA 3D4CA 3G3FA 5AE4A 4PFYA 3S9EA 4X9TA 3CRBA 5B70A 1URGA 1JEUA 2M8CA 1B0LA 4M1VA 1MQDA 1QUJA 5CMMA 5EHMA 4H8IA 3N26A 2GRVA 5BUUA 3A3CA 1D9YA 3TQWA 5KDTA 1RKMA 3C36A 4DIGA 1QVSA 2F5XA 4NWCA 1LGBC 4MFIA 4Z7EA 4PP0A 1DPPA 1QKBA 2UVGA 1LAFE 2FA7A 5AA2B 4H5FA 4YKIA 2NVUB 1R9LA 1OLCA 4HW8A 2I4BA 2ZYMA 5I84A 1FQCA 3UORA 1AOVA 2UVIA 3CI8A 2THIA 1QUKA 3TYHA 2XXHA 4WXJA 2V93A 4DCYA 4GLIA 3ZKLA 5CMCA 4EQBA 1IXIA 5JTYB 4F3PA 2DVCA 1ELJA 3TDJA 5I2NB 1B3EA 2FNCA 3EPEA 2DWAA 3FVKA 3MVWA 2F78A 4ISUA 4L17A 4JWOA 1ZU0A 2Q8JA 1A99A 3IORA 3MUQA 4WKMA 3IOTA 2NWJA 2AL5A 3C9HA 4ZS9A 4BDNA 4FAJA 4LA9A 1LBCA 4ELOA 2XXTA 3KJ7A 2F34A 1HSJA 3PUXE 4YKKA 1DOTA 3O9PA 2ZYNA 3DELB 4RY1A 3OO8A 5I59B 4KR5A 3PMVA 4Q0CA 4ONYA 3RGYA 3JV9A 1A8EA 3CG1A 1MXUA 4ESXA 4H0WA 5ICQA 1MS7A 3JZJA 5HPQA 3H7MA 1PC3A 5DT6A 3BKIB 5K2YA 4WEDA 4R75A 5CM6A 3RLFE 3KSJA 3USDA 3MBPA 3B6WA 3HPIA 4KCDA 1O64A 4NF6A 2D3IA 4QFLA 2VHAA 1NNKA 4KYSA 1NMUA 3PGFA 2ZNSA 2GH9A 3MJNA 1MG1A 3CR9A 4F1YA 1B46A 3VXBA 2O1LA 1P1NA 3I3VA 4MH5A 4RK2A 3AXFA 2VOZA 4YMBA 4FIMA 3UGWA 4NF5A 3SESA 1QULA 3TELA 4KFQA 3FIRA 2ONRA 3H6WA 5F1QA 2DWIA 1LFGA 4O3BA 5I56B 3T96B 1AMFA 3EN3A 2H4IA 2PBWA 4ELQA 4HCYA 2P0SA 4F3GA 5BWJA 3PPNA 1SI1A 2HFBA 3O6IA 3G7WA 1M5DA 3DP8A 2ZMBA 5DVFA 3TTLA 1JETA 2D5WA 1SVXB 3K4UA 3QYTA 4ZDMA 4U1ZA 2O7IA 1WODA 3G3GA 4LUBA 4G8HA 2D21A 2A5TB 3K1PA 1Q1KA 5TP9B 5HM4B 1MQHA 2F7CA 3QUFA 3PPPA 4OERA 3QAXA 3M3KA 3SETA 3GBBA 2I4CA 4ELPA 2XXUA 4G8NA 2XX8A 3C4MA 4OEUA 4G68A 3VVDA 4RK9A 5H8FB 3EHTA 5FHOA 3L6GA 4X1BA 2OJTA 1BIYA 1I6BA 1S50A 4XKRA 4Z0IA 5LOMA 1Z7NE 1MDP1 3TTMA 3TCFA 2XXXA 5IAIA 2B3FA 1B3FA 3FVNA 2Q2AA 2QSXA 1B7HA 1LFHA 1Y4CA 5H8HB 5ITOA 4OFJA 2DWHA 1B7ZA 5CMKA 1H43A 5ELVA 3HO7A 3RTWB 3OEMA 2V25A 3IB2A 3PMWA 2IA4A 2Q9TA 1Y3NA 4YAHX 1LAXA 4OHNA 4UACA 2UXAA 3HCQA 4JWXA 2I0CA 1Y9UA 1S9TA 2PT1A 4KHZE 2O6AA 1LBBA 2XXYA 4F31B 4BDQA 4F18A 5I57A 5KDTB 4OESA 3VVEA 1WVJA 4U4SA 3EF7A 1TFDA 1CE2A 2H99A 4DZ1A 4ZEBA 5DEXB 3T93B 1GVCA 2F8DA 2PT2A 1LFIA 1N3XA 4LZ8A 4Q30B 4R6YA 4ZEKA 3K00A 4FECA 4TLMB 4OWDA 3OO9A 4IY6A 2A5SA 1P1QA 4NWDA 1SDXA 4RXLA 3K6WA 1BKAA 2UYEA 5M2VA 1TT1A 3MP1A 1Z7ME 2ZYOA 1NKXA 3Q28A 3PMXA 1YTVA 1YCJA 5KCJB 2XHDA 1LLSA 1B6HA 2CZLA 1RYXA 4BLAA 2DP8A 5ISUA 1UIVA 1SQYA 4QFKA 4EF1A 4R9FA 1B7UA 1T0KA 4Q8RA 4OETA 4PFWA 1FQEA 4XXUA 1SYIA 2OBGA 1ZIUA 3TTNA 1IXCA 4OMBA 2Q89A 3KOTA 1TXFA 2QS3A 3KN8A 4RJZA 4GD5A 4LZ5A 2OCUA 4OQOA 3MZBA 3N6TA 3LSLA 4QSCA 3C33A 1QJMA 2AL4A 5CRYA 3GZGA 1NH8A 5H8NA 4IO7A 1Y4TA 1F9BA 2VP1A 2AYSA 3IL1B 4IO4A 2V3QA 3V8XB 1VSOA 2CMOA 5H8QA 4AB6A 2GHBA 3E13X 4JWYA 4H5GA 3OO6A 3MVXA 2O1MA 5ITPA 3QK6A 3VE1B 3L6HA 2Q2CA 3R26A 4U1OA 2Z23A 3U8QA 1ZMGA 1OQHA 2W7YA 1MY2A 4NF5B 1BTJA 1B4ZA 2O84X 3LUYA 4JSDA 1DPEA 5TPAB 1POY1 1JW5A 1JEVA 1IXHA 1SYHA 2VD2A 4QFOA 4C1UA 3IO4A 4U2RA 2IEEA 1MM7A 4JXIA 1M5EA 2RC7A 3FV2A 1ZKBA 1UIUA 3KFMA 3T9HB 5L9SA 4LVQA 3UN6A 3OEKA 3H3GA 4ZEDA 1MY4A 5JEIA 1N7WA 1N84A 1XC1A 2Y7RA 3THIA 1FTMA 1H45A 4FE8A 5DVJA 4F19A 5DVIA 3G3IA 3KSXA 2Y7WA 4ND9A 3FUZA 1XVXA 2DXYA 3I5OA 5KZTA 1NNTA 3IOWA 2X26A 3IAZA 4H65A 3G3JA 4G68B 1KWHA 1NNPA 5FTIA 4OFOA 2DXRA 4ZEIA 2P1SA 1M5BA 4OZ9A 3LSFB 3I6VA 3IJOB 4YB6A 1QW0A 3Q29A 4LP2B 1B3HA 4HCWA 5I58B 1LAHE 1MXZA 1Y1MA 2Y84A 2DSFA 4BDLA 2R6GE 4E0XA 1MQJA 1ZTYA 1UTBB 5AA4B 2VGQA 4R6HA 1FCKA 2O7UA 3SDFA 3S4UA 1Y20A 2HXWA 3TKDA 3H03A 1MDQA 2XXQA 4RNSA 4GL0A 2Z8FA 4ESWA 1UQWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XX9A 5I2KA 4KCCA 1L5TA 4N15A 5FTHA 2NXOA 1IMAA 2VT5A 5DTBA 4OVPA 1FBEA 1FBHA 3A29A 2QVUA 4XIGQ 3D4GA 3C34A 5I57B 2G29A 3PUZE 4EQ9A 1XVYA 4ECFA 1LBWA 4LQ5A 3N5LA 3TQLA 1SW5A 3PUYE 1ANFA 1PDAA 2VPNA 4NF4A 4EQ7A 2ANJA 3O6HA 1JW1A 4GF8A 1NV2A 1LBYA 2HCAA 4OA4A 1PBQA 4MNCA 4DCXA 3B50A 1RYOA 1FTJA 3PPQA 4FATA 1AIVA 4PQJA 4XKQA 1MY1A 4DXUA 3PU5A 3IO6A 5A5XA 1XS5A 2HZKA 4RPOA 1H3DA 1M5CA 2LAOA 1XOCA 3KGCA 4POXA 5F24A 3CFXA 2Y7IA 4RYAA 4PFRA 2WYPA 4PGPA 3IX1A 4G2ZA 3CHGA 1LSTA 2RCAA 1B52A 4YKJA 3TPAA 5H8SA 4NF8B 1SBPA 2R71A 3HHGA 4N6KA 1HSLA 5TU0A 2F3DA 3WAFA 3KBRA 3R7XA 1JVXA 2PVUA 2H98A 3DLNA 2ESNA 5I5PA 3SERA 4EXLA 3KN7A 3WAEA 1N3WA 3Q26A 2DE3A 1SW4A 4HTGA 4G68C 4P9KA 1MPCA 2Z8EA 2XD3A 2WKYA 4MMPA 3VDFA 3CSGA 4GVOA 3OMBA 1TFAA 3K0VA 1YPNA 3MPKA 5AA2A 3MWBA 4GFRA 4R73A 1MPBA 1FW0A 3OELA 4U22A 1P1OA 3MVZA 3PD9A 3KJTA 3ILTB 1UTHB 1FQDA 1FTKA 2VD3A 2OWSA 3P7IA 4TLLB 5CBSA 5H8NB 4BDRA 2H9BA 2QRYA 3IR1A 1FQAA 4BDOA 4O3AA 4PE5B 2O69A 4JVIA 2R9JA 1FPIA 3O2AA 2I6EA 1MY3A 3U1OA 1B5JA 4G4PA 1YZ0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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