4H0WA

Bismuth bound human serum transferrin
Total Genus 203
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
203
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
VPDKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAIAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Metal transport
molecule keywords Serotransferrin
publication title Iron and bismuth bound human serum transferrin reveals a partially-opened conformation in the N-lobe.
pubmed doi rcsb
total genus 203
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h0wA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h0wA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h0wA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h0wA03
4ZECA 3CSBA 5EYFA 3O6IA 5AA2A 2QRYA 4KYDA 5AA2B 4WKMA 2XXYA 3PPPA 2VGQA 3M3KA 1A40A 3GXAA 2O51A 3ILUB 4R6HA 4MBPA 4EUOA 2YJPA 5CBSA 1LAFE 2PVUA 1B5JA 2W7YA 5FHNA 1OLCA 1ZU0A 4GVOA 1PB9A 2QS3A 3H06B 3CRBA 1Y4TA 4U23A 2BJJX 3K6VA 3G3HA 3OEMA 3MPLA 4X1DA 1QULA 4F1VA 4YZZA 1Q1KA 4PFUA 3T9HB 2H9BA 2RINA 3SESA 3TELA 4GD5A 1LSTA 2I49A 4F3PA 1IXGA 3QYTA 1A55A 1MH3A 3C33A 1MDQA 2VP1A 2UVJA 4O3CA 1H45A 4OEUA 5KDTA 3HHFA 3MP8A 3L6GA 3FVOA 2DXYA 1ZTYA 3UA8A 3MVYA 5CMMA 1M5DA 4YMBA 5CMBA 1FQFA 4KCDA 1FQCA 5DYHA 3V5AA 4H6DA 4OZ9A 4U22A 3OMBA 3PPOA 3BBRA 4RYAA 1B7ZA 3KFMA 1DPPA 3KSXA 2F7BA 1O64A 2DP8A 2XXRA 1MS7A 3T66A 2D5WA 2F7AA 4OXVA 1FTJA 1HSJA 3P7IA 4NF4A 4NF4B 3K0VA 3OENA 4N6PA 1PC3A 4N07A 4AQ4A 5KCJA 5KCJB 1Y20A 4X9TA 2AYSA 2ZMBA 4PFTA 1LGBC 1JW1A 1P1WA 3E3KA 5AA3A 1M5EA 5CM6A 5AA4A 5AA4B 5I2NB 4F1YA 3O2AA 1JVXA 2AIXA 2UXAA 3IJXB 2PX1A 4KR5A 3QSLA 2UVHA 3IK6B 3G3IA 3ONMA 2ONRA 4NTLA 1I6AA 4O3BA 4FEBA 3HPIA 4ZS9A 2DWAA 2ONKE 5TP9A 3T9UA 2UVGA 2I0CA 4G68C 2ESNA 1R9QA 1EH3A 1VFEA 4YU0A 4RNSA 3KN3A 3WAEA 3QXMA 5ICTA 2HEUA 4YAHX 3RUMA 1QUIA 2ABHA 3IO4A 2NOOA 1LFIA 5JTYA 2I3VA 5EHSA 2YLNA 3D4GA 1I6BA 1OQGA 1ZLQA 4ZEDA 2ZNSA 2V3TA 1N76A 3PU5A 4H8IA 1JQFA 4KFQA 2XD3A 1QVSA 1S7YA 1MG1A 1ATGA 3CFXA 1MPDA 2Z22A 2CMOA 2XXTA 3KGCA 4PETA 1H3DA 1B4HA 4GL0A 5CMKA 2Z8FA 4Q8RA 4R74A 2H25A 3TCGA 1TXFA 3CR9A 3VLWA 1MPCA 1MM6A 1SW5A 5H8QB 5L8DA 4F39A 3RN8A 3QK6A 3IOTA 1MXYA 1JNFA 4LP2B 2G93A 1BP5A 3FUZA 3G7WA 4H8JA 2QMXA 5L9OA 1HSEA 1OMPA 1I69A 1SW1A 2ZYKA 4IY6A 3CIJA 3FXQA 4TQUQ 4R6KA 3V8XB 1MY1A 1UQWA 2OWTA 4MF3A 2Y84A 3S9EA 4C1UA 2Y7IA 1B46A 4YICA 1PBQA 3LC8A 5B70A 3T93B 5HPQA 5CRYA 2RF1A 3U8QA 4F3BA 4EXKA 4FIMA 4OMBA 3SEVA 1MM7A 2PBWA 3MBPA 2G29A 4GQOA 3SEUA 3TAJA 3KN7A 4H5FA 2HAVA 2B65A 4H67A 3K1NA 4NF5A 1SW2A 4NF5B 4DCXA 3TDJA 2F8DA 2OCUA 1B3GA 1JW4A 1FQDA 3VLVA 4G8MA 1URSA 4OVJA 1Z7ME 3PD8A 1AMFA 4TLMB 4I62A 3IOUA 2I3WA 3MWBA 4NF6B 1I6QA 4ZE9A 3TFLA 1BTJA 5ICQA 1FQBA 1CE2A 4NEDA 4RJZA 2P1SA 3FJGA 4C0RA 3FV1A 2M8CA 1J1NA 3TCFA 2QJEA 5FHOA 3G3JA 1US5A 3MVWA 3O29A 1NMUA 3OSQA 4WEPA 5F1QA 3VVFA 5ITOA 1NNTA 4LUBA 4DXCA 4R9GA 4ZE8A 2XXVA 2XXWA 4H5GA 4ELOA 3T9VA 2VD2A 2Q2AA 4RK9A 2QL3A 4Q5TA 3GBBA 1EZPA 4JWYA 1POTA 1BIYA 3RNNA 2V84A 4OQOA 2THIA 3M3FA 4TLLB 5CBRA 4O3AA 2RCAA 2B3BA 1B3FA 4GXAA 4IO6A 1B3HA 5DVJA 5I56A 5I56B 5BUUA 3N6TA 2F7CA 1HSLA 3PUWE 4Q30B 4THIA 4KYSA 1M5FA 1SQYA 3TCHA 2DS9A 4F1UA 4YMAA 3H4ZA 2VHAA 4U21A 4OERA 3HHGA 5LOMA 4JWOA 3RPWA 3U93A 3EF7A 3EHSA 3I5OA 3SDFA 2E1SA 3ZSFA 1LBBA 5KZTA 1AIVA 1MQDA 3SETA 3PMWA 2PT2A 1ELJA 4YB6A 4JWXA 4M1VA 3TTMA 4ISUA 1D3KA 2Q89A 3T96B 5ELVA 1CB6A 1Y4CA 1OLAA 1KWHA 3ZKKA 2O7UA 4BDLA 4Q0CA 5I2KA 4JXIA 1FTMA 3IR1A 3FJMA 4QFLA 4LZ8A 1XC1A 1ZJLA 1D9VA 3HSTA 4ZZEA 1B3EA 3OO7A 3MC2A 3DP4A 3IX1A 3PGFA 1OVTA 2FA7A 1MQHA 4RK2A 4PFYA 1M5CA 4OYVA 4KQPA 4RA1A 4GRKA 3DP8A 4C1TA 2DYXA 3SEYA 4OFLA 3EPEA 4ZDMA 1B51A 1MXWA 4OEVA 2YPNA 2ONSA 4DZ1A 2QS1A 2NWJA 1B6HA 1F9BA 4X48A 2X7PA 3MVXA 3A09A 3VXCA 1YTVA 2F34A 4F29A 3O9PA 4QFPA 2O6AA 3D4CA 1LLSA 5KDTB 1PBPA 3W9VA 3JV9A 2R6GE 2RC9A 3SEXA 3MUQA 1NL5A 1SI0A 2ZYOA 4LATA 1S9TA 5CC2A 3R7XA 4IO3A 1MXVA 4HS7A 3MZBA 4OTEA 2OLBA 2ZYMA 1P1NA 1BKAA 1OVBA 4LZ7A 3OELA 5I58A 5DVIA 2NXOA 2B3FA 2A5TA 2A5TB 4R2BA 4NWCA 3O97A 3PUVE 2OBGA 3BFUA 2V25A 3U1OA 3MP1A 3TPAA 2E0SA 3M8UA 1USYH 2OJTA 4OETA 3H6TA 5EHMA 3U92A 2X26A 4ESWA 1B7UA 1Y3PA 3ZKLA 3H3GA 1ANFA 3TTLA 4JDFA 4HTGA 4ECFA 3F11A 1FTOA 1JETA 2XXXA 3OO8A 4ELQA 4P0GA 1LAGE 5JEIA 3UIFA 1IITA 4K3FA 3MW0A 4YKJA 2O7IA 3ZS6A 2V3UA 5TP9B 4JB7A 2PMSA 5BWJA 1TT1A 3C9HA 3RGYA 1N0TA 2D21A 4OFOA 3FGSA 2I4BA 5HM4B 1IUDA 1URGA 3E4RA 2O84X 4AB5A 1MXZA 3H6WA 1RKMA 3C36A 5JTYB 3GBAA 1B7HA 4ELRA 3VVEA 1A7LA 3WAFA 5FTHA 1O7TA 1B1HA 1NKXA 4U1OA 3RT8A 1SI1A 3VVDA 1Z7NE 1OQHA 4ND9A 1TFAA 1B3LA 2HQ0A 1N7XA 1LAXA 3PMVA 2GHAA 5H8FA 4RPNA 5H8FB 2RCBA 2Z8DA 4ZEIA 4H1XA 2GFEA 3RTWB 2REJA 1A8FA 3E9XA 3FASA 1GGGA 1MQJA 1B9JA 1OIBA 4IY5A 4LQ5A 3TODA 3MAMA 4E0XA 4DCYA 3Q28A 3O6HA 3TEPA 3KSJA 4LA9A 3JYRA 2H5YA 3QUJA 5AA2D 3EHUA 3H03A 1D4NA 4F18A 4BDRA 1B1XA 4NF8A 4NF8B 3BFTA 3C35A 1B58A 3GLBA 3MZ1A 4GOTA 2DSFA 5IAIA 3QAXA 4XKNA 1VFDA 1AL3A 1Y3QA 1MY4A 5DEXA 5DEXB 2O68A 3IB1A 1WVJA 4XKPA 1L5TA 1LFHA 2O1LA 1SBPA 1VR5A 1N3XA 2DOJA 4HW8A 4F3GA 2XD2A 3IB0A 1MY2A 4BDOA 1JVYA 2R71A 3O6GA 3TKDA 3ODBA 4QFNA 2XX7A 4HCYA 1O63A 5AA1A 3O28A 5FTIA 1UIVA 4KHZE 3FVGA 4LONB 2Q9TA 2DE3A 2DVZA 1QUJA 3KJ7A 2V93A 1WDNA 4KPTA 1LB8A 3K2DA 3M3LA 4LZ5A 4H0WA 1Y3NA 2IEEA 1MPBA 3V83A 5AE4A 3VV5A 4PE5B 1Y1ZA 1Y9UA 1B5HA 1NH7A 4GWOA 4WEDA 4I8CA 4OESA 3N26A 3PPNA 5J1DA 1VSOA 1P1OA 3OO9A 3DELB 3FVNA 1MY0A 4QFKA 4R9FA 1EZ9A 2DE2A 4TOZA 1B05A 2XXPA 1B2HA 1R9LA 3FIRA 4DDDA 3T22A 2QSXA 4MFIA 3IL1B 1B32A 3KBRA 4ZZAA 1YCJA 1EU8A 3N6UA 3CFZA 3AXFA 2F36A 1UIUA 1MH4A 4PQJA 1T0KA 2FNCA 4R73A 5IKBA 4NWDA 3I6VA 1FQEA 3B6WA 3IAZA 1MY3A 3TMGA 1JEUA 2F5XA 1N04A 1B0HA 2F6GA 4PP0A 3LBSA 3HN0A 4FJPA 4G77A 3K00A 3TTNA 1R1NA 4KD5A 4R2FA 5L9SA 2RC7A 1LBCA 3Q26A 4G4PA 4BDNA 1H43A 3TTRA 5DT6A 2DXRA 2OZZA 3OD7A 1XVYA 1URDA 4I1DA 2ALUA 5M2VA 2F35A 4G68A 4L17A 4G68B 4GF8A 3N5LA 4MLVA 2PT1A 1SYIA 4XTCQ 1P99A 2GHBA 4ZEKA 1IIWA 3H6VA 1ZIUA 5I2KB 1FTLA 4ZEFA 5DVFA 4OFJA 5L9MA 3C31A 4XIGQ 4YB5A 4M4GA 3CG3A 1UTBA 1UTBB 2Y7KA 4OWDA 1GV8A 4Z7EA 3IOWA 1USYE 1ZBMA 2NUVA 2HZLA 2P2AA 4IO2A 4QHQA 4QF9A 1N84A 4IO5A 4POXA 1PB7A 4PFWA 5K2XA 4EDPA 2XX9A 3U72A 4DIGA 1NNKA 3ECRA 3MP6A 3VE1B 4NMYA 2Z23A 3B6QA 3L6HA 3LUYA 3UK4A 5H8SA 1QKBA 2O1MA 3HV1A 3FV2A 3O66A 1IEJA 3W9WA 4R72A 2DE4A 4FORA 2Q8JA 2LAOA 3MZ9A 3CFLA 4BDQA 1FW0A 1MQIA 3PPQA 1RYOA 1TWYA 3VLUA 3IJOB 1ZKBA 2CZLA 5CI5A 3A3UA 4QSCA 3RQTA 3G3GA 3FXUA 3CVGA 2X7QA 1IQ7A 3PMXA 1WODA 4EQBA 1AH5A 4P0IA 1NNPA 3UP9A 2ANJA 3K6UA 3JZJA 3OO6A 4XXUA 1H44A 3CG1A 3QIMA 4YKIA 5F7VA 1RYXA 5CMCA 5I57A 4KCCA 5I57B 3UGWA 4ELPA 5I58B 3TQWA 3USDA 2VD3A 2A5SA 3RT6B 4DE8A 4FECA 3PD9A 3S4UA 3KG2A 2HCAA 1US4A 3LSWA 1NNFA 3MQ9A 1DOTA 4Z0IA 3TZAA 2O69A 1ZMGA 3VDFA 1SW4A 3THIA 4AB6A 4IO4A 3G3FA 5H8HA 4GIZA 5H8HB 1BLFA 3OXNA 2KLFA 4DLDA 2XXIA 1H76A 3S2VA 1SYHA 2Q88A 4X1BA 4U1ZA 2Z8EA 5I2NA 2I4CA 5H8NA 5H8NB 1AOVA 4YKPA 3FJ7A 1SVXB 1MXXA 2UYFA 3KOTA 1A54A 1GVCA 2DQVA 3MJNA 1N3WA 3A3CA 4IGTA 1IZ1A 3FVKA 1QJMA 3VXBA 3W15C 1YAEA 3DP6A 2P0SA 2RKMA 1QKAA 2GRVA 4JBZA 4QSDA 2I0BA 3K1MA 5A5XA 5A5XB 1XHYA 1II5A 4IO7A 2ZNUA 1DPEA 1PEBA 1MXUA 1A8EA 5TU0A 1SD3A 3PV0E 4FE8A 4ONYA 2GH9A 2ZNTA 1LFGA 2NVUB 4MH5A 3OEKA 4FEDA 4KI0E 2D3IA 3PUXE 1B40A 1EZOA 4N13A 3LR1A 1N7WA 2XXQA 1GTKA 3K1PA 5ISUA 3Q29A 4HCWA 4LVQA 3OSRA 3K4UA 2R9JA 1NH8A 2XXUA 3IB2A 3U94A 3TUSA 4JSDA 1IXHA 3I3VA 3C32A 3FXRA 3TYHA 2WKYA 4XKQA 1JW5A 3FD3A 2REGA 4ZEBA 2F97A 1PDAA 1FCKA 2Q2CA 2QMWA 3KOSA 2H98A 5H8QA 4U2RA 1YPNA 3K6WA 5JK4A 4OENA 1B52A 3C34A 3IO6A 4BDMA 4IGRA 3IORA 3MVZA 4F19A 3S9LC 4R6YA 1XVXA 2AL5A 4UA8A 3B6TA 3C4MA 3BKIB 3ILTB 3FZVA 4U4SA 3E13X 4GLIA 2OWSA 3SEWA 1DSNA 2I48A 3VFJA 2H4IA 3KN8A 3N94A 2VOZA 1QW0A 3HCQA 3EQ1A 1LCFA 3K6XA 1XOCA 3R26A 4EQ7A 2PYYA 2DWHA 4WXJA 3CSGA 2HXWA 2XX8A 4NF6A 4UACA 4FAJA 1QUKA 3DM0A 5I59A 5I59B 2Y7WA 2QPQA 3R6UA 3KEIA 4QRZA 1A99A 1MDP1 4BLAA 4F22A 2QS2A 1Y1MA 4R75A 3H7MA 1XS5A 2DVCA 3HO7A 4EXLA 4F31B 3UN6A 3CI8A 4RXLA 3UORA 4EF2A 2DWJA 1S50A 3TQLA 1TFDA 3G3KA 4E0WA 2RC8A 1MQGA 5FHMA 1DMBA 1FQAA 1LB9A 3RTFB 3PUYE 2Y7RA 2F78A 4EQ9A 1D9YA 1P1QA 1XT8A 4I9DA 3LSLA 3S9MC 2DWIA 3IOVA 1LCTA 4DXBA 3TTKA 3SKPA 2XHDA 1IXIA 3H6UA 2ZXTA 2HAUA 1B4ZA 3Q27A 4XKRA 3K02A 4H65A 4EF1A 5ITPA 1SDXA 2F6PA 5I84A 5K2YA 1IXCA 3FATA 2OK2A 4KYEA 1B0LA 4G2ZA 2UYEA 4G8NA 4POWA 3KZGA 4GFRA 4MLQA 1DTZA 3EN3A 3OOAA 4F2QA 4YKKA 2H99A 2HFBA 4NE4A 2I58A 1Q35A 4JSOA 1LAHE 1POY1 3Q25A 5HBCA 4QSEA 1B5IA 1R6ZA 3RY3A 3GZGA 1MRPA 3LSFB 2XXHA 1VE4A 4YB7A 3PUZE 1DTGA 4RPOA 4IB2A 2Y7PA 3SERA 4ESXA 2IA4A 4FATA 3KJTA 2I6EA 4RY1A 2AL4A 2ZYNA 2V3QA 5TPAA 5TPAB 1GR2A 5DTBA 2QS4A 4QFOA 3DLNA 2FYIA 4GXSB 2HZKA 4GL8A 3QUFA 2UVIA 3K01A 4F3SA 3EHTA 3MPKA 3PPRA 3V89B 1NFTA 1P1UA 1M5BA 4DXUA 1FTKA 4P11A 1JEVA 3S9NC 4OHNA 5B7DA 3LSXA 3T9XB 4LQ2A 3RLFE 1UTHA 4F2OA 1UTHB 4G8HA 1PB8A 4U4XA 3B7DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ZECA 3CSBA 5EYFA 3O6IA 5AA2A 2QRYA 4KYDA 5AA2B 4WKMA 2KQZA 2XXYA 2GQ1A 3PPPA 2VGQA 3M3KA 1A40A 3BIGA 3GXAA 2O51A 3IFCA 3ILUB 4R6HA 4MBPA 4EUOA 1SPIA 4H46A 2YJPA 5CBSA 1LAFE 2PVUA 1B5JA 2W7YA 5FHNA 1FBCA 1OLCA 1ZU0A 4GVOA 1PB9A 2QS3A 4JVDA 4N91A 3H06B 1DK4A 3CRBA 1Y4TA 4MMPA 4U23A 2BJJX 3K6VA 3G3HA 3OEMA 3MPLA 4X1DA 1QULA 4F1VA 4YZZA 1Q1KA 4PFUA 3T9HB 2H9BA 5IGAA 4GX6A 2RINA 3SESA 3TELA 4GD5A 1LSTA 2I49A 4F3PA 1IXGA 3B8BA 3QYTA 1A55A 1MH3A 3C33A 1MDQA 2VP1A 2UVJA 4O3CA 1H45A 2PCRA 4OEUA 5KDTA 4GWZA 3HHFA 3MP8A 3L6GA 3FVOA 2DXYA 1ZTYA 3UA8A 3MVYA 5CMMA 1M5DA 4YMBA 5CMBA 1FQFA 4KCDA 5J16A 1FQCA 5DYHA 3V5AA 4H6DA 4OZ9A 4U22A 3OMBA 3PPOA 3BBRA 4RYAA 1B7ZA 3KFMA 1DPPA 3KSXA 2F7BA 4N15A 2CEXA 4P56A 1O64A 2DP8A 2XXRA 1MS7A 3T66A 2D5WA 2F7AA 4OXVA 1FTJA 1HSJA 4MEVA 2WBDA 3P7IA 4NF4A 4NF4B 3K0VA 3OENA 4N6PA 1PC3A 4N07A 4AQ4A 5KCJA 5KCJB 4X04A 1Y20A 3LUZA 4X9TA 2AYSA 1NV1A 2ZMBA 4PDHA 4PFTA 1LGBC 1JW1A 1P1WA 3E3KA 5AA3A 1M5EA 5CM6A 4P1EA 5AA4A 5AA4B 5I2NB 4F1YA 3O2AA 1JVXA 3T0JA 1NV5A 2AIXA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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