4H0WA

Bismuth bound human serum transferrin
Total Genus 203
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
203
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
VPDKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAIAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Metal transport
publication title Iron and bismuth bound human serum transferrin reveals a partially-opened conformation in the N-lobe.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
total genus 203
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h0wA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h0wA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h0wA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h0wA03
3UORA 3PUYE 4G2ZA 4R72A 1NNTA 2V84A 1I6BA 1IXCA 2Y84A 4QF9A 4I9DA 1A8FA 4M1VA 5L9MA 2O7UA 4YB5A 3DELB 5KCJB 4LVQA 1GR2A 4QFKA 5I2KA 3SERA 4OQOA 1JW5A 4ZZAA 4H8JA 5IKBA 5TPAB 4OZ9A 2I4CA 1IUDA 3OENA 3W9WA 2ZMBA 1SW5A 4MBPA 4XKQA 3HPIA 2VOZA 3WAEA 4OERA 5CRYA 5TP9A 4F31B 5L9OA 5H8FA 4IGRA 3BFUA 1GVCA 1LLSA 5AE4A 4NF4B 1FTJA 3FJGA 4YZZA 1B46A 1R6ZA 3PPPA 3FASA 2I58A 1DTGA 3MJNA 1WVJA 3FATA 3V89B 5DVJA 4EF1A 5CI5A 4IO6A 3MAMA 2O6AA 1JW4A 2O84X 4KPTA 4BDRA 4UA8A 3CFLA 3TMGA 3KGCA 2HFBA 2XX9A 1LSTA 2OWTA 1NH8A 2ZYNA 4PFWA 1T0KA 3QXMA 4DCXA 5I59A 3MZ1A 5I2KB 3OSQA 1B40A 1P1WA 2XD3A 3K6XA 5H8QA 4NWDA 5M2VA 4H5FA 4P0IA 1Y3PA 3C35A 4F39A 3QSLA 4R6YA 1LFIA 1QULA 2V25A 2V3QA 2Q2AA 2DWHA 4EQBA 5H8NA 5TP9B 5H8FB 3V8XB 5FHOA 1S9TA 2F6GA 4NEDA 4XIGQ 1MQGA 3BBRA 3FZVA 3Q28A 5DVFA 3IJOB 4LP2B 3K02A 5ICQA 2DXRA 3TTRA 1RKMA 3IO6A 4H6DA 3VXBA 3I3VA 1MY1A 1SI1A 1XOCA 2P0SA 4TLLB 4ELQA 3CFZA 4ISUA 1XT8A 2O51A 5EHMA 1FQBA 1DTZA 2HAVA 1Y3NA 3RY3A 3UGWA 1USYH 2Z8DA 3B7DA 4JBZA 2IA4A 1Y3QA 5I59B 1BP5A 4WKMA 3T9UA 3O9PA 4OHNA 2R9JA 5B7DA 2Y7PA 3I5OA 3CRBA 4QSEA 1FQCA 1VFDA 4IO4A 2HCAA 1US5A 3CSBA 4F18A 4PFUA 4ZEDA 3T96B 4THIA 3MWBA 1URSA 4NWCA 1MRPA 4PFYA 4AB6A 4TQUQ 1MPDA 4BDLA 1QJMA 1MDQA 3ECRA 4C1UA 3SEVA 1XVYA 5KZTA 2G93A 3FV2A 4EDPA 4ZEIA 5CC2A 2O1LA 5I58A 2ABHA 1URGA 3FVGA 3IK6B 3N26A 2I4BA 2QJEA 1MY2A 4YB6A 5H8HA 4U4SA 4DDDA 1AIVA 1MXXA 4TOZA 3FUZA 2Z22A 1MPCA 2ZNUA 4RJZA 4OENA 1EZ9A 3MP8A 1LAGE 1PC3A 3KOTA 1QUJA 4ZE8A 3PPQA 1PB9A 3EPEA 1N04A 4JXIA 4XKRA 1TFDA 1ZIUA 3G3GA 3S2VA 5HPQA 2E1SA 2UVGA 3IOUA 1D9YA 2I6EA 3CIJA 3SETA 1Q1KA 2DXYA 2YLNA 1B4HA 2HZLA 3IJXB 4IY6A 1LCTA 2DS9A 2I0BA 5FTIA 4G68C 4X1DA 4EF2A 2Q9TA 1DOTA 3MPLA 4R74A 4ZE9A 4JB7A 4N07A 3MUQA 1H45A 4P11A 4OFJA 2M8CA 2I3WA 1BKAA 1XVXA 2Z8EA 4QRZA 5I58B 3IO4A 4GRKA 3I6VA 4Q5TA 3VXCA 3SESA 5H8HB 1VSOA 1UQWA 4BDOA 3SEYA 4KFQA 2O1MA 2OJTA 4MFIA 5CBRA 3ODBA 1BIYA 3PPNA 4LQ5A 2VP1A 4EXLA 5K2XA 3CSGA 1DPPA 1AOVA 4H1XA 3IAZA 4RK9A 1FTMA 3MVWA 4F3GA 3TZAA 3TUSA 2DOJA 4PP0A 5CMBA 2ZYOA 4LZ5A 4KCCA 2ZYMA 2Y7WA 1N7WA 3FJ7A 4C0RA 1B7ZA 3E13X 3MP1A 1NH7A 1MDP1 3JV9A 3TQLA 1SI0A 4KD5A 3B6WA 4KI0E 3H6VA 4LONB 4YB7A 4ESXA 4HW8A 1FTOA 4H0WA 3K6VA 2REJA 4DXCA 1LFGA 4LA9A 4OEUA 1Y1MA 1RYXA 4GQOA 2HAUA 5JEIA 3S9LC 3C33A 4R6HA 4IY5A 2QPQA 3ZSFA 4POXA 3V83A 4MLVA 4Q30B 1B51A 4PE5B 4EXKA 4K3FA 1ANFA 3E4RA 3T9HB 4C1TA 3W15C 1POTA 5IAIA 5AA3A 4R73A 5DYHA 2OLBA 3UA8A 3KN3A 4PETA 5HBCA 1MXVA 2FA7A 3RT6B 1OVBA 3M3LA 3VLUA 3FVOA 2UYEA 3MZ9A 3A09A 4OETA 3KN8A 4Z0IA 3U94A 4N6PA 4X9TA 1B7HA 3TTMA 4ZEBA 2F97A 2DVCA 3IR1A 2PBWA 3MP6A 4I1DA 4R75A 2QMXA 3FD3A 4KYDA 3S9MC 1OVTA 2RC9A 4YAHX 3H06B 5H8SA 3AXFA 3Q25A 4HCYA 1S7YA 1PBPA 3SEWA 2GFEA 2XXYA 5CM6A 4OESA 1VFEA 5I57A 1SD3A 3G3FA 3G3JA 2UXAA 3VVFA 4H8IA 1M5EA 3M8UA 3IL1B 3TPAA 1B3LA 5AA4B 4XTCQ 1MH3A 2GHAA 4MLQA 3TODA 2HXWA 3OSRA 1IXHA 3FXQA 2Q89A 1QW0A 1N3XA 1MQJA 4F2OA 2ZNTA 1B5HA 1B9JA 4ELRA 1MH4A 3QUFA 1OLAA 3O6GA 4P0GA 1B7UA 1MQDA 4H67A 5FTHA 3RNNA 1A40A 2ONKE 4GLIA 1Q35A 4JSOA 2ONSA 2H5YA 1M5DA 3B6QA 4OMBA 4NF8A 5AA2A 5DTBA 1ZJLA 2F35A 4ZDMA 1JETA 1JVXA 3RQTA 2FYIA 2AL4A 3UP9A 4DLDA 1BLFA 1JEUA 4JWOA 1NFTA 3KOSA 2UVJA 2QRYA 3VV5A 5I57B 2RCAA 1Y4TA 4O3CA 2Y7KA 3VVEA 1AH5A 2XXWA 4GOTA 3GZGA 3FJMA 3IB1A 1P1OA 1LAHE 1I6QA 3TDJA 3R7XA 2DWJA 3RTFB 3QIMA 4AQ4A 3DP8A 5FHMA 4F29A 3TFLA 4FECA 4ECFA 1OQHA 4RY1A 3H6WA 4KCDA 2Y7RA 1P1QA 3O29A 2DE2A 1MXZA 1FTKA 2F5XA 4NF8B 5AA2B 2F8DA 4Q0CA 3PUXE 4F2QA 3UK4A 4H5GA 3UIFA 1OMPA 1LB9A 4ZECA 4KR5A 3M3KA 1GTKA 1ELJA 3FV1A 2WKYA 2B3FA 3H6UA 1B52A 4FE8A 1TWYA 5JTYA 4G8HA 3S4UA 2XXVA 2YJPA 4YKIA 3TEPA 4UACA 3IX1A 4ELPA 3EQ1A 5H8QB 4YKJA 4FAJA 3O97A 4E0XA 3KJ7A 3ILUB 3S9NC 1QKAA 5H8NB 2F6PA 3BKIB 1YCJA 4ZEKA 5DEXA 1HSEA 4WXJA 5K2YA 2I48A 2DP8A 3SDFA 4R9GA 1B58A 3QUJA 4DIGA 1OQGA 1UTHA 4QSDA 1R9QA 2F7AA 4LZ8A 1PEBA 4F1UA 2DE3A 1AMFA 4Z7EA 4NMYA 1P1NA 4LZ7A 2DQVA 3G3IA 3G7WA 4DE8A 1B1XA 1FW0A 4H65A 1LBBA 3D4CA 2DSFA 3H03A 2UVHA 3S9EA 4G68A 3FIRA 4KYEA 2ZYKA 2ZXTA 1SW1A 1URDA 5FHNA 1H3DA 3VLWA 2HEUA 3HN0A 1P1UA 1BTJA 3DLNA 1Y20A 4RPNA 3V5AA 2H4IA 1NL5A 3OO7A 4WEDA 2RINA 1A8EA 4YKPA 1MY0A 3HO7A 3PD8A 3EHUA 1O7TA 1H44A 2GRVA 3PU5A 3CI8A 3K6UA 2NXOA 5BWJA 3LR1A 3OXNA 3N6TA 2RC8A 3KFMA 1UIVA 3FXRA 1IEJA 5ITPA 3RT8A 2I49A 2VD2A 1UTHB 4ELOA 3EHSA 2F78A 4O3AA 1B3FA 3HSTA 3PV0E 3CFXA 3ZKLA 3HCQA 4YMAA 3WAFA 4QHQA 3O6IA 4G68B 4U22A 3BFTA 3D4GA 1CB6A 2QS1A 3P7IA 1N7XA 2PYYA 3U8QA 2RCBA 2XXRA 1HSLA 3CG1A 2DVZA 1QKBA 4EQ9A 3KG2A 3E3KA 2F36A 2XHDA 4GXSB 4OEVA 4YICA 4IO7A 1MXUA 1H43A 3IOWA 3K1NA 4GL0A 3C32A 2DWIA 2UYFA 5KDTA 2I0CA 5DT6A 4GFRA 1B0HA 3TQWA 3DP4A 1FQAA 1IXGA 3LSLA 3TTKA 2QS4A 4O3BA 4LATA 2O69A 1XS5A 2ONRA 1MY3A 2XXQA 3GLBA 3FXUA 2V93A 2DWAA 3LC8A 5J1DA 1B4ZA 2NVUB 2DE4A 2PT2A 3RPWA 1SYHA 3KN7A 4QFNA 3GBBA 5ITOA 2PT1A 3TTNA 3MW0A 4LQ2A 3FVNA 4NE4A 3MVZA 2A5TA 3Q27A 2AL5A 1DPEA 1A99A 1XHYA 3U93A 5ICTA 4POWA 3QAXA 2QMWA 4FIMA 3C31A 4PFTA 1VE4A 4PQJA 4FORA 3MVXA 1SVXB 2R6GE 1PB8A 1Y4CA 3ZS6A 3U1OA 4R6KA 4IGTA 5JK4A 1IQ7A 3MC2A 5CMKA 2QS3A 3R6UA 1DMBA 4GVOA 2ALUA 1TT1A 1HSJA 1B3GA 2AIXA 4QFOA 5KDTB 2B65A 1KWHA 2X26A 1IXIA 2B3BA 1J1NA 1EZPA 2XD2A 3O2AA 4NF4A 1FQEA 2ESNA 3TAJA 2V3TA 1JEVA 4GD5A 3H6TA 4X48A 2XXXA 3SKPA 1IITA 3PMXA 2D21A 2XXUA 2A5TB 1F9BA 4FATA 3G3HA 3PPOA 3K0VA 2LAOA 1EH3A 1IIWA 3O28A 1LAXA 3RGYA 1YPNA 4RYAA 1MXWA 1M5FA 1SQYA 1B05A 3KJTA 3FVKA 2QS2A 4YU0A 2OCUA 4RNSA 4U2RA 3W9VA 3PPRA 3VDFA 1ZTYA 1R1NA 4RK2A 4YKKA 4BDMA 1JNFA 4F22A 2W7YA 3EN3A 1N76A 3HHFA 4TLMB 1H76A 1TFAA 4RA1A 5ISUA 3U72A 1FQFA 5DVIA 3LBSA 3R26A 4U23A 2Q8JA 4BDQA 1D3KA 4ZS9A 3ILTB 2Z8FA 1II5A 4OVJA 4QFPA 2REGA 1DSNA 4OYVA 4XXUA 1I6AA 1S50A 3EHTA 1A7LA 3SEUA 3FGSA 4GXAA 1D9VA 1I69A 1JQFA 1N3WA 5F1QA 2H99A 3F11A 2D5WA 3LSFB 3IB2A 4DCYA 1O63A 2E0SA 1MG1A 2FNCA 3B6TA 3Q26A 3TELA 3T9XB 5I84A 2CZLA 1N84A 1FTLA 3A3UA 3G3KA 2XXHA 1LAFE 3MQ9A 2IEEA 3OOAA 2RF1A 3LSXA 3SEXA 1Y1ZA 4OTEA 5HM4B 4FEBA 1CE2A 1JW1A 1ZMGA 1SDXA 3MBPA 1B6HA 1NKXA 2VD3A 5LOMA 2OWSA 4HS7A 4JSDA 1TXFA 5L9SA 4JWXA 1MY4A 1B3HA 1PBQA 2XXIA 2OZZA 4X1BA 4NTLA 4EQ7A 1QUKA 4E0WA 3RUMA 3VE1B 5AA2D 2H98A 3QYTA 4IO2A 2RKMA 2ZNSA 3DP6A 1AL3A 4GIZA 4QSCA 3K4UA 3OELA 1MQHA 5CMMA 2BJJX 3LSWA 3K6WA 1LFHA 3N94A 1ZKBA 2XX7A 2CMOA 2O68A 4KQPA 3RLFE 4HCWA 1FCKA 1M5CA 4LUBA 2NWJA 4OFOA 5EHSA 2V3UA 3HV1A 2UVIA 3K01A 4NF5A 3VLVA 1GV8A 2QSXA 1Z7NE 1Y9UA 4YMBA 1Z7ME 3DM0A 4HTGA 1MM7A 1POY1 3T22A 3KSJA 1SBPA 1OIBA 4WEPA 3C4MA 3K2DA 3IORA 4ONYA 4MF3A 3IOVA 3RN8A 5A5XA 1PDAA 1B2HA 5AA1A 4G8MA 4MH5A 3OEMA 2KLFA 1MQIA 5EYFA 3PGFA 4N13A 1LBCA 2I3VA 4L17A 2XXPA 3E9XA 5L8DA 4AB5A 1YAEA 3RTWB 2OK2A 2F7CA 3L6HA 3OO9A 4OWDA 1MM6A 4U1OA 5F7VA 3K1PA 4U4XA 5B70A 3TYHA 2YPNA 5I56A 3OO8A 4OFLA 3JYRA 4JDFA 2XX8A 2H9BA 1OLCA 5ELVA 5JTYB 3PD9A 4NF5B 3OO6A 1FQDA 4JWYA 4FJPA 3TKDA 2GHBA 3T9VA 1SW2A 5BUUA 3MVYA 4BDNA 3OEKA 1ZLQA 3PMVA 4R2FA 4F19A 3KEIA 5CMCA 3EF7A 1UTBA 1B0LA 1JVYA 2AYSA 3VVDA 3MZBA 2Q88A 1B5IA 1EZOA 3M3FA 1MPBA 1LCFA 5A5XB 5DEXB 1N0TA 4F3SA 3A3CA 3O66A 4G77A 3K00A 2ANJA 1NNFA 2RC7A 4GF8A 5TU0A 4DZ1A 3Q29A 2Z23A 3N6UA 4KYSA 1B32A 2F7BA 2PX1A 2XXTA 4F3PA 1WDNA 4I62A 3TCHA 1R9LA 1A55A 2F34A 2DYXA 3PUZE 1ZU0A 5I56B 2A5SA 4ZZEA 2P1SA 2D3IA 3C9HA 1A54A 3CG3A 4R2BA 4F3BA 1MXYA 1XC1A 3H7MA 1B5JA 4GL8A 4DXUA 4ND9A 3THIA 4NF6A 3C36A 3K1MA 3OD7A 1P99A 3PUVE 4F1VA 3QK6A 4I8CA 4G4PA 3ZKKA 2X7PA 1USYE 3H4ZA 1UTBB 3KBRA 3PUWE 3N5LA 5I2NA 1NNPA 1US4A 2GH9A 1SW4A 4RXLA 4DXBA 2QL3A 3LUYA 4ESWA 1QUIA 3U92A 2Y7IA 2VGQA 3TCFA 3ONMA 4BLAA 3HHGA 1UIUA 4U21A 1L5TA 4GWOA 3TCGA 5CBSA 4QFLA 1B3EA 3VFJA 3O6HA 2X7QA 1PB7A 1NNKA 4U1ZA 1EU8A 1SYIA 2NUVA 4XKPA 2HZKA 3PMWA 1MS7A 3IOTA 3T66A 3CR9A 5KCJA 3GBAA 3H3GA 2G29A 4XKNA 2R71A 4ZEFA 3KSXA 5TPAA 3JZJA 2OBGA 5AA4A 2NOOA 4NF6B 1LB8A 4IB2A 1WODA 3MPKA 1YTVA 4KHZE 3GXAA 1M5BA 2H25A 2PVUA 3OMBA 1QVSA 3CVGA 2HQ0A 1O64A 2VHAA 1RYOA 5I2NB 4IO3A 4IO5A 3USDA 3TTLA 3UN6A 4RPOA 4R9FA 1LGBC 2O7IA 2P2AA 1ATGA 1B1HA 1GGGA 3T93B 2PMSA 4M4GA 1IZ1A 1ZBMA 2Q2CA 1VR5A 3IB0A 3C34A 4EUOA 4Q8RA 3KZGA 4G8NA 4F1YA 4OXVA 1NMUA 2THIA 3L6GA 4FEDA 1D4NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UORA 3PUYE 4G2ZA 4R72A 1NNTA 2V84A 1I6BA 1IXCA 2Y84A 4QF9A 4I9DA 1A8FA 4M1VA 5L9MA 2O7UA 4YB5A 2ZZVA 3DELB 5KCJB 4LVQA 1GR2A 4QFKA 5I2KA 3SERA 5I3SA 4OQOA 1JW5A 4ZZAA 4H8JA 5IKBA 5TPAB 4OZ9A 1G0HA 2I4CA 1IUDA 3OENA 4O94A 3W9WA 2ZMBA 1SW5A 4MBPA 4XKQA 3HPIA 2VOZA 3WAEA 3HFUA 4OERA 1FBGA 5CRYA 1FPLA 3FXBA 5TP9A 3BIHA 4F31B 5L9OA 5H8FA 4IGRA 3BFUA 1NV7A 1GVCA 1LLSA 5AE4A 1NV5A 4NG7A 4NF4B 1VDWA 1FTJA 3FJGA 1IMDA 4YZZA 1B46A 1R6ZA 3PPPA 3FASA 2I58A 1DTGA 3MJNA 1WVJA 3FATA 3V89B 4PBHA 5DVJA 4EF1A 5CI5A 4X8RA 4IO6A 4UABA 3MAMA 2O6AA 1JW4A 2O84X 4KPTA 3KC0A 4BDRA 4UA8A 3CFLA 3TMGA 3KGCA 2HFBA 2XX9A 5LTCA 1LSTA 1DCUA 4N8GA 2OWTA 4GX4A 2XWVA 1NH8A 2ZYNA 1FBCA 4PFWA 1T0KA 3QXMA 4DCXA 5I59A 3MZ1A 5I2KB 4PBQA 3OSQA 4MMPA 1B40A 4XEQA 1P1WA 1FSAA 2XD3A 3K6XA 5H8QA 4NWDA 5M2VA 4H5FA 4P0IA 1Y3PA 1K9ZA 3C35A 4F39A 2DDKA 3QSLA 4R6YA 1LFIA 1QULA 2V25A 1FPFA 2Q2AA 2V3QA 2DWHA 3A29A 4EQBA 5H8NA 5TP9B 5H8FB 3V8XB 4NF0A 5FHOA 1S9TA 2F6GA 4NEDA 4XIGQ 1MQGA 1RDYA 3BBRA 3FZVA 2WBBA 3Q28A 5DVFA 3IJOB 4LP2B 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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