1FTOA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in the apo state at 2.0 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftoA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftoA01
3RT8A 4FEBA 2DWIA 5I59A 5J1DA 3JYRA 3G3IA 4LVQA 3CRBA 1ZBMA 3LC8A 4YU0A 3HN0A 4YKPA 4FORA 5CMKA 1MPDA 2NWJA 2O1LA 3I5OA 5B7DA 3DP8A 3FJGA 4X1BA 1GGGA 3MZ9A 3FXUA 1MH4A 4MLVA 1IITA 5ICQA 1URSA 4POWA 1N3XA 1NH7A 5F1QA 1XVXA 1TFDA 3O29A 4TLMB 2AIXA 5TPAB 1JW5A 2X7PA 3LSWA 5JK4A 5CMBA 5L9OA 5H8HB 1WODA 4KYSA 1JVYA 3O6GA 1YAEA 3H03A 1I6BA 2ZNUA 1QW0A 4NF8A 3T9XB 4GF8A 3C35A 1S50A 4DXBA 1EZPA 5I84A 3I6VA 2REGA 2V25A 3K01A 1EH3A 4KCDA 4XXUA 4YICA 3UN6A 1H45A 2RC7A 4NTLA 4C1UA 4JWOA 2H98A 3T93B 1J1NA 3C31A 1M5FA 1ZMGA 3FD3A 3N94A 2QS3A 2HZLA 4X48A 4GXAA 4IO6A 4JSDA 3TTRA 1Y3PA 1MS7A 4RPNA 2XXTA 2QMXA 3O6IA 5I2NA 3W9VA 3PUWE 2I6EA 4F2QA 4MH5A 4G77A 2X7QA 4OFJA 4KFQA 1MPBA 4YAHX 5TPAA 4ELQA 5I2KB 1A40A 1B46A 2O84X 1M5EA 4U21A 3K1PA 1HSEA 4F2OA 2OBGA 3L6HA 2PBWA 1QUKA 3CFZA 1LCTA 1PB7A 3K0VA 4RPOA 4THIA 1SDXA 2CMOA 3EQ1A 1IXIA 3E9XA 1AOVA 3TQLA 1URDA 3MVZA 2R9JA 2ZNTA 3O6HA 5H8QB 1B1XA 3G3JA 1GVCA 1BLFA 3V89B 3PPQA 3N6UA 4JXIA 1NNKA 3PUXE 1M5DA 3H06B 3MVWA 1SBPA 4U23A 3O28A 4BLAA 2DSFA 2YJPA 3CG3A 3KOTA 4FAJA 1GR2A 3E4RA 4QSEA 1YCJA 4F18A 1MG1A 1EZ9A 2Z22A 3KJTA 1B51A 3TTKA 2Y7PA 2FYIA 1MM6A 4OFOA 1NNTA 1PB8A 5I58B 3FIRA 3H6VA 1AH5A 3QK6A 1MY1A 1B05A 4IGTA 4M4GA 5HPQA 2V3QA 4HS7A 4KQPA 5I56B 3MVYA 1OMPA 3OMBA 1B7ZA 4NF4B 1B3FA 3TFLA 2HCAA 3FATA 1VR5A 2ZYOA 3I3VA 2VP1A 3CVGA 4RYAA 5I2KA 1KWHA 1LB8A 4IO4A 3MUQA 1QUIA 1IIWA 2V93A 3G3GA 3PPNA 3BKIB 4Q8RA 3MZ1A 1LB9A 4GQOA 4R2FA 4R9FA 2F5XA 3T9VA 4GLIA 2I0CA 1Y3NA 2UYFA 4LONB 5H8QA 3K6VA 1Q35A 3S4UA 3FVNA 2VGQA 2P1SA 4IY6A 3BFUA 3PV0E 4GXSB 1QJMA 5FHMA 4RNSA 4G2ZA 4OETA 1B5HA 4U4SA 3IB0A 4DZ1A 1B3LA 2XX7A 1B52A 3W15C 4R75A 2XXQA 3C4MA 3TEPA 4LZ7A 1LAFE 2E0SA 3KFMA 4OFLA 3T96B 4LQ5A 1N0TA 2NXOA 2F7CA 3RLFE 3MJNA 1IZ1A 3IB2A 3H6TA 1B3GA 1B5IA 3O9PA 1MY0A 1BIYA 2RF1A 1BKAA 1D3KA 4XKNA 1JNFA 4I9DA 3CR9A 4OWDA 4YZZA 1DMBA 1POY1 3FVOA 3LBSA 5AA2A 2Y7KA 3JZJA 2NVUB 4JBZA 3UIFA 1QKBA 4R73A 1VFEA 3IK6B 4G8NA 1FQEA 1N7WA 3GBBA 1A54A 2HAUA 3E13X 3OSQA 5CMMA 4EF1A 3VLWA 1Y9UA 5CI5A 1USYE 4PFTA 1PC3A 3H4ZA 2H5YA 5CBRA 2DOJA 5DEXB 1LBBA 1SW1A 2YPNA 1SW4A 1MXXA 5CMCA 2F8DA 4G68B 3U94A 3OO7A 2OWTA 3SKPA 3QAXA 3MZBA 2Y84A 4KYDA 5DTBA 5L9SA 1MDP1 3HPIA 1ZJLA 4YB6A 1BP5A 1SI1A 4OZ9A 3CIJA 2ZNSA 2AL4A 1Z7ME 3OEMA 1DTZA 3RTWB 3VLVA 4GL0A 3A3UA 1OVTA 1DPPA 4F39A 2ALUA 4TQUQ 3RGYA 3KJ7A 2XXHA 1OQHA 4XKRA 1Y20A 4QHQA 2O6AA 4JWXA 3FV2A 1US5A 3DM0A 3E3KA 1OIBA 1N7XA 5AA2D 2QSXA 2D21A 4NF8B 2P2AA 3RUMA 4M1VA 5JEIA 5DVIA 1MY4A 1NFTA 1JQFA 4RA1A 1N3WA 5ISUA 5EHMA 4NWCA 2I49A 3L6GA 3ILTB 4FATA 2HQ0A 3PU5A 4XKQA 1RYXA 5DEXA 4H0WA 3O97A 4R6KA 4G68A 2F34A 3K1MA 1MXYA 3V5AA 3A3CA 3T22A 3VE1B 4ESWA 3KN8A 3M8UA 5ELVA 5JTYB 1NKXA 5I2NB 4ESXA 1MXVA 4L17A 4MBPA 3T9UA 3TKDA 1TT1A 3KBRA 3TMGA 4N6PA 1SYHA 4IY5A 2GHBA 2E1SA 2HFBA 3S9MC 1XS5A 3OO6A 2QPQA 1EZOA 5DT6A 2DE3A 3LSLA 4PQJA 5AA4B 4KYEA 3JV9A 2ONSA 1ZIUA 1WDNA 3VXBA 2O51A 1Q1KA 5H8FA 2GHAA 4YMAA 4G8MA 3GXAA 2ZXTA 4LA9A 3V83A 3IOTA 2XXUA 3VDFA 2F36A 4ELRA 2AYSA 1NL5A 2F97A 2QS1A 4PFYA 1H44A 2A5TB 4I8CA 2DWAA 1OQGA 1I6AA 3CFLA 3N6TA 2B65A 3TDJA 5KCJB 4DXCA 1FCKA 4OENA 4AB5A 1AMFA 1L5TA 2Q89A 3K6XA 3P7IA 5IKBA 3OSRA 4BDOA 2DWHA 2Z8FA 2QS2A 5JTYA 3U1OA 5KDTA 4IO5A 3PGFA 2XXYA 4F1VA 1SW2A 1DTGA 2V3UA 1SQYA 1IQ7A 4LUBA 2Q2CA 1B5JA 4GFRA 5F7VA 3K00A 4EDPA 1YPNA 2VD3A 5AE4A 2F6GA 2F7AA 3O66A 1D9VA 2G29A 3U8QA 4OQOA 3EHUA 4E0XA 1URGA 3PPOA 5AA4A 4X1DA 3IOVA 2PT1A 3K4UA 2F6PA 5TU0A 3OOAA 2ZYMA 2O68A 3PD9A 3USDA 3SDFA 4EXLA 3V8XB 4GD5A 1B58A 4DXUA 3MWBA 3RTFB 1JEUA 3PPRA 2A5TA 3S9LC 4ELOA 1ZKBA 4OHNA 1A8EA 1HSLA 1UTBA 2I3VA 2Q2AA 4GRKA 5KCJA 2QJEA 2QL3A 1FQBA 1Y1MA 3QXMA 2D5WA 3K6WA 3Q26A 3EPEA 4OYVA 1Y4CA 4EQ7A 2VOZA 3IL1B 4NMYA 3AXFA 1R9QA 1CB6A 2H25A 1POTA 4LZ8A 3VVEA 2HXWA 1B32A 3KSXA 1OVBA 2QRYA 2YLNA 1P1NA 4RY1A 3D4GA 3PUYE 3U92A 5K2YA 2PVUA 1MY3A 2Z23A 4LQ2A 4FECA 1I6QA 4PFUA 2XX9A 2QMWA 5FHNA 5AA2B 5CBSA 3BFTA 1UTHB 2RCBA 2I0BA 3FV1A 2H9BA 3KEIA 3VVDA 3QUJA 1XC1A 1MPCA 4H67A 4F3GA 5BWJA 2ABHA 3UA8A 1QKAA 3OO9A 4H5FA 3LUYA 2PYYA 1Y4TA 1MQHA 4Z7EA 3IAZA 1R9LA 1M5CA 3RQTA 4BDMA 1EU8A 2FNCA 3KOSA 4RK9A 1R1NA 2ONKE 3FASA 1H3DA 1VE4A 1N76A 3IO4A 3PPPA 4C1TA 4YKJA 3G3FA 1S9TA 2O1MA 3B6TA 3Q29A 3SEYA 2DVCA 1N04A 3TTNA 2O69A 5CM6A 2DQVA 1IUDA 1SI0A 4QSDA 3TUSA 2XXXA 4U22A 3WAFA 4ONYA 5ITPA 3MC2A 4EQ9A 1ATGA 2UVHA 4U1OA 4YB7A 2I4CA 4JSOA 1NMUA 1VSOA 4ZEDA 4WXJA 5L9MA 4DDDA 3RN8A 3FJ7A 3KN7A 2IEEA 2WKYA 3K6UA 4G68C 1UQWA 2FA7A 4IO7A 1UTHA 1B0HA 3CFXA 4QFNA 4EXKA 4IB2A 4PFWA 4PP0A 1VFDA 5KZTA 3SEUA 1Z7NE 1US4A 2PT2A 1PBPA 4RK2A 4C0RA 4WEPA 3WAEA 3KZGA 3RY3A 4FIMA 5EHSA 1UIUA 1WVJA 3ODBA 2IA4A 2F78A 1SD3A 5LOMA 2Y7IA 3MQ9A 3R7XA 1LGBC 1R6ZA 3FZVA 1IEJA 3ILUB 2Q8JA 4P0IA 1B40A 4ZECA 4PE5B 4OEVA 2HZKA 1JW4A 2DYXA 1O63A 4RJZA 1PBQA 2B3FA 4MF3A 1MXUA 1B4ZA 3TQWA 2DE2A 2P0SA 4AB6A 4O3AA 3EF7A 1D4NA 4GWOA 4I62A 4F19A 2XX8A 2CZLA 3THIA 3GZGA 3CI8A 3KG2A 2GFEA 4PETA 1MQJA 3PUZE 4DE8A 4F29A 1M5BA 4QF9A 4NF6B 3ECRA 3OO8A 2OWSA 3VFJA 3BBRA 3FJMA 4HCWA 2Y7WA 3F11A 4R2BA 3MP8A 1AIVA 3QIMA 1GTKA 2UYEA 2XXRA 2UVJA 4FE8A 4ZEIA 3UK4A 3QUFA 1QVSA 2I3WA 3G3HA 1MH3A 1ZU0A 4F3BA 5H8FB 1IXGA 1NH8A 3QYTA 1USYH 1Y1ZA 2PMSA 2XXPA 1FQAA 1B1HA 1BTJA 3D4CA 4LATA 3CSGA 1DOTA 1XT8A 2ZYKA 5EYFA 1A8FA 1NNPA 3UP9A 2OLBA 4ZE8A 4MFIA 4KHZE 3PUVE 1RKMA 1A7LA 1H43A 3GBAA 4OEUA 1ELJA 1QUJA 3DP6A 5I57B 4UA8A 4IO2A 2D3IA 4N07A 4NF5B 3FUZA 1LFHA 2RINA 3FXRA 1P1UA 2XXVA 4EF2A 3TAJA 1RYOA 2O7UA 3Q27A 1P1OA 5KDTB 3MBPA 2GH9A 4HTGA 5H8NB 1ZTYA 1TWYA 2KLFA 2V84A 2I48A 4QFOA 2I4BA 3G3KA 5B70A 3R6UA 3K02A 1B7HA 4H6DA 4XKPA 4NF6A 3B7DA 4ZEBA 1S7YA 3SERA 2OCUA 3ZKKA 1MY2A 4ZDMA 4TLLB 1FTKA 5TP9B 4QRZA 4N13A 2AL5A 1DPEA 2XD3A 1LSTA 4TOZA 3IJOB 3OD7A 3T9HB 1QULA 2RC9A 5M2VA 4OMBA 1PDAA 4POXA 3MPLA 5FTHA 1I69A 4E0WA 1FQDA 3VXCA 4KD5A 2B3BA 3C33A 4KPTA 5DYHA 3CSBA 1MQGA 1PEBA 4R6YA 3EN3A 1UIVA 3OELA 1UTBB 1P1WA 4YB5A 4H8IA 1XHYA 3C34A 1P1QA 2Y7RA 4BDNA 1DSNA 3LR1A 4I1DA 4YKIA 5I57A 3OEKA 3HV1A 4EUOA 4NF5A 2PX1A 4Q5TA 5AA1A 1LLSA 3C9HA 1SW5A 1TFAA 5ICTA 1TXFA 3K1NA 3HHGA 3RPWA 1IXCA 3TCHA 4O3CA 3KSJA 3N5LA 5H8NA 5CC2A 1SVXB 1IXHA 3KN3A 3PD8A 3M3FA 5DVJA 2UVIA 1MM7A 3SEWA 1MQIA 4GOTA 3MP6A 2G93A 5HM4B 1SYIA 3C36A 2ANJA 3IJXB 5TP9A 4IGRA 3B6WA 4DCYA 4F1YA 2DVZA 3QSLA 1FTLA 2H4IA 1LFGA 1P99A 3TTLA 5DVFA 3FVKA 4LP2B 4ELPA 5IAIA 4H1XA 3IR1A 5H8HA 1B3HA 2NUVA 4OTEA 2W7YA 2UVGA 1HSJA 2ZMBA 4ZEKA 2Q88A 3MP1A 3SETA 1F9BA 2H99A 1B2HA 4DLDA 3U72A 2V3TA 3Q25A 4ZS9A 2ONRA 1FTOA 4QFKA 3ZSFA 2Q9TA 4R9GA 2GRVA 4R6HA 4QFLA 5A5XB 1LCFA 4WKMA 4H5GA 1YTVA 4G4PA 2F7BA 2RC8A 3SEXA 4ND9A 1OLAA 4NWDA 1JW1A 3IX1A 3PMXA 3VV5A 1H76A 2REJA 2R6GE 4BDRA 4QSCA 4FEDA 3DELB 1LAGE 3LSFB 4QFPA 2A5SA 1MXZA 3OXNA 2F35A 1Y3QA 4AQ4A 2OJTA 1MRPA 1MDQA 4ZZAA 1B7UA 5FHOA 4JB7A 1LAHE 3TZAA 3UORA 3ZKLA 4ISUA 3N26A 5CRYA 4HCYA 5ITOA 3TCGA 4P11A 1PB9A 4OVJA 4JWYA 3SEVA 1II5A 3MVXA 3DP4A 3VLUA 3M3KA 3O2AA 3PMWA 4F3PA 4MLQA 4Q30B 2DS9A 2XXWA 3LSXA 3TYHA 4K3FA 2DE4A 1XOCA 2DWJA 1LBCA 3G7WA 4F31B 2QS4A 3FVGA 3H6UA 3TCFA 4P0GA 5A5XA 4XIGQ 1B9JA 4OXVA 3H3GA 4XTCQ 1AL3A 4R74A 4YKKA 4Z0IA 2Z8DA 3TODA 1LAXA 2DXYA 4O3BA 4GIZA 2M8CA 2RCAA 5BUUA 3HHFA 5I58A 2HAVA 3FXQA 3RT6B 2THIA 4U2RA 2ESNA 3T66A 4H8JA 4NEDA 4JDFA 2VD2A 1N84A 3EHTA 5I56A 4OERA 2DP8A 3IOUA 3TTMA 1JVXA 1MXWA 3A09A 4LZ5A 1XVYA 4NF4A 1A55A 4DIGA 1ANFA 1CE2A 3H6WA 4G8HA 3MW0A 2XHDA 1FTJA 3EHSA 4KI0E 3UGWA 4X9TA 4BDQA 1FQCA 5HBCA 4F22A 3H7MA 1LFIA 3HCQA 3RNNA 3SESA 1B4HA 4ZE9A 1ZLQA 4EQBA 4ECFA 3DLNA 1D9YA 2RKMA 4KR5A 4F3SA 4OESA 3S9EA 2HEUA 4F1UA 1OLCA 1B3EA 3C32A 2XXIA 3U93A 1FTMA 4H65A 5I59B 2R71A 4IO3A 3ONMA 3W9WA 4UACA 3OENA 4Q0CA 4FJPA 1A99A 3IOWA 3K2DA 3IORA 2O7IA 3S2VA 3ZS6A 4GVOA 3TPAA 4WEDA 4BDLA 3PMVA 1NNFA 3FGSA 3CG1A 4NE4A 4U1ZA 3KGCA 4ZEFA 3IO6A 4GL8A 2LAOA 1O64A 2Z8EA 4U4XA 4YMBA 2I58A 3B6QA 3M3LA 3R26A 5L8DA 5H8SA 3MPKA 3TELA 2X26A 5K2XA 5AA3A 1B0LA 2ZYNA 1B6HA 4RXLA 4KCCA 1O7TA 4ZZEA 1T0KA 1GV8A 2XD2A 4DCXA 3HO7A 3GLBA 3MAMA 3VVFA 2NOOA 3HSTA 4R72A 1MQDA 5FTIA 1FW0A 2OK2A 1JETA 3Q28A 4HW8A 3S9NC 2DXRA 1FQFA 1JEVA 2UXAA 2BJJX 2OZZA 2VHAA 3IB1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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