1FTOA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in the apo state at 2.0 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftoA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftoA01
4R9GA 4X9TA 4G68A 1MPDA 4GFRA 2V84A 3V89B 1MPBA 2Z8EA 2F6PA 4POXA 3TTMA 1PC3A 3VVDA 4RA1A 3PPPA 3OSRA 1B4HA 2PBWA 1BLFA 4QFOA 3QUFA 1IXHA 2VP1A 2YJPA 4MFIA 1B32A 3DP8A 2HEUA 4JB7A 5H8FA 4UA8A 1SW2A 1N3XA 1GR2A 2QJEA 3HCQA 2THIA 4PETA 1GGGA 2RCBA 4FORA 1P1WA 5TU0A 2F7BA 3DP4A 3TQLA 4OMBA 4OETA 4YMAA 2XX7A 1PB7A 4N6PA 1OMPA 2Q2CA 2VD3A 1M5FA 4OTEA 3CSGA 4ZS9A 2XXIA 3H4ZA 3CG1A 2ESNA 1I6QA 3RLFE 2F6GA 3LSFB 3FVGA 4ECFA 3RN8A 4KR5A 2GRVA 4PFYA 1BTJA 3O6IA 3O97A 1SI1A 3C9HA 1JW1A 2A5TA 3EPEA 4LQ2A 3MAMA 4ZECA 2O51A 4RK2A 1NH8A 3VDFA 1OIBA 4O3CA 3H7MA 2DE2A 4ZZEA 5IKBA 4ZEDA 3KEIA 2V93A 1AMFA 2AYSA 2D21A 5DVFA 5DTBA 3G3HA 1DPEA 1YTVA 5H8NB 1MM6A 2GHBA 4LP2B 2DE3A 1LLSA 3W9WA 4U4XA 5ITOA 1JVYA 3PUVE 2XXPA 1QUKA 3H6VA 3N94A 4Q0CA 2O6AA 3PPRA 4IO2A 1A40A 3N6UA 4QSCA 4H6DA 3IOTA 5L9SA 3DM0A 3PD8A 1P99A 3IK6B 5KCJA 5AA2D 1WODA 4G8MA 4WXJA 3FASA 5TP9A 2I3WA 4G2ZA 3U94A 1US4A 3FXQA 1SD3A 4R2BA 4I62A 5AA2B 1NKXA 3VVEA 1LGBC 3HHGA 4ZEKA 3I6VA 2Q2AA 4ELOA 4H67A 3MP1A 3MW0A 3UK4A 3MVZA 4F3GA 1SVXB 1MXVA 1JW5A 3T9UA 1M5BA 3S9EA 3FV1A 1NMUA 3TTNA 2DXRA 2F35A 3W15C 3IOWA 4IY6A 1DSNA 5AA4A 4H1XA 4KHZE 3MP6A 3GBAA 2PVUA 3SEYA 3PPNA 2RC8A 5AA1A 2HZLA 1II5A 2XXTA 1MY4A 3LSXA 3FVNA 4FAJA 3SERA 2VOZA 1JVXA 3B7DA 3O29A 3G3KA 3TDJA 4OFLA 3CI8A 3UN6A 2YPNA 3S9LC 3RPWA 1B7ZA 1UTHA 4H65A 4PQJA 2H5YA 2O7IA 1NNPA 3K0VA 3G7WA 5I2NB 1ZTYA 1NNTA 2QL3A 3FJGA 1T0KA 2HCAA 2ONSA 3O66A 1FTMA 2G93A 1UTHB 4F3SA 3TTLA 5AA3A 1D9YA 2XX9A 1TT1A 3R6UA 3TCHA 4PFUA 4OHNA 1JW4A 1VSOA 4DZ1A 4F1VA 4F18A 2I49A 4NF5B 3IB2A 1QJMA 3FJ7A 3CR9A 2OBGA 3THIA 2UYFA 4EF2A 2ZNTA 3EHUA 3T9XB 1A55A 4XKNA 4NWDA 1N04A 1B52A 5CBRA 2CMOA 1NH7A 5KZTA 4RJZA 4KYEA 3GXAA 4F1UA 3MC2A 3ODBA 2X7QA 4U4SA 3S4UA 4NTLA 5IAIA 3G3JA 3TTKA 4NMYA 5ISUA 4M1VA 1Y20A 1FQDA 3OEKA 1A99A 1MS7A 2HQ0A 4GXAA 4P11A 1CB6A 4XKRA 1US5A 3OO8A 3KOTA 3N26A 4QRZA 1H45A 3CFXA 1ELJA 5L9MA 1PB8A 3PUXE 3ECRA 3G3FA 2QRYA 4OZ9A 2XXRA 3U93A 3RT8A 1SYIA 5I57B 3CG3A 3PPQA 2HAUA 2Y7WA 1FCKA 4QSEA 1Y3NA 1DTGA 3KG2A 1LB8A 2B3BA 1WDNA 2B3FA 5I58A 2QPQA 1IITA 3T9HB 3O2AA 4U21A 2BJJX 4YB5A 3CRBA 4I9DA 3VLWA 4NWCA 3TAJA 2HAVA 3RT6B 1XS5A 2DVCA 2F7AA 3Q25A 5I58B 4PE5B 3JZJA 3E9XA 4PFTA 4BDMA 4AB5A 5JTYB 1FTJA 3Q27A 3FATA 4F3BA 3BFTA 3PMVA 1TXFA 4U23A 4XKQA 5A5XA 3MVYA 1D9VA 3IO6A 5CMCA 4N13A 1LBBA 1USYH 2UVGA 2OK2A 2QSXA 1M5EA 4RK9A 5TPAA 3FD3A 1ZBMA 3LSWA 5B7DA 5CMBA 1OQGA 3IB1A 5ITPA 4GRKA 3OO6A 3R7XA 4Z0IA 3K01A 1KWHA 3A3UA 2OWTA 5KDTA 4H8IA 3TEPA 1LB9A 4G77A 2Q8JA 2VGQA 3RQTA 4YMBA 3G3GA 4ZDMA 1LFHA 5ICQA 1P1OA 5H8QB 2RC7A 4G4PA 5K2YA 1GVCA 1JEVA 1P1QA 2GFEA 3RGYA 4YB6A 1GTKA 3MBPA 4HS7A 2H99A 1UIUA 4TOZA 4F2OA 1EH3A 1JNFA 4HTGA 3FJMA 4BLAA 3SEVA 1ATGA 4LQ5A 3QIMA 1M5DA 2PMSA 1B3EA 3OENA 3KJTA 2PT1A 4GLIA 1IQ7A 3IJOB 1MQJA 3HV1A 3DELB 4P0GA 4YICA 2Y7IA 2H25A 2ABHA 3ILUB 3SEWA 1QULA 3O9PA 1Y4CA 4G68B 4NF8A 4OESA 5DVIA 2RCAA 4YAHX 1S7YA 1GV8A 4ZEFA 4G8NA 1FQBA 4ZZAA 4LATA 3TFLA 1LAGE 4U1OA 2HXWA 5I59A 2XXWA 2ZYKA 2QS2A 1ZJLA 4F29A 1I6BA 3CIJA 5H8FB 4TQUQ 2O84X 2H98A 3SEXA 2UVIA 4I1DA 4KI0E 3T66A 1Z7NE 3S9NC 5I2KA 1MXXA 1M5CA 4DCXA 4MH5A 1URSA 1SW5A 4N07A 4DXBA 3TCFA 3OO9A 4ELRA 4F39A 2F8DA 1B5HA 5BWJA 3TYHA 4BDRA 3T22A 1JQFA 1FW0A 2F36A 2NWJA 2B65A 4EXKA 2OCUA 3RUMA 1OVBA 3VLVA 2A5TB 3IJXB 4TLMB 1MQHA 1SQYA 2VHAA 3MZ1A 5M2VA 4QF9A 3IX1A 5J1DA 2UXAA 4G8HA 4GVOA 1PEBA 3K1PA 1DPPA 1Y3PA 3MQ9A 1Y9UA 3K6XA 4F31B 2ZYMA 4NE4A 3LR1A 3K02A 4LZ5A 3C35A 1OLCA 4O3AA 4U22A 3FVOA 1B0LA 4F22A 4IO3A 2GH9A 3OO7A 1YCJA 4IGRA 2QS1A 1MY2A 3CSBA 4KCCA 2NUVA 1OVTA 1MY0A 3T96B 1MDQA 2Q89A 2ZYNA 3H6WA 1FQFA 1UIVA 4EDPA 2I6EA 3ZKLA 5H8SA 4NF4A 5KCJB 3PD9A 3OSQA 3OOAA 3VXBA 3RTWB 1B5IA 1EZ9A 4IO4A 5TP9B 4O3BA 2R9JA 1R1NA 3MWBA 3RY3A 4Q8RA 3SESA 4LONB 4HCWA 4R74A 5FHOA 1YAEA 2F34A 4YZZA 3EN3A 2OLBA 4IO5A 3T9VA 4R72A 1ZIUA 4FEBA 1MH4A 2AL4A 3VFJA 3HPIA 2GHAA 1B2HA 4OFOA 1PDAA 4YKJA 2ANJA 1SYHA 4ZEIA 4FEDA 3A3CA 1A54A 4GOTA 2YLNA 5EYFA 2RC9A 3KJ7A 2R6GE 3ZKKA 4OWDA 1FQCA 1RKMA 4MBPA 3U92A 4EXLA 5AA4B 2O1MA 1B05A 1POY1 2H9BA 4LVQA 4KCDA 5AE4A 4QFPA 4HW8A 3IR1A 5CRYA 4XIGQ 5CMMA 3KFMA 1B46A 4H0WA 4ISUA 4ZE8A 3IO4A 1B7HA 1IZ1A 4WEDA 2O68A 3SDFA 3K6WA 2PYYA 2DQVA 4RY1A 3OD7A 3C36A 1EZOA 3VV5A 1VE4A 3LUYA 3PV0E 4P0IA 1MY3A 4KYDA 4EF1A 1LCTA 3IOVA 1AL3A 2Z8FA 3JYRA 3MUQA 4U1ZA 2PT2A 4GIZA 3FUZA 1H43A 3TELA 3FGSA 4NEDA 4OENA 1O63A 5B70A 1OLAA 2NVUB 2AL5A 2XX8A 1MH3A 3K00A 1N7WA 3QUJA 1PBPA 1MDP1 2H4IA 3FXUA 3MZ9A 2XD2A 3CVGA 4RNSA 5EHMA 3S9MC 4DXUA 3H3GA 3Q29A 1NNKA 1MQIA 3CFZA 3EQ1A 2P1SA 3MJNA 3UA8A 1B7UA 1SW1A 4HCYA 3M3LA 3HO7A 1MQDA 2I58A 1MPCA 4KFQA 3FIRA 2RKMA 3MVWA 4R6HA 3S2VA 3GLBA 1BIYA 5L8DA 3OMBA 2AIXA 4R73A 5DEXA 4IO7A 5CC2A 3HSTA 1LFIA 3UIFA 2ZYOA 4ONYA 2DWIA 1B3FA 1O64A 3C31A 3F11A 1JEUA 1B58A 4PFWA 5DEXB 4R75A 4DE8A 1RYOA 4KYSA 4QFLA 1N3WA 1QW0A 5JEIA 1A8FA 3DP6A 1L5TA 4AQ4A 1TFAA 3W9VA 4R2FA 1B3GA 1H3DA 4FJPA 2QMXA 2NOOA 4K3FA 1UQWA 4Q30B 4YKKA 1B40A 2QS4A 1MXUA 2F97A 3QXMA 1LSTA 2XXXA 4LZ8A 4GXSB 1N7XA 5DVJA 1ZMGA 1XVYA 1Y1ZA 5ELVA 4JSDA 4OFJA 2I0CA 5A5XB 1A7LA 3C34A 3V83A 2DP8A 2HZKA 1B1HA 3K4UA 3OEMA 4Z7EA 4ZEBA 4F3PA 5CMKA 2Z23A 5TPAB 3VE1B 2Q9TA 4R6YA 1SW4A 3IL1B 3H6UA 1FQAA 2IEEA 3H03A 3O6GA 3TUSA 3PMWA 4GF8A 3N6TA 2CZLA 1ZU0A 4F2QA 2V3UA 1IUDA 1BKAA 2LAOA 5H8HA 2DWJA 3RNNA 3KOSA 1SDXA 4LZ7A 1B5JA 4U2RA 5KDTB 1S50A 4WEPA 3KN8A 3IB0A 3Q28A 2I4BA 1UTBA 3I3VA 2DOJA 3TQWA 2XD3A 3E4RA 4KQPA 1USYE 1B9JA 4H5GA 5FTIA 3LBSA 3PGFA 3SETA 3H06B 5L9OA 2P0SA 2REJA 3SKPA 4EQ9A 1LAFE 2Y7RA 1CE2A 1MG1A 4BDNA 1D3KA 1R6ZA 3D4GA 4JWXA 3U8QA 4IB2A 3TPAA 1XHYA 3WAEA 3USDA 1IXGA 1XOCA 4R6KA 3HHFA 3U1OA 2XXUA 4JSOA 2QMWA 1XVXA 4OQOA 3A09A 2F5XA 4NF8B 1FTKA 3FZVA 2XXQA 2ONKE 1IXCA 1SBPA 4XXUA 1PBQA 3EHTA 4ESWA 4DDDA 3C33A 2E1SA 2D3IA 3FV2A 1N84A 4QFKA 2FA7A 3TTRA 2DXYA 5I59B 3IORA 1Y3QA 3L6HA 1NL5A 4ZE9A 2O7UA 4DLDA 1AH5A 1MXWA 3FVKA 1P1UA 1RYXA 1H44A 3PMXA 4WKMA 1MY1A 1QKBA 1R9QA 3B6QA 2A5SA 3EHSA 3C32A 3JV9A 3KZGA 4RPOA 1LAXA 3ZS6A 1A8EA 2DYXA 5I2KB 3VLUA 3V8XB 2DWAA 1LBCA 5CBSA 1EZPA 2UVHA 3K1NA 2FNCA 3GBBA 1Q35A 2Q88A 1IXIA 1N76A 5LOMA 1OQHA 3TCGA 1FTOA 3IOUA 5FHMA 3PPOA 2FYIA 5K2XA 3Q26A 4BDOA 5H8NA 4AB6A 3K2DA 1N0TA 3D4CA 4F1YA 2DSFA 3I5OA 4JWOA 4FECA 5FTHA 4H8JA 4JWYA 3OXNA 4GQOA 1B4ZA 2OWSA 4ND9A 4X48A 3E13X 1ZKBA 2Z8DA 2NXOA 3BFUA 4RYAA 2DWHA 2XXVA 4BDQA 4ELQA 3KGCA 4FIMA 3B6WA 2Y84A 5AA2A 2UYEA 1FTLA 3ILTB 2RF1A 3PUWE 4ELPA 1PB9A 4MLVA 1QUJA 1Y1MA 4NF4B 3M8UA 3RTFB 4OVJA 1SI0A 2XXHA 3ONMA 3L6GA 2R71A 4GL0A 4RXLA 2XHDA 1D4NA 1MQGA 3QYTA 1LAHE 4KD5A 3WAFA 3AXFA 3QSLA 3H6TA 3QAXA 3M3FA 2DS9A 3PUYE 5DYHA 4FE8A 4C0RA 3MPKA 2HFBA 1WVJA 4H5FA 4MF3A 1AIVA 1B6HA 4OEVA 5I56A 3UP9A 1VFDA 3O6HA 2M8CA 3TMGA 4MLQA 4DCYA 4E0XA 5I56B 3EF7A 5I2NA 2I4CA 1URDA 4OYVA 2O69A 3KN3A 3PU5A 4UACA 3O28A 3MP8A 4X1BA 3T93B 3C4MA 3G3IA 4M4GA 2X7PA 3U72A 1JETA 4NF5A 4LA9A 1MXZA 3MPLA 4R9FA 4YKIA 3VVFA 1I69A 4XTCQ 3P7IA 1MRPA 2XXYA 2Y7KA 3R26A 4IO6A 1Q1KA 3UORA 1HSEA 2X26A 5CI5A 2V3QA 2F7CA 4DXCA 1QUIA 3FXRA 1DOTA 1FQEA 3K6VA 4F19A 4TLLB 4OERA 4JBZA 3K6UA 4XKPA 1VFEA 4Q5TA 4C1UA 2UVJA 2QS3A 1I6AA 1TFDA 5ICTA 2RINA 2P2AA 2I48A 3CFLA 1MXYA 3KSJA 1S9TA 3VXCA 1Y4TA 4OEUA 3TODA 1BP5A 1HSLA 4PP0A 5I57A 1HSJA 4BDLA 2Y7PA 3PUZE 2ZMBA 3V5AA 3K1MA 2IA4A 4YB7A 3MZBA 5HBCA 5JK4A 5I84A 1DTZA 5F1QA 5FHNA 3KBRA 1ANFA 3BBRA 2ZXTA 1NNFA 5DT6A 5EHSA 4POWA 2ONRA 3E3KA 3KSXA 1URGA 2VD2A 2V25A 3UGWA 5JTYA 1XC1A 3OELA 3KN7A 4YU0A 3TKDA 4EUOA 4RPNA 2I3VA 1P1NA 4G68C 2OZZA 4ESXA 4IGTA 4GD5A 2Z22A 1POTA 1LFGA 1B0HA 1TWYA 2WKYA 3DLNA 4LUBA 1AOVA 3QK6A 1EU8A 4QFNA 5BUUA 1B3LA 3N5LA 3BKIB 1H76A 2KLFA 1VR5A 4DIGA 3IAZA 1IIWA 1J1NA 4GL8A 3MVXA 4EQ7A 2ZNUA 5HPQA 4GWOA 3B6TA 3LC8A 1YPNA 2D5WA 2O1LA 4KPTA 1XT8A 2E0SA 4JXIA 4NF6A 5HM4B 5H8QA 1B51A 4E0WA 1O7TA 1ZLQA 4THIA 2DVZA 1B3HA 5H8HB 3SEUA 4C1TA 3GZGA 4QHQA 1MM7A 1QVSA 4L17A 4NF6B 3M3KA 3ZSFA 5F7VA 1B1XA 4IY5A 1LCFA 2ZNSA 1UTBB 4I8CA 2ALUA 4JDFA 4X1DA 3TZAA 1Z7ME 5CM6A 2REGA 1DMBA 2F78A 1IEJA 2I0BA 1F9BA 4QSDA 4FATA 1R9LA 4OXVA 1NFTA 2OJTA 2V3TA 3HN0A 2DE4A 1QKAA 2W7YA 2PX1A 2G29A 4YKPA 3LSLA 4EQBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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