3TTNA

Crystal structures of polyamine receptors spud and spue from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
SLHIYNWTDYIAPTTLKDFTKESGIDVSYDVFDSNETLEGKLVSGHSGYDIVVPSNNFLGKQIQAGAFQKLDKSKLPNWKNLDPALLKQLEVSDPGNQYAVPYLWGTNGIGYNVAKVKEVLGDQPIDSWAILFEPENMKKLAKCGVAFMDSGDEMLPAALNYLGLDPNTHDPKDYKKAEEVLTKVRPYVSYFHSSKYISDLANGNICVAFGYSGDVFQAAARAEEAGKGIDIQYVIPKEGANLWFDLMAIPADAKAADNAYAFIDYLLRPEVIAKVSDYVGYANAIPGARPLMDKSVSDSEEVYPPQAVLDKLYVSAVLPAKVLRLQTRTWTRIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
source organism Pseudomonas aeruginosa
publication title Structural Basis of Substrate Binding Specificity Revealed by the Crystal Structures of Polyamine Receptors SpuD and SpuE from Pseudomonas aeruginosa
pubmed doi rcsb
molecule keywords Polyamine transport protein
total genus 114
structure length 335
sequence length 335
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ttnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ttnA02
1N84A 2VP1A 3ZS6A 3H3GA 3W9WA 4KYEA 4P0GA 3SEWA 4DCYA 3VLVA 4IO4A 4LQ5A 4LVQA 4G8MA 4BDMA 3T9VA 3IOVA 4G68A 3VE1B 2OZZA 2ZNSA 3SKPA 2CMOA 3IJXB 3PPOA 2V3TA 1P1WA 1TFAA 4NF6A 3PD9A 4N6PA 4F2QA 1R9LA 5ELVA 2VOZA 2REJA 2NVUB 3OEKA 2RCAA 1TXFA 4ELOA 3U94A 5FTIA 4DCXA 1Z7NE 4I8CA 1B5IA 2FYIA 3CRBA 1FQEA 4QRZA 4KYDA 2X7PA 1R6ZA 1AOVA 2V3UA 3V5AA 4ONYA 2OWTA 3Q26A 3OELA 4PFYA 3M8UA 4AB6A 1AMFA 1B7UA 3EF7A 3R26A 2RC7A 4GL0A 1XOCA 1NL5A 4OZ9A 1NNTA 2PYYA 1B4ZA 4OTEA 2DWJA 1TWYA 4BDRA 4LZ7A 3EHUA 1IXIA 3MWBA 1B05A 4GVOA 4H8JA 4TLLB 4OQOA 4N07A 1UTHA 2OBGA 3PUXE 5JTYB 1B3FA 3FATA 1SD3A 1URGA 1PDAA 2XXIA 1QJMA 4RPOA 4YB6A 1Q1KA 5I56B 3LC8A 2ONKE 4DE8A 1NFTA 4NMYA 3S9MC 3VVDA 2AL5A 3S9LC 1B3HA 3TDJA 1OLAA 3KGCA 4LZ8A 1MH3A 2GHAA 1S50A 2Y7WA 3TTNA 3S4UA 3I5OA 1MXXA 4EQ9A 3BKIB 3B6WA 3H03A 3KJ7A 4THIA 1EH3A 3FVOA 3MZ1A 3RY3A 1ZMGA 2UYFA 3MPKA 3PUWE 5HBCA 3VXCA 1LFGA 2XXXA 1T0KA 5CBRA 4FECA 1RKMA 3PPQA 3MC2A 5AA4B 1SBPA 2H99A 3H6VA 2Y7KA 2QS1A 3FVKA 1VR5A 2Y7PA 3TTRA 1IXHA 4ZEFA 5L9MA 1Y20A 2B3FA 1PB7A 3ILTB 3T9UA 1NNFA 2DSFA 2G29A 1MDQA 3MZBA 1MY3A 2R71A 1B3EA 1MQHA 1R9QA 3IOWA 5BWJA 4ZEKA 4F22A 3SDFA 5I2KA 4JSDA 2I4CA 1TT1A 1YCJA 2Y84A 1J1NA 3GBAA 5HPQA 2Z8DA 3C9HA 5I57A 4HW8A 1UQWA 2H25A 4N13A 3VVFA 2XX9A 1FTKA 2O84X 3LSXA 1L5TA 4OMBA 5H8FB 3IAZA 4GRKA 3TKDA 2DOJA 5ICTA 4R74A 1IQ7A 1OQGA 1S7YA 4O3BA 1CE2A 4UA8A 2ZXTA 1JW5A 2RINA 1SI1A 2QL3A 3FZVA 4F1VA 3OSQA 1DOTA 2D3IA 3TEPA 4TLMB 2DVZA 1MM6A 4IO3A 5TP9A 3S9EA 3MJNA 1NKXA 1ZIUA 1EU8A 1HSEA 3HO7A 1URSA 5AA3A 3K00A 4H1XA 1DPPA 4YU0A 1NMUA 2ANJA 1WODA 3ONMA 5H8NB 4H6DA 1PC3A 2B65A 3FASA 4BDNA 1USYE 1XVXA 3GZGA 3RT8A 5CMMA 3I3VA 4FAJA 3MP6A 2H98A 2LAOA 2H4IA 4IO7A 1MG1A 4OVJA 4R9FA 4WEPA 4PFWA 5FHMA 3G3IA 1SYHA 4GWOA 1EZPA 4AB5A 3PUVE 2OCUA 3N6TA 1B3LA 4IY5A 3SESA 4FIMA 4NF4A 3CFZA 1SW4A 4F3PA 3FJMA 3HCQA 3PU5A 3K6UA 1N3WA 2HFBA 2DE4A 4FJPA 4NE4A 4EXKA 1I6BA 4JSOA 2XXWA 3K01A 3TELA 1JW4A 4YB7A 1MQDA 3O2AA 3TCFA 1ZKBA 5IKBA 4OFJA 1LAHE 2NOOA 4L17A 1VE4A 1DSNA 2XXHA 1D3KA 1IITA 2YLNA 2GH9A 4TQUQ 2WKYA 4EQBA 2HAUA 4RA1A 4YZZA 3I6VA 1A7LA 5EYFA 3RTFB 4U4XA 3RPWA 3KN7A 1SW1A 5H8SA 4NF8A 3C4MA 1XS5A 3M3KA 3RGYA 2FNCA 4KHZE 4ELPA 4YMBA 5H8HA 4IB2A 3EN3A 1OVBA 3IX1A 2F97A 4E0XA 4OEVA 2ONSA 3TAJA 3PV0E 5KCJB 3K1NA 5EHMA 4IGTA 2I48A 2PT1A 1MQIA 1Y1ZA 3ZKLA 5I59B 1N0TA 3PUZE 4KR5A 5CBSA 1OQHA 1BP5A 2HEUA 3VLWA 4LQ2A 1DMBA 2P0SA 2X7QA 3IJOB 3OXNA 3UA8A 4RK2A 3H6WA 1B46A 3TYHA 1WDNA 2OWSA 2P1SA 1B40A 3N6UA 1LAFE 1R1NA 4OFLA 3FV1A 4F1YA 4U22A 4G77A 4HTGA 3OOAA 1LFIA 4JWXA 3F11A 1M5DA 4GFRA 1HSJA 4OFOA 1GTKA 3Q27A 1TFDA 4RJZA 4DLDA 2DS9A 3ZSFA 4LUBA 2XHDA 3WAEA 3DM0A 5I84A 3HPIA 2KLFA 3CFXA 4PFUA 2Z8FA 3G3KA 1LCTA 4PP0A 5M2VA 3DP8A 3Q28A 3LBSA 1LGBC 4G8NA 4C1TA 3E4RA 1MY2A 4YKJA 2D21A 1ATGA 2IEEA 4F39A 4RNSA 2DE3A 2OJTA 4NWCA 1MXUA 3PPNA 4XKPA 1I6AA 3CI8A 5AA2B 3GXAA 3SEYA 3TCGA 4ZZAA 3O28A 3GLBA 1KWHA 5CRYA 4YICA 1M5EA 5DVIA 2Z23A 1O7TA 2AL4A 1UTBB 3MUQA 3V8XB 4LP2B 3RQTA 1NNKA 4FEBA 2F78A 1N7WA 5AE4A 3OO9A 4FE8A 3IORA 4GXSB 4ZZEA 4DXBA 4IO6A 4XXUA 4R6KA 3KFMA 4QHQA 2B3BA 5H8FA 1QUJA 3QYTA 2HCAA 4I9DA 4F3SA 3MQ9A 4WKMA 5I2NA 4OENA 4XIGQ 4FATA 3EPEA 1LFHA 1CB6A 3K1MA 3O6HA 4YMAA 4ESWA 1Y3PA 1JVXA 4P11A 1B4HA 4NF5B 3IL1B 2PVUA 2YPNA 3G3HA 4M1VA 1M5CA 4E0WA 5ISUA 3KEIA 1D9YA 4F19A 3M3LA 2HXWA 1WVJA 2XX8A 3K4UA 1PB8A 4F1UA 3A09A 3OO7A 1SDXA 2RF1A 1DPEA 1ZLQA 3B6TA 1B7ZA 2UVGA 5KDTB 2Q9TA 3HHFA 5TPAB 2F35A 1PB9A 5DVFA 5BUUA 1VFEA 1ZJLA 3IK6B 3KG2A 2YJPA 3PPPA 2I6EA 3G3GA 2Q2AA 4DDDA 5ITPA 3O66A 2PT2A 3PMXA 3SEVA 3UN6A 1GVCA 4F3BA 2NWJA 1FTOA 4MFIA 2V3QA 5JK4A 3AXFA 3QUJA 1URDA 4QFNA 1NH7A 3B7DA 3U72A 3S9NC 2DWHA 4RPNA 5ITOA 3S2VA 1B5HA 5L8DA 3FXUA 4MF3A 3RTWB 2O6AA 1B1XA 4G8HA 3O97A 1FTMA 3K0VA 3KOTA 1LLSA 2Q8JA 5DVJA 4YAHX 1FQBA 2F7AA 1POY1 1MXYA 3TODA 2RKMA 5CI5A 2PBWA 1UIUA 1UIVA 2GHBA 3K02A 2VHAA 4G68B 3UORA 5EHSA 1O64A 1FQCA 4MLVA 3ZKKA 3PD8A 4G68C 2ZMBA 1NNPA 4F31B 4ESXA 4WEDA 3ECRA 4OEUA 3FD3A 4Z0IA 4NF6B 1H3DA 3QUFA 1QW0A 2HQ0A 2QJEA 3UP9A 5I59A 1B2HA 2UVHA 4U4SA 3T9XB 4KPTA 1MXVA 1MQJA 1PBQA 2DP8A 4DXUA 2H5YA 5B7DA 4H8IA 1DTZA 4XKRA 3SERA 1A40A 4KFQA 2O51A 3C31A 4GXAA 4IGRA 3USDA 1JEUA 3VDFA 3KOSA 5TU0A 3K6VA 2CZLA 2OK2A 4GQOA 4POXA 4IO2A 2O69A 3O29A 2FA7A 1Y4TA 2AIXA 4JBZA 5I58B 1QKBA 2G93A 4U21A 5A5XA 4R6HA 5L9OA 1A55A 1A99A 1MH4A 1UTHB 4RYAA 4QFPA 3VLUA 3LSWA 3H4ZA 1GR2A 1SQYA 1GGGA 3EHSA 2A5TA 4WXJA 1B58A 2F7CA 1H76A 2ONRA 1SI0A 4ZEIA 3RLFE 1IEJA 2XD2A 4X1DA 1USYH 5B70A 3C32A 1FTLA 1LAXA 1II5A 4H5GA 5AA2A 2O7IA 3L6HA 4F29A 4ZS9A 1BIYA 4K3FA 2DVCA 1QUIA 4Q5TA 1Y4CA 2ABHA 4RY1A 5H8QB 1RYOA 3KSJA 1M5BA 4YKIA 3D4CA 3R7XA 1QKAA 1AIVA 2X26A 2E0SA 3OO8A 5K2YA 1PBPA 4QSEA 1XVYA 3TTMA 3OENA 1LAGE 4UACA 3LSFB 3MP8A 5AA2D 1FTJA 1P1UA 2UXAA 3CSBA 3KN3A 2QS4A 3W9VA 2VGQA 2QSXA 1ANFA 1IXGA 2F6PA 5I2KB 4DZ1A 1EZ9A 4EDPA 3FUZA 3FVGA 1OIBA 3H6TA 5FTHA 1LBCA 5I57B 4BDQA 2O1MA 4I62A 3FGSA 2PMSA 3CFLA 4R6YA 5JTYA 3O6GA 5CMKA 4EF1A 3QXMA 1MPDA 1POTA 1IIWA 3CIJA 5L9SA 5ICQA 2PX1A 2DYXA 4EQ7A 4G4PA 1US5A 4F18A 4QF9A 5I56A 2DXRA 4KD5A 1ZBMA 4XKQA 3SEUA 2R9JA 4R9GA 2ZYNA 5AA1A 5TP9B 2P2AA 3R6UA 4H67A 3RN8A 2HAVA 4MLQA 3T96B 5DTBA 3OMBA 2I3VA 3TQWA 1AL3A 3MZ9A 4HCYA 1FQAA 5AA4A 1B5JA 5IAIA 1IXCA 4R2BA 3RNNA 4BLAA 3UIFA 3JV9A 1H45A 5DEXB 4M4GA 1B6HA 2Y7RA 2ZYOA 3VV5A 4PE5B 2E1SA 1OVTA 3Q29A 2AYSA 4QFKA 3EQ1A 5DYHA 2ZYMA 3N94A 1JETA 1FQFA 4NF4B 2HZLA 4LZ5A 1N04A 3N5LA 1BTJA 3G3JA 4ELRA 3U8QA 5KZTA 2I49A 2DE2A 1Z7ME 2R6GE 3LR1A 4GLIA 4NEDA 3K6XA 1B7HA 2A5SA 3FVNA 3K6WA 3RT6B 3DELB 3MVWA 2DWAA 4F2OA 2DXYA 2Z22A 4LA9A 3PPRA 1JNFA 3ILUB 2XXVA 4GIZA 4MBPA 1B0LA 3T66A 2I4BA 4C1UA 4U23A 1B9JA 4ZE8A 2Y7IA 4X9TA 2I58A 4H5FA 4DIGA 5F7VA 4NF8B 1YAEA 1I6QA 3MVYA 3UK4A 2W7YA 3GBBA 4U1ZA 5H8HB 4R2FA 2Q89A 4JB7A 1US4A 4IY6A 2V93A 1MM7A 3U92A 4QSCA 4X1BA 1B52A 4H65A 2O1LA 4QSDA 1OLCA 3BFUA 4RXLA 3FJGA 2F8DA 4P0IA 4O3CA 5H8NA 3C36A 1MRPA 2ZYKA 2HZKA 5CMBA 3M3FA 4Q30B 2XXQA 5I58A 4R73A 4Q0CA 4ZE9A 4YKKA 3QIMA 3TZAA 1QUKA 3PMVA 4ND9A 1SW5A 3THIA 3QK6A 4ZEBA 1N3XA 4OHNA 3HSTA 3TFLA 3KJTA 4TOZA 3E3KA 2XXUA 3HHGA 1MY1A 4BDLA 4QFLA 3TQLA 3OO6A 4EUOA 2QS3A 3C35A 4LATA 1MQGA 2THIA 3HN0A 2O68A 4ZEDA 3CVGA 4PFTA 3O9PA 1ZU0A 4OYVA 3QAXA 1O63A 3SETA 3MW0A 4C0RA 1XHYA 3IB0A 2QPQA 1H43A 1MPCA 1Y9UA 5H8QA 2XXTA 4O3AA 4GF8A 1EZOA 2D5WA 3FXRA 2ZNUA 3TMGA 5CM6A 3O6IA 2V84A 4R75A 1JVYA 1Y1MA 3W15C 4ECFA 3Q25A 3DP4A 3E13X 3U93A 3N26A 2NUVA 2F36A 4RK9A 3IR1A 2IA4A 4F3GA 1A8FA 3VXBA 1IZ1A 5CMCA 2RC9A 5K2XA 2QRYA 2QS2A 2Q88A 1D4NA 2BJJX 3BBRA 2I0BA 4JXIA 3KSXA 1B32A 1BLFA 1B51A 3MBPA 3FV2A 2F34A 1HSLA 5KCJA 2I0CA 5HM4B 3U1OA 4NTLA 2DQVA 5DT6A 2F5XA 2UVJA 3CSGA 1YTVA 4KI0E 1P1NA 3H06B 4PQJA 3VVEA 3H7MA 1P99A 2XXYA 3WAFA 3CR9A 1N76A 3SEXA 3IO6A 2XD3A 4R72A 2ESNA 5I2NB 1MXZA 1DTGA 3B6QA 1JQFA 3LSLA 3H6UA 2OLBA 2UYEA 3BFTA 3PMWA 3IB2A 5JEIA 2VD2A 1NH8A 3D4GA 1P1QA 4ISUA 3ODBA 3E9XA 2GFEA 4Q8RA 4OERA 1FCKA 4ZECA 1JEVA 3OSRA 4XTCQ 3CG1A 1M5FA 5J1DA 2F7BA 1LSTA 1MY4A 4I1DA 1VFDA 2O7UA 1P1OA 3RUMA 1SYIA 1B0HA 3LUYA 4GD5A 3PUYE 5FHNA 3CG3A 3T22A 2XXPA 1D9VA 3IB1A 4OETA 3MAMA 3TUSA 2UVIA 2XX7A 4KQPA 5DEXA 4EF2A 4Z7EA 1PEBA 3T9HB 1MDP1 2F6GA 3A3CA 2NXOA 3A3UA 2ALUA 2M8CA 4HCWA 1Y3QA 4YB5A 4OWDA 1BKAA 5LOMA 1UTBA 2RC8A 3K1PA 1QVSA 3TPAA 3C33A 4JWOA 4HS7A 1JW1A 1F9BA 1LB8A 1RYXA 3PGFA 1MXWA 3C34A 2I3WA 4FEDA 1MY0A 4POWA 2GRVA 3IO4A 4X48A 4PETA 4KCDA 3JYRA 2DWIA 1IUDA 4JWYA 1SW2A 1B1HA 2XXRA 4FORA 4GOTA 4KYSA 5CC2A 2QMWA 1XC1A 3V83A 3FJ7A 3KBRA 2QMXA 3K2DA 1ELJA 3DLNA 3TTLA 2V25A 3KN8A 1A54A 4QFOA 4NF5A 3HV1A 3P7IA 1QULA 3OD7A 3VFJA 4YKPA 1LCFA 1LBBA 1MPBA 1FQDA 2REGA 3UGWA 3DP6A 1Y3NA 4ELQA 4GL8A 3TTKA 4JDFA 2ZNTA 3G7WA 5FHOA 1VSOA 4U1OA 4LONB 3MPLA 1AH5A 4AQ4A 3TCHA 1YPNA 4IO5A 2Q2CA 3T93B 3QSLA 1H44A 4EXLA 1S9TA 4H0WA 4U2RA 5KDTA 1I69A 3JZJA 4KCCA 5TPAA 3V89B 2Z8EA 5F1QA 4MH5A 2H9BA 1OMPA 4XKNA 1ZTYA 1LB9A 3IOUA 2VD3A 4OXVA 4DXCA 1SVXB 3G3FA 1MS7A 1A8EA 2RCBA 1XT8A 3L6GA 4NWDA 3OEMA 3KZGA 1FW0A 5A5XB 1B3GA 3MVZA 3FIRA 4G2ZA 3IOTA 4OESA 4BDOA 3FXQA 1GV8A 2A5TB 3MP1A 1Q35A 3MVXA 1N7XA 4ZDMA 3EHTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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