3TTNA

Crystal structures of polyamine receptors spud and spue from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
SLHIYNWTDYIAPTTLKDFTKESGIDVSYDVFDSNETLEGKLVSGHSGYDIVVPSNNFLGKQIQAGAFQKLDKSKLPNWKNLDPALLKQLEVSDPGNQYAVPYLWGTNGIGYNVAKVKEVLGDQPIDSWAILFEPENMKKLAKCGVAFMDSGDEMLPAALNYLGLDPNTHDPKDYKKAEEVLTKVRPYVSYFHSSKYISDLANGNICVAFGYSGDVFQAAARAEEAGKGIDIQYVIPKEGANLWFDLMAIPADAKAADNAYAFIDYLLRPEVIAKVSDYVGYANAIPGARPLMDKSVSDSEEVYPPQAVLDKLYVSAVLPAKVLRLQTRTWTRIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Polyamine transport protein
publication title Structural Basis of Substrate Binding Specificity Revealed by the Crystal Structures of Polyamine Receptors SpuD and SpuE from Pseudomonas aeruginosa
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Transport protein
total genus 114
structure length 335
sequence length 335
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ttnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ttnA02
4KD5A 2F7CA 3Q25A 2NUVA 1FQFA 3CG3A 1A8EA 4P0GA 3FD3A 4RK9A 3RT8A 1A55A 4DDDA 1LAHE 2X26A 5DEXB 2O84X 2E0SA 3MWBA 5CRYA 3TKDA 1B9JA 4RY1A 3MBPA 1QUKA 4NE4A 2E1SA 3G3IA 1MM7A 5I59A 2QMWA 3KOTA 3MZBA 1IXIA 3FZVA 2F7AA 3KSJA 5LOMA 1N04A 1Y20A 2AL5A 3F11A 3KN3A 4QHQA 1PB9A 4YB7A 1RKMA 5HPQA 2IEEA 3DELB 1GGGA 3DLNA 1M5FA 1QKAA 3N26A 1IXHA 3HSTA 5AA2D 3VV5A 3G3FA 4POWA 4OFJA 2I4BA 4GL0A 3IJOB 2DWJA 3LSXA 2LAOA 3TTNA 4YZZA 3KOSA 3MVYA 2VP1A 1MPBA 5TP9B 4F22A 4I62A 2XD2A 1P1WA 1P1OA 3T9XB 2ESNA 3JZJA 2VOZA 1US5A 4N07A 3L6GA 4NF5A 3HV1A 5DVIA 1N3XA 2Q2CA 4KCDA 4OMBA 1HSJA 2F5XA 1N76A 4G8NA 1BP5A 4F3GA 4GXSB 3IX1A 3PU5A 3C31A 5J1DA 4OXVA 2DVCA 3MW0A 2P2AA 5EYFA 2I3WA 3ILUB 4AB5A 1LLSA 1LGBC 4NF6A 3CVGA 3G3JA 1USYE 1UQWA 1VE4A 3CFLA 1MY2A 3HN0A 4KCCA 3CR9A 2QMXA 3HPIA 2D3IA 4R75A 4C1TA 3S9NC 4KHZE 5FHNA 1B5JA 2QS1A 1S7YA 4R72A 5DVJA 3SEVA 1OIBA 3GZGA 3R26A 1TWYA 3FJMA 3B6TA 2GHBA 1SYHA 1SYIA 2DE2A 1MDQA 4H65A 1LB8A 3WAFA 1D9VA 3BFUA 4BDLA 1MRPA 4U4SA 5K2XA 3G7WA 4ZS9A 3H03A 2R6GE 2D5WA 2RF1A 1MXUA 3TAJA 3EN3A 1Y3PA 1MH3A 5H8FB 2V93A 2HFBA 3THIA 2VHAA 2OK2A 2DE4A 4EF1A 3SKPA 1NNFA 5A5XB 2A5TB 5FHMA 5I56B 2X7PA 3CIJA 4R73A 4JSDA 5ISUA 1PDAA 4R6KA 4WXJA 1QUJA 1RYOA 3MP1A 3UN6A 3EHTA 3V5AA 3N94A 4YU0A 3PPRA 4IB2A 2ONRA 4FIMA 1DTZA 1MQIA 3TQLA 4L17A 4MBPA 2PYYA 1KWHA 4IY5A 4R2BA 2FNCA 5DYHA 4TOZA 2GFEA 2V25A 3Q29A 3B7DA 3E3KA 1TT1A 4NF8B 2RCBA 2I6EA 4I1DA 2F8DA 5I2KA 3O97A 1QVSA 1JW4A 2Z8EA 3OOAA 1URSA 5HM4B 3VLVA 2Y84A 3KEIA 4YKKA 4PQJA 2F35A 3SETA 4ELPA 5B7DA 3A3UA 1B7HA 1Q35A 4IY6A 2ZYNA 2ZNTA 1Z7NE 3OO6A 3TQWA 1R1NA 4GL8A 3H7MA 1N7XA 1ZU0A 5H8HA 5H8QB 2DWAA 2REGA 2CZLA 3MPLA 1TXFA 3CSGA 4XTCQ 2XXXA 2OZZA 3RGYA 1B0HA 2I0BA 1ZKBA 3QXMA 5AA2A 4X1BA 3V83A 2F78A 4RJZA 4R9GA 4YB6A 1LB9A 3T22A 5ITOA 4OHNA 5AA4B 4YKIA 5EHSA 5I2NA 3I5OA 2QS4A 1N0TA 1IXCA 1ATGA 1JW1A 4QF9A 1MXWA 4LZ8A 3IK6B 4H67A 4EF2A 1Y1MA 4U1OA 3FVKA 5CM6A 3DP4A 4DIGA 3K0VA 4HCYA 1B0LA 1XC1A 1B7UA 4KFQA 1YCJA 2HXWA 4ZZEA 2I58A 4GQOA 3D4GA 4QFOA 4LQ5A 2V3QA 5TPAA 1MQJA 1SQYA 3T9HB 5JTYA 4FEBA 3G3KA 1XT8A 3N6UA 3RNNA 4IO5A 3SEYA 2XXRA 1A7LA 4UA8A 2QRYA 3MVWA 3TPAA 3UK4A 3K1NA 3CI8A 2H25A 2PMSA 4XIGQ 5I58A 1IXGA 2Y7RA 3I3VA 3KFMA 4Q30B 2DYXA 1H3DA 4IGRA 3U93A 4U4XA 3RPWA 3MZ9A 4LA9A 1HSEA 4OEUA 1PC3A 3Q28A 1YPNA 1OLAA 5CMCA 4LVQA 4WKMA 1B7ZA 5ICQA 1BTJA 3FVGA 4F18A 1O64A 2DVZA 4POXA 4OWDA 2HZLA 5ITPA 3T9UA 3KN7A 3K00A 1D9YA 3HHGA 1F9BA 4HCWA 2OJTA 2Z8DA 1AL3A 1SW2A 4UACA 4KYSA 3A09A 4BDQA 4BDRA 4JXIA 2B65A 3M3KA 3FV1A 4LATA 3R7XA 1JQFA 5M2VA 3UP9A 2HQ0A 3S4UA 3FIRA 4Q8RA 4OFLA 2ABHA 4F1VA 3TDJA 4PETA 2GHAA 4BLAA 1R9QA 3HCQA 3LSWA 4N13A 3LC8A 3PPQA 4FECA 4EQ9A 2YJPA 2XD3A 2XXHA 3FJ7A 4DZ1A 2XXIA 4ZEBA 2O7IA 1HSLA 4O3AA 1VR5A 4GWOA 2HCAA 1DOTA 3FVNA 4F1UA 4RNSA 3C33A 4QFPA 2AL4A 5I57A 3BBRA 3O66A 5FTHA 2O68A 4QFNA 3PMWA 1FQCA 1URGA 4E0XA 2RC8A 1UTHA 4OYVA 1IEJA 5IAIA 1USYH 4FORA 3PUWE 4N6PA 3T66A 4THIA 5H8SA 1P1NA 1DPEA 1SI0A 5KCJB 1AIVA 4KQPA 2ZYMA 3GBBA 4R2FA 3OXNA 5ELVA 3S9EA 4Q5TA 3RTWB 3H06B 1MQDA 5H8NB 2HEUA 1DSNA 1DPPA 4GXAA 3C4MA 1B58A 1H45A 2A5SA 3TMGA 4GIZA 2Y7KA 4I8CA 1NH7A 1B5HA 3BKIB 1IUDA 1D3KA 4QSCA 2DE3A 3PUYE 4K3FA 4U23A 3UORA 3KZGA 1ZIUA 3IJXB 4MLQA 3OEKA 3FUZA 3TZAA 3O6GA 2FA7A 1LAGE 1O7TA 2Q9TA 4XKRA 3EHUA 2BJJX 3E4RA 3CRBA 3LR1A 3QIMA 2NVUB 3TCGA 4NF4A 4ZEKA 4RPNA 4JBZA 4PP0A 1FQDA 1Y4CA 3TCFA 4NTLA 3OD7A 2XXUA 3MP6A 3VLUA 4H5GA 2DWIA 5CI5A 1UTBA 1JEVA 3GLBA 1OVTA 2ONKE 1B3HA 4U21A 3PD9A 3FJGA 1Y3QA 3G3GA 4DLDA 4QSEA 1LAFE 1POTA 3BFTA 2Y7PA 2I0CA 3M3FA 2NWJA 2VD3A 3IB0A 4G8MA 4YKPA 1MPCA 1WODA 1LBCA 1GV8A 2QS3A 1Y1ZA 2XXWA 4NMYA 1LFIA 1L5TA 2H99A 1SVXB 3USDA 3TTRA 3WAEA 3ZKKA 1POY1 3T9VA 3KN8A 1XVYA 2WKYA 1OMPA 2XXYA 1A40A 3M8UA 4X1DA 3G3HA 3VVFA 3TTKA 3O28A 2DXYA 3I6VA 1QKBA 4PFWA 1SW4A 4LZ5A 4XKNA 2I48A 3IB1A 2H4IA 2F6GA 4JWOA 1QJMA 2ZNSA 3PV0E 4OVJA 4G2ZA 2R71A 4FJPA 5CMKA 3H4ZA 3O6HA 1BKAA 1NL5A 1Y9UA 4EQBA 4IO7A 3HO7A 1VSOA 1M5CA 3P7IA 4F2QA 5BWJA 4JB7A 4KI0E 2Y7IA 2OWSA 4NWDA 3UGWA 3FXRA 3MJNA 3H6WA 2I4CA 1B6HA 3HHFA 1GVCA 3PUVE 2UYEA 2V84A 2H98A 3K1MA 1PBPA 2ZYKA 5TP9A 1FCKA 1FTLA 4GVOA 4LP2B 2Z8FA 2W7YA 4X48A 3JV9A 4ZDMA 1FTOA 1LSTA 3PUZE 3IL1B 3A3CA 1EH3A 3OSQA 3O6IA 1ELJA 2RKMA 1O63A 2VGQA 1LCFA 1MY3A 3DM0A 1NNTA 1MPDA 4Q0CA 1OLCA 5CMBA 4KR5A 3PPOA 2B3FA 2PX1A 3OO7A 3LUYA 3QYTA 3TTLA 1BIYA 2KLFA 5L9OA 2OLBA 2THIA 1FTKA 2Q88A 4YMAA 4IO4A 4OFOA 3K02A 4TQUQ 5JK4A 3CG1A 5K2YA 2FYIA 1B5IA 1MY1A 5I59B 1II5A 5F7VA 4BDMA 3V8XB 1JNFA 1ZMGA 1ZJLA 1I69A 2P0SA 2QJEA 2PVUA 1DMBA 3N6TA 4PFYA 2QPQA 5DT6A 4TLLB 4GOTA 1IQ7A 3KSXA 3KJTA 3FASA 1PEBA 4H8IA 3IO4A 5H8FA 3EQ1A 4Z7EA 1VFEA 1H44A 1ANFA 4GRKA 2Z23A 1URDA 2RINA 3UA8A 3PPNA 3W15C 4EXLA 5A5XA 2A5TA 1Q1KA 4YKJA 2DXRA 5I56A 1MXXA 4LUBA 4F2OA 1YAEA 4FATA 2V3UA 4I9DA 4ZE8A 4PFTA 4ELQA 3C9HA 3ZSFA 5AA3A 4AB6A 3Q26A 2PBWA 2QS2A 3PMVA 1I6QA 1YTVA 1B51A 1B40A 1ZLQA 5AE4A 4OZ9A 4NF5B 3SESA 4OERA 3W9VA 3GXAA 4G68C 1NH8A 4DXUA 3S2VA 2O1LA 1AMFA 2F97A 2PT2A 3IOWA 1N7WA 3B6QA 5DVFA 3H6TA 2XXTA 4M1VA 5ICTA 1MY4A 1JEUA 4NF8A 3IOUA 1DTGA 3O29A 3U94A 3M3LA 1CE2A 4NF6B 3SDFA 1LAXA 2O51A 3U1OA 1IITA 4F39A 3O2AA 4R6HA 2Y7WA 2F36A 3GBAA 4FEDA 4YAHX 2ALUA 5JEIA 1B3GA 3CFXA 2O6AA 3H3GA 4GLIA 3MC2A 3OELA 3TTMA 3MVXA 3FATA 3C36A 4H6DA 4F1YA 1GR2A 2O1MA 4GD5A 3QSLA 4PE5B 3K4UA 1ZBMA 1JVXA 2OBGA 2DWHA 5H8QA 1P99A 3AXFA 4RYAA 4WEPA 2ZYOA 3QAXA 2YLNA 4GF8A 3PMXA 2D21A 3QUFA 5DTBA 4C0RA 3TEPA 1QULA 5CBSA 4F29A 4DXBA 4TLMB 3JYRA 3OMBA 2V3TA 1B3EA 1MH4A 1P1UA 1T0KA 2QL3A 4F3SA 2XX9A 4IGTA 1EZPA 5AA4A 3SEUA 3S9MC 4QSDA 3QK6A 3T96B 4QFLA 4JSOA 4H1XA 1S50A 2UXAA 4ONYA 1MQHA 1UIUA 3K01A 3EHSA 3VVDA 4OENA 4MF3A 4NEDA 2UVIA 4EXKA 4BDNA 4YMBA 2G93A 3K2DA 4HS7A 2Q8JA 1B1HA 1I6AA 5I84A 4MFIA 3T93B 5I2KB 1R6ZA 4KPTA 3U8QA 3TFLA 3H6VA 3IAZA 2YPNA 1MS7A 1SW5A 3CSBA 4EQ7A 3U72A 1B32A 3FXUA 4Z0IA 1XVXA 4G8HA 2REJA 3D4CA 1S9TA 4F3BA 4M4GA 2G29A 4WEDA 2DP8A 5H8HB 1FTJA 2GRVA 2HAVA 4ELOA 4XKQA 3DP6A 3LSLA 1B2HA 1CB6A 2XX7A 3R6UA 4OTEA 4G68A 4EDPA 4F19A 5AA2B 1IZ1A 2XXPA 3QUJA 1WVJA 2F34A 1JETA 2Z22A 3KJ7A 3IOVA 3FVOA 3V89B 3VXBA 1Z7ME 5I2NB 3CFZA 4NWCA 3VDFA 3RN8A 1XOCA 1I6BA 3ECRA 1SD3A 1PBQA 4ZZAA 3ZKLA 3SEWA 5FTIA 1UIVA 1B4ZA 3K6VA 2VD2A 4ZEDA 2XX8A 1ZTYA 5AA1A 1LFHA 3EF7A 5KDTA 3RT6B 3B6WA 2XXQA 4IO2A 2GH9A 5TPAB 2ZXTA 3PGFA 1RYXA 5TU0A 5JTYB 1A8FA 3SEXA 4KYDA 5B70A 2CMOA 3S9LC 1AOVA 4O3CA 2XHDA 3ZS6A 1MM6A 4H5FA 3MZ1A 3O9PA 3K1PA 3LSFB 3MVZA 4U22A 5DEXA 2Q89A 5I58B 4DXCA 3OO8A 5L8DA 1VFDA 3OENA 1XHYA 4ZE9A 2X7QA 3ONMA 4R74A 1B3FA 1FW0A 4YB5A 3RTFB 3OEMA 3K6UA 1OVBA 2ONSA 4HTGA 3VVEA 2R9JA 3RY3A 3KGCA 3TODA 3KBRA 1OQGA 4F3PA 3MQ9A 4RK2A 4GFRA 4F31B 1P1QA 2Q2AA 1OQHA 1H76A 1MDP1 5KCJA 2HZKA 4ZECA 4X9TA 4C1UA 2DQVA 1QUIA 3IOTA 4ESXA 3DP8A 1M5BA 1D4NA 1J1NA 4E0WA 5H8NA 3IR1A 4BDOA 2OCUA 4DCXA 4ZEFA 1Y3NA 3K6WA 2IA4A 5IKBA 3H6UA 3RUMA 2UVJA 1MY0A 2RC7A 3MUQA 3TUSA 2F6PA 3KG2A 5BUUA 1A99A 4ISUA 3MPKA 1MXYA 2DOJA 4QFKA 4R6YA 4JDFA 1GTKA 3K6XA 4IO3A 4KYEA 3E13X 2HAUA 1NNKA 4G4PA 2NOOA 3FXQA 1LCTA 3C32A 5L9MA 4PFUA 2I49A 3E9XA 2H5YA 4ELRA 5FHOA 5KZTA 1EZOA 4LZ7A 1H43A 2DS9A 2ZNUA 4ND9A 1JVYA 4LQ2A 1FQAA 4XXUA 3OSRA 3TYHA 1Y4TA 5I57B 4EUOA 3C34A 2UVHA 1PB7A 4P0IA 3FGSA 3MP8A 1UTHB 1WDNA 2RC9A 4R9FA 1MQGA 5CBRA 3Q27A 1N3WA 4YICA 2P1SA 4LONB 1B1XA 1JW5A 3IO6A 4JWXA 4MH5A 1EU8A 1B52A 3IORA 3PUXE 1SBPA 4U1ZA 3IB2A 1B3LA 1B46A 1EZ9A 2QSXA 4U2RA 1R9LA 2F7BA 2NXOA 4HW8A 4RPOA 1LFGA 1NNPA 5F1QA 1AH5A 3VE1B 1TFDA 2B3BA 3SERA 2O7UA 1A54A 1MXVA 4XKPA 3VXCA 4QRZA 2ANJA 5CC2A 1MXZA 3L6HA 3TCHA 4OETA 3RQTA 2O69A 3MAMA 1N84A 4DE8A 1NFTA 1NKXA 3TELA 1MG1A 5L9SA 2I3VA 2UVGA 4NF4B 2DSFA 1FQBA 2H9BA 3VFJA 2OWTA 2AIXA 4G68B 1US4A 1IIWA 3W9WA 1SI1A 3OO9A 1FTMA 1B4HA 1B05A 4ZEIA 2ZMBA 4RXLA 3ODBA 4FE8A 1UTBB 1LBBA 4OEVA 4FAJA 3U92A 5CMMA 2RCAA 2XXVA 1M5EA 1M5DA 4AQ4A 3PPPA 4JWYA 1FQEA 3FV2A 2PT1A 1TFAA 5EHMA 3C35A 4ECFA 1BLFA 1SDXA 3EPEA 3LBSA 2AYSA 3ILTB 3N5LA 3UIFA 2M8CA 4OESA 4H0WA 4H8JA 5KDTB 3RLFE 1PB8A 4MLVA 4ESWA 4OQOA 4O3BA 3VLWA 4P11A 2UYFA 5HBCA 4IO6A 1SW1A 1XS5A 4G77A 4RA1A 3PD8A 1NMUA 4DCYA 1QW0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KD5A 2F7CA 4XEQA 3Q25A 2NUVA 1FQFA 4AS5A 3CG3A 1A8EA 4P0GA 3FD3A 4KXPA 4RK9A 3RT8A 1A55A 2F3DA 4DDDA 1LAHE 2X26A 5DEXB 2O84X 2E0SA 3MWBA 1Q9DA 5CRYA 5IM2A 3TKDA 1B9JA 4N15A 4RY1A 3MBPA 1QUKA 4NE4A 2E1SA 3G3IA 1MM7A 5I59A 2QMWA 2P3VA 3KOTA 3MZBA 1IXIA 3FZVA 2F7AA 3KSJA 1LEVA 5LOMA 1N04A 1Y20A 3D1RA 2AL5A 3F11A 1EYKA 3KN3A 4QHQA 1PB9A 4N6DA 1FPBA 4PDDA 2WBBA 4YB7A 1RKMA 2CEYA 5EQ8A 5HPQA 2IEEA 3DELB 4NAPA 1GGGA 3DLNA 1M5FA 1QKAA 3N26A 1IXHA 3LV0A 2XXKA 4OVRA 3HSTA 5AA2D 3VV5A 3G3FA 4POWA 2CZHA 4OFJA 2I4BA 4GL0A 3IJOB 2DWJA 3LSXA 2LAOA 3TTNA 4YZZA 4MEVA 3KOSA 3MVYA 2VP1A 3E78A 1MPBA 5TP9B 4F22A 4I62A 2XD2A 1P1WA 1P1OA 3T9XB 2ESNA 3JZJA 2VOZA 3CHGA 1US5A 4N07A 3L6GA 4NF5A 3HV1A 1EYIA 5DVIA 1N3XA 2Q2CA 4KCDA 4OMBA 1HSJA 2F5XA 1N76A 4G8NA 1BP5A 4OVQA 4F3GA 4GXSB 5IZ3A 3IX1A 4PFRA 2DDKA 4I3EA 1KA1A 3PU5A 3C31A 5J1DA 4OXVA 2DVCA 3MW0A 2P2AA 5EYFA 2I3WA 3ILUB 4AB5A 1LLSA 1LGBC 4NF6A 4JVDA 3CVGA 4PFIA 1FPIA 3G3JA 1USYE 2WBDA 1UQWA 1VE4A 3CFLA 1MY2A 3HN0A 4KCCA 3CR9A 2QMXA 3HPIA 2D3IA 1FPJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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