3TTNA

Crystal structures of polyamine receptors spud and spue from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
SLHIYNWTDYIAPTTLKDFTKESGIDVSYDVFDSNETLEGKLVSGHSGYDIVVPSNNFLGKQIQAGAFQKLDKSKLPNWKNLDPALLKQLEVSDPGNQYAVPYLWGTNGIGYNVAKVKEVLGDQPIDSWAILFEPENMKKLAKCGVAFMDSGDEMLPAALNYLGLDPNTHDPKDYKKAEEVLTKVRPYVSYFHSSKYISDLANGNICVAFGYSGDVFQAAARAEEAGKGIDIQYVIPKEGANLWFDLMAIPADAKAADNAYAFIDYLLRPEVIAKVSDYVGYANAIPGARPLMDKSVSDSEEVYPPQAVLDKLYVSAVLPAKVLRLQTRTWTRIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Basis of Substrate Binding Specificity Revealed by the Crystal Structures of Polyamine Receptors SpuD and SpuE from Pseudomonas aeruginosa
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule keywords Polyamine transport protein
total genus 114
structure length 335
sequence length 335
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ttnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ttnA02
3LR1A 4GOTA 3THIA 3OENA 2RCBA 3DM0A 4F29A 4NF4B 3TODA 4DXUA 4O3BA 4BDLA 2Q2AA 3TELA 3QIMA 2A5TB 4MBPA 1ZJLA 3CSBA 3Q27A 2UVJA 1SW4A 4KYSA 4LP2B 1N84A 3C31A 1DSNA 5CMBA 3CFZA 4WEDA 3V5AA 3VLWA 1B0LA 1LAFE 4FJPA 1B40A 1B3EA 1QW0A 3C9HA 4IY6A 4DZ1A 2RF1A 5L9MA 3TQWA 2REGA 3CI8A 4YMBA 5FHNA 4RPNA 3TCGA 1NH7A 1POY1 1L5TA 5BWJA 4H65A 3RGYA 3MVZA 2O1MA 3SDFA 1MS7A 4OZ9A 4DXCA 3RT6B 1POTA 2OZZA 4H67A 1JNFA 3PU5A 5DTBA 2H99A 4NE4A 3PPRA 4BDRA 3BKIB 4G68B 4QSCA 5H8NB 2VD3A 2H5YA 5F1QA 4NF5B 4R73A 3HHFA 3MZ9A 3S9LC 3H6TA 4R75A 1US4A 3L6GA 4OERA 4JB7A 4TOZA 3G7WA 3H3GA 5A5XB 3E3KA 3LUYA 3U94A 2PVUA 4ZZAA 3A3UA 1MY4A 1P99A 4OMBA 3MC2A 3O6HA 2ZYKA 4C1TA 1GVCA 5EHSA 2O7IA 3VVEA 2ABHA 3EF7A 4ZEFA 4YKJA 2QMWA 1EZ9A 2RC7A 3C4MA 3FVOA 4THIA 3G3IA 4O3AA 3C35A 4ESXA 4EXLA 5K2XA 1B1XA 1QVSA 4H5GA 1VE4A 4F3BA 2GHBA 4QFNA 3HHGA 1ELJA 3W15C 1BLFA 5H8QB 2QRYA 3QK6A 1NMUA 1XVYA 4ZDMA 2DWAA 1S7YA 1JETA 2AIXA 4NF8A 1OVBA 4F3SA 3JZJA 3MVWA 2XXIA 1MDQA 2DXRA 1D9YA 1B32A 4DCXA 1SW5A 4GVOA 2A5SA 2XX9A 2QJEA 2G93A 3H03A 3KOSA 3O6IA 4EF2A 2ZNUA 1NL5A 3IOVA 2F97A 3CG1A 4LQ5A 3O28A 4GWOA 1RYXA 3T66A 1DOTA 1QJMA 4GD5A 2H25A 4QF9A 1I69A 3FXUA 4G2ZA 2XXHA 2XX8A 4LA9A 3UA8A 2X7PA 2D21A 4R6YA 3FZVA 4HS7A 3PPQA 4F1VA 1B7ZA 2Q8JA 3ZS6A 5TP9B 3H6UA 5M2VA 3W9VA 1PBQA 1SYIA 1QKBA 4OFLA 4U1OA 3TYHA 4F22A 2Z23A 1QUKA 1B58A 1AL3A 1N0TA 3FATA 2I3WA 4EQBA 3K01A 4QFKA 4ZE8A 3T93B 3VLVA 1IQ7A 1P1QA 1DTGA 2DSFA 4X1BA 1N7XA 2I6EA 1JVYA 3G3GA 3ILTB 3KBRA 1B0HA 4POXA 4ELRA 2F7CA 2XX7A 4X9TA 3U92A 3R7XA 4BDQA 4ZEDA 3B6QA 5I56B 5AA1A 4LUBA 1BIYA 1MXYA 3KSJA 2XXXA 4IO4A 1NNFA 1N76A 2Q88A 5L9OA 5F7VA 2F7BA 1DPEA 1URDA 1B5JA 1M5EA 3FASA 4U21A 3I5OA 3O2AA 5H8FA 1JW5A 1R6ZA 3CVGA 3E13X 3TTLA 3LSWA 3TTKA 5DVFA 1GTKA 4OWDA 5H8HA 1B5HA 3K1NA 2H98A 3L6HA 3USDA 4ELOA 4PFUA 3IB1A 1SBPA 2XXQA 4NTLA 1UTBA 1DPPA 1SI0A 3T96B 3FIRA 5CMCA 3WAEA 1XHYA 5CC2A 3QYTA 5TPAB 3QXMA 2CMOA 2KLFA 4RK9A 2ALUA 1FQFA 5JTYA 2DOJA 3IOTA 1YTVA 2NUVA 2QS2A 4NMYA 4OETA 2HCAA 5EHMA 4QFPA 3PUVE 5K2YA 2I49A 4JWXA 2VP1A 5KCJA 4AB6A 5AA2B 4OEUA 3UP9A 3SERA 4FEBA 2F78A 3E9XA 2F35A 3DP4A 5LOMA 1ATGA 1FCKA 4H8JA 3OO6A 3MP8A 1OQHA 3C34A 3U72A 3FVNA 1QKAA 4OHNA 3SKPA 4F3PA 3KG2A 4JDFA 5I59A 3H4ZA 3OMBA 2DWHA 1QUIA 3OEKA 3HO7A 3T9VA 4HTGA 3T9UA 1QUJA 4XXUA 1GGGA 4F2QA 4OTEA 3RUMA 1OMPA 2IA4A 3N6TA 3MVYA 1T0KA 2FA7A 2Q2CA 4AQ4A 1R1NA 1B46A 1BTJA 4I9DA 4LVQA 2DE3A 1H43A 1XS5A 5B70A 2XXUA 3LSFB 3H6VA 1ZBMA 3PGFA 1B3GA 1MDP1 1KWHA 1LFHA 2V3TA 4GXAA 2X7QA 4OXVA 1NNTA 3PMWA 4KYEA 2NVUB 3V8XB 2BJJX 5CRYA 5ELVA 3FD3A 4M4GA 2RC8A 4ZE9A 4JXIA 1D9VA 1LB9A 1P1WA 3O6GA 4NEDA 2AYSA 1FQBA 1DMBA 4G68C 5KDTA 5J1DA 1MXVA 3VE1B 1GR2A 4JBZA 3K6VA 1MM6A 1JEVA 5AA2D 2O68A 2AL5A 4YKPA 3OXNA 2O84X 3IR1A 3H7MA 5I2NA 1H3DA 4EXKA 3KZGA 3EPEA 2ZNTA 2ONSA 4P0GA 2DVZA 2Z8FA 4IB2A 5H8SA 3TQLA 1XOCA 5ICTA 3UGWA 1WVJA 1MQJA 1PEBA 1S50A 1FTLA 2ZNSA 1IITA 3DP8A 3OD7A 5DEXA 3K2DA 1F9BA 4DE8A 5HM4B 1ZIUA 2DWJA 5JEIA 3W9WA 4M1VA 3TZAA 1R9LA 3TTMA 2V3UA 5I2KA 2Y7KA 3CG3A 4H6DA 4NF6A 2O6AA 2I0BA 3M3KA 1OLAA 4YZZA 1B7UA 4QFOA 1VSOA 1ANFA 1HSEA 5L8DA 2V84A 4FAJA 1TFDA 4G4PA 3FVGA 1P1UA 5AA4B 4N13A 4XIGQ 2PT2A 2GHAA 4KI0E 4QRZA 4DDDA 1YCJA 1P1NA 4AB5A 2VD2A 5IKBA 5BUUA 4YB6A 4OENA 4NF4A 3KJ7A 2ZYMA 3B6TA 4FECA 3CSGA 3OOAA 3IORA 1H76A 4PETA 1R9QA 3JV9A 5CMMA 2PT1A 5FTHA 1M5DA 4L17A 3RNNA 4TLLB 4U2RA 1DTZA 1N04A 2HQ0A 1J1NA 4LQ2A 3OO9A 3FV1A 1A99A 3KJTA 4C0RA 2FYIA 4E0WA 4F3GA 1JEUA 4R74A 1IXGA 2NXOA 2QS3A 3CRBA 3RQTA 4IO2A 3KN3A 2XXPA 1SVXB 4PFTA 5B7DA 3PMXA 1USYH 4ESWA 1OLCA 4I8CA 4PP0A 1NKXA 2DXYA 3ODBA 2OCUA 1TWYA 2QPQA 2QS4A 3QUJA 4ECFA 3K0VA 3PUXE 2DE2A 4MH5A 1S9TA 3K02A 2HAVA 5DVIA 1OIBA 3OSQA 3HCQA 4JWOA 1PB8A 3LC8A 1LCTA 5I58B 2W7YA 2ZXTA 3PUZE 4G68A 5H8NA 1B51A 1VFDA 4KHZE 4NF5A 2QL3A 1FQDA 3CR9A 1JVXA 4TLMB 1MM7A 2FNCA 4P0IA 3G3KA 3TTNA 4ELQA 3KN8A 4U1ZA 1OQGA 3RN8A 1UIUA 3SEVA 3IO6A 1Q35A 3MQ9A 4Q0CA 4IO7A 3KSXA 2DS9A 3PD8A 3U1OA 3I6VA 2QMXA 2GRVA 4QFLA 4GFRA 3PD9A 4POWA 1FW0A 2HXWA 4RPOA 4LZ5A 3GXAA 5I84A 4MFIA 2F5XA 4G8HA 2ESNA 2UVHA 3TCHA 3S4UA 2PYYA 3TUSA 4YAHX 4MF3A 2OLBA 4H5FA 2I4CA 3MPLA 1A54A 1EU8A 2B3BA 2I3VA 2Z8EA 2H4IA 4X1DA 4H0WA 2AL4A 3HV1A 3AXFA 2OWSA 1FTKA 5H8QA 5IAIA 4XKNA 1US5A 1URSA 4KFQA 2M8CA 1MY2A 3PPOA 2IEEA 4RA1A 1O7TA 1UIVA 3BFTA 1LFIA 3FGSA 2QS1A 3K00A 4TQUQ 1WODA 2OWTA 1B1HA 1MY0A 3GBAA 1O63A 1EZPA 4KR5A 2E1SA 5L9SA 1PC3A 3TPAA 3IOWA 4U4XA 4H1XA 3QUFA 3IX1A 1ZMGA 3KN7A 5DYHA 3MVXA 3VXCA 2YJPA 2Y7PA 4ZEBA 3MZ1A 4R2FA 4BDNA 2D3IA 4WXJA 4HCYA 3ONMA 1PB7A 2Q89A 1VR5A 3DLNA 3R6UA 1CE2A 1A55A 4F31B 4YKKA 5FHOA 2VHAA 2UVGA 2F34A 3GZGA 1LCFA 3IJXB 4XTCQ 5TP9A 4GIZA 2O69A 3D4GA 2F6PA 1H45A 3VVDA 1UQWA 4DLDA 4YICA 3D4CA 3MP6A 2UVIA 3MPKA 4ZEKA 5CBSA 1MY3A 2P2AA 4G8MA 5I57B 4IO3A 1MG1A 4I1DA 3VDFA 2F7AA 1MPBA 2Y7WA 2I48A 4R2BA 1UTHB 2GFEA 3H06B 3A09A 1TXFA 2PBWA 3IL1B 3IK6B 1PDAA 3M3LA 2R71A 1FTOA 4Z0IA 3T9HB 1SD3A 1B3HA 3MBPA 1TT1A 3U8QA 5I56A 4EQ9A 5ITPA 3KFMA 3SEXA 4PFYA 3N26A 1M5BA 1FQCA 1MXXA 2RCAA 3GLBA 1Y3PA 1IZ1A 2Y84A 3C36A 1IEJA 3RTFB 2P1SA 1MXWA 1A40A 3VFJA 2UYEA 4WKMA 4IY5A 3KGCA 3M3FA 3EHSA 2D5WA 3Q29A 1JW1A 4FIMA 2Y7IA 1D4NA 1AIVA 2HEUA 2ONRA 2PX1A 3DP6A 3MUQA 5TPAA 3O97A 2XD3A 1BKAA 3DELB 3K1MA 4DXBA 3LSXA 4JSOA 3TMGA 2ZMBA 3N6UA 1Y20A 3UORA 3U93A 1M5CA 1O64A 3Q25A 4XKPA 1FTMA 1M5FA 3MZBA 3S9EA 1NNKA 5AA2A 4IGRA 3FJMA 2ZYOA 3PUYE 4FATA 3ECRA 1IXIA 1IUDA 2ZYNA 3P7IA 4YB7A 1WDNA 4UA8A 3S9NC 1AMFA 2GH9A 4ZEIA 4DCYA 2O51A 3RY3A 3BBRA 4ONYA 1OVTA 4FE8A 1FTJA 1LB8A 4QHQA 2THIA 3UN6A 3OO7A 3FUZA 3MAMA 2H9BA 4JWYA 2Z22A 1XC1A 2UYFA 4OYVA 5FTIA 1A7LA 4ZZEA 1MH4A 1B6HA 3FV2A 5CBRA 2HZLA 2NOOA 1LLSA 3A3CA 1MXZA 1YPNA 3ILUB 2O1LA 3SEWA 3MW0A 1ZU0A 2XXVA 3CIJA 4PE5B 1II5A 4HCWA 4KCCA 3VLUA 3MJNA 4Q8RA 2X26A 3G3HA 4OFJA 1AH5A 2VGQA 4GLIA 4Q5TA 1HSLA 3MP1A 1MXUA 4R72A 4ZS9A 3PMVA 2WKYA 1B9JA 1B2HA 2QSXA 3K1PA 3S2VA 3PPNA 1USYE 5CM6A 4RK2A 3IO4A 1B4ZA 3SETA 1AOVA 1LBCA 3FXRA 1Y1MA 1I6AA 4GRKA 2DQVA 1RYOA 2R9JA 4NF8B 1Y9UA 1BP5A 2ANJA 1TFAA 4OFOA 2Q9TA 3O9PA 2UXAA 2F6GA 5EYFA 3UIFA 3UK4A 3EQ1A 5CI5A 4O3CA 1P1OA 1EZOA 2A5TA 1MQIA 3TKDA 3IOUA 3FVKA 4MLVA 3FJ7A 4YB5A 3K6WA 2B65A 4EQ7A 1PBPA 1Y4CA 1MQDA 1SW2A 1MY1A 3HN0A 3VV5A 3EHTA 4H8IA 3IB0A 1Y3QA 4F2OA 5ICQA 3E4RA 3C32A 2F8DA 1MH3A 4EDPA 3K6UA 1MQGA 3O66A 3RTWB 1LSTA 4P11A 5AA4A 2P0SA 4IGTA 3S9MC 3GBBA 4UACA 3TTRA 4XKQA 3I3VA 1Q1KA 1URGA 4GL8A 2DYXA 3JYRA 1IXCA 1MPCA 3KEIA 4YMAA 1VFEA 1XVXA 5DVJA 5HBCA 3RT8A 4F1YA 4KQPA 5A5XA 1YAEA 2OJTA 3OO8A 1MPDA 4MLQA 2XXTA 1SQYA 3RPWA 2G29A 4LZ8A 3WAFA 2DWIA 4U23A 3TDJA 4U4SA 3T22A 3ZKLA 3ZSFA 1Y1ZA 4KCDA 4BDMA 1FQEA 3LBSA 3F11A 4N07A 3Q26A 4YKIA 1Y3NA 1GV8A 2F36A 1NFTA 2XXWA 2HZKA 5JK4A 5H8FB 1B52A 4K3FA 1HSJA 3VVFA 3CFXA 1LGBC 5H8HB 4R9GA 3ZKKA 4RXLA 2LAOA 2Z8DA 1LFGA 4RY1A 5I58A 4IO6A 2REJA 1UTBB 3CFLA 4ELPA 4I62A 3IJOB 3TEPA 2ONKE 4GF8A 5AA3A 4KYDA 2XXYA 2DVCA 1ZTYA 4NWCA 4GXSB 4LZ7A 3R26A 1SDXA 5JTYB 3EN3A 2NWJA 4OEVA 4KD5A 3N94A 4LATA 2DP8A 4DIGA 4OQOA 4YU0A 2XD2A 4HW8A 5KCJB 2CZLA 2B3FA 5TU0A 3G3JA 3KOTA 4KPTA 3QAXA 1IIWA 2OBGA 2V3QA 3EHUA 4JSDA 3PPPA 1FQAA 1NH8A 1IXHA 1B4HA 1MQHA 5FHMA 1B3LA 2O7UA 4BLAA 3FXQA 2DE4A 1CB6A 1JQFA 1NNPA 2HFBA 4E0XA 5AE4A 5I59B 3B7DA 5ISUA 4EUOA 4X48A 4QSEA 1RKMA 2XHDA 4R9FA 2YLNA 4NWDA 1JW4A 4PFWA 3V83A 4EF1A 1H44A 2I4BA 1QULA 3V89B 3OSRA 3IB2A 1I6BA 4F39A 3PUWE 4QSDA 3PV0E 3OEMA 4GL0A 2HAUA 4ZECA 4PQJA 1PB9A 3B6WA 3HPIA 3Q28A 3VXBA 4C1UA 2YPNA 4WEPA 1I6QA 1SW1A 4GQOA 1A8EA 4U22A 4OVJA 1ZKBA 2V93A 5CMKA 3QSLA 3M8UA 3TCFA 1LAXA 5KDTB 4ISUA 2I58A 4G8NA 3K6XA 2R6GE 3C33A 1B05A 1LAGE 3LSLA 3RLFE 3HSTA 5I2NB 1N3XA 3TFLA 1Y4TA 4F1UA 4FORA 3SEYA 5HPQA 4N6PA 1LAHE 1D3KA 1N7WA 2Y7RA 2RKMA 3MWBA 4R6HA 4BDOA 4Z7EA 3SEUA 4ND9A 1MRPA 3O29A 5ITOA 5DEXB 5DT6A 1Z7NE 2E0SA 1Z7ME 2RINA 1ZLQA 5I57A 5I2KB 2V25A 2OK2A 1N3WA 3T9XB 3BFUA 3SESA 3K4UA 4RJZA 1A8FA 1UTHA 4NF6B 1EH3A 1SYHA 4G77A 4FEDA 1B3FA 4RYAA 4LONB 1XT8A 3FJGA 3N5LA 4F19A 1B7HA 1LBBA 2I0CA 2VOZA 5KZTA 4Q30B 3TAJA 3IAZA 1B5IA 3H6WA 3G3FA 2RC9A 4XKRA 4OESA 4IO5A 1SI1A 2XXRA 4R6KA 4F18A 3OELA 4RNSA 2PMSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LR1A 4GOTA 3THIA 3OENA 2RCBA 3DM0A 1FJ6A 4F29A 4NF4B 3TODA 4DXUA 4O3BA 4BDLA 2Q2AA 4N4UA 3TELA 3QIMA 4HE1A 2A5TB 4MBPA 1NV5A 1ZJLA 3CSBA 3Q27A 2UVJA 1SW4A 4KYSA 4LP2B 1N84A 3C31A 1DSNA 5CMBA 3CFZA 2P3NA 4WEDA 3V5AA 3VLWA 1B0LA 1LAFE 4FJPA 4MHFA 1B40A 1B3EA 1QW0A 3C9HA 4IY6A 4DZ1A 2RF1A 5L9MA 3TQWA 2REGA 3CI8A 1LBZA 4OVSA 4YMBA 5FHNA 4RPNA 3TCGA 1NH7A 1POY1 2XWVA 1L5TA 5BWJA 4H65A 1LBXA 4PF8A 3MVZA 2O1MA 3RGYA 3SDFA 1MS7A 4OVQA 4OZ9A 4DXCA 3RT6B 1POTA 2OZZA 4H67A 1JNFA 3PU5A 5DTBA 3RPLA 2H99A 4NE4A 3PPRA 4BDRA 3BKIB 4G68B 4QSCA 5H8NB 2VD3A 2H5YA 5F1QA 1FBCA 4NF5B 4R73A 3HHFA 3MZ9A 4NQ8A 3H6TA 3S9LC 4R75A 1US4A 3L6GA 4OERA 4JB7A 4TOZA 3G7WA 3H3GA 5A5XB 3E3KA 3LUYA 3U94A 3IFAA 5T3JA 2PVUA 4ZZAA 3KC0A 3A3UA 1MY4A 1P99A 4OMBA 3MC2A 3O6HA 2ZYKA 4C1TA 4P56A 1GVCA 2L5VA 5EHSA 2O7IA 3VVEA 2ABHA 3EF7A 4ZEFA 2CEYA 4YKJA 2QMWA 1EZ9A 2RC7A 3QMFA 3C4MA 4DI4B 3FVOA 4GWSA 4O7IA 4THIA 3G3IA 4O3AA 3C35A 4ESXA 4EXLA 5K2XA 4N17A 1B1XA 2Y5LA 1QVSA 4H5GA 1VE4A 4F3BA 2GHBA 4N6DA 4AS4A 4QFNA 3HHGA 1ELJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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