3CFLA

Crystal structure of the complex formed between c-lobe of bovine lactoferrin and 5-chloro-6'-methyl-3-[4-(methylsulfonyl)phenyl]-2,3'-bipyridine at 2.25 a resolution
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of the complex formed between C-lobe of bovine lactoferrin and 5-chloro-6'-methyl-3-[4-(methylsulfonyl)phenyl]-2,3'-bipyridine at 2.25 A resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 116
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2008-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cflA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cflA02
1FQFA 4O3AA 4L17A 2Q9TA 1LCTA 2UVIA 1R9LA 5F7VA 4NF5B 3ODBA 1LSTA 4GD5A 4NF6B 4ZE9A 4FAJA 4TOZA 2XHDA 5TU0A 5HPQA 1B58A 1FTLA 2OWSA 1KWHA 3IOUA 3L6HA 3S4UA 1B4ZA 2B65A 2VD3A 1WDNA 2H98A 3K0VA 1N04A 1URGA 1BP5A 1UIVA 3R6UA 4RNSA 2I4CA 1LAGE 4QFPA 5BWJA 5FTHA 5L9OA 4K3FA 1IQ7A 3KOSA 3BKIB 3TQLA 4OEUA 3SEXA 2ALUA 2IEEA 4PETA 3LSFB 2PYYA 2XXHA 2F78A 2DVCA 3VVEA 3UA8A 4NWCA 2HCAA 4C0RA 3SKPA 3PU5A 4R6YA 2AYSA 1ELJA 1BLFA 1O7TA 4F1VA 3S9LC 3K6XA 3OO7A 2LAOA 3A3CA 1TT1A 5CI5A 1PEBA 4KYEA 4ISUA 3O66A 1VR5A 3S9NC 3RY3A 2ONKE 2NVUB 2QJEA 3FV1A 5I2KB 1Y3NA 3IO4A 2XXYA 4N13A 2Q2CA 5H8QA 3QAXA 3KSXA 4ECFA 2KLFA 1M5CA 2HQ0A 3O6IA 3T9UA 1MY2A 2O69A 1DTGA 3UIFA 5CMCA 4R74A 4OENA 5JTYB 3K6VA 1MM7A 2HEUA 3QK6A 2PVUA 1FTKA 4Q0CA 1L5TA 3MWBA 2OJTA 3ECRA 2DOJA 2HXWA 1B6HA 2PX1A 1BKAA 4KYDA 3CSBA 1H45A 3GBAA 4BDLA 3PD8A 4KYSA 2H5YA 4GIZA 4KR5A 1Y3PA 5TPAB 1SI0A 5L8DA 4NF8B 3VVFA 1MQGA 4GRKA 5AA3A 2ZYMA 4PQJA 2FNCA 2XD2A 3PPPA 3KN7A 3KEIA 3QXMA 3EHTA 3I3VA 5DVIA 3HHGA 4NE4A 3IB1A 5IKBA 1PBQA 3EF7A 3T9HB 4FECA 2XXUA 1XC1A 3H4ZA 1UTBB 3MZ9A 4IY5A 1P1QA 2UVGA 3VXCA 1F9BA 1M5BA 3MQ9A 1DTZA 5ISUA 5H8NA 4YKKA 1NH7A 4POXA 1XHYA 3KN3A 3EN3A 3HO7A 2VGQA 3C35A 3ZKKA 2UVJA 2I6EA 3N26A 3C9HA 1Z7NE 3VV5A 4OWDA 1MXUA 5I57B 5DT6A 4F1YA 4NF5A 4YB7A 4U4SA 1GR2A 4DXUA 5AE4A 4E0WA 1XVYA 4IO4A 4R73A 3FJGA 3LUYA 1B40A 2YPNA 4NF6A 1XOCA 4FEBA 5DEXB 5AA1A 2F8DA 5DTBA 3Q26A 2P1SA 4R6HA 4O3BA 1IXIA 3O29A 3TDJA 3IK6B 3KJTA 4Z0IA 4OQOA 4G8HA 2XD3A 3LSLA 4PP0A 1IXGA 1ANFA 2ZNSA 1GV8A 1LAFE 3GXAA 5B7DA 1B3LA 4OFJA 1MQDA 4POWA 5ELVA 3KZGA 4M4GA 1XS5A 2Y7RA 4FJPA 1IITA 2F36A 2V25A 5JEIA 1FQEA 4U22A 3K00A 2QMWA 3FIRA 1QJMA 3DP4A 4Z7EA 2F7BA 2V3UA 1EH3A 1USYH 1I69A 2M8CA 1I6BA 4G2ZA 4LVQA 5I2KA 1FQBA 2NWJA 2DYXA 1Y1ZA 3KJ7A 1B7ZA 1US4A 4P11A 3FXRA 4AB6A 3FVGA 1SI1A 1URSA 3N6TA 5DYHA 5FHMA 3P7IA 1P1UA 4F3BA 2YLNA 1QKBA 1JNFA 1N7XA 1QVSA 4IO2A 4HTGA 5I84A 2O7UA 5A5XB 2ABHA 4QRZA 1PB7A 5JTYA 2QS1A 4IO3A 3SEWA 1OQGA 5L9SA 4DCYA 1FTJA 4RK9A 5DVFA 3G7WA 2O68A 4I8CA 2DXRA 4GLIA 1B7HA 1SVXB 5H8HB 1TWYA 2AIXA 2OK2A 2A5TB 2Z8EA 2UYFA 3FVKA 3FZVA 3K02A 1MM6A 4BDMA 2R6GE 3V83A 5TPAA 2ZYKA 3B6TA 3U8QA 4NF8A 4ZZAA 1POTA 4XKQA 3U1OA 4MH5A 4YMAA 4OMBA 4QHQA 4F31B 1H3DA 2P0SA 1RKMA 4X9TA 4QSDA 4ZS9A 2I3VA 4E0XA 1VFEA 4EQ9A 4H5FA 3KFMA 1B5HA 3JV9A 4MBPA 3G3GA 3N94A 5B70A 4GL0A 2GFEA 2ZNTA 1FTOA 3OO6A 2GRVA 3IOVA 4NMYA 1JW4A 3V8XB 2DE4A 1UTBA 4OHNA 4OTEA 3TTKA 2B3FA 3G3FA 5KDTB 5ICQA 4QFLA 1B4HA 2DP8A 4OFLA 5K2XA 3MAMA 1DSNA 2HAUA 4EXLA 4GVOA 2XX8A 4WEPA 5EHMA 1B3EA 4F3GA 3SEVA 4R2BA 1A40A 1A55A 4YB5A 3K6WA 3G3HA 4DIGA 3MJNA 2PBWA 4IO7A 3FD3A 2XXTA 1QULA 5K2YA 1XT8A 2QPQA 4QF9A 2R71A 5I57A 4AB5A 4HS7A 2I48A 2CMOA 3OD7A 3QYTA 1MQHA 2Q89A 1MY1A 1N3WA 5DEXA 3TCHA 1AH5A 4U4XA 5AA2B 1IIWA 4PFYA 1LLSA 2P2AA 2H4IA 4OVJA 1DOTA 3I5OA 3CFZA 4G8NA 4BDOA 2OWTA 4N07A 4JSDA 3PD9A 1EZ9A 2ZNUA 2Y7KA 1Q35A 3B6WA 4GQOA 1MH4A 1B0HA 5HM4B 4EQBA 1SBPA 1VSOA 3K1NA 1P1NA 2Y84A 4G68C 1ZU0A 1TXFA 4YICA 3OENA 3WAEA 4JXIA 5BUUA 2RC9A 1MDQA 4ZZEA 1ZBMA 3H7MA 2OCUA 2VD2A 3O97A 3IX1A 3UK4A 3GZGA 3TUSA 1QUJA 3HN0A 4KCCA 2PMSA 4JBZA 1OVTA 4DXBA 4P0IA 3MZ1A 3CVGA 1XVXA 3PPRA 5FHNA 3BFUA 3C32A 1DMBA 4AQ4A 1P99A 5JK4A 2E1SA 4DLDA 5CM6A 1H43A 1IZ1A 1POY1 2NOOA 1Q1KA 1Y3QA 4FEDA 3EHSA 1A7LA 1H76A 4FIMA 5J1DA 3CFLA 5A5XA 2GHAA 4IGTA 3MP1A 1SW5A 3TTLA 4DXCA 1LB8A 3PMWA 3W9VA 3Q29A 4ZE8A 2RKMA 5AA2D 3TELA 3IB0A 3FVOA 3U72A 4LZ7A 1LBBA 4TLLB 5H8HA 3MZBA 4KHZE 1CE2A 2A5TA 1UQWA 2B3BA 1NNKA 3KOTA 1MXXA 3K2DA 5I58B 1YCJA 4G4PA 2R9JA 1YTVA 4KCDA 4U23A 2QS3A 3DELB 1Z7ME 3UORA 3VLUA 2O1LA 4MLQA 4IO5A 4OZ9A 4H8IA 1OLAA 1ZIUA 4G8MA 3PPNA 4YZZA 3PGFA 1MG1A 4R9GA 3N6UA 2UVHA 2PT2A 2HZLA 1P1WA 3MBPA 5HBCA 3QUJA 3VVDA 4C1TA 4X1DA 2UYEA 3GBBA 3LBSA 1MXVA 1SQYA 2Q88A 3RT8A 3R7XA 1HSEA 2W7YA 4PFUA 1LB9A 1Y9UA 1EU8A 1M5EA 4UA8A 1LGBC 1MDP1 3G3IA 2DWAA 4NF4B 1AMFA 4F29A 2F6PA 3N5LA 3CG3A 1MXYA 5CC2A 1M5FA 5M2VA 2D3IA 2FA7A 1JEUA 4BDQA 3QSLA 2HZKA 2I0BA 3FUZA 4C1UA 4QSCA 4LQ2A 4JDFA 3TMGA 2AL4A 3OSQA 4G68B 3MVWA 1T0KA 1QW0A 4QFKA 3JZJA 4LZ5A 5ITOA 5CBRA 1H44A 2ONSA 2PT1A 3TZAA 4I62A 1MXWA 3I6VA 1N84A 4ZEBA 3PMVA 4EXKA 4JB7A 5CMBA 1R9QA 5AA2A 4F2QA 4X1BA 4YB6A 5H8FB 4RK2A 4ELQA 3RLFE 2D5WA 1ZKBA 3LC8A 4F1UA 1ZTYA 5I56B 1ATGA 3O6HA 1VFDA 3ZSFA 2X7QA 3T96B 1RYXA 3F11A 4QFNA 1ZLQA 2O51A 3C33A 3H6WA 4P0GA 4BDNA 2G93A 2XXIA 3A09A 3CIJA 1UTHB 4R75A 3FGSA 4H8JA 3D4GA 5TP9B 3U92A 3CFXA 2WKYA 2DQVA 3FJMA 5DVJA 4GXAA 4BDRA 4MFIA 1QKAA 2Y7IA 2AL5A 4KI0E 2GH9A 4FE8A 3BBRA 3JYRA 3ZKLA 3ILTB 4XXUA 3RT6B 5KCJB 1R6ZA 4ELPA 3VFJA 3FXQA 3IOWA 3G3JA 1GGGA 5IAIA 1OVBA 1I6QA 1B3GA 3IORA 1B9JA 3S9EA 2QRYA 4YKPA 1IEJA 3D4CA 1WVJA 4LA9A 5CBSA 3CRBA 3KN8A 5H8QB 1PB9A 4F39A 1MY0A 3EQ1A 3CR9A 1EZOA 1NL5A 2Q2AA 3E9XA 3DP8A 3GLBA 3KGCA 4H1XA 4EDPA 1JW5A 4GFRA 3M3FA 3DM0A 2VOZA 4JWOA 1JW1A 1D9VA 2RF1A 2O7IA 4EF1A 5I58A 5FHOA 1B7UA 4PFWA 4OESA 1SW1A 3A3UA 3M3KA 4ELRA 3TQWA 2Y7PA 2I58A 4H0WA 3OO8A 2DS9A 4OETA 2Q8JA 1OMPA 1JVYA 3UGWA 1IXCA 2DSFA 2ZMBA 1SD3A 4YU0A 4X48A 2H99A 4PFTA 3VLVA 2XXQA 2REJA 2F35A 3MVZA 3TAJA 3IR1A 2RCBA 1A99A 1S9TA 1JETA 4Q5TA 1LFHA 4R9FA 1FCKA 3TCGA 1SDXA 2V93A 3AXFA 3K1PA 3Q27A 4RPOA 1OQHA 3H6UA 1WODA 4EUOA 2O6AA 3PPOA 1B46A 4NF4A 3IJXB 3TTNA 2RCAA 1B3HA 4ONYA 1IXHA 1B5JA 1Y1MA 4EF2A 5I2NB 3R26A 1MY4A 3UN6A 4I9DA 3IB2A 3OSRA 3Q25A 4GOTA 3Q28A 2Z22A 4WKMA 3ONMA 4ZEIA 1B3FA 4ZDMA 1FQDA 1MQJA 2CZLA 3TTRA 1FQAA 4TQUQ 2F97A 3W15C 3QUFA 4R72A 4G68A 4RJZA 4HCYA 3C4MA 2X7PA 4IGRA 4YMBA 2OLBA 3H06B 4ELOA 3PUYE 3M8UA 2F7AA 3CG1A 1B05A 4QSEA 1S7YA 3PUXE 1B32A 1LAHE 1NMUA 5H8FA 3MVXA 2IA4A 4YKIA 5I56A 1BTJA 3S2VA 4QFOA 1FQCA 2Z8DA 1O64A 1D9YA 3LSWA 3ZS6A 1S50A 1NFTA 3DLNA 4H6DA 2FYIA 1UTHA 2REGA 2VP1A 2X26A 1ZJLA 4H67A 5TP9A 4F2OA 3LSXA 2XX7A 3SERA 1QUKA 4NTLA 4YKJA 3H03A 2DXYA 1US5A 2D21A 4NEDA 3W9WA 4MF3A 3T66A 3G3KA 3SEYA 1D3KA 3MUQA 3MPKA 4WXJA 2DWHA 3FXUA 1MPDA 3HCQA 3MP6A 3K01A 5KCJA 3KG2A 3FJ7A 3FVNA 2F7CA 3CI8A 1D4NA 1Y4TA 2ANJA 1PDAA 2NUVA 3M3LA 1IUDA 1MY3A 1R1NA 1SW2A 3V89B 4H65A 2F5XA 5AA4B 4R2FA 4KQPA 2HFBA 4F19A 3PUVE 2V84A 1B2HA 4M1VA 4XKNA 3H3GA 2BJJX 1SW4A 2RC7A 2H9BA 1N76A 1O63A 4O3CA 1MS7A 5F1QA 3K1MA 3K4UA 3THIA 1MH3A 3C34A 3MVYA 1NH8A 1LFIA 1CB6A 2F34A 1AL3A 3OELA 3IJOB 5CMMA 4BLAA 4XTCQ 1A54A 2XXPA 4EQ7A 3FASA 3O6GA 4ESXA 3FATA 4LUBA 2RINA 3PPQA 3HPIA 3E3KA 3O9PA 5EHSA 1A8EA 2ESNA 1N3XA 1N0TA 1YAEA 5H8SA 2I0CA 1B51A 1NKXA 3B7DA 4GF8A 4LONB 3TEPA 3T9VA 4RYAA 1Y20A 4ZECA 4U1ZA 3IL1B 4NWDA 3VXBA 2NXOA 3SETA 3WAFA 3KSJA 3OEKA 4PE5B 2GHBA 2DE2A 1NNTA 5KDTA 3C36A 3H6VA 1Y4CA 5LOMA 4F22A 2QS2A 3VLWA 3SEUA 4DE8A 3VDFA 2YJPA 5I2NA 3MC2A 2XXVA 4LP2B 1SYIA 5EYFA 2Z8FA 1SYHA 1YPNA 1LAXA 4DZ1A 1PB8A 3PMXA 4ND9A 4RA1A 2O1MA 3PUWE 5I59B 4Q8RA 4JWYA 2Y7WA 3T93B 3O28A 4ZEKA 1LBCA 2DWJA 3O2AA 1MXZA 4KD5A 2QSXA 4MLVA 4ZEFA 1AIVA 1N7WA 2QMXA 4U2RA 3TKDA 4R6KA 3EPEA 4IB2A 4ZEDA 4GL8A 1PC3A 3T9XB 1VE4A 1BIYA 2G29A 4XKRA 4HCWA 4OERA 4RY1A 3OO9A 1MQIA 1DPEA 3OOAA 4Q30B 3OXNA 4FORA 2DE3A 1NNFA 3TFLA 1FTMA 2ZYNA 3S9MC 1OIBA 1MPBA 2ONRA 1GTKA 1TFDA 4DCXA 2XXWA 3HSTA 1M5DA 1ZMGA 1JQFA 1TFAA 3PUZE 5FTIA 1MRPA 2XXXA 2OZZA 3RPWA 1DPPA 3RGYA 1AOVA 1NNPA 4F3SA 2RC8A 3OMBA 3C31A 3HHFA 1OLCA 4G77A 1RYOA 5KZTA 3U93A 2XXRA 1EZPA 1FW0A 2O84X 4HW8A 3T22A 2QL3A 3TTMA 3FV2A 4KFQA 4DDDA 2ZYOA 5AA4A 4GXSB 1GVCA 3B6QA 4JWXA 2UXAA 4RXLA 4LQ5A 3RQTA 4U21A 2ZXTA 3CSGA 3DP6A 1JEVA 3ILUB 4OXVA 3IAZA 3MPLA 3RTFB 2I4BA 1II5A 2XX9A 3QIMA 3U94A 4IY6A 4LATA 1J1NA 3VE1B 5CMKA 4TLMB 3SDFA 1USYE 4KPTA 4OEVA 3L6GA 4OYVA 2I49A 3RN8A 3BFTA 3PV0E 2F6GA 4N6PA 3TPAA 3RNNA 4JSOA 4XIGQ 4FATA 2DVZA 3KBRA 4ESWA 4XKPA 3IOTA 2A5SA 4H5GA 3UP9A 1I6AA 4U1OA 1UIUA 3EHUA 3HV1A 2E0SA 3E13X 3OEMA 3MP8A 2HAVA 2Z23A 3H6TA 1A8FA 1HSJA 2THIA 4WEDA 2DWIA 2QS4A 3RUMA 4GWOA 1HSLA 3RTWB 5CRYA 4OFOA 4RPNA 3K6UA 2V3TA 3TCFA 4IO6A 3LR1A 5ITPA 3TODA 3TYHA 4THIA 1B1HA 3SESA 3E4RA 4UACA 1B0LA 1B1XA 1LCFA 2I3WA 1URDA 3USDA 5H8NB 1P1OA 5L9MA 3IO6A 4I1DA 5I59A 1MPCA 4YAHX 1PBPA 4F18A 1B52A 3V5AA 2V3QA 1LFGA 1JVXA 2VHAA 4F3PA 2H25A 1B5IA 2OBGA 5ICTA 3MW0A 1QUIA 4LZ8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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