3CFLA

Crystal structure of the complex formed between c-lobe of bovine lactoferrin and 5-chloro-6'-methyl-3-[4-(methylsulfonyl)phenyl]-2,3'-bipyridine at 2.25 a resolution
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal structure of the complex formed between C-lobe of bovine lactoferrin and 5-chloro-6'-methyl-3-[4-(methylsulfonyl)phenyl]-2,3'-bipyridine at 2.25 A resolution
rcsb
total genus 116
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2008-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cflA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3cflA02
1A8EA 2V3TA 2OWSA 1SW2A 5CMBA 3G3GA 3TCFA 4U4SA 2ONRA 4OERA 4C1TA 5H8QA 1URGA 5IAIA 4G77A 1IEJA 2R6GE 1JVYA 1Q35A 1Q1KA 4OFJA 2H98A 1OVBA 4GLIA 3FUZA 3LSWA 2YJPA 2KLFA 1MDQA 3S9MC 1RYOA 3N6TA 4YU0A 3UIFA 1POY1 1LGBC 4XIGQ 3K0VA 5HBCA 4U21A 1MQJA 1QUJA 2DP8A 5L9MA 3FJMA 2QJEA 1US5A 1GTKA 3D4CA 3G3FA 3K6XA 4G8NA 4EQ9A 2GRVA 5M2VA 2GFEA 1B51A 3G7WA 2HAVA 1WVJA 2XXXA 1MRPA 1XHYA 3KOTA 3E4RA 1SW4A 5TPAA 3TKDA 5FHOA 1HSEA 2QS2A 2QS4A 2DXRA 1B46A 2ZNSA 3HHGA 3IOUA 3E3KA 4PQJA 2BJJX 3KN3A 1IZ1A 2OCUA 2UXAA 4G4PA 4OFLA 1B5JA 2ANJA 1DMBA 1MXUA 5L8DA 5JEIA 2DVZA 2ZNUA 5AA3A 1JNFA 3A3UA 4HTGA 2H4IA 2WKYA 2O84X 5EHMA 4JXIA 2O68A 3O29A 1MM7A 4XXUA 1LAHE 3B6QA 2I6EA 3KZGA 3FZVA 4H65A 3RGYA 4C1UA 3S4UA 3IOWA 1AMFA 2F5XA 4GWOA 3Q28A 5H8NA 3EQ1A 2GHBA 1FTOA 4OMBA 3IL1B 2YPNA 3LUYA 5CBRA 1D4NA 4LZ7A 1Z7ME 3VVDA 3OO6A 5CI5A 1JETA 4NWDA 5DEXA 3QXMA 4K3FA 2O69A 4IY5A 4TOZA 4ZEFA 4F31B 1FQDA 1Y9UA 4BLAA 5I2KA 2DSFA 1IIWA 1B3HA 5JTYA 1LFGA 4EXKA 4UA8A 1B3EA 1FW0A 4OENA 4P0GA 1PB7A 4AB6A 2A5SA 3H7MA 1ZJLA 3O6IA 1H3DA 1JVXA 2DE3A 1RYXA 1QJMA 1MY1A 1OLCA 3T9UA 1DOTA 4F1UA 1NNKA 4E0WA 2XXYA 5H8HB 2Z8EA 2W7YA 1USYH 2P2AA 4X9TA 3T9XB 3OSQA 5I59A 1ZU0A 1A54A 2VD2A 3MPKA 3RPWA 2NXOA 1ZTYA 4NF8B 4GXSB 4GL0A 3OO9A 1MXYA 4XKRA 3VLVA 1M5CA 2DS9A 3DELB 5I56A 1JEVA 1MY4A 3RUMA 2DWIA 1J1NA 5B7DA 1N7WA 2F7CA 1SYHA 4H5GA 5ISUA 4EF2A 4F1VA 4OQOA 2Q9TA 3FVNA 2DWHA 3GBAA 1LAGE 4H5FA 1DPEA 4DLDA 4ONYA 1UTHB 2F34A 2F35A 2XXWA 5KDTA 4O3CA 1P1WA 4FE8A 1RKMA 4G68B 4IY6A 3A09A 4Z0IA 5CMCA 1FTJA 1DPPA 4F3BA 1ATGA 3N6UA 4NMYA 5EYFA 4IB2A 2X7PA 1B32A 3IAZA 4QHQA 3K6UA 3PGFA 3SEXA 3TQLA 5H8FA 1ANFA 1QUKA 3V89B 1FTLA 1B05A 1N76A 2HQ0A 2RCAA 4GVOA 4IO2A 2XHDA 3JZJA 5F1QA 1HSLA 3FXRA 1N84A 2XXIA 3SEYA 1NMUA 5AA4A 4N6PA 3G3KA 1IXGA 1SBPA 4LQ2A 1Z7NE 2PBWA 2RC9A 2H9BA 3ODBA 4ECFA 1XVYA 2O6AA 3VDFA 4GF8A 3UP9A 3MUQA 1SQYA 1NH7A 1B7ZA 3TTRA 3RY3A 2VOZA 1OLAA 2XXVA 4BDLA 4KCDA 4MLVA 4OWDA 4HW8A 3TDJA 3IO4A 4R75A 2H25A 1B1HA 1MY0A 2DE4A 3RNNA 4PP0A 1IXCA 3KEIA 2CMOA 1SYIA 3OOAA 3EHSA 2HXWA 4YB6A 3TAJA 5AE4A 2OJTA 2QSXA 4HCWA 4OEUA 3TZAA 1FQCA 4OZ9A 3GLBA 2Z8DA 4QFLA 1B5IA 4F19A 1MPDA 3GZGA 3EF7A 1MXVA 3I3VA 1JW4A 2DQVA 3V5AA 2DYXA 2REJA 3FVGA 2G29A 5I57B 1LFHA 4N13A 2VHAA 2UYFA 3PPNA 1O64A 4I62A 5I58A 1MPBA 3B6TA 2HAUA 1MQDA 3MVXA 4ZEDA 2XX8A 4XKPA 2Q8JA 1KWHA 4AQ4A 1FQAA 1ZMGA 1I69A 4H6DA 1LBBA 4GL8A 1N3XA 1B7UA 4QFNA 4JWXA 3U72A 2ESNA 3MVZA 1SVXB 3N94A 2R71A 4G2ZA 3F11A 4OYVA 1ZBMA 1CB6A 2GHAA 4LA9A 1HSJA 3WAFA 1P1OA 3MZ9A 2HEUA 4ISUA 1AH5A 2V3QA 3KFMA 3HV1A 4U22A 4I1DA 3S9EA 3EHTA 1B40A 4R72A 1OMPA 4P0IA 3CFZA 1R9QA 3ONMA 4OXVA 2E0SA 3T93B 3UK4A 4POXA 2ZXTA 2XXTA 1MG1A 3K1PA 4HS7A 4ESWA 2XX9A 3N5LA 1IQ7A 2F7AA 3O2AA 1AOVA 3PD9A 4MLQA 2FYIA 3MPLA 1NL5A 4IO3A 1N0TA 5I2NB 3H6WA 1B5HA 3IB2A 2F6GA 1Y3PA 1Y4CA 3HSTA 2ABHA 3K01A 1XOCA 3PU5A 3LBSA 3QUJA 5FTHA 3PMVA 3K4UA 1PDAA 3JV9A 3L6GA 3H6VA 2DXYA 2E1SA 4KCCA 2NVUB 3THIA 4DCYA 2D3IA 1B4ZA 2QPQA 2XXPA 1BKAA 4OFOA 3KG2A 3S9NC 3K02A 4JDFA 5A5XB 3C31A 4OETA 2FNCA 3ZS6A 3BFTA 3IOTA 3CG1A 1A55A 1L5TA 3KN8A 3PUYE 1MS7A 1VE4A 3OEKA 4POWA 4ZEIA 3U8QA 4F3PA 1PBPA 3UGWA 3PUZE 4QFKA 3V8XB 3TCHA 3TFLA 1EZ9A 3OO7A 3CIJA 4KD5A 2GH9A 1D9YA 1II5A 4KHZE 3DM0A 3TPAA 3OENA 1TWYA 1H45A 4UACA 3IB1A 3TTMA 4NWCA 3CSGA 3CI8A 3GXAA 1NH8A 3UA8A 4LP2B 5FTIA 1R1NA 3R6UA 2RC8A 2HFBA 5DT6A 3MJNA 3RQTA 2PMSA 3PPQA 4DXUA 3PPPA 1TXFA 5KZTA 1A99A 4NF8A 4Z7EA 2VP1A 5FHMA 3B6WA 3M8UA 4BDOA 3ILTB 4XKNA 1ZIUA 3OO8A 4KR5A 1A7LA 2OZZA 3IJOB 2RINA 1LLSA 2VD3A 3H06B 2F6PA 3LC8A 4ZE9A 1I6AA 3D4GA 2M8CA 2ALUA 3LSFB 1R9LA 4E0XA 1B6HA 3UORA 5BWJA 3QK6A 1UTHA 4I8CA 1CE2A 1QKBA 5TP9B 3Q25A 4ZEKA 3KOSA 1S9TA 4G68A 4NF5B 2PT2A 2O7IA 3BBRA 3VE1B 3FD3A 4MBPA 2UVGA 1FTMA 4YZZA 1LCFA 4ELRA 4ZZAA 3IR1A 2NWJA 4H8IA 4NTLA 5B70A 1MH4A 3M3LA 1M5BA 3OELA 3G3IA 1M5EA 1YCJA 1LAFE 1N04A 2Z22A 1PEBA 2LAOA 3ZKKA 1AL3A 3CFXA 2Q88A 3MWBA 1A40A 1FCKA 2V84A 3R7XA 2F97A 5DVJA 1JQFA 5HM4B 4Q5TA 1PC3A 4F2OA 3CRBA 4HCYA 1TFDA 1B52A 3L6HA 2DWJA 3CSBA 2Z23A 1P99A 3IB0A 4MFIA 5DYHA 5CRYA 1UTBB 2FA7A 4R6YA 5AA2B 4GD5A 4M4GA 3G3HA 3WAEA 1MQIA 4GFRA 4ZZEA 3MQ9A 4FEBA 1B9JA 2F78A 3DP6A 2B65A 4LVQA 2AYSA 4R2BA 3VLWA 1BTJA 1MY2A 3K2DA 4R6KA 2I49A 4X1BA 4RNSA 4PE5B 2XXQA 1WDNA 2I4BA 3SDFA 4PETA 1VSOA 1NFTA 2I58A 5CMMA 1B0HA 3S2VA 4LZ5A 4R74A 3W15C 3G3JA 4IO7A 2ONSA 4FATA 2I0BA 4WXJA 3C34A 4OTEA 4DZ1A 4QSEA 5J1DA 1UIUA 4DE8A 2XXRA 2QL3A 3CFLA 4ELOA 3C33A 4EQBA 4FORA 4ELQA 3T96B 1S50A 5I57A 3PMXA 4DIGA 4P11A 4N07A 3KGCA 2QRYA 4YAHX 4WEDA 3QAXA 3TYHA 3O6GA 3FXUA 2X26A 4GXAA 2XX7A 5DVIA 3BFUA 1NNTA 3MZBA 4TLLB 3KSXA 4LZ8A 1GR2A 2PX1A 4H0WA 2ZMBA 1LFIA 3LSLA 3HHFA 4O3BA 5CM6A 1USYE 4NF6B 2F36A 4KQPA 3EPEA 2PYYA 2A5TB 1MY3A 3B7DA 1URSA 4OESA 2QS1A 1BLFA 2Y7PA 3O9PA 2H5YA 4YKKA 3TEPA 3SEUA 3TCGA 4R6HA 3IOVA 1UQWA 3DP8A 2I3VA 4NF4B 3TMGA 2AL5A 4JSOA 3K00A 3K6WA 1SW1A 3C4MA 3RTFB 4IGRA 1M5DA 4EF1A 4ZECA 4H1XA 2OK2A 1B58A 2B3BA 1P1NA 2O7UA 3PPOA 3TTNA 4NEDA 4M1VA 2UVJA 3TTKA 2DWAA 1SI1A 1LSTA 4IO4A 1EZOA 4BDQA 4DCXA 3MP8A 1FTKA 1IUDA 5LOMA 5I2NA 2THIA 2CZLA 4FIMA 4RA1A 5KCJB 3PMWA 2G93A 3RN8A 2AIXA 3RT8A 3H6TA 2R9JA 2RCBA 2O1LA 4Q30B 4FEDA 3FV2A 2B3FA 2OBGA 3W9WA 3Q27A 2Q89A 4Q0CA 5ITPA 5ELVA 4EDPA 3OEMA 2AL4A 3KSJA 4IO6A 1H43A 1O63A 4ELPA 1SW5A 4GIZA 5TU0A 3M3KA 4EUOA 4QSCA 1R6ZA 2Z8FA 2HZKA 3MW0A 3PUVE 3SKPA 1D3KA 5A5XA 4RPNA 1PB8A 1NNFA 3QUFA 3VXBA 3RT6B 2UVIA 4H67A 5L9SA 3C35A 1N7XA 3MVWA 4MF3A 3TQWA 2Y7KA 2Q2CA 4GRKA 4KYSA 2QMXA 1QW0A 5DTBA 4KPTA 1MPCA 4JWYA 1EZPA 3H4ZA 1M5FA 1JW1A 3FXQA 1QUIA 1B3LA 3LSXA 3VXCA 1Y3QA 3HN0A 3HO7A 3PUXE 1B3FA 4OEVA 3SETA 4MH5A 1QKAA 2QMWA 4IO5A 1T0KA 3KN7A 3EN3A 4KFQA 3ECRA 5H8QB 4XKQA 2IA4A 2UYEA 2ZYOA 3P7IA 4F22A 1BIYA 1TFAA 3DLNA 4F3GA 4TLMB 4X48A 3W9VA 4C0RA 3QSLA 2I4CA 4DDDA 5AA1A 2V93A 1BP5A 1OVTA 3FJGA 1JEUA 4RXLA 4R9FA 4AB5A 1VR5A 5K2YA 1B2HA 3QYTA 4QFPA 3ILUB 4Q8RA 3KJ7A 1FQFA 2XD2A 3T22A 2V25A 2IEEA 4F3SA 2DOJA 4NE4A 4OVJA 5L9OA 5TP9A 5H8HA 1GGGA 4YB5A 2HZLA 5EHSA 4YMBA 4NF5A 3AXFA 5TPAB 4PFYA 2OLBA 1Y3NA 3RTWB 3CR9A 3FGSA 3I6VA 1D9VA 3O28A 4ZS9A 3PUWE 3I5OA 3V83A 2O1MA 4ESXA 1F9BA 2ZYKA 4LATA 1B7HA 3CVGA 3JYRA 1NKXA 2RKMA 5CC2A 1FQEA 4JBZA 4QSDA 2O51A 2RF1A 2Y7RA 1XVXA 2H99A 1IXIA 4O3AA 3R26A 3O6HA 2XD3A 1MH3A 2ZNTA 1S7YA 4L17A 5AA2D 3FVOA 4U1ZA 1VFEA 1EU8A 1UTBA 1WODA 5AA2A 4LONB 4BDMA 2Y7WA 3E13X 3EHUA 3USDA 5H8NB 1MXXA 3OSRA 3HCQA 3SEWA 4FAJA 2X7QA 3IORA 3O66A 1IITA 3T66A 1MQHA 1EH3A 3MZ1A 4BDNA 5DEXB 4TQUQ 1URDA 2ZYMA 2Y7IA 1SDXA 5BUUA 1POTA 3VFJA 5I2KB 3IJXB 3Q26A 1UIVA 3VVFA 3RLFE 4LQ5A 3PPRA 3PD8A 5ICQA 3TELA 3KJTA 1AIVA 2XXUA 3IX1A 1JW5A 1OIBA 3ZKLA 5JTYB 3E9XA 2REGA 4XTCQ 1MXWA 4GQOA 3U1OA 2I48A 2I0CA 4YB7A 4RK2A 3UN6A 4F2QA 1LAXA 3K1NA 2OWTA 5F7VA 3U93A 1Y1ZA 3KBRA 4RK9A 1P1QA 3OD7A 4KYEA 4KI0E 3CG3A 1H44A 3FVKA 4YICA 2PT1A 4ND9A 3LR1A 3TODA 2UVHA 3K1MA 5I59B 5JK4A 5H8SA 1Y20A 4RYAA 4WEPA 2P0SA 1LCTA 2PVUA 3FIRA 1SI0A 1OQGA 4F29A 1MQGA 1LB9A 1MM6A 1B0LA 4F39A 2F8DA 3SESA 2ZYNA 4ZDMA 4ZEBA 1YPNA 4G68C 3M3FA 5I56B 1B1XA 2VGQA 1LB8A 1B3GA 3N26A 4THIA 2D5WA 4JWOA 2F7BA 4NF6A 3H03A 1PB9A 2RC7A 5HPQA 2A5TA 3OXNA 4YKPA 3U92A 1H76A 3FJ7A 3PV0E 4EXLA 1YAEA 4U4XA 4FECA 1A8FA 5KDTB 3T9VA 4G8MA 2ONKE 1GVCA 3VLUA 4DXBA 4NF4A 4RPOA 1XC1A 3U94A 4R2FA 3FATA 3H6UA 4F1YA 4QFOA 4U23A 2Q2AA 3DP4A 4PFTA 4RJZA 3C32A 4JB7A 3T9HB 2DVCA 4PFUA 3VV5A 5DVFA 5H8FB 3IO6A 1VFDA 1LBCA 4WKMA 1US4A 1IXHA 3C9HA 4U2RA 4G8HA 2XXHA 4QF9A 5ICTA 3SEVA 3BKIB 4GOTA 1MDP1 3Q29A 4H8JA 1ZLQA 3QIMA 2NUVA 1N3WA 3OMBA 1DSNA 2D21A 3FASA 2DE2A 5KCJA 5I84A 1ZKBA 5AA4B 2HCAA 1O7TA 4KYDA 1TT1A 2Y84A 3K6VA 4U1OA 3GBBA 3O97A 4FJPA 1I6QA 3A3CA 1PBQA 4YMAA 1YTVA 5ITOA 4F18A 5CMKA 4RY1A 5IKBA 4YKJA 1GV8A 5CBSA 3MVYA 2YLNA 4R9GA 3MC2A 3ZSFA 1P1UA 4EQ7A 3SERA 2P1SA 3TUSA 1NNPA 4IGTA 4OHNA 4I9DA 3TTLA 4X1DA 1B4HA 1FQBA 4LUBA 3MBPA 4JSDA 2NOOA 1QVSA 1Y4TA 1I6BA 3IK6B 1MXZA 1XS5A 1Y1MA 4ZE8A 4YKIA 4BDRA 3H3GA 2QS3A 3S9LC 3C36A 3FV1A 2V3UA 1QULA 1OQHA 5FHNA 2I3WA 4DXCA 1SD3A 5K2XA 1ELJA 3VVEA 3MAMA 3MP6A 1XT8A 4QRZA 1DTGA 3HPIA 4PFWA 1DTZA 3MP1A 5I58B 4R73A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1A8EA 2V3TA 4O7IA 2XA5A 1NUZA 3B8BA 2WEFA 2OWSA 1SW2A 5CMBA 3G3GA 3RPLB 3TCFA 4U4SA 2ONRA 4OERA 4C1TA 5H8QA 1URGA 4N6KA 5IAIA 1DCUA 4G77A 5IZ3B 1IEJA 2R6GE 2VPNA 1JVYA 1Q35A 1Q1KA 4OFJA 2H98A 1OVBA 3T1BA 4GLIA 3FUZA 3LSWA 2YJPA 2KLFA 2B4LA 1MDQA 3S9MC 1RYOA 3N6TA 4YU0A 3UIFA 1POY1 4OA4A 1LGBC 4XIGQ 3K0VA 5HBCA 4U21A 1MQJA 1NV5A 1QUJA 2DP8A 5L9MA 3FJMA 4DI4B 2QJEA 1US5A 1GTKA 3D4CA 3G3FA 3K6XA 4G8NA 4EQ9A 2GRVA 5M2VA 2GFEA 1B51A 3G7WA 2HAVA 1WVJA 2XXXA 1LEVA 1MRPA 1XHYA 3KOTA 3E4RA 1SW4A 5TPAA 3TKDA 5FHOA 2CZHA 1HSEA 2QS2A 2QS4A 2DXRA 1B46A 2ZNSA 3HHGA 3IOUA 3E3KA 4PQJA 2BJJX 3KN3A 1IZ1A 2OCUA 2UXAA 4G4PA 4OFLA 1B5JA 2ANJA 1DMBA 1MXUA 4GX6A 5L8DA 5JEIA 2DVZA 2ZNUA 5AA3A 1JNFA 3A3UA 4HTGA 4HE2A 4I3YA 2H4IA 2WKYA 2FBPA 1FPJA 2O84X 5EHMA 4JXIA 2O68A 3O29A 1MM7A 4XXUA 1LAHE 3B6QA 2I6EA 3KZGA 5DW8A 3FZVA 4H65A 3RGYA 4N17A 4C1UA 3E78A 3S4UA 3IOWA 3FBPA 1FBEA 1AMFA 2FIXA 2F5XA 5LDZA 5ET8A 4GWOA 3Q28A 5H8NA 3EQ1A 2GHBA 3A29A 1FTOA 4OMBA 3IL1B 2YPNA 3LUYA 5CBRA 1D4NA 4LZ7A 1Z7ME 3VVDA 3OO6A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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