2ZNUA

Crystal structure of the ligand-binding core of the human ionotropic glutamate receptor, glur5, in complex with a novel selective agonist, neodysiherbaine a
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
b'ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2znuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2znuA02
1N84A 3O9PA 4PFTA 4NF8B 5ICQA 1A8EA 4UA8A 4GQOA 3FXRA 1KWHA 4IGTA 5KCJA 2ZYNA 1WDNA 5CI5A 4ZZAA 3BKIB 3PD8A 4R74A 2F7BA 3VVDA 3S9MC 1M5EA 1LAGE 4RJZA 1B2HA 3QAXA 3FVNA 1CB6A 4OXVA 2V3TA 2KLFA 3KG2A 1YPNA 2O7UA 3KBRA 1ATGA 1R6ZA 2R6GE 2RINA 3VDFA 5H8NB 3VLVA 2QSXA 3IB0A 1UTBA 3BFTA 4XKNA 5AE4A 3VE1B 1N04A 4R73A 2OK2A 2Y7RA 3EPEA 4F3PA 5J1DA 5CBRA 3OSRA 4KCCA 1AIVA 3CSBA 2DQVA 2P0SA 3B7DA 2ZYOA 2Y7WA 2F7CA 3CFZA 2XXRA 1POTA 2OLBA 1D4NA 1DOTA 4R2BA 3VV5A 2ESNA 1T0KA 4IO6A 4N13A 1PBPA 3LSLA 3E3KA 1JNFA 1MQJA 3PUWE 4ESXA 3ODBA 4DCYA 3SEWA 3CG3A 3CSGA 4OERA 2AIXA 4G2ZA 4MLVA 4YB7A 4OEUA 4WXJA 4EQ9A 4ELRA 2DE4A 1EZOA 4G68C 1US5A 5KDTA 4GLIA 1FTJA 1MH3A 1SQYA 3OO8A 1SI0A 3UK4A 3MJNA 4YKPA 4ECFA 3L6GA 2UYEA 3SETA 3TTNA 1M5BA 1VSOA 1Y9UA 1B5IA 2QRYA 4OENA 3SESA 2DXRA 2YPNA 5FHNA 4JXIA 1LSTA 1JW5A 1XOCA 4GXSB 2PT1A 3LSFB 1I6AA 1B40A 3V5AA 1FQCA 1LAXA 1MPBA 4QF9A 4PFYA 4NF6B 1LLSA 3KEIA 3M3FA 4FE8A 3RLFE 2V3QA 3HN0A 1FQBA 1IXHA 3R7XA 3OD7A 5H8FA 3KOSA 3IAZA 3OOAA 4RNSA 4F1YA 5EHMA 1ZLQA 1B5JA 2D21A 1A54A 3KJ7A 3LSXA 4H8IA 3D4CA 5I2KB 2O84X 3FXQA 1URDA 4YB6A 3TZAA 1MXZA 3SKPA 1B51A 1Z7ME 3PMVA 2RC7A 2I0CA 3USDA 1GGGA 3Q28A 2O7IA 3O66A 1IUDA 3SEYA 1Y3QA 5AA1A 2ZNUA 4XIGQ 4F39A 3SEVA 4F1VA 4RK2A 3SDFA 3B6WA 1P1WA 2GHBA 4H0WA 5DTBA 4HCYA 1AH5A 3K6XA 4QRZA 3MPLA 2XHDA 1A8FA 1HSJA 4HTGA 4U23A 3KN7A 2W7YA 1LFGA 1FCKA 2XXXA 2PMSA 1D3KA 4G77A 1FTMA 3CRBA 3B6TA 1N7WA 4IY5A 4XKRA 4DZ1A 1NH7A 3MZ9A 1QULA 3N94A 2QMXA 3OENA 1N3XA 3CVGA 4G8HA 1MH4A 1PBQA 3SERA 3RUMA 2D5WA 2VP1A 4GVOA 4QFLA 1S7YA 5FTIA 4LZ5A 5CM6A 3MVZA 1ZMGA 4DXCA 4JSOA 2ZNTA 4I9DA 4JSDA 1MQHA 1XT8A 4HCWA 1UTHB 3W15C 5L9SA 4GL8A 4X48A 5KZTA 2REJA 5H8QA 3K1MA 3I5OA 1I6BA 5HBCA 3VXCA 1BLFA 5A5XA 5FHOA 4NF5B 4ND9A 1IXGA 1LFIA 5I59B 2XX8A 3K0VA 2PT2A 2DWHA 1JVXA 3A3CA 1MXUA 3VLUA 3RT8A 4POWA 2I4CA 3T93B 4EQBA 2CZLA 3IO6A 1XVXA 3K1NA 2X7PA 1NL5A 4JWOA 3MC2A 3IOVA 2Q9TA 1P99A 5EYFA 1QUIA 5I56B 4Q30B 3F11A 3FATA 3QSLA 1M5FA 3RGYA 3FIRA 3TKDA 1XC1A 1LAHE 3PPPA 3HPIA 1H3DA 4FEDA 2PBWA 1MRPA 1SW5A 2XXWA 1B9JA 1MQDA 3IL1B 2WKYA 1BKAA 4O3BA 1ZKBA 3RQTA 4KYEA 2OWTA 4GRKA 5CBSA 3CIJA 4KYSA 2XXIA 4ZECA 1MY2A 2DP8A 3CG1A 5I2NB 3KN8A 3LC8A 4QHQA 1JVYA 4OFLA 4IGRA 4P0IA 1USYE 4YMAA 1O63A 4X9TA 4BDMA 3I6VA 3TDJA 3MZBA 4IB2A 3TMGA 3PV0E 2ZYMA 2A5TB 4R75A 4RPOA 4C1TA 2Z23A 1IXIA 4HS7A 2XXVA 3MWBA 3C34A 3EN3A 1DTGA 3MP8A 4X1BA 2HCAA 3OMBA 3FJ7A 2UXAA 3TAJA 3O29A 1AMFA 2D3IA 4E0XA 3ILUB 2O1MA 3KZGA 2ONKE 4AB6A 2V3UA 4LQ5A 3TTKA 3K00A 1B5HA 4QSCA 5TPAA 3Q29A 1B3EA 2RF1A 3C35A 2YLNA 5H8HA 3S9EA 3UP9A 3QXMA 4Q8RA 5CMKA 3HV1A 4KPTA 3C32A 1NMUA 3TUSA 4G68B 1H45A 4U21A 2VGQA 3N26A 2V25A 2F97A 2RCAA 1OVTA 5EHSA 1HSLA 4UACA 4TLLB 5I58B 4XKQA 4ESWA 2OCUA 1FTOA 1F9BA 1ELJA 3FVKA 1SBPA 2F7AA 4IO7A 3TQWA 2QL3A 1MPDA 3G3JA 1IZ1A 1SVXB 3HHGA 1NNKA 2Z8DA 4P0GA 1FQEA 4ONYA 1SYIA 3FXUA 4EXLA 4H6DA 1B0HA 3WAFA 4Q5TA 4RXLA 3EHUA 3GBAA 1MXYA 1QUJA 2FA7A 3RT6B 5CC2A 1FTLA 3KOTA 2G29A 4FAJA 1PB8A 5FTHA 1GR2A 2B65A 3FASA 2X7QA 3ZS6A 1R9LA 4QSDA 4AB5A 3E13X 2DSFA 3O2AA 1MPCA 3M3LA 1WVJA 1NH8A 4DIGA 2XXPA 1B32A 2DE2A 1ZIUA 3PUZE 2LAOA 1DSNA 3PUXE 3H6TA 4YKKA 3P7IA 3TFLA 2PYYA 4JDFA 3HCQA 4MFIA 3C9HA 3S9NC 1MQIA 5KCJB 2QS1A 2I0BA 1OMPA 4QSEA 2GRVA 2H5YA 2R71A 1B3FA 1R9QA 4LP2B 3PUVE 1P1QA 3E9XA 1ZBMA 4ZEBA 1OLAA 4F2QA 2NVUB 5L9MA 3IO4A 4EXKA 2GH9A 3O6GA 4THIA 3ILTB 2Y7IA 3N6UA 5TP9B 1B58A 3LSWA 3PPNA 4QFNA 3O97A 2XXQA 3FD3A 2THIA 4ZE8A 4QFKA 3IB1A 3KGCA 3SEXA 4KR5A 3CFLA 1B7ZA 4OFOA 5CMMA 4OMBA 3WAEA 1OVBA 4PFWA 3CFXA 3OSQA 1Y1MA 3VLWA 3RTFB 4FATA 2QPQA 3HSTA 1LFHA 4OESA 1SYHA 4KHZE 1GV8A 2I6EA 1B6HA 3U94A 3T9VA 4OFJA 3H6VA 4DE8A 4G8MA 1B7UA 4OTEA 1L5TA 1S50A 1UQWA 1B52A 3L6HA 3W9WA 2H9BA 4DCXA 4I62A 1SDXA 5KDTB 5L8DA 1QVSA 1USYH 3JZJA 1BP5A 2HXWA 5B70A 4KQPA 3UN6A 4OZ9A 2V84A 1ZU0A 4FECA 3FV1A 1QKBA 4DXBA 3FJMA 4AQ4A 2H99A 4YICA 1TFDA 4R2FA 3VFJA 4LVQA 3U1OA 4DLDA 4RY1A 1UIVA 1QUKA 2VD2A 5AA4A 1R1NA 3QUFA 1LAFE 1N76A 1IQ7A 2REGA 4XXUA 3TQLA 4IY6A 2E1SA 4BDNA 4F22A 3U8QA 3PU5A 3TCFA 4ZEIA 1SW4A 4YU0A 1EU8A 1ZJLA 1RYOA 1UIUA 1TT1A 2I3VA 2UVIA 3HO7A 2AL5A 3TTMA 1VFEA 3DP8A 5M2VA 4IO3A 1XVYA 1IIWA 3S2VA 1LCFA 3N6TA 3ONMA 1N0TA 2DVZA 4FORA 3D4GA 1MXWA 3MUQA 3U93A 3K6VA 1WODA 3CR9A 1H44A 3HHFA 5I56A 2XX9A 4FEBA 4F18A 1DPPA 3LBSA 3H03A 1ANFA 4PP0A 1MDQA 4MLQA 3AXFA 2A5SA 3KSJA 4IO2A 4ELOA 2H98A 2X26A 1XS5A 3MP6A 1NKXA 2RC9A 3FZVA 5JTYB 1SD3A 3Q27A 3PPOA 3U92A 4H5GA 1B7HA 3PPQA 3UIFA 2O1LA 2Q89A 2B3BA 2NUVA 1IITA 2QS2A 2ZYKA 5AA2B 1OLCA 4YZZA 5DEXB 5BWJA 3G7WA 4JBZA 4NWCA 3FV2A 3K01A 3EHTA 4PFUA 4N6PA 2UVGA 3OO7A 3MVYA 4GWOA 3T66A 3QUJA 3UGWA 4NF4A 1IEJA 1FQDA 5A5XB 3E4RA 1H43A 3IJXB 4WEPA 5ITPA 3Q25A 1II5A 3EQ1A 3I3VA 2I58A 4NWDA 4H67A 3IB2A 3IOTA 4BDLA 5I84A 1MM6A 1FW0A 4OHNA 4ZDMA 5ISUA 1SW2A 3TYHA 1B05A 4R9GA 1B4ZA 3DM0A 2XXTA 4POXA 5DVJA 4OYVA 3C31A 3FVOA 3RPWA 4NEDA 5I57A 3LUYA 5IAIA 1MXXA 3PPRA 1LBBA 1Z7NE 2PVUA 1B3GA 2OZZA 3O6IA 4OWDA 4TLMB 2I49A 4YMBA 2UVHA 1MY1A 3DLNA 3V8XB 3MVXA 3PMXA 3JYRA 4LUBA 3PMWA 4YKIA 1A7LA 2P1SA 2DOJA 4GL0A 2HEUA 4L17A 3THIA 2ANJA 1BIYA 4LA9A 2ONSA 5HM4B 3KSXA 4OETA 1MG1A 4OEVA 2DS9A 3Q26A 2F6GA 4ELQA 1B4HA 3MP1A 3G3FA 4NF8A 3W9VA 1A55A 4R9FA 3FGSA 1AL3A 4DXUA 2OBGA 2Q2AA 5DYHA 2F78A 2XD2A 3OO9A 1Q1KA 2H25A 1O64A 2V93A 1FTKA 5L9OA 3OO6A 2XX7A 1NFTA 4C1UA 1XHYA 4MF3A 3S9LC 3H4ZA 1O7TA 1Y20A 3QK6A 2P2AA 3V83A 4YAHX 4G8NA 3GXAA 5H8NA 1PC3A 3MVWA 1H76A 3RNNA 3G3HA 3PGFA 1DPEA 4E0WA 2F35A 1QJMA 3IX1A 4KYDA 1BTJA 2Q8JA 2RKMA 5TPAB 3VVFA 3IR1A 1RYXA 4YB5A 3MQ9A 5H8HB 2I3WA 2DYXA 1US4A 4MBPA 4U2RA 3IJOB 4IO4A 1B3HA 4PQJA 1P1UA 3K02A 2O69A 2E0SA 1MM7A 2GFEA 3T9XB 5JK4A 1Y3NA 3A09A 3QYTA 1JQFA 1OQGA 3IK6B 2F8DA 1LBCA 4BDOA 5DVIA 3V89B 4F29A 4EF2A 5LOMA 2XXYA 2XXHA 2OJTA 3TCHA 4XKPA 5TP9A 4QFOA 2HAUA 4P11A 4FJPA 4NTLA 4ZEKA 1MDP1 3SEUA 4I1DA 4ELPA 1B1XA 1Y4CA 2DWAA 1URSA 4NE4A 4U1OA 4U4XA 4F3BA 1M5CA 1VR5A 4EF1A 1MXVA 3DP6A 1LB9A 3C36A 4QFPA 2G93A 3T22A 3H06B 4GXAA 4H8JA 3H6UA 3DP4A 4R6KA 4U4SA 5CMCA 5F1QA 1UTBB 4NF6A 5ITOA 2O6AA 1A99A 1NNFA 1I6QA 5DVFA 4KCDA 2ZXTA 3IOUA 4BLAA 4ZE9A 1VFDA 3K2DA 4TOZA 4WKMA 3ZSFA 1RKMA 2R9JA 5CMBA 1TXFA 4H65A 4JWYA 5FHMA 1QKAA 2I4BA 1JEUA 4I8CA 2F6PA 2O51A 5I2KA 1SW1A 1Y3PA 2F5XA 2ONRA 5B7DA 4LZ7A 3FJGA 2YJPA 5TU0A 3VVEA 4LATA 2DE3A 3KFMA 1JETA 2Z8EA 1PEBA 1A40A 3M3KA 3G3IA 2DXYA 4GOTA 2O68A 3MZ1A 2HZKA 3MPKA 3RN8A 1N3WA 2BJJX 2FNCA 1HSEA 2B3FA 2DWJA 2Q88A 4BDRA 2NXOA 4X1DA 1M5DA 1LCTA 3GZGA 2ABHA 4F2OA 3TEPA 1MY4A 1OQHA 1LB8A 3G3KA 2OWSA 1PB7A 1I69A 4LQ2A 5F7VA 1JW1A 2ALUA 3O28A 2QS3A 5BUUA 4IO5A 4F19A 2NOOA 4FIMA 2FYIA 4NMYA 1P1NA 4ZEFA 1ZTYA 3TODA 1NNTA 3A3UA 5IKBA 3T9HB 3IORA 2VD3A 3JV9A 4RYAA 3PD9A 5H8FB 2HQ0A 5JEIA 3TCGA 2RCBA 1UTHA 2GHAA 3U72A 3BBRA 1YCJA 1EZ9A 3K1PA 2XXUA 4O3CA 1MS7A 1IXCA 4NF5A 4KD5A 2VHAA 2Q2CA 5K2YA 4GFRA 3R26A 5I59A 1DMBA 1PB9A 3M8UA 1D9YA 3C4MA 1SI1A 1B1HA 3BFUA 3TPAA 2Y7KA 4F31B 2HZLA 5JTYA 4KI0E 4K3FA 3K6WA 3K6UA 1DTZA 5AA4B 3FVGA 5HPQA 5AA2A 1OIBA 1NNPA 5DEXA 4GIZA 3TTRA 2QS4A 2H4IA 2QJEA 4EQ7A 2AL4A 1FQAA 3TELA 1VE4A 1URGA 5ELVA 3H6WA 3KJTA 3H3GA 1P1OA 2XD3A 1Q35A 3OEKA 2I48A 3DELB 4OVJA 3G3GA 4GD5A 4U1ZA 1Y4TA 4PE5B 5AA3A 4G4PA 2QMWA 1JW4A 4PETA 1N7XA 3RTWB 5I2NA 1YAEA 2F36A 1B0LA 3FUZA 4ZZEA 3KN3A 4MH5A 2IEEA 5H8QB 4Z7EA 3N5LA 2VOZA 3H7MA 2NWJA 2Y84A 4RK9A 1Y1ZA 2A5TA 2Y7PA 3GLBA 3EF7A 2ZNSA 4U22A 4EDPA 1B3LA 1GTKA 4Z0IA 4O3AA 2IA4A 5DT6A 4F1UA 4M1VA 2DWIA 3MAMA 3T9UA 3CI8A 3TTLA 4YKJA 1EH3A 3MW0A 4F3GA 3O6HA 4R6YA 1TFAA 1MY3A 3T96B 1J1NA 1PDAA 3OEMA 5H8SA 2CMOA 4R6HA 1FQFA 2Z8FA 4WEDA 4G68A 2AYSA 5K2XA 3GBBA 4LONB 1YTVA 3UORA 4NF4B 5CRYA 5ICTA 1JEVA 4JB7A 1CE2A 1AOVA 4HW8A 1S9TA 3ECRA 1QW0A 2F34A 4EUOA 5I58A 2ZMBA 3LR1A 4N07A 1MY0A 2HFBA 4C0RA 3VXBA 3ZKKA 1MQGA 2PX1A 2Z22A 4BDQA 2M8CA 4XTCQ 4RA1A 3C33A 2UVJA 4DDDA 4ISUA 3OXNA 3PUYE 4JWXA 3QIMA 4H1XA 4Q0CA 3B6QA 3K4UA 2UYFA 3R6UA 3RY3A 5I57B 1EZPA 1POY1 1LGBC 2HAVA 5AA2D 4ZEDA 3ZKLA 4R72A 3OELA 3S4UA 4TQUQ 1B46A 4M4GA 3MBPA 4KFQA 1D9VA 2RC8A 3UA8A 4H5FA 4F3SA 2DVCA 3EHSA 4ZS9A 1TWYA 3IOWA 1GVCA 4GF8A 4OQOA 4RPNA 4LZ8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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