2ZNUA

Crystal structure of the ligand-binding core of the human ionotropic glutamate receptor, glur5, in complex with a novel selective agonist, neodysiherbaine a
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2znuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2znuA02
1DPEA 3CSBA 1GGGA 5DTBA 1B05A 4R73A 4JWOA 1ZTYA 4POXA 3S9EA 3RGYA 3PPOA 5EHMA 3L6GA 1H3DA 1SI0A 2O69A 4OFJA 2R6GE 5L9OA 2D5WA 2VD2A 3FJGA 3AXFA 4RYAA 2X7PA 3WAEA 1JETA 3CFXA 2O7UA 3FVNA 3FJMA 3IJXB 3LSLA 2UYFA 3EPEA 4Q8RA 2OZZA 5DT6A 3MC2A 4ZE8A 3CG1A 3PGFA 4EQ7A 2DXYA 5CM6A 1B46A 4AQ4A 4NF6A 4ZEDA 5AA3A 1LLSA 4NMYA 1DOTA 3MW0A 5ISUA 1QVSA 1VFEA 3OO9A 1B7HA 1OMPA 5FHOA 5H8QB 5I84A 1O64A 4LZ5A 3PMVA 1QULA 3O6GA 5EHSA 3KFMA 3MQ9A 3TFLA 2A5TA 3O66A 1A7LA 1GR2A 5I58B 3LSFB 2DVZA 3RT8A 4O3AA 5HM4B 5LOMA 2F7AA 4P0IA 3EHSA 4OERA 3B7DA 1YPNA 2H25A 2IEEA 4U21A 3V89B 4C1TA 4LZ7A 1B4ZA 1Z7ME 4ZEIA 2WKYA 2XXQA 3SDFA 4BDLA 1P1NA 3UORA 3HO7A 2UVHA 2P0SA 3SERA 3K6VA 3IB1A 2ZNUA 4U4XA 3OXNA 3TPAA 3KG2A 1A40A 4RY1A 4HTGA 2PYYA 3G3HA 3THIA 1P1OA 5AA1A 5CMBA 3S4UA 1A55A 3TQLA 5AA4A 1XVYA 3QK6A 2I48A 3C36A 3GZGA 2ZNTA 3FD3A 2QPQA 4MLVA 3ILUB 5F7VA 1M5FA 4OZ9A 4OXVA 1LB9A 2HCAA 3QAXA 1L5TA 3MVYA 5M2VA 4R75A 4FJPA 2I4CA 3I5OA 4ZS9A 2UVGA 2XXVA 4FEBA 3ODBA 2Z8EA 3G3FA 5KDTB 4EUOA 3T9UA 1MDQA 2HXWA 3FVOA 2AL4A 4OESA 2P1SA 4ZZAA 3H03A 1SYHA 1FQCA 1SQYA 1N84A 5CMCA 3O28A 3C33A 1LFHA 3GBBA 3K6WA 2RC8A 1FTOA 3BKIB 2ABHA 1LFGA 3M3LA 3VVEA 3GLBA 1B40A 4ZE9A 4JWYA 4POWA 4WEPA 1O7TA 1WDNA 2VOZA 3KOTA 4F2OA 4F3SA 3CFZA 4N07A 1SYIA 4IO4A 3CFLA 3HV1A 2V3QA 3IOWA 1S50A 2ANJA 1IQ7A 1XOCA 3FXQA 2I0CA 4H5FA 3U8QA 2QMXA 2XD3A 2W7YA 1USYE 3H6WA 1P1QA 1A54A 3TYHA 2AIXA 4KD5A 3K4UA 1FQDA 4XKRA 2B3BA 4KYDA 3OOAA 2DXRA 2DWAA 3ZKLA 4IGRA 1B3LA 1LCFA 2OWSA 5CMKA 3TKDA 5DVFA 1MY0A 1VE4A 3MVXA 5I2KA 3HCQA 3MZ1A 1LBCA 4GWOA 3IO6A 1MY2A 2ZYKA 5CC2A 1POTA 4PFTA 1J1NA 1N3XA 1ZU0A 4ELRA 4F3GA 3C9HA 4PFUA 4GXSB 4G8MA 1IZ1A 1TWYA 2ZYMA 2RINA 3H6VA 3W9VA 4H8IA 4G8NA 1EZOA 3C31A 2XXTA 3R7XA 4YKPA 5KCJA 1JW5A 1XHYA 2XD2A 3ZS6A 3LR1A 5A5XA 2ONKE 4G8HA 1Y3NA 2H98A 4KYSA 1H44A 1UTBA 3MAMA 2Z23A 1QKBA 1SD3A 3MPKA 3IK6B 2VGQA 2Q8JA 4NF6B 4BLAA 5IAIA 2F35A 4GL8A 5DEXA 2LAOA 1NNTA 5CMMA 2V84A 1A8FA 1KWHA 1MG1A 4M1VA 2A5TB 2AL5A 4F31B 2QSXA 3S9NC 5FTHA 1ZMGA 4I9DA 1NNKA 3KGCA 5CRYA 3MBPA 1B7UA 2DWIA 4OTEA 2Z8FA 3UA8A 1N04A 4FORA 3DM0A 4EF2A 3O29A 1MY3A 3B6QA 1D4NA 4R74A 1MM6A 1TT1A 2B65A 2QJEA 4R9GA 1PB7A 1SW1A 1URGA 2HAUA 1R6ZA 4ONYA 1I6AA 1NH7A 4ECFA 1Y20A 1B7ZA 3FIRA 3KN7A 1RKMA 3CIJA 3Q26A 4DCXA 3TEPA 1OVBA 1B1XA 1Q1KA 3TELA 1DPPA 5AA4B 4YU0A 1Y4TA 3T96B 1SVXB 4Q30B 3IB2A 2FA7A 3SEXA 1IXIA 3O97A 3KSXA 4ELOA 3E9XA 3G7WA 4GLIA 1CE2A 3Q25A 1D3KA 1H43A 1QKAA 4R6YA 2XXRA 3MP1A 2OJTA 2QS1A 1HSJA 3RLFE 3T9VA 4LQ2A 2XXPA 4KPTA 2Q88A 5I2NA 2OLBA 3R6UA 3T9HB 1TFAA 4JSOA 5BUUA 4DE8A 3O6IA 2I49A 2E0SA 2Y7PA 2F7BA 3U72A 1I6BA 2VD3A 4AB5A 1B5IA 1MQHA 4F18A 1B32A 3H6TA 3KJ7A 5H8FB 5I59A 5H8HA 1FTMA 3TCHA 2RCBA 4MLQA 4ELPA 1FTKA 4YMAA 4QSDA 4BDNA 1DMBA 4QF9A 2XXUA 3K02A 1M5BA 3G3GA 4ISUA 3TCGA 4R6HA 2Y7RA 4FE8A 2V3UA 1SW5A 4N13A 4GXAA 4U22A 4KCDA 1IUDA 1SW2A 4RK9A 3F11A 4GL0A 5AE4A 1UQWA 3S9MC 4JSDA 2CZLA 3VDFA 3H3GA 2O1MA 1Q35A 1VFDA 3MVWA 3VVDA 1R9LA 4FECA 4NF4A 3A09A 3VVFA 4FIMA 4U2RA 5I2KB 1B51A 3G3JA 4QFPA 3K2DA 1B3FA 3UP9A 2OK2A 3IB0A 3RPWA 1IXCA 3ILTB 4NF8A 2DS9A 1JQFA 2I0BA 3IAZA 3K6XA 1B4HA 2X26A 2KLFA 2YPNA 3SEVA 2H99A 3DP4A 4ESXA 1NL5A 3EN3A 3M3FA 3IL1B 1LSTA 1MH4A 5KCJB 3MPLA 2VP1A 5A5XB 3SESA 4GQOA 4NWDA 3KJTA 1B1HA 3U1OA 1QW0A 5EYFA 2ZXTA 2Y7IA 3RUMA 1UTBB 4GOTA 5TU0A 2NUVA 2M8CA 4TLLB 1LCTA 1XS5A 4IO5A 1FQFA 5DEXB 4IO7A 4KYEA 1N7XA 2AYSA 4RJZA 4E0WA 4EDPA 2G29A 3FUZA 1LAFE 3K6UA 2QS4A 5J1DA 3OMBA 3PUZE 3RN8A 1B9JA 1LAXA 1P1UA 3B6TA 1JW1A 1ZIUA 1NFTA 4LUBA 3LC8A 5AA2A 1S7YA 1NKXA 4JDFA 1MXUA 1DTZA 2HFBA 4ZEKA 3K1PA 2F7CA 1LAHE 4KR5A 3TQWA 4BDOA 1MQDA 3FATA 2XX9A 1IXHA 3G3KA 3E3KA 3O6HA 4DXUA 4HCYA 3N94A 4F29A 1B3EA 4H67A 4UA8A 1EH3A 2QRYA 4KQPA 3OSRA 1GVCA 4XTCQ 4XKNA 1MY1A 3TTNA 3VXBA 1B5JA 2UVJA 3TUSA 2HZKA 2Z8DA 2NXOA 2Y84A 4RK2A 2HAVA 2Y7KA 3OO8A 3LBSA 3RY3A 2XXIA 3O2AA 3QSLA 2DE3A 3OEKA 1OLAA 4I1DA 1WODA 1US4A 3OENA 3IO4A 3B6WA 4DLDA 3KN8A 2HEUA 3USDA 3FXUA 2THIA 3EQ1A 3TTMA 1N3WA 4QFKA 3VLUA 4LQ5A 3T22A 3HHFA 2XXWA 1XT8A 3S2VA 1SDXA 3KZGA 4YB7A 5AA2D 1RYOA 2Q2AA 3DELB 1H45A 2X7QA 1QUJA 1LGBC 1OIBA 1Y1MA 5I59B 1HSEA 1MPBA 5H8HB 3W9WA 5BWJA 1JEUA 4ZECA 5JTYA 2Y7WA 2CMOA 4JB7A 3V83A 1OQGA 2DE4A 3HN0A 3SEUA 1LFIA 3V5AA 4YICA 1MH3A 3TTLA 3CR9A 1B6HA 2H5YA 1AIVA 4YKJA 3HPIA 3D4GA 4F3PA 4GIZA 1YCJA 3N6UA 4GF8A 3EHTA 4F1UA 3FJ7A 3QUFA 2GFEA 4G68A 3SKPA 4C0RA 1JEVA 3IOTA 3QXMA 2QS3A 1FQAA 4DDDA 2ESNA 3D4CA 1F9BA 3K0VA 4TLMB 4F22A 4NF4B 1BP5A 4QSEA 4WEDA 2D21A 3ONMA 1B52A 2UXAA 2F8DA 2H9BA 3G3IA 4GD5A 5I57A 3FV1A 1N7WA 4R2BA 4NF8B 2RCAA 2F36A 4TOZA 2GRVA 1LB8A 1QJMA 4R2FA 1B3GA 1AOVA 3H7MA 4DCYA 4OWDA 3OO6A 1WVJA 4H8JA 1MPDA 1LBBA 2VHAA 1B2HA 1BTJA 3OD7A 1A99A 4YZZA 2Q9TA 4X48A 4XKPA 2XXHA 2DQVA 5L9SA 5F1QA 5JEIA 4XIGQ 1AL3A 3K1MA 3SEWA 3ZKKA 1CB6A 4THIA 1BLFA 2PBWA 1SW4A 2I4BA 4QSCA 4PQJA 4OYVA 2I6EA 4Q5TA 3FZVA 4YKKA 3M8UA 3K1NA 1HSLA 4LP2B 4UACA 2F97A 4DZ1A 4H1XA 5H8NA 3M3KA 3PU5A 4G68C 2XXYA 3RTWB 1OVTA 3W15C 3DP8A 3MUQA 1NMUA 4BDQA 4O3CA 4AB6A 1PC3A 1PDAA 5AA2B 1Y3PA 4BDMA 4I8CA 3TODA 3PUWE 2FNCA 2OWTA 3MVZA 3FVKA 4RPOA 3L6HA 3O9PA 4WKMA 3TAJA 3PV0E 4K3FA 4ZDMA 3T93B 2QL3A 5DYHA 4EQ9A 4EXKA 2Q2CA 3V8XB 1EU8A 4F19A 5L8DA 4Z7EA 1R9QA 2DP8A 3N26A 3Q27A 4R9FA 3CSGA 3P7IA 3MJNA 4RPNA 5B70A 1URDA 4OFOA 3RT6B 2P2AA 3VFJA 2ZYNA 1Z7NE 4I62A 1FQEA 4DXBA 4EXLA 3H06B 5I56A 4IO2A 2FYIA 2XXXA 1R1NA 3KSJA 2PT2A 1II5A 1XC1A 1OLCA 5CI5A 1T0KA 4X9TA 2GHAA 3T9XB 3MZBA 1D9VA 1AH5A 3BFTA 4FEDA 1SBPA 3TTRA 3QIMA 3T66A 4C1UA 1MPCA 3TMGA 1I69A 1LAGE 3I3VA 4RA1A 1RYXA 4IB2A 3BBRA 1PB9A 3PD9A 4F1VA 3UGWA 3LUYA 3SETA 3TDJA 2REGA 1MQGA 3U92A 1P99A 2PVUA 3PUYE 5JTYB 2O84X 3OO7A 1JVXA 1MM7A 3CVGA 4QFLA 5FHNA 2A5SA 5K2XA 3Q28A 2R71A 1ZKBA 3K00A 4L17A 5ITOA 3LSXA 1B58A 3K01A 3OEMA 2O6AA 4RNSA 2PMSA 3QUJA 4IY6A 1ANFA 4G68B 5B7DA 2V3TA 1MXVA 4PFWA 3Q29A 4OEUA 2IA4A 4YKIA 4XXUA 4ELQA 5TPAA 1ZBMA 3JYRA 3TCFA 3N5LA 3PPQA 5DVIA 2QMWA 4H5GA 1NH8A 3IOUA 4JXIA 4E0XA 1PB8A 5CBSA 3GBAA 5I57B 1QUKA 1MRPA 4OMBA 1MXWA 4IY5A 4MH5A 2UYEA 1P1WA 4IGTA 1M5DA 2ZYOA 4DIGA 1FCKA 4NE4A 3LSWA 1A8EA 4RXLA 4EF1A 4U1OA 4IO6A 4NF5A 2XHDA 4QFOA 4EQBA 1D9YA 4ZZEA 1B0HA 3PUVE 3PPRA 2ONRA 2G93A 3IX1A 5CBRA 2DWHA 2DWJA 3MWBA 3BFUA 4HW8A 2NOOA 4DXCA 5K2YA 4P11A 3R26A 3TTKA 4P0GA 4ESWA 2REJA 4KHZE 1OQHA 1ZJLA 2DOJA 3SEYA 2R9JA 1AMFA 1QUIA 4FAJA 3E4RA 2D3IA 1SI1A 4LA9A 3DP6A 5H8NB 1M5EA 1GTKA 4OETA 4OEVA 4NTLA 1YAEA 4OVJA 5L9MA 1GV8A 4TQUQ 1BKAA 4R6KA 4M4GA 5ICQA 1DTGA 2DSFA 1UTHA 4MF3A 5TP9A 4GRKA 1IIWA 1MDP1 4PFYA 2OCUA 2OBGA 1S9TA 3PD8A 5H8FA 1US5A 1FQBA 2B3FA 5DVJA 1H76A 1ATGA 3PMWA 1VSOA 4H6DA 4LONB 4QHQA 4KI0E 4MFIA 1FTJA 3RTFB 3VE1B 3KOSA 3PMXA 3A3UA 5I2NB 1DSNA 5HBCA 2H4IA 5FHMA 2RC7A 4G77A 3PUXE 1PBPA 1ELJA 2RKMA 2O68A 2RF1A 1BIYA 5HPQA 2F78A 2QS2A 1PEBA 4YB5A 3CI8A 3JV9A 2HQ0A 3U93A 3HHGA 3IORA 1UIVA 3MZ9A 3EF7A 1YTVA 4F2QA 3FGSA 4U4SA 3KBRA 4HS7A 3H6UA 2E1SA 5I56B 2UVIA 3UIFA 4OFLA 4OQOA 2XX7A 1N76A 3IR1A 2GHBA 1MXXA 1TXFA 4F1YA 3FXRA 2I58A 3IOVA 2ONSA 4QFNA 5H8QA 2NWJA 2XX8A 3C32A 4XKQA 4JWXA 3C4MA 5I58A 2HZLA 2NVUB 3VXCA 2I3VA 3KEIA 4HCWA 3FVGA 4YMBA 1NNFA 1URSA 1B3HA 5ICTA 2ZMBA 3UK4A 1Y1ZA 1Y4CA 1EZPA 4LATA 2O1LA 3IJOB 4BDRA 3QYTA 3E13X 4ZEBA 1JVYA 3TZAA 5IKBA 4G2ZA 3A3CA 1FW0A 2GH9A 3UN6A 2PT1A 1MQIA 4QRZA 2F34A 4WXJA 2PX1A 3VV5A 4H65A 2I3WA 2BJJX 5JK4A 1MXYA 3ECRA 4X1BA 3DLNA 2DYXA 1I6QA 1XVXA 4NEDA 3RNNA 4Q0CA 3S9LC 2F6GA 1PBQA 3OSQA 1MY4A 4KFQA 2V25A 4H0WA 3VLWA 3GXAA 1POY1 5TPAB 1ZLQA 3KN3A 4ND9A 2YLNA 1EZ9A 4PE5B 5ELVA 3WAFA 4KCCA 5ITPA 1M5CA 3HSTA 4OHNA 4LZ8A 3MP8A 1B0LA 3JZJA 4Z0IA 1VR5A 2Q89A 3FASA 3I6VA 3FV2A 5KDTA 4X1DA 4G4PA 1UIUA 4R72A 3OELA 3N6TA 4NF5B 2ZNSA 1MS7A 2DVCA 2ALUA 3C34A 3VLVA 1Y3QA 2F6PA 5FTIA 2Z22A 1JW4A 1B5HA 1IEJA 1IITA 4JBZA 4ZEFA 2O7IA 1FTLA 4FATA 1Y9UA 1O63A 5KZTA 1MQJA 4F3BA 4OENA 4YB6A 1JNFA 1NNPA 3MP6A 3RQTA 3U94A 3CRBA 4PP0A 5H8SA 1IXGA 1N0TA 3PPPA 4U23A 1MXZA 2DE2A 1USYH 4GFRA 2RC9A 1TFDA 4MBPA 3H4ZA 4IO3A 2O51A 4O3BA 4NWCA 4GVOA 4U1ZA 3C35A 1UTHB 2F5XA 3PPNA 5TP9B 4N6PA 3CG3A 3ZSFA 4F39A 4PETA 3EHUA 2YJPA 4YAHX 4LVQA 2V93A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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