2ZNUA

Crystal structure of the ligand-binding core of the human ionotropic glutamate receptor, glur5, in complex with a novel selective agonist, neodysiherbaine a
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
total genus 83
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2znuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2znuA02
3Q25A 2DE4A 3OEKA 4GL0A 2H99A 3I6VA 2I49A 2RCBA 1UTHA 5I2KB 1LAXA 5AA4A 3OD7A 4PFTA 4O3CA 2ZYKA 3O6HA 3KJTA 4Q5TA 3DELB 1URSA 1FCKA 5ITPA 3PPPA 3HV1A 3PU5A 4OHNA 4KHZE 1LFHA 3TTNA 3PMVA 3KBRA 3M3LA 3MVYA 4JXIA 1A7LA 5L9MA 1LGBC 2AYSA 3RLFE 1XC1A 1ZU0A 1LAGE 2B3BA 3CFXA 2H9BA 3L6GA 3S9LC 5CMMA 3TPAA 3VVDA 1P1NA 4JWYA 3MP8A 3MVWA 1B3HA 3Q28A 2UYEA 5IAIA 4NEDA 4YB5A 4KPTA 5K2YA 2HCAA 3BFUA 4R74A 3BFTA 4AQ4A 3PUVE 4R2BA 2ZNTA 3OELA 4KCCA 5AA2B 2XXYA 4U1ZA 2CMOA 1EH3A 3W15C 3LR1A 4O3AA 1PB8A 3VLWA 3IAZA 2XD2A 3TUSA 2OBGA 3ZSFA 3KSJA 5I56B 5F7VA 3OO8A 2R9JA 3TKDA 1WODA 1NH8A 1FTJA 1QUJA 4ELOA 1LFGA 3OOAA 2V3TA 4IO7A 5TP9B 5HBCA 2OWTA 4LA9A 2B65A 4TLLB 2HZKA 2Y7PA 2XXQA 4FIMA 1PBQA 1P1WA 1SD3A 5H8HA 2ONKE 4NF5A 3E4RA 2H25A 1WVJA 1MQDA 1NL5A 3V8XB 3EHTA 4KD5A 1R9LA 4KYDA 2Z8EA 1B6HA 2F7BA 4DIGA 4JB7A 2H4IA 3VV5A 2Q2CA 2Y7WA 3MPLA 1BP5A 4QFOA 3LC8A 3MUQA 4X9TA 4HW8A 4GXAA 4F39A 3EHSA 3PD9A 1SQYA 1N76A 2QS1A 1QJMA 1Y1MA 3GZGA 2IEEA 3T9XB 3SESA 2R6GE 3AXFA 3FVNA 5AA2D 3VVFA 3VVEA 2DSFA 1SW2A 1H3DA 5CBSA 4EQ9A 3Q27A 3W9WA 2ZNSA 4TLMB 3C32A 2XXIA 3ZS6A 1WDNA 5I58B 3GBBA 1OVBA 1XOCA 3O97A 1H43A 4OQOA 3S2VA 1SW5A 4IO3A 3DLNA 4GWOA 2O1LA 3OXNA 3UIFA 1UIUA 4QFLA 2O51A 1ZKBA 4YB7A 1QVSA 1SBPA 3C9HA 3N6TA 3ZKLA 5K2XA 2GFEA 4IGRA 3IK6B 1EZ9A 2ONRA 4YICA 1J1NA 3OMBA 5I2KA 4H65A 2G93A 1US5A 3C4MA 3RQTA 2I4CA 3R7XA 4OWDA 1MPCA 2DE3A 2QPQA 3HHFA 2I3WA 4GL8A 4YMAA 1FQEA 3UGWA 5DEXB 3MVZA 3ODBA 2PT2A 3LUYA 1N04A 4I1DA 3FV2A 2VD2A 3H03A 3B6TA 1QULA 3FJGA 2ONSA 2P0SA 3K00A 4K3FA 2HQ0A 3LSFB 4H5FA 3FASA 3KN7A 4BDRA 3IR1A 1H44A 4OERA 1MY2A 3SEWA 3OSQA 4R9FA 5I57B 2QRYA 4N6PA 1SDXA 2HZLA 4F2QA 2D21A 2REGA 1TT1A 3TFLA 5JEIA 5DVJA 3MQ9A 4Q30B 5AA2A 3TTKA 2QL3A 3LSLA 3RUMA 4BDMA 1LLSA 3H6UA 1PB7A 1A54A 4F3SA 3SDFA 1ANFA 4PETA 2VD3A 3S9NC 2F7AA 5I56A 1OQGA 3DM0A 1B7ZA 3H3GA 4F31B 2AL4A 3EHUA 1IXCA 4H1XA 5KCJB 3IOUA 1SW4A 4G68B 5TP9A 1YCJA 5HM4B 1XHYA 1LB8A 3W9VA 1JNFA 1IXHA 4G8HA 3T9UA 2OJTA 4QFPA 4JSDA 2RF1A 1VE4A 1JEVA 2V3UA 1MXXA 3FUZA 4YKIA 4KYSA 3V83A 4L17A 3EF7A 1A55A 4XKNA 4MBPA 3U72A 1USYE 3FJMA 1BIYA 4WXJA 3SEXA 2B3FA 1AOVA 2F78A 4H0WA 3OEMA 4RK2A 4OENA 4KYEA 2XXWA 3N26A 3SERA 2V84A 4NWCA 4FEDA 3R6UA 3ILTB 2P1SA 1P99A 1P1OA 4LONB 2ZMBA 1MH4A 2F6GA 1F9BA 1NMUA 3C33A 2HFBA 1R6ZA 1B2HA 2O1MA 3PGFA 4Z7EA 5TPAB 2V25A 3OO6A 1US4A 3PPQA 3N5LA 4GF8A 3KSXA 1EZPA 1T0KA 2ZYMA 1N7WA 1OLCA 4NF4B 3A09A 4NF6B 2F5XA 5HPQA 1OLAA 5I58A 1D3KA 3ONMA 4DLDA 5J1DA 1MG1A 4LZ8A 4NF8B 4EDPA 3OSRA 3GBAA 5TU0A 3TQWA 4NWDA 4YKJA 1NNKA 2ZXTA 3D4GA 3U8QA 4XIGQ 3V89B 3HN0A 5AA3A 1MDP1 4MF3A 3I5OA 1PEBA 4OTEA 2Z8DA 2XXXA 2GRVA 1A8FA 3TQLA 4YKKA 5DEXA 2REJA 3O2AA 1MQHA 5IKBA 2AL5A 1QKAA 2VOZA 3KFMA 4PQJA 3K4UA 1MH3A 2F6PA 5BUUA 2M8CA 3K2DA 3TYHA 4DXBA 2IA4A 1M5BA 3EQ1A 5A5XB 4RNSA 1DTGA 1FQAA 2Z8FA 2ZYNA 2DWHA 3FXRA 4F3PA 5I57A 5L8DA 5AA1A 1KWHA 1SW1A 4F18A 3B7DA 5H8QB 4R72A 4XKRA 4BDOA 2R71A 2PVUA 1B52A 5JTYB 3PV0E 3HO7A 3PPRA 1AMFA 2ABHA 3LSXA 1B7UA 1NNFA 4F3GA 3CG1A 1QKBA 1MPDA 4MH5A 2VGQA 3TTLA 1JVYA 3ILUB 3SEYA 4MFIA 5KCJA 1OVTA 4QFKA 3U93A 2XXPA 2RC9A 2V3QA 1MRPA 4G68A 3C36A 3HHGA 2OWSA 5JK4A 3S9MC 3H6TA 4U23A 4ELRA 1MM7A 3UA8A 1GV8A 3T22A 3VXBA 2XXUA 3K1NA 3B6QA 4H8JA 5L9OA 4C1UA 2DWIA 2Z23A 1LCFA 1MM6A 3JZJA 3PD8A 5B7DA 4GIZA 2DXRA 3T93B 1B3LA 3L6HA 4DCXA 1AL3A 1O64A 3K01A 2F7CA 4IO2A 4IB2A 2NXOA 4GFRA 1M5FA 4OZ9A 5TPAA 1BTJA 3TTMA 3KZGA 1FTKA 1UIVA 3CSBA 3C31A 4NF4A 3KOTA 4NF6A 4F19A 2ESNA 5M2VA 4YKPA 3KOSA 3K0VA 2XXTA 4F2OA 3G3GA 3EPEA 1PDAA 1UQWA 1LAHE 2ANJA 5I2NB 1P1UA 3GLBA 4NF8A 4FEBA 1L5TA 4WEDA 1ATGA 3BBRA 2ZYOA 3CFZA 2NUVA 1N84A 2CZLA 4GQOA 3UK4A 1GGGA 1MXUA 3DP4A 2W7YA 2Y7IA 1TFAA 3M8UA 4KR5A 1IEJA 3Q29A 1B7HA 1RKMA 1HSEA 1MQIA 2I3VA 3SETA 2G29A 2XX7A 4IO6A 2A5SA 4ONYA 3S9EA 5BWJA 1D9YA 2DVZA 3JV9A 2DXYA 1DSNA 4BDLA 1Y3PA 5ICQA 2X7QA 4WEPA 1CE2A 4RYAA 4G8MA 5A5XA 4ZEIA 2HEUA 4TQUQ 2QS3A 2XD3A 4DDDA 3O9PA 5I59B 1MXYA 4RJZA 1PC3A 5L9SA 1IQ7A 1Q1KA 1B3EA 3MC2A 5H8QA 3FGSA 3DP6A 5FTHA 4OMBA 3P7IA 5FHMA 3H06B 5JTYA 5EHSA 2FA7A 1O7TA 1FTOA 2AIXA 3V5AA 4MLVA 1XS5A 3IJXB 2HAUA 3TMGA 3M3FA 3MPKA 2WKYA 3H6WA 4ECFA 3CVGA 4RA1A 3RPWA 4O3BA 3LBSA 4BLAA 4N13A 4GLIA 3MWBA 2H98A 3K1MA 4OEUA 4LZ7A 4QSDA 1YAEA 3WAEA 5CBRA 4POWA 1URGA 4E0XA 1NKXA 3U1OA 3OO9A 2GHAA 4ND9A 2FYIA 2UVGA 1XT8A 3CIJA 4NE4A 1S9TA 3HPIA 3G7WA 3PUZE 1Q35A 2RC7A 3FD3A 2Q9TA 4IY6A 2QMWA 3ECRA 4GD5A 4G77A 1XVXA 3MJNA 3MP6A 1EZOA 4EXKA 4F1UA 3IB0A 5DYHA 2I4BA 2F36A 1PBPA 3IOWA 4R6HA 4GOTA 3FZVA 3OO7A 3MZ9A 2DYXA 4H67A 2DOJA 3TODA 1SI0A 2F34A 3K6UA 4XKPA 3RT6B 3GXAA 4OESA 4ZS9A 4ZECA 3G3JA 1QW0A 2D5WA 3I3VA 3SEUA 4PFUA 5H8FB 5DVFA 4RXLA 2X7PA 1ZMGA 3PMXA 4C1TA 4LQ2A 2DWJA 4RK9A 1URDA 1AIVA 4P0GA 3QXMA 3PPNA 5B70A 1CB6A 4ZEKA 4I8CA 3CSGA 1MXVA 1FQBA 4MLQA 4OFJA 1JW4A 3T9HB 1TXFA 4XKQA 3D4CA 5I2NA 4PE5B 3FJ7A 3TCFA 4UA8A 1FQCA 1A40A 1HSJA 2D3IA 5DTBA 1B1HA 2XHDA 2UVIA 1P1QA 3RY3A 4FE8A 3MZBA 4QRZA 1MY4A 1GVCA 5FTIA 4YAHX 1I6BA 3VXCA 4EF1A 2DVCA 5ISUA 1FW0A 1OIBA 2OZZA 4R73A 4G4PA 3RTFB 1OQHA 4YU0A 4KCDA 4ZE9A 3QK6A 3EN3A 1QUIA 3TZAA 4TOZA 1Y1ZA 3MP1A 1LFIA 1UTBB 3N94A 4LQ5A 5H8SA 4OVJA 2Q88A 3IB2A 2XX8A 1TWYA 4OETA 3USDA 3CR9A 3JYRA 4X1DA 3T66A 4RPNA 3FXQA 4R9GA 1JEUA 5CMCA 3THIA 2Z22A 3TTRA 4ZZEA 3A3CA 4JWXA 3QIMA 1FTLA 1B0LA 1B05A 1I6AA 3B6WA 4OYVA 2GHBA 2RC8A 1RYOA 4U4SA 4R75A 1S50A 1B4ZA 4KQPA 4U21A 2Y7KA 4QFNA 2OCUA 2OLBA 3FVGA 5CMBA 2O6AA 1YPNA 4RY1A 2XX9A 4KFQA 4PFYA 1IZ1A 1H45A 3FV1A 4QHQA 2XXVA 1OMPA 1ZBMA 4AB6A 4DZ1A 1Y4TA 1IXGA 3KG2A 1USYH 3H4ZA 1MY3A 4XXUA 2I48A 2QS4A 2VP1A 2LAOA 4THIA 2UXAA 1NNTA 4ELQA 4F29A 4PFWA 1VR5A 4U2RA 1ZJLA 1TFDA 1ZLQA 2I58A 3VE1B 2A5TB 1MXZA 4IGTA 1ZTYA 1LB9A 2Y7RA 1DPEA 4LUBA 1GR2A 1NFTA 3MBPA 3T9VA 4M1VA 1Z7ME 1N7XA 4FAJA 3G3FA 5CMKA 3IL1B 3O6GA 4JBZA 2ALUA 1IUDA 3O6IA 5CM6A 3QAXA 4JWOA 4Z0IA 3QUJA 4BDQA 1B40A 4GXSB 4IO4A 1ZIUA 4R6KA 4DXCA 3PPOA 5H8NB 1A8EA 2DS9A 4GRKA 3K6XA 2O68A 4DXUA 3S4UA 4OFLA 1POY1 1N3XA 5H8FA 1SYIA 2I0BA 4X1BA 2Q8JA 4GVOA 4HCYA 1B0HA 2X26A 2PBWA 3PUXE 2NWJA 3KN8A 4R6YA 3C35A 4QSEA 4IY5A 1HSLA 2QSXA 3RNNA 4RPOA 2O7UA 1VFEA 4ZZAA 4C0RA 4U22A 1SYHA 3VLVA 1MDQA 1N0TA 3O66A 3PUYE 1PB9A 3K02A 3UP9A 3TCGA 2F35A 2DWAA 1LBBA 3E3KA 3BKIB 2I0CA 1BLFA 3IOVA 1ELJA 2Q2AA 4EQ7A 4F22A 4KI0E 4Q0CA 3CFLA 1D4NA 4P0IA 3RGYA 2THIA 1DMBA 1B5IA 2KLFA 1B51A 1MQGA 1I6QA 1JETA 1LSTA 2Q89A 4PP0A 3FVOA 1FQFA 4H6DA 2VHAA 4UACA 1B1XA 3TEPA 1MS7A 1UTBA 4U1OA 1B3GA 3TAJA 1MY1A 1Z7NE 1B5HA 3IORA 1B4HA 5F1QA 1MPBA 1DTZA 1S7YA 4ZEBA 3FIRA 3PMWA 4FATA 1LAFE 1Y3NA 3U94A 4DCYA 3FVKA 4JSOA 4EXLA 4AB5A 1A99A 4LATA 1MQJA 1R9QA 3CG3A 5I84A 5CC2A 1JQFA 3C34A 4P11A 1Y4CA 5KDTB 2PYYA 3FATA 2DP8A 4BDNA 3G3KA 1RYXA 4Q8RA 3E13X 3MVXA 5DVIA 1M5CA 2DQVA 4N07A 2GH9A 3RN8A 1B3FA 4U4XA 3CI8A 2YJPA 4OFOA 4POXA 1II5A 3N6UA 3TCHA 4EQBA 1M5EA 1YTVA 2F8DA 4E0WA 2E1SA 1DPPA 4NTLA 1IITA 2O69A 2YLNA 4HS7A 2A5TA 1M5DA 1UTHB 4YB6A 3G3IA 5AA4B 3KGCA 1NH7A 1BKAA 4NMYA 3VLUA 1POTA 3WAFA 4QF9A 3IJOB 4LP2B 4G8NA 3K1PA 3VFJA 4YMBA 1Y20A 4IO5A 2YPNA 3U92A 3KEIA 3K6WA 1FTMA 2BJJX 2QJEA 1Y9UA 2OK2A 3IO4A 4ESWA 3UN6A 4ZEFA 5ELVA 5H8NA 2O7IA 3PUWE 3F11A 3A3UA 3QSLA 5AE4A 2HXWA 5CI5A 3T96B 3CRBA 3K6VA 1B5JA 2UVJA 4ZDMA 3IOTA 3Q26A 3IX1A 4ELPA 2NVUB 3TELA 4F3BA 2FNCA 2Y84A 1SI1A 3SEVA 5EHMA 1AH5A 2O84X 3M3KA 2UVHA 3SKPA 3UORA 1Y3QA 2RCAA 3TDJA 3KJ7A 5ICTA 1IXIA 1I69A 2HAVA 4LVQA 4LZ5A 1VFDA 4HTGA 4YZZA 4ISUA 4EF2A 1MY0A 2E0SA 3MAMA 1B9JA 1R1NA 2QS2A 4R2FA 5KZTA 3MZ1A 3R26A 2QMXA 3G3HA 3O28A 2I6EA 1JW1A 3OENA 4DE8A 1SVXB 2RKMA 2V93A 4F1VA 4FJPA 3H7MA 1FQDA 4G2ZA 1VSOA 2PT1A 1EU8A 3DP8A 2H5YA 4H8IA 1B46A 2PX1A 4FECA 5EYFA 1LCTA 4WKMA 5H8HB 5FHOA 4NF5B 4ESXA 2PMSA 4M4GA 3FXUA 5ITOA 4QSCA 1DOTA 4FORA 3RTWB 3VDFA 3IO6A 4F1YA 2UYFA 3H6VA 1O63A 4H5GA 1MXWA 2DE2A 4X48A 4XTCQ 4OEVA 3IB1A 1GTKA 4I9DA 2P2AA 4EUOA 4HCWA 3E9XA 2XXRA 3HCQA 5FHNA 3LSWA 4G68C 5KDTA 5DT6A 1NNPA 3QUFA 5CRYA 3KN3A 2F97A 3QYTA 2XXHA 2NOOA 5I59A 3MW0A 4OXVA 4ZEDA 2RINA 3ZKKA 1JW5A 1B58A 1LBCA 1D9VA 1XVYA 1JVXA 3RT8A 2ZNUA 1QUKA 4ZE8A 5LOMA 3O29A 4I62A 3HSTA 1H76A 1IIWA 4JDFA 1N3WA 1B32A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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