2ZNUA

Crystal structure of the ligand-binding core of the human ionotropic glutamate receptor, glur5, in complex with a novel selective agonist, neodysiherbaine a
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2znuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2znuA02
3FGSA 1PC3A 4YMAA 3G3FA 4NF8A 4G68C 2Y7IA 2M8CA 2UYEA 2F34A 4R6YA 2VD2A 2VOZA 3TCHA 1VFDA 4F3SA 3QAXA 1EZPA 1OQHA 4H5FA 5DVJA 1VR5A 2Z8FA 3QSLA 1LCTA 3GLBA 1USYE 1OIBA 3CFXA 4QFOA 4RXLA 4F3BA 3H3GA 3TZAA 4ZZAA 3PPNA 2O51A 4NWDA 3C31A 3ZS6A 4LZ8A 4EQBA 3PMWA 5I56B 3SERA 1ZMGA 3KGCA 3DP4A 3C33A 1NMUA 4JB7A 5I56A 1CE2A 2OJTA 3PD9A 2H99A 3B7DA 2QPQA 5CC2A 2F7BA 4G4PA 1PB8A 2OWTA 5EHSA 1LB8A 3PGFA 3PUXE 4DXBA 3IO6A 3PU5A 5DVIA 1NL5A 1DOTA 3MVYA 1US5A 2RF1A 4F2QA 4OFOA 1JW5A 2DE2A 2IA4A 1JEUA 2I48A 1FQDA 4X48A 3C34A 3OO7A 1XVYA 2E1SA 1LBCA 3KSJA 1FW0A 4ECFA 2FNCA 1ZKBA 2V3TA 1B9JA 3UORA 2HCAA 1I69A 1OVTA 2A5SA 3WAEA 1AIVA 4O3BA 1M5DA 1MXYA 2PX1A 5L8DA 3VLWA 4RA1A 3HN0A 3TDJA 4BDQA 3VXBA 1QUKA 1IEJA 1PEBA 3KFMA 4IO7A 1Y3PA 3FIRA 3OMBA 1IUDA 2X7PA 1UTHB 1FQFA 1LFHA 3FXQA 2P1SA 1VSOA 4IO2A 1UTHA 4HCWA 1MY3A 1B40A 3E3KA 4F39A 4F31B 1O7TA 1MDQA 4OHNA 4I8CA 4QSCA 1EZ9A 2XXPA 4OTEA 3U72A 1FCKA 1QUIA 4FECA 2NVUB 4PQJA 2H98A 4H6DA 3MJNA 2GH9A 4DCXA 3E4RA 4JWYA 3G3IA 3S4UA 5CMCA 2H9BA 3IJOB 4OEVA 4IGRA 4FIMA 5DYHA 3K1PA 4UA8A 3MC2A 3KJ7A 1SVXB 2PVUA 1M5EA 3KSXA 1ZIUA 2YPNA 4GF8A 4YKPA 3M3KA 4DZ1A 3QYTA 4R6HA 1P1UA 2XXIA 1AL3A 2WKYA 1MM6A 1Y3NA 1MDP1 1NNFA 3MP8A 3FUZA 2UVJA 3PUYE 5EYFA 2OCUA 2W7YA 4G77A 2QMWA 3B6QA 3MUQA 3SEVA 2F7CA 4ELRA 4KCCA 4OFLA 1NH7A 4ZECA 3MVXA 5JEIA 1WDNA 3IB0A 4PP0A 3U8QA 4HW8A 3K02A 3FATA 1PBQA 3FJMA 4ZE9A 4N07A 3OELA 4U4XA 4GXSB 1SW1A 5F1QA 2AYSA 1HSEA 1P1QA 1UQWA 3G3HA 3K2DA 3ECRA 1IZ1A 5AA4B 3TUSA 2O7UA 1BKAA 3O9PA 5FHMA 4ELOA 3EHUA 2ZXTA 1MY2A 1RYOA 4U22A 2QS4A 1B4ZA 3LSFB 1YCJA 1UIUA 4ND9A 1GTKA 2PBWA 2V93A 1Q1KA 4NF6B 3UK4A 5ELVA 1SBPA 2OWSA 2ZYMA 3U94A 3TTNA 4XIGQ 3LBSA 4H0WA 5I58B 3O6GA 4YB7A 4OERA 2O6AA 2REGA 2H4IA 2DVCA 1Y20A 3K00A 1SDXA 4XKNA 3G7WA 5I58A 4ISUA 2Q2AA 1SI0A 3Q26A 4OMBA 2Q88A 4EQ7A 2Q9TA 2I3VA 3MW0A 4DE8A 4IO4A 1TFAA 2ZYOA 2V3UA 1N3WA 1LB9A 3SEXA 1AOVA 2HAUA 3IB1A 4I62A 1DPPA 3N6TA 3H6VA 2QS2A 3CRBA 4GQOA 4OEUA 4WXJA 1MY0A 4ZEFA 5CMMA 3SDFA 2ONKE 4OWDA 2VP1A 4X9TA 4M4GA 5ITOA 1WODA 5H8SA 1Z7ME 3V89B 1JETA 3TCGA 4WKMA 5I57B 1OVBA 4FAJA 1A7LA 3FJ7A 1GV8A 2ZYKA 2R6GE 1P1WA 4Q0CA 4P0GA 1B51A 3FD3A 5HPQA 4GIZA 1EU8A 2O84X 2UVGA 1FTOA 2AIXA 1B2HA 1EH3A 4HCYA 4OETA 3KBRA 3TTRA 4ELPA 2BJJX 1TT1A 2HEUA 3FV1A 4F2OA 2OBGA 3G3GA 3IOWA 4LA9A 3TTKA 4OZ9A 3OSRA 3H4ZA 3UA8A 1Y4CA 1AMFA 1IIWA 3S9EA 1FQCA 1I6BA 1VFEA 1MPBA 3R7XA 1YTVA 1BLFA 3UIFA 4JXIA 1IXHA 1WVJA 4H8IA 4QF9A 4NMYA 3MVZA 5HM4B 1B5HA 1A55A 1XHYA 4OENA 4Z0IA 4F29A 1Y9UA 2UYFA 4FORA 1LAFE 1EZOA 1B1XA 2FA7A 2O69A 1I6AA 4O3CA 1MPDA 3HHFA 1B3EA 4DIGA 3I6VA 4KYDA 1N04A 3PPPA 5A5XB 1MH3A 1FTJA 3K4UA 2F97A 3KN3A 2ONRA 2QL3A 4GFRA 3HO7A 1CB6A 5A5XA 1N0TA 2Y7PA 3LSXA 4DCYA 3RT8A 5I2KB 3LSWA 1MG1A 1L5TA 3QIMA 3H6UA 1H44A 1N76A 4KYSA 3SEUA 2O1LA 2PT2A 2Q2CA 2Z8EA 3G3JA 3VVEA 2XX7A 1POY1 3OXNA 1XVXA 3I5OA 3CVGA 3Q28A 1MQHA 4G8HA 3Q29A 1MQGA 1H43A 3PUVE 1B6HA 3RPWA 1N7WA 3KJTA 4JWOA 3EN3A 5F7VA 1NFTA 5AA1A 2XXTA 1NH8A 2THIA 3MP1A 4DXUA 3C4MA 1D3KA 3IX1A 3DP8A 4ZS9A 1OQGA 3U92A 2XXQA 3TELA 1FQEA 5H8QB 1B5JA 5EHMA 3K01A 4JWXA 2I4BA 1IQ7A 4ZEIA 1MQIA 1LAXA 1F9BA 2Z23A 1B3GA 3N5LA 5H8QA 3FV2A 3FXUA 5AA2D 2UVIA 2B3FA 4ELQA 4WEPA 1IITA 1NNPA 3IJXB 4OXVA 4KR5A 1QUJA 4K3FA 1S50A 5AA3A 4P11A 2VGQA 4QHQA 4IO5A 2HZKA 5JK4A 2DQVA 4RK9A 3G3KA 4ZE8A 3S2VA 3VLVA 3MAMA 3B6TA 3B6WA 5BUUA 4GOTA 3PV0E 3VLUA 2XXVA 2XX8A 3C32A 5TP9B 3IO4A 3MZ9A 2GRVA 2Y7KA 4I1DA 3RT6B 5TP9A 3RNNA 2UVHA 3CFLA 3R26A 4JSDA 4KCDA 3D4GA 3WAFA 1XS5A 2XXXA 3A3UA 4IY5A 4BDNA 1MXVA 2O7IA 2ZYNA 3U1OA 3O6HA 3ONMA 4PFYA 1JVYA 4H65A 5DVFA 3PD8A 2Q8JA 1MXZA 2DP8A 3IR1A 4QFLA 3FVNA 2RC7A 4KFQA 2ABHA 2ZNUA 3O28A 4AQ4A 2D5WA 1B1HA 1NNKA 4GD5A 1JNFA 3JV9A 1FQBA 3K6XA 3TEPA 4N6PA 1H3DA 1MXUA 2HZLA 3OD7A 4R9FA 4FEBA 1MQJA 3CSGA 3GBAA 2DE3A 4LZ7A 2DXRA 3K6VA 4TOZA 5H8HB 3SKPA 3CR9A 5I59B 2QJEA 4P0IA 4U21A 2PT1A 3C36A 4L17A 2AL4A 4YU0A 4U2RA 5H8HA 4OYVA 5I59A 4R75A 4QFKA 3OO6A 2B65A 4JSOA 3THIA 3IORA 3VDFA 1N84A 4XKRA 2HFBA 4Q30B 5FHNA 5ICQA 4LUBA 4F3PA 3EQ1A 4OFJA 3KN7A 3PMXA 2KLFA 3UN6A 4DLDA 3GXAA 2IEEA 3M8UA 1B3LA 4G2ZA 1NKXA 4KPTA 2V84A 1JVXA 4GRKA 4GXAA 3TCFA 4R6KA 2ZNTA 5DEXB 2F78A 5AA4A 1SW4A 1TWYA 5H8FB 1J1NA 1MXXA 5DEXA 1Y1MA 4LATA 3LUYA 5DTBA 5H8FA 4Q8RA 4TLLB 1B3HA 1SQYA 2XHDA 4GVOA 3IL1B 4BDLA 1MS7A 4RPNA 2A5TB 4Q5TA 3V8XB 1UTBB 1DSNA 2Z8DA 2NUVA 4NF6A 3PPRA 3PPOA 4LQ5A 2QSXA 4JDFA 1UTBA 2V25A 3QXMA 2PYYA 2QS3A 2DWJA 1B3FA 1URGA 3W9WA 3MZ1A 2F7AA 4EUOA 1MPCA 1II5A 1ATGA 4MH5A 1DMBA 1QULA 1SYIA 1S7YA 3S9NC 1RKMA 1R1NA 3SEYA 3L6HA 1B32A 1P99A 3BFUA 4FE8A 2DXYA 1ZLQA 4TQUQ 5FTIA 2GHBA 2ZNSA 3T9HB 4KD5A 5IKBA 2OLBA 3LSLA 4E0WA 4RK2A 1ELJA 3IB2A 1Y4TA 1H76A 2XXRA 4QFNA 1PBPA 3D4CA 3E9XA 3RTFB 1VE4A 3UGWA 5I57A 1BTJA 5CMBA 3W9VA 3LC8A 4YB6A 3DM0A 1OMPA 3FVOA 2RC8A 3VE1B 1S9TA 3TYHA 1OLCA 5TU0A 2H25A 2RINA 1N3XA 4QSDA 3CIJA 2Q89A 3F11A 1LBBA 1PB9A 1MRPA 3E13X 3CG3A 2NWJA 3ILTB 2XXYA 4MLVA 1B0HA 1LLSA 1IXGA 4HS7A 1TXFA 3PPQA 4UACA 3VXCA 1ZJLA 4IO6A 1A8FA 4YAHX 4BLAA 2ZMBA 3VVFA 3K0VA 3HCQA 1D9VA 1N7XA 1LAGE 5AA2B 5CBRA 2XD3A 4U4SA 3RN8A 3T66A 4X1BA 2AL5A 3I3VA 2V3QA 1R6ZA 3BFTA 2QMXA 5AA2A 3R6UA 4NTLA 3A09A 4POWA 4ESXA 5KCJB 4QSEA 4Z7EA 2R71A 4RPOA 4EQ9A 5KCJA 1XC1A 4ESWA 1POTA 2RCAA 1Y1ZA 4KI0E 2ONSA 3O6IA 5CRYA 2XXUA 3EHTA 3K6WA 3DLNA 1QKAA 2I6EA 2ALUA 1QW0A 4BDMA 1LFIA 5I2NB 2NXOA 3UP9A 2Z22A 4RJZA 5I2NA 2P2AA 5FTHA 4RY1A 2O1MA 3DELB 5I2KA 1B58A 2E0SA 3OEMA 1B0LA 3V5AA 2REJA 3CG1A 2DWHA 5ICTA 5B70A 4ZEKA 2Y7RA 4F1VA 3QK6A 1XOCA 3MWBA 4F19A 1D4NA 2NOOA 4DXCA 1B05A 3T93B 2HAVA 1HSLA 3BKIB 3T9XB 4PETA 1QJMA 3GZGA 4NE4A 3FVKA 2Y84A 5B7DA 3EPEA 5H8NB 4OESA 2UXAA 2ANJA 4G68B 1A40A 2RCBA 4YB5A 1FTLA 5H8NA 4GWOA 1T0KA 1O63A 3MZBA 2DYXA 4THIA 4G68A 3OO9A 3H03A 3MP6A 3JZJA 4GL8A 2VHAA 4XKQA 4YKIA 4OVJA 3M3FA 1A54A 3TFLA 1R9LA 3TKDA 4ZEBA 1LSTA 2YLNA 3OOAA 4U1OA 3USDA 4NEDA 3T96B 1TFDA 4R74A 3MPKA 1I6QA 2D3IA 1MY1A 4BDOA 2F35A 2QRYA 2DSFA 1DTZA 1GR2A 2F8DA 3OO8A 4EDPA 4EF2A 4ZDMA 2CMOA 2O68A 4IY6A 3JYRA 1ZTYA 3PUWE 4N13A 4H67A 3ILUB 1B4HA 5BWJA 1URDA 3TTLA 2F6GA 4GLIA 2Y7WA 4EXLA 3C35A 2F5XA 4F1YA 1Q35A 1UIVA 3ZKLA 3IK6B 2OK2A 1MH4A 2F36A 1OLAA 3N26A 1H45A 5JTYB 4JBZA 3RTWB 3EHSA 1BIYA 4LP2B 2QS1A 5KZTA 4R72A 5JTYA 4LZ5A 3HHGA 3KZGA 4WEDA 4LQ2A 3K6UA 5IAIA 3P7IA 1XT8A 1B52A 4H8JA 1ZBMA 1P1NA 4F22A 3O97A 4PFWA 1YAEA 3Q27A 3O2AA 3O66A 5L9MA 4PFUA 3DP6A 3SESA 4R9GA 1ZU0A 1M5CA 4X1DA 3MBPA 3K1NA 1SW5A 2D21A 5AE4A 4YZZA 5L9OA 4AB6A 4F3GA 4KHZE 1SI1A 3FXRA 4C1TA 1RYXA 3LR1A 3M3LA 5CI5A 1BP5A 4QRZA 4G8MA 3HPIA 5CMKA 3FASA 4ZZEA 5K2XA 4XXUA 4C0RA 1B7UA 3PUZE 1PB7A 1QVSA 2X7QA 1A8EA 4YKJA 3SETA 3IAZA 1JW1A 1JW4A 1M5FA 3RUMA 1B46A 1USYH 3TQLA 1DTGA 1GVCA 3TMGA 2R9JA 3PMVA 2CZLA 1JEVA 5M2VA 3TAJA 4NF5B 3N94A 1PDAA 3VFJA 3S9MC 4KQPA 1FTKA 4G8NA 5FHOA 3O29A 4NF5A 3H6TA 2H5YA 2I58A 3KN8A 3IOVA 3KEIA 2RKMA 4KYEA 2VD3A 1FQAA 5K2YA 3L6GA 1MY4A 3T22A 2I0BA 1D9YA 2DE4A 4M1VA 3TODA 5TPAB 4O3AA 3RQTA 4R2FA 3QUJA 2HQ0A 3W15C 3KOSA 3VV5A 5TPAA 3T9UA 3T9VA 3Q25A 4F1UA 3IOUA 4HTGA 4FATA 2XX9A 1A99A 2XXHA 4I9DA 4F18A 3H06B 2ESNA 2I4CA 2G29A 3ODBA 2DOJA 2A5TA 3RLFE 4TLMB 4FEDA 4MBPA 3HSTA 1IXCA 2I49A 4YMBA 1NNTA 4FJPA 4E0XA 3EF7A 1Z7NE 1Y3QA 2X26A 2HXWA 1MXWA 3GBBA 2GFEA 5I84A 4MF3A 3U93A 1LGBC 2PMSA 4PFTA 4EF1A 1LFGA 3TPAA 1YPNA 3HV1A 1LAHE 3CSBA 4IGTA 3H7MA 1AH5A 4MFIA 3A3CA 1P1OA 1URSA 2G93A 4RYAA 2I0CA 1SYHA 5ISUA 3S9LC 4BDRA 2RC9A 1FTMA 1O64A 4LONB 2GHAA 3KOTA 3TTMA 4U1ZA 3BBRA 1IXIA 5L9SA 1QKBA 3TQWA 2XXWA 4NWCA 1DPEA 3SEWA 2DWAA 4PE5B 4YICA 2XD2A 3QUFA 4POXA 3MPLA 4C1UA 1B5IA 2DWIA 4R73A 1SW2A 3K1MA 3H6WA 4IB2A 3ZKKA 4LVQA 4MLQA 1ANFA 3MVWA 2DVZA 3RGYA 3OSQA 1MQDA 4RNSA 2I3WA 2F6PA 2LAOA 3OENA 3OEKA 4EXKA 1M5BA 4XKPA 2FYIA 4XTCQ 2B3BA 1LCFA 4U23A 3IOTA 4YKKA 5CM6A 2YJPA 4H1XA 3VVDA 3KG2A 3FVGA 1MM7A 4AB5A 3FJGA 3CFZA 3RY3A 3FZVA 1R9QA 3N6UA 4NF4B 1SD3A 1HSJA 4R2BA 2OZZA 5HBCA 2P0SA 4QFPA 4ONYA 4IO3A 5CBSA 4ZEDA 5KDTB 5LOMA 4GL0A 4NF4A 1KWHA 1B7HA 4DDDA 3V83A 5J1DA 3CI8A 1GGGA 5ITPA 1US4A 1JQFA 4OQOA 5KDTA 3AXFA 4NF8B 1B7ZA 3ZSFA 3MQ9A 4H5GA 2DS9A 3C9HA 5DT6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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