1I69A

Crystal structure of the reduced form of oxyr
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
212
structure length
206
Chain Sequence
ETMSGPLHIGLIPTVGPYLLPHIIPMLHQTFPKLEMYLHEAQTHQLLAQLDSGKLDAVILALVKESEAFIEVPLFDEPMLLAIYEDHPWANREAVPMADLAGEKLLMLEDGHSLRDQAMGFCFDTHFRATSLETLRNMVAAGSGITLLPALAVPPERKRDGVVYLPAIKPEPRRTIGLVYRPGSPLRSRYEQLAEAIRARMDGHFD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription
source organism Escherichia coli
publication title Structural basis of the redox switch in the OxyR transcription factor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HYDROGEN PEROXIDE-INDUCIBLE GENES ACTIVATOR
total genus 45
structure length 206
sequence length 212
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-03-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i69A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i69A02
1LAFE 4NF8B 4QFPA 1OMPA 2M8CA 4G68B 4NWDA 4H65A 2XX7A 4YB7A 1XOCA 3B7DA 4ZEKA 5H8HB 4YMAA 4I9DA 3MZBA 3G3GA 5JEIA 2DS9A 1DPEA 3HPIA 4NF5A 1EZPA 2Z8DA 1Z7NE 2PBWA 4LONB 4YKPA 4G8HA 4LATA 4FATA 4M1VA 3MVWA 4F1UA 5A5XB 2OK2A 2F36A 3FV1A 3KGCA 4R74A 3EHUA 1O7TA 2V93A 4IO7A 3LSFB 3M3FA 5K2YA 4QFLA 3ZKKA 3H06B 3KJTA 2F34A 2YJPA 1OVBA 1A8FA 3C32A 4LZ8A 2HXWA 3RTFB 3O6HA 3UORA 2Q9TA 2DWAA 2UXAA 2PT2A 3JV9A 1N0TA 3TTLA 2XXTA 3C35A 2F6GA 4Z0IA 4IO4A 3PGFA 1DSNA 3UIFA 3WAEA 4H8IA 2H98A 1MXYA 3U8QA 2XXQA 2I3WA 2B65A 3CSGA 3QUFA 3IR1A 4OHNA 1AH5A 1Q1KA 1ZKBA 1US5A 1MXVA 3RPWA 4R9FA 4KYEA 3OO7A 5I2NB 1B51A 2XXHA 4H5GA 1FTKA 3KOTA 3CFXA 4RJZA 1LAHE 4GLIA 2ZNTA 2REGA 3VVDA 1M5FA 3O2AA 3PU5A 2OBGA 5AA2B 3EQ1A 4ISUA 3TELA 1IUDA 5ISUA 1B3EA 5H8QB 5B70A 3N5LA 3TMGA 1JVYA 1J1NA 3TYHA 3MVXA 3FATA 3TQWA 4ELPA 3MAMA 5KCJA 2Z23A 3OD7A 4ZEDA 1DPPA 1URGA 4U4SA 5DTBA 4EF2A 2V3TA 1YAEA 5ICQA 1ZTYA 1QW0A 1ANFA 3RY3A 4ZZAA 1Z7ME 4OXVA 1TXFA 1TWYA 3D4GA 4UACA 1B05A 4OFOA 1B2HA 4RYAA 1PBQA 5AA2D 1UTBB 1AOVA 2Z8EA 1LSTA 3TKDA 4PFWA 2XHDA 1D3KA 5I59A 3OOAA 1VSOA 1I6AA 3KEIA 1FQCA 5DVIA 3JZJA 1POTA 1N84A 4OYVA 4F2OA 3MZ9A 2HFBA 3DLNA 1SQYA 4U21A 5CMCA 3G3IA 1LBBA 5EHSA 1B3GA 5KZTA 1URDA 3TFLA 1M5BA 3CG1A 5CMMA 4KYSA 1URSA 2XXXA 3KN7A 4OETA 2UVJA 1LB9A 3R6UA 1SI0A 1GV8A 4G2ZA 4WEDA 4NF4B 4P0GA 4RK9A 4FEBA 3FVOA 3DM0A 3LSLA 2RC7A 3EHTA 4POXA 1NH8A 4JWYA 4F22A 4O3BA 4LZ5A 2R6GE 4L17A 4ELRA 4XXUA 1FQEA 2GHAA 2KLFA 5BUUA 2F8DA 4ELOA 4Z7EA 3S9MC 1FTJA 1YCJA 3HV1A 1Y3PA 4DE8A 2ZYKA 2BJJX 1B0LA 4KR5A 2F97A 4QHQA 3IJOB 1HSEA 3F11A 4NF8A 1D4NA 4G68A 4IO6A 4E0WA 3FIRA 2H25A 4ZZEA 5H8NB 2DE4A 1PB8A 3UK4A 2F7AA 4OFJA 2HZKA 4Q5TA 4EQBA 4P11A 4BDOA 3T96B 2VOZA 1MXZA 3VLUA 3L6HA 1SW1A 4X48A 3VE1B 3KFMA 3MC2A 3O6IA 3CI8A 4IGRA 4GXSB 1A8EA 1WVJA 3VLWA 1BLFA 3K6XA 3K00A 2HEUA 4OMBA 1H43A 1MXWA 2YPNA 4GD5A 4OTEA 1N76A 2HZLA 3Q28A 3MP6A 1RYXA 5KCJB 4TQUQ 4ZEFA 2ZYNA 2X7QA 2GH9A 3E9XA 3R7XA 5HM4B 4R6HA 3OENA 1S9TA 1QKAA 5CBRA 3PMWA 1POY1 1SVXB 1YTVA 3MPLA 3HHGA 5DEXA 4EQ7A 3U1OA 2XXIA 3U93A 3TQLA 1R1NA 1PB7A 3OELA 3SEYA 3FZVA 4ZECA 1GGGA 1SBPA 3AXFA 5CMBA 3GBBA 3GZGA 1NL5A 4PP0A 3D4CA 3T66A 3OEKA 1QKBA 3ZKLA 2XXWA 3MPKA 3PMVA 3H03A 1FQAA 5FTHA 4H67A 1SW4A 5AA2A 2H9BA 1Y1MA 1XHYA 3W9VA 5F7VA 4EF1A 1FTMA 3CSBA 1Y3NA 3GLBA 3IO6A 1Y3QA 3RUMA 4GRKA 2DSFA 2QS4A 5EYFA 1S50A 3TCHA 5I58B 1LBCA 4Q0CA 4KYDA 3S2VA 3V5AA 2THIA 1WDNA 4N07A 3ECRA 1H45A 4F3GA 1TFDA 2RCAA 4HTGA 4RK2A 2OZZA 3MBPA 5JTYB 4MBPA 2I4BA 1OQHA 2F5XA 1FQDA 3PUZE 4O3AA 2O7IA 1UTBA 3CFLA 1B32A 3QK6A 1FTLA 2I6EA 3FV2A 3OMBA 4F3SA 2DYXA 1BTJA 4X1BA 4JDFA 4N6PA 3T93B 4IO3A 3TTRA 2QMXA 3RGYA 2O68A 1M5CA 4PFUA 3S9NC 4YMBA 3G3FA 4GIZA 5FHNA 3HO7A 2VGQA 4DDDA 3KN8A 4ESWA 1UIUA 4F3PA 2VP1A 4TOZA 1PDAA 1N3XA 3VVFA 4NF4A 1BIYA 5H8FB 4U22A 1XVYA 1OVTA 4N13A 2VHAA 4C1TA 1USYH 2I58A 4OZ9A 3OO9A 1IIWA 4G77A 3KBRA 3G7WA 2O69A 4IO5A 3LSXA 1NMUA 3M3LA 3V8XB 3ZS6A 1LAXA 3V83A 3PD8A 4G68C 4QF9A 1QULA 4BDQA 2IA4A 1B40A 2LAOA 4JSDA 2ONKE 5DEXB 4G4PA 1IXIA 3SEWA 1NKXA 3IX1A 1R9LA 3QYTA 3MVZA 5TP9B 3K0VA 1JW4A 5FHMA 3FJMA 3FXRA 3KOSA 3I6VA 2UVGA 1ZBMA 3HCQA 1EZ9A 5H8NA 4FECA 1TT1A 1B5JA 4XKRA 2A5SA 4XKNA 2ZMBA 3LR1A 1A7LA 3O97A 4C0RA 5DT6A 1CE2A 5ICTA 1B5HA 2DVCA 4FAJA 4R6KA 4ZEBA 2H5YA 3KG2A 4KCDA 4DCYA 1MXUA 4UA8A 1EZOA 4IO2A 1MH3A 1AL3A 3QIMA 3T9UA 4IY5A 5CM6A 1O64A 1MPDA 1FTOA 1MPCA 3TTNA 3A3UA 1BP5A 4DXBA 3IB0A 3FVGA 2V3QA 3K6VA 3FXUA 1T0KA 3U92A 4ECFA 2Q89A 3R26A 1HSLA 1N7WA 1B3LA 1MPBA 1QUJA 1O63A 3VXBA 1B7HA 2F35A 4NEDA 1JEUA 1P1WA 4GL0A 4Q30B 4R75A 2O7UA 3KJ7A 3BFUA 4EUOA 4EXLA 3ODBA 2H99A 4YKKA 4IGTA 3K2DA 3THIA 2DWJA 1P1QA 3K02A 1VFDA 1MM6A 1B6HA 3W15C 3K1PA 3OO8A 1UIVA 3TCGA 1Y4CA 4OFLA 1Y4TA 2DP8A 2I0CA 3B6WA 4GL8A 4OQOA 2QMWA 3KZGA 1JVXA 4WEPA 3O29A 3Q27A 3MJNA 4F3BA 3PPQA 4LQ5A 3FGSA 4IY6A 3IJXB 1GTKA 1AIVA 1USYE 2QS1A 1TFAA 3JYRA 2RC8A 1B52A 4F2QA 4U1ZA 3C31A 3G3JA 4M4GA 2YLNA 1B4ZA 3PPNA 3CVGA 1IXHA 1LFGA 3V89B 3U72A 5BWJA 4I8CA 4THIA 3TTMA 5L8DA 4KD5A 1WODA 4MLVA 2Y7PA 4GQOA 3BBRA 1Q35A 5AA4B 3IB1A 3FJ7A 1B46A 3QUJA 5DVJA 4GF8A 3ILTB 4OENA 1P1NA 2UYEA 3BKIB 4I62A 4QRZA 1RKMA 3IO4A 5I58A 4GFRA 2DXRA 1MG1A 2DOJA 4HCYA 1CB6A 4YZZA 1A40A 2NOOA 3FD3A 2Y7WA 4JB7A 2Y7RA 3I5OA 2B3FA 1M5DA 4U4XA 4FIMA 1NNFA 1Y9UA 5JTYA 1JETA 2FNCA 4MF3A 2XD3A 2VD3A 1I6QA 2PT1A 3O6GA 1B58A 1YPNA 1DOTA 3TCFA 2QS2A 3PMXA 3P7IA 2HAUA 4H5FA 3C4MA 1QJMA 1P1UA 2ALUA 4EQ9A 1JEVA 3EHSA 1MDQA 3O9PA 1H3DA 3MP1A 4KHZE 1JW1A 3PUYE 1IXGA 3RNNA 4ELQA 3IOWA 3S4UA 1MH4A 4BDMA 4PFYA 4ONYA 3RQTA 3UN6A 4FJPA 2XXUA 1GR2A 3HSTA 2RINA 3VXCA 3H6UA 5ITOA 4KCCA 1EU8A 2G93A 3TZAA 1AMFA 4FEDA 2OWSA 3FVKA 2Q8JA 5H8FA 4RNSA 1JW5A 3RT6B 2NXOA 4LQ2A 1DMBA 4XIGQ 4DZ1A 3TTKA 1PEBA 4U2RA 1I69A 4E0XA 5B7DA 3Q29A 3RTWB 4R2BA 3N94A 2HCAA 1EH3A 1NNPA 3USDA 1MQGA 2E1SA 1KWHA 3SEUA 4GVOA 2NUVA 3B6TA 1R9QA 2DE2A 4F31B 4F29A 1NH7A 3DP4A 5TP9A 3EN3A 4K3FA 3E13X 4EXKA 3OSRA 5I56B 4KPTA 1XS5A 3FJGA 4RY1A 1I6BA 4HS7A 4QSCA 3N26A 4LZ7A 5FTIA 1B9JA 1OIBA 4YKJA 1B1HA 4LUBA 5EHMA 1B4HA 4QSDA 1HSJA 4OVJA 2V84A 2GFEA 3PUXE 4YU0A 1ZJLA 4H1XA 3FASA 1MDP1 2F7BA 2HAVA 1B7UA 1LAGE 4XKQA 3PUVE 1Y1ZA 1MQDA 1N7XA 4G8MA 1N04A 5J1DA 3VLVA 1FQFA 4I1DA 3E4RA 2E0SA 4POWA 4XTCQ 2ZNUA 3K1MA 4F18A 5I57A 5F1QA 3A3CA 1VFEA 3I3VA 3PPRA 3OO6A 3FVNA 1MY1A 2Z22A 3SKPA 2XXYA 3K01A 5HPQA 5ELVA 5ITPA 2AIXA 3UA8A 4Q8RA 3FXQA 3PD9A 4DIGA 1LGBC 3B6QA 4HCWA 3H6VA 2AYSA 1NNKA 2O84X 4JWXA 2UVIA 5DVFA 4MFIA 3VFJA 3OEMA 4BDLA 4LP2B 1RYOA 3LC8A 4QFKA 1QVSA 3U94A 5FHOA 4EDPA 3M3KA 1NFTA 4WKMA 3TUSA 3PV0E 3LBSA 2Y7KA 4NF6A 2QPQA 4DLDA 1MY2A 1II5A 5I84A 3OXNA 1XVXA 3ILUB 2DVZA 4RPNA 2GHBA 2W7YA 3FUZA 2UYFA 4OWDA 3K6WA 5AE4A 3SERA 3K4UA 2RCBA 5AA4A 5CMKA 4NWCA 3QAXA 2I0BA 4H8JA 4ND9A 3C9HA 4F1VA 4JBZA 3Q26A 1D9YA 1P99A 2XXVA 1SYHA 3SETA 2R9JA 2PVUA 4OEVA 5DYHA 1ZU0A 2A5TB 1H44A 4YAHX 3S9EA 4QFOA 2NWJA 3HN0A 4ZE8A 4KQPA 4TLLB 1SI1A 4ZEIA 4AQ4A 2XX8A 3OSQA 3N6TA 1LCTA 1LB8A 3LUYA 1ZLQA 3CFZA 4R73A 3MZ1A 4LA9A 4ESXA 4JXIA 4DXCA 1B0HA 1H76A 3LSWA 2PX1A 2FA7A 1SD3A 3TAJA 2X7PA 4LVQA 2UVHA 3H6TA 2XXRA 3S9LC 4R9GA 2O51A 4R6YA 4NTLA 4KI0E 3UP9A 3RLFE 1GVCA 4BDNA 2OWTA 2R71A 1IQ7A 1MQHA 3MUQA 3PPOA 4F1YA 4RA1A 4JWOA 4F39A 4JSOA 3H6WA 3T9HB 1MQJA 5I57B 4P0IA 3H4ZA 3ZSFA 1MM7A 5I2KB 4X1DA 4G8NA 2PMSA 3IK6B 3VVEA 4YB6A 3RT8A 2B3BA 1VR5A 4H6DA 3T22A 1US4A 5TPAB 2Q2AA 4RPOA 4TLMB 4H0WA 3QXMA 2RC9A 3CRBA 1MXXA 5I56A 2ZXTA 5L9MA 4OESA 1JNFA 1ZIUA 4XKPA 4IB2A 2QL3A 2H4IA 1NNTA 1VE4A 1PBPA 4R2FA 3MQ9A 3DELB 3CIJA 1JQFA 3M8UA 3IB2A 4NF6B 1OQGA 5HBCA 2I3VA 4ZDMA 1LLSA 3VV5A 4F19A 4PE5B 4NF5B 3O66A 1PB9A 2QJEA 4QSEA 2I4CA 2XXPA 2RF1A 1LFIA 4PFTA 2Q2CA 2ONSA 3IORA 3IOVA 3KN3A 4C1UA 2ONRA 1FCKA 2D3IA 1SYIA 2AL4A 2ABHA 2VD2A 2QSXA 2PYYA 3C34A 3CG3A 4U1OA 1L5TA 2DWHA 5KDTA 4GWOA 4NMYA 3MVYA 3GXAA 4MLQA 1P1OA 3K6UA 1D9VA 4GXAA 1UTHA 3EPEA 1DTZA 1ATGA 2IEEA 1N3WA 2O1MA 2ZYOA 1B1XA 2FYIA 2WKYA 5CC2A 4YICA 5IKBA 1UQWA 1SW2A 3WAFA 3UGWA 1MS7A 1A99A 3KSJA 2V3UA 1A55A 1Y20A 4NE4A 1MRPA 3E3KA 2DQVA 5CBSA 1IEJA 2ZYMA 3IL1B 3SEXA 5LOMA 5JK4A 2O6AA 2CZLA 4YB5A 5H8HA 3Q25A 1IZ1A 2F78A 3C36A 1XT8A 4ZE9A 3DP6A 1MY4A 3SESA 2F6PA 2F7CA 2ZNSA 1MQIA 5TU0A 1LCFA 5A5XA 2ESNA 4U23A 1QUKA 4AB5A 3TPAA 1FQBA 4BLAA 2HQ0A 3QSLA 3G3HA 3SDFA 3A09A 4PQJA 5AA1A 4DCXA 1S7YA 3H3GA 2P2AA 2A5TA 1B5IA 1B3HA 3K1NA 2REJA 1XC1A 3PUWE 3GBAA 3O28A 2ANJA 2RKMA 1MY0A 2DXYA 5AA3A 5L9SA 2Y7IA 3TEPA 2Q88A 2GRVA 3CR9A 1PC3A 3KSXA 4KFQA 2Z8FA 1LFHA 3C33A 3L6GA 2D21A 2XD2A 5I59B 3DP8A 2Y84A 3H7MA 4HW8A 4OEUA 1B7ZA 3IOTA 3BFTA 3G3KA 3MWBA 4AB6A 2X26A 1ELJA 1B3FA 5I2NA 1FW0A 1OLAA 2DE3A 4O3CA 5CI5A 1DTGA 2XX9A 4YKIA 1F9BA 1SW5A 2D5WA 3PPPA 2V25A 3ONMA 3TODA 2NVUB 2G29A 3VDFA 1M5EA 4FE8A 3MP8A 4MH5A 4R72A 5H8QA 3TDJA 1IITA 2O1LA 4BDRA 4GOTA 4FORA 3T9VA 5KDTB 5M2VA 1A54A 1BKAA 1OLCA 2CMOA 4QFNA 5H8SA 3SEVA 1QUIA 5I2KA 2OLBA 2QS3A 1UTHB 3HHFA 1R6ZA 1MY3A 5L9OA 4DXUA 3W9WA 3T9XB 5TPAA 2I48A 5IAIA 2AL5A 1ZMGA 1SDXA 3MW0A 2P0SA 5CRYA 2OJTA 4OERA 3RN8A 4PETA 4ZS9A 4WXJA 2DWIA 3N6UA 5K2XA 3EF7A 3IAZA 2QRYA 2I49A 4RXLA 2P1SA 3IOUA 2OCUA 4X9TA 1IXCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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