5EYFA

Crystal structure of solute-binding protein from enterococcus faecium with bound glutamate
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
EDILERSKSTNEIIWGVKYDTRLFGMMDIESRTVQGFDVDIAKAITKKILGDNGKTEFVEVTSKTRIPLLKNGNIDAIIATMTITDERKKQVDFSDVYFDAGQALLVKKGSQIKSVDDLNASTTVLAVKGSTSAANIRQHAPDAKILELENYAEAFTALQSGQGDAMTTDNAILLGIADENPEYELVGGTFTNEPYGIAINKGQENFLKAVNQALEEMHADGTYDKIYQKWFPNETEGKVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate ABC superfamily ATP binding cassette transporter,
publication title Crystal Structure of Solute-binding Protein from Enterococcus faecium with Bound Glutamate
rcsb
source organism Enterococcus faecium do
molecule tags Solute-binding protein
total genus 71
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5eyfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5eyfA02
3ZSFA 2DVZA 4P11A 3A3CA 1TXFA 4XKRA 1P1QA 3O2AA 5HPQA 2DWAA 1XVYA 4RNSA 4OFJA 3ILUB 1EZ9A 1H43A 1FQFA 1CE2A 4H8IA 4FIMA 4RK9A 4E0XA 2VOZA 1T0KA 2D5WA 5M2VA 5I57A 4PQJA 4O3CA 1MPBA 3CSBA 1BLFA 2REGA 5CMBA 2HAUA 3OEMA 2O51A 2OK2A 3ZKLA 3G3JA 4G8MA 2OWTA 3O9PA 1UTBB 4ESXA 4GFRA 3VV5A 2Y7WA 2QPQA 1OMPA 1AMFA 3BFUA 2B3FA 3CG3A 5B7DA 4MLVA 1QVSA 1B46A 2BJJX 1M5CA 1WODA 4IO4A 5L9MA 5TPAA 2A5TB 3K01A 1IXGA 4DLDA 1OQGA 2DSFA 1HSJA 3EQ1A 3TCHA 4NF8A 3S9MC 1JW5A 1MXYA 1F9BA 3K1NA 1IXCA 4HCWA 3EHSA 3HN0A 1B05A 4EXLA 3G7WA 5EYFA 3SEVA 1B9JA 2F35A 4GQOA 4ZEKA 2VD2A 1ZLQA 1FQCA 2PT2A 1MG1A 4OTEA 1DPEA 2M8CA 4QFLA 4G68C 3MVYA 4XXUA 1SI1A 2Q9TA 4GD5A 3EF7A 4KI0E 1US5A 2PBWA 4GIZA 2QJEA 1ZMGA 2W7YA 4U1ZA 5AA3A 3MJNA 3W9WA 4X48A 4ESWA 1N7WA 2DXYA 3FUZA 2VD3A 1GV8A 4OWDA 1O63A 4GWOA 4KQPA 3HPIA 1FTLA 5KDTA 1LFHA 2G29A 4NF4B 3DLNA 1R9LA 4TQUQ 4G68B 3C4MA 1QUJA 4HS7A 4F18A 3RLFE 2R9JA 5DT6A 2GRVA 5ICTA 4DXCA 2ONKE 1B0HA 2A5TA 2QS1A 2CZLA 3TCGA 1MQHA 1HSEA 1SYHA 3M3LA 3K6XA 3F11A 2ZMBA 3OSRA 3H4ZA 4KCCA 5J1DA 2OJTA 2XXXA 3O97A 4ZDMA 3K0VA 1MH3A 3T9VA 3MC2A 3ECRA 2F7CA 3KOSA 3AXFA 2O84X 2X7QA 5DYHA 3V89B 4C0RA 1MY2A 5KZTA 4G2ZA 5I2KA 3IB0A 4H65A 1A7LA 3T93B 3K6WA 2D21A 2X7PA 3FXUA 2AYSA 1PB8A 4BDNA 4TOZA 2H9BA 1YPNA 1SYIA 4RPNA 4UACA 1SBPA 1B3HA 5H8FB 1QUIA 3A3UA 2ONRA 2O69A 3O66A 3JZJA 3ONMA 4LATA 2V3UA 1MM6A 1EZPA 3K6VA 1FTJA 1VR5A 2V3QA 2XXPA 2O6AA 1S7YA 3B6QA 3TPAA 4NWCA 4U4XA 1MQJA 3DP6A 2XXWA 3E9XA 3UN6A 5FTIA 3PD8A 4RYAA 1NH8A 4JSDA 3VVDA 5KCJB 4IO2A 2YPNA 1UTHA 3IL1B 2UXAA 5I84A 4R73A 3ILTB 4NTLA 3UGWA 2GFEA 3OD7A 2F6PA 4XIGQ 5H8HA 3H03A 3Q28A 2H4IA 3G3FA 3FZVA 1VE4A 1II5A 3BFTA 1MY3A 2P2AA 4GRKA 1FW0A 4FEDA 2HCAA 3TELA 2ZNTA 3V8XB 4LONB 5JK4A 2THIA 2PT1A 3G3HA 5ITPA 1Y4TA 1DPPA 1POTA 3RTFB 4ELPA 4R6YA 4DCYA 1SW4A 1OLCA 4TLMB 3H7MA 1MXWA 4U22A 2ZYKA 2AL4A 1MPCA 5H8FA 3TTKA 1AH5A 3VVEA 3CIJA 1LB8A 2HAVA 3CVGA 4E0WA 4NF5B 2I4BA 3USDA 3PGFA 3PUXE 3LR1A 4ND9A 1PEBA 4WKMA 2ZNUA 3FIRA 3EN3A 3PPQA 3SDFA 1H3DA 4LQ2A 5AA2A 1D9YA 1FTKA 5I59A 4MFIA 2Z22A 3FV1A 4ISUA 3IB1A 4DIGA 2VHAA 1B58A 2XX8A 3RUMA 2Z8EA 4Z7EA 1JETA 5JTYA 4BDQA 2DWIA 4L17A 2UVJA 2F97A 4F19A 1A8EA 3PV0E 3TEPA 2FYIA 3K2DA 1B5JA 3FGSA 3QK6A 3KG2A 4IGTA 2OWSA 2DQVA 4QSDA 1GR2A 3K1PA 2QS4A 4EDPA 3M3FA 4EXKA 5I57B 1FTOA 1DOTA 2DE2A 3C32A 4THIA 4Z0IA 1SD3A 5LOMA 4QFPA 1S50A 2OCUA 3O6IA 5AA2D 2F7BA 5EHSA 2UYFA 3S9NC 3SETA 4XKPA 3R6UA 4LZ5A 5DVIA 4YKJA 4ONYA 1RYXA 2XXYA 1Y3QA 2Z23A 4GF8A 3KN3A 1M5FA 4N6PA 2I4CA 1YCJA 3VFJA 5TPAB 3CFXA 3PMXA 3FD3A 4ELQA 4F1UA 1B3EA 1LB9A 4PFTA 1NNTA 1B5HA 4NF8B 1D4NA 1MQIA 1D9VA 3RGYA 3TQLA 1Y3NA 4YKKA 3S2VA 2HXWA 4R6KA 3IB2A 3JV9A 3DP4A 3TODA 3Q25A 2IEEA 2ZNSA 3OELA 4EUOA 4H0WA 1ZBMA 3IX1A 3MBPA 4OESA 1IXIA 1YAEA 4IGRA 4R9FA 1URDA 2XD2A 1N76A 3E13X 1HSLA 4POWA 4BDLA 3QYTA 3KN7A 1IUDA 5DVJA 3VLUA 3VXCA 4U1OA 3KFMA 1QUKA 3R26A 3OO9A 3I3VA 4EF1A 5H8NA 2QL3A 3S4UA 4R74A 4M4GA 3Q27A 3QAXA 4I1DA 1S9TA 4O3BA 4PFWA 3QSLA 5KDTB 4H1XA 3C9HA 3EPEA 4YB6A 5ITOA 4PE5B 3MWBA 3PUVE 4F22A 2QSXA 1Q35A 4X1BA 5F7VA 4R75A 2KLFA 2CMOA 3GBAA 2R71A 3TZAA 3FVKA 1AOVA 3H6TA 3IOVA 3N5LA 3KZGA 4LZ8A 2Y84A 4ZEDA 3DP8A 1OIBA 2NVUB 2Q8JA 2ALUA 2HFBA 4KHZE 4MBPA 3FATA 5CMKA 3OXNA 4G8HA 1J1NA 2QMXA 4XKQA 3KGCA 4U4SA 3Q26A 3IOTA 4YB5A 3EHTA 5CI5A 4RY1A 3N6TA 5I2KB 1B3GA 4R2FA 3M8UA 1P1UA 4ZEFA 1NNKA 3TQWA 5DEXA 1SW1A 4JWXA 3OO6A 2ESNA 1O7TA 3G3KA 2IA4A 4F3SA 2RC9A 4KFQA 1XHYA 5I2NA 4O3AA 4KPTA 1NNFA 1M5BA 3VDFA 1LCFA 1ZJLA 3IJXB 4DCXA 1B40A 4QHQA 4G8NA 2RC7A 4H6DA 4PP0A 3SESA 4RPOA 3V5AA 3C36A 3PUZE 4YKPA 3RTWB 3M3KA 3WAEA 1XS5A 1IIWA 2RC8A 1LFIA 1CB6A 3CRBA 4IY5A 1MQGA 4OERA 1UTHB 1OQHA 4YMAA 4ZE9A 1TT1A 3TMGA 5H8HB 3TAJA 3B7DA 2QS2A 3PMVA 3PU5A 1N3XA 3PD9A 2Q89A 1FQBA 3IR1A 1USYH 3O29A 3OMBA 3T9XB 4F3GA 3MP8A 4NWDA 5AA4A 2Y7RA 3T66A 2DP8A 2XXVA 4AB6A 3S9EA 3PPRA 4OETA 2LAOA 1VFEA 2NOOA 2XXUA 3TUSA 5FHMA 4IO7A 4RXLA 4OFOA 3O6GA 5HBCA 1Z7NE 1TWYA 1B51A 1B1XA 2OLBA 2VP1A 1MY4A 1I6AA 3TTMA 4LP2B 4OEUA 1MM7A 4P0GA 3HV1A 1B4ZA 1Y20A 3MZ9A 5AA2B 5I59B 3VE1B 3TTRA 1JW4A 2H99A 4QFNA 3W15C 4POXA 1LBCA 4BDRA 1B7HA 4H5GA 3OO7A 3MP6A 5JTYB 4WXJA 2DE4A 3WAFA 4XKNA 4OQOA 2I0BA 3T9UA 3KEIA 4F31B 1FQAA 3QUFA 1SVXB 3LSXA 3I5OA 3GXAA 1NMUA 2O1LA 5FTHA 2DS9A 3H6WA 4ZZEA 1UIUA 3FXQA 3SEXA 1B7UA 4F3PA 2XXRA 5A5XA 5F1QA 3SERA 1A40A 4EF2A 1N3WA 3FVOA 3IORA 3ODBA 4P0IA 2V84A 1IQ7A 1GTKA 4OENA 4YZZA 5EHMA 2Z8DA 1R9QA 3UP9A 3C33A 1AIVA 1BP5A 1IITA 2GHBA 1Q1KA 5DTBA 3OENA 3RNNA 3VLVA 3CG1A 2PX1A 4N13A 2GHAA 2F6GA 4X1DA 1SW2A 4IO5A 2ZXTA 2PVUA 4F1VA 2F7AA 1YTVA 5I56A 1A54A 1USYE 3RT8A 3IK6B 4JDFA 4KYDA 2OZZA 5FHNA 1JNFA 4N07A 2F8DA 2I3VA 1B5IA 3MPKA 3MQ9A 4ZEBA 3VVFA 4I9DA 5L8DA 4PFUA 3K02A 4NF6A 1Z7ME 2B65A 1I6QA 2I58A 3PUWE 4PETA 2HEUA 3MP1A 2FA7A 1PBQA 4F39A 1L5TA 1NKXA 4K3FA 1FQDA 3MVXA 4ZE8A 1LBBA 4JXIA 5I58A 5AE4A 2D3IA 3TDJA 5H8NB 1EZOA 1QKBA 3D4CA 1MXUA 3C35A 5L9OA 2Q88A 4MLQA 3VLWA 2RF1A 3BBRA 4MH5A 4DXUA 3DELB 3TTLA 2ZYNA 1N84A 4JB7A 4ECFA 3FVGA 2XHDA 2DWHA 3H6VA 1RYOA 1H44A 5IAIA 1MY0A 1MRPA 5BWJA 2PYYA 3KN8A 1D3KA 3FJGA 3D4GA 4H8JA 4JSOA 1KWHA 4G4PA 1N04A 4FJPA 3LC8A 4YB7A 5CC2A 2Y7KA 5CBSA 4GOTA 3LSLA 4R9GA 5JEIA 4KYSA 3K6UA 4KD5A 5TP9A 5TU0A 1M5EA 4ZZAA 3OOAA 3C34A 3KSXA 1N7XA 5DEXB 3THIA 3MUQA 5ICQA 1DTGA 3JYRA 1OLAA 1LAXA 1Y4CA 3ZS6A 4BDMA 1I69A 3T22A 1ATGA 2F34A 3KBRA 3KJ7A 1H45A 2YJPA 5I2NB 3MAMA 4RJZA 1JVYA 1POY1 4U23A 4DXBA 3MW0A 1ZIUA 2XXTA 3KOTA 4WEPA 5H8SA 4F2QA 2G93A 1DTZA 5CRYA 5ISUA 1B4HA 2ONSA 3UA8A 4ELOA 4KCDA 2Y7PA 4YU0A 3N94A 1DSNA 1LAFE 1JW1A 1OVBA 5B70A 4BLAA 1B7ZA 2XX9A 3S9LC 1MXZA 3SEWA 4QF9A 3FVNA 2OBGA 3HCQA 1JEVA 3IJOB 1EU8A 4I8CA 1B32A 4OHNA 4QFKA 4KYEA 4F1YA 4DE8A 3PUYE 1B3FA 3IO4A 3FV2A 1NFTA 3LBSA 2V93A 4NMYA 1P1WA 4LZ7A 5AA4B 3KSJA 1QJMA 2H98A 2P1SA 2HZKA 4G77A 4U21A 1B0LA 1SI0A 3MVZA 3QXMA 1FTMA 3T96B 5CMMA 4LQ5A 1PB7A 3G3IA 2R6GE 4LUBA 2ANJA 3RY3A 1AL3A 3CR9A 2AL5A 4FE8A 4ELRA 4OFLA 2UVHA 3IO6A 4IO3A 3DM0A 1JQFA 1SW5A 1TFAA 1P99A 1LAHE 4YKIA 2DE3A 3I6VA 2DOJA 2PMSA 1B3LA 2YLNA 1IEJA 3IOWA 1R6ZA 4EQ7A 2RKMA 2UVIA 5CM6A 1O64A 1LAGE 3SEUA 1BIYA 1MS7A 4JWYA 4GL8A 2VGQA 3Q29A 1FQEA 4GXAA 1B6HA 1MPDA 3H6UA 4EQBA 4FAJA 1M5DA 3PMWA 4H5FA 1UTBA 3FASA 2HZLA 3IOUA 2O68A 3T9HB 3N26A 3PPNA 4GL0A 4IB2A 1EH3A 2I0CA 4C1UA 3EHUA 1XVXA 1NH7A 1OVTA 2XD3A 4QRZA 1PB9A 2Q2AA 1R1NA 4OVJA 1ANFA 3SEYA 5A5XB 1ELJA 5K2YA 3U94A 1WDNA 1JEUA 3TYHA 2RINA 4TLLB 2REJA 3IAZA 4YICA 1UIVA 3SKPA 1Y3PA 2Y7IA 2XXIA 1H76A 4UA8A 1XT8A 2V25A 3L6HA 4DDDA 1P1NA 3K1MA 4FATA 1DMBA 2E1SA 3HHGA 3HHFA 4RA1A 4Q0CA 3MPLA 2DYXA 2I48A 4OXVA 3E3KA 4MF3A 3K00A 3B6WA 2RCAA 3U93A 5BUUA 4F3BA 3FJMA 2QS3A 1TFDA 4FECA 3FJ7A 2ABHA 2AIXA 4M1VA 1MXXA 2O1MA 1QULA 5I56B 1PBPA 1GVCA 5H8QB 1IXHA 3RPWA 4F2OA 2P0SA 2QRYA 4DZ1A 3L6GA 4LA9A 4NF6B 1PDAA 4JWOA 2QMWA 1VFDA 3MZ1A 4NF4A 4G68A 2NUVA 3O6HA 4HCYA 3RT6B 3OEKA 4R72A 2Q2CA 4NEDA 4QFOA 3P7IA 1LFGA 3LSFB 1SQYA 2DXRA 5I58B 1IZ1A 2UYEA 4OZ9A 4HW8A 4Q8RA 1URGA 4OEVA 3CFZA 1A99A 1I6BA 3B6TA 1QW0A 2HQ0A 4C1TA 2I6EA 1NL5A 4YMBA 3RN8A 1Y9UA 1N0TA 1RKMA 4R6HA 1LCTA 2DWJA 2WKYA 4R2BA 4ZS9A 1B52A 3E4RA 3LUYA 4F29A 2X26A 2O7UA 2A5SA 1GGGA 1LLSA 4I62A 3TFLA 2DVCA 3GBBA 4AB5A 4GVOA 4HTGA 3N6UA 3ZKKA 5CBRA 3G3GA 2E0SA 3K4UA 1BKAA 3KJTA 3CSGA 3HSTA 4EQ9A 1URSA 2F5XA 4BDOA 5H8QA 4RK2A 2H5YA 5TP9B 4YAHX 5DVFA 3GLBA 3U92A 1P1OA 3VXBA 2Z8FA 3H06B 4FORA 2NXOA 4ZEIA 4IY6A 2UVGA 3UORA 2O7IA 4IO6A 4Q30B 1LSTA 3A09A 2ZYMA 4Q5TA 2F36A 3MVWA 5IKBA 5KCJA 5AA1A 1MDP1 1MY1A 4WEDA 1A55A 2GH9A 3CFLA 1FCKA 4GLIA 2FNCA 3W9VA 1WVJA 1XOCA 4AQ4A 1ZTYA 4X9TA 2B3BA 2XX7A 2I49A 3HO7A 2XXHA 5K2XA 4PFYA 1A8FA 3OSQA 3BKIB 1LGBC 3CI8A 3GZGA 1B1HA 3V83A 4JBZA 5ELVA 3O28A 4ZECA 1Y1MA 1ZU0A 3QUJA 1US4A 3LSWA 4QSEA 1MXVA 3C31A 4GXSB 1B2HA 2V3TA 1QKAA 1NNPA 1VSOA 1ZKBA 2H25A 1JVXA 5FHOA 5HM4B 3PPOA 4OMBA 4OYVA 2XXQA 3TTNA 1SDXA 1UQWA 4U2RA 3QIMA 4QSCA 2RCBA 4KR5A 4FEBA 1PC3A 3RQTA 3U8QA 4XTCQ 1XC1A 3FXRA 3UIFA 3TCFA 1MQDA 5L9SA 3MZBA 4NF5A 2NWJA 3U1OA 3TKDA 3U72A 1MDQA 3R7XA 1MH4A 4H67A 3OO8A 4NE4A 2ZYOA 4LVQA 2I3WA 3PPPA 1Y1ZA 2F78A 3H3GA 3UK4A 5CMCA 1BTJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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