5EYFA

Crystal structure of solute-binding protein from enterococcus faecium with bound glutamate
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
EDILERSKSTNEIIWGVKYDTRLFGMMDIESRTVQGFDVDIAKAITKKILGDNGKTEFVEVTSKTRIPLLKNGNIDAIIATMTITDERKKQVDFSDVYFDAGQALLVKKGSQIKSVDDLNASTTVLAVKGSTSAANIRQHAPDAKILELENYAEAFTALQSGQGDAMTTDNAILLGIADENPEYELVGGTFTNEPYGIAINKGQENFLKAVNQALEEMHADGTYDKIYQKWFPNETEGKVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Solute-binding protein
molecule keywords Glutamate ABC superfamily ATP binding cassette transporter,
publication title Crystal Structure of Solute-binding Protein from Enterococcus faecium with Bound Glutamate
rcsb
source organism Enterococcus faecium do
total genus 71
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5eyfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5eyfA02
1MPDA 1LLSA 1IITA 3B6QA 4XIGQ 2ONRA 3CRBA 3PPPA 4EXLA 1O64A 2NVUB 4GF8A 3MVZA 4R2FA 4OTEA 5DEXA 4EQ9A 3C35A 5DVJA 4DIGA 3TQWA 3PUZE 3T9XB 4IO3A 4YICA 4HS7A 3G3GA 1ZKBA 3CG1A 2QS1A 1XT8A 4TOZA 3K6UA 4YB5A 1B4ZA 4ZZAA 1SI0A 1UTBB 3K01A 4YMAA 2PX1A 4FEDA 3OOAA 4BDOA 4PFWA 1QKAA 3TTRA 4I9DA 4G4PA 3R26A 4QFKA 2UVHA 1MQIA 4C1UA 3BBRA 3ZS6A 4G8NA 4MLQA 3G7WA 1SQYA 4EQBA 2XX8A 1UTBA 1LGBC 1FTOA 4ZZEA 4KCDA 4ISUA 3IR1A 3VVFA 3IAZA 1FQBA 2THIA 1ZLQA 2Y7IA 4G68B 5FHMA 4RXLA 3CFXA 2F36A 1URSA 3TCFA 3HHFA 5L9SA 1M5BA 5H8NB 2ANJA 1UQWA 3TMGA 1B3GA 3VDFA 2V84A 3FD3A 1B3FA 4OYVA 3VFJA 2F7CA 3PPRA 3I3VA 3UIFA 2YLNA 3FVKA 3FATA 2DP8A 5I2NB 4RK2A 1PEBA 4EUOA 4G68A 4KI0E 4QFOA 1AH5A 1JEVA 1B3EA 5H8NA 3KFMA 4NF4B 2XHDA 1Y3QA 4TLMB 4DZ1A 4GQOA 1P1OA 3Q28A 1MXVA 1FQCA 3U93A 2XD3A 4K3FA 2XXWA 3A3CA 5I2NA 3FVGA 1PBQA 4U23A 5H8HB 3EPEA 1A54A 3FV2A 3HV1A 1TFAA 4O3CA 3T66A 3K02A 1D9YA 3TTMA 1QUKA 3H7MA 4G8MA 4ELQA 5HPQA 1H3DA 4NF4A 4XKNA 4U21A 1TT1A 3O97A 5AA1A 1OQGA 3PGFA 3O29A 5LOMA 3LSXA 2XXRA 3SKPA 3FVOA 2O7UA 4KHZE 5AA4A 3IOVA 4JXIA 3RUMA 2XXPA 1ZBMA 4F3BA 3WAEA 2P2AA 5I56B 1I6QA 2V3QA 4H8IA 3E13X 1FTLA 2RC9A 1DMBA 2ZYKA 4N07A 5EHSA 1R9LA 4ZEKA 2UVIA 1DSNA 2UYEA 3VVDA 1FTJA 1RYXA 4KYEA 4IO5A 2F97A 1JW1A 4ZEIA 2OBGA 2ONKE 5ICQA 3T9UA 5I56A 2RKMA 4ZE8A 2H5YA 4LQ5A 1N3WA 4IGRA 3RN8A 1ZTYA 2NWJA 1POY1 4ND9A 1LSTA 4EDPA 1ZIUA 3E4RA 1LAFE 3TDJA 4JWXA 4R9FA 4FIMA 1B40A 2I0BA 2B3FA 2DE2A 1BTJA 1FQDA 2X26A 1LFHA 1MY0A 3CR9A 4I1DA 3EHUA 5F7VA 4IY5A 3JYRA 1OIBA 3TZAA 1B7UA 1GGGA 2REJA 1MY2A 4FE8A 4OFJA 3SEVA 3RTWB 1QULA 5KDTB 5AA3A 2AIXA 3L6GA 4FAJA 2DVZA 1GVCA 2DE3A 3QYTA 3MP1A 4YU0A 3E9XA 4Q30B 4DDDA 1TWYA 3EN3A 3S9LC 3G3HA 3V83A 4FECA 1VR5A 5A5XB 4KYSA 1N7XA 1FQEA 3A3UA 3DP4A 1MY4A 1AL3A 2P0SA 3TODA 3T9VA 2PVUA 3SESA 2M8CA 5KDTA 3IJOB 2I49A 1GR2A 1A99A 4KPTA 1B52A 2GHBA 3LR1A 3M3LA 3IB1A 3PD8A 2HZLA 1N3XA 5JTYA 2Z8EA 5A5XA 4GXAA 1R6ZA 1OVBA 3RT8A 3H06B 4QHQA 3UGWA 2QRYA 4NMYA 1HSJA 1MH3A 2O68A 3A09A 1JW5A 4U2RA 4YKKA 2VHAA 3C34A 3SEUA 1DOTA 1FW0A 2X7QA 4BDNA 4HTGA 2DOJA 4F3PA 4DCYA 1L5TA 4OEUA 1SDXA 4FATA 1B3LA 2DSFA 3RY3A 3H03A 1USYH 1XVYA 2RC7A 3TUSA 3GBAA 2UVJA 1XC1A 1I6AA 1WODA 3MBPA 4PFTA 4YKIA 1P1UA 4H0WA 4I62A 1SW2A 1MQHA 2GH9A 3VLUA 4OFLA 4OERA 3V5AA 1CE2A 1IIWA 4GLIA 1PB7A 3RLFE 1HSEA 4JWYA 2CZLA 2VOZA 4OXVA 2ZNSA 4R9GA 3KN7A 3UP9A 4H6DA 3V8XB 3C4MA 4F1UA 2ESNA 3O9PA 5JEIA 3PU5A 4XKPA 1FQFA 1IEJA 3KOSA 3N6TA 1J1NA 2GFEA 1UIVA 1Y9UA 1KWHA 1QKBA 5CRYA 3K1NA 2WKYA 1VE4A 3FGSA 2F6PA 1MM7A 3H3GA 3CFZA 4KR5A 3OD7A 3MPKA 1R1NA 2E1SA 4DXBA 3H6VA 2I48A 2XXYA 1LBCA 1M5CA 5TP9B 3KSXA 3FASA 4Q0CA 4EXKA 3EHSA 1T0KA 4TQUQ 5HM4B 1M5EA 2I3WA 3K0VA 5H8FB 3P7IA 1Y1ZA 3PMWA 1EZPA 4H1XA 2KLFA 3LSFB 4RY1A 2YPNA 4JSOA 4F19A 1AMFA 2HAUA 2HZKA 2ZYMA 3V89B 5TP9A 1LCTA 2H25A 5I84A 3C36A 4Q5TA 2Z8FA 2O84X 1EZOA 4R2BA 4P11A 2NOOA 1A55A 5M2VA 4ZS9A 3FXQA 1PBPA 3KJ7A 2A5TB 5H8FA 1MDP1 3TTKA 4EQ7A 1YTVA 3PUXE 3ECRA 2Q8JA 3GZGA 4Q8RA 2P1SA 3U1OA 3QSLA 1Q1KA 2H4IA 3H6WA 4MLVA 2I58A 2QJEA 2ZYNA 1B1HA 3ILUB 4F3SA 5I59B 2D3IA 3QUFA 1B0LA 1SW5A 1FCKA 1II5A 2A5TA 1URDA 1WDNA 1BIYA 4IB2A 2ZMBA 2DWIA 5ITPA 1SVXB 4O3BA 3VLWA 2Z22A 5FTHA 3MUQA 1A8EA 1B6HA 1OMPA 3I6VA 2QPQA 4F39A 1SYIA 1MY3A 4LZ5A 2NUVA 1D4NA 5CMBA 2ABHA 3QXMA 1LAXA 3JZJA 3MW0A 4ESWA 1LFGA 3RTFB 1NMUA 3TQLA 2H98A 4DCXA 4ZE9A 2QS3A 3K1PA 5I2KB 3U72A 4MH5A 1VFDA 1MG1A 4OWDA 1Z7NE 1SI1A 2RCBA 1N04A 1DTZA 3MP6A 4GRKA 2F6GA 3DP8A 4G8HA 4P0GA 3D4GA 1IXGA 5H8QB 4R75A 1HSLA 2HFBA 1IQ7A 3KBRA 3MVWA 4GWOA 1QUIA 5I2KA 1FTMA 5B7DA 1B0HA 4GL0A 1TXFA 1NNKA 4WEPA 3HHGA 3T22A 5ISUA 3KEIA 5FHNA 1MPBA 4ZEBA 4TLLB 4U4SA 3KGCA 5H8QA 3KJTA 4JB7A 2YJPA 2Q89A 5CMCA 2VP1A 2V93A 4LUBA 4OVJA 4F3GA 2OLBA 3IX1A 3N5LA 3K1MA 4N13A 4OEVA 5H8HA 3ONMA 1LBBA 3IO6A 3RQTA 1RKMA 3Q26A 3O28A 4NF6B 2UXAA 2O1MA 1ZJLA 3DM0A 3G3IA 4Z7EA 1LB8A 3IB0A 4MF3A 1MXXA 5BUUA 2F8DA 1PDAA 4Z0IA 2LAOA 4RK9A 1QW0A 4IGTA 4RYAA 4H8JA 4NF6A 1B46A 4DE8A 3TYHA 4WKMA 1LFIA 4NWDA 5KCJB 2Q2CA 4OETA 1XOCA 1NH8A 4UA8A 1H45A 4LATA 2RINA 4F31B 5ITOA 3PV0E 2F7AA 3ILTB 4YKPA 3SEWA 4ELPA 1MQDA 1O7TA 2FA7A 4LZ7A 3LC8A 3FUZA 4QSEA 4KQPA 4LQ2A 3HCQA 3IO4A 5KCJA 4JDFA 1NNFA 1P1WA 3C33A 1GTKA 4QFLA 3DLNA 4E0XA 2I4CA 3S4UA 3FV1A 1I6BA 1Y4TA 4GD5A 3KN8A 1B4HA 2PYYA 4ELOA 3T93B 3M8UA 4LA9A 4BLAA 4H5GA 4YKJA 1SW1A 3B6WA 5CM6A 4THIA 2QMXA 4NF8B 4FJPA 4OHNA 5I58B 1H76A 3K6VA 2D5WA 3VLVA 2QS4A 2XXQA 5BWJA 2FYIA 1Y20A 5K2XA 2DS9A 1P1NA 2ZYOA 3MPLA 3MZBA 4F29A 4E0WA 2O69A 3G3JA 4NF8A 3FZVA 3UA8A 3MWBA 4ZEFA 3C32A 3ZKKA 1ATGA 5EYFA 4NF5B 4ZECA 1B51A 4NEDA 1BLFA 4AQ4A 2QL3A 4JWOA 2QSXA 3N6UA 5CMMA 4H5FA 2HXWA 5CI5A 4OZ9A 1B9JA 3FIRA 3OSRA 4RPNA 4IO6A 1JETA 1OLCA 1SD3A 5L9MA 2REGA 1US4A 2XXXA 2Y7RA 3QK6A 2Z8DA 3U8QA 3EF7A 2DWAA 4HCYA 1PB9A 1B5HA 3D4CA 1B2HA 3FVNA 4YB6A 1PC3A 3Q27A 1OVTA 5FHOA 2XXUA 4JBZA 1B7ZA 1POTA 3SEYA 4QSCA 3HN0A 5DVIA 3FXUA 3SDFA 3W15C 3O2AA 3TFLA 4F18A 5TPAB 3TCGA 1EH3A 5FTIA 1PB8A 2ONSA 3THIA 2F34A 3E3KA 1IZ1A 4NWCA 4U4XA 2OWSA 3WAFA 5DTBA 1M5FA 3FJGA 3TKDA 3CI8A 3HSTA 4GFRA 1MXUA 3L6HA 3GXAA 3K00A 1NNPA 4F1YA 3PMXA 5TPAA 5L9OA 1ELJA 4M1VA 4X1DA 3M3FA 2PBWA 3PPOA 2XXVA 1QUJA 4RA1A 3LUYA 3K4UA 1Y3PA 4DXUA 4YAHX 1NH7A 1BP5A 4RJZA 1N84A 1RYOA 2I4BA 4LZ8A 3IK6B 4NTLA 2UYFA 3LSLA 3G3FA 1D9VA 5ELVA 2QMWA 1DTGA 1MY1A 1S9TA 2BJJX 1MS7A 5AA2B 5L8DA 2F7BA 2PMSA 4IO4A 1YPNA 3IOWA 2OWTA 4G68C 4G77A 1Z7ME 2IA4A 4XKRA 2E0SA 2DE4A 1MXWA 3B6TA 5I57B 3O6GA 1A7LA 3TCHA 4IO2A 3HO7A 1R9QA 1ANFA 4U22A 4KFQA 3RT6B 1NKXA 4ECFA 1IXIA 4ELRA 2XXIA 5AA2A 4GVOA 5H8SA 2V3TA 2DXYA 3K6WA 5AA2D 1QVSA 4ZEDA 1XHYA 2ZNUA 1NFTA 2CMOA 5I57A 4GL8A 3M3KA 1H43A 2HEUA 4GXSB 2HQ0A 2B65A 4BDMA 3S9MC 2AL4A 4DXCA 3I5OA 3O66A 4C0RA 4X1BA 1I69A 3KSJA 3S9NC 4PETA 3OO9A 5DVFA 1B58A 1MDQA 3IOTA 3IORA 4PE5B 2VD3A 4BDLA 5JK4A 3N94A 3S9EA 5AE4A 4R6KA 3C31A 1D3KA 2Y7WA 3DP6A 4U1ZA 5I59A 2ZXTA 3DELB 2XX9A 1MPCA 4DLDA 4R72A 1B05A 3PUYE 4KD5A 2V25A 3B7DA 2W7YA 3K6XA 4GIZA 2VGQA 3OENA 2I6EA 4OESA 2DVCA 2DWHA 2Y7KA 4EF2A 5F1QA 3F11A 4ESXA 1S50A 1LAGE 3KG2A 3IL1B 2O1LA 1VSOA 3GLBA 3OXNA 4IO7A 3TPAA 1XS5A 1B32A 4GOTA 5IAIA 2RCAA 2DQVA 4PP0A 5DYHA 2F78A 4R6YA 2ZNTA 2A5SA 3Q29A 1MQGA 3QIMA 1LB9A 3PPQA 1IXHA 4MFIA 3FJMA 1CB6A 3CG3A 4KCCA 4QSDA 2H9BA 4MBPA 4HW8A 2Q88A 5CMKA 3IJXB 3W9VA 2R71A 3O6IA 4PFUA 4POXA 2UVGA 1XVXA 3KOTA 4C1TA 5DT6A 4OFOA 1UTHB 1OLAA 5B70A 4N6PA 2F35A 1IXCA 1US5A 4OMBA 1B5JA 1GV8A 1B7HA 2OK2A 3RGYA 5AA4B 1MXYA 3GBBA 4R6HA 3W9WA 2FNCA 1MRPA 3UN6A 1Y3NA 4WEDA 4QF9A 2R9JA 1MXZA 1UTHA 2DYXA 3MVXA 1UIUA 2D21A 2AYSA 3CVGA 4LONB 4YMBA 3PPNA 2I0CA 5IKBA 1ZU0A 5J1DA 2Y7PA 3OSQA 4G2ZA 4HCWA 1P1QA 4L17A 2G93A 1LAHE 4RPOA 4H65A 3UK4A 2H99A 2O51A 1Y4CA 3TELA 5ICTA 5CBSA 1H44A 3T9HB 3LSWA 2ALUA 3TTNA 1P99A 3EHTA 4F1VA 3OO7A 4IY6A 4OQOA 3VVEA 2O6AA 3EQ1A 3VXCA 4F2OA 2F5XA 2I3VA 3AXFA 3PD9A 3R7XA 1B1XA 3SEXA 1F9BA 2X7PA 2XXHA 1URGA 3VXBA 4RNSA 3C9HA 1MH4A 4YB7A 1A40A 3FJ7A 4R74A 1N0TA 3OEMA 4YZZA 1JVXA 2RC8A 1YAEA 3TTLA 5EHMA 3KZGA 4ONYA 3TEPA 1Y1MA 4WXJA 3UORA 2Y84A 1FQAA 4JSDA 4POWA 4LVQA 3QUJA 4F22A 1FTKA 1DPEA 3FXRA 1M5DA 3N26A 3ODBA 1OQHA 2DWJA 2IEEA 3OMBA 3OO6A 5CBRA 1AOVA 1A8FA 1QJMA 3PUWE 3CSGA 3QAXA 4PQJA 3BFTA 5K2YA 2XXTA 4F2QA 1S7YA 5HBCA 3U92A 2O7IA 2AL5A 4M4GA 4PFYA 3MZ9A 3RNNA 5CC2A 1O63A 3VE1B 1IUDA 5JTYB 2OJTA 2GRVA 3OO8A 3SETA 3JV9A 1YCJA 4QRZA 4I8CA 5I58A 5TU0A 1USYE 2G29A 2HCAA 3ZKLA 1JQFA 1JNFA 1TFDA 3MZ1A 3KN3A 3OEKA 4AB6A 3G3KA 3IOUA 4QFPA 3S2VA 4XKQA 1SW4A 3R6UA 4NF5A 3LBSA 3VV5A 2Q2AA 3TAJA 3USDA 3OELA 4XXUA 4NE4A 1EZ9A 4QFNA 2R6GE 3Q25A 4FEBA 3CSBA 1MQJA 1AIVA 1ZMGA 3IB2A 3PMVA 2NXOA 4KYDA 1N7WA 3K2DA 3ZSFA 3MVYA 1NNTA 3U94A 2HAVA 3CIJA 1WVJA 3H6TA 1B5IA 3BKIB 3MP8A 3H4ZA 2XX7A 2OZZA 4FORA 1B3HA 1MM6A 1JVYA 3H6UA 4ZDMA 3RPWA 3MAMA 3O6HA 4X48A 4EF1A 4OENA 2B3BA 2QS2A 4LP2B 4UACA 2Z23A 2Q9TA 1EU8A 2PT1A 2OCUA 3HPIA 1SBPA 2PT2A 3MJNA 2DXRA 4R73A 1NL5A 3CFLA 5KZTA 4O3AA 3T96B 1BKAA 4XTCQ 1JEUA 4U1OA 2VD2A 1Q35A 2XD2A 1N76A 2V3UA 4H67A 4X9TA 1LCFA 1SYHA 2RF1A 1JW4A 4BDQA 4P0IA 3SERA 4BDRA 3MQ9A 1DPPA 2GHAA 3MC2A 1VFEA 5DEXB 3BFUA 3PUVE 4AB5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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