5EYFA

Crystal structure of solute-binding protein from enterococcus faecium with bound glutamate
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
EDILERSKSTNEIIWGVKYDTRLFGMMDIESRTVQGFDVDIAKAITKKILGDNGKTEFVEVTSKTRIPLLKNGNIDAIIATMTITDERKKQVDFSDVYFDAGQALLVKKGSQIKSVDDLNASTTVLAVKGSTSAANIRQHAPDAKILELENYAEAFTALQSGQGDAMTTDNAILLGIADENPEYELVGGTFTNEPYGIAINKGQENFLKAVNQALEEMHADGTYDKIYQKWFPNETEGKVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal Structure of Solute-binding Protein from Enterococcus faecium with Bound Glutamate
rcsb
source organism Enterococcus faecium do
molecule tags Solute-binding protein
molecule keywords Glutamate ABC superfamily ATP binding cassette transporter,
total genus 71
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5eyfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5eyfA02
4OEUA 4IGRA 3C36A 4H8IA 1B0HA 2V3QA 4LUBA 1FTOA 4R2FA 5CMCA 3RLFE 1B7UA 3FJMA 4QFLA 2A5TA 3W9VA 5CMMA 4F3BA 5I59B 1J1NA 1MY0A 1AIVA 2UVGA 2DSFA 4XTCQ 1Y20A 4GOTA 2FA7A 2P2AA 1I69A 4GFRA 4BDMA 3VVEA 1MH3A 3HO7A 1ZBMA 2VP1A 2AIXA 3ECRA 3W15C 3FVNA 5ELVA 1IUDA 3IR1A 2I0BA 2PT1A 3KFMA 5I56A 2Z8DA 2ESNA 4EF2A 1B58A 1DPEA 5DTBA 5CM6A 1Y3PA 5CC2A 2HZKA 4OZ9A 4RPNA 4BLAA 4ZE8A 4NWCA 1B4ZA 1RKMA 1B7HA 3QUFA 5I57B 4YZZA 2VGQA 5I58A 2OWTA 3CRBA 4NF8B 3FV1A 3V5AA 4AQ4A 5J1DA 3GBAA 2DWIA 2UXAA 4GL8A 3C33A 3UK4A 4OERA 3Q27A 1JW1A 2ALUA 1MDP1 1MY4A 2DVZA 3MPKA 4BDNA 1OQGA 1H44A 4L17A 4MH5A 2H99A 2ZYOA 4NTLA 4XXUA 2F7CA 1FQDA 2OJTA 4FIMA 4GF8A 4JWXA 4YKPA 1BLFA 3VVFA 1FQEA 2ONKE 4HS7A 4YKKA 4F19A 4R6HA 5I2KB 4E0XA 1MXWA 1IITA 3VDFA 1I6BA 3TTNA 1P1NA 4IY5A 1R1NA 1BIYA 3C31A 1S7YA 5KZTA 1SD3A 4YICA 1MY1A 2FYIA 4NWDA 3H3GA 1Y4TA 1A54A 5JTYA 4F18A 3A3CA 3N94A 4OMBA 4F2OA 3E13X 2VHAA 1B05A 1RYXA 3FVOA 1USYE 4R2BA 1ATGA 4ONYA 3RPWA 3HSTA 2YLNA 2XD2A 3B6WA 4P11A 1EZOA 1URGA 1RYOA 3O9PA 1N76A 2PVUA 2X7PA 1QUIA 4GIZA 1A55A 2F35A 1A8EA 2OLBA 3MP8A 4AB6A 1IXIA 1XVXA 1UQWA 1HSLA 3OEKA 4R9FA 3UGWA 1LBCA 3KZGA 4KR5A 4Z0IA 4ZDMA 1MG1A 4F29A 2REJA 1SI1A 1I6QA 3FIRA 3QYTA 4NF6B 4U21A 1B3HA 5H8SA 4H65A 4ZECA 3QUJA 1B1HA 3DP8A 2PMSA 3PUXE 4GXAA 4P0GA 3PPQA 4DDDA 2DXRA 1JQFA 2AL5A 2BJJX 3EPEA 3OOAA 3SETA 2QS4A 4YAHX 4HW8A 1LAXA 3Q28A 3K4UA 4GXSB 1NH8A 4YB6A 3T9VA 3IJXB 5I2NA 3U93A 2RKMA 5L9OA 3H6UA 4ZZEA 4TLMB 1OLCA 3K6VA 3F11A 5H8QA 1B51A 1Q35A 3KN3A 5H8HB 3H03A 5A5XA 3UORA 4I8CA 3Q29A 3S9LC 3K00A 2IA4A 5DEXA 1MQDA 4Q30B 4U4SA 5AA2D 2ZYNA 4BDQA 2XX7A 4EXKA 3C9HA 4H8JA 1QKBA 3EN3A 3O6GA 1AL3A 1Y3QA 4ZEKA 1UTBB 2ZYMA 4NF8A 5FHOA 1O7TA 2RC8A 2XXQA 2PYYA 4C1UA 3SEUA 3W9WA 2PT2A 1LCFA 1NH7A 4I62A 1GR2A 4G8MA 1FQBA 3EQ1A 3KN8A 3PGFA 3S4UA 2XXYA 2PX1A 2ZNSA 2O7IA 3H6WA 1R6ZA 4HCWA 5KCJA 1JW4A 2IEEA 2DWAA 3KBRA 4E0WA 4EUOA 1S50A 3RNNA 4FECA 3EF7A 3ILUB 3ZKKA 4MFIA 3MBPA 5H8FA 4IGTA 4QSDA 1AH5A 1MH4A 1A99A 1IXHA 4H1XA 2Q88A 4XKQA 1P1WA 4OETA 4LONB 3K6WA 3M3KA 4POXA 1PBPA 5ICQA 3IAZA 2RINA 3K1PA 1VE4A 2F6GA 5A5XB 4H67A 2ZNUA 5H8QB 5TP9A 3IX1A 2P1SA 4U2RA 3H4ZA 4GVOA 3TQWA 1MXUA 4C0RA 1MY3A 3VFJA 1B5JA 3O66A 1FTJA 1LAFE 4PFUA 4XKPA 1N84A 4U1ZA 3TCGA 3TQLA 1OIBA 1PBQA 4LZ7A 3HHGA 2I49A 3V8XB 4KHZE 1US4A 4GRKA 1HSJA 1GGGA 4FE8A 5F1QA 5FHNA 4RA1A 3TKDA 4ZS9A 1B7ZA 4FJPA 4IO7A 4LATA 4NF6A 2QMXA 3CSBA 3TTMA 3A3UA 1H43A 2F6PA 3ZSFA 3PPOA 1ELJA 4G8HA 4NEDA 1S9TA 1Z7NE 4F1UA 3OO8A 1P1QA 1IEJA 5ITPA 1B3FA 2OWSA 3C34A 3CVGA 4GLIA 3TAJA 1A8FA 3IJOB 4QF9A 5CMBA 3O29A 5TPAB 4MF3A 1FTLA 1M5BA 4IO4A 2GRVA 3RT8A 1LBBA 3MVXA 2Y7PA 4QSEA 4JWYA 1F9BA 5TP9B 2QMWA 4R73A 2ONRA 5AA1A 3A09A 1JVYA 1BP5A 2Q89A 2Y84A 1XOCA 3PMVA 5ICTA 2DE2A 5EHMA 3BFTA 2CMOA 3IB2A 4EDPA 1DTZA 1VFDA 2XD3A 3KSXA 1XVYA 3QK6A 4QFNA 3SEXA 3U8QA 4FEBA 4KYDA 1ZJLA 3TDJA 1TFAA 4U1OA 3SEVA 3OSRA 4JSOA 5LOMA 3TPAA 2QPQA 4H5GA 3FXRA 1B52A 1HSEA 2X26A 3K6UA 1I6AA 3VLVA 1ZKBA 3U92A 4O3CA 4U4XA 4QFPA 5CBSA 2QL3A 4M1VA 3G3FA 4RY1A 1FTMA 3U72A 2LAOA 5L9MA 1SI0A 2GHBA 1OMPA 3H6VA 2R71A 1SQYA 3HCQA 4G2ZA 3VV5A 1UTHA 3T9HB 2I6EA 1UTBA 1M5FA 1LAGE 2XXVA 3CIJA 1QUJA 1UIUA 2I3VA 3IOTA 3N6TA 3R6UA 3RTWB 4G68B 5I84A 3TUSA 2DQVA 1FW0A 2B65A 1Y9UA 2DXYA 2ONSA 2VD3A 2Y7IA 3H6TA 1H76A 1US5A 3SEWA 4UA8A 4G68C 1QULA 2HQ0A 2XXIA 3ONMA 3ILTB 2DVCA 3MP6A 4G68A 1XHYA 3KN7A 1B5IA 3VLWA 2DE4A 3JYRA 5DVFA 4IO5A 3LR1A 2DS9A 4OQOA 3IB0A 5H8FB 1UTHB 5CRYA 1M5CA 3SDFA 3IORA 4POWA 3BBRA 1LCTA 1MPDA 5IKBA 4LVQA 3JZJA 4U23A 1B0LA 4G4PA 5KCJB 3KG2A 2HCAA 3PUYE 4R6YA 1B1XA 1LGBC 4U22A 4I1DA 4PP0A 5FTHA 2A5TB 2F8DA 2HXWA 1QJMA 1WODA 3KEIA 2R9JA 3MJNA 4TLLB 5F7VA 3GZGA 4OFOA 1OQHA 3MP1A 1EH3A 1O64A 2P0SA 4BDLA 3VLUA 1LFGA 3OELA 4HCYA 1B6HA 2QRYA 3MQ9A 4G8NA 4N07A 3V89B 2XXWA 4I9DA 4LZ5A 3S2VA 5ISUA 3K0VA 3IB1A 3MVYA 3OXNA 1LB8A 2R6GE 4GL0A 4ISUA 2FNCA 4YB5A 4DE8A 3DP4A 1JNFA 1OVBA 2HAVA 4YB7A 2F97A 2XXHA 3H7MA 1OLAA 4YKIA 1MY2A 2DYXA 3D4CA 4R74A 3IO6A 1FQAA 3DLNA 5TPAA 3T9UA 4ELPA 4YMAA 5EHSA 2KLFA 5AA3A 2DWHA 2I3WA 1N7XA 1QKAA 3DP6A 4X1DA 1MXZA 5M2VA 1LSTA 5IAIA 3PPNA 1N7WA 1Y3NA 2RC7A 5I2KA 1TXFA 4XKNA 5CI5A 4N6PA 4ZEIA 3T9XB 4H0WA 1IIWA 4IO3A 3IOWA 5JEIA 1MM7A 2H9BA 3C4MA 3IO4A 3PPRA 3O97A 4RPOA 3EHUA 3SEYA 4DCXA 4Q0CA 1P1OA 2O1LA 3TCFA 4F22A 1DPPA 2O7UA 4YKJA 3H06B 4RXLA 4FAJA 1LLSA 3LBSA 3L6GA 5B7DA 5BUUA 1ZIUA 1JEUA 1B2HA 1URSA 3FD3A 3T22A 2O1MA 4F31B 4KFQA 3PU5A 1SW5A 1VFEA 3P7IA 4F3PA 5CBRA 5DVIA 1DSNA 3OENA 4R6KA 2HAUA 3S9EA 3UP9A 1YTVA 4DXUA 3U1OA 3N26A 4LZ8A 4FEDA 4LA9A 3Q26A 3CG3A 4HTGA 4X48A 3TZAA 2DOJA 2NXOA 2UYFA 2Y7RA 1YPNA 3TTLA 2E0SA 1PB8A 1NMUA 2ANJA 3K02A 4JSDA 4P0IA 4R9GA 3TTRA 2QJEA 4H5FA 3I6VA 3RT6B 2H4IA 3PV0E 4QHQA 1TFDA 1ZU0A 1B9JA 4ECFA 1SDXA 2O51A 3OO7A 3BFUA 2XXXA 4THIA 4F3GA 4EQBA 1DMBA 2D3IA 1FCKA 3TYHA 2QS3A 3O6HA 4DCYA 2O68A 4O3AA 1UIVA 4OXVA 3THIA 3E4RA 1EU8A 1AMFA 3MPLA 2HZLA 1II5A 2CZLA 2RF1A 3UA8A 1B5HA 3R7XA 1LFIA 1EZ9A 4NF5A 4ESXA 1SW2A 3CSGA 3G7WA 3KJTA 3PMWA 4EQ9A 1ANFA 1IZ1A 1YCJA 2H5YA 2DP8A 3RTFB 3C32A 4ZE9A 2HFBA 5FHMA 1TWYA 3LSFB 1D4NA 1NFTA 1NKXA 4OTEA 4WKMA 2ZMBA 5DEXB 4EXLA 5I57A 4OWDA 1D3KA 2H25A 1M5DA 3OD7A 5H8HA 2ZNTA 4R72A 1MDQA 1GVCA 3VVDA 5HPQA 1N0TA 4KPTA 5HBCA 5L8DA 4BDRA 3N6UA 3PUWE 3LSLA 5I2NB 2REGA 1SYIA 3KJ7A 1NNTA 1PB9A 2I4BA 3PUVE 3CFLA 1MQJA 3K01A 3O28A 4AB5A 1R9LA 4QSCA 4ELRA 2UYEA 3HV1A 1LFHA 1B32A 3FATA 4FORA 2M8CA 3VXCA 4H6DA 2Y7KA 3ZS6A 1JW5A 4OENA 2DWJA 3FXUA 3PD8A 3RY3A 2QSXA 3I3VA 3IL1B 1CB6A 1FTKA 1IQ7A 4ZEDA 3KOTA 1D9VA 1A40A 2E1SA 1EZPA 3KSJA 3SERA 1VSOA 2ABHA 1WVJA 4O3BA 4OVJA 4WXJA 4UACA 2NUVA 4X1BA 4F1VA 2RC9A 4PETA 1ZLQA 1OVTA 1LB9A 5B70A 3AXFA 3KGCA 4YU0A 1NNFA 3ODBA 5H8NB 1H3DA 3CFXA 2NWJA 3FV2A 1JEVA 3B7DA 3G3GA 3MW0A 3G3HA 3L6HA 1L5TA 5AA2A 3D4GA 2QS1A 3DELB 1B3GA 5DVJA 3E3KA 4F2QA 3K2DA 3B6TA 2UVIA 2XXRA 4NE4A 2THIA 2V25A 1MXYA 4NF4A 1ZMGA 4ELQA 1MXVA 4RJZA 5JTYB 2GFEA 4PFTA 1CE2A 1P99A 1MPCA 1Y4CA 3EHTA 3G3JA 3OMBA 4OESA 1DOTA 1B40A 2I58A 2OK2A 1P1UA 2WKYA 3CFZA 4RNSA 5ITOA 2F7BA 2I0CA 2XXPA 2D21A 2NOOA 3FXQA 3O6IA 4IB2A 4KCCA 4RK9A 3RQTA 3T93B 3TEPA 4XIGQ 5K2XA 2OBGA 1PB7A 3HHFA 4LQ5A 5H8NA 5HM4B 4OYVA 3M8UA 4TQUQ 3U94A 2XXUA 2V84A 2I48A 4OFLA 2X7QA 3LC8A 1POY1 2XXTA 2B3BA 4BDOA 1B4HA 2QS2A 4RK2A 2YPNA 1IXGA 2Z23A 4WEPA 1POTA 3OO6A 3G3KA 4ESWA 3MVZA 5EYFA 3GLBA 4IY6A 2V93A 3OEMA 3O2AA 2XX9A 5K2YA 4ZZAA 1GV8A 3S9NC 4ND9A 4WEDA 2I4CA 1Y1MA 4LQ2A 1ZTYA 2ZXTA 4QFKA 4X9TA 3TFLA 3FJ7A 1XS5A 3SKPA 1Z7ME 1SVXB 3UIFA 5I58B 2YJPA 3TODA 2W7YA 1MS7A 4RYAA 3RUMA 2F36A 4OFJA 4ELOA 3LSXA 1USYH 2AYSA 3M3LA 4M4GA 4TOZA 5CMKA 2H98A 4KQPA 1VR5A 3K6XA 3R26A 4KD5A 3UN6A 4ZEBA 4DXCA 5I56B 3TMGA 3V83A 3WAEA 1AOVA 3EHSA 1MQGA 1PEBA 3GXAA 4Q5TA 3G3IA 1PC3A 5JK4A 1R9QA 4PE5B 1XT8A 4IO6A 4MBPA 2D5WA 4F3SA 3I5OA 2VD2A 1WDNA 2RCAA 3MVWA 2F34A 4JBZA 2O6AA 4F39A 5AA4B 2A5SA 3MUQA 4NF5B 3BKIB 3M3FA 5TU0A 4DIGA 3IK6B 1M5EA 3MZ1A 5I59A 4XKRA 1PDAA 1Q1KA 1IXCA 3HPIA 5DYHA 3USDA 4EF1A 5KDTA 2Q9TA 1LAHE 5AA4A 1SBPA 1Y1ZA 5BWJA 2O84X 2O69A 1JVXA 2VOZA 3IOVA 4ZEFA 3RGYA 4GD5A 3ZKLA 2V3TA 3PMXA 3S9MC 3JV9A 1N3WA 1BTJA 4KCDA 3VXBA 2RCBA 1XC1A 3DM0A 3MZ9A 1SW4A 4N13A 4DXBA 3FUZA 3T66A 1B3LA 1A7LA 3E9XA 3OO9A 4QFOA 3K1NA 3MZBA 4DZ1A 1GTKA 4Q8RA 4DLDA 3IOUA 3HN0A 2GH9A 3LSWA 2V3UA 4NMYA 4EQ7A 1T0KA 2F5XA 2HEUA 3K1MA 3CG1A 1MQHA 3MWBA 1SW1A 2Z8EA 1O63A 3FJGA 2GHAA 3LUYA 4GQOA 3MC2A 4IO2A 4OHNA 5AE4A 2UVJA 2UVHA 1JETA 3QSLA 1TT1A 1URDA 3GBBA 1D9YA 3QIMA 1MPBA 3C35A 3SESA 4JB7A 1NL5A 4GWOA 3FGSA 4QRZA 2Q2AA 3B6QA 1SYHA 5DT6A 2Q8JA 2Z22A 4OEVA 4PFYA 2XX8A 3RN8A 4F1YA 1MXXA 1FQCA 1QW0A 3FZVA 3PPPA 4Z7EA 1MRPA 2XHDA 2F7AA 2DE3A 3FVKA 2OCUA 4PFWA 3PUZE 1MQIA 2ZYKA 4LP2B 1QVSA 3KOSA 4JDFA 1FQFA 2PBWA 2Q2CA 4G77A 2OZZA 1NNPA 4JWOA 5KDTB 4KI0E 2B3FA 4R75A 1BKAA 1DTGA 1KWHA 1N3XA 1B3EA 1QUKA 3MAMA 4MLVA 5L9SA 4FATA 3T96B 3FASA 2G29A 3N5LA 1MM6A 2G93A 4K3FA 4JXIA 4NF4B 4C1TA 4KYSA 3QXMA 4PQJA 1YAEA 4KYEA 3CR9A 2NVUB 3Q25A 3QAXA 4MLQA 3TTKA 4YMBA 5AA2B 3WAFA 1H45A 3OSQA 2Z8FA 2AL4A 3TCHA 3PD9A 3FVGA 1NNKA 2F78A 3CI8A 1N04A 2Y7WA 1B46A 5FTIA 3VE1B 3TELA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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