4NF4A

Crystal structure of glun1/glun2a ligand-binding domain in complex with dcka and glutamate
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
284
structure length
277
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Insights into Competitive Antagonism in NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
total genus 75
structure length 277
sequence length 284
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf4A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf4A02
1HSJA 1RYXA 4OWDA 2OWSA 2G93A 3RNNA 2XXYA 3GXAA 1MM7A 4U1ZA 4I62A 1S7YA 1XVXA 4BDQA 4RJZA 1B40A 1MY1A 3I6VA 1Y3NA 4LUBA 4AB5A 3KSXA 5I56B 2GFEA 4XXUA 3H6TA 1QJMA 3ODBA 2O7IA 3DLNA 2DP8A 2ALUA 1AIVA 3K01A 1MS7A 2Y84A 3IO6A 4POXA 1HSEA 2QPQA 2REJA 1A7LA 4R74A 3RY3A 2F7BA 2HEUA 2GH9A 4U4SA 1IIWA 4H8IA 1BP5A 4H5GA 2DVCA 3O97A 4ZEDA 1VFEA 1VR5A 5KDTB 3EHUA 2OJTA 1B3HA 4RPNA 5I2NA 4MF3A 3PMXA 3TFLA 2DVZA 1EZOA 2F5XA 2QMXA 2Z8DA 1MXYA 1D3KA 3EQ1A 4IO5A 1B1XA 1I6QA 2O84X 4DE8A 3KEIA 3SDFA 1M5DA 2A5TA 2DYXA 3VVFA 2XXQA 4O3BA 4NWDA 3KN3A 4FJPA 1P1OA 4KCDA 2QS4A 3IAZA 4XKRA 1P1NA 2H25A 4X1DA 3JYRA 3FIRA 3JZJA 3TCGA 3ZKLA 1URSA 1IXCA 2M8CA 3UIFA 3W15C 1LAHE 2NUVA 3BFTA 4I9DA 1WODA 1QUKA 4GXAA 3FJGA 2H98A 3N6TA 5DVFA 3MZBA 1N0TA 4M4GA 3MVYA 1JNFA 4KYDA 3A3CA 4IO7A 5ITOA 4MFIA 1PB7A 2VP1A 4F3SA 3FJ7A 3CIJA 1MY2A 4PFUA 3DELB 1FW0A 2XXPA 4WEPA 5EHSA 3TQLA 1GGGA 1XHYA 2GHBA 4YKJA 2XXVA 1TXFA 1Y4TA 3QXMA 5H8HB 5HM4B 1MQGA 2Z8EA 5I57A 3OD7A 1FQDA 1GR2A 1SVXB 4U21A 5L9SA 2G29A 1R9QA 3VVDA 3A09A 2QS1A 4F2OA 4O3CA 1TWYA 1YTVA 3LSFB 2UVIA 4H0WA 4KD5A 1ZIUA 1TFAA 3VXCA 4NF4A 5TPAA 1M5BA 3FASA 4F1YA 3E3KA 1JEUA 1MPCA 1NNTA 1SBPA 3I3VA 4Q5TA 4JBZA 2Z8FA 5AA2B 2Q9TA 3SEWA 4NF6A 4H65A 2I4BA 1O63A 3MAMA 2O68A 2D21A 2RCAA 4R73A 4BDLA 1L5TA 2DXRA 1AOVA 4LVQA 3VDFA 2V3QA 2OZZA 4QFKA 2W7YA 5DVIA 3PD8A 2R9JA 3SEVA 3DP6A 4ZE8A 4MH5A 3UA8A 4LP2B 3T96B 1DTGA 3H3GA 3MPKA 5DYHA 5KCJA 3IR1A 4GIZA 4KPTA 3U92A 1B3LA 1OQGA 2OWTA 3ILTB 1MXUA 4QFLA 5AA2D 3PUYE 3FVGA 5AA4A 4OEUA 3FXQA 3U72A 3C36A 2ANJA 2VD2A 4HTGA 3MWBA 1Y1ZA 2B3BA 2VHAA 1MM6A 4FAJA 1VFDA 4E0XA 3B6TA 4ELRA 4G8HA 1IQ7A 3G3HA 4R6KA 2XXUA 4NTLA 3WAFA 1Y4CA 3OENA 4KQPA 5ISUA 2B65A 4YB5A 3IJOB 3RQTA 4ZS9A 3USDA 3JV9A 1B7ZA 1ZLQA 4H67A 1IEJA 4F22A 3G3KA 1B9JA 2ZMBA 3KBRA 5ITPA 2UVJA 1SYHA 2X7QA 3KN8A 4GL0A 3TPAA 1OVTA 1P1QA 4XTCQ 1NNPA 5L9MA 4KI0E 3VLUA 3IX1A 1UTBA 2R71A 2QMWA 5H8QB 5A5XB 2DSFA 2OCUA 2AIXA 5L8DA 2XD3A 4PQJA 2YJPA 1SQYA 5H8FB 4EQBA 4RA1A 3TTNA 1R6ZA 1ZMGA 4P0IA 1FQEA 1OLCA 4TOZA 1UIUA 2NVUB 4OXVA 1FQCA 3PPRA 4IO4A 4PETA 2ONKE 1NNFA 4NWCA 2DE3A 3PUVE 1LB8A 3RT8A 3O9PA 5IAIA 4YB7A 4ZEIA 2ZYMA 3UP9A 3V5AA 4KHZE 5LOMA 3KFMA 1MPBA 3OSRA 2V3UA 3CG1A 1B5HA 3EPEA 4QFOA 4ZEKA 1A99A 3HPIA 3K00A 4JWYA 4XKPA 1USYH 1ZBMA 4YMAA 1JQFA 3PUWE 4P11A 2P1SA 1PC3A 2RF1A 1WVJA 3Q26A 2HFBA 3H4ZA 4OEVA 4YICA 5CMBA 4OZ9A 1VE4A 2DS9A 3CI8A 5B7DA 5FHOA 1Z7NE 1A8FA 2I4CA 5FTHA 2HAVA 4OVJA 4QSEA 1GV8A 4H6DA 1B05A 1SD3A 1MDP1 3TTRA 3R26A 4R2BA 3QUJA 4JSDA 3QAXA 3IB0A 4OHNA 2HCAA 1O7TA 4X1BA 4C1UA 4LQ2A 4OTEA 2LAOA 4ZEBA 3ZS6A 3MBPA 4RPOA 1BTJA 1Y3QA 2WKYA 1Y9UA 1JVYA 1Q35A 2I6EA 2RC8A 3PV0E 4GL8A 4RNSA 3EF7A 1FQFA 1OVBA 1H76A 4R72A 1NKXA 3FVOA 4ELQA 4Q0CA 4YKPA 1LCTA 4UACA 3LR1A 5JTYB 1YAEA 2ZYNA 3CFLA 3M3LA 4IO3A 1II5A 1B0HA 4PFTA 3O6IA 3OEMA 3TELA 5DEXB 2V3TA 2F8DA 3KZGA 3CVGA 3VVEA 3RT6B 5I58A 4PP0A 4NEDA 3M3FA 4GD5A 3FATA 1HSLA 1NNKA 3MP6A 3THIA 1B6HA 1DMBA 1S50A 5TP9A 3SKPA 4U2RA 3M8UA 4FIMA 5M2VA 2F7AA 1MXVA 1A54A 4G68B 2H99A 1LBCA 2F6GA 3FD3A 2ZYOA 1B5JA 1B32A 4OQOA 3KG2A 4XKQA 1UTHB 3F11A 2I0CA 3SETA 1MQDA 3UORA 1CB6A 1ANFA 4F1UA 2O51A 1QKAA 4LZ5A 4BLAA 3MW0A 1N3WA 1B4ZA 2ZNTA 3H6UA 5I59A 1I6AA 5FHMA 4ZDMA 1LGBC 1DPEA 5CBSA 3Q25A 4ELOA 3OMBA 3N26A 1TFDA 3MC2A 2FA7A 3TYHA 3D4CA 3IB2A 3P7IA 3RUMA 1OIBA 3SERA 1R1NA 3VLWA 4NF8B 3EHSA 1XT8A 4RYAA 4ELPA 2F36A 2QJEA 4U1OA 2GRVA 3HHGA 3G3JA 5BUUA 3FJMA 3GLBA 2P2AA 5I2KA 4F3BA 3K6VA 4GFRA 4O3AA 4NF5B 1US5A 3OO8A 5DT6A 1GVCA 2IEEA 4PE5B 2AL4A 1PDAA 1XC1A 2O6AA 4RK2A 4P0GA 3CRBA 3PMVA 5H8NB 5AA3A 3IB1A 3T22A 1MRPA 1P99A 2UXAA 4MLVA 4DXUA 2X26A 4ND9A 1LFHA 2VGQA 3QIMA 1FTLA 4TQUQ 3DP4A 3TCFA 5CRYA 4E0WA 3U8QA 3RGYA 2RC7A 3K0VA 1B4HA 3O66A 2Z23A 4RXLA 1BKAA 3W9VA 3BFUA 3B7DA 1D4NA 4POWA 1IITA 1POTA 1MXZA 2ZXTA 1XVYA 4X48A 3HCQA 1S9TA 2I0BA 2Y7KA 2P0SA 3H7MA 4LATA 5I56A 2ONSA 1Y20A 4JWOA 3OO6A 2XXIA 2R6GE 2VD3A 4YB6A 4R75A 3OSQA 3HSTA 2XXTA 2DOJA 1WDNA 4YKIA 2DE4A 3FGSA 3RN8A 3K6WA 2E1SA 3ECRA 1XOCA 3VFJA 1OLAA 4RY1A 2QSXA 4H5FA 4IY5A 1PEBA 3LBSA 5DVJA 2QS2A 4QFNA 4ESXA 3H6WA 1LAGE 1TT1A 5JK4A 5KDTA 4BDMA 1NL5A 5BWJA 1FTOA 3OOAA 5CMCA 3OELA 1DPPA 3G7WA 3K1NA 3GZGA 1LB9A 2HAUA 4WEDA 1MG1A 4R9FA 2AL5A 2D5WA 1B7UA 4OETA 1N7XA 4G4PA 4GWOA 3FUZA 1DOTA 3M3KA 2DWAA 3MJNA 4GRKA 4Z0IA 2Q2CA 1QVSA 1IXGA 4I1DA 1O64A 3KJ7A 1AMFA 1EZ9A 3D4GA 4FORA 3RPWA 5HBCA 4F1VA 3UK4A 3T9VA 3V83A 5CC2A 1I69A 5KZTA 4WKMA 2YLNA 3PPPA 2PMSA 1NH7A 3T9XB 3TTMA 2HZKA 1ZJLA 4IY6A 3U94A 3KOSA 1USYE 4LA9A 1VSOA 1MXWA 4G2ZA 3H03A 3LC8A 5EHMA 4OESA 3FVNA 5H8HA 2QRYA 1B3EA 1M5EA 4ZEFA 2VOZA 4HCYA 3EHTA 1QULA 3FV2A 3E9XA 1B7HA 5J1DA 5I2NB 1LAFE 3R6UA 2I49A 4N13A 4DXCA 1ZKBA 4JXIA 5TU0A 4OENA 1UIVA 3O6HA 1SYIA 1CE2A 4JSOA 1B1HA 4GF8A 4EQ7A 2DXYA 4U23A 3B6QA 3K1MA 3TKDA 2Q8JA 3AXFA 2A5TB 1XS5A 3Q27A 4NE4A 3R7XA 4N6PA 1B0LA 5AA2A 3CG3A 2DWJA 2IA4A 3O6GA 4F31B 4R6YA 3CFZA 3C31A 2Q88A 4BDRA 1Z7ME 4DLDA 3PMWA 2Y7WA 4ZZAA 1B51A 3OO9A 3S9EA 1SW1A 3FZVA 1QUJA 3PGFA 2Q2AA 1A55A 1MH3A 5HPQA 3PD9A 3ILUB 3GBAA 3O28A 5I84A 2UVGA 4ECFA 3K02A 3TDJA 4HCWA 2PT2A 1MY0A 4H8JA 3EN3A 3C33A 3U1OA 1JEVA 2HZLA 2OK2A 1POY1 1QKBA 3H6VA 4EF1A 3N94A 1SW4A 4ESWA 1EU8A 2F97A 2V25A 4DIGA 1LFIA 5I57B 5IKBA 4LZ8A 1FCKA 3C32A 3E4RA 4DXBA 3KSJA 4H1XA 1B5IA 3VE1B 4FECA 1Q1KA 3QSLA 3RTFB 3L6HA 3K6XA 4OMBA 3UGWA 4KFQA 4F3GA 1KWHA 2F7CA 4NF4B 5TPAB 1MQJA 3MP1A 1FTKA 4THIA 4U4XA 3IL1B 4IGRA 5FHNA 3HHFA 2PX1A 4NF6B 2E0SA 1H3DA 5H8QA 1B46A 5A5XA 3GBBA 1FQBA 3N6UA 2V84A 1FTMA 2I3VA 2CZLA 3TEPA 2A5SA 5H8FA 4QF9A 3IOWA 4GVOA 4YKKA 3T93B 1Y3PA 3K1PA 4DCXA 4F39A 3S9NC 5KCJB 1FTJA 3MZ9A 3O29A 1SDXA 2RINA 3TUSA 1JW1A 3PPOA 2RC9A 2H5YA 4FE8A 2F35A 5AA4B 3I5OA 3S2VA 1IXIA 1H45A 3DM0A 3C35A 4R2FA 1LFGA 5F7VA 4F29A 2O1LA 1IZ1A 4KYSA 3TCHA 4F19A 1BIYA 5CI5A 1P1WA 5ICTA 1JW4A 4GLIA 1MQIA 4C1TA 4QSDA 3A3UA 2PBWA 4JDFA 4EXLA 2NWJA 1PB8A 4FEDA 4WXJA 3FXRA 4OYVA 3KOTA 2AYSA 2B3FA 1ZTYA 5ICQA 4YMBA 2I48A 4AQ4A 4G77A 2I3WA 5AE4A 4IGTA 2D3IA 3K6UA 4I8CA 2OLBA 1NH8A 4OFOA 1ZU0A 3W9WA 2UYEA 1EH3A 1N76A 3TTKA 3SEUA 5F1QA 4EXKA 1MXXA 1UTBB 4R6HA 2THIA 5CBRA 5B70A 3L6GA 3S4UA 4G8MA 5K2XA 1I6BA 3IJXB 1B3FA 4ZE9A 3LSLA 4ISUA 3SEXA 2O1MA 1UQWA 4OERA 2XHDA 3RTWB 5CMKA 5CMMA 4F18A 2Z22A 1BLFA 3UN6A 2PT1A 3OXNA 5CM6A 2HXWA 2XX8A 3B6WA 3T9HB 3ZSFA 1B58A 2CMOA 1QUIA 5DTBA 3VV5A 4TLLB 3MPLA 3HN0A 5JTYA 2DWIA 2YPNA 4LONB 4R9GA 3U93A 2BJJX 1P1UA 4MBPA 4EDPA 3TAJA 5DEXA 5FTIA 4K3FA 4IO2A 1M5FA 4C0RA 3VLVA 2ONRA 4PFYA 2V93A 2NOOA 3LUYA 2XXHA 4TLMB 2ZNSA 4HS7A 1N7WA 3FVKA 2Y7PA 4QHQA 3MP8A 4U22A 3K4UA 3V89B 2ZNUA 1LBBA 4YAHX 1D9VA 3IOUA 4DDDA 4G68A 4G68C 2XD2A 1MQHA 2H9BA 1SI1A 2DWHA 1DSNA 3HO7A 1UTHA 3CFXA 4RK9A 2XX7A 3IOTA 1H43A 3ZKKA 3T9UA 1LAXA 4EQ9A 4NMYA 4JWXA 2F34A 1N04A 3CR9A 2GHAA 3SESA 3IOVA 3OO7A 1PB9A 1Y1MA 2HQ0A 1OMPA 3RLFE 4IB2A 3QUFA 3TTLA 1NMUA 2Y7IA 2PYYA 2Q89A 2ABHA 3KN7A 1T0KA 4EF2A 1US4A 5JEIA 3S9LC 4KR5A 3O2AA 2O69A 3T66A 3G3IA 4NF8A 3S9MC 2X7PA 4Q8RA 3CSBA 1DTZA 3G3FA 1SW2A 5L9OA 2QL3A 1GTKA 3PUZE 2REGA 2QS3A 3H06B 1URDA 1D9YA 1IXHA 1F9BA 5ELVA 1SI0A 3WAEA 2O7UA 3E13X 3KGCA 4NF5A 3OEKA 3QYTA 5I58B 3V8XB 3BBRA 1B2HA 3N5LA 3PU5A 2OBGA 1JVXA 1M5CA 4LZ7A 5H8NA 3IK6B 2Y7RA 3VXBA 1A8EA 2XX9A 5TP9B 4MLQA 1N3XA 2XXXA 1B52A 4GOTA 1MY3A 1JW5A 2KLFA 2DQVA 3HV1A 3MVXA 1A40A 4XKNA 1MPDA 1J1NA 3C4MA 1ELJA 2RCBA 1URGA 4KYEA 3LSWA 3BKIB 3IO4A 3KJTA 4M1VA 4EUOA 4XIGQ 3FV1A 1MY4A 3C9HA 3Q28A 1QW0A 3QK6A 5I59B 2ESNA 3MZ1A 4UA8A 2DE2A 3K2DA 1IUDA 4KCCA 5EYFA 3TQWA 1ATGA 3MUQA 3LSXA 3CSGA 4QRZA 3IORA 3DP8A 2FYIA 4LQ5A 2FNCA 1RYOA 3SEYA 2RKMA 2UVHA 2H4IA 2I58A 3MVWA 4OFLA 3TMGA 3PUXE 1SW5A 4OFJA 1JETA 4FEBA 4JB7A 4Q30B 1AH5A 1NFTA 3PPQA 3Q29A 3TODA 4F3PA 1LLSA 4Z7EA 3FXUA 4FATA 1MH4A 5I2KB 4YZZA 2NXOA 1N84A 4DCYA 1FQAA 1R9LA 1YCJA 4BDNA 4BDOA 1MDQA 4F2QA 4GQOA 1OQHA 2UYFA 2F78A 5K2YA 3G3GA 4DZ1A 2XXRA 4YU0A 2XXWA 2ZYKA 5H8SA 4HW8A 4IO6A 1LSTA 3ONMA 1PBPA 1YPNA 4GXSB 4G8NA 4QFPA 4PFWA 4QSCA 3PPNA 2F6PA 5AA1A 3TZAA 1B3GA 4ONYA 3MVZA 4X9TA 1AL3A 4AB6A 1LCFA 4ZZEA 3C34A 1PBQA 4ZECA 4N07A 3MQ9A 1H44A 2PVUA 4L17A 1RKMA 1EZPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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