1WODA

Crystal structure of moda, a molybdate protein, complexed with tungstate
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
GKITVFAAASLTNAMQDIATQFKKEKGVDVVSSFASSSTLARQIEAGAPADLFISADQKWMDYAVDKKAIDTATRQTLLGNSLVVVAPKASVQKDFTIDSKTNWTSLLNGGRLAVGDPEHVPAGIYAKEALQKLGAWDTLSPKLAPAEDVRGALALVERNEAPLGIVYGSDAVASKGVKVVATFPEDSHKKVEYPVAVVEGHNNATVKAFYDYLKGPQAAEIFKRYGFTIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of the molybdate binding protein ModA.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MODA
molecule tags Transport
total genus 78
structure length 231
sequence length 231
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-06-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1wodA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1wodA02
2ZNUA 1TFDA 3IAZA 4NE4A 4F31B 1B5IA 2H98A 4ZEIA 3IJXB 2QS1A 5H8SA 2F6GA 4X1BA 4DE8A 2HFBA 2F97A 1YTVA 1LBCA 4IY5A 4GOTA 3TFLA 2R71A 4PQJA 4LP2B 2RF1A 4X48A 2DXYA 3O6HA 5KZTA 1ANFA 2OJTA 2I6EA 3VFJA 1JEVA 4BDQA 4ZEBA 1MM7A 2E0SA 3T96B 4EQBA 3U72A 1B52A 4QSEA 4IO4A 5TPAB 3IB0A 5L9OA 3KSJA 3K6VA 3R7XA 3MWBA 4FIMA 1MXZA 2XXHA 3PGFA 5K2XA 1VFEA 5AA1A 1O64A 1IXHA 1M5FA 4FE8A 2NWJA 3FJMA 3OXNA 4ELQA 1OQGA 2OCUA 1M5CA 4H67A 3FATA 2F6PA 3LC8A 4YU0A 4PFYA 1IXGA 1EH3A 3QUFA 3UIFA 3G3JA 3BFUA 1B46A 4H0WA 3U8QA 1Y3PA 3I3VA 3OSQA 1GR2A 3TMGA 1MY1A 1LAGE 1M5BA 1SW5A 3QIMA 3RT8A 2H9BA 3THIA 3SEVA 3S4UA 3K00A 2Q88A 4BDOA 1SI0A 5H8QB 4C0RA 2RKMA 2UVGA 3K0VA 4PP0A 2UVHA 5AA2D 1FW0A 1WVJA 4OESA 4ZECA 2HEUA 2GHAA 3O97A 1JW1A 4OETA 5DTBA 2XXXA 1TFAA 2ZNSA 5BUUA 1D3KA 3Q27A 3O66A 4H5GA 1OVTA 4F3SA 2QS3A 3JZJA 2UYEA 1R6ZA 3FXQA 3IORA 3UN6A 3C9HA 4ZZEA 5I59A 3MBPA 2ZYNA 2Y84A 3Q26A 1QKBA 1FQCA 2B3FA 3M3KA 3TODA 2Y7RA 4POWA 1B4ZA 4I9DA 5ISUA 2I4CA 2B3BA 4QFNA 1MQGA 5CM6A 1IEJA 1MG1A 4YMAA 2RINA 4DXCA 4H1XA 1ZTYA 3CVGA 4XXUA 1I69A 1B7ZA 1IITA 3U94A 1FTMA 5L9MA 1MPDA 3RN8A 2YJPA 1P1NA 3MJNA 4F1UA 3V89B 1P1OA 3CR9A 4JSDA 4NF5B 3RY3A 3DELB 1FQAA 5AA4B 2CZLA 1MPBA 3IJOB 3B6WA 4AQ4A 1LFGA 2Y7IA 4XKNA 3ONMA 1CB6A 1M5DA 3CG1A 3HHGA 1MH4A 3TCGA 4U2RA 2IA4A 4FATA 4TOZA 3FXRA 3RPWA 5HM4B 3G3KA 3DP6A 1EU8A 4H5FA 2XXVA 1JW4A 2REJA 3E9XA 2YPNA 3WAEA 1B51A 3SETA 3PUZE 5CRYA 2R6GE 3ZSFA 1RYOA 1LSTA 4HCWA 2HZKA 2QMWA 2VD3A 2HCAA 3K6WA 3RGYA 2XX8A 2HAVA 4IGTA 1Y4CA 1NH8A 4IB2A 2ZNTA 1NMUA 4QFKA 1PB9A 1N0TA 1R9LA 3F11A 3CI8A 4G68A 4MLQA 2X26A 3G3FA 4YICA 2Y7KA 3OEMA 4ZEKA 4PFWA 4G8HA 3TZAA 2AYSA 2DP8A 4HS7A 5HBCA 4XKQA 5I84A 1URSA 1LAHE 1AIVA 3CRBA 1D9VA 4H8JA 3TYHA 3UGWA 4HCYA 4C1TA 3FVOA 3VVEA 1H76A 3IOTA 1A54A 4YKIA 4F18A 4R72A 2OBGA 4ZDMA 4U23A 3PUYE 3MZBA 2OLBA 2Z23A 1MY2A 4KYSA 2GHBA 3PU5A 5H8QA 5EHSA 1URGA 3GXAA 4GF8A 3MVWA 2VOZA 1Y9UA 4KI0E 4GXSB 5F7VA 2BJJX 1QVSA 2AL5A 2X7QA 2FYIA 3OSRA 3SESA 1Y1MA 2O6AA 4N07A 2I4BA 5I57B 1SD3A 4R6HA 1I6AA 3OO6A 3LSLA 5B70A 3E3KA 3K6XA 1B3FA 4KYEA 4ONYA 4YB6A 3PUVE 2ZYOA 1MXXA 4GL8A 4JDFA 5EHMA 3CIJA 4RJZA 1MDQA 1GV8A 2QRYA 2DWHA 2ABHA 2XD3A 4OEVA 4RYAA 1UIUA 3ZS6A 3C32A 4R73A 3K1PA 1KWHA 1N7XA 2XXYA 4NF8A 5B7DA 1XT8A 1H43A 2H99A 3H6TA 4UACA 1B1HA 4EQ7A 1O63A 2DQVA 4BDLA 1QUIA 1B6HA 2V3UA 3W15C 5TP9B 3OOAA 1LB9A 3PPPA 4JWOA 3DP4A 5CBSA 4ELPA 4DLDA 2ONRA 4G77A 3A09A 1ATGA 1B3HA 4RPNA 1SW4A 1LCFA 4EXKA 1LAXA 3IB1A 1MQIA 2M8CA 1TT1A 1UTHB 1NNTA 4XTCQ 3GLBA 5DVJA 4Q0CA 5FHOA 2VP1A 1B0HA 1YCJA 2DVCA 3E13X 3U1OA 2O7IA 3GZGA 3M3FA 3TTRA 3FIRA 3MW0A 4U1ZA 3IO6A 4EDPA 3HPIA 5I2NB 3TTKA 3MQ9A 2REGA 3QAXA 1ZJLA 2CMOA 2PBWA 3QUJA 3FD3A 2QJEA 2PVUA 4KPTA 4RNSA 2V93A 1LLSA 3RT6B 4GVOA 2I3VA 4QFPA 1D4NA 1LFIA 4WEPA 2G29A 4M1VA 1NKXA 5FTHA 2D21A 2UVJA 4RPOA 3QXMA 3UP9A 3KG2A 5DVFA 4RXLA 3FVNA 2QS4A 1BTJA 1MQHA 3JV9A 1MXYA 4BDNA 2DXRA 3RLFE 5CMMA 1BLFA 1VFDA 4OXVA 2ANJA 4F19A 1DMBA 3KFMA 1IUDA 1A99A 4LVQA 4N13A 3TELA 5AE4A 3G3GA 2QPQA 2IEEA 3HCQA 4EQ9A 4HW8A 1MY3A 2NOOA 4U1OA 4OHNA 1GVCA 1TWYA 3FASA 3ZKKA 5BWJA 1NNFA 4DZ1A 3S2VA 3B6QA 5I57A 2QS2A 1PBQA 1B32A 4QFLA 2WKYA 3L6GA 4ZZAA 3CG3A 2XHDA 3QYTA 3TDJA 4DCXA 2GH9A 3IR1A 1XHYA 2VHAA 4IO5A 4P0GA 1TXFA 1NL5A 3KEIA 3SEYA 1MY4A 3TTLA 2A5TA 4R6KA 1MM6A 4NWCA 5DEXB 2I58A 3FGSA 4X9TA 5I2KB 3SEUA 1J1NA 4F1VA 3CFZA 4YAHX 5M2VA 1OLAA 5H8FB 1B9JA 5KDTA 4FORA 1MXWA 1Z7NE 4TLLB 3TEPA 3H7MA 3MC2A 5TP9A 3E4RA 5DYHA 3TTNA 4OQOA 1OVBA 4PFTA 3LSWA 1R9QA 1FTLA 4OZ9A 1Y4TA 3SERA 1XOCA 4LA9A 1B58A 4G8NA 1UTHA 4NEDA 4TLMB 3H6VA 5KCJA 3H4ZA 3K1NA 5ELVA 1XVXA 3SEXA 2G93A 4QSDA 4GLIA 1N3XA 1SW2A 1NNKA 4I62A 3FVKA 3D4GA 3C35A 4NTLA 4ECFA 2XD2A 1MH3A 1AMFA 4U4XA 2Z8FA 1URDA 2ZYMA 2Q2CA 4JSOA 2DS9A 4POXA 1M5EA 2UVIA 4ISUA 3RNNA 1UIVA 3N26A 1A7LA 3KOTA 5CMBA 5I2NA 3KJ7A 2HZLA 4E0XA 3MPKA 3PV0E 2HXWA 1PC3A 2DWAA 4H6DA 4F3GA 3TKDA 5H8NB 2O68A 1B40A 4KD5A 5H8HB 4HTGA 3QSLA 3UORA 4GL0A 4G2ZA 2DOJA 3G3HA 3K02A 5JTYB 3VLVA 1VR5A 1ZBMA 3PUXE 1FQFA 3I5OA 3T9VA 2Q89A 5TPAA 4DIGA 2V3QA 3VVDA 5FHMA 2FNCA 4YKKA 4LQ2A 2OZZA 2Z8EA 1LBBA 2THIA 4LUBA 4O3AA 1SQYA 2Y7PA 4NWDA 3PMXA 2YLNA 1DTZA 3MZ9A 3A3CA 1MQDA 3H06B 2DE3A 3TCFA 1B1XA 5JK4A 1A40A 4GQOA 1AH5A 1GGGA 2PMSA 2V25A 4NF6B 1JQFA 1JETA 2V84A 4LZ5A 3VDFA 3VVFA 3DM0A 4PE5B 3O6IA 3V8XB 3OO7A 4K3FA 4WXJA 2I49A 3LUYA 4IO3A 1JVXA 2O7UA 1SVXB 4EF2A 4JWXA 4PETA 1AL3A 4FAJA 1MXUA 2P2AA 3EN3A 2Q2AA 3BFTA 3T93B 5I2KA 1IXIA 5CI5A 3S9EA 3Q25A 2Y7WA 4GD5A 2O1MA 5AA3A 1IZ1A 5CC2A 5ICQA 3VXCA 1OMPA 3MVYA 5H8FA 4EF1A 1DTGA 4OTEA 4GXAA 1EZPA 1BKAA 4GIZA 3T66A 3RTWB 2PT1A 2QL3A 1JNFA 5ITPA 1N76A 1US5A 4R9FA 5AA2B 1IIWA 5IAIA 3MP8A 1PEBA 4AB6A 1QULA 1SDXA 4R9GA 3FJ7A 3DP8A 2Z22A 4G4PA 1WDNA 2O69A 1ZU0A 3OEKA 4LQ5A 1MPCA 3IL1B 1NNPA 1HSJA 1POY1 5DVIA 3AXFA 1H3DA 3KSXA 2LAOA 2XXPA 5A5XB 1SW1A 1LFHA 4NF5A 3U93A 3MZ1A 1MRPA 4MFIA 5AA4A 4R2BA 3H6UA 3FVGA 3BBRA 3FZVA 2DVZA 1XVYA 2ONSA 3B6TA 2I0BA 2Q9TA 3HHFA 1HSEA 1PB7A 2H25A 4R75A 3UK4A 4FEDA 2HAUA 1UQWA 1L5TA 1FCKA 3N5LA 2VGQA 3PD8A 3MVZA 3QK6A 3JYRA 1OQHA 3KGCA 3V83A 4OWDA 1B7UA 4O3CA 4ELRA 2XXIA 1S9TA 5H8NA 4F1YA 5H8HA 1Y3QA 1QUKA 4QFOA 3WAFA 3TPAA 3N94A 1VE4A 2O51A 4NF4B 1DPPA 1ZIUA 3G3IA 4GWOA 5CMCA 2QMXA 2KLFA 1AOVA 2NVUB 1BIYA 4QF9A 2H5YA 5JTYA 1DSNA 3SDFA 1ELJA 3IOVA 4P0IA 1H44A 4WKMA 2XXTA 2DWIA 3RTFB 2RC9A 2XXWA 3KJTA 4M4GA 1ZKBA 3EF7A 4KYDA 3TTMA 3FXUA 2XX9A 3Q29A 3VV5A 3OMBA 4JWYA 4R6YA 4OENA 1POTA 3ECRA 3N6TA 3PPNA 3O6GA 3IX1A 4C1UA 1CE2A 1QUJA 2OK2A 2GFEA 3CFXA 4R74A 4JXIA 4ESWA 3LR1A 2ESNA 4P11A 5HPQA 3T9HB 1ZMGA 1MXVA 2F5XA 2ZMBA 1A8FA 2H4IA 4NF6A 3IOWA 2P0SA 4YZZA 3H6WA 1LAFE 1FQBA 1SYHA 3H3GA 1UTBB 4I8CA 2A5SA 4U4SA 4WEDA 2DSFA 2NXOA 3C36A 4MF3A 3TQWA 1US4A 1H45A 3T9UA 4OVJA 4N6PA 4FECA 1SBPA 2PX1A 4IGRA 4G68B 1F9BA 3OENA 1ZLQA 3P7IA 4YKJA 3DLNA 3O28A 4X1DA 1NFTA 3KOSA 2UXAA 4RY1A 5JEIA 4Q5TA 5FTIA 1B3GA 2DYXA 4BDRA 2F36A 1BP5A 1Y3NA 4H8IA 2NUVA 4XKRA 1XS5A 2Z8DA 3ZKLA 2XX7A 3EQ1A 1OIBA 4NMYA 5TU0A 3S9NC 3GBBA 1B3EA 1USYH 1YPNA 4DXUA 4E0WA 4OEUA 5AA2A 2OWTA 3K01A 3LBSA 1VSOA 3TQLA 1WODA 4PFUA 3CSBA 1A55A 3FV1A 1P1WA 1Y1ZA 1N3WA 3OELA 4Z7EA 2ZXTA 1B2HA 3ODBA 2PYYA 3MP6A 4BLAA 3EHTA 4IY6A 5CBRA 2O84X 4ZE9A 2R9JA 3PPOA 4GFRA 3MPLA 3VXBA 3V5AA 5K2YA 4FEBA 4KCDA 5A5XA 2ALUA 4ESXA 5I58B 3KN3A 2I0CA 1S7YA 4DXBA 1I6QA 3R6UA 3OO9A 4DCYA 1PBPA 1Y20A 2I3WA 3RQTA 4ZE8A 4XKPA 5LOMA 1FQEA 3BKIB 3FUZA 1JW5A 4IO6A 2QSXA 4OERA 4R2FA 3O29A 4LZ8A 4NF8B 2F7AA 1NH7A 1MQJA 3EPEA 4O3BA 4F39A 1P1UA 5I56B 3EHSA 2F7CA 4GRKA 1Z7ME 4U21A 4NF4A 3LSXA 3USDA 3T22A 2F78A 1P1QA 2GRVA 3IO4A 1T0KA 2Q8JA 2D3IA 3SKPA 4G68C 3D4CA 2OWSA 2DE4A 4KCCA 1RYXA 3FJGA 1DPEA 3MUQA 3CSGA 2F7BA 1P99A 1QJMA 1EZ9A 3PD9A 4OFLA 3SEWA 1I6BA 2ONKE 4KHZE 4KR5A 4OMBA 5FHNA 3HV1A 3L6HA 4QRZA 3KN8A 4MLVA 3K1MA 1Q1KA 3O9PA 4RA1A 4LONB 2ZYKA 4YKPA 4RK2A 1LGBC 5J1DA 3PPQA 1JEUA 1UTBA 3C33A 4EUOA 3KZGA 1YAEA 2AL4A 3R26A 4TQUQ 3K4UA 4OFJA 3UA8A 2XXUA 3C31A 1XC1A 4Q8RA 1B5HA 4RK9A 2RC7A 2UYFA 2P1SA 1GTKA 2W7YA 2AIXA 3PMVA 1SI1A 3VLUA 3PUWE 4F2QA 2XXQA 1D9YA 2X7PA 3M3LA 3ILUB 3C34A 2HQ0A 1N7WA 1A8EA 1B4HA 2DE2A 2VD2A 1LB8A 4BDMA 4F3BA 1PB8A 5DT6A 1JVYA 3PPRA 3KBRA 5EYFA 5L9SA 5DEXA 5IKBA 1S50A 2PT2A 3TUSA 2RCAA 1IXCA 3GBAA 1EZOA 3H03A 3MAMA 4ZEDA 4EXLA 4QHQA 1QW0A 3I6VA 4MBPA 4XIGQ 4F29A 4ELOA 2DWJA 4F22A 2E1SA 4MH5A 2XXRA 4LZ7A 3Q28A 4ND9A 4OYVA 4OFOA 4YB5A 3ILTB 5I58A 3RUMA 3U92A 3TAJA 1IQ7A 4ZS9A 1Q35A 4KQPA 3HSTA 3K6UA 1FQDA 4KFQA 4F3PA 3B7DA 1FTJA 4JBZA 4ZEFA 3IOUA 2A5TB 3A3UA 2RC8A 1MS7A 3OD7A 4DDDA 4U22A 1MDP1 1N04A 3EHUA 1SYIA 1LCTA 5I56A 1USYE 4I1DA 1B3LA 3O2AA 3W9WA 1N84A 3PMWA 1MY0A 1O7TA 3C4MA 5KDTB 2FA7A 5I59B 1B05A 3IK6B 2F34A 1HSLA 2V3TA 3VLWA 4Z0IA 5ITOA 2F8DA 3CFLA 1B5JA 1II5A 4LATA 1FTOA 3KN7A 4JB7A 4UA8A 3VE1B 3IB2A 5CMKA 4QSCA 4YMBA 1PDAA 4G8MA 1QKAA 2I48A 3MP1A 3MVXA 4Q30B 1RKMA 1DOTA 1B7HA 4IO2A 3TCHA 3G7WA 4L17A 3N6UA 1R1NA 5KCJB 3K2DA 3S9MC 4IO7A 1FTKA 3W9VA 3OO8A 4AB5A 4THIA 4FJPA 4H65A 1OLCA 2F35A 2O1LA 3FV2A 3HN0A 1B0LA 3M8UA 3S9LC 2D5WA 2RCBA 5L8DA 4F2OA 5F1QA 3T9XB 4YB7A 5ICTA 2B65A 3LSFB 3HO7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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