3LSLA

Piracetam bound to the ligand binding domain of glua2 (flop form)
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Piracetam Defines a New Binding Site for Allosteric Modulators of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazole-propionic Acid (AMPA) Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, G
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lslA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lslA02
3PUZE 3LR1A 2Z22A 3F11A 1WDNA 1MY3A 4HW8A 4ZECA 5H8QB 5H8FB 2DE4A 2B65A 1IEJA 2VP1A 3FVKA 3CFXA 3OXNA 4OFLA 4NF5B 4GIZA 3S2VA 3EHSA 3DP4A 3MBPA 1YCJA 1AIVA 4POXA 1A7LA 2O51A 1ELJA 1QVSA 1LAXA 1LFHA 3HHGA 4LZ8A 5JTYB 1N84A 3R26A 4KHZE 4ZEIA 5K2XA 3O6HA 2IEEA 4RPNA 3EF7A 4GXSB 4AB6A 3HV1A 2G29A 3OO6A 1MQDA 3U72A 4BLAA 4LA9A 1A99A 4H5FA 1SYIA 4R9GA 3TMGA 3U93A 3IAZA 1ZTYA 3R6UA 1MXXA 1P1NA 3MVWA 2QPQA 3MPKA 4F3SA 4NMYA 4GXAA 1LSTA 3C33A 4H67A 5AA2B 3G3KA 3SETA 2RC8A 1P1UA 4FEDA 2DWHA 2ALUA 2VD3A 1TT1A 1H43A 3UA8A 2ANJA 1UQWA 2O6AA 3CFLA 2DXYA 1FTKA 3C4MA 4GF8A 2Z23A 5DEXB 3K6UA 1LLSA 3E9XA 5EHSA 1Y3QA 2Z8FA 3TTKA 2R9JA 3U8QA 4YKJA 1O63A 3KZGA 1ZU0A 3IOTA 1D9VA 5L9MA 3IOUA 4WXJA 4FJPA 2H4IA 2Y7KA 5CMCA 2ABHA 2X7PA 2ESNA 5FHMA 1FQAA 2O69A 1TFAA 4XKQA 2NXOA 2RC9A 2Q9TA 5CBRA 2O1MA 2UYEA 4GL8A 2P2AA 1UTBA 3V83A 3TCFA 2XHDA 1PC3A 5A5XB 3VDFA 3RUMA 3QUFA 2I58A 3MP1A 3RQTA 2A5TA 1XS5A 3ZKLA 4EUOA 4GWOA 1P1OA 1OIBA 4KCCA 3IX1A 3PGFA 3TTRA 3KJTA 3PV0E 4ELQA 3T22A 4C1TA 1L5TA 3RY3A 3GZGA 1LB8A 1MM6A 3FUZA 3N94A 1MH4A 1H76A 4F31B 2XXHA 3N26A 1NL5A 1O7TA 4IO4A 4DDDA 4GLIA 2QL3A 4G68A 4PFWA 2V3TA 1P99A 3VVDA 1GTKA 4U23A 4ZEBA 3LSLA 3I5OA 4RK9A 1LBBA 2HQ0A 4G8MA 3VVFA 4DLDA 1UIVA 3IO4A 3K1NA 3R7XA 4BDNA 3IORA 4MFIA 2FA7A 4F1UA 1DOTA 1LAFE 3PD8A 4QFNA 4QSDA 2QS4A 3LC8A 1JNFA 2D21A 4YZZA 5H8HB 3T93B 4BDOA 3RGYA 4EXKA 4U1OA 5AA4A 1YTVA 3SERA 4YB7A 1RKMA 1YPNA 2REGA 3O66A 2OJTA 5CMKA 3M3KA 1MXZA 1SW4A 1SI1A 3FV2A 4LONB 1TXFA 1FTMA 4LVQA 4Z0IA 2OWSA 2NUVA 2DQVA 1NMUA 3PUVE 1QJMA 5ITPA 3CR9A 1DTZA 2XXYA 4UA8A 2G93A 3BFUA 4KYSA 3FXQA 4KR5A 5FHNA 5CMBA 4LQ2A 4IO2A 4R72A 2QRYA 4F1VA 4LATA 3C32A 1TWYA 4K3FA 5H8SA 4FORA 4BDMA 4AB5A 1IQ7A 3H6VA 1B6HA 1M5DA 4F3BA 1P1WA 3ONMA 3K1MA 3O6GA 1QW0A 2F8DA 2O7IA 5IAIA 5CI5A 4OTEA 3SEXA 1NH8A 3BBRA 4TOZA 3H7MA 5ELVA 1LCFA 3OO8A 3ECRA 2Q2CA 1B58A 1UTHA 4YKKA 1FTJA 3LSWA 4R6KA 1Y1ZA 3CVGA 3KSJA 4XXUA 3JZJA 4RJZA 2XXPA 3PUWE 4R73A 1Q35A 3FXRA 5CBSA 2H99A 4MLQA 2XX7A 1VE4A 1SI0A 3C36A 3CSGA 2DOJA 3OO9A 5FHOA 4Q8RA 3G7WA 4RA1A 4JSDA 3H6UA 1LAGE 1ZMGA 1JEVA 3PU5A 4OESA 5K2YA 2Z8EA 1B5IA 1LAHE 1OVTA 1OQHA 3OENA 3ZS6A 4P0GA 1Z7ME 2HEUA 3TTNA 5CRYA 1XT8A 4NF6A 1II5A 1B3GA 3D4CA 2DP8A 4PETA 3QXMA 3FVNA 3MPLA 3G3JA 1B5HA 4F3PA 1MPCA 5CMMA 1UTBB 4R9FA 3MUQA 4OVJA 4OWDA 1JW5A 1EH3A 3TTLA 3FJ7A 2ONSA 5I57A 4Q30B 5JEIA 3FZVA 2A5TB 5EHMA 3PMXA 2FYIA 3PPOA 1S9TA 2O84X 1LB9A 4PFTA 5I58A 4TLLB 1BLFA 1R1NA 4O3AA 1FW0A 4ESXA 1D3KA 3Q26A 2AL4A 1MRPA 1DTGA 1MXUA 2XD3A 4GVOA 4U22A 2Q8JA 3KEIA 4QSEA 5I2KA 4OETA 4BDRA 2ONKE 2Y7WA 4G68B 3P7IA 2I0CA 4MBPA 5ISUA 1MH3A 1FTOA 2XXVA 4OQOA 4EQ9A 1UIUA 3D4GA 3PUYE 4U1ZA 1N3XA 3KBRA 1ZBMA 3QK6A 3LSXA 1B52A 1URDA 3TTMA 4OFJA 2RCAA 3FXUA 3O28A 3OD7A 3FD3A 2XXUA 1HSLA 4U4SA 4ZEDA 2ZYOA 1MXVA 1MG1A 4OXVA 1SDXA 4JBZA 4LZ5A 1USYH 1AMFA 2QS2A 5AA4B 4ESWA 4WKMA 4NWCA 4HCYA 4F39A 2VHAA 2DWIA 2I4CA 5DTBA 2AIXA 1Y4CA 1GVCA 2DYXA 3K01A 1IXHA 2QMXA 1FQDA 2ZNTA 3H6TA 1GR2A 2Y84A 4EDPA 2O1LA 3OOAA 4JB7A 1SQYA 4XIGQ 3VLUA 4IGTA 1IXIA 5I2NA 1O64A 1SVXB 3OO7A 4G2ZA 4E0WA 4M1VA 2ONRA 5CM6A 1VFDA 4F22A 3QAXA 3VXCA 2OBGA 3DP8A 2PVUA 1B40A 1B5JA 5B70A 4GRKA 1MDP1 2DE3A 3RPWA 1QKAA 5AA3A 1RYXA 3O2AA 4DIGA 3FVOA 4OZ9A 3MP6A 4IGRA 1PB8A 4EF1A 2DS9A 3S4UA 4P0IA 3SEUA 1B3HA 4PFYA 3EHUA 5KCJA 4GL0A 1NNTA 4F19A 4HS7A 4HTGA 3VV5A 1N0TA 2B3BA 3V5AA 1F9BA 2CZLA 2X26A 4XKNA 2HXWA 3A3UA 2P0SA 3TKDA 4R75A 3VVEA 3Q27A 3U1OA 2VD2A 1UTHB 3IO6A 5HBCA 2OWTA 1Q1KA 1LCTA 1S50A 1B51A 3VLWA 1B05A 4U4XA 3N5LA 1J1NA 4YB5A 1R9QA 4KQPA 4QFLA 3SEYA 4GFRA 2F35A 3IJOB 3Q28A 2ZXTA 1DMBA 2I49A 1AH5A 3MWBA 4KI0E 3PMWA 4YICA 3S9MC 1ATGA 2ZNSA 2CMOA 1IIWA 2F6PA 4H0WA 1A54A 1EU8A 4LZ7A 4N13A 1QKBA 3WAFA 1BKAA 4KCDA 2H5YA 3IK6B 1PB9A 2V3UA 3MAMA 1GV8A 2DVZA 1B4HA 3IR1A 4G8HA 1FCKA 1AOVA 3ILUB 1YAEA 1B4ZA 2V3QA 2HAUA 3T9HB 1IZ1A 2H98A 4I62A 3SDFA 3SESA 4HCWA 2I48A 3W15C 4WEDA 1FQFA 4LUBA 5TPAA 3SKPA 4NEDA 5M2VA 3RT6B 3T66A 3CRBA 2I3VA 4JWYA 2F7BA 2E1SA 3E3KA 2AYSA 1XOCA 1WVJA 3E13X 2UXAA 3CSBA 5I57B 3MZ1A 3CIJA 4X1BA 3V8XB 3RTWB 4F18A 4RY1A 5I56A 3TCGA 1B3LA 1B1XA 5I58B 4OERA 1NH7A 1SW5A 2YLNA 4R2BA 1I6BA 1BTJA 1PDAA 1NKXA 1ZIUA 3EPEA 3MVYA 5BUUA 4ZEFA 3MZBA 3G3HA 4DXUA 3KOSA 4G4PA 3KN3A 3H06B 2WKYA 2HFBA 2VOZA 2UYFA 4G8NA 1SBPA 5I2KB 1A55A 3IJXB 3KN7A 3OEMA 1MY0A 2D3IA 1FQBA 1B2HA 2DWJA 5BWJA 1JVXA 1VFEA 3KN8A 1B46A 3E4RA 1MXWA 4F2QA 4DE8A 3U94A 2HZLA 1H44A 2GH9A 1ZLQA 3Q25A 1B7HA 3TDJA 3KJ7A 1M5CA 2AL5A 2DVCA 4OEVA 4TLMB 4GD5A 3EQ1A 5JTYA 4FAJA 2KLFA 5IKBA 4YMAA 3M3FA 3TPAA 4G77A 4C1UA 2F7CA 1LFIA 3OMBA 1MY2A 4FIMA 4O3CA 1SYHA 2XXXA 3EN3A 5KZTA 1JW4A 2NWJA 4F29A 3PPPA 1MQIA 2IA4A 3OSQA 4KYEA 3O97A 3C35A 1XVYA 3K6WA 5DVFA 4O3BA 3PD9A 4PQJA 1I69A 1B7UA 1EZ9A 1FQEA 4KD5A 5ITOA 4Z7EA 5I2NB 4YU0A 3OELA 4YB6A 3HCQA 3RTFB 5F7VA 3G3FA 4IO3A 3USDA 1Y3PA 4RK2A 1QUIA 3LUYA 3B6TA 4ELRA 1B32A 3MVXA 4H6DA 3LBSA 3IL1B 4F3GA 2O68A 1R6ZA 1A8EA 4PP0A 5J1DA 1MQHA 2NVUB 4ZZAA 4R6HA 3PPRA 5TU0A 3V89B 5KCJB 1MPBA 5JK4A 5TP9A 2PBWA 3HHFA 4LP2B 3O6IA 2Q88A 4YKPA 3TUSA 3H6WA 4TQUQ 2F36A 2P1SA 3O9PA 1PBPA 2X7QA 3BKIB 4OHNA 3FJMA 2PT1A 5H8NA 2XXRA 4X1DA 1EZPA 1B1HA 4QHQA 4E0XA 3KFMA 3MJNA 2VGQA 1M5BA 3W9WA 4UACA 4ELPA 4H1XA 5L8DA 3TQWA 4ZE9A 2PMSA 4POWA 2GHBA 4JSOA 1VR5A 1LBCA 3IB1A 2F34A 4N07A 4ISUA 3VXBA 3DELB 3K6XA 1BIYA 3K4UA 3IOVA 3THIA 1N76A 3MVZA 5LOMA 4RNSA 5KDTA 2Q89A 1IUDA 1Y4TA 4NTLA 4RYAA 5TPAB 1D9YA 4QFKA 4ELOA 2HAVA 3CG3A 4OYVA 5HM4B 1ANFA 5ICTA 4IO7A 3JV9A 2GHAA 3PPNA 4P11A 3Q29A 1N04A 1OMPA 4I9DA 4DCXA 3IB2A 3MZ9A 3C9HA 4FATA 4NF8A 1WODA 1HSJA 2DXRA 5I56B 1Z7NE 1Y9UA 1OLCA 1EZOA 4QSCA 1LGBC 1H3DA 3MQ9A 4OMBA 3U92A 5DVIA 4ZS9A 1B7ZA 3HO7A 1XVXA 4EQ7A 3G3IA 1MQGA 2O7UA 1FTLA 3BFTA 1IITA 1MY4A 2XXIA 1MDQA 1JVYA 3KSXA 3FVGA 5AA2D 3TEPA 1S7YA 4ONYA 4JWXA 4L17A 4NF4A 3K1PA 1POTA 4N6PA 4M4GA 3FGSA 4H8IA 1FQCA 3VFJA 1POY1 3CG1A 3HN0A 1Y3NA 1MPDA 2UVJA 3S9EA 1QUJA 3I3VA 4QFPA 1JETA 1PBQA 4EF2A 3RN8A 4X9TA 3ILTB 3H4ZA 2HZKA 3UGWA 4FEBA 4XKRA 4KPTA 3MW0A 1Y20A 1BP5A 1JW1A 3T9VA 4GQOA 2HCAA 4OEUA 1XHYA 3SEWA 3B6QA 1JQFA 3K6VA 1US5A 4XKPA 3KG2A 3TZAA 3IB0A 1MY1A 4DCYA 1CE2A 4YKIA 5I59A 2RCBA 4X48A 1IXCA 4IY5A 1MS7A 1D4NA 4BDLA 3FASA 3FATA 4R2FA 3N6UA 4OENA 2OK2A 1OQGA 2Y7IA 2RKMA 3T9XB 3K0VA 2THIA 4ND9A 1OVBA 3OSRA 4GOTA 1N7WA 2W7YA 5I84A 1B0LA 4U2RA 4KFQA 3MP8A 1ZJLA 2XXTA 1B3FA 3A09A 2M8CA 4OFOA 3JYRA 2XX8A 3K2DA 4Q5TA 3H03A 5CC2A 1JEUA 5TP9B 2OLBA 2XXWA 2F78A 4NWDA 1SW2A 2UVGA 4H8JA 1I6QA 2DWAA 5HPQA 3KGCA 3LSFB 4YMBA 3W9VA 5H8NB 4NF6B 4Q0CA 3FJGA 1PB7A 2PYYA 4H65A 3RNNA 3S9LC 5ICQA 4XTCQ 4IY6A 2QJEA 3DLNA 4ZEKA 4IO5A 2F5XA 1USYE 4ZE8A 1NFTA 2NOOA 3HPIA 2R71A 3RLFE 1KWHA 3GXAA 3SEVA 3TCHA 2XXQA 3K02A 1CB6A 3OEKA 5FTIA 1LFGA 5KDTB 3UN6A 2ZYNA 2F97A 2QSXA 1H45A 2XD2A 1I6AA 1MM7A 4EQBA 4JWOA 3T9UA 2V93A 1PEBA 5H8QA 2ZMBA 3QIMA 5H8FA 3UK4A 4MH5A 3KOTA 2RF1A 4H5GA 4C0RA 4NF5A 2Y7PA 4KYDA 3WAEA 4I1DA 4I8CA 2E0SA 4NF8B 1R9LA 3CFZA 1ZKBA 3C31A 3A3CA 1MQJA 2YJPA 5B7DA 2F7AA 2ZYMA 2I0BA 1NNFA 2I6EA 2I4BA 1A40A 3M3LA 3O29A 1NNPA 1SD3A 4R74A 1T0KA 5F1QA 2DSFA 2XX9A 4ZDMA 2DE2A 4NF4B 3L6GA 1DPEA 1DPPA 2D5WA 2Z8DA 2GRVA 4PFUA 5DVJA 3DM0A 3TFLA 5L9SA 3EHTA 3FV1A 2Y7RA 3TAJA 1TFDA 2V84A 4NE4A 3TQLA 3GLBA 3CI8A 3QUJA 5AA2A 4FECA 3ODBA 2Q2AA 3VLVA 1URGA 4MLVA 2FNCA 3B6WA 4ZZEA 4MF3A 2GFEA 4JXIA 4F1YA 3PMVA 1MXYA 1N3WA 5DEXA 1URSA 2ZYKA 2QS3A 5DYHA 3AXFA 4IB2A 2QMWA 3T96B 1OLAA 3TELA 2ZNUA 1NNKA 3VE1B 1M5EA 2BJJX 4PE5B 3N6TA 1DSNA 5AE4A 5I59B 2RINA 4QF9A 3PPQA 3H3GA 2OCUA 1HSEA 4IO6A 1IXGA 3ZSFA 2F6GA 1QUKA 1B9JA 2REJA 4THIA 2PT2A 4QFOA 3ZKKA 1GGGA 5A5XA 2QS1A 2I3WA 2OZZA 5FTHA 3MC2A 3HSTA 3RT8A 2YPNA 1QULA 3GBAA 1AL3A 3K00A 4G68C 5DT6A 3B7DA 4RXLA 1M5FA 1RYOA 4F2OA 1B0HA 3UP9A 3IOWA 5EYFA 3PUXE 1SW1A 1Y1MA 2B3FA 2H9BA 4QRZA 3S9NC 1B3EA 2LAOA 3DP6A 1N7XA 5L9OA 4U21A 4BDQA 2V25A 3G3GA 3GBBA 2A5SA 2H25A 3TYHA 4WEPA 3M8UA 4AQ4A 2UVIA 4ECFA 4JDFA 4LQ5A 4YAHX 3TODA 3FIRA 3UIFA 2R6GE 4DZ1A 5AA1A 4FE8A 4DXBA 4DXCA 2PX1A 1VSOA 3C34A 4R6YA 2UVHA 1A8FA 1XC1A 1US4A 4EXLA 3I6VA 5H8HA 3QYTA 3QSLA 3UORA 3L6HA 2RC7A 1P1QA 4RPOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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