3LSLA

Piracetam bound to the ligand binding domain of glua2 (flop form)
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Piracetam Defines a New Binding Site for Allosteric Modulators of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazole-propionic Acid (AMPA) Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, G
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lslA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lslA02
1PB9A 5AA1A 1H3DA 2REGA 4G68B 4GVOA 4IY5A 4FATA 5H8FA 5EYFA 4QSDA 3EN3A 3K1PA 3KN7A 1T0KA 1LCTA 4I62A 1JQFA 3OSRA 1AL3A 2Z8DA 4ELRA 3E4RA 2DWAA 4WEPA 4FE8A 2I48A 4GIZA 3LC8A 1IXHA 4ONYA 1N7WA 2HZKA 1XS5A 2O1MA 4YKKA 5KCJA 3FZVA 4QHQA 4DXUA 2Z22A 5CI5A 1LGBC 1BIYA 3ECRA 3C33A 1O63A 4Q0CA 5FTIA 5AE4A 3Q27A 1D4NA 1OLCA 4QRZA 2O7UA 5TP9B 2PX1A 4C1UA 1WODA 1VFDA 3WAEA 2Y7WA 3S9NC 4G8MA 1HSEA 1USYE 5HPQA 4IB2A 2Q2AA 4UACA 3VXBA 4R72A 1SI0A 1XVXA 2XD2A 1SDXA 3JYRA 2E0SA 4TOZA 1B58A 3PUZE 2FNCA 2QL3A 1O64A 2UYEA 1QULA 3PMXA 3T93B 2XXTA 5I56A 2KLFA 3MQ9A 1BTJA 1VE4A 1P1WA 3UN6A 4DCYA 2WKYA 5CC2A 1P1NA 3O9PA 1ZIUA 1PB7A 4GXSB 2XXVA 2I4BA 1VR5A 4GOTA 1JVYA 1TFAA 3LSFB 1QUJA 4BDNA 2M8CA 3CFZA 1AOVA 3RQTA 4YB5A 1URGA 3K6WA 1DTGA 2FA7A 2DS9A 1MPCA 4QFLA 1OIBA 3BFTA 4QSEA 3KN3A 4H8JA 3FXQA 1URDA 3THIA 3O97A 3SEYA 2O68A 5ICTA 4ZEBA 1OVTA 1Y4TA 5H8FB 4ISUA 4F3GA 1Y3NA 3ZSFA 5K2XA 1B3EA 2I0BA 3JZJA 2XXPA 3PPQA 1IIWA 3TODA 4JXIA 3TPAA 3S9MC 2P1SA 3PD8A 4RA1A 2QJEA 1OQHA 2GFEA 1B3HA 2R71A 2XX9A 3RPWA 1B0LA 4EXLA 1B5HA 3TFLA 5CRYA 1LCFA 3FV1A 3KGCA 3UA8A 2R6GE 1IXGA 3FD3A 3LSLA 2I0CA 1B7UA 3H06B 1S7YA 1M5FA 4PQJA 4F22A 3OO8A 3C32A 3KFMA 4ZECA 1II5A 1Y4CA 3V8XB 4NF4A 4FORA 5DTBA 2XX8A 3FASA 3K0VA 2YLNA 4ZZEA 3TCGA 1FW0A 4IO5A 3MZ9A 3A3UA 5I56B 4NE4A 1GGGA 3O28A 4G8HA 3MVYA 4KYSA 4IO7A 4M4GA 2OWSA 3VVFA 2DQVA 4OMBA 3V5AA 3EHTA 4U1ZA 3IR1A 3MVWA 3K6UA 2QMWA 3KEIA 4H5GA 5I2NA 3K1MA 3E9XA 3RTFB 4OWDA 3E13X 1LFGA 4DXBA 2V25A 4DZ1A 3KJTA 4ND9A 3VE1B 4X9TA 1MS7A 3C9HA 4OESA 3U8QA 1GVCA 4POXA 3G7WA 2HFBA 3F11A 3VVEA 4ZZAA 3FJMA 3R26A 2DE2A 3TQWA 2X26A 1EZPA 4Q5TA 1GTKA 5L9OA 1OMPA 2XXUA 1ANFA 2NWJA 5I57A 1IXCA 5ELVA 2PMSA 3QUFA 2V3UA 1NNFA 4P0GA 2Y84A 4BDRA 1QUIA 4FECA 1FTJA 2G93A 3SDFA 1JEVA 1JVXA 4IO3A 4DLDA 1N76A 3OENA 4YMAA 4ESWA 1B7ZA 3OEKA 3HV1A 2HAVA 1Y20A 3CSGA 3KSXA 2OBGA 4AQ4A 3PPPA 1EH3A 1B0HA 1FQAA 2H5YA 3DELB 4I9DA 2F34A 4NEDA 3DP6A 4NF4B 3U1OA 4EQ7A 3SKPA 1POY1 4LZ7A 3T9XB 5I59A 1B5IA 1QJMA 5K2YA 1MY0A 1GR2A 4JB7A 1FQDA 2H99A 2RCBA 3TTMA 1MXWA 5BUUA 1JETA 1A54A 4QSCA 1A7LA 1MXUA 3TEPA 3HN0A 5HBCA 4O3CA 3VLWA 4KI0E 1Y3QA 4LUBA 4BDOA 1NFTA 4IO4A 4R9GA 5TPAA 2R9JA 1LFIA 1H44A 3CRBA 1B9JA 1ZJLA 3M3FA 3PPNA 4OFLA 1NNTA 3HSTA 1RYXA 1MM6A 2Q88A 4XKRA 4HCWA 4RK2A 4U2RA 5HM4B 3SETA 2I3VA 3OO7A 3LBSA 1NH7A 4Z7EA 5TP9A 2O7IA 3I6VA 1NL5A 4DCXA 4F2OA 2REJA 4GQOA 4UA8A 3W15C 5TU0A 1BP5A 4EQBA 4XKPA 1ELJA 3FUZA 3O66A 4OHNA 3O29A 3FXRA 4F39A 4PFTA 2H4IA 2BJJX 4N13A 2UVJA 4KYDA 3T9HB 4F18A 3FJGA 1US5A 3OSQA 3O6HA 3KJ7A 1Z7ME 4XIGQ 1BKAA 4Q30B 1FTLA 4HTGA 1B3GA 2V84A 3FJ7A 1FQBA 1QUKA 2O6AA 5I59B 4RPOA 4YKPA 3RTWB 3H7MA 1B7HA 5JEIA 2ZNTA 1URSA 1SW1A 3MW0A 4BDQA 5H8NB 1SW4A 2Q8JA 5M2VA 3TCHA 4ZE8A 4NF6A 3A09A 4ELPA 5TPAB 3E3KA 4GLIA 1WDNA 5J1DA 3VV5A 2O1LA 5CMCA 3V89B 3UK4A 4OYVA 4GRKA 1P99A 3FVKA 3ZS6A 1I6BA 4KYEA 4U23A 5B7DA 4YKJA 1HSJA 3JV9A 2B3BA 1F9BA 3C36A 2ABHA 4AB6A 2HEUA 1UIVA 2Q2CA 2ZNSA 4R2BA 2O69A 2UYFA 4PE5B 3KBRA 1AIVA 5ISUA 4LQ5A 1NKXA 2XXXA 4OFJA 1TWYA 1MG1A 4XTCQ 3TAJA 3HHFA 3IO4A 3G3KA 3HO7A 1US4A 1MXVA 5CMMA 2YPNA 1N0TA 4ZDMA 1PEBA 5CMBA 2G29A 2IA4A 4GXAA 4NMYA 2NXOA 1TT1A 2Z8EA 3D4CA 2ANJA 3B6QA 2O84X 2Q9TA 3Q26A 1MDP1 1QVSA 3PUVE 1J1NA 3S2VA 5EHSA 4GD5A 3OO9A 1UQWA 4RY1A 1LB8A 3IJOB 3H6WA 3OMBA 1LBCA 3SESA 3I5OA 3VXCA 5IKBA 3EHUA 3TZAA 5H8HA 1YAEA 4C1TA 4JSDA 1I69A 4RXLA 3CI8A 4NF6B 3LR1A 2PT1A 3IOWA 4MBPA 4R73A 5FHNA 4U21A 3VVDA 2F35A 1NMUA 2ONKE 3GBBA 4KFQA 3N94A 4XXUA 5BWJA 3H6UA 1R6ZA 4PFUA 3G3FA 2F7AA 4ZEDA 3M3KA 1I6QA 2ZMBA 3D4GA 1H43A 1M5BA 4ZEFA 1P1UA 2VD2A 3TQLA 3IAZA 5DYHA 1NH8A 5JK4A 4RNSA 3UP9A 5CBRA 3MZ1A 4E0WA 3PD9A 5KZTA 4GL0A 4IGRA 4JWOA 2HAUA 1N3XA 3S9EA 3R7XA 2XXIA 2F6GA 3RLFE 3MUQA 1DOTA 2CZLA 1B3LA 1YPNA 3EQ1A 4THIA 1SW2A 1A40A 2F6PA 4KR5A 2DXYA 1DSNA 2V93A 4F2QA 2RF1A 2RC7A 4KCCA 3U72A 4FJPA 4X1DA 3IB2A 4IY6A 1B1XA 4DIGA 1FCKA 5AA4B 2O51A 2UXAA 4LP2B 3K02A 1Q35A 2OCUA 2AL5A 1XVYA 2I4CA 3O6GA 4OERA 1SW5A 5H8HB 4EDPA 2FYIA 4LQ2A 5AA2A 2HQ0A 2PT2A 1ZU0A 4H5FA 4KD5A 4NWCA 1DPEA 2UVGA 1B32A 4EF1A 4G8NA 4F3BA 3MPLA 2YJPA 3SERA 3FVNA 4Z0IA 2DWHA 2F7CA 2I49A 2HZLA 1EU8A 1XT8A 3T96B 1MDQA 2B3FA 3S9LC 2QPQA 1NNKA 2QS1A 3G3JA 4IO2A 1Y1ZA 1BLFA 3TMGA 4F31B 4YKIA 1NNPA 2OJTA 4GWOA 5B70A 1B3FA 2QRYA 1P1QA 4G4PA 3CSBA 4IGTA 4I8CA 3IORA 1R1NA 1ZLQA 2DE4A 2Y7PA 4NTLA 3ILTB 1N7XA 4JWYA 2VP1A 2F36A 2Y7RA 1S50A 4ECFA 1FQCA 3SEWA 1CB6A 3CG1A 4U1OA 1LFHA 3FGSA 4X48A 3C4MA 4R6HA 4H0WA 3K6XA 2E1SA 2P0SA 1N04A 4KHZE 5H8NA 3MC2A 3VLVA 1D3KA 4OEVA 1IUDA 1SYIA 3W9VA 2OZZA 4JDFA 3LUYA 1DPPA 1LLSA 2F8DA 2VD3A 2D3IA 1B5JA 4H67A 1MH4A 2DVZA 4POWA 1Y1MA 5F1QA 1M5EA 4JBZA 1B6HA 3PUYE 2XHDA 2PYYA 2H9BA 5AA2B 4KPTA 3PU5A 2RCAA 3VDFA 3C35A 3L6GA 1H76A 4OXVA 3K6VA 3CFXA 1SYHA 5L8DA 4LATA 3RGYA 3BFUA 4FEBA 2QSXA 3G3GA 2X7PA 3SEVA 4LZ5A 5H8SA 3TTRA 3MZBA 3LSXA 1PB8A 2QMXA 3MP1A 2I3WA 2XXHA 2Z8FA 1H45A 4KQPA 3K1NA 3EPEA 3N5LA 3OOAA 4LA9A 4F3PA 3SEUA 1XHYA 5L9MA 2XXQA 3GZGA 2Y7IA 2ZXTA 1B4ZA 2DYXA 4PFWA 3RN8A 3G3HA 1XOCA 3T22A 3MBPA 1IZ1A 5CMKA 4DXCA 2ZYNA 3S4UA 3PUWE 1A99A 4QFNA 4RPNA 3V83A 2GHAA 4YU0A 1UTHA 3IOTA 3IJXB 2I58A 4GL8A 3PMVA 4NF8A 3K2DA 4K3FA 4P11A 4F3SA 3PPOA 1TXFA 3R6UA 3O2AA 2X7QA 4RJZA 4F29A 1B05A 4NWDA 1R9LA 2DOJA 4I1DA 1B4HA 3MJNA 4YB6A 3MP8A 3T9VA 5LOMA 4DDDA 4QFPA 1LSTA 4R6YA 2F5XA 3W9WA 4OQOA 3BKIB 1VFEA 1N84A 2OK2A 3QUJA 4ELQA 4WKMA 3RNNA 2IEEA 3KG2A 4WXJA 1QKBA 5CBSA 4ZEKA 3QYTA 4BDLA 1LAXA 3P7IA 3GBAA 3QIMA 3TYHA 3GLBA 1VSOA 3CFLA 3IOVA 5H8QA 3B7DA 2VHAA 5AA3A 2VGQA 4U22A 4LONB 1UIUA 3K01A 3C34A 3VFJA 2QS3A 3H6VA 2A5SA 5DVFA 3DLNA 4NF5A 3RUMA 4R6KA 5FHOA 4GF8A 5JTYA 3FIRA 5ITOA 1DTZA 4ZEIA 1LBBA 1MH3A 5L9SA 3QAXA 3IB1A 3IL1B 2UVIA 1MXXA 1PC3A 1SD3A 4YMBA 1A8FA 3EHSA 2RKMA 5AA4A 3IO6A 1HSLA 1UTHB 5A5XA 3RY3A 1Y3PA 1B40A 4NF8B 4EUOA 2DWJA 1Q1KA 1A8EA 4OENA 1AMFA 3B6TA 2D21A 1SI1A 4R2FA 1JEUA 3KOSA 4R9FA 2NUVA 1UTBA 4U4SA 1P1OA 1AH5A 1POTA 1MQJA 3PUXE 4AB5A 3H6TA 3VLUA 2Z23A 3FVGA 5FHMA 1B1HA 4GFRA 3N6UA 3G3IA 5I58A 4Q8RA 4U4XA 1O7TA 1YTVA 2NOOA 1B2HA 3ONMA 2AYSA 4F1VA 4BDMA 4E0XA 5FTHA 2ONSA 3MWBA 2Y7KA 5KDTA 3DM0A 3C31A 3UGWA 4H65A 3TTNA 3IB0A 1MY1A 3ODBA 5KCJB 3K00A 4F19A 4G77A 2DWIA 2PBWA 4ELOA 1DMBA 2DVCA 3Q28A 2HCAA 1JNFA 2D5WA 5H8QB 3PMWA 4DE8A 3IX1A 4O3BA 4OETA 1MY4A 3Q25A 4MH5A 2ZYKA 3FVOA 3DP8A 2XXYA 4FEDA 1Z7NE 5CM6A 3IK6B 1FTOA 4NF5B 2HXWA 4YZZA 2DP8A 4H6DA 4MF3A 3TELA 1B46A 4HW8A 1S9TA 4EXKA 3FATA 5JTYB 2ZYOA 4P0IA 1JW1A 4MLQA 2PVUA 1SBPA 4R75A 1PBPA 1I6AA 2GHBA 1USYH 1M5DA 4PFYA 2AL4A 3HCQA 1MRPA 3MVXA 2F7BA 4X1BA 1PDAA 4MFIA 1LAGE 3WAFA 4IO6A 2ZYMA 1XC1A 1ZKBA 1MY2A 4HCYA 1MXYA 5A5XB 2V3QA 1EZ9A 4QFOA 1TFDA 3MPKA 1ZMGA 3OEMA 3SEXA 3T66A 4C0RA 1FQEA 4G2ZA 1UTBB 3TKDA 3UIFA 1KWHA 3U93A 4N07A 3OXNA 1ZTYA 2QS4A 5DT6A 2XD3A 1OVBA 5I58B 1OQGA 3TDJA 4OTEA 3T9UA 1QKAA 3TTKA 5F7VA 1R9QA 3H3GA 3RT6B 1FTKA 1IITA 5KDTB 3PPRA 3LSWA 2OWTA 2RC8A 3A3CA 3EF7A 1CE2A 4F1UA 3GXAA 2Q89A 1EZOA 1YCJA 1PBQA 5IAIA 4EQ9A 3CR9A 4WEDA 4KCDA 4YICA 3ZKKA 5EHMA 3QXMA 5I2KA 3N26A 4YB7A 4OFOA 4RK9A 3ILUB 2H98A 2CMOA 5DEXA 5ICQA 4H1XA 3O6IA 2VOZA 1MQIA 1MPDA 3H03A 3L6HA 1ATGA 2GRVA 2OLBA 3DP4A 1JW4A 1IEJA 3K4UA 3KSJA 4ESXA 2A5TA 4O3AA 4H8IA 1MQHA 4EF2A 4ZE9A 3CIJA 2UVHA 4OEUA 1Y9UA 3IOUA 2ALUA 3U92A 1D9YA 4TLLB 1FTMA 3AXFA 4N6PA 4YAHX 4TQUQ 1IQ7A 3HPIA 1RYOA 2B65A 1SQYA 2XX7A 2NVUB 2DXRA 1ZBMA 5I2NB 4G68A 4JSOA 3QSLA 5I84A 4XKNA 1JW5A 3RT8A 4LVQA 4OVJA 4M1VA 4QF9A 2F78A 3MVZA 4F1YA 2ONRA 1M5CA 1N3WA 3TCFA 1IXIA 3I3VA 4G68C 5AA2D 1D9VA 1MM7A 3N6TA 3QK6A 3CG3A 2GH9A 1OLAA 1WVJA 2ESNA 2RC9A 2XXRA 2THIA 3OD7A 1SVXB 2H25A 5I57B 2ZNUA 2F97A 1FQFA 3OO6A 3M3LA 4FIMA 3USDA 4PP0A 4JWXA 1B51A 2AIXA 3FV2A 3PV0E 4ZS9A 4XKQA 4TLMB 2W7YA 2I6EA 3PGFA 3TTLA 2DSFA 1A55A 2DE3A 5I2KB 3UORA 1QW0A 3OELA 5ITPA 3KN8A 3KZGA 4OZ9A 2P2AA 4R74A 1GV8A 3M8UA 3Q29A 4MLVA 4PETA 3BBRA 5DEXB 2V3TA 5DVIA 1LAFE 3U94A 3H4ZA 1B52A 1MY3A 3ZKLA 1MXZA 5DVJA 2RINA 3MP6A 1MQDA 3FXUA 1MPBA 2A5TB 1RKMA 1LAHE 4BLAA 2QS2A 4QFKA 4RYAA 1MQGA 4FAJA 3B6WA 4LZ8A 2LAOA 2XXWA 3MAMA 3HHGA 3KOTA 4HS7A 3TUSA 4L17A 1L5TA 1LB9A 3CVGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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