1Q35A

Crystal structure of pasteurella haemolytica apo ferric ion-binding protein a
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
318
structure length
317
Chain Sequence
ANEVNVYSYRQPYLIEPMLKNFEKDTGIKVNIIFADGLVDRVKQEGELSPADVLLTVDISRVMEIVNADLAQKIDSKVLEKNIPAQFRDSNDQWFGLTTRARVIYTSKDRVGKLPAGFDYLDLAKPEYKGKVCVRSGKNSYNVSLFAAMIEHYGIEKTKAFLEGLKANLARKPQGGDRDQVKAIKEGICDYSIGNSYYYGKMLDDEKQKSWAEAAIINFPSGEHGTHKNISGVVIAKHSPNKANAVKLIEYLSGEKAQGLYAELNHEYPVKEGIEPSAIVKGWGTFKSDTIKLEDIAKNYEAALKLVDEVKFDDFSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Metal binding protein
source organism Mannheimia haemolytica
publication title Crystal structure of Pasteurella haemolytica ferric ion-binding protein A reveals a novel class of bacterial iron-binding proteins
pubmed doi rcsb
molecule keywords iron binding protein FbpA
total genus 124
structure length 317
sequence length 318
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-07-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1q35A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1q35A02
1Y3NA 5KCJA 3BFUA 4EQBA 5H8FB 1B5IA 2RINA 3SEUA 3LUYA 4FECA 1USYH 1XVXA 3TAJA 1B1HA 4GF8A 4RA1A 1DMBA 1DPEA 4EF1A 3HHGA 2O51A 1SD3A 5AE4A 4YB7A 1OLAA 2RF1A 3OO8A 2I3VA 3ILUB 3JYRA 4XKPA 1P1OA 4WXJA 4ZS9A 3S9MC 3PUXE 4JBZA 1M5CA 3FJMA 3TCHA 2X26A 1OVBA 4RY1A 5L9OA 3EN3A 2Z8EA 2RCAA 1EU8A 1SYIA 3MP1A 3MAMA 1SDXA 1GR2A 1FQEA 3CRBA 2G29A 1N7WA 3S9EA 5I2KA 1UIVA 4NF8B 2D21A 3PPQA 2R9JA 2E1SA 2Y7RA 4OXVA 1MM7A 2PBWA 3GZGA 4OFJA 4RYAA 2AIXA 1Y1MA 1B2HA 1XVYA 4O3CA 3PPOA 3Q28A 5JEIA 2THIA 2OBGA 3U1OA 1TXFA 1JQFA 3EQ1A 2HAVA 3VV5A 2HAUA 5AA4B 3RT6B 5ICQA 1UQWA 3M8UA 3O6GA 2UVGA 2F6PA 1TFAA 4QF9A 4G68A 4YMBA 2DSFA 5ELVA 1MY2A 1B1XA 2PMSA 3K4UA 1IXCA 5A5XB 1I6QA 2P0SA 3QAXA 3LSFB 3H7MA 2UYEA 1QUKA 4TLMB 3R26A 1ATGA 1J1NA 3KGCA 4N6PA 1SVXB 1Y3QA 5L9MA 2I58A 5FHOA 4NF6A 1PBQA 5B7DA 5AA4A 1AL3A 1MY3A 3GLBA 5DTBA 4LONB 1GTKA 4JDFA 4ZEIA 1LFGA 4YKKA 4IO3A 4H5GA 2H98A 4YU0A 4F1VA 1SW1A 4G8HA 3PMVA 4C1TA 1PB7A 3OEKA 2RCBA 3Q26A 5DT6A 5AA2D 1LFIA 1S50A 5JK4A 2DWAA 4ZECA 4RJZA 4H6DA 1B4HA 3RTFB 1UTBA 5H8QB 4I9DA 3IOWA 2DWIA 2REJA 1FTJA 2H5YA 3KJTA 4X9TA 3TPAA 3S4UA 2XX8A 1LBBA 3G3FA 1HSLA 4MBPA 4F3GA 1WVJA 4DXBA 3M3FA 2OWSA 3UA8A 4HCWA 5TPAB 3SETA 1JEUA 3KN3A 2DXYA 2ZNSA 1VFDA 3K02A 2V3TA 4O3BA 3HSTA 5AA3A 4TOZA 2Q8JA 2GRVA 4F1YA 1IITA 1R9LA 4KD5A 5I58B 2I48A 1XC1A 3LSXA 3B6TA 3O97A 1BIYA 2PVUA 1IXHA 3T9HB 3CIJA 4FE8A 3UK4A 2O68A 3PMXA 1Z7NE 1TFDA 3Q27A 1RYXA 1B4ZA 3OSQA 3S9NC 1B58A 4HCYA 3KBRA 3WAFA 4NF4A 4OQOA 4G68C 1Q1KA 4F31B 3U72A 4F39A 4XXUA 4QSEA 3TTKA 4U22A 2R71A 5IKBA 2F35A 3BFTA 4GFRA 1BP5A 4F2QA 2HZLA 2O1MA 3OO9A 4HTGA 3H3GA 2F7BA 4OETA 5H8SA 5I59A 4U1OA 1B52A 3FVKA 4FEDA 5IAIA 3Q25A 3H06B 3A09A 3T9UA 2H99A 3PPPA 3VVEA 1KWHA 1POY1 2IA4A 4O3AA 3UP9A 5ISUA 1MPDA 2DYXA 3CR9A 1D4NA 2F97A 2QS2A 1UTHB 4WEDA 1M5FA 2O84X 4F3BA 3VLVA 3RLFE 2XX7A 3KG2A 3LSLA 4GWOA 3IK6B 1H44A 4X1DA 2ONKE 3A3UA 1SQYA 4EQ9A 1SI1A 3AXFA 5DVIA 3V89B 4I8CA 4PFUA 1ELJA 4G77A 1HSEA 3C34A 4H1XA 1ZLQA 4IY6A 3I3VA 4X48A 3GBBA 5FTIA 2QPQA 4RK9A 1BLFA 4OTEA 3C35A 4IGTA 1MXUA 4YKIA 2H9BA 1JEVA 1IEJA 3PPRA 1IXGA 3IX1A 4LZ7A 3RNNA 2Y7WA 2DE2A 3O9PA 4ZZEA 1N0TA 3O2AA 2DS9A 2W7YA 3OD7A 3ONMA 3G3HA 3CFXA 2ONRA 5ITPA 3IJXB 1B46A 4YMAA 2X7QA 3ZS6A 1P1QA 3ILTB 3UGWA 1TT1A 5ITOA 5AA2B 1BKAA 3CFLA 5F7VA 1PEBA 4KI0E 4KYEA 3C36A 2VD3A 2XX9A 3MC2A 5K2YA 5CRYA 1D3KA 1PB8A 2RKMA 3OMBA 2QMWA 3KFMA 2PYYA 1YAEA 3FD3A 5CI5A 2Q9TA 4JWOA 2I3WA 2QJEA 3N6TA 1PBPA 4AB6A 3IO4A 4U2RA 4KPTA 3OOAA 4GD5A 2Y7IA 4BDRA 2V93A 2HEUA 4XKQA 3KN8A 3TKDA 4YAHX 2Q88A 4BDNA 2DOJA 4FIMA 5TP9A 4OFLA 1II5A 1JW1A 3OENA 3I6VA 3MQ9A 1ZKBA 3E3KA 3T96B 3TEPA 3HV1A 1SYHA 4IO5A 1B5HA 2AYSA 4AB5A 1PC3A 1N76A 3FJGA 4UA8A 2UXAA 3CVGA 2X7PA 5I2KB 4NE4A 3K6VA 3O6HA 3C33A 5EHSA 4GOTA 1Y1ZA 4NMYA 3R6UA 4C0RA 5CMBA 1MM6A 3PMWA 1SBPA 3EF7A 5KDTA 4OMBA 4F3SA 4ZEBA 3G7WA 4H5FA 3TUSA 3K1PA 1UIUA 3CG3A 2HZKA 2QSXA 3T9XB 4ESWA 4F2OA 4ZEDA 4GL8A 5DEXB 2NWJA 4G8MA 2GHAA 5JTYA 2E0SA 3TTRA 4EF2A 3HCQA 4G68B 1LBCA 3IB1A 1AMFA 3RUMA 2Q89A 1BTJA 4IGRA 4H0WA 3Q29A 1US5A 3I5OA 2FNCA 4U4XA 1LAFE 1QKAA 1I6AA 4NWDA 4H8IA 4DCYA 1MXVA 1QUJA 2Y84A 1GGGA 3N94A 4DIGA 2F78A 4N07A 4QFOA 3FUZA 2DE3A 4M1VA 4Z7EA 5CMCA 1LB8A 3K6XA 2RC9A 4ND9A 2XXPA 2QS4A 3FZVA 4NF6B 4R75A 3VXBA 3A3CA 2FA7A 5DEXA 1FTMA 3VDFA 1D9YA 1CE2A 4PE5B 3SEYA 1ZBMA 4G8NA 1VR5A 3OO6A 3DLNA 4KCDA 5CBSA 3V83A 3PUZE 3TZAA 1YCJA 1T0KA 3KSJA 3VLWA 4KHZE 4F18A 1Z7ME 3IR1A 5DYHA 4XIGQ 1HSJA 3VXCA 4RNSA 3THIA 4KYSA 2A5TA 5H8HA 2Z23A 3TELA 1PDAA 1UTBB 4R2FA 2D5WA 4GRKA 3MVYA 4DZ1A 4R6HA 2UYFA 1ZTYA 4BDLA 1D9VA 1DSNA 3MBPA 4TQUQ 3IOTA 4RPOA 4LATA 4E0XA 3O6IA 3HO7A 1FQAA 1YTVA 5CBRA 3C31A 1B7UA 1FCKA 1Y20A 2XXIA 3DP8A 4LQ2A 4U4SA 2A5SA 5I2NA 2H25A 3S9LC 3FATA 1A7LA 2UVHA 5BUUA 4ELQA 4QHQA 1MY0A 1LFHA 3OXNA 1AH5A 2XXXA 3K1NA 3G3JA 1B9JA 3U94A 1GV8A 3KOSA 4JB7A 1B3GA 2F7CA 4YZZA 1MPCA 4ZDMA 4THIA 3MZBA 2V25A 4TLLB 3MWBA 4PFYA 4YICA 4I62A 1B3EA 1P1UA 4JSDA 2DVZA 1XT8A 2Q2CA 3OO7A 3HHFA 3MP6A 2ZMBA 3H4ZA 1A8EA 2VGQA 3MP8A 1DTZA 3O66A 4R72A 3PUWE 4DXUA 1NH7A 3JV9A 1ZU0A 1EZ9A 3QSLA 4K3FA 1A54A 5HBCA 4NF4B 3F11A 3D4GA 4H67A 2P1SA 3TQWA 4FATA 4ZEFA 3OELA 4QFKA 2ALUA 2HQ0A 4HS7A 1URGA 1S9TA 3MUQA 5L8DA 4OEUA 1DPPA 3CSBA 3ZKLA 4EXLA 1Y4TA 5CM6A 5EHMA 3OEMA 4MFIA 2OK2A 1JW5A 5I59B 3KJ7A 4IB2A 4RXLA 4XTCQ 1TWYA 2PT2A 3SEWA 1H43A 1XS5A 1N3WA 3KOTA 4Q0CA 4M4GA 3SESA 2DWJA 2AL4A 3SKPA 1OVTA 2XXQA 2XD2A 2REGA 1A55A 1NNPA 1R1NA 1NNTA 1B40A 1MXXA 1R9QA 3N26A 2ONSA 1H3DA 3ECRA 3W9WA 4H65A 3FXUA 4BDQA 2O7UA 1VSOA 4OERA 2NXOA 1LSTA 3TTMA 2XD3A 4F3PA 3LBSA 2Q2AA 1MDQA 2XXVA 1MH3A 4N13A 1MXWA 3U8QA 2F36A 1B3HA 4NF5B 1B3LA 2OLBA 3C4MA 4JWYA 1O64A 4ELRA 2AL5A 3H6WA 3IOUA 3T22A 1MQIA 4Q30B 4XKRA 4FAJA 3S2VA 1OMPA 3DP6A 3RQTA 2IEEA 5KZTA 2QL3A 2DP8A 4KYDA 3G3IA 4ECFA 1SI0A 3FGSA 4KFQA 3PV0E 3K0VA 2ZYNA 3H6VA 3PGFA 4JWXA 3QYTA 4KQPA 4NF5A 4POWA 2XXYA 1MQDA 1B32A 2QRYA 3H6UA 3FVOA 4C1UA 5FHMA 1JVXA 1B5JA 3QXMA 3QUFA 1LB9A 3E4RA 2OJTA 2DXRA 2UVJA 2QMXA 4ONYA 3CFZA 4POXA 1S7YA 1VE4A 4Z0IA 4OYVA 3ODBA 3KZGA 1SW4A 3RGYA 3E13X 4IO2A 2XXTA 4LA9A 1URSA 2Y7KA 2F7AA 4KR5A 4YKPA 5M2VA 3IORA 3IOVA 4QSDA 4WEPA 4FEBA 4FJPA 5CMMA 3MZ9A 4GVOA 4GXSB 2DWHA 4QFPA 3SDFA 2VHAA 3T9VA 4NWCA 3CSGA 4GXAA 1B3FA 5TP9B 3DP4A 1ZMGA 3QK6A 3K6WA 1MXYA 2ZNUA 2YJPA 4QFNA 4DCXA 3V8XB 3M3KA 4LUBA 1ZJLA 1LCTA 4E0WA 2ZYOA 2ESNA 1ANFA 5DVFA 1GVCA 5I57A 1JW4A 2I0BA 3C9HA 2GFEA 2HFBA 4UACA 4DLDA 1MQHA 2HXWA 4R6YA 5I56B 3RTWB 3UORA 4JXIA 1MH4A 1NKXA 4F29A 5KDTB 3SEXA 1QVSA 1B0LA 5CMKA 3K1MA 1NNKA 4OFOA 3K00A 4OENA 1Y4CA 3FV2A 2G93A 3TCFA 2OCUA 2PX1A 1XOCA 4GQOA 5JTYB 4DE8A 3KEIA 3RT8A 4F1UA 5F1QA 4MF3A 1AIVA 2R6GE 2NUVA 3E9XA 2V3QA 4P0GA 2XXWA 5FTHA 5I56A 3PUYE 2P2AA 4G2ZA 4PFWA 2CZLA 3FV1A 1OLCA 5H8NA 2FYIA 4FORA 2KLFA 3DELB 4EQ7A 4IO6A 3C32A 3R7XA 1NMUA 4F22A 3L6GA 1B7HA 1IIWA 3FASA 5H8FA 3VLUA 4YKJA 4MLQA 2I0CA 1WODA 4MLVA 5EYFA 1LLSA 2VD2A 1B7ZA 3U93A 1POTA 1YPNA 4EXKA 2NOOA 3PD9A 2B3BA 1A8FA 1IQ7A 3IO6A 4PFTA 2A5TB 5H8HB 5BWJA 4P0IA 2LAOA 4PETA 3EHSA 1B6HA 2HCAA 4H8JA 4ZZAA 2B3FA 2I6EA 3EPEA 1P1WA 3ZKKA 4LVQA 4HW8A 3VVDA 3G3KA 3MPLA 3VFJA 1LGBC 2Z22A 4ZEKA 3TFLA 1IUDA 1QKBA 3IB0A 4R9FA 3MW0A 3M3LA 3UIFA 4LZ8A 5I2NB 4NF8A 1Y9UA 3FXRA 1XHYA 5I84A 2VP1A 2ZNTA 3IAZA 4OHNA 1I6BA 2PT1A 4ESXA 2DVCA 4LZ5A 1DOTA 1NL5A 4R9GA 1JVYA 1MG1A 3TCGA 1O63A 3O29A 3VVFA 4XKNA 3W15C 2O7IA 3CG1A 3T93B 1URDA 1L5TA 4PQJA 4LP2B 3VE1B 2GHBA 2ZYMA 4BDOA 5K2XA 3FXQA 3PPNA 1FTOA 5DVJA 1US4A 3H6TA 5A5XA 1FQCA 3B6WA 1QULA 3BBRA 1M5EA 2F8DA 2DQVA 3MJNA 3CI8A 4DXCA 2ABHA 3LSWA 4IY5A 1QW0A 5ICTA 2H4IA 2F5XA 5LOMA 5AA1A 3RPWA 3B7DA 5FHNA 3K6UA 3EHUA 2M8CA 4F19A 1SW2A 2OZZA 2QS3A 2NVUB 3RY3A 1MPBA 4ELPA 3MZ1A 1N04A 3WAEA 3OSRA 1Q35A 3MVXA 1H76A 3TYHA 3IL1B 1B51A 1QJMA 4U23A 3PUVE 3IB2A 1P99A 1IXIA 1FW0A 4NTLA 3RN8A 2ZYKA 3TTNA 5H8QA 1USYE 2UVIA 3LC8A 5HM4B 3D4CA 4OWDA 1OIBA 4NEDA 1MRPA 3JZJA 1B05A 1MQGA 1Y3PA 4OZ9A 2QS1A 3K2DA 1MY1A 3SEVA 3USDA 4U1ZA 5TPAA 1SW5A 2VOZA 5J1DA 3QIMA 3MPKA 1EZPA 4WKMA 4U21A 3UN6A 3KN7A 3O28A 1WDNA 4L17A 3FVGA 1NFTA 1EZOA 2O69A 4OESA 1H45A 3DM0A 1FQBA 1LAGE 4QSCA 1MS7A 4R73A 2D3IA 4RPNA 2CMOA 3BKIB 4LQ5A 3GBAA 3TODA 1LAXA 3IJOB 3KSXA 5I58A 4OEVA 4BLAA 4Q5TA 2Z8DA 3H03A 4R6KA 4QRZA 4ZE9A 3G3GA 5L9SA 2O6AA 2Y7PA 1JETA 3TDJA 3EHTA 2B65A 1QUIA 4X1BA 1FTLA 1RYOA 2I49A 1N84A 4P11A 2RC7A 1NNFA 1OQHA 2I4BA 4MH5A 4G4PA 4IO4A 3TMGA 3FVNA 4PP0A 1MY4A 2Z8FA 3MVWA 4ZE8A 1JNFA 2I4CA 1R6ZA 5TU0A 1RKMA 3PD8A 4GLIA 1FTKA 4R2BA 3GXAA 2XXRA 4RK2A 3FJ7A 3B6QA 2XHDA 2RC8A 1LAHE 4OVJA 1M5DA 2F6GA 1P1NA 3TQLA 4EDPA 4BDMA 4I1DA 4ISUA 2F34A 3SERA 2XXUA 3PU5A 1UTHA 1MDP1 1A40A 3T66A 4IO7A 5I57B 4R74A 4DDDA 1ZIUA 5HPQA 1EH3A 1IZ1A 2YLNA 4KCCA 1OQGA 2DE4A 4ELOA 3P7IA 3ZSFA 3N5LA 1MXZA 1A99A 1NH8A 4AQ4A 2YPNA 1O7TA 3HN0A 2O1LA 1B0HA 3LR1A 4JSOA 5B70A 1FQFA 3FIRA 4YB5A 1M5BA 3W9VA 3TTLA 1F9BA 3QUJA 2V84A 3K01A 5KCJB 1I69A 2XXHA 3U92A 3V5AA 2BJJX 1MQJA 1N3XA 2OWTA 1FQDA 3N6UA 4YB6A 2WKYA 1LCFA 4GL0A 1VFEA 5CC2A 3MVZA 4QFLA 1DTGA 4Q8RA 5H8NB 1AOVA 3L6HA 1PB9A 1CB6A 1N7XA 5AA2A 2ANJA 2GH9A 4EUOA 3HPIA 2V3UA 4GIZA 2ZXTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1Y3NA 5KCJA 3BFUA 4EQBA 4OVRA 2V4CA 5H8FB 1B5IA 1FBFA 2RINA 3SEUA 3LUYA 4FECA 1USYH 1XVXA 3TAJA 1B1HA 4GF8A 4RA1A 1DMBA 1DPEA 4EF1A 3HHGA 2O51A 1SD3A 5AE4A 4YB7A 2B4MA 2HXRA 1OLAA 2RF1A 3OO8A 3IFCA 2I3VA 3ILUB 5LDZA 5ESYA 3JYRA 4XKPA 1P1OA 4WXJA 4ZS9A 3S9MC 3PUXE 4JBZA 1M5CA 3IFAA 3FJMA 3TCHA 2X26A 1OVBA 4RY1A 5L9OA 3EN3A 5T3JA 2Z8EA 4GWUA 2RCAA 1EU8A 4MMPA 1SYIA 3U65A 3MP1A 3MAMA 2WYKA 1SDXA 1GR2A 1FQEA 3CRBA 2G29A 1N7WA 3S9EA 5I2KA 1UIVA 4NF8B 2QVUA 2D21A 3PPQA 2R9JA 2E1SA 2Y7RA 4OXVA 1MM7A 1IMDA 4QBAA 2PBWA 3GZGA 4OFJA 1RDXA 4RYAA 2AIXA 1Y1MA 1B2HA 4DI3D 1XVYA 2XWOA 4O3CA 3PPOA 3Q28A 5JEIA 2THIA 2OBGA 3U1OA 2CZIA 1TXFA 1JQFA 3EQ1A 5EYGA 2HAVA 3VV5A 5I5PA 2HAUA 5AA4B 3RT6B 5ICQA 1UQWA 3BIHA 1RDZA 3M8UA 3O6GA 2UVGA 2F6PA 1TFAA 4QF9A 4G68A 1LBXA 4YMBA 2WX9A 2F3DA 2DSFA 1NV4A 5ELVA 1MY2A 1B1XA 1IMEA 2PMSA 1DK4A 1IXCA 3K4UA 5A5XB 1I6QA 2XXKA 2P0SA 3QAXA 3LSFB 3H7MA 4N91A 2UYEA 1QUKA 4TLMB 3R26A 1ATGA 1J1NA 3KGCA 4N6PA 1SVXB 1Y3QA 4P9KA 5L9MA 1YZ0A 1FRPA 2I58A 5FHOA 4AS5A 4NF6A 3MSTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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