2Y7WA

Dntr inducer binding domain
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
212
structure length
207
Chain Sequence
SFDPFASTRTFNLAMTDIGEMYFMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPNAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFTELEHVGVVAGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription
molecule keywords LYSR-TYPE REGULATORY PROTEIN
publication title Crystal Structures of Dntr Inducer Binding Domains in Complex with Salicylate Offer Insights Into the Activation of Lysr-Type Transcriptional Regulators.
pubmed doi rcsb
source organism Burkholderia sp.
total genus 56
structure length 207
sequence length 212
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-02-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2y7wA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2y7wA02
2I0BA 3MJNA 3ILUB 4JSOA 1GTKA 3VLVA 4ND9A 3FXQA 4C0RA 1OLAA 3TQWA 3T9UA 4YMBA 1XC1A 3O66A 1AIVA 2H25A 1A40A 1SVXB 1QKBA 3KN8A 3TUSA 2FYIA 4LP2B 4F1YA 1NNKA 3E3KA 3PU5A 3UN6A 3B7DA 3RNNA 4KI0E 2A5TB 4MBPA 3DM0A 3FV2A 3L6HA 3Q26A 3T22A 1MXVA 2B65A 2HAUA 1SBPA 4ZDMA 1FTLA 1IZ1A 4H67A 2IEEA 4F3PA 2OWSA 1MXXA 1VFDA 4F18A 3S4UA 3KOSA 5FHOA 3IOTA 3EHTA 2ZNSA 1XOCA 4AQ4A 2QSXA 4BDNA 5BUUA 1XVYA 5TPAA 2UYEA 4R9FA 4OVJA 2FNCA 3I6VA 3KGCA 5A5XB 2QMXA 4P11A 3U72A 2P2AA 1MY0A 4U1OA 3HO7A 3N94A 3QK6A 2PX1A 4N6PA 3G3JA 1F9BA 2RC8A 3K6UA 2H5YA 4GXSB 3IB1A 5AA2A 2XHDA 2DVCA 1Y4CA 4FORA 1TFAA 3TAJA 4L17A 1GR2A 3FASA 1Y3QA 2CZLA 2AIXA 4E0WA 1TT1A 1PB9A 3GBAA 5I84A 4JWOA 1EU8A 3DELB 1UTBA 3PUZE 1XS5A 1OIBA 1FTJA 3T96B 3K0VA 4F3SA 1MS7A 1IEJA 2OWTA 3LSXA 3FJMA 3LBSA 1LFHA 1AOVA 3QAXA 3PUWE 5KDTA 4F39A 1VFEA 2PYYA 4Q30B 3K6WA 2HCAA 1JW5A 1IUDA 3A3UA 2O7UA 4M4GA 4EXLA 2D3IA 1MM7A 2W7YA 1MY3A 3H4ZA 1M5DA 2WKYA 5B7DA 3RQTA 1LAGE 2V3UA 5JTYA 1Y1MA 5TPAB 4ELRA 5I57A 3GXAA 1N3XA 1N7WA 1SW5A 3OELA 4H1XA 3TTRA 3TODA 3M3KA 4DIGA 4OFOA 2HZLA 4IO6A 4Q0CA 3DP6A 1VSOA 5AA2B 5K2XA 1BIYA 3VFJA 4G8NA 1ATGA 4EQ7A 1P99A 1P1OA 3N6UA 1OQHA 3AXFA 3GBBA 3H6VA 4X9TA 1JW4A 1IXIA 3RPWA 4OESA 1UTBB 4GD5A 3OXNA 1PC3A 4EQBA 4QSEA 1M5CA 3IOUA 4OZ9A 4FAJA 1A8EA 4XKQA 3W9VA 3QIMA 4YU0A 2XX7A 3SEWA 3TMGA 3C32A 1B05A 3HHGA 3T9HB 4RK9A 1DPPA 3WAFA 2GHBA 3MVYA 4C1UA 5KDTB 4I62A 1DSNA 2H9BA 1DTGA 5H8FA 2ZNUA 5F7VA 3IJXB 3MP6A 1FQAA 3K2DA 5CBRA 2X7PA 3BFUA 3IORA 1Y20A 4RJZA 3EHSA 4ELQA 4M1VA 5JTYB 3OO7A 2XXQA 2XXPA 2F7CA 3C4MA 2H4IA 1N76A 5I57B 3MBPA 3A09A 3CIJA 1B5HA 3T66A 3IB2A 1MY1A 2F6GA 1USYH 1MXWA 4IO2A 5LOMA 4AB6A 2XXYA 3VLUA 3PMXA 2I3VA 2OLBA 2Y7WA 2DE2A 2RC7A 4O3AA 3FATA 5L9SA 3UIFA 2F97A 2CMOA 2G29A 3H6UA 3ZS6A 2Q89A 3MP1A 4MLQA 1MM6A 2BJJX 1B2HA 1Y9UA 3D4CA 5AA4A 3H7MA 5AA3A 1DPEA 5FTHA 3FVOA 4PFUA 2ZYNA 4QFNA 2XD2A 1H43A 3S9LC 3S9NC 1B7HA 4NMYA 1POTA 5H8NA 3JYRA 2O1LA 4ISUA 2RF1A 2Z8EA 2Y7PA 3TKDA 1NNPA 1YAEA 3A3CA 3TPAA 5H8FB 2ZXTA 4XKPA 4LONB 3FIRA 5ISUA 1CE2A 4MLVA 3K4UA 3OD7A 4GXAA 2DQVA 3BBRA 5DTBA 1B0HA 4YKPA 4YMAA 4NF8A 4LUBA 1QUKA 3CSGA 1O63A 1IITA 4PFWA 1EZOA 4NTLA 1A8FA 3RLFE 1FCKA 1QKAA 3ZSFA 1S50A 1JNFA 3TELA 2AL5A 3VDFA 4DCYA 1FTMA 1JEUA 2ABHA 1MQGA 4EDPA 1M5EA 4JBZA 5F1QA 2OZZA 2ZYOA 3O9PA 1O64A 4XIGQ 4ZE8A 2V25A 3KJ7A 4P0GA 5JK4A 4POXA 1Z7ME 4TLLB 2ESNA 1II5A 2Q2CA 3KN7A 3HSTA 5AA4B 3MZ9A 3RT6B 3HN0A 3LC8A 1H44A 4GVOA 1ZU0A 3PUXE 2V93A 5I2KA 4KD5A 2V84A 2QMWA 3VXCA 5CC2A 1ZMGA 2X26A 5AE4A 2VP1A 4F29A 3PUYE 1Y3PA 1MQDA 5H8NB 5DEXA 3TQLA 1MXYA 4LQ2A 1IXCA 4F1VA 4HTGA 1HSEA 1B3EA 4IY5A 4NE4A 3PPQA 1PBPA 3IJOB 3C35A 1MPDA 2F6PA 4KQPA 4IO7A 4FECA 1LAHE 4QFOA 5CM6A 4DDDA 3OENA 1ZTYA 4DE8A 4GL0A 1JW1A 4YICA 2Q8JA 3EHUA 4NF8B 3K6VA 3N6TA 4OERA 5I58A 3CSBA 4Z7EA 3MWBA 1D9VA 5K2YA 3KOTA 1GVCA 4RPNA 5ITPA 3ECRA 1Y1ZA 5ITOA 4OEVA 2P1SA 1IIWA 2RCAA 1FQFA 1GGGA 4EXKA 1LLSA 3B6TA 4G4PA 1MXZA 5DVJA 1NH8A 2F8DA 4YAHX 3O97A 5DVIA 4GRKA 4PFTA 1B4HA 3TFLA 3M3LA 4IGRA 2QS3A 4NWCA 3EF7A 1Y4TA 1P1NA 3G3GA 4X1BA 4N13A 5I2KB 3F11A 2E1SA 4PE5B 4MH5A 4R9GA 2VHAA 3K1PA 2I48A 4TQUQ 4F22A 1P1UA 4FEBA 3K01A 4G2ZA 3S2VA 2QS1A 1VR5A 4U22A 4DXUA 1Z7NE 1A55A 2Z22A 5AA1A 3SEVA 2R9JA 4MF3A 4P0IA 4DXBA 4IO5A 3VLWA 1MDP1 5TP9A 1ZLQA 5H8HA 3SEYA 4G68C 3PGFA 1D9YA 5DT6A 5IKBA 3U8QA 4WKMA 3EQ1A 4QSCA 1JEVA 1YCJA 1LBBA 5I58B 4OFJA 3T93B 1WVJA 3O28A 3MVZA 1B3GA 3FV1A 3P7IA 1SDXA 3U93A 2AYSA 3MC2A 3W9WA 3Q28A 1UIVA 2AL4A 1MH4A 1YTVA 3THIA 3EPEA 3Q25A 4OETA 1MY2A 3L6GA 4ECFA 1LFGA 3IB0A 1TXFA 4R2FA 4JWXA 3MZ1A 3HCQA 4R6YA 4U4SA 2M8CA 1FQCA 3K1MA 2ZMBA 2DVZA 3MP8A 3CVGA 2F36A 2GH9A 2I4BA 1XVXA 3MPLA 2YPNA 4POWA 3M8UA 4LA9A 4OENA 3ZKLA 2GRVA 5KZTA 3DP8A 2LAOA 3FVKA 1NNFA 3TTKA 4I9DA 5B70A 2GHAA 5CMKA 3O6GA 4KHZE 1LB8A 3PD9A 2DS9A 4R73A 4BDMA 3ILTB 2Y7IA 2P0SA 3UGWA 2Q9TA 1D4NA 4RA1A 4GF8A 1AMFA 2UVJA 4NF4A 4KR5A 4KFQA 5TP9B 5H8HB 3N26A 1MQIA 1ZKBA 3OOAA 2NVUB 5I56A 1R9QA 1NL5A 4YB6A 4EQ9A 2DXRA 3BKIB 2RKMA 4NWDA 4ZS9A 1XHYA 3OO8A 3CRBA 3H06B 1RKMA 2O69A 3DLNA 3MW0A 1JVYA 3TCGA 1QULA 3V5AA 3MZBA 4WEPA 2DSFA 4YZZA 4BDRA 1RYOA 3QSLA 3OEMA 2O6AA 1ZJLA 3FGSA 3CR9A 4X48A 2XX8A 2DE3A 2X7QA 4JDFA 2XXTA 1B7UA 1R9LA 4QSDA 1BLFA 3B6WA 1USYE 1YPNA 4NF5A 4OQOA 5TU0A 3PPPA 4HCWA 1B3LA 4ZECA 4C1TA 1URGA 3BFTA 4OWDA 4KPTA 1SD3A 3TZAA 2XXRA 3LUYA 1PBQA 2I4CA 1ZIUA 1SW2A 2ONRA 3LSFB 1ELJA 4BDOA 5H8QA 1B5IA 3K1NA 4LZ5A 3FVGA 1JETA 2DXYA 3G3HA 4LQ5A 1MH3A 3CG1A 4UA8A 1AL3A 1SW4A 4BDLA 2QPQA 4OXVA 2NUVA 1LFIA 3VVFA 1LGBC 4OHNA 3IL1B 3SETA 3HV1A 3QUFA 3HHFA 4FE8A 4K3FA 4TLMB 2A5SA 5I56B 2Q88A 4U2RA 4O3BA 4FJPA 1US4A 4YKIA 1LAXA 2ONKE 3U1OA 2OBGA 3SERA 1MDQA 3RUMA 3JZJA 3VE1B 4Q5TA 5BWJA 4YB7A 3MPKA 1KWHA 1B1HA 4LVQA 5L9MA 2F34A 4OTEA 2Z8DA 3KG2A 2YJPA 2ZYMA 1XT8A 1UTHA 2XXIA 5HBCA 1B5JA 3Q27A 3E13X 2F78A 3KEIA 4R72A 3E4RA 4BLAA 2RC9A 3S9MC 4ONYA 4WXJA 1J1NA 1PB8A 4YKJA 4PQJA 1MXUA 1B9JA 3TCHA 1BP5A 2I49A 4GFRA 4G77A 3RTFB 1N0TA 3IOWA 3O29A 3U92A 3G3FA 4ZEKA 2UVHA 2DP8A 5H8QB 3SEXA 3PMVA 1NKXA 1QW0A 3JV9A 4H65A 3SDFA 3OO6A 5FTIA 1H45A 3H6WA 2QS2A 1Q1KA 2REJA 3TEPA 1NNTA 3H6TA 3TDJA 4I8CA 5I59A 2ZNTA 1B3HA 1N7XA 1FTKA 4TOZA 1B3FA 1IXHA 4O3CA 5DYHA 3FUZA 3IK6B 1B52A 1MQHA 4RXLA 2IA4A 5L8DA 5CMMA 3V89B 3K02A 1FQBA 3E9XA 2QRYA 3VVDA 2PT1A 4OMBA 5CBSA 3OMBA 3UK4A 1FQDA 2VOZA 3KN3A 1H76A 5J1DA 3W15C 5A5XA 1QUJA 2HXWA 1AH5A 4UACA 1LSTA 5CI5A 2Q2AA 1B58A 3PV0E 4OFLA 4U23A 1QVSA 3KJTA 2E0SA 4RYAA 2F7AA 2Y7KA 1UTHB 5FHNA 3V8XB 1D3KA 3USDA 1N3WA 3V83A 2XXUA 2Y84A 3IO4A 1EH3A 2DOJA 1ANFA 1P1WA 3K00A 4F3BA 4F2QA 4QF9A 2H99A 1OLCA 4BDQA 4R6KA 4E0XA 2PMSA 1RYXA 2F7BA 1S9TA 4U21A 1HSLA 3DP4A 3O6HA 5KCJA 3PMWA 1QJMA 3CG3A 4ESWA 2YLNA 2XD3A 4EF1A 3GLBA 4RY1A 2V3QA 2RINA 2Z8FA 4DCXA 4QFKA 1A54A 1URSA 4LZ7A 1UQWA 2H98A 1FTOA 3S9EA 2HQ0A 3VV5A 3OO9A 3TYHA 5I59B 1O7TA 4FEDA 4HS7A 2HEUA 3G7WA 1S7YA 2D21A 2HZKA 1DMBA 4PFYA 1QUIA 4LATA 4XKRA 1OVTA 1SI0A 2R6GE 1R6ZA 3R26A 4KYSA 4GQOA 1IQ7A 1SYHA 2QL3A 4GOTA 5DEXB 4ZEIA 2O84X 3FD3A 4H5GA 2UYFA 3UP9A 4NF6A 5CMBA 1JVXA 1M5FA 4QHQA 1SW1A 4H8JA 3CFLA 3FZVA 4Q8RA 1I6BA 4QFPA 2THIA 3C31A 1PEBA 2XXVA 5L9OA 5HPQA 3RY3A 2HAVA 1B46A 4R2BA 4H5FA 3RT8A 1NH7A 3C33A 1B32A 3CI8A 1UIUA 3O2AA 2QJEA 5FHMA 3LSLA 3TTMA 1URDA 2I0CA 5KCJB 4PETA 4U4XA 2OCUA 3CFXA 1ZBMA 5ICTA 3ODBA 5M2VA 3IO6A 4IO3A 4NEDA 2XX9A 3FJGA 3M3FA 2ALUA 4F2OA 1B40A 2REGA 4OEUA 4X1DA 4MFIA 2DE4A 2I6EA 4XXUA 4FATA 3ONMA 1NFTA 3FJ7A 2XXHA 4JXIA 4YB5A 3SESA 2UVGA 2RCBA 2B3BA 3OSRA 3PUVE 4WEDA 4GWOA 5JEIA 2F35A 4RPOA 3MVWA 1M5BA 1LAFE 3SKPA 3OEKA 4PP0A 4G68A 1Y3NA 3I3VA 4NF6B 1I6QA 4F1UA 4JWYA 5AA2D 5H8SA 5HM4B 2XXWA 3PD8A 3R7XA 4IB2A 3MUQA 2Z23A 5ICQA 2FA7A 4JB7A 4Z0IA 3PPRA 3TTLA 4KYEA 2O68A 4H8IA 1OMPA 4R74A 1TWYA 2V3TA 3QYTA 2I58A 3PPOA 3LSWA 3H03A 2NWJA 5EYFA 4DLDA 4H0WA 1I6AA 3KFMA 3OSQA 4IY6A 3QUJA 2R71A 1TFDA 2DWIA 3C36A 1FQEA 3ZKKA 3G3IA 1MPBA 4ZE9A 2PVUA 3O6IA 2VD2A 3U94A 4THIA 2B3FA 4DXCA 4RNSA 1OQGA 1FW0A 3K6XA 3N5LA 3I5OA 3FXUA 1CB6A 2F5XA 4RK2A 3TTNA 4QRZA 3UA8A 5DVFA 4GIZA 3VXBA 4ZEBA 2XXXA 1HSJA 1LCTA 1DOTA 4XKNA 3KSXA 4G68B 4DZ1A 4N07A 3B6QA 3C9HA 4OYVA 4IGTA 1SI1A 2PBWA 1B6HA 2G93A 1A99A 1NMUA 1BTJA 1WODA 4NF4B 2ONSA 1H3DA 4IO4A 4R75A 1B51A 2I3WA 3G3KA 3MAMA 1GV8A 3QXMA 5CRYA 2NXOA 5ELVA 2QS4A 2ZYKA 3KSJA 4LZ8A 3FVNA 4AB5A 4ZZEA 1I69A 5I2NA 4EUOA 3KZGA 1MY4A 3EN3A 1B0LA 3IOVA 4HW8A 3RTWB 3MQ9A 1POY1 1L5TA 4H6DA 2O51A 2UVIA 2DWAA 1LB9A 1N84A 2D5WA 1MRPA 3HPIA 1JQFA 4GL8A 4EF2A 3RN8A 2OJTA 2OK2A 4ESXA 1DTZA 3VVEA 3RGYA 4NF5B 1P1QA 2NOOA 1SYIA 2DWJA 1EZPA 1T0KA 4GLIA 3IR1A 3SEUA 1R1NA 4G8MA 3IX1A 1IXGA 1MQJA 3Q29A 2O1MA 2ANJA 4U1ZA 4FIMA 1US5A 3MVXA 4I1DA 3UORA 2HFBA 2VD3A 4JSDA 4QFLA 1EZ9A 2A5TA 3R6UA 1B1XA 3KBRA 4F19A 3PPNA 4ZZAA 4ZEFA 1Q35A 3T9XB 1PDAA 1LBCA 4KYDA 2O7IA 1VE4A 3C34A 3WAEA 4ZEDA 1OVBA 3CFZA 2KLFA 1WDNA 4XTCQ 2UXAA 3IAZA 1SQYA 5EHMA 5I2NB 1A7LA 3FXRA 1B7ZA 4F3GA 2DYXA 2DWHA 5EHSA 1MPCA 1BKAA 4KCCA 4G8HA 3H3GA 1MG1A 3D4GA 3GZGA 3LR1A 4ELPA 1N04A 4YKKA 1LCFA 4ELOA 1B4ZA 4KCDA 2GFEA 4F31B 1PB7A 2Y7RA 2VGQA 4HCYA 5CMCA 4R6HA 2PT2A 5IAIA 3T9VA 3TCFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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