2Y7WA

Dntr inducer binding domain
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
212
structure length
207
Chain Sequence
SFDPFASTRTFNLAMTDIGEMYFMPPLMEALAQRAPHIQISTLRPNAGNLKEDMESGAVDLALGLLPELQTGFFQRRLFRHRYVCMFRKDHPSAKSPMSLKQFTELEHVGVVAGEVDGLLERAGIKRRMRLVVPHFIAIGPILHSTDLIATVPQRFAVRCEVPFGLTTSPHPAKLPDIAINLFWHAKYNRDPGNMWLRQLFVELFSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription
molecule keywords LYSR-TYPE REGULATORY PROTEIN
publication title Crystal Structures of Dntr Inducer Binding Domains in Complex with Salicylate Offer Insights Into the Activation of Lysr-Type Transcriptional Regulators.
pubmed doi rcsb
source organism Burkholderia sp.
total genus 56
structure length 207
sequence length 212
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-02-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2y7wA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2y7wA02
3VLUA 3FJMA 5M2VA 3ECRA 4F18A 4JSDA 1MQIA 3OMBA 2HZLA 3JYRA 4GIZA 4QFKA 2Z8DA 1LLSA 1Y9UA 4OFLA 4JXIA 3ODBA 5ISUA 2H4IA 3G3JA 4QF9A 4R74A 4DXUA 3SDFA 4KHZE 5I2KB 1NFTA 1NH8A 1B3HA 2VD2A 4KYDA 3QK6A 5I2KA 4KYEA 3BFUA 3PUZE 1JNFA 1DMBA 4Q5TA 1D3KA 3K01A 4FE8A 3PUVE 4AQ4A 3G3IA 2UVGA 5JK4A 3GXAA 1LAGE 3T96B 1KWHA 4X1DA 1P1NA 2I58A 3K6XA 5ICTA 1M5EA 1CE2A 5K2XA 4TOZA 1B0HA 4YZZA 1MXXA 3TEPA 3IORA 3U93A 2DYXA 3MPKA 4POXA 1MXYA 4QSDA 2HAUA 3PMVA 2DSFA 4EQ9A 4NF6A 1USYH 1SI1A 4LATA 3H03A 4ZZEA 4GQOA 4RPNA 4EXLA 1M5CA 3OOAA 4ZEKA 4OEVA 2QRYA 1XVYA 1POY1 2DE2A 3KSXA 3U8QA 3USDA 1FQBA 1FQCA 2X7PA 1ZTYA 3CFXA 2XXYA 3C32A 1TXFA 3SETA 1SW1A 1QVSA 2O6AA 3MP8A 4R9GA 1HSEA 4Z7EA 4ZEBA 2Q2CA 2ABHA 3RT8A 2O7IA 4BDRA 1FCKA 1UIUA 5I58B 5DYHA 1POTA 4NWCA 3T9VA 4FJPA 2OK2A 4EUOA 1XS5A 3MPLA 5JTYB 1P1OA 2B3FA 4FEDA 2I48A 3FVGA 4N13A 5I58A 3O6IA 2O68A 5JTYA 1B7ZA 2XXVA 3K6VA 1D9YA 4G68C 1L5TA 2F78A 4NE4A 5I57B 1IQ7A 4F3BA 4NF5B 1QKAA 3BFTA 1TFAA 3PD8A 3MVYA 1JVYA 3H4ZA 3S9LC 3C34A 4P0IA 3MVXA 4DDDA 4PFYA 3FXUA 3TTNA 2XXQA 2PT1A 3VXBA 1LAXA 2YPNA 2OBGA 2I4BA 3SEXA 1PB7A 1BTJA 4JDFA 3TPAA 3T9XB 4U1ZA 4OVJA 2F5XA 1DSNA 3UORA 2XHDA 2XX8A 2DXRA 3KGCA 3UK4A 3S9EA 4H6DA 5DT6A 2HXWA 1PB9A 1R1NA 1FQEA 1PB8A 5HBCA 1H76A 1GR2A 4AB6A 2Q89A 1M5BA 2A5SA 3U1OA 1I6QA 4H8IA 4IY6A 5DVIA 4YKIA 1YCJA 1MS7A 4ECFA 3S2VA 3N5LA 4XIGQ 1AIVA 3QUFA 1JQFA 3VVEA 4EF1A 1XT8A 4G8HA 2XX9A 4NF8B 3IOWA 4G68B 2OLBA 5A5XB 4NF8A 1SYHA 5DVFA 3OO9A 4G68A 3TQWA 4THIA 2UVIA 4DE8A 1B1HA 3IO4A 4XKPA 1GV8A 3IB0A 4BLAA 3LSLA 2OZZA 3PPOA 1FTOA 1OMPA 4OTEA 1UTHB 4F1UA 2THIA 5TP9B 1SW2A 3PPNA 3O9PA 1NKXA 1JVXA 1UTHA 4GD5A 5TP9A 2QS4A 1NMUA 1BKAA 2ZNUA 1H43A 4TLLB 4ELPA 4R6YA 3C9HA 2RC7A 3VFJA 4G2ZA 2D21A 4G8NA 1SD3A 4ZE9A 2XXRA 4IO5A 3Q29A 2V84A 1P1QA 1DOTA 2O7UA 1B3EA 1LBBA 2W7YA 3IAZA 2NXOA 4Q30B 3VVFA 2HEUA 1OLCA 2DP8A 3ZKKA 3SESA 3UA8A 4Q8RA 4ZEDA 1LBCA 2ZNTA 3O29A 3PD9A 1SI0A 2IEEA 2Y7KA 3HO7A 4IGRA 5B70A 4WXJA 5FHOA 3C35A 4MLVA 5FTIA 1YTVA 1UIVA 3RPWA 4LZ5A 3K6UA 1B7UA 3ZS6A 5I56B 1Y3PA 3KJ7A 3CFZA 4POWA 2OJTA 1Y3NA 5I56A 4I62A 4YB6A 4H0WA 4QHQA 1B51A 3KBRA 4EQBA 3H6UA 1B5HA 5CI5A 2Y7IA 3MAMA 1LFHA 4IB2A 4R6KA 4E0XA 1LCFA 1ANFA 5J1DA 3BBRA 4LA9A 5ITPA 1Y1ZA 4OXVA 3OSRA 4Q0CA 5IKBA 4U22A 3KN3A 2I6EA 1A7LA 3K1PA 1OLAA 5CBSA 3M3LA 1J1NA 4ZEFA 4U4SA 5L9OA 2DE3A 3TTMA 4ZZAA 1US4A 3PPRA 4MLQA 5I2NB 1IUDA 4EXKA 2PX1A 3C4MA 5I2NA 3H6WA 3N6UA 4HS7A 4MF3A 2D5WA 1QULA 5I84A 2B3BA 5TPAB 4PE5B 2A5TB 3DP8A 2I49A 1Y4TA 1SQYA 3TFLA 5TPAA 3KOSA 3B6TA 2Y7RA 1Z7NE 3TYHA 3S9MC 2HQ0A 3C36A 4GL0A 4KYSA 1Z7ME 3IL1B 5FHNA 5H8SA 3IB1A 5EYFA 5BWJA 1IZ1A 4LZ8A 1O64A 3TCHA 3IO6A 4NMYA 3LBSA 4QSCA 4X1BA 2I0CA 3C33A 3OENA 1P1WA 3MBPA 2VHAA 2ALUA 1DTGA 2UYFA 2R6GE 2VGQA 3WAEA 1IXCA 5AE4A 2V93A 5H8NB 2DWJA 2LAOA 3CIJA 4O3AA 2DXYA 4GF8A 3RNNA 4Z0IA 1QUJA 5H8NA 5AA3A 2ONKE 4DLDA 1MY1A 2Q2AA 4PFUA 1NNTA 5TU0A 4PETA 2I4CA 4YAHX 1B7HA 4KFQA 4R6HA 4FIMA 4KI0E 3F11A 3P7IA 4LVQA 3RN8A 2I0BA 1AMFA 2V3TA 3QAXA 4BDQA 2PT2A 1SYIA 4GOTA 3W9WA 1HSJA 1NNFA 1EZPA 2B65A 4GL8A 3TQLA 1R9QA 4TQUQ 4ND9A 1XOCA 1MM7A 1PDAA 4NF6B 3EHUA 3SKPA 3OEMA 4BDOA 3THIA 1JEUA 1B3FA 4F3PA 2HZKA 2O51A 4RJZA 3FVNA 1ATGA 3PU5A 2Y84A 4X48A 4GLIA 5CRYA 3M3FA 5AA1A 3Q25A 1A40A 5H8HB 1LB9A 5L8DA 1JW1A 2V25A 3V83A 5H8HA 4QFOA 2REJA 1PBPA 1B1XA 1DTZA 1DPPA 3OELA 2E1SA 3K2DA 3O97A 4PQJA 4AB5A 1MXVA 2AL5A 4BDNA 3IJOB 5F1QA 1UQWA 3IB2A 3SEWA 2GHBA 2QL3A 4F19A 3ILTB 4U2RA 3U94A 4I1DA 4IO2A 3VVDA 1FTLA 4PFTA 2ZYMA 3G3HA 1B40A 3H06B 3OO6A 1LSTA 1PEBA 2F6PA 3H3GA 3O6HA 1F9BA 4WEPA 4K3FA 5HM4B 2ONRA 4NEDA 1TT1A 1P99A 3EHSA 1I6BA 2QJEA 3DELB 1YPNA 2NVUB 1TFDA 2D3IA 3CVGA 4RXLA 4HCWA 4ZECA 3HCQA 3I3VA 2F8DA 2ANJA 3T22A 3VDFA 2KLFA 3MZBA 2DQVA 3LR1A 2XXUA 3CFLA 1FTMA 4ELOA 4JWYA 1B46A 2YJPA 3VV5A 3RTWB 1OVBA 3K6WA 4YMAA 3W15C 3L6HA 3HPIA 3IX1A 3L6GA 2DE4A 4F1YA 3OSQA 1GVCA 3FJ7A 3MQ9A 3MJNA 4E0WA 2Y7PA 4LUBA 4ZS9A 3RT6B 1US5A 2F7AA 4UACA 4GFRA 5I59B 2I3WA 4H67A 1M5FA 3SEUA 4GVOA 4QFLA 2ZXTA 1N76A 1USYE 5I59A 2NWJA 3CRBA 3FXQA 1Y4CA 1IEJA 1MRPA 1XVXA 3AXFA 2QSXA 4LONB 2Z8FA 5EHMA 3LSXA 3FVKA 1FTJA 3TCGA 3MP6A 4N07A 5AA2B 4F22A 3IOVA 3PMWA 1IXHA 4DXBA 5AA2A 1MXZA 5CMKA 4RNSA 5CMBA 2Z8EA 4KR5A 4GWOA 3WAFA 1B3GA 2R71A 1Y20A 4IO4A 5DEXB 4FECA 2QPQA 1URGA 1S9TA 5FHMA 5K2YA 1B52A 5DEXA 4RYAA 3KZGA 2BJJX 3FZVA 1QKBA 4H1XA 1MXUA 1AL3A 3T9HB 4M1VA 4H65A 1URDA 3T9UA 4M4GA 5ITOA 4F2QA 3V5AA 4O3BA 3OXNA 2DOJA 2P1SA 3RTFB 3O66A 2HCAA 1SVXB 1ZJLA 1B4HA 3TTKA 4ISUA 1IXIA 2DVCA 3N6TA 4ESWA 1B0LA 4G4PA 4F3GA 4HCYA 2X7QA 3IR1A 1RKMA 2XD3A 5H8FB 4EF2A 5KZTA 4ZDMA 2QMXA 1LFIA 4ZE8A 5H8FA 4ELRA 4PFWA 1EZOA 2M8CA 1SDXA 5DTBA 2HAVA 2NUVA 4XTCQ 5B7DA 4H8JA 4R75A 2X26A 3EHTA 1ZLQA 2ZMBA 3TELA 2O1MA 3ILUB 3VLVA 1MY0A 2RKMA 2ZNSA 2I3VA 5CMCA 3R6UA 2WKYA 3M8UA 1Q35A 1HSLA 1A55A 4YKKA 4PP0A 1D4NA 2DVZA 2PVUA 4U1OA 5HPQA 1NL5A 4OWDA 5EHSA 3W9VA 2F7BA 3TAJA 3IOUA 4OHNA 4JWXA 1LB8A 2CMOA 2AIXA 3MUQA 3QUJA 3ZSFA 4HTGA 1GTKA 1B05A 2Z22A 4F39A 3H7MA 2H9BA 4OMBA 2DS9A 1MY4A 4JB7A 4O3CA 1QJMA 1N7XA 3KG2A 1ELJA 2F97A 4DZ1A 3S9NC 1WODA 3C31A 2F6GA 1MPCA 3QIMA 3K0VA 1Y3QA 3V89B 3OEKA 1MY3A 1I69A 3HN0A 1B6HA 4DCYA 1FW0A 1MY2A 4KCCA 3QYTA 3DLNA 1Y1MA 2YLNA 3N26A 3R7XA 4YMBA 3HV1A 1A54A 1TWYA 4YB7A 1H3DA 2XXPA 3CSGA 3PUYE 3UGWA 2UYEA 4U4XA 4NF4B 3GZGA 4TLMB 3GLBA 3CG3A 4NF4A 3IOTA 2UXAA 1MQGA 4IO7A 2ZYNA 2H5YA 4WEDA 4QSEA 5F7VA 4KCDA 1ZU0A 4EDPA 1LFGA 3FUZA 3ZKLA 2QMWA 3JV9A 1H44A 2FNCA 2P2AA 5L9MA 3PPPA 4DCXA 3V8XB 2AL4A 3LUYA 4YKPA 3LC8A 1BP5A 5BUUA 1Q1KA 3TZAA 1MQJA 5KDTB 1D9VA 4KD5A 3S4UA 3O2AA 3I6VA 3MWBA 1N84A 3U92A 3PUWE 2OWTA 1R6ZA 3TTRA 1MQHA 5KDTA 1MPDA 2G29A 1MDP1 2O69A 1FQAA 3KJTA 2RC8A 3FIRA 3A3CA 2IA4A 1QW0A 2OWSA 3E4RA 1VSOA 2DWHA 3PV0E 5IAIA 4R2FA 1R9LA 3MVWA 1QUKA 2PBWA 2Q88A 4NTLA 2ONSA 1SBPA 4OESA 4P0GA 1ZBMA 1YAEA 3ONMA 1B5JA 2RCBA 3B6QA 4L17A 1PC3A 1M5DA 1N04A 2HFBA 4U21A 4RK9A 3QSLA 1JW4A 3T93B 3HHGA 3UIFA 4KPTA 1VE4A 1OQHA 2FYIA 4X9TA 3TCFA 1B5IA 4GXSB 3MP1A 1B3LA 1ZKBA 4FEBA 3VE1B 4YICA 4GXAA 4N6PA 1XC1A 1II5A 4UA8A 3MZ9A 3KN8A 1MQDA 4FAJA 3D4GA 4BDMA 1RYOA 2RC9A 1A8FA 4YU0A 3PGFA 5DVJA 2QS3A 2V3QA 5ICQA 4OFJA 3H6VA 2RF1A 3MC2A 3N94A 4H5FA 3RLFE 3TKDA 4OERA 1LAFE 4KQPA 4F1VA 2AYSA 1GGGA 1B4ZA 5I57A 4I9DA 4IY5A 4ONYA 3KSJA 4OEUA 3LSWA 4NF5A 1B58A 4JWOA 1IIWA 1BLFA 3VLWA 3SERA 1JW5A 3TODA 4G8MA 4R73A 2XD2A 1MXWA 1JETA 2GRVA 3MW0A 3OO7A 2QS2A 2H25A 4QFNA 4NWDA 1IXGA 3FJGA 3HHFA 3MZ1A 5LOMA 1T0KA 4R2BA 1RYXA 1MG1A 4LP2B 1EZ9A 3DP4A 3TDJA 4ZEIA 3H6TA 4DXCA 3RQTA 4LZ7A 1VFDA 1SW4A 2G93A 3K00A 1OIBA 2F36A 4HW8A 3G3FA 2XXWA 4XKQA 3K1MA 4H5GA 3IJXB 2H99A 2RINA 4OFOA 3FVOA 1N0TA 3B6WA 1EU8A 2F35A 3TUSA 3SEYA 1OVTA 1B9JA 1FQFA 2RCAA 1FQDA 4ESXA 2REGA 2QS1A 3VXCA 1MH3A 2XXHA 3PMXA 1LAHE 1OQGA 2CZLA 2O84X 4R9FA 1MH4A 4LQ5A 3DM0A 5A5XA 2XXIA 5JEIA 1BIYA 3QXMA 2V3UA 5CM6A 1MDQA 1EH3A 2NOOA 3IK6B 3KN7A 1ZIUA 5CMMA 1PBQA 5ELVA 3FASA 2F34A 3Q28A 3O28A 4LQ2A 1B32A 4XKNA 1DPEA 1JEVA 1MPBA 3KEIA 3R26A 2F7CA 3EN3A 4IO3A 4FORA 5CBRA 2ZYKA 2GH9A 3CG1A 3KFMA 3PUXE 3FGSA 1VR5A 2VD3A 1QUIA 4XXUA 3K1NA 1ZMGA 3GBAA 1CB6A 4C1TA 4OYVA 1VFEA 3Q27A 3EPEA 3UP9A 4OZ9A 3E3KA 3CI8A 2ZYOA 5FTHA 3A09A 1A8EA 1NH7A 4F29A 5AA2D 4OETA 3RUMA 3TMGA 2GFEA 3G3KA 4IO6A 2OCUA 1I6AA 2UVHA 4OENA 4RPOA 2FA7A 3MVZA 3T66A 5AA4B 1N3XA 4F2OA 3LSFB 4QFPA 2Z23A 3FV1A 1NNPA 2DWAA 5AA4A 3FXRA 5L9SA 3A3UA 3D4CA 4C1UA 1AH5A 3TTLA 2O1LA 3I5OA 4RK2A 2VOZA 3E9XA 2P0SA 1NNKA 4JSOA 3EQ1A 2Y7WA 3EF7A 3M3KA 3Q26A 1LGBC 4GRKA 4XKRA 2PMSA 3HSTA 3B7DA 1FTKA 1O63A 2H98A 3KOTA 1N7WA 2E0SA 2PYYA 3RY3A 4ELQA 5H8QB 1XHYA 4R72A 3UN6A 4U23A 4G77A 2GHAA 1H45A 5H8QA 1IITA 4WKMA 1S50A 3BKIB 3CR9A 3GBBA 1URSA 1B2HA 2UVJA 1O7TA 3FV2A 3OO8A 3FD3A 4OQOA 2Q9TA 1WDNA 5CC2A 3O6GA 4DIGA 3DP6A 4I8CA 4MH5A 1UTBB 4QRZA 4P11A 3RGYA 4RY1A 2VP1A 2XX7A 4MBPA 1UTBA 1WVJA 1LCTA 3K4UA 1A99A 4FATA 3G3GA 4EQ7A 5KCJB 3U72A 1AOVA 2XXTA 4IGTA 4MFIA 2Q8JA 5KCJA 2ESNA 3E13X 1S7YA 3FATA 1SW5A 4F31B 3JZJA 2XXXA 3CSBA 3OD7A 1P1UA 4F3SA 3PPQA 4JBZA 1N3WA 4BDLA 4C0RA 3K02A 4RA1A 2A5TA 3G7WA 4YB5A 3SEVA 2DWIA 1MM6A 4YKJA 2R9JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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