4QRZA

Crystal structure of sugar transporter atu4361 from agrobacterium fabrum c58, target efi-510558, with bound maltotriose
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
DVTLTLWSLDRDIQPAPNLIKEFNALNNGIKIEYRQLQFDDVVSESMRAYSTGNAPDIIAIDNPNHAMFASRGAFLDVTDMIAKSDVIKTENYFPGPLKSVTWDGKYFGVPKATNTIALYYNKDLFKAAGLDAAKPPQTWDELVDAARKLTNPAKNVYGISFSAKANEEGTFQFLPWAQMAGATYKNINTDGAVKALETWKTLLDEKLASPDTLTRSQWDSTATFNAGNAAMAISGPWEIDRMLKDAKFDWGVTLLPVPTPDAPRSSAMGDYNWAIFSKTKHPAEAFKAIEFFASKDKDMFKNFGQLPARSDIPVPPTGNALKDEALKTFVEQLKYAQPRGPSPEWPKISKAIQDAIQGALSGQMTPKAALDQAAEKIKLVDG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords ABC-TYPE SUGAR TRANSPORTER
publication title Crystal Structure of Maltoside Transporter from Agrobacterium Radiobacter, Target Efi-510558
rcsb
source organism Agrobacterium fabrum
total genus 139
structure length 383
sequence length 383
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qrzA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qrzA02
4QFPA 4ELQA 4M1VA 4RYAA 1R9LA 4LZ5A 1IXHA 4NF5A 1FTKA 2OWSA 4PE5B 3P7IA 4E0XA 4G68A 4F3SA 4HTGA 1SW2A 1JW5A 1B58A 3FVGA 3M3KA 5DVJA 4ZZEA 2D5WA 5CBSA 1XC1A 1MY4A 3VLUA 1YPNA 1XT8A 3IX1A 4R6KA 1R9QA 2XD2A 5CMKA 4OTEA 4KPTA 2CZLA 1NMUA 2ZNUA 3IK6B 4DCXA 5JK4A 4IY5A 3OXNA 3RTFB 3TTKA 3Q28A 3JV9A 3OEMA 1I6BA 2H99A 5I2KB 3H3GA 1WODA 2ONSA 5H8HB 4I8CA 1MY2A 4R75A 2H4IA 3HHGA 4WKMA 3IB0A 3IO4A 4NE4A 1PBPA 4YKKA 3PPOA 2I4CA 2XXWA 5I2NB 1B5HA 4I9DA 3QYTA 4IB2A 5A5XA 4G2ZA 1DTGA 2HFBA 2F78A 5I56B 2ONKE 4QFNA 2V3QA 4I62A 1VFEA 5ITOA 1B52A 4OFLA 2Y7IA 2RINA 3SEWA 1B7ZA 4PFWA 4GOTA 5ICTA 3U1OA 3H4ZA 4JXIA 2AYSA 4G8HA 5L8DA 2V84A 2I3VA 4YU0A 1M5FA 1FQAA 3W9VA 3PV0E 2Y7KA 1ELJA 5CM6A 1SI0A 2Q89A 5AA3A 1B3GA 1B4ZA 1UTHB 2NOOA 1II5A 2DWIA 3UORA 3T9XB 3KN7A 2THIA 1SW5A 4OEVA 1VE4A 1BKAA 3IJOB 1OLCA 2VOZA 4DIGA 2B3BA 5CMMA 3VE1B 1UIVA 4FJPA 1HSEA 1ZBMA 3FGSA 5CI5A 3TPAA 2I48A 4KCDA 4FATA 2VD3A 3K6WA 1Y1MA 3ZSFA 3K0VA 1T0KA 3OD7A 4L17A 4U4SA 1LAHE 4GF8A 4KHZE 1URDA 3LSFB 4EDPA 3IAZA 1I69A 4BDRA 4RK2A 4EUOA 2XXUA 3FD3A 5H8SA 1NNKA 4YZZA 3IOVA 4RK9A 5IKBA 4NF8A 1PC3A 3K00A 2I0CA 4U23A 3SETA 1Q1KA 2Z22A 4EF2A 3OEKA 5KCJA 1MH4A 2DXYA 1JVXA 2D21A 4U21A 2OZZA 3LSXA 3K1PA 2Q88A 2UVJA 3HN0A 3PUZE 5I58A 1SVXB 4QSCA 3UN6A 1B4HA 2DVCA 2I3WA 3L6HA 3G3KA 1RYXA 4POWA 1XOCA 4UACA 4NF4B 2F34A 3CRBA 1OQHA 4DCYA 3GXAA 1SDXA 4XKPA 1NNFA 3T9VA 3U93A 2HXWA 4OHNA 4H5GA 1RKMA 1JW1A 3N5LA 3O66A 4K3FA 4KYSA 1XVXA 3EHUA 1MXZA 4IGTA 3IO6A 4NF6A 3O9PA 4IO2A 2QMWA 1NH7A 1NH8A 3CFZA 1D9YA 2UVIA 2P0SA 4OETA 1XVYA 1LFHA 1VR5A 2HZKA 3OSQA 2QJEA 4TLLB 3RUMA 3C9HA 1MXYA 2VD2A 2UVHA 3V89B 1O63A 3IB2A 3T93B 4KYDA 3Q29A 4GL8A 2OLBA 4IY6A 3UGWA 3U94A 1Y3QA 4JWOA 3Q27A 2X7PA 3K6UA 3PPPA 5H8FB 4NTLA 1IXCA 4EQBA 4OMBA 3OENA 3TTMA 1SYHA 3A3CA 3KEIA 2A5TA 1O64A 4Q30B 1URSA 4RY1A 5I84A 4OVJA 3KJ7A 2Q2AA 4OFJA 4XXUA 2OBGA 1KWHA 2I49A 3MVWA 3EF7A 4HCWA 3A3UA 1TT1A 2QS1A 3O97A 1QW0A 3I3VA 5F7VA 4X1BA 2HAVA 3CI8A 1MQHA 1QVSA 3QIMA 1PB8A 3FV2A 1FW0A 3CVGA 3MPLA 1DPPA 3S4UA 2DXRA 4OERA 3BBRA 1P1QA 4XTCQ 2O68A 1MQIA 3LBSA 4ECFA 1M5CA 3JZJA 2V93A 1FQDA 1AIVA 1JVYA 4Z0IA 2ALUA 1LCTA 3UP9A 3I5OA 3GLBA 3CFLA 2O51A 1QUJA 1IEJA 1AOVA 4MH5A 3SKPA 3VVFA 3EQ1A 1FTMA 1SD3A 4G77A 3TKDA 4EF1A 5ICQA 5ISUA 2GFEA 4X9TA 4U4XA 2REGA 5CC2A 4LP2B 1A40A 1MH3A 3OSRA 4IO6A 1UIUA 2HCAA 4NWDA 4I1DA 3TCFA 3T9UA 5I57B 4LQ2A 3WAEA 5CRYA 4FEBA 3S2VA 3H6WA 1PEBA 3KFMA 4Q8RA 2Z8EA 1B0HA 2XXTA 3E3KA 1NNTA 1IIWA 3T96B 4ZEFA 5HM4B 2DOJA 1M5DA 4F29A 4AB6A 3C34A 1MS7A 3VVDA 4R74A 5JTYA 3IB1A 1OQGA 3B7DA 3LC8A 1SI1A 3TCHA 4GL0A 3JYRA 3DLNA 3MVYA 1OIBA 2VP1A 5H8QA 1S7YA 4JWXA 5AA2A 5DEXB 2G29A 2A5SA 1SBPA 3FVKA 1URGA 3DP8A 5FHMA 1LGBC 2LAOA 4XKQA 2QSXA 3KOTA 5KZTA 3MP6A 4OQOA 4F22A 3MJNA 2Z23A 2NVUB 1B32A 3VLVA 3SEYA 2RCBA 1XHYA 3E9XA 1B2HA 3SERA 4YICA 4BDNA 2XX9A 3C36A 5DVIA 4PFUA 5HPQA 1B3EA 1O7TA 1H45A 5H8NA 3V8XB 5M2VA 5EHSA 2PX1A 4BDQA 2ZXTA 4FEDA 3QXMA 3CIJA 3H6VA 1Z7NE 4GRKA 5DVFA 4DZ1A 3DP4A 2HEUA 3HV1A 4ISUA 3PUXE 3TODA 4PFYA 1QUKA 3IJXB 5KDTA 1Y4CA 2GRVA 4HS7A 4F3GA 4O3CA 5DT6A 3FATA 1Y20A 4LVQA 4IO3A 2KLFA 1MY0A 4H1XA 2OWTA 5IAIA 3B6WA 4EXLA 2W7YA 2ONRA 4IO5A 3FIRA 1N7XA 1PB7A 1SQYA 1DTZA 4KYEA 3RQTA 2OCUA 1POTA 2ZYMA 4FECA 1N04A 3MVZA 1FQEA 1MPBA 2V3TA 3R6UA 2FA7A 4F2OA 1NFTA 3TAJA 3EHTA 3HCQA 4F19A 3IOUA 2RKMA 3PUVE 4NF8B 4ESXA 1DPEA 1SYIA 3TUSA 4YB5A 3RGYA 3Q26A 3KZGA 1ANFA 3B6TA 3N6TA 1R6ZA 2DWHA 4XKNA 4MF3A 5KCJB 4F3BA 4ESWA 1EH3A 2B3FA 4C1TA 5K2YA 3QSLA 1DSNA 1R1NA 2QS4A 2O7UA 3LSLA 4DDDA 4ZEDA 2O1MA 2DP8A 3T22A 1B0LA 3OMBA 2XXVA 4QHQA 2XXIA 5H8HA 5BWJA 3OO9A 5CBRA 1B3LA 3TELA 1ZIUA 4DLDA 2X26A 1IITA 4GWOA 3GBAA 4BLAA 3KSXA 1H76A 1MXXA 4ZECA 1VSOA 1N7WA 4O3AA 4F31B 2V25A 4NEDA 4NF6B 1LB9A 2UXAA 3G3HA 4RA1A 3W15C 2HZLA 4F2QA 3TQWA 5FHNA 4KCCA 1WVJA 3TZAA 5TPAA 2XX7A 2I4BA 1UTHA 4H0WA 1SW1A 2DYXA 4RPOA 3O2AA 1A7LA 2NUVA 4NMYA 1EU8A 4KR5A 3KJTA 3UIFA 1A99A 3RNNA 2AL4A 3HO7A 1B1HA 1MXWA 3MVXA 4N13A 4F1YA 4U1OA 1N3XA 3MQ9A 1P1OA 2XXQA 4U1ZA 5F1QA 3TTRA 3IOWA 2UVGA 2PMSA 2ZNSA 3C35A 3TTLA 1HSLA 2A5TB 3L6GA 1Z7ME 3V83A 2DE2A 3DELB 1D9VA 1LB8A 4Q5TA 2I6EA 4TQUQ 3TFLA 1B3FA 4DE8A 4OESA 4WXJA 3PD9A 3K2DA 3S9LC 3C32A 2UYEA 2Y7PA 4KD5A 3BFTA 4FAJA 1Y1ZA 1N84A 4NF4A 3HHFA 4N6PA 4MBPA 3O6GA 4U2RA 3CFXA 4P0IA 1MM7A 3MZ1A 3IORA 4EXKA 1NL5A 1MY3A 3LUYA 4X1DA 5TU0A 3MW0A 4TLMB 5AA4A 3VFJA 5LOMA 2WKYA 4KFQA 1BP5A 4DXBA 1AH5A 2QS3A 2F97A 3H6TA 2I0BA 3W9WA 1B1XA 4LA9A 2XXPA 3TDJA 1LAXA 3VXBA 4P0GA 4QFLA 1MQDA 1ZKBA 1F9BA 3FVOA 4YKJA 4R9FA 2ESNA 1YAEA 2Z8DA 3ODBA 3S9EA 1FTLA 3PD8A 1PDAA 4OZ9A 2FYIA 5I59B 3TEPA 4OWDA 4R72A 2M8CA 4BDLA 3D4GA 2DE4A 4G4PA 3FZVA 5JTYB 3RLFE 3K1MA 2Q2CA 1FCKA 4C0RA 2F8DA 3T9HB 5H8FA 3MP1A 2XHDA 5TP9B 3Q25A 3F11A 2BJJX 3G3FA 1GGGA 2DVZA 4GLIA 1ZU0A 5AA2B 5FTHA 1FTJA 1RYOA 1MXVA 1BTJA 1SW4A 1BLFA 1EZOA 3TTNA 4YKIA 3CG1A 4RJZA 4P11A 5ELVA 1LFIA 3O28A 1PBQA 4WEDA 1I6AA 2IEEA 1P1WA 1LSTA 4NF5B 4YB6A 1LCFA 3PPNA 3ILUB 4G68B 3KSJA 5AE4A 1ZLQA 4DXCA 4TOZA 3KOSA 4QSDA 3KGCA 3CR9A 3ECRA 3SEVA 5HBCA 3VV5A 2P2AA 4G8NA 2O7IA 1US5A 3PU5A 1YCJA 1QULA 3G3GA 1IXGA 5KDTB 1B46A 1D3KA 4LATA 4JWYA 2V3UA 1MQGA 1A8FA 2RC9A 4EQ9A 3OO7A 3LR1A 4ZE9A 3KN8A 2DS9A 1A55A 4RXLA 5A5XB 3MC2A 2F35A 4QSEA 2O84X 2RF1A 3VLWA 5FTIA 5I57A 1TFDA 3MZBA 3SESA 2VGQA 1FTOA 3C4MA 4IO4A 2XX8A 3FJ7A 4QRZA 4XKRA 1B5IA 2E0SA 2NWJA 2QPQA 4ZE8A 3PGFA 1JNFA 1JQFA 2F6GA 5J1DA 4UA8A 4OXVA 1IQ7A 4WEPA 3O6HA 5JEIA 1NNPA 3OELA 2H9BA 4LZ8A 3RY3A 3O29A 1LBBA 4GXAA 3UK4A 3K01A 1CE2A 1QKBA 3K02A 2ZYOA 4R6HA 3FV1A 3PUWE 4R2FA 3RTWB 3WAFA 4H8IA 1N3WA 3M3FA 3E4RA 1QKAA 5DEXA 2RC7A 2DWJA 1MQJA 2Z8FA 1UTBA 2ZNTA 2FNCA 3H06B 3S9MC 1B9JA 3LSWA 2HAUA 4F1VA 1N76A 2GH9A 3U72A 1M5EA 3VDFA 3QUFA 2GHAA 1VFDA 2NXOA 3FASA 2QS2A 3QK6A 1GV8A 4XIGQ 2Y84A 3HPIA 5FHOA 3RPWA 2RC8A 4ELRA 3SEXA 4H65A 4AQ4A 1XS5A 4GVOA 4QF9A 5EHMA 3OOAA 1B51A 3O6IA 4Z7EA 2ZMBA 3VXCA 1Y3PA 1B6HA 4ZDMA 4Q0CA 1D4NA 2DE3A 2H25A 2DWAA 2XXRA 5I58B 1I6QA 2GHBA 5EYFA 5TPAB 3K6XA 1MM6A 4LZ7A 3ONMA 2PBWA 4YAHX 1LAFE 2H5YA 4QFKA 2F36A 3N6UA 3MPKA 3K4UA 3ILTB 3G3JA 4LUBA 1MDP1 4F3PA 1JETA 1B3HA 4X48A 3MWBA 4LONB 5I2KA 1Y9UA 2XXXA 4M4GA 1MY1A 2E1SA 1ZTYA 3N94A 4OEUA 2X7QA 4H6DA 2QMXA 5I2NA 4ZEKA 2ZYKA 2DSFA 3R7XA 5I56A 2IA4A 3GBBA 3UA8A 2OJTA 3MP8A 4GFRA 3S9NC 5K2XA 2R6GE 4H8JA 3ZKLA 3QAXA 2O6AA 1Y3NA 2REJA 2I58A 1L5TA 4R73A 3CSGA 3RN8A 1UQWA 3M8UA 5ITPA 4FE8A 4H67A 2D3IA 3AXFA 2XXHA 1TWYA 1EZPA 5DYHA 3PMVA 3TMGA 1USYH 2VHAA 1IXIA 3QUJA 5L9SA 1B05A 1PB9A 3C33A 3D4CA 4ELOA 3G3IA 3H03A 3PPRA 4HW8A 2AIXA 3E13X 1ATGA 4YKPA 2PVUA 5AA1A 1MPDA 3MZ9A 1DOTA 4BDOA 3KG2A 4KI0E 1JEUA 1POY1 1H3DA 3EHSA 3PUYE 4R2BA 1H44A 1ZJLA 3B6QA 2R71A 3TQLA 2UYFA 1H43A 2O1LA 2R9JA 1MPCA 4FIMA 3PMWA 2Y7WA 2ABHA 3OO8A 1J1NA 2PT1A 5AA4B 5CMBA 1IZ1A 4R9GA 3OO6A 3SEUA 4OYVA 4PQJA 3M3LA 3MUQA 1LLSA 4ZEIA 4C1UA 3FUZA 1JW4A 2RCAA 1FQCA 1P1NA 4PETA 5L9MA 3K1NA 2Y7RA 3RT8A 2Q9TA 3U92A 2QL3A 1IUDA 1OVBA 4OENA 4OFOA 3MAMA 4RPNA 3DM0A 4EQ7A 4F1UA 4LQ5A 1LFGA 1B7HA 5DTBA 2PYYA 4QFOA 3VVEA 1YTVA 3CSBA 4THIA 1FQFA 2O69A 3PMXA 5L9OA 4GIZA 1LAGE 4GQOA 1MRPA 4MLVA 2YPNA 4G68C 4YB7A 4HCYA 3K6VA 1OMPA 2F6PA 4YMAA 4JBZA 3GZGA 4RNSA 3FJGA 3V5AA 2ANJA 4DXUA 4ZS9A 4MLQA 1OLAA 1ZMGA 3SDFA 1N0TA 1USYE 3HSTA 2DQVA 4F18A 3PPQA 1DMBA 1S9TA 4JSOA 3THIA 3A09A 4AB5A 1A54A 1GVCA 1QJMA 1B40A 2QRYA 1JEVA 3FXRA 2F5XA 1US4A 2YJPA 1P99A 4GD5A 4POXA 3ZKKA 4IGRA 2H98A 2YLNA 2ZYNA 4KQPA 2PT2A 5B70A 1MG1A 4G8MA 2B65A 3I6VA 1EZ9A 4JDFA 2HQ0A 4U22A 1Q35A 1M5BA 1P1UA 1WDNA 1OVTA 4ONYA 3RT6B 3C31A 4BDMA 3IR1A 4IO7A 4GXSB 3MBPA 3DP6A 5H8QB 1B7UA 1HSJA 2CMOA 3G7WA 4N07A 1CB6A 1LBCA 4R6YA 3KN3A 3H6UA 4PP0A 4PFTA 2AL5A 2F7BA 1GTKA 5BUUA 4ZZAA 4MFIA 3H7MA 5B7DA 3BKIB 2OK2A 4ELPA 3CG3A 3EPEA 1Y4TA 3TYHA 3KBRA 2G93A 4ZEBA 5H8NB 4NWCA 1A8EA 1TXFA 3USDA 3BFUA 3TCGA 1MDQA 1AL3A 5I59A 3T66A 1NKXA 2P1SA 2XD3A 2F7CA 3FXUA 3IOTA 1B5JA 3EN3A 4FORA 3IL1B 5CMCA 4E0WA 1TFAA 1QUIA 3FJMA 3N26A 2F7AA 3FXQA 4O3BA 5TP9A 1BIYA 1FQBA 4H5FA 2Q8JA 4YMBA 4ND9A 5AA2D 4F39A 3FVNA 1GR2A 4JB7A 1UTBB 4JSDA 1MXUA 3ZS6A 3U8QA 1S50A 2XXYA 1AMFA 3R26A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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