4QRZA

Crystal structure of sugar transporter atu4361 from agrobacterium fabrum c58, target efi-510558, with bound maltotriose
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
DVTLTLWSLDRDIQPAPNLIKEFNALNNGIKIEYRQLQFDDVVSESMRAYSTGNAPDIIAIDNPNHAMFASRGAFLDVTDMIAKSDVIKTENYFPGPLKSVTWDGKYFGVPKATNTIALYYNKDLFKAAGLDAAKPPQTWDELVDAARKLTNPAKNVYGISFSAKANEEGTFQFLPWAQMAGATYKNINTDGAVKALETWKTLLDEKLASPDTLTRSQWDSTATFNAGNAAMAISGPWEIDRMLKDAKFDWGVTLLPVPTPDAPRSSAMGDYNWAIFSKTKHPAEAFKAIEFFASKDKDMFKNFGQLPARSDIPVPPTGNALKDEALKTFVEQLKYAQPRGPSPEWPKISKAIQDAIQGALSGQMTPKAALDQAAEKIKLVDG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
source organism Agrobacterium fabrum
publication title Crystal Structure of Maltoside Transporter from Agrobacterium Radiobacter, Target Efi-510558
rcsb
molecule keywords ABC-TYPE SUGAR TRANSPORTER
total genus 139
structure length 383
sequence length 383
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qrzA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qrzA02
5I2KA 3H6VA 3L6HA 4F2OA 4F3BA 3UIFA 2REJA 3TEPA 2AIXA 3GLBA 3A3UA 2HXWA 1M5EA 2NXOA 1Y9UA 2Z23A 1USYE 3MBPA 3TTNA 4WEPA 3IB2A 2P1SA 3FVNA 3T96B 4DXUA 3V8XB 5I57B 4LATA 3OSQA 4R6HA 3K2DA 2R71A 1IIWA 4ECFA 1WODA 4C0RA 2QJEA 4X48A 2GHBA 2F97A 1B46A 3QXMA 4QRZA 4G68B 3KOTA 4M1VA 3TDJA 4U2RA 2I3VA 3PPOA 3VVFA 3GBAA 5TU0A 1B3LA 1FTMA 1UQWA 1DMBA 1O7TA 3KG2A 4KD5A 4PFUA 2GHAA 3FD3A 3OO7A 1FCKA 4G8NA 5FTHA 2B3FA 3HHGA 3QYTA 4HTGA 3KSXA 2F35A 4ZDMA 2VP1A 2HAUA 1RYXA 2XXXA 5K2YA 2UXAA 1PBQA 3U1OA 1BLFA 3EHTA 3O6HA 3OMBA 2UVGA 3PPRA 4F39A 3SERA 2B3BA 5TP9A 3OXNA 2CMOA 4Q5TA 5H8QA 1T0KA 1IZ1A 5AA1A 1IXCA 4R74A 3UK4A 3UORA 1BTJA 3W15C 1Q35A 2XD2A 4DXCA 4GL8A 1DTGA 1OQGA 4NF4B 1SYHA 4RXLA 4EXLA 2A5TA 4R73A 3PU5A 3N94A 1B05A 5M2VA 2XXTA 3RPWA 4OEUA 1NH8A 1LFGA 1TWYA 1AH5A 1M5CA 3E4RA 3H7MA 4FORA 1UTHA 5DVFA 3IOWA 5H8SA 3IOVA 1QVSA 3Q27A 3JYRA 2O51A 1EZOA 4MFIA 3HN0A 2XXQA 1R9LA 3IO6A 1I6BA 3PMVA 3A3CA 4YMBA 5I84A 1SW5A 4BDOA 3QSLA 2O84X 3H6WA 1XT8A 2AL5A 3U92A 1N76A 3TTLA 4H0WA 2I48A 2DE3A 4H65A 4RY1A 3H06B 3TQWA 2XX8A 3HCQA 2XXVA 3ODBA 4YKKA 2ZNSA 3MPLA 1LAFE 4ESWA 3MZ9A 1NMUA 4TLLB 4OFOA 2ANJA 2R9JA 4EQ9A 2Z8EA 5FHOA 2ZMBA 3GBBA 2UVJA 1B3HA 1FTJA 4LP2B 3MP6A 4U1ZA 2Z8DA 2O6AA 3SKPA 5DVJA 2Y84A 3DM0A 4GL0A 2OZZA 1JW1A 3M3LA 1LB8A 3TQLA 1WDNA 3EPEA 4ZEBA 5ELVA 1QUIA 3R7XA 2PVUA 3RQTA 2ALUA 3MVWA 4GRKA 2F34A 3K6WA 3E13X 4KR5A 4G8MA 3KEIA 1DSNA 4Q0CA 3U94A 3KFMA 4F1VA 3H3GA 3FV2A 3T9HB 4H8JA 4LQ2A 4YU0A 4ZEKA 4EQ7A 2RC8A 1MM7A 1QW0A 1B58A 3CFLA 2Q2CA 4MBPA 1H45A 3VXBA 4BDMA 3O6GA 1MQIA 3PMWA 1MPCA 4RNSA 3MZBA 4ZE9A 4QFKA 4YB7A 1OMPA 4MF3A 4NF4A 1PC3A 2DE2A 4KCCA 2HZKA 5CBSA 2XD3A 1ZLQA 2QS2A 2ZNTA 2HEUA 2Z22A 1POY1 3UGWA 3G3GA 1USYH 2RINA 3KN8A 5I2KB 4OEVA 4NF5B 4I62A 4QFPA 4UA8A 3VDFA 1B51A 1B6HA 4IO2A 4F3SA 1EZPA 1FQDA 3B6TA 2XXYA 2AYSA 5H8FB 1TFDA 2I0BA 4GF8A 2QMXA 4XKRA 2V3TA 2R6GE 2H99A 5FTIA 1MY3A 4K3FA 1B7ZA 1IITA 5CI5A 2H4IA 4EQBA 4P0GA 2LAOA 2IA4A 4O3BA 5H8HA 1QUKA 2ZXTA 4ZZAA 3H03A 1IXIA 3L6GA 2XXPA 3K1NA 1D3KA 1HSEA 3A09A 2KLFA 1MXUA 5F7VA 3FASA 1UTBA 4Z7EA 1MXXA 1MDP1 2PYYA 3K6UA 1B5JA 4F19A 2DS9A 1ZU0A 4KYDA 1ZBMA 2XXWA 3FJ7A 3S9EA 3O6IA 2HFBA 2XX7A 1YPNA 4ZZEA 1B3FA 3IJOB 4JWXA 1MXWA 3S9LC 3G7WA 1JW5A 3KJTA 2Z8FA 3FXUA 3OOAA 3ZKKA 3E9XA 1MS7A 1JVYA 3MVZA 3G3HA 1XC1A 1FQEA 4P0IA 4R6KA 2HCAA 3K1MA 3K6XA 4ZECA 3EHSA 4H6DA 3TYHA 4X1BA 1AIVA 3JZJA 1LFHA 1S50A 3CI8A 1MQDA 2O7UA 5DVIA 2I49A 4R2BA 4OFJA 1QJMA 1PB9A 1R6ZA 1A7LA 1MH4A 1LCTA 1VR5A 1GVCA 4FAJA 2NWJA 5CMBA 4LQ5A 1TT1A 1N04A 3P7IA 1AL3A 3B6WA 4OETA 4OXVA 1Y1MA 3K00A 1VFEA 1LSTA 2DSFA 2V93A 2XXRA 3OELA 1M5DA 2QL3A 4XIGQ 4H8IA 4EUOA 4DE8A 4ND9A 2RKMA 2X26A 4NF5A 4ELPA 1B3EA 4U4XA 1LAGE 3FVGA 3Q28A 2DVCA 3D4CA 2OJTA 3FV1A 5H8FA 5CMMA 4R6YA 3IX1A 5CMCA 4GWOA 4NWDA 4F1UA 3QUFA 3E3KA 1NL5A 1HSLA 4OZ9A 4YKIA 1IXGA 3MUQA 4NF6A 1B4ZA 1LAXA 3FZVA 4PQJA 3IORA 1A40A 3FIRA 2ZYMA 1LLSA 2QMWA 1P1OA 3PUYE 3TFLA 2I0CA 1F9BA 4N13A 1B4HA 4RPNA 1N7XA 2XXUA 4FIMA 3T9UA 3T66A 3C33A 5J1DA 3WAEA 2FYIA 4LZ8A 1II5A 1SDXA 5BUUA 1P1WA 4QFNA 3BBRA 2GRVA 3IB0A 1O63A 4PFTA 3C4MA 3MWBA 3B6QA 3SEYA 3DP8A 2I3WA 2GH9A 4BDNA 4GQOA 4ONYA 1MQHA 4HCYA 4RJZA 2V3UA 3D4GA 4YMAA 3EF7A 1SBPA 1L5TA 1URDA 1B0LA 3GXAA 4DXBA 3CG1A 4IO4A 4YB6A 3SEUA 3W9WA 5EYFA 1QKAA 3HV1A 1ELJA 4F29A 3SESA 1Z7NE 1B2HA 2D21A 2ESNA 1PB7A 3OEMA 3OO8A 5CC2A 3TMGA 4LZ7A 2VHAA 1B52A 5AA4A 1Y3NA 3TODA 1B0HA 4FE8A 3SEVA 1NKXA 2V84A 3N6UA 1N3WA 2ONSA 5I56A 4DDDA 1I6QA 4TOZA 4YB5A 3IB1A 4GIZA 5I58B 3U72A 3PD8A 3PGFA 5FHNA 4AB6A 1MDQA 1B1XA 4G8HA 5KZTA 4JSDA 4ISUA 5F1QA 4M4GA 3RTFB 3MVXA 4JXIA 4PETA 3LUYA 1JNFA 1M5BA 4OVJA 1N3XA 1Y3QA 2CZLA 3FXRA 5H8HB 2DWJA 1XVXA 2Y7IA 5KDTB 3ONMA 4OERA 2X7PA 4RK9A 4U4SA 5I59B 4N6PA 1SYIA 2RCAA 4WXJA 2M8CA 5A5XB 1Z7ME 4XTCQ 1QULA 4KYEA 1UTBB 1LFIA 3IAZA 3MW0A 3F11A 5L9MA 4F18A 2E1SA 2H5YA 4DCYA 4PE5B 4G4PA 1IEJA 1M5FA 4LUBA 3TKDA 4I8CA 3OD7A 5ISUA 1GGGA 1A55A 3VLUA 2OBGA 4HS7A 1JVXA 3BKIB 3FGSA 3CRBA 2DXYA 2F7CA 4F22A 1SW4A 3H4ZA 3O28A 3FJGA 4FEDA 3IOUA 1TXFA 1MQGA 3KZGA 3ZKLA 1NNKA 5ITPA 1P1NA 4PFYA 3LSWA 4QSCA 2FA7A 5ICTA 4XKQA 4JBZA 1MRPA 5DTBA 4ZEFA 4H5GA 3RUMA 1SW2A 4F2QA 5KCJA 4KHZE 3OO6A 3CSBA 1UIVA 2ZNUA 1EU8A 4QFOA 3PUZE 4JWOA 4EF1A 1LBCA 3IO4A 2V3QA 1Y20A 3JV9A 2HQ0A 4X1DA 1VFDA 1ZTYA 1I6AA 3TCHA 2X7QA 3TCGA 3C35A 4IO7A 4KFQA 4BDQA 3HSTA 1FQFA 4JWYA 5AA3A 3M3KA 4P11A 1LBBA 4NWCA 4GVOA 4JB7A 4LVQA 4FECA 3M3FA 2HAVA 3I5OA 3O97A 1GR2A 1QUJA 1Y4CA 4R2FA 4N07A 3RN8A 1JETA 1BP5A 3LR1A 1MH3A 2ONRA 1GV8A 5I58A 4E0WA 5CBRA 3PMXA 4QFLA 2XXHA 4XKNA 3WAFA 1PDAA 3CR9A 3TTMA 3PUWE 1Y1ZA 1O64A 1XVYA 1JEVA 3O29A 4OYVA 4NF6B 2ONKE 3O66A 2UYFA 3K4UA 4THIA 3KJ7A 3U93A 5KDTA 3T22A 3PPPA 1YAEA 4EXKA 3U8QA 3HHFA 5I59A 3VVEA 3CIJA 5A5XA 4TLMB 2V25A 4R72A 2I4BA 4H1XA 2BJJX 4GFRA 4NF8A 5L9SA 1MPBA 1YCJA 4QHQA 2QS4A 4UACA 3K01A 4OENA 1Y4TA 1A8EA 3KOSA 1ANFA 2DWHA 2A5SA 3H6UA 2UVHA 1S7YA 3VLVA 1FW0A 3G3JA 3IL1B 5JEIA 1US5A 2P2AA 2W7YA 4IB2A 2VD3A 2QRYA 1URSA 1GTKA 4WEDA 1R1NA 2O1LA 3KBRA 2GFEA 3LSLA 1NNTA 4G68C 1DTZA 5B70A 1OLCA 2P0SA 4LZ5A 3S9MC 2VGQA 3S2VA 1UIUA 5FHMA 4F31B 1FTKA 5ITOA 3RTWB 2WKYA 3TELA 2Y7WA 1DPEA 3MJNA 2DXRA 1MXZA 3IR1A 2QSXA 4BLAA 3VE1B 1LGBC 1P1QA 1CE2A 2G93A 2QS1A 3TAJA 3R26A 4POXA 3O2AA 5AA4B 4OFLA 4ELOA 3ECRA 2E0SA 2DVZA 2XHDA 5I56B 3MP8A 1OVTA 1MY0A 1NFTA 2PT1A 3KN3A 4YKJA 2H9BA 3TTKA 4ELRA 3R6UA 2Q88A 4ZEDA 1JEUA 2O69A 2D5WA 3I3VA 3THIA 5DT6A 4Q30B 3SETA 3C32A 5HPQA 4FEBA 3M8UA 3OEKA 1XOCA 4RA1A 3S4UA 1MG1A 3LC8A 4PP0A 1FQAA 3HO7A 1US4A 3OENA 5HM4B 5H8NB 2Q9TA 1URGA 3PPQA 3KGCA 1SD3A 4OTEA 2Q89A 3FATA 5AE4A 5JTYB 2PT2A 1DOTA 1RKMA 5AA2A 5DEXB 1P1UA 1N7WA 3CFXA 4DCXA 4I9DA 3CFZA 1B40A 3MP1A 4OESA 1VSOA 1ZMGA 3MC2A 2F6PA 4TQUQ 3T93B 2VOZA 2F6GA 3BFUA 3S9NC 4MLVA 4GLIA 2OCUA 2G29A 4NEDA 4MH5A 5CMKA 1YTVA 1SI1A 4RK2A 4ZEIA 1PBPA 1A8FA 4F3GA 1R9QA 5KCJB 2F7AA 2Y7KA 4R9FA 4NMYA 1B5HA 1IUDA 3AXFA 3O9PA 1MY1A 4KPTA 4IGTA 3VV5A 1AMFA 4NE4A 1D9VA 3DELB 3EHUA 4ZE8A 4DIGA 3IJXB 2IEEA 1FQCA 3PV0E 3CSGA 3RT6B 3H6TA 3PD9A 3K6VA 4PFWA 1ZJLA 2PBWA 4L17A 1H3DA 2YPNA 4LONB 2F8DA 1B3GA 3FXQA 1MXYA 3T9VA 3N5LA 4YKPA 3PUVE 4KYSA 4IO5A 4OQOA 3FUZA 3V5AA 4NTLA 1TFAA 2I58A 4GXSB 3Q25A 1KWHA 2UYEA 5I2NB 5B7DA 1PB8A 1QKBA 2QPQA 2O1MA 4HCWA 1ZIUA 3G3IA 1HSJA 3CG3A 1Q1KA 4R9GA 3C9HA 1WVJA 4C1UA 3DP6A 2YJPA 3MPKA 4KQPA 4JSOA 3MQ9A 3RGYA 3VFJA 4H67A 4Z0IA 2NVUB 4LA9A 5L9OA 1BIYA 2F7BA 1SI0A 3TUSA 1NNPA 4IO6A 1H43A 3EN3A 1IQ7A 4E0XA 2NOOA 2H25A 1MPDA 2I6EA 3RT8A 4ZS9A 2ABHA 5JK4A 2DQVA 5H8NA 1OLAA 1J1NA 4NF8B 5IAIA 3GZGA 4WKMA 4G2ZA 4YAHX 3K0VA 5JTYA 3SEXA 4OWDA 4AB5A 5I57A 2HZLA 5EHMA 5DEXA 3PUXE 2VD2A 4RYAA 1MQJA 4Q8RA 4QSDA 4G77A 4ELQA 5HBCA 4QF9A 2F36A 2PMSA 1N0TA 2OK2A 2DP8A 1S9TA 3BFTA 1IXHA 4G68A 1JW4A 3RLFE 2AL4A 1POTA 3ZSFA 4QSEA 3HPIA 5CRYA 1LAHE 4KI0E 3G3FA 4KCDA 4IGRA 3SEWA 2H98A 3UP9A 3V89B 5L8DA 1B7HA 5TPAB 2O68A 5EHSA 3UA8A 2I4CA 1XS5A 4EDPA 4RPOA 4IY5A 2DOJA 4ESXA 4GD5A 5ICQA 1H76A 1CB6A 1B1HA 3FJMA 3OSRA 2Y7PA 2FNCA 4MLQA 3FVKA 3ILUB 4F1YA 2XXIA 5K2XA 2UVIA 3FVOA 2ZYOA 1DPPA 5I2NA 3QIMA 2YLNA 4U1OA 3IOTA 1VE4A 3VXCA 3K02A 2PX1A 1LCFA 3G3KA 2DWAA 4IO3A 2Q8JA 3UN6A 4YICA 2D3IA 4DZ1A 2ZYKA 1NH7A 3C34A 5DYHA 4U22A 1SW1A 1LB9A 2RCBA 1N84A 3EQ1A 4JDFA 3DLNA 1Y3PA 1XHYA 4BDRA 3QUJA 3V83A 1FQBA 1EZ9A 4GXAA 3DP4A 1MXVA 3ILTB 3LSXA 4HW8A 4GOTA 5AA2B 1OIBA 3N6TA 3W9VA 2OWSA 3LSFB 1MY4A 4FATA 4YZZA 1B32A 4U23A 3VVDA 5LOMA 2REGA 5BWJA 2RC7A 1NNFA 2XX9A 3IK6B 4XXUA 1D4NA 3CVGA 2DWIA 1SQYA 1B9JA 3RNNA 3K1PA 4OHNA 3TPAA 1MM6A 2F78A 3Q26A 3B7DA 3PPNA 2B65A 2O7IA 2NUVA 4OMBA 1B5IA 3SDFA 4XKPA 3I6VA 1OVBA 2F5XA 3TCFA 4DLDA 1ZKBA 1BKAA 2Q2AA 3QK6A 3LBSA 3RY3A 1MY2A 4X9TA 2QS3A 2DE4A 4O3CA 2THIA 2OLBA 5TP9B 1H44A 5H8QB 3VLWA 4U21A 4H5FA 5TPAA 4I1DA 1EH3A 4IY6A 1ATGA 3C36A 5IKBA 3TTRA 1JQFA 3MZ1A 2OWTA 3C31A 1I69A 2A5TB 3KN7A 3T9XB 2Y7RA 3KSJA 3USDA 3OO9A 4BDLA 3QAXA 4AQ4A 3TZAA 1A99A 1SVXB 1B7UA 1UTHB 3MVYA 1RYOA 1AOVA 2DYXA 3Q29A 4FJPA 3N26A 2RC9A 4POWA 4F3PA 5CM6A 2RF1A 1PEBA 4C1TA 1A54A 1FTOA 4EF2A 1OQHA 3ZS6A 1P99A 4O3AA 2ZYNA 1FTLA 3MAMA 4R75A 5AA2D 1D9YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I2KA 3H6VA 3L6HA 4F2OA 4F3BA 3UIFA 2REJA 3TEPA 2AIXA 3GLBA 3A3UA 2HXWA 1M5EA 2NXOA 1Y9UA 2Z23A 1USYE 1NV2A 4PAKA 1FPFA 4N8GA 3MBPA 3TTNA 1NUXA 4WEPA 3IB2A 2P1SA 3FVNA 4IR8A 3T96B 4DXUA 3V8XB 5I57B 4LATA 3OSQA 4R6HA 3K2DA 2FVZA 2R71A 1IIWA 4ECFA 1WODA 4C0RA 2QJEA 3KC1A 4X48A 2GHBA 2F97A 1B46A 3QXMA 4QRZA 5LDZA 4G68B 3KOTA 4M1VA 3TDJA 4U2RA 2I3VA 3PPOA 3VVFA 3GBAA 5TU0A 1B3LA 1FTMA 1NV6A 1UQWA 1DMBA 1NV5A 1FPGA 1O7TA 3KG2A 4KD5A 4PFUA 2GHAA 3FD3A 3MSTA 3OO7A 1FCKA 4G8NA 5FTHA 2B3FA 3HHGA 3QYTA 4HTGA 3KSXA 2F35A 4ZDMA 2VP1A 2HAUA 1RYXA 2XXXA 5K2YA 2UXAA 1PBQA 3U1OA 1BLFA 3EHTA 3O6HA 3OMBA 2UVGA 3PPRA 4F39A 3SERA 2B3BA 5TP9A 3OXNA 2CMOA 4Q5TA 5H8QA 1T0KA 1IZ1A 5AA1A 1IXCA 4R74A 3UK4A 3UORA 1FSAA 4NN3A 1BTJA 3W15C 1Q35A 2XD2A 4DXCA 1RDYA 4GL8A 2VPOA 1DTGA 4GWXA 2WYPA 1OQGA 4NF4B 1SYHA 4RXLA 4EXLA 4N6DA 2A5TA 4R73A 3PU5A 3N94A 1NV0A 1B05A 5M2VA 2XXTA 3RPWA 4PFRA 1NH8A 4OEUA 1LFGA 1TWYA 1AH5A 1M5CA 3E4RA 3H7MA 4FORA 1UTHA 5DVFA 3IOWA 5H8SA 3IOVA 1QVSA 3Q27A 3JYRA 2O51A 1EZOA 1AWBA 4MFIA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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