4QRZA

Crystal structure of sugar transporter atu4361 from agrobacterium fabrum c58, target efi-510558, with bound maltotriose
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
DVTLTLWSLDRDIQPAPNLIKEFNALNNGIKIEYRQLQFDDVVSESMRAYSTGNAPDIIAIDNPNHAMFASRGAFLDVTDMIAKSDVIKTENYFPGPLKSVTWDGKYFGVPKATNTIALYYNKDLFKAAGLDAAKPPQTWDELVDAARKLTNPAKNVYGISFSAKANEEGTFQFLPWAQMAGATYKNINTDGAVKALETWKTLLDEKLASPDTLTRSQWDSTATFNAGNAAMAISGPWEIDRMLKDAKFDWGVTLLPVPTPDAPRSSAMGDYNWAIFSKTKHPAEAFKAIEFFASKDKDMFKNFGQLPARSDIPVPPTGNALKDEALKTFVEQLKYAQPRGPSPEWPKISKAIQDAIQGALSGQMTPKAALDQAAEKIKLVDG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ABC-TYPE SUGAR TRANSPORTER
publication title Crystal Structure of Maltoside Transporter from Agrobacterium Radiobacter, Target Efi-510558
rcsb
source organism Agrobacterium fabrum
molecule tags Transport protein
total genus 139
structure length 383
sequence length 383
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-07-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qrzA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4qrzA02
4ESXA 2O51A 5CM6A 1S50A 4Q5TA 2GFEA 4G8NA 2XXWA 3ZKLA 4F19A 4U2RA 1US4A 3SEXA 2CZLA 5A5XA 3UIFA 2I4CA 2D3IA 4R6KA 1A54A 3T93B 4ECFA 4GFRA 3MP1A 4E0WA 3LR1A 3HO7A 3S9EA 5CC2A 1FTLA 2ONKE 1B4HA 2QPQA 1I69A 2HQ0A 1B3GA 3IR1A 4YAHX 2RCBA 4QFPA 3A3CA 4IO7A 1GVCA 4UACA 2ZNSA 3U93A 2F6PA 2NXOA 2Z8DA 4OXVA 1POTA 4LVQA 2B65A 1MQGA 3K1PA 3MP6A 3TQLA 3VV5A 1AH5A 4H5FA 2HZLA 2A5TA 3BBRA 4DCYA 3MVXA 1B1HA 3QIMA 4F22A 3PPPA 3VLUA 2ZNUA 4KD5A 4RYAA 5H8NB 3SEYA 5TP9A 3GXAA 2P2AA 1H76A 3K6VA 3KN8A 3N26A 4EXKA 3UORA 3USDA 1JQFA 3OO9A 3IOWA 4KR5A 2XHDA 3KEIA 3HPIA 3IB2A 3CFLA 4YKIA 5CMMA 3SETA 2X26A 5BWJA 4TOZA 3MAMA 1B32A 1DSNA 1OLAA 1NFTA 1DTZA 3HHGA 3T22A 2Q88A 2RCAA 1FQAA 3DP4A 2O7UA 3KZGA 4OEUA 4F3GA 5KZTA 1ZTYA 3GZGA 4YKJA 4XTCQ 1N3XA 1PC3A 5I56A 5I2KA 4N6PA 2AYSA 1ZKBA 4H0WA 4XIGQ 5J1DA 1ZMGA 5AE4A 3CSGA 3KBRA 2FNCA 3QSLA 2I0CA 3V83A 5DVFA 3V5AA 4Q30B 1QKAA 1IIWA 4F31B 1D4NA 5DEXA 1LLSA 3Q29A 1SD3A 2M8CA 5JTYA 3F11A 2IEEA 1NMUA 1A8EA 3N6UA 1BKAA 2V3UA 4GXSB 1MY0A 2QS1A 3SERA 3PUYE 4EXLA 1B9JA 3T9HB 2DP8A 4TQUQ 4MBPA 1QULA 3TCGA 2DE4A 4OFOA 3A3UA 4UA8A 2DE2A 1ELJA 2Y7IA 1IXIA 3MZBA 5KCJA 3CFZA 4O3AA 4OETA 1GR2A 5ITOA 2F6GA 1USYH 3L6GA 1AOVA 5ICTA 1LAHE 3C4MA 4QFOA 3PV0E 1B2HA 3MW0A 1NL5A 1I6BA 4Q0CA 4IY5A 2O69A 5H8HA 2O84X 5CBSA 2DWJA 1D3KA 2D5WA 2XXYA 3VLWA 4RXLA 3ECRA 1M5DA 3FVKA 4OHNA 4EF2A 1S7YA 4KHZE 4OTEA 2P0SA 2QMWA 3MUQA 5B70A 3N5LA 3U8QA 2O7IA 3TTLA 2W7YA 3MZ1A 2RC8A 1LBBA 3OEMA 3FD3A 1LFHA 2XX9A 3O28A 5L9OA 1O7TA 2ABHA 4XXUA 3QXMA 5HM4B 5JEIA 3G3IA 4NWDA 4LONB 3D4CA 1NKXA 1Y1ZA 3PMWA 3FATA 3IO4A 1VR5A 2ZMBA 4R75A 3G3JA 2XXQA 2HEUA 2VD2A 3HSTA 4XKQA 2V84A 1IXHA 1MXVA 2DWAA 3TQWA 4LATA 1N7XA 1QVSA 4R2FA 4NEDA 2AL4A 3IOTA 4MFIA 5AA4B 3DELB 1LCTA 2QRYA 2XXHA 1B46A 4GL0A 4R9GA 1YAEA 4NE4A 2OWSA 5I2NB 2R9JA 2F36A 2QL3A 1N84A 2F7AA 3LUYA 4ONYA 2H9BA 4JB7A 2Q9TA 1MDQA 1SQYA 3D4GA 2I4BA 3Q25A 3UK4A 4GLIA 4XKRA 3TAJA 1UTBA 3R7XA 3WAFA 5EHMA 4TLLB 5FHMA 1BIYA 1B7ZA 2Z8EA 4LQ2A 1SDXA 2A5SA 2UVIA 3FV2A 4NF8A 2YLNA 4THIA 4FATA 5JK4A 5HBCA 2UYFA 2HZKA 1SVXB 3CFXA 3PMVA 3OD7A 2H5YA 1AMFA 3FZVA 1SW4A 4ELQA 1B58A 5IKBA 5ITPA 3M3KA 1B6HA 2DWIA 4NF5A 3O97A 1A8FA 1JW4A 1MG1A 2O68A 4F1YA 4H8IA 4O3BA 1LAFE 4PE5B 1BP5A 4MLQA 1TFAA 4GWOA 3JZJA 3B6QA 1PB9A 2XXRA 3I3VA 2GH9A 5I59B 4IY6A 1A7LA 4U4SA 4QSEA 1DMBA 2P1SA 4JWXA 4JWYA 2DSFA 4ZEDA 1S9TA 4ZS9A 5AA2D 3M8UA 1FW0A 2Y7RA 3Q26A 4N13A 1SYIA 3LSXA 5H8FA 3KN7A 3PPRA 3G7WA 4JSDA 4OESA 4F1UA 3OENA 2F7CA 4NTLA 4R6YA 2O1LA 4Z7EA 1Z7NE 4ZZEA 1CB6A 1PEBA 3MWBA 4RY1A 4C1UA 4H67A 4I9DA 3FV1A 4KCDA 3IAZA 2PT1A 1M5EA 5I84A 1IXGA 3PPQA 3LBSA 3BFUA 5EHSA 3K1NA 4LQ5A 1IQ7A 2RF1A 2Z23A 3N94A 2DYXA 2OK2A 2NVUB 3ZS6A 2XXVA 1T0KA 3L6HA 3H6UA 3IL1B 4G68B 5I58B 3TODA 4YU0A 3BKIB 2FYIA 1I6QA 1QKBA 4AB6A 4YKKA 2Y7PA 4GIZA 3K2DA 4H1XA 1UTHB 4IO4A 1SW2A 4LZ8A 5I57B 2IA4A 3CIJA 4KCCA 2XXIA 3WAEA 3PUZE 3IJOB 1SYHA 3MJNA 3SKPA 1B52A 1JVXA 2NOOA 3CG1A 3CRBA 5TPAB 1M5FA 1D9VA 1B3LA 3RGYA 3O2AA 3EN3A 3TTNA 3IB1A 4EQ7A 2BJJX 1B1XA 1OQHA 3H4ZA 1R9LA 1H44A 2REJA 3VFJA 3ODBA 1ZIUA 1Z7ME 3IORA 1FQFA 4G68C 1POY1 1XOCA 1OQGA 4U22A 4IO6A 1JW5A 1IEJA 3O9PA 1ZBMA 2NUVA 3PD8A 5AA3A 4YB5A 4OFJA 5F1QA 3GLBA 3S4UA 4LZ7A 1PBQA 1VFEA 3G3KA 5CMBA 3R6UA 5DT6A 4PFTA 3LSWA 1MQDA 1DPPA 4HTGA 5EYFA 4IGTA 2OLBA 4JSOA 4OQOA 4QFLA 3RPWA 1N3WA 3CVGA 4LA9A 2QSXA 3KN3A 4GRKA 4QF9A 1R9QA 1MY3A 2ZNTA 1XC1A 3OMBA 2FA7A 3ZKKA 3N6TA 1SW5A 3HV1A 4U1OA 4HCYA 1OMPA 2OWTA 1B7UA 3K6XA 2DOJA 1MXZA 1YPNA 3W15C 4NWCA 4P0IA 2Z8FA 1P1WA 3U92A 2V93A 3C36A 3VE1B 3SEWA 1VSOA 4AQ4A 1NH7A 4NF6A 5KDTA 2Y7WA 2HXWA 3K0VA 3TFLA 1J1NA 2ONRA 2DE3A 2UVGA 1LGBC 1KWHA 5A5XB 4FE8A 3K02A 2H99A 1P1UA 2DVZA 2R6GE 1Y3NA 5AA4A 2CMOA 1MM6A 4Z0IA 1URSA 3VXCA 2X7QA 4NF4A 1L5TA 3QUFA 3FJMA 4F39A 3RT6B 1B05A 3KJ7A 4G4PA 2GHBA 2I48A 4HCWA 3MQ9A 2LAOA 3FUZA 4QSCA 3Q28A 1FTOA 4E0XA 4QFKA 2VOZA 3H6WA 4ZEBA 3EHUA 3IOVA 3TTRA 3P7IA 1B5JA 2O6AA 1MH4A 3T9UA 1P1OA 4ZDMA 3RN8A 4ZEKA 1NNPA 3O6GA 3EHTA 4ZE9A 5AA2A 3UP9A 1MM7A 4R74A 1B0HA 2XD2A 2A5TB 4R2BA 4F1VA 1N7WA 1Y4CA 1XHYA 3S2VA 3EPEA 4RA1A 1Y1MA 4P0GA 1BLFA 3IOUA 1LAXA 1MPBA 4WXJA 4X48A 3FVOA 5TP9B 2UVHA 3HHFA 1AIVA 4EQBA 1FTKA 1FQDA 5L8DA 2ZYKA 1N76A 4WKMA 4I1DA 2Q8JA 2XXUA 1FQCA 3C31A 3DLNA 5FHOA 2V25A 3FXUA 5I59A 4QFNA 1WODA 3H3GA 2RC7A 3H03A 3RY3A 4OENA 1FQEA 4H65A 2Q2AA 3R26A 3QYTA 2RC9A 3FVNA 4OYVA 3W9VA 1XVXA 3HN0A 2UVJA 4YZZA 4ISUA 1RYOA 3BFTA 5I56B 4DXBA 4POXA 5I2KB 2V3TA 1II5A 1MDP1 2I6EA 2I0BA 4C0RA 4ZECA 4QSDA 3PD9A 5H8QA 3THIA 5DEXB 2AL5A 2Y84A 4KQPA 2YJPA 1PB7A 5JTYB 3CG3A 1TWYA 2THIA 4YICA 3SEVA 4LZ5A 3HCQA 2XXPA 4GL8A 2PMSA 3C33A 3SEUA 5ELVA 4IO3A 2GRVA 3OELA 3MP8A 4EQ9A 3GBAA 2UYEA 2ANJA 1P1QA 5CMKA 4X9TA 3VDFA 4DIGA 3RUMA 4JDFA 3TDJA 3MZ9A 2DS9A 3DP8A 4KYDA 3T96B 1HSEA 4H8JA 4F2OA 4AB5A 4O3CA 3H6TA 1HSLA 4RK9A 4PFUA 4OWDA 4BDNA 1MPDA 3B7DA 5KCJB 2VGQA 3G3FA 1DPEA 1JETA 4GXAA 4R9FA 4KYSA 4U4XA 3RNNA 2RINA 5H8NA 5H8HB 4BDMA 3C35A 1B4ZA 4ELPA 4M1VA 3S9NC 3DP6A 4FIMA 4EF1A 1GGGA 2ALUA 2HAUA 2Z22A 4Q8RA 3RLFE 3TUSA 3O29A 3KSXA 2QJEA 1N04A 4FECA 2V3QA 1URGA 1P1NA 4F18A 1F9BA 2F35A 4RPOA 3SDFA 3EQ1A 1HSJA 3FGSA 3CI8A 1EH3A 1JEUA 3E4RA 3B6WA 4FJPA 4YB6A 3VLVA 1MS7A 4DZ1A 3TTMA 5BUUA 2REGA 3ILTB 1R6ZA 4ELRA 2XX8A 3FXQA 3PU5A 1LFGA 1MPCA 1A40A 2F5XA 1B40A 3K4UA 1Y3QA 3T9XB 1I6AA 3UA8A 4TLMB 1GTKA 2HCAA 3PMXA 1ANFA 2B3BA 5L9MA 2HFBA 2OZZA 5K2XA 3LSLA 3FJ7A 2VP1A 4HW8A 1TFDA 3OXNA 4I8CA 3T66A 2H98A 1RYXA 2QS2A 5ICQA 1SW1A 1O64A 1UQWA 4QHQA 4KYEA 1TXFA 4XKNA 4JWOA 3QK6A 1H45A 3UN6A 4X1DA 4MF3A 1B3FA 1NNTA 4F3PA 3FASA 1IZ1A 5B7DA 1D9YA 2VD3A 1JNFA 5K2YA 1RKMA 3UGWA 3GBBA 1QUKA 3E9XA 1XVYA 3I5OA 1MH3A 4JBZA 3TCFA 2UXAA 4OFLA 1MY2A 3PPNA 5FHNA 1WVJA 3H6VA 3H06B 3KFMA 1O63A 1SBPA 1UTBB 4WEDA 4U1ZA 3IO6A 4ELOA 4G77A 4DDDA 4R6HA 4NF8B 3O6HA 2Q2CA 5TU0A 4GVOA 1B7HA 2DWHA 4ZEFA 3TTKA 1N0TA 4FEDA 4GD5A 1B0LA 1EZ9A 2I3VA 3MVZA 2DVCA 1EU8A 2ZYOA 2I3WA 4PP0A 3PUVE 1DTGA 4KI0E 5CBRA 2F78A 2GHAA 2B3FA 3KOTA 4BDLA 2OBGA 1FTJA 3MPKA 1Y9UA 4NF5B 4DXUA 4RK2A 2HAVA 3KOSA 3RTWB 4G2ZA 3TELA 2ESNA 2ZXTA 1VFDA 3RTFB 3JV9A 2I58A 5H8SA 2PYYA 3OO6A 1ZU0A 4U23A 4DXCA 4ZE8A 1MXWA 1QW0A 3O6IA 1JVYA 3OO7A 1Y20A 4IB2A 1A55A 3LSFB 2I49A 1YCJA 4YKPA 1MQIA 3KG2A 5CRYA 1WDNA 2XXXA 3TYHA 2X7PA 3PPOA 3AXFA 3MVYA 4GOTA 1TT1A 3FVGA 5H8FB 1LFIA 5ISUA 3OSQA 4OMBA 4JXIA 2E0SA 1B3EA 5FTHA 2QS4A 3PGFA 4LP2B 4PFWA 1PBPA 3TZAA 3VVFA 1SI1A 2PT2A 3RT8A 1YTVA 2ONSA 5F7VA 3VVDA 4DE8A 1Y3PA 1IUDA 3M3FA 3B6TA 3U94A 2G29A 2OCUA 3V89B 3C9HA 5I2NA 4X1BA 3KSJA 5DVIA 1Y4TA 3TMGA 4R72A 5LOMA 3KJTA 3S9MC 3QAXA 1IXCA 4MLVA 4OERA 3MBPA 4OEVA 3TKDA 2Q89A 2OJTA 4OVJA 3U1OA 1ATGA 1MXXA 4GQOA 1LSTA 3RQTA 3EF7A 4ESWA 1CE2A 1ZLQA 3CR9A 3OOAA 3T9VA 1FTMA 5L9SA 2R71A 4EUOA 3S9LC 3G3GA 4BDOA 1B3HA 1URDA 4YB7A 5CI5A 4H5GA 1MXUA 4I62A 4R73A 4YMAA 1EZOA 1OVTA 4L17A 4ND9A 4U21A 1XT8A 4G8MA 1UIUA 1BTJA 4H6DA 2RKMA 3M3LA 3MVWA 4ZZAA 4BLAA 3V8XB 2H4IA 1OLCA 4IO2A 1VE4A 5DVJA 1B5IA 1ZJLA 4GF8A 3JYRA 1MQHA 1JEVA 4PFYA 4RPNA 1LB8A 4HS7A 1GV8A 1MY1A 2Y7KA 1NNFA 3I6VA 4BDRA 4POWA 3ZSFA 1MXYA 1US5A 2PX1A 1FQBA 4F3BA 3LC8A 4OZ9A 1Q1KA 2ZYMA 2WKYA 3ILUB 2E1SA 4G8HA 3TPAA 3IK6B 3FIRA 4LUBA 1PB8A 3C34A 1USYE 3OO8A 4RJZA 2D21A 3K6WA 4NF6B 5KDTB 1XS5A 4PETA 2AIXA 2O1MA 1JW1A 2DXYA 5I58A 1IITA 4G68A 2VHAA 1FCKA 2XXTA 3K6UA 1SI0A 3ONMA 4QRZA 4M4GA 3MC2A 4NF4B 4P11A 4ZEIA 1QJMA 5AA1A 1UTHA 3DM0A 1NNKA 2DXRA 3K1MA 4F29A 4WEPA 1LCFA 4FEBA 5I57A 1M5BA 4F3SA 1H43A 1P99A 2H25A 1MY4A 1MRPA 5CMCA 1Q35A 2PBWA 3OEKA 5TPAA 1OVBA 1B5HA 1OIBA 3A09A 3PUWE 1R1NA 5AA2B 3O66A 5FTIA 2NWJA 3C32A 1EZPA 3E3KA 3IB0A 3PUXE 4BDQA 1LBCA 3Q27A 3TCHA 1UIVA 2DQVA 4FORA 4MH5A 4FAJA 4NMYA 5DTBA 3H7MA 2YPNA 3K00A 3VVEA 2F7BA 4F2QA 1B51A 2XX7A 3IJXB 4IGRA 3CSBA 5HPQA 4EDPA 4N07A 1A99A 4PQJA 2QS3A 3VXBA 1LB9A 1QUJA 3K01A 1MQJA 2PVUA 4YMBA 3EHSA 3KGCA 4XKPA 2QMXA 2KLFA 4KPTA 2F97A 5M2VA 2G93A 3TEPA 5DYHA 2F34A 1NH8A 3FXRA 1DOTA 4KFQA 4K3FA 3QUJA 1AL3A 2XD3A 4DLDA 4DCXA 1QUIA 3W9WA 4C1TA 1LAGE 1M5CA 3MPLA 3IX1A 4RNSA 3G3HA 3E13X 2ZYNA 1PDAA 2F8DA 3SESA 1H3DA 3U72A 3OSRA 5IAIA 4IO5A 3FJGA 5H8QB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ESXA 2O51A 5CM6A 1RDZA 1S50A 4Q5TA 2GFEA 4G8NA 2XXWA 3ZKLA 4F19A 4U2RA 1US4A 3SEXA 2QVUA 2CZLA 5A5XA 3UIFA 3RPLB 2I4CA 2D3IA 4R6KA 1A54A 3T93B 4PBQA 4ECFA 4GFRA 3MP1A 4E0WA 3LR1A 3HO7A 1NV2A 3S9EA 5CC2A 1FTLA 2ONKE 1B4HA 2QPQA 4KXPA 3A29A 1LBVA 1I69A 2HQ0A 1B3GA 2F3DA 3IR1A 2WYKA 4YAHX 2RCBA 4QFPA 3A3CA 4IO7A 1GVCA 2CEYA 4UACA 2ZNSA 3U93A 2F6PA 2NXOA 2Z8DA 5ET6A 4OXVA 1POTA 3GYYA 4LVQA 2B65A 1MQGA 3K1PA 3MP6A 3TQLA 3VV5A 1AH5A 4H5FA 2HZLA 2A5TA 3BBRA 4DCYA 3MVXA 1B1HA 4MX6A 3QIMA 4F22A 3PPPA 3VLUA 2ZNUA 4KD5A 5IZ1A 4RYAA 5H8NB 3QMFA 3SEYA 5TP9A 3GXAA 2P2AA 4DI3D 1H76A 3K6VA 4LN5A 3KN8A 3N26A 3FXBA 4NHBA 4EXKA 3UORA 3USDA 1JQFA 3OO9A 3IOWA 4KR5A 2XHDA 3KEIA 3HPIA 3IB2A 3CFLA 4YKIA 5CMMA 3SETA 2X26A 5BWJA 4TOZA 3MAMA 1B32A 1DSNA 1OLAA 1NFTA 1DTZA 3HHGA 3T22A 2Q88A 2RCAA 1FQAA 1DCUA 3DP4A 2O7UA 3KZGA 4OEUA 4F3GA 5KZTA 1ZTYA 3GZGA 4YKJA 1NV7A 4XTCQ 1N3XA 1PC3A 5I56A 5I2KA 4N6PA 4P9KA 2AYSA 1FPFA 4P1EA 1ZKBA 4H0WA 4XIGQ 1FBGA 5J1DA 1ZMGA 5AE4A 3CSGA 3KBRA 2FNCA 3QSLA 2I0CA 3V83A 5DW8A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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