5I56A

Agonist-bound glun1/glun2a agonist binding domains with tcn201
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
288
structure length
286
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQECD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
total genus 81
structure length 286
sequence length 288
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i56A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i56A02
2HAUA 5BUUA 5I59A 3RTWB 3LSLA 1DOTA 3O6HA 4F1VA 4GXSB 4IO2A 1Y20A 1QUIA 4POWA 2P2AA 1MY4A 3FXQA 2Q8JA 3VXBA 1NMUA 4F31B 4OESA 4PETA 3I3VA 1QUKA 1M5DA 1B5HA 5H8QB 4R73A 3K6XA 3E4RA 3HPIA 2F36A 1LGBC 1TFAA 1QW0A 2ABHA 4YB6A 1II5A 3EHSA 4XKPA 2VD3A 2AIXA 2Y84A 3SESA 1R9QA 3Q26A 1FQFA 3IK6B 1IEJA 1JVXA 2ALUA 2V25A 4G2ZA 4TLLB 1XS5A 2F97A 4OXVA 4HS7A 2I48A 3LR1A 3DP8A 3CFZA 4QFKA 2F7CA 2GFEA 3VVDA 3PD8A 1QJMA 3FIRA 1FQEA 2RCBA 2W7YA 1DMBA 4TOZA 3IX1A 2O51A 4YKIA 4GD5A 2V93A 2B65A 4ND9A 1UTBB 3SKPA 3PPNA 3TTRA 2HQ0A 2I6EA 4U22A 5HPQA 1B0HA 1QVSA 3S2VA 1Q1KA 2UVJA 5ITPA 4DCYA 3D4CA 5TP9B 3PPPA 1I6QA 3CG3A 4PFTA 1FW0A 3MC2A 4O3AA 4F2OA 2AL4A 2V3UA 1H45A 1XHYA 2VHAA 3MVWA 1H76A 2QL3A 3RNNA 3VFJA 4U23A 3FJGA 4JWYA 4P0IA 4LVQA 2IA4A 2P1SA 5L9MA 1Y3NA 2HFBA 3G3JA 1ZBMA 4Z0IA 3W9WA 5L9SA 4IO6A 1TXFA 3GXAA 2UVHA 3L6GA 2QS3A 4NEDA 4YKJA 2E1SA 4HTGA 3SEUA 3L6HA 4F2QA 3OOAA 1B3LA 1ELJA 1MXYA 1NL5A 5DEXB 4X1BA 2DE3A 4RXLA 4R6YA 3B6TA 4NTLA 4LA9A 3UIFA 1SYIA 1PBQA 1GVCA 1MPBA 5AA3A 5FHOA 4R6HA 2A5SA 5J1DA 4G8HA 2NWJA 1P1WA 1SD3A 2IEEA 4IO3A 1H43A 1O7TA 4KFQA 1Y3PA 2AYSA 4YZZA 3FJMA 4TLMB 1NNFA 4O3BA 3OSQA 2VGQA 3UA8A 3DP6A 5K2XA 1OIBA 2Y7IA 4Q5TA 3OELA 3K4UA 3VE1B 3FATA 3DP4A 5DVFA 4U21A 3TAJA 3S9NC 3QUFA 1URGA 5A5XA 2QS1A 3FXRA 4I8CA 4XKNA 1FQCA 2CMOA 2RC7A 5AA4A 3CSBA 1AOVA 1RYXA 5AA2D 1USYE 3SERA 2Q89A 4NF8A 3OO6A 2D21A 1I6BA 4OFLA 3U94A 4QSDA 1UTBA 3IJOB 5EHSA 1ZKBA 3G3GA 3U8QA 3H4ZA 1SW5A 2OCUA 2DS9A 1TFDA 2ZYMA 1IXHA 3KZGA 3VXCA 3CR9A 4N6PA 5KDTA 3E3KA 1IUDA 2RCAA 1B6HA 4G8NA 4ESXA 3V83A 2UXAA 1SBPA 2RINA 2XX8A 1P1OA 2ZNTA 1B4HA 3MW0A 3WAFA 5IKBA 2I4BA 4PFWA 4JSOA 3W9VA 2DWIA 3TELA 2F8DA 2H99A 2QMWA 4F22A 3K6VA 2FYIA 4YKPA 3MWBA 1Y1ZA 2F6PA 1LBBA 1MY0A 5AA2A 4BDRA 2REGA 2DYXA 4QFOA 5JK4A 1FTMA 3SDFA 4GXAA 1D9VA 2DWAA 1B7UA 1XVXA 2PT2A 1ZLQA 2HAVA 1H3DA 4M4GA 1S7YA 2F35A 1NH8A 2B3BA 4IY5A 4OENA 4XKRA 3VLUA 3TCGA 2XXTA 5DTBA 3K1NA 3IJXB 1B3EA 3OEKA 4FORA 3K00A 4RYAA 2F78A 5CMKA 2BJJX 1POY1 3FVKA 4MF3A 4OHNA 4KD5A 1A54A 4OEUA 5L9OA 3KSXA 1AL3A 3MUQA 4EF2A 1A40A 3V89B 1JW1A 1MXUA 3C35A 2XD3A 1MH4A 4GF8A 5K2YA 1JEUA 2X26A 3CIJA 3H06B 1IITA 2QS4A 4MBPA 2O7UA 4LQ2A 2P0SA 5I56A 4AB5A 4P11A 4ZEIA 3MQ9A 3RY3A 4M1VA 4F39A 3Q29A 3OXNA 3T9XB 5EHMA 1JW4A 2GH9A 3KFMA 3O66A 1VSOA 1TT1A 2WKYA 3PGFA 3VLVA 3P7IA 3A09A 3CSGA 4OETA 2DE2A 2G29A 4KCDA 5H8FB 1RYOA 3MBPA 1N0TA 1FTLA 1DPEA 2O69A 3N6UA 1B3FA 3A3CA 1MXWA 4ZZAA 2DVCA 2H4IA 2NOOA 4HW8A 1MY3A 2PMSA 4KYDA 4MFIA 4GVOA 1AMFA 3OEMA 2R9JA 4R9GA 4ZEKA 3LSXA 3BBRA 4WXJA 1A8FA 1YTVA 2ZMBA 3FVGA 5IAIA 1DTGA 4H5FA 1US5A 4G77A 3QXMA 1A99A 1UQWA 1NFTA 3S9LC 3K6UA 3IOUA 4DDDA 3PUXE 4DXBA 4Q30B 4KR5A 5H8HB 1ZJLA 3VV5A 1OQHA 2DOJA 4NF4A 2PT1A 2HCAA 1Y4CA 3KN3A 4LQ5A 1L5TA 3ZS6A 4WEPA 4GRKA 3SEVA 2I49A 2Q9TA 3TQWA 4IO5A 2RKMA 4LZ5A 2V84A 1B4ZA 3O9PA 3VLWA 3RT8A 4U4SA 5TU0A 1UIVA 3C33A 3KOTA 4H1XA 2REJA 1A8EA 4N13A 3RN8A 1IZ1A 2HEUA 3G7WA 1YPNA 4IO7A 4X48A 2ONKE 4PP0A 3SEWA 1PEBA 3KN8A 4YICA 1M5CA 4KPTA 3T9HB 1DSNA 5I2KB 3KN7A 3O28A 2GHAA 3FUZA 4IB2A 3TTMA 4FJPA 1F9BA 3IB0A 4UACA 4MLVA 1H44A 2F34A 1MDQA 5H8SA 2XXWA 4R75A 4YB7A 4ZDMA 2O1MA 1B5JA 3JV9A 4I62A 3CG1A 5TPAB 3TFLA 2O84X 3USDA 4FEDA 3B6WA 1PBPA 3EPEA 3IB1A 3IOWA 2ZXTA 2ESNA 4EDPA 4KQPA 1IQ7A 1SQYA 3A3UA 4BDOA 3T66A 1UTHB 1SW4A 2NXOA 4GFRA 1MM6A 2RF1A 1D3KA 1N76A 1URDA 3T96B 1PDAA 3PUVE 1LAHE 4YU0A 1XC1A 1OLAA 1M5FA 4IGRA 4HCYA 1DPPA 1SI1A 1EZOA 1FCKA 4ZEBA 5H8NA 1NKXA 3BFTA 1LAGE 2NUVA 4ESWA 1CB6A 3ECRA 4RPOA 3ZKKA 4DLDA 3PMVA 2B3FA 2DSFA 2Z8DA 2D3IA 4QFLA 5KCJB 5H8HA 4QFPA 4G68A 4IO4A 4X9TA 1LAFE 3C31A 4JWXA 4F3PA 2YJPA 3LSFB 3U1OA 4QFNA 3CFLA 2I4CA 3IAZA 2ONSA 5JTYA 3FVNA 4NF6B 5I58A 3O6IA 4EXLA 5B7DA 1OVBA 1JVYA 1LAXA 1Q35A 4Q8RA 3JYRA 3Q25A 4WEDA 1BIYA 4XXUA 2X7PA 5L8DA 3ILTB 1LBCA 3LBSA 1GV8A 5FTHA 3KGCA 3ZSFA 4QHQA 4PFYA 3R6UA 4POXA 1MQIA 5H8QA 2O1LA 2H9BA 3FXUA 4YMAA 3H3GA 3D4GA 5HBCA 1ZU0A 3MZBA 1T0KA 4EQ9A 3S4UA 5I2NB 1FQBA 3OO9A 3U93A 3BFUA 2DE4A 3EQ1A 5FHMA 5DVIA 3RT6B 1B7HA 2V3QA 3PD9A 1JEVA 3K0VA 5ELVA 4L17A 2H5YA 2DXYA 4OERA 2XD2A 4LATA 3AXFA 4BDLA 1B7ZA 4KHZE 3C36A 2PYYA 2UYFA 4HCWA 1N04A 3IR1A 4R74A 3PUZE 1MQDA 2M8CA 3MP6A 3C4MA 3H6WA 1WDNA 3THIA 1FQDA 5I84A 3M3LA 3OD7A 2A5TB 1JETA 5CBRA 5CBSA 1PB7A 1B40A 2X7QA 1LB9A 3C9HA 4RJZA 3O2AA 3OENA 4H0WA 4FEBA 4U4XA 5TP9A 3C34A 3GBBA 4R2FA 2XXUA 1LFHA 4P0GA 3QUJA 5BWJA 2UVGA 4H67A 4C0RA 4YAHX 5CC2A 1N7WA 3N26A 3I5OA 2XXHA 3UORA 2O7IA 5I57B 2O68A 5AE4A 2ANJA 1VR5A 1QUJA 1NH7A 4IY6A 1I6AA 4H5GA 2VD2A 5JEIA 4U1ZA 4JWOA 3S9EA 2I0BA 4BDMA 3B7DA 3M3FA 3E9XA 4NF5B 4Q0CA 4LZ8A 3K02A 4OTEA 5DEXA 3G3IA 2QPQA 1MPDA 3DLNA 3GZGA 2D5WA 3T9UA 1LFGA 5I59B 1XT8A 3O6GA 1ZTYA 2Z22A 3TMGA 1MY2A 4U1OA 1JW5A 2Q2CA 2ZYNA 3MVYA 5LOMA 2HXWA 3HSTA 3MZ9A 3ZKLA 3TTKA 2DXRA 3K01A 3N5LA 3HCQA 4H6DA 3WAEA 1PC3A 3H6UA 3FJ7A 4QSCA 3G3KA 2F5XA 1USYH 5EYFA 4AB6A 3TODA 1N3WA 3SETA 1Y3QA 1N3XA 4YB5A 1MG1A 3W15C 3KOSA 1B51A 4LONB 1POTA 5ITOA 3LC8A 3O97A 3U72A 4TQUQ 3MAMA 1HSJA 1OVTA 2HZKA 2ZNUA 3OO8A 1IXCA 5CI5A 4H8JA 1AH5A 1MRPA 2ZYKA 2XXRA 1Z7ME 3KSJA 5ISUA 3FD3A 4G68C 1LCTA 1B52A 5CMBA 2OWTA 1VFEA 1BLFA 1IXGA 2I58A 2H25A 2Q2AA 3FV1A 4RK9A 2UYEA 4E0WA 3QIMA 4LZ7A 1PB8A 1B9JA 1Y9UA 1BTJA 1P1NA 2FA7A 3VVEA 3Q27A 4R9FA 1MXVA 3IL1B 4H8IA 3OMBA 4BLAA 3FVOA 4ZECA 5B70A 1D4NA 3QAXA 2XXQA 4ZEFA 1BKAA 1B0LA 3LUYA 4ZS9A 4DE8A 4EQ7A 3PUWE 3V5AA 4IGTA 4ELPA 5FHNA 3PU5A 3TUSA 1BP5A 2LAOA 3GLBA 3MVXA 2XX9A 2XXPA 4EF1A 3CFXA 3I6VA 3PMWA 1URSA 1SW1A 1MY1A 3R7XA 3T22A 1DTZA 1B58A 5F7VA 1MM7A 4KYEA 3EHTA 2RC8A 3MVZA 2OWSA 2DQVA 3KG2A 1RKMA 4GL0A 3K1PA 1LSTA 4KCCA 4BDQA 1LFIA 4PFUA 4F3GA 4R72A 4FECA 4FIMA 1P99A 4RK2A 2XXVA 2QJEA 1LCFA 1QULA 5DYHA 2Z8FA 3VVFA 4F29A 4X1DA 3UGWA 1B1XA 3DM0A 1FTKA 3RTFB 4WKMA 4PQJA 1B3GA 4GIZA 5H8FA 2V3TA 5A5XB 2ONRA 4NMYA 1GGGA 1XVYA 4EQBA 2QSXA 4LP2B 1EZ9A 4QF9A 5AA4B 3QK6A 3PPOA 1KWHA 3MP8A 4ELOA 3FASA 4NF8B 4F1YA 3SEYA 1ZMGA 4JXIA 3TPAA 1N84A 1MXXA 3FGSA 3PV0E 4RPNA 1J1NA 3CI8A 2UVIA 3EF7A 3MP1A 5KDTB 1Y4TA 2Y7PA 1B5IA 3TTNA 4KI0E 4OEVA 1SYHA 1WODA 3PUYE 1A55A 2NVUB 2PVUA 4GQOA 3R26A 3G3HA 5CMMA 1MS7A 4MH5A 4R6KA 3TTLA 4ONYA 4JDFA 2PX1A 3IB2A 3VDFA 5AA2B 1MXZA 2KLFA 3JZJA 2OK2A 1XOCA 2R6GE 3S9MC 3TDJA 4QSEA 5DT6A 4MLQA 4E0XA 4JB7A 3SEXA 2XX7A 1SI0A 4DXCA 2CZLA 3HN0A 2XXXA 1O64A 1P1UA 3V8XB 3ODBA 5CRYA 4OWDA 3KEIA 3G3FA 1JNFA 5I2KA 1SW2A 3QYTA 2XXYA 3HHFA 3UP9A 5ICTA 2E0SA 2F7AA 4ISUA 4GOTA 2PBWA 1VFDA 3FV2A 2FNCA 2Q88A 4YKKA 4H65A 4FAJA 2I0CA 5TPAA 2ZYOA 5DVJA 4NWCA 2F6GA 2DWJA 4C1UA 3PMXA 3TKDA 5I56B 2GRVA 4F1UA 1GR2A 2HZLA 1UTHA 4YMBA 4XTCQ 4AQ4A 4I1DA 3H6VA 1SDXA 1LB8A 2Y7KA 4U2RA 1US4A 2RC9A 4GWOA 1MQHA 1IIWA 3BKIB 3RPWA 4QRZA 2QRYA 4G4PA 3N6TA 2I3WA 4RNSA 1EH3A 3U92A 1M5EA 3M3KA 4KYSA 4OVJA 1YAEA 1NNKA 4K3FA 4N07A 3RGYA 4OYVA 4DZ1A 5AA1A 5HM4B 3RLFE 3E13X 4XIGQ 3TYHA 1OLCA 1M5BA 1YCJA 2OZZA 1D9YA 3H03A 5KCJA 1ZIUA 2Y7WA 3OO7A 1MQGA 4FATA 4FE8A 1SVXB 4NE4A 2OJTA 3T9VA 2G93A 1MQJA 3B6QA 5ICQA 4ECFA 5FTIA 4JBZA 3MPLA 1S50A 2QMXA 2O6AA 4THIA 3HV1A 3OSRA 3PPQA 4Z7EA 4RY1A 4NF4B 1R6ZA 4OQOA 4NF6A 3N94A 4DXUA 3QSLA 3ILUB 4I9DA 3KJ7A 2XXIA 1Z7NE 3K2DA 4PE5B 3UN6A 1AIVA 2OBGA 3RQTA 4ZE9A 1I69A 3K1MA 3PPRA 2XHDA 1B32A 3IOTA 3C32A 4OFJA 3T93B 4JSDA 4ZEDA 3FZVA 2F7BA 3IORA 1O63A 1R1NA 4F19A 1IXIA 2THIA 3MPKA 3KJTA 2VOZA 1PB9A 1B46A 1OQGA 4OZ9A 2QS2A 3TCHA 2DVZA 1MDP1 4GL8A 2R71A 1OMPA 5I2NA 2H98A 4ELRA 3TQLA 3TCFA 3MZ1A 3IOVA 4ZZEA 1MPCA 4EUOA 3H7MA 1N7XA 4BDNA 1Y1MA 4OFOA 4DCXA 3IO6A 4RA1A 1EZPA 2YLNA 5M2VA 3GBAA 1QKAA 1S9TA 3F11A 1EU8A 1WVJA 4F18A 5F1QA 4G8MA 5CMCA 2GHBA 1MH3A 2A5TA 4O3CA 1FTOA 3LSWA 4NWDA 1UIUA 1QKBA 2AL5A 2DP8A 4DIGA 4R2BA 3KBRA 4ELQA 1HSEA 1NNPA 1FTJA 2VP1A 4GLIA 3HO7A 3M8UA 3HHGA 5KZTA 3RUMA 1VE4A 3TZAA 3TEPA 3IO4A 2YPNA 2Z23A 1CE2A 5I57A 1GTKA 1NNTA 5H8NB 2Z8EA 3CRBA 3ONMA 1B3HA 4OMBA 3CVGA 1TWYA 3EN3A 4EXKA 3UK4A 1FQAA 2DWHA 1LLSA 1P1QA 2I3VA 3DELB 1JQFA 3H6TA 4F3SA 3EHUA 4G68B 4LUBA 2ZNSA 1B1HA 1HSLA 2OLBA 4NF5A 4F3BA 1R9LA 4XKQA 1A7LA 5CM6A 3MJNA 1ANFA 3K6WA 4UA8A 4C1TA 1ATGA 3Q28A 5JTYB 1B2HA 5I58B 3O29A 4ZE8A 2Y7RA 1B05A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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