5I56A

Agonist-bound glun1/glun2a agonist binding domains with tcn201
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
288
structure length
286
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQECD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 286
sequence length 288
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i56A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i56A02
5DEXB 5KCJA 4OWDA 4PQJA 2ZNUA 1Y20A 3SESA 3USDA 2QL3A 2RC7A 1LAFE 1MXXA 2PVUA 4BLAA 2HFBA 1QVSA 1A99A 1EZPA 3MPKA 3K6XA 1FW0A 1ZIUA 4DXBA 5HM4B 1IXHA 1M5BA 1EZ9A 2A5TA 4WEPA 3O6GA 1B9JA 1PBPA 1OVBA 4LQ2A 1B52A 4F1UA 4IO5A 5ICTA 4AQ4A 3K1NA 1FCKA 3TUSA 3TFLA 1XT8A 4GIZA 3G3IA 3V83A 1B0HA 3PPNA 3U93A 4OMBA 4R75A 3PMWA 1B7ZA 3U1OA 1MPDA 5DVJA 3B6QA 4BDOA 2PYYA 3E4RA 3CIJA 5FHMA 4QSCA 3OSRA 3IOTA 1SW4A 3VLVA 3ZKLA 2PMSA 3T9VA 3TODA 2DQVA 4LQ5A 5CM6A 4KYSA 3FXRA 1PEBA 3KJ7A 3FXUA 1ATGA 1GV8A 2R71A 3B6WA 3QUFA 4FJPA 3ZSFA 1USYH 3P7IA 3O28A 3O2AA 1ZLQA 3CR9A 5KDTA 4LZ5A 1I6QA 3OSQA 5DVFA 1YCJA 4Q30B 3WAEA 4DCXA 5I2KA 1B40A 2THIA 3G3JA 3HHFA 5AA3A 3CG3A 5H8HB 2D3IA 3MPLA 3EPEA 1N04A 2YPNA 4ZE8A 3SEVA 1IXGA 4LP2B 4IGTA 4NTLA 1VFDA 1Y3NA 1F9BA 1MXZA 3RN8A 3TKDA 2DSFA 4F2OA 3W9VA 1LBCA 3VVEA 1Y3QA 3U8QA 1ZKBA 1IEJA 4X1DA 4FE8A 3FXQA 4RA1A 5K2YA 2REGA 4F2QA 4FEBA 3QYTA 1BIYA 1B4ZA 3OO6A 1D9VA 2UYEA 1B3EA 4ZEBA 2PBWA 3FATA 5A5XB 2F5XA 1NNPA 4E0XA 4F1YA 3OELA 4FORA 4RJZA 2OLBA 1B4HA 2OWSA 1Y4TA 2YLNA 1ZJLA 2Q2CA 4DE8A 3LSLA 3M3LA 3KOSA 1B5JA 4G68B 1LGBC 5TU0A 5LOMA 4U2RA 2OK2A 3O97A 4U21A 4YB5A 3C9HA 4TLLB 4NF6A 5CC2A 3FIRA 1ZU0A 1FQAA 4ND9A 4YZZA 5JTYB 2XXQA 3K1PA 3VVDA 3SKPA 4QHQA 2VGQA 1SYIA 3RTWB 4R2FA 4QRZA 5DYHA 3KEIA 3PMVA 4GLIA 3CSBA 3TTRA 4EQ7A 4NF8B 2YJPA 5L9SA 3IJOB 4PFTA 3THIA 3DP4A 2OWTA 1SD3A 5H8SA 3PV0E 4GXSB 4ZZEA 4DZ1A 2H4IA 1DTZA 3PPRA 2RCAA 1DMBA 1YTVA 4WXJA 1MM6A 3KBRA 3GBBA 3R6UA 3UIFA 4YICA 3IOVA 2Z22A 2RCBA 5I2NA 2NXOA 4LA9A 3SEXA 5ISUA 4HCYA 1MDP1 4RPOA 3HCQA 4K3FA 3T9HB 4BDRA 4ZS9A 4BDLA 4P0GA 4C1TA 3OEMA 1P99A 2F7BA 3T96B 3AXFA 4EQ9A 2UVHA 3TCGA 5TP9A 5KCJB 4YKJA 3R26A 3S9MC 3PD9A 1SW2A 1IIWA 1XVXA 4IY6A 3BKIB 1B5HA 1NNTA 1IQ7A 3IOUA 1FTLA 4YB7A 4U4XA 3WAFA 1QW0A 2DS9A 3S4UA 4H1XA 3KSXA 3TZAA 3V5AA 1N76A 2A5TB 3LC8A 1DPEA 1Y9UA 2Y7KA 2P0SA 3HN0A 3FZVA 1OMPA 2FA7A 1LFIA 1NH8A 4R6HA 2LAOA 3Q27A 2DXRA 3C35A 4X9TA 4OEVA 4JXIA 3G3HA 3V89B 1POY1 3PU5A 3K00A 5H8QB 2OJTA 2Q9TA 4ZEDA 1UTHA 3FJ7A 2H25A 2UYFA 4R72A 1M5FA 3ODBA 2Z8FA 3OEKA 4QFLA 4R6YA 1TT1A 3UK4A 3H6VA 3Q29A 1JVXA 1EZOA 1HSEA 4ZZAA 1R9LA 3E9XA 4RNSA 4GL8A 1FQBA 3N94A 3W15C 3PUWE 1TXFA 1UTBB 4YKIA 5H8FB 1LFHA 1UQWA 1LB8A 1QUKA 3UA8A 2QS3A 4ZDMA 3TTMA 5I58A 2RC8A 3D4CA 1R9QA 4GF8A 4H6DA 1P1UA 2XXPA 2QMWA 5I59A 5KDTB 2ABHA 4P11A 4IY5A 3TQLA 3DLNA 1MY4A 1Z7ME 3RY3A 2ZMBA 3HSTA 3C34A 1B1HA 3KFMA 1RKMA 3H4ZA 2O6AA 2QS2A 2DVZA 1MG1A 1B05A 4N13A 4JDFA 1URDA 4GWOA 4HW8A 1ZBMA 4TLMB 4E0WA 1JNFA 3U92A 1MQJA 2I3WA 2IA4A 4R73A 3TQWA 2V3QA 3JYRA 4ZEFA 3MVXA 2F6PA 2V3UA 2I4CA 3CFXA 4U22A 1L5TA 1B3HA 3M3KA 1N7XA 1MY2A 1M5DA 2D21A 3IB2A 5I84A 1BKAA 1UIUA 3MVYA 3G3FA 1H45A 2QSXA 5F7VA 3IB0A 1JEVA 5DT6A 1MH4A 1MPCA 5I57B 3ZKKA 3OO7A 2GHBA 2QMXA 1A8FA 3OOAA 4P0IA 5CMMA 1O7TA 4NMYA 3TTKA 3GXAA 1I6BA 2Z8DA 3FD3A 4F3PA 4JBZA 4NWDA 3RTFB 2XXHA 1P1QA 3SETA 1LCTA 2HAUA 3MJNA 1VE4A 4G2ZA 2VD2A 2I3VA 3Q26A 2X7QA 5M2VA 3TTNA 1LAGE 3VFJA 1FQCA 3TELA 3UGWA 3FVOA 5CMKA 1B46A 3A3CA 1H76A 4H65A 3RLFE 4KPTA 1SI0A 2R9JA 2XXUA 5FTIA 3UN6A 3UP9A 2DWAA 3PMXA 2R6GE 4LZ7A 4ZE9A 1BTJA 3C32A 4G8HA 3O6IA 4OHNA 4OERA 1N84A 2H9BA 3H6TA 3H3GA 4FECA 1AMFA 3C33A 5TPAA 5CBRA 3K01A 2ZYKA 4PFUA 3LSWA 2AL5A 3OO8A 2XHDA 3S2VA 4OQOA 2HZKA 4OESA 3IO6A 4L17A 4QFOA 5EHMA 4M1VA 4KHZE 1T0KA 3CG1A 3I3VA 2Y7WA 1XHYA 4GXAA 3OENA 3KG2A 3L6GA 4KQPA 4YU0A 5ITPA 3HV1A 5AA2B 4LONB 4WKMA 3KSJA 3DM0A 1P1NA 2QJEA 2ZYOA 4IO2A 4POXA 1Y4CA 2V84A 4F3BA 2NUVA 1MQGA 3T22A 1AL3A 2DXYA 2XXTA 3MP1A 3N6TA 4OYVA 4EQBA 3L6HA 4H5FA 4O3CA 3H06B 4RK9A 4FEDA 4Z7EA 2DWHA 1JW4A 3MBPA 4F22A 1QKBA 2UVIA 4R6KA 1VFEA 2W7YA 3O9PA 1MDQA 1NH7A 5AA4B 2Q8JA 3MP6A 3EHTA 1MRPA 4OFOA 4PP0A 4JWXA 3LUYA 1POTA 2ALUA 3K4UA 2WKYA 5B7DA 3RQTA 1MXWA 1Q35A 3VVFA 3CI8A 4FIMA 3IORA 4OTEA 2H98A 4RK2A 1PDAA 1DOTA 2X7PA 4GFRA 1UTHB 1PB8A 2XXIA 4AB5A 2I49A 2ESNA 5IKBA 4KI0E 3IR1A 4F3GA 5EHSA 4OVJA 1D3KA 4ECFA 3MAMA 1H43A 4NF4B 3V8XB 3IK6B 3VXBA 1VR5A 5I58B 4I9DA 2HXWA 1SQYA 1PB9A 4AB6A 1PB7A 2B3FA 3PUXE 1M5EA 4IO3A 2B65A 4NEDA 3N5LA 3G7WA 2HEUA 1A7LA 4LATA 1MQIA 1HSLA 4U4SA 3TDJA 3PPPA 4NWCA 3SEYA 1UIVA 3MWBA 3HHGA 3CVGA 3W9WA 2RF1A 2Y7PA 4DDDA 2P1SA 3DP6A 4XKRA 2Z23A 3R7XA 3F11A 1WVJA 2F7CA 1IUDA 2DE2A 3MC2A 2XXRA 2O7IA 1SDXA 2ZYMA 3VV5A 2HZLA 3SDFA 1IITA 3E13X 1B0LA 1YAEA 5I56A 1TFDA 4JB7A 1B3GA 1LAHE 4JSDA 3S9LC 3S9EA 2PT2A 3O66A 2GRVA 2CMOA 1LB9A 4F3SA 3T93B 2XXXA 4EF1A 2F97A 1EU8A 1RYXA 1ZTYA 2ZNTA 2F6GA 1LCFA 1EH3A 2E1SA 5DVIA 4Q8RA 5EYFA 4PFYA 1B7HA 3TMGA 3PPOA 1LFGA 3G3KA 3MP8A 1A8EA 2XXYA 2GFEA 4H67A 4HS7A 3TCHA 2O51A 1JQFA 2V93A 3PPQA 4R9GA 3TPAA 3LSXA 2DE3A 5K2XA 4NF5A 3C31A 2HCAA 3RNNA 4JWYA 3S9NC 3K02A 4EDPA 5H8HA 1DSNA 2O7UA 1MH3A 2UVGA 4H8IA 2Q89A 3C4MA 5IAIA 3EHSA 4GD5A 3N6UA 5HPQA 4U1OA 4ELQA 2RKMA 2I4BA 3OD7A 4H5GA 4PE5B 4MBPA 3GBAA 1O64A 4R9FA 4F29A 3A3UA 3U94A 1JW1A 3N26A 1SVXB 2QPQA 4UA8A 2V25A 3K6UA 4C0RA 4OEUA 2ZNSA 3KJTA 3RT6B 3FVGA 3IL1B 5FHOA 3U72A 3SERA 5I2KB 4F39A 1N3XA 5CMBA 1JW5A 2Y7RA 2DE4A 5BUUA 4G68A 5JEIA 2XX7A 4MLQA 4EUOA 3K2DA 4XKPA 3FVKA 2KLFA 2I0CA 2XXVA 4YAHX 3QK6A 4LZ8A 5L8DA 3D4GA 1US5A 1MXVA 4G77A 4OFJA 4EXKA 1P1WA 5JTYA 1S9TA 2BJJX 2V3TA 1M5CA 1KWHA 2I0BA 1AH5A 4PETA 5ELVA 2GHAA 5CMCA 3MUQA 2Q88A 2ZXTA 2QS1A 3FUZA 1SW1A 4DLDA 4NF8A 1FTKA 4IB2A 3MVZA 3QUJA 4THIA 3T66A 1J1NA 4WEDA 1B3LA 2DOJA 2H5YA 1FTJA 1JEUA 1N0TA 1IXCA 1LSTA 5F1QA 4OXVA 4F1VA 3ILUB 2Z8EA 1B6HA 2XX8A 2UVJA 1FQDA 5B70A 1Q1KA 3Q28A 4YB6A 4OENA 5J1DA 4OZ9A 1MY1A 5CRYA 1WDNA 1B58A 4O3BA 1MM7A 1JETA 1H3DA 4NF6B 3MZBA 4GOTA 5AE4A 2ZYNA 3RT8A 3KN7A 3TCFA 3OXNA 4I1DA 1B32A 3FJGA 3K6WA 4UACA 4YMAA 1DTGA 2OZZA 4ISUA 1N7WA 4MFIA 3LSFB 4Q5TA 1MS7A 1OLCA 1LLSA 4BDMA 4JSOA 1TWYA 1A54A 4HCWA 4XIGQ 1D9YA 1NFTA 1MY0A 3CFZA 1ZMGA 4O3AA 5I56B 2Y84A 1OLAA 2GH9A 2OBGA 1XS5A 4RPNA 4LUBA 4NE4A 2O84X 3PGFA 5I2NB 1QJMA 3QSLA 4F19A 1SBPA 2E0SA 1GR2A 4QFNA 1IZ1A 2DVCA 3K0VA 1GGGA 5H8QA 2A5SA 1URGA 2RINA 1Y1MA 3C36A 3VLWA 4QF9A 1I69A 4KYEA 4IGRA 4QSDA 4QSEA 1A55A 5TP9B 4TQUQ 1HSJA 1UTBA 5H8FA 2HQ0A 1ELJA 4GRKA 1AOVA 2VHAA 2PT1A 1SW5A 1MPBA 4XXUA 5L9OA 2XD3A 4I8CA 2AL4A 2O68A 5AA2D 1VSOA 4POWA 3K1MA 4NF5B 2F7AA 1YPNA 3CFLA 3MZ1A 1NL5A 2HAVA 2Q2AA 2XXWA 3VE1B 1OQHA 3T9XB 1Y3PA 3HPIA 3CSGA 1OIBA 2F35A 4KD5A 4F31B 4PFWA 3O29A 1TFAA 4YKKA 3O6HA 1FQEA 2REJA 4XKNA 1Z7NE 3Q25A 1D4NA 4Q0CA 4RXLA 5H8NA 4ELOA 2I6EA 1XC1A 3T9UA 4R2BA 2FYIA 1O63A 3PD8A 5ICQA 3B6TA 1LAXA 4FATA 4RYAA 5I57A 4JWOA 5I59B 3BBRA 3IJXB 3OMBA 2NVUB 4I62A 2M8CA 4DIGA 2Y7IA 4U23A 4H0WA 1B2HA 1OQGA 2O1MA 1B7UA 1B1XA 2NOOA 2F36A 3BFTA 3FV2A 3K6VA 3UORA 2AIXA 2O69A 5DEXA 1GVCA 3H6UA 4ESWA 1S7YA 4LVQA 1ANFA 1FQFA 2F34A 4F18A 4XKQA 3GLBA 3JZJA 4IO6A 3LR1A 4EXLA 2G93A 4XTCQ 5FHNA 2NWJA 4BDNA 1FTMA 4G68C 3VXCA 2OCUA 2F8DA 4FAJA 3EQ1A 3MW0A 3M3FA 3RUMA 1FTOA 4M4GA 4GL0A 3CRBA 1SYHA 4KCDA 2ONSA 3PUZE 3E3KA 2QS4A 3I6VA 3PUYE 2DP8A 2UXAA 5JK4A 1USYE 2P2AA 2D5WA 4YKPA 1B3FA 2VD3A 4R74A 3KN8A 4N6PA 4IO4A 3H7MA 1IXIA 4G8MA 1R1NA 3G3GA 1SI1A 2XD2A 4EF2A 3KOTA 5CBSA 4N07A 3TAJA 3EN3A 1Y1ZA 1GTKA 3MZ9A 3FGSA 1QUIA 4MLVA 5AA2A 1MXUA 3MQ9A 2QRYA 2VP1A 1MXYA 2I58A 5HBCA 1MQDA 1B5IA 3H03A 2G29A 1NNKA 1OVTA 2ONRA 3TYHA 2ANJA 5AA4A 4Z0IA 3JV9A 1NMUA 3SEWA 3FJMA 5TPAB 4TOZA 3MVWA 5L9MA 1QKAA 3IO4A 3KN3A 3PUVE 3VDFA 3KGCA 1B51A 4MH5A 5ITOA 4G8NA 3RPWA 1P1OA 1NKXA 5CI5A 4KYDA 2FNCA 1LBBA 5AA1A 3A09A 4ELRA 4X1BA 1H44A 5A5XA 1QUJA 2X26A 1RYOA 1US4A 4ZEKA 3TTLA 4ESXA 3B7DA 3IAZA 3QXMA 2F78A 4KR5A 4NF4A 2AYSA 4GVOA 1XOCA 3RGYA 3GZGA 2DYXA 4G4PA 3OO9A 5FTHA 4ZECA 2H99A 4QFKA 3FV1A 4KFQA 1N3WA 1BLFA 3QIMA 1I6AA 4DCYA 4OETA 4GQOA 2IEEA 4RY1A 2VOZA 3ONMA 3ZS6A 4IO7A 1MY3A 4X48A 1R6ZA 2PX1A 3ECRA 3EHUA 2DWIA 1AIVA 1NNFA 3VLUA 1BP5A 1CE2A 1II5A 3I5OA 3M8UA 2RC9A 3ILTB 3SEUA 4ELPA 4OFLA 3DELB 4ZEIA 1A40A 3DP8A 4U1ZA 1CB6A 4HTGA 5BWJA 5H8NB 5DTBA 1PC3A 1QULA 3BFUA 3KZGA 3LBSA 1DPPA 3EF7A 3IB1A 3FVNA 1MQHA 1PBQA 2DWJA 3IX1A 2CZLA 3H6WA 2XX9A 4C1UA 1JVYA 2O1LA 1WODA 4H8JA 4KCCA 4MF3A 4DXUA 4DXCA 3IOWA 2ONKE 4QFPA 2B3BA 1S50A 3TEPA 4ONYA 2I48A 3FASA 5KZTA 4YMBA 1XVYA 3HO7A 3QAXA 4BDQA 1URSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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