2GFEA

Crystal structure of the glur2 a476e s673d ligand binding core mutant at 1.54 angstroms resolution
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDEDTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDDGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Interdomain interactions in AMPA and kainate receptors regulate affinity for glutamate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 86
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-03-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2gfeA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2gfeA02
4G8MA 5I57B 3IOTA 2UVJA 3CFXA 1LSTA 3TQLA 3LR1A 3M3LA 3CR9A 2ZNUA 3OSQA 2ZYMA 3U1OA 3CG3A 4OVJA 1US5A 4FEBA 3MZ9A 1M5BA 2O7UA 2HXWA 3MUQA 1YAEA 2DWJA 3OO7A 4H65A 4YMAA 2P0SA 4LQ5A 3GXAA 4WEDA 4OETA 1SW4A 1SD3A 1DPPA 1VSOA 3OSRA 2DE4A 3VLWA 4U23A 2LAOA 3LSXA 2ABHA 2QS1A 2DP8A 4F1UA 3UGWA 1N04A 3G7WA 1IUDA 4HCYA 1FTLA 4Q8RA 1Q35A 1LCFA 4G68B 1YPNA 1NH7A 1N7XA 1S7YA 4EQ9A 3ONMA 3VV5A 3MVYA 4RY1A 3IO6A 3ZKKA 5ITPA 3W9WA 1P1UA 3UP9A 3G3GA 5EYFA 1B5IA 2PMSA 3DP6A 3FZVA 1FQBA 1FQCA 1RYOA 1B7UA 3FXQA 1DPEA 4Q5TA 3G3FA 5A5XB 4ZS9A 4WEPA 5IKBA 4NEDA 1SW5A 4PFTA 4NTLA 2G29A 4PQJA 1LAFE 2O7IA 1URGA 2GRVA 4IGTA 3W15C 3N6TA 2HEUA 2V93A 2R71A 5DVIA 3VXBA 1MY2A 3QK6A 5ICTA 4ZEFA 1MXWA 5I58B 5K2YA 5KZTA 3KN7A 4GVOA 1BP5A 4U4SA 1A7LA 3KN3A 3A3CA 3PPNA 1EZPA 3TTRA 4R74A 5EHMA 1LB8A 4EF1A 2HAVA 4KYEA 2GH9A 1QUKA 5FTIA 3TAJA 5FHMA 1QJMA 3H03A 1O7TA 1XVYA 3TQWA 3VLUA 1MY0A 5I59A 3VE1B 3H6WA 3SEYA 1H43A 1AMFA 2OK2A 4LUBA 4OTEA 3H3GA 1AOVA 5DVJA 1MQDA 1B3FA 3LSWA 4I1DA 4YKJA 5AA2D 1EH3A 2UVIA 1B4ZA 1ATGA 3UIFA 2H5YA 2IA4A 3MJNA 4OQOA 4X1DA 5CMBA 2G93A 5B7DA 1LGBC 3IO4A 3EPEA 5I56B 3GBAA 1USYH 4IO5A 1P1NA 4RK2A 3IAZA 1POY1 3CSBA 1OQGA 3R26A 1SW1A 4ZE8A 5TU0A 3H6VA 2ZNTA 3F11A 2DVCA 4QFOA 4EDPA 5H8NB 3K6UA 2RC7A 4HS7A 3KOSA 2RC9A 2DXRA 4R6HA 4GRKA 2ZYKA 3SEWA 1MPDA 2O51A 1Y1ZA 2B3BA 3MVXA 1DTGA 3OXNA 4THIA 2XXXA 1SVXB 1N0TA 1MDQA 5CRYA 2X7QA 4QF9A 4F3SA 5CM6A 2A5TA 4KPTA 4M4GA 3RQTA 1LFIA 1UIVA 1OLAA 1MY4A 4LP2B 3B7DA 2PX1A 1Y3PA 4YKKA 2THIA 1WVJA 5B70A 4ONYA 2QL3A 2I4CA 1BLFA 1GTKA 2H98A 3O28A 1QUIA 3PUYE 1JNFA 4ELOA 4QSEA 3RN8A 3O97A 4H0WA 4NF4B 4HCWA 4R9FA 4G8HA 2DWIA 1QW0A 4JBZA 4E0XA 1SQYA 1HSJA 1SW2A 1OIBA 5H8SA 2Z8EA 5DT6A 1I69A 4AB6A 4Q30B 3MVWA 1H3DA 4IY6A 4FEDA 2WKYA 5FHOA 4H5GA 4YAHX 1A40A 2UYFA 4OZ9A 4NWCA 2HZLA 3MBPA 4R2FA 4O3AA 3S9MC 4WKMA 4X48A 1P1WA 3JYRA 5TPAA 3HO7A 1B58A 1H44A 4AQ4A 2X26A 3O6HA 3SETA 4OYVA 3PGFA 4NF6A 1VFEA 3FXRA 3O6GA 4LATA 5I2KB 4QFNA 3VVDA 3FGSA 2DVZA 5ITOA 3CFLA 2NXOA 2RCBA 1SDXA 2P1SA 2H9BA 1XOCA 3USDA 4NF8B 3PUXE 2UVGA 3TTLA 3VDFA 2QS3A 3B6QA 3KGCA 3PUWE 5ICQA 1VE4A 3U8QA 3SKPA 1DSNA 1R6ZA 3LSFB 1Y1MA 4JDFA 4YICA 5CMMA 1FTMA 2I3VA 4O3BA 5CBRA 1LLSA 2X7PA 4WXJA 3IJXB 3N5LA 2QMXA 4OEUA 2F7AA 4TLMB 5CMCA 2F5XA 4Z7EA 2PVUA 4Q0CA 4NE4A 4QFLA 1Y9UA 3IOVA 4ZEIA 1OVBA 4RNSA 4GXAA 3FV1A 3U93A 2AL4A 1PB8A 3VFJA 3FJMA 4GOTA 1NFTA 1UTBA 1JVYA 2F36A 1IXHA 3I5OA 3E9XA 1A55A 4KYSA 3RUMA 1BTJA 1LAXA 1FTKA 1L5TA 3CFZA 4KYDA 3TTNA 1FTJA 4RPNA 4XKQA 5H8HB 2BJJX 3MZBA 5F7VA 4OMBA 1B2HA 4NF5A 3T9HB 3HN0A 4DXCA 4R9GA 4G68C 4IO4A 1LBCA 2DS9A 3TYHA 2HFBA 3IB2A 1GGGA 1JVXA 4QRZA 1CB6A 3RT8A 5AA4A 4F39A 3C35A 3Q25A 4GD5A 5K2XA 3KZGA 3OELA 3DLNA 3MAMA 4GIZA 1WODA 5KCJB 4IO2A 3PD8A 2XXUA 4RA1A 1S50A 3K1PA 3HSTA 2B3FA 1B3HA 3TTKA 1BIYA 5I58A 3PU5A 1FQAA 3GLBA 3PPQA 1VFDA 1B3EA 4FE8A 4MLQA 2QS2A 3P7IA 4YB6A 1MH3A 3RT6B 2REJA 4C1UA 4G2ZA 4RXLA 3PMXA 3LUYA 4PP0A 2DE2A 3TCHA 3JZJA 3FIRA 5AA3A 2VD3A 4YZZA 1B05A 3IJOB 1USYE 4R73A 3I6VA 4OFJA 1MY1A 1B5HA 4ZE9A 3ECRA 3TMGA 3M3FA 3PUVE 1MQIA 2Q9TA 2HZKA 4X9TA 3G3HA 3O2AA 2HQ0A 4HW8A 3FVNA 4POXA 3UK4A 5I56A 1A8FA 5AA1A 3HPIA 1R1NA 5DTBA 3AXFA 4EXKA 1URSA 3HHFA 1IEJA 1D9VA 4Z0IA 5TP9B 3IX1A 2IEEA 4LA9A 1F9BA 4MH5A 1MH4A 2UVHA 4KD5A 2Y7KA 2O6AA 2FNCA 4QSCA 3PV0E 1Q1KA 1PEBA 1DTZA 1EZ9A 3FD3A 2ANJA 4U1ZA 2NUVA 2XX9A 3RTWB 2GFEA 4EXLA 3CSGA 1B4HA 3PMWA 3EHTA 5J1DA 2F34A 2Z22A 3SDFA 4LZ5A 3C34A 2YJPA 4P0IA 1M5DA 1EZOA 2Y84A 1R9QA 1D9YA 4ELRA 3RNNA 2QMWA 2QRYA 3FJ7A 1Y4TA 3A3UA 4I9DA 2YLNA 3O66A 1MRPA 1SYHA 3VLVA 2QPQA 4JWYA 3A09A 5L9OA 2XXTA 3SEVA 1UTHB 3C33A 1B7HA 1MG1A 4JSDA 4KCCA 2I6EA 2OZZA 3PPRA 2I49A 5JTYA 4U4XA 1QULA 5DEXA 3ZKLA 3FV2A 3QYTA 1TWYA 3D4GA 3ILUB 5BUUA 4ZDMA 3PUZE 3MP8A 3IL1B 4OEVA 1P99A 2ALUA 4TQUQ 1PC3A 5I84A 1MQJA 2O69A 3W9VA 2O1LA 3Q26A 4DXUA 2DQVA 3T96B 1B40A 4OWDA 1B1HA 3S2VA 3O6IA 1AL3A 1NMUA 4O3CA 1Y3QA 5I2KA 5ISUA 5KDTA 1D3KA 3M8UA 4BDNA 3C36A 3SERA 3MZ1A 3H6TA 1JQFA 1Z7NE 1S9TA 3N26A 2R6GE 4LONB 4FIMA 4IO6A 4F1YA 3KG2A 1TXFA 2FYIA 3KFMA 4N07A 2DWAA 3S9LC 3EHSA 3OO6A 4OHNA 1LBBA 2V3QA 3OO8A 1XVXA 4JSOA 3TKDA 3E3KA 1MPCA 4YKPA 2V3TA 2RCAA 3TPAA 1OVTA 4FATA 3K00A 4GFRA 2ZYOA 2O1MA 2D3IA 1IXCA 1DOTA 4R75A 1SBPA 3BBRA 1P1OA 4H5FA 2V3UA 4F3BA 3N6UA 5AA2B 3H4ZA 4LQ2A 2DOJA 4IO3A 4L17A 4YKIA 1XT8A 2M8CA 1MM7A 2Y7IA 4GL8A 5AE4A 4PETA 4JXIA 4E0WA 4ELPA 3M3KA 1A54A 5I59B 3O29A 5BWJA 3HHGA 3RY3A 1IITA 2I4BA 2P2AA 3S4UA 1A99A 5CI5A 2ZNSA 4QFPA 4JWOA 4YU0A 5H8QA 5M2VA 5L8DA 3OO9A 3CVGA 2F8DA 1QUJA 4F3PA 1MQGA 1YCJA 1PBPA 2DYXA 2VD2A 4KI0E 3E4RA 4DLDA 3ZS6A 4LZ7A 4R6YA 4DCXA 3KJTA 5H8FB 2OBGA 1QKBA 3RTFB 1I6QA 1NNKA 1FCKA 4KCDA 5FHNA 3IOUA 3QAXA 4H1XA 2Z8DA 4IO7A 4OFOA 2DSFA 4MF3A 1XC1A 4GWOA 5I57A 3RGYA 2DWHA 3DM0A 1LCTA 2HCAA 2AIXA 1NH8A 3R6UA 2A5TB 3KJ7A 1LFHA 4YMBA 2NWJA 3OMBA 5DVFA 1QVSA 2XHDA 4FAJA 4F18A 3T9UA 2FA7A 4YB7A 5JEIA 1OMPA 1CE2A 2XXHA 4U22A 4XXUA 2E1SA 2QSXA 1Y4CA 4G8NA 1MS7A 1FQFA 3UN6A 5CMKA 4DDDA 4ESXA 1POTA 3G3JA 1ELJA 4MBPA 3BKIB 2Q89A 3TELA 2QS4A 3L6GA 4H8IA 2R9JA 1P1QA 4G68A 5I2NB 2ESNA 1SYIA 3OEMA 1N3XA 5DYHA 1IIWA 1B0LA 2D5WA 3G3IA 4BDQA 1MXXA 4POWA 3TCGA 1XHYA 2ZMBA 4G4PA 3FXUA 5TPAB 4R6KA 5A5XA 3MW0A 4ELQA 5EHSA 2OCUA 1UQWA 1LAGE 2Z23A 4ECFA 1D4NA 4DZ1A 4F31B 4UACA 3D4CA 4QHQA 1II5A 1AIVA 4G77A 2I48A 3E13X 1ZLQA 3TODA 4TLLB 3PMVA 1MXVA 3TTMA 2XD2A 5L9MA 4MFIA 2A5SA 1PB9A 2I0CA 4ZZEA 4XIGQ 1MXUA 5F1QA 1J1NA 5CBSA 2W7YA 1NL5A 1Y3NA 2Y7WA 5FTHA 4BLAA 2RC8A 3OEKA 1UTHA 4RPOA 1LB9A 3U72A 1ANFA 3IORA 2VP1A 3Q29A 1TT1A 3H6UA 2Q8JA 3S9EA 4KR5A 1JETA 5IAIA 3KBRA 1ZBMA 2YPNA 4IY5A 4DXBA 1N84A 4RK9A 4PFYA 4P11A 1SI0A 3K2DA 2GHAA 3IR1A 2O84X 1MPBA 1BKAA 3PPOA 1UTBB 1NNFA 1M5FA 1N76A 1ZMGA 3JV9A 3KSXA 1WDNA 4F2OA 1MM6A 2F97A 3B6TA 3C31A 1JEUA 2OLBA 2F35A 3T9VA 3RPWA 2V25A 1US4A 3EHUA 1N7WA 3BFTA 2F7CA 2UXAA 3B6WA 5H8NA 4NMYA 3SESA 4NF5B 3TEPA 3T22A 3MQ9A 4OERA 2CZLA 2Y7PA 1ZIUA 3V89B 3LC8A 4GQOA 4MLVA 1FQDA 1OQHA 2NVUB 1B0HA 2PT2A 4U1OA 3MPKA 1XS5A 3QXMA 5AA4B 1MQHA 1PDAA 1MXZA 4DCYA 1A8EA 2XXPA 3MP1A 3G3KA 4XKPA 4BDLA 4U2RA 4GXSB 1KWHA 2OWTA 4KQPA 2XXVA 2VGQA 1JW1A 1NNPA 1MDP1 4GF8A 3Q28A 3VXCA 4KFQA 2E0SA 2V84A 4NF4A 3CI8A 2H4IA 2XD3A 4QFKA 1Y20A 4DE8A 5AA2A 1VR5A 1GR2A 1PBQA 5L9SA 4N6PA 1N3WA 3SEXA 1Z7ME 1B9JA 2I58A 3FJGA 1GV8A 4ND9A 1URDA 2D21A 3KN8A 3MWBA 2O68A 1B46A 3K01A 4P0GA 4FECA 2HAUA 3C4MA 1M5CA 4ZZAA 1M5EA 5JK4A 4C0RA 3S9NC 4IGRA 2RF1A 1B52A 3K4UA 4F3GA 2QJEA 3TFLA 2PBWA 4BDRA 3QIMA 2XXQA 3PD9A 2XX7A 4PFWA 5H8FA 4N13A 3TZAA 2NOOA 1FW0A 1B51A 2F6GA 3R7XA 4NF8A 3QSLA 3EN3A 1ZJLA 2RKMA 1JW5A 1R9LA 4GL0A 2ZXTA 1ZTYA 3EQ1A 3L6HA 3K1MA 1EU8A 1RKMA 2REGA 1JEVA 3FASA 4EUOA 3WAFA 3O9PA 2VOZA 3FVOA 3QUFA 4DIGA 4RYAA 1JW4A 1O64A 1IXGA 4F2QA 4H6DA 3V5AA 3FVGA 4I62A 1ZU0A 4GLIA 4OENA 2PYYA 4I8CA 4FORA 2XXWA 3Q27A 4ZECA 5ELVA 4ZEDA 5CC2A 3I3VA 1B6HA 3K02A 4ZEBA 3SEUA 3QUJA 5HPQA 1I6AA 2PT1A 3H06B 4BDOA 4JB7A 4ZEKA 4U21A 4PE5B 1SI1A 2Q88A 2F78A 3IB1A 3DP4A 5JTYB 5DEXB 2VHAA 1HSEA 1IXIA 4M1VA 5I2NA 2ONKE 2ZYNA 3U94A 2OWSA 2XX8A 3C9HA 5H8HA 5LOMA 4X1BA 3U92A 1IQ7A 4XKRA 2H99A 1LFGA 4R2BA 3K0VA 4AB5A 3ZSFA 4KHZE 2ONRA 1NNTA 3C32A 3TDJA 1T0KA 3H7MA 4TOZA 3GBBA 3UORA 4EF2A 2XXYA 3N94A 4F29A 3CG1A 5KDTB 1O63A 5KCJA 3T93B 2XXIA 4NWDA 3ILTB 2Q2AA 3LBSA 1HSLA 3K6XA 2CMOA 4LVQA 2AYSA 3GZGA 3MVZA 2ONSA 4PFUA 2Z8FA 3LSLA 4K3FA 1NKXA 1TFAA 3VVEA 3KSJA 4JWXA 3EF7A 2F6PA 3TCFA 3FVKA 2F7BA 4QSDA 4EQBA 1AH5A 2B65A 1OLCA 2I0BA 4H67A 3FATA 3UA8A 4OESA 3K6WA 1MXYA 4XTCQ 4FJPA 1B7ZA 3T9XB 2RINA 3FUZA 1B5JA 4R72A 1B3LA 3DELB 4H8JA 4ESWA 3IOWA 4XKNA 2I3WA 3RLFE 3DP8A 1DMBA 2GHBA 4F22A 3OENA 1H76A 3T66A 4YB5A 3K1NA 1FQEA 4EQ7A 2AL5A 3PPPA 2DE3A 4F19A 2Q2CA 3ODBA 4F1VA 3K6VA 3TUSA 1ZKBA 2Y7RA 3CRBA 3HV1A 1MY3A 1UIUA 5TP9A 1IZ1A 3OOAA 3KEIA 3WAEA 2H25A 1B3GA 1GVCA 3IK6B 5H8QB 4NF6B 4OFLA 4IB2A 4C1TA 4HTGA 1TFDA 1B1XA 2KLFA 4UA8A 4BDMA 3CIJA 3KOTA 5HM4B 3OD7A 3MC2A 1RYXA 4RJZA 2DXYA 3BFUA 1QKAA 1I6BA 3V8XB 1PB7A 4LZ8A 3VVFA 3HCQA 1YTVA 3IB0A 1LAHE 3THIA 1B32A 3MP6A 4OXVA 1H45A 3MPLA 2UYEA 2OJTA 2XXRA 1FTOA 5HBCA 3V83A 4ISUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4G8MA 5I57B 3IOTA 2UVJA 3CFXA 1LSTA 3TQLA 4P8BA 3LR1A 1NV7A 3M3LA 3CR9A 3PTYA 2ZNUA 3OSQA 2ZYMA 3U1OA 3CG3A 4OVJA 1INPA 4P47A 1US5A 4FEBA 3MZ9A 1M5BA 2O7UA 2HXWA 3MUQA 1YAEA 2DWJA 3OO7A 4H65A 3CHGA 4YMAA 2P0SA 4LQ5A 3GXAA 4WEDA 4OETA 1SW4A 1SD3A 1DPPA 1VSOA 3OSRA 2DE4A 4H46A 3VLWA 4U23A 3IFAA 2LAOA 3LSXA 2ABHA 2QS1A 2DP8A 4F1UA 3UGWA 1N04A 3G7WA 3GYYA 1IUDA 5IZZA 4HCYA 1FTLA 4Q8RA 5LTCA 1G0HA 1Q35A 1LCFA 4G68B 1YPNA 1NH7A 1N7XA 1S7YA 4EQ9A 3ONMA 3VV5A 4XFEA 3MVYA 4RY1A 3IO6A 3ZKKA 5ITPA 3W9WA 1NV1A 1P1UA 3UP9A 3G3GA 5EYFA 4OA4A 1B5IA 2PMSA 3DP6A 5IGAA 3FZVA 1FQBA 1FQCA 1RYOA 1B7UA 3FXQA 1DPEA 4Q5TA 3G3FA 5A5XB 1FBCA 4ZS9A 4WEPA 5IKBA 4NEDA 1SW5A 4PFTA 4NTLA 2G29A 4PQJA 2XWVA 1LAFE 2O7IA 1LEVA 1URGA 2GRVA 3EKIA 1NUYA 4IGTA 3W15C 3N6TA 2HEUA 2V93A 2R71A 2WBBA 5DVIA 3VXBA 1MY2A 2PCRA 2WYPA 3QK6A 5ICTA 4ZEFA 5ET8A 1MXWA 5I58B 5K2YA 5KZTA 3KN7A 4MNPA 4O94A 2QVUA 4GVOA 1BP5A 4U4SA 1A7LA 3KN3A 3A3CA 3PPNA 1EZPA 3TTRA 2FIXA 2F3DA 2P3VA 2ZZXA 4R74A 5EHMA 1LB8A 4NF0A 4EF1A 2HAVA 4KYEA 2GH9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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