2GFEA

Crystal structure of the glur2 a476e s673d ligand binding core mutant at 1.54 angstroms resolution
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDEDTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDDGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Interdomain interactions in AMPA and kainate receptors regulate affinity for glutamate.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 86
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-03-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2gfeA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2gfeA02
4JSOA 1LFIA 3K4UA 2D21A 4YKIA 2RC7A 5AA3A 4NWDA 3TTLA 3T66A 3K6UA 2VD3A 1HSEA 1XC1A 3LSFB 2UYEA 2AL5A 2ZNSA 3O28A 4TLMB 4EF2A 1LSTA 1JW4A 2Y7IA 1FQDA 2QMWA 4IO5A 5CM6A 1M5FA 3CG1A 2Y7WA 1IQ7A 5CMMA 4BLAA 5DTBA 3RTFB 4BDMA 4QFOA 4MF3A 3T96B 1IZ1A 1TXFA 1FQCA 4GFRA 1PBQA 2DVCA 5M2VA 2O7UA 2OCUA 2A5SA 4XKQA 3CIJA 1B05A 2Z8FA 2QS4A 1UIUA 4P11A 4R75A 3VFJA 2AL4A 2ABHA 1VSOA 3ZKKA 4JWYA 3ONMA 1MRPA 1NKXA 4DLDA 1AIVA 2PT2A 4R73A 1ATGA 1D4NA 3RQTA 4BDQA 3E13X 3OENA 2NXOA 1OVBA 4PETA 4YICA 3SETA 4EF1A 2H4IA 1S9TA 3CR9A 2DP8A 1YAEA 2UVJA 4K3FA 3D4GA 4FEDA 2NVUB 2CZLA 1LGBC 3MVXA 3OO9A 2DWHA 3MP6A 3CSBA 4LA9A 1ZMGA 3SEUA 3M3KA 4HS7A 1ZBMA 1Y9UA 1FCKA 1A99A 5EHMA 3G3HA 3EF7A 4YKJA 3TKDA 3V89B 1SD3A 3IOWA 3PV0E 2F36A 1DPEA 5FHNA 1Y3QA 3B6TA 5H8FB 3MJNA 4JWXA 3E9XA 4F3BA 5KCJA 1GTKA 3IOVA 2QL3A 3QK6A 4M1VA 2V84A 2NUVA 3KBRA 5AA2B 3DP6A 4YKKA 3V83A 1MY1A 5DVFA 5DEXA 4F1VA 2VD2A 3HV1A 5I56A 2R6GE 2O51A 1A54A 1O7TA 4MH5A 4GXAA 5I2NB 1IEJA 2O68A 4YMAA 1MQHA 2OK2A 4G68A 5AE4A 4AB6A 5I57A 2NOOA 1PB9A 3TTRA 2QS1A 1DTGA 4FECA 5H8HB 1CE2A 4NF4B 4PFUA 3USDA 4N6PA 1FQBA 3TCHA 2Z8EA 3A3UA 3ILUB 3C32A 3VE1B 1QKBA 3VLUA 2PMSA 4UA8A 3THIA 4ISUA 4H8JA 1JW1A 2XD2A 4KD5A 3QSLA 4G4PA 2Z8DA 1A55A 2F6GA 3MVZA 3IOTA 4NF5B 2Y7RA 1BP5A 2B65A 1R1NA 4DDDA 3H6TA 2F7AA 5CMCA 4X1BA 5H8QB 1TFDA 4H1XA 3UK4A 2I3VA 2A5TA 3EHSA 1SI1A 3ODBA 1ELJA 2WKYA 2PBWA 1NH7A 4KHZE 1R9QA 3TZAA 2I4BA 5KZTA 5JTYB 2QS3A 1URDA 1P1WA 3KN8A 2QJEA 2R9JA 3UIFA 2RINA 4KYEA 3FVGA 5F7VA 3UORA 4NEDA 1P1QA 1SQYA 3LSLA 5K2XA 4KQPA 2PVUA 1NNFA 4FATA 4Q30B 4OETA 1UTHA 3OD7A 3B6WA 3LSWA 3R7XA 3K1NA 2F7BA 1MPBA 2OBGA 1RYXA 2DXYA 5K2YA 3RTWB 3CVGA 1LFGA 4IO6A 2DQVA 5DVIA 1WODA 4GOTA 3FV2A 3L6GA 4G8NA 5AA2D 4QHQA 1LAFE 5I58B 3OO7A 4U22A 1B9JA 4M4GA 4R9GA 3QYTA 1D3KA 1MXZA 2B3FA 1MDP1 3IR1A 2X7QA 3TYHA 3ZSFA 1FTLA 2Z23A 4OQOA 4DIGA 1PEBA 2V3UA 5BWJA 1MXWA 4NTLA 2F8DA 3S4UA 4QSEA 1EZPA 4RJZA 3M3LA 3TCFA 4RK2A 1JETA 1B4HA 4FEBA 1Q1KA 1FQEA 1YTVA 1VE4A 2H99A 3MW0A 2RC8A 3MZBA 2GRVA 2THIA 4KPTA 2HAVA 3O9PA 1HSJA 1P1OA 3M8UA 3IO4A 4U2RA 4GL0A 5ISUA 3G3KA 4YMBA 1ZU0A 4Z7EA 3OXNA 2YJPA 3C9HA 3OMBA 4OEVA 4OYVA 4GVOA 1POY1 1I6AA 2F97A 4E0XA 1CB6A 1M5DA 2IA4A 3G7WA 1BTJA 3RT8A 3RLFE 4QRZA 5I59B 2QMXA 2R71A 3TODA 1DPPA 1XT8A 3CRBA 3FVOA 1R6ZA 3CFLA 2GHAA 1MXVA 4NE4A 4O3AA 4KYSA 1MDQA 5DVJA 4EXLA 3K6WA 5FHOA 3KOTA 2OLBA 3T9XB 3HHGA 5HM4B 2D3IA 2E1SA 3TELA 1N7WA 3H6UA 3U93A 4ND9A 3PUYE 4MFIA 4PP0A 4WEPA 4BDOA 1M5EA 5ICTA 3Q25A 2XXTA 3UN6A 1OQGA 3FJMA 2Q8JA 5F1QA 3GLBA 3IB0A 1Y3PA 1S7YA 5CMKA 4C1TA 3E3KA 1JW5A 2Y84A 4R6HA 1MM6A 1XVYA 5DEXB 2DE3A 2F7CA 1LFHA 4JB7A 5I56B 3T9UA 1MXYA 2H98A 2YPNA 3FASA 2FYIA 5AA1A 4HCYA 4O3BA 3VDFA 3KG2A 3PUVE 1N76A 4Q5TA 1PBPA 1ZLQA 1BKAA 4F39A 5TPAA 4U4SA 1IXIA 1URSA 3KN7A 1MQDA 1D9YA 3O29A 3LUYA 4LONB 4GWOA 4BDLA 2FA7A 3HPIA 3Q29A 4NF6B 1NL5A 2Y7KA 1O64A 4C0RA 3ECRA 4LP2B 4EUOA 4OHNA 2F5XA 3PUWE 3IAZA 3BBRA 3T93B 3K6XA 3DP8A 2RF1A 4U4XA 3EHTA 1B7UA 1YPNA 1DOTA 3VLVA 2IEEA 5BUUA 3FV1A 5DT6A 1AOVA 5B7DA 5J1DA 5FTHA 3OEMA 1MH4A 3H06B 4EQ9A 2HXWA 4ZE9A 5KDTB 3MVWA 3UA8A 2I3WA 2PYYA 5L8DA 1IIWA 1MY4A 1B5JA 2ZMBA 1UTBA 4LZ8A 4U1ZA 1UQWA 1AMFA 2UVHA 3OOAA 4R2BA 3SEWA 4F3PA 4U21A 2GHBA 4IO7A 1B5IA 1M5CA 1MG1A 5B70A 3C36A 5I2KB 1B0HA 3CFXA 2ZYNA 5TP9A 3H4ZA 3RUMA 3IORA 3G3GA 5TU0A 1FTJA 2ANJA 4NF8A 4ZE8A 1Y3NA 1OLAA 1ZIUA 3PD8A 5ELVA 3MP8A 2DWAA 4FE8A 3V5AA 3SKPA 4IGTA 1Y1ZA 4AQ4A 5A5XA 4N13A 2DWJA 2XXUA 1MY0A 1QW0A 1QUKA 2XXVA 3HSTA 3PD9A 2H9BA 3DLNA 4NMYA 3EQ1A 3S9LC 3TAJA 2RKMA 1QUJA 2HCAA 1M5BA 4UACA 1DTZA 3HN0A 1VR5A 4R6YA 5CRYA 2P0SA 1MQGA 3GZGA 4ZEKA 3K02A 4OENA 1MY2A 4GD5A 5HBCA 4ZEDA 1WDNA 2VOZA 2Q9TA 3FZVA 3FXUA 4AB5A 4DXCA 4FAJA 3S9EA 3H3GA 3JYRA 3B7DA 4ELPA 2OZZA 4X48A 1B2HA 3K00A 4ELQA 1B7ZA 1VFDA 4H6DA 1B1XA 1RKMA 3FJGA 4ELRA 3SDFA 2UVIA 5CBSA 1QKAA 2ZNUA 2RCBA 1P1NA 3CG3A 1P1UA 3CSGA 4RK9A 1KWHA 2ZNTA 5JEIA 4G2ZA 3IO6A 3KOSA 1AH5A 1NNTA 2Q2CA 1B6HA 4LQ5A 2GH9A 2DE2A 3SEVA 3W9WA 4OXVA 4X9TA 3S9MC 3H7MA 3TMGA 1SDXA 2QS2A 1DMBA 1IXHA 1GV8A 4F18A 4BDRA 2D5WA 1JVXA 2DWIA 4OMBA 2REJA 3A09A 2HQ0A 4IGRA 3PU5A 1LCTA 2XXHA 4QF9A 4IO3A 1GR2A 4TOZA 2I6EA 4OFOA 4MBPA 4JXIA 3MPKA 3H03A 2DE4A 3KFMA 4JWOA 3MWBA 3QXMA 2Y7PA 4YB7A 2O1LA 1FW0A 4RPNA 4GXSB 1MXXA 1NFTA 5JK4A 3T22A 5CI5A 2I58A 3H6WA 3N6UA 2PX1A 3KSJA 4IY5A 3MQ9A 4R2FA 1B3GA 1NNPA 4WKMA 3K0VA 1PC3A 1UIVA 3I5OA 4XTCQ 5IAIA 2XXYA 1QJMA 3L6HA 3K6VA 3A3CA 3U72A 2XX8A 5H8FA 4ECFA 1B7HA 4Z0IA 2DVZA 3O6IA 4MLVA 2I4CA 4ZZEA 3D4CA 1FTMA 1FQAA 1N3XA 3P7IA 3TCGA 3TQLA 5FTIA 1POTA 1L5TA 3T9VA 2XXRA 4YZZA 5EHSA 1FQFA 1LB8A 3HHFA 5AA2A 3O2AA 3MUQA 1MPCA 2GFEA 4YB5A 4P0GA 3U92A 1TFAA 1I69A 3SERA 5FHMA 1Z7ME 3DM0A 1B1HA 5I2NA 1A7LA 3OSQA 3QAXA 3DP4A 4C1UA 2VP1A 3C4MA 1MQIA 4HTGA 1JQFA 3FATA 4ESXA 5L9SA 2XX9A 4RXLA 3K1PA 4IB2A 1SW1A 4NF4A 1SW2A 1SW4A 4G68C 3WAEA 4YB6A 2KLFA 2UXAA 3VVEA 2O69A 4LZ7A 5ITPA 2ONSA 4THIA 2FNCA 3PPOA 4NF5A 4G8MA 4GF8A 2HZLA 3GXAA 4DCXA 1I6QA 1VFEA 2O84X 3C35A 3IB1A 4F2QA 4XKRA 2CMOA 1PB8A 1LAHE 5AA4A 5H8QA 1N3WA 4F31B 1N84A 1SYIA 2M8CA 2Z22A 3IL1B 3KN3A 1H76A 4ZS9A 2P2AA 2ZYMA 4ZEIA 3GBBA 1Y4CA 1SBPA 1GVCA 2ESNA 1B51A 2LAOA 3AXFA 5KCJB 2I0CA 4PFTA 5JTYA 4KCDA 3TPAA 2V93A 4WXJA 4MLQA 3OELA 3RN8A 3EN3A 3OSRA 1Y1MA 4F1UA 4H5FA 4RPOA 1XOCA 1Z7NE 2XXQA 3SEXA 3S2VA 3MZ9A 4XKPA 3O97A 1N0TA 4HW8A 5H8NA 1MM7A 4LZ5A 3OEKA 1US5A 1FTKA 4KI0E 3U1OA 3PPNA 1B58A 1NNKA 3BFTA 4GL8A 3VXBA 3TFLA 3HCQA 1II5A 3FD3A 5L9OA 1Q35A 3U94A 4G68B 2G29A 4BDNA 4FJPA 1R9LA 2F34A 4QSCA 5I57B 1IITA 4KR5A 5I58A 3MP1A 4H5GA 2O1MA 1SW5A 3G3FA 4QFLA 2Q88A 1FTOA 3I6VA 1B46A 3QIMA 1A8EA 1IXCA 1B3FA 1MS7A 4XKNA 3G3JA 3UP9A 3C34A 3IK6B 1H45A 4U23A 1XHYA 2HZKA 4IO4A 2DSFA 4E0WA 2E0SA 3PUXE 2HFBA 4RNSA 1BLFA 4OFLA 4ZEFA 3RT6B 5IKBA 3FXRA 2QSXA 4X1DA 3O6HA 4I8CA 4I62A 2A5TB 4ZECA 5DYHA 2ZYKA 3RY3A 4PQJA 4F2OA 2H25A 3GBAA 3O66A 3TTNA 1S50A 3RNNA 3V8XB 2I49A 5CBRA 1JNFA 1B40A 3ZS6A 2W7YA 1US4A 1GGGA 1MY3A 3JV9A 3FUZA 1ZJLA 3PPRA 2X26A 2BJJX 3PUZE 4L17A 4EQBA 2VGQA 4H65A 4ELOA 5LOMA 3PMWA 1B3LA 1MXUA 1USYH 1UTHB 5I59A 1OLCA 3PMXA 2DOJA 1H43A 2AIXA 4GQOA 4R74A 2VHAA 1ZTYA 3C31A 4OWDA 1B0LA 3W9VA 1SYHA 3LSXA 3PPPA 2RC9A 1O63A 1EH3A 4LQ2A 4Q8RA 2XXPA 4GRKA 2H5YA 2XX7A 1JEVA 1DSNA 3VV5A 3OO8A 5HPQA 1WVJA 4YKPA 2V3TA 3G3IA 3FVKA 3T9HB 2QRYA 3IJXB 3FVNA 2YLNA 1B5HA 1OIBA 1EZOA 2OWTA 4H67A 3DELB 1N7XA 4R9FA 4U1OA 3SEYA 2AYSA 1NMUA 4ZZAA 1I6BA 4P0IA 3MAMA 2NWJA 4GIZA 4FIMA 1B52A 1LAGE 2HAUA 4DXUA 1EU8A 4O3CA 2XXXA 1P99A 3C33A 1B3EA 3VLWA 4POWA 2G93A 4QFPA 3I3VA 3S9NC 4F1YA 4EDPA 5ITOA 1IXGA 3K2DA 2HEUA 3N5LA 4RA1A 1LBCA 3MPLA 2XXIA 1H3DA 3FGSA 3R6UA 4F29A 4TQUQ 1IUDA 1NH8A 4LUBA 3FXQA 3MZ1A 3M3FA 1LAXA 4OTEA 4NF6A 2Q2AA 4ESWA 3PPQA 1LB9A 3KGCA 2F6PA 3U8QA 4H8IA 1MQJA 5AA4B 4IY6A 4OFJA 1OMPA 4YAHX 4XIGQ 1A8FA 3MVYA 2ALUA 2DYXA 1D9VA 4R6KA 4G77A 5KDTA 1LLSA 2OWSA 2V25A 3B6QA 4I9DA 2QPQA 4HCWA 3N26A 3IX1A 2I48A 2XXWA 1AL3A 3TEPA 3TTKA 1Y4TA 1T0KA 5I84A 4OZ9A 1SI0A 4RYAA 3E4RA 2O6AA 4KCCA 1H44A 4POXA 5H8NB 5I2KA 4LATA 4F3GA 2I0BA 4JSDA 4KFQA 2Q89A 3CI8A 4F3SA 3RPWA 2XD3A 2UYFA 2RCAA 2ONRA 3VXCA 2F78A 4ONYA 4XXUA 4Q0CA 1QULA 3KZGA 5TPAB 4QFKA 1B3HA 3PGFA 4PE5B 1BIYA 4EQ7A 3TUSA 1JVYA 1RYOA 3HO7A 3FIRA 1QUIA 1PB7A 3TQWA 3IJOB 4KYDA 4N07A 1QVSA 3LBSA 1SVXB 1MPDA 5H8SA 3BKIB 4DXBA 1YCJA 3KJ7A 3KJTA 4JDFA 3K1MA 1MH3A 1OVTA 3R26A 2DS9A 3BFUA 3H6VA 4OERA 1LCFA 3LR1A 2V3QA 3ZKLA 2UVGA 3TDJA 1N04A 2F35A 5EYFA 2B3BA 4I1DA 3CFZA 4EXKA 4ZDMA 3Q27A 2REGA 2ZYOA 3ILTB 4IO2A 5H8HA 3TTMA 3KEIA 4R72A 1B4ZA 4DZ1A 1URGA 1JEUA 1OQHA 3EHUA 2X7PA 4H0WA 1PDAA 4F19A 4NWCA 1UTBB 3IOUA 3JZJA 3QUFA 3LC8A 5CC2A 4G8HA 4RY1A 3VVFA 2P1SA 1B32A 4DE8A 4YU0A 3Q28A 3SESA 5TP9B 5ICQA 2XHDA 4OEUA 1J1NA 4OESA 1HSLA 3EPEA 4NF8B 4ZEBA 3RGYA 2DXRA 3KSXA 1TT1A 3QUJA 1LBBA 3PMVA 5CMBA 4TLLB 3FJ7A 3F11A 3VVDA 4F22A 4LVQA 4WEDA 2O7IA 3UGWA 2PT1A 3Q26A 5A5XB 4QFNA 4DCYA 4PFWA 5L9MA 3N6TA 1XS5A 3N94A 1ANFA 1TWYA 1F9BA 1XVXA 2ZXTA 3MC2A 3WAFA 3MBPA 3K01A 3W15C 1Y20A 3IB2A 4PFYA 1ZKBA 4GLIA 4QSDA 3O6GA 2ONKE 2OJTA 1A40A 1EZ9A 4JBZA 3OO6A 4FORA 1USYE 4OVJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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