2GFEA

Crystal structure of the glur2 a476e s673d ligand binding core mutant at 1.54 angstroms resolution
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDEDTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDDGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Interdomain interactions in AMPA and kainate receptors regulate affinity for glutamate.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 86
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-03-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2gfeA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2gfeA02
1D9YA 2Q2AA 3O66A 3K6XA 1ZU0A 1D3KA 3E4RA 4NMYA 3M3FA 3VXBA 2GHAA 3KN7A 3MUQA 1FW0A 5IKBA 3CG1A 4OMBA 1JNFA 1GVCA 2HZLA 2UVGA 4MLVA 4U1ZA 1I6AA 2HEUA 1RKMA 3OEKA 4WXJA 1B3EA 4ELQA 3FV2A 5JK4A 1OVTA 2CMOA 3HSTA 1MY2A 1PB7A 4K3FA 2QRYA 5CMKA 1QJMA 1M5FA 4KCCA 1Y9UA 4TOZA 4YB5A 3EN3A 2V3QA 1B4ZA 1I69A 1US4A 4MLQA 2HZKA 1B51A 3KN8A 4FECA 4HS7A 1POTA 4G68B 5F1QA 1H76A 3VLWA 5H8NB 3CFLA 5L8DA 4F22A 2O7IA 4EXKA 4IO7A 1LB8A 2O69A 1DPPA 4RXLA 3U93A 4THIA 2HAVA 5H8FB 1B5JA 4ESWA 1YPNA 2VOZA 1UTBA 1B4HA 4HTGA 3RY3A 3ILUB 1JW5A 3B7DA 2QL3A 3U1OA 3O2AA 1JEVA 1SYIA 4YKIA 4ISUA 4DDDA 1FCKA 5ITOA 2QMXA 3CFXA 3SEUA 4KPTA 3MAMA 1N84A 1YCJA 2ONSA 5AE4A 3MZ9A 5I56B 3PPNA 1JETA 3MVWA 4FEBA 1EZ9A 4NF6B 4PFYA 3H03A 2XXRA 4N13A 3KSXA 3N26A 3PUZE 4DXBA 3RPWA 3SEYA 3TQWA 2R9JA 1LCFA 1MH3A 4OXVA 2DP8A 1B9JA 2UVIA 1KWHA 1MQJA 2F6GA 1Z7NE 2OWSA 3H6VA 3D4GA 4POXA 1MG1A 5AA4A 2Y7WA 3PPRA 2XXXA 2Q88A 1Q1KA 1B0LA 2QS1A 1LAGE 1PDAA 3C33A 4GXSB 3QK6A 1QUIA 1AMFA 1P99A 2OBGA 2ZYKA 3VFJA 2UVHA 3RTWB 3VLUA 3MZ1A 4E0XA 3MW0A 4NE4A 3OD7A 4M4GA 4BDLA 4LQ5A 4PFWA 1Z7ME 1LLSA 1DTGA 4DCXA 1EH3A 5AA2A 3G3JA 5ITPA 5AA3A 2DSFA 1Y4CA 1WODA 2YJPA 4IO5A 5A5XA 3FXQA 1H45A 4I9DA 2NOOA 3QIMA 4IO4A 1USYE 2ZMBA 4PQJA 3S9EA 4HCWA 3Q29A 1H43A 4GIZA 2F6PA 3OELA 3PUVE 4EXLA 3CG3A 3ZSFA 3H6TA 4NF8A 3V5AA 4U4XA 4TLLB 3SEXA 2Z8EA 2GHBA 3A09A 5ELVA 1PB9A 1Y1MA 4KI0E 4IGRA 3BFTA 5I58B 5KZTA 3OO7A 5TPAB 4KQPA 3TODA 1SBPA 2D5WA 2IA4A 2I0CA 1O63A 3PPQA 3PV0E 4FIMA 3WAEA 3FVGA 2FYIA 1LAXA 3SETA 2Q2CA 1HSEA 2A5SA 1A40A 2ZNSA 3CR9A 2XD3A 5DEXA 4OFLA 5DVIA 5DYHA 2H5YA 2DVZA 3H4ZA 1NH8A 3C34A 3RLFE 4BLAA 1VE4A 2V3UA 2RF1A 4OFJA 2O6AA 1YAEA 1B7UA 4H5FA 1RYXA 1SD3A 4ELRA 3UP9A 3O9PA 3K1NA 5CBRA 2RC7A 2RKMA 3PD9A 3DP6A 1LFHA 4YMAA 3VDFA 4XKRA 1EU8A 3IB1A 1BLFA 4XKNA 3K0VA 2PMSA 1S50A 3PUXE 3PMWA 2P2AA 3O97A 3SKPA 1MPCA 2XXVA 4I1DA 3U72A 2M8CA 4QF9A 3LUYA 5BUUA 2XXUA 2F8DA 5ICQA 2QJEA 1B52A 4YICA 1IQ7A 2ESNA 3IK6B 5ICTA 5AA2D 2ZYMA 5CBSA 3TZAA 3G3HA 1SDXA 3S2VA 3H6UA 2XXQA 5H8QB 4H6DA 3MWBA 3K00A 1MXWA 1ZKBA 3E3KA 4DZ1A 4R72A 3T22A 4R6HA 2KLFA 4TLMB 2ZNUA 1URSA 1LGBC 5TU0A 4R9GA 3IJOB 3UIFA 4EQ7A 4G68A 3C4MA 3VE1B 2DE3A 4MFIA 4KYEA 5F7VA 2I48A 4F18A 4GL8A 4P0IA 2O84X 2Q89A 5H8FA 2F35A 1FQDA 2R71A 4IO2A 3FIRA 2XX7A 1BKAA 2Q8JA 4G2ZA 4FEDA 3U92A 1B46A 2LAOA 1VR5A 4BDOA 4RA1A 3T66A 3KGCA 1A54A 2WKYA 1XVXA 3IO4A 5HPQA 3PPOA 4ONYA 3S9LC 4R6YA 1NH7A 4C1TA 1MS7A 5KCJA 4AQ4A 1B2HA 3ILTB 3M3KA 5I56A 1A8FA 2DWAA 4JWXA 4NF6A 4F1UA 3UK4A 3O6HA 4JWYA 4RK2A 3FASA 4X48A 4F1YA 4ZEFA 2XXTA 3CSGA 1DPEA 2Z8FA 4N07A 2YLNA 3JYRA 3BFUA 2AL4A 3LBSA 1TFAA 1IXHA 4OERA 3TTLA 1L5TA 2ONKE 2F36A 4QFKA 3PUWE 3RT6B 1VFDA 3P7IA 3TFLA 3ZKKA 3UA8A 3C31A 3M8UA 1QKAA 3LC8A 4HCYA 5TP9A 4RJZA 4DLDA 1J1NA 1ZMGA 1N3XA 1DOTA 3IOWA 1P1OA 2ALUA 4AB6A 4YKKA 4WEPA 3OENA 3L6GA 1MM6A 3EHUA 1Q35A 2V93A 4H8IA 3SDFA 1DSNA 1MY0A 1XVYA 2X26A 4JBZA 2FA7A 3E13X 4F31B 2I6EA 1B40A 1IIWA 3OEMA 4JWOA 4IGTA 3V83A 1N04A 1Y4TA 3KG2A 3UORA 2I4BA 1ZJLA 1N0TA 1MXXA 2H99A 3HPIA 3T9UA 2I58A 4EQBA 3SERA 4YZZA 3KOSA 5I58A 2REJA 4OESA 1FTMA 3IX1A 5FTIA 4LATA 5TPAA 3S9NC 1B1HA 1SQYA 4QSCA 4OQOA 5L9OA 3HHGA 3L6HA 2VGQA 3FV1A 3R6UA 2O51A 5KDTB 4U22A 1NNFA 4GOTA 3C35A 4ZDMA 4DCYA 4FJPA 4R75A 2NUVA 3DP8A 3EPEA 4QFOA 3C9HA 1GR2A 3JV9A 3A3UA 1NNKA 1IUDA 4N6PA 1GGGA 4KD5A 3O28A 5J1DA 2F7AA 1JW1A 1B05A 3BBRA 2XXYA 1MQDA 1N76A 4F3SA 4KR5A 4R2FA 4C0RA 3LSWA 1AOVA 2HCAA 5I2KB 4Q0CA 2Y7IA 1USYH 4O3BA 4EDPA 4DXCA 3K6WA 4JDFA 1BIYA 4H1XA 1PBPA 5ISUA 3LSLA 1O7TA 4MF3A 4GD5A 1ANFA 1MPDA 3MQ9A 4H0WA 3MVYA 5I84A 3VVFA 2NVUB 1UQWA 5CC2A 4DE8A 3CFZA 4JSDA 2Y7RA 2GRVA 4ZEIA 4QSEA 2E1SA 3ZKLA 3MPKA 1JQFA 3C36A 3LSXA 3OO9A 2R6GE 2PX1A 4GRKA 5H8QA 5FTHA 2Y84A 1D4NA 3FXUA 4PETA 3TELA 2O1MA 3TCFA 3OXNA 1ZTYA 5CRYA 4LUBA 4EUOA 4OENA 4OEUA 3IOVA 4OTEA 2ANJA 4LONB 1QUKA 2I3WA 2ABHA 3W15C 4IO3A 4WKMA 2FNCA 1LAFE 4LVQA 1N3WA 4PP0A 1JW4A 2Y7KA 2XX8A 3KZGA 4YU0A 2X7QA 2DOJA 4BDRA 3MP8A 4JSOA 4KYDA 2QS4A 3RUMA 1RYOA 4XKQA 1JVYA 5B70A 1XHYA 3U94A 2QMWA 2HQ0A 2DXRA 4F19A 1FQAA 1HSJA 1AL3A 3DLNA 1MXVA 1SI0A 5I2NB 2D21A 2E0SA 2AIXA 3ZS6A 1MQGA 3V89B 2OJTA 3QAXA 3HO7A 5DVFA 3TQLA 3HCQA 5EHSA 1DTZA 1QVSA 3E9XA 1VFEA 2RCBA 4H67A 3TAJA 1FQEA 4UA8A 1SI1A 3MP6A 4P11A 3OO8A 3O29A 1MQHA 1B3FA 2AYSA 4LP2B 2Q9TA 4G68C 2P0SA 3MZBA 1UTHA 1ZLQA 2F7BA 1M5BA 1F9BA 4EQ9A 1PC3A 4I8CA 3R26A 4PE5B 1SW2A 3OMBA 3K01A 1URGA 3B6TA 3UGWA 4TQUQ 1QUJA 3PD8A 3OO6A 2THIA 2A5TB 2F97A 3DELB 2QPQA 3HHFA 1M5CA 4F2QA 5FHNA 5CI5A 4QHQA 3TTKA 1B5IA 1Y3QA 2YPNA 1I6QA 2DXYA 2RINA 5I59B 4Q8RA 2ZXTA 3MVZA 1MY3A 3PMXA 1US5A 3SESA 2XXHA 4XKPA 2UYEA 1IZ1A 4NF5B 2DWIA 1UIVA 1OLAA 5HBCA 1IXCA 2PT2A 2REGA 4LA9A 1MXUA 4U2RA 3G3IA 2IEEA 3GXAA 5FHOA 4O3AA 2UXAA 4LQ2A 5AA1A 1LSTA 1URDA 3I3VA 3WAFA 2GFEA 2DE2A 4F3GA 1A55A 3VVDA 4YB7A 3CIJA 3QYTA 5H8NA 1FQBA 2F7CA 1FQCA 1PEBA 4HW8A 4R2BA 1M5EA 2NXOA 4DIGA 3USDA 2XD2A 4NTLA 1UIUA 1SVXB 5H8SA 1MQIA 2F34A 4PFTA 5KDTA 1POY1 5HM4B 3H3GA 4I62A 1QULA 3IL1B 5IAIA 3TCHA 2X7PA 2O68A 3PPPA 2B3BA 5DTBA 3G7WA 3FZVA 3ONMA 3W9WA 2DVCA 1B32A 2O7UA 4FATA 4H65A 2PVUA 1XS5A 5B7DA 1MPBA 3FJ7A 1IXIA 1MDQA 3SEWA 2HXWA 3Q27A 3GBBA 3TTMA 4MBPA 5H8HB 4IY5A 1EZOA 3KBRA 5I2KA 4LZ8A 4NF4B 3N5LA 4NEDA 1OIBA 2ONRA 1LBBA 4ZEBA 2ZYOA 4NWDA 4ZEDA 3VV5A 3ODBA 4OVJA 3K6UA 1NNPA 1QW0A 4YKJA 3CVGA 4P0GA 4R74A 4Z7EA 3FUZA 3I5OA 3QUFA 3ECRA 3T93B 4MH5A 4EF2A 1ELJA 4QRZA 2W7YA 2H25A 3HN0A 3RQTA 4ELPA 1NFTA 2DS9A 4F2OA 3PU5A 2XX9A 4JB7A 3EQ1A 4YMBA 2H9BA 1WDNA 4YB6A 1BTJA 4OEVA 1MXYA 4U4SA 1B1XA 4ZE9A 1H44A 5CMCA 1EZPA 1OVBA 1LFIA 3IOUA 2RC8A 1P1NA 4L17A 1B7ZA 3G3KA 3M3LA 3MP1A 1WVJA 5L9SA 3UN6A 3V8XB 2OZZA 3GBAA 4GXAA 4ELOA 3TMGA 1NL5A 2XHDA 2XXWA 4OYVA 4E0WA 2Y7PA 1IEJA 1MRPA 3MVXA 3QUJA 4IY6A 3CI8A 3TTNA 5I57B 4YAHX 3AXFA 4OFOA 1DMBA 4U21A 3LSFB 4GLIA 4U1OA 2I4CA 3H06B 3D4CA 1ZIUA 3KOTA 2GH9A 3FD3A 1II5A 3IB2A 1XOCA 1A7LA 3B6QA 1TXFA 1I6BA 1B58A 3T9XB 4DXUA 5I2NA 3TEPA 3I6VA 1R1NA 3OOAA 5FHMA 2DYXA 3MC2A 4GL0A 3S4UA 4F39A 1MY1A 3QSLA 4X1DA 5EYFA 3VVEA 4JXIA 3TPAA 1H3DA 2V3TA 3FVOA 5KCJB 3FJMA 3KFMA 3N94A 1FTLA 5L9MA 2B65A 3C32A 3CSBA 3TDJA 4QSDA 4RK9A 4ZE8A 3FVNA 4C1UA 1A8EA 3U8QA 1GV8A 2VD3A 2DQVA 4XTCQ 2Z23A 3QXMA 2XXIA 3MJNA 2UYFA 1T0KA 3KN3A 1O64A 1MM7A 3TTRA 3KEIA 1Y3NA 5JTYB 2A5TA 4IO6A 4BDMA 1BP5A 4OHNA 3FXRA 4G8HA 2QS3A 4F29A 2P1SA 1S7YA 1MH4A 3RN8A 4R6KA 4AB5A 5I59A 2XXPA 2QSXA 2H98A 1CE2A 2I3VA 4IB2A 4LZ7A 4ECFA 3OSRA 3DP4A 1MDP1 3JZJA 3Q28A 3TYHA 3Q26A 4NF5A 3N6TA 1LAHE 5TP9B 1SW1A 2DWHA 2Z8DA 4KCDA 3VLVA 3KJTA 1AH5A 1FTJA 4GWOA 1MXZA 1MY4A 4ESXA 3MPLA 1JEUA 3A3CA 4BDNA 1B3HA 4R9FA 2ZNTA 4X9TA 3K2DA 2G29A 4G4PA 1OQGA 4G77A 2H4IA 1PB8A 3Q25A 4H8JA 2VP1A 3SEVA 1XC1A 4H5GA 2OLBA 5EHMA 2Z22A 4RPOA 3S9MC 1B3GA 1NNTA 1LFGA 4ZS9A 1R9QA 3T96B 1GTKA 5K2XA 1P1QA 3EHTA 1VSOA 4OETA 2VHAA 4F1VA 1OMPA 1Y3PA 1UTBB 4UACA 1P1UA 3R7XA 1NKXA 3THIA 1TWYA 3G3GA 3TKDA 5H8HA 5LOMA 3EF7A 5CMMA 1N7XA 4GVOA 3RGYA 3K1PA 4BDQA 1IITA 4NF4A 3IORA 4YKPA 1ZBMA 4POWA 4RY1A 1LBCA 2HFBA 4KHZE 1R6ZA 4ND9A 1LB9A 4G8MA 4ZEKA 2VD2A 3GLBA 3DM0A 3G3FA 3K1MA 5BWJA 2G93A 4F3PA 1LCTA 2PT1A 1TFDA 4M1VA 3K6VA 4RNSA 3F11A 4FE8A 4FAJA 5AA4B 2UVJA 3IOTA 3K02A 1NMUA 1JVXA 2F5XA 4KFQA 4WEDA 4EF1A 1D9VA 3FGSA 4ZECA 3PMVA 4QFPA 2DE4A 3BKIB 1M5DA 4RYAA 1FTOA 1N7WA 3FATA 2O1LA 3PGFA 4F3BA 2RC9A 3RTFB 2AL5A 4NWCA 3B6WA 2QS2A 5M2VA 5AA2B 3H7MA 3RNNA 3PUYE 3K4UA 5A5XB 1AIVA 3H6WA 3IJXB 1XT8A 5I57A 3O6IA 2F78A 3T9VA 4RPNA 4QFLA 1HSLA 4XXUA 2ZYNA 1PBQA 2BJJX 2HAUA 4GQOA 1P1WA 3KSJA 1B0HA 1Y1ZA 2I49A 5DT6A 2RCAA 4NF8B 1CB6A 2OK2A 3RT8A 3CRBA 3W9VA 2B3FA 1TT1A 1B5HA 2PYYA 1SYHA 1SW4A 4LZ5A 3IB0A 3KJ7A 1FQFA 1IXGA 1B6HA 4Q5TA 4GFRA 4XIGQ 4Z0IA 1R9LA 4X1BA 3T9HB 1ATGA 2V25A 3VXCA 3IAZA 3LR1A 3EHSA 4R73A 3FJGA 1SW5A 3OSQA 2I0BA 3MBPA 2OCUA 4O3CA 4QFNA 5CM6A 1QKBA 1A99A 2V84A 5DEXB 3TCGA 1FTKA 4ZZEA 3IO6A 5DVJA 4OZ9A 5JEIA 1B7HA 3O6GA 3GZGA 2D3IA 2DWJA 1Y20A 3IR1A 3FVKA 4Q30B 3HV1A 4U23A 1YTVA 4GF8A 5JTYA 1OLCA 2PBWA 3N6UA 1OQHA 4G8NA 2CZLA 1S9TA 4KYSA 5CMBA 4ZZAA 3TUSA 1B3LA 5K2YA 4OWDA 4FORA 2NWJA 2OWTA 4PFUA 1UTHB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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