3KBRA

The crystal structure of cyclohexadienyl dehydratase precursor from pseudomonas aeruginosa pa01
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
232
structure length
231
Chain Sequence
ESRLDRILESGVLRVATTGDYKPFSYRTEEGGYAGFDVDMAQRLAESLGAKLVVVPTSWPNLMRDFADDRFDIAMSGISINLERQRQAYFSIPYLRDGKTPITLCSEEARFQTLEQIDQPGVTAIVNPGGTNEKFARANLKKARILVHPDNVTIFQQIVDGKADLMMTDAIEARLQSRLHPELCAVHPQPFDFAEKAYLLPRDEAFKRYVDQWLHIAEQSGLLRQRMEHWL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of cyclohexadienyl dehydratase precursor from Pseudomonas aeruginosa PA01
rcsb
molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule keywords Cyclohexadienyl dehydratase
total genus 75
structure length 231
sequence length 232
ec nomenclature ec 4.2.1.51: Prephenate dehydratase.
pdb deposition date 2009-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kbrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kbrA02
2W7YA 4ZEBA 3CG1A 1JNFA 1VSOA 4H65A 4U1OA 1H43A 3TTLA 1OLAA 1IITA 1M5BA 3K1PA 3MVWA 4F29A 4I62A 4F3GA 1POTA 4IGTA 5H8HB 1TT1A 1UTHB 2Y7KA 3K1MA 3S9MC 3MBPA 3MJNA 2Z8DA 3MVYA 3FV2A 3KN3A 3GBBA 4F31B 3TTMA 1EZPA 3IL1B 5F1QA 3RGYA 3QUJA 4U4XA 3A3CA 3BFTA 2THIA 4BLAA 1A40A 2NWJA 1BTJA 3FATA 4DE8A 5TP9A 3S2VA 2I4CA 3LSLA 3KSJA 4RPOA 5JK4A 4IO6A 1SYIA 1ZBMA 3JV9A 5KZTA 1N76A 3KN7A 3I5OA 3MPKA 4FATA 5H8NA 3THIA 3LR1A 3LSXA 2O68A 2Q89A 2ZYKA 5B7DA 3Q26A 2HFBA 1M5CA 1QUIA 4OEUA 1SYHA 3IB2A 2FYIA 2DP8A 2DYXA 3RQTA 1ZLQA 3K1NA 1LLSA 3U72A 2QS3A 3LC8A 4ND9A 3T9XB 3P7IA 1A8EA 1P1WA 2DWHA 4G4PA 4RYAA 3K6XA 1D9VA 4JWYA 3IOUA 2AL4A 4P11A 2DWIA 3CI8A 3S9LC 3K2DA 4R72A 5IAIA 4TQUQ 1DTZA 4XKRA 3QUFA 2DE3A 2Q9TA 3FJ7A 3U94A 1B2HA 3MZBA 2UYEA 2RINA 4JSOA 3OELA 5J1DA 3IK6B 1QUKA 1ANFA 2D21A 3ILUB 5B70A 3RN8A 5H8QB 1Y9UA 4PE5B 5ITOA 4HCWA 4NF8A 3JYRA 5BUUA 2PT2A 4YMBA 4OMBA 1OQGA 3DLNA 5CBRA 1MDQA 1B0LA 5A5XA 3KEIA 3MVZA 2CMOA 1SVXB 5CMCA 4YU0A 2OZZA 4OVJA 5KDTB 4H8IA 2REJA 2HAVA 3PD8A 3OO9A 1T0KA 1B3GA 4DXUA 2I58A 4YKIA 2RCAA 4RY1A 4NMYA 2GHAA 1HSLA 1LBBA 4ONYA 3Q25A 1FQFA 4ZECA 1TXFA 2H4IA 2D5WA 4NWCA 4NF5B 3PMWA 1FTLA 3LBSA 4KHZE 3RTWB 1I6QA 5AA2D 4F2OA 1JQFA 2XXUA 3MAMA 4QFPA 2UXAA 4E0WA 4LZ5A 3HPIA 4OTEA 3FXUA 4EF1A 3TMGA 5I57A 3K01A 5AA2A 3LSWA 5JEIA 4EQBA 1MQJA 3USDA 1MQGA 1QVSA 5ICTA 5K2XA 4RJZA 1B7ZA 1TWYA 4WKMA 3T9UA 3VDFA 2ANJA 3WAFA 3KZGA 4DDDA 3FXRA 4PFWA 4C0RA 4KCDA 3FVOA 3IOWA 3MC2A 2YPNA 3FZVA 4PQJA 2X7QA 2QMXA 1FCKA 4OFOA 2QS1A 2V3TA 3RT8A 4U1ZA 5I84A 4GIZA 4NF6A 1XT8A 5I57B 1BIYA 1B32A 4AB5A 3C34A 5AA2B 1FQBA 1MG1A 3T22A 3FIRA 1L5TA 3ZS6A 3M8UA 3PD9A 1LAFE 2H5YA 2OJTA 2R9JA 2RKMA 3IB0A 5H8FA 5I56A 3PPPA 4Z7EA 2DWAA 3VLUA 4OERA 3B7DA 4OETA 4ELRA 4LZ7A 1Y1MA 1B7UA 1MY1A 3K6WA 1MH3A 4IO3A 5FHOA 3TTKA 2Q8JA 2H25A 1B3LA 1MY2A 2DVZA 4X9TA 3DP6A 1NMUA 4ESWA 3RTFB 3TQLA 5FTHA 4R9FA 3VXBA 3Q28A 4P0IA 3RPWA 3MZ9A 4EXLA 1B1XA 4MF3A 3K4UA 3EF7A 2F97A 3M3FA 4KI0E 4R2FA 4N13A 4BDQA 3FV1A 1QW0A 4DCYA 1VFEA 1O63A 1AMFA 2A5TA 3IR1A 1UQWA 1Y20A 4POWA 4NF4B 3MVXA 3SEXA 2Y7RA 1SI0A 2HZLA 2V3UA 3M3KA 2Z8EA 4QFLA 1YPNA 4MFIA 3OEMA 3MPLA 4DIGA 4KD5A 2VD3A 1XHYA 2GRVA 5H8SA 3G7WA 1DPEA 3ILTB 1LCTA 4OFJA 4ESXA 2Y84A 1US5A 4H5GA 1LBCA 1IEJA 3QAXA 1R6ZA 3G3KA 2F7AA 4XTCQ 1PB8A 2A5TB 3GLBA 4BDMA 4UA8A 2F8DA 2ZYMA 2ONRA 3QK6A 5JTYA 1QKAA 1FTMA 1H44A 1XVXA 4XXUA 4OWDA 4LQ5A 4WXJA 4UACA 1NH8A 4F1YA 3HN0A 5KCJB 2H98A 1MRPA 3TEPA 5HPQA 1MM6A 4XKNA 4N6PA 5BWJA 3MUQA 3FJGA 4GWOA 4QF9A 1MXVA 4JSDA 2PT1A 1S50A 3HV1A 3UK4A 3T9HB 3VVEA 2XXIA 4LA9A 1R9LA 4GVOA 4QFOA 2O6AA 2RC7A 1Q1KA 5JTYB 3C33A 1B3FA 4ECFA 1SQYA 2F34A 3LSFB 4MLVA 2DXRA 4QFKA 4DZ1A 5I2NA 4M1VA 3TCGA 3T9VA 1MXWA 1WVJA 4L17A 2FNCA 5I2KA 3MWBA 3OSRA 4Q0CA 1JW1A 4KPTA 2ONSA 4WEPA 2XXQA 1N7XA 1S9TA 5EHMA 2B3FA 3DP4A 5HBCA 4MH5A 1D9YA 1FQAA 1Z7NE 4Q8RA 2ALUA 4KFQA 1LFIA 4JBZA 2GH9A 1N84A 4OFLA 1SBPA 3WAEA 4O3CA 4TLMB 4QRZA 1ZTYA 1ATGA 5FTIA 4PETA 4EF2A 3FGSA 2O69A 3IO4A 4GQOA 4NTLA 1DSNA 4F3BA 2PBWA 1VR5A 2DE4A 4EQ9A 3UA8A 1N0TA 1Q35A 2P1SA 3OMBA 1LAXA 3RNNA 3TZAA 1GVCA 1MXYA 1QKBA 3CR9A 3E4RA 4MLQA 5I58A 3M3LA 4IO7A 5L8DA 5EYFA 3OOAA 2DE2A 2ZMBA 2XXVA 1Y4CA 1I69A 4F2QA 1IXGA 4IY6A 4H8JA 5TP9B 1B6HA 3TODA 1PB7A 4QFNA 4BDOA 3SEVA 2VD2A 3ZKLA 4TOZA 4F39A 3PUXE 2PVUA 3V8XB 4GL8A 3CSGA 4FEDA 3TDJA 3E13X 1LSTA 4H5FA 3H6UA 5H8NB 3E3KA 4IGRA 3SETA 3R6UA 1QULA 1MQHA 3MZ1A 3W15C 2V25A 1FQEA 4YB6A 1B46A 2NXOA 3RY3A 4LQ2A 4ZEIA 3ECRA 1YCJA 1IUDA 4U23A 4QSCA 3O97A 2F6PA 2NVUB 3FXQA 2Y7IA 4ELOA 3V83A 2F78A 3G3JA 2REGA 3G3GA 4R2BA 4BDRA 3OXNA 1P1NA 1DOTA 1IXIA 3KJ7A 4FE8A 2V84A 3TCHA 4Q30B 5ELVA 1LAHE 2QS2A 2O7IA 5CBSA 3U1OA 3PUZE 2HAUA 1Y4TA 5M2VA 2V3QA 3TAJA 3EN3A 3QSLA 4G8NA 3OD7A 1HSJA 4NF8B 2QJEA 3T93B 1B40A 4LZ8A 5TPAA 5A5XB 4KYSA 4G77A 1FQDA 2GHBA 4XIGQ 1AOVA 4ELQA 1MPBA 3VE1B 1P1OA 4XKPA 4LONB 2BJJX 4HS7A 5I59A 3PGFA 2YJPA 2VHAA 3CRBA 4LP2B 3SKPA 2XXXA 1FTJA 4EUOA 4PFYA 1OVTA 3B6WA 3FVNA 2DVCA 2AYSA 3FUZA 1CE2A 3TKDA 3ONMA 3KJTA 3H03A 1EU8A 2ZNUA 5EHSA 3OO8A 5IKBA 2XXYA 3C36A 3PPOA 3QXMA 4R74A 3UIFA 3CVGA 4R75A 2OBGA 5AA1A 1NKXA 1VFDA 3C4MA 2B65A 2Q88A 5I59B 3MQ9A 4DLDA 4YB7A 2NUVA 4H0WA 1B7HA 4G2ZA 2RC8A 1B5JA 1OQHA 4LUBA 1B9JA 2XXTA 1USYH 3IO6A 1I6AA 2OCUA 1XVYA 2NOOA 3K00A 2HCAA 4U2RA 1AH5A 1ZIUA 1P1UA 3B6TA 3C9HA 1KWHA 2XXPA 4EXKA 4HCYA 5CI5A 4E0XA 3S9EA 4I9DA 2FA7A 3IX1A 4RPNA 4NF6B 1MH4A 4ZEDA 3FVKA 5ICQA 1M5FA 5AE4A 4G8MA 4Z0IA 4X48A 4GL0A 1HSEA 2HZKA 4F19A 1NNFA 2X26A 3IAZA 1MXZA 2DS9A 3PPNA 4GRKA 5H8FB 4N07A 5I56B 2Y7WA 3SESA 2KLFA 3CFXA 3C31A 4EQ7A 1SI1A 1AIVA 2E1SA 3TQWA 3C32A 3SDFA 4HTGA 3GBAA 2ZYOA 2I3VA 1N3WA 2XX9A 1N7WA 2I0BA 1PDAA 3FJMA 1SW5A 4YICA 1LGBC 1YAEA 1MY0A 1P1QA 4H67A 3Q27A 4YAHX 1B4HA 4IO4A 4R9GA 4HW8A 1ZU0A 1P99A 4ISUA 3CSBA 3TYHA 3SERA 1RKMA 2ESNA 3PU5A 1TFAA 4PFTA 3QIMA 1OMPA 3VVFA 4FORA 3O9PA 2A5SA 3L6GA 3N26A 2DWJA 3HCQA 2I6EA 4NWDA 2ZYNA 3O6IA 1D4NA 4O3AA 5K2YA 3EHSA 4RNSA 3AXFA 1FQCA 3VLWA 4ZE9A 2OWSA 3O6GA 5AA4A 1WODA 1ZKBA 3D4GA 1ZJLA 2I0CA 2VP1A 4RK9A 1B3EA 2XXWA 4G68A 3O28A 2PMSA 1N04A 2UVGA 4AQ4A 4X1BA 2QL3A 4KQPA 2VGQA 4DCXA 3U8QA 1FW0A 1MM7A 3OEKA 4GXAA 4ZS9A 2F7CA 3OO7A 4PP0A 1Y1ZA 4QHQA 3KBRA 3H6WA 1URDA 3DP8A 1A54A 3VXCA 3G3IA 1CB6A 5AA4B 3EQ1A 2QS4A 5F7VA 5ISUA 4C1TA 3G3FA 4F3PA 2UVIA 5H8HA 1B5HA 4G68B 3EHTA 2CZLA 1DTGA 1NNTA 2B3BA 1B1HA 1JVXA 1UTHA 3EHUA 1EZOA 2HEUA 4FJPA 1SD3A 3ODBA 3QYTA 4F22A 2RC9A 4U21A 3RT6B 3CFLA 3KN8A 2PYYA 3HHFA 3UN6A 1GGGA 5ITPA 2YLNA 1IXCA 1NH7A 4YB5A 1MQIA 3O66A 1MQDA 1SW1A 4KR5A 5CMBA 1B58A 5I2NB 2I4BA 3VVDA 1B0HA 5DT6A 1B52A 3N5LA 5CMMA 1PBQA 1ZMGA 3OO6A 2UVHA 3ZSFA 5I2KB 1LFHA 4RK2A 5DTBA 1US4A 5DEXA 4YKJA 3TTRA 1F9BA 3B6QA 3VV5A 5FHMA 4BDLA 3PV0E 4QSEA 1EZ9A 4OZ9A 1UIUA 4YMAA 2XD2A 1S7YA 3GXAA 3T66A 2H9BA 2UVJA 3IOVA 3OENA 4F18A 1VE4A 1URGA 3PPRA 1IZ1A 1O64A 1B05A 3TFLA 3U93A 3UORA 1NL5A 1NNKA 3HSTA 4GOTA 4JWXA 1BP5A 1MPDA 3O2AA 2GFEA 2O7UA 1B4ZA 3IORA 3PPQA 5DEXB 1B51A 1PEBA 3H7MA 1QUJA 5H8QA 3W9VA 1I6BA 1JVYA 1IXHA 4GF8A 2IA4A 2ZXTA 5I58B 1QJMA 3S4UA 2XX8A 4YZZA 1Y3QA 1DMBA 4OESA 3R7XA 4ZDMA 2DXYA 5KDTA 2DOJA 1FTKA 3MP8A 4ELPA 1PC3A 3O6HA 1OLCA 4GFRA 4KYEA 2ABHA 4NE4A 1R9QA 2PX1A 4FECA 2D3IA 3A09A 3KOTA 1IQ7A 2HXWA 2P0SA 2V93A 5DYHA 1MY3A 4OYVA 1B5IA 2F36A 4F3SA 1USYE 5CM6A 4NF5A 1PBPA 4G8HA 3IB1A 1UIVA 3SEUA 4GLIA 4JB7A 2OLBA 1A7LA 3BKIB 3V89B 3H06B 4H1XA 3N6UA 1WDNA 3H6VA 4IO2A 4MBPA 3R26A 1JW4A 1A99A 2F6GA 2I49A 3TTNA 3V5AA 4OHNA 3T96B 2Z8FA 1MXXA 1MY4A 2QMWA 3L6HA 4U22A 2QSXA 2X7PA 4C1UA 1JW5A 4KYDA 2UYFA 2Q2CA 1OIBA 4FEBA 4FIMA 4ZE8A 5DVFA 5L9SA 4IO5A 3K02A 1POY1 1GV8A 2E0SA 4JXIA 2I3WA 1ELJA 1AL3A 3FVGA 2XXRA 2OK2A 1GR2A 4R6KA 2IEEA 4RXLA 3N94A 3TPAA 2O84X 3S9NC 2DQVA 4P0GA 1O7TA 2XHDA 5DVJA 4THIA 4GD5A 2RF1A 1SDXA 4LVQA 1MPCA 3JZJA 2RCBA 1DPPA 3FD3A 1R1NA 5TPAB 1NFTA 5FHNA 4DXBA 3CG3A 3RUMA 4ZZEA 1XS5A 3K0VA 4I8CA 4K3FA 3KG2A 4OXVA 3KFMA 3A3UA 1M5EA 3PMVA 3CIJA 2ZNTA 4YKPA 1Z7ME 3IOTA 5CRYA 4U4SA 5AA3A 4IY5A 1RYXA 3H6TA 4FAJA 4OENA 4BDNA 3HHGA 3DM0A 4F1UA 3TCFA 3DELB 3O29A 4M4GA 1LB9A 1XC1A 3TUSA 4YKKA 3FASA 3UP9A 3VFJA 3D4CA 1Y3NA 2VOZA 2P2AA 4I1DA 1J1NA 1TFDA 5DVIA 4QSDA 3HO7A 4GXSB 1SW4A 1LB8A 2F7BA 1A55A 1NNPA 4NF4A 3RLFE 3E9XA 1LCFA 2F5XA 1A8FA 3I3VA 3H3GA 1Y3PA 3IJXB 3EPEA 1BLFA 1II5A 1GTKA 1PB9A 3UGWA 2QPQA 4LATA 4DXCA 2OWTA 5L9OA 5LOMA 3G3HA 1D3KA 1JEUA 2Q2AA 2XX7A 3GZGA 3SEWA 4JWOA 3PUVE 3MP1A 2G93A 2WKYA 3KOSA 1UTBA 1B3HA 2Y7PA 4X1DA 2O51A 3PUWE 3MW0A 3BFUA 2AL5A 4PFUA 3BBRA 2H99A 3F11A 3K6VA 3LUYA 3OSQA 4ZEFA 1H76A 3U92A 1M5DA 3N6TA 5KCJA 5HM4B 3CFZA 4EDPA 2LAOA 2G29A 1FTOA 2O1LA 2M8CA 1YTVA 2ONKE 4TLLB 4H6DA 4JDFA 3IJOB 3TELA 3KSXA 3KGCA 2AIXA 3PMXA 4R6YA 1H45A 1BKAA 2F35A 1UTBB 2XD3A 4IB2A 4Q5TA 4AB6A 3K6UA 5CMKA 2ZNSA 1LAGE 1RYOA 4NEDA 1OVBA 1XOCA 4WEDA 4R73A 4ZZAA 3MP6A 1MS7A 3Q29A 2R6GE 2QRYA 1H3DA 1JETA 1LFGA 3W9WA 3C35A 1EH3A 4R6HA 3ZKKA 4F1VA 2Z22A 3PUYE 4RA1A 1URSA 2DSFA 2R71A 4ZEKA 3I6VA 5CC2A 1MXUA 1JEVA 2HQ0A 5L9MA 4KCCA 3H4ZA 2O1MA 4G68C 2I48A 4POXA 4OQOA 1MDP1 1N3XA 1IIWA 3SEYA 1SW2A 4OEVA 3VLVA 4XKQA 5TU0A 2XXHA 4O3BA 2Z23A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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