4ESXA

Crystal structure of c. albicans thi5 complexed with plp
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
310
structure length
309
Chain Sequence
GSHMSTNKITFLLNWEAAPYHIPVYLANIKGYFKDENLDIAILEPSNPSDVTELVGSGKVDMGLAMVHTLAAKARGFPVTSIGSLLDEPFTGICYLEGSGITSDFQSLKGKRIGYVGEFGKIQVDELTKHYGMTPDDYVAVRCGMNVAKYILEGTIDCGIGIECIQQVELEEALKEQGKDSNDAKMLRIDKLAELGCCCFCTILYIANDKFIAENPQAVKKFLKAIKRATDYMLAHPREAWAEYGNFKPTMQTDLNTKKFQRCYAYFSESLYNVHRDWRKVNNYGKRLDILPENYVPNYTNEYLSWPEP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Candida albicans
publication title Thiamin pyrimidine biosynthesis in Candida albicans : a remarkable reaction between histidine and pyridoxal phosphate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Pyrimidine biosynthesis enzyme THI13
total genus 112
structure length 309
sequence length 310
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF09084 NMT1 NMT1/THI5 like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4esxA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4esxA01
4MH5A 2F35A 3I6VA 1QKBA 2O7UA 2XXRA 4QFNA 4Q30B 4ZZEA 4OFJA 2Y7KA 4LQ2A 4TQUQ 3QUJA 4BDQA 3N6UA 1O63A 3G3GA 1RYOA 4OENA 2A5TA 3PD9A 1MY2A 1MQDA 1Y4CA 4U2RA 3QYTA 1T0KA 3KFMA 1JQFA 4RJZA 2XHDA 3K2DA 4ZDMA 3MC2A 4HCYA 3IOTA 4IB2A 3ODBA 3FVNA 1B0LA 4BDLA 3M3FA 3PV0E 3LR1A 4HS7A 4RA1A 1TXFA 3VDFA 2RC9A 4IO4A 4C0RA 4ELRA 3K1MA 1ZJLA 3RNNA 2G93A 3MP1A 4E0XA 3CFLA 3S9EA 1PDAA 1ZTYA 4TLMB 2HQ0A 2XD2A 4R2BA 3A09A 3CG1A 4P0GA 1MG1A 2DWJA 2V25A 3TUSA 4PFUA 1AIVA 4G68C 3RPWA 3QUFA 3RQTA 4Z7EA 4ZEDA 5I59A 3H4ZA 1CB6A 3JZJA 4OXVA 4X1BA 3CFZA 3U92A 4EF2A 4RYAA 1B2HA 5B7DA 3FASA 2ESNA 3L6HA 5H8FA 1GV8A 3AXFA 2GHAA 1S9TA 2Q89A 3IB2A 4RY1A 3EHSA 3K1NA 1LCTA 3T66A 4I9DA 1TWYA 1Q35A 4YAHX 3T9UA 3N5LA 2DXYA 3K02A 1MXUA 4Q8RA 5M2VA 4DZ1A 2F5XA 1MY4A 3ZS6A 3MWBA 4EQ7A 1VE4A 5H8HA 2HZKA 3IK6B 2PT2A 4R6HA 1F9BA 1NNTA 2B3FA 4PETA 2H9BA 3O6GA 1BLFA 4G2ZA 1IXGA 4YMBA 5DYHA 5FHOA 4QFLA 2M8CA 2WKYA 3QAXA 5AA4B 2F7AA 2CZLA 4X48A 4IO7A 1B5IA 1B7ZA 1RKMA 4P0IA 4GIZA 2YJPA 2QJEA 2REGA 1JW4A 1N7XA 2Z22A 5LOMA 3KN8A 1S7YA 3TQWA 2REJA 5CRYA 1MQHA 1H45A 1FQEA 3O97A 1MQIA 4OVJA 2F36A 3K01A 5KDTA 4JDFA 3MZ1A 3TDJA 1IIWA 2O84X 1WVJA 1PB8A 3LSWA 5ISUA 1MQJA 1B3GA 3KN7A 3HHFA 3VV5A 2XXHA 5AA2B 1PC3A 1SW4A 2RC8A 4XKQA 5JEIA 2Y84A 3D4GA 2ALUA 1P1NA 3IJOB 5JTYB 3D4CA 4Z0IA 1JETA 4GQOA 1M5BA 1SDXA 1FQCA 4YB7A 4OTEA 3V8XB 2F78A 4ELOA 5ICQA 4H8JA 1MH4A 3SESA 1YTVA 4LZ7A 2VOZA 3TTLA 3MPLA 3FXRA 1QVSA 1LAFE 1PB7A 1PEBA 1LB8A 2H4IA 2QMXA 2I4CA 4H5GA 1II5A 3OENA 3N94A 1USYH 3B6TA 4OQOA 2X26A 1B9JA 3OSQA 2I58A 1B46A 4GF8A 1A54A 4H65A 3W15C 5DVJA 3PUYE 1VR5A 3PMVA 2DSFA 4F39A 3HCQA 4HTGA 5JK4A 2IA4A 5AA2D 1FTLA 2A5TB 3H6UA 3RUMA 1UQWA 3K1PA 1US5A 4IO6A 4XTCQ 3Q29A 1DMBA 2V3TA 5H8QA 4O3CA 1NKXA 1B5JA 1ZMGA 4OETA 2ONKE 2F8DA 3V5AA 1A7LA 5F1QA 1I6BA 3KSXA 3HSTA 1BP5A 2ZYNA 1M5DA 3MPKA 4F2QA 5I2NA 1MXYA 4LVQA 4PFYA 3JYRA 4R9GA 3KSJA 1URSA 2V84A 3DELB 4KFQA 4R6KA 5CMMA 5I56A 3MVYA 3C33A 4R72A 2I3VA 5I57B 2P1SA 3HV1A 3PPQA 4RK9A 4EUOA 5I59B 3T96B 2V3UA 4DCYA 1D4NA 1MDP1 3SEVA 3CRBA 3N6TA 3S4UA 5CMKA 4ZEBA 5H8FB 2UXAA 2DXRA 3T9HB 1M5CA 1I6QA 5FHNA 3RTFB 3IO4A 1MXXA 4R2FA 2PVUA 3ZSFA 1LGBC 4H67A 2DE2A 1B7UA 3U8QA 2Y7WA 1A8EA 5KZTA 1SQYA 1CE2A 4LONB 1SW1A 3KEIA 3V83A 3JV9A 4IO5A 4PQJA 2O7IA 3H7MA 1M5FA 4GFRA 4QRZA 5ELVA 4F1YA 1OLAA 4KI0E 3OO6A 3FV1A 3TODA 5H8HB 4JSDA 4WKMA 2UVJA 2Q2AA 3IAZA 1P1UA 3CSBA 2XD3A 2UVGA 2VHAA 3RN8A 3PPOA 2UYEA 3DM0A 4UACA 3BBRA 3M3LA 1VSOA 3C32A 3OXNA 4BDRA 4OMBA 4LATA 4G8NA 4FORA 1JW5A 3ZKKA 4GXAA 4DXUA 4DXCA 3ILUB 1MM7A 3TTKA 4F29A 3P7IA 3IL1B 4NF8A 2DE4A 1FQBA 5KDTB 4PFWA 2KLFA 1A8FA 3KN3A 1S50A 4OERA 2RF1A 2QL3A 2I48A 5H8SA 4YU0A 4G68A 3HN0A 3E4RA 4LP2B 3GZGA 4OEVA 4JBZA 4F1VA 3Q28A 5TP9A 2R9JA 2GRVA 1FTJA 3M3KA 1UTBA 2OBGA 2W7YA 2FYIA 5HM4B 4NE4A 4DE8A 1AH5A 2B3BA 1P99A 3LSXA 3RY3A 5B70A 2NWJA 1B4ZA 5L9MA 1XVXA 4THIA 4QF9A 1ZIUA 1BIYA 3WAEA 3GBBA 1Q1KA 3SKPA 4HCWA 4BLAA 2QS2A 4DCXA 1GGGA 3T93B 1LLSA 1J1NA 5CI5A 2DE3A 2XX8A 1RYXA 3MVXA 5ITOA 4GRKA 2IEEA 4PFTA 3SETA 3B6WA 4KR5A 2VP1A 2RCBA 3MQ9A 4QFPA 4BDOA 1LCFA 2H98A 5H8QB 3SEWA 3K6WA 4IO2A 1I6AA 2Q8JA 1GTKA 5KCJA 2E0SA 3Q27A 4FATA 3GLBA 2ZXTA 1POY1 3RTWB 1OLCA 3UA8A 4JWYA 4FAJA 2DYXA 1H3DA 5I2NB 5DEXA 1FQAA 3F11A 1MPDA 2YPNA 4PE5B 1N3WA 4ESWA 1AMFA 1LB9A 2OJTA 3TTRA 3TTMA 1SBPA 2OCUA 4R9FA 3QK6A 4K3FA 5DVFA 2QS4A 4YB6A 3HHGA 5I56B 1FCKA 1Y3QA 3LBSA 2XX9A 3C4MA 1IXCA 1URGA 4F19A 3PPNA 2I0CA 4GD5A 3UORA 1JNFA 1B5HA 3H6WA 1JW1A 3TEPA 1R1NA 4OFOA 1MY3A 2DS9A 1FW0A 1LAHE 3S9MC 3PMXA 4KCCA 4OEUA 4MFIA 2Q88A 3OEKA 2Y7IA 3FJMA 3KZGA 1B40A 4F1UA 3I5OA 2F7BA 4LUBA 4ZEFA 4FEBA 3PD8A 1MPBA 4G4PA 2O51A 1O7TA 1MDQA 1SYIA 3KG2A 4POWA 3M8UA 1Y3NA 1LBCA 1LAXA 3FD3A 1P1QA 3THIA 2Z8FA 3DP6A 3MZ9A 1PB9A 3TELA 3VVFA 3TQLA 3OOAA 3A3CA 2D5WA 4AQ4A 2O69A 5I2KA 2F7CA 1OQHA 3PU5A 1GR2A 4GL8A 3VXCA 4LZ8A 3E9XA 5DTBA 4MF3A 4C1TA 5I58A 4I62A 5HBCA 1OVTA 1UIUA 1UTHA 4FEDA 4ESXA 4NF8B 3O66A 3QIMA 3E13X 5J1DA 3TYHA 2UVHA 4ELPA 1FQFA 1SD3A 3EF7A 1VFEA 4XXUA 2ZYKA 3O2AA 4DLDA 4JXIA 2X7QA 4OFLA 4QSDA 4G68B 2OLBA 1AOVA 1H43A 3CSGA 4WEPA 3TTNA 1YCJA 3OEMA 5TP9B 3FGSA 1UTBB 1FTOA 1NMUA 4ISUA 2PX1A 1P1WA 1LBBA 2DWIA 3R26A 2NOOA 2DQVA 2XXYA 2UYFA 3H6VA 2DVCA 2O6AA 2PMSA 5TU0A 4OYVA 1B6HA 1QJMA 4DDDA 3U94A 4AB5A 1GVCA 3UN6A 5I84A 1P1OA 3MP6A 5EHMA 3R7XA 1B3LA 4I8CA 3OO8A 1NH8A 1D9VA 3MP8A 4FE8A 5EYFA 5DVIA 2QRYA 4H8IA 1I69A 2F97A 4H5FA 1A99A 1N7WA 3Q26A 3S9LC 2P0SA 2ZMBA 4ELQA 1POTA 4NF6A 3HO7A 2XXXA 3BFUA 5KCJB 3VLVA 1SI1A 3ECRA 3EHUA 4KYDA 4C1UA 4NF5A 3T9VA 4X9TA 4JWXA 3PGFA 5L8DA 5ITPA 3GBAA 2YLNA 2A5SA 3UIFA 5DEXB 4H1XA 4KCDA 1H44A 4FECA 2XXWA 2ZYOA 2RINA 3OO7A 2HAVA 4ZEIA 1Z7NE 3H06B 3MUQA 4R73A 2QSXA 3MAMA 4KQPA 3KJTA 2I3WA 2NUVA 4FJPA 3O6IA 4U4XA 2HCAA 3UP9A 1Y20A 3IX1A 4EXKA 3MVZA 1L5TA 3OMBA 3RLFE 3RT8A 1Y1ZA 3FVGA 2OWTA 1D9YA 3FJ7A 3H6TA 4F22A 5H8NA 1B0HA 3ZKLA 1TT1A 3CIJA 2ZNSA 1IZ1A 1NFTA 2ABHA 2P2AA 1LFHA 1EZOA 1PBPA 2HAUA 5TPAA 1YAEA 3MVWA 3CI8A 2I49A 1QUIA 2ANJA 1A55A 2AIXA 3O29A 4U1OA 4XKRA 4MLQA 3G3HA 3LSLA 3N26A 3G3JA 5IAIA 1IQ7A 4GLIA 1IXIA 3GXAA 4TOZA 4Q5TA 5A5XA 1JVXA 2VD2A 4YICA 3T22A 2GFEA 2PYYA 3KJ7A 1XHYA 4YMAA 3W9VA 2VD3A 4YZZA 5I2KB 2ONSA 3PUXE 4QSCA 1ANFA 4NEDA 3CG3A 2GH9A 5I58B 1UIVA 2I4BA 2DWAA 1UTHB 1QW0A 1B3FA 4ZEKA 1NL5A 1ZBMA 4R74A 4YB5A 2F6GA 4ZE9A 3B7DA 1BTJA 3IJXB 1VFDA 4JB7A 1MY1A 4F3PA 3G3IA 2H99A 4F2OA 4NWCA 3E3KA 4BDNA 4ONYA 4KYEA 1B1XA 4NWDA 4U1ZA 1N84A 1EH3A 2FNCA 2X7PA 1WODA 3FXUA 4F18A 3BKIB 1MM6A 4XIGQ 1AL3A 4IGRA 1WDNA 2QPQA 4EQ9A 3LUYA 1PBQA 4OWDA 5L9OA 3B6QA 1OMPA 3FJGA 1QKAA 1NNFA 2D3IA 4GOTA 1USYE 1SYHA 1US4A 1SVXB 3DP4A 4NMYA 1B51A 4DXBA 4X1DA 5CMCA 3SDFA 3FATA 3OD7A 2RCAA 3U72A 1DPPA 2ZNTA 4QFKA 1OIBA 4YKJA 1Y3PA 4U22A 5DT6A 1JEVA 3IORA 3SERA 4NF6B 4ND9A 1LFIA 4RXLA 2AL4A 3TFLA 4NF5B 3K00A 1BKAA 4M1VA 1MH3A 1ZKBA 3R6UA 2F34A 1D3KA 4NF4A 4LQ5A 5BWJA 1N0TA 5AA3A 3H03A 3UK4A 2PBWA 3TCHA 3C35A 3OO9A 2XXIA 5BUUA 5FHMA 1B4HA 1R6ZA 1URDA 4KD5A 5IKBA 4R6YA 4N07A 1QUKA 2H5YA 1ELJA 4EXLA 3EN3A 2D21A 5I57A 1IITA 1XOCA 3EQ1A 1B58A 3KBRA 3PUWE 4O3AA 4IY5A 1B3HA 3K6VA 1Z7ME 3MW0A 5K2YA 1MS7A 3BFTA 1R9QA 5H8NB 3QXMA 2RC7A 4P11A 4IO3A 3TZAA 5CC2A 3KGCA 4PP0A 5TPAB 3VLUA 3KOSA 3FV2A 4KPTA 2QS1A 5ICTA 2CMOA 2Q2CA 1Y9UA 4XKPA 3K6UA 2RKMA 4U23A 3IB0A 4L17A 2I0BA 4F31B 1QUJA 4GXSB 1N04A 3O9PA 3DP8A 2R6GE 4AB6A 3OSRA 2I6EA 5A5XB 1B1HA 3FXQA 3I3VA 3IOVA 1XVYA 2UVIA 4ZZAA 3SEYA 4RPNA 3C31A 1SI0A 3CR9A 4BDMA 3A3UA 4MBPA 3IR1A 4H0WA 2F6PA 4GWOA 4WXJA 1MXZA 2NXOA 3WAFA 5AE4A 4G8HA 1ZLQA 3PPPA 1NNKA 4QSEA 3PPRA 1B7HA 1SW5A 4GVOA 2DVZA 4IGTA 3FVKA 1B52A 3EPEA 2HZLA 2O1LA 2O1MA 1LAGE 5AA1A 4R75A 1ATGA 1R9LA 4EF1A 1HSEA 3CVGA 3TPAA 1DOTA 1NH7A 2LAOA 4EQBA 3KOTA 3PMWA 4N6PA 5EHSA 2VGQA 1IUDA 1OQGA 2Z23A 4GL0A 4POXA 2XXTA 3RT6B 4O3BA 1MXVA 3V89B 3G3FA 1EZ9A 1B3EA 1B05A 1Y1MA 4ZECA 1OVBA 3H3GA 4F3GA 2ZNUA 3L6GA 1N3XA 1TFDA 3C36A 3C9HA 3SEUA 4U21A 3T9XB 1MPCA 3K0VA 5FTIA 1B32A 3IOWA 3FIRA 3USDA 1LSTA 2HEUA 2XXPA 3O6HA 3MZBA 4HW8A 5FTHA 2AL5A 5CBRA 1XS5A 2QS3A 5CM6A 4IY6A 3RGYA 2DOJA 4QFOA 4KHZE 1DPEA 2E1SA 3VVDA 4LA9A 5F7VA 3LC8A 4XKNA 3U1OA 1H76A 3PUVE 2AYSA 4E0WA 1SW2A 3MJNA 4NF4B 2HFBA 4JWOA 1M5EA 2HXWA 3IB1A 3QSLA 1DSNA 4DIGA 3FZVA 3VE1B 2XX7A 3DLNA 2NVUB 1FTMA 1XT8A 1O64A 2V3QA 4QHQA 2XXVA 1MXWA 2PT1A 4F3BA 3EHTA 3VLWA 3G7WA 4ZS9A 1JEUA 1DTZA 2DWHA 2Z8EA 3S2VA 4OZ9A 1DTGA 2Y7RA 2ZYMA 4EDPA 1EZPA 4G77A 1FTKA 1N76A 5CBSA 4LZ5A 3OELA 3W9WA 4U4SA 2ONRA 4UA8A 1A40A 3K6XA 1KWHA 2Y7PA 3TCGA 3TMGA 2FA7A 2R71A 3UGWA 4M4GA 1EU8A 3PUZE 3VFJA 1ZU0A 1LFGA 2OZZA 3VXBA 5L9SA 2V93A 1MY0A 1YPNA 3CFXA 1HSJA 4RPOA 4F3SA 4N13A 1QULA 3K4UA 2GHBA 5AA4A 2XXQA 3ONMA 3C34A 2G29A 3IO6A 3S9NC 3TKDA 2XXUA 4WEDA 1MQGA 3TCFA 4ECFA 1TFAA 5K2XA 4TLLB 1JVYA 3FVOA 3ILTB 3Q25A 2Q9TA 2QMWA 4YKKA 4ZE8A 1XC1A 4RK2A 4KYSA 2B65A 1FQDA 5AA2A 2THIA 4JSOA 3O28A 3IOUA 1IEJA 5HPQA 4FIMA 5JTYA 3MBPA 3LSFB 4YKIA 2OWSA 2DP8A 1HSLA 2OK2A 1MRPA 2Z8DA 4RNSA 3U93A 1IXHA 3FUZA 4Q0CA 3G3KA 1Y4TA 4OESA 3SEXA 4NTLA 3HPIA 4I1DA 3VVEA 2BJJX 4YKPA 5CMBA 4G8MA 4H6DA 3TAJA 2H25A 2O68A 4OHNA 4MLVA 1NNPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MH5A 2F35A 3I6VA 1QKBA 2O7UA 4OVTA 4GWWA 1Q9DA 4N8YA 2XXRA 4QFNA 2V4CA 2QVUA 4Q30B 1FPKA 2R8TA 4ZZEA 4OFJA 2Y7KA 4LQ2A 4TQUQ 3QUJA 4BDQA 3N6UA 4XF5A 1O63A 3G3GA 1RYOA 4OENA 2A5TA 3PD9A 1MY2A 4NX1A 1MQDA 3RYDA 1IMDA 1Y4CA 4U2RA 2ZZXA 3QYTA 1T0KA 3KFMA 1JQFA 4RJZA 2XHDA 3K2DA 1KA0A 3ISPA 4ZDMA 4MNCA 3MC2A 4HCYA 3IOTA 4IB2A 3ODBA 3FVNA 1B0LA 4BDLA 3M3FA 3PV0E 3LR1A 4HS7A 1YZ0A 2F3BA 4RA1A 1TXFA 3VDFA 2RC9A 4IO4A 4C0RA 3KC0A 4ELRA 1VDWA 3K1MA 1ZJLA 3RNNA 2G93A 3MP1A 4E0XA 3CFLA 2DDKA 3S9EA 1PDAA 2CEYA 5ET8A 3RPLB 4XFEA 1NUZA 1ZTYA 4TLMB 2HQ0A 2XD2A 4R2BA 3A09A 3CG1A 4P0GA 1MG1A 2DWJA 2V25A 3TUSA 4PFUA 1AIVA 4G68C 3A29A 2FHYA 3RPWA 3QUFA 3RQTA 4Z7EA 4ZEDA 5I59A 3H4ZA 1CB6A 3JZJA 4OXVA 4X1BA 3CFZA 3U92A 4EF2A 4RYAA 1B2HA 5B7DA 3FASA 4OVQA 2ESNA 3L6HA 5H8FA 1GV8A 3AXFA 2GHAA 1S9TA 2Q89A 3IB2A 4HE1A 4RY1A 3EHSA 3K1NA 1LCTA 3T66A 4I9DA 1TWYA 1Q35A 1DBZA 4YAHX 3T9UA 3N5LA 1NV2A 2DXYA 3K02A 4JVIA 1MXUA 5IZ3A 4Q8RA 5M2VA 4NGUA 4DZ1A 2F5XA 1FJ6A 1MY4A 3ZS6A 3MWBA 4EQ7A 1VE4A 3MYUA 1FBDA 5H8HA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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