3RTFB

Chlorowillardiine bound to the ligand binding domain of glua2
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanisms of Modal Activation of GluA3 Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rtfB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rtfB02
3MC2A 1IUDA 3M3LA 4OETA 2A5TA 3CIJA 3OENA 2F6PA 3IJOB 2XX8A 1B3LA 4F3SA 2X7PA 1LFIA 1Q1KA 5TPAA 3PPOA 3BKIB 3PD9A 3H4ZA 4XXUA 3H6WA 2G93A 4NWCA 3UN6A 2Y7PA 4ZECA 2QSXA 3SDFA 3IL1B 4LP2B 3M3FA 1M5FA 3C9HA 4LATA 3K02A 1YTVA 3PUZE 2ONKE 2H25A 3VXCA 3I5OA 1AH5A 1NNFA 4YMAA 4GL0A 2HAVA 4KYEA 3QXMA 3EPEA 1A40A 1I6BA 4XKPA 1MPDA 5FTHA 4R2FA 5FHNA 1P1OA 3CI8A 1LBCA 5TPAB 5J1DA 1B0LA 4OENA 1CE2A 3K4UA 4OXVA 4G68B 4YICA 3N5LA 3OEMA 2XXQA 5TP9B 1SW4A 1PB7A 5DEXA 1IXCA 2XXUA 3RN8A 5DTBA 5CM6A 2NUVA 2O68A 1KWHA 2V3UA 4KHZE 5I2NB 1LBBA 4R2BA 1NH7A 2XX9A 3DP8A 1QW0A 1ZTYA 3K1PA 2Z8FA 2Q89A 3IX1A 5I57A 2F78A 2QS2A 2XD3A 4BDMA 1NNKA 3KN8A 5K2YA 1USYH 3KOSA 4I9DA 4ZZAA 4FECA 1B1HA 1JW1A 1Y4TA 5DYHA 2DE3A 3P7IA 4LQ5A 3TTNA 1B3GA 3VLVA 3USDA 2HEUA 3KSXA 5CMCA 2VGQA 3IO6A 3EHTA 2UVHA 3G7WA 2V84A 3FVKA 4PETA 1IQ7A 3I6VA 2XXXA 4RY1A 5FHMA 3AXFA 3EF7A 2V3TA 3TTRA 3KJTA 3GBAA 1B4HA 3K6VA 4KCDA 2UVIA 4X9TA 1OIBA 5DVJA 1XOCA 1LAFE 2DE2A 2AYSA 3ONMA 4HW8A 2W7YA 3PUYE 2I3WA 3MP1A 3HO7A 2DOJA 3H6TA 2E1SA 3FZVA 1B58A 1GVCA 4FORA 4EF1A 2DWJA 1ANFA 4H1XA 4FE8A 3TODA 1P1QA 3MVZA 2D3IA 3U72A 2F36A 1M5EA 4U22A 4HTGA 3KEIA 3DM0A 2XX7A 1LFHA 3MZBA 4THIA 1IZ1A 5H8SA 1B1XA 1UTHA 2XD2A 1F9BA 1H76A 1D9VA 1TFDA 1XVYA 1SW2A 1PBQA 1XVXA 3IOVA 3FXUA 4IO5A 4ECFA 2RCBA 3U1OA 2IEEA 3FVOA 3CFZA 5AA2D 1M5CA 4GRKA 1P1NA 5H8HA 5CRYA 3TPAA 1VE4A 2PVUA 4RA1A 2CZLA 2YPNA 1QUJA 2HZLA 3B6TA 2O1MA 1QUIA 4H8JA 5H8QB 4DZ1A 1B52A 1IXIA 1EU8A 3G3JA 1R1NA 4GF8A 3PUVE 2HXWA 3LR1A 1Y3NA 3UA8A 1MM7A 4KD5A 3HN0A 3VLUA 2XXYA 2YJPA 4ZEBA 4I8CA 4ELOA 5JTYA 1H3DA 4NF6B 3FV1A 1B7HA 4NF5A 3Q27A 3O66A 1FQFA 3PPNA 2DVCA 4FJPA 3U8QA 2F7BA 4R6KA 1T0KA 4RNSA 3JYRA 2AL4A 1B0HA 2I48A 3TCFA 1Y1MA 2XXVA 2HAUA 4DXCA 4IY5A 4YKJA 1QVSA 2OJTA 3G3IA 3O6IA 3EN3A 1GV8A 1QUKA 1MRPA 4R6YA 1R9LA 1UQWA 3IB0A 1O63A 3QK6A 4JWYA 2WKYA 3R7XA 3A3CA 4QFNA 4F3BA 4QSDA 1L5TA 1B9JA 1FQDA 2I4BA 4KQPA 2YLNA 4JSDA 3SESA 1DTGA 2F6GA 2VHAA 1S9TA 4IY6A 4DIGA 2Q8JA 3TELA 1D3KA 3TAJA 4LA9A 4EQ9A 1P99A 4NF8B 1AIVA 3IJXB 4LONB 3RUMA 1MH4A 4H65A 3ZSFA 4PFUA 3C31A 3K01A 3PPQA 1MY0A 1M5DA 4MF3A 4Q0CA 1TT1A 1FTJA 4M4GA 5KCJA 2UVJA 2RINA 2R9JA 4FAJA 4TQUQ 5F1QA 3ILUB 3MZ9A 3TKDA 3SETA 4JBZA 2UYEA 1B5JA 5KDTB 3C36A 1FQEA 1H45A 2DSFA 4F39A 1M5BA 3PGFA 1PEBA 1GR2A 1OMPA 2ZYNA 4U1ZA 4OEUA 1I6QA 4MLQA 4H67A 2H99A 1LCFA 1FQBA 4YU0A 3FJGA 5ICQA 1BKAA 4L17A 3VVEA 2UXAA 1XT8A 1SBPA 3RT6B 4XKRA 3SEYA 3RT8A 4OERA 3HV1A 4C0RA 4PP0A 2I0BA 2PMSA 1H44A 4AB5A 3IK6B 2QS3A 3W15C 5CBRA 1XHYA 3FVNA 2QS4A 4U23A 1JW4A 4KYDA 2ZYMA 2Q2AA 3E4RA 4G68A 1ZU0A 5M2VA 3T9XB 4LZ8A 4YKKA 4Z7EA 4QSCA 4X1BA 5TP9A 3VVDA 4ELQA 3PMXA 1LAHE 3T66A 4OHNA 3DP6A 5BUUA 1OVTA 5I2NA 3MVXA 2HQ0A 1TFAA 1NFTA 4YB7A 2ZXTA 1MPCA 4P0GA 4JDFA 4U1OA 2F34A 3M8UA 1HSLA 3SEXA 2F8DA 4G8NA 2CMOA 1B2HA 3PMWA 3VFJA 1LGBC 4DXUA 3PUWE 5AA2B 3B6WA 4BDRA 3N94A 5B70A 1UIUA 3T9UA 1TXFA 3RNNA 4KCCA 1P1WA 1RKMA 4ZS9A 1LLSA 4R9FA 3OO6A 1MQGA 1SYIA 3LBSA 3BBRA 4OFLA 3K2DA 1BTJA 5ISUA 3FATA 4MFIA 4YAHX 1SQYA 3IB2A 3MAMA 3GLBA 1FQCA 3H06B 2NOOA 3W9VA 4PQJA 1Z7ME 3CG1A 3ZKKA 3FGSA 3C34A 1AOVA 1B3EA 2OCUA 5ITPA 4ZEFA 4KFQA 4F1VA 1N3WA 2AL5A 1B51A 1N84A 5JK4A 1CB6A 4U2RA 3SEUA 3PUXE 2Z8DA 5TU0A 1SD3A 2F7AA 4YMBA 4GXAA 4NTLA 2DWIA 4JXIA 1B40A 4XKQA 3JZJA 4OWDA 3V89B 3V8XB 4R75A 3OO7A 4FIMA 4QRZA 4IO2A 1BLFA 3ZS6A 1MQJA 3C32A 4JB7A 1A8EA 4ZE9A 2QMXA 2DXRA 1VFDA 1JETA 3FUZA 3Q26A 4F31B 4DCXA 3DLNA 2Q9TA 4NMYA 3UK4A 3WAEA 3MPKA 4RXLA 2GRVA 1B05A 4FATA 3C4MA 1O7TA 3OO8A 5AE4A 1FTOA 1IIWA 3TDJA 2RC8A 2XXWA 2ZYOA 1FTKA 4OFJA 3S9MC 4M1VA 3OSQA 4GXSB 1MS7A 3MP8A 2BJJX 4TOZA 3TTKA 4R72A 5JEIA 2P1SA 4DXBA 1N76A 4U4XA 4TLMB 2ZMBA 5KZTA 3ECRA 4XKNA 4ELRA 3LSWA 2P2AA 4WEDA 1O64A 3E13X 2QJEA 5H8QA 1YPNA 1MXWA 1QJMA 2ZNUA 1PDAA 3OSRA 3PMVA 1IXHA 4P0IA 3B7DA 3OO9A 1Z7NE 3QIMA 4GWOA 3EQ1A 3S4UA 5I58B 3ILTB 3CR9A 5LOMA 1JVXA 4QSEA 1WODA 2I6EA 1H43A 4JWOA 3L6HA 3H6VA 4RJZA 2ABHA 5ICTA 3FASA 4NF6A 5FHOA 4X48A 4MBPA 2AIXA 1DMBA 2QS1A 4GOTA 1SDXA 3HHGA 1A55A 1FTMA 3CRBA 2H98A 2F35A 4PFTA 1VR5A 4MH5A 3CFXA 2HCAA 2PT2A 3FXQA 2RC9A 1VSOA 1B32A 5L9SA 4RK2A 1I6AA 5EYFA 3HSTA 3HHFA 4KI0E 2X26A 3LUYA 1AMFA 2F97A 3OXNA 4YZZA 1B4ZA 2FA7A 3QYTA 2P0SA 1POTA 4F19A 4TLLB 3GZGA 2O7IA 1Y20A 4OVJA 4F2OA 3Q28A 4G8HA 3MZ1A 4IB2A 5H8FB 3A3UA 3Q25A 4H8IA 2I4CA 3F11A 3UGWA 2GHBA 2F5XA 1NH8A 2Y84A 1B6HA 1WVJA 1URGA 2DWAA 1RYOA 4ISUA 3TMGA 1EZPA 1B5IA 2OBGA 3T22A 3LSFB 4Q30B 4N07A 4EXLA 3KN3A 4NF8A 2THIA 1SW1A 2V25A 3KG2A 4POWA 3CSBA 3IR1A 4YB6A 1URSA 5I56B 3O6GA 4GD5A 5H8NB 2Z22A 1PC3A 3SEVA 4R74A 2D5WA 4ONYA 2H4IA 1Q35A 3T93B 4F1YA 3KBRA 2HFBA 4ESWA 3GXAA 2Z23A 3TTLA 1B7UA 3TQWA 3V83A 3IOTA 5KDTA 3LSLA 1MXVA 1JW5A 3IOUA 4KYSA 4NF4B 3TTMA 2E0SA 1Y3QA 3PPPA 4IO3A 2ONRA 5AA4B 3I3VA 2ESNA 2IA4A 2OK2A 3VDFA 3K6XA 4HCYA 3MQ9A 2Q88A 1ATGA 1ZKBA 2OWSA 4ESXA 1ZLQA 4ZEIA 1MH3A 4BDQA 2QL3A 1MQIA 1MXUA 4QFLA 4O3CA 4KPTA 3K1NA 5I59B 5A5XB 1SVXB 2ANJA 3TZAA 4FEBA 3D4CA 1QKAA 4G4PA 3T9VA 1US4A 5BWJA 1A54A 3MBPA 2A5SA 3G3KA 4DDDA 2F7CA 1DPEA 4BDLA 1IITA 2DYXA 5EHSA 4WEPA 1DSNA 4DE8A 1II5A 2GHAA 1SI0A 4RPOA 2REGA 2QPQA 1S50A 4BDNA 3S9NC 4NEDA 4RYAA 5DT6A 4ZEKA 2M8CA 4EDPA 3MWBA 5ITOA 4PFWA 4PE5B 4E0WA 4FEDA 4XTCQ 4OTEA 2REJA 2FYIA 3VE1B 2Y7RA 3DP4A 4POXA 2OLBA 2VOZA 3SKPA 1MPBA 4JSOA 4UACA 2RF1A 1UTBB 2DP8A 2V3QA 3DELB 2XHDA 5AA2A 3O28A 3MP6A 2VD3A 3FJMA 3TFLA 3W9WA 2O1LA 3QAXA 1JNFA 1POY1 4QFPA 2RC7A 2QRYA 1PB9A 3QSLA 1JEVA 1OLAA 3IOWA 1OLCA 3KFMA 2B65A 4WKMA 1MDQA 2O84X 1P1UA 4X1DA 3SEWA 4UA8A 1EZOA 4YB5A 1GTKA 2Y7KA 4XIGQ 5I2KB 3M3KA 4C1TA 2ZYKA 3MPLA 2PYYA 3LSXA 3CFLA 4G77A 5CMKA 1JQFA 4LVQA 2Y7WA 4RPNA 1D9YA 3PV0E 3OOAA 1ELJA 1MQHA 5CMMA 4ZE8A 4N6PA 1B3HA 4HS7A 5CBSA 4IO4A 2Z8EA 4OEVA 1HSJA 1NKXA 3O6HA 4Z0IA 2DWHA 3FVGA 1IXGA 3PD8A 3MVYA 2A5TB 2PX1A 4WXJA 1JEUA 4OMBA 4QFKA 5IKBA 3BFTA 3BFUA 4EUOA 4QHQA 3K1MA 1MDP1 1LAGE 3TCGA 1Y3PA 1LB9A 4LQ2A 4GLIA 2DQVA 1WDNA 5IAIA 2GH9A 3RY3A 5B7DA 3TUSA 2GFEA 4HCWA 4KR5A 3RPWA 4EQ7A 4NE4A 1MQDA 1OVBA 1MM6A 1US5A 2KLFA 2UYFA 1MY3A 2B3FA 2XXIA 4GQOA 1ZJLA 3S9EA 3D4GA 1R9QA 3IO4A 4O3AA 4F29A 3ZKLA 4IGTA 1B7ZA 1FTLA 2UVGA 4IO6A 3K0VA 5CC2A 1QKBA 3PU5A 1A7LA 4JWXA 3CVGA 3THIA 4EQBA 3UIFA 4ZZEA 5DVIA 4H6DA 4H5FA 3H7MA 4F1UA 1NNTA 4PFYA 3S9LC 1MY2A 1N7WA 4GFRA 3VV5A 3OEKA 5DEXB 3MVWA 1NNPA 3KN7A 4N13A 5I58A 3O97A 3HCQA 1RYXA 3R6UA 4LUBA 3PPRA 4IGRA 2Y7IA 4OQOA 5FTIA 2D21A 2QMWA 2ZNSA 5I57B 1HSEA 4I1DA 3VLWA 2B3BA 4H0WA 1FW0A 4AB6A 3R26A 2V93A 1Y9UA 1S7YA 4BLAA 1D4NA 4G2ZA 3OELA 3KGCA 4DLDA 5AA1A 2R6GE 4Q5TA 1XC1A 3T9HB 3FIRA 3TQLA 1IEJA 4ZDMA 5DVFA 2DVZA 5CI5A 1OQGA 1LB8A 3OD7A 3JV9A 3MUQA 3H6UA 2DS9A 3E9XA 5H8FA 1LAXA 1PBPA 4E0XA 1LSTA 4OYVA 3OMBA 2NXOA 2H9BA 4IO7A 4U21A 2ONSA 4H5GA 3HPIA 3T96B 4R73A 3RGYA 2O6AA 3N6TA 1PB8A 4Q8RA 1I69A 2HZKA 2Q2CA 1YAEA 3CG3A 2ZNTA 1FCKA 2PBWA 3UORA 3MW0A 3C33A 3N26A 3V5AA 3KJ7A 5ELVA 5I56A 4F3PA 5H8NA 2ALUA 1DOTA 4MLVA 3SERA 1SYHA 3QUJA 5HM4B 3FD3A 3Q29A 2XXRA 5I84A 3K6UA 1QULA 3TYHA 1UTHB 3RTFB 3QUFA 1Y1ZA 4NF4A 2XXHA 3L6GA 1URDA 4YKPA 3G3GA 3TEPA 5AA4A 2O69A 4U4SA 2X7QA 1EZ9A 4C1UA 1BIYA 2OWTA 1MG1A 1LCTA 1MY4A 4ND9A 4F2QA 1ZMGA 1A99A 1B46A 4R9GA 3KSJA 5H8HB 3KOTA 3C35A 4OFOA 2H5YA 3KZGA 5HBCA 2XXPA 5I59A 2O51A 5A5XA 2DE4A 4F22A 3RQTA 1JVYA 4GL8A 4G68C 3EHSA 1ZBMA 1R6ZA 4R6HA 1ZIUA 2VP1A 3G3FA 4O3BA 5L9OA 3CSGA 4P11A 1N3XA 1UIVA 3GBBA 1N7XA 3FV2A 3O29A 1J1NA 3ODBA 4ZEDA 3B6QA 3H3GA 4G8MA 1MXXA 1MXYA 3VXBA 3RLFE 5JTYB 4YKIA 1TWYA 5EHMA 4AQ4A 4NWDA 3FXRA 3VVFA 4NF5B 2VD2A 2I3VA 2I58A 2I49A 4QFOA 3IB1A 1DPPA 1YCJA 1B3FA 3IORA 1BP5A 1AL3A 1VFEA 2R71A 3EHUA 3O2AA 2O7UA 1B5HA 4K3FA 4LZ5A 4OZ9A 4GIZA 3E3KA 1EH3A 1UTBA 2NVUB 1LFGA 3U94A 5K2XA 4F18A 4EXKA 1OQHA 3RTWB 4RK9A 3TCHA 2PT1A 5CMBA 4DCYA 3FJ7A 1N04A 2NWJA 3H03A 3N6UA 3O9PA 1N0TA 4ELPA 1MY1A 4OESA 3K6WA 3G3HA 3WAFA 2LAOA 3MJNA 4BDOA 4LZ7A 2RKMA 5I2KA 3IAZA 3U92A 5F7VA 3K00A 2RCAA 2I0CA 4EF2A 2XXTA 4F3GA 3LC8A 1USYE 2G29A 1NMUA 3U93A 5HPQA 5L9MA 2OZZA 2DXYA 1GGGA 1FQAA 4I62A 1Y4CA 5AA3A 1DTZA 4GVOA 1NL5A 2FNCA 1MXZA 4QF9A 5L8DA 1A8FA 1SI1A 1SW5A 5KCJB 1XS5A 3S2VA 3UP9A 3A09A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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