3RTFB

Chlorowillardiine bound to the ligand binding domain of glua2
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanisms of Modal Activation of GluA3 Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rtfB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rtfB02
3K1MA 2G29A 3C35A 4U22A 1B52A 3LSFB 1LAGE 2DXYA 3MAMA 5EHSA 1LAFE 2VHAA 1ANFA 2D21A 3OSQA 1OVTA 1IEJA 4QFOA 5L9SA 1B3GA 5H8HB 1LSTA 2A5SA 4XKRA 2F8DA 4GRKA 2I48A 1XHYA 3VV5A 1L5TA 1IXGA 3M8UA 1WDNA 3BFTA 1BKAA 2GH9A 3V83A 1B1XA 4IO6A 3UK4A 1MH4A 1IUDA 1BLFA 4R6KA 3MW0A 3MPLA 3U94A 3BKIB 2FYIA 4OFLA 4MLVA 4GFRA 1NL5A 1B3EA 1NNFA 3SEWA 3K4UA 2XXUA 5AA4A 3K02A 1I6QA 1IZ1A 2B65A 1D9VA 4RA1A 1JEVA 4AB5A 2A5TB 3TODA 3IJXB 4Q30B 3LSLA 2NVUB 2Z8DA 4KFQA 4U4SA 3RUMA 4THIA 4YAHX 1O63A 2DOJA 3CG3A 1Y1MA 4KHZE 4FE8A 3DELB 5I58A 3S9MC 4DE8A 3C34A 4ZEIA 4F18A 4LUBA 4PETA 3SEUA 4H67A 3FVNA 3I6VA 1N04A 2E1SA 2HZLA 1I69A 3FV1A 1NNKA 3PPRA 3K1NA 5A5XA 1MPDA 1JEUA 4NF4A 2XXPA 4R74A 3B7DA 4H8JA 3H6WA 3IORA 3PD8A 4R9FA 4EQ7A 1SYHA 3QK6A 1XT8A 4L17A 1MXZA 1B1HA 3IX1A 4EQ9A 4BDRA 4GL0A 4U1ZA 4Q0CA 2ESNA 2QS2A 5CRYA 4O3CA 3BBRA 3U1OA 1DTGA 2IA4A 4G4PA 4POXA 2GRVA 1PC3A 4HTGA 1BP5A 1SYIA 1I6AA 4DLDA 4I1DA 4H5GA 3O66A 1DPEA 2QJEA 5AE4A 1SDXA 4PP0A 2RC8A 1A7LA 2RC9A 3VVEA 3FASA 2I3VA 2YPNA 2R9JA 3MP8A 5ICQA 1LAXA 2OLBA 1Y9UA 3TTNA 5IAIA 4ELOA 3H4ZA 4ZEFA 2QPQA 2YJPA 1FQEA 1LFGA 3W9WA 2YLNA 4DIGA 4NF5A 4XIGQ 2XHDA 5CC2A 3CR9A 3U92A 1N7WA 2DE2A 1S50A 1BIYA 4R72A 2H5YA 4G68C 5AA4B 1ATGA 3MZBA 4R6YA 5L9MA 3E4RA 3TUSA 2Z8FA 4RY1A 4LONB 5KDTA 1A8FA 3FZVA 4ZECA 1IQ7A 2PBWA 5TU0A 4LZ5A 4H0WA 5IKBA 5H8SA 1B5JA 1LFIA 4GQOA 4H6DA 1M5BA 2GHBA 3VDFA 4OEUA 3RPWA 4DXBA 2X7QA 1XS5A 2O6AA 1B4ZA 5I58B 3OENA 2O68A 1HSLA 4YB6A 1RKMA 3D4GA 1SI1A 2M8CA 3PUWE 1A55A 1R9QA 1NMUA 1JNFA 5A5XB 3KN7A 3GLBA 4NF4B 4P11A 3LBSA 3Q27A 3QYTA 1LBBA 4FECA 5TP9B 4RNSA 1URSA 3GZGA 1MY0A 5BUUA 3MPKA 5DVIA 3TPAA 3UORA 3TELA 3VVFA 2QMWA 3VLVA 1N0TA 3JV9A 4N6PA 3UGWA 1ZKBA 3E13X 4YU0A 4OFJA 4I8CA 2NOOA 5L8DA 1XC1A 5F1QA 2R6GE 3LC8A 5LOMA 4YMAA 5ISUA 3UP9A 1MXYA 3O6IA 4IGRA 2HAUA 1WVJA 2HXWA 5CMMA 1M5DA 2V3QA 4DZ1A 5JEIA 2DXRA 2UXAA 3HCQA 1ZJLA 4ELRA 3C32A 2UVIA 1P1NA 5CI5A 1LB8A 3DM0A 4UACA 4U4XA 4JSOA 2XXIA 1D3KA 2DSFA 1ZLQA 2ONKE 5H8FB 2XXQA 1Y3NA 4DDDA 2UVJA 2KLFA 4GLIA 5H8NB 3PUYE 4IB2A 3K6VA 4NF5B 3HPIA 3PPPA 3S4UA 3TFLA 2Q2AA 4NWDA 3IO4A 3KEIA 1OQHA 3RT8A 2FA7A 4ND9A 4LATA 1LAHE 4OESA 3VFJA 2F6PA 4IO4A 3SERA 1NNTA 3TCGA 2NXOA 3IO6A 3MVYA 1URGA 1F9BA 4QSEA 3UA8A 1AMFA 5KDTB 2HCAA 3RNNA 1FTOA 4YKPA 3KSJA 1HSJA 1MPBA 4EXKA 3H6VA 3IAZA 3TAJA 1Y4TA 4N07A 4EDPA 4R6HA 3TCHA 3HHGA 4IY5A 3Q26A 1JW5A 2P0SA 3KOSA 4XKNA 1FQBA 4KCCA 3G3HA 3S9LC 5I2NA 1LGBC 1AIVA 3UN6A 2FNCA 5CBSA 3DLNA 3OMBA 1XVYA 4FEDA 5DT6A 3G3GA 3SDFA 4BDMA 1NNPA 1PBPA 3L6HA 3K1PA 4G8HA 1GTKA 1B0HA 1R9LA 4QHQA 4KPTA 3EHUA 2NWJA 1ZMGA 3CFLA 2I6EA 1H43A 2VOZA 2UYEA 3OSRA 4X9TA 3MJNA 1QVSA 2UVHA 3PPNA 2XXTA 3ZSFA 4YKKA 3T9UA 1GR2A 1SW2A 5CMBA 1MS7A 3R26A 1QULA 1EZ9A 1NKXA 3OEMA 3OO6A 5CBRA 2QSXA 3D4CA 4OZ9A 1A99A 4R2FA 2ZYMA 4R73A 3CRBA 4OQOA 4O3BA 3K6WA 2I4CA 2VD2A 2Y84A 2I3WA 3PU5A 2XXRA 2XD2A 4ESWA 1M5EA 1FQDA 2I0CA 5DVJA 1PBQA 4FAJA 3FGSA 1N76A 3Q29A 4ONYA 3OD7A 3GBAA 1MRPA 2DVCA 2OWTA 5H8QA 1MXUA 3CFZA 4U23A 4YKJA 4ESXA 3O28A 3GBBA 1Q35A 3T96B 2QMXA 3A3UA 1LBCA 2I0BA 2I4BA 4AQ4A 4YMBA 5TPAB 1TFAA 3H6TA 2HAVA 3S9NC 4NWCA 4E0XA 4OFOA 4F22A 5CM6A 3OO8A 1H76A 2XXHA 3G3FA 4NTLA 1DPPA 4UA8A 3EHSA 1O64A 1PDAA 3MVXA 4PE5B 2Y7RA 5JTYA 1MY1A 4EF2A 4G68A 2XXXA 2H9BA 4O3AA 1LCFA 4LQ5A 3SKPA 4GL8A 1RYXA 4JWYA 4BDOA 5CMCA 1SW4A 3OO9A 1N3XA 1URDA 4EQBA 4R9GA 3N94A 1AL3A 1GGGA 4JB7A 3PD9A 3EPEA 4OETA 1UIVA 3IJOB 2ZNUA 1ZU0A 4M4GA 4F2OA 4POWA 1OMPA 2F36A 4PQJA 4P0IA 2E0SA 4PFWA 1OQGA 1TXFA 2DP8A 3DP6A 5FHOA 2PVUA 1LFHA 5K2XA 3RGYA 4YZZA 1PB8A 1AOVA 3LR1A 4JWXA 2F6GA 4QFKA 4ZEDA 3CVGA 3H03A 1MQGA 4F19A 2F5XA 3M3FA 3MP1A 5AA2D 4HS7A 1JW4A 5HBCA 4H5FA 4DCXA 3SETA 5L9OA 2ALUA 3C33A 3RTFB 1MY4A 3Q25A 4DXCA 1Y3QA 5H8QB 4H8IA 3P7IA 3TTMA 4ZEBA 5I57A 1S7YA 1MXVA 1FQAA 2X7PA 3MZ9A 2I58A 3F11A 1P1QA 1VFEA 3E9XA 3THIA 3FV2A 3WAFA 4QSCA 3QUFA 4Q8RA 3T9HB 4MF3A 3FVKA 3MVWA 1P99A 3FATA 5I59A 1JVXA 3JYRA 4NF6A 1O7TA 5DEXA 3RT6B 3EN3A 1P1UA 5AA2A 1SI0A 2AL5A 3R7XA 2DE4A 5JTYB 3U72A 4G68B 3MP6A 1BTJA 1DOTA 1FCKA 4G8MA 1AH5A 4LZ7A 2D5WA 1ZTYA 3HSTA 1Q1KA 2THIA 4IO2A 3T9XB 2F7AA 4XKQA 1PB7A 2HFBA 2VD3A 4G8NA 5EHMA 1QW0A 4QFNA 2O51A 4KYSA 2HQ0A 5EYFA 3KGCA 3I5OA 2DWJA 3LUYA 4MFIA 3O29A 2B3FA 5ITPA 3FVGA 4LQ2A 2V25A 2V93A 4PFYA 1IIWA 1VR5A 2QS3A 4LP2B 1CB6A 2ZNSA 5BWJA 1B58A 1VFDA 4AB6A 1TFDA 2WKYA 3T93B 3RTWB 1QKBA 3TZAA 4DCYA 4Q5TA 2ZYNA 3QSLA 1MDQA 3VLWA 3IB0A 3HV1A 3VXCA 4R75A 1US5A 2Z8EA 4Z0IA 2RF1A 1NFTA 4N13A 3CFXA 1B05A 1SQYA 3OO7A 3KSXA 2O1MA 3O2AA 4RK9A 1UTBA 3TQWA 4KD5A 5AA3A 3SEXA 4P0GA 1II5A 2Z23A 2ZYOA 1T0KA 4LA9A 4ZZEA 1SD3A 1M5CA 3H06B 3G7WA 5KCJA 1EU8A 4RYAA 2V3TA 3WAEA 5FHMA 4WEPA 1YTVA 3V8XB 4ZS9A 1B2HA 2XD3A 1B9JA 2ONSA 2DYXA 5F7VA 3HHFA 4EUOA 2XXYA 4WXJA 1PB9A 3TMGA 2DQVA 3MQ9A 5HM4B 1FW0A 4JDFA 3CSBA 1ELJA 5I59B 4QFLA 4QRZA 4U21A 3A3CA 3PMVA 4C0RA 4NF6B 2VP1A 3ZKKA 2OZZA 3B6QA 3N5LA 5DEXB 3MZ1A 1D4NA 5AA2B 1MQJA 2P1SA 3U8QA 4TLLB 4NF8A 4WEDA 4XXUA 4TLMB 3PUZE 2PX1A 2IEEA 4ECFA 2R71A 3VE1B 1Y20A 4RPOA 4F3GA 3T66A 1US4A 2PT2A 2DWIA 3QAXA 3EHTA 1Z7NE 1PEBA 2DVZA 3TEPA 4F1VA 4KYEA 3Q28A 2PMSA 4OYVA 3B6TA 1JW1A 4MH5A 2H98A 2ZXTA 2Y7IA 3ONMA 5B70A 2F78A 3PUXE 2H99A 2OWSA 3FXUA 1B5HA 1MXWA 4IY6A 3HO7A 1YCJA 2NUVA 1B5IA 2Y7PA 3C36A 1SW5A 4F3SA 2AIXA 3IL1B 1UQWA 1S9TA 4F31B 5K2YA 4E0WA 5AA1A 3E3KA 4C1TA 1EZPA 3IB2A 2O1LA 3MC2A 4FATA 4G77A 3FJMA 3IK6B 3M3KA 3PGFA 2DWHA 3USDA 3I3VA 3RY3A 1YAEA 2QRYA 3KZGA 4Z7EA 5DTBA 1OLAA 4LZ8A 3OEKA 2REGA 2Y7WA 3O97A 1UTBB 3FUZA 1MQHA 4FEBA 3KG2A 3G3JA 1MY3A 4KCDA 2Y7KA 3TTRA 1EZOA 5KCJB 3K2DA 3PV0E 3KFMA 4BDLA 4HCYA 1A8EA 4RK2A 3N6TA 2PT1A 1MY2A 1FQFA 1I6BA 3ZKLA 1VE4A 4RJZA 3CI8A 2F7CA 1SVXB 5B7DA 1EH3A 3TDJA 1H3DA 2ANJA 1Y1ZA 1D9YA 3CSGA 1B32A 4LVQA 4F39A 3FXRA 4M1VA 4GXSB 4YB5A 3V5AA 4DXUA 1N7XA 1N84A 3PMWA 3S9EA 1Z7ME 5DVFA 4KI0E 3H7MA 4OWDA 1MQIA 4TQUQ 3LSXA 4IO5A 4X1DA 1DSNA 3K00A 4PFTA 3BFUA 1Y4CA 1B0LA 1FTJA 4NF8B 1B6HA 4XKPA 4FJPA 3GXAA 2O84X 1UTHA 1H45A 5ITOA 5DYHA 5I2NB 5JK4A 1B3LA 5FHNA 3U93A 2W7YA 1B40A 2F35A 3MBPA 2AL4A 4ELQA 1LCTA 4I9DA 4KYDA 4R2BA 1MQDA 3FJGA 5TP9A 3AXFA 3TTKA 4QSDA 5I2KA 1JVYA 2ZYKA 2GHAA 4GVOA 1WODA 5I84A 3FXQA 1IXHA 3N6UA 1Y3PA 3RN8A 2DE3A 2I49A 4FIMA 3VXBA 1FTLA 1CE2A 1USYH 2QL3A 1MM7A 1NH7A 1B7HA 4H65A 3MWBA 3KBRA 1RYOA 1MXXA 4I62A 3MUQA 1B7UA 1TT1A 3IOWA 1MPCA 3OXNA 2REJA 3B6WA 3EQ1A 2VGQA 2XX7A 3MVZA 4EF1A 4WKMA 5FTHA 1FTMA 1XVXA 5J1DA 4OENA 2RKMA 2LAOA 4GD5A 3TQLA 3M3LA 3DP4A 1H44A 1KWHA 3O6HA 4F2QA 4ZE8A 3DP8A 3ILUB 3EF7A 2DS9A 2HEUA 2V3UA 5H8FA 1MDP1 3G3KA 1R1NA 5CMKA 2ABHA 2RC7A 1IXCA 4BLAA 5H8NA 1IXIA 4F3PA 4NE4A 1P1OA 1R6ZA 4KR5A 1QUKA 2OBGA 2G93A 2GFEA 4X48A 3RQTA 1N3WA 4YB7A 4U1OA 1B46A 4ZE9A 4F1UA 1TWYA 1QUIA 3KJTA 1QJMA 2XXWA 4RXLA 4EXLA 1ZBMA 4ELPA 1YPNA 1J1NA 2Q89A 2H25A 3L6GA 3QXMA 2RCAA 3TKDA 2RINA 3ILTB 1QUJA 2ZNTA 4G2ZA 3A09A 1GV8A 1B51A 3CG1A 1UTHB 3K01A 2OCUA 2X26A 2PYYA 4JXIA 4U2RA 3ECRA 1ZIUA 1NH8A 3W9VA 2QS4A 4NMYA 2P2AA 3IR1A 4OVJA 2V84A 3LSWA 4KQPA 3VVDA 3N26A 4JWOA 1MM6A 5ELVA 3ODBA 4GOTA 4F29A 5HPQA 4H1XA 2RCBA 4OTEA 3KJ7A 3H6UA 5I2KB 2OJTA 1VSOA 3IOVA 3PUVE 5M2VA 1M5FA 4MBPA 4XTCQ 3H3GA 4HCWA 1LLSA 5I56A 1OVBA 1A54A 3TYHA 4OMBA 2D3IA 4PFUA 4MLQA 3IOUA 1MG1A 4F1YA 3HN0A 4QF9A 4YICA 1DTZA 3V89B 1USYE 4OERA 1SBPA 3T22A 4X1BA 3IB1A 2HZKA 2O7UA 1FQCA 2Q88A 3FD3A 5KZTA 2AYSA 2F7BA 3C9HA 4ZZAA 3QIMA 5H8HA 3O6GA 3VLUA 2Z22A 2O7IA 5FTIA 4FORA 3PPOA 4HW8A 3KN8A 3K6XA 3K0VA 2XXVA 2ONRA 2XX8A 5I57B 4GWOA 4IO7A 4ZEKA 4GIZA 2H4IA 2O69A 3G3IA 5ICTA 2Q8JA 1B3FA 3KN3A 3S2VA 3QUJA 2CMOA 2F97A 1UIUA 3KOTA 2QS1A 3IOTA 5TPAA 4BDNA 3W15C 2DWAA 3RLFE 4GXAA 2A5TA 4OXVA 2F34A 2Q9TA 1DMBA 2UVGA 1SW1A 1P1WA 3JZJA 2UYFA 2CZLA 3C31A 4NEDA 4K3FA 2OK2A 4OHNA 4F3BA 3SEYA 4JBZA 3C4MA 3O9PA 1B4HA 4OEVA 4ISUA 4YKIA 1MH3A 4RPNA 3K6UA 1B7ZA 3FVOA 4IO3A 1OLCA 4TOZA 1OIBA 3FJ7A 3CIJA 3SESA 3ZS6A 3TTLA 1B3HA 2XX9A 2BJJX 1LB9A 3PPQA 1IITA 1POTA 3PMXA 1JETA 4QFPA 3OOAA 1FTKA 2B3BA 1POY1 1GVCA 4ZDMA 4IGTA 1XOCA 2ZMBA 3SEVA 5I56B 3R6UA 1QKAA 4GF8A 1JQFA 3T9VA 4BDQA 4JSDA 1HSEA 2Q2CA 3TCFA 3FIRA 3UIFA 3OELA 4C1UA 1A40A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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