3RTFB

Chlorowillardiine bound to the ligand binding domain of glua2
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanisms of Modal Activation of GluA3 Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rtfB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rtfB02
4KFQA 2OZZA 2YJPA 4R9GA 2O7IA 1DTZA 2ZXTA 1B2HA 1US4A 3WAEA 4FEBA 2HCAA 3H03A 2Z23A 3WAFA 2XXVA 4F3SA 1D3KA 1N7WA 3R7XA 2XD3A 2HQ0A 3P7IA 1RYOA 4FAJA 4O3AA 4JWXA 3HN0A 3T22A 2ZYMA 5H8NB 4LZ5A 1N84A 2Y7KA 3RT8A 1FTMA 1D9VA 4GL8A 3W15C 3IK6B 1MY4A 1FQAA 4JXIA 5DT6A 3S9NC 1POTA 2F97A 1AOVA 3LUYA 5CM6A 5I58A 4HW8A 1QUKA 3Q25A 5HBCA 3JZJA 5K2XA 1ZBMA 2GRVA 3IOUA 1OLCA 1OLAA 2H25A 1PC3A 1LFIA 1LAFE 3V8XB 3KFMA 3G7WA 4JWOA 4WKMA 4Q8RA 4DXBA 2DE4A 1IQ7A 3LSFB 1LCTA 4FECA 2QL3A 2QMXA 3M3LA 4U1OA 3G3HA 1LFHA 3JYRA 1MM7A 2HFBA 3O2AA 4YKPA 3T66A 1Z7ME 3OO9A 3FXQA 4M1VA 4EQBA 2GHAA 1SI0A 3CR9A 5I59B 1S7YA 4KPTA 3TQWA 2O6AA 3HPIA 3HHFA 2THIA 4GF8A 2LAOA 3MP8A 4FIMA 4KQPA 4THIA 3FD3A 1WODA 1MQIA 3K6XA 5KDTB 1NL5A 2DP8A 3HHGA 2OJTA 2DWHA 2HZLA 5ISUA 5FHOA 3KOTA 3FVNA 4AB5A 4N07A 3IJOB 3IR1A 3HSTA 3SEWA 4RXLA 3LR1A 2UYEA 1ELJA 1A7LA 3FVKA 1Y3NA 4MH5A 2XX8A 4JSDA 2D21A 2FYIA 1LAGE 1ZIUA 4G77A 4EXKA 4IO3A 1B7ZA 3W9VA 1Y4CA 3KOSA 1SW5A 4G2ZA 2DVCA 5I59A 4NWDA 3B6TA 3M3FA 3K6WA 4XKPA 3ZS6A 5ITOA 1YTVA 5AE4A 2DOJA 2Q2AA 2F34A 3RPWA 2I4CA 2QPQA 2R71A 3SEVA 4ZEFA 2YLNA 4F31B 3BKIB 1TT1A 4AB6A 1A54A 2I48A 1ZLQA 4ELPA 5JK4A 1IZ1A 1CE2A 2A5TA 2RF1A 4BDOA 1MM6A 2F7CA 1GR2A 1LCFA 2XXPA 3PMVA 1T0KA 4I8CA 1R1NA 1MXUA 3PUZE 4U1ZA 4H8IA 1PB7A 1VSOA 3PGFA 1FTKA 2V3QA 3C31A 5IKBA 1N04A 4H1XA 3EN3A 3MBPA 1ZMGA 5TPAB 3MVYA 1JVXA 3E13X 4G8NA 1FQBA 4NF5A 3LSXA 1HSEA 3A09A 5FTIA 4OFLA 1PEBA 1NNPA 3FJMA 3O28A 3MVXA 5DVFA 3SEYA 1I6BA 4AQ4A 4OQOA 3HV1A 1P1NA 2O68A 3CFXA 3GZGA 4MLVA 1POY1 3PV0E 3TTNA 4PFYA 3G3JA 5AA3A 4F2OA 1Q35A 4DE8A 5JTYA 2UVHA 1LLSA 4OVJA 1RYXA 1ZJLA 2Y7PA 3C36A 1I6QA 1P1UA 3RT6B 1B3EA 3IO6A 1SYHA 2IA4A 3IB1A 4GLIA 1LB8A 4KYEA 3RQTA 3ONMA 2IEEA 3IORA 1JW4A 5F1QA 3R26A 1Y3PA 3SDFA 3LC8A 3W9WA 3ECRA 4ZEKA 4H8JA 2O69A 2XXHA 3LSWA 4I62A 4R2FA 4IGTA 1ZU0A 2XXWA 4FEDA 3PPPA 3U92A 3S4UA 2H99A 2ZYKA 5TPAA 3OO6A 3OO7A 5L9OA 4BDLA 4OMBA 2ZMBA 1XHYA 3QK6A 1BIYA 5TU0A 3TCFA 3QIMA 2H98A 3FV2A 4F22A 3TELA 4G8HA 2DWJA 3FZVA 4ZE9A 4LQ5A 5IAIA 1J1NA 2I49A 1LGBC 4ZS9A 1II5A 3VE1B 1F9BA 3G3FA 3O9PA 2OWSA 3N5LA 1TFDA 3TPAA 2D5WA 1IITA 4MFIA 4ZEDA 4KCCA 1PDAA 2WKYA 2ZNUA 1MG1A 1B3FA 2Q88A 2Z22A 3G3GA 1MXYA 1EZ9A 2F36A 2OWTA 4ONYA 1TFAA 5CBRA 5TP9A 4F3PA 5EHMA 3MJNA 4I9DA 2O84X 4DDDA 1QJMA 3UGWA 3GBAA 5DEXA 2V3TA 4BDRA 2DE2A 2FNCA 4F3BA 4ELQA 2UVGA 2GH9A 1LBBA 4NEDA 3RNNA 1FQCA 4PFWA 1DSNA 3K1PA 2H4IA 1USYE 3FATA 1O63A 4QFLA 1VFDA 1B52A 2BJJX 4WEPA 2PVUA 3GLBA 1LAXA 1EZOA 4YZZA 3C4MA 3ZKLA 4GRKA 1M5EA 5I58B 1R9QA 5B70A 4KI0E 2Q89A 4I1DA 4JWYA 1UIUA 3KSXA 5CMMA 3H4ZA 3MQ9A 1PBPA 3KN7A 4IO4A 2XHDA 1IXIA 4UACA 1NMUA 1M5BA 3KGCA 1BLFA 5CBSA 3K02A 2Q8JA 2M8CA 1B40A 2NXOA 5FTHA 1MPBA 4PETA 2F6PA 2VGQA 5AA2A 3MP6A 4QSEA 3LBSA 4BDQA 3C9HA 3VXBA 2DWIA 1Z7NE 2W7YA 5ITPA 4OHNA 1MDP1 1M5DA 3PPRA 1B4HA 1P99A 1BKAA 4G68A 4TQUQ 3ODBA 1B7UA 4X9TA 4OFOA 1OIBA 4YB5A 4POXA 4EQ9A 5L9MA 1NFTA 2PBWA 3TEPA 4HCWA 5DVJA 4PE5B 3F11A 1N0TA 2HXWA 2ZNSA 1KWHA 1QVSA 3KG2A 1B4ZA 2AIXA 2RINA 5A5XB 4OEUA 1SBPA 1YAEA 3TTMA 2UVJA 4F1VA 3HO7A 3TZAA 4H5GA 4F3GA 3M8UA 5JEIA 3CI8A 3OMBA 1B58A 3KJ7A 3Q29A 1URGA 1QKAA 1SVXB 4EF2A 1M5FA 1QUIA 4PFUA 4G8MA 3B6WA 1OQGA 4LVQA 1O7TA 4UA8A 4U23A 4WXJA 5AA4B 2F8DA 2VP1A 3DP4A 4U4SA 3MZBA 4F1YA 2OBGA 3MPLA 1QW0A 4FATA 5FHMA 3RLFE 4OEVA 4IO5A 3EF7A 1Y20A 2Z8DA 4ISUA 3Q26A 1EZPA 3MVZA 3PPQA 3ILUB 1MY3A 4QF9A 1AMFA 3VVDA 3USDA 3SERA 3IB2A 1US5A 1OVTA 3N26A 5BWJA 3C35A 2NVUB 5KCJA 2ANJA 2I3WA 4BDNA 4GVOA 1I69A 1MH4A 4OYVA 3T9VA 2A5TB 4OFJA 5A5XA 1B7HA 2I6EA 3OSRA 2PT2A 1CB6A 4LUBA 4IGRA 5DTBA 1A40A 2XXXA 1H3DA 4DZ1A 2GHBA 4BLAA 4HTGA 3IOTA 4YMBA 1B32A 1B3GA 4EUOA 3UA8A 2I0CA 3U93A 3IX1A 3QUFA 1UTBB 4X48A 3MPKA 5I2NB 5AA4A 3PUYE 1B3LA 2P1SA 3PUVE 4NF5B 4ZZEA 5F7VA 1D9YA 2ESNA 1QUJA 1R9LA 4IO6A 1FCKA 3IAZA 3D4GA 2F35A 1ATGA 2RCAA 2X26A 2F78A 2V93A 2O7UA 3V5AA 1S9TA 5H8FA 4R6KA 5JTYB 3VLWA 1LB9A 1UQWA 2XXTA 3BBRA 1GVCA 5CRYA 3ZSFA 1WVJA 4KHZE 1B51A 1AL3A 4YB6A 4EF1A 4PQJA 1UIVA 4HCYA 4GIZA 3R6UA 2XD2A 2E0SA 5AA1A 3PUXE 4YB7A 3CG3A 4F1UA 4YU0A 4ESXA 2XXYA 1SW2A 1MY1A 1XS5A 1SD3A 1VR5A 4N6PA 4ELOA 3E4RA 4DXCA 1VE4A 1IXCA 2GFEA 3FVGA 1UTBA 1TXFA 5I2NA 4RPOA 4TLMB 1B46A 3OELA 4FJPA 2A5SA 1AH5A 1XOCA 2KLFA 2DXRA 1GTKA 1PB8A 5AA2D 4N13A 3FXRA 4GWOA 2AYSA 3SEXA 3I6VA 4POWA 2O1MA 4LA9A 4DCXA 5CC2A 1UTHA 4RK2A 2QS3A 2HAVA 2Q2CA 1MXZA 2DE3A 1FQFA 4R73A 1H44A 1JEUA 3UK4A 3SKPA 3PPOA 4PP0A 4NF8A 1Y9UA 5I56A 2X7PA 1MXVA 1Y4TA 4OETA 2P0SA 4KCDA 4NF6B 4ND9A 4FORA 3V83A 5TP9B 1SYIA 3H3GA 3TFLA 5HM4B 1FW0A 4X1DA 5DEXB 3QXMA 4IO2A 2PMSA 3CIJA 2DS9A 1R6ZA 2REJA 4OERA 1IIWA 3H06B 2QS2A 4P11A 4YKIA 2OLBA 1NNFA 3D4CA 2VHAA 4EDPA 1B0HA 1N3XA 3OD7A 4Z0IA 3TYHA 3TTKA 5DYHA 1MQDA 3HCQA 5LOMA 2V3UA 4G4PA 2DQVA 2Y7WA 1LSTA 3QYTA 4ZE8A 3CFZA 3L6GA 1FTLA 1MPCA 4OWDA 3EPEA 1QULA 4XKNA 3EQ1A 4F39A 2I0BA 2XXQA 2X7QA 1NNKA 4XKRA 1AIVA 1PBQA 2NUVA 1MXXA 2I3VA 3M3KA 1B9JA 3VLUA 2HEUA 4GOTA 2O1LA 2ONKE 4NF6A 1Y3QA 1URDA 3CVGA 2RKMA 3TUSA 3TQLA 1B1XA 2YPNA 3L6HA 3OXNA 2OCUA 3PMXA 5AA2B 1DPPA 1XC1A 4YKJA 5DVIA 4QRZA 3Q27A 3K0VA 4U4XA 1M5CA 4IY6A 3DP8A 3MP1A 4FE8A 4KYDA 1SW4A 4G68B 3ZKKA 3AXFA 1USYH 3OENA 1XVYA 5L8DA 4R75A 1N76A 2DSFA 1O64A 5CMCA 4P0IA 3K01A 4F19A 3O6IA 3TCGA 1SDXA 2Y7IA 1P1QA 2QRYA 5M2VA 3DELB 1MQJA 3U94A 3QSLA 3IJXB 3H6UA 2VOZA 3Q28A 2RC8A 4U22A 4JBZA 1FQDA 4JB7A 3TCHA 3VXCA 3EHSA 4DCYA 4F2QA 5CMBA 4C1UA 3MC2A 3K00A 3MW0A 4R2BA 3QAXA 3VLVA 2B65A 4GL0A 1JW1A 4GD5A 1H45A 2NOOA 3VVFA 1HSLA 5L9SA 1YPNA 4H6DA 3MZ9A 4DIGA 3I3VA 2DWAA 3UP9A 5ICQA 1JQFA 3C32A 3T9HB 2OK2A 4NE4A 3CSBA 1FQEA 3S9EA 3N6TA 2CZLA 3V89B 2QMWA 3S2VA 3TODA 3RGYA 3PPNA 3B6QA 3FUZA 1FTOA 2Y7RA 3FVOA 4R9FA 1DMBA 2G93A 4R6YA 5KCJB 3SESA 4LZ8A 4QHQA 3BFUA 3CRBA 4ZZAA 4QSDA 5H8HA 3GXAA 3JV9A 3CG1A 3K6UA 3DLNA 3VFJA 2UXAA 4C1TA 3UORA 3KN3A 4MF3A 3U72A 3GBBA 3K1NA 3T9UA 3FGSA 4NF4A 1Q1KA 4YMAA 3FXUA 4RPNA 4ZEIA 1SI1A 4H65A 2B3FA 2NWJA 5FHNA 2QS1A 3FASA 1B5JA 2I4BA 4R72A 3KEIA 1NKXA 1MPDA 3K6VA 4M4GA 3T9XB 3ILTB 4IY5A 4Q5TA 2F6GA 3VVEA 3KJTA 1IUDA 1N3WA 2Q9TA 2H5YA 1D4NA 5H8NA 1DPEA 5CMKA 4LQ2A 4OESA 2VD2A 4F29A 2HAUA 3G3KA 3E3KA 2D3IA 4IB2A 5H8FB 1P1WA 2V84A 3FIRA 4RA1A 4MLQA 3PMWA 1VFEA 5EYFA 1I6AA 4NTLA 5ELVA 3S9LC 3KBRA 4OENA 5HPQA 5H8QB 2CMOA 2UVIA 4GXSB 4XTCQ 5I84A 3O29A 2UYFA 3TKDA 4G68C 5K2YA 3TMGA 2AL5A 4TOZA 3OEKA 5I2KB 3RY3A 3U8QA 4GQOA 5KZTA 3CSGA 3PD9A 1MXWA 3PUWE 2HZKA 4QFKA 3I5OA 4RNSA 1MQGA 4MBPA 3T96B 4R74A 1MY2A 2DVZA 4ECFA 3A3CA 1H43A 1RKMA 1B3HA 2E1SA 4L17A 4H67A 3K1MA 1EU8A 2F5XA 1UTHB 4NWCA 3PU5A 1XVXA 1LBCA 2Y84A 3TTRA 2ONSA 3A3UA 4KR5A 2PX1A 4P0GA 4EXLA 3UIFA 2XXUA 4RK9A 4XXUA 4HS7A 1L5TA 3TDJA 3E9XA 4OZ9A 4NF8B 2VD3A 5H8QA 1GGGA 1B6HA 5I56B 1DTGA 4WEDA 3MVWA 5BUUA 3N94A 2FA7A 5EHSA 1JETA 4F18A 3C34A 5I2KA 5KDTA 4JSOA 1DOTA 3MWBA 1A99A 1A8FA 3OOAA 4TLLB 4DLDA 3RUMA 4O3BA 1GV8A 3K2DA 2QS4A 4H0WA 3O6HA 1B1HA 2PT1A 1H76A 4R6HA 1XT8A 4Q30B 1NH8A 2ONRA 1ZKBA 1BP5A 3H6VA 1A55A 4RJZA 3IO4A 1TWYA 2QJEA 4ZECA 2PYYA 1A8EA 3MUQA 3K4UA 2ZNTA 1Y1MA 3N6UA 3OO8A 4PFTA 4Z7EA 2R9JA 4GFRA 1MQHA 4QFNA 3H7MA 1JNFA 1OVBA 2ALUA 2B3BA 3KZGA 1IEJA 3OSQA 4XKQA 4RYAA 3TTLA 2DYXA 1OQHA 3H6WA 2DXYA 3C33A 3THIA 3BFTA 5CI5A 2Z8FA 1N7XA 1HSJA 4GXAA 4Q0CA 2H9BA 3U1OA 1B05A 4LZ7A 1IXHA 5J1DA 3QUJA 1NH7A 3RN8A 5H8SA 5I57B 3IB0A 3H6TA 4ELRA 3IL1B 2ZYNA 1JEVA 1SW1A 3VDFA 3MAMA 2V25A 4C0RA 3DP6A 3O66A 3UN6A 1MS7A 4OTEA 3TAJA 3S9MC 1FTJA 1SQYA 4IO7A 1JW5A 3O6GA 4K3FA 2F7AA 2ABHA 2R6GE 1IXGA 4OXVA 4YAHX 3IOVA 3OEMA 3CFLA 2REGA 4LATA 2ZYOA 3LSLA 3RTWB 2O51A 1ANFA 4RY1A 3KSJA 4X1BA 4YICA 4BDMA 1OMPA 1P1OA 1LAHE 3EHUA 4U2RA 4YKKA 1MRPA 5I57A 1B5IA 4KYSA 1YCJA 3T93B 1LFGA 5ICTA 3SEUA 1MY0A 2AL4A 4DXUA 2QSXA 1URSA 1JVYA 4U21A 4LP2B 4XIGQ 3FJ7A 1BTJA 4ZEBA 1B5HA 2XX7A 3B7DA 4KD5A 3DM0A 1WDNA 1MH3A 2G29A 1NNTA 4E0XA 4ZDMA 2RCBA 4JDFA 1ZTYA 2RC7A 3EHTA 2XX9A 2XXRA 4E0WA 3G3IA 2P2AA 4NMYA 3O97A 2I58A 1MDQA 4QFOA 1PB9A 4LONB 3RTFB 4QFPA 3SETA 3MZ1A 3KN8A 1EH3A 3PD8A 2RC9A 3VV5A 4EQ7A 1Y1ZA 5H8HB 4ESWA 1S50A 2XXIA 1B0LA 2F7BA 2Z8EA 3FV1A 3FJGA 4QSCA 1QKBA 5B7DA 3IOWA 4NF4B 4O3CA 4H5FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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