4F2QA

Quisqualate bound to the d655a mutant of the ligand binding domain of glua3
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLASGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein/agonist
source organism Rattus norvegicus
publication title The loss of an electrostatic contact unique to AMPA receptor ligand binding domain 2 slows channel activation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 3
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f2qA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f2qA02
3VLUA 2YPNA 4XKPA 3UN6A 1ZBMA 3USDA 3RTWB 1P1UA 1B5HA 3N6UA 1HSJA 3QSLA 2E1SA 3TQLA 4ZECA 5FHMA 3EF7A 1A55A 1MPCA 3TMGA 4HCWA 2REJA 4JXIA 3D4GA 3ZS6A 2PMSA 5I84A 2NWJA 1A8FA 4JDFA 1MM6A 4N07A 3TTLA 1M5FA 1MQIA 3HN0A 3PU5A 3G3IA 4ND9A 3IX1A 5JTYB 3CR9A 3PUYE 2F35A 3FXRA 2LAOA 3KOTA 1SD3A 4PFWA 3KZGA 4G4PA 3S4UA 4YAHX 4NMYA 2VGQA 1LCTA 5I59A 3A3UA 3PD9A 3KSJA 2QS2A 3W9WA 3VVEA 1IQ7A 1UQWA 1P1NA 4R72A 1URDA 2QMWA 3OD7A 1NNFA 1B40A 5CC2A 2ZYMA 4NEDA 2NUVA 3U8QA 2HZLA 1LAGE 1QW0A 3MZBA 5J1DA 3GZGA 2E0SA 3UK4A 2XXUA 1M5EA 3TUSA 3SETA 4TOZA 4AQ4A 2A5SA 3O97A 2OBGA 5CMCA 4F3BA 3RUMA 2DVCA 3MWBA 4XTCQ 4F22A 2RINA 5L9MA 4EQ7A 1NL5A 4OENA 4DDDA 4HW8A 1ZIUA 4JWYA 2QS1A 4I1DA 4QFPA 4XKNA 4F3GA 3IB2A 3I6VA 4YB6A 4KYSA 5I57B 1H43A 1Y20A 5BWJA 1BLFA 4DXCA 3IJXB 5AE4A 1QKBA 4JBZA 3HV1A 1ELJA 2QL3A 3IK6B 1B9JA 4OEVA 3C36A 1R9QA 1GV8A 3KGCA 3OO7A 5H8NA 4PP0A 3PGFA 1PB8A 4KCCA 2UYEA 4ZDMA 4FEDA 4YKIA 2H99A 3MPKA 4IO3A 1QUIA 3WAEA 1MS7A 2ABHA 1MPDA 4QFLA 2F6PA 4BDQA 4GRKA 1Y3PA 3R6UA 3BKIB 3C9HA 3SDFA 5L9OA 4OFJA 2O69A 2RC8A 5AA2B 4NF6A 3C4MA 1F9BA 1L5TA 4F1UA 4NF5B 4P0IA 1PDAA 4I62A 5L9SA 4H5GA 3TPAA 2DE2A 3RTFB 2Y84A 3O28A 3IO6A 2V84A 5BUUA 1LBBA 1M5CA 2AIXA 3RLFE 4RPNA 1JNFA 4NF8A 4BLAA 2X26A 4JWXA 3EQ1A 2ZNTA 3IR1A 3K6VA 4X48A 2DE4A 1TWYA 4O3CA 1AOVA 4YB7A 4R2FA 1DMBA 3HO7A 1XS5A 4EXLA 5KCJA 2H25A 4GQOA 3RT8A 4R75A 1BKAA 3T9UA 3DM0A 2A5TB 3EPEA 1US5A 3K0VA 4KCDA 1US4A 1UTBB 4G68C 4X9TA 1Q35A 2PT2A 3FD3A 3T66A 5AA4A 4EXKA 1D9YA 4F3PA 2HZKA 3TODA 2VD2A 3IO4A 1FTLA 1EH3A 4YICA 1UTHA 1MRPA 3JV9A 4H65A 1LLSA 3TEPA 3VVFA 1H45A 5TP9B 4KHZE 2HAVA 1MDQA 2UYFA 1I6BA 3THIA 3Q28A 1Y1ZA 1JEVA 1B7HA 1I6QA 1ANFA 1N0TA 3KOSA 3DP8A 2NVUB 1AIVA 4YMAA 1I6AA 2OJTA 3MJNA 3TTKA 3T96B 1R9LA 3RGYA 5DT6A 1FCKA 4U1ZA 3GXAA 1N3XA 1LSTA 4R9FA 2F34A 4ZEBA 1B2HA 3TCFA 2NXOA 1MY2A 3O6IA 2Q88A 2Z8DA 4NWDA 5HM4B 2F6GA 4R9GA 3T9XB 1MH4A 5KDTA 2FA7A 3KJ7A 3I5OA 3C32A 4U21A 5H8SA 1PB9A 1T0KA 1A7LA 1GGGA 2HCAA 1B6HA 1B3FA 4LP2B 1CE2A 2F78A 4QRZA 4H0WA 3PPOA 2ZMBA 3EHTA 1ZLQA 4KI0E 3ZKLA 3QXMA 4QSCA 4TLLB 4F1YA 3MBPA 2F7BA 2DXYA 1B7UA 2XXRA 2PBWA 5A5XB 2Y7WA 2XXTA 3TQWA 2I48A 3DLNA 1SI0A 5K2XA 2KLFA 3FJ7A 4RPOA 1ZTYA 2H9BA 2QS4A 2GHBA 3DELB 2QS3A 3K1NA 2RCBA 1FQFA 4OFLA 5M2VA 3TZAA 3E3KA 3I3VA 1LCFA 4TLMB 1JW5A 4YZZA 3ZSFA 1N76A 1MXUA 5AA2D 4E0XA 4EDPA 3OELA 3FXQA 1MY4A 3V83A 1Y3NA 1LAFE 1B1HA 3BBRA 4KR5A 2FYIA 5H8QA 2DWAA 1D9VA 3AXFA 1UIUA 4G8HA 1EZOA 2UVIA 4OQOA 2ONKE 2Y7RA 1ZJLA 1DSNA 1Z7NE 4DXBA 3Q27A 2RC9A 3IJOB 3MZ9A 3CSGA 4GWOA 5I58B 2XHDA 4N6PA 1MPBA 3C33A 4R74A 1LFIA 2REGA 3VVDA 4ISUA 4YKPA 3MP8A 4U4XA 1URGA 3UIFA 4LATA 1GVCA 4BDRA 4AB6A 3GBBA 3H6TA 1Q1KA 4P0GA 1Y9UA 4U2RA 1AL3A 3DP6A 4YU0A 1VE4A 4FE8A 3EHSA 5CMMA 2XXQA 4WEPA 2Q89A 5L8DA 4IO7A 1EZ9A 3H6VA 5CBSA 2ONSA 2HQ0A 3IORA 3SEYA 3TKDA 1HSLA 2Z23A 2F7AA 1SDXA 2PX1A 2DVZA 4IY5A 3KN3A 4RJZA 4WXJA 4IO2A 3MQ9A 2GH9A 3SEXA 3PMXA 3CG1A 5TPAB 2R9JA 3IAZA 1USYE 3PV0E 1B4ZA 3C35A 3B6WA 3K1PA 4R6HA 4M4GA 1B3HA 3PPQA 2B3BA 2F5XA 3HHGA 4ECFA 3A3CA 5I56B 3OENA 5LOMA 1FQBA 3O29A 1FW0A 1CB6A 1IXCA 3B7DA 5AA3A 5JTYA 1TT1A 1MY1A 4XKRA 1BP5A 3FXUA 1Y1MA 4C0RA 3TTRA 3O6GA 4LONB 2G29A 4JWOA 4X1DA 3PUVE 1D3KA 3M3LA 4FEBA 3G3KA 2H4IA 2IEEA 4XIGQ 5ISUA 3T22A 3OO8A 5B70A 4YKJA 3Q25A 5CMBA 1XHYA 1DPPA 1XOCA 3U72A 2AYSA 1R1NA 4AB5A 2Y7KA 2VP1A 1WODA 3N5LA 4U1OA 5FHNA 3VDFA 1NNTA 1MM7A 3IL1B 3P7IA 4EF2A 1FQDA 2QMXA 4N13A 3LUYA 2OLBA 2ZXTA 5F1QA 3K4UA 1N7WA 2CZLA 3SEVA 4FECA 1FTKA 3KBRA 1DPEA 5JK4A 2THIA 1AH5A 2D21A 3KSXA 4OMBA 2F36A 2FNCA 4U22A 2I0BA 4OTEA 5DVIA 3N6TA 3H6UA 4UACA 3FVNA 4EQ9A 3B6TA 3H7MA 3OXNA 1J1NA 3CIJA 2XD2A 3V89B 1SI1A 5I57A 4PQJA 4LZ8A 3FV2A 3UP9A 4OERA 4BDOA 1D4NA 2D5WA 2PYYA 3L6HA 4NF4B 4K3FA 3T9VA 4F2QA 3IOUA 3K00A 1A99A 2XXPA 2AL5A 4ELRA 5EHSA 1RKMA 2DQVA 3Q29A 2Z22A 2VD3A 3TCGA 3IOTA 3OMBA 4GVOA 2B65A 3OSRA 4ZE8A 1NMUA 1FQCA 1LB9A 1XC1A 3U93A 4QF9A 4U4SA 2XD3A 1P1WA 3MP1A 1B5IA 3FVOA 3M3KA 4HTGA 4IGRA 2ALUA 4LA9A 4KYDA 2DWJA 5AA2A 3IOWA 4GD5A 3U1OA 1IEJA 4THIA 4NF5A 4XXUA 1DTZA 3W15C 1B0HA 4MFIA 2VHAA 4IB2A 3VFJA 2X7PA 4KQPA 4R6KA 3RY3A 5DVJA 2RCAA 1XVXA 3MVZA 3MVYA 1OQHA 3VV5A 1B7ZA 4GL0A 4I8CA 2V3UA 4H5FA 3VXBA 2I49A 2O6AA 5DEXB 3KN7A 4C1TA 4PFYA 2Q2AA 2P1SA 3S9MC 4OESA 1SBPA 1ZKBA 4QSEA 3G3GA 3QIMA 1P1OA 1MG1A 2ESNA 2X7QA 2O1MA 1P99A 1LGBC 1LAHE 1POTA 3F11A 4ZEDA 5H8HB 4KD5A 3UA8A 2I4CA 1QKAA 2A5TA 3TAJA 2PT1A 4FORA 4GIZA 1PC3A 1UTBA 2AL4A 3T9HB 3CSBA 4G8NA 4NWCA 1JW1A 3LSLA 1SYIA 4Q5TA 5I2NB 1B46A 1B3EA 1AMFA 3FASA 1N04A 1MQHA 1OVTA 1NNPA 1NNKA 5HBCA 1MH3A 1LBCA 5TP9A 3RPWA 3LBSA 2PVUA 4FJPA 2DE3A 2UVJA 4OFOA 4IGTA 2I4BA 1MXWA 3PUWE 5H8FB 3IB1A 1M5BA 4OEUA 3JYRA 1A8EA 2V3TA 3HCQA 5I2KB 3E9XA 3QUFA 1N7XA 2V3QA 4LQ5A 1N84A 1A40A 2F8DA 2DSFA 4RXLA 2YJPA 4RY1A 2B3FA 2OWTA 1MY0A 1VSOA 5TU0A 2HAUA 1H44A 3H3GA 4GXSB 1PBPA 3QYTA 2ZYNA 3GLBA 4GL8A 4GF8A 1XVYA 3QAXA 2G93A 1JETA 1B5JA 1MQGA 3V5AA 3O66A 1OLCA 1OMPA 3QUJA 3R7XA 1IXHA 4DLDA 4LVQA 2R6GE 2OCUA 2R71A 1SW4A 4HCYA 4F3SA 2I58A 1QUKA 4F19A 3UORA 5DVFA 3TTMA 5ICTA 4F31B 2GFEA 3A09A 1ZU0A 5A5XA 3N94A 1LFGA 3CFXA 3MW0A 2OWSA 4ELPA 4M1VA 3O9PA 3TTNA 3T93B 2DWIA 3CRBA 3CFZA 3ILTB 2XXXA 2P0SA 3LR1A 3EN3A 3VLWA 2Y7PA 4DCYA 2DWHA 1JVXA 2OZZA 3FATA 3Q26A 5I59B 5FTIA 1GR2A 3PPRA 1Z7ME 4GOTA 5DTBA 2QPQA 4H8IA 1MQJA 3H6WA 3OEKA 1IITA 4ZEKA 4H6DA 4DE8A 5EYFA 2Z8EA 2D3IA 4BDNA 1S50A 1IZ1A 4MH5A 1LB8A 2Y7IA 1S9TA 2O68A 1SW5A 1QULA 1IUDA 3ODBA 1FTJA 2I0CA 4LUBA 2V25A 3TDJA 3O6HA 3H03A 4NE4A 1B05A 3LC8A 5I58A 4ELQA 4O3AA 2DOJA 3DP4A 3VXCA 3S9EA 4PE5B 1NKXA 1EU8A 4GLIA 4FATA 1QJMA 2Z8FA 4FIMA 1WVJA 4IY6A 1BTJA 1MXXA 2RF1A 3S2VA 4OZ9A 4NTLA 3LSXA 5IAIA 3FGSA 1H76A 3PPNA 2ZNSA 2XXHA 3ZKKA 3HHFA 1B3GA 2QSXA 3TFLA 3HPIA 4YKKA 5CBRA 3ECRA 3PUXE 3FJGA 5CMKA 4TQUQ 3C31A 3PMVA 5H8NB 3KEIA 4X1BA 3UGWA 4R73A 1H3DA 3MP6A 1SQYA 4RNSA 1MXYA 3MUQA 4JSOA 1P1QA 1B51A 5ELVA 3RQTA 1OIBA 1RYOA 1ZMGA 3TYHA 4I9DA 4LZ5A 3WAFA 1FTMA 4G68B 5TPAA 3VE1B 3GBAA 3B6QA 5ICQA 4P11A 4HS7A 2O7UA 4GFRA 4BDLA 1VFDA 1YCJA 2HEUA 4NF6B 1FTOA 4DZ1A 2IA4A 4XKQA 3SEWA 5I56A 3MAMA 4JB7A 4RK2A 1II5A 4DCXA 3MPLA 2BJJX 1DOTA 3OO9A 3V8XB 3PMWA 1Y4CA 3D4CA 2Q2CA 1MY3A 4Z0IA 3QK6A 4RYAA 4YB5A 1Y3QA 4OYVA 3CFLA 3K6WA 1R6ZA 3G7WA 4NF8B 1OQGA 3SERA 4FAJA 1LAXA 4MBPA 4MLQA 3TCHA 2I3VA 1XT8A 3KJTA 2XXVA 2ZYKA 3FV1A 2OK2A 4OVJA 2QJEA 2XX9A 5B7DA 2UXAA 1PBQA 4G68A 4QFKA 1RYXA 4GXAA 5KCJB 2VOZA 1TXFA 2RC7A 3MZ1A 5DYHA 5AA1A 3FVGA 3CI8A 1USYH 1VFEA 4WEDA 3G3JA 1MQDA 4ELOA 1B52A 1NFTA 3R26A 2V93A 3H06B 3K6UA 4G2ZA 1IIWA 5AA4B 3JZJA 1PB7A 1B3LA 1UTHB 1BIYA 4ZZEA 3SKPA 3KFMA 1UIVA 4Z7EA 3FVKA 2P2AA 4ESXA 3K6XA 5HPQA 4Q30B 1QVSA 1TFAA 3M8UA 3W9VA 4ZE9A 3MC2A 2DP8A 4F29A 1SYHA 2UVGA 1YPNA 4NF4A 4QSDA 2DS9A 1QUJA 3S9LC 3VLVA 1OVBA 4POXA 4EUOA 4BDMA 2O51A 4F1VA 1JVYA 3O2AA 4IO5A 2HFBA 2ANJA 3FIRA 3KG2A 3IOVA 1B1XA 4JSDA 3KN8A 4H1XA 1NH7A 3PD8A 3MVXA 5CRYA 4YMBA 1O64A 4QFOA 3RNNA 2XX7A 3U92A 2GHAA 1NH8A 1JW4A 5KDTB 3HSTA 5FHOA 3OOAA 5IKBA 4O3BA 5CM6A 4H67A 2O84X 3E13X 1EZPA 4EF1A 5KZTA 4QHQA 4E0WA 4ESWA 2NOOA 1VR5A 4KFQA 3E4RA 3PPPA 4LQ2A 1MXZA 1B4HA 2XX8A 2O1LA 1GTKA 4DIGA 1JQFA 3G3FA 4R2BA 3U94A 1Y4TA 4KYEA 2F97A 3SEUA 4ZZAA 3FUZA 4QFNA 4G77A 2H98A 3FZVA 4MLVA 4OHNA 1A54A 4IO6A 1PEBA 3MVWA 5DEXA 4OXVA 3S9NC 4C1UA 4PFUA 1POY1 3K01A 1SVXB 4F39A 4L17A 3ILUB 3RN8A 3M3FA 2ONRA 2HXWA 2QRYA 3EHUA 3OSQA 5FTHA 4WKMA 4RA1A 3ONMA 5H8HA 5ITPA 3H4ZA 1SW1A 4G8MA 4POWA 2CMOA 3L6GA 4F18A 1N3WA 3TELA 2XXIA 3PUZE 3LSWA 4PFTA 4ZEIA 3CVGA 3RT6B 1I69A 1O63A 3OEMA 1TFDA 1IXGA 1HSEA 2DXRA 2XXYA 4EQBA 3K2DA 5I2NA 3G3HA 5CI5A 5H8QB 4H8JA 4KPTA 2GRVA 4R6YA 4U23A 1S7YA 2RKMA 4DXUA 1B0LA 5EHMA 3K02A 3IB0A 4IO4A 2W7YA 1DTGA 5JEIA 2DYXA 5ITOA 4F2OA 3SESA 4Q0CA 3C34A 5F7VA 3BFTA 5H8FA 4UA8A 1WDNA 1M5DA 3CG3A 3OO6A 1MDP1 4OWDA 1KWHA 1YTVA 1O7TA 4MF3A 5I2KA 2XXWA 1FQAA 1LFHA 4ZEFA 1B58A 4ZS9A 2F7CA 2I6EA 4LZ7A 2ZYOA 2Q8JA 1JEUA 2O7IA 2I3WA 1MXVA 2YLNA 1FQEA 2H5YA 2Q9TA 3FJMA 2ZNUA 3K1MA 4PETA 2WKYA 4OETA 1URSA 1OLAA 4RK9A 4Q8RA 1ATGA 3LSFB 4ONYA 1SW2A 1IXIA 2M8CA 3N26A 1YAEA 2UVHA 5K2YA 3BFUA 1B32A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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