4F2QA

Quisqualate bound to the d655a mutant of the ligand binding domain of glua3
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLASGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein/agonist
molecule keywords Glutamate receptor 3
publication title The loss of an electrostatic contact unique to AMPA receptor ligand binding domain 2 slows channel activation.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f2qA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f2qA02
3KEIA 3ILUB 2DS9A 4OWDA 3UIFA 4E0WA 4NTLA 4OTEA 3SKPA 1ZIUA 4R72A 3H6WA 3IOVA 5AA1A 4C1UA 2IA4A 4XXUA 5I57B 4IB2A 3KJTA 1NNFA 2XX8A 1EZOA 2XXPA 4O3AA 5BUUA 1WODA 2I0BA 3EQ1A 3OO8A 4BDLA 2LAOA 4H67A 4YAHX 3QAXA 2F6GA 3P7IA 3DP4A 3I6VA 4G4PA 4JSDA 2F7CA 3MP8A 1B3FA 1BIYA 2XD2A 2Y7IA 4QSCA 3KBRA 1B7HA 1VFEA 4EF2A 5AA2B 1B3HA 2DXYA 4YB7A 3QUFA 3BFTA 1SYHA 2DYXA 1QUIA 1MXYA 3OSQA 3G7WA 2V3QA 2DE2A 4KI0E 1SI0A 1NKXA 3A3CA 2AL5A 3SEUA 3N5LA 3O6GA 4GIZA 5H8NA 3V5AA 2F8DA 3G3JA 1LAXA 3V8XB 3MZBA 2V3TA 1SW5A 3FD3A 1IEJA 2Y7WA 4KYSA 1N3XA 3IOTA 1Y4CA 3IAZA 3W9VA 3MUQA 1YPNA 3HV1A 3UK4A 3M8UA 1PEBA 1XS5A 2D5WA 2R71A 2XXUA 3G3KA 4N07A 5FTHA 4Z7EA 4DCYA 4IO6A 1PB9A 3O29A 2F36A 4G2ZA 1ZLQA 3T9HB 4RK2A 3K1PA 4QFPA 1O63A 5HPQA 4OFJA 2PMSA 4M4GA 4XKPA 3FASA 4U4XA 5H8FB 3MVXA 5AE4A 5I59B 5ICTA 1MQIA 3S4UA 1IITA 3TODA 2ABHA 4UA8A 4QF9A 4JDFA 1I69A 1JVXA 4LZ7A 2XXRA 2Z22A 3KFMA 2I4CA 1N0TA 3SEYA 5JEIA 4EUOA 2B65A 5I57A 1H43A 4QSEA 1DSNA 1O64A 3QUJA 4NF4B 1DPPA 4DXBA 1ZBMA 1URSA 3OXNA 4MH5A 2QS1A 4DDDA 3C34A 1MH4A 4FEBA 1XHYA 3FXRA 4YICA 4BDQA 3PUXE 2H5YA 5DTBA 1SW2A 2NXOA 1LCTA 3WAFA 1Q1KA 1YAEA 4OERA 4Q8RA 4ZEFA 3U1OA 1MM6A 3PD8A 4DE8A 1MRPA 3HHGA 2UVGA 4EF1A 5CM6A 5AA2A 4OFOA 1OVTA 5CMCA 1POY1 3ZKKA 4IGTA 1SBPA 2Q9TA 5ICQA 3KN8A 2ONSA 4R6HA 3HSTA 4ZZEA 3OEMA 3TEPA 4GFRA 2OZZA 2CMOA 1NMUA 2F7AA 4U1ZA 2P1SA 2Z8EA 1LBBA 1US4A 3IB1A 2PYYA 4ZDMA 1PB8A 4F31B 2RC7A 1DTZA 1B58A 1QVSA 3A09A 3FUZA 1B3GA 2REGA 1UIUA 3MZ1A 3UORA 4ELRA 3PU5A 3EHSA 2QPQA 3BFUA 1URGA 2X26A 2H98A 3MBPA 2R6GE 3CRBA 3SEVA 2RF1A 5HBCA 1OQHA 1UIVA 1US5A 5I56B 4OETA 2HZLA 1H76A 1JQFA 4H1XA 4NWDA 3PMVA 4IO7A 5H8FA 3C33A 5I59A 3KSXA 4MF3A 1NNTA 1MDP1 1USYH 1IUDA 4R74A 1Z7ME 3L6GA 1XOCA 2QS2A 1HSJA 3LUYA 4PFWA 3T22A 3RN8A 1P1UA 1Y20A 4OEUA 4XKNA 2H25A 3MVYA 1BKAA 1HSEA 1AH5A 1B0LA 1MY2A 3CIJA 1MXXA 3T9UA 1XT8A 4U4SA 1B7ZA 2UXAA 3U92A 1MPCA 1O7TA 4G77A 4O3CA 1A40A 4F22A 4ESXA 1MXUA 3OENA 1FTOA 3CG1A 4ZEBA 1I6AA 2XD3A 4GXAA 2I58A 1FTLA 1EH3A 1AOVA 4YB6A 3PGFA 4OMBA 3H4ZA 4RA1A 4R2BA 3WAEA 4FE8A 1GTKA 4FIMA 1R9QA 2QS4A 4I9DA 3AXFA 4PFYA 1JNFA 2P2AA 1P1QA 4QHQA 5EHSA 1N3WA 4YKJA 4FAJA 4HW8A 1VSOA 3GLBA 4OHNA 1FTJA 4P0GA 1FTMA 1A55A 1CE2A 4U23A 4KCDA 1CB6A 3B6QA 4X1BA 3JZJA 5H8HB 1IXGA 2UVJA 3KN7A 4F1VA 3VVDA 5DVJA 2I6EA 5I2NB 3TTKA 3KN3A 4WKMA 3RLFE 3T9XB 2QL3A 5I56A 4GL0A 3IO4A 5B70A 4YMAA 4BDMA 4FECA 2Z23A 3TFLA 2O6AA 2O7UA 3OEKA 3JV9A 2PX1A 4NF8B 4H0WA 3KSJA 3KOTA 4Q5TA 5CMKA 3EF7A 3N6UA 3A3UA 1PB7A 1NFTA 3RTFB 4OESA 3FZVA 3RT8A 1MY0A 1DMBA 3OO7A 4ZS9A 1EZ9A 3LR1A 4IGRA 3G3IA 1GV8A 1M5CA 1MS7A 2Q89A 4LQ5A 3QK6A 2FNCA 1P1OA 4IO2A 4KYDA 3KG2A 3HO7A 1RKMA 2R9JA 4R6YA 4ZE9A 3FIRA 4H8IA 5L9MA 4YKIA 1Q35A 3EHTA 2RCAA 1TT1A 3FVOA 4LP2B 3TQLA 5AA3A 3TYHA 1LBCA 4JBZA 3FVGA 2AIXA 5DYHA 3MP6A 2YPNA 4U21A 2HZKA 4TQUQ 3TCGA 1FQAA 3JYRA 2RINA 1DTGA 1MQGA 2RCBA 2RKMA 3SERA 1ZTYA 2REJA 4RPOA 3O28A 3K6XA 4R73A 2AL4A 2YLNA 3W9WA 3PUYE 4RNSA 4KCCA 4ONYA 3LSFB 3V83A 1R1NA 4BLAA 4PP0A 2H9BA 1B3LA 3IB2A 2YJPA 4F3PA 3PD9A 2HFBA 1N76A 2D3IA 1QKBA 4YZZA 3N94A 2ZYOA 1GGGA 4RPNA 4HCWA 3HHFA 1FQFA 3I3VA 4ZECA 3MAMA 5I2NA 1RYXA 4DCXA 2ESNA 4NWCA 4M1VA 4ZE8A 5KCJB 4F2QA 4OEVA 1PDAA 3B6TA 1MY3A 1AMFA 5L9OA 3IJXB 3EHUA 3SEWA 3CSGA 1B4ZA 1ZJLA 5AA2D 3DELB 3K1NA 3SETA 2PVUA 2HAVA 4K3FA 2X7QA 1PC3A 4EQ7A 1SVXB 1A7LA 3E3KA 2I49A 3VXCA 4OYVA 1MY4A 4F1YA 1D9YA 3I5OA 3OMBA 3TPAA 3Q28A 4RY1A 5CI5A 2O51A 3MJNA 1WDNA 1B51A 4RJZA 1UQWA 1TXFA 2O84X 5TU0A 4POWA 2DXRA 4DXCA 4PQJA 1FTKA 1MH3A 3Q25A 1QUKA 3SEXA 4YB5A 1JEVA 4FATA 2XXQA 2O69A 1LAHE 4H6DA 1OMPA 3SDFA 1PBQA 1FCKA 1B7UA 3MPKA 4IY6A 2XXIA 4NMYA 2UVHA 2DVCA 3PMWA 1B5HA 3MPLA 3S9NC 5ISUA 3RGYA 3M3KA 2D21A 4XIGQ 5EHMA 3G3FA 3GBAA 5ITPA 3FXUA 4PE5B 3R26A 2V3UA 4DLDA 3S9EA 4OZ9A 3M3LA 2Z8DA 1BLFA 1TFAA 1LAGE 3OSRA 2QJEA 5H8QB 1F9BA 4F3SA 3FXQA 1BP5A 1VFDA 5DVFA 3H7MA 3VFJA 4Q0CA 2F35A 3IK6B 2GHBA 4EDPA 5CMMA 4YKPA 3HN0A 1S50A 4LVQA 3PPNA 3RTWB 1B9JA 2Y7PA 2OCUA 3PPOA 5KCJA 3E4RA 3DLNA 1OVBA 1JVYA 3PUZE 1B1HA 3MVZA 4RK9A 1OLCA 5CBSA 4X48A 2QMXA 1JW4A 2XX7A 4R6KA 2ZYNA 2DVZA 5H8SA 3PPRA 3HPIA 3LSWA 4LONB 1MQHA 4MLVA 1OQGA 3RY3A 5HM4B 1QJMA 4AQ4A 4U2RA 3EPEA 3B7DA 3KOSA 4G8MA 2F34A 3E9XA 5DEXB 4ELQA 3E13X 1I6QA 1UTHB 5ELVA 3IX1A 3O6IA 1OLAA 4NF4A 4F39A 4DZ1A 1S9TA 2ONRA 5KZTA 4QFNA 3PUVE 4KYEA 2PT2A 4JWOA 5I58B 5FTIA 4BDNA 1H44A 4KHZE 4ECFA 3IORA 3N26A 4QFLA 1JETA 3RNNA 2QRYA 1N7WA 2Y84A 2O1LA 2OLBA 4KFQA 3TTNA 4NEDA 1POTA 3SESA 1T0KA 2W7YA 2HQ0A 1A99A 4PETA 5LOMA 1ATGA 1QW0A 1LFIA 4GOTA 4GLIA 3ODBA 4THIA 5F7VA 3CR9A 3MQ9A 5A5XB 1Y9UA 2NUVA 4R9GA 3FJMA 2FYIA 3QIMA 1B3EA 4RXLA 1II5A 3LSXA 4IO4A 1J1NA 1LSTA 5H8QA 1A54A 2IEEA 1GVCA 2QS3A 4F18A 4G68B 2O7IA 1ZKBA 1BTJA 2Z8FA 1H3DA 3K00A 4LZ8A 2DWJA 3L6HA 3OO9A 2H99A 1Y4TA 4UACA 1ELJA 1Z7NE 4I1DA 4NF6B 5CBRA 1I6BA 1RYOA 1XVYA 4GQOA 4ELOA 3RT6B 2OWTA 4IO3A 1P1WA 3IO6A 5CRYA 2A5TB 1N04A 2XXYA 1S7YA 4DXUA 1B52A 1SI1A 2F78A 1M5DA 1M5FA 3H03A 3T93B 2THIA 4GD5A 4X9TA 1SDXA 3K02A 3OELA 2PBWA 3KGCA 3Q29A 1AIVA 3MW0A 2GH9A 5KDTB 1AL3A 3OOAA 4NE4A 2Q2AA 4JWYA 4HS7A 1MXWA 2XXWA 1PBPA 4ZEIA 4BDRA 4ND9A 3T66A 1IZ1A 3CG3A 2VD3A 4LATA 2ZYMA 1NL5A 3CFXA 4ELPA 4F19A 3K0VA 4MBPA 5DEXA 3U72A 3U94A 1UTHA 2I0CA 2VGQA 3PUWE 3DP6A 1SW1A 5DVIA 5I2KB 2Q8JA 5K2XA 2HXWA 1B1XA 1GR2A 3TELA 5I58A 2AYSA 2O1MA 4R2FA 1N7XA 1MDQA 3KZGA 1LCFA 4MFIA 4O3BA 5I84A 1SQYA 3HCQA 4NF5B 5L9SA 1OIBA 3IL1B 3ILTB 2G93A 1B6HA 2ONKE 2ZNTA 3H6TA 3UN6A 2RC8A 1B05A 4LA9A 4JB7A 3H6VA 3VE1B 3TCFA 3N6TA 5A5XA 2DP8A 4Z0IA 2OBGA 2DWIA 2UYFA 2GRVA 2V25A 3IOWA 5ITOA 2KLFA 1IIWA 1FQBA 4L17A 2PT1A 4G68A 1MG1A 4IO5A 1MM7A 3CFLA 3MVWA 4DIGA 1B32A 4F1UA 2I4BA 1XVXA 5H8HA 4IY5A 1MXZA 1EZPA 2VHAA 4FEDA 3R7XA 4ZEDA 3H06B 4H5FA 1WVJA 2ZNSA 4NF6A 3PPPA 2ZNUA 4P11A 1EU8A 1Y1ZA 3MZ9A 1MY1A 2I3WA 4AB5A 5IKBA 2CZLA 3B6WA 2A5TA 4YKKA 3Q26A 1B46A 4G8NA 1JW1A 4OXVA 3K01A 2NVUB 2Q88A 1N84A 3K6UA 3R6UA 3CVGA 1LFGA 2XX9A 4NF8A 1NH7A 3T9VA 5KDTA 4F3GA 3C4MA 2F5XA 1Y3QA 5TP9B 3D4GA 2XXHA 4LZ5A 3VLVA 3K4UA 2NWJA 4LQ2A 3O66A 4RYAA 3Q27A 2WKYA 1ZU0A 3CSBA 3TTMA 3VLUA 3TMGA 2DE3A 3C35A 1USYE 4OVJA 5JTYB 3VDFA 4U1OA 2VP1A 2X7PA 3IR1A 5I2KA 4WEPA 3USDA 5J1DA 3QSLA 4MLQA 4H65A 2O68A 4R9FA 2XXTA 1MQDA 2GFEA 5CMBA 4QFOA 4EXLA 3G3HA 3VV5A 1UTBB 4X1DA 4NF5A 1ZMGA 3PPQA 1FQCA 2GHAA 3MWBA 1B40A 3VLWA 3FATA 5L8DA 2H4IA 2P0SA 1IXIA 3K2DA 3VXBA 1Y1MA 4FORA 3T96B 4JXIA 3LSLA 2UYEA 3IB0A 1QUJA 3FV2A 4GF8A 5M2VA 3ZKLA 1QKAA 3D4CA 1P1NA 2DWAA 3TUSA 4G8HA 5AA4B 5FHMA 3TZAA 3H6UA 2G29A 3ONMA 3O2AA 4GRKA 3THIA 5FHOA 3U93A 3MC2A 1LAFE 4XTCQ 3MP1A 1XC1A 2QSXA 3GXAA 2F97A 3EN3A 4ZZAA 4F29A 2HAUA 4OENA 1MQJA 3C32A 2HEUA 3C31A 4KR5A 1KWHA 3QYTA 3ZS6A 3KJ7A 2ANJA 5K2YA 2B3FA 3M3FA 1VE4A 4N13A 5TPAB 3FV1A 3GZGA 4GWOA 2F7BA 1P99A 4PFTA 3UP9A 3GBBA 5EYFA 2V84A 1SD3A 3ECRA 3U8QA 3C36A 1M5EA 5DT6A 1YCJA 1VR5A 4C0RA 1R9LA 1TFDA 4EQBA 2I3VA 4KD5A 1Y3PA 4P0IA 5TP9A 4TOZA 2XXVA 4I8CA 2OWSA 3VVEA 3O97A 4AB6A 1LB8A 1D9VA 3UA8A 3K1MA 4KQPA 4FJPA 3TTRA 4GXSB 2ALUA 1H45A 1JEUA 3G3GA 1IXHA 4HTGA 5JTYA 1URDA 1B2HA 3LBSA 4EXKA 3BKIB 4TLLB 5FHNA 4GVOA 1LFHA 1DOTA 4HCYA 3ZSFA 3CFZA 1ANFA 4N6PA 4YMBA 3TDJA 2HCAA 2E0SA 3S9LC 4WEDA 3H3GA 5F1QA 1R6ZA 2RC9A 1FW0A 4H5GA 2V93A 4ZEKA 1UTBA 4H8JA 3DP8A 4TLMB 3K6WA 3K6VA 1D4NA 1LLSA 2FA7A 2XXXA 3DM0A 3FGSA 3RPWA 5CC2A 1A8EA 1L5TA 3CI8A 3V89B 2B3BA 2OJTA 2ZXTA 4POXA 1MPDA 5IAIA 2Q2CA 1NNPA 1LGBC 3RUMA 2NOOA 4BDOA 3TQWA 1B5JA 4I62A 3IOUA 5AA4A 1TWYA 4QRZA 3TKDA 1IQ7A 2E1SA 1QULA 3BBRA 1B4HA 3FVKA 1MPBA 4JSOA 3OO6A 3UGWA 3S2VA 4Q30B 1MXVA 1NNKA 1M5BA 4GL8A 4KPTA 2M8CA 4ISUA 3IJOB 4LUBA 2ZYKA 2F6PA 3RQTA 1A8FA 5TPAA 1NH8A 1B0HA 2Y7RA 4XKRA 4XKQA 2VD2A 3W15C 4EQ9A 3LC8A 4OQOA 1D3KA 2XHDA 3O6HA 4PFUA 4F3BA 3F11A 3TTLA 3TCHA 2QMWA 1JW5A 5H8NB 5JK4A 4QSDA 2I48A 4E0XA 3PV0E 4C1TA 2ZMBA 4OFLA 2DSFA 2BJJX 3FJ7A 2OK2A 2A5SA 4G68C 1IXCA 2DE4A 2Y7KA 4U22A 1B5IA 1DPEA 1LB9A 3QXMA 4YU0A 4ESWA 3C9HA 4WXJA 3VVFA 2VOZA 4QFKA 5B7DA 1FQDA 2UVIA 1SW4A 2DQVA 1HSLA 3OD7A 4F2OA 1YTVA 1FQEA 5BWJA 3S9MC 3O9PA 3PMXA 2DWHA 1SYIA 4JWXA 1Y3NA 3TAJA 4R75A 2DOJA 3FJGA 3FVNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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