5I58B

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-004
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
279
structure length
277
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 76
structure length 277
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i58B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i58B02
3S9MC 3TUSA 2NXOA 3K4UA 4KI0E 1MG1A 3IAZA 3SEVA 1SI1A 5HPQA 5KCJB 3Q29A 1D9VA 3KN7A 2OK2A 3K02A 1ANFA 2UXAA 4G68A 3VVEA 3IB2A 2QS2A 4H5FA 3TQWA 4OFJA 2Y7KA 1LFIA 4JWYA 1JQFA 3UN6A 3TMGA 4RJZA 3OO8A 4N13A 3EHSA 3S9NC 5L9MA 1PC3A 1USYH 2Q2AA 1MQHA 4ZZEA 4DXUA 1A40A 4NF4B 3E9XA 3RLFE 1SQYA 3Q28A 4JBZA 3THIA 2O7UA 3KOTA 4XIGQ 3RN8A 2CMOA 1A8FA 2B3BA 2QMWA 2X26A 3TPAA 3I3VA 3SEYA 4QFPA 1EZ9A 3QK6A 3CG3A 4ZEFA 5HBCA 1NNTA 2D3IA 2GRVA 1DOTA 1B5JA 2F7CA 4FAJA 4OVJA 1FQDA 2UYEA 4PFTA 4ZZAA 3KGCA 1IUDA 5DTBA 2DWIA 2WKYA 3H6WA 1B3EA 4OYVA 1PB7A 4X1DA 2HCAA 3IK6B 3PU5A 4LQ2A 1YTVA 1FQAA 4U2RA 4F1UA 3IOWA 2O68A 3QUFA 2OWTA 3OSRA 2UVIA 1NNPA 1SDXA 5ELVA 3LR1A 2RINA 3M3LA 1S50A 2LAOA 3PPPA 5AA1A 2Y7IA 1B4ZA 4NWCA 5DVJA 1MXVA 2GH9A 1B3FA 5ISUA 3KZGA 3O6IA 1M5EA 1SD3A 3IX1A 5AA4A 1Y1ZA 2OBGA 3T66A 4P0GA 2YPNA 2ONSA 1JW1A 4TQUQ 4LZ8A 2REGA 2QS4A 3U92A 3OD7A 3LBSA 2NUVA 1B2HA 3S9LC 4EUOA 1B51A 2F78A 1Y3NA 4WEDA 3K1NA 5H8QB 3L6GA 4WXJA 4ONYA 3OO9A 5L9OA 2H25A 4RXLA 2IA4A 1FCKA 3WAEA 4QF9A 3T22A 1VE4A 2XXRA 4POXA 1JETA 2NWJA 5IAIA 1Y3PA 1DPEA 3K6WA 3IB0A 4NF6B 5AA2D 2VD2A 1UIVA 5I56A 1P1UA 1B7UA 4O3AA 1VFEA 4EQBA 3HSTA 5KDTA 3PUZE 2O69A 3PMXA 1B40A 1R9QA 1OLCA 1FTLA 3OEMA 2Z22A 2DP8A 2I4BA 3SETA 3L6HA 4PQJA 1WDNA 3MVYA 3TQLA 1US4A 3HHGA 1DTZA 2UVHA 3UP9A 2UYFA 2HEUA 1M5CA 4TOZA 2XXQA 1OLAA 2QPQA 4KD5A 1QJMA 3A09A 2FYIA 4N07A 5TPAB 2I3WA 1LBCA 2Q89A 2O1LA 2X7PA 4G8MA 3EPEA 4E0XA 1WVJA 1XC1A 4OQOA 3HV1A 3B6WA 4PFUA 4Q30B 3G3FA 3FD3A 2HZLA 3TODA 4ZEKA 1UTBA 2ZYKA 1OQHA 4OENA 1N0TA 3OEKA 4YB5A 2V3QA 4QRZA 4ZEBA 1Q35A 3VVFA 3FZVA 1Z7NE 1P1WA 4G8NA 4KCDA 5I59B 3LSFB 1Z7ME 3O28A 3MZBA 5CBRA 2NVUB 3DP4A 3USDA 3ILTB 2KLFA 1MY0A 5DYHA 3IO4A 1FQEA 1I6BA 1N3XA 4FJPA 4RPNA 3U72A 4LATA 4RNSA 3S2VA 4U4SA 2AL5A 1F9BA 1I69A 1PB9A 3CSGA 2Y84A 2HAUA 3MVXA 4OEUA 3RTFB 3H03A 1S7YA 3B6TA 5H8FB 4OERA 1FQCA 1I6QA 4Q5TA 1TT1A 4THIA 3H7MA 2BJJX 5DEXA 1URDA 3FJMA 5EHMA 4H5GA 2AYSA 3JYRA 3PGFA 1MXXA 4KR5A 4F22A 4XKRA 2QS1A 3MVZA 5FTIA 4IO6A 5KCJA 4IY6A 4YB6A 3O2AA 1MH4A 2DS9A 1D3KA 3C36A 3VVDA 1H44A 1VSOA 5I2NB 4OFLA 2I3VA 5AA2B 4BDQA 3OO6A 4F3BA 4HTGA 4H8JA 4YKPA 3H6UA 1POY1 4R9FA 2DQVA 1BIYA 3MP8A 3IB1A 3ECRA 2Q9TA 2Z8DA 3SKPA 3T9XB 4XTCQ 2I0BA 4IO3A 1MM7A 3TFLA 1YPNA 5IKBA 3PUVE 3KG2A 5H8NB 1Y9UA 1JEUA 4AB6A 4R73A 4GD5A 1EH3A 3MW0A 4NF4A 1LAGE 4XKPA 3VLUA 1B6HA 4YU0A 1LFGA 4E0WA 1AIVA 3TTNA 3RQTA 4KYDA 2B3FA 5L8DA 2ANJA 4M4GA 1NMUA 2Z8EA 4YAHX 3V8XB 1USYE 2XXUA 4ELRA 1MY3A 2RKMA 1H3DA 1IEJA 1R6ZA 1IQ7A 4MH5A 3DP8A 3KJ7A 4BDOA 4OXVA 3OO7A 4RK9A 1R1NA 3S9EA 4ISUA 5ITPA 3C4MA 3MC2A 4PFWA 5TU0A 4ELQA 1MM6A 4U22A 1XS5A 2Q88A 3MZ1A 2I58A 1WODA 4ECFA 3SEXA 4JB7A 4JDFA 5TP9B 1M5FA 4GF8A 1P99A 4GRKA 1QKBA 4EF2A 2Z8FA 3O97A 2PYYA 4HCYA 1ZU0A 5AE4A 1FTJA 2ZXTA 3DP6A 3HCQA 3C35A 3TCHA 1IITA 1B46A 5HM4B 1VR5A 5I2KB 3PUYE 2P1SA 2F7BA 2F35A 3SEWA 4H0WA 2Q2CA 1J1NA 3PUWE 4NF8B 2RC9A 1XVXA 4OTEA 5CRYA 4C1UA 1I6AA 3N5LA 3G7WA 3FGSA 3C33A 1LAXA 3OSQA 4R2BA 4F29A 2PX1A 3ZSFA 1PDAA 2RF1A 2DE3A 1MQGA 3F11A 4R6HA 3N26A 5H8QA 1LB9A 1XVYA 2XXHA 3H6VA 4F2QA 1URGA 4UACA 3QUJA 4GLIA 3I5OA 1XT8A 1SW5A 4OWDA 1Y4CA 3OENA 2DOJA 4DCXA 4ND9A 1B0HA 1SW2A 1JEVA 3VXCA 1NH7A 1B5HA 4G2ZA 2XXIA 2XXWA 2QSXA 2Y7PA 5CMMA 1DPPA 4NF6A 1PEBA 3W9WA 3IL1B 1FQFA 1LLSA 3IOVA 5DT6A 1Y1MA 4NF5A 3AXFA 4BLAA 1ATGA 5M2VA 4TLMB 2XX9A 3KN8A 4I8CA 1BP5A 1Q1KA 1B52A 3IORA 3RGYA 4OZ9A 2O7IA 4JWOA 3M3FA 3N6TA 2NOOA 5I58B 3O66A 2VHAA 4GOTA 4ZEDA 2DXRA 3PPNA 2OZZA 3UIFA 1XHYA 1MPCA 1B5IA 3HPIA 4TLLB 3FATA 5BUUA 4KYEA 1QW0A 4QSEA 2OCUA 4F39A 5F1QA 1SYIA 1P1QA 2FA7A 5BWJA 2E1SA 1IIWA 3VLVA 5EYFA 1R9LA 5TPAA 1LAHE 3QSLA 1AH5A 2DXYA 1CB6A 1MXYA 1IZ1A 4GIZA 4RY1A 3PD9A 4KHZE 3FJGA 3CRBA 3PD8A 4KFQA 1B0LA 2XXTA 4GL8A 3BBRA 1UTHB 3MPKA 4LVQA 4QSCA 1B3HA 4RYAA 4BDMA 1GVCA 2XXVA 3A3UA 3MP1A 3ZKKA 4LQ5A 1B7HA 1B1XA 3RTWB 3TELA 3RY3A 1DMBA 3D4GA 5I59A 4LA9A 1VFDA 4ZE8A 4NF5B 1JNFA 2A5TB 1ZJLA 3K0VA 2DYXA 3VE1B 2AIXA 4IB2A 3CFXA 4POWA 5L9SA 3E3KA 3IO6A 3IJOB 3S4UA 2GFEA 3MJNA 2OJTA 3FVKA 3G3KA 3N6UA 3PUXE 1GR2A 3QAXA 3C9HA 4FE8A 1JW5A 4QFKA 3O6GA 3PMWA 4DE8A 3B7DA 5H8FA 3K00A 1QUIA 4F2OA 2DVZA 3T9HB 2DVCA 1ZKBA 1RYXA 2OWSA 3P7IA 3T9UA 3IOUA 1RYOA 1MDQA 3ONMA 4XKQA 3TDJA 4O3CA 4EQ7A 4Z7EA 5JK4A 3FV1A 5H8HB 4QSDA 1LAFE 2XX8A 1QUJA 1OVBA 3TYHA 5I2NA 4PE5B 3Q25A 1SBPA 1MXWA 4NWDA 1OIBA 5AA2A 3V89B 3TTKA 3FXQA 4WKMA 1AMFA 4PP0A 4MBPA 4G8HA 3PPRA 3U8QA 3FXRA 3A3CA 4DXBA 1BKAA 4QHQA 4F19A 1P1OA 1SVXB 1EZPA 2HZKA 3TTMA 2QJEA 1A55A 3U1OA 3H06B 3ZS6A 1B3GA 3MQ9A 4LZ7A 2HQ0A 5ICTA 5DVIA 5H8NA 4R74A 2F34A 4I9DA 3TAJA 3K6VA 4LONB 2F36A 2X7QA 4X1BA 2DE4A 4H1XA 1URSA 1M5BA 2QL3A 3GLBA 4Q0CA 3FVOA 3MAMA 1M5DA 2PT1A 3RT6B 4OESA 2UVGA 4EXKA 5CBSA 4EXLA 4FIMA 2I4CA 5H8SA 2P2AA 2P0SA 3OXNA 3QIMA 5AA3A 2R6GE 4OETA 3EHUA 1FTKA 4BDNA 3HN0A 1O64A 3R6UA 4R72A 1H45A 4AQ4A 2OLBA 2PVUA 1A99A 3JV9A 3OOAA 2DSFA 2VOZA 5TP9A 4BDRA 4RPOA 1HSEA 2QS3A 3CFLA 5CMCA 1BLFA 1ZLQA 2RC7A 2F97A 2O51A 5I2KA 2PMSA 4IGRA 3CIJA 4H65A 3G3GA 3KJTA 4YKIA 3MBPA 1T0KA 2I49A 2XHDA 4NF8A 1SW4A 4IY5A 1CE2A 4I1DA 3TZAA 3TKDA 4XKNA 2ZMBA 4N6PA 4OEVA 1LCTA 2R71A 1L5TA 4R9GA 2E0SA 4JSDA 3H6TA 3IR1A 2DWJA 4FORA 1KWHA 3G3JA 3IOTA 3MPLA 1HSLA 3PMVA 3RNNA 3FASA 4YICA 4LUBA 1YCJA 4ZS9A 4DZ1A 1SW1A 1IXIA 4MLQA 1JVXA 3H3GA 4F1VA 4NEDA 5JTYB 1Y20A 1GV8A 4AB5A 1Y3QA 4ESXA 1MPBA 2ZYMA 5I84A 3DELB 3K1MA 4MFIA 3H4ZA 3BFTA 1B7ZA 3VFJA 3W15C 3M3KA 2V84A 2DE2A 4GWOA 1UIUA 5I57A 5I58A 1TXFA 3EF7A 2HFBA 2O1MA 3GXAA 3DLNA 1LBBA 4GQOA 2ZNSA 1MXUA 1JVYA 1NNKA 3D4CA 4GXSB 1PBQA 4Q8RA 3QXMA 4G4PA 2G29A 3FXUA 3FIRA 4NMYA 2XD3A 3VDFA 1O63A 3B6QA 4O3BA 2ONKE 4FATA 2AL4A 4FEDA 3I6VA 3PV0E 4LP2B 3GBAA 1NH8A 3BKIB 4YKJA 2V3UA 5B7DA 3MP6A 2Y7RA 4DCYA 1UTHA 5ITOA 4R6KA 4ZE9A 5CI5A 4G77A 1PBPA 3IJXB 3MZ9A 3SERA 3SEUA 3CG1A 4U1ZA 4UA8A 3SDFA 1LSTA 4ZDMA 2ABHA 3UA8A 1IXHA 3PPQA 4KYSA 1A54A 2G93A 2A5TA 2YJPA 1B1HA 4YB7A 1N84A 3KN3A 3LSLA 3LSWA 2FNCA 3FVNA 3UK4A 5A5XB 1TFAA 4FEBA 4F3PA 4F3GA 1Y4TA 5I57B 1N7WA 3TCFA 3FV2A 1LGBC 3M8UA 2O6AA 1FQBA 2M8CA 1D9YA 3TCGA 4IGTA 5DVFA 4RA1A 3KEIA 3PPOA 1B58A 1FTMA 4ELPA 4ESWA 2I0CA 2ONRA 3CVGA 3V5AA 3GZGA 1BTJA 4LZ5A 5EHSA 3RUMA 1MY1A 4G68B 3K01A 1H43A 1B9JA 1QULA 4MLVA 4EDPA 2VGQA 4IO4A 2I6EA 3Q26A 5LOMA 1DTGA 2D5WA 4U1OA 2F5XA 4BDLA 5FHMA 3UORA 1S9TA 2B65A 4R2FA 5H8HA 3RPWA 3OMBA 4PETA 4U23A 4JXIA 1N7XA 4OHNA 2QRYA 3SESA 2RC8A 2Y7WA 4U21A 4GFRA 4IO5A 4KCCA 2H99A 3Q27A 4F18A 1YAEA 2F6GA 1GTKA 4OMBA 3QYTA 4R75A 1EZOA 5JEIA 2ZNUA 3C34A 3FJ7A 3R7XA 4EF1A 1A8EA 1MPDA 1GGGA 4HW8A 2V3TA 1FTOA 3C31A 3EHTA 3C32A 3EN3A 1XOCA 1H76A 2VD3A 2I48A 1MY2A 1ZIUA 4L17A 1OMPA 2ALUA 4P11A 1II5A 2VP1A 4NE4A 3KSJA 3G3IA 1NNFA 2H98A 3T96B 2DWAA 3E13X 1LCFA 4QFOA 3O6HA 4U4XA 3U94A 3ODBA 1IXGA 4MF3A 4X9TA 2H5YA 4ZECA 4QFLA 3LUYA 2XXPA 1NFTA 4F3SA 2XXXA 3G3HA 1ZMGA 3LC8A 4WEPA 3E4RA 1UQWA 2V93A 1N76A 1OVTA 1TWYA 1FW0A 4XXUA 4DXCA 3K2DA 3O29A 3K6XA 3ZKLA 3OELA 2THIA 4YZZA 1QUKA 4NTLA 1HSJA 1P1NA 3N94A 1N3WA 1ELJA 2REJA 3WAFA 1MY4A 2GHAA 3HO7A 5AA4B 5CC2A 1TFDA 4GVOA 1MQJA 4YKKA 4HCWA 1MQIA 5B70A 2HXWA 1POTA 2ESNA 1MXZA 4DIGA 3TTRA 2W7YA 4DLDA 1B4HA 4EQ9A 2IEEA 2UVJA 4GL0A 4GXAA 2QMXA 4RK2A 5CMBA 2ZYNA 1LFHA 4ZEIA 3CSBA 2H9BA 4C0RA 3CI8A 5I56B 4K3FA 4KPTA 1MQDA 2RCBA 2H4IA 3MUQA 5KDTB 2RCAA 3VV5A 4QFNA 3KBRA 2DWHA 2O84X 5CM6A 3FUZA 3T93B 2D21A 4IO2A 2GHBA 5F7VA 5J1DA 1ZBMA 2YLNA 3KFMA 4PFYA 2CZLA 3DM0A 5FHNA 3MWBA 4OFOA 2ZYOA 3HHFA 3K6UA 1QVSA 5JTYA 1NKXA 5KZTA 1MH3A 3R26A 1B05A 4H8IA 3T9VA 5ICQA 3FVGA 3K1PA 2ZNTA 3GBBA 3VLWA 4G68C 4YMBA 1EU8A 4M1VA 1SI0A 5K2YA 3O9PA 4YMAA 2A5SA 1D4NA 3RT8A 4JWXA 3W9VA 1AL3A 1NL5A 1OQGA 4Z0IA 1A7LA 2F8DA 2HAVA 4P0IA 1DSNA 5FHOA 5CMKA 3MVWA 1LB8A 2F7AA 4DDDA 5FTHA 1UTBB 3KOSA 3KSXA 2XXYA 1MDP1 1N04A 2V25A 4H6DA 1MRPA 4IO7A 1QKAA 1B32A 2PT2A 3BFUA 3EQ1A 4F31B 2F6PA 3LSXA 4F1YA 3ILUB 2R9JA 4JSOA 3V83A 4C1TA 2Z23A 4X48A 3TTLA 2XX7A 3CR9A 2PBWA 5K2XA 3U93A 4R6YA 3UGWA 3VXBA 4KQPA 1AOVA 2Q8JA 1PB8A 1JW4A 4H67A 1ZTYA 4FECA 2XD2A 1IXCA 4ELOA 1RKMA 1B3LA 1O7TA 1SYHA 3TEPA 3JZJA 1US5A 5DEXB 1MS7A 5A5XA 3CFZA 4HS7A 4I62A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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