5I58B

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-004
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
279
structure length
277
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
total genus 76
structure length 277
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i58B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i58B02
1URGA 3MUQA 3OEKA 1OQHA 5FHOA 1B9JA 2ZXTA 2DE4A 5I84A 1CE2A 1OVTA 1FQCA 3KN8A 5JTYB 3CI8A 4DZ1A 4HCYA 2V3TA 1M5BA 3MZ1A 1P1QA 1TWYA 3HV1A 3KZGA 4QRZA 3USDA 4C0RA 4ZZEA 1OMPA 2QS2A 4NE4A 4QF9A 5ITPA 3EHUA 3PUXE 2OLBA 2HCAA 2F7BA 3ZKKA 4H65A 1D9VA 4X1BA 3IAZA 4E0WA 2Z8FA 3E4RA 1MQHA 5CBSA 1QUKA 4GD5A 3MJNA 3H4ZA 3ONMA 1B32A 3BBRA 3PUYE 4YKKA 3PUVE 3OOAA 2FNCA 4OEVA 4PP0A 2HZLA 3UN6A 3OSRA 1I6QA 5TPAA 2I3WA 1N76A 4R73A 4G8NA 1WODA 3U8QA 4THIA 3KJ7A 4KR5A 1GGGA 1NMUA 3EHSA 3M3KA 4PETA 2DOJA 5BWJA 1UIUA 4NMYA 1EZOA 4OESA 3TELA 3PD8A 3B6WA 4H67A 2Y7RA 3HSTA 4BDLA 3VFJA 2NXOA 4AB6A 3TPAA 5L9SA 3QIMA 4WKMA 1QJMA 4FAJA 1JETA 4GVOA 1H3DA 3O6GA 2PX1A 2O69A 1NFTA 4X9TA 1AMFA 2Q89A 1N3XA 2XX9A 4R6KA 1IUDA 4LZ7A 4H1XA 1AIVA 4TLMB 2O51A 4ZEFA 3U72A 4FIMA 3MZ9A 5KCJA 1PB8A 4BLAA 1DPPA 2XXTA 3CG1A 2KLFA 3Q26A 4WXJA 1UIVA 3IORA 1VE4A 2E1SA 3TEPA 2O6AA 2OJTA 1URDA 1JVXA 1IIWA 3K0VA 1I6BA 4HW8A 1B58A 4DXBA 5ITOA 2AL5A 5ISUA 1ZBMA 5AA4A 2OWTA 5DYHA 3MP1A 1FTOA 4QSDA 3TCFA 4ELOA 4LQ2A 3WAFA 5I59A 2XXXA 3M8UA 3K1NA 1IQ7A 2RC9A 4KYDA 1MH3A 1MPCA 1B2HA 2F6GA 4LONB 3MBPA 2XXVA 1MM6A 4F22A 4OERA 3W9VA 1FQFA 4ZEIA 4LA9A 3L6HA 1OQGA 3HN0A 4Z0IA 4NF8A 3LSFB 1DTZA 4GL0A 2ONKE 3KGCA 3LR1A 4ZEDA 4GF8A 1JEVA 5FHMA 1OLCA 4G68A 3TTLA 1S50A 5TU0A 4ND9A 4X1DA 5H8FB 4OTEA 3MAMA 4OFOA 4P0GA 2F7CA 2RF1A 2Q88A 3MVYA 1JW5A 1QW0A 2VOZA 1ZMGA 2HZKA 3LBSA 2XXPA 3FXQA 2VHAA 3VLWA 4YKIA 1MH4A 3FJGA 1Y9UA 3FVNA 4OYVA 3ZSFA 3UP9A 4G4PA 2NUVA 1N3WA 1DPEA 1B46A 1QKAA 2IEEA 3TFLA 4GXSB 5KDTB 3FVKA 4XKRA 3BFUA 2ZMBA 3TDJA 2ZYNA 2QPQA 5L9OA 3H6WA 4XXUA 2FA7A 1LAHE 4PFUA 4ELRA 3IO6A 3IOTA 5IKBA 4R2FA 3OELA 4IY5A 4C1TA 4JSOA 2I48A 5I2KA 4NF5B 3B6QA 1LGBC 4DXUA 4OVJA 3MPLA 2PT1A 3JZJA 4F19A 2V3UA 2HQ0A 3U1OA 1JW1A 3K6XA 1IXIA 2GHAA 2XHDA 5I57A 2DSFA 4F3PA 1YCJA 1O7TA 4IGRA 4NF6B 4JB7A 2UVJA 4IO2A 3BKIB 1O64A 4RY1A 5A5XB 1YTVA 1FQEA 2Y7PA 1WVJA 4FATA 3ILTB 4P11A 3UA8A 3IK6B 3RLFE 3G7WA 4FORA 2ZNTA 1IXGA 3OO9A 4GXAA 2ZYKA 4G8MA 3KG2A 5B70A 3MVXA 5L9MA 3Q27A 4XKQA 5AE4A 5TPAB 3O6IA 2V84A 4RPOA 4U23A 2Q2AA 4O3AA 1I6AA 3Q29A 2VD2A 3DP4A 2O7IA 4C1UA 1GTKA 1SW5A 2CMOA 2F36A 3MP8A 3RGYA 1US4A 3H3GA 1NNKA 2ABHA 3S9MC 3TQLA 4F2QA 3PPPA 5K2XA 3IOUA 1XC1A 4F1YA 1DOTA 5AA2A 1B5JA 5H8FA 1ELJA 2QSXA 1B3LA 1VR5A 2DQVA 1RYOA 3IB2A 4TOZA 2RCAA 2F8DA 2XX7A 1B7HA 4JWYA 3SKPA 5I2NA 5K2YA 1PEBA 3LUYA 4BDNA 5ICQA 4MH5A 3A09A 1JVYA 4ONYA 3FJ7A 1P99A 2VD3A 3IR1A 5EHSA 3OXNA 2I3VA 2R71A 2ALUA 5FTHA 3SERA 4XKPA 3V8XB 4DIGA 5H8SA 4GWOA 3PUWE 1YPNA 2DE3A 4ELPA 1P1WA 2D21A 4QSCA 2UVGA 1MS7A 1USYH 1PBQA 4FE8A 3F11A 3K1MA 1ZU0A 2YLNA 1P1UA 2RC7A 2Z8EA 1AH5A 3N6UA 1N7WA 5B7DA 4F2OA 4O3BA 5ELVA 3D4GA 4AQ4A 5AA4B 1Z7ME 3R26A 3OEMA 5CI5A 1POY1 4U1ZA 5I59B 1B7ZA 3C33A 2QJEA 4NF6A 4HCWA 4U1OA 5A5XA 4AB5A 2Y84A 3OD7A 4POXA 4OMBA 1SYHA 3S4UA 3KBRA 2F6PA 2R6GE 3O28A 5I56A 1TFAA 5M2VA 1A7LA 1LCTA 1R6ZA 3E3KA 3QYTA 1MQGA 3V83A 1B40A 1UQWA 1OLAA 1T0KA 5CBRA 4PFWA 2P2AA 4N6PA 4IY6A 3ZKLA 4MLVA 2XD2A 4NF8B 4FEBA 2H99A 3M3FA 5I58A 1H76A 3DM0A 4ZS9A 2UYFA 4G68B 4KD5A 3TTNA 1D3KA 3VVFA 5TP9B 3FIRA 4EF2A 5JEIA 4ZECA 3K4UA 4F29A 4RJZA 4JBZA 4BDOA 1BIYA 4GQOA 5CM6A 4FEDA 5F1QA 4BDQA 3FASA 3Q28A 5CMBA 3IJOB 1B0HA 4DE8A 5AA3A 1Y1ZA 1BP5A 4LQ5A 4QHQA 4DCYA 2PMSA 1B0LA 3GZGA 1B6HA 2Q8JA 1ZTYA 2RCBA 1JNFA 4YMBA 4R2BA 1J1NA 1Y1MA 4GFRA 2I58A 4OHNA 5BUUA 5DTBA 1LAXA 3N26A 3VLVA 1B3FA 3IOVA 2NVUB 5I2KB 1SI1A 1D9YA 3W9WA 1MQIA 3G3FA 2ONRA 4YKJA 3PMWA 1NKXA 1CB6A 4WEDA 2M8CA 4TQUQ 2F7AA 2I49A 4TLLB 5I57B 1NL5A 4KYSA 4QFKA 3FVOA 1UTHA 2GH9A 4BDMA 1POTA 3TTRA 1QVSA 3N5LA 1XVXA 1VSOA 1H45A 3KFMA 2V25A 2F78A 4JDFA 4H0WA 1O63A 1Y3PA 4ZZAA 4IO4A 4M4GA 2XD3A 4I1DA 3LSLA 5H8NA 3SEUA 1RKMA 4QFLA 3UGWA 1Y3NA 2V3QA 3SEXA 2GFEA 4ESWA 2LAOA 1A54A 4U4SA 1L5TA 2XXWA 2WKYA 3V5AA 3Q25A 1N7XA 4RNSA 4BDRA 1JQFA 4LUBA 3IB0A 3PMXA 2BJJX 1S7YA 2G93A 3GLBA 4R74A 4EQ9A 3KJTA 1SW4A 3RT8A 2QS3A 5AA2B 4IGTA 1MDQA 3K2DA 3MQ9A 5TP9A 4H5GA 1B52A 3ZS6A 3QUJA 2DWHA 3IB1A 2UVHA 3FXRA 5I2NB 4QFPA 4RK9A 4KYEA 1LB8A 4ECFA 4KCDA 5HM4B 3O66A 1MM7A 2I0BA 1QUJA 4U2RA 4H5FA 3IOWA 3K00A 4OQOA 2DVCA 3EHTA 3FD3A 4N07A 3LSXA 1LCFA 3UK4A 1HSEA 3HHGA 3I3VA 4UACA 4ZEBA 5H8HB 4LZ5A 3C4MA 1DMBA 2Q9TA 2UYEA 2XXIA 1FTMA 2Y7KA 3ODBA 4I9DA 4LVQA 4QFOA 5H8QB 5L8DA 1I69A 1N0TA 2YPNA 1M5FA 1SI0A 2B3FA 1MXWA 4OFLA 1LFGA 2PT2A 2D5WA 3E13X 3H6VA 2XXQA 1Q35A 1GR2A 3PD9A 1SW2A 5I56B 1SBPA 2H4IA 4F39A 3VE1B 4Q0CA 3KEIA 4ESXA 4LZ8A 2P0SA 3U92A 3SEVA 5EHMA 2QS4A 1SQYA 4JSDA 1USYE 3K02A 2NOOA 1ZKBA 1OIBA 4ZE9A 3TTMA 3TYHA 4MF3A 4E0XA 3N94A 2OZZA 5I58B 3U94A 3A3CA 4JXIA 4XTCQ 5F7VA 1M5DA 2FYIA 4HTGA 3G3JA 1H43A 2HEUA 1A99A 1AL3A 2Y7IA 1ATGA 4U21A 1MRPA 3I6VA 3S9EA 4ZDMA 3UORA 3I5OA 1Z7NE 2X7PA 4EQBA 2DP8A 2XXYA 3TQWA 2H5YA 2QRYA 5DEXB 2F35A 2I4CA 2A5TA 4F1VA 4Q30B 1B5IA 1M5CA 3T9HB 4GOTA 4KCCA 2X7QA 1MXZA 1Y4CA 2F5XA 1XOCA 4JWXA 4R6HA 3VLUA 4Q8RA 3O6HA 4I62A 1HSJA 4Q5TA 1LAGE 1MQDA 2AL4A 1B5HA 4MFIA 4POWA 5CMCA 1NH8A 5CRYA 2Y7WA 1P1OA 3L6GA 4YKPA 4F3GA 3DP6A 3K1PA 4I8CA 4G77A 1LAFE 3TTKA 1QULA 1FQBA 4G2ZA 1D4NA 3KOSA 3PPQA 3MVWA 1Y20A 2DYXA 3FV1A 3QUFA 3G3IA 3MC2A 2W7YA 3PV0E 4PFTA 3MW0A 3P7IA 4KI0E 2I0CA 3FV2A 4U4XA 4WEPA 3SETA 4YICA 1Y4TA 1A55A 1Y3QA 2HAUA 5H8HA 3C32A 4R6YA 3A3UA 1RYXA 1UTHB 5AA1A 4ZEKA 3WAEA 2ZNSA 1WDNA 3MPKA 3RN8A 2GRVA 4ELQA 1MY3A 3VVEA 3G3KA 1GVCA 1XHYA 1B05A 1B3GA 2QMXA 1LFIA 3RNNA 5H8QA 4YU0A 2I6EA 3TUSA 4IO6A 3TMGA 2V93A 1ANFA 4RYAA 2THIA 5DT6A 3BFTA 1B1HA 2DWJA 3QSLA 2XX8A 3RY3A 3THIA 1FQAA 1N84A 1VFEA 3EF7A 2HFBA 1BKAA 1JW4A 4GLIA 5H8NB 5CMKA 1QKBA 3SEYA 3H03A 2I4BA 2B3BA 4YB5A 1GV8A 1MQJA 3C36A 3R6UA 3CR9A 3HO7A 5J1DA 2XXUA 4R9GA 1SW1A 3KOTA 2Q2CA 4O3CA 4DDDA 3GBAA 1LBCA 1QUIA 3KN7A 1TFDA 3IO4A 3H6TA 1PB7A 3K6WA 4JWOA 3OO8A 3KN3A 1TT1A 2AYSA 2Z22A 4K3FA 1II5A 4H8IA 4OZ9A 5DEXA 4GIZA 3RQTA 2HAVA 4MBPA 3KSXA 2D3IA 3TODA 3PPOA 4GRKA 2Z8DA 1ZJLA 1MY0A 3TCHA 1B1XA 3MWBA 2PVUA 2F34A 4PFYA 1MXVA 3DP8A 2RKMA 3TKDA 3CVGA 3JV9A 1AOVA 2ONSA 4P0IA 1R9LA 1Q1KA 4IO7A 3FGSA 1MPBA 4Z7EA 3CSGA 4FJPA 3S9LC 4OENA 3IL1B 1LB9A 3DELB 3OENA 2OK2A 3RT6B 4F31B 3D4CA 1SVXB 3CFXA 5LOMA 1LBBA 1DSNA 3O97A 3KSJA 2PYYA 3MZBA 3LC8A 2RC8A 3CRBA 4NEDA 3R7XA 4M1VA 4L17A 1MG1A 4NF4B 2YJPA 3FJMA 3TAJA 3T96B 3RTFB 1EH3A 3HCQA 1ZLQA 4EDPA 1N04A 1M5EA 5HBCA 4YB6A 3W15C 1P1NA 2UVIA 3T93B 4NTLA 2A5SA 5JTYA 4F3SA 2P1SA 3QAXA 4G68C 2R9JA 3EPEA 3S2VA 2H98A 5KZTA 2ANJA 3SDFA 3K6UA 1OVBA 4F1UA 2REJA 1MY1A 4KQPA 3PMVA 1NNTA 3PGFA 3CG3A 3K01A 4YB7A 1MDP1 1ZIUA 1FTLA 2AIXA 2H25A 1TXFA 1MXYA 3PUZE 4MLQA 2A5TB 4R72A 4H6DA 1XVYA 4EF1A 1IXHA 1MXXA 1KWHA 4OFJA 1B3HA 3GBBA 4GL8A 3O2AA 5ICTA 4EXLA 2VGQA 3RUMA 4QFNA 2DXRA 3GXAA 1R9QA 1EZ9A 2DWAA 1UTBB 4DXCA 4OEUA 3RPWA 4G8HA 1NNFA 3C35A 4ISUA 2O1LA 1H44A 4H8JA 3H06B 4R9FA 3CIJA 3HPIA 4RA1A 1A8FA 4QSEA 3T9XB 2ESNA 1LFHA 2IA4A 5CMMA 2O68A 1HSLA 2F97A 1MY4A 2NWJA 3CFZA 2GHBA 5CC2A 2RINA 1YAEA 3ILUB 5FTIA 3VXCA 4RK2A 2UXAA 1B51A 1XT8A 3SESA 2O7UA 5AA2D 4U22A 3FVGA 2DWIA 3LSWA 1XS5A 4HS7A 1B3EA 5HPQA 1EZPA 1NNPA 5JK4A 3K6VA 3PU5A 4DCXA 3G3HA 3T66A 4RXLA 4N13A 3C31A 1MPDA 2OWSA 4F3BA 3QK6A 4X48A 2QS1A 1S9TA 1MXUA 2QL3A 2ZNUA 1FW0A 4F18A 4YZZA 3VDFA 3EN3A 4EQ7A 4NF4A 2DXYA 2XXRA 3JYRA 1FQDA 3C9HA 3E9XA 3V89B 3H7MA 3FZVA 1URSA 2ZYMA 4OETA 1FCKA 3QXMA 3C34A 3FXUA 2CZLA 1FTKA 1NH7A 3EQ1A 3RTWB 3CSBA 1MY2A 4NWCA 1EU8A 4LP2B 4EUOA 4FECA 2DVZA 4OWDA 4IO5A 3T22A 1FTJA 5EYFA 2H9BA 1PB9A 1PDAA 4NWDA 1PC3A 3G3GA 2PBWA 4LATA 2Z23A 3PPRA 3FUZA 1JEUA 2O1MA 1BTJA 2HXWA 3OO6A 4KHZE 4OXVA 1B4HA 5DVFA 3DLNA 3U93A 4PQJA 2XXHA 2B65A 2O84X 4YAHX 2DE2A 5DVJA 1VFDA 4KFQA 3AXFA 4UA8A 1SDXA 4ZE8A 1LSTA 1US5A 1UTBA 2ZYOA 2E0SA 1IZ1A 3VXBA 1IEJA 4PE5B 4XIGQ 4DLDA 1SD3A 1B7UA 4RPNA 3H6UA 3TZAA 3MVZA 3T9VA 3VV5A 3OO7A 3IJXB 3SEWA 3FATA 3CFLA 2DS9A 3O9PA 1F9BA 1IITA 4XKNA 3B6TA 3N6TA 2QMWA 2OBGA 3T9UA 1R1NA 3IX1A 1IXCA 2G29A 5FHNA 3PPNA 1BLFA 2REGA 1PBPA 5KDTA 3VVDA 1LLSA 4R75A 4IB2A 3O29A 5KCJB 2OCUA 3OSQA 4KPTA 4IO3A 1A8EA 1DTGA 1SYIA 3UIFA 4EXKA 4YMAA 3S9NC 2VP1A 5DVIA 3M3LA 1A40A 3ECRA 2X26A 3TCGA 5IAIA 1B4ZA 4NF5A 3MP6A 3OMBA 3B7DA 3HHFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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