1M5BA

X-ray structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with 2-me-tet-ampa at 1.85 a resolution.
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structural Basis for AMPA Receptor Activation and Ligand Selectivity: Crystal Structures of Five Agonist Complexes with the GluR2 Ligand-binding Core
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-07-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5bA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5bA01
4JSDA 1O7TA 2V84A 4MBPA 2V93A 1IEJA 3CG1A 4PFTA 4F31B 1N04A 2ONRA 4DZ1A 4YKIA 2PX1A 5LOMA 1B1XA 1UTHB 3CSGA 2F36A 2AYSA 1SBPA 1DSNA 2WKYA 2RC8A 4TLMB 4KYDA 5H8NA 1B3HA 1TXFA 3FASA 3M8UA 2DWHA 3TQLA 3K6XA 2DWJA 5ICQA 4QF9A 3PV0E 1VE4A 3ZKLA 5CBRA 1ZKBA 3IOTA 3TTMA 3I3VA 3PPQA 2B3BA 2XXTA 1Z7NE 2O84X 2UYFA 3WAEA 3K6VA 1B58A 3KN7A 1PC3A 4KPTA 2X7QA 3R6UA 3O97A 1JVYA 3OSQA 2VD3A 3KEIA 4KFQA 3IR1A 2HEUA 4U22A 2ZMBA 3PGFA 3FIRA 1Y3NA 4EQBA 2H9BA 4GOTA 4ZECA 2DP8A 3PD8A 4M1VA 2IEEA 1ZMGA 1B52A 3KZGA 2XX9A 3FXQA 1FTKA 4ESXA 5AA2A 2GRVA 1H44A 1AOVA 5L9OA 3SKPA 1LAGE 1OLCA 2OK2A 3IX1A 4YB7A 3QSLA 4GD5A 3VLWA 1O63A 4OESA 4EQ9A 3M3LA 3OELA 1JQFA 2RKMA 2QPQA 1Q1KA 4LZ8A 3TPAA 3FVNA 3TCFA 4GLIA 3K6UA 5ITOA 5DEXA 3U92A 3W9VA 3M3KA 5H8HB 1F9BA 4ISUA 1II5A 3OO8A 3Q25A 3PPNA 4L17A 4EXLA 3C33A 3SEXA 4PE5B 1T0KA 4LZ5A 3FVKA 3IOUA 2PYYA 3B6WA 4JXIA 1NMUA 3G3GA 3EHTA 4I62A 1VR5A 4XKRA 3OSRA 2R71A 3A3CA 5F7VA 3RQTA 1S50A 3FZVA 4OQOA 5K2XA 1MQHA 4QSEA 3C32A 1FQEA 1B1HA 1Y3PA 2UVJA 3H03A 3GLBA 1OVTA 3DELB 4EQ7A 1P1WA 1Y4TA 3K01A 1UIVA 1IITA 4UA8A 1SVXB 3CR9A 1TT1A 4XKQA 5DVIA 2OWTA 1MQIA 1ATGA 2FA7A 2HAVA 1QUJA 3B7DA 4F1VA 3MZ9A 4LVQA 4Q8RA 4BDQA 3I5OA 3S9NC 3RT8A 1IQ7A 4IB2A 3B6TA 3G3FA 3CVGA 2E0SA 5HM4B 4LUBA 2Q2AA 3D4CA 3F11A 4ESWA 1H43A 5IAIA 3MP6A 3G3JA 4H67A 5JTYB 4RK2A 3TELA 1BIYA 3TTNA 1B7UA 1UTHA 3MAMA 2ZXTA 4ZDMA 1JW1A 3IOWA 1P1OA 1NH8A 3AXFA 1I6AA 2GHBA 4P11A 1URGA 3THIA 1NFTA 4ECFA 4NF4B 3T9HB 2VD2A 3GBAA 3H7MA 4YB5A 3VVFA 1DOTA 3IOVA 2RF1A 3PD9A 4JBZA 4RY1A 4R9GA 3CRBA 3KN3A 1LBCA 1AH5A 1TWYA 2FYIA 1Y1MA 2CMOA 1VFEA 1LB9A 3PUXE 3Q27A 3UP9A 3O66A 1XC1A 4DLDA 3Q26A 3H6WA 1M5FA 2DS9A 3UK4A 4PFWA 1N3XA 1B3FA 4F29A 3DP4A 5ELVA 2F78A 3QIMA 4GRKA 5CBSA 3SERA 3MPLA 1GR2A 3O6IA 4G68C 3LUYA 4WEPA 4O3CA 3RLFE 5H8QB 4DCXA 3E9XA 3RY3A 2DWAA 1IXGA 4RYAA 5DVJA 3U8QA 1EH3A 3OEKA 4DDDA 4IGRA 2ZYMA 1Y4CA 2P2AA 4DIGA 1ZIUA 4DCYA 5IKBA 4QFNA 4H5FA 2LAOA 2I58A 2H99A 5H8HA 1MXVA 1XS5A 3RTWB 1OIBA 2OLBA 3K1PA 1XOCA 2P1SA 4AB6A 2Y84A 1B5HA 4EF2A 1N3WA 1SI0A 1B0LA 4LATA 3N94A 1RYXA 4U21A 3I6VA 1ZBMA 2KLFA 4R74A 3EHUA 3DLNA 4X9TA 2XXPA 4F18A 1R1NA 1MPDA 3TCHA 4HCWA 1D9VA 2I48A 3H06B 1MPBA 1FQAA 4YAHX 2AL4A 4EF1A 4HS7A 1MPCA 2RINA 3M3FA 4NEDA 4QFKA 4F3GA 4GVOA 1QJMA 2F97A 4ZZAA 1N7WA 3KN8A 5I59B 1J1NA 1H3DA 4ZEFA 2M8CA 5BUUA 2QS1A 2RC7A 1MDP1 4H65A 3RNNA 1LCFA 2QMWA 1YTVA 1B9JA 4RXLA 4R2BA 3IB2A 4E0WA 5I56A 2I4BA 3DM0A 4YICA 1D9YA 4G77A 3K1MA 1MH4A 2AIXA 4P0GA 1MG1A 4I9DA 4RPNA 1LLSA 4H8IA 4Q30B 5JTYA 4NWCA 3TTRA 1B0HA 1MY1A 1I69A 5FTIA 3QUFA 2XXQA 1XVYA 1S7YA 2QMXA 1AMFA 2RCAA 4GIZA 4NF4A 1N84A 3S4UA 4JWXA 3IJOB 3MVZA 5ICTA 4LP2B 4RJZA 4KCDA 1FW0A 1L5TA 3CFZA 1OQGA 2XX7A 3V83A 1SW1A 1RYOA 4EXKA 1N0TA 2O7UA 3FUZA 3FV1A 5K2YA 2V25A 1RKMA 3FGSA 1POY1 4GL0A 5DVFA 4BDOA 2QS3A 1B2HA 4O3AA 4MH5A 3MQ9A 3FVGA 5L8DA 4I1DA 4HTGA 4YKKA 4YKPA 3SEYA 3VFJA 1ZTYA 1YAEA 3O28A 2QS2A 4FEDA 3OO7A 4N6PA 1KWHA 3FJGA 2H4IA 3CI8A 3HHFA 1PEBA 2Q9TA 5CRYA 1B5IA 5H8SA 3MJNA 4NF6B 3PPPA 5H8QA 3HO7A 3C4MA 2NOOA 2UYEA 3V8XB 4ZE8A 1IIWA 4GXSB 3OOAA 4POWA 4IO5A 1AL3A 3IORA 3GXAA 2Y7IA 4ZS9A 4R73A 3TQWA 1B4HA 1NNKA 4H5GA 2RC9A 2HAUA 3O6HA 1NNPA 4ND9A 4R75A 1MY2A 4H0WA 3ILUB 5EHSA 1MXXA 3C34A 3LR1A 4R6KA 1EZPA 3S9EA 4R6HA 2F7CA 3K02A 4DXUA 2DOJA 3G3HA 1Y20A 4G68B 3C35A 3O29A 2I3WA 2V3TA 4IO4A 4MLQA 5TPAB 1BKAA 4X48A 5I57B 4XIGQ 2OZZA 1JNFA 2XXWA 4OEVA 4FEBA 1R9LA 5FHMA 2D3IA 4PETA 3R7XA 1B05A 2Z22A 4Z7EA 4U1ZA 2QRYA 3DP8A 1OQHA 3MVYA 1B7HA 5B7DA 5KDTB 3HCQA 4R6YA 5I2NB 4YMBA 2H5YA 1B3EA 1B46A 5M2VA 3G3IA 5TU0A 3MZBA 1IUDA 4GL8A 3JZJA 2UVHA 5TP9B 2Q2CA 3BBRA 3SETA 2O6AA 1H76A 2YLNA 5AE4A 4FAJA 3OD7A 2ZYOA 1H45A 3T22A 3SEWA 1QVSA 2F35A 3LBSA 3V89B 3C36A 3O9PA 3CFLA 1WVJA 3T93B 2ONSA 3H3GA 5I58B 1QKBA 3BFTA 2I6EA 2NUVA 1USYE 1B5JA 2O1LA 1YCJA 5EYFA 2DVZA 3O2AA 3KSXA 2DXYA 3OEMA 4O3BA 5HBCA 1SW2A 4GQOA 3G3KA 5FTHA 4F1UA 5I2KB 4BDLA 1A99A 1FCKA 5ISUA 2DE3A 4NF8B 3OXNA 4G8NA 1POTA 1MM7A 4TOZA 3E3KA 3A09A 4XKPA 5DTBA 1JVXA 3RTFB 2HXWA 4H8JA 3H6TA 2O51A 3CSBA 3PUYE 3LC8A 3SEVA 2QJEA 3Q28A 2ZYNA 3PUVE 1D4NA 2IA4A 2I0CA 3ONMA 2Z23A 4WKMA 2I4CA 2E1SA 3FVOA 1GGGA 1URSA 1B3GA 3O6GA 2XXHA 4QHQA 1OLAA 4NF6A 3RT6B 1IZ1A 1B51A 2DXRA 2PMSA 2ZNUA 1EZOA 3TUSA 3VLUA 2GH9A 4YMAA 3U94A 2I3VA 1SQYA 4DXCA 3P7IA 1OMPA 1B6HA 1ZJLA 2H98A 1FQDA 3K4UA 1NH7A 5F1QA 4BDMA 3CG3A 1B7ZA 4C0RA 3HV1A 1ZLQA 3KOSA 4KI0E 3FATA 3E13X 2UXAA 1GTKA 3UA8A 5DYHA 1PB9A 2UVIA 3KJ7A 4X1BA 3IL1B 2DYXA 2Z8EA 5FHNA 4G68A 1B32A 1Z7ME 4BDNA 1UQWA 2O1MA 4OERA 4RPOA 5TPAA 5I57A 2XD2A 4TLLB 1CB6A 3HPIA 2OWSA 1LGBC 2NXOA 2GFEA 3UN6A 2A5TB 2I49A 1QW0A 3IO6A 3MP8A 3FD3A 1LSTA 4OWDA 3TMGA 1WODA 4OFJA 1ELJA 4IO6A 3H6VA 2ZNTA 3W15C 5CI5A 5I2NA 4N07A 1XHYA 2BJJX 2I0BA 3QYTA 3IB0A 1VFDA 2XXIA 2UVGA 1MY4A 4BLAA 1P1QA 4MLVA 2HQ0A 4HCYA 1JETA 4JSOA 3FJMA 5L9MA 3PMWA 1FQBA 1D3KA 4U1OA 4U4XA 4IO3A 4ZEKA 3PUZE 5AA4B 3IAZA 4XTCQ 4ONYA 4QSCA 3TEPA 4FJPA 3K0VA 2DVCA 1US4A 4G8MA 3HSTA 2OCUA 2PT2A 2REJA 3K2DA 1FTJA 2DWIA 4H1XA 1GV8A 1N76A 4G8HA 4LQ2A 5I84A 3GBBA 3UIFA 4YZZA 2AL5A 3JYRA 3TFLA 3E4RA 4F19A 3TDJA 2F8DA 2G93A 2XXRA 1B40A 2VOZA 1FTOA 3VDFA 4JDFA 2YPNA 2Y7KA 1FTLA 3N6TA 4LQ5A 1O64A 3VVEA 3EN3A 4NF8A 2ZYKA 3PMXA 1QUKA 5BWJA 4M4GA 4I8CA 4RNSA 4F3BA 3T96B 2G29A 3K1NA 1IXCA 3KFMA 1JW4A 1FQCA 2Y7PA 1M5EA 4DXBA 1HSJA 1EU8A 1NNFA 2X26A 3RGYA 3S2VA 1S9TA 4QFOA 4F3SA 1IXIA 3T9UA 3ECRA 3HHGA 1LB8A 3SESA 3BKIB 4GWOA 2THIA 1AIVA 1XT8A 2W7YA 3MZ1A 4FIMA 4FORA 2V3UA 1TFAA 3LSFB 4X1DA 4K3FA 1MH3A 2X7PA 2O68A 5L9SA 4EDPA 2D21A 4XKNA 4PFYA 2XX8A 5CMMA 1PBPA 3MBPA 4KHZE 5JEIA 2VGQA 2Z8DA 3A3UA 4NF5B 1USYH 1UTBB 1A8EA 2F7AA 3OMBA 2F6GA 5DT6A 1B3LA 4FATA 1PBQA 4E0XA 2Q88A 1QUIA 3U93A 4F39A 2ALUA 4F1YA 1JEVA 2DE4A 4OZ9A 1SW4A 2B65A 3G7WA 4GFRA 3OENA 4KR5A 4R9FA 3RUMA 2A5SA 2HFBA 1SI1A 2GHAA 1A7LA 4LONB 4ZZEA 2Z8FA 1MQDA 3C9HA 1FQFA 2ESNA 5JK4A 3QAXA 5ITPA 3IK6B 3BFUA 5FHOA 3SEUA 4GXAA 1MQJA 3TODA 5A5XB 2B3FA 4FECA 1B4ZA 2A5TA 2XXVA 3ZSFA 2RCBA 3T9XB 3MC2A 4Q5TA 3H4ZA 1P1NA 1URDA 1LAHE 1LBBA 3Q29A 3UGWA 4EUOA 3TAJA 5AA2D 4F2QA 1MY0A 3FV2A 4DE8A 2XD3A 5HPQA 4UACA 1NNTA 3VV5A 1MXZA 4Q0CA 4QSDA 3R26A 1FTMA 3QUJA 4IY5A 3T9VA 3B6QA 1MRPA 1VSOA 3RPWA 3CIJA 1HSEA 1HSLA 4KYSA 3VXCA 5CC2A 2DE2A 4LA9A 2PT1A 1PDAA 3EPEA 5AA4A 2O69A 1A40A 3L6HA 2HZKA 3MWBA 1Y3QA 5I59A 1Y9UA 2Y7RA 3SDFA 2F6PA 2XXYA 5KZTA 5KCJB 3LSXA 2ZNSA 3DP6A 1NL5A 1CE2A 4ZEBA 5CMBA 5CMKA 4OTEA 4OFLA 3U72A 1ANFA 1MS7A 1XVXA 3EQ1A 1US5A 4KYEA 3PU5A 4LZ7A 3OO9A 1Q35A 3MVXA 1SW5A 3TTKA 3N26A 2F5XA 1I6QA 3ZKKA 4RK9A 1JW5A 4OYVA 3KJTA 4OEUA 3WAFA 1A54A 3U1OA 2QSXA 3HN0A 1BLFA 4NTLA 2VHAA 3KGCA 2P0SA 4N13A 5I56B 3PPRA 5H8FB 4JWOA 4PP0A 4ELPA 3MW0A 3QXMA 3LSWA 3MP1A 4ELOA 2F7BA 3T66A 3K6WA 3IB1A 3CFXA 3UORA 3JV9A 2QL3A 3TTLA 2D5WA 4ZEDA 3VLVA 3S9MC 4NMYA 4OHNA 4TQUQ 3KSJA 1MXUA 2H25A 4ZE9A 2NVUB 1NKXA 2V3QA 4WEDA 3OO6A 2F34A 1SDXA 2HZLA 3PPOA 5CMCA 1DPEA 1JEUA 4HW8A 4U4SA 1GVCA 1I6BA 1N7XA 4FE8A 4ELQA 4P0IA 3FJ7A 1WDNA 4NE4A 1P99A 1MXYA 2XXXA 2QS4A 5H8NB 1TFDA 4QRZA 3IO4A 3PUWE 2XHDA 1DTZA 3GZGA 3V5AA 1SD3A 1UIUA 2PBWA 4OENA 1YPNA 1P1UA 1M5DA 4C1UA 4NF5A 2R6GE 1UTBA 4GF8A 4R2FA 3S9LC 5J1DA 4JWYA 2PVUA 2HCAA 3KOTA 1OVBA 4OETA 4IY6A 5AA3A 3ODBA 2ONKE 2FNCA 2OBGA 4KQPA 3N6UA 5CM6A 3L6GA 3RN8A 1QULA 3C31A 1MM6A 4H6DA 1DTGA 3USDA 3ZS6A 2DQVA 4F2OA 4BDRA 3MVWA 3IJXB 1MY3A 4G2ZA 4YU0A 5A5XA 5AA2B 1LFHA 2XXUA 1BP5A 4G4PA 3KG2A 3TZAA 4U23A 1R6ZA 4THIA 2R9JA 1PB7A 1PB8A 1Y1ZA 3EHSA 1LAFE 1MDQA 3VE1B 2ANJA 1LFIA 1LCTA 1LAXA 1A8FA 5AA1A 1SYIA 4ELRA 3MUQA 2CZLA 1SYHA 3KBRA 4KCCA 5DEXB 4RA1A 5B70A 5KDTA 2DSFA 4PQJA 4F22A 1MQGA 4R72A 2ABHA 1M5CA 4POXA 1IXHA 4JB7A 2OJTA 4MFIA 3K00A 4YKJA 3ILTB 4U2RA 1R9QA 3TCGA 5TP9A 1DPPA 5KCJA 5EHMA 3PMVA 1ZU0A 4ZEIA 2REGA 3FXRA 3H6UA 1MXWA 2VP1A 4AB5A 4OVJA 4NWDA 1M5BA 1BTJA 3D4GA 4QFLA 1A55A 4PFUA 2O7IA 1LFGA 2Q8JA 4AQ4A 4QFPA 4OFOA 2Q89A 2NWJA 4OMBA 4WXJA 4OXVA 3EF7A 3TYHA 3W9WA 4IGTA 1QKAA 4YB6A 3TKDA 5I58A 3VXBA 1DMBA 3LSLA 5H8FA 3FXUA 3MPKA 3N5LA 4MF3A 2Y7WA 1EZ9A 4IO2A 4F3PA 3QK6A 5I2KA 3VVDA 4C1TA 4KD5A 4IO7A 4Z0IA 4XXUA 2YJPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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