1LCFA

Crystal structure of copper-and oxalate-substituted human lactoferrin at 2.0 angstroms resolution
Total Genus 222
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
222
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
GRRRSVQWCAVSNPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCLKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLKDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Iron transport
molecule keywords LACTOFERRIN
publication title Structure of copper- and oxalate-substituted human lactoferrin at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 222
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 1994-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lcfA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lcfA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lcfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lcfA03
1MM6A 2PMSA 1T0KA 1N76A 4BDMA 1LGBC 2I6EA 5A5XA 1JVYA 3JV9A 2QPQA 3LSFB 3FATA 3KZGA 4F3SA 1MQJA 3MBPA 2QL3A 4ZEFA 5DTBA 1ZTYA 2DOJA 1MG1A 2RC9A 2PYYA 4EUOA 4ELRA 4M4GA 3TMGA 2ALUA 3H03A 3K4UA 4QF9A 3RTWB 1FTLA 1XS5A 4QFPA 5CI5A 4U2RA 2ZXTA 1D4NA 1Y1MA 4IGRA 3KEIA 2XD2A 3BFTA 3LSXA 5AE4A 1USYE 4H5GA 3CVGA 4BLAA 4F19A 4YKKA 2DXRA 3ZS6A 2F7AA 3FVNA 3L6HA 4PE5B 2LAOA 2RCBA 1MQHA 2V25A 5H8NA 1AL3A 3G3IA 1M5FA 3ECRA 2OCUA 2X26A 5KCJB 4KR5A 3CFZA 1LB9A 1NKXA 3MZ1A 3IOWA 3VVEA 4MLVA 4H6DA 2VGQA 4N6PA 1P1OA 5JEIA 3MVXA 1MXXA 1OVTA 2V93A 1FTOA 2DWAA 2UVIA 1HSJA 3H6TA 4YKIA 3U1OA 2DWJA 3TCGA 2OWTA 3FJGA 4PQJA 2D21A 5DVFA 3VDFA 1FQDA 3MQ9A 5F7VA 4NF8B 2OLBA 4NE4A 5I58B 5L9MA 2NUVA 3CIJA 4R9FA 1JEUA 2DWIA 1MDQA 2HEUA 3QUFA 2ZMBA 1NH8A 2YPNA 3EHSA 1SQYA 2FA7A 3UORA 4LUBA 1QKBA 4AQ4A 2X7PA 4LQ2A 3TPAA 3N5LA 1UTHB 4OYVA 4WEPA 3F11A 3FV2A 4ZDMA 4TQUQ 1A7LA 3DELB 3ODBA 1OQHA 3UIFA 3LR1A 4KYEA 1IXCA 2DYXA 5H8FB 2QRYA 5CBRA 2YLNA 5I2KA 3O28A 1TFDA 1FQFA 2IA4A 5DVIA 3TKDA 4YU0A 1ZIUA 1NNPA 4ZECA 5FTIA 2UYEA 3N94A 3TTLA 3E3KA 1VFEA 5TP9A 3U92A 2H5YA 5HM4B 2NOOA 3U72A 1QUJA 1UIUA 2DP8A 3C35A 5I57B 1YCJA 4O3CA 4XKRA 1MY0A 3IB2A 3R6UA 1FTMA 4F1VA 1IQ7A 2G29A 2ZYNA 2I4BA 2D5WA 2IEEA 4OFOA 2UXAA 3VVDA 2V3QA 5TPAB 3IR1A 1A40A 4U4XA 3KFMA 3V83A 1CE2A 1O63A 1UQWA 1QUIA 3SEXA 1QULA 3N6UA 1BP5A 4R73A 2B65A 2A5TB 4DE8A 3TEPA 1B4HA 4G68C 4KYDA 3IO6A 2F78A 4ZZEA 1MXZA 1IITA 4Q5TA 1IXGA 4F22A 4R2BA 4OMBA 2ZNTA 4ELPA 3OO6A 3VXBA 4LZ5A 3UA8A 4KHZE 5DYHA 4EDPA 3B6TA 4DZ1A 1I6QA 1MQGA 2O7IA 4U21A 4H1XA 4OHNA 3OMBA 1MQIA 4G8NA 1DOTA 4QFOA 2O1LA 2F5XA 4GQOA 1J1NA 4K3FA 4DCYA 3S9MC 5BWJA 3PD9A 4YZZA 3MPKA 2THIA 5H8HB 4X1BA 5FHNA 2DXYA 3FJMA 3T66A 2DWHA 3QSLA 3FJ7A 2XXUA 4IO6A 2ESNA 2V3TA 4G68B 4DLDA 3HCQA 2O68A 4OXVA 4R6KA 3RTFB 2D3IA 1H3DA 2QS1A 4UACA 3T9VA 1OLCA 1B7UA 1B7ZA 1B7HA 4G4PA 5AA4A 2R9JA 3FVOA 4U1ZA 3K6VA 4RJZA 4ESWA 3A09A 3M3FA 3PUWE 3TTRA 4YAHX 1M5DA 3V89B 1MXWA 3PV0E 4XKNA 4LONB 4GVOA 2UVHA 3VE1B 4NWDA 5ITOA 1M5EA 3RUMA 4ZS9A 3EN3A 4NF5B 3H3GA 4MH5A 4OVJA 3U8QA 1Y3PA 2ONSA 3MZBA 4Q30B 3VV5A 5ELVA 2ABHA 3PUYE 4JWYA 4BDOA 4RNSA 4JSDA 1D9VA 1DMBA 4H67A 1A55A 4OFJA 1SBPA 3PPRA 2QS2A 3RN8A 3Q29A 1GVCA 4EXKA 2ZNSA 3RT8A 1Z7ME 3PMWA 3BKIB 5I2NA 3OSRA 3KBRA 1P1NA 3MAMA 2RF1A 1N04A 3S9EA 4QFNA 3K1MA 1WDNA 1RYOA 3SDFA 4OZ9A 1US5A 1SVXB 1QJMA 4MF3A 1ZU0A 3VLWA 3H4ZA 4LZ7A 4DXCA 1B46A 4ZE9A 1JETA 1MXUA 1ZLQA 2XXTA 4FORA 3KN7A 4F1UA 1OVBA 3PPQA 2I0BA 3ZKKA 4IGTA 4QRZA 2F34A 3USDA 3OO7A 2PX1A 1DTGA 2DS9A 3FUZA 3PGFA 1B5JA 3LSWA 1N3XA 5AA3A 2DSFA 1RYXA 3FV1A 3MUQA 4LZ8A 1JW4A 3B6QA 1SDXA 4DXUA 4JB7A 2NXOA 3EQ1A 4I8CA 3CI8A 4ELQA 2H98A 1JQFA 3TFLA 1LFGA 4R6YA 3IO4A 3MP8A 4JWOA 2I49A 3FXUA 1XOCA 3S9LC 2VHAA 4NMYA 2X7QA 2HAUA 3TCHA 4EQ9A 4NF6B 4YB7A 2XX7A 3N26A 3KGCA 4Z0IA 1YTVA 3TTMA 4GF8A 5DEXB 1OMPA 5KCJA 2O84X 1TXFA 2V84A 5AA1A 3MP6A 5CBSA 1HSEA 1QUKA 2B3BA 3SEYA 3KOTA 4ZEBA 5AA2B 4LA9A 1Y4CA 4P0IA 4LVQA 1IIWA 1D3KA 2ANJA 2QSXA 2Z8EA 2O6AA 4N07A 1QKAA 3IAZA 5TU0A 3C9HA 3CFXA 1ZMGA 2RC7A 4OETA 3DLNA 3RPWA 3IOTA 3TAJA 1URGA 1ZBMA 4FAJA 3SERA 1SD3A 3KSXA 4NF8A 1USYH 1MXVA 5I58A 3CR9A 1NFTA 1VR5A 3V5AA 1DPEA 2Z22A 5KDTB 2PVUA 2DQVA 4ELOA 3MZ9A 1PBQA 2VOZA 2HQ0A 1UTHA 1B58A 5ISUA 4PETA 3M3KA 1XVYA 4H8IA 4EQ7A 4P0GA 4HW8A 3QIMA 3HSTA 4C0RA 5H8FA 4XTCQ 1PB7A 1POY1 4G8MA 4KCDA 2HFBA 5B7DA 4ZEKA 3L6GA 4WEDA 3T9XB 4GL8A 4TLMB 5KZTA 1VSOA 3TELA 1DSNA 4X1DA 4LP2B 1MH3A 1BTJA 3I3VA 4GXSB 1TT1A 4YB6A 1ANFA 3CG3A 4G77A 4RPOA 3G3FA 3HN0A 4IO4A 3O6GA 2UVJA 5TPAA 2F7CA 4F2QA 4JSOA 1B40A 5CRYA 1MM7A 2FNCA 2GH9A 4KFQA 3JZJA 3TDJA 2A5TA 4POWA 1EZOA 3UGWA 1A8EA 2O1MA 1FTKA 3E4RA 3U93A 1NNFA 2Q89A 2ZYKA 3JYRA 2R6GE 1Y3QA 4TLLB 3DP6A 3PPOA 2XX8A 1B3LA 3MW0A 1URDA 2I48A 4F18A 4JBZA 1NNTA 4OEVA 1OIBA 4LATA 1SI1A 1IXIA 4KQPA 3DP8A 2ONRA 3PU5A 3T93B 1S50A 4IO3A 1H43A 1RKMA 4Z7EA 1MRPA 5M2VA 2XXQA 4RK9A 4I1DA 4KI0E 4OESA 4H5FA 1B0LA 4FEDA 5H8HA 1YPNA 3FGSA 1SW2A 4IB2A 2H25A 1PDAA 4F3GA 2HCAA 4GRKA 3RT6B 2B3FA 2HZLA 3UK4A 1UTBB 4G2ZA 4G68A 3PMVA 3RQTA 3GLBA 4JDFA 1FQBA 3ZSFA 3OENA 4HTGA 2Z23A 1P1WA 1NL5A 4F39A 1N3WA 3KSJA 4QSCA 4X9TA 3K01A 2F97A 1B2HA 4AB5A 4NF5A 4R75A 3SESA 2DVZA 3QK6A 5K2YA 4RXLA 3OOAA 3HPIA 2AYSA 2FYIA 4XKPA 3TQLA 1N7WA 2I58A 2I4CA 1B05A 4YKJA 1IEJA 4IO2A 3CSBA 3HV1A 2VD2A 3Q27A 1EZ9A 2P0SA 1WVJA 3ZKLA 1XC1A 2P2AA 2OJTA 5F1QA 2Z8FA 1SW5A 5CMCA 3T96B 2XXRA 3QUJA 1B51A 3PPNA 3QXMA 2GHAA 4ND9A 3EF7A 3EHUA 3GBBA 3OSQA 3SETA 5HPQA 3G3HA 4OQOA 1F9BA 2AL5A 4XIGQ 2AL4A 1KWHA 3D4GA 1XVXA 2QS3A 1XHYA 3C34A 3MVZA 5IKBA 1LFHA 2PT2A 3C32A 3MP1A 4DIGA 4RA1A 1JW1A 2F6GA 5IAIA 3G3KA 1PBPA 4QFKA 1B6HA 3QYTA 3AXFA 3IB1A 3C31A 1H45A 2QS4A 4QHQA 2OBGA 1LBCA 4OTEA 3SEUA 1MPDA 3N6TA 3FXRA 3I6VA 3R7XA 3O9PA 3P7IA 1FW0A 1MY3A 4F1YA 1MS7A 4GFRA 3U94A 1MXYA 3IOVA 3W9VA 1ZKBA 4R6HA 3OD7A 4PP0A 4IO7A 2OK2A 4TOZA 2E1SA 4Q8RA 5LOMA 3M8UA 1B5HA 5DEXA 1LCTA 4NEDA 1LLSA 2I3VA 3IJXB 4PFYA 2UYFA 1TWYA 5AA2A 1R6ZA 4KPTA 3W9WA 2XXIA 1US4A 3VFJA 1M5CA 5I59B 3IL1B 1GV8A 4OEUA 1B5IA 3G3JA 4F2OA 3VVFA 3HO7A 3W15C 2F7BA 1NNKA 4GXAA 3RLFE 3G7WA 3O29A 1URSA 1Z7NE 5JK4A 5KDTA 4M1VA 1B0HA 1FQAA 3FD3A 1QVSA 3MWBA 4MLQA 1ELJA 3S4UA 2YJPA 5B70A 3B6WA 2VP1A 3K1NA 4P11A 4XKQA 2CZLA 2Q2AA 2UVGA 3KJ7A 3DM0A 2ONKE 1AH5A 2BJJX 3TTKA 5I56B 3LBSA 3T9HB 3K6WA 5CC2A 3KN3A 2REJA 5JTYB 2CMOA 2Q9TA 1DPPA 1A99A 2QJEA 1R9LA 1LBBA 2PT1A 4FEBA 4R2FA 3PPPA 3O66A 2Y7IA 1B52A 2Q8JA 3IK6B 1EU8A 4OERA 4WKMA 5CM6A 3K6XA 4F3PA 1SW1A 4YKPA 1B32A 1Q35A 1XT8A 4THIA 5L9SA 1R9QA 1JW5A 2P1SA 4QSEA 5DVJA 2G93A 2W7YA 1B9JA 3VLUA 1FQCA 3PUZE 2F36A 4F3BA 3C36A 4BDQA 3E13X 4HS7A 1BKAA 1L5TA 4I62A 4O3BA 3E9XA 3M3LA 4ISUA 4GIZA 5H8QB 3FIRA 3SKPA 1R1NA 2QMWA 2KLFA 1Y3NA 3SEWA 4IY5A 2XXWA 4R74A 1JNFA 3T9UA 4F29A 3QAXA 3SEVA 2XHDA 5CMBA 1LSTA 2H99A 4RK2A 1BIYA 1ATGA 4OFLA 5ITPA 4C1UA 1OQGA 1P1QA 5I57A 3TODA 4YMAA 4IO5A 4YB5A 3IX1A 1I69A 2Y7RA 3H6UA 5BUUA 3K1PA 1PC3A 3CG1A 3THIA 4NF4B 3OXNA 1SI0A 3PUXE 1MQDA 3EHTA 2DVCA 2VD3A 4U22A 3BFUA 4FE8A 4FECA 1UTBA 4OENA 2Y7KA 4U1OA 5A5XB 1PB9A 3PUVE 3S9NC 1YAEA 1GGGA 3KJTA 2R71A 4HCYA 3RY3A 1MY1A 3K02A 1MPCA 1LAFE 3C33A 3K0VA 1N0TA 3EPEA 4EF1A 4U4SA 5FHMA 3V8XB 1HSLA 2ZYOA 4NTLA 1JVXA 2O69A 3MVWA 1AOVA 3CSGA 3LSLA 1Y1ZA 4C1TA 4UA8A 4EF2A 3S2VA 4EXLA 2V3UA 3LUYA 3LC8A 3OO9A 4IY6A 4MBPA 4AB6A 2XD3A 3IJOB 3KOSA 3Q25A 2O7UA 4H0WA 4ECFA 5H8NB 5HBCA 3FVKA 1B1HA 3H6WA 3WAFA 1B4ZA 3RGYA 3MC2A 1S9TA 4FJPA 3OEKA 4ONYA 3TQWA 3DP4A 1LFIA 1D9YA 4GL0A 2Q2CA 4LQ5A 4BDRA 1B3GA 1ZJLA 4DCXA 2XXHA 2PBWA 3PD8A 2O51A 3FASA 2XXXA 4DXBA 4RY1A 2F35A 4YMBA 1FQEA 2ZNUA 3CRBA 1Y20A 1Q1KA 5FHOA 2RC8A 3Q26A 2QMXA 2GHBA 4HCWA 2M8CA 3GXAA 2HXWA 4PFTA 2I3WA 3H6VA 5J1DA 4I9DA 3TCFA 3G3GA 2I0CA 3TUSA 1LAXA 5CMKA 3O6HA 1SW4A 3TZAA 1B3HA 1AMFA 2RKMA 4KD5A 3HHFA 1O7TA 1P1UA 3OO8A 4E0WA 4EQBA 2AIXA 5EHMA 1NH7A 4ZZAA 3BBRA 5H8SA 3GBAA 4ESXA 5I2KB 2ZYMA 4RPNA 2HZKA 3TTNA 1WODA 2Y7WA 3ONMA 3R26A 4R9GA 4ZEIA 1POTA 2F6PA 4XXUA 5TP9B 2Q88A 3ILTB 4FATA 4POXA 4O3AA 2XXYA 4FIMA 3O2AA 4DDDA 1CB6A 2OWSA 4Q0CA 4WXJA 3UN6A 1H76A 1QW0A 1N7XA 2RCAA 4OWDA 1LCFA 4R72A 4H8JA 1JEVA 2DE3A 5I59A 5L9OA 3A3CA 3D4CA 1MY2A 1UIVA 4GOTA 4BDNA 2RINA 3RNNA 1B3EA 4X48A 1S7YA 1M5BA 4JWXA 3KN8A 1VFDA 3TYHA 2XXVA 4U23A 3FXQA 1SYIA 1IXHA 3O97A 4ZEDA 3MPLA 1VE4A 1H44A 5DT6A 3K00A 3FVGA 1FCKA 1LB8A 4JXIA 4L17A 3OELA 2REGA 4BDLA 2NWJA 3HHGA 1II5A 5I56A 3K6UA 4NF6A 1IZ1A 4RYAA 1Y4TA 5JTYA 3T22A 2H9BA 2Y84A 4N13A 1DTZA 4GWOA 4ZE8A 4GD5A 3FZVA 2GFEA 1MH4A 1EZPA 1Y9UA 1I6AA 5FTHA 3MVYA 4PFUA 5I84A 2GRVA 3I5OA 4H65A 3Q28A 1N84A 2NVUB 2XX9A 3WAEA 1AIVA 4GLIA 3VLVA 1B3FA 3K2DA 3GZGA 1A8FA 3KG2A 3IORA 3MJNA 2WKYA 4E0XA 1OLAA 5AA4B 4YICA 2Y7PA 4KYSA 1B1XA 4F31B 2Z8DA 4G8HA 1MDP1 3UP9A 1GTKA 5EHSA 3C4MA 4QSDA 2XXPA 3O6IA 2DE4A 2OZZA 3VXCA 2DE2A 1P99A 5H8QA 1MPBA 1LAHE 3CFLA 1MY4A 1PB8A 1IUDA 3OEMA 5L8DA 3PMXA 4MFIA 5ICQA 3H7MA 1O64A 1FTJA 4QFLA 1A54A 5ICTA 2H4IA 1NMUA 5K2XA 3A3UA 1LAGE 2A5SA 5EYFA 5AA2D 1PEBA 1SYHA 5I2NB 4PFWA 1BLFA 1TFAA 3IB0A 3B7DA 3H06B 3ILUB 2E0SA 2F8DA 4KCCA 2HAVA 1I6BA 4NWCA 4NF4A 1EH3A 3IOUA 1GR2A 5CMMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1MM6A 1LBZA 2PMSA 1T0KA 1N76A 4BDMA 1LGBC 2I6EA 5A5XA 1JVYA 3JV9A 2QPQA 1K9YA 3LSFB 3FATA 3KZGA 4F3SA 1MQJA 3MBPA 1NUYA 2QL3A 4ZEFA 5DTBA 4GWWA 1KA0A 1ZTYA 2DOJA 1MG1A 2RC9A 4GWSA 2PYYA 4EUOA 4ELRA 4M4GA 3TMGA 2ALUA 4QBAA 3H03A 1IMCA 3K4UA 4QF9A 3RTWB 1EYKA 1FTLA 1XS5A 4QFPA 4PAKA 5CI5A 4U2RA 2ZXTA 1D4NA 1Y1MA 4IGRA 3KEIA 1KZ8A 2XD2A 3BFTA 4NX1A 5ET6A 3LSXA 5AE4A 1USYE 4H5GA 3CVGA 5ET7A 4BLAA 4F19A 3FBPA 2FIEA 4YKKA 2DXRA 3ZS6A 2F7AA 3FVNA 3L6HA 3HFUA 4PE5B 2LAOA 2RCBA 1MQHA 2V25A 5H8NA 1AL3A 3G3IA 1M5FA 3ECRA 2OCUA 2X26A 5KCJB 4KR5A 3CFZA 1LB9A 1NKXA 3MZ1A 1KA1A 3IOWA 3VVEA 4N6KA 4PE3A 4MLVA 4H6DA 1FBGA 5FBPA 4O94A 2VGQA 4N6PA 1P1OA 5JEIA 3MVXA 1MXXA 1OVTA 2V93A 1FTOA 4PDDA 4GBVA 2DWAA 2UVIA 1NV2A 1HSJA 3H6TA 1NV5A 4YKIA 3U1OA 2DWJA 3TCGA 2OWTA 3FJGA 4PQJA 2D21A 5DVFA 3VDFA 1FQDA 4N8YA 5A5LA 3MQ9A 5F7VA 4NF8B 2OLBA 4NE4A 5I58B 5L9MA 2NUVA 3CIJA 4R9FA 1JEUA 2DWIA 2ZZWA 1MDQA 2HEUA 3QUFA 2ZMBA 4H46A 1NH8A 4UABA 2YPNA 3EHSA 1SQYA 2FA7A 3UORA 4LUBA 1QKBA 4PF8A 4AQ4A 2X7PA 3LV0A 4LQ2A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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