1LCFA

Crystal structure of copper-and oxalate-substituted human lactoferrin at 2.0 angstroms resolution
Total Genus 222
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
222
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
GRRRSVQWCAVSNPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCLKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLKDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Iron transport
source organism Homo sapiens
publication title Structure of copper- and oxalate-substituted human lactoferrin at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
total genus 222
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 1994-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lcfA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lcfA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lcfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lcfA03
1II5A 1USYE 4OHNA 4JBZA 4MF3A 3BKIB 3PPOA 3TAJA 4TLLB 4BDMA 1RYXA 3EN3A 5H8FB 4FIMA 3PMXA 3CFXA 3BBRA 1OIBA 1EZ9A 4QRZA 3TZAA 2I49A 1NNTA 1PDAA 4RNSA 1GR2A 2NOOA 2V3TA 4YAHX 3VE1B 2M8CA 4DIGA 3B6QA 2GH9A 1D9VA 1AH5A 1USYH 3GBBA 1FTJA 3S9EA 2V84A 3K02A 4IY5A 4PE5B 4IO3A 4TOZA 4C1TA 1ZIUA 1P1OA 2V25A 2V3UA 2F7BA 4PFTA 4QFNA 3U72A 5H8QA 1A7LA 2QL3A 2D21A 3SEXA 4DXBA 3CFLA 3PD8A 3MVXA 3RTWB 1B4HA 2HAVA 5I2NB 4XKNA 3TCHA 3KN8A 2QSXA 4LATA 4MFIA 3DLNA 2CMOA 5FTHA 2ABHA 4NE4A 3LSWA 3O6IA 3A3CA 4Z7EA 3HHFA 2Z23A 3CVGA 4Q5TA 2HZLA 3T93B 1TFAA 2WKYA 1UQWA 4LA9A 3S9LC 2IA4A 3T9XB 2A5TA 4MBPA 4OFJA 1YPNA 3K6XA 3G3KA 1B3FA 1Y20A 3IORA 2GHBA 3PV0E 1A99A 4IO4A 3VLVA 2HXWA 5BUUA 1MXYA 4KCCA 2I6EA 4X1BA 1TXFA 3MP6A 2HCAA 4L17A 3SEVA 1DTGA 1VFDA 2HFBA 3G7WA 4U1ZA 1MY2A 4EXKA 3C33A 1B1XA 5I57A 1LAFE 3CG3A 4OEVA 3IB0A 2Z8EA 1N84A 3O28A 4F19A 4X9TA 3TDJA 5EHMA 4ELPA 4ZS9A 1AL3A 2ONKE 3VFJA 1VSOA 3AXFA 1FQEA 2NUVA 4QHQA 2XD3A 2ZNTA 1YAEA 2VD2A 3MVYA 3M3LA 4KD5A 1SQYA 2XD2A 3P7IA 4IY6A 1URDA 1QUIA 2W7YA 1QULA 4OVJA 1MS7A 1GGGA 4R9GA 1LAGE 2ZYNA 1B2HA 4NMYA 4FJPA 3K2DA 3UA8A 3HV1A 4NWDA 2I0CA 4OFLA 2F7CA 5ICQA 5HPQA 4OERA 2Y7RA 1B7HA 2QS3A 4YKJA 1S9TA 4NF6A 1QJMA 1AOVA 1SBPA 4R6YA 4WXJA 1US5A 4GL0A 2VOZA 1H76A 3TTRA 3RT8A 1B52A 1MXVA 5CC2A 5DYHA 3MZBA 3CRBA 1NKXA 4F1UA 3K01A 1O7TA 2UXAA 1J1NA 2F36A 3QK6A 3PPPA 4F29A 3VV5A 1B51A 3LR1A 3UN6A 4ZZAA 4BDOA 4GD5A 3C32A 1B58A 3KZGA 4WEDA 4LP2B 2YLNA 3LSFB 5A5XB 1Z7ME 2XXWA 1LFHA 4F1VA 3PMWA 5K2YA 5I56A 1F9BA 4YKPA 2AYSA 4XIGQ 4U1OA 1HSEA 3EHUA 4G68A 4NF8B 2P0SA 2F97A 4YU0A 4ZE9A 2RINA 2PX1A 2REGA 3Q29A 1D9YA 3FJ7A 2O69A 3DP8A 3MPKA 2XX7A 4MH5A 1YTVA 5H8HB 4F2OA 2F5XA 1SW5A 2V3QA 4I62A 3KN3A 3R26A 4PP0A 4QFPA 1LB8A 5ISUA 1BTJA 4I9DA 2I4BA 4R9FA 5AE4A 4E0XA 4WEPA 1ZJLA 1B05A 3CIJA 3FVNA 5CBSA 5JTYA 3N26A 4Q0CA 2Q89A 4JSOA 2PBWA 5I57B 3E13X 4G8HA 3FJMA 1H44A 4QSEA 2H9BA 4EQBA 1MPBA 2HZKA 3FD3A 4H0WA 2DXYA 3KG2A 2XXPA 3MPLA 1PC3A 5TPAA 3SKPA 3UIFA 3W9VA 3VVDA 3B7DA 1WVJA 4KFQA 3LUYA 4GL8A 4LZ5A 5K2XA 3LBSA 3H6VA 3FZVA 1MXZA 4LZ8A 1MY1A 1LSTA 1EZOA 2G29A 2F34A 2VHAA 1PB9A 3E3KA 4Q30B 3C4MA 4OFOA 1B3HA 4HS7A 3U92A 3WAEA 4JWOA 1LBBA 2Y7WA 2QMXA 1IQ7A 3Q28A 1FTMA 2RC7A 3ILTB 4ELOA 3W9WA 4KYSA 4U21A 1JW5A 5ITPA 3K00A 3GBAA 2RCBA 4ONYA 2DSFA 4FEDA 3EQ1A 3K1PA 1P99A 1SW1A 1M5FA 2ZYMA 4ELQA 3KFMA 1LLSA 3OEMA 4Q8RA 1UTBA 5H8NB 4AB6A 1B46A 4RY1A 2Q88A 3VXBA 1MXWA 4OWDA 2DWHA 4PETA 2YPNA 1NL5A 1B1HA 3T22A 4OQOA 4OXVA 4X48A 2RKMA 5AA1A 4POXA 3V8XB 3HO7A 4YKIA 3QAXA 3OELA 2XHDA 2Y7PA 4UA8A 1LGBC 2UVIA 3FASA 4H5FA 1Y9UA 3K1MA 3KBRA 3PPNA 3L6HA 4C1UA 3TCGA 4YICA 1GV8A 1AMFA 1UTHB 4UACA 2QMWA 3N5LA 1B7UA 1XC1A 4RA1A 3MUQA 2ZYOA 2RC9A 4BDRA 4XXUA 1IITA 3O2AA 3TELA 3D4CA 1PB7A 1I6BA 1S50A 3G3HA 5CMMA 4R2FA 2B3FA 1Y3QA 1LAHE 2F6GA 4RXLA 3U94A 4QFKA 1MY3A 1B0LA 4R72A 3TEPA 1OQHA 4F3GA 4F39A 1OMPA 4IO7A 1VE4A 2VD3A 2XXHA 2ALUA 1M5BA 1MQGA 1O63A 2FNCA 1MY0A 5AA4B 5I58A 3PUVE 4GIZA 1FQDA 3RPWA 3T9UA 4XKQA 2ZNUA 5TU0A 1MXXA 3OSRA 3KJTA 1OVTA 3PMVA 1UIVA 4YB5A 4EQ9A 2Z22A 3OO8A 2I58A 3A3UA 4YMBA 1JEVA 4G4PA 2AIXA 4RPOA 4F3BA 1Y3NA 1SYIA 3VVFA 5F7VA 2FA7A 1US4A 4QFLA 4XKPA 4LQ2A 4N6PA 4GXSB 3TQLA 5TP9B 3VLWA 5L9OA 3KEIA 4HCWA 1MG1A 4HTGA 1B6HA 3WAFA 3SDFA 3LC8A 4F18A 5KDTB 1I6QA 1R9LA 1KWHA 1DOTA 1XS5A 3SESA 4NF4B 1P1QA 1L5TA 3MZ9A 4G8MA 2O6AA 3TTMA 5KCJB 1MM6A 4G8NA 2PT2A 2ANJA 3IB2A 2P1SA 3O9PA 3H3GA 2H5YA 1MPDA 2OWTA 4BDNA 4GF8A 4GVOA 1P1NA 2QS1A 1B40A 3CSGA 1LFIA 1JVXA 1B5JA 4ZZEA 3S2VA 1RYOA 3SERA 3FXUA 1SDXA 1Y4CA 3EHSA 4DCYA 4N07A 4FORA 4I1DA 3FIRA 2Q2CA 3E4RA 2HEUA 2E1SA 2KLFA 3FVKA 4HCYA 3QYTA 1SI0A 3G3GA 3B6TA 3KOSA 5DT6A 3PPRA 5FHOA 1FTLA 2GHAA 2NWJA 3CI8A 2O84X 1IXIA 4OESA 2RCAA 5AA3A 2XXIA 5I2KB 3SETA 1FTKA 4YMAA 4BDLA 1D4NA 5CMCA 3O29A 5IKBA 1Q1KA 1M5CA 1GTKA 5J1DA 4JDFA 3TMGA 5CMKA 3TKDA 2LAOA 4R6HA 3IOVA 1NH7A 3I6VA 3OENA 3PUYE 3QIMA 2ZMBA 4GFRA 5I59A 1JW4A 3GLBA 2F8DA 3RN8A 1T0KA 1NNFA 1GVCA 3U1OA 2O51A 3ZSFA 2GRVA 2F35A 4NTLA 1POTA 4RK2A 2QRYA 1UIUA 2PVUA 4IO6A 3EHTA 1N76A 2UVGA 2Y84A 3O66A 5FTIA 1DSNA 5H8QB 2PT1A 3GXAA 4U4XA 4R75A 2OCUA 1MPCA 3V89B 3FVGA 1QVSA 3KJ7A 2Z8FA 2OJTA 3VXCA 1LAXA 1JVYA 1SW2A 1TT1A 2OLBA 3TODA 2AL5A 3RNNA 5DTBA 4IO5A 3R7XA 3HPIA 3MC2A 3M3FA 4PFYA 2DE3A 5DVJA 5ELVA 1N7WA 2H25A 2FYIA 3PUXE 4OTEA 4AQ4A 1SD3A 2A5TB 2ESNA 1ZMGA 3MBPA 2BJJX 5KZTA 2DE2A 4I8CA 2X7PA 1DPPA 4PFWA 3E9XA 2ZXTA 1MQJA 4H6DA 4YKKA 1TFDA 4JWXA 4QSDA 2VGQA 2H98A 5JEIA 5EHSA 4OZ9A 5H8FA 1Y3PA 3IO4A 1OLCA 2H4IA 4O3AA 3KN7A 4DDDA 1JW1A 2R71A 1LBCA 5CRYA 4OYVA 3ZKLA 3W15C 4KQPA 4U23A 3T9HB 2HAUA 3N94A 1A55A 2Q8JA 1XT8A 1O64A 2XX9A 1FW0A 3MWBA 1H43A 2DP8A 3ZKKA 2QS4A 4QF9A 1QW0A 2F6PA 3H6TA 1B3GA 3DP6A 1CE2A 2O1MA 1IXGA 3M8UA 4G2ZA 3LSLA 1A8FA 4R73A 3IK6B 4JWYA 1MH4A 1Y1MA 4EQ7A 2G93A 2F7AA 4LONB 1N3XA 1SYHA 3FGSA 1DMBA 3HHGA 4LZ7A 1IXCA 1P1WA 1BP5A 1ANFA 2OZZA 3RT6B 1B5HA 4NF6B 2Y7KA 1B0HA 1N0TA 4DLDA 3C9HA 4M1VA 2I3WA 3T96B 5H8SA 3FXQA 1NNKA 3LSXA 3O6HA 2XXVA 1HSJA 3IAZA 2DQVA 2VP1A 4Z0IA 2X7QA 3S4UA 1B5IA 3DM0A 3MP8A 3H06B 4NF5A 3IX1A 1EZPA 1WODA 3RLFE 3IR1A 2NVUB 3RGYA 3JV9A 2XXYA 4YZZA 4ELRA 5ITOA 4F1YA 1Z7NE 3TPAA 5I56B 3UK4A 4KHZE 1R1NA 4KYDA 1R6ZA 4DE8A 1EU8A 3PGFA 5B7DA 1FTOA 4QFOA 4G68B 5DVIA 2DWAA 2O68A 2O7IA 5AA2D 4P11A 3TQWA 2UVHA 2ZYKA 5ICTA 2ONSA 5BWJA 4DCXA 3S9MC 3RTFB 4C0RA 1DPEA 1FQFA 2DYXA 3H4ZA 3OMBA 4YB7A 1MDP1 5CMBA 4EXLA 2UYFA 2O1LA 3OO7A 4ZE8A 3PD9A 1Y1ZA 1QKBA 4NWCA 3BFTA 2ONRA 5JTYB 3EF7A 3Q26A 5JK4A 2OWSA 2GFEA 3H03A 4FATA 4F22A 3T66A 3HCQA 5L8DA 3SEYA 2DVZA 2X26A 3UORA 4P0GA 3PPQA 4LQ5A 4FE8A 4ZECA 1A54A 1FQCA 1IZ1A 5TPAB 1DTZA 5HBCA 5CI5A 3ONMA 3UP9A 3EPEA 3T9VA 4POWA 1MH3A 4ZDMA 4QSCA 3MVZA 1MM7A 2IEEA 1H45A 3TTKA 2O7UA 3VDFA 1QUJA 3O97A 4GWOA 3CR9A 4JB7A 4XTCQ 5A5XA 3R6UA 5L9SA 3V83A 5DVFA 3FATA 1R9QA 5HM4B 4U22A 1OQGA 4JXIA 2I3VA 1ZKBA 1MQDA 4NF8A 3TUSA 1PEBA 3DP4A 4TQUQ 1BLFA 3OD7A 4ECFA 1A40A 4IB2A 1XHYA 4K3FA 1WDNA 1UTBB 3N6TA 5DEXA 5H8HA 3IOUA 4RYAA 1AIVA 5I84A 4EUOA 3QUFA 1IIWA 1LCTA 3G3JA 1MXUA 1FQBA 4NF5B 4FECA 4RPNA 1LB9A 1URSA 4GLIA 1NH8A 4ISUA 1OVBA 5FHMA 3THIA 3JYRA 3V5AA 3U8QA 4F3SA 2R9JA 1B32A 4JSDA 4IGTA 3QXMA 2Y7IA 4X1DA 1VR5A 3C36A 1MRPA 1IXHA 5IAIA 1I69A 4WKMA 2QS2A 2THIA 5EYFA 1OLAA 3FVOA 4H67A 1YCJA 1SVXB 3BFUA 3MVWA 5L9MA 1N3WA 3TYHA 1JETA 2H99A 4HW8A 1SI1A 4MLVA 3K6WA 4H8JA 4YB6A 5F1QA 4R2BA 4THIA 5AA2A 1JQFA 1BIYA 3PUZE 4H8IA 3ZS6A 4N13A 3KGCA 5CBRA 3K6VA 3L6GA 2DXRA 1N7XA 1I6AA 2QJEA 2RC8A 4DZ1A 2D5WA 4P0IA 1PBPA 3MZ1A 3Q25A 4KYEA 4EF1A 1S7YA 3USDA 4LVQA 3I3VA 4AB5A 1ZLQA 3PU5A 3OOAA 4DXCA 3IOWA 2XX8A 3KSXA 3MP1A 3B6WA 2OK2A 4MLQA 3TCFA 4U2RA 3TTLA 3FXRA 4FAJA 2B3BA 5I58B 3UGWA 2XXTA 3RQTA 2XXUA 2PMSA 5H8NA 1Q35A 2R6GE 3IOTA 3GZGA 3Q27A 4BLAA 2HQ0A 3KSJA 3JZJA 3MJNA 5M2VA 4OMBA 1D3KA 4GRKA 3MW0A 4IO2A 4F2QA 4GXAA 1FCKA 3IL1B 4O3CA 1ZTYA 3ODBA 3OO9A 3OSQA 3H7MA 3PUWE 1IEJA 4NEDA 2I0BA 3K4UA 4G68C 2UVJA 2PYYA 5LOMA 4ESXA 3CG1A 4BDQA 1B3EA 5FHNA 1EH3A 4ND9A 3FJGA 1UTHA 3K0VA 2YJPA 3MQ9A 4EF2A 5DEXB 4H65A 4FEBA 3RY3A 4M4GA 1MQHA 1M5DA 1ZU0A 1MDQA 2F78A 1PBQA 3MAMA 4KPTA 1B7ZA 2OBGA 1B3LA 1VFEA 1P1UA 2DOJA 1ELJA 4TLMB 4IGRA 3IO6A 3ILUB 1JEUA 4KI0E 1LCFA 1NNPA 1M5EA 3K6UA 3HN0A 2DVCA 2REJA 3IB1A 3VLUA 3F11A 3IJXB 4H1XA 1QUKA 3A09A 1TWYA 2B65A 3G3IA 4H5GA 2D3IA 3G3FA 4R74A 3OO6A 4KCDA 1ATGA 5AA4A 4ZEIA 4OEUA 3KOTA 4LUBA 4OETA 3FV1A 3H6UA 2DWJA 1B4ZA 4DXUA 2QPQA 2Z8DA 3CFZA 1LFGA 4R6KA 3DELB 5I2NA 5AA2B 2V93A 3CSBA 3ECRA 1PB8A 3VVEA 4F3PA 1XVYA 1FQAA 3QSLA 4ZEFA 3QUJA 4G77A 1HSLA 1XVXA 3O6GA 2NXOA 4GOTA 3C31A 5I59B 5B70A 1ZBMA 3SEUA 3SEWA 2DE4A 2A5SA 5TP9A 3OXNA 4OENA 4ZEKA 4KR5A 1XOCA 2CZLA 2ZNSA 4XKRA 4O3BA 1SW4A 1QKAA 3K1NA 1MQIA 2DWIA 3S9NC 5KDTA 3C34A 3TTNA 1NFTA 4NF4A 2I48A 2XXQA 5KCJA 4GQOA 1IUDA 4PFUA 3RUMA 4PQJA 1Y4TA 3TFLA 1NMUA 3FV2A 1CB6A 1BKAA 4RK9A 4ESWA 4ZEBA 3H6WA 1H3DA 1POY1 4ZEDA 2P2AA 2Q2AA 2XXRA 3FUZA 1RKMA 4U4SA 4RJZA 1URGA 1A8EA 2UYEA 2Q9TA 4F31B 3C35A 2I4CA 1JNFA 3M3KA 1MY4A 3IJOB 2RF1A 2AL4A 3HSTA 3N6UA 4EDPA 3OEKA 2DS9A 3I5OA 4E0WA 5CM6A 1B9JA 3U93A 2E0SA 1N04A 3D4GA 5I2KA 2XXXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1II5A 1USYE 4MX6A 2FVZA 1FPLA 4OHNA 1NUYA 4JBZA 4MF3A 4MNIA 3BKIB 3PPOA 3U65A 3TAJA 4TLLB 4BDMA 1RYXA 3EN3A 5H8FB 4FIMA 5ESYA 3PMXA 3CFXA 3BBRA 5EQAA 1OIBA 1EZ9A 4QRZA 3TZAA 4P8BA 2I49A 2ZZXA 1NNTA 1PDAA 4RNSA 1LBZA 1GR2A 2NOOA 2V3TA 4YAHX 3FXBA 3VE1B 2M8CA 4DIGA 3B6QA 1FBEA 2GH9A 1D9VA 1AH5A 1USYH 3GBBA 1FTJA 3S9EA 2V84A 1FBGA 3K02A 4IY5A 4PE5B 2Y5KA 4IO3A 4TOZA 4C1TA 1ZIUA 1P1OA 2V25A 2V3UA 2XWVA 2F7BA 4PFTA 4QFNA 3U72A 3ROJA 5H8QA 1A7LA 2QL3A 1IMFA 2D21A 3SEXA 4DXBA 3CFLA 3PD8A 3MVXA 3RTWB 1B4HA 2HAVA 5I2NB 4XKNA 3TCHA 3KN8A 2QSXA 2R8TA 4LATA 4MFIA 3FBPA 3DLNA 2CMOA 5FTHA 2ABHA 4NE4A 3LSWA 3O6IA 1NUZA 2KR0A 3A3CA 4Z7EA 5IZ3A 1JP4A 3HHFA 3T1BA 2Z23A 3CVGA 4Q5TA 2HZLA 3T93B 1TFAA 2WKYA 1UQWA 4PE3A 4LA9A 1FBCA 3S9LC 4XF5A 2IA4A 4PBHA 3T9XB 2A5TA 4MBPA 4OFJA 1YPNA 3K6XA 3G3KA 1B3FA 1Y20A 3IORA 2GHBA 1LBVA 3PV0E 1A99A 4IO4A 1FJ9A 3VLVA 2HXWA 5BUUA 1MXYA 4KCCA 2FHYA 2I6EA 4X1BA 1TXFA 3MP6A 2HCAA 4L17A 3SEVA 1DTGA 1VFDA 2HFBA 3G7WA 4U1ZA 1MY2A 5F24A 4EXKA 3C33A 1FRPA 1B1XA 5I57A 1LAFE 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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