1LCFA

Crystal structure of copper-and oxalate-substituted human lactoferrin at 2.0 angstroms resolution
Total Genus 222
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
222
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
GRRRSVQWCAVSNPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCLKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLKDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords LACTOFERRIN
publication title Structure of copper- and oxalate-substituted human lactoferrin at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Iron transport
total genus 222
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 1994-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lcfA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lcfA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lcfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1lcfA03
4R9FA 4PFTA 4GXAA 3PD8A 1MY0A 4KHZE 2H9BA 2RINA 3FZVA 2F7BA 2O6AA 4NF6A 4LA9A 1MM7A 3TAJA 1IXIA 2DWIA 2I3VA 3Q28A 2PT1A 3IJOB 1B32A 2F6PA 1B3GA 4GOTA 3AXFA 1MY1A 3S9MC 2F36A 4R6KA 4ECFA 4G8NA 1PBQA 2REGA 4QF9A 3H6UA 1LCTA 3O66A 3QSLA 4KCDA 4NF5B 3PPRA 3KSXA 3IOWA 1JEUA 3TTRA 3ZS6A 2HAUA 1Y3NA 2XD2A 4GXSB 2UXAA 1L5TA 2P2AA 1NH8A 2HZLA 2DWHA 4IO5A 4I62A 2ZXTA 2I4BA 4H8JA 3IOUA 2NOOA 4OEUA 2UVHA 1VFDA 3ILUB 4ISUA 1Y20A 3FJ7A 3LSXA 4M1VA 4N6PA 4GF8A 2O7IA 4QFLA 2A5TA 3VLUA 3B6QA 2IEEA 1NNKA 4LZ7A 1URGA 1NFTA 1B1XA 3G3IA 3QK6A 1IUDA 4DCYA 4O3AA 3G3KA 1B5JA 3LUYA 4R75A 4OYVA 1LFHA 3S9EA 3O29A 3UGWA 2QMXA 1D4NA 4IY5A 1BP5A 4R74A 2DXYA 4POXA 4YB6A 4F31B 3LSLA 3K2DA 3FIRA 2P1SA 1B3HA 2Z22A 5H8HA 1IITA 1M5EA 2H4IA 1MQJA 3OO9A 3KFMA 2W7YA 2Q2AA 1J1NA 1TWYA 4YKJA 2VP1A 5I56B 5CMMA 3MPLA 3QXMA 2B3BA 4U22A 4P0IA 4X48A 3MZBA 3CFLA 3UORA 1QVSA 3RTFB 3U92A 5CBSA 4BDLA 2R6GE 1A8EA 1DPEA 4YKKA 4LQ2A 4ND9A 4LONB 1LGBC 4IO3A 1IXHA 1EZ9A 2XXWA 1NH7A 5CRYA 2O84X 4EDPA 3T9XB 3T22A 3RUMA 1TXFA 1POTA 4EQ7A 3SEUA 1BIYA 1ZMGA 2XXTA 1JNFA 1MS7A 2HAVA 2G29A 3PPPA 3S4UA 2NUVA 5H8FA 4IO6A 3MP6A 3MVWA 4I1DA 4YICA 1UTHA 5BWJA 4NWDA 4KYDA 4OXVA 5L9OA 3FUZA 1URDA 1Y1ZA 4GIZA 4ELRA 1QUJA 4H5GA 1S50A 1UTHB 4RYAA 1LB9A 1B9JA 1ZU0A 1B4ZA 5ICQA 2RC7A 3HHFA 3UN6A 1Q1KA 1BTJA 1A55A 4YU0A 1FQFA 3TELA 2I48A 3OXNA 3H3GA 5I59B 2CZLA 3VXCA 5DVFA 1MQDA 1I6BA 2YPNA 3L6HA 1B52A 4MFIA 1MPCA 3PPOA 4I9DA 2Y7IA 3OEMA 5L9MA 3E9XA 2YJPA 2RC9A 3MWBA 5CBRA 2GFEA 3MZ9A 3BFTA 4OQOA 4H65A 1B58A 3EHUA 1H43A 4LATA 1UTBA 1B46A 4LZ8A 4QSCA 2F97A 3VFJA 4NMYA 3C32A 3TCHA 3O2AA 1FTMA 3IJXB 2AYSA 3MQ9A 4R6YA 4R9GA 5DEXA 4DIGA 2BJJX 4ZE8A 3CVGA 1MQIA 5KDTA 1DPPA 5AA3A 1N76A 4XKQA 4MLVA 3HHGA 3CR9A 2ESNA 4H6DA 1AIVA 3EPEA 3M3KA 1B05A 4OVJA 3RT6B 1N7XA 4IY6A 2RCBA 2KLFA 3SERA 5ISUA 1MPBA 2M8CA 5KDTB 4NF4A 4G2ZA 4GL8A 3SETA 3PMXA 2NXOA 1R6ZA 1FW0A 2H5YA 3IOTA 3GBAA 2NVUB 1AMFA 1Q35A 1LAGE 2G93A 3GLBA 3DLNA 5I2KA 2RC8A 2R71A 5I2NA 4XIGQ 1XS5A 2RCAA 1IEJA 1B7UA 3WAFA 2XXRA 1KWHA 3C36A 5IAIA 5TPAA 5JTYA 4PQJA 3QAXA 5CMCA 3OMBA 4OFLA 3K01A 3SKPA 1H44A 3O97A 3TFLA 3IL1B 4AB5A 1FQAA 5I2NB 1XVXA 1URSA 1P1OA 3FVGA 3DP8A 3V8XB 4KI0E 4FAJA 1UQWA 1ZJLA 1HSJA 5AA2D 3DP4A 4OEVA 2O1LA 2O69A 4YB7A 4OESA 2F7AA 2QS4A 2DS9A 4RXLA 4GFRA 4IO2A 3K6XA 4ZEIA 1QUKA 3RNNA 2V3TA 3K0VA 2R9JA 4TOZA 1YCJA 3VVFA 4PFYA 4RJZA 2ZYMA 2A5SA 1SW1A 2Y84A 4R73A 3TODA 4PE5B 4XKPA 2ZYOA 3U1OA 3B7DA 1OQHA 3PUYE 4ZEBA 1YPNA 3FGSA 1MH4A 1WDNA 3QIMA 3TYHA 1A7LA 4ELQA 4FECA 3MBPA 1Y9UA 1QKBA 4TLLB 3PPQA 2I6EA 2OWTA 2Q8JA 3PUWE 5K2YA 3U94A 3UA8A 5ITPA 3TTLA 1I6QA 1B0LA 4JB7A 3Q27A 1D9VA 1SI1A 5CMKA 3FJGA 3G3HA 4ONYA 3FXQA 4LQ5A 4JDFA 3PU5A 3ZKKA 1B3EA 1B40A 3FVNA 4RK9A 1NNTA 2QS2A 2DVZA 5AA4B 3TUSA 4WEPA 4JBZA 4YB5A 4NF5A 3KG2A 4C1TA 5F7VA 3UIFA 3IOVA 1NKXA 1S9TA 5J1DA 2F35A 4P0GA 4JSOA 1M5DA 1MQGA 4PETA 3A09A 4H0WA 4NEDA 2DE2A 3KOSA 1SBPA 4FEBA 1WVJA 3FV1A 3H6TA 3D4GA 1FTOA 3PMVA 1M5BA 3VXBA 1ELJA 1DSNA 3LC8A 4X1DA 1I6AA 3HCQA 1LFIA 1SD3A 4DE8A 2GH9A 3TKDA 1IIWA 1R1NA 2PT2A 3MUQA 5EHMA 4BDRA 5IKBA 3TTNA 5ELVA 3JZJA 4YAHX 3T9VA 2I49A 4YMBA 3HSTA 2XXVA 5F1QA 3RGYA 1PB8A 1FQEA 3C34A 1GTKA 4IO7A 5FHMA 1ZIUA 4DDDA 2QSXA 1FQDA 4YZZA 3KGCA 4THIA 3KZGA 3I5OA 2O1MA 1SW4A 5I56A 2XXXA 5FTIA 3KEIA 4F3PA 2F34A 3OSQA 4G68C 5ITOA 3G3JA 2Q88A 1ZTYA 3CRBA 1B6HA 1PB7A 2FYIA 4BDNA 3ECRA 4R2BA 4IGRA 3K02A 1B7HA 3LSWA 2Z23A 5BUUA 1HSLA 1N0TA 1O7TA 4ZECA 1UIUA 5CI5A 1MRPA 2DSFA 1US5A 5DTBA 2DVCA 2HCAA 1PB9A 4P11A 3TMGA 4GL0A 3VLVA 1AL3A 2XXQA 4EQ9A 5AE4A 4EXLA 3SEVA 4F1YA 3OSRA 3ZKLA 2E1SA 1LSTA 4F22A 3EN3A 3UK4A 1FTKA 2Q9TA 4JXIA 1QJMA 1BKAA 2OLBA 3SESA 1O64A 3RT8A 1OLCA 4GLIA 4IO4A 4PFWA 4U21A 4TQUQ 1MH3A 3OENA 4QHQA 3USDA 3BKIB 4HW8A 1TT1A 1S7YA 1AH5A 3T9UA 5AA2A 4GRKA 1MY3A 4F19A 1JW5A 2ONSA 4E0WA 4QSDA 3BBRA 4QSEA 5KCJB 1GGGA 3IB1A 3H03A 4H67A 3SDFA 5H8QB 4M4GA 3SEXA 4JSDA 5AA2B 1A8FA 3CIJA 3TEPA 3O6HA 5I59A 4OENA 4OMBA 3E13X 4N07A 3EHTA 1IXCA 5TU0A 1FQCA 4FIMA 1DTZA 4H5FA 1FCKA 4Z0IA 1MXZA 3FXRA 3VE1B 3UP9A 1WODA 4QFNA 3PUZE 4BDQA 1SW5A 1VE4A 4KPTA 4KQPA 4C0RA 1OVBA 3PUXE 4F1UA 2X7QA 1PEBA 1CE2A 3VLWA 4NE4A 4OFJA 5TP9B 1PDAA 2I3WA 4L17A 3M8UA 1I69A 4G77A 3E4RA 3FATA 3G3FA 3IO6A 1SQYA 3V5AA 4OERA 3IK6B 1A99A 1OQGA 2VOZA 5DVJA 2PVUA 1XHYA 3N94A 1A40A 3CI8A 2UYEA 3MPKA 1D9YA 3MVYA 1EH3A 2DXRA 3KN3A 1MDQA 5I58B 4EF2A 2ZNUA 1JQFA 3MZ1A 2D5WA 5L8DA 4R6HA 2NWJA 3FVOA 1B5HA 3FVKA 1US4A 1MDP1 1T0KA 1POY1 4DXUA 4U23A 2DOJA 2ONRA 3CFXA 1Z7ME 4QRZA 2QS3A 2OZZA 1VR5A 4POWA 4Q8RA 3T96B 3MVXA 5CM6A 4R2FA 1JW4A 3PGFA 3TPAA 3EQ1A 4ZEFA 4ZS9A 1B7ZA 3EF7A 1H45A 3FASA 4ZEKA 3IORA 1HSEA 4H1XA 3TQWA 3ONMA 1YAEA 2E0SA 3LSFB 1B5IA 3THIA 1JETA 4HCYA 3TQLA 4DCXA 5AA1A 2QS1A 1P1WA 4KCCA 3P7IA 3K1PA 1EZPA 4LVQA 2ONKE 3QUFA 2X26A 1N3XA 3CG1A 4XKNA 4BDMA 5KZTA 2XD3A 3CFZA 4G8MA 2THIA 3M3LA 3R26A 3TTKA 2ZYNA 2ALUA 1USYH 1LLSA 4KR5A 5A5XA 3W9VA 1Y1MA 1N84A 4NWCA 2Y7WA 4AQ4A 3OD7A 2PX1A 2REJA 1OLAA 3H6WA 2GRVA 3KBRA 2F7CA 4NF8B 4OETA 3L6GA 3ILTB 5A5XB 4U1ZA 2I4CA 2Z8EA 4Z7EA 3F11A 2FA7A 4FORA 3MP1A 1FTLA 4FEDA 4OFOA 3H7MA 3T66A 1NNFA 3KJ7A 2UVIA 1GR2A 2VD2A 2I0BA 4F2QA 2P0SA 3A3CA 2V3QA 4BDOA 4KD5A 2OWSA 3LR1A 3C9HA 2F6GA 4F39A 1LAFE 1ANFA 1UIVA 3K6WA 2Y7RA 4RNSA 5AA4A 1FTJA 3VVDA 4YKPA 5EHSA 3H4ZA 3DM0A 3TCGA 3K00A 4F3GA 1TFDA 3T93B 3Q26A 4IGTA 3JYRA 1R9LA 3MJNA 4OZ9A 1DMBA 4G68B 3W15C 1RYOA 4RPNA 4R72A 1IZ1A 1BLFA 4GWOA 4EXKA 2OCUA 1RYXA 4U2RA 2O68A 4LP2B 3CSGA 3ODBA 4F29A 1MQHA 3SEYA 2Z8DA 2VHAA 5I57B 3O9PA 5H8NB 1QUIA 3GZGA 2OK2A 1USYE 2QL3A 5HM4B 4F1VA 3IB0A 2GHAA 5FTHA 3FV2A 3V89B 2XX7A 4QFPA 4BLAA 4NF6B 1MPDA 1P1UA 1O63A 2H25A 4Q30B 1CB6A 3FD3A 2Q2CA 4ZZEA 3K6UA 2RF1A 3OO8A 3MW0A 2LAOA 2B3FA 4I8CA 1D3KA 1ZKBA 1Z7NE 3C33A 3OELA 2V93A 1MY2A 2F8DA 4MF3A 1NNPA 4ELPA 4ZEDA 2O7UA 3GBBA 3KN8A 3A3UA 3HN0A 2XXYA 4ESXA 4FATA 1P1QA 1LBCA 1B51A 5CMBA 2PBWA 2WKYA 4F3BA 3SEWA 4KFQA 4WKMA 2DWJA 2ZNTA 2DWAA 2QJEA 4MH5A 2XHDA 4YKIA 4GVOA 1VSOA 2QMWA 2CMOA 1H3DA 5EYFA 3RPWA 2VGQA 2A5TB 5L9SA 5LOMA 3RN8A 3N5LA 3K4UA 1IXGA 1R9QA 4KYSA 2XXPA 4F2OA 4H8IA 1OMPA 3IAZA 3CSBA 4LUBA 5JK4A 1B3FA 2XX9A 4DXBA 4OTEA 2AL4A 3N26A 2XXIA 1B3LA 1VFEA 4UACA 4PFUA 2ZMBA 3N6UA 2D3IA 4EQBA 4ESWA 3OOAA 5H8HB 2VD3A 4EUOA 3IB2A 4XKRA 4NTLA 3QYTA 2DP8A 4IB2A 1M5FA 3WAEA 2H98A 1Y4CA 2ABHA 3K6VA 1GV8A 5KCJA 1Y3PA 5H8QA 1LCFA 4DLDA 1B4HA 1MY4A 2UVGA 1MXXA 3OO7A 2XX8A 3PMWA 1XOCA 4F18A 1XVYA 2QRYA 4QFOA 4Q0CA 2ZYKA 3I6VA 2OBGA 2Z8FA 1NL5A 2DYXA 4U1OA 3U72A 3MC2A 3TDJA 4MBPA 3E3KA 1ATGA 4N13A 3OEKA 1A54A 1JVXA 2I0CA 5H8FB 4O3BA 4E0XA 3VDFA 2H99A 3MAMA 5TP9A 4HCWA 3C4MA 4G8HA 4Q5TA 1IQ7A 4X9TA 3S9NC 2V25A 3Q25A 1MG1A 3I3VA 5ICTA 4OHNA 3TCFA 2PYYA 5FHOA 3N6TA 5JEIA 4KYEA 1Y4TA 3CG3A 4LZ5A 4XTCQ 4WXJA 2XXUA 5I58A 3U8QA 3TTMA 1ZLQA 2UVJA 2PMSA 5B70A 1MXYA 2F78A 5B7DA 2HXWA 2YLNA 2Q89A 4XXUA 4RK2A 1EU8A 3PV0E 4RA1A 1B2HA 4F3SA 5DYHA 3K1MA 3KJTA 1LAHE 5DVIA 2RKMA 5M2VA 1AOVA 1QULA 2QPQA 4JWYA 2D21A 3S2VA 3RQTA 4RY1A 4C1UA 3RLFE 1YTVA 2Y7KA 2GHBA 4U4SA 3R6UA 2OJTA 3PD9A 3IX1A 4HS7A 1OVTA 1PC3A 3DELB 1UTBB 1XT8A 3HPIA 1JEVA 1QKAA 2HFBA 2AIXA 4OWDA 3IR1A 2DQVA 4ZE9A 4DXCA 1MXWA 1II5A 4QFKA 1N04A 3C31A 2AL5A 3OO6A 5DEXB 3JV9A 3Q29A 3S9LC 1LB8A 1SDXA 2HEUA 3W9WA 1SYIA 3B6TA 1FQBA 3ZSFA 1F9BA 3PUVE 4ELOA 4GD5A 2HQ0A 1XC1A 3T9HB 1DTGA 3M3FA 3KOTA 3IO4A 4ZZAA 2DE4A 3BFUA 1ZBMA 3LBSA 1QW0A 5HBCA 4DZ1A 1B1HA 4NF4B 3VV5A 3HV1A 1DOTA 3O6IA 2X7PA 3KSJA 4EF1A 3MVZA 1NMUA 3TZAA 1P1NA 1TFAA 5I2KB 1B0HA 1Y3QA 3R7XA 4RPOA 4PP0A 1JVYA 3B6WA 3FJMA 4NF8A 1M5CA 4FJPA 3G3GA 2DE3A 1PBPA 3H6VA 5TPAB 3KN7A 2V84A 5JTYB 1RKMA 1MM6A 1EZOA 1LAXA 1H76A 2O51A 4GQOA 4MLQA 3HO7A 4AB6A 4WEDA 5HPQA 5I84A 3GXAA 3EHSA 4UA8A 5K2XA 1P99A 3G7WA 4TLMB 3FXUA 3DP6A 3QUJA 1JW1A 3H06B 4JWOA 3O28A 4X1BA 2F5XA 4ZDMA 2V3UA 1SYHA 2FNCA 5FHNA 3RTWB 3U93A 1GVCA 2UYFA 4U4XA 1MXUA 3RY3A 3V83A 2ANJA 1OIBA 1SW2A 2B65A 5CC2A 4K3FA 1N7WA 1SVXB 2XXHA 2I58A 5DT6A 3K1NA 3PPNA 3VVEA 1LBBA 4G68A 3D4CA 4O3CA 3C35A 2ZNSA 1N3WA 1LFGA 4JWXA 5H8SA 2Y7PA 3O6GA 2HZKA 1SI0A 4G4PA 4YMAA 2IA4A 5I57A 4FE8A 1MXVA 5H8NA 4HTGA 3MP8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4R9FA 4PFTA 4GXAA 3PD8A 1MY0A 4KHZE 2H9BA 4PTKA 2RINA 2HHMA 3FZVA 2F7BA 3BIHA 1FBFA 2O6AA 4NF6A 4LA9A 1MM7A 3TAJA 5EQ7A 1IXIA 2DWIA 2I3VA 3Q28A 2PT1A 3RPLA 3IJOB 1B32A 4AS4A 2F6PA 1B3GA 4GOTA 3AXFA 1MY1A 3S9MC 4PGNA 1FBCA 2F36A 4R6KA 4ECFA 4G8NA 1PBQA 2REGA 4PF8A 4QF9A 3H6UA 1LCTA 3O66A 3QSLA 4KCDA 4NF5B 3PPRA 3KSXA 3IOWA 1JEUA 3TTRA 3ZS6A 4N91A 2HAUA 1Y3NA 2XD2A 4GXSB 2UXAA 3E78A 3RPLB 1RDZA 1L5TA 1NV7A 4N6DA 4I3YA 1FBGA 2P2AA 4MIJA 1NH8A 2HZLA 2DWHA 4IO5A 4I62A 2ZXTA 2I4BA 1INPA 4N8YA 4H8JA 3IOUA 2NOOA 2QVUA 4OEUA 2UVHA 1VFDA 3ILUB 4ISUA 1Y20A 3FJ7A 3LSXA 4M1VA 4N6PA 1DCUA 4GF8A 2O7IA 1LBZA 4QFLA 4XEQA 2A5TA 2VT5A 3VLUA 2P3VA 3B6QA 2IEEA 1NNKA 4LZ7A 4MMPA 1URGA 1NFTA 1B1XA 3G3IA 3QK6A 1IUDA 4DCYA 1Q9DA 4O3AA 3G3KA 1B5JA 3LUYA 4R75A 4OYVA 1LFHA 1NUYA 3S9EA 3O29A 3UGWA 2QMXA 1D4NA 4IY5A 1BP5A 4R74A 2DXYA 4POXA 4YB6A 2Q74A 4PAFA 4F31B 3LSLA 3K2DA 3FIRA 2Y5LA 2P1SA 1FRPA 1B3HA 2Z22A 5H8HA 1IITA 1M5EA 2H4IA 1MQJA 4MNIA 3OO9A 3KFMA 2W7YA 1FPGA 2Q2AA 1J1NA 2B4MA 1TWYA 1LBXA 4YKJA 4GWXA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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