4LZ5A

Crystal structures of glur2 ligand-binding-domain in complex with glutamate and positive allosteric modulators
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Discovery and Characterization of a Novel Dihydroisoxazole Class of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic acid (AMPA) Receptor Potentiators.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz5A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz5A02
4OESA 1YAEA 3UN6A 2E1SA 4E0WA 1QJMA 2XXWA 2NOOA 5HBCA 3T22A 3UIFA 1JEUA 3LBSA 3B6QA 2I3WA 1VR5A 2ANJA 3OO8A 4U4XA 4E0XA 3GLBA 2A5TA 2DSFA 2XXVA 1Z7ME 3K6UA 2VD2A 4X9TA 3OELA 4OVJA 2F6GA 3FXUA 2HZLA 4BDNA 1LLSA 4H6DA 4G8MA 2P0SA 4ELOA 1MQGA 2I49A 2GH9A 5M2VA 1I6QA 2UVIA 2PYYA 4WEPA 3QAXA 3PUZE 1N7WA 2XXTA 2HXWA 4O3BA 2XX8A 5TU0A 3TCHA 2I4BA 5DT6A 1WODA 3C4MA 3HHGA 2RKMA 4NF8B 3S9LC 1JW1A 4HCYA 1LBBA 4JWXA 3S2VA 5FHOA 2I48A 2XD3A 4DXUA 4RXLA 3RTFB 2O69A 1TFAA 5FHNA 1QW0A 2NUVA 3ZSFA 2QL3A 4NF5B 4GL0A 1TFDA 3HV1A 4MF3A 4GVOA 4YKPA 3T9VA 3CSGA 3MJNA 2X26A 1MH4A 4H0WA 5BUUA 4NF6A 2XX7A 4LZ7A 4DCYA 1MG1A 3MPLA 4GD5A 1AL3A 4EF1A 5ITOA 4LZ8A 4L17A 5DVJA 4X1BA 1MS7A 2UVJA 3KZGA 3FVNA 3N94A 1Y1MA 4F2QA 4THIA 4F1YA 1PB8A 3EHTA 5I59B 5DYHA 1B5IA 1A54A 2ONSA 3TELA 1MY4A 3PD9A 3PUXE 5I2KB 1JETA 4U1OA 1I69A 4ECFA 3G3FA 3IK6B 2GHBA 1MXUA 4LP2B 1DSNA 3O66A 3ZKKA 3N6TA 2XHDA 2V3TA 1B0HA 1ZMGA 3PD8A 1N3WA 3SEXA 4QHQA 3RN8A 3CI8A 3OO7A 3TAJA 4RA1A 2XXQA 2G29A 5B7DA 3MVZA 5LOMA 3CIJA 2DS9A 2I0BA 1MY3A 5JTYB 1R6ZA 2QPQA 2HFBA 3K00A 4QSEA 2Z22A 2XXIA 3O6IA 1XT8A 3LUYA 4QFOA 2YJPA 3C32A 5H8QA 2OJTA 1N04A 4ZE8A 2OCUA 4AB6A 2UYFA 2PMSA 5B70A 4YAHX 3N26A 4MLQA 3RT6B 2D5WA 1FW0A 3ECRA 1JW5A 4ZEDA 3QSLA 5AA2D 5BWJA 1FQAA 1CE2A 2DWIA 2H5YA 1FQFA 4OWDA 4F2OA 1VFDA 5H8HA 1A55A 2RCBA 3MP6A 4XKPA 1ZTYA 3SEUA 3Q28A 3GZGA 1MDP1 4YB7A 5JEIA 1D9VA 4OXVA 3KSJA 3IOVA 3H4ZA 4WKMA 3MZ1A 4NF4A 4G68B 3PPQA 5I2NB 2XX9A 4H5FA 5KCJA 1NH8A 1SVXB 3IB2A 1N7XA 2HAUA 5IKBA 4F31B 3MVWA 1Q1KA 2DQVA 3DELB 3FJGA 4GQOA 3O28A 1SW4A 3FVGA 2D3IA 1BTJA 1BKAA 1RYXA 1XHYA 2ALUA 3GBAA 4YB5A 2RF1A 1XC1A 4Z7EA 3HO7A 3MP1A 5IAIA 1HSJA 1I6AA 3MP8A 2OLBA 3UORA 3VXCA 2O7UA 4PETA 5L8DA 5DEXB 1B4HA 1PBPA 5ISUA 2XXUA 4GFRA 5HPQA 2OWSA 1XVXA 4RK9A 3TODA 1DTGA 3WAEA 4I8CA 4ZEKA 1D9YA 4YKJA 5DVFA 3TTRA 1EZPA 4QSCA 2RC8A 2AIXA 2X7QA 3RT8A 4ONYA 3RLFE 4R2BA 3MZBA 1OLCA 2V84A 4KCCA 1PB9A 1Y3NA 2Y7PA 4OHNA 4FATA 3K6WA 4ZZAA 1JVXA 3K6XA 1B5HA 1ZJLA 4ISUA 4Q8RA 2OK2A 4WEDA 2AYSA 4FEBA 4R9FA 3LC8A 4ELPA 3V89B 4EUOA 1N76A 2FNCA 4RY1A 4NWCA 3T96B 2QJEA 3A09A 4QFKA 2Q2CA 3IJXB 5I56B 2I58A 1YCJA 1MPCA 4BDRA 1JW4A 2YPNA 2Q2AA 3VVDA 3G3GA 1URGA 1MH3A 4IB2A 2DVZA 3EHUA 1GTKA 4FIMA 1TWYA 1NMUA 1N0TA 1URDA 1IXIA 5CBRA 2DE4A 3O9PA 1Y3PA 1AH5A 2ZYMA 4MLVA 2BJJX 2VOZA 3MBPA 2RINA 4G8HA 3K02A 3T93B 5A5XB 1UTHB 4I1DA 3MZ9A 2PX1A 4GLIA 1L5TA 2H4IA 3C34A 3TZAA 1NNTA 3G3IA 1PDAA 1Y20A 3C33A 5CMBA 4OENA 2FYIA 1IZ1A 1B5JA 1US5A 2NWJA 3QUFA 2ZNSA 3M8UA 1US4A 1B7UA 4GF8A 2B3FA 3SERA 1IIWA 3HSTA 4XXUA 1LB8A 1YTVA 5TP9B 2W7YA 5ELVA 3TQLA 1S50A 3USDA 2NXOA 4O3CA 3SEYA 1LAFE 1MXXA 3TTLA 4BLAA 2Y7RA 4OMBA 3KN8A 2Q8JA 1NNKA 3H6WA 5TPAB 2XD2A 1MY2A 2UXAA 4KFQA 3BKIB 1A8EA 1H76A 1B3FA 1FTKA 1Y4CA 3PU5A 5FHMA 1SQYA 3FXQA 3IAZA 3MQ9A 4KI0E 1HSEA 5EHSA 2IA4A 4BDLA 4KR5A 4IO5A 5CRYA 3H03A 3PPPA 1DMBA 3U8QA 1B3HA 4OEVA 2Y84A 2DWHA 2QS3A 3H06B 1SW2A 3H6TA 2XXHA 2DE3A 2OWTA 4DXCA 5I58B 3ZS6A 1PB7A 2V93A 3QYTA 3LSXA 3AXFA 2XXPA 3TKDA 2QS1A 1MQJA 4GL8A 1B0LA 2F7CA 4P11A 2GHAA 1SD3A 2ONRA 4KCDA 3VVEA 1H44A 3JYRA 4DE8A 4ZECA 1RYOA 3IOTA 2HZKA 2A5TB 2Y7WA 4R6HA 2LAOA 3GBBA 3VVFA 1ZLQA 2GRVA 3T9HB 3KFMA 3ILTB 5AA1A 3M3KA 5CBSA 2Y7IA 2YLNA 2O68A 5K2YA 4OETA 2QMXA 1OQGA 1Y3QA 3KJ7A 5ICQA 1AOVA 3THIA 2X7PA 1B58A 2F6PA 4F3BA 4BDMA 3U72A 2ZNUA 4JXIA 1OVBA 2B65A 3W9VA 4TLMB 4LQ5A 1B46A 4YKIA 2VHAA 3PUYE 4YKKA 3PMXA 3IOWA 3DM0A 1II5A 4XKNA 4YICA 1ATGA 2R6GE 4IO4A 1IITA 2Q89A 1M5DA 4F39A 3SKPA 2WKYA 5JTYA 1FCKA 2Z8DA 1B3EA 1JQFA 1MM7A 4R72A 4PE5B 4NF6B 3SETA 3G3KA 3VXBA 1SW1A 2F36A 3G3JA 3F11A 1FQEA 4H67A 4KQPA 3K01A 1AIVA 3RTWB 2F35A 1HSLA 1Q35A 1GV8A 2VD3A 3UP9A 4ESXA 1R9LA 4F22A 1NNPA 4GXAA 2KLFA 4XKRA 4RK2A 5CM6A 4F29A 3KG2A 4H65A 3FVKA 5AA4B 3V5AA 5CMCA 4XTCQ 4KYSA 4QFNA 1OMPA 4GXSB 5EYFA 3VDFA 3EHSA 2UVGA 3TTKA 3ODBA 3KOTA 4MFIA 4H5GA 1QUIA 4JWYA 1SYIA 3S9NC 2O84X 2F5XA 3WAFA 5H8FA 3VFJA 5L9OA 1LCFA 2ONKE 4G68A 1I6BA 5J1DA 1B3GA 2F78A 2QS2A 3U93A 4PFYA 1POTA 4AB5A 4PFUA 4IO2A 2RC7A 1TXFA 1JVYA 3KN7A 4JSDA 1TT1A 5DVIA 1GGGA 1IEJA 3DP4A 1URSA 2DXYA 5KDTA 3FZVA 1F9BA 1Y9UA 3E4RA 4XKQA 3PMVA 1FQBA 3K1PA 4DIGA 1SI0A 4NE4A 3LR1A 3SEWA 1FTJA 1WDNA 3BBRA 3FATA 4DXBA 1B51A 3IB1A 2PBWA 1ELJA 3IX1A 4JDFA 4QFLA 1B05A 1B3LA 3O6HA 1MQDA 3GXAA 4X48A 5DEXA 2QRYA 2PT2A 2RCAA 2O51A 3C9HA 3E3KA 5H8HB 3TCGA 3Q25A 1LAGE 2DWAA 3OD7A 2Z8EA 3VLUA 1QUJA 1DPEA 3OSQA 4BDOA 1M5CA 4DCXA 2OBGA 3ILUB 1SYHA 4RYAA 4LA9A 3QK6A 4C0RA 3FVOA 3OO9A 3DLNA 3JZJA 4C1TA 3EN3A 4F19A 3LSWA 4PQJA 3BFTA 3E9XA 5L9SA 4GRKA 1A99A 3TQWA 1B52A 4P0IA 3MVXA 4QSDA 3TCFA 2QSXA 1MXWA 3T9UA 2Y7KA 4ND9A 5I57B 5I84A 1DPPA 1H43A 2RC9A 3L6HA 4MH5A 4OZ9A 3QUJA 2O1MA 2CZLA 5CI5A 3I3VA 3MPKA 4FAJA 5KZTA 4OQOA 3ZKLA 1CB6A 1MXYA 1LAHE 3U94A 4FJPA 4PFTA 1VSOA 2GFEA 1DOTA 4EXKA 3EPEA 1P1UA 1P1QA 4DZ1A 1LFIA 1M5BA 1T0KA 1XVYA 2HEUA 1SBPA 3TTMA 3VE1B 4C1UA 1R1NA 3PUWE 1MXZA 5ITPA 3G3HA 3DP6A 5CMKA 1YPNA 2IEEA 1UIUA 5L9MA 1O64A 4ZEIA 3O6GA 4ZS9A 2P2AA 3RGYA 4IGTA 4OERA 1VE4A 5EHMA 4N13A 3OOAA 5TP9A 1MY1A 1XS5A 3V8XB 4R6YA 2A5SA 3OEMA 2Q88A 1P1OA 3C36A 5H8NA 4JBZA 5FTHA 2DYXA 5HM4B 4LUBA 4ZZEA 3TUSA 1QKBA 2I4CA 3JV9A 4OYVA 3OEKA 5AA2B 1IQ7A 1IXHA 1ZBMA 3RQTA 4Q0CA 2UYEA 4G8NA 4F1VA 4U23A 3I5OA 3IOUA 1IUDA 1AMFA 3D4CA 4IO6A 3PMWA 2ABHA 5CMMA 1UTBB 4R73A 2HQ0A 1D4NA 4ELRA 2D21A 2REGA 3B6WA 1OQHA 1USYE 3PV0E 3O2AA 2I3VA 5I58A 2V3QA 2Z23A 2OZZA 3LSFB 4IY6A 5K2XA 1O63A 4NTLA 3UGWA 1LAXA 1A7LA 4KD5A 4ZEBA 4POXA 1BIYA 3QIMA 1NL5A 4YMBA 1WVJA 3IJOB 4QFPA 2Z8FA 4QF9A 4R75A 2I0CA 3VLVA 2E0SA 4UA8A 3S9EA 3H6UA 2P1SA 3RPWA 3E13X 4OFJA 4JSOA 4NF8A 3FD3A 3MC2A 1EZOA 4R9GA 1P1WA 4G4PA 1PEBA 2F8DA 3CG1A 3VV5A 2FA7A 4LVQA 4ZDMA 4NF5A 1ANFA 1N84A 1BLFA 2VP1A 1P99A 1PBQA 2QS4A 4U2RA 1EH3A 1LBCA 3N6UA 3B6TA 3C35A 4U1ZA 1UIVA 4HW8A 1LSTA 2F7BA 3K1MA 3FGSA 3RNNA 4H8JA 3CFZA 3O97A 3BFUA 4EDPA 1B32A 3MVYA 4RPOA 1ZU0A 4H8IA 4R74A 3FJMA 3W15C 4NEDA 1B1HA 1OIBA 4KPTA 5I59A 3Q26A 4JB7A 1B4ZA 4HCWA 1GVCA 4F3SA 1R9QA 3TFLA 5I2KA 1LCTA 4Z0IA 3C31A 1N3XA 1MQIA 4FORA 3IB0A 3OO6A 1MXVA 3H3GA 1IXCA 3DP8A 3KBRA 4FE8A 4RPNA 4PP0A 4I9DA 3QXMA 3LSLA 4G2ZA 4U22A 4GIZA 4ELQA 4KHZE 1JEVA 3KOSA 1O7TA 1D3KA 3OENA 1PC3A 4IY5A 3U92A 3CRBA 4PFWA 1IXGA 4NMYA 3V83A 5DTBA 1NH7A 4GOTA 3UK4A 2DXRA 3EF7A 3N5LA 1MPDA 5AA4A 1MDQA 1FTOA 4LZ5A 3ONMA 4OFOA 3G7WA 3K2DA 4KYDA 3OSRA 4I62A 3CSBA 3IO4A 2I6EA 4POWA 1LB9A 2VGQA 1QULA 1FQDA 2PVUA 3H7MA 3MAMA 3A3CA 4WXJA 5CC2A 2H99A 4X1DA 3O29A 1NFTA 3KJTA 1M5EA 4U21A 2M8CA 1Y4TA 4M4GA 3R6UA 3TTNA 2ZYOA 4FECA 2ZYNA 1FTMA 1QVSA 4IGRA 4OEUA 4OFLA 4EQBA 1JNFA 4H1XA 2DOJA 4R2FA 2V25A 4O3AA 3FIRA 4BDQA 4YB6A 4TLLB 5I2NA 1B6HA 4R6KA 1B9JA 1LGBC 3SESA 2DP8A 4UACA 3TYHA 1A40A 2HCAA 3P7IA 1FQCA 2O6AA 4YMAA 4Q30B 3SEVA 4IO3A 5AA3A 1OVTA 5H8QB 3UA8A 4FEDA 4NWDA 3HPIA 2H9BA 1S7YA 1Y1ZA 1RKMA 3HN0A 4P0GA 1MPBA 4F1UA 4LQ2A 4M1VA 2REJA 5H8FB 3KN3A 1ZIUA 3FASA 3S4UA 2ZYKA 3IR1A 3IORA 3CVGA 1MRPA 2DWJA 3MWBA 1VFEA 4DDDA 4G68C 1OLAA 3FV1A 2UVHA 3MUQA 1P1NA 4G77A 4ZE9A 4OTEA 3I6VA 3K6VA 1B7ZA 1B7HA 2H98A 2XXRA 3PGFA 5KDTB 3Q27A 3CG3A 2O7IA 4JWOA 1LFHA 5AE4A 2F7AA 2ZMBA 4NF4B 3R7XA 2F34A 5I57A 1POY1 4MBPA 4LONB 3Q29A 5KCJB 1QUKA 2HAVA 4ESWA 3CFXA 3B7DA 1UQWA 2ESNA 2Q9TA 4HS7A 4AQ4A 4U4SA 1SI1A 3M3LA 1EZ9A 3KSXA 1XOCA 1MQHA 4YU0A 3FUZA 4RJZA 4F3GA 1KWHA 1GR2A 2B3BA 4EF2A 5I56A 5F1QA 2XXXA 1M5FA 4N6PA 3A3UA 4EQ7A 4LATA 3D4GA 3M3FA 4HTGA 3IL1B 3HCQA 1USYH 1Z7NE 3W9WA 2AL4A 1B40A 2NVUB 3TMGA 3S9MC 1A8FA 3K0VA 1MM6A 2H25A 3PPRA 1LFGA 1EU8A 2R9JA 1ZKBA 4K3FA 1BP5A 5A5XA 1UTHA 1NKXA 4TQUQ 3RUMA 1QKAA 1FTLA 2DE2A 5JK4A 3TDJA 3MW0A 4N07A 1DTZA 3OMBA 4KYEA 5H8SA 1MY0A 5FTIA 2O1LA 4DLDA 3FXRA 2AL5A 2QMWA 2F97A 3K4UA 2ZNTA 1H3DA 4F18A 5AA2A 3HHFA 3L6GA 3PPOA 1SDXA 3TEPA 4RNSA 4ZEFA 1UTBA 5TPAA 3OXNA 2PT1A 3R26A 3VLWA 2THIA 1SW5A 3CR9A 4TOZA 1J1NA 2G93A 2DVCA 3H6VA 4EXLA 2R71A 4GWOA 2CMOA 3PPNA 1S9TA 3KGCA 3SDFA 1B2HA 4XIGQ 3TPAA 2V3UA 2ZXTA 3RY3A 3PUVE 3CFLA 3K1NA 4IO7A 3T9XB 3EQ1A 3FJ7A 1NNFA 3T66A 4Q5TA 1H45A 4YZZA 3KEIA 5ICTA 4F3PA 1B1XA 3U1OA 3IO6A 5H8NB 2XXYA 3FV2A 5F7VA 4QRZA 4EQ9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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