4LZ5A

Crystal structures of glur2 ligand-binding-domain in complex with glutamate and positive allosteric modulators
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Discovery and Characterization of a Novel Dihydroisoxazole Class of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic acid (AMPA) Receptor Potentiators.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz5A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz5A02
5KDTB 3K00A 1L5TA 4OENA 4QFLA 2VHAA 1SQYA 4RYAA 4PE5B 4U23A 4M1VA 4POWA 2GHBA 3KEIA 3H6UA 2Q8JA 1FTJA 1DPEA 4F2QA 1SW5A 4EQBA 4IY6A 3RLFE 4EF1A 2QPQA 1FQBA 2B3FA 3L6GA 4NF4B 1MH3A 3UN6A 4THIA 4DDDA 3EF7A 4LZ5A 5HM4B 1HSJA 4RK2A 4EXKA 2XXIA 4Z7EA 3HPIA 3KOSA 1MY4A 2FYIA 3RNNA 3OD7A 5AE4A 5DVFA 4QFOA 4RY1A 2P1SA 2RCAA 1MQHA 3TQWA 2H5YA 2OWSA 4H8IA 3O9PA 4GVOA 2Y7PA 2B65A 4F29A 1T0KA 3G3IA 1HSEA 2ALUA 1B6HA 3DM0A 1UTBA 1LBBA 2AYSA 1OVTA 1RYOA 3KZGA 2V3UA 2DVZA 4LZ7A 5L9MA 3OXNA 3QYTA 5CMBA 2F6GA 3V89B 3ONMA 2WKYA 2Z8DA 5I59A 5B70A 1LB9A 3ZSFA 2Z23A 2D3IA 2I0BA 4LP2B 3IX1A 3IO6A 3PD8A 4OERA 5CBSA 4YB6A 1QUJA 3FV1A 5HPQA 3G3GA 3PU5A 3VLVA 1NH7A 4DCXA 1OIBA 3C33A 3QSLA 1B46A 2I3VA 1O7TA 1NFTA 5ELVA 4RPNA 1J1NA 1TWYA 3CG3A 3DLNA 3CI8A 1PC3A 1USYH 1S7YA 5I57A 3B6TA 4KYSA 2F78A 4NTLA 3FJGA 3Q29A 3RTWB 4IO3A 1ZU0A 4NWCA 2M8CA 1R1NA 2F7CA 1LAGE 1ZKBA 3A3UA 5K2XA 3QIMA 4OTEA 5I59B 3TCHA 5EHSA 4JWYA 3VV5A 1KWHA 2VD2A 1CE2A 2DSFA 4O3CA 1NNTA 2PYYA 3T96B 4QFKA 5CC2A 4PETA 1N0TA 2ZNSA 1LFIA 3PPQA 1MY1A 1H43A 3RGYA 4BLAA 3TPAA 1DTGA 3OO8A 2DWIA 4U1OA 4U21A 1P99A 4H5GA 2RC7A 3N6TA 4FE8A 2QS3A 3HN0A 3PPNA 5FHMA 4GF8A 3IL1B 5ICTA 1MXUA 2Q9TA 2RC8A 2ZNUA 5I56A 1EH3A 4OETA 1LFHA 4ECFA 3TTLA 4X1DA 2ZYMA 1RKMA 1TFDA 2H4IA 1JEUA 3FXRA 1PBPA 4NEDA 3MP8A 3ZKLA 3T22A 1Y1MA 5AA1A 2O7IA 3FASA 4YKPA 3IOWA 2XXVA 4R72A 3T9VA 1LAXA 3CFLA 4G8MA 4PFUA 1F9BA 2Z8EA 3F11A 4G8NA 4RJZA 4ZDMA 3LBSA 3PD9A 2RC9A 4EXLA 3QAXA 3K02A 4YAHX 1N7XA 3CVGA 2F34A 4JSOA 4R73A 3N6UA 3PPRA 4JWXA 1H76A 4H5FA 1SW1A 5L9SA 1WDNA 1EU8A 4IB2A 3HSTA 1JETA 3ECRA 2VP1A 4I8CA 4GD5A 3JYRA 1LCFA 2UYEA 3G3KA 2QJEA 1OLCA 4XIGQ 1JEVA 1MQIA 3IJXB 4POXA 3EN3A 3H03A 3V8XB 1TT1A 1IXHA 4ESXA 1NL5A 5I84A 1QKAA 3USDA 5I2KA 2XXQA 1B7HA 4H1XA 4DLDA 4ZS9A 1UTHB 2UVGA 1B4HA 1IEJA 4ELRA 4IGTA 1MQJA 2XX7A 2XXYA 3K1PA 1ZBMA 2DVCA 4IY5A 2NWJA 2O68A 3PPOA 3MQ9A 4Q0CA 5JTYA 1LFGA 1A54A 3HCQA 3D4CA 1XT8A 4C1TA 2H99A 1GTKA 4LUBA 2CMOA 3OO7A 4F3GA 5DEXA 2O1LA 5AA2D 2RINA 1UIUA 1NNPA 1VSOA 1JNFA 1GVCA 3K1MA 3MP1A 1H45A 3DP4A 2QS1A 4LA9A 1QUKA 4JSDA 3PV0E 2X7PA 2DWHA 3G3FA 2XXUA 2GHAA 2I48A 3ILUB 3PPPA 5I2KB 2VOZA 3R6UA 1MS7A 1POTA 1VR5A 3FD3A 3TTNA 4YICA 1OVBA 2VGQA 5JK4A 5CRYA 4F3PA 2ABHA 1SBPA 1UIVA 2QS4A 4YB5A 3AXFA 4C0RA 1MPCA 4YZZA 2ONRA 4P0IA 3FVGA 5JTYB 3FJ7A 2B3BA 5AA4A 2F5XA 1B05A 3QXMA 3KSJA 2YPNA 3L6HA 3HV1A 3R7XA 4FIMA 1IXIA 1URSA 3FXQA 1MXWA 3OELA 5H8SA 1IXCA 1Q1KA 1I69A 2PMSA 1A8FA 1M5DA 2ZNTA 4OFOA 4H6DA 1SI1A 4XTCQ 3SEYA 3SEUA 3U94A 3ILTB 4MF3A 4NE4A 5BUUA 4XKRA 4GIZA 1GV8A 2XHDA 3W15C 1PEBA 1B1HA 1SDXA 3TCGA 3SDFA 2DE3A 5H8NA 3T9XB 2NXOA 3GLBA 2NVUB 1TFAA 4RK9A 1EZOA 1MY3A 2X26A 3MVYA 4AB5A 4ELPA 2V93A 3WAFA 3C34A 4I62A 1A99A 3FGSA 5AA2A 2W7YA 4R74A 4MFIA 3IAZA 4E0XA 1N7WA 5TU0A 1CB6A 3E4RA 1OQHA 4MH5A 3SKPA 2XXPA 4Z0IA 2UYFA 5AA4B 3FATA 2Z22A 2E1SA 4ZEDA 4DXUA 2PT2A 3BFUA 1FW0A 5LOMA 2ZYNA 2ZXTA 4DZ1A 4ZEKA 1B1XA 3KFMA 3SEXA 1JW4A 1A7LA 1ATGA 3THIA 1PBQA 1PB9A 4UA8A 3C31A 1VFDA 3QUJA 3MVXA 3MP6A 3CR9A 4NF5A 3DELB 3C32A 4XXUA 2NUVA 3GBBA 3PMWA 1ELJA 2THIA 3K01A 3PUWE 3B7DA 5H8NB 2QMXA 4U4SA 3E13X 4R6YA 3UA8A 3RN8A 4QFNA 5I2NA 2ONSA 1M5EA 2Y7KA 3B6QA 2HFBA 4YMBA 2I4CA 5AA2B 1LCTA 3N94A 1XC1A 2H25A 2QL3A 2I4BA 3RT8A 3OOAA 1P1UA 2AL4A 4IO4A 2D5WA 1POY1 4LONB 4HS7A 4N07A 1I6AA 3MPKA 1JVYA 2DXYA 3CSGA 3C36A 1SYIA 3FVNA 5F1QA 4WEPA 2NOOA 3MW0A 3CFXA 4PP0A 4F1YA 1A8EA 3LSXA 4XKPA 4R6KA 3VVFA 1RYXA 2DXRA 4ONYA 1UTBB 2O1MA 4ND9A 4KCDA 3MZ9A 1M5FA 5HBCA 4OWDA 3Q26A 1N3WA 4L17A 4RXLA 5A5XA 3I3VA 1EZ9A 3RT6B 3IOUA 4M4GA 4N13A 3TDJA 3E3KA 3H6VA 2F6PA 4NF5B 4GOTA 1B7ZA 3TKDA 4EQ7A 1B2HA 1MDP1 5ITOA 4TOZA 4OFLA 4LZ8A 1B3EA 2ZMBA 3PGFA 3KJ7A 1B4ZA 1P1NA 3LR1A 2Y7RA 4QHQA 3IB1A 4LQ5A 1PB7A 1MY0A 3MVWA 2F36A 4YKKA 4OZ9A 3C9HA 4F18A 2QS2A 4BDNA 4U4XA 4EQ9A 4GXAA 3K0VA 2R9JA 2I58A 4HCWA 4KR5A 3C35A 5K2YA 2G93A 4OESA 5DVJA 2DWJA 4DCYA 3FUZA 3CIJA 4OXVA 5IAIA 1P1OA 3S9NC 3ZS6A 3KN8A 1WODA 1MDQA 1A55A 2DYXA 3TYHA 2I49A 4JWOA 5I57B 1FTOA 4YKIA 3VLWA 3MC2A 4OMBA 4QRZA 5AA3A 1Y20A 2KLFA 3FV2A 1VFEA 4ZEFA 4NF6A 4R9GA 5FTIA 1AL3A 4G77A 1P1QA 2H98A 1FTKA 3H4ZA 3ZKKA 4QFPA 1UQWA 1B0HA 3V5AA 1SYHA 4F1UA 2O6AA 3O97A 1SD3A 2F7BA 1B9JA 1YCJA 4KFQA 4BDQA 2A5TA 2HEUA 3VVDA 4UACA 3CG1A 3O29A 3FZVA 4KI0E 4EUOA 3FIRA 1ANFA 3Q27A 2UVIA 5FHNA 5KCJA 3H06B 3LC8A 1ZLQA 3EHUA 1B58A 5CMMA 3O66A 1D3KA 1SW2A 1N76A 1N84A 1FTLA 2XX8A 1AH5A 3U72A 4ZZEA 3HHFA 5I56B 5TP9A 1XOCA 2F97A 2X7QA 1VE4A 2HAUA 2UVHA 3N26A 1ZIUA 1Y3NA 4JXIA 4F1VA 1MXVA 5JEIA 1B3LA 2RCBA 1M5CA 1O64A 3C4MA 4KYEA 1H3DA 3IB2A 4NMYA 3MWBA 1Y1ZA 1R9LA 1ZTYA 3FVKA 4R2FA 1BP5A 2OJTA 2OBGA 4ZE8A 5DT6A 4XKNA 5ICQA 2UVJA 4ZEBA 3UORA 3BKIB 3MVZA 2Z8FA 1HSLA 4GL8A 2V3TA 3RQTA 3K4UA 5M2VA 5TPAA 3K6UA 4ISUA 4OEUA 1WVJA 3CRBA 3SERA 4OQOA 3MUQA 4QF9A 2A5TB 4Q5TA 4NWDA 2O69A 4R6HA 3T93B 3HO7A 5KCJB 2O51A 4JDFA 4MLQA 1IQ7A 2DQVA 3T9UA 1I6BA 3N5LA 3VDFA 1N04A 2OWTA 3TUSA 1S50A 2Q2CA 1MPBA 2V84A 3IOTA 4BDMA 3KJTA 5I58A 1OQGA 4K3FA 5KDTA 4XKQA 4F3SA 5TP9B 2FA7A 4F39A 4QSDA 2XXHA 1Z7ME 2REJA 4KCCA 4H8JA 3T9HB 4H65A 1Y3PA 3SEWA 4MBPA 3DP6A 1M5BA 3KSXA 4LQ2A 2OK2A 5EHMA 4ZE9A 3W9WA 3LSLA 2O84X 1O63A 3A3CA 1IITA 1D9YA 1FTMA 2XD3A 5DTBA 3M3LA 4ESWA 2I3WA 1LB8A 4GL0A 4DXCA 4X1BA 3EQ1A 2DE2A 3O6GA 4FJPA 4G8HA 1R9QA 3RUMA 3PMVA 3VFJA 1PDAA 2R6GE 3U92A 4EDPA 2Y7IA 3EHSA 2HQ0A 3GXAA 2F35A 3CSBA 2XXRA 2DP8A 1JVXA 5CBRA 4PQJA 4ELOA 4TLMB 5DEXB 1QUIA 4IO2A 1URGA 4JBZA 3SEVA 1FQAA 3FVOA 1II5A 3TQLA 4G4PA 5KZTA 1P1WA 3B6WA 1B5JA 5L9OA 2OLBA 3KGCA 4FORA 4KHZE 3VXBA 3UGWA 1NKXA 3VXCA 2YJPA 3H6WA 1H44A 1QW0A 4U1ZA 3OENA 1XVXA 1FQFA 2Y84A 2FNCA 3TZAA 2HXWA 1OLAA 3KBRA 2AIXA 1QULA 4R9FA 5J1DA 4KQPA 4ELQA 4RA1A 2OZZA 2YLNA 3PMXA 4OEVA 3FXUA 3UK4A 4OYVA 1B51A 5H8HA 2DWAA 1N3XA 1FQDA 1B52A 3LSWA 4PFWA 1NNKA 1D4NA 2GFEA 1SW4A 1DMBA 2VD3A 4GFRA 3M3FA 2G29A 3K6XA 1IUDA 3IORA 3TELA 1FQEA 1NMUA 3Q25A 3A09A 5H8FA 1B5IA 1B3FA 1FQCA 3TCFA 4KYDA 3TMGA 4LVQA 1QKBA 3EPEA 2LAOA 2Q2AA 1YTVA 1QJMA 3O2AA 2PX1A 1XVYA 1TXFA 4F3BA 4MLVA 4HTGA 2XX9A 2ZYOA 4ZEIA 2RKMA 4FAJA 4BDOA 2V25A 5CM6A 4RPOA 2XD2A 5EYFA 1AOVA 5B7DA 4AB6A 4GWOA 1MM6A 1LAHE 4DXBA 2I6EA 4BDLA 3OO9A 1GR2A 2UXAA 2OCUA 3OEMA 4G2ZA 4Q8RA 3V83A 1B3GA 2PT1A 2I0CA 5F7VA 4F22A 4U2RA 4ZECA 1Y3QA 3IB0A 5CI5A 1USYE 5H8HB 4PFTA 2E0SA 3FJMA 1B3HA 3MZ1A 3M3KA 1IZ1A 4QSEA 2HZKA 3TTKA 2PVUA 3BBRA 4FATA 3TTMA 4P11A 3LUYA 4BDRA 4WXJA 3TODA 2ONKE 3K6WA 4GLIA 2F8DA 1MPDA 5H8FB 3EHTA 2R71A 4LATA 1ZJLA 3U1OA 4QSCA 4FECA 2XXXA 2Y7WA 1S9TA 3D4GA 4AQ4A 4YU0A 3OO6A 3MJNA 3K6VA 1LSTA 5I2NB 3SESA 1OMPA 2P0SA 4ZZAA 3H6TA 3PUVE 1IIWA 3PUXE 1MQDA 3G7WA 1PB8A 1Y4CA 2HCAA 2P2AA 3DP8A 1US4A 3SETA 4H67A 1LLSA 5CMKA 5ITPA 2F7AA 1R6ZA 3WAEA 3JV9A 1NNFA 3TEPA 1YPNA 2XXTA 2DE4A 5IKBA 4KPTA 1EZPA 4FEDA 1ZMGA 1A40A 3S9MC 1B5HA 3RY3A 4G68A 1JQFA 2RF1A 3OMBA 3RTFB 5A5XB 1NH8A 1DOTA 2QRYA 4U22A 2XXWA 1Y9UA 5DVIA 2DOJA 4C1UA 1B0LA 3TTRA 2GH9A 1XHYA 2IA4A 5FTHA 2CZLA 4O3AA 4FEBA 3O6HA 4O3BA 4IO5A 5FHOA 3IR1A 1XS5A 4NF8A 1B32A 3W9VA 4TLLB 1I6QA 3VVEA 3K2DA 1Q35A 3IJOB 1UTHA 3ODBA 1MXYA 3K1NA 3S4UA 1BLFA 4EF2A 4HCYA 2BJJX 2ANJA 4GXSB 2H9BA 4GRKA 4IGRA 4H0WA 1GGGA 4F19A 1FCKA 2GRVA 4Q30B 2Q88A 3GZGA 1Z7NE 3QK6A 2V3QA 3MBPA 1MH4A 3O28A 3Q28A 3UP9A 3R26A 4P0GA 3KG2A 4IO6A 1US5A 4JB7A 2IEEA 1JW5A 4G68B 4PFYA 3RPWA 3IOVA 3MZBA 4HW8A 2AL5A 3G3HA 4I1DA 3VE1B 1AMFA 4NF6B 1BTJA 3H3GA 2QSXA 2HZLA 3BFTA 2A5SA 2REGA 4TQUQ 1SVXB 1BIYA 5H8QA 4G68C 3M8UA 3TFLA 3P7IA 3JZJA 4NF8B 1DSNA 3KN3A 1LAFE 4OHNA 5L8DA 4YMAA 4WKMA 1JW1A 1DTZA 1B7UA 2D21A 3U8QA 1MRPA 3O6IA 3MAMA 3H7MA 4R75A 3MPLA 4F31B 3T66A 3UIFA 1B40A 5BWJA 5DYHA 4IO7A 1DPPA 3S2VA 1MXXA 3PUZE 4X9TA 1QVSA 1AIVA 2PBWA 2DS9A 4WEDA 3HHGA 2ESNA 4E0WA 4DE8A 3VLUA 1LGBC 5ISUA 3OSQA 4I9DA 3OSRA 5CMCA 3IO4A 4F2OA 4X48A 1D9VA 1Y4TA 1IXGA 4NF4A 4GQOA 3E9XA 3IK6B 2O7UA 1MY2A 4RNSA 5H8QB 2HAVA 3OEKA 4YB7A 4DIGA 2Q89A 5TPAB 4YKJA 3I5OA 3QUFA 1MG1A 4N6PA 4KD5A 3S9EA 1MXZA 1MM7A 3GBAA 1BKAA 3G3JA 3I6VA 3TAJA 4R2BA 1MQGA 3U93A 4OVJA 1SI0A 3PUYE 1URDA 1YAEA 3S9LC 3CFZA 3KN7A 3LSFB 2QMWA 4OFJA 3KOTA 5I58B 2ZYKA 1LBCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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