3IJOB

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, althiazide
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ijoB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ijoB02
1PEBA 1Y4CA 2QS3A 3LSWA 3OO9A 5H8HA 3DELB 1VE4A 5KDTA 1OQGA 4XKNA 3PUZE 4R6HA 1NH8A 3K6UA 4JXIA 1PC3A 3C36A 1B7UA 3C34A 3W9WA 1OMPA 3CG3A 4NEDA 3T9XB 2DVZA 2CMOA 2HFBA 1D4NA 1DPEA 4KYDA 1H44A 2Q2CA 1H76A 3D4CA 2Y7KA 5J1DA 1LFHA 2Z22A 2XXXA 1IITA 3FZVA 2ONSA 1EZOA 5H8QA 4N6PA 3LBSA 4KR5A 3KN8A 5HM4B 3FXUA 2DWHA 5AA2D 2ZNTA 1QVSA 1B1XA 2DOJA 3KJ7A 1MXYA 3E3KA 3VLUA 4F3GA 3CFLA 1B3EA 1POY1 2D5WA 1B4HA 1M5EA 1JQFA 1MY0A 4PFTA 2H98A 3SETA 2ZYOA 4F18A 3SEYA 4QFNA 4BLAA 1MPBA 5DYHA 1POTA 3EQ1A 2PVUA 5K2XA 3H7MA 1WDNA 1I69A 4GRKA 3MVZA 5H8SA 4Z7EA 5FHMA 4K3FA 2XXTA 3N6TA 3RTWB 5HPQA 3IAZA 2VD2A 1IXCA 1MQHA 2UVJA 4LONB 1LB8A 4ELRA 1MXUA 3N5LA 1SW4A 1N76A 1Y3NA 1JW1A 4ZS9A 1TWYA 2XXUA 2DS9A 2OK2A 4XXUA 4G68B 2KLFA 1FW0A 2I4CA 2I6EA 1B1HA 1EZ9A 4P0GA 2ZXTA 4EDPA 3OMBA 3CR9A 4ZEFA 4NF4B 1A8EA 3USDA 3K4UA 1NH7A 1ANFA 3M8UA 3BKIB 3T9VA 2R6GE 2XXHA 1VR5A 1M5DA 3VE1B 5H8FB 4R2BA 2O7UA 3FIRA 4G8MA 4ZEKA 4F1VA 4BDRA 3S2VA 3IB2A 1J1NA 2ONRA 3FV1A 2X7QA 4R9GA 1LBBA 5F7VA 2H99A 5TP9B 4Z0IA 5I2KB 3TPAA 3FJ7A 1SQYA 2F97A 1MS7A 1SD3A 1YPNA 2FA7A 2O84X 3U93A 4ESWA 4OFJA 1BIYA 1UTBB 4UA8A 1Z7ME 4DCYA 1MY2A 5LOMA 3B6TA 3R6UA 1Y9UA 2QJEA 1ZBMA 3G3JA 3Q26A 4F3BA 3EN3A 1LBCA 2FYIA 2G29A 4OFLA 1JVYA 4OESA 3U94A 3O66A 1MG1A 3SKPA 4GXSB 4IO2A 4R72A 5CBSA 4NTLA 1A40A 1JEUA 5I84A 3RN8A 5ITPA 2QMXA 2D3IA 1N7XA 1MQIA 3LSXA 2I48A 1B5HA 4TOZA 3CSGA 4MF3A 3BFUA 4LUBA 2B3FA 1SDXA 3OO6A 5KCJA 4ONYA 2GH9A 4F1UA 1IQ7A 3UIFA 5I59B 2RC9A 5B7DA 2F35A 2OWSA 1NL5A 4MLQA 3HN0A 1HSJA 4WEDA 3O2AA 4F3PA 3V8XB 2PBWA 3TKDA 3IB1A 4PP0A 4AB6A 1B5IA 3K1PA 1SW1A 4YKPA 3C4MA 1RKMA 2I3WA 3UGWA 3M3FA 3N26A 4XKRA 2NVUB 1Q35A 2VD3A 4P0IA 4NE4A 3M3LA 1USYE 2DSFA 3C9HA 3WAFA 4OEUA 3C31A 1JNFA 5BWJA 2QMWA 1GV8A 3IJXB 5DEXA 4RPOA 3O6GA 1R9LA 3IL1B 3PPQA 3CSBA 3FVGA 2E1SA 2Y84A 5AA4A 1B6HA 3ONMA 1D9VA 2QS1A 1H43A 1YTVA 4C0RA 1LLSA 2HQ0A 1AOVA 3K6WA 3KG2A 5JTYA 4IO7A 3VDFA 4EXLA 4H5FA 4KFQA 2Z23A 2DXYA 1FQEA 3PD9A 1CE2A 1UTHA 1B5JA 3WAEA 3HV1A 1FTMA 2R71A 3LR1A 2Z8DA 2QPQA 4FJPA 4HCYA 2DP8A 3T22A 3MQ9A 3QIMA 3EHUA 4OMBA 3TCFA 2IA4A 5IKBA 2V3QA 3W9VA 5CMCA 3N94A 5I2NB 3TCGA 3UK4A 1B40A 1PB9A 3DP4A 1I6BA 1O63A 5CM6A 4RK9A 5EYFA 1PBQA 4IY5A 4ZDMA 1XT8A 3MW0A 4BDOA 3PPPA 4ELPA 4YKKA 1AIVA 3D4GA 3HPIA 5I56B 4MLVA 1TT1A 4ZEBA 4F2OA 4EQBA 2F7AA 1BLFA 3E4RA 4R6KA 1ZLQA 3AXFA 1ZIUA 3TODA 1A99A 1FQDA 1I6QA 3S9LC 4ND9A 3MP8A 4ZE9A 5JK4A 2ALUA 2OLBA 3HSTA 1EH3A 3MZ1A 4F1YA 4OERA 2Q89A 4F2QA 3IB0A 3FXQA 2GHAA 1MXZA 5FTHA 1US5A 2F34A 4OVJA 1N3XA 5FTIA 4C1UA 4LQ2A 4F22A 1IXGA 3ZS6A 5M2VA 3U1OA 1NFTA 4FEBA 2QSXA 4LZ7A 2DE2A 2O1LA 1GR2A 3QUJA 3VVFA 3PV0E 4LQ5A 1ZTYA 3VXCA 4X1BA 3FVNA 4I62A 4L17A 3PPOA 2DQVA 3OSQA 4NF5B 4NWDA 3MZBA 5A5XA 4RNSA 2NXOA 1R6ZA 4GOTA 1B3LA 1MH4A 1LFGA 5H8HB 3H3GA 1LAHE 1OVTA 2G93A 1OLAA 1NNPA 1H45A 3Q25A 4ZZAA 2ZMBA 3K6XA 2HAUA 4M1VA 2QS2A 3K0VA 1B3FA 1M5CA 3FASA 2W7YA 2OWTA 2XHDA 4QSEA 1JETA 3JV9A 4BDLA 2H9BA 2UVIA 1LB9A 3A09A 1XVYA 3KOTA 2VOZA 3PPNA 4H0WA 4JDFA 5K2YA 5TPAB 4GL8A 3UA8A 3MP6A 4C1TA 1SVXB 4Q5TA 1NKXA 3MPKA 1NNFA 2F8DA 3PUVE 2PYYA 2PMSA 4EF1A 3ZSFA 1KWHA 1XVXA 4DXUA 3FJGA 3B6WA 3O9PA 3TTKA 3KFMA 4GVOA 4OZ9A 2QL3A 4NF6B 3TCHA 1N7WA 3KSJA 3QAXA 1CB6A 2NOOA 4KHZE 2XXWA 1DMBA 3W15C 3G3GA 4ESXA 3MAMA 1B4ZA 1ELJA 2WKYA 2V25A 3SEUA 1QUKA 1PB7A 3GXAA 3E9XA 4F3SA 4BDNA 4IGRA 1FTJA 5CMBA 1DOTA 4EQ7A 3KN7A 3OD7A 1RYXA 2ESNA 1B2HA 2ANJA 2HXWA 4QFLA 1UIVA 4O3AA 4FORA 2IEEA 4PQJA 3V89B 3L6GA 4N07A 1EZPA 1FQBA 2Z8FA 5CRYA 3DP8A 5AA2B 3JZJA 4ZEDA 3RUMA 3HHGA 2VGQA 2V3TA 5JEIA 2M8CA 1IEJA 3ECRA 4E0WA 4G68A 2NWJA 4GXAA 2Q88A 3TZAA 4R6YA 5CMKA 4GQOA 4DXCA 5AA1A 4OTEA 1AH5A 4NF4A 2H4IA 1N84A 2XXQA 4YB7A 1SI1A 4RY1A 1DTGA 3UP9A 2UVGA 4JB7A 5H8FA 4QFPA 3KZGA 1N3WA 1LFIA 4KCCA 3KEIA 3SESA 1QJMA 1SW5A 4NMYA 1Y4TA 2F6GA 3FV2A 4DLDA 4JSDA 3MVWA 3MVXA 2HCAA 4YKIA 1BTJA 3IOTA 3K1MA 1LSTA 5EHSA 5I2KA 1B58A 5AE4A 4DIGA 3SEXA 3V5AA 3UORA 2XD2A 3O28A 2Y7IA 3TTRA 1TXFA 1FCKA 3HCQA 1UTBA 4KYSA 3I6VA 4THIA 5DVJA 1XC1A 3CRBA 3IK6B 1MM6A 3RT6B 1SW2A 3A3UA 2ZYNA 2DE4A 1P1QA 1XOCA 4FEDA 2ZYKA 3IORA 5FHNA 4IGTA 3QYTA 3U72A 4PFWA 3ILTB 5ELVA 3MZ9A 5ICTA 5H8NB 1YAEA 3GZGA 5I57B 3S9NC 4JBZA 2I49A 3EF7A 1LCFA 3CG1A 1ZKBA 3H6TA 1FQCA 5L9MA 1H3DA 2VP1A 1B32A 3LC8A 3PU5A 1MQGA 1OQHA 4YMBA 1P1UA 4GLIA 2XXVA 2F6PA 1T0KA 4M4GA 5I59A 1GTKA 1IIWA 5L9OA 3MP1A 3TUSA 2A5TB 3BBRA 1DTZA 4MFIA 2H5YA 4F31B 2O69A 3PUXE 2I3VA 4JWOA 2V3UA 3H6VA 1OIBA 2E0SA 3RGYA 4WXJA 3TTMA 2HZLA 3I5OA 3Q29A 2NUVA 3PMVA 1AL3A 2XD3A 2F36A 2REGA 4R74A 4F29A 3E13X 5ICQA 1OVBA 3KJTA 2THIA 5EHMA 2VHAA 4FE8A 5L8DA 3F11A 3THIA 3TMGA 3C33A 3GBAA 3OO8A 4KD5A 1HSEA 1VSOA 1MXXA 4KCDA 5CMMA 1B7HA 4OETA 4QRZA 2AL5A 1Y1ZA 4MBPA 1MPDA 4YU0A 3RNNA 4G4PA 5JTYB 4LATA 5I58A 3S4UA 3KSXA 4P11A 5HBCA 3OO7A 1TFDA 1MQDA 3OOAA 1SBPA 4POXA 1MRPA 5CC2A 1MY1A 1P1OA 2GFEA 2HZKA 3DP6A 1JVXA 2ONKE 1L5TA 2OJTA 2A5SA 4ZZEA 4ECFA 4H67A 3CVGA 3TDJA 4YB5A 5DVIA 3K6VA 4E0XA 5I2NA 2D21A 3VXBA 5CI5A 3SEWA 1SI0A 1MY3A 1Q1KA 1MM7A 3QK6A 2UXAA 3OELA 2ZNUA 3T66A 4YAHX 3RTFB 1LGBC 2QS4A 2DE3A 2F7BA 4DDDA 1NNKA 2B65A 2O51A 3G3FA 1URDA 3S9EA 5I56A 4YMAA 2RINA 1URSA 3OXNA 4ELOA 3I3VA 1B51A 4H8JA 4DCXA 3IOWA 4FAJA 4G8NA 1FTOA 2XXYA 1P1NA 1MDQA 2GHBA 4I8CA 4HCWA 4NF8B 3H6WA 1FTKA 1B0LA 5DTBA 3DLNA 3MPLA 1BKAA 1AMFA 1DSNA 3CI8A 2DWIA 1LAXA 4DE8A 3PPRA 4Q0CA 3HO7A 1MDP1 1MY4A 2I0CA 4NWCA 4IO5A 2DYXA 4U22A 4XKQA 4KYEA 3KBRA 2DWJA 2RC8A 3O29A 3TYHA 1B0HA 3UN6A 1US4A 3OSRA 4JWXA 3FVKA 4POWA 1ZMGA 3O6IA 4R73A 4G2ZA 4X9TA 3H4ZA 1PB8A 3FD3A 3K00A 1YCJA 1FQAA 4IO3A 3LUYA 5KDTB 4Q8RA 4ISUA 4GD5A 4NF5A 4LZ5A 4H1XA 4U1ZA 1URGA 3P7IA 4RA1A 4FECA 4WKMA 1Y3PA 1JEVA 3B6QA 1S9TA 3G3IA 3JYRA 4TLLB 3MUQA 4WEPA 2AL4A 4IO6A 1Y20A 2AIXA 4G77A 1MXVA 3EHTA 5H8QB 4I9DA 4OXVA 3IR1A 2X7PA 2HEUA 3IOUA 3H06B 4KQPA 3ILUB 4O3BA 5AA3A 4DZ1A 4RK2A 1JW4A 5TPAA 4O3CA 3OEKA 2RCAA 3IJOB 4XTCQ 4AB5A 3K02A 3PUYE 3KN3A 2O6AA 1IXIA 3TQLA 1ZJLA 1M5FA 2F5XA 4R9FA 4H8IA 1QKBA 4QHQA 2DWAA 4NF6A 3GLBA 4FATA 1IUDA 2UYFA 1SYIA 3Q27A 2YLNA 2B3BA 4ZE8A 3SDFA 3QXMA 1Z7NE 4YKJA 5ITOA 4GWOA 4H5GA 1RYOA 5B70A 4I1DA 3ZKLA 3IO4A 2XX8A 3G7WA 3FUZA 3ODBA 2ZNSA 1A8FA 3O97A 3FVOA 2P2AA 4QSCA 2R9JA 2PX1A 4PFUA 3VFJA 3Q28A 4XKPA 1O64A 1D3KA 1B05A 4XIGQ 4YZZA 2F78A 5AA2A 2PT2A 2I58A 3FGSA 4OFOA 1PDAA 1VFDA 1IXHA 3OENA 4YICA 4U23A 2O7IA 1HSLA 5FHOA 4OENA 3PGFA 3S9MC 1ATGA 3DM0A 2Q2AA 4QSDA 1A55A 3SERA 4YB6A 2Z8EA 1II5A 3FXRA 1I6AA 4LP2B 2LAOA 2XXIA 4LZ8A 2XX7A 3KGCA 4HW8A 2XXRA 3MC2A 1QUJA 1NMUA 3VVDA 5CBRA 2Y7RA 5TP9A 4TQUQ 4UACA 5DT6A 3H03A 4ZEIA 3T93B 4TLMB 3RLFE 1B9JA 3N6UA 3G3HA 2AYSA 3A3CA 1QUIA 4IY6A 2CZLA 3V83A 4H6DA 2O1MA 3VV5A 3C35A 2XXPA 4H65A 1MH3A 2DVCA 4Q30B 2Y7PA 1QW0A 1TFAA 3MWBA 1LAFE 3U92A 3RQTA 4QFKA 3ZKKA 2YJPA 1Y1MA 1N04A 2V84A 5KCJB 3K2DA 5KZTA 3LSFB 5BUUA 4R2FA 3OEMA 1B7ZA 4U1OA 4X1DA 3FATA 1B46A 1R9QA 1B3GA 1DPPA 5H8NA 1Y3QA 4KPTA 5I57A 4X48A 1PBPA 1WODA 1VFEA 5IAIA 1FQFA 2FNCA 4KI0E 4FIMA 4OWDA 3O6HA 3VVEA 3MJNA 4IO4A 3L6HA 3U8QA 4N13A 4OHNA 1O7TA 1P99A 3TTLA 2OCUA 2O68A 5ISUA 2ZYMA 3CFXA 1MPCA 1FTLA 4U4XA 4PE5B 2A5TA 3SEVA 4PFYA 2F7CA 4HS7A 1JW5A 3BFTA 3QSLA 3T9UA 1EU8A 3GBBA 3R26A 4RXLA 4JWYA 1QKAA 4JSOA 1LCTA 1ZU0A 5DEXB 1OLCA 2Q9TA 4IB2A 4MH5A 3H6UA 5AA4B 2P1SA 1MQJA 3CIJA 2PT1A 1LAGE 2Y7WA 4QFOA 4GL0A 1UIUA 1QULA 3KOSA 4GIZA 2RCBA 2I4BA 4OQOA 3RT8A 3PD8A 1D9YA 4ZECA 3VLWA 1P1WA 3G3KA 2RF1A 3IX1A 5I58B 4G8HA 3CFZA 1MXWA 1UTHB 3C32A 1XHYA 3IO6A 3TAJA 1S50A 1A7LA 1GGGA 4G68C 4GFRA 4RYAA 1B3HA 1SYHA 4U4SA 4OYVA 3EPEA 4LA9A 4ELQA 1B52A 4EUOA 3TTNA 1A54A 4R75A 1XS5A 2ABHA 4U2RA 3IOVA 4F39A 3T9HB 4EXKA 4BDMA 1WVJA 2DXRA 4HTGA 3B7DA 5F1QA 3LSLA 1IZ1A 3RPWA 3MVYA 3K01A 4QF9A 3TFLA 3MBPA 2OZZA 4U21A 2GRVA 3RY3A 5L9SA 1R1NA 4GF8A 1N0TA 2XX9A 1UQWA 4F19A 4AQ4A 3R7XA 2UYEA 4DXBA 2V93A 3TEPA 4LVQA 1BP5A 4RPNA 4EF2A 2RC7A 3K1NA 3HHFA 4NF8A 1F9BA 5DVFA 1NNTA 4RJZA 2REJA 5TU0A 2HAVA 4EQ9A 3QUFA 1GVCA 2YPNA 2QRYA 4PETA 2Q8JA 3FJMA 2X26A 1M5BA 2RKMA 1USYH 2H25A 3TQWA 3TELA 3VLVA 4OEVA 4BDQA 3PUWE 2OBGA 1S7YA 5A5XB 3PMWA 2I0BA 3PMXA 3EHSA 2BJJX 3T96B 3M3KA 2UVHA 2P0SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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