3IJOB

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, althiazide
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ijoB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ijoB02
2ZYMA 3QK6A 3T9VA 1OMPA 1LB9A 3O9PA 4Q30B 4MLQA 1N7XA 3U8QA 3TDJA 3BKIB 5B7DA 4RK2A 1DSNA 4JSOA 1EZOA 3HV1A 3O6GA 1N3XA 1SD3A 3SDFA 3CVGA 1DMBA 2BJJX 2D21A 4DCYA 3LUYA 3MZ1A 3U92A 5CMCA 5A5XA 1HSJA 1MDQA 3T96B 2OK2A 2ESNA 3TCHA 1MQJA 3W9VA 5H8NB 1JEVA 4OMBA 2IEEA 5AA2B 1EZPA 3ECRA 3OXNA 4E0XA 4H65A 2F78A 1B3FA 2F34A 3SETA 2H99A 2RF1A 3MW0A 3G3FA 3KG2A 3IO6A 4UACA 1MPDA 1LB8A 4FORA 3A3CA 2GHAA 3OEMA 3TAJA 4ZECA 1ZU0A 5ICQA 4P11A 1TFAA 4ESXA 4X1BA 5DVFA 5TP9A 3TPAA 4G68C 4GFRA 4I8CA 4GVOA 4AB5A 4OFLA 4BDMA 5BWJA 3ZS6A 4NEDA 5CMBA 1QVSA 4FAJA 2V3TA 1XS5A 1B3LA 3PUYE 5H8FA 3O29A 4LATA 3PD8A 5L8DA 3CIJA 3RGYA 4H0WA 4ND9A 4F1YA 3OO9A 3TTKA 1XVXA 3GLBA 2O69A 3JZJA 2DWJA 3E9XA 1LAHE 5DTBA 1P1NA 5KDTA 4G8HA 1R6ZA 2I0CA 5CBSA 1MQDA 4IY5A 4NTLA 3LBSA 2QS1A 4ONYA 2V3UA 1N0TA 1GR2A 5HBCA 2AL5A 2UVGA 4ISUA 2I0BA 3W9WA 4G8NA 2QRYA 3K6WA 4R72A 5I56B 3UK4A 2Y7RA 1US5A 2DS9A 1B2HA 3U1OA 4KQPA 3EN3A 4R2BA 4PFYA 2PBWA 3KN7A 5I57A 5CI5A 4NF8B 2ABHA 1OQHA 1DTGA 3H3GA 3H4ZA 1SBPA 3LSLA 2ZYNA 3L6HA 4ZE9A 2ONSA 2I49A 3MBPA 3HHFA 1Y4CA 3O6IA 4PFUA 1SW1A 3S9LC 2DVCA 3TCFA 3OELA 1MXVA 2XXHA 2ZNTA 3K2DA 4NF5B 1ATGA 3CRBA 5I58B 3TQWA 3UA8A 2R9JA 3TYHA 3FGSA 5AA4B 1B7UA 4N13A 1VSOA 3FD3A 3N94A 2DXRA 3KZGA 3HSTA 4ELRA 1OVBA 3T93B 3PMVA 1Y3PA 1QKBA 1MY4A 5H8NA 4L17A 2DE3A 2OLBA 5AA2A 1AL3A 1Y9UA 1VR5A 2DSFA 3PV0E 3GXAA 3R7XA 5FTIA 4RXLA 1AOVA 2I4CA 3C31A 1ZKBA 2R6GE 3JV9A 3MUQA 4F29A 4Z0IA 4JDFA 2Q2AA 1USYH 3VXCA 1B58A 3K6VA 3CFLA 1TT1A 1B40A 1Y3QA 1YTVA 1OVTA 1GGGA 3I6VA 1M5BA 4KI0E 2XXTA 2QL3A 4KCDA 2Z8DA 1B6HA 4XTCQ 1FTOA 2REGA 1Z7NE 4POWA 4IO7A 3I3VA 4KD5A 2FA7A 2F7CA 4DLDA 4IO4A 2O68A 2NXOA 2WKYA 4IB2A 4QSEA 2CMOA 4HTGA 2Z23A 3O6HA 4TLMB 2RINA 5TPAB 2Y7PA 5AE4A 1XT8A 4X9TA 5TU0A 2FNCA 4M4GA 3KJ7A 2VP1A 5DYHA 3VLVA 3RN8A 1I6AA 3EPEA 1Q35A 1SW2A 1SDXA 4IO6A 5L9OA 3MZBA 3SEXA 1OLAA 1NNFA 5I56A 1QULA 5KCJB 1Y1MA 1MH4A 4FIMA 1PBQA 4IY6A 4YB5A 4F39A 1NNKA 1P1UA 1UTBB 4IO2A 2HEUA 3TTLA 1I6QA 1TFDA 2HAVA 3FVNA 3KOSA 3QYTA 4BLAA 1XVYA 3THIA 4RJZA 4F3SA 1II5A 3ODBA 4AQ4A 4F3GA 2HZLA 2CZLA 3H6VA 3MVZA 1BLFA 2O1LA 3SEYA 5DVJA 2E1SA 1IXGA 3DELB 4YB7A 1MG1A 2F35A 2PT2A 4NF5A 1LAFE 5I58A 3T9UA 3UGWA 4G77A 1D3KA 4ZEFA 4MLVA 1FQDA 4BDRA 3LR1A 4G4PA 2QMXA 5AA4A 2HZKA 2HQ0A 4LA9A 3T9XB 3MC2A 4LONB 1IQ7A 3PUZE 3H6TA 2M8CA 1ZBMA 2Z22A 4H1XA 1EU8A 2D5WA 4IGTA 3TUSA 1H43A 4PFTA 2HXWA 4RPOA 4R2FA 3PUWE 3PUXE 1ZLQA 1IXIA 3U94A 1ELJA 3ILUB 3MQ9A 1JVXA 1IXHA 4OEVA 2RC7A 2XX8A 2ONRA 3H6WA 2H4IA 3HPIA 3EF7A 3K02A 2F7BA 1MRPA 4Q0CA 3WAFA 1MXYA 3OOAA 3DP6A 1ZMGA 1J1NA 2B65A 4NWDA 1MPCA 3A3UA 3Q25A 2Z8FA 4U1ZA 5EYFA 1B4HA 3E3KA 3FJGA 2Q2CA 3TEPA 1N84A 4GD5A 2P2AA 1MXUA 4U23A 4GRKA 1DOTA 1JW5A 3K6XA 5AA3A 1MS7A 4YKIA 3IOWA 3EHSA 4LUBA 1WDNA 1LFIA 2XXPA 4QFPA 2YPNA 3TZAA 3MJNA 1D9YA 4WEPA 1Z7ME 4ELQA 3MPKA 4U1OA 3K1PA 3Q26A 3VV5A 1BKAA 4ZEIA 1I6BA 2NVUB 5TPAA 2NOOA 3T22A 2D3IA 4HW8A 1S50A 1URGA 2DWHA 1B5IA 3OSQA 1P1QA 4IO5A 2I4BA 4KFQA 3CSBA 4KR5A 4DXBA 3TQLA 4E0WA 5IAIA 1AMFA 3N6TA 4YU0A 3G3IA 3FXRA 3TTMA 1SYIA 4O3AA 5KCJA 4OVJA 1JETA 5FHMA 4PETA 4C0RA 3MP1A 1UTBA 3RLFE 1P99A 4QFOA 1I69A 1NNTA 2DP8A 3E4RA 1NFTA 1JW1A 3HO7A 2Q88A 3IB0A 4BDLA 2UVIA 4O3CA 1B3GA 2DE2A 1B1HA 3B7DA 4M1VA 1N3WA 2I3VA 3O97A 4HS7A 3C9HA 3MZ9A 3FXQA 1JEUA 1HSEA 3BFTA 4ZS9A 3IAZA 2RC8A 1LBBA 3KGCA 4U22A 2YJPA 5F7VA 3HHGA 5H8SA 3SERA 3OENA 1B3HA 4DCXA 4G2ZA 3OEKA 4XXUA 4OETA 3ONMA 2X7QA 4LVQA 1IUDA 1H45A 4U4XA 3ZKKA 1B0LA 4WKMA 1MH3A 3Q28A 4F1UA 4X48A 3IX1A 3G3KA 3N26A 4THIA 3FVGA 1LSTA 1UTHB 2ANJA 2XX9A 3T66A 2XD3A 3DP4A 1RYXA 1FCKA 3SEWA 3C32A 3KJTA 4ZE8A 3H06B 1ZJLA 2X26A 2PYYA 3IORA 3V89B 4LQ5A 2XXVA 4H6DA 4EQ9A 3S9NC 3C34A 1VFDA 4Q5TA 4GL8A 4YZZA 4Q8RA 3E13X 3TTNA 2X7PA 3C35A 4RY1A 1RYOA 1OQGA 1NH8A 1R9LA 4H8JA 4DZ1A 3LSFB 5AA2D 2XHDA 2GRVA 1Y1ZA 1T0KA 3R26A 2QS3A 5FTHA 1NL5A 3M3LA 1US4A 2B3BA 4GL0A 2XX7A 1RKMA 3RTFB 2Y7IA 3K0VA 3KEIA 4R75A 4GWOA 3ZKLA 4FEBA 3C33A 1P1WA 2F6GA 1JVYA 3MWBA 3TTRA 3JYRA 3EHTA 2FYIA 1YPNA 5CM6A 1FTJA 4GOTA 3TCGA 1PB7A 3R6UA 4YB6A 4RA1A 1DPEA 4DDDA 2F7AA 3KFMA 4WEDA 3RT8A 3VFJA 1JQFA 1IXCA 4YAHX 4OFJA 1LGBC 3HCQA 2A5TB 3IJOB 3RQTA 3IOUA 2QMWA 5J1DA 4NF4B 4P0GA 1POY1 3S4UA 2XXYA 2P1SA 2ZNUA 5HM4B 1FQAA 2PVUA 1MQGA 2XXRA 4F18A 2Y7WA 4H8IA 3KN8A 1QW0A 1A40A 2DWIA 3FJ7A 3K01A 4MF3A 1SYHA 5H8QB 2REJA 4XKRA 4FE8A 2RKMA 2UYFA 5M2VA 4TQUQ 1H44A 1NMUA 2XXUA 1VFEA 3HN0A 4EQ7A 2GFEA 1B32A 4QFKA 5I2KB 1CE2A 3S9MC 4NF6B 2G29A 3Q29A 1EZ9A 2DXYA 1AIVA 4YMBA 3PU5A 2W7YA 2UVJA 3VXBA 4C1TA 3FZVA 3L6GA 2OWSA 2P0SA 4DE8A 3M3FA 1EH3A 2UXAA 4XKPA 1AH5A 3OSRA 5CMMA 2DE4A 2VHAA 4IO3A 2ZXTA 1DPPA 4POXA 2YLNA 1GTKA 4I9DA 4GF8A 2OZZA 1FQEA 1DTZA 1R1NA 4QFNA 4JBZA 1UTHA 1NKXA 1B05A 2DQVA 5JEIA 4F1VA 4BDNA 1PDAA 4MFIA 1YAEA 3IK6B 1PEBA 4UA8A 4NF8A 2Q9TA 4U2RA 1B0HA 2V93A 4ZEBA 3DP8A 1QKAA 1S7YA 3SEVA 1LBCA 5BUUA 1LCFA 2DYXA 1B1XA 3SESA 4GQOA 3IOTA 1URSA 1QJMA 3QUFA 4NWCA 4ZDMA 4NMYA 4JB7A 1IZ1A 3IOVA 2O7UA 2XXWA 4EDPA 4N07A 2DWAA 3C4MA 5CC2A 3Q27A 4OEUA 2LAOA 3CFZA 4DXUA 4XKQA 5JK4A 2QSXA 3G3GA 3QAXA 4KCCA 2F8DA 5K2XA 4OTEA 3VE1B 4JWXA 1MDP1 3IJXB 1B3EA 2I48A 1GV8A 4LP2B 2OWTA 2V25A 3A09A 4YKPA 4ESWA 2PT1A 1GVCA 4EUOA 2G93A 3CG3A 1LAXA 1MY3A 1SW5A 3MVYA 3B6TA 3G3JA 5CMKA 3B6QA 3O28A 3ILTB 2O1MA 4R9FA 1MQIA 3IO4A 1PC3A 1QUJA 4GXSB 5I2NB 4F3PA 4NE4A 1TWYA 3CR9A 4QRZA 3IB1A 4PP0A 3N6UA 4PQJA 1Y4TA 3PPQA 3MAMA 5H8HB 2QS2A 1LFHA 4N6PA 4Z7EA 4OQOA 4HCWA 4IGRA 1O7TA 3GBAA 3TMGA 1SQYA 2ONKE 5ELVA 3T9HB 3D4CA 2A5TA 4GXAA 1H3DA 4NF4A 1BIYA 4JSDA 4OWDA 2OBGA 1JNFA 2RCBA 1D4NA 5FHOA 2NWJA 4U4SA 1POTA 2V3QA 2QS4A 3KSJA 4KPTA 4F2QA 5H8QA 4X1DA 4BDQA 4R6YA 2I3WA 1MXZA 3PUVE 3V8XB 1O63A 1LLSA 1YCJA 5I2KA 4TLLB 3MP8A 4NF6A 2B3FA 3IR1A 1XOCA 1SI1A 1WVJA 3IB2A 4KYDA 4DIGA 1FQCA 4QFLA 4F22A 1R9QA 2RC9A 2O51A 2Q8JA 5I84A 5DVIA 1LAGE 1B52A 4H67A 5HPQA 2AYSA 1S9TA 3C36A 3KBRA 4R73A 2XXIA 3SEUA 3S2VA 4HCYA 2E0SA 4PE5B 2VD3A 1BP5A 2PX1A 3W15C 4FEDA 4OXVA 5L9MA 1Y20A 3RUMA 3RNNA 3EQ1A 4GLIA 2O7IA 4JWOA 1NH7A 4EF2A 2Y84A 4F31B 1B9JA 1PBPA 1UIUA 3LSXA 3ZSFA 2PMSA 2XXXA 3FJMA 1UIVA 1M5FA 4EF1A 2F97A 1LFGA 4LQ2A 1N76A 1WODA 1H76A 3K6UA 4YMAA 2Z8EA 4I62A 4OENA 4KYEA 5B70A 5FHNA 2HAUA 3H6UA 4KHZE 1MPBA 2AIXA 3CFXA 3LC8A 1A8FA 4DXCA 2HFBA 4LZ5A 1D9VA 3LSWA 1XHYA 4ECFA 3FASA 1B4ZA 5AA1A 2RCAA 3CSGA 3KSXA 4XIGQ 3RPWA 2ZNSA 3RT6B 2ZMBA 4F19A 3GZGA 1L5TA 2GH9A 1QUIA 4OFOA 2H5YA 3VVEA 4AB6A 2F6PA 3OMBA 4ELOA 3K1NA 4QF9A 2ZYOA 2H9BA 5I2NA 3M3KA 1ANFA 3QIMA 3TFLA 4OZ9A 3F11A 1IEJA 2UVHA 3V5AA 3DM0A 3UIFA 4K3FA 3EHUA 1F9BA 5L9SA 3B6WA 1ZTYA 5H8HA 4R9GA 3D4GA 5JTYB 1FTLA 4EXKA 1UQWA 1MY0A 1B5JA 4RK9A 4QHQA 1URDA 1FW0A 3PPOA 1SVXB 3FXUA 2AL4A 3N5LA 4U21A 3PPNA 4BDOA 3PMXA 4FJPA 3K4UA 1SI0A 4P0IA 1FTMA 1QUKA 4R74A 1B51A 2F36A 5DEXB 3CG1A 4EQBA 1USYE 3RTWB 3SKPA 1M5CA 4O3BA 2ZYKA 2OJTA 3PPPA 4R6HA 3BFUA 4EXLA 4QSDA 4RPNA 1KWHA 4QSCA 1ZIUA 3M8UA 3K1MA 2O6AA 3WAEA 1A99A 4F3BA 5I59B 2XD2A 4JWYA 4FATA 1MM6A 4H5FA 4G68B 1A54A 5ITOA 3MVWA 1VE4A 3FVKA 4TOZA 1OLCA 1BTJA 4KYSA 3AXFA 3OO6A 1OIBA 5CRYA 1PB8A 1CB6A 3USDA 1MQHA 3UN6A 3FIRA 2THIA 2NUVA 3FV1A 4ZEKA 5ICTA 2DOJA 4GIZA 3RY3A 3P7IA 3MPLA 4MBPA 2OCUA 3O66A 4F2OA 1LCTA 2KLFA 4XKNA 3UP9A 3FATA 1TXFA 2H25A 5EHMA 5ISUA 2VD2A 1HSLA 3VLWA 5A5XB 1B46A 3V83A 2VOZA 4OERA 4PFWA 2QJEA 4MH5A 4ELPA 1SW4A 3VLUA 3O2AA 5LOMA 2Q89A 4G8MA 2H98A 1IIWA 1JW4A 4YICA 3PMWA 1M5EA 2I58A 3GBBA 2VGQA 1MXXA 5DT6A 3FV2A 1MXWA 3TODA 1B7ZA 4RYAA 1A7LA 2O84X 2R71A 2DVZA 5F1QA 3U93A 2QPQA 4JXIA 3FVOA 5TP9B 3MVXA 3QXMA 1PB9A 4H5GA 5K2YA 4YKKA 1O64A 3TKDA 4RNSA 3VVFA 2A5SA 5KZTA 2UYEA 3PD9A 3IL1B 4LZ8A 3DLNA 3KOTA 4LZ7A 4ZZAA 1A55A 1IITA 1A8EA 2ALUA 3G7WA 5JTYA 5H8FB 2Y7KA 5ITPA 3QSLA 4OESA 1NNPA 4OYVA 1FQBA 1FTKA 2XXQA 2F5XA 2V84A 1Q1KA 3FUZA 4OHNA 3KN3A 1N04A 1XC1A 3CI8A 3VVDA 3BBRA 2HCAA 5KDTB 3H03A 3G3HA 4ZEDA 5CBRA 5DEXA 3UORA 1M5DA 1MM7A 3PGFA 3U72A 1B5HA 3I5OA 4YKJA 1P1OA 1N7WA 4R6KA 2GHBA 3TELA 2I6EA 3PPRA 4I1DA 3VDFA 4FECA 3K00A 3MP6A 3OO7A 3QUJA 3H7MA 3OO8A 4ZZEA 4WXJA 5I57B 5I59A 4C1UA 2IA4A 1MY2A 1B7HA 3OD7A 4G68A 5IKBA 3S9EA 1FQFA 1Y3NA 5EHSA 1MY1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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