3IJOB

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, althiazide
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ijoB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ijoB02
4IY5A 4DCXA 2O1LA 4IO3A 1OMPA 2DE4A 1FQEA 4GFRA 2O51A 2R6GE 4ZEFA 1I6BA 3FGSA 1PC3A 3A3CA 3HN0A 2OCUA 5DVJA 3PPRA 3N26A 3T9UA 2V3TA 2QS4A 4WXJA 1IITA 1O64A 1WVJA 2NUVA 4LQ2A 3OXNA 4F19A 3SEXA 3M3LA 4R73A 4EXKA 2RC9A 4DZ1A 4BDQA 2QPQA 1XOCA 4KD5A 4U2RA 5DYHA 3LC8A 2E1SA 1ZJLA 5ITPA 2CZLA 4OWDA 1A8FA 1AIVA 3ONMA 4LZ5A 3IJOB 4F3GA 4EQ9A 5JTYB 4IO7A 1MS7A 5H8NA 3PPQA 1Z7NE 1UTBA 4UACA 3H4ZA 3BFTA 3DLNA 1MY4A 3G3GA 3MZBA 2ZMBA 1DSNA 4QFLA 4QFPA 4XIGQ 2UVIA 1LBCA 2UYFA 1ZU0A 1POY1 1XC1A 4O3BA 3FIRA 2PT2A 3PUXE 4ZDMA 3CR9A 4LQ5A 4IB2A 5IKBA 1MY1A 5AA1A 4U1OA 3IOVA 4YU0A 3WAEA 1SD3A 2VD2A 5I2NA 1H45A 3CFLA 3PPOA 2XXIA 1I6QA 3PMVA 1Y4CA 3CSGA 1TFAA 1P1OA 2B65A 3K00A 1R9LA 1DTZA 1URGA 3L6HA 1A54A 1IXIA 3RTFB 3PUYE 1DPEA 1B5JA 3TQWA 5H8QA 3E13X 4YZZA 5H8FB 2DYXA 3KJ7A 3QIMA 4DLDA 2OLBA 4ELRA 3CFXA 4PFYA 3ZKKA 3EPEA 1RYOA 4ISUA 3FD3A 5CMMA 3IX1A 3VV5A 4NWDA 2ZNTA 2ZNUA 2H98A 3WAFA 4N6PA 3H6VA 2OWTA 3B6TA 4LONB 4NF4B 2F34A 3L6GA 4EXLA 2XXQA 1A40A 3MJNA 3IORA 5H8HA 2XX8A 4THIA 1MPCA 1POTA 2AIXA 4F3PA 3FVNA 1IXCA 2H9BA 2UVJA 4FEDA 4GRKA 2D21A 3FJGA 2I4CA 3FVGA 5DEXB 3H6WA 1QKBA 4YB6A 3K01A 1MM7A 4NWCA 4EF1A 5I57A 3TELA 4WKMA 1MQHA 4BDOA 3OOAA 1M5EA 4JDFA 3TFLA 4PFWA 3MAMA 1H44A 2DSFA 3MVYA 2V25A 4ZEDA 2XXPA 2QL3A 1LAHE 3I5OA 3I6VA 4MLQA 3FV1A 1FTJA 4XTCQ 5I58A 2DP8A 3W15C 3C4MA 2RCAA 2I4BA 4H5FA 1T0KA 3PUWE 3T96B 5KCJB 1B52A 1FQFA 1P1QA 2Z22A 4KFQA 4XKNA 2W7YA 1TFDA 2WKYA 4IGTA 2XXVA 4AQ4A 2XD3A 2O7IA 4L17A 1D9YA 3AXFA 2QMXA 1OQHA 3TYHA 2LAOA 4NF5B 4U1ZA 4FATA 4EQBA 4YB5A 4ZEBA 3KEIA 3DELB 3E4RA 2P2AA 5CC2A 2HEUA 4I62A 1NFTA 2GH9A 1EZPA 2HZLA 2V84A 4FJPA 4E0XA 3HHGA 5FTIA 3O2AA 1XT8A 3FATA 4YKKA 5KDTA 1TWYA 4UA8A 1IIWA 4PP0A 1L5TA 2VHAA 1D9VA 3KZGA 5TPAA 1R6ZA 5I56B 1PBQA 2PX1A 1B5IA 4PETA 4KCDA 5CRYA 4U4XA 1ZIUA 3TCFA 3W9WA 5ELVA 1VR5A 4Q5TA 2NWJA 1MXXA 4G77A 2DWJA 1Y1ZA 4OESA 1YAEA 4LA9A 4G8HA 2Z8EA 4POWA 3TCGA 2BJJX 3M3FA 1US5A 4C0RA 4ZS9A 1SW5A 2I58A 4FECA 2QRYA 3N5LA 2A5TA 1UIVA 4F3SA 2HZKA 4QSEA 1DPPA 1IQ7A 1SW2A 1RKMA 4NE4A 1MM6A 3G3KA 3U8QA 4G68A 1JW5A 1M5DA 3KBRA 5ITOA 1QW0A 2I6EA 1B3EA 4H67A 3H6TA 3K1PA 1Z7ME 2F36A 1H3DA 4KYEA 3OELA 3OSRA 3CG3A 3TKDA 4BDLA 4GVOA 4FIMA 4FEBA 2Y7IA 2HXWA 3PV0E 1LLSA 3TCHA 3QSLA 5HPQA 3PUZE 1XHYA 3PPPA 2I0BA 1MY0A 1M5FA 1SYIA 3S9LC 3BBRA 3FJ7A 5AA4B 4R72A 1QUIA 3EHTA 1A99A 5DTBA 1MQIA 4R75A 3SESA 3W9VA 3HPIA 4R6HA 3MVZA 5I84A 4GXSB 4RK9A 4ELQA 1JETA 4U21A 2O68A 4C1TA 1EZ9A 3P7IA 2IEEA 2GRVA 1FW0A 3A09A 3GBAA 2REJA 1QVSA 4NMYA 1FCKA 4OFLA 3S9NC 3LSFB 1LBBA 2DWAA 4HW8A 5J1DA 1MXUA 1SBPA 2ANJA 3B6WA 3HCQA 2F7AA 1QKAA 1UTHA 5A5XA 2Q2AA 5FHMA 3B6QA 1GVCA 2YLNA 4WEDA 4ZE8A 1MXVA 2REGA 1SI0A 1UIUA 4KQPA 4OENA 4OTEA 3HO7A 2QJEA 3JV9A 2I3VA 4HCYA 3U1OA 1B46A 1B5HA 5I2KA 1N3XA 3C34A 3UK4A 3B7DA 1J1NA 3MP1A 3EN3A 1P1NA 4F31B 4G4PA 4U23A 4YMAA 4GF8A 3TPAA 5TP9A 4PQJA 1JW4A 2P0SA 4G68C 2QS2A 1GGGA 1B4ZA 5CBRA 1QUJA 5FTHA 4FAJA 3K6XA 1N76A 4TQUQ 1ZKBA 3TTKA 3KFMA 1WDNA 4ONYA 2H5YA 1N84A 1A7LA 2O7UA 3IJXB 3SERA 2O84X 3O6GA 3TEPA 3R6UA 4OFJA 3RPWA 1B32A 1UQWA 4H6DA 5JTYA 1YTVA 4RPOA 4YKPA 4QFOA 1B0HA 4LUBA 1LB8A 3SEWA 3TQLA 3A3UA 4HS7A 5I2NB 2UVGA 4JSDA 4P11A 4IGRA 2Y7RA 3OENA 1NH7A 4RK2A 4LP2B 2NOOA 4MLVA 4ZECA 3V83A 1FTMA 4ESWA 3FXUA 3M8UA 1ANFA 1USYH 2QSXA 3O29A 2Y7WA 2Z8FA 2RCBA 3RT6B 4DXUA 4BLAA 1SI1A 1DMBA 4XXUA 5CMKA 4H8IA 4QF9A 3R7XA 1M5BA 1MDQA 2P1SA 2DOJA 4JWOA 3FVKA 1JVYA 4NF6A 5CMBA 4OYVA 5H8HB 1B1HA 3KN7A 1P1UA 1N7WA 2ZXTA 2XXUA 3G3FA 1ZLQA 4OFOA 3H06B 3KSXA 1LCTA 3ZKLA 4KPTA 2Q9TA 3IOUA 5I57B 1IXGA 2DXRA 3QXMA 2ONSA 2DE3A 2RC7A 5B7DA 5DEXA 1DOTA 2XD2A 1NMUA 3QUFA 3UP9A 1OVTA 2ZYMA 4YMBA 2RKMA 2DXYA 3K6WA 2B3FA 3OSQA 4R2FA 1SW1A 1D3KA 1JQFA 1BLFA 3O9PA 2F7BA 5I58B 3VE1B 4LATA 3VLUA 1MQDA 1B3GA 3U93A 3OO8A 3V8XB 3TTLA 2HAVA 5EHMA 3PMXA 4MH5A 4NEDA 3FVOA 4OMBA 5JK4A 1LAGE 1BIYA 1JW1A 4PE5B 2V3QA 1KWHA 2GHAA 3LUYA 3OEMA 5KCJA 1GV8A 4R9FA 4R74A 4NTLA 5L9OA 3EHUA 4DCYA 1S7YA 4QHQA 5CMCA 3MVWA 3ILTB 3T9HB 4IO2A 4E0WA 4DDDA 1QUKA 1URSA 5AA3A 3LSXA 4NF5A 1HSLA 4OXVA 1Y3PA 4EF2A 3D4CA 3TODA 4GLIA 3QK6A 4PFUA 3S4UA 3TDJA 4X9TA 1LFHA 3UGWA 2F35A 3OEKA 3S9MC 3IO6A 4LZ8A 4FORA 1VFDA 1SQYA 3N6TA 3PGFA 3UORA 1GTKA 2F6PA 2HCAA 2DS9A 1B05A 3IAZA 1FQCA 4Q8RA 2E0SA 5EHSA 1MY2A 1JNFA 2XHDA 5I56A 1OLAA 5I59A 2PYYA 4F3BA 5CBSA 1MPDA 3S9EA 4N07A 3UN6A 2V3UA 1LCFA 3MPKA 5FHNA 3FASA 2YJPA 1USYE 2ZYKA 1Y20A 1S9TA 1LSTA 2UYEA 3GZGA 2DWHA 2THIA 3IL1B 3R26A 2A5TB 1Y9UA 4JB7A 3T9XB 2I0CA 2AL4A 2ALUA 4ZZAA 1MH4A 2R71A 1N04A 3CG1A 4I9DA 4R6YA 4HCWA 5ISUA 5HM4B 3LSLA 2KLFA 4RJZA 1CE2A 3LBSA 2ESNA 4G68B 3RLFE 1NNFA 4JSOA 1AMFA 4MFIA 1HSEA 4ZE9A 2OWSA 1XVXA 1AH5A 1LAXA 1R9QA 2XX9A 3UA8A 4NF8A 1FQBA 4GWOA 1B7UA 4Z7EA 3V5AA 1PDAA 3MPLA 1VE4A 4TLLB 5L9SA 2VOZA 3PU5A 3F11A 3KN8A 4OERA 1SYHA 3GBBA 3CIJA 3PD8A 5K2XA 5BWJA 4O3CA 3T9VA 2VD3A 4F18A 1HSJA 4ZEKA 5BUUA 3SETA 3V89B 5DT6A 3EQ1A 2ABHA 4LVQA 1O63A 4GD5A 3ODBA 3TZAA 5ICQA 3H03A 3EF7A 5AA4A 4G8MA 3S2VA 1S50A 4GOTA 4OVJA 3G3IA 4N13A 3VFJA 2PT1A 3VXBA 3ZSFA 2QS1A 4EQ7A 2X26A 1RYXA 5JEIA 4AB5A 1PB7A 4KR5A 2DQVA 2I3WA 4X1DA 3K6UA 2F97A 1VFEA 4HTGA 2G29A 2D3IA 4RPNA 5AA2B 1FTKA 3FZVA 3IK6B 2OJTA 5FHOA 3HV1A 1PEBA 1O7TA 2FNCA 3N94A 4ELPA 3VXCA 1EH3A 4I8CA 3CFZA 2XXTA 1Q35A 1MXZA 1B6HA 3VVEA 3O28A 1LFIA 4P0GA 2QMWA 3FJMA 2Q8JA 3H7MA 4JBZA 3C35A 4EDPA 2VGQA 3Q27A 2Z8DA 5DVFA 5TP9B 2XXHA 1Q1KA 2PBWA 1JEVA 4OHNA 5ICTA 2ZYOA 4F1VA 4X1BA 1CB6A 3OMBA 1XS5A 3G3JA 3RTWB 3TTRA 4M4GA 3OD7A 1AOVA 3E9XA 3MZ1A 3MZ9A 3U92A 3EHSA 3M3KA 1BTJA 3JYRA 1B2HA 1B0LA 2I49A 1NH8A 3RNNA 4BDRA 4PFTA 4P0IA 3VLWA 1QULA 2H99A 4ZZEA 2GHBA 5K2YA 2QS3A 3RUMA 5H8NB 4R6KA 1JEUA 1UTBB 2D5WA 1NKXA 3CI8A 1LGBC 2XXWA 1Y3QA 4MBPA 1Y1MA 2PVUA 3IB2A 1Y3NA 1DTGA 1MQJA 3MQ9A 4F2QA 4YICA 1M5CA 1OIBA 2HQ0A 1NNPA 5DVIA 1MY3A 3IOWA 2HAUA 3FUZA 1B51A 3ILUB 3H6UA 1SVXB 1B3LA 3C32A 2Y7PA 4DE8A 5HBCA 3FXRA 4POXA 2Q88A 1I69A 4F1UA 2V93A 2YPNA 3IB0A 1ZBMA 1MXYA 5F1QA 1IEJA 3SDFA 5TU0A 1A55A 1H43A 3RGYA 4XKQA 3N6UA 3K2DA 2DVCA 3TAJA 4DXCA 5H8QB 4RNSA 1LAFE 4TOZA 1I6AA 2Y84A 3RQTA 4GXAA 3OO9A 2GFEA 2IA4A 4M1VA 4RXLA 3O66A 2ONKE 3I3VA 1FTLA 4TLMB 3DP8A 4IO6A 4H1XA 2XXXA 3CVGA 4KYDA 1B58A 4F2OA 5H8FA 4GL8A 2H25A 4NF6B 2ZNSA 4QFKA 1LB9A 5CI5A 1FTOA 1IXHA 1SW4A 4KI0E 2XX7A 4U22A 3T66A 2CMOA 4XKRA 1NNKA 1H76A 4H65A 3JZJA 4NF4A 1MQGA 4F29A 2Q2CA 3IOTA 4I1DA 3TMGA 4RA1A 1N7XA 4F1YA 1B7ZA 4IY6A 4C1UA 2XXYA 3IO4A 3DM0A 5B70A 1MPBA 4OQOA 3SEYA 5LOMA 1Y4TA 3KSJA 2OZZA 1XVYA 4U4SA 1AL3A 4JWYA 1YPNA 1BP5A 1EU8A 1QJMA 2X7QA 3DP6A 1PB8A 1D4NA 1A8EA 2UXAA 2G93A 2OBGA 3T93B 3UIFA 2F7CA 3G7WA 4H5GA 2PMSA 3K4UA 3LSWA 5AE4A 1ATGA 3OO6A 3VLVA 3HHFA 4MF3A 4OEVA 4LZ7A 3H3GA 5H8SA 1F9BA 3BFUA 2FA7A 3BKIB 1EZOA 1JVXA 3O6HA 5CM6A 3ZS6A 1TXFA 1N3WA 2HFBA 1FQAA 3G3HA 1P1WA 4QRZA 4F22A 4KCCA 4RYAA 3U94A 4KYSA 1NL5A 3KOSA 4Z0IA 1WODA 2F78A 5KDTB 2NXOA 2VP1A 4Q30B 3U72A 3MBPA 3LR1A 5TPAB 5EYFA 2F8DA 1FQDA 3T22A 3SEUA 4ZEIA 3QUJA 4AB6A 3MP6A 3Q29A 3THIA 5KZTA 1OLCA 5IAIA 3PPNA 4GQOA 1ZTYA 4R9GA 3PMWA 2RINA 3RT8A 4BDMA 4YB7A 5I59B 1LFGA 1OVBA 2RC8A 3MP8A 3MWBA 2Q89A 3VVDA 4O3AA 3D4GA 2F5XA 3IR1A 3TTMA 4H0WA 4GIZA 1II5A 4R2BA 4JWXA 4ELOA 2X7PA 3Q26A 5L9MA 4ND9A 3GLBA 3RN8A 2O69A 1MRPA 2B3BA 3Q25A 1VSOA 3IB1A 3C33A 2AYSA 1GR2A 2M8CA 4G2ZA 2I48A 1SDXA 3QAXA 4OEUA 1B1XA 4FE8A 3CRBA 2R9JA 4NF8B 4IO4A 3K0VA 3VVFA 4QFNA 4QSDA 4DIGA 1IUDA 2NVUB 3QYTA 3TUSA 1MXWA 1N0TA 1IZ1A 3FV2A 1B3FA 4Q0CA 4XKPA 1P99A 4WEPA 1YCJA 3KG2A 5L8DA 1BKAA 3DP4A 3HSTA 2RF1A 3USDA 4K3FA 3K1NA 3C31A 3FXQA 4JXIA 4X48A 3O97A 4F39A 1B7HA 1MG1A 4GL0A 4YAHX 2ONRA 4YKJA 3MUQA 2UVHA 2XXRA 3SEVA 4ESXA 3Q28A 3ECRA 4OETA 1US4A 4H8JA 2FYIA 2Z23A 3CSBA 1B4HA 3KJTA 1OQGA 2ZYNA 5M2VA 2DWIA 3VDFA 1PB9A 3PUVE 3K6VA 3SKPA 4QSCA 3RY3A 4EUOA 3KN3A 3MC2A 1MH3A 4OZ9A 1UTHB 3PD9A 5A5XB 3C36A 1B40A 3O6IA 1TT1A 5AA2D 1B3HA 3OO7A 2DE2A 2Y7KA 4BDNA 5F7VA 3MVXA 3C9HA 2O1MA 1ELJA 1PBPA 3MW0A 2O6AA 4RY1A 4KHZE 5AA2A 4DXBA 5I2KB 1R1NA 4YKIA 3KGCA 1NNTA 3K02A 3GXAA 3KOTA 4ECFA 1URDA 4IO5A 2F6GA 2DVZA 3K1MA 2A5SA 2H4IA 1B9JA 3TTNA 3E3KA 1MDP1 1ZMGA 2OK2A 2AL5A 4G8NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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