3IJOB

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, althiazide
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ijoB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ijoB02
2QS4A 4NTLA 2PT1A 1SW2A 1TFDA 4WKMA 3OEKA 3FV1A 3N26A 2Y7PA 2Q88A 4RYAA 2PT2A 3SDFA 2IEEA 4KYSA 4TOZA 1LAHE 3FXUA 5CMCA 3IX1A 2VD2A 2Y84A 3KN8A 3MJNA 1F9BA 3VV5A 2F97A 4IY5A 3SERA 4G68C 3PPRA 5AA2A 1B5HA 3SEXA 2XX9A 3R7XA 3IOWA 1DPEA 3M3FA 3TODA 2NXOA 1VFDA 1N76A 1UTBA 1MQDA 3MZ1A 5FHOA 4MBPA 2F7AA 3T9HB 1WODA 2DE3A 4QFPA 3H6VA 1BTJA 4U22A 3WAEA 1URSA 3TELA 1M5DA 1Y3PA 3N6UA 4PFUA 1MRPA 4LP2B 1MH4A 4FORA 2ZYOA 3RPWA 1AL3A 4WXJA 3C9HA 3K00A 3O9PA 4DXUA 3V83A 5AA3A 1R6ZA 1S7YA 3RUMA 1TWYA 5AA4A 1A99A 4UA8A 3KFMA 4KPTA 2ABHA 2OCUA 1YCJA 2AL5A 2REJA 4KFQA 4Q8RA 3HCQA 5FHNA 1B3GA 4TQUQ 4ESWA 1MY0A 3K6VA 1JW4A 4MH5A 4I8CA 3H6UA 2OJTA 4Q5TA 4IO7A 1B7UA 1P1WA 1SYHA 1BKAA 1ZKBA 2WKYA 3T93B 4P0IA 3OO9A 4BLAA 1GTKA 1UTBB 2RKMA 4OEUA 2D3IA 4X48A 1CB6A 4GXSB 2G29A 2Q2CA 1ELJA 4LQ5A 3TKDA 3RT6B 2Z23A 1Q1KA 1HSLA 5I84A 2A5SA 3K01A 4R75A 3KJ7A 1L5TA 1Y20A 4F1UA 1B0LA 1Z7NE 3EHSA 4IGTA 5I56A 4QRZA 3ILTB 2XXXA 3K4UA 2UXAA 3F11A 3GBAA 2D5WA 3IJXB 2DWAA 4U4SA 3O28A 1LFHA 1USYE 3TTKA 2UVGA 1LBCA 1B5IA 5AA4B 3Q26A 1EH3A 1SI0A 1VSOA 5BUUA 2O1LA 2REGA 3GLBA 3TTMA 1NMUA 1MXVA 4HCYA 3S9NC 1SD3A 2RC8A 1FTJA 3Q25A 3MPLA 2GFEA 2R9JA 4DLDA 1Q35A 3RY3A 2DVCA 3TTNA 3QSLA 2XXHA 3VFJA 5LOMA 5B7DA 1HSEA 1IZ1A 3FJ7A 2I49A 5K2YA 4DIGA 3GZGA 1B58A 3U92A 5A5XA 5H8FA 5I59A 3K0VA 2ONSA 4NF8B 1B7ZA 5FHMA 3C36A 2X26A 2I3WA 4G77A 2XXVA 4NEDA 2GHAA 5KCJA 1H45A 5H8NA 3KN3A 3EN3A 1MDQA 5I56B 1NNFA 2P0SA 1I6AA 3PV0E 3VVDA 1PBQA 4H65A 2B65A 2VD3A 4R2FA 1FQEA 1NKXA 1MM7A 3CVGA 4YU0A 4YAHX 2HZLA 3G3FA 3OO8A 2XXRA 4ZDMA 2HEUA 2H9BA 4O3AA 3SEWA 2KLFA 3EHUA 3G3IA 4RY1A 2H4IA 4RJZA 2FYIA 4RXLA 1TT1A 3TDJA 2I0BA 4R72A 2H98A 1MY3A 2HQ0A 1LLSA 2CZLA 3P7IA 1YTVA 4KHZE 4G8NA 4OXVA 4H1XA 3T96B 2VHAA 3C32A 5ISUA 3PMVA 1ZMGA 1LAFE 2I48A 1POTA 3FXQA 3V89B 4M4GA 1H3DA 2NVUB 5AA2D 1ZJLA 4GD5A 1B40A 1O63A 3HSTA 5I2KB 1LB8A 1JQFA 4F1YA 3HPIA 3FATA 4Z0IA 5H8FB 1VFEA 2XXWA 1FQDA 2V93A 3K2DA 4LVQA 3KSJA 3QXMA 3U93A 4R6KA 3UP9A 4BDRA 4PFWA 1NNPA 5L8DA 5FTHA 5CBRA 5KCJB 4DZ1A 3TCGA 4ZZAA 1OIBA 3S9MC 1DSNA 3EF7A 5H8NB 5IKBA 4H6DA 2Q89A 1MXZA 4EXKA 4FE8A 3CSBA 3S2VA 5JK4A 2GHBA 5M2VA 1B3HA 3V5AA 4ELRA 1MPCA 3PD8A 4JXIA 3HHGA 3E13X 1SBPA 3B7DA 1SVXB 4PFTA 4R9FA 3RLFE 1MXYA 1M5CA 2I4BA 4OFOA 2QS2A 2OZZA 1ZBMA 1FW0A 1PEBA 3FVOA 1LCTA 1VE4A 1PC3A 3MVZA 3DP6A 4QSEA 1SI1A 5HBCA 3SETA 3CRBA 4WEPA 3W9WA 5JTYA 1ANFA 4X1BA 2X7PA 1B4ZA 4ONYA 4O3BA 1PDAA 4C1UA 3GXAA 3TUSA 1OVTA 2I4CA 1POY1 2F8DA 1PB7A 3HO7A 1PB9A 1B52A 2ZNUA 3O6IA 1IEJA 4H8IA 5F1QA 4XXUA 1O7TA 4XKRA 4JSOA 1B32A 4R74A 3C4MA 5L9OA 5KZTA 3U1OA 2VGQA 1R1NA 2FA7A 1Y4CA 1GV8A 1B1XA 2F35A 1P1UA 4MFIA 1D9YA 3BFUA 3MZ9A 3KEIA 1S9TA 2CMOA 3TCHA 4KYDA 4R73A 3K6UA 3N6TA 2LAOA 4UACA 3KG2A 4RA1A 4QF9A 3FZVA 4QFNA 1PB8A 4YKIA 3IB0A 1Y1ZA 2D21A 4RK2A 3K6WA 4EQ7A 1IUDA 4I1DA 4ZEKA 5EYFA 3MBPA 5DTBA 4DCXA 4G68A 5JTYB 1Y1MA 3EPEA 4H5GA 2I3VA 3TZAA 2ZYNA 1XC1A 3TYHA 4KR5A 4GFRA 3H6WA 2DVZA 1FQFA 5TU0A 4P0GA 1XHYA 4OENA 3BFTA 2E0SA 1EZPA 3O6HA 1A54A 3LSWA 5HM4B 3MW0A 2OBGA 3ZSFA 1B9JA 1MY2A 4OTEA 3G3KA 4LZ8A 1OQGA 1UQWA 2DE4A 3JZJA 1QUKA 2VOZA 3TTRA 2OWTA 2F78A 1N7XA 3FUZA 2O1MA 4PFYA 1I6BA 4IO2A 2DQVA 3HHFA 1P1OA 3MZBA 1MQGA 3CG1A 3UGWA 4L17A 2O6AA 4F31B 4AB6A 3W15C 2Z8EA 1URGA 4ELOA 3H06B 3TCFA 1FQCA 5BWJA 1JW1A 1NL5A 4KYEA 4U4XA 3TEPA 4HW8A 4FIMA 4OESA 1MXWA 4I9DA 4G68B 3FVNA 2DSFA 3RN8A 2Y7WA 2R6GE 4MF3A 1QKAA 3WAFA 1LAGE 3IOTA 5ELVA 3ODBA 1JVXA 4NWCA 2Y7RA 3L6HA 3B6QA 2DE2A 1AMFA 2PMSA 5ICQA 4JWXA 5AA2B 1XS5A 1ZIUA 4THIA 3O97A 4IY6A 2BJJX 2V3TA 4ZS9A 4YMBA 4BDMA 2M8CA 4ND9A 5I57A 4ZEIA 1MPDA 4YZZA 3KOSA 1A40A 1NH7A 3C35A 4DXCA 1XT8A 1SQYA 1GGGA 1MPBA 4BDNA 1B46A 3HV1A 3PMWA 3R26A 2NOOA 4ISUA 4FEDA 2DWIA 4ZEFA 4XKQA 4DXBA 1LFIA 4PETA 1P99A 1JEVA 4F3BA 5H8SA 3CFLA 3A3UA 4MLVA 4P11A 1MS7A 2B3BA 4GXAA 4QHQA 4GL0A 1RKMA 3TPAA 1N7WA 3KSXA 4F3SA 2XX8A 3VXBA 3CIJA 3CG3A 4HTGA 4Q30B 2V84A 2H99A 4C1TA 2O84X 4F3GA 1H43A 1ZTYA 5TP9A 1Y4TA 1RYOA 1DPPA 4KI0E 5I2NA 4F39A 4GOTA 3TQLA 4JWYA 4E0XA 4XTCQ 1LB9A 1ATGA 1UIUA 3D4CA 1MXXA 3H3GA 5FTIA 4NF5A 3E4RA 1DTGA 1MG1A 3IB1A 3LC8A 3U94A 4GLIA 3VLUA 3OENA 5EHSA 4BDOA 1GVCA 1VR5A 3PGFA 1MY1A 3KGCA 4EXLA 2ZYMA 3PPQA 4H5FA 4F19A 5AA1A 4ESXA 1YAEA 1Y3NA 3Q28A 4EUOA 4NMYA 5CI5A 2DP8A 4FATA 5CMKA 5K2XA 2B3FA 4JSDA 1A8FA 2UVIA 4OMBA 2OK2A 4U23A 4AB5A 4NF4A 5H8HA 3HN0A 4OETA 2DWJA 3KBRA 4GVOA 3DP4A 2QS3A 3QAXA 1OMPA 4F22A 1RYXA 3R6UA 4QSCA 1N0TA 1BIYA 2ZMBA 4EF1A 4LONB 3K02A 3OO7A 1URDA 3SEYA 5TP9B 2DOJA 3QUFA 3FGSA 5I2NB 1IXCA 4G4PA 1FQAA 4RNSA 2GH9A 4YKPA 3RTFB 1QUJA 2F34A 4I62A 4IO5A 3CR9A 1P1NA 4ZECA 5A5XB 4NF5B 1MQIA 5DEXA 3KZGA 1I69A 1II5A 5I59B 3K1NA 2AYSA 1JETA 2RCAA 4KCCA 3C31A 2QJEA 3O2AA 1IITA 3N94A 2RINA 5CMMA 2QS1A 2OWSA 2YJPA 2H5YA 3PUVE 4NWDA 2QMWA 5TPAA 1R9QA 2XD2A 1DMBA 3FVGA 2OLBA 1SDXA 1B3LA 1QUIA 3OSQA 4H0WA 4QFKA 3OSRA 3L6GA 4Z7EA 3H6TA 3E3KA 4NF4B 5B70A 3QIMA 1N84A 5H8HB 3FD3A 4MLQA 3A09A 1B1HA 4G8HA 4G8MA 3JYRA 4RPNA 1R9LA 2XXYA 4XIGQ 2GRVA 1JEUA 4F29A 2HCAA 4N07A 1OLCA 4XKPA 3IO6A 1M5EA 2DXRA 3QUJA 3IL1B 3VE1B 2O51A 1LBBA 5DEXB 1UTHA 4O3CA 3KOTA 1Y3QA 1JW5A 4OZ9A 2UYFA 3D4GA 4X9TA 1KWHA 3FIRA 1JNFA 4KD5A 4N6PA 3M3KA 2F5XA 4F18A 3KN7A 5CRYA 4YMAA 3U8QA 3LSLA 1Y9UA 4PQJA 3THIA 3CSGA 5TPAB 1DTZA 4PP0A 4ZE8A 4YICA 1B7HA 2Z8DA 1SW5A 5DYHA 1AH5A 2H25A 4NF6A 1OQHA 2DWHA 1MXUA 2ZNSA 2O69A 3G7WA 1BLFA 4DCYA 3CFZA 3BKIB 4HCWA 5DVJA 1JVYA 1A7LA 1DOTA 4ZEBA 3PUXE 1TFAA 1NNTA 4FECA 2W7YA 2HZKA 1UTHB 2PX1A 2QMXA 2A5TA 2AIXA 1B6HA 1XVXA 2F7BA 4JWOA 5ITPA 2HAVA 1IXHA 3ZKLA 3MP8A 5L9MA 1IXIA 4F1VA 5DT6A 1T0KA 2PBWA 4LA9A 4F2QA 2XD3A 3TFLA 3DELB 4DE8A 2ONKE 3UK4A 1B5JA 1M5BA 4JBZA 1LFGA 2XX7A 4YKJA 1D9VA 3MUQA 4BDQA 3UORA 3DM0A 4GF8A 4NE4A 3BBRA 4YB7A 3ILUB 2HXWA 1IQ7A 3I6VA 4NF6B 3V8XB 3CI8A 3MQ9A 4ELPA 1N3XA 3MP6A 1AOVA 3MC2A 1USYH 1FTKA 3T22A 4U2RA 3AXFA 4HS7A 3DP8A 4ELQA 2I58A 5J1DA 1B3EA 2QPQA 1SYIA 3H03A 4LUBA 2DS9A 4POXA 3I3VA 1B0HA 3H7MA 1SW1A 1H76A 2UVJA 3FJGA 1H44A 4GRKA 3PPNA 5KDTA 3M8UA 2A5TB 3TMGA 3UIFA 4JB7A 2ZYKA 1LSTA 2Q9TA 3LUYA 4ZEDA 3PPOA 3ONMA 1IIWA 3DLNA 5JEIA 5CM6A 1QW0A 1ZLQA 3SESA 1B2HA 3T9UA 1XVYA 4QSDA 4LZ5A 3IR1A 1MDP1 4YKKA 2XXPA 4OHNA 2Z8FA 3RNNA 2P1SA 4NF8A 1FTMA 1ZU0A 1NNKA 3FV2A 3RQTA 3E9XA 1US4A 3U72A 4AQ4A 2E1SA 4POWA 3KJTA 2VP1A 3MPKA 1Z7ME 4R2BA 3G3GA 2V3UA 4QFLA 3OEMA 2QRYA 5DVFA 1EU8A 3FXRA 4OWDA 1YPNA 2X7QA 3RTWB 1LGBC 1I6QA 2RC7A 3T66A 4R9GA 1LCFA 4GWOA 1MH3A 3QYTA 2RF1A 2O68A 4OEVA 5AE4A 4FEBA 5ITOA 3TAJA 5KDTB 3PUWE 1B05A 3TQWA 3OMBA 2R71A 1IXGA 2DYXA 3VXCA 3A3CA 3B6TA 1M5FA 1S50A 3PPPA 1PBPA 3H4ZA 5CMBA 3VVEA 3MVXA 4ZZEA 3RT8A 5I57B 4EQBA 2XXUA 4F3PA 4WEDA 2AL4A 4LZ7A 3O66A 4G2ZA 3K1PA 5I2KA 2ZNTA 2RC9A 2RCBA 2HAUA 4DDDA 4ZE9A 2PYYA 3LBSA 4U1ZA 1SW4A 4OERA 2Y7KA 3B6WA 4M1VA 1OVBA 3S9EA 5F7VA 2YPNA 1LAXA 3FVKA 4PE5B 5DVIA 3MP1A 2NWJA 4U1OA 3QK6A 4E0WA 1B4HA 4H8JA 3O29A 1WVJA 4OFLA 4N13A 3IOUA 1EZ9A 4ECFA 5ICTA 4EDPA 2I0CA 3Q27A 4OQOA 1WDNA 1UIVA 4OFJA 3EHTA 3I5OA 1HSJA 1NH8A 4IGRA 4JDFA 2ZXTA 4EF2A 4RK9A 4F2OA 3FJMA 3VVFA 3JV9A 2V3QA 3IAZA 3IOVA 5CC2A 2F6PA 4Q0CA 3G3HA 1B51A 3T9XB 3W9VA 2NUVA 3PU5A 3SEVA 3FASA 5EHMA 3MVWA 2QL3A 2XXTA 3Q29A 3SKPA 2I6EA 1XOCA 3T9VA 3K1MA 2QSXA 1OLAA 2YLNA 4U21A 2Z22A 3PMXA 2XXIA 3UA8A 1FTLA 2ALUA 1FCKA 1AIVA 4H67A 1MQHA 1CE2A 3IK6B 4LATA 4GL8A 3TTLA 1EZOA 3S4UA 5H8QA 4IB2A 3USDA 2P2AA 5CBSA 4GQOA 4K3FA 1D4NA 3K6XA 3C34A 5IAIA 4FJPA 3CFXA 3MAMA 2Q8JA 1QKBA 2ANJA 1MM6A 3GBBA 2PVUA 5I58A 4OYVA 2XXQA 3LR1A 2F6GA 1O64A 1J1NA 4IO4A 4IO3A 4IO6A 3RGYA 4RPOA 4R6YA 3C33A 3IO4A 3LSXA 1QJMA 1MQJA 2O7IA 3ZKKA 4QFOA 1N04A 3M3LA 3PD9A 3G3JA 2ESNA 1A55A 5L9SA 4EQ9A 1P1QA 2F36A 3ZS6A 3SEUA 4C0RA 2Q2AA 1N3WA 3IJOB 3OOAA 3OELA 4YB5A 4BDLA 3O6GA 4KQPA 4FAJA 4KCDA 3VLVA 3S9LC 5HPQA 4LQ2A 2G93A 3PUZE 4TLLB 1US5A 4YB6A 3VDFA 2THIA 3OXNA 3N5LA 4GIZA 2V25A 1A8EA 1D3KA 2Y7IA 1FQBA 1QULA 1QVSA 5H8QB 4TLMB 3MVYA 3UN6A 2IA4A 2O7UA 4R6HA 3IORA 2UYEA 2XHDA 5I58B 2FNCA 3OO6A 3OD7A 3LSFB 2HFBA 1GR2A 3ECRA 4XKNA 3VLWA 3IB2A 1B3FA 1FTOA 2DXYA 2ONRA 2UVHA 3MWBA 3PUYE 1NFTA 1TXFA 4OVJA 1BP5A 3EQ1A 1MY4A 2F7CA 4X1DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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