3IJOB

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, althiazide
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ijoB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ijoB02
5K2XA 1NNPA 3VLUA 2UYEA 3LSWA 1XS5A 3PMXA 3K00A 1MXXA 4L17A 1O64A 3PUVE 3LBSA 4O3CA 4RK9A 1A40A 3U72A 4OETA 5KCJB 3C36A 2I3VA 3C9HA 1LLSA 2XXUA 1LSTA 4IB2A 4OTEA 1JW1A 5LOMA 4LATA 1Z7NE 1A8EA 3O9PA 5KZTA 2VD2A 2O7UA 4GD5A 3G3IA 5CBSA 4I62A 1NFTA 3MPLA 5DYHA 1QVSA 3CFZA 4NEDA 4LVQA 5H8HB 3EHTA 3OSRA 2F6GA 1JNFA 3Q26A 3G7WA 1Y3PA 2DWJA 4H65A 4NF6B 1Y1MA 2GH9A 3IOTA 3UIFA 3UN6A 1O63A 1AIVA 3Q25A 2F8DA 1H43A 2ONKE 4G4PA 1JEUA 2DWAA 1CE2A 2GHAA 2HXWA 3EQ1A 3PPPA 4IO5A 3PD9A 2DSFA 3KOTA 3MQ9A 4X1BA 1VFEA 3JZJA 4EUOA 4EF2A 3OO9A 3VXBA 3VV5A 4DXUA 1PEBA 3FASA 4R9GA 1DTGA 2I58A 3IJOB 4RK2A 4EQ7A 1MQDA 3FD3A 1LB9A 3ONMA 4IGRA 2E1SA 3KEIA 3W9VA 3IOWA 3Q28A 3R26A 4OZ9A 3PUXE 4ZEIA 3U94A 4JWYA 1JEVA 1XVYA 2A5SA 4MLVA 1A7LA 4U2RA 3SETA 1DPEA 1VFDA 3SEVA 1DSNA 4F19A 4GF8A 4NF6A 3HHFA 3O6GA 3I5OA 4OWDA 3IOVA 4JXIA 3PPQA 1Y20A 1NNTA 2XXVA 2DE2A 2QPQA 2DXRA 2V25A 1CB6A 3IORA 3OOAA 4JBZA 4NF5A 3RT8A 3TTRA 4BDQA 4P11A 3K0VA 2F36A 2O6AA 3CFLA 1OQHA 3TODA 3FVGA 1LB8A 1XT8A 2OJTA 5DT6A 1RYOA 5EYFA 4DZ1A 3H03A 2UYFA 2XXXA 3L6HA 4YICA 2V84A 4QF9A 3AXFA 4AB5A 3UORA 4U4SA 1AH5A 3S9NC 3G3JA 1GR2A 1M5BA 3MVWA 3PGFA 4QSDA 2H9BA 3VLWA 5H8FA 1F9BA 3FUZA 5CMBA 4PFYA 4XKQA 5ELVA 3RN8A 1PBQA 2IEEA 1R9LA 2UVIA 1ELJA 5CMMA 3SEUA 4ELQA 3GZGA 3KOSA 5AE4A 2Y7WA 2RCBA 3IR1A 3CR9A 4U22A 3KSXA 3E13X 3PUWE 5AA4B 4N13A 1FQCA 3VVDA 4POXA 5I2KA 1EZOA 1R6ZA 5TP9A 3H3GA 1US5A 2NOOA 3VFJA 4IGTA 3O2AA 2AIXA 2QJEA 1PDAA 1SI0A 5AA1A 3T66A 3HN0A 3FJ7A 4OQOA 4DXBA 4PE5B 1EH3A 4N6PA 5I57B 4WEDA 2HAUA 3F11A 2O1MA 3D4GA 4I8CA 4O3AA 2DVZA 2O1LA 2A5TA 1S50A 1OQGA 2THIA 5EHMA 2R71A 1D4NA 1OVBA 2RC8A 5ITOA 4Q5TA 1I6BA 4PP0A 2ZXTA 2Q2AA 4F1YA 2X7PA 3DP6A 1B4ZA 3GXAA 3ZSFA 1ANFA 1B7HA 3OENA 2RKMA 3PV0E 4RPNA 1DOTA 1B52A 3IO6A 4GRKA 5I59A 4DXCA 2I3WA 3SEYA 1JQFA 1JETA 3QIMA 4KD5A 4JSDA 3C4MA 1URGA 2OK2A 3FIRA 4YKPA 2OZZA 3RNNA 5ICTA 3B6TA 4FIMA 2F78A 1MDP1 1MPBA 3ILUB 3OO7A 4R75A 5FHMA 4ZEBA 1Y3QA 5A5XA 3KZGA 2QMWA 3RGYA 4K3FA 1J1NA 1OMPA 5I84A 3IO4A 5B7DA 3QSLA 3MUQA 3U93A 4I1DA 3FZVA 5JK4A 1USYH 4ZECA 2ZYNA 3PPNA 1AL3A 1FTLA 4JB7A 1IUDA 1GTKA 2HZKA 4PQJA 4RPOA 4ZE8A 1HSEA 3N94A 4RXLA 1B5JA 1IXHA 1MQIA 3B6QA 4YMAA 5I59B 4LQ5A 4DIGA 1ZMGA 3V8XB 5HBCA 3RTWB 4GFRA 1YPNA 1B3FA 1WODA 3O28A 3KG2A 1B5HA 4M1VA 3TKDA 2DQVA 2I0BA 1FTKA 2VGQA 1BP5A 2ALUA 5I58A 2QS4A 2PT1A 2OWSA 5AA2A 2ZYKA 5TPAB 1B0LA 3B7DA 3G3GA 3TQLA 2ABHA 1IEJA 5FTIA 3FATA 1QUKA 1XVXA 1JVYA 3OO6A 2QMXA 3T9UA 2HAVA 2VP1A 3TEPA 1N3WA 4YKKA 2RCAA 4YU0A 2F7CA 4BDMA 1B9JA 4EF1A 2Y7IA 1BKAA 1LAHE 2B65A 2OLBA 3BFTA 1LAFE 2QS3A 2Z22A 2LAOA 5H8SA 2O69A 1LBBA 4G8HA 1M5FA 4F1UA 5F1QA 3MVXA 5JTYB 5M2VA 4I9DA 3FJGA 4H67A 3S4UA 3OEKA 1IIWA 1FQFA 2O7IA 3IB2A 3MP1A 2I0CA 4MFIA 1S9TA 4ISUA 3VXCA 4LZ5A 3T9HB 3M3FA 3K01A 1IXCA 3JV9A 2XXYA 3G3FA 1PC3A 4OVJA 5ICQA 2ZNTA 1LAGE 1I6QA 1TXFA 4TLLB 1NKXA 4G8MA 5DEXA 2O84X 3VVFA 4ECFA 4NWCA 4F39A 2PMSA 1XOCA 4X9TA 1FQEA 4QRZA 1N7WA 2ZYOA 3MC2A 3R6UA 1B4HA 3CI8A 3ZS6A 2W7YA 3K2DA 3MBPA 2F35A 4Z7EA 4OENA 5L8DA 5BUUA 4TQUQ 4KQPA 2PYYA 3CIJA 1MY0A 4F22A 3PU5A 4OFLA 3E3KA 2H5YA 2FA7A 3SEXA 5CC2A 1WDNA 1GVCA 5ISUA 3IAZA 4EQBA 4HCYA 3KJTA 3S9MC 3IL1B 3FXUA 4MH5A 2QSXA 1B6HA 2Z8FA 1LBCA 4KHZE 2ESNA 3SKPA 1BLFA 2X26A 3WAFA 2X7QA 4KCDA 5EHSA 3T9VA 4PFWA 4KR5A 4FATA 3UP9A 1B1XA 2RC7A 1A99A 1QULA 1SW1A 3ILTB 1FCKA 1H45A 4YKIA 1DPPA 3TQWA 1LFGA 4IO2A 4NTLA 2XXTA 4KPTA 4KYDA 1R9QA 4RA1A 1EZPA 2UVJA 4NF4A 1A54A 1MY4A 1N84A 2QS1A 2RINA 2WKYA 3G3KA 5L9OA 5CMCA 1T0KA 4QFNA 4G2ZA 3PPOA 2Q89A 2PBWA 4QFPA 4EXLA 5CI5A 2ZYMA 5L9MA 1S7YA 5CM6A 2Z8EA 3VLVA 4ESXA 5KDTB 1LFHA 1I69A 3H6UA 4GQOA 1SW4A 3RUMA 1SD3A 3TCGA 3TPAA 3Q29A 4XKRA 4F3PA 3FVKA 4IO7A 4P0IA 2P2AA 1P1OA 1SDXA 3KN7A 2NWJA 2R6GE 1MM7A 4FAJA 3RPWA 1URDA 3VVEA 1B3HA 1M5DA 1N04A 1O7TA 1XHYA 3K1PA 5H8NA 1MH4A 1Y1ZA 1FQBA 2O68A 2ZNUA 3N6UA 4G68A 4POWA 3K1MA 4ZZEA 2G93A 4GXSB 1NMUA 2XXPA 4IO4A 4N07A 4ND9A 1TFDA 3K1NA 4IY6A 5A5XB 1MXVA 1NL5A 1HSJA 2R9JA 3TAJA 4G8NA 5AA2B 5I56A 3V5AA 1EZ9A 1UIVA 3DP4A 1SYHA 3A3UA 4GXAA 3QYTA 1UIUA 2GHBA 1H44A 4RJZA 2NVUB 4OFJA 4YMBA 5KCJA 1P1UA 4HTGA 2I4CA 1YTVA 3O6IA 3FV2A 1LCTA 1Y9UA 2XX7A 3EF7A 3O29A 4H8IA 4WKMA 4XKNA 3TMGA 1B7ZA 2F5XA 3JYRA 4ZE9A 1NH7A 3TDJA 1L5TA 4H1XA 3IJXB 1LGBC 4GOTA 1UTBA 2DE4A 3TFLA 4G68B 2REJA 4R6HA 3T96B 4ESWA 4YB7A 2HCAA 2OCUA 3LSFB 3H6TA 1ZBMA 3PD8A 1PB8A 1QJMA 4YB5A 2PT2A 1MPDA 3E4RA 5FHNA 1ZKBA 3TCFA 2I49A 4QHQA 4TOZA 5I56B 2H99A 3TTNA 5I58B 4F3SA 3QXMA 3ECRA 2B3BA 2V3QA 1B32A 1P1NA 2OBGA 1QKAA 4KI0E 1US4A 1MRPA 3DELB 5DEXB 1UQWA 4F3GA 1QUIA 2IA4A 4OESA 3EPEA 4QFOA 4ZEFA 3RT6B 1MY3A 3IK6B 5FHOA 3TYHA 1SVXB 3D4CA 1NH8A 1N76A 3OMBA 3MZ1A 4YKJA 2Q88A 5F7VA 3TZAA 1A55A 2D3IA 1ATGA 1DTZA 1ZU0A 1FTJA 4X1DA 3KGCA 4Q30B 3OSQA 1P1QA 3BKIB 4YZZA 2CZLA 2DVCA 2I6EA 3HCQA 1MS7A 4Z0IA 4ZZAA 3S2VA 3DM0A 1OLCA 1VSOA 3DLNA 2HQ0A 1BTJA 3IB1A 3TELA 1URSA 1TWYA 4BLAA 5IKBA 3V83A 1NNKA 3SERA 1M5CA 2QS2A 4H8JA 3HSTA 4R6YA 5AA2D 1GGGA 4XXUA 3S9EA 3PUZE 2G29A 2UXAA 3SEWA 3QK6A 3Q27A 2AL4A 4E0WA 2H4IA 3N5LA 4AB6A 4F2QA 4FE8A 3MVYA 1GV8A 4LZ7A 4BDNA 3TUSA 4H5GA 2HFBA 2V3TA 4R72A 1TFAA 2DP8A 3PMVA 4PFUA 3FJMA 3LC8A 4TLMB 4WXJA 1AOVA 3K6XA 5H8FB 2I4BA 2REGA 4GIZA 2I48A 1MXYA 4KYSA 4LP2B 2FYIA 2QL3A 1POTA 2DWIA 4IO6A 2ZNSA 3V89B 5L9SA 1MY2A 1SQYA 3DP8A 4OEVA 3KBRA 2Y7PA 1A8FA 2B3FA 2F34A 3C35A 3OXNA 3C33A 4C0RA 2GFEA 3U8QA 4NE4A 3PMWA 3VE1B 2Y7KA 3W9WA 3CVGA 1FQAA 4H5FA 3H06B 3BBRA 5I2KB 1NNFA 3H6VA 2NUVA 2HZLA 2CMOA 4FEDA 4DCYA 5B70A 5ITPA 3RTFB 1AMFA 5AA3A 3K6UA 4H6DA 1WVJA 4LZ8A 3CRBA 1H3DA 3MP6A 1XC1A 3T22A 3I3VA 1B3EA 4FEBA 3EHSA 4QSEA 4AQ4A 2XXIA 3CSGA 5DVIA 2Y84A 4U4XA 3L6GA 2DWHA 2O51A 3WAEA 4JWXA 2F7AA 3GLBA 4ELRA 3HV1A 3R7XA 3G3HA 2F7BA 5BWJA 2A5TB 5JEIA 3IX1A 2DE3A 1ZTYA 3C31A 3C34A 3FV1A 2HEUA 1YCJA 4M4GA 4ELPA 4U21A 3O97A 4MF3A 1BIYA 2ANJA 2P1SA 4LQ2A 3HHGA 2Z23A 4R74A 4XTCQ 1N7XA 2F97A 3TCHA 3W15C 4WEPA 1R1NA 3A09A 4DCXA 4NMYA 4OYVA 4BDOA 1UTBB 3OELA 2DS9A 4R2FA 1B2HA 1ZLQA 3K02A 2M8CA 1MG1A 1OLAA 1VE4A 1B51A 3E9XA 4OXVA 4C1UA 3TTLA 3N6TA 3S9LC 3M3LA 4F1VA 3QUJA 4G68C 4Q0CA 3RQTA 4HW8A 4IY5A 4F2OA 4GVOA 1QW0A 4UACA 3FXRA 3UA8A 5HPQA 2XXRA 3KN8A 1Q35A 4FORA 4LA9A 1Z7ME 1IXGA 2YPNA 4DLDA 5HM4B 1P99A 1RYXA 1QKBA 1MY1A 1MQGA 2XD3A 2XHDA 1OVTA 2ONSA 1KWHA 1N3XA 2YJPA 3H6WA 4KFQA 1FTOA 4U23A 3FXQA 1ZIUA 2AYSA 1JVXA 4MBPA 3RY3A 1LAXA 2DYXA 1MPCA 4H0WA 1Y4TA 3O6HA 3QAXA 4U1OA 2F6PA 1SW2A 2VHAA 3MZ9A 3LSXA 4THIA 4ZDMA 3U92A 4RNSA 5DTBA 3PUYE 3GBAA 4ONYA 4F3BA 3CG3A 4EDPA 3EN3A 2DOJA 1H76A 1TT1A 1Y4CA 1MXUA 1Q1KA 2V93A 1MQJA 4XKPA 3IOUA 4HS7A 2RF1A 4ZS9A 5TPAA 1UTHB 2H98A 2QRYA 2XXQA 3SDFA 2E0SA 3MAMA 3FGSA 3MW0A 4LUBA 3KFMA 5FTHA 3ZKLA 2NXOA 3FVNA 3OO8A 2KLFA 3FVOA 3OEMA 3KN3A 3LUYA 4PETA 4RYAA 3ZKKA 4R6KA 4OHNA 4RY1A 3T9XB 4DDDA 3HPIA 5H8HA 3VDFA 2AL5A 3QUFA 4BDRA 1D9VA 2Q8JA 2ZMBA 4YAHX 5K2YA 1QUJA 1SBPA 1Y3NA 3RLFE 4C1TA 2RC9A 2XX8A 5JTYA 4QFLA 3EHUA 4O3BA 4QFKA 3LR1A 3M8UA 1IZ1A 5J1DA 1PBPA 1B05A 3MPKA 3MP8A 5IAIA 1MXWA 1ZJLA 3CG1A 1N0TA 1P1WA 1UTHA 1PB9A 3KJ7A 3MJNA 4F18A 3T93B 3SESA 4GLIA 2XX9A 4Q8RA 4JSOA 4NF8B 2PVUA 3K6VA 1B40A 3O66A 3UK4A 1D9YA 1M5EA 4GL8A 2Q9TA 3N26A 1IITA 1MM6A 1SI1A 1MQHA 2FNCA 4XIGQ 2GRVA 5H8QB 4ZEKA 3M3KA 4OFOA 4ELOA 1LCFA 1IQ7A 5I2NB 3PPRA 1FW0A 3K4UA 3UGWA 3K6WA 1SW5A 4HCWA 1PB7A 4NF5B 2H25A 2V3UA 2OWTA 4UA8A 1RKMA 1FQDA 2PX1A 4X48A 2YLNA 4KCCA 4GWOA 1D3KA 1B7UA 3CFXA 3CSBA 5AA4A 1YAEA 2D21A 4JDFA 3OD7A 2DXYA 5TP9B 1LFIA 4LONB 4OEUA 4PFTA 4EXKA 1MDQA 5CMKA 4NF8A 4QSCA 4GL0A 3USDA 4NF4B 4R73A 5CBRA 1HSLA 3B6WA 1B5IA 1B58A 1EU8A 1II5A 2Q2CA 2XXHA 5H8QA 2XXWA 3U1OA 4FECA 4F29A 2XD2A 2Y7RA 4ZEDA 2UVGA 1FTMA 1IXIA 3H7MA 3MWBA 3C32A 4G77A 4IO3A 4R9FA 5DVFA 5H8NB 5I2NA 1MXZA 1VR5A 4FJPA 1B0HA 4MLQA 4E0XA 4F31B 2D5WA 4JWOA 5KDTA 1I6AA 3KSJA 3ODBA 1B3LA 1DMBA 3P7IA 1JW5A 5CRYA 3MVZA 1POY1 2UVHA 1B1HA 5I57A 1OIBA 4EQ9A 4OMBA 3IB0A 3THIA 3TTMA 4BDLA 1B3GA 2BJJX 4YB6A 5DVJA 1SYIA 4P0GA 3HO7A 2Z8DA 3TTKA 4DE8A 3MZBA 1B46A 1MH3A 2ONRA 3LSLA 3H4ZA 2P0SA 3I6VA 1USYE 4KYEA 5TU0A 2VD3A 4NWDA 3GBBA 2VOZA 3A3CA 4U1ZA 4OERA 1JW4A 3BFUA 4R2BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VLUA 3IFCA 3PMXA 1MXXA 3LBSA 3U72A 4OETA 3C36A 2I3VA 3C9HA 3GYYA 2XXUA 5LOMA 1JW1A 2VD2A 2O7UA 4GD5A 3G3IA 4NEDA 3OSRA 2F6GA 1Y3PA 4NF6B 3UN6A 3UIFA 1O63A 3Q25A 2F8DA 1CE2A 4IO5A 3KOTA 3VXBA 3VV5A 2CEYA 2I58A 1MQDA 3KEIA 3R26A 4ZEIA 3PUXE 2A5SA 4U2RA 1DPEA 1DSNA 5JEIA 2QPQA 4JBZA 3OOAA 4BDQA 3K0VA 2F36A 2O6AA 3FVGA 5DT6A 4DZ1A 1NV4A 3H03A 2CZKA 1AH5A 5I5PA 4QSDA 5ELVA 4NN3A 2ZZVA 1ELJA 3SEUA 4ELQA 4U22A 3IR1A 5I2KA 4N13A 3VVDA 1LBWA 4PBHA 1LBXA 1PDAA 1SI0A 5AA1A 4PE5B 4N6PA 2O1MA 3D4GA 4I8CA 2DVZA 2A5TA 1SPIA 1OVBA 4P1LA 4PTKA 4PP0A 1ANFA 2P3NA 5I59A 4DXCA 1JQFA 4KD5A 4YKPA 1FPEA 2ZZWA 3OO7A 4R75A 1Y3QA 2QMWA 1OMPA 3IO4A 5B7DA 3QSLA 2PCRA 3PPNA 1AL3A 2HZKA 4PQJA 3N94A 4PF6A 3B6QA 4LQ5A 4DIGA 3RTWB 4GFRA 1B3FA 1WODA 3KG2A 1B5HA 3TKDA 4OVSA 2QVRA 2I0BA 5I58A 5AA2A 1YYZA 5FTIA 4G61A 1N3WA 2RCAA 4YU0A 2B65A 1M5FA 5M2VA 4I9DA 3OEKA 2O7IA 1EYIA 2I0CA 4AS5A 1PC3A 5FBPA 1I6QA 2HXRA 4G8MA 4OANA 2O84X 5DEXA 4X9TA 1FQEA 4P9KA 1N7WA 1B4HA 3CI8A 3K2DA 4Z7EA 2F35A 4AS4A 4KQPA 2PYYA 4OFLA 5ISUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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