3IJOB

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, althiazide
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ijoB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ijoB02
4GOTA 5CMKA 5H8FA 3OO8A 1OQHA 2V84A 3M3KA 3FIRA 1URSA 1MQDA 2XX7A 2H5YA 4LZ5A 3K6XA 3QYTA 1VFDA 2R6GE 2ZYNA 3K6WA 1R9QA 4F39A 1Q35A 4G8HA 5I58B 1GVCA 3K0VA 3FXUA 2B65A 5KCJA 4RPNA 1EZOA 4EXKA 2OJTA 2XXQA 4GL8A 1YPNA 2PMSA 4FE8A 1Y3NA 1IXHA 4JWOA 2ZYOA 4OETA 5B7DA 4ZEFA 4DLDA 2VGQA 4F3SA 2QMXA 4NF6B 2DVZA 4F2OA 1SYHA 2Y7IA 2VD2A 1Z7NE 3TAJA 3KG2A 3R6UA 4BDOA 2DWAA 4RYAA 1SI1A 3SETA 2QS1A 4K3FA 4F3PA 2OWTA 1UIVA 3MC2A 4ESXA 3TCFA 3TFLA 3O6HA 3FJGA 3JYRA 4U2RA 2LAOA 3RQTA 2HZLA 3MPKA 1B3LA 2OZZA 3LR1A 1FQAA 3PD9A 4HS7A 1VSOA 2XXPA 5F7VA 5CMBA 3FVGA 1M5BA 4JSOA 4H1XA 2FA7A 4EXLA 4ELOA 3KOTA 4KI0E 3FZVA 3M3FA 4QHQA 4U22A 3G3FA 4YU0A 3T9HB 1MY4A 2Z8EA 4BDRA 2FYIA 3OEMA 3IOUA 3F11A 4NWDA 3MP1A 5HM4B 1LSTA 1NNKA 2ANJA 1T0KA 5AA4A 3SEWA 5AE4A 4DXUA 1MQIA 1N7WA 1DTGA 4G68A 1IXGA 3B7DA 3QUJA 3EQ1A 2UYFA 3SEVA 2CZLA 2Z22A 2REJA 4JWYA 1FQFA 4R2FA 1B6HA 4QFPA 4AB5A 2ZXTA 3H6WA 1IXIA 4F18A 3H06B 5TU0A 1B5HA 2GFEA 4Q5TA 4ZZEA 5CMCA 2Q89A 3KN7A 3JV9A 1I69A 2HXWA 3FD3A 1PBPA 3IB1A 4MF3A 2NXOA 1B5JA 4FEDA 2RC9A 4G68C 2RC8A 3VLVA 4ELPA 3ILTB 4NF4B 4BDLA 4LP2B 2DOJA 2DQVA 3I5OA 5I2NB 4N6PA 4GFRA 1FW0A 2DSFA 1BKAA 4TOZA 3OENA 3PUXE 3ODBA 3THIA 3KFMA 2O51A 4ZE8A 4U4SA 3N26A 1IIWA 4MBPA 4JBZA 4ZDMA 3DP4A 2QS3A 5IKBA 1FQEA 2XXTA 5DEXA 4GIZA 3O2AA 4BDMA 3SEUA 4NMYA 2WKYA 4U1ZA 4LONB 4EDPA 1PEBA 1ZIUA 3E13X 1NH8A 4BDNA 3IAZA 4GXAA 1MRPA 1AOVA 3TELA 3E3KA 3CFXA 4F3BA 3CFZA 5I57A 1P1WA 3K1PA 4L17A 5HPQA 4LQ5A 4I9DA 1I6AA 3WAEA 1MPBA 1KWHA 3FATA 3VV5A 3MZ9A 2F7AA 5KZTA 4YKJA 5ISUA 3FVNA 4EF1A 3BFTA 2KLFA 3IOTA 1OLCA 1LBBA 1A54A 1SYIA 3BFUA 1N0TA 3RUMA 4AB6A 3PPNA 1MY2A 1LBCA 3C9HA 1Y1MA 4IY5A 3LSWA 4IO4A 4I62A 2GHAA 2H9BA 1URGA 3LSLA 3DM0A 2OCUA 3OMBA 1MPCA 3OELA 5I2NA 3CFLA 2O84X 4OYVA 4YKIA 1JW5A 2I49A 5H8QB 3N5LA 1EH3A 1OIBA 2F8DA 3IO4A 2Z23A 1PB9A 1EU8A 5TP9B 4PE5B 1II5A 1Z7ME 1DSNA 3G3HA 1MXXA 2UVIA 5K2XA 1B3GA 2I4BA 2F78A 4JXIA 2AL4A 3TUSA 1NH7A 2XX8A 3KN3A 3VVDA 4LZ8A 2Y7WA 4YB6A 1OLAA 4ZE9A 2Q88A 3UGWA 1MXZA 2V3TA 4IO5A 2H99A 4N07A 3RN8A 1US5A 2F35A 1YCJA 1A8FA 1GR2A 1IQ7A 4JSDA 1H44A 1SW5A 3QAXA 4F31B 4IGRA 2F5XA 4C1TA 1ZJLA 4I8CA 2REGA 1Y3QA 4O3BA 5H8FB 5LOMA 4H5GA 3DLNA 1TXFA 3IORA 3MJNA 3D4GA 2PX1A 4EQBA 4WXJA 4BDQA 3UN6A 3RT6B 1QVSA 2HZKA 2RINA 3C32A 5FHMA 2O69A 1F9BA 3PMVA 4RXLA 1IZ1A 3OOAA 1R1NA 2UVGA 2I3WA 3T9XB 3UK4A 2YPNA 5KCJB 3GZGA 1A8EA 2AYSA 4OEUA 3S9MC 1MXWA 3UA8A 4IGTA 3HV1A 3QXMA 3HHGA 4KYSA 4QFLA 5I59A 2RCAA 2X7PA 1VFEA 4WKMA 4LQ2A 2VP1A 4NEDA 1SQYA 2DXRA 1EZ9A 4AQ4A 3KSJA 4GVOA 3QSLA 2ZNSA 2IA4A 5L9SA 5CBRA 4WEDA 2GRVA 1NNPA 3IX1A 4ZEDA 1FTLA 3EN3A 2OBGA 1JVYA 4PQJA 1UIUA 1B7ZA 3T96B 4O3AA 1USYH 2YLNA 4XKPA 2PT1A 4GLIA 3PMWA 4PETA 1IXCA 4ND9A 4EUOA 1DPEA 2QRYA 4NTLA 1LB8A 3EHTA 1LFIA 2RC7A 3G3GA 1B3EA 5AA4B 4X1BA 3O6GA 2I48A 5CC2A 3IB2A 1FTKA 3MP8A 3KN8A 2O1MA 3MZBA 4G68B 1DOTA 2HEUA 5FTHA 1TFDA 4M1VA 3HO7A 5ITPA 4LATA 4F1YA 1TT1A 3QK6A 4H0WA 2ONRA 1ZMGA 2UVJA 2XXRA 3FXQA 1O63A 2F34A 2XXVA 3U94A 1TWYA 2W7YA 4QSEA 4GF8A 2NWJA 5I2KA 2QJEA 3LBSA 1RYXA 2XXWA 3PUYE 3RTFB 2R9JA 1P1NA 3T66A 3S4UA 1B5IA 1LAXA 2H25A 1N3XA 4IB2A 3PV0E 1FQDA 4E0XA 1D4NA 1QUKA 1A55A 4X48A 2Y7KA 4GL0A 2PVUA 3KBRA 1H76A 4MH5A 1S50A 3GXAA 1XOCA 4U4XA 2XXYA 3K1MA 1CB6A 1EZPA 4X9TA 5J1DA 4F22A 5TPAA 1B7HA 2AIXA 1P1UA 2DE3A 3IJXB 4F3GA 4U21A 2I6EA 1YTVA 1FCKA 5DTBA 2HQ0A 1MM7A 5DEXB 2RF1A 3ZSFA 2ALUA 4QSDA 1LB9A 2Z8DA 1LGBC 1WODA 3QUFA 2O6AA 3V83A 4KD5A 4OZ9A 5H8SA 5A5XA 1LFHA 3QIMA 3VLWA 1SW2A 3ZKKA 3LUYA 3IB0A 3VDFA 4FORA 4YKPA 4ELQA 2I0CA 5I57B 2ZMBA 1Y4CA 3T9VA 5ICQA 3OSRA 4RY1A 5EYFA 4RJZA 4KYDA 1B51A 1Y1ZA 3EHSA 2QSXA 1MY1A 2XX9A 4F29A 3FUZA 5CBSA 3W15C 1JNFA 2A5SA 4GQOA 3ECRA 1PB8A 4WEPA 4NF5A 3PD8A 4JWXA 4R2BA 5DYHA 1B40A 5HBCA 1M5EA 4KQPA 2NOOA 5CMMA 1XHYA 2RCBA 3O9PA 2V25A 3MUQA 3C31A 5H8NA 3DELB 3K4UA 1SVXB 4XTCQ 3TDJA 1NNFA 1AMFA 4O3CA 1FTOA 4EQ7A 3K00A 4XKNA 3KOSA 3PUWE 4HCWA 3C4MA 3O66A 1H3DA 1XVXA 2ZYKA 1BLFA 4TLLB 2HCAA 5FTIA 3CVGA 5AA2D 2H98A 2F6GA 5AA2A 1LCTA 3KEIA 3Q28A 1B0LA 3FJMA 4FJPA 1BIYA 1MXUA 3VFJA 3G3IA 1PB7A 5I84A 3HN0A 2ONSA 2XD2A 1D9VA 3TTMA 5L8DA 3K02A 1POTA 1MQHA 2P1SA 1UTBA 2B3FA 1N3WA 3OO7A 2GH9A 3RY3A 3FV1A 4UA8A 4XKRA 4Z7EA 1QKAA 2IEEA 1Q1KA 2HAUA 4P0IA 2XXIA 5DVFA 2BJJX 3CRBA 3G3JA 1MDP1 2I58A 1ZU0A 3UORA 3RTWB 4POWA 3V5AA 1XS5A 2DWJA 3FXRA 5I59B 3GBAA 3H6VA 3T22A 2Y7RA 4R72A 1N7XA 2O7UA 3O6IA 1A7LA 2Q2AA 5IAIA 4OMBA 4F19A 1NFTA 3OD7A 2XXXA 2VHAA 4IY6A 1XT8A 1QUJA 4UACA 5CRYA 3I6VA 3W9VA 3EPEA 4LZ7A 2QL3A 4Q0CA 4IO7A 4FECA 2GHBA 2I3VA 1HSJA 1OVTA 3PPPA 4ECFA 5B70A 5JTYA 3KGCA 4R9GA 3IOVA 1MXYA 3G7WA 2ONKE 3ILUB 2NUVA 4R73A 5F1QA 4F1UA 1ZTYA 2DWHA 2I0BA 3TCHA 3D4CA 3OO6A 5DT6A 5DVIA 4Z0IA 4FAJA 3MVYA 2QS4A 1MG1A 3USDA 3LSFB 3PPRA 1RKMA 4G8NA 3TCGA 3TQLA 2OK2A 3U8QA 1P1OA 5CM6A 4QSCA 3TODA 3T93B 3VVFA 4IO2A 3V89B 4QF9A 4ZEIA 5I56A 3PU5A 2PT2A 2O68A 3IL1B 3TTNA 4OXVA 5I2KB 5ITOA 4HW8A 1SD3A 4R6HA 3H3GA 1XVYA 1NL5A 3SDFA 1ZBMA 5AA3A 3W9WA 4LUBA 2H4IA 1HSLA 3TTLA 3G3KA 4H8JA 1CE2A 3MWBA 3O28A 1H45A 2R71A 3H6UA 1M5FA 5EHMA 3I3VA 4ESWA 2O7IA 4PFTA 1GV8A 4IO3A 4XKQA 3FVKA 3BBRA 2XXHA 5KDTA 4YAHX 4C1UA 5TPAB 3A09A 2O1LA 1HSEA 1NNTA 1R6ZA 3B6QA 4P11A 3T9UA 1MQGA 5JK4A 1B58A 3MVXA 1RYOA 4MLQA 3EHUA 4I1DA 4Q30B 3PPQA 2DYXA 4FATA 3RGYA 4NF8A 3A3CA 1MDQA 4ZZAA 1B7UA 4GXSB 4OHNA 3IO6A 1UTHA 5A5XB 4XIGQ 1S9TA 1B1XA 1B0HA 3IR1A 1I6QA 4U1OA 3L6GA 1LAGE 4ONYA 4BLAA 3PGFA 3PPOA 4PFYA 2PYYA 4H5FA 1ZLQA 4OTEA 3E4RA 3N6UA 4KHZE 4M4GA 1R9LA 3EF7A 2Z8FA 3HPIA 1QKBA 3FVOA 4OQOA 1B2HA 3Q25A 2F7CA 1QW0A 2F97A 1LLSA 2FNCA 4KPTA 3KZGA 3HHFA 4YB7A 3CSGA 1P99A 1PBQA 3TYHA 3KJTA 4KCDA 1SW4A 1IUDA 3MQ9A 4DDDA 4NF5B 1JEVA 1FTMA 1B3FA 3PMXA 3Q26A 1JW4A 1YAEA 1USYE 5BUUA 5EHSA 2DXYA 2DVCA 3IK6B 1MQJA 3CSBA 1B52A 4R9FA 3SEXA 1DMBA 1OQGA 2F36A 4H67A 2Y84A 1I6BA 1B3HA 2Q9TA 3ZS6A 3Q27A 2VD3A 5H8NB 4NWCA 3R26A 1VE4A 2E1SA 2ZNTA 3U93A 3MW0A 3MZ1A 3TTKA 3OEKA 3C34A 2XHDA 3GLBA 2V93A 2A5TA 2P2AA 4N13A 3O29A 2V3QA 4GWOA 4KFQA 3MPLA 3C36A 3TMGA 4ZEKA 2QMWA 1N76A 4ELRA 1B4HA 5AA2B 1N04A 4DXCA 3RPWA 3U92A 4OWDA 4KCCA 4RNSA 5L9MA 3S9LC 1N84A 2P0SA 2ABHA 2NVUB 4HCYA 3AXFA 1P1QA 3VE1B 1D3KA 4F2QA 3K01A 4P0GA 2XXUA 3FJ7A 1UTBB 3K6UA 3BKIB 4DCYA 3H03A 3MVWA 2G93A 1O64A 2DWIA 4OERA 4PFUA 3KSXA 3K6VA 5I58A 4ZS9A 1ATGA 1AIVA 3WAFA 4PP0A 1SI0A 3KJ7A 5CI5A 1JEUA 4R6YA 1PDAA 1FQBA 5M2VA 4MLVA 1MXVA 3OSQA 1VR5A 1A99A 2G29A 1ZKBA 4LVQA 3PUZE 4OVJA 4NF6A 1QULA 3RLFE 4G4PA 4KYEA 2ZYMA 3M3LA 3RT8A 2RKMA 1M5CA 3SEYA 5BWJA 1IITA 1J1NA 1B32A 1B9JA 3H7MA 5DVJA 4H8IA 2PBWA 3B6WA 4R6KA 4DE8A 3HSTA 1OMPA 1Y20A 3A3UA 3FGSA 3DP6A 1GGGA 1MY0A 4YICA 1MH4A 4KR5A 2OLBA 4QFKA 3JZJA 3GBBA 1LCFA 2THIA 3MVZA 5JTYB 3U1OA 2B3BA 1Y4TA 3LC8A 2D3IA 3UIFA 1M5DA 1AH5A 1DTZA 4XXUA 1TFAA 4GD5A 2ESNA 2HAVA 1XC1A 3MBPA 1POY1 4RK9A 2AL5A 2UVHA 1MS7A 3H6TA 1QJMA 3TEPA 3O97A 1L5TA 4OEVA 3FV2A 4ZECA 3HCQA 2D21A 4MFIA 1SDXA 2DS9A 4DCXA 5L9OA 5FHNA 3SESA 3RNNA 5I56B 3MAMA 4NE4A 1SBPA 1PC3A 2Q2CA 1LAFE 3P7IA 3TPAA 3C33A 2ZNUA 4GRKA 4DZ1A 4ISUA 4NF4A 4RPOA 2XD3A 3ZKLA 3K2DA 4POXA 4EF2A 5JEIA 1FQCA 3OO9A 5H8HB 1H43A 3R7XA 2D5WA 1MY3A 4G8MA 1Y3PA 4JB7A 5KDTB 1ANFA 1LAHE 1B05A 1SW1A 3S9NC 2F7BA 3TQWA 3L6HA 4OESA 4U23A 1NMUA 2M8CA 5K2YA 4FEBA 4OENA 4X1DA 3TKDA 3UP9A 2Y7PA 4NF8B 1MH3A 5AA1A 4YMBA 4THIA 4HTGA 5ICTA 3IOWA 1B4ZA 3S2VA 3N6TA 1UTHB 1URDA 4OFJA 1UQWA 1US4A 1OVBA 4RK2A 2QPQA 1DPPA 2V3UA 3N94A 2F6PA 1B46A 4H65A 2UYEA 3CG3A 3C35A 3V8XB 1NKXA 2Q8JA 2YJPA 3E9XA 4OFLA 1JVXA 1JQFA 1WDNA 2UXAA 2QS2A 2DE2A 3CIJA 4C0RA 4QFNA 4FIMA 1FTJA 2E0SA 4H6DA 4RA1A 2OWSA 3Q29A 4LA9A 2CMOA 5ELVA 4OFOA 3B6TA 3TTRA 4IO6A 2X26A 3OXNA 3SERA 4QFOA 3S9EA 3PUVE 1O7TA 1IEJA 3VLUA 3ONMA 1BTJA 3CI8A 4TLMB 4YZZA 1LFGA 1WVJA 5H8HA 3MP6A 5H8QA 4JDFA 2DP8A 2DE4A 3DP8A 4ZEBA 4YKKA 5FHOA 4TQUQ 3CG1A 1S7YA 3M8UA 5TP9A 3FASA 4R75A 4DIGA 4F1VA 4YB5A 1JW1A 1B1HA 2A5TB 1MPDA 3IJOB 4G77A 2I4CA 1GTKA 3VVEA 4E0WA 1A40A 3H4ZA 1D9YA 4YMAA 3TZAA 1AL3A 1MM6A 4QRZA 3VXCA 3VXBA 1Y9UA 1QUIA 2X7QA 1BP5A 3LSXA 1JETA 1ELJA 3CR9A 3U72A 4EQ9A 4PFWA 3K1NA 2VOZA 2HFBA 3SKPA 4G2ZA 4Q8RA 4R74A 4DXBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GOTA 5CMKA 5H8FA 4GX4A 3OO8A 4MNIA 1OQHA 2V84A 3M3KA 3RPLB 3FIRA 1URSA 1FPGA 1MQDA 2XX7A 3MYUA 2H5YA 4LZ5A 3K6XA 3QYTA 1VFDA 2R6GE 2ZYNA 3K6WA 1R9QA 5F24A 4F39A 1Q35A 4PC9A 4G8HA 4PFIA 5I58B 1FPJA 1GVCA 1D9QA 3K0VA 3FXUA 2B65A 5KCJA 4RPNA 1EZOA 1FSAA 4EXKA 2FHYA 2OJTA 2XXQA 4GL8A 1YPNA 2PMSA 4FE8A 1EYKA 1Y3NA 1IXHA 1FBDA 4JWOA 2ZYOA 4OETA 5B7DA 4ZEFA 4DLDA 2HXRA 2VGQA 4F3SA 2QMXA 4NF6B 2DVZA 4F2OA 1SYHA 2Y7IA 4AS5A 2VD2A 1Z7NE 3TAJA 3KG2A 3R6UA 4BDOA 2Y5LA 2DWAA 4RYAA 1SI1A 3SETA 2QS1A 4N6DA 4K3FA 4F3PA 2OWTA 1UIVA 3MC2A 4ESXA 1AWBA 3TCFA 3TFLA 3O6HA 1NV0A 3FJGA 3B8BA 3JYRA 4U2RA 2LAOA 3RQTA 2HZLA 3MPKA 1B3LA 2OZZA 3LR1A 1FQAA 3PD9A 4HS7A 1RDYA 1VSOA 2XXPA 5F7VA 5CMBA 3FVGA 1M5BA 4JSOA 4H1XA 2FA7A 4EXLA 4ELOA 3KOTA 4KI0E 3FZVA 3M3FA 1FBHA 4QHQA 4U22A 3G3FA 4YU0A 3T9HB 1MY4A 2Z8EA 4JVCA 4HE2A 4BDRA 2FYIA 3OEMA 3IOUA 3F11A 4NWDA 3MP1A 3E78A 5HM4B 1LSTA 1NNKA 1LEVA 3NOHA 2ANJA 4FBPA 1T0KA 5AA4A 3SEWA 4PDDA 5AE4A 4DXUA 1MQIA 1N7WA 3E79A 1DTGA 4O94A 4G68A 4LN5A 1IXGA 3B7DA 3QMFA 4I3YA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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