3IK6B

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, chlorothiazide
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ik6B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ik6B02
2XXRA 4KQPA 4Q8RA 2REJA 2HZKA 3QUFA 3TMGA 4ZECA 3GBAA 2DWIA 4JSDA 3OELA 5FHNA 4LP2B 4ISUA 2RCBA 2DWJA 2RINA 4O3BA 4XKNA 4WEPA 2I0CA 1LAXA 1P1NA 1BLFA 2Q2AA 4FJPA 2NUVA 1PB8A 3VLUA 3MAMA 1BTJA 1FTKA 1OVTA 4IGRA 4KFQA 3VXBA 3A3CA 1Y1ZA 3W15C 2F6GA 1FTMA 2RCAA 1S50A 3CFXA 4U23A 4R75A 2I3VA 2PYYA 1M5CA 2DP8A 4YKIA 3C9HA 1MY0A 2DXYA 2AYSA 1M5FA 1LFIA 3K1MA 3H6WA 3MP6A 3UP9A 1P1QA 5A5XB 4FEBA 4G77A 3USDA 1JEUA 1P99A 2HCAA 4ZEKA 2NWJA 2XXPA 1DSNA 1JQFA 1FTJA 3M3FA 4U22A 3A09A 3FJGA 3CSGA 1B9JA 1LB8A 2ZYOA 2UYFA 2H4IA 2HAUA 3KJ7A 1A40A 1B3FA 2D3IA 5I84A 1RKMA 1Y20A 3ILUB 1O7TA 3IB2A 3BFUA 4JB7A 3V83A 3G3KA 3ONMA 5EHMA 1TFDA 3PUXE 3IOTA 4ND9A 5B70A 3I6VA 4BDNA 1I6AA 3KGCA 1BKAA 4IY6A 2X7QA 3LSWA 2ZYNA 3OO8A 5J1DA 3MVZA 4ZE8A 2XXVA 3DP4A 2FA7A 4ZEFA 4GQOA 1R6ZA 3ZS6A 4NF4B 1VR5A 3EPEA 3G3JA 4QFNA 1IUDA 1GGGA 4G8NA 2V25A 4KYSA 2O1LA 3OO9A 1SYHA 1PB9A 4U21A 3T9UA 1OMPA 3IOWA 3C33A 3QXMA 1OLAA 3RTWB 3SDFA 3E13X 2B3FA 1LCTA 1Y3NA 3Q27A 4IO2A 1EZ9A 3C32A 4EDPA 2Y7RA 3AXFA 4BLAA 5AA3A 1NH7A 1IIWA 4EXLA 1M5EA 1QUKA 3KN7A 4F19A 1DMBA 5JTYB 1RYXA 4QSDA 3R7XA 3IB0A 1R9LA 4KR5A 3M3LA 5BWJA 1BP5A 3U8QA 1BIYA 3QAXA 1MG1A 5I57A 1MH4A 1WODA 2QS2A 3BBRA 4IGTA 2LAOA 4F18A 4NF5A 3C35A 3H7MA 4QFOA 4F3GA 4KPTA 4LUBA 4HCWA 1XHYA 5M2VA 4KHZE 4NEDA 2VD2A 2VP1A 4F2OA 2G93A 3SEUA 1ZTYA 4GWOA 5LOMA 1YTVA 2CMOA 5KCJA 1FQEA 3MPKA 1DPEA 4U2RA 4F39A 4YB7A 4LZ8A 4KD5A 2ZMBA 3LSXA 1A55A 1Y4TA 4UA8A 5DVIA 4U1OA 5L9OA 2AIXA 5AA4B 1J1NA 4R9GA 3PUZE 3ZKKA 1FCKA 1TWYA 2ZNSA 4XIGQ 2VD3A 1RYOA 3JZJA 4RK2A 2I4BA 5I57B 3MJNA 2XD3A 1OQGA 1POTA 2UVIA 1ZJLA 4WXJA 4X1BA 1N0TA 3MC2A 4NF8A 2Q2CA 2H99A 2RKMA 3K6UA 3OO7A 3RT6B 3IK6B 3VV5A 2DWAA 3IB1A 3SEYA 1YPNA 4TLLB 2D21A 2DE2A 2E1SA 3CVGA 1SI0A 3C31A 2XX8A 1PEBA 2ZYKA 1FW0A 4OQOA 3MP8A 4NWDA 2V84A 4LZ5A 5ICTA 1PBQA 3TTMA 4EXKA 3S9NC 2Z8EA 3VXCA 3O97A 1B46A 2UYEA 3Q26A 2RF1A 4ZEDA 2GH9A 4N6PA 2BJJX 1EZPA 4LATA 1B05A 1LSTA 2YLNA 4IO3A 4F3PA 1A7LA 5FTHA 1D9VA 3MP1A 4NF8B 3O6GA 2PVUA 1AH5A 1IQ7A 1JVYA 3PUVE 3T96B 4ZZAA 2B65A 5ITPA 3PD8A 3JV9A 2GRVA 4C1TA 4OXVA 4RPNA 4FATA 1IXCA 5DYHA 5L9SA 3S4UA 4O3CA 3CSBA 4ONYA 3CFZA 4I1DA 3W9WA 2XHDA 3FXUA 1ZIUA 3D4CA 3K4UA 3KOSA 1OIBA 4DCYA 4ELPA 1MDP1 2Z8FA 3OO6A 4MFIA 3FVOA 4C0RA 1P1OA 1D4NA 4YAHX 4BDOA 3E9XA 4X1DA 1MPDA 4JWYA 3SKPA 1B7ZA 5HM4B 1O64A 3PMVA 2O6AA 3CI8A 2F7AA 1B58A 4PFTA 3U93A 1JW1A 4YMAA 4TLMB 4JWOA 1AL3A 5CRYA 4OFJA 1UIUA 5KZTA 3SEVA 3Q25A 2R6GE 3KSXA 4RY1A 3OXNA 5HBCA 4R6YA 3U72A 3TQLA 3HPIA 1TT1A 1ELJA 3K6XA 4ELQA 4LA9A 4AQ4A 2HXWA 3H6UA 3IR1A 2O68A 4GVOA 4I8CA 4G68C 3PUWE 1DTGA 4JXIA 4U4XA 1QUIA 1LGBC 4OZ9A 4R2BA 1IXIA 3H6VA 1B3GA 2GHAA 5I58B 4MBPA 3KOTA 4E0XA 1LB9A 4ZDMA 2B3BA 4YB6A 4RA1A 5AA1A 3PD9A 1MXUA 5DVJA 4YU0A 3UORA 2CZLA 4GF8A 5ICQA 3N6TA 4DCXA 2M8CA 3FGSA 3VVFA 4LZ7A 5HPQA 4AB5A 1MXVA 3IOVA 2QL3A 3HHFA 5EHSA 4H0WA 3RN8A 2W7YA 2DSFA 5AA2A 1IITA 5CMKA 3VDFA 4G68A 3THIA 2Y84A 2F97A 2QPQA 1DPPA 2R71A 4F22A 3G3GA 2XXIA 3MVXA 3TELA 4N07A 5H8FA 4R2FA 3BKIB 4MLVA 3GXAA 4KCCA 4OVJA 4YZZA 3KZGA 4OEVA 1XT8A 1R9QA 3RGYA 2NOOA 3CG3A 2WKYA 4FIMA 1D9YA 3QYTA 5H8SA 3LBSA 2H5YA 4PFWA 4KYEA 1ZBMA 1IXHA 3ZKLA 3CG1A 5I2KA 4HW8A 4YB5A 1DOTA 2Y7IA 4DIGA 1NNTA 4KI0E 3TTLA 3FIRA 1LAFE 3OENA 4GL8A 4OETA 1IZ1A 5AA2B 2RC9A 5CMMA 2YJPA 3K1PA 1FQDA 2ABHA 2OWTA 2R9JA 3DM0A 2D5WA 3KBRA 4G2ZA 1LAHE 1B7HA 3E3KA 4IO6A 4DXUA 1NNFA 2IA4A 3N26A 2F35A 4POWA 3OSRA 1I6QA 5CBSA 5KDTA 5L8DA 4H8JA 1Y4CA 1NFTA 3VVDA 1B3LA 2VGQA 3V5AA 1IEJA 3FUZA 3TTNA 3TZAA 3PV0E 1PB7A 3IO4A 5I2NA 2THIA 3EHTA 1ZMGA 2Q89A 4OWDA 3T22A 3BFTA 1ANFA 2A5TA 1ZLQA 4QRZA 1FQFA 4ESWA 3LUYA 4QSCA 1QULA 2XXUA 1MQHA 1B5IA 3SESA 3DP8A 1JVXA 3IL1B 3T9VA 5ISUA 1POY1 3TFLA 1UTBA 2Z23A 4ZEIA 3QSLA 4ZEBA 1B4ZA 2DE4A 1MDQA 3FVGA 1CE2A 5TU0A 1FQBA 1MRPA 4U4SA 3TQWA 1TFAA 4GLIA 3RPWA 2I3WA 4QFPA 3U1OA 3O66A 1JW5A 1MQJA 1XS5A 2DVCA 3TUSA 4GD5A 3LSLA 5B7DA 3PUYE 3MZ1A 3EHSA 1Z7ME 2GFEA 3HSTA 1WVJA 5BUUA 2ALUA 3O28A 1T0KA 4FEDA 5I2NB 2DWHA 1PBPA 3CFLA 4IY5A 3VE1B 2OZZA 4X9TA 4LONB 4QFKA 2X7PA 4DZ1A 1MM6A 4THIA 1GVCA 1LBCA 2KLFA 2ESNA 1M5BA 3FVKA 1MY4A 3K1NA 1Q35A 3T93B 1LFHA 5I59A 1EZOA 1B1XA 4EQBA 5EYFA 1M5DA 4NE4A 1UTBB 3Q28A 3TTKA 1B5HA 4OEUA 3SEXA 4OTEA 1MQIA 2UXAA 4YICA 3S9LC 2V3UA 2NXOA 1USYH 3KN8A 1CB6A 4N13A 1US5A 1YAEA 2OLBA 3N94A 4MLQA 3TPAA 2OK2A 1QW0A 2XXQA 3MQ9A 4FAJA 3GZGA 3EQ1A 4NF5B 2YPNA 4X48A 1SW1A 4GRKA 4GXSB 2REGA 3MBPA 3QK6A 5H8QA 2UVHA 5F7VA 5AE4A 4I9DA 4G8HA 3FATA 1YCJA 2XXYA 1N7XA 4JWXA 1HSJA 2NVUB 2I49A 4LVQA 4P11A 1B3HA 3SEWA 5KCJB 5F1QA 3RUMA 5H8HA 2V3TA 2XXWA 2Y7PA 4XXUA 3T9HB 1NNPA 1I69A 1S7YA 2F34A 3PU5A 5I59B 2VHAA 3TYHA 3K2DA 1MH3A 4R9FA 2O7IA 3MZBA 4RPOA 3PMXA 3KSJA 3GBBA 4QFLA 1QJMA 3KFMA 3T9XB 4Z7EA 1XOCA 1AIVA 1Y3QA 1SVXB 3UN6A 2QS4A 3UK4A 3T66A 3PPOA 2F36A 3D4GA 4BDQA 3UGWA 3VVEA 2ONSA 1SYIA 3PPNA 4EQ9A 5H8NA 1QKBA 4R72A 4OERA 3IO6A 4MH5A 2OWSA 4U1ZA 4HCYA 3IAZA 1MS7A 2O51A 2H25A 3DELB 1P1WA 3K02A 4NTLA 5TPAA 3TKDA 4PFUA 1SW2A 3TTRA 3MVYA 1II5A 4OFOA 3QIMA 2ZNUA 2DXRA 3B7DA 2DVZA 4GIZA 2X26A 1URGA 2I0BA 1QUJA 4ELRA 1GV8A 2HFBA 1JEVA 2O1MA 2PMSA 1F9BA 1OLCA 4F1VA 4ESXA 3C34A 4PFYA 4O3AA 1SDXA 5K2XA 3O9PA 4PE5B 2DOJA 2ZNTA 3H6TA 1B5JA 4Q5TA 3F11A 5H8NB 3MWBA 2O69A 2FNCA 3WAFA 1MPBA 2PT2A 1H43A 1XVXA 3RY3A 2ANJA 3N6UA 3H03A 5CMCA 3HHGA 3CIJA 3RNNA 3O29A 1H44A 1Y1MA 2F6PA 4EUOA 1SW5A 4DE8A 3JYRA 1GTKA 2Q8JA 4OFLA 4TQUQ 4F31B 3IORA 4GXAA 3OSQA 3IJOB 4LQ2A 1B3EA 5A5XA 2QS3A 5IKBA 2Y7WA 3ODBA 1H76A 4POXA 2IEEA 2DS9A 3CR9A 3FV2A 3FVNA 4FORA 4OHNA 4JDFA 3C4MA 3IJXB 3O6HA 3RLFE 2FYIA 1R1NA 3R26A 1D3KA 5I56A 4JBZA 2DE3A 4E0WA 5FTIA 4EF1A 1QVSA 2OJTA 4F1YA 2AL5A 4GOTA 1VFEA 3A3UA 5ITOA 5AA2D 5L9MA 1MY1A 1WDNA 4RNSA 1EH3A 1B40A 1FQCA 3MUQA 2I58A 2F8DA 3I3VA 4TOZA 1MPCA 2QSXA 1SD3A 3PPRA 4F29A 2RC7A 1B32A 3SERA 3OEKA 3K6VA 1USYE 4H65A 4KYDA 3P7IA 2QMXA 1SI1A 1A8EA 1I6BA 4NF4A 1FTOA 5JEIA 3H06B 2F7BA 3IX1A 1B1HA 3V89B 4YKPA 2VOZA 2HAVA 3FJ7A 2QRYA 5CBRA 5I56B 3N5LA 4R6HA 3U92A 2F5XA 2UVJA 1SW4A 4OENA 1LAGE 2RC8A 3L6HA 4G68B 3PMWA 2XX7A 1JNFA 2H9BA 1PDAA 3B6WA 2ZYMA 2HZLA 3PPPA 1N3WA 5IAIA 4R73A 1DTZA 2A5SA 4DXBA 5FHMA 5JTYA 5H8FB 4QF9A 3ECRA 1MXZA 3HN0A 2XX9A 4L17A 3V8XB 5K2YA 4H8IA 1OVBA 4PQJA 3B6QA 2PBWA 3S9MC 3CRBA 1NMUA 3FXQA 1A8FA 1B7UA 3LSFB 3KN3A 2I48A 1Y9UA 5DVFA 3K0VA 4G8MA 5I2KB 3W9VA 4FECA 1UTHA 3IOUA 4Q0CA 4IO4A 3Q29A 1O63A 4UACA 3MW0A 2PT1A 3FV1A 2H98A 4ZS9A 5FHOA 2Q9TA 1TXFA 3R6UA 3M8UA 2QMWA 1IXGA 4OMBA 1A54A 1Q1KA 3TCHA 3DLNA 1N84A 4RK9A 2F7CA 4H1XA 1PC3A 1URSA 4MF3A 1VE4A 3TDJA 4ZE9A 3FD3A 5KDTB 3LR1A 2Q88A 4R6KA 5DEXA 3S9EA 1S9TA 3K01A 4P0GA 5AA4A 1MM7A 2OCUA 3PPQA 1H45A 3FJMA 2OBGA 1H3DA 2XD2A 3OEMA 1HSLA 1VFDA 4F1UA 4H5GA 4WKMA 3G3HA 2DYXA 1SBPA 3PGFA 4EF2A 1LLSA 2A5TB 1UTHB 1MQDA 1UQWA 4YMBA 3MZ9A 4GL0A 1B6HA 2XXXA 4I62A 4M4GA 5CMBA 3OMBA 4IB2A 2O84X 4BDMA 2P2AA 2GHBA 4LQ5A 1NL5A 2AL4A 2E0SA 1N04A 3SETA 3ILTB 5CI5A 1JW4A 1XC1A 4R74A 2XXTA 4RYAA 2I6EA 4XKPA 3HCQA 3KJTA 4Q30B 4XKRA 5ELVA 1A99A 3C36A 5JK4A 1MY3A 1N7WA 3H3GA 3MPLA 4XKQA 2HQ0A 1SQYA 3FASA 4IO7A 4HTGA 4K3FA 2P1SA 4F3SA 4FE8A 5DEXB 3DP6A 3FXRA 3RT8A 1FTLA 4DXCA 4C1UA 1LFGA 3TCGA 1KWHA 3HO7A 4JSOA 1UIVA 5TP9A 1MXYA 3S2VA 1EU8A 2V3QA 3E4RA 3K00A 5CM6A 1NKXA 4ZZEA 4RJZA 4OYVA 1MY2A 2HEUA 3KEIA 4NMYA 4NF6A 2XXHA 4DLDA 3LC8A 1MQGA 3VLWA 1AOVA 1LCFA 5DTBA 2F78A 4OESA 4KCDA 3GLBA 3K6WA 3UIFA 1MXXA 3FZVA 4IO5A 3B6TA 4YKJA 1ATGA 1B4HA 4ECFA 2PX1A 4GFRA 4QSEA 1QKAA 2QS1A 3ZSFA 4YKKA 4PETA 3TEPA 1LBBA 4XTCQ 4M1VA 1B0LA 2P0SA 1JETA 5CC2A 3EHUA 1NH8A 2Z8DA 1FQAA 1HSEA 3KG2A 2ONRA 3EF7A 2ZXTA 3O6IA 4ELOA 4F3BA 2Z22A 4BDLA 3U94A 1AMFA 5H8QB 5TP9B 3L6GA 1NNKA 4EQ7A 4NWCA 2O7UA 1GR2A 1US4A 1Z7NE 3HV1A 2ONKE 4Z0IA 3RTFB 4NF6B 1N76A 1VSOA 1ZU0A 4DDDA 3G7WA 4AB6A 5H8HB 3M3KA 1P1UA 1Y3PA 2Y7KA 2DQVA 1MXWA 3EN3A 1URDA 4RXLA 5DT6A 1L5TA 3VLVA 4F2QA 4HS7A 1N3XA 3QUJA 4H6DA 3UA8A 3OOAA 3TODA 1B51A 5I58A 1OQHA 4BDRA 1XVYA 3G3FA 3TAJA 2G29A 2QJEA 3O2AA 2UVGA 4H5FA 1B52A 4G4PA 2V93A 3I5OA 4H67A 3G3IA 4PP0A 1B2HA 3H4ZA 5TPAB 3WAEA 3MVWA 3TCFA 4WEDA 4QHQA 3VFJA 1B0HA 1ZKBA 4P0IA 3OD7A 3RQTA 2I4CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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