3IK6B

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, chlorothiazide
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ik6B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ik6B02
1LGBC 4IO7A 1ZIUA 4WEPA 5CM6A 4QFPA 4QSEA 4GF8A 3IL1B 4MF3A 1GTKA 4PP0A 1CB6A 1YCJA 1HSJA 4OTEA 3FXRA 4E0XA 1FQCA 1VE4A 1SQYA 5EHMA 1ANFA 1DPPA 3IB0A 1SW5A 1UTHB 2QPQA 3FJGA 2OLBA 4BDQA 1B4HA 5KCJA 1IXGA 2DE2A 2GFEA 1B3EA 3GLBA 4FE8A 4PFUA 4ZE9A 3DP8A 5H8HB 3MZBA 1R9LA 3TQWA 4N6PA 2LAOA 3KG2A 3O9PA 4RA1A 3FUZA 1MXXA 2V3TA 2B65A 3MBPA 3TCFA 3CG1A 1IXIA 4ND9A 4U4XA 5H8QB 4R6KA 5CMMA 4R9FA 5IKBA 2HXWA 3TELA 3RUMA 3IO6A 1XT8A 3L6HA 3IR1A 4GXAA 1XVYA 1H3DA 2HEUA 3TCHA 3ZS6A 3EHTA 1MDQA 5I57A 1PEBA 4QFKA 5B7DA 1Y1MA 3PPPA 3M3KA 2HZKA 5HM4B 5CBSA 2X26A 2E1SA 4G68B 5J1DA 2XXUA 2H5YA 3FJ7A 2DP8A 1B3GA 2ESNA 3C31A 2B3FA 1B0LA 3JZJA 3CVGA 3S9MC 1B5IA 1Y1ZA 4YMBA 4FORA 1BTJA 3QAXA 3FASA 4LP2B 4ESWA 4JDFA 2ZNTA 4ZEDA 2ANJA 3LSWA 3FVOA 4IGRA 2XXIA 4X48A 1LCTA 3VE1B 3K6WA 3KSJA 1MM6A 3TCGA 3DELB 1M5BA 5BWJA 3K2DA 2RCBA 2Y7WA 4F2QA 2HAUA 1MXVA 4JWXA 3KEIA 3T22A 1MY1A 1IITA 1N0TA 4PFWA 3K6XA 2HQ0A 3RNNA 4I9DA 3G3KA 3RTFB 4ZEIA 3DM0A 5I2KA 4DCXA 5CMCA 5B70A 5ITOA 2HZLA 2UVIA 3H6VA 1B05A 3SESA 1GVCA 1OVTA 3MP1A 5L9SA 3KFMA 2O1MA 5M2VA 3W9WA 3FIRA 3IOTA 3VVFA 1OLAA 4XTCQ 2I4BA 1AH5A 1AMFA 4NF8B 2ZNUA 4ELQA 1IXHA 4KQPA 4DXBA 4TLMB 2E0SA 1QKAA 1BIYA 2PT1A 2PVUA 2A5SA 2VD2A 1Y3NA 4UACA 3TTNA 1QUKA 3W9VA 2XX7A 4YB6A 2D5WA 1DTGA 2DVCA 3MPLA 3OO7A 4H0WA 3I6VA 3FVNA 4LUBA 5IAIA 1FQAA 2RKMA 3Q26A 3G3JA 3PPOA 3SEWA 2Z8EA 3BBRA 3DLNA 1EZPA 3A3CA 1Q1KA 3VV5A 1QUJA 4WEDA 1EH3A 2D21A 4GOTA 1JEUA 4GWOA 1SBPA 2NVUB 4R73A 1N76A 1S50A 3E9XA 3TUSA 1PBPA 4KPTA 1MQIA 1EU8A 1FTOA 1MQGA 4Q8RA 3K4UA 3GXAA 3B6TA 2QRYA 4WKMA 2F36A 5H8HA 3TODA 2OWSA 2DXYA 1US4A 3TZAA 2G93A 2NWJA 3U94A 3M8UA 4R72A 5KZTA 4IO5A 3U92A 1J1NA 1NNKA 2XXQA 3IO4A 2I0BA 2V25A 3EPEA 4MLQA 3WAEA 3T9VA 4YKPA 5I57B 1LAXA 2V3UA 2UYFA 1I6AA 1JVXA 1JNFA 4OFOA 4JSDA 3RQTA 1II5A 2H99A 4P11A 3T96B 3FATA 1MG1A 5LOMA 4G68A 4JWYA 3T9UA 3RT6B 5DVIA 3ECRA 1R6ZA 3MVWA 3OSRA 2QS4A 1I69A 1FQBA 1B7ZA 1H76A 1TXFA 1MXWA 4IO3A 3FXUA 3ONMA 2F34A 4ZDMA 1ZMGA 1USYE 3V5AA 1PDAA 4GFRA 4OQOA 4ZZAA 1USYH 2Z22A 2O6AA 4OESA 4OFJA 4IB2A 5AA3A 4JXIA 1FTLA 4NF6A 3VLVA 3TYHA 2O7IA 3UIFA 4F3SA 3M3FA 1S7YA 2OWTA 1B58A 4XXUA 5I2KB 1AIVA 2PMSA 1GV8A 2Q8JA 1UQWA 4NF5B 3T9XB 1FTMA 3LC8A 3SKPA 3D4GA 3C9HA 2Y7RA 3UGWA 2PYYA 4MFIA 2YLNA 4JSOA 2O7UA 2ALUA 3QXMA 1SYIA 1N3WA 4ESXA 3HPIA 5FHMA 1FW0A 1VFEA 5H8NB 3JV9A 4I1DA 4QFLA 3PU5A 3H6TA 2QS3A 1I6QA 3H6WA 4ISUA 4OMBA 5A5XA 3FJMA 3MVXA 3KN3A 1POY1 2Y7PA 2G29A 2REGA 3DP4A 1QVSA 2QJEA 2F6PA 4NF8A 5I84A 1QW0A 3ZKKA 3GBAA 3SEXA 5BUUA 4QFNA 1MPCA 4YAHX 3HV1A 5EHSA 4GD5A 1NNFA 3Q25A 1BKAA 2VOZA 4F29A 1D4NA 4BDRA 1Y4TA 4ZEKA 4F31B 3UP9A 4R9GA 2I49A 3EQ1A 4OERA 4OHNA 1OQHA 2IA4A 5JTYB 4GRKA 4F18A 1Z7NE 2YJPA 1CE2A 2REJA 4OEUA 1IEJA 2GH9A 3MW0A 5DYHA 4U22A 4EXLA 2H9BA 2X7QA 4R2FA 3RTWB 4YZZA 3THIA 2ZYOA 2Q89A 2ONSA 3PD9A 4NTLA 4U23A 4QF9A 3QYTA 5DVJA 2DS9A 2DYXA 1LFHA 5L8DA 3K1MA 3CSBA 3UORA 2VGQA 3LSFB 4IO4A 2UYEA 5ICQA 2P1SA 3LSLA 3Q28A 1M5DA 5I2NB 2VD3A 1SYHA 3TTRA 2ZNSA 5K2YA 1XS5A 5TPAA 4FATA 4XKQA 3I3VA 3QIMA 4YMAA 4F3GA 1VFDA 5EYFA 1LLSA 1Q35A 1PBQA 3ILUB 4XIGQ 1Y3QA 3K1NA 1ATGA 4G8NA 1UTBB 4C0RA 3SETA 3K01A 3HCQA 2ZYNA 1M5EA 3IOUA 1Y9UA 4HCYA 1JVYA 4YKJA 3KN7A 5DVFA 1A8FA 2BJJX 1JQFA 2HCAA 4G77A 3E13X 4F3PA 4MLVA 5TP9B 3MAMA 4NF6B 4YB5A 2XXPA 2XXHA 4THIA 3KZGA 4FEBA 1URDA 4IY6A 4RK2A 4ZEBA 4X9TA 1ZLQA 1EZ9A 4LZ5A 4FECA 1JW4A 4BDMA 4ELPA 1IQ7A 3C4MA 1O7TA 2I3WA 3L6GA 3TEPA 4RK9A 4R2BA 4H8IA 4X1BA 1B3FA 3E3KA 1URSA 4U4SA 3MUQA 4RPNA 4NF5A 3DP6A 1DTZA 2FA7A 3C36A 4H67A 2Z23A 5AA2B 4LZ7A 3MP8A 3MP6A 2HFBA 4L17A 3FV2A 2ONRA 4QFOA 4U21A 1URGA 5CMKA 4TQUQ 4C1UA 2DWJA 2RINA 3KBRA 3FZVA 4G68C 4U1ZA 1LFIA 4YU0A 4PETA 5H8NA 5A5XB 2GRVA 4XKRA 2AYSA 1SI0A 3O6HA 5CI5A 3OMBA 1LCFA 2V93A 3BFTA 1YAEA 2RF1A 3VLUA 3V8XB 1AOVA 1PB7A 1BLFA 4RY1A 4YKKA 2F6GA 2GHAA 3OELA 4MBPA 3LUYA 3SEYA 4DDDA 5JK4A 4EF1A 1B9JA 1XOCA 4OZ9A 2FYIA 1P1QA 1MY2A 1H45A 3IAZA 1OVBA 2YPNA 2PT2A 1M5CA 4NE4A 3FV1A 4LONB 2DE4A 1WODA 3OENA 4KCDA 2F5XA 3JYRA 2ABHA 1US5A 1MY4A 3EHUA 1S9TA 2NXOA 1A55A 2I3VA 4HS7A 2HAVA 5AA1A 4R75A 2XXTA 3ZSFA 4JBZA 1NFTA 3C32A 2QMXA 2AL5A 3IORA 4EUOA 3G7WA 3PPQA 1OMPA 2CMOA 2IEEA 4R6HA 3ODBA 1P1UA 5JTYA 1ZKBA 3MC2A 5DEXB 1A8EA 2Z8DA 5ELVA 4G8MA 2Q9TA 1DSNA 2CZLA 2PX1A 3ZKLA 3AXFA 4JWOA 1B1XA 3CR9A 3PMVA 4KR5A 3VXBA 5FHNA 5I56B 1POTA 3FVKA 4DXUA 4G8HA 2XXRA 1D3KA 5TPAB 4AQ4A 4I62A 2H98A 2FNCA 5I58B 5I2NA 1RKMA 2WKYA 3VVDA 1SW1A 3M3LA 3PPNA 3E4RA 2ZXTA 4ZS9A 5L9MA 1MDP1 4EQ7A 1IIWA 4BDLA 5AA4A 3FGSA 2ZMBA 1P1OA 3U1OA 5ISUA 3OO9A 1SW2A 2XD3A 3LR1A 4O3CA 1UIUA 2I48A 1UTBA 4H65A 3O6GA 1NH7A 3R26A 2R9JA 4Q0CA 1SD3A 4F39A 4ZZEA 5FTHA 1IXCA 4F2OA 1MM7A 3H06B 2O68A 4RXLA 5FTIA 2P0SA 4EQ9A 4LA9A 4YKIA 4PQJA 1B5HA 1MRPA 3V83A 3IX1A 1LAFE 4FEDA 5TP9A 2I0CA 3BFUA 1QKBA 3O2AA 2XXXA 5DTBA 3OEKA 5HPQA 3PUXE 3RLFE 4BLAA 3KN8A 3PUZE 4TLLB 4GLIA 1DMBA 2F97A 3OO6A 4H6DA 3QK6A 1FQFA 1B4ZA 3KOSA 4ZEFA 1SI1A 3OXNA 1A99A 5AA2A 3FD3A 4NF4A 3IB1A 2OCUA 1WVJA 4KYEA 1MQJA 4GL8A 1DOTA 3MZ1A 1JW5A 2GHBA 3S9NC 4JB7A 4NWDA 3IB2A 1F9BA 3KGCA 3H03A 1A7LA 2UVGA 4EF2A 4HCWA 4LATA 2ONKE 3CG3A 3K00A 4I8CA 1MXYA 5FHOA 3CFXA 1ZBMA 2UXAA 4RYAA 3O29A 3G3IA 1MY0A 4KI0E 1RYXA 2THIA 4IGTA 3A09A 3RN8A 5KDTA 3SEUA 3ILTB 2PBWA 3K0VA 4F1UA 3C33A 4O3BA 5HBCA 3KJ7A 3EN3A 4GL0A 4Z7EA 1PC3A 3USDA 3MZ9A 3IJOB 3U8QA 2DE3A 3O66A 3HSTA 5TU0A 4FIMA 2QMWA 1FTJA 1LAGE 3O28A 4OXVA 2Y7KA 1LB9A 1VR5A 2R71A 3CSGA 4H8JA 4IO2A 1UIVA 4HW8A 4P0GA 5H8FB 2P2AA 3O97A 1T0KA 3R6UA 4POWA 2I58A 3R7XA 2OBGA 1B7UA 2F78A 1N3XA 3C35A 3WAFA 3B6QA 3UK4A 5AA2D 1NMUA 2XXWA 1YPNA 4DIGA 3N26A 5DEXA 1B3LA 2Y84A 2NUVA 3GBBA 2XXYA 1SW4A 4DE8A 1PB8A 4OWDA 3TTKA 1B51A 3IOVA 2RC7A 2VP1A 4M1VA 1Y4CA 4PFYA 1XHYA 1FQEA 5AE4A 1B0HA 4ZE8A 2DXRA 4OFLA 3SEVA 3EF7A 2W7YA 4F1VA 5I56A 3TTLA 3S2VA 4PE5B 4HTGA 3OSQA 4K3FA 4N07A 3LBSA 1MPBA 2Q2AA 3KOTA 3RPWA 3TFLA 1LB8A 2NOOA 1OQGA 4TOZA 5I58A 2AL4A 4G2ZA 1B1HA 5AA4B 1A40A 4G4PA 2Z8FA 3EHSA 4KYSA 3CFZA 3TKDA 1HSEA 2QS1A 3OD7A 4KD5A 3N94A 4RPOA 2D3IA 4RNSA 4O3AA 4H1XA 3H6UA 1XC1A 4XKNA 5I59B 2O69A 4NMYA 1ELJA 1A54A 1JW1A 1Y20A 3H4ZA 3T93B 1ZTYA 2I4CA 4ONYA 3K6UA 2QS2A 2Q88A 4OYVA 1TFAA 3N5LA 3VLWA 1LBBA 2X7PA 4QSCA 2M8CA 1FCKA 4DLDA 4F22A 2B3BA 4LZ8A 5H8SA 3VXCA 5CMBA 1LSTA 1WDNA 1DPEA 1D9VA 2DOJA 1NL5A 4NF4B 1N7XA 4ZECA 2H25A 3TTMA 2F7BA 2F7AA 3QUFA 2F7CA 4GIZA 2DWHA 1JETA 3CI8A 1B7HA 4QSDA 1R9QA 4RJZA 4QHQA 3U93A 3KSXA 3IOWA 4DZ1A 2V3QA 4Q30B 4YB7A 2UVJA 3FVGA 4ELRA 1MPDA 3HHGA 4F3BA 1ZU0A 3OOAA 3RY3A 3OO8A 1B2HA 3N6UA 4NEDA 2XX8A 5KDTB 5CRYA 2VHAA 2A5TA 2ZYMA 3PUVE 1B32A 3BKIB 1B6HA 1I6BA 3S9LC 3B6WA 4EQBA 1FTKA 1R1NA 1JEVA 4U2RA 2DSFA 3IJXB 3PUWE 4IY5A 4M4GA 1MY3A 1EZOA 2R6GE 2OJTA 1MH3A 3K1PA 3PMXA 2RC8A 4AB5A 2O1LA 4UA8A 3Q29A 2DVZA 3CIJA 2F8DA 3V89B 1LFGA 3TMGA 1M5FA 2V84A 3G3GA 1TWYA 4E0WA 3RGYA 3OEMA 4GVOA 2XHDA 2H4IA 2UVHA 1BP5A 5H8FA 1Y3PA 1OIBA 4OETA 3VDFA 3I5OA 3SERA 1AL3A 4FJPA 5KCJB 3N6TA 1HSLA 2ZYKA 1GR2A 1IUDA 2Y7IA 1QJMA 4ECFA 3H7MA 3SDFA 1UTHA 4OENA 4R74A 1NNTA 4F19A 1MXUA 3PUYE 3MVZA 3GZGA 1B3HA 1PB9A 2O84X 3C34A 1SDXA 4GQOA 5JEIA 1NNPA 4X1DA 3PD8A 4H5GA 5H8QA 3CFLA 4R6YA 1TT1A 4C1TA 3W15C 3CRBA 4NWCA 3HHFA 1B52A 4BDOA 2QL3A 1N04A 1D9YA 3K6VA 4IO6A 1P99A 2RC9A 4N13A 4Z0IA 4H5FA 3QUJA 4DXCA 3HO7A 4OVJA 1N84A 2AIXA 3MQ9A 3MWBA 3MPKA 1OLCA 1LBCA 3PMWA 1KWHA 3PGFA 1B46A 4KCCA 4LVQA 4KFQA 1B40A 3TPAA 2DQVA 4EXKA 5F7VA 2I6EA 1O64A 5I59A 3KJTA 1IZ1A 3RT8A 2DWAA 2F35A 3TAJA 2QSXA 3T9HB 2O51A 4AB6A 5DT6A 1O63A 1QULA 3IK6B 3TDJA 3S4UA 3VVEA 4MH5A 5F1QA 2Q2CA 5L9OA 4GXSB 3PV0E 4ELOA 3G3FA 4QRZA 2XD2A 3B7DA 2KLFA 3LSXA 2XX9A 3VFJA 3U72A 1B5JA 4OEVA 3UN6A 3MJNA 4DCYA 3H3GA 5ICTA 4YICA 1NKXA 3G3HA 3MVYA 1MXZA 1H43A 1RYOA 3HN0A 4F1YA 2A5TB 3S9EA 4KHZE 2XXVA 5CC2A 1P1NA 4LQ2A 3A3UA 1VSOA 1MQHA 2OZZA 1LAHE 1YTVA 4FAJA 1H44A 1FQDA 4KYDA 3QSLA 4POXA 3P7IA 4Q5TA 3K02A 4XKPA 1MS7A 1GGGA 2DWIA 3FXQA 3PPRA 4LQ5A 1P1WA 1NH8A 4PFTA 1XVXA 5K2XA 3UA8A 5ITPA 3T66A 1QUIA 3Q27A 2OK2A 1SVXB 1N7WA 4P0IA 1MQDA 1Z7ME 2RCAA 5CBRA 3F11A 4WXJA 3D4CA 1ZJLA 1L5TA 4BDNA 4U1OA 4EDPA 1TFDA 3TQLA 1MH4A 3O6IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LBXA 1LGBC 4IO7A 1ZIUA 4WEPA 5CM6A 4QFPA 4QSEA 4GF8A 3IL1B 2XXKA 4MF3A 1GTKA 4PP0A 1CB6A 1YCJA 1HSJA 4OTEA 3FXRA 4E0XA 1FQCA 1VE4A 1SQYA 5EHMA 1ANFA 1DPPA 3IB0A 1SW5A 1NUWA 1UTHB 4N8YA 3U65A 2QPQA 3FJGA 2OLBA 4BDQA 2FBPA 1B4HA 5KCJA 1IXGA 2DE2A 2GFEA 1B3EA 3GLBA 4FE8A 4PFUA 4ZE9A 3DP8A 5H8HB 3MZBA 1R9LA 3TQWA 4N6PA 2LAOA 3KG2A 3O9PA 4RA1A 4P1LA 3FUZA 1MXXA 2V3TA 5ET6A 2XA5A 4PCDA 2B65A 3MBPA 3TCFA 4N15A 3CG1A 3E78A 1IXIA 4ND9A 4U4XA 5H8QB 4R6KA 5CMMA 4R9FA 5IKBA 2HXWA 3TELA 3RUMA 3IO6A 1XT8A 3L6HA 3IR1A 4GXAA 1XVYA 1H3DA 2HEUA 3TCHA 5ET5A 3ZS6A 3EHTA 1MDQA 5I57A 1PEBA 4QFKA 5B7DA 1Y1MA 3PPPA 3M3KA 4NQ8A 4P9KA 2HZKA 1FPGA 5HM4B 5CBSA 2PFYA 2X26A 2Y5LA 2E1SA 3A29A 4G68B 5J1DA 4O7IA 2XXUA 2H5YA 3FJ7A 2DP8A 1B3GA 1NV3A 2ESNA 1NV0A 3C31A 2B3FA 1B0LA 3JZJA 3CVGA 3S9MC 1B5IA 1Y1ZA 4YMBA 2Q74A 4FORA 1BTJA 3QAXA 3FASA 4LP2B 4ESWA 4JDFA 2ZNTA 4ZEDA 2ANJA 3LSWA 3FVOA 4IGRA 2QVVA 2XXIA 4X48A 1LCTA 3VE1B 3K6WA 3KSJA 1MM6A 3TCGA 3DELB 4P8BA 1M5BA 5BWJA 3K2DA 2RCBA 2Y7WA 4F2QA 5LDZA 2HAUA 1MXVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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