3IK6B

Crystal structure of the ampa subunit glur2 bound to the allosteric modulator, chlorothiazide
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Probing the allosteric modulator binding site of GluR2 with thiazide derivatives
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ik6B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ik6B02
3N5LA 4EQ9A 5I58A 3H7MA 4EXLA 2PT1A 5ELVA 4RPOA 1H3DA 4NF8B 2OZZA 2F7BA 2Z22A 3MVXA 1J1NA 3S9EA 1SBPA 3QIMA 4OEVA 1B7UA 2ONSA 3MVZA 2G93A 2XXYA 4WEDA 5FHOA 3IK6B 2DQVA 4PFUA 3E3KA 5DEXB 1QUJA 4F2OA 4GLIA 1EU8A 2HZKA 1FQAA 3O29A 2F5XA 5CC2A 3HHFA 1IQ7A 5TPAA 1UIUA 2QMXA 4OENA 3H4ZA 2Z8FA 1VR5A 4QSDA 1Q35A 4KHZE 5I58B 4MH5A 2REJA 4N6PA 4C1TA 3TTKA 3UIFA 1SD3A 1ZBMA 2ALUA 2P0SA 1I6BA 3M8UA 1LLSA 3KG2A 1TFDA 4I9DA 3EHUA 3PUWE 4QFOA 3FV2A 2PVUA 1YPNA 3TYHA 3GZGA 3U8QA 2A5SA 3TEPA 4YKJA 2DXYA 1B3LA 2HCAA 4G68A 4R72A 2NXOA 4K3FA 5TPAB 4R6HA 4M1VA 5AE4A 4GWOA 3FXQA 1D4NA 2UVHA 2RCAA 4YZZA 4ZECA 1EZPA 3R6UA 1LBCA 2H99A 1ZLQA 1NH8A 3CVGA 2XX7A 4OYVA 4OFLA 4XKQA 2AL5A 2P1SA 3PD8A 2QJEA 3KSJA 2HEUA 3FGSA 4ELPA 2ZNUA 2ZNSA 5KCJA 3M3FA 3QXMA 3HO7A 3IJXB 4HCWA 4G2ZA 4HCYA 4RK2A 2X7PA 1JEUA 1XHYA 2I48A 2Z23A 3OENA 3TZAA 3C32A 1JNFA 3S2VA 5ICTA 4O3AA 4G68B 3HV1A 4NWCA 3PV0E 2F7AA 3EHSA 5AA1A 1R1NA 3VVEA 4FE8A 2QSXA 4U4XA 4NF6B 3KJTA 3O6HA 4YAHX 2FYIA 1GTKA 3CG3A 2OBGA 5I59A 2Q2AA 2R6GE 1RYXA 4FIMA 4FAJA 2XX8A 1A99A 1ATGA 5H8SA 4P11A 4ZE9A 4U23A 3KSXA 3EPEA 4JXIA 5KCJB 3CRBA 1ELJA 4GXSB 3VFJA 3SETA 3G3HA 3W9VA 2UYFA 3T9VA 1XVYA 1MY2A 1JVXA 3FJ7A 3JZJA 3IJOB 3F11A 3EF7A 1B52A 2I0BA 2I4CA 2QS1A 2H4IA 3H6UA 2O1LA 2Q88A 3O97A 1MY4A 1NNPA 1YCJA 3H6TA 3SESA 4YICA 3FVNA 1SQYA 5I59B 4LUBA 1MY1A 1RKMA 1GGGA 4R2BA 3R7XA 1EZOA 3K00A 2PX1A 3VDFA 1PDAA 3B6QA 1MY3A 2I3VA 4F18A 1O64A 5AA3A 3I3VA 3L6GA 4U4SA 3FXRA 3HSTA 1TXFA 4LZ8A 1ZJLA 5F1QA 4YMAA 3GLBA 2DWIA 4MFIA 1BIYA 3UN6A 4XIGQ 2RCBA 3M3LA 4Q30B 3I6VA 4DE8A 3O2AA 2V3QA 4AB5A 3H3GA 2ZYKA 5L9SA 4P0GA 4LQ5A 2F8DA 4NF4A 4BDOA 3S4UA 3T9XB 5H8QA 3TELA 3IB0A 3PUYE 2O51A 3PMXA 1MPBA 3RT8A 4FATA 4DLDA 4IO3A 2DP8A 1P1UA 3KN7A 4TLMB 5HM4B 4DXCA 3C35A 4ZZAA 4ZEDA 1OVTA 4R9FA 4C0RA 1NNTA 2VHAA 1NNFA 3V89B 1T0KA 5DVJA 3IB2A 3DP8A 4IO7A 5I2KA 4NF4B 1OLCA 3PPNA 3CSGA 3SDFA 5H8QB 3N94A 1R9QA 1H45A 2GHAA 1OIBA 4Q5TA 4X1DA 4X1BA 4MLVA 3RGYA 1MXWA 3VLVA 1QKBA 3FJGA 2XXRA 3MP1A 4DCYA 1PEBA 1XVXA 5CBSA 1BLFA 3IOUA 4GFRA 4KI0E 4MBPA 4QF9A 3Q26A 1Y1MA 1SW4A 2XXTA 4E0XA 1R6ZA 1GR2A 3TQLA 5CMMA 4LATA 3U72A 1VFEA 5I2KB 1ANFA 3KZGA 3THIA 2V84A 2VD3A 2XX9A 2DWAA 3OEKA 4DXUA 2UYEA 4HTGA 4JWYA 1URSA 3RN8A 1Y3PA 3OEMA 1DMBA 4Q8RA 4C1UA 1FTJA 1Z7NE 2I4BA 1D3KA 2OJTA 2D21A 4TQUQ 1FQEA 1CB6A 4OFOA 4R9GA 3ODBA 1AH5A 1P99A 4G4PA 4XKNA 3RY3A 2A5TA 3TAJA 1JETA 2VD2A 4OERA 1N84A 4IO5A 4RA1A 1SI1A 1A8EA 2YLNA 2KLFA 1N0TA 1IIWA 3IO6A 2REGA 1PB7A 3PUZE 5CMCA 3TCHA 3HHGA 4DDDA 4EDPA 4YB5A 2Q8JA 3MZ9A 2O7IA 5FTHA 2HZLA 5TU0A 1B46A 3UP9A 1URGA 1B7HA 2X26A 4H5FA 2QL3A 2QRYA 3ONMA 1MM6A 4NWDA 1IEJA 2ZMBA 4YKIA 3TKDA 4F3SA 3K1MA 4KR5A 1M5BA 1MH4A 2A5TB 4HS7A 4OVJA 3U1OA 4R6YA 2Y84A 2DS9A 3MZ1A 4IB2A 4DZ1A 4XKPA 4JSDA 2YJPA 3Q28A 4ZEIA 3OO7A 4RJZA 3DELB 2QS2A 4BDRA 4OEUA 4GL0A 3BFUA 3FVGA 3TTNA 1PBQA 1LB8A 3RTFB 4ECFA 1WDNA 4R73A 1I69A 1UTBA 3MBPA 5A5XA 3TMGA 2PYYA 2NOOA 2GFEA 3OO6A 1Y9UA 2H9BA 1MM7A 4NTLA 2I6EA 3KOSA 3C33A 4MF3A 3CG1A 3KGCA 2XXIA 3U93A 3VV5A 2Z8DA 3U94A 3TDJA 4U21A 3K0VA 3IX1A 1FQFA 1ZU0A 3MP8A 3T22A 1MXXA 3WAEA 1P1NA 3ZKKA 2RC8A 1BP5A 4KQPA 1UTBB 5A5XB 2O84X 3BBRA 3EN3A 1Y20A 3RPWA 2UVIA 1H44A 1B3HA 1FQCA 2QPQA 4BDMA 3V8XB 3PPPA 3W9WA 3VXCA 1L5TA 1JVYA 3TPAA 2F34A 4FECA 4NF6A 3K1PA 1MXZA 3CFZA 5DTBA 1US5A 4NMYA 3CI8A 4QFKA 4KCCA 1OLAA 3MJNA 4YB6A 3K2DA 4YMBA 1P1OA 2DOJA 2P2AA 1CE2A 2ONRA 3MZBA 1QKAA 1NFTA 5HPQA 1MRPA 1MH3A 1IXGA 4KCDA 1Y3QA 5DYHA 4OMBA 1A40A 4G68C 5I84A 3IOVA 1ZIUA 1SW5A 3SEYA 1MQIA 2B3BA 3CSBA 4ESXA 4YB7A 3ZKLA 1LAHE 3K6WA 3Q27A 3FIRA 1HSJA 5J1DA 2GH9A 1O7TA 3CR9A 4IGTA 3L6HA 1M5CA 3QUJA 4OXVA 2OCUA 1TWYA 1POY1 2XXWA 2B65A 2OWTA 3OOAA 3KBRA 4G77A 2XXHA 1MXVA 4ND9A 3D4GA 1LAFE 4H67A 3HN0A 1DSNA 3MVWA 1Y4CA 4GOTA 2I0CA 1B5HA 3OD7A 2RF1A 4WEPA 3RUMA 3WAFA 3SERA 3RT6B 3PPOA 4O3CA 5CMBA 5JTYA 3MPLA 3T9HB 5L9MA 2F35A 2Z8EA 4ISUA 1DPPA 1NMUA 1DTZA 2E0SA 3C9HA 4G8MA 3E4RA 3MP6A 5L9OA 1MG1A 2O6AA 3TTLA 2LAOA 1LCTA 1S7YA 3JV9A 1NL5A 3Q29A 4GL8A 3KN3A 2Q2CA 4I8CA 2R71A 4LA9A 3E9XA 2ZYMA 4OETA 1USYE 2F97A 4JWXA 1SW2A 3FASA 3GBBA 3KJ7A 1B3GA 3C4MA 3B7DA 4IY6A 1URDA 1AOVA 4ESWA 2DWHA 4RK9A 1QJMA 5JTYB 4JWOA 3IL1B 4QFLA 1AL3A 4EF1A 3CFLA 1LAGE 1MQHA 2O1MA 1KWHA 2DWJA 4KFQA 1N3XA 2NUVA 1B9JA 4F1VA 3IO4A 3K6XA 4R2FA 3OO9A 3MAMA 2F78A 3M3KA 4R74A 2AYSA 5DVFA 5I57A 1B58A 4H8JA 1B4HA 1HSLA 4HW8A 4H1XA 2E1SA 4U1ZA 1SVXB 3OXNA 4H65A 5DVIA 3PD9A 4F1UA 4OZ9A 1USYH 4YU0A 3EQ1A 1II5A 2HAVA 2O68A 2PT2A 3H06B 4PFYA 3H03A 1DTGA 4LZ7A 3G3JA 4PP0A 2D3IA 1B7ZA 4ELQA 1D9YA 5B7DA 1Y1ZA 3QYTA 4F3PA 3IR1A 4QFPA 4BDNA 4IY5A 3ZSFA 4OFJA 2OLBA 1XT8A 3RQTA 3FJMA 3KN8A 3T93B 5I57B 5AA2A 5CRYA 4F2QA 4I62A 5DT6A 2Y7WA 1UQWA 2Q9TA 1N7WA 1SYHA 3C34A 3R26A 2XD3A 3K4UA 3IORA 3LSXA 4XTCQ 3MPKA 1IXCA 4OQOA 3BFTA 3O28A 5CMKA 4RY1A 3FUZA 3FATA 4R6KA 1VE4A 3ECRA 2UVGA 3AXFA 5CM6A 3RNNA 1R9LA 1BKAA 4POXA 5AA2B 1LFIA 1OQHA 1XS5A 3PMWA 2DE4A 4NEDA 1B4ZA 1LB9A 1QW0A 1RYOA 1FW0A 4DIGA 1B0HA 4WXJA 2UVJA 4BLAA 3FVOA 3ZS6A 4N07A 1MQJA 4IO4A 4RNSA 1B5JA 3OSRA 4JSOA 1B6HA 1DPEA 3CIJA 2HQ0A 1LSTA 4F39A 3K6UA 4PE5B 1B51A 3OELA 1JW5A 2XXQA 1D9VA 1TT1A 1N7XA 3IOWA 5ITOA 1QUIA 2Y7IA 1JEVA 4GD5A 3OSQA 2XXVA 5TP9B 3D4CA 3O6GA 5F7VA 2RKMA 3TQWA 1HSEA 5BWJA 3O66A 1LBBA 3IAZA 2DVZA 3MVYA 1MDP1 3RTWB 3Q25A 1XC1A 1IUDA 1LAXA 4DCXA 4OHNA 1M5DA 2XHDA 1XOCA 1ZKBA 2DXRA 2NWJA 4E0WA 5KZTA 4F1YA 4F3BA 1B0LA 1PB9A 2CMOA 1MXYA 4OTEA 4F22A 3OMBA 1JQFA 1P1WA 1A7LA 2O7UA 1MPCA 3QAXA 3HPIA 1MQGA 3C36A 4Z7EA 3LSFB 4EQ7A 4FEBA 1B05A 5H8HA 2Y7KA 4OWDA 2V3UA 3H6VA 2V93A 4TOZA 3T66A 2FNCA 5L8DA 1EZ9A 3ILTB 3SKPA 4H5GA 1NH7A 3O6IA 4GVOA 2H25A 1I6AA 1IZ1A 2Y7PA 4TLLB 1MXUA 2HAUA 3GBAA 3CFXA 4QHQA 3C31A 2RC9A 3IOTA 1H76A 4JBZA 2ONKE 3T9UA 1P1QA 2HXWA 1JW1A 3K02A 5H8HB 4PETA 1PC3A 3W15C 1B32A 3P7IA 4F29A 1FTLA 3LSWA 5IKBA 4RYAA 2DE2A 1FTKA 3E13X 1YAEA 3G3GA 1I6QA 1NKXA 4FORA 4X9TA 3PPQA 3T96B 1POTA 5B70A 1VFDA 4M4GA 4KYEA 4MLQA 3VVDA 1GV8A 2XXUA 5ITPA 2QS4A 2DSFA 4IO6A 3FXUA 2X7QA 1F9BA 3UK4A 1SI0A 4THIA 1LFGA 1A55A 1IXHA 2UXAA 4EF2A 3SEXA 2ANJA 5KDTA 3PMVA 5K2YA 1H43A 1QUKA 4KPTA 2R9JA 5H8NA 2I49A 3GXAA 4QRZA 5AA4A 3SEWA 3FD3A 1MQDA 3TUSA 4LZ5A 4YKKA 4KYDA 3UGWA 3DP6A 3MQ9A 1BTJA 5ISUA 2QS3A 1Q1KA 2DVCA 1B3FA 4Z0IA 1GVCA 2ESNA 4KYSA 2ZYOA 1MDQA 3S9NC 3KEIA 2I58A 3DP4A 1DOTA 3DLNA 1ZMGA 4RPNA 1OQGA 3TTMA 4XXUA 2NVUB 1MY0A 2RC7A 3LSLA 4Q0CA 5KDTB 1WODA 3N6UA 1LGBC 3A3CA 5H8NB 2AL4A 4GF8A 5AA4B 2VP1A 3V83A 4GQOA 2V25A 4GRKA 2VOZA 3V5AA 3UA8A 2OK2A 4U22A 2I3WA 2GRVA 4OESA 1PB8A 3TFLA 3PPRA 4IGRA 4EQBA 5ICQA 1N04A 2PBWA 2IA4A 1WVJA 1TFAA 2RINA 4NE4A 3USDA 4LQ2A 4ELOA 1Y4TA 1FCKA 4PFWA 5H8FA 5FHMA 2VGQA 3TTRA 1JW4A 1Y3NA 4LP2B 1NNKA 3BKIB 4ZS9A 1N3WA 2YPNA 4ONYA 2DYXA 3IB1A 4QFNA 1FQDA 4ZEFA 1B1XA 1MPDA 2AIXA 3I5OA 4ZZEA 3PU5A 4POWA 1US4A 4U1OA 3SEVA 4BDLA 4WKMA 1LFHA 1FTOA 3G3FA 4PFTA 3VXBA 4RXLA 3QUFA 3B6WA 2D5WA 1S9TA 1B40A 3VE1B 3MC2A 1AIVA 3KOTA 2O69A 4EUOA 3VLWA 4ZEKA 2IEEA 3MW0A 2Y7RA 1YTVA 5H8FB 2DE3A 4FJPA 4JDFA 3N26A 5IAIA 4X48A 2ABHA 5FHNA 3OO8A 3LUYA 5CI5A 2CZLA 4LONB 4ELRA 3PUXE 3G3IA 4ZDMA 4R75A 3HCQA 3DM0A 1MS7A 4U2RA 4NF5A 4QSCA 1B2HA 3S9MC 4F31B 4JB7A 2GHBA 4G8NA 1ZTYA 3PUVE 4ZE8A 4IO2A 3G7WA 5JEIA 2M8CA 2THIA 4GIZA 2H98A 4ZEBA 1O63A 4PQJA 5LOMA 4QSEA 3QK6A 3LR1A 4XKRA 3O9PA 5HBCA 1AMFA 1A8FA 1UIVA 3JYRA 3TCGA 5EYFA 5CBRA 3G3KA 2ZYNA 2XXXA 4YKPA 4H6DA 4G8HA 1SDXA 3A09A 5FTIA 5K2XA 2Q89A 5BUUA 4NF5B 2ZXTA 1B1HA 3LBSA 4GXAA 2XXPA 1UTHA 4H8IA 3LC8A 2ZNTA 2FA7A 1M5FA 3A3UA 4P0IA 5M2VA 5I56A 4LVQA 3QSLA 5I2NA 1IXIA 4FEDA 4N13A 2OWSA 5TP9A 3SEUA 1B5IA 2F6PA 2BJJX 1PBPA 4AB6A 4H0WA 3FV1A 4AQ4A 3VVFA 4O3BA 1LCFA 3K6VA 2WKYA 1EH3A 2HFBA 5EHMA 2QMWA 3K1NA 5JK4A 1QVSA 3RLFE 3TCFA 3B6TA 1FTMA 3FVKA 3ILUB 3MWBA 2F36A 4BDQA 4F3GA 1UTHB 3MUQA 1M5EA 3H6WA 5AA2D 3FZVA 2H5YA 4UA8A 2G29A 2PMSA 2V3TA 1IITA 1SYIA 5EHSA 3UORA 4L17A 4NF8A 4UACA 5I56B 1SW1A 3EHTA 1OMPA 1Z7ME 5I2NB 3KFMA 1QULA 4F19A 3VLUA 3TODA 4I1DA 5DEXA 1FQBA 1B3EA 2F7CA 2B3FA 1VSOA 1S50A 2F6GA 3S9LC 1A54A 3K01A 4EXKA 3U92A 3PGFA 1OVBA 4KD5A 2W7YA 1N76A 2XD2A 4DXBA 3N6TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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