3VVFA

Crystal structure of ttc0807 complexed with arginine
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
GGSEFQVRSFEEIKRSGEIRIGTEGAFPPFNYFDERNQLTGFEVDLGNAIAERLGLKPRWIAQSFDTLLIQLNQGRFDFVIASHGITEERARAVDFTNPHYCTGGVIVSRKGGPRTAKDLQGKVVGVQVGTTYMEAAQKIPGIKEVRTYQRDPDALQDLLAGRIDTWITDRFVAKEAIKERKLENTLQVGELVFQERVAMAVAKGNKSLLDALNRALAELMQDGTYARISQKWFGEDVRCK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Two ATP-Binding Cassette Transporters Involved in (S)-2-Aminoethyl-Cysteine Uptake in Thermus thermophilus
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Thermus thermophilus
molecule keywords Amino acid ABC transporter, binding protein
total genus 90
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3vvfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3vvfA02
1POTA 3TTLA 5FHNA 3CSGA 2H9BA 3UORA 4MF3A 4RPNA 1FQCA 1BIYA 1Y4CA 2F6GA 5AA4B 3QSLA 3TUSA 4JWOA 3I3VA 4KYSA 1GV8A 3LSWA 1YAEA 3LC8A 2O7IA 4ESXA 4F19A 3C34A 3RTFB 4G8HA 4NF6B 3MAMA 2M8CA 1SW5A 1A7LA 5KDTB 5DT6A 4H5FA 1B5HA 4F3SA 4ECFA 4U21A 1QKBA 5AE4A 4X48A 3W9WA 2XXTA 5I2KA 5JTYB 3TDJA 2I3WA 4LA9A 2Y84A 3FATA 2A5SA 1B7HA 4XIGQ 5I58A 3SEVA 4AQ4A 4QFOA 3E9XA 4L17A 5M2VA 4GF8A 3Q28A 4F1VA 4QHQA 2YPNA 1QVSA 4TLMB 2QJEA 1MXZA 2OLBA 3L6HA 3IL1B 3O9PA 1ZTYA 5I56A 1YTVA 1UTBB 4QFNA 1GVCA 4DDDA 1EU8A 3I6VA 3CVGA 3KOSA 3BBRA 4TOZA 4YKIA 4WEDA 2HZKA 1JVXA 3L6GA 1M5CA 2RC8A 1UTHB 3OEMA 4G77A 1FQAA 1SI0A 4NWDA 3H4ZA 1OIBA 2Z8DA 5A5XB 5H8NB 4OTEA 3EF7A 5ITPA 1RKMA 4N6PA 2F7CA 4YZZA 1R9QA 2Q89A 2F36A 1M5BA 5L9MA 2VP1A 1N7WA 1QJMA 4ZDMA 2DS9A 3TPAA 4O3CA 3C35A 1Q35A 4TLLB 1QUJA 2O68A 3FJGA 1P1UA 2XX9A 3IOTA 3U92A 1I6QA 1FQDA 3TFLA 2DE4A 2I0BA 2UXAA 4KQPA 4IB2A 1AL3A 2QS1A 4M4GA 3CSBA 3FJMA 3FUZA 4NF4A 2BJJX 3PUVE 1WODA 2A5TB 3TODA 2I0CA 4ZEDA 3PUXE 3PPPA 2RKMA 2Y7WA 3FIRA 5L9OA 3S9EA 1POY1 1AH5A 1B3FA 4PQJA 1B32A 4OHNA 5H8QA 2DVZA 1PDAA 3RLFE 1JW4A 3KN7A 4GRKA 2QS3A 1MM7A 1A99A 1NNKA 3S9NC 1JVYA 1IIWA 1L5TA 3GBAA 5IAIA 5DVIA 4QSDA 1ZLQA 3U94A 2XXUA 3CR9A 1S50A 1OVBA 2I3VA 1B9JA 2ZYKA 5CMMA 4U4SA 3V5AA 1ZU0A 4LVQA 3FZVA 2FA7A 1FW0A 3M3KA 3KGCA 4OERA 1A54A 3LR1A 3UP9A 3QIMA 4YKPA 3PUZE 4R74A 3IOVA 4ONYA 3VDFA 5AA2A 2DE3A 1SVXB 1MRPA 2ZMBA 5BWJA 4GXSB 4F3BA 4YB7A 3IOWA 1B1HA 1IXCA 2XXQA 1B51A 4QFKA 3MVWA 4NEDA 4QSCA 4EUOA 2I4CA 1Z7NE 1GTKA 1IUDA 5I2NA 4MH5A 3OMBA 2PX1A 3B6WA 1IXGA 4IY5A 2ONSA 3CFLA 2P0SA 1JW5A 4LQ2A 3F11A 4Q30B 2Y7IA 2YLNA 4JDFA 1P99A 1ATGA 1JQFA 1FQBA 4N13A 2XXHA 3RGYA 4PP0A 3T22A 3S2VA 1Y3PA 4I1DA 4KD5A 4BDQA 3DM0A 4P0GA 3HO7A 5CBSA 2GFEA 2UVHA 3PD8A 1Y4TA 3K6WA 1J1NA 1EZ9A 2X7PA 1PB9A 5HPQA 4YMAA 1SYHA 2RCAA 2F97A 2GHBA 5FHOA 4JWXA 5CMCA 3K1NA 5TPAB 1O7TA 3HV1A 1B4HA 2ABHA 2I49A 2GRVA 1MPDA 2ZYNA 4OEVA 2Q8JA 3N94A 3T93B 1SDXA 5FTHA 4X1BA 2G29A 2ONRA 2DXRA 2QSXA 3PPNA 5F7VA 3FVGA 5H8FB 2ZNTA 3EHSA 1LFHA 4AB6A 3DP6A 4RA1A 3TZAA 4OWDA 4NF8B 4FEDA 4X9TA 1FTLA 3FD3A 4NWCA 1XS5A 4H1XA 1H43A 2DP8A 1XVXA 4F3PA 3S9MC 2F78A 1N0TA 2GH9A 4IO3A 3OELA 4RK2A 3OSRA 4U23A 4ZZEA 4LUBA 4JWYA 1SW4A 1HSLA 3QAXA 3R7XA 5DVFA 4OYVA 5CRYA 5I59B 2REJA 2QPQA 2DWIA 3FGSA 4OQOA 2OK2A 4DE8A 1T0KA 2P2AA 3PU5A 1B5IA 3MVYA 2UYEA 1H44A 1MXVA 4KYDA 4IO7A 3IO6A 1LCTA 2KLFA 3QK6A 4WKMA 1LAXA 4C1UA 4U1OA 4MBPA 4IY6A 4GQOA 3KSJA 2UYFA 4BLAA 1H3DA 2PT2A 3PV0E 3ZS6A 1DOTA 1H45A 3MPKA 1VE4A 1LLSA 1B7ZA 3ILUB 1O64A 2H25A 4ELQA 2DXYA 3A3CA 2OZZA 3MUQA 1PBPA 2QS2A 5DEXA 1I69A 4ELRA 4WXJA 3G3GA 3VE1B 1B3HA 1LAFE 3O2AA 3QUJA 1USYE 1QUIA 3HPIA 2HAUA 4FATA 4F31B 2OWTA 4F39A 1IITA 1AMFA 5IKBA 2FYIA 5H8FA 2V25A 3IB0A 2VD3A 2AIXA 2Z23A 2QMWA 3G3FA 2NVUB 3N26A 1NFTA 2DWJA 4NF8A 4RXLA 3PPOA 3JV9A 3PUWE 4GIZA 1WVJA 3SKPA 1FCKA 4R9GA 1MDQA 2XXVA 1MXUA 2V3TA 1N84A 1NKXA 2Q2AA 3MW0A 4GOTA 3TTNA 2CZLA 3KOTA 3OO9A 5I59A 3VXBA 4HW8A 1MY2A 2I58A 2ZNSA 3M3LA 3TCGA 1EZOA 5JEIA 3E3KA 4PFYA 4DIGA 1YCJA 3MWBA 3G7WA 3H7MA 3C33A 1FQFA 5ELVA 4MFIA 4GD5A 1Y1MA 3O28A 2ZYOA 3PGFA 3OENA 1EZPA 4IO6A 1MPBA 3K2DA 2HZLA 3N5LA 4YB5A 4DLDA 5TU0A 3SERA 1LFIA 3H6TA 1BTJA 2B3FA 2XXIA 3IR1A 4OESA 4RK9A 3CI8A 3TELA 1QW0A 4U1ZA 2D3IA 1D4NA 5I57B 1LB9A 4LP2B 3WAFA 2HQ0A 3G3HA 4XKNA 4JXIA 4F1YA 3TAJA 3KJTA 2G93A 1JEVA 3I5OA 5KCJB 3PMXA 4LZ7A 1NH7A 1ZMGA 5AA4A 5ISUA 1PC3A 4DCYA 4Z7EA 1SW2A 1Y20A 3W15C 4NF6A 2F7BA 5KDTA 1R9LA 3H3GA 4OENA 4UACA 1MQHA 4THIA 3CIJA 3K6VA 1AIVA 3RTWB 3ZKKA 3KSXA 5DYHA 1DPPA 3G3KA 1B7UA 1LAHE 3KEIA 3N6TA 3FXUA 2AL4A 3O6GA 4C0RA 2ZYMA 2DOJA 4LZ5A 2B3BA 3FASA 1NH8A 4FJPA 4NMYA 5JTYA 4H8JA 3A09A 4WEPA 4KYEA 2RINA 2XXWA 4P0IA 1RYXA 1N3XA 3K4UA 1DPEA 3W9VA 2H4IA 3C32A 4ZE8A 1FTKA 5CM6A 3K6UA 2XD3A 4POWA 3K6XA 2PYYA 4H67A 4O3BA 1US4A 2F7AA 1TFDA 5CMKA 5DVJA 1PB7A 4YMBA 1UTBA 3C36A 1LGBC 4KI0E 3K1PA 1CE2A 1B2HA 4EDPA 1UTHA 2D21A 3V89B 2GHAA 3EQ1A 3TTMA 4H8IA 1MXWA 1JEUA 4ISUA 3B7DA 1DTZA 3PMVA 3TCHA 1B4ZA 3DELB 4H0WA 1Y9UA 2ALUA 3IB2A 4EQ7A 3G3IA 5I57A 5A5XA 5H8NA 1B0LA 4OXVA 1NMUA 3V8XB 1AOVA 3SESA 1WDNA 4KPTA 1NNTA 1XVYA 3PPRA 5KCJA 3C31A 3TMGA 1M5EA 3GZGA 4YKKA 1MH4A 1CB6A 2OWSA 2Q88A 4EXLA 4UA8A 1B6HA 2PMSA 1MG1A 2WKYA 4ELPA 3Q29A 2UVGA 4TQUQ 1N76A 3IB1A 1MY4A 3KG2A 3VVDA 3M8UA 4MLQA 3MP6A 2I4BA 5TP9B 4OVJA 1A8EA 3VVFA 1TXFA 3U72A 3MZ9A 3E13X 2A5TA 1N04A 1FQEA 3MPLA 3LSFB 2W7YA 4IO5A 3JYRA 3A3UA 2XXRA 5I84A 3BFUA 1TFAA 2O69A 3JZJA 2PT1A 3TYHA 2VHAA 4ZEIA 4ZECA 1Z7ME 4F3GA 4G68C 2XX8A 3H6VA 3K02A 4QFPA 1JW1A 3TEPA 1ZKBA 3O66A 4KCDA 1KWHA 4RJZA 4FEBA 1Q1KA 4Q5TA 3T66A 3Q26A 4EF1A 2F6PA 3OD7A 1ZIUA 1F9BA 3EPEA 3TTRA 4OMBA 1UIVA 4R6KA 4I9DA 1BKAA 4PETA 4XTCQ 3OO6A 2RF1A 3RT8A 2VGQA 5H8SA 2RCBA 1HSEA 5DTBA 1YPNA 3T9UA 2F8DA 3GBBA 4E0WA 4IGRA 1VSOA 3OXNA 1SD3A 4EF2A 1USYH 3H6WA 5CBRA 3BKIB 2E1SA 4QSEA 1DSNA 3TTKA 1GGGA 3Q27A 2UVIA 3HCQA 2Q9TA 3FVOA 1N3WA 2DWHA 4XKQA 3K1MA 5AA2D 2XXXA 5HBCA 2I48A 5I58B 4NE4A 1QUKA 3T9VA 1B05A 3FXRA 3LSXA 5K2YA 2RC9A 1MXYA 1D9YA 3RT6B 4NF5B 2DSFA 4Z0IA 4HS7A 4RYAA 4DXCA 4X1DA 4OFOA 1MPCA 3O29A 4FORA 2ANJA 4PE5B 4Q0CA 3IJXB 3G3JA 3UGWA 5CMBA 2FNCA 2THIA 3N6UA 5ICQA 3IX1A 4U4XA 4GWOA 3EHUA 1UQWA 4OFJA 1US5A 4JSOA 5EHMA 3T96B 4F22A 5AA3A 4GL8A 5F1QA 2O7UA 5TPAA 4GLIA 1OVTA 4F18A 1MQGA 1MM6A 2X26A 5B70A 1SYIA 4KHZE 2DVCA 4PFUA 2DWAA 4H5GA 3MP8A 3ZKLA 5AA1A 3S4UA 4ESWA 1SBPA 1NL5A 4BDNA 4F1UA 1IEJA 1JNFA 2H98A 1MQDA 1ZBMA 4G4PA 3UN6A 1Y3NA 4F29A 1MS7A 4C1TA 4QF9A 3SEYA 5K2XA 4DXUA 4R9FA 2O1MA 2O84X 1LBBA 2NUVA 4PFWA 3K00A 1SQYA 1LB8A 3U93A 2V3QA 3SETA 2D5WA 3THIA 2AL5A 3FJ7A 3U1OA 1MH3A 1N7XA 3K0VA 3RUMA 1QKAA 2AYSA 4ND9A 3TKDA 1II5A 1MQIA 1B1XA 5HM4B 3SEUA 3EHTA 3O6IA 4GXAA 4R6YA 1B3EA 3SDFA 2ZNUA 4HCYA 4NF4B 3BFTA 4NF5A 4GL0A 4DZ1A 4EXKA 1URDA 3VLUA 3GLBA 1NNPA 1R1NA 3FVKA 4F2OA 1FTMA 4R6HA 3RQTA 1P1NA 5L8DA 2B65A 4GVOA 3SEXA 1B46A 3RPWA 3QUFA 5EYFA 5H8QB 2HXWA 3MBPA 4HTGA 4E0XA 1TT1A 2IA4A 3CG3A 1B58A 4LONB 5JK4A 2XXPA 2Q2CA 1A55A 1LCFA 5BUUA 3T9HB 2HCAA 4JBZA 1VFDA 3R26A 1P1OA 3RN8A 4BDRA 4YICA 4Q8RA 3V83A 3H03A 4BDLA 3IK6B 4OEUA 3CFZA 3OO8A 4GFRA 1M5FA 5H8HB 1D9VA 3ZSFA 4OFLA 1DMBA 4OZ9A 1R6ZA 2XXYA 1OMPA 1ANFA 1XC1A 4DXBA 4U2RA 3KN8A 2ZXTA 1Y3QA 5L9SA 5AA2B 2IEEA 2E0SA 3Q25A 4FE8A 1URGA 3SEWA 3VFJA 4FAJA 3DLNA 4G8NA 3UK4A 4BDOA 3P7IA 2R71A 4EQBA 4DCXA 2H5YA 5CI5A 2HEUA 3PUYE 4ZS9A 3KN3A 3QXMA 1BP5A 2I6EA 3TQWA 1LAGE 5I2NB 2P1SA 5J1DA 2RC7A 3TQLA 3CFXA 3ONMA 1MXXA 3VLVA 1NNFA 5ITOA 2O51A 1OQGA 1D3KA 1LSTA 3M3FA 2F34A 1JETA 1IXIA 3IOUA 2REGA 2X7QA 3FV1A 1B3GA 2LAOA 2V93A 2PBWA 1S7YA 3MJNA 3O6HA 4R2BA 2V84A 3S9LC 1B40A 3HSTA 1IQ7A 1LFGA 2HAVA 3KZGA 1SI1A 3VVEA 4R75A 4IO4A 2QL3A 3ECRA 2NWJA 4R73A 1MDP1 2Y7RA 4POXA 5ICTA 1IZ1A 2CMOA 2DYXA 2YJPA 4N07A 1P1QA 5H8HA 1B3LA 2NOOA 3D4GA 1I6AA 4RPOA 2Z8FA 2OCUA 4IO2A 4R2FA 1PB8A 1P1WA 4XKPA 4XKRA 4ZEKA 2O1LA 1A40A 1M5DA 3KBRA 3OOAA 4AB5A 4NTLA 3B6TA 1IXHA 3FXQA 4JSDA 3ILTB 3MVXA 3VV5A 4PFTA 3KJ7A 3UIFA 3GXAA 4FECA 1OLCA 1PEBA 2ONKE 4YKJA 3AXFA 4YAHX 3RY3A 2DQVA 4G68B 3MVZA 2R6GE 2VOZA 3D4CA 1Y1ZA 3IAZA 1XOCA 1MY3A 2XD2A 2V3UA 5KZTA 3VXCA 2Y7KA 2Y7PA 4ZEFA 1PBQA 3FVNA 4I62A 1XT8A 3TCFA 3R6UA 4ZE9A 3WAEA 4ZZAA 2F35A 4KFQA 3DP8A 4M1VA 4U22A 2VD2A 2HFBA 2Z22A 3MC2A 5EHSA 5FHMA 3HHGA 4ZEBA 2OJTA 2R9JA 1O63A 4R72A 3PMWA 3USDA 4I8CA 3OSQA 1A8FA 1FTOA 1B52A 5LOMA 1MQJA 2O6AA 5FTIA 3U8QA 2PVUA 1VFEA 1LBCA 2ESNA 2DE2A 3PD9A 1ELJA 1OQHA 3CRBA 3ODBA 4IGTA 2XHDA 4G2ZA 5DEXB 2H99A 1VR5A 3K01A 3LUYA 3IJOB 4LQ5A 4LZ8A 3IORA 4YU0A 2OBGA 4H65A 4ELOA 3LBSA 3RNNA 4FIMA 5B7DA 4XXUA 1B5JA 4F2QA 4KCCA 4OETA 3DP4A 3C9HA 3VLWA 3H6UA 2QS4A 5TP9A 3IO4A 1SW1A 1MY0A 5I2KB 1XHYA 1HSJA 1RYOA 1EH3A 2XX7A 3LSLA 4G68A 1H76A 3C4MA 3E4RA 1ZJLA 3CG1A 1QULA 3QYTA 1BLFA 2F5XA 4RNSA 4EQ9A 2NXOA 3B6QA 3MP1A 1FTJA 1B0HA 3MQ9A 5CC2A 4QFLA 3H06B 3PPQA 4MLVA 1MY1A 3OEKA 4KR5A 1UIUA 4O3AA 2UVJA 4YB6A 4JB7A 1GR2A 5I56B 1I6BA 1TWYA 3T9XB 3EN3A 3OO7A 2QRYA 3O97A 2QMXA 2Z8EA 4LATA 3FV2A 4H6DA 1S9TA 3UA8A 4K3FA 3MZ1A 4G8MA 4RY1A 3MZBA 1URSA 1DTGA 4BDMA 4HCWA 3KFMA 1OLAA 4QRZA 3HHFA 3HN0A 4P11A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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