3VVFA

Crystal structure of ttc0807 complexed with arginine
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
GGSEFQVRSFEEIKRSGEIRIGTEGAFPPFNYFDERNQLTGFEVDLGNAIAERLGLKPRWIAQSFDTLLIQLNQGRFDFVIASHGITEERARAVDFTNPHYCTGGVIVSRKGGPRTAKDLQGKVVGVQVGTTYMEAAQKIPGIKEVRTYQRDPDALQDLLAGRIDTWITDRFVAKEAIKERKLENTLQVGELVFQERVAMAVAKGNKSLLDALNRALAELMQDGTYARISQKWFGEDVRCK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Amino acid ABC transporter, binding protein
publication title Two ATP-Binding Cassette Transporters Involved in (S)-2-Aminoethyl-Cysteine Uptake in Thermus thermophilus
pubmed doi rcsb
source organism Thermus thermophilus
molecule tags Transport protein
total genus 90
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3vvfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3vvfA02
3CI8A 3MJNA 4U1OA 1MQGA 2F36A 4QSCA 2AIXA 3PD9A 2F6GA 2D5WA 4KYSA 4QRZA 4R9GA 1MQJA 3FJ7A 3VE1B 3BFTA 3K1MA 4X1DA 3PUXE 3PPPA 2DP8A 4RPOA 3QK6A 3FV2A 3O6HA 3S4UA 2F34A 5DVJA 3TUSA 1IXHA 5IKBA 1JVYA 3T93B 1HSEA 1P1WA 5JTYB 2XXXA 1JEUA 3MBPA 4F31B 1FCKA 2QS1A 4PP0A 2HAUA 1A40A 5I57A 4DLDA 2P0SA 3S9LC 5I2NA 4RNSA 5BWJA 4OVJA 3H06B 2NWJA 3P7IA 1Q1KA 1MXXA 4ZEDA 2BJJX 4YAHX 4TLMB 2DOJA 2OBGA 3T9UA 4BDOA 4U4SA 1Y3QA 5L9OA 2XXHA 3O2AA 4HS7A 5FTIA 1YPNA 3G3HA 5M2VA 4X1BA 4ND9A 2ESNA 3HN0A 3LSWA 4EXKA 1A55A 4BDLA 4F1YA 1MQDA 2QS4A 3E4RA 3BBRA 4NF6A 4GD5A 3Q25A 4ELQA 1LFIA 3R6UA 2GHBA 1UTHB 5LOMA 2HAVA 4OEUA 3N94A 1M5CA 5DVIA 1ZKBA 3CVGA 1Y4TA 3PV0E 3WAFA 1FTJA 1P1QA 4YB5A 1S50A 1GVCA 2H98A 2PVUA 1MG1A 3I5OA 3U1OA 3PMXA 4OFJA 5EYFA 1NNPA 4EQ7A 5H8HB 3BKIB 4IO7A 1MM6A 5I58B 2D3IA 4OYVA 1USYH 2DVZA 1O64A 2QL3A 3MW0A 1NNTA 4AB5A 1TXFA 3LSLA 1FQFA 1UIVA 5JTYA 3RT6B 3K6WA 4ZZAA 3K02A 5EHMA 3D4CA 5CMKA 4YMAA 2RF1A 4C0RA 4MH5A 3FV1A 5DEXB 2Q88A 2H9BA 5H8NB 1FTMA 3GBAA 1IITA 1P1UA 4DCYA 1MY1A 3TTNA 5ELVA 4QHQA 4ELOA 1NNFA 1JETA 4LQ2A 3MVWA 4G8HA 1QKBA 1SW4A 1FQBA 4JWXA 3FJGA 1NMUA 3VFJA 5TP9A 1XC1A 4OENA 3SETA 4G77A 3RGYA 4YB7A 3IB2A 1O7TA 1UTBA 3SEVA 2YJPA 3QXMA 1JW5A 4RA1A 1N76A 4HW8A 3TQLA 4H67A 3RTWB 1YTVA 1EZPA 4RYAA 1AL3A 1IEJA 1UTHA 3CG1A 2O7UA 2R6GE 3W9VA 3EHUA 4YICA 1FQDA 1MPCA 5DTBA 4E0WA 3G3JA 2DE4A 1A8EA 3CFXA 1F9BA 3FXRA 3O6GA 3B6QA 4MBPA 2Q89A 4RPNA 2IA4A 3T9HB 3W9WA 2DE3A 5H8HA 3FVGA 4I62A 2O68A 1P1NA 4MLQA 4ZE9A 4H8JA 5I58A 1II5A 2Q2CA 1SI0A 4HTGA 3RTFB 2DE2A 2QS2A 4EDPA 3RUMA 2E1SA 2KLFA 2REJA 1IUDA 3ZS6A 2F97A 4P0IA 2I0CA 1LAFE 3KOTA 4KCCA 1ZTYA 4O3AA 1Y1ZA 4F1UA 5DEXA 4F1VA 5H8NA 4Z0IA 2DQVA 3ZSFA 3MAMA 2ZNTA 2GHAA 1URSA 1ELJA 4GQOA 3OENA 4OESA 1B32A 4OETA 5H8FB 2ZXTA 3QSLA 4GL8A 3PGFA 4POXA 1POTA 3DLNA 3I3VA 2OWTA 3A3UA 3MP6A 4JWOA 2O84X 2XXVA 2XX8A 4R75A 2THIA 3FVKA 5HBCA 1O63A 4IB2A 4EXLA 4O3CA 2I4BA 2V3UA 4LZ5A 4RK2A 2YLNA 4IO4A 5CMBA 4R74A 2M8CA 3R7XA 3IOVA 4NWDA 3S9EA 2Y7IA 4OEVA 2X7QA 1LFHA 3QIMA 2RC8A 2UVHA 1UQWA 5ICQA 3JZJA 3TCGA 2VD2A 5DYHA 4IY5A 4MFIA 4U4XA 1ZIUA 3USDA 1TT1A 1H76A 3PPNA 3EN3A 5F1QA 3PPQA 5CRYA 4F18A 3VVDA 3L6HA 4G68A 1H3DA 4M1VA 1KWHA 2OZZA 3TODA 2FYIA 3UA8A 4DDDA 1XVYA 3OO8A 1XOCA 1ANFA 2OWSA 2RC9A 1ZJLA 3N26A 1IQ7A 4EQBA 5ITOA 3TTLA 3SEUA 2ZNSA 3OSQA 2ONSA 3H03A 3EPEA 4NF6B 3PMWA 3H7MA 2FNCA 2XX7A 3OEMA 4Q0CA 1EZ9A 4FJPA 3UGWA 2AL5A 1JW1A 3KN8A 4F3SA 3AXFA 1IIWA 3R26A 1CB6A 5KCJB 2O6AA 4GRKA 3M8UA 3GXAA 3B7DA 4MLVA 1IXCA 1SD3A 4ESWA 3D4GA 1LBCA 4F29A 3LBSA 3Q29A 5H8FA 4YKKA 1A54A 3K00A 3RT8A 4ZZEA 3M3KA 4KR5A 1Y3PA 4R6KA 1PB8A 4JWYA 1CE2A 3OD7A 3O97A 3VXBA 4EF2A 1PBQA 3CR9A 1IXGA 1YCJA 4XIGQ 5H8QB 5B70A 1UIUA 1MQIA 3KEIA 1LB9A 3HCQA 1M5BA 3WAEA 3TELA 2Y7KA 4KPTA 1N3WA 2VGQA 5TPAB 3MVYA 2D21A 1ZU0A 5H8SA 3KOSA 1S9TA 1FQAA 3PMVA 1OIBA 4JSOA 1MY4A 4U21A 1B5IA 2AYSA 3S9MC 3MZ1A 3KSJA 1P99A 4JB7A 1FTOA 3GBBA 3SKPA 2H25A 4QF9A 2HZKA 4DCXA 3CIJA 1T0KA 3PUWE 3QAXA 2QSXA 2ONRA 1B3LA 1AOVA 4NF4B 4LA9A 4AB6A 4F22A 4NF8B 5TP9B 5FHMA 4RY1A 3C9HA 4IO2A 3I6VA 4LP2B 1FTKA 1QULA 4X9TA 4F3GA 3MP8A 3JV9A 1UTBB 1XS5A 3A3CA 5ISUA 4R73A 1L5TA 4K3FA 1PB7A 2A5SA 4PFTA 4DIGA 2DXRA 3BFUA 4E0XA 1JEVA 3FASA 2F6PA 3TPAA 4F2OA 2H99A 1XT8A 3PU5A 3OMBA 1H44A 2I3WA 4C1UA 2UVIA 1ZMGA 4H65A 5KCJA 3FXQA 4X48A 1B58A 4KD5A 3TDJA 3VLWA 3N6UA 1B4ZA 3CRBA 3M3FA 4TOZA 4FORA 2RCBA 1J1NA 4DXUA 4Z7EA 2IEEA 2H5YA 4DZ1A 4THIA 3MPLA 1PDAA 1AIVA 4NEDA 1D4NA 3MPKA 3OXNA 5TU0A 1H45A 2O51A 5H8QA 4PE5B 2B65A 4UA8A 2G29A 5AA1A 2R9JA 5TPAA 2QPQA 1MXZA 3B6TA 4XTCQ 2V84A 1Y4CA 4M4GA 3H3GA 3RPWA 1OMPA 4IGTA 4LATA 3U92A 1B7ZA 3RNNA 1N7WA 2VOZA 3THIA 3L6GA 1XHYA 4QFOA 1H43A 3U94A 4NWCA 1Q35A 3S2VA 3DP4A 1WDNA 2HZLA 2QRYA 3A09A 4FEDA 1ATGA 4NF4A 1QUJA 4EUOA 4NF8A 2I48A 5J1DA 1AMFA 3FJMA 4U2RA 1LCTA 2PBWA 2OLBA 3E13X 4WEPA 2O69A 1NH8A 5I2KB 1B5HA 5ICTA 4AQ4A 2I6EA 4OFOA 4ECFA 2VHAA 1BP5A 1I6BA 5I59A 2I49A 3T22A 4IO6A 1Y1MA 1EZOA 1QUIA 2NOOA 1SDXA 4LZ7A 1YAEA 3H4ZA 5CMMA 3KGCA 3IORA 1GV8A 5AE4A 1R6ZA 3MUQA 1I69A 1MDQA 3DP8A 2Z23A 3MZBA 4WXJA 4KCDA 3HSTA 1SI1A 3QUFA 3IB1A 3S9NC 2Z22A 4RXLA 2XXIA 3CSGA 3IB0A 2NUVA 3G7WA 1MPBA 2ALUA 5EHSA 1ZBMA 2CMOA 2B3FA 4G68B 3OOAA 3C34A 2O1LA 3PUYE 5CI5A 3LSXA 1QVSA 4H0WA 5CC2A 3UN6A 3VVEA 2ZNUA 3MVXA 3V8XB 3K01A 4F2QA 1B3HA 1BTJA 2DVCA 3EHSA 2ZYKA 4PETA 1NL5A 2XXQA 3ILUB 1B52A 3TCHA 4ESXA 1N3XA 3OO6A 4OTEA 3VVFA 1LAXA 3T96B 3SERA 3HPIA 3K2DA 3VV5A 4GXSB 4LQ5A 4G4PA 1BKAA 4N13A 4ZS9A 3TTMA 3FZVA 3HHGA 4QFPA 1GGGA 5A5XA 3TZAA 3TQWA 1LFGA 2F78A 3PPOA 4ISUA 3FUZA 4ZEBA 1Y3NA 1B3FA 2PX1A 1B3EA 5DVFA 4R6HA 4OFLA 4F19A 5I84A 1OLAA 4FE8A 4JSDA 1QJMA 3LUYA 1DMBA 5HPQA 3PD8A 1OVBA 2DS9A 2XHDA 4GLIA 4I9DA 1DTZA 1R1NA 1LBBA 2HXWA 4DXBA 1R9LA 2Y7PA 3ODBA 2QMXA 3B6WA 1N0TA 4ZECA 5I2KA 2XX9A 3K1NA 4I8CA 1Z7ME 1LLSA 4QSEA 5KDTA 3W15C 2OCUA 2UXAA 3V89B 2F5XA 4YKJA 3HV1A 2I3VA 2ZYOA 1A7LA 2ZYNA 5FHNA 5AA4B 1B4HA 3IJOB 3MC2A 3FVOA 5L9MA 1NFTA 1PEBA 4R72A 3PUVE 1IZ1A 3DELB 4Q30B 4P11A 2V25A 3ONMA 4I1DA 3MP1A 4QFKA 4QSDA 1DTGA 1FW0A 4L17A 4H1XA 1B3GA 3RLFE 3TAJA 3GLBA 5AA3A 1GTKA 1PC3A 2FA7A 2I58A 3IAZA 2GRVA 1HSLA 3TEPA 3O9PA 4KYDA 1M5FA 1VR5A 2PYYA 3SDFA 1B7HA 4NE4A 4OQOA 3K6UA 2I4CA 1B0LA 2F8DA 4GOTA 3O29A 4G2ZA 3KN7A 1B7UA 4KQPA 4QFNA 5K2XA 4GL0A 2XXRA 2DWHA 4NMYA 2Z8FA 3TTRA 1EU8A 1MXYA 2UVGA 2QMWA 2CZLA 5L9SA 3EF7A 4ZDMA 3QYTA 3UORA 3C32A 1JVXA 3N6TA 3E3KA 1USYE 1RYOA 3IL1B 4BDMA 2Q8JA 1MY2A 1TWYA 3LC8A 3IK6B 4YB6A 4FIMA 4OMBA 1BIYA 4NF5B 1SQYA 3K6VA 3RN8A 2W7YA 1SW2A 4ZEIA 5HM4B 1B2HA 3FATA 3OO7A 3KJTA 5ITPA 3FGSA 1VE4A 4KHZE 4YZZA 4OERA 3KFMA 3CSBA 2Q2AA 4FEBA 1LB8A 4QFLA 2DWAA 3SEWA 3U72A 2I0BA 1NKXA 1MH4A 2P2AA 1VFDA 3M3LA 1MXUA 5AA4A 3TMGA 3TYHA 1TFDA 1N04A 4LUBA 3IOTA 5AA2D 4GWOA 3ILTB 4FECA 4IGRA 1MM7A 4DXCA 4KFQA 4IO5A 2X26A 4TLLB 2GFEA 2Y7RA 1POY1 1URGA 3OELA 1WODA 4LONB 2O7IA 3RY3A 3UK4A 2NXOA 4Q5TA 4UACA 2OK2A 3K0VA 4FAJA 2XD3A 3KG2A 1SYHA 3C31A 1B0HA 3DM0A 3C33A 2WKYA 4POWA 2HQ0A 3O28A 3IOUA 4G68C 5I59B 3N5LA 3Q28A 2DYXA 4XXUA 4H8IA 1B51A 4GIZA 3HO7A 2E0SA 4MF3A 2DWJA 4PFYA 4YMBA 2RC7A 3CFZA 3KN3A 5AA2B 2XXUA 2DXYA 1PBPA 4R6YA 1DPEA 5FTHA 2XXWA 4U23A 4JXIA 2R71A 1WVJA 1M5DA 4JDFA 3OEKA 1URDA 1NNKA 1JNFA 3U8QA 4LVQA 3O6IA 5JEIA 3O66A 1QW0A 1Y20A 4PQJA 2XXPA 4WKMA 2UVJA 3TKDA 4NF5A 4P0GA 4IY6A 4XKRA 5K2YA 1FQEA 4FATA 1A8FA 1D3KA 4H5FA 3CFLA 3IO6A 3HHFA 4C1TA 2ANJA 2F7CA 2NVUB 4PFUA 1QUKA 2LAOA 4EQ9A 1B46A 2PMSA 1I6AA 4HCWA 4ZE8A 3KJ7A 1Z7NE 4ZEKA 2ZMBA 1RKMA 5CBSA 2H4IA 3VLUA 1LAHE 1FTLA 3TTKA 3G3FA 3LSFB 5A5XB 3SESA 2OJTA 1GR2A 2RCAA 3GZGA 5I56B 3T9VA 3PUZE 4KI0E 4PFWA 2Y84A 4GF8A 3VLVA 3C36A 5JK4A 5L8DA 4BDQA 1HSJA 3IJXB 2Z8DA 4U22A 4R2BA 1N7XA 3EHTA 3SEXA 1LSTA 4IO3A 3Q27A 1SBPA 5KDTB 4OZ9A 4O3BA 3OSRA 3DP6A 4NTLA 1R9QA 1JW4A 3MWBA 1N84A 4R2FA 2DWIA 5AA2A 1JQFA 1MPDA 3IOWA 1QKAA 1OLCA 2AL4A 4ONYA 4YKPA 4BDRA 1LAGE 5CM6A 2GH9A 4DE8A 3K6XA 1LGBC 3EQ1A 3G3KA 3Q26A 3H6WA 1ZLQA 3SEYA 3FD3A 3QUJA 4N6PA 2F7AA 1MY3A 2V3QA 2V3TA 1TFAA 2DSFA 4HCYA 1SW1A 2ZYMA 2XXTA 1DSNA 3G3GA 2HEUA 5KZTA 2Y7WA 1B9JA 4F39A 4XKPA 3MQ9A 1B6HA 2REGA 1SW5A 3V5AA 2X7PA 5IAIA 1MS7A 1S7YA 1LCFA 3KBRA 2HCAA 1MH3A 4H5GA 2A5TB 3ZKLA 4LZ8A 1NH7A 1RYXA 4JBZA 3G3IA 1MQHA 3UP9A 4F3PA 1OQHA 2UYEA 4KYEA 4RJZA 4RK9A 1EH3A 4G8MA 3KSXA 5I56A 4Q8RA 4GXAA 1Y9UA 2PT2A 5FHOA 1AH5A 1B5JA 4TQUQ 5BUUA 1US4A 3PPRA 1A99A 4H6DA 1I6QA 3TCFA 3ZKKA 1OQGA 4N07A 1MRPA 1MY0A 4OHNA 2YPNA 2B3BA 2ONKE 3JYRA 4ELRA 1OVTA 1XVXA 2F35A 2P1SA 1VFEA 5DT6A 1D9YA 1MDP1 3H6VA 2VD3A 3H6TA 4GFRA 3IR1A 5CMCA 3MVZA 1PB9A 4YKIA 4XKQA 1DOTA 3MZ9A 1D9VA 3K4UA 1US5A 2Q9TA 3T66A 3E9XA 3CG3A 4GVOA 3KZGA 4G8NA 2RINA 4BLAA 3V83A 5I57B 3IX1A 1SYIA 5I2NB 3T9XB 1IXIA 3OO9A 4EF1A 3LR1A 3TFLA 2VP1A 1BLFA 2XD2A 4BDNA 3H6UA 2XXYA 3RQTA 4F3BA 1B05A 3VDFA 3UIFA 2UYFA 2QJEA 1MXVA 2QS3A 4WEDA 4ZEFA 3C35A 3IO4A 2A5TA 3C4MA 2F7BA 3FIRA 2ABHA 1B1HA 2PT1A 5B7DA 1FQCA 3F11A 4YU0A 1B40A 2G93A 1SVXB 2RKMA 3K1PA 1M5EA 3ECRA 4R9FA 4XKNA 2V93A 4ELPA 3FXUA 1MXWA 5CBRA 2HFBA 1B1XA 3VXCA 3FVNA 2Z8EA 1DPPA 5F7VA 4U1ZA 4OWDA 1VSOA 4OXVA 1P1OA 2O1MA 3U93A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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