3EN3A

Crystal structure of the glur4 ligand-binding domain in complex with kainate
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRTTAEGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYTEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEAGVLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 4,Glutamate receptor
publication title Correlating AMPA receptor activation and cleft closure across subunits: crystal structures of the GluR4 ligand-binding domain in complex with full and partial agonists
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3en3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3en3A02
3TELA 5I57B 4EXKA 3BKIB 2Y7IA 5DEXB 3PV0E 2FNCA 4EUOA 1LFHA 5ISUA 3WAEA 4OEUA 2ANJA 3O9PA 3CG3A 3K6XA 1J1NA 3N5LA 2O68A 1UTBA 1Y3NA 2RINA 4JB7A 1B7ZA 4GIZA 1LBBA 3Q29A 1QULA 1GV8A 4NF5A 3C32A 2I58A 3FVOA 5CRYA 4F29A 2XX8A 3OO8A 2Z8FA 2QS3A 1DSNA 4POWA 1SI1A 3EN3A 3O6IA 4OFLA 2REGA 5KCJA 3VE1B 4RXLA 1MQJA 2NWJA 4XKNA 2B65A 2Y84A 1AOVA 3TFLA 4ZEIA 1MXYA 3MC2A 1NL5A 3KZGA 1BP5A 1IXGA 4KYEA 2E0SA 1JEUA 2X7QA 1D9VA 5I58B 4G68A 3S4UA 3Q27A 1MY2A 4PFWA 2XX7A 2F35A 3FZVA 4MLVA 3IORA 4PFUA 3UA8A 1P1QA 5EYFA 3ECRA 3C35A 2BJJX 1WDNA 4EQ9A 3M8UA 1A55A 3N26A 1B2HA 1M5BA 3VVFA 4NWCA 3SESA 2XD3A 3TTLA 3IO6A 5F7VA 3A3UA 5I2KB 1UIVA 1Y1ZA 2QMXA 3EHSA 2O51A 4R9FA 1MRPA 3IR1A 4BDMA 5AA2A 1CE2A 3KG2A 2DXRA 3B6TA 3ZS6A 2ZNSA 1BLFA 1NNTA 3KSJA 2HZKA 2ALUA 2XXXA 3FXRA 4QF9A 1AIVA 3I3VA 3HCQA 1M5FA 2IA4A 3ONMA 4QRZA 1S7YA 2QRYA 3V5AA 4THIA 3QIMA 4HS7A 4Q8RA 1FQEA 3EF7A 3H6VA 5EHSA 1MY3A 5TP9A 3D4CA 3K0VA 5L9OA 3RPWA 3K1NA 1VSOA 4TLLB 3KJ7A 2KLFA 2VOZA 3PUXE 1AH5A 4MH5A 1Y4CA 3FUZA 4F1UA 5B7DA 2XXYA 1B3FA 4ESXA 4M1VA 4C1TA 3EQ1A 3G3GA 1NH7A 1M5DA 5LOMA 4NF6B 5H8SA 1B32A 1ZJLA 3TODA 2REJA 4OZ9A 1Y1MA 5H8NA 3QSLA 4RJZA 1P1WA 1B5IA 1BTJA 4E0XA 3M3KA 1MQGA 2HAVA 3OD7A 5AE4A 5I2NA 1F9BA 5AA1A 2I6EA 4I62A 4AB5A 1DOTA 1FTKA 2XXHA 3O66A 3GZGA 3G3IA 4JWOA 3C9HA 1QW0A 3RUMA 3T96B 2A5SA 3A09A 4XXUA 1B0HA 1TFDA 1B9JA 3OO7A 3IO4A 3T9UA 3EHTA 1PBPA 3BFUA 1D3KA 1XS5A 3TCGA 2DXYA 1GR2A 1B7HA 2I0BA 1MPDA 2F34A 2I4CA 4LUBA 3VXCA 3EHUA 4RNSA 2FYIA 4KCCA 1JW1A 4NE4A 4GWOA 4YB6A 3T9VA 2RCAA 1O64A 3PPPA 4F39A 1IXHA 1SBPA 4O3CA 4K3FA 3D4GA 2DWJA 3N6UA 4GFRA 3MQ9A 3S9NC 4R73A 4ZZEA 5I56A 3T22A 1PEBA 3U72A 2Z8EA 3M3LA 5DVFA 1SYHA 2XXWA 3CSBA 3OO9A 5FHOA 3TAJA 4H1XA 3HHGA 2GRVA 2PYYA 2VGQA 1WODA 1B05A 5JK4A 3IOTA 4YAHX 4GD5A 1B3EA 1PBQA 1I6QA 4FE8A 4GXSB 1IXCA 3CRBA 2OJTA 3MWBA 1RYXA 3KBRA 1ZMGA 3DP4A 2QS4A 3ZKKA 4IGRA 4ZZAA 3LSXA 3MZ9A 1JVYA 4I1DA 1DTZA 1OMPA 5TU0A 5ELVA 1P99A 2ONKE 3HO7A 3T93B 3OXNA 4IO7A 4QFOA 2D3IA 3LBSA 1Y4TA 3B7DA 2XHDA 5FTIA 1RKMA 1MH3A 1YTVA 3S9MC 3SEWA 1Q1KA 2PT2A 2WKYA 2V84A 1OIBA 3PD9A 1MY4A 2AL4A 3MW0A 2VD2A 4U21A 4U1OA 3CR9A 3IL1B 4YKIA 3SEXA 4F1YA 3JYRA 1II5A 2Y7PA 3ILTB 1H45A 4C0RA 5H8QA 1GVCA 4BDNA 5CBRA 3E13X 4RA1A 1Y3PA 2HEUA 3IB2A 1M5EA 1NH8A 5L8DA 4F3PA 4I9DA 4OENA 2AL5A 2HFBA 3USDA 3VFJA 2DQVA 4AQ4A 1IUDA 2V3TA 3TTNA 5JTYA 1M5CA 1JW4A 3FGSA 3SETA 1NFTA 4QSDA 1FQFA 2PT1A 3TCFA 2V3QA 3PMXA 2Q88A 2OWSA 3IJXB 4RYAA 4WXJA 5HM4B 4NMYA 4F19A 4NF8A 4MBPA 3VVEA 1TXFA 5ITOA 5TPAB 3RY3A 2QL3A 4PFYA 4ZEKA 5DVIA 4OFOA 3LC8A 2O6AA 4MFIA 4EQ7A 3TDJA 1B46A 1SYIA 1HSJA 3IAZA 3CG1A 4F3SA 4RPNA 1Z7NE 1JEVA 4ZEBA 5BWJA 3FXQA 2ZYNA 5L9SA 3S9LC 3KJTA 1FQBA 2GHAA 1FTJA 1LB9A 1LAXA 5H8FA 3CFZA 3MZ1A 3DELB 3AXFA 3K2DA 2CZLA 4KI0E 2DWHA 5A5XA 4KQPA 1GGGA 3FASA 3ZSFA 5AA4B 4GLIA 3OSRA 2F7BA 4F2QA 1XT8A 5IKBA 1PDAA 1LBCA 1H43A 4G4PA 4EDPA 4P11A 3L6HA 3PMVA 4U4XA 4ZE9A 1PB9A 1JNFA 3Q25A 1EZPA 4FORA 4QSEA 2OBGA 1N04A 4ZEFA 3U1OA 1N7WA 4R6KA 2RC9A 3P7IA 4YB5A 3G3HA 3ZKLA 5I59A 3G7WA 1D9YA 3TUSA 3THIA 4X1BA 4QFKA 3KOTA 1MDQA 3H6UA 4DCYA 1QVSA 2LAOA 1FCKA 2P1SA 4H8JA 3H03A 3VLVA 4YU0A 3I6VA 3TKDA 3PU5A 1IZ1A 4H0WA 3TYHA 3ODBA 4OEVA 4LZ5A 5DYHA 1BIYA 1OQHA 5JTYB 3PD8A 1R1NA 3K01A 4E0WA 1MQIA 2ZXTA 4G8NA 3MPLA 1ZTYA 5ICTA 2O7UA 3FVNA 2Q2CA 5H8HB 4TOZA 4DLDA 3U8QA 3MVWA 4PETA 2OK2A 4NF8B 3UP9A 1ZKBA 3HPIA 3FIRA 1MPCA 3OENA 5KDTB 1SD3A 3RQTA 4YICA 5DVJA 1B51A 4F31B 3MP8A 3CI8A 3FV1A 1A8EA 1SI0A 1ANFA 3FVKA 5K2YA 1B4ZA 3UORA 2YPNA 4OYVA 3IB0A 2O69A 4HCWA 4I8CA 4H5GA 3TTMA 1SW4A 5H8FB 2GHBA 3PUVE 1PB7A 1ZLQA 2A5TA 3TTRA 4AB6A 4XKQA 5A5XB 1QUJA 3MBPA 4XKPA 3K6WA 3QXMA 3O28A 4JWYA 1MH4A 5HBCA 1US4A 2RCBA 1UTBB 3LR1A 3MZBA 2XXIA 1RYOA 5M2VA 3IJOB 4QHQA 2V3UA 3GXAA 2Z23A 3FD3A 4OERA 1EZOA 2RF1A 2DWIA 4NF5B 4OXVA 1UTHA 1SQYA 3G3KA 1OVBA 3TCHA 1PB8A 3U93A 1Y9UA 4LA9A 1MY0A 2UYEA 2D21A 2ZYMA 4KFQA 2PMSA 3FJ7A 4U4SA 3HSTA 5KCJB 4NF4A 4LONB 1S50A 5BUUA 3HV1A 3B6WA 5AA3A 5CMBA 3FATA 4F2OA 4MF3A 3E4RA 5CI5A 3TQLA 5JEIA 3UN6A 1MY1A 1B5HA 3SEYA 5B70A 4C1UA 1OLAA 4G68B 2XXPA 4KPTA 5CMKA 3OMBA 3GBAA 4DXCA 1B3GA 3PUWE 2R6GE 2QS2A 4QFLA 2HAUA 3E3KA 1CB6A 2O84X 2VD3A 4PP0A 2F36A 4RK2A 4UACA 2RC7A 3DM0A 1MM7A 2Q89A 2UYFA 2H9BA 2M8CA 3UGWA 4ECFA 3GBBA 3PPQA 2I0CA 4P0IA 4X9TA 1SDXA 3V89B 3R7XA 1B52A 4IO3A 4DE8A 4JSOA 1XC1A 5IAIA 2RC8A 4RPOA 2UVIA 1P1NA 4ISUA 1KWHA 3PUZE 5AA2B 1XHYA 3MJNA 1BKAA 4PQJA 4IB2A 2QPQA 3SKPA 4ZECA 3FV2A 3OO6A 4FIMA 3VV5A 4DCXA 2O1MA 2VHAA 3A3CA 1L5TA 4NTLA 5TP9B 2R9JA 1SW5A 2Y7KA 3I5OA 2G93A 4WEDA 2F6PA 3K02A 4YMAA 3SERA 5I57A 3C31A 4X48A 1IXIA 4QFNA 1N3XA 1SW1A 3VXBA 5HPQA 2XXQA 3IX1A 2PX1A 4GVOA 3TPAA 1LSTA 5H8NB 1R6ZA 3N6TA 3Q26A 1MPBA 3O6HA 1LB8A 4R6HA 3TMGA 1UTHB 3RGYA 4OTEA 1AMFA 3UIFA 4KD5A 4PFTA 3CIJA 5I2NB 3T9HB 1FQCA 2YLNA 4G68C 1MM6A 3U94A 4X1DA 2ZYKA 2F6GA 1UQWA 1H76A 4RK9A 4NEDA 2NUVA 4PE5B 1I6BA 1HSLA 3FJGA 5CBSA 3EPEA 1HSEA 1YPNA 2W7YA 4HCYA 5I58A 4ELQA 4U23A 1LFIA 2FA7A 3K1PA 1VFDA 3OEKA 1OVTA 2XX9A 2B3FA 1YAEA 2I3VA 1USYE 2HCAA 2I48A 4H65A 3RLFE 1N0TA 3MAMA 2DS9A 4DXUA 1JVXA 3PMWA 1EU8A 1NNKA 4GQOA 2DVCA 1S9TA 5I56B 1O7TA 1A7LA 4F3BA 3FVGA 4OESA 1N84A 4YMBA 2QJEA 4OQOA 4GXAA 1H3DA 5I84A 5AA2D 2DVZA 2Z22A 4MLQA 1IIWA 1I69A 4P0GA 3KEIA 3RT6B 1A99A 2HZLA 1Q35A 3IB1A 3DP8A 3LSWA 3WAFA 3E9XA 5CM6A 3RNNA 2ABHA 3JZJA 1A8FA 1Z7ME 4NWDA 1MQDA 1OQGA 2ESNA 3L6GA 3M3FA 4HTGA 1QJMA 4DIGA 2X26A 3O97A 4H6DA 1SVXB 4TLMB 2Z8DA 3MVZA 3T9XB 4R2FA 3IK6B 1ZU0A 3PGFA 2P0SA 4YKPA 3Q28A 3K6UA 1NKXA 3G3JA 1O63A 4JSDA 1MXUA 1DPEA 2H99A 4NF6A 4OMBA 2PBWA 1LFGA 4Q5TA 2E1SA 2QSXA 4LP2B 4XIGQ 3LUYA 4ZDMA 1QUIA 2R71A 4GF8A 4GOTA 2PVUA 3DLNA 5H8QB 3DP6A 4ELPA 3H4ZA 2XXTA 1B5JA 4R74A 2DOJA 2XD2A 3K1MA 3K00A 1JW5A 4F18A 3H06B 1H44A 1I6AA 2UVHA 1LLSA 1DMBA 1MXWA 2F97A 4U22A 4DDDA 1R9LA 4O3BA 3TQWA 4BDOA 1MXVA 1ZIUA 3H6TA 4H67A 5K2XA 4LATA 4ZE8A 1MXZA 5ICQA 4IO5A 3H6WA 1SW2A 4LQ5A 4YB7A 2H4IA 2Y7WA 5KZTA 3G3FA 3W9VA 1VE4A 1QKAA 4FECA 2H5YA 1JETA 2DE3A 3FJMA 3BBRA 4YKJA 2HXWA 4N07A 3R6UA 2D5WA 3RTWB 4FATA 2RKMA 1LAHE 4O3AA 5J1DA 1FTLA 4GRKA 2UVJA 3T66A 2I4BA 3V8XB 2ZYOA 4GL8A 4BDLA 2UVGA 3S2VA 1IITA 4KR5A 1T0KA 1FW0A 4OHNA 1OLCA 1B6HA 3C36A 2Y7RA 3KOSA 4R6YA 3C4MA 4U2RA 1P1UA 2P2AA 2DP8A 5CC2A 3FXUA 2DE4A 3PPRA 3VDFA 4Z7EA 4F3GA 1Y20A 1B3HA 1YCJA 4M4GA 3OOAA 2V93A 3LSLA 4EF1A 1UIUA 3CSGA 4L17A 1TFAA 2QMWA 1ZBMA 1MQHA 3CFLA 4ONYA 1URDA 1N3WA 1B7UA 2H98A 4UA8A 3BFTA 3N94A 1R9QA 2OLBA 3O29A 3OELA 1NNFA 1FTMA 1LCTA 4KYDA 5FTHA 4EXLA 1IEJA 3PPNA 3V83A 1MS7A 3B6QA 4ZEDA 3CFXA 1B1HA 5I59B 4ESWA 1B40A 3KN8A 2GFEA 3RT8A 4IO4A 4R72A 2NOOA 4KCDA 4N13A 3S9EA 3KFMA 4JBZA 2OCUA 1MXXA 1TT1A 4R2BA 3QK6A 4RY1A 1FQAA 2NXOA 1P1OA 1B0LA 4Z0IA 4IO6A 5FHNA 4IY6A 4F1VA 4R9GA 1URGA 2DSFA 4H5FA 1WVJA 2Q2AA 3PPOA 4EQBA 3W9WA 3IOWA 2F7AA 4POXA 1B4HA 3KN7A 4QSCA 3ILUB 5FHMA 5TPAA 1JQFA 1FTOA 3JV9A 4G77A 3H3GA 4FAJA 2ONSA 4IO2A 3MP1A 4G8MA 1US5A 4JDFA 1POTA 2I3WA 4YZZA 3MVYA 4KHZE 4G2ZA 2I49A 3CVGA 3KSXA 3LSFB 4LZ7A 2UXAA 2ZNUA 1A54A 2GH9A 2VP1A 4ELRA 1TWYA 1POY1 3KGCA 3R26A 1N7XA 1USYH 1LCFA 2XXVA 3VVDA 1PC3A 4JXIA 1LAFE 1EH3A 3GLBA 2A5TB 3MUQA 1MG1A 3QAXA 5DEXA 4DXBA 4G8HA 4LVQA 3H7MA 4WKMA 3IOUA 4H8IA 3MVXA 1N76A 2YJPA 2OWTA 4LZ8A 4BDQA 5AA4A 2AIXA 2NVUB 3F11A 2ZMBA 2OZZA 4OFJA 4OVJA 1LGBC 4QFPA 3OEMA 5EHMA 1A40A 1Y3QA 4BLAA 1LAGE 4TQUQ 1MDP1 1XVYA 2CMOA 2AYSA 2DWAA 4ZS9A 4XKRA 1XOCA 4NF4B 4FEBA 4YKKA 1AL3A 2DYXA 2DE2A 4Q0CA 3SEVA 4Q30B 4IY5A 4FJPA 4WEPA 3IOVA 1B58A 4KYSA 5F1QA 2ZNTA 1EZ9A 2HQ0A 5ITPA 4U1ZA 3RTFB 4LQ2A 4HW8A 2G29A 2X7PA 1FQDA 4R75A 1VFEA 3C33A 1NMUA 4OWDA 4ND9A 3O2AA 4GL0A 4XTCQ 4ELOA 2O1LA 5L9MA 1ELJA 3MPKA 3TEPA 1GTKA 4IGTA 2F5XA 2F8DA 3QUJA 1NNPA 3O6GA 2ONRA 2O7IA 5H8HA 1B1XA 1QKBA 3QYTA 2Q9TA 5I2KA 1XVXA 2QS1A 3W15C 3PUYE 3RN8A 1DPPA 5DT6A 3MP6A 4EF2A 3QUFA 3KN3A 3SEUA 1VR5A 4N6PA 1DTGA 2B3BA 2H25A 3UK4A 5KDTA 2XXRA 3OSQA 5CMMA 2V25A 2XXUA 3VLWA 1D4NA 1QUKA 4F22A 2Q8JA 3U92A 4DZ1A 3VLUA 3C34A 2THIA 4BDRA 1URSA 1B3LA 2F78A 3K6VA 5CMCA 4OETA 3TZAA 1IQ7A 3HHFA 1ATGA 4JWXA 2F7CA 2IEEA 3TTKA 3K4UA 5DTBA 4FEDA 3SDFA 3HN0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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