3EN3A

Crystal structure of the glur4 ligand-binding domain in complex with kainate
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRTTAEGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYTEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEAGVLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Correlating AMPA receptor activation and cleft closure across subunits: crystal structures of the GluR4 ligand-binding domain in complex with full and partial agonists
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 4,Glutamate receptor
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3en3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3en3A02
3TZAA 2DE4A 4POXA 3SEVA 1SVXB 1Y3NA 3H6VA 2NUVA 4OTEA 3E4RA 3T93B 5AA4B 1USYE 3CI8A 3BKIB 4JB7A 3CIJA 1MXVA 1B3EA 2OBGA 5HPQA 1N3WA 2XX9A 3PUVE 1MY0A 4EQ9A 2ZNTA 3LBSA 4NF8A 4O3BA 5CMCA 3GXAA 1LB9A 3KEIA 3QYTA 3C36A 1B4HA 4C1UA 1TXFA 1LSTA 3G3JA 2UVIA 4WKMA 3TODA 2XXVA 4KPTA 5TP9A 1BTJA 1EU8A 4QFOA 1YTVA 3IORA 4ZEBA 4IB2A 1MQIA 4OFOA 3D4CA 2O7IA 4YB7A 5CI5A 5CBRA 4LQ5A 2V3TA 1IEJA 4H5GA 3ECRA 3I6VA 3TUSA 3H3GA 1NH8A 3EHSA 4DE8A 1GV8A 1SD3A 4FEDA 4YKKA 4IGRA 1B5HA 1JNFA 3HHFA 4E0WA 1LFHA 5TU0A 4L17A 5EHSA 2XXYA 3K6UA 3TCGA 3IO4A 1Y3QA 1URSA 2QS1A 3MC2A 3CSBA 2VD3A 1LGBC 4OVJA 1IIWA 3O9PA 4BDNA 4Q5TA 3Q25A 1DSNA 3MZBA 3S9NC 2G29A 1VE4A 4POWA 5J1DA 3TTLA 1PC3A 1B52A 1BLFA 4R6YA 4OHNA 3OEKA 4X9TA 1FW0A 2ANJA 3M3KA 1MDQA 3G3FA 4YICA 2XD3A 3RUMA 2GFEA 5ELVA 1PB9A 3I3VA 2R6GE 4LONB 1XT8A 1DOTA 4F3BA 3KZGA 4JDFA 3E13X 2XD2A 1OLCA 3WAEA 1B3LA 4IO7A 4PE5B 1AOVA 1FQDA 3PU5A 1NKXA 4G8MA 2LAOA 1FCKA 1EH3A 1VFDA 4EXKA 4OETA 1L5TA 1N7WA 1RYXA 2ZNUA 3HSTA 3W9WA 1NFTA 5H8FB 5L9SA 4NF4B 3IOVA 3O97A 4NF5B 1FQCA 2RF1A 1FTLA 3CR9A 4GF8A 2AIXA 4G4PA 2XXWA 2VOZA 4ZS9A 5FTHA 3QIMA 3MVZA 1DTGA 4IO4A 3T9HB 4WEPA 1M5CA 1B58A 3FD3A 4QF9A 4I1DA 4G68A 1MQHA 4OFLA 2XX8A 1MXXA 2GRVA 3RPWA 3MP6A 4H6DA 2DP8A 4UACA 4QSCA 5CRYA 3PPPA 3TCFA 3QXMA 3V83A 4KCCA 3ILUB 1Y1MA 3A3UA 4NE4A 5KZTA 4JSOA 5DEXB 3KJ7A 4YU0A 1PDAA 2H5YA 4GWOA 5JTYB 5IAIA 2D3IA 3E3KA 3CVGA 3H6WA 1ZJLA 3EPEA 5CBSA 5I2KA 3C35A 2PMSA 1HSEA 5CMBA 4GD5A 3C33A 1I6AA 1JEUA 4BDMA 4EQBA 3Q29A 3VVEA 3CSGA 4FAJA 2O69A 2WKYA 3FVOA 2ZYNA 4WXJA 5I58A 3IOTA 1LBBA 1PEBA 5CMKA 3UIFA 3K0VA 3KOTA 4RPOA 3C31A 3U1OA 2F7AA 3IJXB 2NWJA 4EXLA 1PBPA 4QSDA 1LLSA 4RJZA 4P0IA 4QFPA 4AB6A 2A5TA 3G3GA 3ODBA 3F11A 3PMWA 1WODA 1D9YA 1OLAA 3SDFA 2XX7A 4NF6B 4ZZAA 3OO8A 3LR1A 1II5A 4DXUA 4F1YA 4F1UA 1Y20A 4ISUA 1IUDA 2O84X 3FVGA 1LB8A 4KI0E 4MBPA 2DS9A 4R2FA 5H8HB 3IB0A 3KG2A 1B7UA 4KQPA 2GHBA 1QW0A 3T9UA 2V84A 2V93A 4DXBA 2OWSA 3T9XB 3ZSFA 2X7QA 4TQUQ 4JWXA 3USDA 1PBQA 3UA8A 1UTHB 4YZZA 3V89B 2ONKE 3CG3A 1MY4A 1XOCA 4YKJA 1IZ1A 2V3UA 2F6PA 2QS3A 3MUQA 4C1TA 3PUYE 5K2YA 3PUWE 2FA7A 5ITOA 1M5FA 2XXTA 3JYRA 1VSOA 5TPAA 4GRKA 4EQ7A 4OEVA 5DVFA 1P1UA 5I56B 2I58A 3PV0E 3HHGA 1P1QA 3PPQA 4EUOA 4U4XA 3RT6B 1RYOA 2IEEA 3I5OA 5FTIA 4QSEA 3TFLA 4ZDMA 1Y3PA 1MXUA 3S9MC 2F36A 2NOOA 2UXAA 4R9GA 1FQBA 4YB5A 3CFLA 3RT8A 4JWYA 2DWHA 4LQ2A 1OMPA 3A09A 3HCQA 2Z8FA 5M2VA 3KN7A 5B7DA 2XHDA 3W15C 3IX1A 3FV2A 1N84A 1R9LA 4NMYA 4U21A 5ICTA 5I2NA 3U93A 5BUUA 3DP4A 4DXCA 2O7UA 4F3SA 1Q35A 4KD5A 2R9JA 1EZPA 4OMBA 1ZMGA 4Q0CA 4M1VA 2HFBA 2QMWA 4F29A 1SW2A 4ECFA 5K2XA 2DXRA 3RY3A 2I49A 4OZ9A 1ZKBA 4RXLA 3H03A 4HTGA 3HPIA 3TQWA 3OENA 4LATA 2O6AA 1I6QA 1B1XA 3HV1A 2I0CA 3T22A 4G68C 3L6HA 1O64A 4C0RA 3TELA 2D5WA 5I84A 3TDJA 2AL4A 4U2RA 3MVYA 4PETA 3GBAA 3M3FA 1QVSA 1B3GA 2QRYA 1MY3A 1MH3A 4LP2B 1BP5A 1B1HA 5EHMA 3U72A 4ELQA 5H8NB 1S9TA 1OIBA 4H8IA 4I62A 4PFYA 1B0LA 1BKAA 2DVZA 1M5DA 4QFNA 4F18A 2UYEA 4U1ZA 2O1MA 3WAFA 1MPCA 4H8JA 2QL3A 2Y7IA 2Q89A 4G8NA 2PT2A 3MWBA 1F9BA 1NL5A 1A8EA 1J1NA 1P1WA 3OO9A 1ZIUA 2F78A 2O51A 3OOAA 2G93A 4DIGA 3SEXA 4XIGQ 4WEDA 1LAXA 1POTA 1URDA 2I6EA 1SYHA 4HW8A 3KOSA 3K6XA 3OXNA 1A8FA 1UTBB 1VR5A 2YPNA 3KBRA 3TTMA 2Z23A 4LUBA 4F1VA 3C32A 5I58B 4X1DA 4RPNA 1MS7A 1D9VA 4R6KA 1XS5A 4U23A 4JXIA 3TTKA 3DELB 3H6TA 1N7XA 3A3CA 4OXVA 2GHAA 1Z7NE 2O68A 3LSLA 3O6GA 1NNKA 1NNFA 2A5TB 2F97A 4PFTA 4XXUA 2E1SA 5DVIA 3PPNA 1AL3A 5KCJA 3P7IA 3B6QA 3OSQA 3G3IA 3RNNA 3RTFB 4G8HA 4MLQA 3VV5A 3O66A 3K6VA 4ELRA 3EF7A 5KDTB 1IITA 1Y4CA 1JW5A 3TTRA 1LAGE 5AE4A 3PD8A 3M3LA 3VXCA 2PBWA 1YPNA 2ZMBA 1MQJA 1IXCA 1A40A 1B3FA 1DTZA 5I59A 3S2VA 4LZ5A 1P99A 5B70A 4G2ZA 2F6GA 3ZKLA 4NWDA 1H76A 3ONMA 4EF2A 2I3VA 3IB1A 2V3QA 4XKRA 4U1OA 1LFGA 1HSJA 3TQLA 4GL8A 2X7PA 4Z0IA 3CG1A 5AA1A 5AA4A 4ZEKA 1XVXA 2QJEA 3O6HA 4XKNA 1D3KA 2DWAA 4RA1A 3TPAA 2PX1A 3MAMA 1T0KA 1B7HA 3JV9A 2NXOA 2RINA 4MFIA 1AH5A 2XXQA 3N5LA 1JW1A 4ND9A 2Y7WA 5I57B 1BIYA 3M8UA 2YLNA 4ONYA 2DSFA 3S9EA 3O6IA 2YJPA 2F8DA 1AMFA 4IO6A 3THIA 5EYFA 3FATA 3K6WA 4JWOA 2DYXA 5DYHA 2B3BA 1XVYA 3IOUA 3SETA 4PFUA 4LZ8A 3FXUA 1A54A 2DXYA 4TOZA 3RGYA 4JSDA 3IK6B 2RC9A 4X1BA 4LZ7A 5HM4B 3PGFA 4Q8RA 2DVCA 1DPEA 2B65A 1JETA 1EZOA 3Q27A 3KSXA 4GL0A 4FECA 4NWCA 3HN0A 3FVKA 4OESA 3KSJA 5BWJA 4K3FA 4OWDA 4IY6A 5F1QA 5L8DA 4N07A 4XTCQ 2AYSA 4O3AA 1NNPA 3K1MA 3IOWA 4R9FA 1Y9UA 3VVFA 4GFRA 2DE2A 1B51A 4BDLA 3BFUA 3G7WA 4H1XA 2X26A 4NF8B 5AA2D 3FV1A 4BDQA 3CRBA 4GXSB 4PFWA 5FHNA 3OMBA 1N3XA 4RYAA 3FASA 1OQGA 3LC8A 2HZKA 4YMAA 3U94A 2DE3A 2CMOA 2W7YA 1QUKA 2QS4A 4F2QA 1SW4A 4RK2A 4KHZE 5TP9B 3OO6A 2XXXA 5H8QA 1MPDA 2HEUA 1N76A 1P1OA 3K02A 3FJ7A 4MH5A 3LSWA 3VLVA 1YAEA 4YKIA 3MP1A 1ZBMA 2UVJA 3CFXA 3R7XA 3B6TA 2XXPA 1ZU0A 1VFEA 4R2BA 2OCUA 3KN3A 3IL1B 4PP0A 4ELOA 2DWIA 3MBPA 3OSRA 1B0HA 1Q1KA 4FATA 3PUXE 4FORA 4E0XA 2H9BA 4X48A 1SDXA 5AA2A 2XXIA 1B9JA 1B6HA 5H8FA 5CMMA 4FJPA 2FYIA 4NF5A 1R6ZA 3AXFA 3VFJA 4F3PA 3ZS6A 3FIRA 4I9DA 3FXQA 4QFLA 3JZJA 1N0TA 2VGQA 1A99A 1B40A 1LCTA 3KN8A 2DQVA 1DMBA 3K4UA 4H67A 1PB8A 3D4GA 4OYVA 3S4UA 3T96B 3PD9A 1QKAA 3SEUA 1MH4A 3PMVA 3Q26A 4ZEIA 3VDFA 1MQGA 4KYEA 1UQWA 4ZE9A 4HCWA 2ESNA 4M4GA 5CC2A 4F31B 3C34A 4G77A 5DEXA 3H4ZA 1FTOA 1FQEA 4KR5A 1ELJA 3OO7A 1SBPA 2QSXA 3PUZE 2VP1A 1FTKA 2FNCA 3ILTB 3HO7A 4THIA 1MM7A 3R6UA 1MXZA 4GIZA 3CFZA 3T66A 1EZ9A 3VXBA 2ABHA 3KGCA 2OJTA 1R9QA 2Y84A 3MPLA 3G3KA 1H45A 4ZEDA 1PB7A 4RY1A 2QPQA 3IB2A 5ISUA 1D4NA 3DM0A 1CB6A 4EF1A 3GLBA 2ZXTA 4QFKA 1S50A 3SESA 1B4ZA 4RK9A 5A5XA 3W9VA 4G68B 3PPOA 4GQOA 2QMXA 3FUZA 3KFMA 1POY1 2R71A 3FGSA 3V5AA 1SQYA 1WVJA 2CZLA 1FQAA 2F5XA 4YKPA 3TMGA 3K1NA 1MPBA 1N04A 2RCBA 4NF6A 1JW4A 1NH7A 1MXYA 3MZ1A 1SW1A 4IO5A 2RC8A 1ATGA 3OD7A 3GZGA 3KJTA 4ZEFA 2O1LA 4FE8A 4LA9A 4TLLB 1M5BA 3C4MA 1TWYA 1JVYA 2HZLA 3TTNA 2I0BA 5H8HA 2VHAA 2D21A 1WDNA 2HXWA 3Q28A 2I3WA 4I8CA 5I2KB 4JBZA 3PPRA 1UIVA 3OELA 3U8QA 1B3HA 3O2AA 1UTHA 3MVWA 3R26A 1MM6A 1I69A 2HQ0A 1B5JA 3N6TA 4FIMA 1OVBA 3T9VA 2RCAA 2ONRA 4R73A 4DCYA 1RKMA 2ZNSA 3RQTA 5HBCA 4KYSA 3TCHA 4F2OA 5I56A 1IXIA 3FZVA 2REGA 4IO2A 3MJNA 1B5IA 1ZLQA 1FTMA 2BJJX 4ZZEA 2Z8DA 1KWHA 3BBRA 1GR2A 2HAVA 4UA8A 1SYIA 1XHYA 2AL5A 2Y7PA 2F7BA 2OK2A 4ESWA 3VE1B 1P1NA 4OEUA 2Q88A 1US5A 5IKBA 2Q8JA 5H8QB 4PQJA 1GTKA 4QHQA 4OQOA 2REJA 3IAZA 4HS7A 3EHTA 1MY2A 4DDDA 1LAHE 3GBBA 3MW0A 3K01A 2VD2A 4R75A 1URGA 3BFTA 1B46A 1QULA 5F7VA 5CM6A 2F34A 4R74A 3LUYA 1GVCA 1XC1A 5DVJA 5AA3A 1QUJA 1QKBA 2PYYA 1H43A 3N6UA 5L9OA 4HCYA 2ZYOA 5ITPA 5AA2B 4R6HA 3FJGA 5FHOA 4RNSA 4N13A 1FQFA 2HCAA 1MRPA 1ANFA 4ZECA 1B05A 1S7YA 3MP8A 2I48A 5TPAB 3VLWA 2H25A 2Z22A 3H7MA 2I4CA 2HAUA 4ESXA 1MQDA 4EDPA 2Q2AA 5H8NA 1B7ZA 2H98A 2NVUB 4YB6A 1TFAA 1R1NA 3TKDA 3S9LC 5ICQA 1TFDA 2H4IA 1LCFA 1ZTYA 4IGTA 3PMXA 2RKMA 3SERA 5FHMA 1H3DA 4ELPA 3DP6A 4OENA 1IQ7A 2P2AA 5H8SA 5I2NB 3LSFB 2ONSA 2Y7RA 1SI1A 1B32A 4H0WA 3IR1A 1NNTA 2PVUA 2DWJA 1Z7ME 3VVDA 3TAJA 2F7CA 4GLIA 3RN8A 3EQ1A 1B2HA 3TYHA 1LBCA 2Z8EA 3G3HA 4O3CA 4Z7EA 3O29A 3FXRA 3QK6A 4YMBA 4ZE8A 1SW5A 4GVOA 1UTBA 2ZYKA 4F39A 4DZ1A 2PT1A 4BLAA 2Y7KA 4NEDA 2DOJA 1Y4TA 3DP8A 1TT1A 4YAHX 1H44A 4P0GA 3QSLA 4H65A 3OEMA 4U22A 2UYFA 2P1SA 5A5XB 1MXWA 4KCDA 4IY5A 5DTBA 1UIUA 2I4BA 5L9MA 3SKPA 4KFQA 1GGGA 4DLDA 3B6WA 5JK4A 1A55A 1MY1A 2B3FA 3TEPA 1MDP1 1OQHA 2ZYMA 4OFJA 2H99A 2Q2CA 4GXAA 3IO6A 2P0SA 3EN3A 2E0SA 3UK4A 2XXHA 3QAXA 2OZZA 2A5SA 5KDTA 3EHUA 3UN6A 3MPKA 5DT6A 3FJMA 4DCXA 4N6PA 3B7DA 1M5EA 4BDRA 4OERA 3RLFE 1MG1A 3UP9A 2OWTA 3IJOB 2GH9A 1US4A 4MF3A 3V8XB 3N94A 1LAFE 3MVXA 4NF4A 4TLMB 3C9HA 1USYH 1LFIA 1IXGA 1OVTA 1AIVA 3MZ9A 3SEWA 4QRZA 3N26A 2UVGA 2IA4A 1I6BA 1QJMA 1DPPA 2THIA 4KYDA 3LSXA 2XXRA 1SI0A 4FEBA 3SEYA 2V25A 4MLVA 2XXUA 4LVQA 3K1PA 1CE2A 2ALUA 4BDOA 2UVHA 2Q9TA 5I57A 3O28A 3H6UA 1QUIA 2M8CA 3U92A 4IO3A 1FTJA 4R72A 4F19A 4AQ4A 5KCJB 1O63A 1Y1ZA 4P11A 4NTLA 1IXHA 3DLNA 1JVXA 3L6GA 4AB5A 1A7LA 3H06B 3K2DA 5JTYA 4H5FA 4XKQA 3VLUA 1YCJA 3RTWB 3FVNA 5JEIA 4GOTA 3ZKKA 3MQ9A 3QUJA 3QUFA 1JQFA 3UORA 2RC7A 1JEVA 4F22A 5LOMA 2KLFA 1HSLA 4XKPA 3K00A 4U4SA 2QS2A 4F3GA 1O7TA 2F35A 5I59B 3UGWA 1NMUA 4Q30B 3E9XA 2OLBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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