1FTJA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with glutamate at 1.9 resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftjA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftjA01
2V3QA 5FHNA 3MVYA 4X1DA 2G93A 2ABHA 5TPAA 2XXWA 4JWYA 3MW0A 4O3CA 2QS1A 2OWTA 4XKQA 4NF5A 3MP1A 4BDOA 4N07A 4E0WA 1HSEA 1QVSA 3Q28A 1M5BA 3PPQA 4OEVA 3PD8A 3TEPA 4LZ7A 3FZVA 3TTMA 5AA2A 2OLBA 1SVXB 2PT2A 3SERA 3C36A 4NF8A 2VOZA 1TFAA 3K6UA 2RF1A 1M5DA 4KQPA 4GL0A 3MQ9A 2ONSA 2R71A 1UTBB 4KI0E 5CI5A 4OTEA 1IITA 1B5IA 5TU0A 1SI1A 3M8UA 4KCDA 4P0GA 1B3EA 2H9BA 1O64A 4ZEBA 2WKYA 5TPAB 1R9QA 1XC1A 2F6PA 4TLLB 3ZKLA 1N84A 4NF5B 2P1SA 3GBBA 2E1SA 3CSGA 3G3JA 3Q29A 3G3GA 3FJMA 1ZMGA 2RC9A 3M3LA 4O3BA 4XKPA 4IGRA 5AA2B 3KBRA 3Q25A 4RK2A 1DPPA 4OFOA 4NF8B 1MPBA 3S9EA 4H1XA 1A55A 4ELPA 3R6UA 5DVIA 3C35A 3PMXA 4WKMA 2ZXTA 1R1NA 4PP0A 2B3BA 1I6BA 1LCTA 1A7LA 3FJ7A 3GXAA 3VFJA 1Y1ZA 2Q88A 4Z0IA 3UN6A 4IO3A 3MVXA 3T9XB 3OELA 1A99A 3FV1A 3PUWE 4G8MA 3C31A 2O51A 3FVOA 3W9WA 3QAXA 3N26A 3PUXE 1B3HA 5ITPA 2G29A 2GRVA 1Y3NA 5CC2A 4IY5A 4GFRA 4R6HA 2DS9A 3K1MA 3QXMA 2XHDA 2HQ0A 5JTYA 2O7UA 4OYVA 3MBPA 3LC8A 1MXXA 1PDAA 5M2VA 2DWJA 3O28A 4R6KA 4C0RA 4DXBA 3KJTA 3EPEA 2E0SA 1N7XA 2ONRA 3MP8A 1CE2A 3U92A 1MQDA 2D3IA 4FE8A 4C1UA 3N6TA 4EF2A 3A3CA 2DP8A 5H8QA 2YLNA 1BLFA 4ISUA 3T9UA 1B58A 1VE4A 3OENA 1H76A 4BLAA 2GFEA 3UK4A 1BKAA 1B5JA 5CMBA 4ZE9A 1MPDA 2F7CA 3C33A 1JW1A 1XS5A 3E13X 2QS3A 5I59A 4LONB 2XXTA 3CFZA 3USDA 4JDFA 3IX1A 5HM4B 3TAJA 3TQLA 3IOWA 2XXVA 3MAMA 1UQWA 4F3BA 4DCXA 1GR2A 3FV2A 3O2AA 1MY4A 4NMYA 4YU0A 4POWA 4THIA 4DDDA 3B6WA 3G3FA 3JYRA 3ECRA 3LSFB 1URGA 4H0WA 3ODBA 3OD7A 2O68A 1GTKA 1B1HA 4U1ZA 5H8QB 3LSLA 4F1UA 1MPCA 2F7BA 3O97A 2Y7RA 4OEUA 1GGGA 3K2DA 5I84A 5H8SA 1P99A 4U21A 2P2AA 4PE5B 5FTIA 3KJ7A 4U4XA 4H5FA 1QUJA 4PFUA 5I59B 4OFJA 1JW5A 2I0BA 1QW0A 4WEPA 3K6WA 1LFGA 2I49A 2DVZA 2DQVA 3FVKA 4M4GA 4OMBA 3RY3A 4JWXA 1OIBA 1B7UA 4JSDA 5TP9B 3UGWA 4EF1A 1PB9A 4QHQA 3O6GA 1XHYA 4PQJA 2YPNA 1B40A 4HS7A 3HPIA 2V3TA 2QS4A 3SEVA 5LOMA 2V84A 3KN7A 3TCGA 2O6AA 3PU5A 4NF4A 2OBGA 2P0SA 1NL5A 4YKKA 3VLUA 1B1XA 4IO5A 3FGSA 2UVHA 4LP2B 3JV9A 1USYH 3MVWA 4KYEA 3V83A 2Z8EA 2XXIA 4R74A 4GXAA 4BDMA 3S2VA 4AB5A 3U8QA 2AIXA 3OSRA 2CZLA 3B6TA 2X7QA 5BUUA 2H98A 3CFLA 2Z8FA 4Q8RA 1MXZA 5B70A 3MC2A 5DYHA 1H43A 2F35A 4MLVA 3TODA 2DXRA 3TUSA 4GL8A 1MXWA 1I6QA 2FYIA 1POY1 4EUOA 3C9HA 1D3KA 4ECFA 1ZLQA 4NF4B 2UVJA 5CBSA 5HBCA 2RKMA 4NWCA 3U1OA 2PX1A 5ELVA 3FVNA 1LFHA 4RK9A 3T9HB 4GQOA 3K6VA 1P1NA 4F19A 3IB2A 1POTA 2F6GA 1A40A 4G68C 1QUIA 4I62A 2Q2AA 4FEDA 1RYOA 4NE4A 3HHGA 3LSXA 1IZ1A 1IUDA 3KEIA 1NMUA 1B32A 5CMCA 1JW4A 1FTLA 3VVFA 4IGTA 2IEEA 1SW1A 2X7PA 2ZNSA 4EXLA 1MY3A 1YCJA 3IAZA 1HSLA 2ZYNA 1IEJA 2UYFA 4KYDA 2RCBA 2YJPA 1NNFA 1MQGA 3CG1A 1N04A 4UACA 4ELQA 4OFLA 1FCKA 3EHSA 4Z7EA 2XXPA 5CMMA 2I58A 2OCUA 1LB9A 3RTWB 2DE2A 4F29A 1B0LA 3B7DA 2QS2A 2R9JA 4KD5A 2D21A 2ALUA 4IO2A 4NF6A 4GD5A 3FXQA 3RGYA 1MQJA 4ZE8A 3Q27A 1JVYA 1MXVA 3QIMA 3K6XA 1Y20A 4DZ1A 3K1PA 3OO7A 2XD2A 2PMSA 4G77A 2DOJA 1TWYA 3W15C 3BFUA 1QKAA 1US4A 1MY1A 3K0VA 5DT6A 4XXUA 3DELB 1B3GA 1H44A 2FA7A 3EQ1A 1H45A 2HCAA 1SQYA 4I9DA 1MQHA 3O6IA 1A54A 1PEBA 3EN3A 1LAHE 1PC3A 4U2RA 2CMOA 5JEIA 1MS7A 3IB0A 4ESXA 4TLMB 3TTKA 1FQFA 1N0TA 3SESA 2QPQA 2Y7KA 4QSDA 4RA1A 4ZZEA 4NF6B 2PYYA 3TYHA 1N3XA 1B3LA 2V25A 3V89B 1VFEA 2OZZA 2BJJX 1S7YA 3ZS6A 2ANJA 2OWSA 2F5XA 4JWOA 3RN8A 1SD3A 4X48A 1B46A 3HO7A 4O3AA 1FQDA 2NWJA 4BDQA 5EHSA 3QK6A 4IO6A 3KOTA 1EH3A 2ZMBA 1Y3PA 3T22A 3MZBA 1B51A 1H3DA 4DXCA 5B7DA 4IY6A 3VV5A 4EDPA 2QSXA 2F78A 4H8IA 3PPRA 1ZJLA 3E3KA 1EU8A 4ZS9A 2VGQA 2H99A 3D4GA 5K2YA 3VVEA 2HXWA 4OHNA 2F7AA 3MZ9A 3G3KA 5I2NA 2XXRA 3MZ1A 4YMAA 1NH7A 1GV8A 3H6WA 3RLFE 2XX7A 1IQ7A 1IXCA 3VXBA 4F3PA 3PGFA 2H5YA 2XX8A 1MXUA 3U94A 1TXFA 3LSWA 5EYFA 3PUVE 4Q30B 4TOZA 2Y7IA 3CG3A 1LAFE 4RY1A 1B4ZA 2OJTA 3WAFA 1OVTA 5JK4A 3ZSFA 4KHZE 3HV1A 1PBQA 4RPOA 3K1NA 3DP4A 1IXGA 3FVGA 4UA8A 1DTZA 3ILUB 4H8JA 2UYEA 4YKIA 3A09A 2F97A 1Q35A 1I69A 1SYIA 1P1UA 3QUFA 2I0CA 4G68A 3UORA 4ZEDA 3PPOA 4MFIA 2ZNUA 5TP9A 1LBBA 5I2NB 2DYXA 4QF9A 3TMGA 3N6UA 1XT8A 3MP6A 4KFQA 3TKDA 3N5LA 4QFKA 4KR5A 2AL5A 4F3GA 1SW2A 5FHOA 3PV0E 2NOOA 3FD3A 3IJXB 1Y1MA 4R2FA 4JBZA 3KSXA 1USYE 2QMWA 2QJEA 2DWHA 2UXAA 2REGA 1SW4A 4LQ2A 2GHAA 1N76A 1FTJA 1D9VA 2PBWA 5DVJA 3DLNA 3IR1A 5DEXA 3T96B 2H4IA 2Q8JA 3H3GA 1J1NA 4F22A 3FUZA 4P0IA 3MJNA 2UVIA 4YB5A 5AE4A 2I6EA 3EHUA 1XOCA 4FAJA 4G68B 3DM0A 1B2HA 2V3UA 5I56B 3BBRA 3FATA 3PUZE 4GRKA 4H6DA 4LZ5A 4MLQA 4LA9A 4WXJA 1R6ZA 5FTHA 4TQUQ 3PPNA 4POXA 3ILTB 1FQCA 2B65A 3IB1A 4K3FA 3PMVA 1URDA 2REJA 3OXNA 4ZECA 3W9VA 5F7VA 3MWBA 3TQWA 3VE1B 1TT1A 4QSCA 4M1VA 2F8DA 5AA4A 5AA2D 1LBCA 1MY0A 3KOSA 1OLCA 1ZIUA 4ESWA 3HCQA 2NUVA 1SYHA 5ITOA 3UA8A 1ELJA 3KN8A 4G8NA 5EHMA 2QL3A 1B7ZA 3K01A 1MRPA 1WDNA 4X9TA 2NVUB 2M8CA 5DEXB 5FHMA 1NFTA 4F1YA 3AXFA 3K02A 2Q2CA 4LZ8A 1LCFA 3O9PA 1FW0A 3JZJA 3O29A 5IKBA 4R75A 5H8FA 1SI0A 2R6GE 3HHFA 4DE8A 3KSJA 4ZZAA 2HAVA 4RXLA 1PBPA 4EQBA 4NEDA 3VVDA 2UVGA 1JQFA 1JNFA 3T9VA 2PVUA 3C32A 2FNCA 2OK2A 3ZKKA 3OMBA 1DTGA 3OO6A 3HN0A 3RTFB 1M5FA 5K2XA 3EHTA 2Q89A 2XXYA 5AA4B 3O6HA 3N94A 2Q9TA 3S9MC 4JB7A 4ZDMA 2RC8A 3TTNA 4EXKA 2Y84A 1LAGE 3SEYA 3WAEA 3IORA 4QFPA 2ZNTA 2I4BA 3B6QA 3SEUA 3U93A 4E0XA 4HTGA 4XIGQ 4N6PA 1LAXA 1LLSA 4QSEA 1Z7ME 4QFLA 2W7YA 1WVJA 2XXXA 1R9LA 3DP8A 3FXUA 4IB2A 1Y4CA 3D4CA 1MDQA 1MM7A 3KFMA 3H6TA 4YZZA 1RKMA 3UP9A 3KG2A 3VLVA 4GLIA 1YPNA 2THIA 4IO4A 2IA4A 5H8FB 1A8EA 1AMFA 1DMBA 4YMBA 3TTRA 1DPEA 1NNPA 3S9NC 3TDJA 2XXQA 1M5CA 1XVYA 2NXOA 1YTVA 4N13A 1SDXA 3IO6A 1BIYA 3L6HA 2I4CA 3SEXA 4G8HA 2V93A 5I2KA 1OLAA 1MY2A 3G3HA 4Q5TA 4QFNA 3FXRA 5F1QA 2DWIA 3I5OA 2VP1A 4MH5A 2Y7PA 3TPAA 1QULA 2Z22A 1ANFA 4R2BA 1A8FA 1CB6A 3PUYE 4L17A 4F2QA 4GXSB 2O7IA 1D4NA 2Z23A 4G2ZA 5ISUA 2KLFA 4Q0CA 1FTKA 1FTOA 2HEUA 1RYXA 4KPTA 1IXIA 4I1DA 3TTLA 5L9OA 5H8NA 4OQOA 2ESNA 3H7MA 2DSFA 2DVCA 4RJZA 1IXHA 5I58A 1P1OA 4U1OA 4ELOA 1UIVA 3BFTA 1NNKA 1II5A 1KWHA 3ONMA 3GBAA 4ONYA 4FIMA 4LVQA 3TCHA 4H65A 1O63A 4ZEFA 3C34A 1P1QA 3CIJA 3QYTA 2DXYA 4F31B 4U22A 1MH4A 1B3FA 4R73A 4YKPA 2D5WA 4FECA 2F36A 4PFTA 3CFXA 5I2KB 1B5HA 4LATA 2HZLA 1URSA 2A5TA 3RPWA 5IAIA 3H6UA 2I48A 3IOTA 3SETA 3G7WA 4HCWA 1B9JA 4DLDA 3I6VA 2VD3A 2DWAA 3TZAA 3CSBA 1M5EA 3R26A 3P7IA 1QJMA 3OEMA 2LAOA 4R9GA 1OQHA 3KGCA 5H8NB 3H6VA 1VSOA 1MG1A 1Z7NE 4GOTA 3FASA 5I58B 2QRYA 3H03A 3C4MA 1B6HA 1D9YA 4I8CA 1JVXA 1LSTA 1AOVA 1WODA 1BP5A 4DXUA 3IL1B 1LB8A 1SBPA 3I3VA 1I6AA 4C1TA 5CBRA 3CI8A 5CMKA 2HFBA 2DE4A 3VXCA 2A5TB 3RT6B 1AL3A 1EZOA 3S9LC 4LUBA 2RC7A 4OETA 3CR9A 5DTBA 4HW8A 4HCYA 1N3WA 1MQIA 1OQGA 1L5TA 4JSOA 3IJOB 4OERA 3GLBA 4DCYA 5KZTA 2O1MA 4AQ4A 2PT1A 4F3SA 3TFLA 1IIWA 3O66A 3RUMA 3M3FA 5AA1A 1B0HA 4OXVA 2ZYKA 4WEDA 4RPNA 1O7TA 4NWDA 2ONKE 5AA3A 3G3IA 4GVOA 2B3FA 5A5XA 5BWJA 1OMPA 1FQAA 4ND9A 1OVBA 1N7WA 1NNTA 1B52A 2HAUA 1UIUA 3Q26A 1T0KA 1ZBMA 5L9SA 3V5AA 3F11A 4OWDA 2XX9A 4JXIA 5I56A 4YB7A 3VLWA 3LR1A 1NKXA 3IOVA 3OEKA 1EZ9A 1US5A 1VR5A 1QKBA 2AYSA 2VD2A 1P1WA 2VHAA 2O84X 4XKNA 2GHBA 3CRBA 4GF8A 5I57A 1Y3QA 4X1BA 3LUYA 4F39A 3T66A 4PFYA 4BDNA 4PFWA 3A3UA 4QRZA 3K00A 3PD9A 1FQEA 3GZGA 3RQTA 1Y4TA 4OZ9A 2RINA 4XTCQ 1EZPA 5A5XB 1LGBC 2AL4A 5JTYB 3QUJA 3KZGA 1PB7A 3CVGA 5L9MA 5KCJA 4ZEIA 2XD3A 2GH9A 1ZTYA 3DP6A 3E9XA 3OO9A 3PMWA 3RNNA 3R7XA 5KDTA 4H5GA 3RT8A 2X26A 3OOAA 3K4UA 1QUKA 1F9BA 3MPKA 1FTMA 1MXYA 5ICTA 2Z8DA 4OENA 4QFOA 3TELA 4DIGA 1DSNA 4R6YA 1GVCA 4MBPA 1AH5A 5I57B 1SW5A 4BDRA 1ZKBA 1XVXA 5HPQA 4KCCA 1S9TA 3V8XB 4NTLA 1UTHA 4YKJA 4EQ7A 3LBSA 5DVFA 1MDP1 5L8DA 3BKIB 3SKPA 1PB8A 4GWOA 3TCFA 3OO8A 3SDFA 2F34A 3THIA 4FATA 5KCJB 1HSJA 4P11A 2ZYMA 2RCAA 1ATGA 3VDFA 4ZEKA 1JEVA 3IOUA 2I3VA 3S4UA 4H67A 5KDTB 4KYSA 1B7HA 4RNSA 2O1LA 3FJGA 1B4HA 3H06B 4R72A 2HZKA 4G4PA 4PETA 4GIZA 4FORA 5H8HA 4BDLA 4XKRA 1S50A 3KN3A 4IO7A 3T93B 3MVZA 4MF3A 3L6GA 4FJPA 3E4RA 3U72A 1AIVA 1NH8A 4F2OA 4ELRA 4EQ9A 1UTHB 3IO4A 2H25A 2O69A 1JEUA 3PPPA 1B05A 2QMXA 5CRYA 3IK6B 3HSTA 4U23A 4F18A 4F1VA 5CM6A 2I3WA 4YAHX 4OESA 2DE3A 4FEBA 3UIFA 1MM6A 3OSQA 4LQ5A 1TFDA 5ICQA 1DOTA 3MPLA 1JETA 3FIRA 2XXHA 4YICA 3QSLA 4RYAA 2A5SA 2Y7WA 1MH3A 1LFIA 5J1DA 1VFDA 2ZYOA 1UTBA 1Y9UA 1BTJA 5H8HB 3H4ZA 3MUQA 3SEWA 1YAEA 1Q1KA 1ZU0A 3M3KA 4OVJA 4U4SA 4AB6A 3EF7A 4YB6A 1FQBA 4R9FA 2XXUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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