1FTJA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with glutamate at 1.9 resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftjA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftjA01
1I6BA 1TWYA 3GXAA 2DE2A 1TFDA 4OENA 3TKDA 2P1SA 3FVGA 2ZYKA 3DELB 1Y4TA 1SQYA 5I56A 1FTOA 5I57A 3TYHA 2ZNSA 1JW1A 3IAZA 2Z8FA 5K2XA 3UP9A 1DSNA 1FW0A 3VFJA 4KD5A 3O29A 4ZS9A 1XC1A 1GGGA 2V93A 3G3HA 1ZU0A 2GFEA 3Q25A 3QYTA 5H8NA 1YTVA 2QL3A 3H6UA 3TTKA 1EH3A 1NH8A 3EN3A 4YB5A 1MQGA 4LQ5A 4ZE9A 3KOTA 3E4RA 2F5XA 1R6ZA 4U21A 4ONYA 3LUYA 2F34A 5L9MA 5KDTB 4YKJA 4ZZEA 3TMGA 1HSJA 4LATA 2CMOA 1LCFA 4WKMA 3MZ9A 1B5HA 1TFAA 1N0TA 4ESXA 3C36A 1OIBA 3VVDA 2X7PA 3U93A 2ZYOA 3N94A 1Q1KA 5EYFA 4RYAA 1QKAA 1MM6A 4G68A 3QSLA 1OVBA 2UVGA 4ZZAA 4F1VA 2I4CA 1B58A 3U1OA 3RGYA 4LA9A 1UIVA 1NKXA 5K2YA 4YKKA 1B46A 2ESNA 4M1VA 1BLFA 1USYE 3FIRA 3KGCA 3OENA 3T66A 2NVUB 4F1UA 1SW5A 1BP5A 1B4ZA 3V5AA 4F39A 4QRZA 4JBZA 2IEEA 2UXAA 1XVYA 3H6TA 3OO6A 3VXBA 1FTKA 3OSRA 2O7UA 3TAJA 3S9MC 1TT1A 2RINA 3B6TA 5H8HB 3U72A 4QSEA 3OD7A 2D5WA 3OELA 4THIA 4F19A 2Q8JA 2YPNA 3RT6B 4P0IA 5J1DA 3DP4A 5CMCA 4IO2A 5AA1A 3HV1A 4ZEKA 2XXXA 4IY5A 4LQ2A 1URDA 4TQUQ 3QK6A 3PPOA 1MY4A 4O3BA 4ZEBA 4YU0A 4KI0E 5CC2A 3K0VA 2FNCA 2REJA 3PV0E 2P0SA 1R1NA 1OVTA 5CMMA 3PMWA 4L17A 5KCJA 4G68C 3TZAA 3R26A 4JB7A 4YB6A 4HCYA 4EDPA 1A99A 2ZXTA 2VD3A 3QUFA 4BDOA 4H5FA 2E0SA 1MY1A 1US4A 3C31A 3E9XA 1IXIA 2ZNUA 3F11A 4Z0IA 4IO6A 1IIWA 5IAIA 3LSXA 4F31B 3PPRA 4ND9A 2H99A 4BLAA 4H6DA 3TFLA 3LSWA 2QS3A 5I2KA 2R71A 3O2AA 1MY0A 2Y7KA 1B3FA 3SEWA 5I59B 1NNKA 2M8CA 4LP2B 4O3AA 4XIGQ 2ZYMA 2DE3A 3CIJA 2OK2A 4GWOA 1UTBA 3EHUA 1LGBC 4NF4A 4OFJA 4BDLA 4OFLA 3S2VA 1A8FA 2XD2A 4HCWA 4XKNA 1M5FA 5ICTA 1IEJA 3IB0A 5BWJA 2DOJA 2NXOA 2AIXA 3DP6A 4JXIA 2ABHA 5DYHA 4LUBA 1ZMGA 1IXGA 4IO5A 3PPQA 4R74A 1EU8A 3FATA 4OEVA 3C32A 3A3UA 2Q2AA 3EF7A 3O6GA 3R6UA 2A5TB 1DPPA 1M5EA 4FIMA 4P0GA 3T9VA 4KQPA 4QHQA 3CG3A 3SDFA 3RLFE 1JVXA 4O3CA 1ANFA 2UYFA 1DTZA 2UVJA 4XKRA 1FQAA 1IXCA 4JWXA 4OHNA 3OXNA 2ALUA 4JDFA 1Z7NE 4MH5A 4EF1A 1QVSA 3HPIA 1MH4A 3UIFA 5FHNA 1ZIUA 5EHMA 3FXUA 3ILUB 3MPKA 3TPAA 1WODA 4DE8A 2O69A 1MDP1 3C35A 4FEDA 4ELPA 1GR2A 2CZLA 2UYEA 1ATGA 3SEYA 3Q28A 1URSA 5H8QA 3MWBA 5FTIA 3V8XB 4NWDA 1D9YA 1SW1A 2F97A 1O7TA 3W9WA 1QULA 1MRPA 4RPOA 3IO6A 2VHAA 3PUYE 3U94A 4HW8A 4TOZA 2XXRA 3TCGA 2PBWA 5B70A 3TQWA 4R72A 1Y4CA 2Y7IA 1KWHA 4YB7A 1Y9UA 4OETA 5A5XB 2R9JA 4QFKA 4OMBA 2GHAA 4NE4A 2XD3A 3N26A 5CRYA 3BBRA 4RXLA 5DTBA 5DVJA 4GXAA 2AYSA 2V84A 3UK4A 3V89B 4E0XA 5AA4B 4F3BA 4LONB 4NTLA 3G3FA 3PUWE 1BIYA 2DS9A 1PBQA 1JVYA 3MC2A 2THIA 1UQWA 4R6HA 1B3EA 4OERA 2UVIA 4AB5A 4F2OA 4GVOA 2O1LA 2V3UA 1D3KA 4KHZE 4Q5TA 1SI0A 2UVHA 5AA3A 3V83A 1B2HA 4R2BA 4NF6A 3CG1A 1N84A 3RTWB 3IJOB 1H3DA 1D4NA 5JTYA 3T22A 3H3GA 1XHYA 4LZ5A 1JETA 2Z22A 1MY2A 1Y3NA 4NF5B 4N13A 4F3GA 2BJJX 3DM0A 2G93A 3VLWA 4PFUA 5L8DA 4F3PA 3LSLA 2FA7A 3LC8A 3BKIB 1QUIA 3GZGA 2PT2A 4R9FA 2F78A 2RC8A 2VP1A 4H8JA 1AIVA 4MLQA 3MBPA 1O63A 2XXIA 3VV5A 5HPQA 3IORA 1I6AA 1P1QA 2FYIA 4PETA 1M5DA 4UACA 1FCKA 3IK6B 2OJTA 3IR1A 3ZSFA 1DOTA 3IOTA 3IX1A 4JWYA 4Z7EA 2D3IA 1JW4A 3TDJA 4ZEFA 4BDQA 3SEUA 1MDQA 1II5A 5CMKA 1B0HA 3USDA 4R2FA 1XT8A 3MP8A 3TTMA 4GLIA 3E13X 1FQCA 5B7DA 5CBRA 4DZ1A 2XXTA 4DXBA 1UTHB 4LVQA 4DXCA 4C1UA 2Q88A 2Z23A 1MQIA 4QFOA 3K1NA 4JSDA 4GL8A 1MM7A 4WEDA 3HSTA 1B3HA 4BDRA 3FJGA 5ISUA 3TUSA 2QS1A 3HHGA 1LLSA 3JZJA 2GHBA 1B1HA 5I2NB 1URGA 3PUXE 3VLVA 1LFIA 3H6VA 3RUMA 1P99A 1B9JA 5F7VA 3RQTA 4EF2A 1MQHA 4IY6A 2GRVA 3MUQA 3VDFA 4ZEIA 3SEVA 1B3LA 4M4GA 3S9LC 3FGSA 1MXYA 4EQ9A 1J1NA 3H03A 1POTA 4F1YA 2O6AA 1B40A 1CB6A 1B0LA 3RY3A 5TU0A 2I48A 3PMVA 1DTGA 2RCAA 1MXXA 4G8HA 1WVJA 4C1TA 3WAFA 3ECRA 1GVCA 4QFLA 2PT1A 5DT6A 1LAHE 1PC3A 3I3VA 1S9TA 2PX1A 1UIUA 1SD3A 2V3TA 2DVZA 3HO7A 3MVYA 2X7QA 3BFUA 1L5TA 3M3FA 1USYH 1B52A 5L9OA 4R9GA 1OQHA 1MXUA 1MS7A 3G3IA 1NNTA 1T0KA 4R73A 3RNNA 5I56B 1B7UA 4N6PA 3TODA 2XXPA 4F22A 2I0BA 2NOOA 1HSLA 1VE4A 5DEXA 4MF3A 5TP9A 2O84X 3W9VA 1JNFA 2F8DA 4GF8A 3GBAA 5ITOA 4KYSA 1NMUA 4GIZA 5H8NB 5I84A 4EUOA 2Y7WA 4Q0CA 1ZBMA 1SVXB 3GBBA 4IGRA 2B3FA 3C9HA 4FJPA 4DCXA 3FVNA 3CR9A 2OCUA 2HAVA 2HZLA 4F3SA 3AXFA 4MLVA 3CFZA 4OVJA 1US5A 3D4CA 4N07A 2F36A 1DMBA 4ZDMA 3ZKKA 3KFMA 1LFHA 2Y84A 4QFPA 4Q8RA 4NF8A 1LFGA 3T9HB 1ELJA 5A5XA 1FTLA 3U8QA 3SETA 3RPWA 3MZBA 1H44A 2NWJA 4GRKA 1YPNA 3QAXA 3EPEA 3OMBA 4EXLA 3EHTA 3K6XA 3T9XB 2OWTA 4U4SA 3TTLA 2DWIA 1JEUA 3PD9A 2Y7RA 2H4IA 3CVGA 2DYXA 3M3KA 4U1OA 3UORA 2B3BA 3K01A 3I5OA 1B6HA 3MAMA 4U2RA 4YKIA 3OO8A 3G3GA 4PFWA 2QMXA 3PPNA 4OFOA 3DLNA 1BKAA 4AB6A 1FQBA 3H7MA 3K6UA 4NEDA 2RC7A 5ELVA 1A7LA 3T9UA 1H76A 3MZ1A 4F18A 3TEPA 2HFBA 3OEKA 4I62A 3FV1A 1Z7ME 4I8CA 1VSOA 1D9VA 4WEPA 1SDXA 2B65A 5FTHA 4H67A 1S50A 3PU5A 2Q9TA 4NF5A 5AA2B 5TPAA 4YMBA 3K4UA 3H4ZA 1MXZA 3A09A 1EZOA 3H6WA 5H8FA 1QJMA 3TQLA 3ZKLA 1ZLQA 3KJ7A 1F9BA 1MH3A 2F7BA 3SESA 3UA8A 1SI1A 2XXWA 2HQ0A 1OLAA 3LR1A 4G8MA 3S9NC 1VFDA 4ECFA 3S4UA 2VOZA 3KBRA 1MG1A 4JWOA 1CE2A 1A8EA 2R6GE 4DDDA 1N7XA 4OTEA 3IOWA 5KCJB 3MP1A 4PQJA 3PMXA 4KFQA 2YJPA 2VGQA 3CI8A 1GTKA 4H5GA 5AE4A 1A54A 3K00A 3HCQA 1B5JA 3MQ9A 4GL0A 2Q89A 4BDMA 5L9SA 4DCYA 4POWA 1YAEA 2XXYA 4IO7A 3PD8A 3FVOA 1Y3QA 1SW2A 3SKPA 1FTJA 2O1MA 1QKBA 4IGTA 2ANJA 3GLBA 4NMYA 2QRYA 1NNPA 3OEMA 4ELQA 5KDTA 3IOUA 1LAXA 3OO9A 5I2KB 3U92A 1EZPA 4X48A 3MVXA 3RTFB 1B32A 5I2NA 1UTBB 4ZE8A 4DIGA 4NF4B 1Y20A 5ICQA 3Q27A 5I58B 4IO3A 3TCHA 4H65A 4RNSA 3K6VA 4XKPA 3OOAA 2PMSA 2AL5A 3TELA 3C34A 3FASA 1VFEA 3KN7A 1B05A 3VLUA 1JEVA 1M5BA 2WKYA 1ZTYA 3L6GA 3UGWA 4EQBA 4R6YA 4YKPA 2OWSA 1B51A 3E3KA 1NH7A 2DE4A 3SEXA 1PB8A 1MQJA 5H8HA 3K6WA 1FQEA 3QUJA 4PFTA 1EZ9A 3KN8A 2RCBA 4KYDA 2OZZA 1LAGE 3K1PA 2PVUA 4I9DA 4ISUA 1DPEA 3TTRA 4FECA 2QPQA 5H8SA 4XXUA 3ILTB 1MY3A 4EXKA 2F6PA 2GH9A 4R6KA 1MQDA 2O7IA 1N04A 5H8QB 4WXJA 1TXFA 5JK4A 2RC9A 2RKMA 2H5YA 1N76A 3PGFA 3TCFA 4EQ7A 1NL5A 1SW4A 4U23A 1QUJA 4E0WA 1Y3PA 4QSCA 4P11A 3FJ7A 2DVCA 4UA8A 4F2QA 2Z8DA 2DP8A 3FZVA 2ZYNA 5CBSA 2YLNA 3C33A 1N7WA 2AL4A 3THIA 2H25A 4QFNA 2ONSA 2HXWA 4G8NA 3DP8A 4GD5A 3T96B 3MVWA 3S9EA 3O9PA 4PFYA 2A5SA 3R7XA 4XTCQ 4POXA 1MXWA 4YICA 2I4BA 4ELOA 4OZ9A 1PB7A 4RK2A 4X9TA 5I59A 1R9LA 1IQ7A 1B3GA 3PPPA 1MPDA 4X1DA 3LBSA 3ODBA 4X1BA 3Q26A 2I3WA 3B7DA 4AQ4A 1AH5A 3MP6A 4G2ZA 1JQFA 2REGA 4NF6B 1WDNA 2HCAA 3O28A 3KJTA 2O51A 4H1XA 1NFTA 3WAEA 3N6UA 4IB2A 5FHOA 3EHSA 3MVZA 5JTYB 3KZGA 2VD2A 5EHSA 3UN6A 4PE5B 2W7YA 2ONRA 3H06B 1N3WA 4OWDA 2QMWA 2D21A 4YZZA 1LSTA 3D4GA 2A5TA 4OESA 3SERA 3A3CA 1VR5A 4GFRA 4U4XA 3FV2A 2ONKE 4QF9A 3OO7A 2DWAA 3IJXB 2LAOA 1MPBA 1POY1 5F1QA 4G4PA 5AA2A 4ZECA 5I57B 1RYOA 2OBGA 2IA4A 3OSQA 4KPTA 1JW5A 1R9QA 1LB8A 3O6IA 3MJNA 3JV9A 4NWCA 3I6VA 2DQVA 1XOCA 3TTNA 4BDNA 1HSEA 5JEIA 3T93B 1I6QA 4YMAA 4TLMB 4GXSB 2QS4A 2F35A 1NNFA 3FUZA 2H9BA 1QW0A 1OQGA 3KN3A 4DXUA 2I3VA 4ELRA 4ESWA 1LBBA 5HM4B 1H45A 1B5IA 1PDAA 2I58A 4GOTA 1LCTA 3MW0A 4KYEA 2F7CA 1B4HA 3Q29A 4KR5A 1Q35A 2OLBA 2Z8EA 4K3FA 3B6WA 3FXRA 1Y1MA 4DLDA 2F6GA 4MBPA 3B6QA 4FORA 4XKQA 4RK9A 5CMBA 5CM6A 1B7HA 3G3KA 3FJMA 1OMPA 1P1NA 4G68B 3JYRA 2HAUA 2XX7A 5AA4A 1LB9A 4FATA 2QSXA 4KCCA 1SYHA 2I6EA 1RYXA 3M3LA 1IITA 4MFIA 4OEUA 1XS5A 3M8UA 3IO4A 2Y7PA 4PP0A 5I58A 2XXUA 1YCJA 4U22A 1IUDA 2DWJA 2H98A 4RA1A 4LZ8A 4YAHX 2O68A 4C0RA 1PB9A 5AA2D 4KCDA 1B7ZA 4RY1A 1IXHA 5KZTA 3KSXA 4JSOA 4HS7A 2DXRA 3ZS6A 5ITPA 3PUVE 4IO4A 4RJZA 4QSDA 3O66A 3BFTA 2XX8A 3HHFA 1S7YA 2XX9A 1RKMA 3G7WA 3CRBA 1PEBA 3FVKA 1ZKBA 3IL1B 3KOSA 3RN8A 2DWHA 1H43A 3N6TA 4I1DA 3KG2A 3RT8A 1AL3A 5DEXB 1MPCA 5TP9B 4RPNA 1SBPA 4GQOA 3QIMA 3EQ1A 3IB2A 4OXVA 2ZMBA 4FE8A 1IZ1A 4F29A 1FQDA 4HTGA 1Y1ZA 2I49A 3L6HA 1A55A 1O64A 2DSFA 3FXQA 2QJEA 2DXYA 3HN0A 4LZ7A 3C4MA 1SYIA 5BUUA 5LOMA 1A40A 4U1ZA 3K1MA 4TLLB 2QS2A 2XXQA 3CSBA 1UTHA 2E1SA 1FTMA 3MPLA 5FHMA 2Q2CA 1ZJLA 2ZNTA 4NF8B 1N3XA 2XXHA 4R75A 3K02A 2RF1A 3VE1B 1FQFA 3O97A 4OQOA 2V25A 1AOVA 2X26A 1PBPA 2G29A 3IOVA 5DVFA 3K2DA 4OYVA 4FAJA 2XXVA 3VVEA 5IKBA 2PYYA 5DVIA 2F7AA 5M2VA 1M5CA 1LAFE 2KLFA 4G77A 3VXCA 3O6HA 3G3JA 1P1OA 1B1XA 5CI5A 1MXVA 1XVXA 2HEUA 3CSGA 1OLCA 3N5LA 4H8IA 1P1WA 3CFXA 3P7IA 2NUVA 3ONMA 2I0CA 1I69A 3KSJA 2XHDA 3IB1A 3W15C 3PUZE 3FD3A 1AMFA 4Q30B 3CFLA 1GV8A 3VVFA 4H0WA 2P2AA 5TPAB 3KEIA 4FEBA 1BTJA 1LBCA 3LSFB 5HBCA 2HZKA 5H8FB 1QUKA 3QXMA 2V3QA 1P1UA 4ZEDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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