1FTJA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with glutamate at 1.9 resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanisms for activation and antagonism of an AMPA-sensitive glutamate receptor: crystal structures of the GluR2 ligand binding core.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR SUBUNIT 2
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftjA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ftjA01
3FVKA 2FYIA 2XXPA 4NWCA 4C0RA 2QSXA 3T9VA 1ANFA 3AXFA 4OFJA 4HCWA 2YPNA 4U4XA 3UA8A 1B5HA 3EF7A 1O7TA 4R2BA 4GL8A 4KFQA 5K2YA 3SEYA 3OO7A 5HBCA 1MQIA 2VOZA 1B5IA 1IQ7A 3EHTA 1YTVA 4OESA 2NWJA 2DWIA 4XKRA 1FCKA 1A55A 3EQ1A 4H5FA 3E4RA 3VE1B 3TTLA 1LCTA 3EHUA 3PV0E 1N84A 1D4NA 2A5TB 2HAVA 1FTLA 2QPQA 1XS5A 1TT1A 1NH7A 3DM0A 4KI0E 4MH5A 5CMCA 3R6UA 3VV5A 2DVZA 3KFMA 4F3SA 4U21A 4QRZA 3FASA 4ELRA 4QSEA 4F22A 1ZJLA 4AB5A 1QW0A 1AH5A 3G3GA 3T66A 3HN0A 1SVXB 4HW8A 4FATA 4AB6A 3T9HB 4IO4A 3G3FA 4H6DA 1HSEA 5I2KA 3FJ7A 4ZZEA 1B7UA 2O51A 3KJ7A 4RK2A 3OD7A 3PUWE 2RKMA 4OFOA 2F7CA 3IB2A 1IUDA 2VGQA 3A3CA 3ODBA 4FJPA 4H5GA 1ZBMA 1B05A 3K2DA 3T93B 4DXCA 1NNPA 2GHAA 4OERA 1NNFA 4N13A 1B51A 2XXIA 1EZ9A 3MUQA 4NF8A 5AA1A 3K6WA 3TPAA 3RTWB 4XXUA 5AA4A 5FHNA 4IO3A 1I6QA 3KEIA 3MVZA 4RY1A 2XXQA 5I57B 3FGSA 4OMBA 2F8DA 5AA4B 4EUOA 1N76A 4OTEA 3E3KA 1MQDA 1B3LA 2DXRA 3PPQA 3OEKA 4MBPA 2O68A 4F1VA 5AE4A 3PU5A 5M2VA 1LAHE 2PBWA 3M3FA 3FXRA 4OEUA 3H6VA 1DTGA 1Y4CA 3MPLA 4JXIA 3SKPA 5JTYA 5KZTA 2ZYNA 3MAMA 1OQHA 1B3EA 1PC3A 2V3UA 3K4UA 3G3JA 4IO5A 4OZ9A 4R9FA 1SW2A 4C1UA 3IK6B 3M3KA 4X1DA 3O6GA 1Q35A 5B7DA 2Y7KA 3SESA 3GLBA 1D3KA 1B1XA 2GFEA 4G68C 3RT8A 1SDXA 4N07A 4R2FA 1OVBA 3DELB 3V8XB 1Y3NA 4NWDA 3VXBA 1SI0A 2UVHA 2Y7IA 4POWA 1QUJA 1NFTA 2G29A 3BBRA 4PFTA 5CMMA 2Z8FA 1QVSA 4L17A 4XKQA 1LAGE 2OCUA 2ESNA 4IY5A 1MXXA 1N3XA 1IEJA 2F78A 3SERA 1UTBB 2DWJA 5LOMA 1PB9A 3EHSA 3N6TA 4M1VA 4OQOA 2NOOA 1M5CA 2I58A 2NVUB 4F2OA 2YJPA 1MXYA 2DQVA 3C32A 3MW0A 4IO6A 4QSDA 1YCJA 1LFHA 3M3LA 2ZYMA 1JW4A 2F6GA 5CMKA 1M5DA 2XHDA 1B7HA 4F29A 3FXQA 1IITA 4ESXA 3M8UA 4RK9A 2AYSA 3FUZA 2PX1A 3B6WA 4QFOA 3K6UA 3MJNA 1BLFA 2FNCA 5JTYB 4QHQA 4KQPA 1Z7NE 1VE4A 2CMOA 5DEXB 2DE2A 1JNFA 3KN7A 2PYYA 1EZPA 2O1LA 3C33A 2H9BA 1URGA 5DEXA 3DP6A 3KG2A 3VVDA 3PPNA 1USYE 3CG1A 1P1QA 3K0VA 4JWYA 3U72A 4P0IA 3IORA 4IGRA 1ZLQA 1B32A 1R9LA 3Q29A 5I59B 2X7QA 2DP8A 3LR1A 3CFZA 4ELPA 4F3BA 2OZZA 4G68A 1JEVA 1ZTYA 5CRYA 5BWJA 5ITPA 3LSLA 4FIMA 2DS9A 1MDQA 3O6HA 4R9GA 1AOVA 5DTBA 2XX9A 4RXLA 3PUZE 3IO6A 3QUJA 2QL3A 4IO7A 3VLWA 1LCFA 1H43A 2H99A 2I0BA 1MG1A 3H6WA 1Y9UA 3H6TA 3ILTB 3K1NA 3KN8A 3MZBA 5FTIA 1SW4A 2VD3A 4NF4B 2I3WA 3B6TA 1UIVA 1WODA 2WKYA 1VFDA 3Q28A 4ZZAA 4ELOA 1B0HA 2ZYKA 3OO9A 3MZ9A 1Q1KA 4G2ZA 3CSGA 4FORA 4ESWA 2R6GE 3OMBA 5KCJA 1HSJA 1LAXA 4YKPA 2HQ0A 3C4MA 2H5YA 5EHMA 3SEVA 2Y7PA 1MQGA 2QMWA 3H4ZA 3MVWA 2RC9A 4YB7A 1LBCA 3OOAA 4NF6B 3MBPA 4X48A 4EQBA 2UVIA 2F97A 4P11A 1LBBA 4TLLB 5A5XB 2R71A 3CFLA 3FV2A 2E1SA 4LATA 4NTLA 5TP9A 3OO6A 4X1BA 1P1NA 2THIA 1B3HA 4M4GA 4RPNA 3S4UA 5J1DA 5KDTA 3ECRA 3VLVA 5FHOA 3G3IA 2E0SA 4EXLA 3W9WA 1YPNA 2AIXA 2KLFA 2QMXA 2A5TA 2ALUA 3RPWA 1LFIA 3T9XB 2PT2A 3HHGA 3UORA 4IB2A 1URSA 3G7WA 4ZEIA 3W9VA 1DPPA 3FJGA 3L6GA 5AA3A 4PFWA 3KOTA 1PDAA 3O28A 3Q26A 2P2AA 3K6XA 2PMSA 3TQWA 1B3GA 4Q8RA 5EYFA 2A5SA 1US5A 2XD3A 3TODA 3OXNA 4E0WA 3TCGA 1D9VA 3QUFA 1CB6A 3OSRA 3KSXA 4TLMB 1IIWA 1B1HA 1FQBA 3PPPA 4WEPA 1B7ZA 1MY0A 2GH9A 3EPEA 4F2QA 3RNNA 1O63A 1I6AA 4KPTA 4GWOA 4C1TA 3OENA 1M5FA 3E9XA 2DSFA 1WDNA 1IXGA 1SW1A 1XOCA 2Z8EA 1GTKA 3HO7A 5H8HA 3VXCA 4O3AA 2Z23A 3JV9A 4K3FA 2YLNA 2VP1A 1EU8A 5I84A 1SYHA 3TTRA 5A5XA 3CVGA 1IZ1A 4LVQA 1M5BA 5FHMA 3GBAA 1GR2A 4O3CA 3TUSA 1MH3A 3L6HA 3THIA 2GRVA 4R6YA 1Z7ME 4U22A 4WKMA 4DXUA 1ZMGA 1FTKA 2VD2A 3VFJA 4Z7EA 3V83A 2I48A 3T22A 1MXZA 3W15C 3FXUA 4NMYA 4YB5A 5TP9B 2REJA 4AQ4A 1NKXA 3IB1A 2DXYA 4BDRA 2F7BA 1VR5A 4BDMA 1II5A 3HV1A 4Z0IA 2XXRA 4H65A 3SDFA 2I0CA 4GIZA 4KHZE 4EQ7A 2OK2A 3FV1A 4YU0A 3K6VA 3TELA 2XXHA 3CR9A 3H3GA 1VSOA 1F9BA 1MXWA 4RYAA 1OLAA 1ZU0A 2HZLA 4I1DA 4LONB 2AL5A 4F3PA 4GXAA 4GQOA 1TFDA 4XKPA 3MP8A 1I6BA 1QJMA 2QRYA 2OJTA 4X9TA 3VVFA 1MM6A 2X7PA 1LB8A 1MY2A 3HSTA 3MQ9A 1HSLA 3IJOB 2RCBA 1A8FA 3N94A 4ZDMA 4DCXA 1A99A 4OWDA 3N26A 3OO8A 3ZSFA 4KR5A 1POY1 1BKAA 1ZKBA 4EQ9A 1IXIA 2CZLA 4FE8A 3FVOA 3EN3A 1XT8A 1GVCA 4I62A 4F19A 1BIYA 3T96B 1RYXA 3QK6A 1Y3PA 3TCHA 3WAFA 1EH3A 4LP2B 4U1OA 3FVNA 2XXWA 1QKBA 3A09A 4EXKA 5CBSA 2RCAA 3TAJA 1Y3QA 4ND9A 1FQEA 3TTKA 3QAXA 4HTGA 3TDJA 1NNTA 4PP0A 3SEXA 4PQJA 5AA2D 1JETA 3IB0A 4ECFA 1Y4TA 1MY3A 5H8FA 3DP8A 1NL5A 1R6ZA 4NF5A 5JEIA 1S9TA 3G3HA 3O2AA 3PMWA 4ISUA 4JB7A 4YAHX 2Q8JA 3TQLA 1MS7A 1DMBA 2P0SA 4IO2A 4JWOA 1H45A 5CI5A 3GBBA 2IEEA 5L8DA 3PMVA 4ZEBA 4YMBA 1R1NA 3JZJA 2I4BA 4OYVA 5L9MA 4R74A 2DE3A 4QFNA 1QUIA 3IJXB 3GXAA 3RT6B 1UIUA 3RGYA 5TU0A 1OVTA 3KJTA 4O3BA 1MDP1 2OWTA 1SQYA 4U1ZA 1QKAA 2F6PA 5I56A 1POTA 3ILUB 3O9PA 4LQ5A 1Y1ZA 2DYXA 2XXXA 3RUMA 3TCFA 4ELQA 4ZEDA 4KCDA 3KZGA 4GVOA 4R73A 2ONSA 2IA4A 1MPBA 1DOTA 1JW1A 1SBPA 4MLQA 5K2XA 3PMXA 3FVGA 3UK4A 2UYEA 4WXJA 2R9JA 3D4CA 2G93A 3B6QA 2HXWA 3CI8A 3FIRA 1GGGA 4G8MA 4XKNA 5TPAB 3TFLA 3TTNA 4F39A 1B46A 1DPEA 1P99A 4R6KA 3QYTA 1LFGA 4KYEA 4FEBA 3C35A 4OXVA 1AIVA 1LGBC 3K00A 1XVXA 3K02A 2DVCA 5H8FB 3R7XA 2O1MA 3P7IA 2W7YA 2XX7A 3N6UA 1IXCA 1ELJA 2RF1A 2XXTA 1VFEA 2F36A 2UXAA 1RYOA 4NF6A 4R75A 4TQUQ 4YKKA 5DYHA 4ZEFA 1N04A 4JDFA 1NMUA 4FAJA 4PETA 2D5WA 2PVUA 3C9HA 3CSBA 3LUYA 2V3TA 2Q2CA 2O7UA 4JBZA 4R72A 1WVJA 4E0XA 3IOTA 2ONRA 2I3VA 2ZMBA 2ZYOA 3GZGA 3PD8A 4GL0A 3MVYA 4PE5B 5KDTB 1B5JA 1TFAA 1ZIUA 1LLSA 2I6EA 3I6VA 2H98A 3BFUA 3LC8A 2X26A 3O66A 1JEUA 2DWHA 4LZ8A 4LZ7A 5H8QA 1AMFA 1B4HA 2OBGA 3DP4A 3HPIA 3IX1A 3DLNA 4OHNA 4TOZA 4YZZA 1CE2A 4UA8A 1USYH 2I4CA 1OMPA 4F1YA 3D4GA 4GF8A 1QULA 2REGA 3MZ1A 4Q30B 5L9SA 1LAFE 2V25A 2VHAA 1JQFA 2Q89A 2XXVA 3WAEA 1P1UA 4EF2A 4JSOA 4F31B 1N3WA 3OEMA 4PFUA 3VDFA 3KOSA 1MXUA 3O6IA 5I2KB 5BUUA 5I58B 5DT6A 2ABHA 3CIJA 3FD3A 3TKDA 5I58A 5CBRA 1I69A 4FECA 5AA2A 1LSTA 4GXSB 2Z22A 4QF9A 2HZKA 2UYFA 3S9NC 1RKMA 2QJEA 1FTOA 4U4SA 3RY3A 1B6HA 2DOJA 3KGCA 3LSXA 3R26A 4GOTA 5CC2A 1OIBA 2M8CA 4DDDA 2FA7A 4DLDA 2I49A 3BKIB 1T0KA 4JWXA 1S50A 4NF8B 3UP9A 2Y84A 3C31A 2GHBA 3H7MA 3V5AA 3VVEA 5DVJA 1NH8A 4DIGA 1TWYA 3MC2A 4LQ2A 4OVJA 1JVXA 4RA1A 4JSDA 2F34A 4YICA 2F5XA 3PGFA 3LBSA 2QS4A 1PBPA 3K1PA 5EHSA 4H1XA 4QFKA 4BDQA 5F1QA 1UQWA 2NUVA 4OETA 4R6HA 1URDA 2O84X 2V3QA 3TEPA 4F18A 4FEDA 1FW0A 3O29A 2ZNUA 4YKJA 3KN3A 5B70A 5HPQA 3IL1B 2D21A 1B40A 4BDOA 3SEWA 4H8JA 1Y20A 3I3VA 4ZE9A 5H8NB 4MFIA 1MPCA 5CMBA 3A3UA 3H06B 1BP5A 4H0WA 4ZS9A 5DVFA 1P1WA 1NNKA 4ZE8A 4P0GA 3H03A 2BJJX 3CG3A 1MRPA 3C34A 3UIFA 2AL4A 1GV8A 2DE4A 4OENA 5AA2B 1FQFA 4IGTA 3QSLA 4GFRA 1PB8A 1M5EA 4G77A 2Z8DA 1US4A 1H3DA 1MH4A 4KYSA 4MF3A 3RQTA 4I8CA 1XHYA 4PFYA 5I2NA 3USDA 2B3FA 1A8EA 1FQAA 1PEBA 4XTCQ 2QS2A 2XXUA 4UACA 5FTHA 2UVGA 1UTBA 5ICQA 1Y1MA 2F7AA 2V84A 4LA9A 1B58A 1S7YA 4QFLA 4H67A 3ZKLA 2F35A 1SYIA 4U2RA 5CM6A 4ZECA 5ICTA 2ANJA 2RC7A 5I57A 3ONMA 4Q5TA 4NF5B 4LUBA 4NEDA 1B4ZA 1PB7A 3QIMA 4RNSA 2XXYA 5F7VA 3U92A 1B0LA 1B52A 2D3IA 2LAOA 1YAEA 3IR1A 3K01A 3LSFB 1N0TA 4KCCA 4Q0CA 4ZEKA 2HCAA 2Q88A 1N7WA 1AL3A 2XX8A 1H44A 4NE4A 3U94A 4BLAA 4F3GA 3IO4A 1H76A 3SETA 5HM4B 3UN6A 1SW5A 4DXBA 4HCYA 3OELA 2XD2A 5ISUA 3PUXE 3IOVA 1EZOA 3N5LA 3CFXA 3PPOA 3UGWA 1MY1A 2HAUA 4H8IA 1JVYA 4YB6A 3Q27A 2Q2AA 3FATA 4GLIA 3H6UA 3VLUA 2B3BA 3C36A 4KD5A 2RINA 2V93A 1LB9A 3QXMA 5L9OA 3IAZA 4DCYA 1TXFA 5I56B 3TMGA 3U93A 4G68B 1D9YA 2NXOA 4GRKA 1PBQA 3V89B 3RLFE 1QUKA 3TTMA 4EF1A 2OWSA 3MP6A 2B65A 2ZNTA 1UTHA 4ONYA 3MPKA 1FTJA 1MPDA 1P1OA 5H8NA 3RTFB 3ZKKA 1A40A 4EDPA 3U8QA 4THIA 1R9QA 4NF4A 2Q9TA 4POXA 4F1UA 3TZAA 5DVIA 3FJMA 4RJZA 1DSNA 4OFLA 2OLBA 3F11A 4RPOA 1MY4A 2H4IA 3MWBA 1A54A 3KSJA 2O7IA 3JYRA 1XVYA 1J1NA 2PT1A 3K1MA 2UVJA 1SD3A 3I5OA 1SI1A 1MQJA 3Q25A 4G4PA 1B3FA 2QS3A 2RC8A 3PUVE 5IAIA 3HHFA 3IOUA 1DTZA 5IKBA 1JW5A 3MVXA 1N7XA 3PUYE 1OQGA 3S2VA 2DWAA 1IXHA 1XC1A 3LSWA 4BDNA 2HEUA 2HFBA 3FZVA 4MLVA 4QSCA 1O64A 1B2HA 2O69A 3PD9A 3U1OA 4GD5A 5H8QB 1FQCA 5JK4A 4U23A 1OLCA 4HS7A 5I59A 3T9UA 3BFTA 5I2NB 4N6PA 4I9DA 2ONKE 1MQHA 3MP1A 4G8HA 3S9LC 4QFPA 4IY6A 2P1SA 1B9JA 4DE8A 1UTHB 1KWHA 1MXVA 3G3KA 4XIGQ 3E13X 2ZNSA 3OSQA 5ITOA 1FQDA 3HCQA 2ZXTA 4OEVA 1A7LA 3SEUA 4YMAA 1ATGA 3ZS6A 2Y7WA 3KBRA 5ELVA 4BDLA 5TPAA 3TYHA 4WEDA 2H25A 3B7DA 1FTMA 5H8SA 4YKIA 3S9MC 2QS1A 3O97A 4LZ5A 4DZ1A 3S9EA 4KYDA 5KCJB 2O6AA 3CRBA 1MM7A 3RN8A 1L5TA 3IOWA 3PPRA 1BTJA 5H8HB 2Y7RA 4G8NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NG7A 2XXPA 3AXFA 2YPNA 3EF7A 4R2BA 4KFQA 5K2YA 1MQIA 1YTVA 2DWIA 1A55A 3EQ1A 2A5TB 3DM0A 4KI0E 5IZZA 3R6UA 3VV5A 4GX3A 4F3SA 4U21A 4QRZA 4F22A 1QW0A 3G3GA 2CZIA 1SVXB 2VT5A 4UABA 3FJ7A 4ZZEA 2VPNA 5I7IA 3PUWE 2RKMA 1IUDA 3K2DA 4OERA 2XXIA 4NF8A 5AA1A 3TPAA 5AA4A 4IO3A 3KEIA 2F8DA 4EUOA 1N76A 4F1VA 5AE4A 3M3FA 4OEUA 1DTGA 5KZTA 1NV5A 4N6DA 2ZYNA 5ET5A 4R9FA 3M3KA 3ISPA 1Q35A 3SESA 1D3KA 1B1XA 3RT8A 1Y3NA 3VXBA 2Q74A 1NV0A 2Y7IA 1FPEA 1QUJA 3BBRA 5ET7A 1QVSA 4L17A 1LAGE 2FHYA 2OCUA 4IY5A 2F78A 1UTBB 5LOMA 3EHSA 4OQOA 2I58A 2DQVA 3KBZA 4F29A 3M8UA 2PX1A 4PGNA 4MNCA 2FNCA 4QHQA 2PYYA 3C33A 5DEXA 1URGA 3VVDA 4JWYA 3U72A 3LR1A 4GX4A 4G68A 3RPLB 5BWJA 5ITPA 2DS9A 2QVUA 4R9GA 4RXLA 3PUZE 2I0BA 5H8NB 3H6TA 3MZBA 5FTIA 1WODA 3Q28A 2ZYKA 4G2ZA 3MZ9A 5KCJA 2R6GE 4YB7A 1MQGA 2QMWA 3OOAA 4P11A 4LATA 2E1SA 4NTLA 4X1BA 1P1NA 1B3HA 4M4GA 1NUXA 3U65A 2QMXA 3RPWA 3T9XB 3L6GA 5AA3A 3Q26A 3O28A 1FPDA 3TQWA 4Q8RA 1US5A 1FBEA 3OXNA 4X8RA 4E0WA 3OSRA 3EPEA 2GH9A 4KPTA 4GWOA 5IM2A 3OENA 1M5FA 1IXGA 1GTKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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