1TFAA

Ovotransferrin, n-terminal lobe, apo form
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
KSVIRWCTVSSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQVFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLIHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Alternative structural state of transferrin. The crystallographic analysis of iron-loaded but domain-opened ovotransferrin N-lobe.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
molecule keywords PROTEIN (OVOTRANSFERRIN)
total genus 100
structure length 329
sequence length 329
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-01-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1tfaA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1tfaA02
3KFMA 1EZOA 3UK4A 4JSOA 4GL0A 1ZKBA 3PU5A 4P11A 4RNSA 2XXHA 1H44A 4WKMA 3TCHA 1PC3A 1PB8A 3D4CA 1Y3NA 3P7IA 3IO6A 3PPOA 5CI5A 5I84A 4TOZA 2Q2CA 1GTKA 4F2OA 2ZYKA 4ELQA 1S50A 4ND9A 4F3PA 3HSTA 4O3BA 3KOSA 4YAHX 4RPNA 1P99A 5TU0A 1BTJA 1MPBA 3HCQA 5CM6A 2F5XA 2ZNUA 1D9VA 4EQBA 3IB1A 4I8CA 2QSXA 4NWCA 4XKQA 1LCTA 2XD2A 5HM4B 1XHYA 3MVWA 5LOMA 4GOTA 4YMAA 3QIMA 1MXYA 3B6WA 3N94A 3BFUA 3RGYA 3E9XA 4ZE9A 4WEPA 3MQ9A 4QFKA 1IITA 2BJJX 2I48A 4OTEA 1JQFA 1MY1A 5CMKA 3H7MA 3A09A 5FTIA 2XXYA 3K6UA 2QPQA 4HTGA 3RLFE 3OD7A 1DOTA 2ESNA 4KD5A 4RJZA 1SBPA 3FXRA 3Q29A 2H98A 1B5IA 2I4BA 3TODA 4DZ1A 2ZYMA 3EHUA 4ZECA 2Y84A 1FTJA 2YJPA 1JETA 2PBWA 3C31A 4F3GA 4GF8A 2QMXA 4FE8A 5TP9A 3E3KA 4U1OA 1P1OA 3LSFB 1NNTA 3IR1A 1M5BA 2VOZA 4I1DA 2VHAA 3ODBA 2F78A 1YAEA 2R6GE 4GVOA 5FHNA 3CIJA 3TTMA 4ECFA 3LSWA 4POWA 4MFIA 1M5CA 2RKMA 4R74A 4H8IA 4OESA 3CSBA 1SYIA 5EHMA 1B5JA 3PUVE 4FJPA 3ONMA 4LONB 4ZZAA 1MQJA 3O29A 3VLUA 5I56B 2H9BA 1JW1A 3R6UA 2V3UA 2XXVA 4FEDA 3O97A 1OLAA 4PE5B 1URDA 5H8NB 2DE3A 4OYVA 3CG1A 3VLWA 4EUOA 1T0KA 3RT6B 2GRVA 2HFBA 2ZNTA 1B3EA 1I69A 4FECA 4Q0CA 4P0IA 3GBAA 5I59A 3FJMA 4OMBA 3S9EA 4JWXA 1GVCA 2R71A 3AXFA 1R9LA 3PPQA 4MLVA 4EXLA 1RKMA 3FV1A 1MPDA 3TYHA 1YCJA 2F8DA 1F9BA 4KCCA 2OZZA 1AMFA 4RK9A 4H8JA 5TPAB 1N7WA 1ZTYA 3CFZA 1MXZA 3K6VA 2W7YA 3PUZE 3UGWA 1B52A 3SETA 5DVJA 4EXKA 4G8MA 3CFXA 1MXXA 3K6XA 1VE4A 3MZBA 3GBBA 3LUYA 3Q28A 3HV1A 4BDQA 3ZSFA 1IUDA 1JVXA 2QMWA 1BLFA 4ZEIA 2I49A 1XC1A 2H4IA 3G7WA 4ZZEA 3IB2A 3T96B 4EF2A 5B7DA 1IXGA 2V84A 3SKPA 5I58B 1KWHA 1B5HA 2O84X 2OCUA 4LQ2A 5DVFA 3TFLA 4AQ4A 2DE2A 4JXIA 1XVXA 3CSGA 4R9FA 4ONYA 5A5XB 4NEDA 5FHMA 2O1LA 3PD8A 4PQJA 4F19A 5KCJB 4F1YA 3UN6A 4OZ9A 3T93B 4IO7A 3SEWA 1QUJA 3TUSA 1JW5A 2WKYA 3Q26A 4G2ZA 1N04A 2P2AA 3CFLA 3PPRA 3T9VA 1M5DA 4U23A 1XVYA 2H5YA 3TTLA 2A5TA 2DS9A 3ILTB 4ELRA 2XD3A 2I3VA 1FQBA 1NNKA 2X7PA 3JYRA 2X26A 4KCDA 3KN8A 4IO2A 3FXUA 4LATA 4JWOA 3U93A 4R6HA 3SDFA 4C0RA 3GLBA 3OSQA 3PD9A 4L17A 3SEYA 4DXBA 3LR1A 5CMCA 1XS5A 4ZS9A 3A3CA 2NWJA 3MPLA 1ZLQA 2Z8EA 3QSLA 4FEBA 4U2RA 3VV5A 1Y3QA 4N6PA 3PPPA 1TXFA 1LCFA 3LBSA 3OEKA 1OQGA 5DVIA 3N26A 3RT8A 2UVJA 1QULA 2ABHA 2XX9A 1CE2A 3KJ7A 3MP1A 2DSFA 3KN7A 2V93A 3KBRA 4FIMA 1LAXA 4F39A 3BBRA 3ZKKA 3D4GA 4NF8B 1A54A 1MPCA 2UVIA 3HO7A 3CVGA 3ECRA 4H6DA 4RXLA 4XTCQ 5CBRA 4DCYA 1URGA 3PMXA 1DPEA 4OETA 1D4NA 3DP6A 3G3FA 3IO4A 4XKPA 4X1BA 1I6AA 4GXAA 1FQAA 2DWJA 1QKBA 4NF5A 3N6TA 4Z7EA 3KJTA 3JZJA 4F2QA 5DTBA 1MH4A 5AA1A 1M5FA 3IOWA 4LZ8A 4G68A 4YICA 1IIWA 2XHDA 4GL8A 3E4RA 4O3AA 3IL1B 4YB7A 3PUYE 1B4ZA 1PBQA 3IOVA 4F18A 1HSJA 1FW0A 1WVJA 4JBZA 4DIGA 4KFQA 3FATA 4UA8A 5K2XA 3OO8A 3QXMA 1DPPA 1LLSA 4G8NA 4GFRA 3TTRA 4BLAA 1LFGA 2ZYNA 3B6QA 1P1UA 1TFDA 3W15C 2AIXA 1A8EA 1BP5A 1JNFA 1QUKA 2V3TA 3C32A 3H6TA 2RF1A 3H4ZA 2UYEA 3MAMA 1SYHA 3DP8A 1NMUA 4G8HA 5JTYB 3S4UA 4QRZA 5DEXB 4KQPA 2OWTA 2OK2A 4NF4B 5H8FB 4TLMB 2B3BA 2HEUA 4IO6A 4LZ7A 4OXVA 1A8FA 2DXRA 1Y4CA 4IO4A 3G3GA 1II5A 5I2KA 1MQIA 1UIVA 1FQCA 3FUZA 3FVNA 2VD3A 3FZVA 4KYSA 3KZGA 2H99A 4LZ5A 3SESA 4IY5A 2A5TB 5I56A 3DP4A 2RCAA 4NF6A 4BDLA 1VFDA 4K3FA 1RYOA 1SW5A 2UVGA 3UIFA 3GZGA 3VVDA 4IGTA 1WODA 1USYE 1S7YA 3EHSA 2IEEA 5H8QB 5K2YA 3CR9A 1MY2A 3H06B 4E0WA 1IEJA 2Z23A 1EH3A 1Y4TA 4DDDA 3IAZA 4OENA 3R7XA 2F36A 4ZEFA 3T9UA 3QYTA 3CI8A 3OO9A 2AYSA 3RPWA 1FTLA 1OIBA 1O7TA 3EN3A 1QW0A 2GH9A 4H0WA 5AA2D 1NL5A 2NOOA 3N6UA 1LBBA 3OO7A 5J1DA 3HPIA 1EZ9A 2DOJA 3KSXA 3VXCA 4F3BA 4E0XA 5ICQA 4QFLA 1DTGA 4OEUA 3JV9A 1Y20A 5CMBA 1QJMA 4H67A 4YKIA 3K02A 5BWJA 5KCJA 1MQGA 4G68B 3FVKA 4MF3A 4ZDMA 2X7QA 5FHOA 2E1SA 2O69A 4BDRA 5I2NA 3M3KA 1IXHA 3H3GA 4OERA 5KZTA 3U92A 1MY4A 2G29A 3K1PA 4IY6A 2ALUA 4X1DA 4YMBA 1MDQA 1EU8A 2HQ0A 2F97A 1GR2A 2O51A 2QRYA 3O28A 1UTHA 2XXXA 3I3VA 4RK2A 4F29A 1SW1A 4QSDA 5JK4A 1SW4A 1MH3A 1Y9UA 4OEVA 2Y7WA 3L6HA 4H5FA 4XXUA 4YU0A 1IXCA 1PEBA 1PBPA 2DVCA 3DELB 2FYIA 3B7DA 1HSLA 4QSCA 1L5TA 1LAFE 2DYXA 3MW0A 4AB5A 1WDNA 1PDAA 3KG2A 3EQ1A 1UTBA 2I3WA 4XKRA 3IX1A 2ONSA 4OFLA 1GGGA 2PT1A 1LGBC 4U22A 3RN8A 1A99A 1B46A 1MRPA 1OLCA 3M3LA 1Q1KA 1AL3A 1VSOA 4M4GA 3S9LC 3DLNA 2I6EA 3V5AA 3KOTA 2OLBA 1B3LA 1NH7A 1D3KA 1N0TA 2QJEA 3MVXA 4O3CA 4RYAA 1VR5A 3HHGA 1O64A 3PGFA 2NUVA 3R26A 2REJA 1FQFA 3G3KA 3Q25A 1M5EA 1I6QA 2DWIA 4NF5B 3TQLA 5TPAA 1B05A 1H45A 2ZYOA 2ZNSA 3C36A 5FTHA 4NWDA 2O6AA 1DTZA 2D3IA 1URSA 3B6TA 2XX8A 1A40A 1ZJLA 1A55A 1ZMGA 3PV0E 4I62A 4OQOA 3RNNA 2REGA 1HSEA 2Z8FA 4BDMA 5DT6A 5I57B 1QVSA 4LUBA 1P1QA 1OVBA 1N7XA 5EYFA 2F7AA 4PFYA 2D21A 2FNCA 4IO3A 5EHSA 3VVFA 5KDTB 2GFEA 1SW2A 3VXBA 3VVEA 4M1VA 4OVJA 1OMPA 2THIA 3RTWB 1TFAA 4GIZA 5AA3A 3G3HA 2PVUA 1ANFA 2XXIA 3IOTA 3VFJA 1MY0A 4JSDA 1JEUA 2O7UA 3MP6A 4EQ9A 2GHAA 4RA1A 1JW4A 2H25A 4JDFA 2ONKE 1MS7A 1BIYA 1B3FA 3IJOB 3TPAA 1B2HA 4QFNA 5HPQA 4G4PA 1A7LA 4LA9A 4R75A 5CMMA 1S9TA 3KSJA 1MXWA 3HHFA 1H3DA 5H8NA 1N3WA 2QS4A 4MBPA 4X48A 5L8DA 4DCXA 5I57A 3TAJA 3ILUB 3N5LA 4IO5A 1B0LA 1IZ1A 4THIA 1B4HA 2I4CA 3MWBA 4GWOA 2Y7IA 4FORA 2RC9A 3SERA 4KHZE 1B0HA 4ELPA 4F22A 4R2BA 4IB2A 3OXNA 1Y3PA 1P1WA 1PB9A 1TT1A 3G3JA 3MZ1A 4RY1A 5DYHA 4KYEA 4F1VA 2DP8A 2F34A 5AA2A 5B70A 3TTKA 4OFOA 1LFIA 4HCWA 4NF8A 2RC8A 4P0GA 1AOVA 3V8XB 3KGCA 3LSXA 3U1OA 4QF9A 1R1NA 5M2VA 4ZEDA 1OVTA 3QAXA 2F6PA 2ANJA 1XOCA 5L9MA 2E0SA 1JEVA 3WAFA 3BKIB 4QSEA 1NFTA 3OOAA 4H65A 1AIVA 5L9SA 4TLLB 4N13A 2P1SA 3C9HA 4U4SA 5H8HA 1B7UA 4R9GA 2P0SA 3MVZA 1B3HA 1ZIUA 1B40A 4IGRA 1MQHA 4NE4A 1TWYA 3SEVA 2OJTA 3G3IA 4I9DA 3K01A 1OQHA 3UP9A 2NXOA 2Y7RA 1B7ZA 2F7CA 4QFPA 1YTVA 5CRYA 2Y7KA 4KR5A 4FAJA 3VDFA 5ISUA 4QHQA 2UVHA 2Y7PA 4POXA 1B58A 1LBCA 3PPNA 1CB6A 3U72A 3O6IA 1NNFA 4C1TA 5KDTA 1UTHB 1Z7ME 4U4XA 4XIGQ 2Z8DA 4GQOA 3IK6B 3T9HB 1MXUA 4GXSB 2XXUA 4R72A 3VE1B 4QFOA 2AL4A 2HZKA 3FXQA 3M8UA 2D5WA 1SDXA 4F1UA 3OELA 4MH5A 4Q8RA 2ZXTA 3QUJA 2DWAA 3SEUA 5I58A 5AA4A 1LAGE 1LSTA 1B51A 4JWYA 2Q89A 1FCKA 3VLVA 3H03A 5I2KB 3H6UA 3S2VA 3OO6A 4AB6A 5A5XA 4U21A 1SQYA 1US4A 3QUFA 2Z22A 3EHTA 3S9MC 1IQ7A 2B3FA 3EF7A 3W9VA 1NKXA 4LVQA 4H5GA 4N07A 3C4MA 1MM7A 4EF1A 4LP2B 4NF6B 2RINA 4F3SA 1QUIA 4HW8A 2V25A 4RPOA 1N84A 1J1NA 2G93A 2OBGA 4ESXA 1US5A 4R6YA 2YPNA 3GXAA 4EQ7A 2VP1A 1ZBMA 3FASA 2QS3A 3U8QA 5I59B 2I58A 1POTA 3MVYA 3T66A 1JVYA 4OFJA 1B9JA 3I6VA 3MPKA 1D9YA 1Y1MA 2F6GA 3F11A 3OENA 1DSNA 2F7BA 4YKKA 3TTNA 2RC7A 1B1XA 1IXIA 3O66A 3FV2A 3A3UA 1B3GA 2DQVA 3K6WA 3PUXE 4PFUA 1EZPA 4TQUQ 1H76A 2GHBA 3RTFB 5IKBA 2CZLA 2UXAA 2OWSA 2XX7A 3M3FA 1MM6A 3EPEA 5F7VA 1FTOA 3S9NC 3FVOA 3C34A 5JTYA 3MJNA 1B6HA 3TDJA 3USDA 3FVGA 3WAEA 3IJXB 4WEDA 1I6BA 1N76A 2XXQA 1Y1ZA 3FGSA 3O6HA 1MY3A 3O9PA 4OWDA 3FJGA 4PP0A 4YKPA 4DE8A 5ICTA 2ZMBA 4H1XA 2PYYA 4NMYA 1LB9A 1GV8A 3RUMA 1SVXB 3K0VA 5BUUA 1B32A 2HZLA 2KLFA 3H6WA 5I2NB 4YKJA 4ESWA 2PMSA 1R9QA 4R73A 1XT8A 1FTMA 1VFEA 2Q9TA 4ZE8A 3L6GA 1UIUA 2A5SA 3O2AA 4UACA 2XXWA 1MG1A 4HS7A 3C35A 1SD3A 5ITPA 1UQWA 3TMGA 5TP9B 3W9WA 3HN0A 4WXJA 2DE4A 4BDNA 4Q30B 3UORA 4BDOA 3PUWE 3CG3A 2PT2A 5H8QA 4GLIA 3SEXA 2DWHA 1BKAA 3IOUA 3MP8A 3ZS6A 2ONRA 2QL3A 1MXVA 5L9OA 1LAHE 1N3XA 4G68C 1O63A 1H43A 2LAOA 2YLNA 2XXTA 5DEXA 3ZKLA 1NNPA 5AA2B 2FA7A 1ELJA 3TELA 3UA8A 4JB7A 5H8SA 5CBSA 3IORA 3T9XB 3K4UA 1SI1A 3OMBA 2HXWA 4PFWA 5AA4B 2Q88A 3TKDA 3LSLA 1FQEA 5F1QA 2AL5A 1Z7NE 3TZAA 3TEPA 3IB0A 4FATA 5CC2A 4KPTA 5IAIA 4Q5TA 2XXRA 1RYXA 2I0BA 3C33A 1R6ZA 3TQWA 4PFTA 5H8HB 2UYFA 4X9TA 4R6KA 5HBCA 3QK6A 1QKAA 1USYH 3RQTA 1DMBA 3Q27A 3K1MA 1B1HA 3V89B 2B65A 2QS1A 2DVZA 4DXUA 4F31B 5AE4A 4R2FA 2Q2AA 2RCBA 1FQDA 3I5OA 2O1MA 2Q8JA 3KEIA 4C1UA 1LFHA 4YB5A 3CRBA 3MUQA 4KI0E 2I0CA 4ZEBA 3LC8A 4Z0IA 2NVUB 1Q35A 1ZU0A 3OSRA 4U1ZA 2O68A 3V83A 4LQ5A 1YPNA 1POY1 2VGQA 4GRKA 4G77A 3H6VA 5ELVA 5H8FA 1MQDA 1NH8A 3KN3A 3U94A 2VD2A 4DXCA 3K1NA 2O7IA 4NTLA 4OHNA 3TCFA 2R9JA 3OEMA 4ISUA 4MLQA 2CMOA 2HAUA 3MC2A 3O6GA 4YZZA 1MDP1 2F35A 1PB7A 2IA4A 2QS2A 1LB8A 4ELOA 1P1NA 1UTBB 2XXPA 4XKNA 4EDPA 3FJ7A 3MBPA 2M8CA 3K00A 3THIA 1B7HA 1AH5A 4NF4A 3PMVA 3K2DA 2V3QA 3TCGA 3BFTA 1SI0A 3FD3A 3PMWA 3MZ9A 2PX1A 3E13X 4HCYA 3T22A 4DLDA 3DM0A 2HCAA 5JEIA 4GD5A 2HAVA 3FIRA 4ZEKA 1FTKA 4YB6A 3RY3A 1ATGA 2DXYA 4KYDA 4PETA 5ITOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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