1MPCA

Maltodextrin-binding protein (maltose-binding protein) mutant, with arginine replacing tryptophan at position 230 (trp-230-arg)
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPRAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
publication title Crystal Structures and Solution Conformations of a Dominant-Negative Mutant of Escherichia Coli Maltose-Binding Protein
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Periplasmic binding protein
total genus 120
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpcA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpcA01
4KD5A 3N5LA 4IO5A 4M4GA 3OSRA 1N7XA 3U1OA 4ELOA 4XKPA 3WAFA 2O51A 2ZMBA 3AXFA 3ILTB 2XXHA 4FORA 5ITPA 2DE2A 1EZOA 4PETA 1WDNA 1IITA 4TLMB 2I3WA 1FQCA 1B7UA 3S4UA 3HHFA 2XXTA 3N6UA 3SEWA 2UVGA 3B6WA 2YPNA 2OJTA 2THIA 4R2BA 4QSEA 4TQUQ 3M8UA 3FXQA 4U21A 1QUIA 2PT2A 2UYFA 4OEUA 2XXXA 1AL3A 4F18A 4TLLB 5H8QB 5JTYA 2NVUB 2P0SA 3IJOB 3KBRA 2DE3A 2O1LA 1IZ1A 4H6DA 3TQWA 3WAEA 3FVGA 1BP5A 2Y7RA 4P0IA 4RYAA 5JEIA 1PB9A 1HSEA 3ONMA 4R73A 4BDLA 1AOVA 3H06B 3RLFE 3MPKA 2P1SA 1SVXB 2ZNTA 1LAGE 1N0TA 3KN3A 1SW5A 3O66A 4JB7A 1N84A 2VD2A 2XX9A 4N07A 1P1OA 3OELA 3BFTA 5KDTA 2RKMA 5H8NA 1N3WA 4FECA 4GVOA 4XIGQ 3FD3A 3PD8A 2IA4A 1FQBA 1MH4A 4KYSA 5FHOA 4ZS9A 2I0BA 4ELQA 2XXIA 4RJZA 4K3FA 4F19A 3SEYA 1OQHA 2RC9A 1MY3A 1AIVA 3TFLA 1R1NA 3K1PA 3FVKA 2O7UA 5CI5A 2DSFA 3BFUA 3SDFA 2YLNA 4LZ7A 3EHSA 3S2VA 4NWCA 4TOZA 4Q8RA 4U22A 5BUUA 4H65A 5EHMA 4F1YA 5BWJA 2HXWA 5AA4B 3IX1A 5JK4A 1B3FA 2LAOA 3E13X 3EHTA 3S9LC 1O63A 2ZYKA 4NWDA 2W7YA 2QMXA 1IIWA 2H99A 5TP9A 1MY4A 1WVJA 2RF1A 5I58B 1B51A 3IOTA 5HM4B 1B4HA 3IORA 4F31B 4JDFA 5DEXB 1MQDA 4DCXA 2AL5A 2Y7KA 2HEUA 3OO6A 1A40A 4U23A 2ESNA 1J1NA 3DP4A 1N7WA 1M5EA 4H0WA 2PVUA 3BKIB 4EQ7A 4IGTA 1NKXA 1A7LA 2WKYA 4ECFA 3I3VA 1SW2A 2XXWA 1H44A 4JBZA 1XT8A 4YMAA 3PMWA 4DZ1A 4THIA 1R9QA 2D3IA 4G68B 4DCYA 3SEXA 3TAJA 1ZTYA 4DXUA 5ISUA 3MWBA 2F78A 1FTJA 4MFIA 4G77A 2H5YA 1S7YA 2GH9A 5M2VA 4Q30B 1I6AA 4KFQA 3VLUA 1F9BA 3LBSA 1N3XA 1NNKA 4EDPA 3MW0A 3M3LA 1BKAA 3USDA 1GVCA 5AE4A 2F6GA 4JSOA 2H9BA 2X26A 4F3BA 1B1XA 2ZYOA 2DWJA 1D3KA 4ONYA 4OMBA 4NF4B 1VE4A 2A5TB 3CG1A 3C32A 4POWA 5I2NB 3ZKKA 3N26A 3T9VA 4IY6A 4F3SA 1US5A 1AH5A 3BBRA 1LBBA 1JW5A 2Z8EA 1Y1ZA 5DYHA 3TTMA 5I59A 2XX7A 1T0KA 1LSTA 3H6WA 2UVIA 4NF8A 3OO9A 3O9PA 2DWHA 4YKPA 4I9DA 2HAUA 3GLBA 4MLVA 2I3VA 4G8NA 3QUFA 2NWJA 3CRBA 1MXVA 3VDFA 2Y7WA 3IO6A 4ZEIA 3L6HA 4OVJA 4EF1A 3TCHA 3T9HB 3HN0A 4H67A 3FJMA 1UIVA 2ONSA 3ZSFA 3KSXA 1B7HA 2FYIA 5B7DA 2AYSA 1MM6A 1PEBA 2ZNUA 1LFIA 4KYEA 2Y7PA 1S50A 4WXJA 2DXYA 4QFKA 3HV1A 4OWDA 2F7BA 4C1UA 2O7IA 1B7ZA 4XKQA 3G3JA 4LZ8A 1UTBA 4OQOA 3Q27A 1B9JA 3TTNA 4YAHX 4H5GA 3FXUA 4KI0E 1Y3QA 4R9GA 2UVJA 1TFAA 2FNCA 4PE5B 1POY1 1VFEA 5DVFA 2I6EA 3FV2A 3MUQA 4PFUA 3TTRA 3P7IA 3PUXE 4H8JA 4Q0CA 4RNSA 4AB5A 3SETA 4BDMA 4YICA 2XD3A 4DE8A 1HSLA 5IKBA 3LSLA 4YZZA 5HPQA 1Z7ME 2ONKE 1UTHB 1B0LA 5I84A 1H76A 3TDJA 1XC1A 4U4SA 1AMFA 2AIXA 1JQFA 4OENA 1Y3NA 2F36A 4I8CA 2V84A 4IO2A 4PQJA 3HPIA 4PFWA 3FJ7A 3OXNA 4OFOA 3C34A 2RINA 5CC2A 4MLQA 4M1VA 3JZJA 1MPCA 2PT1A 2B3FA 3T96B 4H5FA 4YB6A 2H4IA 2B65A 3IJXB 5B70A 4OESA 4UA8A 3CFZA 3RGYA 4LUBA 1R6ZA 3IB0A 1FTOA 2QPQA 1SBPA 1O7TA 1SI1A 1B3LA 1MS7A 4NMYA 4X48A 3UGWA 3RT6B 3GXAA 4RK2A 2VHAA 4BDNA 1URDA 1QUJA 1ZIUA 1EH3A 4PFTA 1IQ7A 1JW1A 3T9XB 3IK6B 4ZEBA 5J1DA 4ND9A 2O69A 1LLSA 3PPRA 1B32A 3MVWA 5FTIA 3OO8A 3MZ9A 5H8QA 3IOVA 4YB7A 3FZVA 1OVBA 3GZGA 4AB6A 3Q26A 5CMMA 2GHBA 2DVCA 1QVSA 3KN8A 3G3KA 4RPOA 5H8HB 2O84X 2I0CA 1PDAA 2E1SA 3PPQA 1XOCA 3VVDA 1QULA 3H6UA 4LA9A 2XXRA 2DE4A 2YJPA 4KPTA 2DVZA 3KZGA 4DDDA 2AL4A 3RTFB 4GLIA 4ZE8A 1P1QA 1NNPA 4DXBA 3MAMA 3C31A 3C4MA 2XHDA 2ALUA 1VR5A 3MVZA 4R9FA 3IO4A 1SYHA 4DXCA 2G93A 1MQHA 4X1BA 2VD3A 4MF3A 5AA2D 1QUKA 4R6KA 3A09A 3RN8A 4U2RA 3FASA 3LSXA 4LQ2A 4DLDA 3MP1A 3TELA 4G4PA 2HAVA 2V3QA 1A8FA 1ZLQA 2OCUA 3O6HA 2DYXA 4NF5B 3SESA 5TU0A 5AA4A 5I56B 3MBPA 2HFBA 1SDXA 3K6VA 4P11A 1MG1A 2QSXA 1D4NA 1M5BA 4R75A 5EYFA 2UYEA 1A8EA 2Q2CA 3R6UA 5A5XB 1LB9A 4HTGA 5I58A 3TMGA 1MY2A 3HSTA 3H6TA 3QXMA 3M3FA 2R9JA 5IAIA 5AA1A 4F1VA 1TWYA 2I4CA 2DS9A 2OWTA 1IXCA 3PMVA 3CFXA 1SD3A 2I4BA 3H7MA 5DEXA 3UN6A 1GR2A 4QHQA 2G29A 3UIFA 1RKMA 3KOSA 5ICTA 1A55A 1YAEA 2NXOA 3V8XB 5H8SA 2Q8JA 1M5CA 2VOZA 4G8MA 3RT8A 1Y3PA 3PMXA 4U1OA 3TEPA 3IB1A 4X1DA 2O68A 2PMSA 1USYH 4EQBA 3JYRA 2QRYA 4FAJA 2P2AA 4L17A 3DLNA 1TXFA 5L8DA 5KZTA 3RUMA 1ATGA 4G68A 4OHNA 4JWYA 4KCDA 1A99A 1I6BA 4LP2B 1NNTA 1P1WA 1MH3A 2O6AA 4HS7A 1I69A 3EF7A 2QMWA 3DELB 4OETA 4U4XA 4H8IA 1NH8A 2QS3A 3CR9A 2XXQA 1LB8A 3EN3A 2GFEA 5L9SA 4R2FA 2REJA 2DQVA 4P0GA 2CMOA 1SQYA 3QSLA 3RNNA 4XKRA 3K0VA 3R26A 4JSDA 3QIMA 2ZNSA 4NF4A 4ESWA 2A5TA 1LCFA 3QUJA 1FQEA 2Y84A 3CI8A 5CRYA 4QSDA 1A54A 5I2NA 2NOOA 3I6VA 1MXWA 1MXYA 3W9WA 4QF9A 5CM6A 1UQWA 3QYTA 3W9VA 1JVXA 1TFDA 2X7PA 3FXRA 1B2HA 4ELPA 1MRPA 4F1UA 1B58A 1BLFA 3PV0E 2OBGA 4ESXA 2CZLA 4LVQA 2QL3A 1ZJLA 4BDRA 4IO6A 3G7WA 4U1ZA 1LAHE 1H43A 4N13A 1ZU0A 3QK6A 4ZZEA 4OFJA 1PC3A 3D4CA 3TQLA 5DVIA 4QFNA 3VLWA 3S9MC 5FTHA 4O3CA 3O97A 3DM0A 1NNFA 4YU0A 1SW1A 5HBCA 1N76A 2GHAA 2XXVA 1FQAA 3CVGA 4O3BA 1P1NA 4GFRA 3O6IA 3FGSA 3PUZE 5L9MA 5AA2B 2Z22A 3THIA 4IO3A 2OLBA 1CB6A 3R7XA 1MDQA 1OLCA 3OSQA 5LOMA 2D5WA 2I48A 2V3UA 1VFDA 1Y4TA 3TODA 3EHUA 5H8FB 3PGFA 1DPPA 4LZ5A 4KHZE 1MY0A 1LCTA 1MXUA 3MVXA 1LFGA 2Z8DA 4NTLA 4BDOA 2I58A 4OFLA 1MQIA 3B6QA 2PBWA 2XX8A 3Q29A 1UTHA 2H25A 4YKIA 1CE2A 1YCJA 3ILUB 1DOTA 5DTBA 3TYHA 4KYDA 3C9HA 4POXA 4OTEA 2DXRA 2XXUA 4XTCQ 4G68C 1LAXA 2HCAA 3CIJA 3UORA 4F3PA 4AQ4A 3OOAA 2ONRA 2Z23A 1B40A 3HCQA 5ICQA 3KG2A 5KCJB 4YKKA 3KJ7A 1FTLA 2F8DA 4ELRA 1M5DA 4NF6A 4FATA 4OXVA 3CSGA 1Y20A 5ITOA 3FVNA 1WODA 3W15C 1R9LA 2HZLA 3K2DA 5DVJA 3FUZA 2H98A 3RPWA 3L6GA 1LFHA 4LONB 4NF6B 3C35A 1BIYA 4BDQA 3IB2A 3OEMA 5I57B 3U8QA 3K01A 3TPAA 1EZPA 1URSA 4Q5TA 3KEIA 3FVOA 4LQ5A 3GBBA 4IY5A 2R6GE 4RXLA 4I62A 1OIBA 1ELJA 4PP0A 2KLFA 5I2KA 2QS1A 4EUOA 3MJNA 4GWOA 4X9TA 4ZECA 2Q89A 3T93B 4O3AA 1B05A 5H8HA 5FHMA 3TUSA 3E3KA 3K02A 1DTGA 1JEVA 1KWHA 1OVTA 2FA7A 2M8CA 1EZ9A 5I2KB 4ISUA 1H3DA 1ZMGA 3PU5A 1MPDA 2VGQA 1B5JA 4F2OA 4IB2A 3VLVA 3SERA 1NFTA 3QAXA 3Q25A 1MDP1 2RCAA 2D21A 2RCBA 2V3TA 3E4RA 4YB5A 1LGBC 3OMBA 4R74A 2GRVA 4G2ZA 4XXUA 5ELVA 2F7CA 1O64A 2HZKA 1D9VA 3FATA 4GXSB 3RTWB 3KGCA 4QSCA 5TPAA 4WEPA 3M3KA 5CBSA 1MPBA 4IGRA 1UIUA 3PPNA 1B46A 3G3IA 3MP8A 5JTYB 1SW4A 3TKDA 4Z0IA 4YKJA 4GIZA 4NF5A 5I56A 3O29A 5TPAB 5EHSA 1IXHA 3O2AA 4ZDMA 2ANJA 3VXBA 4HW8A 3C36A 1Q35A 3UP9A 4QFPA 1GTKA 3K6XA 4OZ9A 5A5XA 3CG3A 1B52A 3K6UA 5KDTB 2Z8FA 3U93A 5H8NB 4ZEFA 1L5TA 3PUWE 1YPNA 3VXCA 4JWOA 3C33A 3IL1B 1IEJA 2A5SA 3T9UA 3T22A 2RC8A 2UXAA 1MXXA 3KOTA 1IUDA 3A3UA 4FJPA 4DIGA 2OK2A 3K6WA 4EF2A 3PD9A 2PYYA 1XVYA 1BTJA 3H6VA 2DWIA 3V89B 4H1XA 1FW0A 1D9YA 1SI0A 3S9NC 3PPOA 2QS4A 1GGGA 4FIMA 3I5OA 1FQDA 3N6TA 1N04A 2F35A 1JVYA 3MQ9A 1XVXA 1Z7NE 5K2XA 2B3BA 3MVYA 1I6QA 1ANFA 3O28A 4Z7EA 4IO4A 1ZKBA 3TCFA 4GXAA 3B6TA 4FEBA 2R71A 5CMCA 1DSNA 4R72A 1QKBA 4FE8A 5TP9B 4QRZA 1PBPA 1POTA 2RC7A 4HCWA 1S9TA 1Y9UA 3HO7A 3ZKLA 1OLAA 2IEEA 2F97A 3G3FA 3IR1A 2Q9TA 3MPLA 4ZE9A 1FQFA 3JV9A 3K4UA 3TTKA 4GOTA 2DP8A 4GRKA 1JEUA 3TZAA 4F29A 3UK4A 1B3GA 4GF8A 3ECRA 4WEDA 1B1HA 3SKPA 3ODBA 5F1QA 1JETA 4KCCA 1QJMA 1GV8A 2I49A 4F2QA 3A3CA 3KN7A 3IOUA 2VP1A 3SEUA 4R6HA 1DMBA 2F5XA 3K00A 4FEDA 1MM7A 3VV5A 2V93A 3N94A 4E0XA 4OEVA 3SEVA 4JXIA 2Y7IA 3F11A 3OEKA 1XS5A 1ZBMA 1B3EA 1MXZA 4XKNA 3MP6A 1US4A 4EXLA 4RA1A 4I1DA 3U94A 3LSFB 2UVHA 1P1UA 2DOJA 3TTLA 2DWAA 3H3GA 3PUYE 1Y4CA 3FV1A 3RY3A 2XXPA 2E0SA 2XD2A 3K1NA 3LSWA 4C0RA 3TCGA 1JNFA 1P99A 1MQJA 1B5HA 4R6YA 3H03A 4RY1A 3T66A 4ZEKA 4NEDA 4JWXA 1LBCA 3G3HA 1PB7A 4GL8A 4GL0A 2F6PA 4E0WA 4ZEDA 4BLAA 5CMBA 2X7QA 1B5IA 4C1TA 5CMKA 3FJGA 1HSJA 1DPEA 3DP8A 4KQPA 2REGA 4UACA 3ZS6A 1RYXA 4IO7A 1MQGA 5F7VA 2ZYNA 1IXGA 4EQ9A 1II5A 4OYVA 3B7DA 5AA2A 2BJJX 3EPEA 5CBRA 4GQOA 3V83A 3FIRA 3G3GA 3OO7A 3KSJA 1NMUA 3VVEA 1DTZA 2F7AA 1Q1KA 3LUYA 5I59B 3DP6A 5AA3A 3GBAA 5H8FA 3MZBA 4F3GA 3PPPA 1B6HA 1B3HA 2QJEA 4NF8B 3KFMA 1TT1A 3VFJA 1URGA 3UA8A 3CFLA 1JW4A 2HQ0A 1QKAA 3Q28A 4MBPA 5FHNA 4RK9A 4HCYA 2OWSA 3LC8A 1FTMA 4KR5A 1LAFE 3EQ1A 2QS2A 3KJTA 3K1MA 3MC2A 3LR1A 4WKMA 4QFOA 1M5FA 3CSBA 3MZ1A 1SYIA 4F39A 3IOWA 1IXIA 2ABHA 3PUVE 1H45A 2Q88A 1NH7A 5KCJA 1OQGA 1UTBB 3HHGA 4YMBA 3OD7A 3RQTA 3U92A 1USYE 1FCKA 2O1MA 2Q2AA 2NUVA 4NE4A 1QW0A 1YTVA 1XHYA 3E9XA 1PB8A 4QFLA 2OZZA 1B0HA 2PX1A 1FTKA 3OENA 4N6PA 4F22A 1Y1MA 1NL5A 4MH5A 4ZZAA 5I57A 1RYOA 1PBQA 4OERA 4EXKA 3S9EA 4G8HA 1B4ZA 3V5AA 3U72A 3VVFA 3IAZA 4RPNA 1OMPA 2XXYA 3D4GA 4GD5A 2F34A 1EU8A 3H4ZA 3O6GA 4PFYA 2ZXTA 2ZYMA 1MY1A 4LATA 2V25A 5DT6A 5K2YA 1VSOA 3VE1B 5L9OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KD5A 3N5LA 4IO5A 4M4GA 3OSRA 1N7XA 4PF6A 3U1OA 5T3JA 4ELOA 5IZ3B 4XKPA 3WAFA 2O51A 2ZMBA 3AXFA 3ILTB 2XXHA 4FORA 5ITPA 4O7IA 1LBXA 4KXPA 2DE2A 1FPKA 1EZOA 4PETA 1DCUA 1WDNA 2XXKA 2XWOA 1IITA 4UABA 4TLMB 2I3WA 1FQCA 1B7UA 3S4UA 3HHFA 2XXTA 3N6UA 3SEWA 2UVGA 3B6WA 2YPNA 2OJTA 2THIA 4R2BA 1INPA 4QSEA 4TQUQ 3M8UA 3FXQA 4U21A 1QUIA 2PT2A 2UYFA 4OEUA 2XXXA 1AL3A 2XWKA 4F18A 4TLLB 5H8QB 5JTYA 2NVUB 2P0SA 3IJOB 3KBRA 1NUZA 2DE3A 2O1LA 1IZ1A 4H6DA 2HHMA 3TQWA 3WAEA 3FVGA 1BP5A 2Y7RA 4P0IA 4RYAA 5JEIA 2HPGA 1PB9A 1HSEA 3ONMA 4R73A 4BDLA 1AOVA 3H06B 3RLFE 3MPKA 1Q9DA 2P1SA 4X8RA 1SVXB 2ZNTA 1LAGE 1N0TA 3KN3A 1SW5A 3O66A 4JB7A 1N84A 2VD2A 2XX9A 4N07A 1P1OA 3OELA 3BFTA 4PTKA 5KDTA 3E79A 2RKMA 5H8NA 3IFCA 1N3WA 4FECA 4GVOA 4PGNA 4XIGQ 1YZ0A 2ZZXA 3FD3A 3PD8A 2IA4A 1FQBA 1MH4A 4KYSA 5FHOA 4ZS9A 2I0BA 4ELQA 4PBHA 2XXIA 4RJZA 4K3FA 4F19A 4DI3D 3SEYA 1OQHA 2RC9A 1MY3A 1AIVA 3TFLA 1IMFA 2WBBA 1R1NA 3K1PA 3FVKA 2O7UA 5CI5A 2DSFA 3BFUA 3SDFA 4XEQA 5ET7A 2YLNA 3E78A 4LZ7A 3EHSA 1LBVA 3S2VA 4NWCA 1FPFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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