4OXVA

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa complexed with valine
Total Genus 158
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
158
sequence length
428
structure length
424
Chain Sequence
APTALERVQKEGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFAQHLQQRLPRYESHFKQSGKQLDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of MltF from Pseudomonas aeruginosa complexed with valine
rcsb
molecule keywords Membrane-bound lytic murein transglycosylase F
molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa padk2_cf510
total genus 158
structure length 424
sequence length 428
ec nomenclature ec 4.2.2.-:
pdb deposition date 2014-02-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4oxvA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4oxvA02
1MXUA 4OQOA 4R6YA 3THIA 2XXWA 2XXXA 3E9XA 2O1LA 3O6IA 2XXYA 3TTKA 4OENA 4U1OA 3S9NC 3BBRA 5IKBA 3PUYE 1MQIA 4LZ5A 3ZKLA 5HM4B 2Y7PA 4ZDMA 3TCHA 1H43A 3O6GA 2DVZA 3OSQA 5AA4B 3G3FA 2ZNTA 4YB5A 1YTVA 1PBQA 3VV5A 2OJTA 1MY3A 3OEKA 3KN3A 1Y3QA 1FTMA 3UP9A 4F3PA 3ONMA 5I57B 4POXA 3FVKA 2VOZA 2DWAA 1A55A 1NH7A 1H76A 5ISUA 3IO4A 1M5CA 4LQ2A 5HBCA 3GBBA 1EH3A 3C32A 3MC2A 1N7WA 1MQGA 1DTZA 2Q89A 2DE4A 3HSTA 2O1MA 3D4GA 3ILTB 4L17A 3T9XB 4PP0A 4EDPA 3IL1B 3W15C 2A5TA 2DWHA 4DXCA 4Z7EA 1OQHA 1ZLQA 5DTBA 5H8FA 2Z8FA 3AXFA 4G68C 3HCQA 4U1ZA 1LAGE 4YMBA 2GH9A 1A8FA 4ZEDA 2GHAA 4X48A 3A3UA 3VVFA 2DSFA 1NKXA 3CRBA 4JWXA 5H8NA 4AQ4A 4LZ7A 3TTRA 5AA3A 2G93A 4GXSB 4C1TA 1B5IA 4DCYA 1LAXA 1LLSA 1Y3PA 1B32A 3MAMA 3K1NA 2ONKE 4NWCA 3MP6A 5BWJA 2ABHA 1HSEA 1MY4A 4Q5TA 5L8DA 3VXCA 4KPTA 4XKRA 3MZ1A 4GVOA 2H99A 2HQ0A 1M5EA 3SEWA 2Z8EA 3IORA 3TQWA 3FJMA 3KGCA 2VHAA 3C34A 5LOMA 3TTLA 1MPCA 4EF1A 1YPNA 2H25A 2XD3A 3R7XA 5DEXA 4IGTA 3E4RA 4YB7A 4RPNA 3OXNA 4I9DA 3JYRA 1SW4A 4EQ9A 2F34A 1ANFA 3IOTA 1EZ9A 1P1WA 2XXHA 1B3EA 3Q28A 1N3XA 3KFMA 2OZZA 2W7YA 1Y4TA 4DIGA 2DS9A 2A5TB 2OK2A 4FEDA 1R6ZA 1OQGA 3PPPA 1LBBA 3SEYA 2I58A 5H8FB 4PFWA 1FQEA 4U4XA 4RPOA 1PB9A 1B52A 4OEVA 3QUJA 4OTEA 3OOAA 1II5A 1S7YA 3K01A 2Y7IA 5H8NB 1SW1A 2Q2AA 1D9YA 4R9FA 2RCBA 2Q8JA 2DE2A 1FQCA 1LFGA 3D4CA 4KHZE 3S9MC 4KYSA 4U2RA 2P0SA 4KYEA 2VGQA 2P2AA 4QSEA 5TPAA 1SYHA 3O9PA 4DE8A 4F3GA 3PPNA 1LB9A 2X26A 4ISUA 2RCAA 1US5A 4KCCA 2HZLA 3C4MA 3OO9A 2VD2A 4QFLA 4R2FA 4RJZA 5JTYA 3U93A 1B2HA 3O66A 3OO8A 2ZYNA 2DXYA 3B6WA 5CMCA 4YZZA 5DEXB 3OEMA 4HCYA 1GTKA 2RC7A 3CSGA 3N5LA 1R9LA 1MXWA 2UVJA 1MY1A 5L9SA 3TZAA 1ELJA 3TTMA 1P1OA 1DSNA 3CFXA 4C0RA 1B58A 3VVEA 1DTGA 1S50A 1A99A 4LA9A 1VR5A 1SYIA 3B6TA 4JSOA 4PFTA 3UK4A 4P11A 3IB2A 1Z7ME 5F1QA 1LSTA 1B7UA 3PUXE 2DWJA 1MQHA 1NL5A 1ZIUA 5TP9A 5I84A 3Q26A 1MDQA 1B9JA 4YKPA 2VD3A 1LGBC 1JETA 3TDJA 3P7IA 3DLNA 4RK2A 1LCTA 3FXUA 1B7ZA 1Y1ZA 1PBPA 2XXVA 1B1XA 1LFHA 1I69A 4U4SA 4JWYA 3K6WA 1MDP1 3VLVA 4ND9A 1MXYA 5TPAB 1URSA 3VLWA 3C35A 4GIZA 1B5HA 1OIBA 3PUWE 1QUIA 1N3WA 4AB5A 5B7DA 4F39A 4FE8A 3OO6A 4TQUQ 1WODA 2QJEA 4QFPA 3FATA 4NF4A 2YPNA 2O7UA 2Z8DA 5JTYB 3IOWA 1XVYA 4IO5A 2F7AA 2QPQA 3N6TA 5H8QB 2ALUA 1ZTYA 3RQTA 4JB7A 4YKKA 1BLFA 5HPQA 3B7DA 1JQFA 2XXIA 4IGRA 4LUBA 3RUMA 4KD5A 4IB2A 1OLCA 2NWJA 4BDOA 1O64A 4F31B 4RNSA 1XHYA 2Q88A 5DVFA 3V89B 3PD9A 1SI0A 3PPOA 4LATA 5EHMA 2OLBA 5KDTB 2Y7KA 2QL3A 3WAEA 1BIYA 1B05A 5CMMA 2RKMA 3L6HA 4IO2A 5TP9B 3ZSFA 4G68A 4DDDA 4GOTA 3PU5A 2REGA 3TMGA 4GL0A 4QHQA 4MLVA 1P1UA 2PYYA 5FHNA 5CRYA 3RPWA 2UVGA 3JZJA 4KQPA 1SDXA 5DT6A 4EQBA 2VP1A 2ZXTA 2NUVA 4RYAA 3TCFA 1LAFE 2E0SA 4GD5A 3SETA 4KFQA 3K1MA 1DOTA 1NNPA 4NF4B 4EF2A 3V5AA 3KJ7A 3BFTA 3H3GA 4ELOA 4LQ5A 1IXCA 2H4IA 1BP5A 1Y1MA 4F19A 1S9TA 3CR9A 3O97A 1MY2A 3C9HA 2F36A 4HCWA 5DVIA 2XHDA 1CB6A 1SBPA 1B7HA 1ZU0A 5B70A 5I56A 4EXLA 5FHMA 1FQAA 4F22A 3FJ7A 3UIFA 4QSCA 2O68A 1AOVA 3N26A 4NWDA 3K4UA 2PT1A 1ZKBA 4XIGQ 1LFIA 1VFDA 3U94A 3KJTA 4E0XA 1SD3A 1SW2A 3MWBA 3IO6A 4G68B 4H8IA 1DPEA 1H45A 4BDQA 4GF8A 3Q29A 2F7BA 4OHNA 4P0IA 4HS7A 5EYFA 2GFEA 4MLQA 1Y4CA 5CMKA 2DP8A 5I2NB 1R1NA 2Y84A 4PETA 3V83A 4ZEKA 2M8CA 2UVIA 2YJPA 2V3QA 2UYEA 4KCDA 3MVZA 3IR1A 4JXIA 3C36A 2A5SA 4H5GA 4X9TA 1FW0A 1UIVA 1ZBMA 4NF6A 4GXAA 3MBPA 2AL5A 3MQ9A 4JDFA 3TFLA 1TT1A 2I48A 3LC8A 4BDRA 3H6WA 3RGYA 5CC2A 2Y7RA 1URGA 3HHFA 1OVBA 1URDA 2RC8A 1H3DA 3C33A 4YKIA 2F5XA 3FVGA 1ZJLA 4XKQA 2QSXA 2Q9TA 5I56B 4MFIA 4F1YA 4YICA 5L9MA 3RNNA 1OLAA 2V84A 3FUZA 3T22A 3EN3A 3CG1A 3K02A 4MBPA 1D3KA 4ELRA 3O6HA 3V8XB 2I49A 3TKDA 4XXUA 4PFYA 3QAXA 4G8HA 2QMXA 1A7LA 1A54A 3RN8A 2Y7WA 4H65A 2I6EA 3K0VA 4LZ8A 1QUJA 3GZGA 1VFEA 5CBRA 1JEVA 1NNKA 1B0LA 3KN7A 2NVUB 3TAJA 3SEUA 3I3VA 5ITOA 4ELQA 3L6GA 2XXRA 3QIMA 2ZYMA 3PMWA 3PUZE 3MZBA 3EF7A 1JVXA 1QVSA 4YAHX 1YAEA 5K2XA 1Z7NE 1KWHA 2O6AA 4BDLA 1QJMA 3SEVA 3IAZA 3FGSA 4F1UA 3IOUA 4WEPA 4OESA 4NF6B 1JNFA 1US4A 3VE1B 1N7XA 3IB0A 1GGGA 3K6XA 3LSWA 2XX7A 2Z22A 4C1UA 4GRKA 1PEBA 1TFAA 4Q8RA 1DMBA 3MW0A 3PV0E 3OMBA 1MQDA 4MF3A 4Q0CA 1Y20A 2OWSA 3FVOA 2HFBA 2XX9A 2OWTA 4R2BA 4HW8A 5I58B 3CFZA 1POTA 1UTBA 3FXRA 2ONRA 3FV1A 4IO4A 3M3FA 2D3IA 1N0TA 4PE5B 5CBSA 4FECA 2XXQA 3ZKKA 1NFTA 2Q2CA 5A5XA 2B65A 3CSBA 3S9EA 1Y9UA 2GHBA 3MZ9A 5DYHA 1JW5A 1XS5A 2DVCA 1MY0A 3TCGA 1QW0A 2QMWA 3FVNA 2FNCA 3H06B 2R6GE 4YMAA 3SKPA 4QSDA 1QKBA 2V93A 5H8QA 1VSOA 3RTFB 5CMBA 2QS2A 3N94A 3HPIA 2ZNSA 2I3WA 3MPKA 4QFKA 3M3LA 5BUUA 4F18A 5L9OA 3PD8A 1FCKA 1J1NA 4NTLA 3LR1A 1IXHA 1UIUA 4ZE9A 3O29A 4BDMA 1PDAA 1NH8A 3QXMA 4QF9A 3VDFA 5KDTA 5F7VA 3H7MA 1CE2A 4LVQA 1D4NA 3VLUA 4N6PA 3H03A 1TFDA 4I1DA 1B5JA 1MH4A 4IY6A 3G3KA 3LSFB 4E0WA 1USYE 1JW4A 1VE4A 1UTBB 3OO7A 4NMYA 3BKIB 2X7QA 3T9UA 2AIXA 4ZEFA 4M4GA 4R6KA 3S4UA 4FAJA 2XXPA 5I59A 2RF1A 4H6DA 4RA1A 2REJA 3HHGA 5A5XB 3SEXA 4DLDA 1NNTA 2B3BA 3G3JA 2V3TA 3KSJA 4NF5A 3I6VA 3IX1A 2O69A 4GQOA 3CFLA 3TODA 5FTIA 1TWYA 4G4PA 1B3GA 3QUFA 1A8EA 2OBGA 3OENA 4KYDA 2WKYA 2PVUA 2XXUA 1OVTA 4ZEBA 1LBCA 3FXQA 4RK9A 2H98A 3LSXA 1UQWA 1LCFA 2DXRA 4OMBA 1HSJA 1BTJA 1IXIA 3PMVA 1RYOA 4U21A 3LSLA 4GL8A 4R75A 4ECFA 3T66A 4HTGA 3MUQA 5CI5A 3U1OA 1ZMGA 2F7CA 2IA4A 4R72A 4XTCQ 3TQLA 1YCJA 3F11A 1RYXA 2DOJA 3G3IA 4GFRA 1UTHA 2H5YA 3KOTA 2UVHA 4FIMA 2QS3A 4GLIA 3JV9A 4R9GA 5I2NA 4OERA 3R6UA 4IO6A 1M5FA 4R6HA 1MM6A 1BKAA 1AL3A 1XT8A 4TOZA 4WKMA 2I4CA 4IO3A 5I59B 2AL4A 1N04A 3WAFA 4F2QA 5KZTA 1GVCA 1FTKA 2RINA 4RY1A 1I6AA 2XXTA 3CIJA 4NF5B 3H6VA 3T9VA 2B3FA 3TELA 4H5FA 2V3UA 1MPDA 5I2KA 2HZKA 1M5DA 5EHSA 1AIVA 2FA7A 3FIRA 2E1SA 4I8CA 4RXLA 2ESNA 3PUVE 3LUYA 3EQ1A 5AA2A 1GV8A 3I5OA 5ICTA 1MXXA 3LBSA 2HAVA 4ZECA 3M3KA 4OFLA 3B6QA 3FZVA 4ESWA 5AE4A 3DP6A 2R9JA 2F6PA 4LP2B 1MM7A 1ATGA 3VVDA 2HAUA 3KZGA 4THIA 3GLBA 1P1NA 3MVWA 3U8QA 4MH5A 4X1DA 3FJGA 3SESA 2ZMBA 3HN0A 1A40A 4PFUA 3H4ZA 4ZEIA 1TXFA 5H8HA 3M8UA 1FTJA 4K3FA 1UTHB 4OEUA 3SDFA 3HO7A 5M2VA 3OELA 3MVXA 3O28A 5JEIA 1POY1 3ZS6A 4O3BA 2THIA 1XC1A 4U22A 3TEPA 1MRPA 4H1XA 1MQJA 4WEDA 5ITPA 3ODBA 1IITA 2H9BA 3K00A 4DCXA 4OYVA 1EU8A 1AH5A 2X7PA 5I2KB 1IQ7A 1B3LA 2I0CA 3OD7A 3FD3A 3W9WA 3PGFA 1FQDA 2PMSA 3MPLA 1N84A 5I58A 2ANJA 3SERA 4IO7A 1JEUA 4DXBA 1R9QA 1SQYA 5AA2B 1SI1A 4NE4A 1GR2A 4KR5A 2I3VA 1QULA 1IXGA 2NOOA 4O3CA 5K2YA 4JWOA 3U92A 3G3GA 4QFNA 4UACA 4N07A 2KLFA 3IJOB 3KSXA 3E13X 3PMXA 2ONSA 2OCUA 1N76A 1RKMA 3S9LC 5H8HB 3MP8A 3H6TA 3G3HA 1XOCA 1O7TA 4IY5A 3IB1A 4UA8A 4FEBA 4TLLB 2ZNUA 2F35A 1IUDA 4PQJA 4YB6A 2UYFA 4XKPA 2NXOA 4ZZAA 3ECRA 2ZYKA 1WVJA 4ZS9A 3Q25A 1D9VA 1B4HA 3KEIA 1I6BA 4X1BA 2F8DA 1NMUA 5J1DA 3KG2A 3H6UA 1H44A 5IAIA 1EZPA 3USDA 4Q30B 2BJJX 3GBAA 3T9HB 3OSRA 2PT2A 3FASA 4QFOA 2D21A 4R73A 3MJNA 1USYH 5CM6A 3EPEA 2R71A 2F97A 2HCAA 1WDNA 5FHOA 3U72A 2I0BA 3K2DA 2PX1A 4I62A 3CVGA 3TUSA 1FTLA 3KOSA 3IOVA 3DP4A 4F3BA 1IIWA 2Z23A 4QRZA 3QSLA 4FJPA 4NF8A 1FTOA 5TU0A 1MG1A 2XD2A 2RC9A 4G8MA 2V25A 1B46A 2IEEA 3O2AA 5DVJA 3C31A 4ELPA 2ZYOA 5JK4A 3R26A 2O51A 1FQFA 3RLFE 4G8NA 1OMPA 4OZ9A 4ZZEA 1B1HA 1B3HA 3UA8A 4TLMB 4POWA 1Q1KA 2GRVA 3GXAA 2AYSA 3K6UA 1B51A 1SW5A 4M1VA 2DQVA 1Q35A 4ESXA 4F2OA 4DZ1A 3PPQA 2D5WA 1I6QA 3UORA 2I4BA 1MXZA 3DELB 4KI0E 2QRYA 2XX8A 1DPPA 3CG3A 3K1PA 1QKAA 3QK6A 1P1QA 4JBZA 2QS1A 4FATA 4OETA 3VXBA 3DP8A 2HXWA 4H8JA 1B0HA 1B3FA 5AA2D 5KCJA 4FORA 2O84X 2P1SA 3DM0A 3EHSA 1MXVA 4LONB 3KN8A 3EHUA 3T93B 3N6UA 1HSLA 1F9BA 4OXVA 5H8SA 3PPRA 2HEUA 4N13A 3Q27A 4Z0IA 4NF8B 1B40A 2DE3A 3BFUA 2O7IA 3TPAA 1NNFA 2DWIA 2YLNA 3A3CA 3RT8A 1P99A 3E3KA 3S2VA 2QS4A 4O3AA 1O63A 3KBRA 3VFJA 4F29A 3CI8A 4EXKA 2FYIA 5ICQA 3A09A 1JVYA 3IJXB 1M5BA 1MS7A 2CMOA 4WXJA 3W9VA 3TTNA 2F78A 1JW1A 3IK6B 5AA1A 2F6GA 5FTHA 3K6VA 5AA4A 3UGWA 1SVXB 1EZOA 4BLAA 1B6HA 4OVJA 4U23A 1IEJA 3RT6B 1LAHE 5I57A 3RTWB 4OWDA 4XKNA 4JSDA 3MVYA 1AMFA 4R74A 2UXAA 4ZE8A 4EQ7A 3MP1A 4AB6A 4DXUA 3RY3A 4G77A 1FQBA 4H0WA 3QYTA 2DYXA 4NEDA 4OFJA 1B4ZA 4GWOA 3UN6A 4G2ZA 1Y3NA 1PB7A 4YKJA 1T0KA 5KCJB 1XVXA 3G7WA 1QUKA 2PBWA 1MPBA 2G29A 2CZLA 5ELVA 3ILUB 1LB8A 4ONYA 3T96B 4BDNA 4F3SA 3TYHA 3EHTA 3HV1A 1L5TA 1PC3A 2LAOA 3FV2A 4OFOA 4EUOA 4YU0A 4H67A 4P0GA 1PB8A 4F1VA 1MH3A 1IZ1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1MXUA 1YYZA 4OQOA 4R6YA 5ET5A 3THIA 2XXWA 2XXXA 3E9XA 2O1LA 3O6IA 2XXYA 3TTKA 4OENA 4U1OA 3S9NC 3BBRA 5IKBA 3PUYE 1MQIA 4LZ5A 3ZKLA 2F3DA 5HM4B 2Y7PA 4ZDMA 3TCHA 1H43A 3O6GA 2DVZA 3OSQA 5AA4B 3G3FA 2ZNTA 4YB5A 1YTVA 1PBQA 3VV5A 2OJTA 1MY3A 3OEKA 3KN3A 1Y3QA 1FTMA 3UP9A 2Y5LA 4F3PA 3ONMA 5I57B 4POXA 3FVKA 4NG7A 2VOZA 3T1BA 2DWAA 4P47A 1A55A 1NH7A 1H76A 5ISUA 3IO4A 1M5CA 4HE0A 3ROJA 4LQ2A 5HBCA 3GBBA 2CEXA 1EH3A 3C32A 3MC2A 1N7WA 4GBWA 1MQGA 2GQ1A 1DTZA 2Q89A 2DE4A 3HSTA 2O1MA 3D4GA 3ILTB 4L17A 3T9XB 4PP0A 3KBZA 4EDPA 3IL1B 3W15C 2A5TA 2DWHA 4DXCA 4Z7EA 1OQHA 2Q8MA 1ZLQA 5DTBA 1IMDA 5H8FA 2Z8FA 3AXFA 4G68C 3HCQA 4U1ZA 1JP4A 1LAGE 4YMBA 2GH9A 2XWOA 1A8FA 1FBDA 2GHAA 4ZEDA 5IGAA 1IMBA 4X48A 3A3UA 3VVFA 2DSFA 1NKXA 3CRBA 4JWXA 4MIJA 1FPKA 1LBZA 5H8NA 4AQ4A 4LZ7A 3TTRA 5AA3A 1FRPA 1K9ZA 2QFLA 2G93A 4GXSB 4C1TA 1B5IA 4DCYA 4GX4A 1LAXA 1LBYA 1LLSA 1Y3PA 1B32A 3MAMA 3K1NA 2ONKE 4NWCA 3MP6A 5BWJA 2ABHA 1HSEA 4PGNA 1MY4A 4Q5TA 2XWIA 5L8DA 3VXCA 4NF0A 4KPTA 4XKRA 3MZ1A 4GVOA 2H99A 2HQ0A 1M5EA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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