4OXVA

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa complexed with valine
Total Genus 158
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
158
sequence length
428
structure length
424
Chain Sequence
APTALERVQKEGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFAQHLQQRLPRYESHFKQSGKQLDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Membrane-bound lytic murein transglycosylase F
publication title Crystal structure of MltF from Pseudomonas aeruginosa complexed with valine
rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa padk2_cf510
molecule tags Lyase
total genus 158
structure length 424
sequence length 428
ec nomenclature ec 4.2.2.-:
pdb deposition date 2014-02-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4oxvA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4oxvA02
1YAEA 2A5TB 3MWBA 3PGFA 4LQ5A 2Y7KA 2KLFA 3PMWA 4DZ1A 4H0WA 1ELJA 2VOZA 3FJMA 1ZU0A 3OD7A 2X7QA 2Q89A 3G3KA 4MLVA 3H6VA 4F3GA 1QUIA 3SETA 4EF1A 1B4ZA 3K6XA 2F35A 2NOOA 5ICQA 1IXGA 4TQUQ 2XXXA 2ZMBA 3LSFB 5I84A 1CE2A 1N3XA 1XHYA 3KFMA 4XKQA 1T0KA 1JNFA 5F7VA 4ZEKA 1MQDA 1QKAA 4NE4A 1JW4A 5B70A 3S9MC 3THIA 4HS7A 3PPQA 4U1OA 4I1DA 3C33A 2DWJA 4WKMA 5H8FA 3C31A 3BBRA 1FQDA 3UN6A 3IX1A 1QVSA 2Z8EA 1AIVA 1QULA 1MM7A 1IITA 2D5WA 4RY1A 3RT6B 1YTVA 4YKIA 4OWDA 4ZS9A 2Q2AA 3VFJA 4RXLA 3CVGA 4XKNA 5KCJB 5K2YA 2NXOA 4YKKA 4K3FA 4C0RA 2F7CA 5ELVA 1FQFA 3FVNA 4OFLA 1QKBA 2AYSA 1O63A 1Q35A 1LGBC 4R6HA 3OMBA 3Q26A 4POWA 4OENA 4QFLA 2D3IA 3E3KA 1D9VA 4F1YA 3ILUB 1MH4A 4KCDA 3PPRA 5KDTA 3N94A 4KYEA 2YLNA 4KFQA 3G7WA 5H8HB 1Y3PA 3D4CA 2E0SA 1PB9A 2QS4A 3K6UA 3MPLA 4LVQA 4QFOA 2B3FA 1I6QA 4PFWA 5B7DA 4GXSB 5L8DA 3SKPA 4MLQA 3S9EA 2OJTA 3B6TA 4H5GA 2XXRA 3HHGA 2I3WA 2FNCA 3OOAA 3TZAA 1NMUA 4BDLA 2NVUB 4C1UA 1Y4CA 2WKYA 3VVDA 2OCUA 3VE1B 5ITPA 3C36A 4THIA 4GD5A 5I2KA 2B3BA 1TWYA 1LAGE 4G77A 3LSWA 5CBSA 3DM0A 3TCGA 2GH9A 3FXRA 1RKMA 3HCQA 3TELA 2REGA 3T9UA 3P7IA 4P11A 3SEXA 2Z23A 4NF4B 4IO7A 2XXTA 3MP8A 4BDQA 3OELA 4H8JA 1LBCA 4LP2B 1OIBA 4LQ2A 2ABHA 4JWYA 4LATA 3B6WA 1HSEA 1DOTA 4GWOA 1SBPA 4C1TA 1P1QA 3TKDA 1IUDA 3IB0A 4U21A 2HEUA 3JYRA 1A99A 1L5TA 4G68B 1R9QA 5I2NA 1JVYA 3IL1B 4NF6A 2GFEA 5EHMA 1LCTA 3I3VA 3MPKA 3QUFA 3PUWE 3B6QA 3MP6A 3TAJA 2PT1A 2ANJA 5DEXB 3AXFA 3HHFA 1JVXA 2RKMA 3K0VA 5AA3A 3H6UA 3KSJA 4P0IA 4X9TA 4HW8A 1UTHA 1AMFA 4NF5B 5DTBA 3TUSA 1SI1A 2F7BA 3O6GA 1MDQA 3KZGA 1B0HA 3H7MA 3ZS6A 3RY3A 3QYTA 4OEVA 4YU0A 4GFRA 3IB1A 3OENA 1B3EA 2F6PA 3UORA 2XXUA 5ITOA 4IO3A 1O64A 3TCHA 1N7WA 4RYAA 3SEWA 4OVJA 5I56B 3H4ZA 1H45A 3CFZA 4DCXA 5L9OA 3SERA 2QS2A 1NH7A 4IO2A 4GXAA 2VHAA 1VFEA 1MY3A 3R7XA 1EZOA 3PMXA 3W9WA 3TFLA 4HCWA 1PC3A 2PBWA 4N07A 2HCAA 3O6IA 1MQJA 3T66A 4R9GA 1HSLA 3VV5A 1FTJA 4GL8A 3IR1A 3B7DA 4ND9A 3D4GA 3IJXB 1IXIA 5H8QA 4RK2A 3N26A 4NTLA 2XD3A 3G3JA 5L9MA 3CI8A 1MS7A 1I6AA 1H44A 3OO8A 1HSJA 1A40A 1XC1A 4H1XA 3MC2A 2Z22A 2RC8A 4ZE9A 3L6GA 5H8NA 3IOWA 3EHTA 1OQGA 3FVGA 4QSEA 4G8HA 1Q1KA 1IXCA 3PPNA 2GRVA 1B5HA 1LSTA 3O29A 2OLBA 3RTFB 3KOSA 3IO6A 3K1NA 3DP4A 2Y7IA 4WXJA 1H76A 4G8MA 4H67A 4F22A 2XX7A 5TPAA 3VVFA 4YMBA 2R9JA 3M8UA 5BWJA 1B9JA 5CM6A 3H6TA 4YKJA 1FQBA 4YMAA 2GHAA 4XTCQ 1SDXA 4RK9A 2OK2A 2A5TA 3C4MA 4U2RA 1URGA 1VFDA 3CR9A 4OMBA 2F78A 1B32A 4Z7EA 2DWHA 4O3CA 5AA4B 2IEEA 1B58A 4TLLB 4H8IA 2H4IA 3LUYA 4ESXA 4F2OA 4F1VA 4ELQA 3N6TA 4UACA 4YKPA 1EZPA 1LB9A 1TFAA 3MVXA 1MM6A 3TEPA 2UYFA 4YB5A 4RA1A 1MXYA 1URSA 4PFUA 4FAJA 3M3LA 3MQ9A 1S50A 2AL5A 3K02A 1B7UA 1BTJA 2DE2A 1II5A 1B3FA 3GBAA 3A09A 3LR1A 4LUBA 1P1WA 1USYE 4DIGA 3G3GA 1R1NA 3UGWA 2DP8A 4Q0CA 5AA2D 4EQ7A 3IO4A 4ISUA 2ONRA 5K2XA 2F97A 4F19A 4F29A 4KYDA 5KCJA 4G4PA 2QMXA 2V3TA 3I6VA 5CC2A 4EDPA 1P1OA 4XIGQ 4PQJA 2QRYA 1B7ZA 1FQEA 4JSDA 1USYH 5HM4B 3U72A 2I0BA 3N6UA 5I59B 3O66A 3OO6A 1PDAA 1LFGA 3GBBA 4QSCA 3CSGA 2O1MA 1MY0A 5H8HA 2ZNSA 1PB7A 1R6ZA 2H99A 2G93A 4ZEBA 2DWIA 4H6DA 2H25A 5KZTA 3LSLA 4OETA 1Y4TA 3ZKKA 3RGYA 2HFBA 4DXUA 2OZZA 4FECA 2QJEA 2Y84A 4I62A 2VD2A 2UYEA 3TMGA 1Y9UA 3SEVA 2X7PA 3Q27A 2XXIA 1JW5A 4NWCA 4Q5TA 3H03A 3G3HA 4QFPA 1FTMA 3KJTA 4U22A 2O69A 5H8SA 3ECRA 4AB6A 4ZEFA 1WVJA 3QSLA 4IB2A 1XS5A 3F11A 1QUJA 2R71A 5TP9B 1EZ9A 4RNSA 3RT8A 3M3FA 3I5OA 4DLDA 3KG2A 2Q9TA 1LFHA 4NF4A 4RPOA 3KN3A 1S9TA 2HZKA 1VSOA 1N76A 2ZNTA 3EF7A 3MZ1A 1GVCA 1LB8A 2HQ0A 2CZLA 3RQTA 5FHNA 1RYXA 4NEDA 3PUZE 2ZXTA 3K1MA 3MUQA 4O3AA 4MBPA 1DPEA 5HPQA 1M5EA 1N0TA 3IB2A 3CFXA 1IEJA 3S2VA 2V3QA 5AA2B 1LBBA 1LAFE 3T9VA 3UIFA 3T22A 4Z0IA 2Z8FA 2V84A 1UIVA 1H3DA 3MVWA 2OWSA 4G68A 4E0XA 4R73A 5AA1A 3U8QA 4IY5A 1UTBB 5I57B 1GGGA 1YPNA 2PVUA 5DEXA 4NMYA 2UVJA 3U92A 1LFIA 4KR5A 3FJ7A 3LBSA 4F3SA 1H43A 3OO7A 4BLAA 1B6HA 4NF5A 3ZSFA 2XXPA 4FIMA 1B3GA 2OBGA 5FTHA 3SESA 2E1SA 5A5XB 2V93A 1XVXA 4OEUA 2PMSA 4MF3A 1QJMA 2I6EA 3BKIB 4KHZE 1AOVA 2I49A 3TQLA 2OWTA 1QUKA 3Q29A 1A54A 3K00A 5EHSA 5I56A 3MVYA 4JXIA 1EH3A 3G3IA 3IORA 2HAVA 3TTMA 2Q8JA 4OQOA 2VD3A 5F1QA 3EHUA 3MJNA 4KYSA 4QFKA 1B4HA 1IXHA 3MAMA 1DTZA 3MVZA 1MY4A 3M3KA 2I58A 1XOCA 1P1NA 2HXWA 1NH8A 5DVJA 4KD5A 4QSDA 2PT2A 4F31B 3EN3A 3ZKLA 3JZJA 1FW0A 3FXQA 1FQAA 3IK6B 3EHSA 5JTYA 2YJPA 2XXQA 1POY1 1IZ1A 4LONB 4ZDMA 1SVXB 3ONMA 4BDNA 1KWHA 3R26A 1ZBMA 1B52A 4OHNA 1SW2A 3LSXA 2F36A 3PPPA 3UP9A 4LZ7A 1I6BA 1JETA 3FZVA 3N5LA 5HBCA 4G8NA 3MP1A 1OVTA 3KOTA 2VP1A 3IAZA 1NKXA 1N7XA 2DE4A 1SW1A 1Z7ME 1DPPA 4KI0E 3CIJA 3WAFA 2XX8A 3CG1A 3S9NC 4QHQA 3Q28A 2UVGA 3W15C 2CMOA 4M4GA 3HSTA 5JTYB 1DSNA 4NF8B 3K01A 1TFDA 1D3KA 2YPNA 4H5FA 1N84A 1ZLQA 3T9HB 2UXAA 3RPWA 1MY1A 3V83A 1US5A 2RF1A 2O7IA 1F9BA 3IOTA 3FVOA 4JBZA 2ALUA 3FV1A 4ONYA 4R75A 3DLNA 1BP5A 4OERA 2F7AA 1YCJA 2G29A 2BJJX 3O6HA 2I48A 1O7TA 1MQIA 3IOVA 4R2FA 1S7YA 3O9PA 3DP8A 4KQPA 5AA4A 1B40A 3MZBA 5ICTA 4EXKA 4H65A 4R6KA 5EYFA 1DMBA 2O68A 3R6UA 3G3FA 3OEKA 5JEIA 1PBPA 2PX1A 4GOTA 1NL5A 1IIWA 3PUVE 1PBQA 1ZIUA 1MXWA 4LA9A 1Y1ZA 1MXUA 4ZEIA 4XKRA 1SI0A 3O97A 1A8FA 1NNPA 4JSOA 1N3WA 4UA8A 4BDOA 3FD3A 2P2AA 2LAOA 1OLAA 2NWJA 3S4UA 4O3BA 4EF2A 4R9FA 4ZZEA 2DSFA 2ZYNA 3V5AA 3OSQA 3PUYE 3UK4A 3KGCA 4FEDA 4E0WA 1A8EA 3BFTA 2QS1A 2PYYA 2DS9A 5J1DA 1BKAA 2XXYA 5ISUA 1SYIA 3OSRA 3QIMA 1MRPA 5I58B 2Y7RA 3VVEA 2RC9A 4X1DA 4JWXA 3ODBA 1P99A 3HN0A 4L17A 4G68C 1OLCA 3W9VA 3KBRA 4DXCA 5CMBA 4FJPA 4PFTA 4GQOA 1TT1A 1LAXA 3CG3A 1FTLA 1UIUA 4MH5A 2H9BA 2DXRA 3BFUA 3IOUA 5I59A 3H6WA 3E13X 4FORA 1ZMGA 4QFNA 4YZZA 5DVFA 4LZ5A 1US4A 1Y20A 1AL3A 1B51A 3GZGA 3KN7A 1FQCA 2HAUA 2AL4A 3FATA 3K4UA 3T96B 4OFOA 4ZECA 4X48A 1ATGA 1B05A 1P1UA 1DTGA 3O2AA 3TTKA 3KJ7A 4DCYA 2QPQA 4MFIA 1MXXA 5L9SA 4N13A 3USDA 5TU0A 4PFYA 3TODA 1B5JA 3PD8A 2W7YA 3QAXA 3K6WA 4OZ9A 1MDP1 3FV2A 4QF9A 2DVZA 4RPNA 1J1NA 5CI5A 4F3PA 2RCAA 1NFTA 2VGQA 2ZYMA 3TYHA 3U94A 2RC7A 4R2BA 3VDFA 1B1XA 2XXWA 1MH3A 4IGTA 2RINA 3RUMA 3U1OA 2QSXA 2UVIA 1MXZA 3CRBA 2O51A 4FEBA 2ZNUA 5TP9A 2NUVA 4GIZA 2THIA 1XT8A 4PETA 4PP0A 1GR2A 4YB6A 2P0SA 3PPOA 2V25A 2O1LA 5CMKA 2DWAA 1M5BA 2F8DA 1A7LA 1MXVA 2X26A 4XKPA 3LC8A 1MPBA 1TXFA 3EQ1A 3OEMA 3Q25A 3K2DA 5DVIA 4OXVA 3E4RA 2DQVA 1B1HA 1Y3NA 4KPTA 5AA2A 3GLBA 1OMPA 4ELRA 3QXMA 1B0LA 2O84X 3FXUA 4Q30B 3OXNA 5H8FB 2H5YA 4IGRA 4U23A 4GVOA 3TPAA 1UTBA 1MPDA 5I57A 4EXLA 4JB7A 2ESNA 3C32A 3DELB 1POTA 4GRKA 4R72A 1ANFA 1LLSA 4OFJA 4ZEDA 5A5XA 3HV1A 2I4BA 2Q2CA 3DP6A 3FVKA 2XHDA 2HZLA 4IY6A 1Y1MA 4P0GA 4ECFA 1NNFA 4U4XA 4FATA 3FASA 1XVYA 2RCBA 3VLUA 1SW4A 5FHOA 4EQBA 3L6HA 4TLMB 1A55A 5KDTB 4NWDA 4U1ZA 4ZE8A 2QMWA 3O28A 1WODA 1MG1A 4QRZA 1JW1A 1MY2A 4LZ8A 2Y7WA 4OTEA 1B46A 4IO5A 1D4NA 4BDRA 1B2HA 2F5XA 5M2VA 3SEUA 1LCFA 4GF8A 1MQHA 1UQWA 1ZKBA 2DE3A 4DDDA 2O7UA 2DVCA 2I4CA 2ONSA 2FA7A 1JEVA 3QK6A 1GTKA 3PUXE 2XD2A 2Q88A 3V89B 3RN8A 5I2KB 1B3HA 4R74A 1WDNA 5FTIA 4RJZA 1Z7NE 4N6PA 2F34A 3U93A 2QL3A 3C9HA 1SQYA 3KN8A 4F1UA 4AQ4A 1PB8A 5FHMA 1Y3QA 2I3VA 3WAEA 3RLFE 2ZYOA 4X1BA 3RNNA 2UVHA 4ELOA 1ZJLA 3CFLA 3KEIA 3K6VA 4NF8A 3FJGA 4GL0A 3TDJA 3TQWA 1BIYA 2F6GA 5BUUA 2ZYKA 4GLIA 3S9LC 4U4SA 4OESA 1IQ7A 3C34A 1CB6A 2DYXA 3C35A 2V3UA 4YICA 2O6AA 5IKBA 3PMVA 4M1VA 2XXHA 3PV0E 3KSXA 1MQGA 3A3UA 2Y7PA 5I2NB 3GXAA 4NF6B 3TCFA 5CRYA 4AB5A 3T93B 3JV9A 3E9XA 5CMCA 4EQ9A 4R6YA 1BLFA 1URDA 1SYHA 4XXUA 4HTGA 3OO9A 3MW0A 4JWOA 4DE8A 1PEBA 3FIRA 1UTHB 4POXA 4I8CA 3UA8A 1RYOA 2REJA 3TTLA 4WEDA 2IA4A 3VLWA 4IO6A 1MPCA 2M8CA 1OQHA 4OYVA 2DXYA 2Z8DA 2DOJA 5I58A 5IAIA 5AE4A 4F2QA 2D21A 5DYHA 4YAHX 1I69A 2GHBA 3VXCA 2FYIA 5DT6A 2XXVA 3FGSA 1B5IA 1FTKA 1SD3A 4KCCA 2A5SA 3MZ9A 1VE4A 2P1SA 3FUZA 4I9DA 3MBPA 4DXBA 1SW5A 5H8QB 2B65A 3TTNA 4G2ZA 2ONKE 4F3BA 5JK4A 3A3CA 1N04A 5LOMA 1B7HA 3SEYA 4F39A 3CSBA 1FCKA 1B3LA 2I0CA 4WEPA 1OVBA 3VXBA 2H98A 1JEUA 1LAHE 1M5CA 4Q8RA 5CBRA 3TTRA 3PD9A 4F18A 1JQFA 5H8NB 1NNKA 1EU8A 3QUJA 4FE8A 1M5DA 4BDMA 1M5FA 4ELPA 2QS3A 4HCYA 4IO4A 1AH5A 3SDFA 2AIXA 3V8XB 1GV8A 1ZTYA 3HPIA 5TPAB 3H3GA 4TOZA 2XX9A 4YB7A 1NNTA 3VLVA 1QW0A 3EPEA 4EUOA 4PE5B 3K1PA 4ESWA 4ZZAA 3HO7A 1FTOA 3IJOB 3RTWB 1D9YA 1VR5A 3ILTB 4JDFA 3PU5A 1R9LA 5CMMA 3H06B 2R6GE 3T9XB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ET7A 4P1EA 1YAEA 2A5TB 4OVQA 1KA1A 3MWBA 3PGFA 4LQ5A 2Y7KA 2KLFA 3PMWA 4DZ1A 4H0WA 5IZ3B 1LBZA 1ELJA 4PDHA 2F3BA 2VOZA 3FJMA 1ZU0A 3OD7A 2X7QA 4MNPA 4PE3A 1FBPA 2Q89A 3G3KA 4N81A 4MLVA 3H6VA 4P56A 4F3GA 1QUIA 3SETA 4PFBA 4EF1A 1DBZA 4NX1A 1B4ZA 3K6XA 2F35A 2NOOA 5ICQA 1IXGA 4TQUQ 1NUWA 1NV3A 2XXXA 2ZMBA 1IMBA 3LSFB 5I84A 1CE2A 5F24A 1N3XA 1XHYA 2HHMA 3KFMA 4XKQA 1T0KA 1JNFA 5F7VA 4ZEKA 1MQDA 1QKAA 4NE4A 5IZ1A 1JW4A 5B70A 3S9MC 3THIA 4HS7A 3PPQA 4U1OA 1VDWA 4I1DA 4OVPA 3C33A 2DWJA 4WKMA 1LEVA 5H8FA 3C31A 3BBRA 1FQDA 3UN6A 3IX1A 1QVSA 2Z8EA 5LTCA 1AIVA 1QULA 1MM7A 4NHBA 1IITA 2D5WA 4RY1A 3RT6B 1YTVA 1K9ZA 4YKIA 1FPEA 4OWDA 4ZS9A 2Q2AA 4OVTA 3VFJA 4RXLA 3CVGA 4XKNA 5KCJB 5K2YA 3EKIA 2NXOA 4YKKA 4K3FA 4C0RA 2F7CA 5ELVA 1FQFA 3FVNA 3RYDA 4OFLA 1QKBA 2AYSA 4AS4A 1O63A 1Q35A 1LGBC 4GX4A 4R6HA 2CEYA 3OMBA 3Q26A 4POWA 4OENA 4QFLA 2D3IA 3E3KA 1D9VA 5EQ9A 4F1YA 3ILUB 1MH4A 4KCDA 3HFUA 3PPRA 5KDTA 3N94A 4GX3A 4KYEA 3B8BA 2YLNA 4KFQA 3G7WA 5H8HB 1Y3PA 3D4CA 2E0SA 1PB9A 2QS4A 3K6UA 3MPLA 4GWUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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